View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9317-LTR4-TNT-insertion-4 (Length: 505)

Name: F9317-LTR4-TNT-insertion-4
Description: F9317-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9317-LTR4-TNT-insertion-4
F9317-LTR4-TNT-insertion-4
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (8-497)||(46941023-46941513)
chr3 (274-473)||(54246055-54246254)
chr3 (275-466)||(54237097-54237288)
chr3 (275-469)||(40808863-40809057)
chr3 (274-466)||(42394326-42394518)
chr3 (275-467)||(42100688-42100880)
chr3 (275-470)||(24688310-24688505)
chr3 (274-469)||(47190933-47191127)
chr3 (274-468)||(25413680-25413874)
chr3 (274-467)||(36150130-36150323)
chr3 (275-467)||(45126836-45127028)
chr3 (275-466)||(40480750-40480941)
chr3 (275-465)||(53581766-53581956)
chr3 (271-425)||(52629870-52630024)
chr3 (275-465)||(27748565-27748746)
chr3 (274-465)||(1078229-1078411)
chr3 (274-469)||(53273600-53273786)
chr3 (306-452)||(51249323-51249469)
chr3 (365-471)||(29558232-29558338)
chr3 (368-473)||(4190266-4190371)
chr3 (379-468)||(25996267-25996356)
chr3 (368-471)||(9434120-9434223)
chr3 (300-471)||(11064655-11064824)
chr3 (368-469)||(10457893-10457994)
chr3 (368-469)||(52627978-52628079)
chr3 (274-365)||(29556866-29556956)
chr3 (368-472)||(34791824-34791928)
chr3 (368-467)||(51757593-51757692)
chr3 (275-347)||(9434244-9434316)
chr3 (285-353)||(19148882-19148950)
chr3 (301-363)||(26141543-26141606)
chr3 (301-357)||(20764932-20764989)
chr3 (438-471)||(47532018-47532051)
chr3 (275-347)||(51757713-51757784)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (275-471)||(5489772-5489968)
chr1 (275-467)||(43570994-43571186)
chr1 (275-469)||(48498870-48499064)
chr1 (274-470)||(24769406-24769602)
chr1 (274-465)||(7447828-7448018)
chr1 (272-465)||(4401329-4401523)
chr1 (276-477)||(37814768-37814969)
chr1 (274-468)||(750212-750406)
chr1 (272-467)||(50448165-50448360)
chr1 (273-465)||(2497468-2497660)
chr1 (275-470)||(23989431-23989627)
chr1 (273-467)||(4888055-4888236)
chr1 (368-469)||(44112675-44112776)
chr1 (368-467)||(38335918-38336017)
chr1 (368-467)||(48119628-48119727)
chr1 (368-467)||(35003294-35003393)
chr1 (368-467)||(46168383-46168482)
chr1 (368-469)||(45639733-45639834)
chr1 (368-468)||(41065152-41065252)
chr1 (368-468)||(45427746-45427846)
chr1 (374-468)||(38113202-38113296)
chr1 (368-468)||(45705824-45705924)
chr1 (368-467)||(35000114-35000213)
chr1 (368-469)||(26585460-26585561)
chr1 (274-347)||(35003414-35003487)
chr1 (274-347)||(44112797-44112870)
chr1 (275-347)||(45705945-45706017)
chr1 (410-469)||(14427345-14427404)
chr1 (281-347)||(48119748-48119814)
chr1 (301-345)||(23597120-23597165)
chr1 (275-347)||(35000021-35000093)
chr1 (271-312)||(45427649-45427690)
chr1 (301-344)||(37649224-37649268)
chr1 (275-347)||(45639640-45639712)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (273-472)||(36743389-36743588)
chr8 (280-477)||(29705352-29705549)
chr8 (273-467)||(11582766-11582960)
chr8 (274-472)||(30660649-30660847)
chr8 (274-465)||(30912469-30912660)
chr8 (275-468)||(2546995-2547188)
chr8 (276-468)||(42197344-42197536)
chr8 (281-465)||(29800864-29801048)
chr8 (275-478)||(31384653-31384856)
chr8 (275-471)||(42295191-42295386)
chr8 (274-465)||(20148762-20148953)
chr8 (269-466)||(45397317-45397513)
chr8 (279-467)||(2165875-2166063)
chr8 (276-465)||(26125637-26125825)
chr8 (298-470)||(5754900-5755072)
chr8 (275-425)||(9241594-9241744)
chr8 (275-471)||(3743767-3743963)
chr8 (274-467)||(1375542-1375735)
chr8 (315-468)||(40528582-40528736)
chr8 (371-465)||(42699259-42699353)
chr8 (368-470)||(35181513-35181615)
chr8 (368-468)||(18066719-18066819)
chr8 (368-469)||(34304786-34304887)
chr8 (368-472)||(33629994-33630098)
chr8 (374-468)||(16603633-16603727)
chr8 (269-347)||(10678054-10678132)
chr8 (373-471)||(16358839-16358938)
chr8 (368-425)||(10678153-10678210)
chr8 (434-467)||(28977146-28977179)
chr8 (274-347)||(34304908-34304980)
chr8 (271-347)||(35181636-35181712)
chr8 (442-472)||(19386645-19386675)
chr8 (302-347)||(18066653-18066698)
chr8 (301-344)||(20074964-20075008)
chr8 (365-413)||(32328815-32328863)
chr8 (275-347)||(33629901-33629973)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (270-469)||(33703139-33703338)
chr4 (275-467)||(35017733-35017924)
chr4 (274-469)||(1771173-1771368)
chr4 (274-469)||(28982729-28982924)
chr4 (274-467)||(27550309-27550502)
chr4 (269-472)||(23035975-23036178)
chr4 (275-465)||(43514594-43514784)
chr4 (274-470)||(55966253-55966449)
chr4 (275-469)||(25051691-25051885)
chr4 (275-465)||(27893750-27893940)
chr4 (274-470)||(27864561-27864757)
chr4 (274-465)||(43735744-43735935)
chr4 (275-464)||(23204686-23204875)
chr4 (275-474)||(43949709-43949909)
chr4 (273-467)||(27316618-27316813)
chr4 (281-468)||(48463364-48463551)
chr4 (272-465)||(31680904-31681097)
chr4 (275-467)||(12496956-12497148)
chr4 (293-465)||(39631102-39631275)
chr4 (275-425)||(51512173-51512323)
chr4 (274-470)||(28988470-28988665)
chr4 (306-466)||(41878407-41878567)
chr4 (281-472)||(45490227-45490418)
chr4 (274-468)||(21687005-21687199)
chr4 (281-472)||(41847966-41848157)
chr4 (302-465)||(41327478-41327641)
chr4 (287-414)||(46412389-46412516)
chr4 (271-413)||(56215802-56215943)
chr4 (368-467)||(17619153-17619252)
chr4 (368-469)||(711958-712059)
chr4 (368-467)||(55272377-55272476)
chr4 (379-471)||(35037001-35037093)
chr4 (373-465)||(3756252-3756344)
chr4 (368-468)||(32728356-32728456)
chr4 (368-468)||(48435580-48435680)
chr4 (387-469)||(960890-960972)
chr4 (268-347)||(19880074-19880153)
chr4 (368-465)||(38851515-38851612)
chr4 (275-347)||(55272284-55272356)
chr4 (368-429)||(19879992-19880053)
chr4 (382-470)||(46827721-46827809)
chr4 (273-347)||(3756158-3756232)
chr4 (276-347)||(35037125-35037195)
chr4 (281-347)||(712080-712146)
chr4 (274-347)||(17619059-17619132)
chr4 (368-425)||(36004117-36004174)
chr4 (275-347)||(48435487-48435559)
chr4 (387-468)||(49229684-49229765)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (274-468)||(30838631-30838825)
chr2 (274-466)||(19047158-19047350)
chr2 (275-472)||(1750409-1750606)
chr2 (274-465)||(43490308-43490499)
chr2 (273-472)||(4764632-4764831)
chr2 (272-470)||(12302158-12302356)
chr2 (275-469)||(43335671-43335865)
chr2 (275-467)||(16096747-16096940)
chr2 (276-467)||(42849768-42849946)
chr2 (274-466)||(34817683-34817875)
chr2 (308-472)||(13780676-13780840)
chr2 (280-468)||(42026766-42026956)
chr2 (273-429)||(39149200-39149354)
chr2 (328-465)||(8896544-8896681)
chr2 (373-465)||(33229303-33229396)
chr2 (368-470)||(43114554-43114656)
chr2 (368-467)||(12415461-12415560)
chr2 (368-467)||(12427521-12427620)
chr2 (368-465)||(11825655-11825752)
chr2 (368-469)||(16803966-16804067)
chr2 (368-469)||(16843248-16843349)
chr2 (368-465)||(41281975-41282072)
chr2 (374-468)||(18491704-18491798)
chr2 (368-470)||(34895742-34895844)
chr2 (368-469)||(966835-966936)
chr2 (378-465)||(7070418-7070505)
chr2 (368-437)||(4451951-4452020)
chr2 (382-465)||(6518484-6518566)
chr2 (274-347)||(34895648-34895721)
chr2 (275-347)||(11825562-11825634)
chr2 (382-465)||(4299435-4299518)
chr2 (274-347)||(6518401-6518474)
chr2 (274-347)||(12531570-12531643)
chr2 (274-347)||(18491825-18491898)
chr2 (274-347)||(41281881-41281954)
chr2 (275-347)||(966742-966814)
chr2 (275-347)||(43114677-43114749)
chr2 (385-468)||(14285675-14285758)
chr2 (301-363)||(40613913-40613976)
chr2 (318-363)||(42257237-42257282)
chr2 (275-339)||(12415368-12415432)
chr2 (275-339)||(12427428-12427492)
chr2 (275-347)||(16804088-16804160)
chr2 (275-347)||(16843370-16843442)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (274-470)||(7273242-7273438)
chr6 (281-473)||(26669923-26670115)
chr6 (274-468)||(9698240-9698434)
chr6 (274-468)||(21279928-21280122)
chr6 (274-470)||(3213397-3213593)
chr6 (281-471)||(7292743-7292933)
chr6 (275-465)||(24203895-24204085)
chr6 (278-470)||(7367546-7367738)
chr6 (272-468)||(21293582-21293778)
chr6 (276-467)||(13743130-13743321)
chr6 (276-467)||(13748630-13748821)
chr6 (276-467)||(30014343-30014534)
chr6 (268-465)||(30735984-30736181)
chr6 (274-471)||(26466795-26466992)
chr6 (368-469)||(33242401-33242502)
chr6 (368-465)||(27441544-27441641)
chr6 (368-468)||(31109223-31109323)
chr6 (368-467)||(33253913-33254012)
chr6 (274-347)||(27441662-27441735)
chr6 (275-347)||(33242523-33242595)
chr6 (273-347)||(33254034-33254108)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (281-473)||(679-871)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (273-467)||(24000918-24001112)
chr7 (275-467)||(42538339-42538531)
chr7 (281-472)||(5015390-5015581)
chr7 (274-467)||(5810831-5811024)
chr7 (270-465)||(44416837-44417032)
chr7 (274-468)||(35069720-35069914)
chr7 (275-458)||(32029725-32029908)
chr7 (274-465)||(44326180-44326371)
chr7 (273-467)||(42972852-42973046)
chr7 (275-465)||(43343532-43343722)
chr7 (274-465)||(16180264-16180454)
chr7 (278-451)||(27393171-27393344)
chr7 (275-464)||(26898310-26898499)
chr7 (275-469)||(41861672-41861868)
chr7 (274-467)||(45326020-45326213)
chr7 (275-465)||(10573751-10573941)
chr7 (274-468)||(9216301-9216494)
chr7 (293-430)||(38160505-38160642)
chr7 (274-465)||(4638106-4638297)
chr7 (275-468)||(43317442-43317635)
chr7 (300-468)||(5194164-5194332)
chr7 (328-468)||(24280557-24280697)
chr7 (379-470)||(40236916-40237007)
chr7 (274-387)||(47279631-47279744)
chr7 (368-467)||(31513287-31513386)
chr7 (368-466)||(31408634-31408732)
chr7 (368-470)||(27535232-27535334)
chr7 (400-467)||(39998408-39998475)
chr7 (368-471)||(33384866-33384970)
chr7 (272-347)||(40237039-40237114)
chr7 (274-347)||(31408540-31408613)
chr7 (432-468)||(38160659-38160695)
chr7 (414-468)||(47279744-47279798)
chr7 (301-344)||(46033831-46033875)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (273-467)||(2614555-2614749)
chr5 (275-469)||(18033980-18034174)
chr5 (275-467)||(41334571-41334763)
chr5 (273-469)||(33801467-33801663)
chr5 (272-470)||(5256992-5257190)
chr5 (300-467)||(22512305-22512472)
chr5 (274-471)||(7617129-7617326)
chr5 (281-469)||(38470577-38470765)
chr5 (274-465)||(25914903-25915085)
chr5 (315-468)||(39122381-39122533)
chr5 (368-467)||(32473395-32473494)
chr5 (392-467)||(33855068-33855143)
chr5 (274-380)||(39122263-39122369)
chr5 (368-468)||(17208073-17208173)
chr5 (368-472)||(30622720-30622823)
chr5 (269-347)||(30622621-30622699)
chr5 (276-347)||(32473303-32473374)
chr5 (301-364)||(28177801-28177865)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (274-466)||(112656-112848)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (275-468)||(14097-14289)
scaffold0187 (275-468)||(24425-24617)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (275-469)||(11249-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (275-467)||(23329-23521)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (368-465)||(45720-45817)
scaffold0003 (274-347)||(45626-45699)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (368-467)||(35457-35556)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 46941513 - 46941023
Alignment:
Q  8 gtaacttggtgtatgttggttttagatttggatgagtaaaaaactcagannnnnnnnncagtgtgtaagttcaatcactagactacgataatgaaagaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941513 gtaacttggtgtatgttggttttagatttggatgagtaaaaaactcagatttttttttcagtgtgtaagttcaatcactagactacgataatgaaagaaa 46941414  T
Q  108 acaaaattgatttcggagatataaattgattttaacatatttaaatgctcccaaatataattgaccatgatttcagaattgattcaaattcaaagctagg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941413 acaaaattgatttcggagatataaattgattttaacatatttaaatgctcccaaatataattgaccatgatttcagaattgattcaaattcaaagctagg 46941314  T
Q  208 aattagnnnnnnnnn-gttgcatagatcgtaacttttaccctcgaacttatggatgaacacatttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggca 306  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941313 aattagttttttttttgttgcatagatcgtaacttttaccctcgaacttatggatgaacacatttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggca 46941214  T
Q  307 atacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941213 atacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 46941114  T
Q  407 ccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttattttatagactattatatatatta 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941113 ccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttattttatagactattatatatatta 46941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 274 - 473
Target Start/End: Original strand, 54246055 - 54246254
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54246055 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacattctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 54246154  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttta 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246155 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatctctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttta 54246254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 275 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 54237288 - 54237097
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  54237288 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaatattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 54237189  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54237188 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 54237097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 275 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 40809057 - 40808863
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40809057 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 40808958  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40808957 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttcctt 40808863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 274 - 466
Target Start/End: Original strand, 42394326 - 42394518
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42394326 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 42394425  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42394426 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 42394518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 42100880 - 42100688
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  42100880 gagtgatcatacatgtaccacctcatgtggcaatgcaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaataaaagataa 42100781  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42100780 aatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42100688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 275 - 470
Target Start/End: Original strand, 24688310 - 24688505
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24688310 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacccccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 24688409  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688410 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 24688505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 274 - 469
Target Start/End: Original strand, 47190933 - 47191127
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47190933 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaatagaagata 47191032  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47191033 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacat-gggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 47191127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25413874 - 25413680
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25413874 agagtgatgatacatgtaccaccccatatgacaatacaccctttacacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaagata 25413775  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25413774 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 25413680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 274 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 36150323 - 36150130
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36150323 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 36150224  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36150223 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctgatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtattcatgtaacattttcc 36150130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Original strand, 45126836 - 45127028
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  45126836 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctggcatgtggtaatctggaccccacataaatagaaaataa 45126935  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45126936 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 45127028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 275 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 40480941 - 40480750
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40480941 gagtgatgatacatgtatcaccccatgcggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaaatagaagataa 40480842  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480841 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggcatatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 40480750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 275 - 465
Target Start/End: Original strand, 53581766 - 53581956
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53581766 gagtgatgatacctgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 53581865  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53581866 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacataggatgtacaatggagtgtatgaataaagagtgttcatgtaacatttt 53581956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 271 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 52630024 - 52629870
Alignment:
Q  271 tttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  52630024 tttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccctacataaatagaag 52629925  T
Q  371 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgta 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  52629924 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccttaatacatagggtgta 52629870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27748746 - 27748565
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27748746 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacac---------cgacacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 27748656  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27748655 agtattgttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataaggtgtataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 27748565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1078411 - 1078229
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  1078411 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaatagaagata 1078312  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
            ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078311 --------ttgtgagatgaacctacaaaaatat-cctaatacattaggtgtacaatgaggtgcaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 1078229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 274 - 469
Target Start/End: Original strand, 53273600 - 53273786
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         | ||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  53273600 agagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacac---------ctacacaaaattctgatacgtggtaacctggatcccacataaataaaagata 53273690  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  53273691 aagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtataggaataaatgatgttcatataacattttcctt 53273786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 306 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 51249469 - 51249323
Alignment:
Q  306 aatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 405  Q
    ||||||||| |||||  || | |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51249469 aatacactccttacattcatacaaaattctgacatgtggcaatctggatcccacacaaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaata 51249370  T
Q  406 tccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgtt 452  Q
    ||| |||| |||| |||||| |||| | ||   ||||||||||||||    
T  51249369 tccttaatgcatgaggtgtataatgggttgggtgaataaagggtgtt 51249323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 365 - 471
Target Start/End: Original strand, 29558232 - 29558338
Alignment:
Q  365 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattt 464  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  29558232 tagaaaataaaatgtgattgtgagatgaatttaccaatatattcctaatatatagggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgttcatataacattg 29558331  T
Q  465 tcctttt 471  Q
    |||||||    
T  29558332 tcctttt 29558338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 368 - 473
Target Start/End: Original strand, 4190266 - 4190371
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4190266 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatctctaatacataaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 4190365  T
Q  468 ttttta 473  Q
    ||||||    
T  4190366 ttttta 4190371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 379 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25996356 - 25996267
Alignment:
Q  379 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25996356 tggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatatatggggtgtacaataagatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 25996267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 368 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 9434223 - 9434120
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat-gagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9434223 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagag-tgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttc 9434125  T
Q  467 ctttt 471  Q
    |||||    
T  9434124 ctttt 9434120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 300 - 471
Target Start/End: Original strand, 11064655 - 11064824
Alignment:
Q  300 tgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 399  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| | | |    
T  11064655 tgtgacaatacaccccttacacccacacaaaattttgacatgtggtaatctagaccccacacaaatagaagagtaagtgtgattatgagatgaattaatc 11064754  T
Q  400 aaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  11064755 aaaatatctctaaagcatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttca--taacattttcctttt 11064824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Original strand, 10457893 - 10457994
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  10457893 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 10457992  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  10457993 tt 10457994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Original strand, 52627978 - 52628079
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  52627978 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatacttaatgcatgaggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcacgtaacattttcc 52628077  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  52628078 tt 52628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 365
Target Start/End: Original strand, 29556866 - 29556956
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaat 365  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  29556866 agagtggtgatacatgtaccactacatgtggcaatacacaatttacacccatataaaa-tctgacatgtggcaacctgaaccccacacaaat 29556956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 34791928 - 34791824
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||| ||| ||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34791928 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattattaaaatgtccctaatgcatgaggtttacaatatggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 34791829  T
Q  468 ttttt 472  Q
     ||||    
T  34791828 atttt 34791824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 51757692 - 51757593
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||  | |||| || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  51757692 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatgtccataatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttatgtaatattttcc 51757593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9434316 - 9434244
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9434316 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 9434244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19148950 - 19148882
Alignment:
Q  285 acatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttgga 353  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  19148950 acatgtacacccccatgtggcaatacaccacttacacccacacaaaattctgacatatggcaacctgga 19148882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26141606 - 26141543
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttta-cacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaa 363  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  26141606 gtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaa 26141543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20764989 - 20764932
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttta-cacccacataaaattctgacacgtggcaacttggacccc 357  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  20764989 gtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggacccc 20764932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 471
Target Start/End: Original strand, 47532018 - 47532051
Alignment:
Q  438 ggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47532018 ggaataaagggtgtttatgtaacattttcctttt 47532051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51757784 - 51757713
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  51757784 gagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatatacctcttacacccacacacaatcctgacatgtggcaa 51757713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 275 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5489968 - 5489772
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5489968 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 5489869  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5489868 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 5489772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Original strand, 43570994 - 43571186
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43570994 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43571093  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43571094 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 43571186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 275 - 469
Target Start/End: Original strand, 48498870 - 48499064
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48498870 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 48498969  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48498970 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcctt 48499064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 274 - 470
Target Start/End: Original strand, 24769406 - 24769602
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24769406 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 24769505  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24769506 aagtgtggttgtgataagaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggagtgtagaaataaaaggtgttcatgaaacattttccttt 24769602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7448018 - 7447828
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7448018 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 7447919  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7447918 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctgtaatacat-gggtgtacaatgggatgtaggaataaaggatgttcatgtaacatttt 7447828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4401523 - 4401329
Alignment:
Q  272 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4401523 ttagagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcatattggaccccacacaaatagaaga 4401424  T
Q  372 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaat-aaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4401423 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaatgaagtgtaggaataaaagagtgttcatgtatcatttt 4401329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 276 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 37814969 - 37814768
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaa 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37814969 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccatataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaa 37814870  T
Q  376 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttatt 475  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37814869 gtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcccttttttt 37814770  T
Q  476 tt 477  Q
    ||    
T  37814769 tt 37814768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Original strand, 750212 - 750406
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  750212 agagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaatagaagata 750311  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  750312 aagtgtggttttgagatgaatttatcaaaatatccctgatacatggggtgtacaatggggtgtaggaaataagggtgttcacgtaacattttcct 750406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 272 - 467
Target Start/End: Original strand, 50448165 - 50448360
Alignment:
Q  272 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaaga 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  50448165 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacatggaacccacaaaaatagaaga 50448264  T
Q  372 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50448265 taaaatgtggttgtaagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcc 50448360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 273 - 465
Target Start/End: Original strand, 2497468 - 2497660
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||| |||    
T  2497468 tagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttatacccacataaaattctgacacgtgacaatctggatcccacataaatagatgat 2497567  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2497568 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccttaatatatggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 2497660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 470
Target Start/End: Original strand, 23989431 - 23989627
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23989431 gagtggtgatacatgtaccaccctatatggcaatacaccctttacacccacacaagattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 23989530  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaa-tgagatgtaggaat-aaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989531 agtgtggttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatacatagggtatacaattgag-tgtatgaataaaagggtgttcatgtaacattttccttt 23989627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 273 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4888236 - 4888055
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  4888236 tagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaatatatcctttacatccacacaaaattctgatacatggcaatttggacaccacacaaatagaaaat 4888138  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4888137 aaagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatccctaatacatgg------------gatgtaggaataaagggcgttcatgtaacattttcc 4888055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 44112776 - 44112675
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44112776 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 44112677  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  44112676 tt 44112675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 38336017 - 38335918
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38336017 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 38335918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 48119727 - 48119628
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48119727 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 48119628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 35003393 - 35003294
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35003393 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 35003294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 46168482 - 46168383
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46168482 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcattgggtgtacaataggatatatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 46168383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Original strand, 45639733 - 45639834
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45639733 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaataggatgtatgattaaagagtgttcatgtaacattttcc 45639832  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  45639833 tt 45639834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41065252 - 41065152
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||   | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41065252 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgcccctaatgcatggggtgtacaacagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 41065153  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  41065152 t 41065152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Original strand, 45427746 - 45427846
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  | |||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  45427746 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtattcatgtaacattttcc 45427845  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  45427846 t 45427846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 468
Target Start/End: Original strand, 38113202 - 38113296
Alignment:
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38113202 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacattttcct 38113296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 45705924 - 45705824
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  45705924 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatgtccataatgcatggagtgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatataacattttcc 45705825  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  45705824 t 45705824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 35000114 - 35000213
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat-gagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||  || |||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  35000114 aagagaaagtatggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatacatgaagtatacaatagag-tgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttc 35000212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 26585561 - 26585460
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    |||| || |||||  ||||||| |||||||||||    
T  26585561 aagagaaagtatgattgcgagatgaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatatagtgtatgattaaagaatgttcatctaacattttcc 26585462  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  26585461 tt 26585460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35003487 - 35003414
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  35003487 agagtggtgatacatgcacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44112870 - 44112797
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44112870 agagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 44112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45706017 - 45705945
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  45706017 gagtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 45705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14427404 - 14427345
Alignment:
Q  410 taatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||| |||| ||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14427404 taatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 14427345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48119814 - 48119748
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  48119814 tgatacatgtacacccccacgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 48119748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23597165 - 23597120
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttt-acacccacataaaattctgacacgtggc 345  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  23597165 gtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggc 23597120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 35000021 - 35000093
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaataca-ctctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  35000021 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctc-ttacacccatacaaaatcctgacatgtggcaa 35000093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 312
Target Start/End: Original strand, 45427649 - 45427690
Alignment:
Q  271 tttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacac 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45427649 tttagagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacac 45427690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 37649224 - 37649268
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttt-acacccacataaaattctgacacgtgg 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37649224 gtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtgg 37649268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 45639640 - 45639712
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  45639640 gagtggtgatacatgtacacccccttgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 45639712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 273 - 472
Target Start/End: Original strand, 36743389 - 36743588
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36743389 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 36743488  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743489 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 36743588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 280 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 29705549 - 29705352
Alignment:
Q  280 atgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29705549 atgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaatagaagataaagtgt 29705450  T
Q  380 ggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttatttt 477  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29705449 ggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccattttttttt 29705352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 273 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 11582960 - 11582766
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11582960 tagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 11582861  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582860 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 11582766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 274 - 472
Target Start/End: Original strand, 30660649 - 30660847
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30660649 agagtgatgatacatgtatcatcctatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30660748  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660749 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 30660847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Original strand, 30912469 - 30912660
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30912469 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagata 30912568  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30912569 aggtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatacccctaatacatgaagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 30912660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 275 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2547188 - 2546995
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2547188 gagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataa 2547089  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2547088 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcct 2546995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 276 - 468
Target Start/End: Original strand, 42197344 - 42197536
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42197344 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaa 42197443  T
Q  376 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42197444 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagtgtgtgcaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacattttcct 42197536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 281 - 465
Target Start/End: Original strand, 29800864 - 29801048
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29800864 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtgtg 29800963  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29800964 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 29801048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 275 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31384856 - 31384653
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31384856 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacatccacataaaattctgacacgtagcaacctggaccccacacaaatagaagataa 31384757  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttat 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |    
T  31384756 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaatagaatgtaagaataaagggtgttcatgtaatactttcctattttt 31384657  T
Q  475 ttta 478  Q
    ||||    
T  31384656 ttta 31384653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 275 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 42295386 - 42295191
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42295386 gagtgatgataaatgtaccatcctatgtggcaatataccctttacatccacacaaaattctgacatgtggcaacttggaccc-acataaatagaagataa 42295288  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42295287 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttttctttt 42295191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20148953 - 20148762
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||    
T  20148953 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 20148854  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20148853 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 20148762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 269 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 45397513 - 45397317
Alignment:
Q  269 tttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaataga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  45397513 tttttagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaacacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaatctggagcccacacaaataga 45397415  T
Q  369 agataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45397414 agataaattgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtagaatggggtgtaggaataaagggtgttcacgtaacattttc 45397317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 279 - 467
Target Start/End: Original strand, 2165875 - 2166063
Alignment:
Q  279 gatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtg 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2165875 gatgatacatgtaccatcccatgtgacaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaaccccacacaaatagaagataaagtg 2165974  T
Q  379 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2165975 tggttatgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtatacaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaatattttcc 2166063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 276 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26125825 - 26125637
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaa 375  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26125825 agtggtgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccgcataaaattctgacacgtggcaatctggaccc-acataaatagaagataaa 26125727  T
Q  376 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26125726 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 26125637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 298 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5755072 - 5754900
Alignment:
Q  298 catgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaactta 397  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755072 catggggcaatacaccctttacacccacacaaaattctaacacgtggcaacttggatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaactta 5754973  T
Q  398 ccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5754972 ccaaaatatccctaatatatgggatgtacaatgggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 5754900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9241744 - 9241594
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9241744 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacaccctttgcacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 9241645  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgta 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  9241644 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgta 9241594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3743963 - 3743767
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||    
T  3743963 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtagcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctgaaccctacataaatagaagataa 3743864  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||| || | | |||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  3743863 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatacttaatatatggggtgtataatgggagggatgaataaagggtgtatatggaacatttttctttt 3743767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 274 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1375735 - 1375542
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  1375735 agagtggtgatacatgtaccaccctatgtgacaatacattctttacacccacacaagattctaacacgtggcaatctgaactccacacaaatagaagata 1375636  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1375635 aagtgtagttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaaaattttcc 1375542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 468
Target Start/End: Original strand, 40528582 - 40528736
Alignment:
Q  315 tttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 414  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  40528582 tttacatccacacaaaattatgacatgtgacaacttgaaccccacacaaatagaagagaaagtgtggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaata 40528681  T
Q  415 catggggtgtacaatgagatgtaggaat-aaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
     ||||||||||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  40528682 tatggggtgtacaatggggtttgtgaataaaagggtgttcatgtattattttcct 40528736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 42699353 - 42699259
Alignment:
Q  371 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42699353 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccataatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 42699259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 368 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 35181615 - 35181513
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35181615 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 35181516  T
Q  468 ttt 470  Q
    |||    
T  35181515 ttt 35181513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Original strand, 18066719 - 18066819
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18066719 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatatccctaatacatgggatgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 18066818  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  18066819 t 18066819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 34304887 - 34304786
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  34304887 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 34304788  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  34304787 tt 34304786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 368 - 472
Target Start/End: Original strand, 33629994 - 33630098
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| |    
T  33629994 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattactaaaatgtccctaatgcatagggtgtacaatgaggtgtatgattaaagggtgttcgtgtaacatttttc 33630093  T
Q  468 ttttt 472  Q
    |||||    
T  33630094 ttttt 33630098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 468
Target Start/End: Original strand, 16603633 - 16603727
Alignment:
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16603633 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtctttaatgcatggggtgtataataaggtgtatgattaaagggtgtgcatgtaacattttcct 16603727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 10678054 - 10678132
Alignment:
Q  269 tttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaataca-ctctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  10678054 tttttggagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctc-ttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10678132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 471
Target Start/End: Original strand, 16358839 - 16358938
Alignment:
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttc-atgtaacattttcctttt 471  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||  | |||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16358839 aaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatattcttaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtcttcaatgtaacattttcttttt 16358938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Original strand, 10678153 - 10678210
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgta 425  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  10678153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatatatggggtgta 10678210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28977179 - 28977146
Alignment:
Q  434 tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977179 tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 28977146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34304980 - 34304908
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  34304980 agagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatacacctcttacacccaaacaaaatcctgacatgtggcaa 34304908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35181712 - 35181636
Alignment:
Q  271 tttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  35181712 tttagagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35181636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 472
Target Start/End: Original strand, 19386645 - 19386675
Alignment:
Q  442 taaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19386645 taaagggtgttcatgtaacattttccttttt 19386675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 347
Target Start/End: Original strand, 18066653 - 18066698
Alignment:
Q  302 tggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18066653 tggcaatacacctcttacacccacataaaattctgacatgtggcaa 18066698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20075008 - 20074964
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttt-acacccacataaaattctgacacgtgg 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  20075008 gtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgg 20074964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 413
Target Start/End: Original strand, 32328815 - 32328863
Alignment:
Q  365 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaat 413  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32328815 tagaagagaaagtatagttgtgagataaacttaccaaaatattcctaat 32328863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 33629901 - 33629973
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  33629901 gagtggtgatatatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacctacacaaaattttgacatgtggcaa 33629973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 270 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33703338 - 33703139
Alignment:
Q  270 ttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33703338 tttttgagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaatagaa 33703239  T
Q  370 gataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703238 gataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 33703139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 35017924 - 35017733
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017924 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 35017825  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017824 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccct-atacatggggtgtacaatgagatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 35017733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 274 - 469
Target Start/End: Original strand, 1771173 - 1771368
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1771173 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgagacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 1771272  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1771273 aaatgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 1771368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 274 - 469
Target Start/End: Original strand, 28982729 - 28982924
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28982729 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 28982828  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28982829 aagtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgggatgtacaatagggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 28982924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 274 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27550502 - 27550309
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27550502 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagata 27550403  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27550402 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcc 27550309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 269 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23036178 - 23035975
Alignment:
Q  269 tttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaataga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23036178 tttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaataga 23036079  T
Q  369 agataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23036078 agataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgtacaatagggtgtaggaataaaggaggttcatgtaacattttcct 23035979  T
Q  469 tttt 472  Q
    ||||    
T  23035978 tttt 23035975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 275 - 465
Target Start/End: Original strand, 43514594 - 43514784
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43514594 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacaaaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataa 43514693  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43514694 ggtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatgaagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 43514784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 274 - 470
Target Start/End: Original strand, 55966253 - 55966449
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  55966253 agagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacaggtggcaatctagaccccacataaatagaagata 55966352  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55966353 aattgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 55966449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 275 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25051885 - 25051691
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25051885 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatcatttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataa 25051786  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25051785 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagtgtgttcatgtgacattttcctt 25051691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 275 - 465
Target Start/End: Original strand, 27893750 - 27893940
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||    
T  27893750 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 27893849  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27893850 agtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 27893940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 274 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27864757 - 27864561
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||| |||||||| |||    
T  27864757 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaata 27864658  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27864657 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttccttt 27864561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 43735935 - 43735744
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43735935 agagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtgacaacttggatcccacacaaatagaagata 43735836  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43735835 aagtgtgattgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggaatgtataatgagatgtaggaataaaggatgttcatgtaatatttt 43735744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 275 - 464
Target Start/End: Original strand, 23204686 - 23204875
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23204686 gagtgatgatacacgtaccatcccatgtggcaatatatcctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 23204785  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattt 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23204786 agtgtggttgtgacatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatgggatgtaggaataaagagtgttcatgtaacattt 23204875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 275 - 474
Target Start/End: Original strand, 43949709 - 43949909
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43949709 gagtgatgatacatgtaccaccctatttggcaatacaccctttatacccatacaaaattctgacacgtggcatattggatcccgcacaaatagaagataa 43949808  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaat-aaagggtgttcatgtaacattttccttttta 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  43949809 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgcaggaataaaagggtgttcatgtatcatttttcatttta 43949908  T
Q  474 t 474  Q
    |    
T  43949909 t 43949909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 273 - 467
Target Start/End: Original strand, 27316618 - 27316813
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaa-ttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaaga 371  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  27316618 tagagtgatgatacatttatcatcccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaaattctgacacgtggcaacttggactccaaataaatagaaga 27316717  T
Q  372 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27316718 taaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccttaatacatggggtgtataatgaggtgtaggaataaagggtgttcgtttaacattttcc 27316813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 281 - 468
Target Start/End: Original strand, 48463364 - 48463551
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  48463364 tgatacatgtaccactctatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagtatg 48463463  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48463464 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttcct 48463551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 272 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 31681097 - 31680904
Alignment:
Q  272 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaaga 371  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  31681097 ttagagtggtgatacatgtagcatcccatgtggcaatacaccctttacacctacataaaattctgacacgtggcaatctaaaccccacataaatagaaga 31680998  T
Q  372 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  31680997 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatacggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttacgtaacatttt 31680904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12497148 - 12496956
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12497148 gagtaatgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataa 12497049  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12497048 agtgtgattgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 12496956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 39631275 - 39631102
Alignment:
Q  293 caccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 392  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631275 caccccatgtgacaatacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtgacatattgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 39631176  T
Q  393 acttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaat-aaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  39631175 acttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggggttcatgtatcatttt 39631102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Original strand, 51512173 - 51512323
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttac-acccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  51512173 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaataca-tctttaatacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaataaaagata 51512271  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgta 425  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51512272 aagtgtggttataagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgta 51512323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 274 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28988665 - 28988470
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||| | |||| | || | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28988665 agagtggtgatacatgtacaccctcatgtgacaatacaccccttac-ctcatacaaaattctgacatatggcaacctggaccccacacaaatagaagaga 28988567  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28988566 aagtgtggttatgagatgaatttatcaaaatgtccctagtgcatggggtgtacaatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 28988470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 306 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41878567 - 41878407
Alignment:
Q  306 aatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 405  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41878567 aatacactctttacaccaacacaaaattctgacacgtgacaatctggaccccacacaaatagaagagaaggtttggttgtgagatgaacttatcaaaata 41878468  T
Q  406 tccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41878467 tccctaatggatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaagagtgttcatgtaacattttc 41878407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 281 - 472
Target Start/End: Original strand, 45490227 - 45490418
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |   |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  45490227 tgatacatgtagtaccctatgtggcaatatatcatttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagataaagtgtg 45490326  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  45490327 gttgtgagatgaatttactaaagtatccctaatacatgaggtgtacaattggatgtataaataaaatgtgttcatgtaacattttccatttt 45490418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21687199 - 21687005
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  21687199 agagtgatgatatatgtaccaacctatgtggcaatacattctttacattcacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccagacaaatagaagata 21687100  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||  | |||| |||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21687099 aagtatggttatgagatgaacttactaaaatatttctaatacataagatgtataatggggtgtaaaaataaaggatgttcatgtaacattttcct 21687005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 41848157 - 41847966
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41848157 tgatacatgtacacccccatgtggcaatacaccccttacatccacgcaaaattctgacatgtgacaatctgaaccccacacaaatagaagagaaagtgtg 41848058  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    |||||| |||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  41848057 gttgtgcgatgaatttgccaaaatgtctctaatgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaaaaaaggatgttcttgtaacattttccgtttt 41847966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Original strand, 41327478 - 41327641
Alignment:
Q  302 tggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaa 401  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41327478 tggcaatacaccccttacactcacaaaaaattctaacatgtggcaacctggaccccacacaaattgaagagaaagtgtggatgtgagatgaatttaccaa 41327577  T
Q  402 aatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||| ||| || | |||  ||||||||||| | |||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  41327578 aatgtccgtagtgcataaggtgtacaatggggtgtgtgaataaagggtgtctatgtaacatttt 41327641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 414
Target Start/End: Original strand, 46412389 - 46412516
Alignment:
Q  287 atgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtg 386  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46412389 atgtaccaccctatatgacaatatactttttacatctacacaaaattctgacacgtggcaatttaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtg 46412488  T
Q  387 agatgaacttaccaaaatatccctaata 414  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  46412489 agaagaacttaccaaaatatctctaata 46412516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 413
Target Start/End: Original strand, 56215802 - 56215943
Alignment:
Q  271 tttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaag 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  56215802 tttagagtggtgatacatgtacaccaccatgtggccatacacctcttacacccacacaaaattctgacatatagcaacctagaccccacacaaatag-ag 56215900  T
Q  371 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaat 413  Q
    | |||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  56215901 agaaagtgtggttgtgagataaattttccaaaatatcgctaat 56215943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 17619153 - 17619252
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  17619153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 17619252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 712059 - 711958
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  712059 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 711960  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  711959 tt 711958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 55272377 - 55272476
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat-gagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  55272377 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagag-tgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttc 55272475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 35037093 - 35037001
Alignment:
Q  379 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat-gagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35037093 tggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagag-tgtatggttaaagggtgctcatgtaacatttttctttt 35037001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 465
Target Start/End: Original strand, 3756252 - 3756344
Alignment:
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3756252 aaagtatgattgtgagataaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 3756344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32728456 - 32728356
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  32728456 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttactaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 32728357  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  32728356 t 32728356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Original strand, 48435580 - 48435680
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||  | |||  || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  48435580 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttcc 48435679  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  48435680 t 48435680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 960890 - 960972
Alignment:
Q  387 agatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaga-tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  960890 agatgaatttaccaaaatgtccctaatgtatagggtgtacaat-agagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 960972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19880153 - 19880074
Alignment:
Q  268 atttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19880153 attttgagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38851612 - 38851515
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||| |  |||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  38851612 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatgtccataatgcatggagtgtacattatgatgtatgattaaaggatattcatgtaacatttt 38851515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 55272284 - 55272356
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  55272284 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 55272356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19880053 - 19879992
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat 429  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19880053 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatgtccataatatatggggtgtacaat 19879992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 470
Target Start/End: Original strand, 46827721 - 46827809
Alignment:
Q  382 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaga-tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||||| || |||||||||  | | |||| ||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46827721 ttgtgagataaatttaccaaaacgttcttaatgcattgggtgtacaat-agagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttccttt 46827809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 347
Target Start/End: Original strand, 3756158 - 3756232
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatac-actctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  3756158 tagagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacaactc-ttacacccacataaaatcatgacatgtggcaa 3756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35037195 - 35037125
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  35037195 agtggtgatacatgtac-actccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35037125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 712146 - 712080
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  712146 tgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 712080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 17619059 - 17619132
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  17619059 agagtggtgatacatgtacatccccacctggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 17619132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Original strand, 36004117 - 36004174
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgta 425  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36004117 aagagaaagtatggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatatatggggtgta 36004174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 48435487 - 48435559
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaataca-ctctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  48435487 gagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacatctc-ttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 48435559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 468
Target Start/End: Original strand, 49229684 - 49229765
Alignment:
Q  387 agatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||  | |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49229684 agatgaatttaccagaatatccttaatgcatgaagtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatataacattttcct 49229765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30838825 - 30838631
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30838825 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacacctacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30838726  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838725 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 30838631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 274 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19047350 - 19047158
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19047350 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 19047251  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19047250 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 19047158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 1750606 - 1750409
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1750606 gagtgatgatatttgtaccaccccatgtggcaacacaccctttacactcacacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 1750507  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1750506 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccatttt 1750409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Original strand, 43490308 - 43490499
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  43490308 agagtgatgctacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 43490407  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43490408 aagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagagtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 43490499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 273 - 472
Target Start/End: Original strand, 4764632 - 4764831
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4764632 tagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 4764731  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4764732 aaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacatggggtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttccttttt 4764831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 272 - 470
Target Start/End: Original strand, 12302158 - 12302356
Alignment:
Q  272 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaaga 371  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12302158 ttagagcgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacatcctttacatccacacaaaattctgacacatggtaacctggaccccacataaatagaaga 12302257  T
Q  372 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302258 taaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 12302356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 275 - 469
Target Start/End: Original strand, 43335671 - 43335865
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  43335671 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaagataa 43335770  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  43335771 agtgtagttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtaggaataaatgatgttcatataacattttcctt 43335865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16096940 - 16096747
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggacccc-acacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  16096940 gagtgatgatacatgtaccacatcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttagacccccacataagtagaagata 16096841  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16096840 aagtgtggttgtgagattaactcaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 16096747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 276 - 467
Target Start/End: Original strand, 42849768 - 42849946
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42849768 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa-ataaa 42849866  T
Q  376 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42849867 gtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatgggg------------tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42849946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 274 - 466
Target Start/End: Original strand, 34817683 - 34817875
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | | ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||| |    
T  34817683 agagtgatgatacatgtacacccccatgtggcaatgctccccttacacccatacaaaattctgacatgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagaga 34817782  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | | || | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34817783 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatgtgcgtagtgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaagggtgttcatgtaacattttc 34817875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 308 - 472
Target Start/End: Original strand, 13780676 - 13780840
Alignment:
Q  308 tacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 407  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13780676 tacaccctttacacctatacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttatcaaaatatc 13780775  T
Q  408 cctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  13780776 cctaatgtatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaaatgtgttgatgtaacattttccatttt 13780840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42026956 - 42026766
Alignment:
Q  280 atgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgt 379  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  42026956 atgatacatgtacacctccatgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatcttgcaacctagaccccacacaaatagaaaagaaagtgt 42026857  T
Q  380 ggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaa--gggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||| |  ||| |||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42026856 agttgtgagatgaatttgccaaaatatccctaatgcgcgggatgtacaatggaatgtatgaataaattgggtgttcatgtaacattttcct 42026766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 429
Target Start/End: Original strand, 39149200 - 39149354
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| || || ||||| ||||||||| |||||    
T  39149200 tagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggtaatacaccttttacacccacacaaaattatgagacgtggtaatttagaccc-acacaaataaaagat 39149297  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat 429  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  39149298 aaagtgtagttgtgggatgaacttaccaaaatatctctaatacataggatgtacaat 39149354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 465
Target Start/End: Original strand, 8896544 - 8896681
Alignment:
Q  328 aaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtaca 427  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |  || |||||||||    
T  8896544 aaaattctgacatgtggcaacctgaacctcacacaaatagaaaagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatattcctattgtatagggtgtaca 8896643  T
Q  428 atgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8896644 atggaatgtgtgaataaagggtgttcatgtaacatttt 8896681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 373 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 33229396 - 33229303
Alignment:
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaat-aaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33229396 aaagtgtgattgtatgatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggtgttcatgtatcatttt 33229303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 368 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 43114656 - 43114554
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43114656 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 43114557  T
Q  468 ttt 470  Q
    |||    
T  43114556 ttt 43114554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 12415461 - 12415560
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12415461 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12415560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 12427521 - 12427620
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12427521 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12427620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 465
Target Start/End: Original strand, 11825655 - 11825752
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11825655 aagagaaagtatgattgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 11825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16804067 - 16803966
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16804067 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16803968  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  16803967 tt 16803966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16843349 - 16843248
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16843349 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16843250  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  16843249 tt 16843248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 465
Target Start/End: Original strand, 41281975 - 41282072
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41281975 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 41282072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18491798 - 18491704
Alignment:
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18491798 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgttcttaatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 18491704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 470
Target Start/End: Original strand, 34895742 - 34895844
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||  | |||  || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  34895742 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttcc 34895841  T
Q  468 ttt 470  Q
    |||    
T  34895842 ttt 34895844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Original strand, 966835 - 966936
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||  | | |||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  966835 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaacgttcttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 966934  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  966935 tt 966936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7070505 - 7070418
Alignment:
Q  378 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||| |||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7070505 gtggttgtaagatgaatttatcaaaatgtccccaataaatggaggttacaatgggatgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 7070418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 437
Target Start/End: Original strand, 4451951 - 4452020
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgta 437  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  4451951 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatgcatatggtgtacaataagatgta 4452020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 465
Target Start/End: Original strand, 6518484 - 6518566
Alignment:
Q  382 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat-gagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  6518484 ttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagag-tgtatgattaaa-ggtgttcatgtaacatttt 6518566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 34895648 - 34895721
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  34895648 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 34895721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 11825562 - 11825634
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  11825562 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 11825634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 465
Target Start/End: Original strand, 4299435 - 4299518
Alignment:
Q  382 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||  | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  4299435 ttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacatttt 4299518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 6518401 - 6518474
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  6518401 agagtggtgatacatgtacacctccatgtgtcaatacaccttttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 6518474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 12531570 - 12531643
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12531570 agagtgatgatacatgtacacctccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 12531643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18491898 - 18491825
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  18491898 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 18491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 41281881 - 41281954
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  41281881 agagtggtgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 41281954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 966742 - 966814
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  966742 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggaaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 966814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43114749 - 43114677
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  43114749 gagtggtgatacatgtacaccctcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacaagtggcaa 43114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14285758 - 14285675
Alignment:
Q  385 tgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||  | |||| || |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  14285758 tgagatgaatttaccaaaatatctttaatatatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttgtgtaatattttcct 14285675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40613976 - 40613913
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttt-acacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaa 363  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  40613976 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaa 40613913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 363
Target Start/End: Original strand, 42257237 - 42257282
Alignment:
Q  318 acacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaa 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  42257237 acacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaa 42257282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 12415368 - 12415432
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgaca 339  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12415368 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaattctgaca 12415432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 12427428 - 12427492
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgaca 339  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12427428 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaattctgaca 12427492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16804160 - 16804088
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| || || ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16804160 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16804088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16843442 - 16843370
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| || || ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16843442 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16843370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 274 - 470
Target Start/End: Original strand, 7273242 - 7273438
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7273242 agagtgatgatgcatgtaccaccccatgtggtaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 7273341  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273342 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaataaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 7273438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 281 - 473
Target Start/End: Original strand, 26669923 - 26670115
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26669923 tgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagataaagtgtg 26670022  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttta 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670023 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttta 26670115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Original strand, 9698240 - 9698434
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9698240 agagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 9698339  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698340 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21280122 - 21279928
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21280122 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 21280023  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21280022 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatacatgggatgtgcaatggaatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 21279928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 274 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3213593 - 3213397
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  3213593 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 3213494  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3213493 aagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 3213397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 281 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 7292933 - 7292743
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292933 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacacaaacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 7292834  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7292833 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaatggtgttcttgtaacattttcctttt 7292743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 275 - 465
Target Start/End: Original strand, 24203895 - 24204085
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24203895 gagtgatgatacatgtaccactccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaatataa 24203994  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24203995 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacatttt 24204085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 278 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7367738 - 7367546
Alignment:
Q  278 tgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  7367738 tgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaaaataaagt 7367639  T
Q  378 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  7367638 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttcatataacattttccttt 7367546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 272 - 468
Target Start/End: Original strand, 21293582 - 21293778
Alignment:
Q  272 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaaga 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  21293582 ttagagtggtgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaaga 21293681  T
Q  372 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21293682 taaagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacagtgaaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcct 21293778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 276 - 467
Target Start/End: Original strand, 13743130 - 13743321
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaa 375  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13743130 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13743229  T
Q  376 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13743230 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13743321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 276 - 467
Target Start/End: Original strand, 13748630 - 13748821
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaa 375  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13748630 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13748729  T
Q  376 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13748730 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13748821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 276 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 30014534 - 30014343
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaa 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30014534 agtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggaccccatataaatagaagataaa 30014435  T
Q  376 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30014434 gtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatgcctaatacatgggatgtataatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 30014343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 268 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30736181 - 30735984
Alignment:
Q  268 atttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatag 367  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30736181 attttttgagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatag 30736082  T
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30736081 aagataaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatcactaatacatgaggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgttcatgtaacatttt 30735984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 274 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26466992 - 26466795
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  26466992 agagtgatgatacatttaccaccctatgtggcaatacaccttttacacccatacaaaatcctgatacgtggcaacctgaaccccaaacaaatagaagata 26466893  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26466892 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatggagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgtttatgtaacattttcctttt 26466795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33242502 - 33242401
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  33242502 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatacatggggtgtacaataaggtgtatgattaaatggtgttcatgtaacattttcc 33242403  T
Q  468 tt 469  Q
    ||    
T  33242402 tt 33242401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27441641 - 27441544
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27441641 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 27441544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Original strand, 31109223 - 31109323
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||| |||||| || || |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31109223 aagagaaaatgtggtcgtaagttgaatttatcaaaatatccctagtgcatggggtgtataatgggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 31109322  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  31109323 t 31109323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 33254012 - 33253913
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||  | |||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  33254012 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacattttcc 33253913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27441735 - 27441662
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27441735 agagtggtgatacatgtacacacccatgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 27441662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33242595 - 33242523
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33242595 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 33242523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33254108 - 33254034
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  33254108 tagagtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacaccttttatacccacacaaaatccggacatgtggcaa 33254034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 281 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 871 - 679
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  871 tgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagataaagtgtg 772  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttta 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  771 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttta 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 273 - 467
Target Start/End: Original strand, 24000918 - 24001112
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24000918 tagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 24001017  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001018 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 24001112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Original strand, 42538339 - 42538531
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42538339 gagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 42538438  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538439 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 281 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5015581 - 5015390
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015581 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacactcacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 5015482  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5015481 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttccttttt 5015390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 274 - 467
Target Start/End: Original strand, 5810831 - 5811024
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5810831 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacatgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 5810930  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5810931 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatatatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtggtcatgtaacattttcc 5811024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 270 - 465
Target Start/End: Original strand, 44416837 - 44417032
Alignment:
Q  270 ttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44416837 ttttagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa 44416936  T
Q  370 gataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44416937 gataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttt 44417032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 35069914 - 35069720
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35069914 agagtgatgatacatgtaccatcctatgtggcaatatatcctttacatctacacaaaattctgacacgtggcaacttggacctcacataaatagaagata 35069815  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35069814 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagagtgttcatgtaacattttcct 35069720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 275 - 458
Target Start/End: Original strand, 32029725 - 32029908
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32029725 gagtcatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataa 32029824  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgta 458  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||    
T  32029825 agtgtggttgttagatgaatttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgtttatgta 32029908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44326371 - 44326180
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||    
T  44326371 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 44326272  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44326271 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 44326180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 273 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 42973046 - 42972852
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42973046 tagagtaatgatacatgtactatcctatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 42972947  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42972946 aaaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtaggaataaaggatgttcaggtaacattttcc 42972852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 275 - 465
Target Start/End: Original strand, 43343532 - 43343722
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43343532 gagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43343631  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43343632 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttt 43343722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Original strand, 16180264 - 16180454
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16180264 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 16180363  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16180364 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacgtggggtgtacaatg-ggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacatttt 16180454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 278 - 451
Target Start/End: Original strand, 27393171 - 27393344
Alignment:
Q  278 tgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27393171 tgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcctttacacccacataaaattctgacatgaggcaacctggaccccacataaatagaagataaagt 27393270  T
Q  378 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgt 451  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27393271 gtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagagtgtacaataggatgtaggaataaagggtgt 27393344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 275 - 464
Target Start/End: Original strand, 26898310 - 26898499
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26898310 gagtggtgatacatgtaccatcctatgtggcaatacaccttttacacccacataaaattctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaatataa 26898409  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattt 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26898410 agtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggaatgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattt 26898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 275 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41861868 - 41861672
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41861868 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccatacaaatagaagataa 41861769  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccc--taatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41861768 agtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatctctataatacatagggtgtataattgggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 41861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 274 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 45326213 - 45326020
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||| ||||||||||||    
T  45326213 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatacaccatttacacccacataaaattctgacaggtggtagtctggaccccacataaatagaagata 45326114  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  45326113 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatgtgatgtatgaataaaaggtgtttatgtaacactttcc 45326020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 275 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 10573941 - 10573751
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||| |||||||||||||    
T  10573941 gagtggtgatacatgtaccaccgcatgtgacaatatatcctttacacccacataaaattctgatatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 10573842  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10573841 agtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaataggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 10573751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 274 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9216494 - 9216301
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9216494 agagggatgatatatataccaccccatgtgacaatacaccttttacatccacacaaaattctgacatgcggcaacttaaaccccacacaaatagaagata 9216395  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9216394 aaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatgcat-gggtgtacaataggatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9216301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 293 - 430
Target Start/End: Original strand, 38160505 - 38160642
Alignment:
Q  293 caccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 392  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38160505 caccccatgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatga 38160604  T
Q  393 acttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatg 430  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38160605 agttactaaaatatccctaatacatggggtgtacaatg 38160642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Original strand, 4638106 - 4638297
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4638106 agagtggtgatacatgtaccaccctacgtgacaatacaccctttacatccatacaagattctgacacgtggtaacctagaccccacacaaatagaagata 4638205  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaa-tgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4638206 aagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccataatatatggggtgtacaattgag-tgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 4638297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43317635 - 43317442
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| ||||||||||||  ||   ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||  |    
T  43317635 gagtggtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 43317536  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43317535 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccctaaagcataggatgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcct 43317442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 300 - 468
Target Start/End: Original strand, 5194164 - 5194332
Alignment:
Q  300 tgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 399  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |    
T  5194164 tgtggcaatacaacccttacacccacacaaaattttgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagtaagtgtgattgtgagatgaatttatc 5194263  T
Q  400 aaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5194264 aaaatatccttaaaacatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcct 5194332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 328 - 468
Target Start/End: Original strand, 24280557 - 24280697
Alignment:
Q  328 aaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtaca 427  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||| |||| |    
T  24280557 aaaattctgatatatggcaacttggaccccacacaaatagaagagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatatttctagtgcatgggatgtaga 24280656  T
Q  428 atgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24280657 atagggtgtatgaataaagggtgttcacgtaacattttcct 24280697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 379 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 40237007 - 40236916
Alignment:
Q  379 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237007 tggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttccttt 40236916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 387
Target Start/End: Original strand, 47279631 - 47279744
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||| ||  |||| || | | ||||||||||||    
T  47279631 agagtggtgatacatgtaccatcccatctgacaatacaccctttatacccacataaaattctgatatgtggtaatctggatcctatataaatagaagata 47279730  T
Q  374 aagtgtggttgtga 387  Q
    ||||||||||||||    
T  47279731 aagtgtggttgtga 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 31513386 - 31513287
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31513386 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtatacaatagggtgtatgattaaagagtgttcatgtaacattttcc 31513287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 466
Target Start/End: Original strand, 31408634 - 31408732
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat-gagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31408634 aagagaaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaatagag-tgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttc 31408732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 470
Target Start/End: Original strand, 27535232 - 27535334
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaga-tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27535232 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattaccaaaatgtctttaacacatggagtgtacaat-agagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttc 27535330  T
Q  467 cttt 470  Q
    ||||    
T  27535331 cttt 27535334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 39998475 - 39998408
Alignment:
Q  400 aaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  39998475 aaaatatccctaatacatggggtgtacaataggatgtatgattaaaatgtgttcatgtaacattttcc 39998408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 33384970 - 33384866
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaat-gagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | | |||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  33384970 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccctaatgcatggagtatacaataggggtgtatgattaaatgatgttcatgtaacattttc 33384871  T
Q  467 ctttt 471  Q
    |||||    
T  33384870 ctttt 33384866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40237114 - 40237039
Alignment:
Q  272 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40237114 ttagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 40237039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 31408540 - 31408613
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31408540 agagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 31408613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 468
Target Start/End: Original strand, 38160659 - 38160695
Alignment:
Q  432 gatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38160659 gatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 38160695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 47279744 - 47279798
Alignment:
Q  414 acatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  47279744 acatggggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtatttatgtaatattttcct 47279798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46033875 - 46033831
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttta-cacccacataaaattctgacacgtgg 344  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46033875 gtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtgg 46033831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 273 - 467
Target Start/End: Original strand, 2614555 - 2614749
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2614555 tagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 2614654  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614655 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 2614749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 275 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18034174 - 18033980
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18034174 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccatataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 18034075  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034074 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 18033980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Original strand, 41334571 - 41334763
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41334571 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 41334670  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334671 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 41334763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 273 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33801663 - 33801467
Alignment:
Q  273 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 372  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33801663 tagagtgatgatatatgtaccttcccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagat 33801564  T
Q  373 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33801563 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaatggggtgtagaaataaaggatgttcatgtaacattttcctt 33801467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5257190 - 5256992
Alignment:
Q  272 ttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaaga 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  5257190 ttagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaaga 5257091  T
Q  372 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  5257090 taaagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttttcttt 5256992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 300 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22512472 - 22512305
Alignment:
Q  300 tgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 399  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512472 tgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 22512373  T
Q  400 aaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512372 aaaatatccctaatacatggagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 22512305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 274 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 7617326 - 7617129
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||| ||||||||||||    
T  7617326 agagtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccttttacaccaacacaaaattctgacatgtgacaacttagatcccacataaatagaagata 7617227  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617226 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggagtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 7617129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 281 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 38470765 - 38470577
Alignment:
Q  281 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 380  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38470765 tgatacatgtaccacctcatatggcaatacaccctttacacccacataaaattctgatacgtggtaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 38470666  T
Q  381 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38470665 attgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcctt 38470577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 274 - 465
Target Start/End: Original strand, 25914903 - 25915085
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25914903 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 25915002  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
            || |||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25915003 --------ttatgagatgaacctacaaaaatat-tctaatacattgggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 25915085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 468
Target Start/End: Original strand, 39122381 - 39122533
Alignment:
Q  315 tttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 414  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39122381 tttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaata 39122480  T
Q  415 catggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    ||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  39122481 cat-gggtgtctaattagatgtatgaataaaaggtgttcatgtaatagtttcct 39122533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 32473395 - 32473494
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32473395 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatgcatgtggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 32473494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 392 - 467
Target Start/End: Original strand, 33855068 - 33855143
Alignment:
Q  392 aacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33855068 aacttaccaaaatgttcctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 33855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 380
Target Start/End: Original strand, 39122263 - 39122369
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  39122263 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagata 39122362  T
Q  374 aagtgtg 380  Q
    |||||||    
T  39122363 aagtgtg 39122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17208173 - 17208073
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17208173 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaataaagtgtatgattaaagggtgttcacgtaacattttcc 17208074  T
Q  468 t 468  Q
    |    
T  17208073 t 17208073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 472
Target Start/End: Original strand, 30622720 - 30622823
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| | ||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  30622720 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatgggct-tacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 30622818  T
Q  468 ttttt 472  Q
    |||||    
T  30622819 ttttt 30622823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 30622621 - 30622699
Alignment:
Q  269 tttttagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  30622621 ttttttgagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattttgacatgtggcaa 30622699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Original strand, 32473303 - 32473374
Alignment:
Q  276 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32473303 agtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 32473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 364
Target Start/End: Original strand, 28177801 - 28177865
Alignment:
Q  301 gtggcaatacactcttt-acacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 364  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  28177801 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaa 28177865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 274 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 112848 - 112656
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  112848 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 112749  T
Q  374 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112748 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 112656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 468
Target Start/End: Original strand, 14097 - 14289
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14097 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 14195  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14196 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 14289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 468
Target Start/End: Original strand, 24425 - 24617
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24425 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 24523  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24524 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 275 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11249
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11443 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacactatttacacctacacaaaattctgacacgtagcaacttggaccccacatcaatagaagataa 11344  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11343 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatggggtgtatgaataaagtgtgttcatgtgacattttcctt 11249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Original strand, 23329 - 23521
Alignment:
Q  275 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23329 gagtaatgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataa 23428  T
Q  375 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23429 agtgtgattgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 23521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 465
Target Start/End: Original strand, 45720 - 45817
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 465  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45720 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 45817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45699
Alignment:
Q  274 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45626 agagtggtgatacatgtacacacccatgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 45699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 35457 - 35556
Alignment:
Q  368 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 467  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||  | |||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  35457 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatatggtgtatgattaaatggtgtttatgtaacattttcc 35556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 207 times since January 2019
Visitors: 952