View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9345-LTR4-TNT-insertion-8 (Length: 418)

Name: F9345-LTR4-TNT-insertion-8
Description: F9345-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9345-LTR4-TNT-insertion-8
F9345-LTR4-TNT-insertion-8
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (1-410)||(14182784-14183192)
chr8 (1-384)||(40717543-40717923)
chr8 (6-387)||(14191729-14192107)
chr8 (6-82)||(14200743-14200819)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (1-410)||(45645034-45645441)
chr4 (14-69)||(1390135-1390190)
chr4 (240-325)||(1397724-1397809)
chr4 (291-351)||(1390311-1390371)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (9-410)||(34302505-34302903)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (10-381)||(34645848-34646216)
chr5 (10-381)||(34665542-34665910)
chr5 (15-164)||(19649543-19649692)
chr5 (248-325)||(19649385-19649462)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (29-146)||(44491528-44491645)
chr2 (29-138)||(45396682-45396791)
chr2 (29-138)||(28402694-28402803)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 14182784 - 14183192
Alignment:
Q  1 cccaacatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14182784 cccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaag 14182883  T
Q  101 tttaaaccatcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14182884 tttaaaccatcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaattttt 14182983  T
Q  201 gtgaatatagtatctcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14182984 gtgaatatagtat-tcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatt 14183082  T
Q  301 tcctaaaactgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgcaagttctggtatagttggccttggaggtggaccagcatctcttatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14183083 tcctaaaactgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgcaagttctggtatagttggccttggaggtggaccagcatctcttatt 14183182  T
Q  401 acataattgg 410  Q
    ||| ||||||    
T  14183183 acacaattgg 14183192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 40717543 - 40717923
Alignment:
Q  1 cccaacatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  40717543 cccaccatttaagttatatggcattgttgacacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtgaacaatgttacaaccaaaccactcctaag 40717642  T
Q  101 tttaaaccatcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaattttt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||||| |  | |   |  |  |||||  |  || |||||||    
T  40717643 tttaaaccatcaaaatcatcaacttacaaaaatatcccatgttcatctaacctatgtcaatctgtgagaga---tatctcttgtaatgcccacaattttt 40717739  T
Q  201 gtgaatatagtatctcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatt 300  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||    
T  40717740 gtgaatatactatttcttatggagatcattcacattcacaaggagatcttagtgttgatactcttacattagagtcctctactggtggtcatatttcatt 40717839  T
Q  301 tcctaaaactgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgcaagttctggtatagttggccttggaggtgg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40717840 tcctaaaactgtgataggatgtggaaccaacaatacagtgtcgtttaaaggtgcaagctctggtatagttggccttggaggtgg 40717923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 387
Target Start/End: Original strand, 14191729 - 14192107
Alignment:
Q  6 catttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaa 105  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14191729 catttaagttatatggtattgttgataccggtagtgatattgtttggcttcaatgtgagccttgtcaagaatgttacaaccaaaccactcctatgtttaa 14191828  T
Q  106 accatcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaatttttgtgaa 205  Q
     || || |||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||  |  | ||| |||||  |    ||| | ||   ||||  ||  |||||| |||||||    
T  14191829 tccgtcgaaatcgtcaagttacaaaaacattccttgcccatcaaagttgtgtcaatctatg---gaagatacctcatgtaatgacaaaaattattgtgaa 14191925  T
Q  206 tatagtatctcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatttccta 305  Q
    |||  ||  | |||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||| | |  ||||||||||||    
T  14191926 tattctacttattatggtgataattcacattcaggaggagatcttagtgttgacactcttacattggaatccaccaatggacttacagtttcatttccta 14192025  T
Q  306 aaactgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgcaagttctggtatagttggccttggaggtggacc 387  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||   |||| | |||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||    
T  14192026 atattgtgataggatgtggaactaacaatattttgtcctatgaaggcgcaagctctggtatcgttggcttcggaagtggacc 14192107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 14200743 - 14200819
Alignment:
Q  6 catttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttac 82  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  14200743 catttaaggtatttggctttgttgatacaggtagtgaccttgtttggcttcaatgtgagccttgtaaacaatgttac 14200819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 45645034 - 45645441
Alignment:
Q  1 cccaacatttaagtt-atatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  45645034 cccaccatttaagtttatatggtattatcgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaatgttacaaccaaaccactcctaa 45645133  T
Q  100 gtttaaaccatcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaatttt 199  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||| | || | |     |  | ||  ||| |  || |||| ||||    
T  45645134 gtttaatccatcaaaatcatcaagttacataaacattccttgttcttctatcctatgtcactcagtg---agatctacctcttgcaatgaccaaattttt 45645230  T
Q  200 tgtgaatatagtatctcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcat 299  Q
    ||||||||||  ||    ||||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||   ||| ||||||    
T  45645231 tgtgaatatacaattaactatggagatgattcacattcacaaggagatcttagtgttgaaactcttacattggattccaccactggaagccctgtttcat 45645330  T
Q  300 ttcctaaaactgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgca-agttctggtatagttggccttggaggtggaccagcatctctta 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||| |||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  45645331 ttcctaaaactgtgataggatgtggaaataacaatac-gggtcgtttggaggtgcagggctctggtatagtgggccttggaggtggaccagtgtctctaa 45645429  T
Q  399 ttacataattgg 410  Q
    | ||| ||||||    
T  45645430 taacacaattgg 45645441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 1390135 - 1390190
Alignment:
Q  14 ttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttg 69  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  1390135 ttatatggtattgttgatacaggtagtgacatggtttggcttcaatgtaagccttg 1390190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 325
Target Start/End: Original strand, 1397724 - 1397809
Alignment:
Q  240 aaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatttcctaaaactgtgataggatgtgga 325  Q
    ||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||| || ||||   | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1397724 aaggagatcttagtttagaaactcttacattagattccacctctggttcttctatttcattgcctaaaactgtgataggttgtgga 1397809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 351
Target Start/End: Original strand, 1390311 - 1390371
Alignment:
Q  291 ctatttcatttcctaaaactgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaagg 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  1390311 ctatttcatttcctaaaacagtgataggttttggacataataatacattgtcatttgaagg 1390371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Original strand, 34302505 - 34302903
Alignment:
Q  9 ttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaaacc 108  Q
    |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34302505 ttaagtcatatggtattgtcgatacaggtagtgacattgtatggctacaatgcgagccttgtgaacaatgttacaatcaaaccactcctaagtttaatcc 34302604  T
Q  109 atcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaatttttgtgaatat 208  Q
    |||||| || || | ||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||| |     || | ||  ||| |  ||  ||||   ||| ||||||    
T  34302605 atcaaagtcatcgagttacaaaaacatttcttgttcgtctaaactatgtcaatctgtg---agagatacctcttgcaatgacaaaaaaaattgcgaatat 34302701  T
Q  209 agtatctcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatttcctaaaa 308  Q
      ||||  ||||||  || | ||||| ||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||  ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  34302702 tctatcaattatggcaatcaatcacattcacaaggagatcttagtcttgagactcttacattggaatctaccactgggcgtcctgtttcatttcctaaaa 34302801  T
Q  309 ctgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgcaagttctggtatagttggccttggaggtggaccagcatctcttattacataatt 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||| || | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||    
T  34302802 ctgttataggatgtggaactaacaatatagggtcgtttaaacgcgtaagctctggtgtagttggccttggaggtggacctgcatctctaataacacaatt 34302901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Original strand, 34645848 - 34646216
Alignment:
Q  10 taagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaaacca 109  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| |  ||||| |||    
T  34645848 taagatatatggtattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtgaacaatgttacaaccaaaccactcccatttttaatcca 34645947  T
Q  110 tcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaatttttgtgaatata 209  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||| |     ||   ||  ||| |  || ||||||| |||| ||||||    
T  34645948 tcaaaatcatctagttacaaaaacattccttgttcgtctaagctatgtcattctgtg---agagacacctcttgcagtgaccaaaattcttgtcaatata 34646044  T
Q  210 gtatctcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatttcctaaaac 309  Q
      ||   |||||| |||  |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||  |||  |||| |||||||||||||||     
T  34646045 aaattagttatggagattcttcacattcacaaggagatcttagtgttgatactctttcattggaatccaccagcggaagtcctgtttcatttcctaaaat 34646144  T
Q  310 tgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgcaagttctggtatagttggccttggagg 381  Q
     |||||||| ||||||||||| ||| | | | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646145 agtgataggttgtggaactgataatgcggggacgtttggaggcgcaagctctggtatagttggccttggagg 34646216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Original strand, 34665542 - 34665910
Alignment:
Q  10 taagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaaacca 109  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| |  ||||| |||    
T  34665542 taagatatacggtattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgtgagccttgtgaacaatgttacaaccaaaccactcccatttttaatcca 34665641  T
Q  110 tcaaaatcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctgggcaacaaggtgccgtttgtaccgatcaaaatttttgtgaatata 209  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||| |     ||   ||  ||| |  || ||||||| |||| ||||||    
T  34665642 tcaaaatcatctagttacaaaaacattccttgtttgtctaagctatgtcattctgtg---agagacacctcttgcagtgaccaaaattcttgtcaatata 34665738  T
Q  210 gtatctcttatggtgataattcacaatcgaaaggaaatcttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatttcctaaaac 309  Q
      ||   |||||| |||  |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34665739 aaattagttatggagattcttcacattcacaaggagatcttagtgttgatactctttcattggaatccaccagtggaagtcctgtttcatttcctaaaac 34665838  T
Q  310 tgtgataggatgtggaactgacaatacagtgtcatttgaaggtgcaagttctggtatagttggccttggagg 381  Q
     |||||||| ||||||||||| ||| | | | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34665839 agtgataggttgtggaactgataatgcggggacgtttggaggtgcaagctctggtatagttggccttggagg 34665910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19649692 - 19649543
Alignment:
Q  15 tatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaaaccatcaaa 114  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || |||||    
T  19649692 tatatggtgttgttgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgtaagccttgtgaacaatgctacaagcaaaccactcctatatttaatccttcaaa 19649593  T
Q  115 atcgtcaacttacaaaaacattccatgttcgtctgacctatgtaaatctg 164  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||| || || ||| || ||||| ||||||    
T  19649592 atcatcaagttacaaaaatattccttgctcttctaacttatgtcaatctg 19649543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19649462 - 19649385
Alignment:
Q  248 cttagtgttgatactcttacattagagtcctccactggacatcctatttcatttcctaaaactgtgataggatgtgga 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19649462 cttagtgttgagactcttacattggattccaccaccggtcattctgtttcatttcctaaaactgttatcggatgtgga 19649385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44491645 - 44491528
Alignment:
Q  29 gatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaaaccatcaaaatcgtcaacttaca 128  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||  | ||||  ||||| || |||||||| |||| |||||    
T  44491645 gatacaggtagtgacttagtttggcttcaatgcaagccttgcaatatatgttacaagcaaacctcgcctatatttaatccttcaaaatcttcaagttaca 44491546  T
Q  129 aaaacattccatgttcgt 146  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  44491545 aaatcattccatgatcgt 44491528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 45396791 - 45396682
Alignment:
Q  29 gatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaaaccatcaaaatcgtcaacttaca 128  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| |||| |||||    
T  45396791 gatacaggtagtaacatagtttggcttcaatgccagccttgtaatacatgtttcaatcaaacctctcctatatttaatccttcaaaatcttcaagttaca 45396692  T
Q  129 aaaacattcc 138  Q
    |||| |||||    
T  45396691 aaaatattcc 45396682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 28402694 - 28402803
Alignment:
Q  29 gatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaatgttacaatcaaacaactcctaagtttaaaccatcaaaatcgtcaacttaca 128  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  |   ||||| |||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| |||| |||||    
T  28402694 gatacaggtagtaacatagtttggcttcaatgccagccttgtcatacatgtttcaatcaaacctctcctatatttaatccttcaaaatcttcaagttaca 28402793  T
Q  129 aaaacattcc 138  Q
    |||| |||||    
T  28402794 aaaatattcc 28402803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 420 times since January 2019
Visitors: 972