View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9346-LTR4-TNT-insertion-4 (Length: 627)

Name: F9346-LTR4-TNT-insertion-4
Description: F9346-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9346-LTR4-TNT-insertion-4
F9346-LTR4-TNT-insertion-4
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (390-601)||(17919431-17919642)
chr5 (390-600)||(123591-123801)
chr5 (390-601)||(24221508-24221716)
chr5 (403-601)||(26680212-26680409)
chr5 (403-601)||(26951819-26952016)
chr5 (403-601)||(22756759-22756955)
chr5 (403-601)||(12028854-12029052)
chr5 (422-601)||(17410124-17410300)
chr5 (403-601)||(31341788-31341975)
chr5 (390-601)||(21366951-21367168)
chr5 (422-600)||(23535838-23536016)
chr5 (422-601)||(18773858-18774035)
chr5 (390-561)||(23439650-23439819)
chr5 (390-561)||(23451017-23451186)
chr5 (390-561)||(23458261-23458430)
chr5 (390-561)||(23462522-23462691)
chr5 (422-601)||(18783701-18783878)
chr5 (422-601)||(42805075-42805252)
chr5 (422-601)||(33408881-33409058)
chr5 (487-601)||(26743084-26743196)
chr5 (422-601)||(16673807-16673983)
chr5 (422-601)||(20232206-20232383)
chr5 (422-601)||(24533321-24533497)
chr5 (390-561)||(1859251-1859427)
chr5 (424-594)||(17730685-17730853)
chr5 (422-601)||(26172118-26172294)
chr5 (484-561)||(19473710-19473786)
chr5 (484-561)||(20294905-20294981)
chr5 (485-561)||(11219970-11220045)
chr5 (485-561)||(11224556-11224631)
chr5 (485-561)||(11228379-11228454)
chr5 (485-561)||(11230368-11230443)
chr5 (484-560)||(18355279-18355354)
chr5 (484-546)||(10752054-10752115)
chr5 (484-561)||(40724562-40724638)
chr5 (390-465)||(20766726-20766801)
chr5 (481-584)||(21295613-21295713)
chr5 (487-600)||(4035872-4035984)
chr5 (422-601)||(21885465-21885641)
chr5 (422-601)||(26666404-26666580)
chr5 (422-601)||(26938001-26938177)
chr5 (481-577)||(14360176-14360270)
chr5 (481-577)||(15442313-15442407)
chr5 (390-465)||(20805304-20805379)
chr5 (509-577)||(22343096-22343164)
chr5 (481-584)||(24554187-24554287)
chr5 (510-577)||(22326359-22326426)
chr5 (510-577)||(22352526-22352593)
chr5 (403-448)||(18770306-18770352)
chr5 (403-448)||(22032091-22032137)
chr5 (404-465)||(23511853-23511914)
chr5 (406-486)||(23201092-23201171)
chr5 (406-465)||(21873007-21873066)
chr5 (406-465)||(21877287-21877346)
chr5 (406-465)||(21887042-21887101)
chr5 (406-448)||(22107919-22107962)
chr5 (406-451)||(23501617-23501662)
chr5 (562-601)||(23439595-23439635)
chr5 (562-601)||(23450962-23451002)
chr5 (481-548)||(25534679-25534744)
chr5 (422-451)||(20027272-20027301)
chr5 (487-600)||(25229746-25229859)
chr5 (487-600)||(25293902-25294015)
chr5 (422-451)||(27989260-27989289)
chr5 (409-448)||(14078918-14078958)
chr5 (415-474)||(19661152-19661211)
chr5 (562-601)||(23458206-23458246)
chr5 (562-601)||(23462467-23462507)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (390-601)||(195202-195412)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (390-601)||(27411-27622)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (390-601)||(7559-7770)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (390-601)||(24174430-24174639)
chr2 (390-600)||(25961809-25962019)
chr2 (390-601)||(24869511-24869719)
chr2 (422-601)||(24735047-24735223)
chr2 (422-601)||(19691921-19692097)
chr2 (390-601)||(40428093-40428291)
chr2 (390-601)||(24655616-24655816)
chr2 (390-596)||(37524303-37524514)
chr2 (390-601)||(24716803-24717019)
chr2 (390-561)||(22812198-22812367)
chr2 (422-601)||(19928777-19928952)
chr2 (422-601)||(22461463-22461639)
chr2 (390-561)||(25964001-25964178)
chr2 (422-600)||(26124839-26125014)
chr2 (391-481)||(21327857-21327946)
chr2 (484-561)||(1282455-1282531)
chr2 (484-561)||(10102834-10102910)
chr2 (484-561)||(24629505-24629581)
chr2 (484-561)||(24648359-24648435)
chr2 (509-601)||(24703587-24703679)
chr2 (484-561)||(27380378-27380454)
chr2 (484-561)||(27384424-27384500)
chr2 (484-561)||(27600836-27600912)
chr2 (484-561)||(30346041-30346117)
chr2 (484-561)||(41531999-41532075)
chr2 (390-481)||(21318925-21319015)
chr2 (481-584)||(24502766-24502866)
chr2 (403-486)||(24673299-24673381)
chr2 (403-486)||(24679916-24679998)
chr2 (404-486)||(23020009-23020090)
chr2 (422-601)||(23597994-23598169)
chr2 (422-600)||(23186732-23186906)
chr2 (487-600)||(60471-60583)
chr2 (390-448)||(9784566-9784625)
chr2 (422-601)||(18855734-18855909)
chr2 (510-577)||(24872821-24872888)
chr2 (510-577)||(30971421-30971488)
chr2 (403-448)||(40622513-40622559)
chr2 (406-448)||(22741269-22741312)
chr2 (510-577)||(24880706-24880773)
chr2 (422-481)||(25175582-25175640)
chr2 (483-577)||(27195406-27195498)
chr2 (421-481)||(22134524-22134583)
chr2 (481-561)||(23020100-23020179)
chr2 (562-601)||(23020194-23020234)
chr2 (406-448)||(45678434-45678477)
chr2 (564-601)||(22759206-22759244)
chr2 (408-465)||(22799433-22799490)
chr2 (427-481)||(28405722-28405775)
chr2 (422-451)||(8064-8093)
chr2 (415-451)||(8946424-8946461)
chr2 (422-451)||(18787234-18787263)
chr2 (422-451)||(22413468-22413497)
chr2 (488-584)||(24641327-24641420)
chr2 (415-478)||(38433-38496)
chr2 (403-465)||(7679366-7679429)
chr2 (485-561)||(21319036-21319111)
chr2 (485-561)||(21327967-21328042)
chr2 (562-601)||(22799614-22799654)
chr2 (415-478)||(23072267-23072330)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (194-395)||(33587146-33587347)
chr6 (390-601)||(27567887-27568097)
chr6 (403-601)||(19791068-19791265)
chr6 (390-601)||(27553849-27554058)
chr6 (8-131)||(33587410-33587533)
chr6 (422-601)||(17803841-17804017)
chr6 (390-601)||(18180114-18180324)
chr6 (390-601)||(16523670-16523886)
chr6 (390-601)||(22408579-22408788)
chr6 (390-601)||(20908259-20908449)
chr6 (390-601)||(18692198-18692414)
chr6 (425-601)||(19298050-19298223)
chr6 (455-601)||(25767449-25767592)
chr6 (422-601)||(16740860-16741038)
chr6 (422-601)||(2685592-2685768)
chr6 (458-601)||(9482601-9482743)
chr6 (422-601)||(19662425-19662601)
chr6 (422-582)||(12706362-12706520)
chr6 (390-596)||(21830726-21830929)
chr6 (422-601)||(12495964-12496139)
chr6 (390-600)||(21766316-21766523)
chr6 (515-601)||(22430402-22430488)
chr6 (390-486)||(18906846-18906941)
chr6 (484-561)||(11565866-11565942)
chr6 (484-561)||(12619868-12619944)
chr6 (484-561)||(16759241-16759317)
chr6 (484-561)||(19869633-19869709)
chr6 (484-561)||(22948121-22948197)
chr6 (484-561)||(22952077-22952153)
chr6 (484-561)||(23394072-23394148)
chr6 (484-561)||(23413980-23414056)
chr6 (484-561)||(23870565-23870641)
chr6 (484-561)||(23874521-23874597)
chr6 (484-561)||(23988964-23989040)
chr6 (487-600)||(21701941-21702053)
chr6 (484-561)||(8242878-8242954)
chr6 (481-577)||(19808181-19808275)
chr6 (481-584)||(34298973-34299073)
chr6 (484-546)||(31479243-31479304)
chr6 (487-600)||(5617155-5617267)
chr6 (390-448)||(22074477-22074536)
chr6 (510-577)||(25597040-25597107)
chr6 (403-448)||(2077028-2077074)
chr6 (484-546)||(16623041-16623102)
chr6 (403-448)||(21740336-21740382)
chr6 (488-577)||(22333915-22334002)
chr6 (484-541)||(14471317-14471373)
chr6 (406-486)||(15894742-15894821)
chr6 (404-448)||(22335200-22335245)
chr6 (484-584)||(34370334-34370431)
chr6 (487-600)||(1588071-1588183)
chr6 (406-448)||(19862747-19862790)
chr6 (406-448)||(19872889-19872932)
chr6 (415-481)||(22081051-22081117)
chr6 (406-448)||(22432018-22432061)
chr6 (406-448)||(22438568-22438611)
chr6 (510-577)||(34832255-34832322)
chr6 (415-480)||(22831247-22831312)
chr6 (404-448)||(16960323-16960368)
chr6 (404-448)||(16965612-16965657)
chr6 (484-584)||(22758500-22758597)
chr6 (415-478)||(16920948-16921011)
chr6 (415-481)||(1561040-1561106)
chr6 (422-481)||(19651926-19651984)
chr6 (406-444)||(25642492-25642531)
chr6 (422-451)||(9100903-9100932)
chr6 (422-451)||(13019250-13019279)
chr6 (425-478)||(31155695-31155747)
chr6 (415-478)||(11185253-11185316)
chr6 (562-601)||(15894850-15894890)
chr6 (422-478)||(25629677-25629732)
chr6 (422-478)||(27325901-27325955)
chr6 (415-478)||(28496788-28496851)
chr6 (415-478)||(29809199-29809262)
chr6 (406-441)||(31165142-31165178)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (390-601)||(15353584-15353793)
chr4 (403-601)||(11250850-11251046)
chr4 (403-601)||(25555111-25555308)
chr4 (422-601)||(36134225-36134401)
chr4 (390-601)||(5339263-5339473)
chr4 (455-601)||(1952066-1952211)
chr4 (390-601)||(16348949-16349166)
chr4 (406-601)||(16357253-16357454)
chr4 (422-600)||(17152760-17152934)
chr4 (455-601)||(19757906-19758051)
chr4 (455-601)||(19781755-19781900)
chr4 (422-601)||(18222652-18222829)
chr4 (422-601)||(16243675-16243851)
chr4 (422-601)||(2014433-2014609)
chr4 (423-601)||(18229128-18229304)
chr4 (422-601)||(23138927-23139102)
chr4 (390-486)||(16352129-16352223)
chr4 (422-601)||(18236546-18236722)
chr4 (539-601)||(16352217-16352280)
chr4 (422-601)||(26243940-26244115)
chr4 (422-601)||(45937804-45937979)
chr4 (487-600)||(3412452-3412564)
chr4 (422-601)||(14708911-14709087)
chr4 (484-561)||(5757836-5757912)
chr4 (484-561)||(9555534-9555610)
chr4 (484-561)||(12486689-12486765)
chr4 (484-561)||(14758452-14758528)
chr4 (484-561)||(14955217-14955293)
chr4 (390-561)||(16488363-16488539)
chr4 (424-600)||(18603009-18603183)
chr4 (484-561)||(25688907-25688983)
chr4 (484-561)||(33741304-33741380)
chr4 (484-560)||(4562311-4562386)
chr4 (481-584)||(41386095-41386195)
chr4 (390-481)||(631255-631346)
chr4 (487-600)||(18609642-18609755)
chr4 (406-448)||(13569271-13569313)
chr4 (422-584)||(14678618-14678774)
chr4 (406-486)||(12569748-12569827)
chr4 (390-450)||(13813457-13813518)
chr4 (481-601)||(15122194-15122313)
chr4 (469-584)||(14684826-14684938)
chr4 (422-601)||(9530089-9530265)
chr4 (510-577)||(53432974-53433041)
chr4 (423-561)||(13818054-13818189)
chr4 (488-577)||(21340037-21340124)
chr4 (488-577)||(35613621-35613708)
chr4 (404-448)||(15122104-15122149)
chr4 (404-448)||(17048614-17048659)
chr4 (481-577)||(35170309-35170403)
chr4 (481-584)||(23838089-23838189)
chr4 (415-481)||(7798513-7798579)
chr4 (406-448)||(15125347-15125390)
chr4 (422-481)||(20157730-20157788)
chr4 (406-448)||(23843246-23843289)
chr4 (510-577)||(30235422-30235489)
chr4 (409-486)||(15093508-15093584)
chr4 (484-541)||(15223804-15223860)
chr4 (415-478)||(14053619-14053682)
chr4 (422-601)||(28569696-28569874)
chr4 (390-448)||(12423473-12423532)
chr4 (422-481)||(12773821-12773879)
chr4 (422-481)||(14038441-14038499)
chr4 (406-448)||(44675400-44675443)
chr4 (555-601)||(13515000-13515046)
chr4 (564-601)||(15125529-15125567)
chr4 (415-451)||(14174-14211)
chr4 (422-451)||(12288542-12288571)
chr4 (562-601)||(12569679-12569719)
chr4 (562-601)||(15093364-15093404)
chr4 (481-561)||(15093419-15093498)
chr4 (415-478)||(17046227-17046290)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (403-601)||(11595428-11595625)
chr3 (390-601)||(11557662-11557872)
chr3 (390-600)||(1983088-1983296)
chr3 (403-601)||(42325572-42325769)
chr3 (422-601)||(7793636-7793812)
chr3 (422-601)||(327451-327627)
chr3 (422-601)||(20461786-20461962)
chr3 (423-601)||(2898110-2898291)
chr3 (422-601)||(15482318-15482495)
chr3 (403-559)||(3403246-3403402)
chr3 (457-601)||(7574650-7574792)
chr3 (422-601)||(31097829-31098005)
chr3 (390-601)||(322206-322422)
chr3 (390-601)||(11848930-11849145)
chr3 (390-601)||(12495872-12496089)
chr3 (390-601)||(18384202-18384417)
chr3 (422-601)||(3833328-3833504)
chr3 (390-572)||(19726188-19726375)
chr3 (390-601)||(26196707-26196923)
chr3 (390-599)||(11862409-11862623)
chr3 (422-601)||(38814037-38814214)
chr3 (422-601)||(16809155-16809330)
chr3 (422-601)||(17241628-17241804)
chr3 (494-601)||(23419705-23419810)
chr3 (484-561)||(17318163-17318239)
chr3 (484-561)||(4108265-4108341)
chr3 (484-561)||(4112117-4112193)
chr3 (484-561)||(7108703-7108779)
chr3 (484-561)||(7112638-7112714)
chr3 (484-561)||(11166554-11166630)
chr3 (484-561)||(14159841-14159917)
chr3 (484-561)||(15616642-15616718)
chr3 (484-561)||(15963943-15964019)
chr3 (484-561)||(15967867-15967943)
chr3 (484-561)||(15971791-15971867)
chr3 (484-561)||(22320671-22320747)
chr3 (484-561)||(22335726-22335802)
chr3 (484-561)||(28948849-28948925)
chr3 (484-561)||(30064854-30064930)
chr3 (484-561)||(55021992-55022068)
chr3 (481-584)||(20722665-20722765)
chr3 (390-561)||(12172455-12172626)
chr3 (487-561)||(11069155-11069228)
chr3 (484-561)||(14498412-14498488)
chr3 (422-601)||(1598755-1598930)
chr3 (390-481)||(12852812-12852903)
chr3 (392-452)||(11298819-11298880)
chr3 (484-545)||(27411104-27411164)
chr3 (481-577)||(28368800-28368894)
chr3 (481-577)||(28376618-28376712)
chr3 (481-577)||(28384440-28384534)
chr3 (421-481)||(9512670-9512729)
chr3 (421-481)||(9520645-9520704)
chr3 (484-544)||(14067599-14067658)
chr3 (481-584)||(24187433-24187533)
chr3 (421-481)||(49668388-49668447)
chr3 (481-584)||(55148634-55148734)
chr3 (510-577)||(12891003-12891070)
chr3 (510-577)||(13320574-13320641)
chr3 (422-481)||(14665166-14665224)
chr3 (422-481)||(14668322-14668380)
chr3 (487-601)||(16696441-16696552)
chr3 (510-577)||(17253498-17253565)
chr3 (403-448)||(855908-855954)
chr3 (403-448)||(15067451-15067497)
chr3 (484-546)||(16751668-16751729)
chr3 (481-577)||(838908-839002)
chr3 (422-601)||(15942180-15942355)
chr3 (406-448)||(15878356-15878399)
chr3 (406-448)||(23408198-23408241)
chr3 (422-481)||(32307410-32307468)
chr3 (403-448)||(16909642-16909688)
chr3 (484-546)||(19774435-19774496)
chr3 (421-478)||(14572352-14572408)
chr3 (481-561)||(16332850-16332928)
chr3 (404-448)||(16796067-16796112)
chr3 (415-481)||(13210645-13210711)
chr3 (410-448)||(16369169-16369208)
chr3 (422-451)||(606656-606685)
chr3 (480-545)||(11298921-11298985)
chr3 (422-451)||(14234239-14234268)
chr3 (413-477)||(16097102-16097166)
chr3 (415-451)||(17499106-17499143)
chr3 (422-451)||(22110683-22110712)
chr3 (422-451)||(37251457-37251486)
chr3 (422-451)||(52524060-52524089)
chr3 (390-437)||(12038226-12038274)
chr3 (422-478)||(15467612-15467667)
chr3 (415-478)||(23083677-23083740)
chr3 (423-451)||(53301857-53301885)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (390-601)||(3705343-3705552)
chr1 (403-601)||(33050305-33050502)
chr1 (403-601)||(18394254-18394449)
chr1 (403-600)||(45490032-45490217)
chr1 (422-601)||(21172656-21172832)
chr1 (422-601)||(36819583-36819760)
chr1 (422-601)||(21312772-21312948)
chr1 (422-601)||(16080690-16080864)
chr1 (390-561)||(3473209-3473385)
chr1 (390-601)||(8761916-8762135)
chr1 (390-601)||(18182405-18182628)
chr1 (422-601)||(20137739-20137914)
chr1 (390-601)||(17678873-17679084)
chr1 (422-601)||(18882047-18882222)
chr1 (422-601)||(46975143-46975321)
chr1 (484-572)||(52634788-52634874)
chr1 (534-601)||(30643942-30644009)
chr1 (484-561)||(1009727-1009803)
chr1 (484-561)||(1926179-1926255)
chr1 (484-561)||(16376430-16376506)
chr1 (484-561)||(20925193-20925269)
chr1 (390-448)||(20091762-20091821)
chr1 (390-448)||(22831671-22831730)
chr1 (484-561)||(33796577-33796653)
chr1 (481-584)||(23762867-23762967)
chr1 (422-601)||(12646525-12646702)
chr1 (390-448)||(22449552-22449611)
chr1 (535-601)||(24783484-24783551)
chr1 (422-577)||(19111063-19111212)
chr1 (510-577)||(50888194-50888261)
chr1 (484-546)||(39244979-39245040)
chr1 (484-546)||(39248534-39248595)
chr1 (390-465)||(41781789-41781864)
chr1 (405-448)||(48603037-48603081)
chr1 (422-481)||(20248013-20248071)
chr1 (406-448)||(21714316-21714359)
chr1 (406-448)||(21788349-21788392)
chr1 (406-448)||(22469007-22469050)
chr1 (422-481)||(33680738-33680796)
chr1 (487-546)||(41389430-41389488)
chr1 (406-448)||(42865519-42865562)
chr1 (403-448)||(6151617-6151663)
chr1 (403-448)||(21022349-21022395)
chr1 (422-481)||(21753779-21753837)
chr1 (422-481)||(22922200-22922258)
chr1 (422-481)||(52928302-52928360)
chr1 (484-553)||(18626681-18626748)
chr1 (564-601)||(20091959-20091997)
chr1 (422-480)||(20229543-20229599)
chr1 (423-481)||(20847461-20847517)
chr1 (424-478)||(21161486-21161539)
chr1 (422-451)||(16368616-16368645)
chr1 (422-451)||(16758414-16758443)
chr1 (404-448)||(22123434-22123479)
chr1 (404-448)||(22131385-22131430)
chr1 (422-451)||(29297884-29297913)
chr1 (422-451)||(35261367-35261396)
chr1 (422-451)||(41050367-41050396)
chr1 (415-478)||(38801705-38801768)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (403-601)||(8191-8388)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (403-601)||(4528-4724)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (403-601)||(20569884-20570081)
chr7 (404-601)||(9446450-9446646)
chr7 (390-601)||(42203626-42203835)
chr7 (422-601)||(12317779-12317956)
chr7 (390-601)||(14429498-14429714)
chr7 (390-601)||(2759752-2759969)
chr7 (225-395)||(7680286-7680454)
chr7 (421-601)||(9593001-9593178)
chr7 (423-601)||(14152280-14152455)
chr7 (423-561)||(15605549-15605685)
chr7 (455-601)||(13635770-13635914)
chr7 (422-601)||(13148809-13148985)
chr7 (421-601)||(20627-20804)
chr7 (422-601)||(16457631-16457807)
chr7 (422-601)||(8917081-8917257)
chr7 (487-601)||(13461414-13461526)
chr7 (422-601)||(6800867-6801043)
chr7 (469-601)||(3271480-3271610)
chr7 (484-561)||(32113-32189)
chr7 (484-561)||(71833-71909)
chr7 (484-561)||(75942-76018)
chr7 (484-561)||(12705693-12705769)
chr7 (390-481)||(18301814-18301905)
chr7 (423-509)||(16583000-16583086)
chr7 (422-600)||(16724906-16725083)
chr7 (422-600)||(17701920-17702097)
chr7 (484-561)||(12713928-12714004)
chr7 (484-561)||(18278447-18278523)
chr7 (484-561)||(18282410-18282486)
chr7 (484-561)||(45171057-45171133)
chr7 (481-584)||(11261984-11262084)
chr7 (481-584)||(26419655-26419755)
chr7 (487-600)||(14216578-14216690)
chr7 (422-501)||(14933050-14933128)
chr7 (422-501)||(15356485-15356563)
chr7 (422-501)||(15360599-15360677)
chr7 (406-448)||(9703032-9703074)
chr7 (484-546)||(12717767-12717828)
chr7 (484-546)||(12722678-12722739)
chr7 (487-599)||(16275179-16275290)
chr7 (481-584)||(12692151-12692251)
chr7 (542-601)||(14126102-14126161)
chr7 (481-584)||(44408660-44408760)
chr7 (510-577)||(6017613-6017680)
chr7 (481-583)||(11548617-11548716)
chr7 (515-601)||(15580322-15580408)
chr7 (403-448)||(17138363-17138409)
chr7 (422-601)||(18556627-18556801)
chr7 (481-563)||(11555213-11555293)
chr7 (487-600)||(15727978-15728090)
chr7 (406-448)||(18155145-18155188)
chr7 (406-448)||(24054234-24054277)
chr7 (481-550)||(14952913-14952980)
chr7 (481-550)||(14958852-14958919)
chr7 (481-550)||(15380506-15380573)
chr7 (424-481)||(811467-811523)
chr7 (561-601)||(15211059-15211100)
chr7 (404-448)||(15211223-15211268)
chr7 (484-541)||(18424493-18424549)
chr7 (394-440)||(12322032-12322079)
chr7 (422-481)||(15144356-15144414)
chr7 (415-481)||(15755269-15755335)
chr7 (470-509)||(16582943-16582982)
chr7 (406-448)||(19649794-19649837)
chr7 (390-448)||(20487352-20487411)
chr7 (487-600)||(35151294-35151406)
chr7 (422-481)||(44013910-44013968)
chr7 (403-448)||(12186787-12186833)
chr7 (555-601)||(48813926-48813972)
chr7 (422-451)||(2282581-2282610)
chr7 (422-451)||(16056089-16056118)
chr7 (415-448)||(16220041-16220074)
chr7 (415-478)||(11996345-11996408)
chr7 (415-478)||(16402753-16402816)
chr7 (415-478)||(40443194-40443257)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (390-601)||(10573-10781)
scaffold0439 (390-475)||(2713-2797)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (390-602)||(414325-414537)
scaffold0003 (421-601)||(100727-100903)
scaffold0003 (514-585)||(139382-139453)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (403-601)||(4492-4687)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (390-601)||(1802-2010)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (403-601)||(205352-205549)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (390-601)||(7105-7314)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (390-550)||(68546-68706)
scaffold0036 (422-601)||(66701-66877)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (390-601)||(1421-1630)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (390-601)||(39095213-39095411)
chr8 (390-601)||(20856714-20856926)
chr8 (422-601)||(22044539-22044715)
chr8 (390-601)||(22010953-22011162)
chr8 (422-601)||(16231749-16231925)
chr8 (390-601)||(17926991-17927207)
chr8 (422-601)||(23847290-23847466)
chr8 (390-528)||(16861611-16861747)
chr8 (390-598)||(30643578-30643799)
chr8 (422-599)||(23833828-23834004)
chr8 (422-601)||(30309028-30309203)
chr8 (432-601)||(15611756-15611931)
chr8 (390-545)||(16410534-16410694)
chr8 (484-561)||(21829002-21829078)
chr8 (484-561)||(21977658-21977734)
chr8 (484-561)||(22111055-22111131)
chr8 (484-561)||(30941136-30941212)
chr8 (484-561)||(43250815-43250891)
chr8 (390-448)||(377041-377100)
chr8 (432-601)||(15603304-15603479)
chr8 (484-561)||(18863661-18863737)
chr8 (484-561)||(21973567-21973643)
chr8 (422-585)||(17828858-17829018)
chr8 (487-600)||(32604864-32604976)
chr8 (422-601)||(15440240-15440415)
chr8 (422-601)||(15531544-15531719)
chr8 (422-601)||(15538103-15538278)
chr8 (510-577)||(3215862-3215929)
chr8 (422-481)||(6520095-6520153)
chr8 (390-448)||(23913827-23913886)
chr8 (510-577)||(26935618-26935685)
chr8 (403-480)||(20466344-20466420)
chr8 (406-601)||(24755362-24755570)
chr8 (481-584)||(20527105-20527205)
chr8 (406-465)||(21162365-21162424)
chr8 (422-601)||(24445782-24445957)
chr8 (406-448)||(23777140-23777183)
chr8 (487-600)||(32598332-32598444)
chr8 (481-571)||(16184355-16184443)
chr8 (404-445)||(16184492-16184534)
chr8 (534-601)||(16862036-16862104)
chr8 (403-448)||(19259851-19259897)
chr8 (408-448)||(22873574-22873615)
chr8 (406-448)||(19898863-19898906)
chr8 (422-481)||(23761176-23761234)
chr8 (422-481)||(26355993-26356051)
chr8 (406-448)||(44385153-44385196)
chr8 (415-476)||(21389768-21389829)
chr8 (415-476)||(21779094-21779155)
chr8 (422-451)||(983737-983766)
chr8 (422-451)||(15203617-15203646)
chr8 (488-584)||(20705995-20706088)
chr8 (562-601)||(376935-376975)
chr8 (562-601)||(16184309-16184349)
chr8 (406-465)||(21169038-21169097)
chr8 (415-478)||(21249125-21249188)
chr8 (415-478)||(21254963-21255026)
chr8 (415-478)||(31971041-31971104)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (422-601)||(53209-53385)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (225-395)||(111221-111389)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (390-601)||(15499-15697)
scaffold0017 (390-601)||(20021-20219)
scaffold0017 (403-448)||(193279-193325)
scaffold0017 (564-601)||(193451-193489)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (422-601)||(18906-19084)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (390-601)||(16763-16973)
scaffold0080 (403-448)||(19016-19062)
scaffold0080 (422-451)||(20136-20165)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (390-601)||(422809-423008)
scaffold0001 (422-550)||(172999-173124)
scaffold0001 (514-550)||(178702-178738)
scaffold0001 (407-445)||(204655-204694)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (390-601)||(21811-22028)
scaffold0037 (422-481)||(23001-23059)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (421-601)||(18843-19021)
scaffold0044 (421-540)||(12619-12737)
scaffold0044 (531-601)||(12541-12610)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (406-569)||(916-1077)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (422-601)||(2946-3123)
scaffold0013 (422-601)||(81499-81675)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (390-561)||(19575-19744)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (392-601)||(1443-1658)
scaffold0104 (392-601)||(9126-9341)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (455-601)||(20319-20463)
scaffold0120 (422-481)||(33277-33335)
scaffold0120 (422-481)||(45670-45728)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (390-601)||(33163-33381)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (422-601)||(9939-10114)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (422-601)||(9075-9251)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (422-601)||(25244-25419)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (390-601)||(1767-1975)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (390-561)||(42290-42459)
scaffold0124 (390-481)||(25097-25189)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (423-601)||(2216-2390)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (433-601)||(8169-8350)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (390-561)||(5247-5424)
scaffold0476 (390-561)||(6442-6619)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (421-601)||(63509-63686)
scaffold0042 (406-486)||(35223-35302)
scaffold0042 (484-561)||(35315-35391)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (422-601)||(22871-23048)
scaffold0010 (481-584)||(241713-241813)
scaffold0010 (422-451)||(117957-117986)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (422-601)||(6516-6691)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (423-601)||(14036-14219)
scaffold0412 (390-481)||(6691-6781)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (480-601)||(1106-1226)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (390-601)||(7416-7640)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (390-601)||(17397-17621)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (422-601)||(6616-6791)
scaffold0109 (513-577)||(42859-42923)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (422-550)||(228645-228770)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (406-553)||(34146-34291)
scaffold0008 (422-481)||(15031-15089)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (422-601)||(16333-16509)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (424-600)||(22-196)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (484-561)||(4884-4960)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (484-561)||(33712-33788)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (484-561)||(15146-15222)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (484-561)||(68206-68282)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (509-601)||(13578-13668)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (485-561)||(79577-79652)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (422-601)||(14990-15166)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (390-448)||(14860-14919)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (390-561)||(51-226)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (484-561)||(6045-6121)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (390-486)||(630-725)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (484-572)||(11496-11582)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (390-481)||(8092-8183)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (390-448)||(48-107)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (487-600)||(6341-6453)
scaffold0130 (487-600)||(8340-8452)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (390-448)||(47015-47074)
scaffold0035 (481-561)||(47120-47199)
[»] scaffold0093 (3 HSPs)
scaffold0093 (481-561)||(5200-5279)
scaffold0093 (406-465)||(5111-5170)
scaffold0093 (562-601)||(5294-5334)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (487-601)||(17004-17117)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (390-448)||(4201-4260)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (422-481)||(29325-29383)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (403-465)||(2585-2647)
scaffold0158 (403-465)||(6251-6313)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (422-481)||(40425-40483)
scaffold0023 (403-448)||(38781-38827)
scaffold0023 (422-481)||(100082-100140)
scaffold0023 (422-480)||(101271-101328)
scaffold0023 (482-551)||(29183-29251)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (406-452)||(74069-74116)
scaffold0022 (422-451)||(44363-44392)
scaffold0022 (422-451)||(78084-78113)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (403-448)||(1892-1938)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (423-481)||(3424-3481)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (406-451)||(10260-10306)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (422-601)||(9559-9733)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (403-448)||(281198-281244)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (406-451)||(8122-8167)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (481-601)||(9808-9924)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (404-448)||(3287-3332)
scaffold0165 (405-448)||(7350-7394)
scaffold0165 (422-451)||(28043-28072)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (404-448)||(48749-48794)
scaffold0102 (422-481)||(18993-19051)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (405-448)||(415-459)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (481-584)||(19231-19331)
scaffold0242 (481-584)||(25378-25478)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (406-465)||(16654-16713)
scaffold0096 (513-577)||(15433-15497)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (406-465)||(14416-14475)
scaffold0081 (406-465)||(23432-23491)
scaffold0081 (406-465)||(38856-38915)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (421-481)||(132446-132505)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (422-481)||(1847-1905)
scaffold0621 (422-481)||(6264-6322)
[»] scaffold0615 (2 HSPs)
scaffold0615 (515-601)||(2487-2573)
scaffold0615 (407-448)||(2383-2425)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (390-448)||(6382-6441)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (406-448)||(10823-10866)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (406-448)||(3510-3553)
scaffold0149 (406-448)||(7941-7984)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (406-448)||(19750-19793)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (422-585)||(35978-36138)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (406-448)||(32215-32258)
scaffold0111 (564-601)||(32038-32076)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (406-448)||(9268-9311)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (406-448)||(18005-18048)
scaffold0043 (422-601)||(77447-77622)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (406-448)||(178669-178712)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (406-448)||(69563-69606)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (404-465)||(2030-2091)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (403-444)||(1652-1694)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (408-448)||(995-1036)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (481-563)||(1027-1108)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (421-481)||(3420-3479)
scaffold0628 (422-481)||(7981-8039)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (422-478)||(16920-16975)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (421-481)||(31848-31907)
[»] scaffold0862 (1 HSPs)
scaffold0862 (510-577)||(4969-5036)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (487-541)||(4560-4612)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (406-448)||(1108-1151)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (406-448)||(36224-36267)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (422-481)||(46123-46181)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (422-601)||(8991-9166)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (481-577)||(14649-14744)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (403-448)||(22107-22153)
scaffold0210 (403-448)||(29999-30045)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (403-448)||(7064-7110)
scaffold0114 (562-601)||(6898-6938)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (422-451)||(312-341)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (404-448)||(5863-5908)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (422-451)||(16394-16423)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (481-577)||(14891-14985)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (422-451)||(8404-8433)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (415-451)||(53872-53909)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (422-482)||(6549-6608)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (415-478)||(10742-10805)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (415-482)||(38542-38609)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (422-478)||(24215-24270)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (415-478)||(46735-46798)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (415-478)||(51321-51384)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 17919431 - 17919642
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17919431 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 17919530  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17919531 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 17919630  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  17919631 ttatattgatta 17919642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 390 - 600
Target Start/End: Original strand, 123591 - 123801
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  123591 attaatactaaactattgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 123690  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  123691 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatttgaaa 123790  T
Q  590 ttatattgatt 600  Q
    |||||||||||    
T  123791 ttatattgatt 123801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 24221716 - 24221508
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24221716 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 24221618  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24221617 tgttattgatgatgattg-aatgatgtgattacttgataattgtttatc-aagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgctaattatgattttgaa 24221520  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  24221519 ttatattgatta 24221508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26680409 - 26680212
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26680409 tgttgggggctcataccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 26680311  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26680310 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgattatgttgttaactatgattttgaattatattgatta 26680212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26952016 - 26951819
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26952016 tgttgggggctcataccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 26951918  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26951917 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgattatgttgttaactatgattttgaattatattgatta 26951819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 22756955 - 22756759
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22756955 tgttgagggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatt-gcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 22756858  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756857 gattgaaatgatgtgattacttaataattgtttagtgaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 22756759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 12028854 - 12029052
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtattt-gtcgagtcaaaagatgttatgttattgatga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12028854 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagacttgcattgtcacattttgtcgagtcaaaagatgttttgttattaatga 12028952  T
Q  502 tgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028953 tgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgattatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 12029052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17410300 - 17410124
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  17410300 gattggtaccacatgcatataagaggtata-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattggtgatgattgaa-tgttgtgatta 17410203  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17410202 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgacgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 17410124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 31341975 - 31341788
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31341975 tgttgggggctaatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttacattgtcgcatttgtcgagtcaaaagttgttaagttattgatgat 31341877  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| |||||||||| ||||||        |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31341876 gattg-aatgatgtgaatacttg--------ttatcaaatatgcaatgatgtttaagattgtttatgttgttaattat-aatttgaattatattgatta 31341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 21366951 - 21367168
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa------- 481  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||           
T  21366951 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaatgatgtt 21367048  T
Q  482 -agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  21367049 aagatgttatgttatttatgatgattg-aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattac 21367146  T
Q  581 gatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  21367147 gattgttgaattatattgatta 21367168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 422 - 600
Target Start/End: Original strand, 23535838 - 23536016
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || || | ||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23535838 gattgataccacatgcatataagggtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaggatgtttatgttattgatgatgattgaaatc-tgtgat 23535935  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatt 600  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23535936 tacttgataactgtttatcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgacttcgaattatattgatt 23536016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 18774035 - 18773858
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  18774035 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgat 18773940  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18773939 tatgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagattgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 18773858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23439819 - 23439650
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||  ||||||    
T  23439819 attaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatatatgaggtttag-gttgcattgtagca-ttgtcgagtcaactgatgtt 23439722  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23439721 atgttatttgtgatgattg-aatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagat 23439650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23451186 - 23451017
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||  ||||||    
T  23451186 attaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatatatgaggtttag-gttgcattgtagca-ttgtcgagtcaactgatgtt 23451089  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23451088 atgttatttgtgatgattg-aatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagat 23451017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23458430 - 23458261
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  23458430 attaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaactgatgtt 23458333  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||| |||||||    
T  23458332 atgttatttatgatgattg-aatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagat 23458261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23462691 - 23462522
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  23462691 attaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaactgatgtt 23462594  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||| |||||||    
T  23462593 atgttatttatgatgattg-aatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagat 23462522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 18783878 - 18783701
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  18783878 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgat 18783783  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18783782 tatgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 18783701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 42805252 - 42805075
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  42805252 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgat 42805157  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42805156 tatgcgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagattgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 42805075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 33409058 - 33408881
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  33409058 gattggtaccacatgcatataagtgtctgag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaatgatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 33408963  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaa-ttatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  33408962 acttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaatttatgatttcgaattacattgatta 33408881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 487 - 601
Target Start/End: Original strand, 26743084 - 26743196
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatttt 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  26743084 ttatgttgttgatgatgattgaagt--tgtgattacgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgaataagattgattatgatgttaattatgatttc 26743181  T
Q  587 gaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||    
T  26743182 gaattatattgatta 26743196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 16673983 - 16673807
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  16673983 gattggtaccacatacatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaatgatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 16673888  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16673887 acttgataattgtttattaaagatggtatgttgtttaagactgatcatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 16673807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 20232383 - 20232206
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |  |||||||    
T  20232383 gattggtatcacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatggtgaatgaagt--tgtgatt 20232288  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatttt-gaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20232287 atgtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattacgattttcgaattatattgatta 20232206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 24533321 - 24533497
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  24533321 gattgataccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcacatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 24533416  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  24533417 atgtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattacgatttcgtattatattgatta 24533497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Original strand, 1859251 - 1859427
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-------aa 481  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| | |||||||||||       ||    
T  1859251 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttttg-gttgcatagtcgca-ttgtcgagtcaattgatgaa 1859348  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  1859349 agatgttatgttaattgtgatgattg-aatgatgtgattacttgatattttattatcaatgatgttatgatgtttaagat 1859427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 424 - 594
Target Start/End: Original strand, 17730685 - 17730853
Alignment:
Q  424 ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  17730685 ttggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagttttaaagatgtttatgtcattgatgatgattgaagt--tgtgatta 17730779  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattata 594  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  17730780 agtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttagttatgatttttgaattata 17730853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26172294 - 26172118
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || | |||| ||| ||||||| | ||||||| |  |||||||    
T  26172294 gattggtaccacatgcatataagagtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaggttgtttatgctattgataaagattgaagt--tgtgatt 26172199  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  26172198 atgtgataaatgtttatcaaagatgctatgttgattaagattgattaagatgttgattatgatttgaaattacattgatta 26172118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 19473710 - 19473786
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19473710 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 19473786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 20294981 - 20294905
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20294981 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgccatgatgtttaagat 20294905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11220045 - 11219970
Alignment:
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11220045 tgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 11219970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11224631 - 11224556
Alignment:
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11224631 tgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 11224556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11228454 - 11228379
Alignment:
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11228454 tgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 11228379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11230443 - 11230368
Alignment:
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11230443 tgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 11230368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 484 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 18355354 - 18355279
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaaga 560  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18355354 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaaga 18355279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 10752115 - 10752054
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752115 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 10752054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 40724562 - 40724638
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  40724562 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttagcaaagatgctatgatgtttaagat 40724638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20766801 - 20766726
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20766801 attaatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcg 20766726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Original strand, 21295613 - 21295713
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  21295613 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 21295709  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  21295710 gatt 21295713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4035984 - 4035872
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  4035984 ttatgttattgatgaagattgaa--gctgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttt 4035887  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  4035886 tgaattataatgatt 4035872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 21885465 - 21885641
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || | |||| ||| ||||||| | ||||||| |  |||||||    
T  21885465 gattggtaccacatgcatataagagtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaggttgtttatgctattgataaagattgaagt--tgtgatt 21885560  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |   ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| || ||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21885561 atgcgataaatgtttatcaaagatgctatgttgattaagaatgattaagatgttgattatgatttgaaattacattgatta 21885641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 26666404 - 26666580
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  26666404 gattggtactacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttaagttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 26666499  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  | |||| |  ||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  26666500 atgtcataaataattatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattacgatttcctattatattgatta 26666580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 26938001 - 26938177
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  26938001 gattggtactacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttaagttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 26938096  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  | |||| |  ||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  26938097 atgtcataaataattatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattacgatttcctattatattgatta 26938177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Original strand, 14360176 - 14360270
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||    
T  14360176 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgaatacgtgataattgtttatcaaacatgcaaagttgtttaagattgattatgatgttaat 14360270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Original strand, 15442313 - 15442407
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  15442313 aagatgctatgttgttgatgatgattgaac--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 15442407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20805379 - 20805304
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20805379 attaatactataatgctgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcg 20805304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 509 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22343164 - 22343096
Alignment:
Q  509 aatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  22343164 aatgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 22343096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 24554287 - 24554187
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  24554287 aagatgttatgttgttgatgatgattgaat--acttgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 24554191  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  24554190 gatt 24554187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 22326359 - 22326426
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  22326359 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 22326426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22352593 - 22352526
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  22352593 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 22352526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 18770306 - 18770352
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18770306 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 18770352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22032137 - 22032091
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22032137 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22032091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23511914 - 23511853
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  23511914 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 23511853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23201171 - 23201092
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  23201171 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaatgatg 23201092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21873066 - 21873007
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  21873066 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 21873007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21877346 - 21877287
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  21877346 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 21877287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21887101 - 21887042
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  21887101 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 21887042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 22107919 - 22107962
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22107919 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22107962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 451
Target Start/End: Original strand, 23501617 - 23501662
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23501617 tgggggctcatgccatgaatggtaccacatgcatataagagtttta 23501662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23439635 - 23439595
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23439635 tgtttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 23439595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23451002 - 23450962
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23451002 tgtttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 23450962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25534744 - 25534679
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaa 548  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25534744 aagatgctatgttgttgatgatggttgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaa 25534679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 20027272 - 20027301
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20027272 gattggtaccacatgcatataagaggttta 20027301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Original strand, 25229746 - 25229859
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga--tt 584  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |  ||||| ||||| ||||||  ||    
T  25229746 ttatgttattgaggaagattgaagttatg--attatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactaattatgatgttagttatgatttt 25229843  T
Q  585 ttgaattatattgatt 600  Q
    |||||||||| |||||    
T  25229844 ttgaattataatgatt 25229859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Original strand, 25293902 - 25294015
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga--tt 584  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |  ||||| ||||| ||||||  ||    
T  25293902 ttatgttattgaggaagattgaagttatg--attatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactaattatgatgttagttatgatttt 25293999  T
Q  585 ttgaattatattgatt 600  Q
    |||||||||| |||||    
T  25294000 ttgaattataatgatt 25294015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 27989260 - 27989289
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989260 gattggtaccacatgcatataagaggttta 27989289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 409 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14078958 - 14078918
Alignment:
Q  409 gggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14078958 gggctcatgccccgaattggtaccacatgcatataagaggt 14078918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 474
Target Start/End: Original strand, 19661152 - 19661211
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcg 474  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||    
T  19661152 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcg 19661211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23458246 - 23458206
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23458246 tgtttatgttgttaattttgattgttgaattatattgatta 23458206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23462507 - 23462467
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23462507 tgtttatgttgttaattttgattgttgaattatattgatta 23462467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 195202 - 195412
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  195202 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagagtcttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 195301  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195302 tgttattgatgatgattg-aatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 195400  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  195401 ttatattgatta 195412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 27411 - 27622
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27411 attaatactaaacacttgggggctcataccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 27510  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27511 tgttattgatgatgatttaaatgatgtgattactcgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 27610  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  27611 ttatattgatta 27622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 7559 - 7770
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7559 attaatactaaactgttgggggctcatgccctaattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgaattgtcgcatttgtcgaatcaaaagatgtta 7658  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7659 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttataaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatttgaaa 7758  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  7759 ttatattgatta 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 24174639 - 24174430
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24174639 attaatactataatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 24174541  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24174540 tgttattgatgatgattgaa-tgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 24174442  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  24174441 ttatattgatta 24174430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 390 - 600
Target Start/End: Original strand, 25961809 - 25962019
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25961809 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtt 25961907  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt-acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttg 587  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961908 atgttattgatgatgattgaa-tgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttg 25962006  T
Q  588 aattatattgatt 600  Q
    |||||||||||||    
T  25962007 aattatattgatt 25962019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 24869719 - 24869511
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24869719 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 24869621  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869620 tgttattcatgatgattgaa-tgatgtgattatttgataattgtttatcaa-gatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 24869523  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  24869522 ttatattgatta 24869511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 24735223 - 24735047
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24735223 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagttgttatgttattgatgatgattgaa-tgatgtgatta 24735126  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24735125 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 24735047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 19691921 - 19692097
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19691921 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 19692018  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19692019 cttgttaattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 19692097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 40428291 - 40428093
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40428291 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaaagatgtta 40428193  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttga 588  Q
    |||| |             |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40428192 tgttgt------------gaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagttacaatgatgtctaata-tgttcatgttgttaattatgattgttga 40428106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 24655616 - 24655816
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||     
T  24655616 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgttgcatt-gtcgagtcaaaagatgttt 24655713  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatc-aaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||          ||||||||||||||| |||    
T  24655714 tgttattgatgatgattgaa-tgatgtgattacttgataattgtttatccaaagatgcaaagatgtttaag----------ttgttaattatgattgttg 24655802  T
Q  588 aattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||    
T  24655803 aattatattgatta 24655816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 390 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 37524514 - 37524303
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||       |    
T  37524514 attaatactataatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgttgcatt-gtcgagtcaatggatgaa 37524417  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  37524416 agatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattacg 37524319  T
Q  582 att-ttgaattatatt 596  Q
    ||| ||||||||||||    
T  37524318 attgttgaattatatt 37524303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 24716803 - 24717019
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  24716803 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 24716900  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24716901 agatgttatgttaattatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgcaatgatatttaaga-tgtttatgttgttaattatg 24716998  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  24716999 attgttgaattatattgatta 24717019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Original strand, 22812198 - 22812367
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22812198 attaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcatggtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgtt 22812295  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22812296 atgatatttatgaagatag-aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 22812367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 19928777 - 19928952
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||  ||||||| |||   |||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  19928777 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtctcatttgtctagttttaagatgtttatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 19928872  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| || ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  19928873 acttgataattgtttatcaaagatgctattttgtttaagactgattatgatgttaattatga-ttcgaattacattgatta 19928952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 22461463 - 22461639
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  22461463 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 22461558  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  22461559 atgtgataaatgtttatcaaagatgtaatgttgattaagaatgattatgatgttaattacgattccgtattatattgatta 22461639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Original strand, 25964001 - 25964178
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------- 480  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||            
T  25964001 attaatactataatgctgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgggtcaattgatgtt 25964098  T
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  25964099 aagatgttatgttatttatgatgattg-aataaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 25964178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 422 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 26125014 - 26124839
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttat-gttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  26125014 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagatgatattgttattgatgatgattgaagt--tgtgatt 26124920  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatt 600  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  26124919 atgtgataattgtttattaaagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttttgaattataatgatt 26124839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 481
Target Start/End: Original strand, 21327857 - 21327946
Alignment:
Q  391 ttaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21327857 ttaatactaaacagttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 21327946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 1282531 - 1282455
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1282531 atgttatgttattgatgatgatc-aaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 1282455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 10102834 - 10102910
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10102834 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 10102910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 24629505 - 24629581
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24629505 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 24629581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 24648435 - 24648359
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24648435 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 24648359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 509 - 601
Target Start/End: Original strand, 24703587 - 24703679
Alignment:
Q  509 aatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24703587 aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgcaatgatatttaaga-tgtttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 24703679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 27380378 - 27380454
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27380378 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 27380454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 27384424 - 27384500
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27384424 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 27384500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 27600912 - 27600836
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27600912 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 27600836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 30346041 - 30346117
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30346041 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 30346117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 41531999 - 41532075
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41531999 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 41532075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 21318925 - 21319015
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21318925 attaatactaaactgttgggggcttatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttggattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 21319015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 24502866 - 24502766
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  24502866 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 24502770  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  24502769 gatt 24502766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24673381 - 24673299
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24673381 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatg 24673299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24679998 - 24679916
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24679998 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatg 24679916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 486
Target Start/End: Original strand, 23020009 - 23020090
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  23020009 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatg 23020090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23598169 - 23597994
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttat-gttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |  ||||| |    
T  23598169 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagaggatattgttattgatgaagattgaagt--tgtgaat 23598075  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatta 601  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  23598074 atgtgataattgtttatcaaagatgcaa-gttgattaagaatgattatgatgttagttatgatttttgaattataatgatta 23597994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23186906 - 23186732
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttat-gttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |  ||||| |    
T  23186906 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagaggatattgttattgatgaagattgaagt--tgtgaat 23186812  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatt 600  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  23186811 atgtgataattgtttatcaaagatgcaa-gttgattaagaatgattatgatgttagttatgatttttgaattataatgatt 23186732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 60583 - 60471
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||  | ||||| ||||| |||||| |||    
T  60583 ttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagacggattatgatgttagttatgatttt 60486  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  60485 tgaattataatgatt 60471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9784625 - 9784566
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9784625 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 9784566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 18855734 - 18855909
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | || |  ||||||    
T  18855734 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagttttaaagatgtttatgttgttgatgatgaataaagt--tgtgat 18855828  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18855829 tatgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgattttaattatga-tttgtattatattgatta 18855909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 24872821 - 24872888
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  24872821 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 24872888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 30971421 - 30971488
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  30971421 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 30971488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 40622513 - 40622559
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40622513 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 40622559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 22741269 - 22741312
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22741269 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22741312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 24880706 - 24880773
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  24880706 atgatatgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 24880773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25175640 - 25175582
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  25175640 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 25175582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 27195498 - 27195406
Alignment:
Q  483 gatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||    
T  27195498 gatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgaatatgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgattatgatgttaat 27195406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Original strand, 22134524 - 22134583
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  22134524 tgattggtaccacatgcatataagagattta-agttgcatagtcgcatttgtcaagtcaaa 22134583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Original strand, 23020100 - 23020179
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23020100 aagatgttatattatttatgatgttt-aaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 23020179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Original strand, 23020194 - 23020234
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23020194 tgtttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 23020234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 45678434 - 45678477
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45678434 tgggggctcatgccatgaattggtaccacatgcatataagaggt 45678477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 564 - 601
Target Start/End: Original strand, 22759206 - 22759244
Alignment:
Q  564 tttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22759206 tttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 22759244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 408 - 465
Target Start/End: Original strand, 22799433 - 22799490
Alignment:
Q  408 ggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  22799433 ggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 22799490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 427 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28405775 - 28405722
Alignment:
Q  427 gtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  28405775 gtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 28405722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 8064 - 8093
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8064 gattggtaccacatgcatataagaggttta 8093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 8946461 - 8946424
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946461 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggttta 8946424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 18787234 - 18787263
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787234 gattggtaccacatgcatataagaggttta 18787263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 22413468 - 22413497
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22413468 gattggtaccacatgcatataagaggttta 22413497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 584
Target Start/End: Original strand, 24641327 - 24641420
Alignment:
Q  488 tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt 584  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || | || |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  24641327 tatgttgttgatgacgattgaat--atgtgattacgtgatgattgtttatcaaatatgaaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattatgatt 24641420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 38433 - 38496
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  38433 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 38496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7679429 - 7679366
Alignment:
Q  403 tgttgggggctc-atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  7679429 tgttgggggctttatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 7679366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Original strand, 21319036 - 21319111
Alignment:
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21319036 tgttatgttatctatgatgattg-aatgaagtgattgcttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 21319111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Original strand, 21327967 - 21328042
Alignment:
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21327967 tgttatgttatctatgatgattg-aatgaagtgattgcttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 21328042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Original strand, 22799614 - 22799654
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22799614 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 22799654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 23072267 - 23072330
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  23072267 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 23072330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 194 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33587347 - 33587146
Alignment:
Q  194 gtgtcttagaaggactaaaaacgtgttttaagttttaactccactttttagtccgttacaagacaatcgattttaaaaattactttttaagttgataaga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33587347 gtgtcttagaaggactaaaaacgtgttttaagttttaactccactttttagtccgttacaagacaatcgattttaaaaattactttttaagttgataaga 33587248  T
Q  294 tttttcctgatttaaaaggtcacacatgctaagtttggataatcagaatcatctgcagaaccaacttnnnnnnngtcttctagaactgactgtataatta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  33587247 tttttcctgatttaaaaggtcacacatgctaagtttggataatcagaatcatctgcagaaccaacttaaaaaaagtcttctagaactgactgtataatta 33587148  T
Q  394 at 395  Q
    ||    
T  33587147 at 33587146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 27567887 - 27568097
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggg-gctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27567887 attaatactatgatgttggggagctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcgaaagatgtt 27567985  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttga 588  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27567986 atgttattgatgatgattgaa-tgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgcaattatgtttaagattgtttatgttgttaattatgattttga 27568084  T
Q  589 attatattgatta 601  Q
    |||||||||||||    
T  27568085 attatattgatta 27568097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 19791068 - 19791265
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19791068 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatt-gcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 19791165  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg-attttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19791166 gattgaaatgatgtgattacttaataattgtttattgaggatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgaattttgaattatattgatta 19791265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 27553849 - 27554058
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27553849 attaatactatgatgttgggggctcatgccttgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 27553947  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27553948 tgttattgatgatgattgaa-tgatgtggatacttattaattgtttatcaaagatgcaatgatatttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 27554046  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  27554047 ttatattgatta 27554058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33587533 - 33587410
Alignment:
Q  8 ataactgttcttgagggttttgaaaggtagtacttttgaattggttctcataaatttgattaaaaaacgagtttgactaacttaaatttaaggacgaagg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33587533 ataactgttcttgagggttttgaaaggtagtacttttgaattggttctcataaatttgattaaaaaacgagtttgactaacttaaatttaaggacgaagg 33587434  T
Q  108 ttgtactttttaattggttctatg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33587433 ttgtactttttaattggttctatg 33587410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17804017 - 17803841
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  17804017 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattg-aatactgtgatta 17803920  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17803919 cttgttaattg-ttatcaaagatgcaatgatgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 17803841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 18180324 - 18180114
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  18180324 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcacatt-gtcgagtcaaaagatgtt 18180227  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt--tt 586  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |   ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  18180226 atgttgttgatgatgattg-aatgaattgattgcttgatattatattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtatatgttgttaattatgatttgtt 18180129  T
Q  587 gaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||    
T  18180128 gaattatattgatta 18180114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 16523670 - 16523886
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  16523670 attaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 16523767  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  16523768 agatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattacg 16523865  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16523866 attgttgaattatattgatta 16523886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 22408579 - 22408788
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22408579 attaatactaaaatgataggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaaagatgtt 22408676  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||  |||| || ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  22408677 atgttattgatgatgattg-aatgaagtgactacttaatattttattataaatgatgctatgatgtttaaga-tatttatgttgttaattatgattgttg 22408774  T
Q  588 aattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||    
T  22408775 aattatattgatta 22408788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 20908259 - 20908449
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  20908259 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca---------ttgtcgagtcaaaagatgtta 20908349  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttga 588  Q
    ||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20908350 tgttat------------gaatgatgtgattacttgataattgtttataaaaaatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattatgattgttga 20908436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 18692198 - 18692414
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  18692198 attaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 18692295  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  18692296 agatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattgcttgatatttgattatcaaaaatgcaatgatgtttaaga-tgttcatgttgttaattacg 18692393  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  18692394 attgttgaattatattgatta 18692414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 425 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 19298223 - 19298050
Alignment:
Q  425 tggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattact 523  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  19298223 tggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaa--gctgtgattact 19298128  T
Q  524 tgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19298127 tgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattacgatttcgaattatattgatta 19298050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 455 - 601
Target Start/End: Original strand, 25767449 - 25767592
Alignment:
Q  455 ttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgc 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  25767449 ttgcattgtcgcatttgtcgagtctaa-gatgttatgttattggtgatgattgaa-tgctgtgattacttgataattgtt-atctaagatgcaatgatga 25767545  T
Q  555 ttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25767546 ttaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 25767592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 16741038 - 16740860
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||    
T  16741038 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcacttgtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgatttgaa-gctgtgatt 16740942  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaa-ttatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16740941 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgataattaagaatgtttatgatgttaatttatgatttcgaattatattgatta 16740860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 2685592 - 2685768
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  2685592 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaaat--tgtgatt 2685687  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2685688 atgtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattacgatttcgtattatattgatta 2685768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 458 - 601
Target Start/End: Original strand, 9482601 - 9482743
Alignment:
Q  458 cattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgctt 556  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||    
T  9482601 cattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttattgattatgattgaaac--tgtgattacttgataattgtttatcaaggatgctatgttgttt 9482698  T
Q  557 aagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9482699 aagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 9482743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 19662601 - 19662425
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  19662601 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 19662506  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  19662505 atgtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagaatgattatgatgttaattacgattccgtattatattgatta 19662425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 422 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 12706520 - 12706362
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  12706520 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgttgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaa--gctgtgat 12706425  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga 582  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  12706424 tacttgataattttttatcaaagatgcaaggatgattaagactgattatgatgttagttatga 12706362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 596
Target Start/End: Original strand, 21830726 - 21830929
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  21830726 attaatactataatgttggaggttcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgtt 21830823  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    | | | || ||| | |||  ||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||    
T  21830824 aagatgtt-atg-ttatttgaataaagtgattacttgatattttattatcaaagatgttatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaatcacgattgttg 21830920  T
Q  588 aattatatt 596  Q
    |||||||||    
T  21830921 aattatatt 21830929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12496139 - 12495964
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  12496139 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagacgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 12496044  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12496043 atatgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 12495964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21766523 - 21766316
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  21766523 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccacatgcatataataggtata-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgtt 21766426  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    | | | || ||| | |||  ||| | |||||||| ||||| ||  ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||    
T  21766425 aagatgtt-atg-ttatttgaataaagtgattacatgatattttattatcaaagatgttatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaatcacgattgttg 21766329  T
Q  588 aattatattgatt 600  Q
    |||||||||||||    
T  21766328 aattatattgatt 21766316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 515 - 601
Target Start/End: Original strand, 22430402 - 22430488
Alignment:
Q  515 gtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22430402 gtgattatctgataattgtttatcaatgatactatgatgcttaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 22430488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18906941 - 18906846
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  18906941 attaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatg 18906846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11565942 - 11565866
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11565942 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 11565866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 12619868 - 12619944
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12619868 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 12619944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 16759317 - 16759241
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16759317 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 16759241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 19869709 - 19869633
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19869709 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 19869633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22948197 - 22948121
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22948197 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 22948121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22952153 - 22952077
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22952153 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 22952077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23394148 - 23394072
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23394148 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 23394072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23414056 - 23413980
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23414056 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 23413980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23870641 - 23870565
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23870641 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 23870565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23874597 - 23874521
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23874597 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 23874521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23989040 - 23988964
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23989040 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 23988964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21702053 - 21701941
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  21702053 ttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgattacgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgtttaagactgattatgatgttagttatgatttt 21701956  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  21701955 tgaattataatgatt 21701941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 8242954 - 8242878
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  8242954 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttgctaattgtttatcaaatatgctatgatgtttaagat 8242878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 19808275 - 19808181
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||    
T  19808275 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgaatacgtgataattgtttatcaaacatgcaaagttgtttaagattgtttatgatgttaat 19808181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Original strand, 34298973 - 34299073
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  34298973 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 34299069  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  34299070 gatt 34299073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Original strand, 31479243 - 31479304
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31479243 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 31479304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Original strand, 5617155 - 5617267
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  5617155 ttatgttattgatgaagattgaa--gttgtgattatgtgatacttgtttatcagagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttt 5617252  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  5617253 tgaattataatgatt 5617267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 22074477 - 22074536
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22074477 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 22074536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 25597040 - 25597107
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  25597040 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 25597107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2077074 - 2077028
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2077074 tgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 2077028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16623102 - 16623041
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16623102 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 16623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 21740336 - 21740382
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21740336 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 21740382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 577
Target Start/End: Original strand, 22333915 - 22334002
Alignment:
Q  488 tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||    
T  22333915 tatgttgttgatgatgattgaat--atgtgaatacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgattatgatgttaat 22334002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 14471373 - 14471317
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14471373 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 14471317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 486
Target Start/End: Original strand, 15894742 - 15894821
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  15894742 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgttgagtcaaatgatg 15894821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 22335200 - 22335245
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22335200 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22335245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 584
Target Start/End: Original strand, 34370334 - 34370431
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgat 583  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  34370334 atgttatgttgttgatgacgattgaat--atgtgattacatgataaatgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattatgat 34370430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Original strand, 1588071 - 1588183
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||| | ||||| |||||| |||    
T  1588071 ttatgttattaatgaagattgaagt--tgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattacgatgttagttatgatttt 1588168  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  1588169 tgaattataatgatt 1588183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19862790 - 19862747
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19862790 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 19862747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19872932 - 19872889
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19872932 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 19872889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Original strand, 22081051 - 22081117
Alignment:
Q  415 atgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  22081051 atgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 22081117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22432061 - 22432018
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22432061 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22432018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22438611 - 22438568
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22438611 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22438568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 34832322 - 34832255
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  34832322 atgatgtgattacgtgataattgtttctcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 34832255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22831312 - 22831247
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  22831312 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaa 22831247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 16960323 - 16960368
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16960323 gttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 16960368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 16965612 - 16965657
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16965612 gttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 16965657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 22758597 - 22758500
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgat 583  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22758597 atgttatgttgttgatgacgattgaat--atgtgattaggtgatgattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattatgat 22758501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 16920948 - 16921011
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||    
T  16920948 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggttta-agttgcatagttgaatttgtcgagtc 16921011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1561106 - 1561040
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  1561106 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 1561040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 19651984 - 19651926
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || | |||||||||||||||    
T  19651984 gattggtaccacatgcatataagagattta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 19651926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 444
Target Start/End: Original strand, 25642492 - 25642531
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataag 444  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25642492 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataag 25642531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 9100903 - 9100932
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9100903 gattggtaccacatgcatataagaggttta 9100932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13019279 - 13019250
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13019279 gattggtaccacatgcatataagaggttta 13019250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 478
Target Start/End: Original strand, 31155695 - 31155747
Alignment:
Q  425 tggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  31155695 tggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtc 31155747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11185316 - 11185253
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||  ||||||||||||    
T  11185316 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcacatttgtcgagtc 11185253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Original strand, 15894850 - 15894890
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15894850 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 15894890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Original strand, 25629677 - 25629732
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  25629677 gattggtaccacatgcatataggaggtcta-aattgcatagtcgcatttgtcgagtc 25629732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Original strand, 27325901 - 27325955
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||    
T  27325901 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtc 27325955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 28496788 - 28496851
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  28496788 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 28496851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 29809199 - 29809262
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  29809199 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 29809262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 441
Target Start/End: Original strand, 31165142 - 31165178
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31165142 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 31165178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 15353584 - 15353793
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15353584 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgtattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 15353682  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353683 tgttattgatgatgattgaa-tgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 15353781  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  15353782 ttatattgatta 15353793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 11250850 - 11251046
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11250850 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagttaaaagatgttatgttgttgatgat 11250948  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250949 gattgaac-gatgtgattacttgctaattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 11251046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 25555308 - 25555111
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaa-gatgttatgttattgatga 501  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25555308 tgttgggggctcatgtcctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatt-gcattgtcgcatttgccgagtcaaaaagatgttttgttattgatga 25555211  T
Q  502 tgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25555210 tgattgaaatgatgtgattacttaataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 25555111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 36134225 - 36134401
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36134225 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcacatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 36134322  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36134323 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 36134401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 5339263 - 5339473
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5339263 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaaaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaaagatgtt 5339360  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt--tt 586  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |   ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  5339361 atgttgttgatgatgattg-aatgaagtgattgcttgatattatattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtatatgttgttaattatgatttgtt 5339458  T
Q  587 gaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||    
T  5339459 gaattatattgatta 5339473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 455 - 601
Target Start/End: Original strand, 1952066 - 1952211
Alignment:
Q  455 ttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1952066 ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaa--gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgttg 1952163  T
Q  554 cttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1952164 attaagactgattatgatgttatttatgatttcgaattatattgatta 1952211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 16348949 - 16349166
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa------- 481  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||           
T  16348949 attaatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaatgatgtt 16349046  T
Q  482 -agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  16349047 aagatgttatgttatttatgataattg-aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatactatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattac 16349144  T
Q  581 gatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16349145 gattcttgaattatattgatta 16349166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 406 - 601
Target Start/End: Original strand, 16357253 - 16357454
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa--------agatgttatgttatt 496  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||        |||||||||||||||    
T  16357253 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaatgatgttaagatgttatgttatt 16357350  T
Q  497 gatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatat 595  Q
     ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16357351 tatgataattgaa-tgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatat 16357448  T
Q  596 tgatta 601  Q
    ||||||    
T  16357449 tgatta 16357454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 422 - 600
Target Start/End: Original strand, 17152760 - 17152934
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  17152760 gattggtactacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgacgattgaagt--tgtgatt 17152854  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatt 600  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17152855 atgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatt 17152934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 455 - 601
Target Start/End: Original strand, 19757906 - 19758051
Alignment:
Q  455 ttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  19757906 ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttattgattatgattgga--gctgtgattacttgataattgtttatcaaagacgctatgttg 19758003  T
Q  554 cttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19758004 tttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 19758051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 455 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 19781900 - 19781755
Alignment:
Q  455 ttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  19781900 ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttattgattatgattgga--gctgtgattacttgataattgtttatcaaagacgctatgttg 19781803  T
Q  554 cttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19781802 tttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 19781755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 18222652 - 18222829
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  18222652 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgttgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgat 18222747  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18222748 tatgtgataattgtttatcaatgatgcaatgttgattaagactgattgtgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 18222829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 16243675 - 16243851
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || | ||||||||||| |||| |||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  16243675 gattggtaccacatgcatataa-atgtcta-agttgcattgtcgcatttatcgaatttaaagatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgact 16243770  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16243771 acttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacatttatta 16243851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 2014609 - 2014433
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  |||||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  2014609 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcatcgtcgcatttgtcgagtttgaagatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 2014514  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2014513 acttggtaattgtttatccaggatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 2014433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 423 - 601
Target Start/End: Original strand, 18229128 - 18229304
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||    
T  18229128 attggtaccatatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtaatt 18229223  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18229224 atgtgatacttgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattgtgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 18229304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23139102 - 23138927
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  23139102 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 23139007  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23139006 atgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 23138927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Original strand, 16352129 - 16352223
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16352129 attaatactatgatgttgggagctcatgccctgattgctaccacatgcata--agaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatg 16352223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 18236722 - 18236546
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||    
T  18236722 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgttt 18236628  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgt-tgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18236627 atgtgataattgtttatcaaagatgtaatgttgattaagaccgattatgaatgttaattatgatttcgaattatattgatta 18236546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 539 - 601
Target Start/End: Original strand, 16352217 - 16352280
Alignment:
Q  539 aaagatgcaatgat-gcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352217 aaagatgcaatgattgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 16352280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 26243940 - 26244115
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |  |||||||    
T  26243940 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgacgatgaatgaagt--tgtgatt 26244035  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||| || || ||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26244036 atgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgatttagactgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 26244115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 45937979 - 45937804
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| |   | ||||||    
T  45937979 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatatgtcgagtttcaaagatgtttatgttgttgatgatgattaa---gctgtgat 45937885  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45937884 tatgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagattgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 45937804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 3412564 - 3412452
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  3412564 ttatgtcattgatgatgattgaagt--tgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttagttatgatttt 3412467  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  3412466 tgaattataatgatt 3412452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 14708911 - 14709087
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  14708911 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaaggtgtttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgatt 14709005  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatta 601  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  14709006 atgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttttgaattataatgatta 14709087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 5757836 - 5757912
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5757836 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 5757912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 9555610 - 9555534
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9555610 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 9555534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 12486765 - 12486689
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12486765 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 12486689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 14758452 - 14758528
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14758452 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 14758528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 14955217 - 14955293
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14955217 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 14955293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Original strand, 16488363 - 16488539
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-------aa 481  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | | |||||||||||       ||    
T  16488363 attaatactaaaatgttgggggctcattccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgttgca-ttgtcgagtcaaatgatgaa 16488460  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  16488461 agatgttatgttgtttatgatgattg-gatgaagtgattacctgatattttattatcaatgatgttatgatgtttaagat 16488539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 600
Target Start/End: Original strand, 18603009 - 18603183
Alignment:
Q  424 ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaag-atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattac 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||     
T  18603009 ttggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagttttaaggatgttatgtcattgatgatgattgaagt--tgtgattaa 18603103  T
Q  523 ttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg-cttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatt 600  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  18603104 gtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgatttaagactgattatgatgttagttatgatttttgaattataatgatt 18603183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 25688983 - 25688907
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25688983 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 25688907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 33741380 - 33741304
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33741380 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 33741304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 484 - 560
Target Start/End: Original strand, 4562311 - 4562386
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaaga 560  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4562311 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaaga 4562386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Original strand, 41386095 - 41386195
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  41386095 aagatgttatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 41386191  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  41386192 gatt 41386195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 631255 - 631346
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  631255 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaagttttg-gttgcattgttgcatttgtcgagtcaaa 631346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Original strand, 18609642 - 18609755
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg-cttaagattgtttatgttgttaattatga-tt 584  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  18609642 ttatgtcattgatgatgattgaagt--tgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgatttaagactgattatgatgttagttatgattt 18609739  T
Q  585 ttgaattatattgatt 600  Q
    |||||||||| |||||    
T  18609740 ttgaattataatgatt 18609755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13569313 - 13569271
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569313 tgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggt 13569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 14678774 - 14678618
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta-gatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||   ||||||||| ||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||||   ||| ||||    
T  14678774 gattggtaccacatgcatataaggagtctaaga---gcattgtcgcatt-gtcgtgtctaatgatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgcgatt 14678681  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt 584  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  14678680 acgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattatgatt 14678618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12569827 - 12569748
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  12569827 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatg 12569748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Original strand, 13813457 - 13813518
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggttt 450  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13813457 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttt 13813518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 601
Target Start/End: Original strand, 15122194 - 15122313
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||||||||  ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||  |||||||  |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||     
T  15122194 aagatgttatgagatttatgatgttt-aaatgaagtgattacttgatattttattatcaataatgctatgatgttgaagat-gtttatgttgttaattac 15122291  T
Q  581 gatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  15122292 gattcttgaattatattgatta 15122313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 14684938 - 14684826
Alignment:
Q  469 ttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttat 568  Q
    |||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||    
T  14684938 ttgtcgtgtctaatgatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgcgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atat 14684842  T
Q  569 gttgttaattatgatt 584  Q
    | ||||||||||||||    
T  14684841 gatgttaattatgatt 14684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 9530265 - 9530089
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | || |  ||||||    
T  9530265 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatatgtcgagttttaaagatgtttatgttgttgatgatgaataaagt--tgtgat 9530170  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9530169 tatgtgatacatgtttatcaaggatgcaatgttgattaagactaattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 9530089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 53433041 - 53432974
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  53433041 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 53432974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 561
Target Start/End: Original strand, 13818054 - 13818189
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattac 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | | |||||| | |||||  ||||| |    
T  13818054 attggtaccacatgcatataagaggttttg-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgttgttatgttaattacgatgatag-aatgaaatgattgc 13818150  T
Q  523 ttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  13818151 ttgatattttattatcaatgatgctattatgtttaagat 13818189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 577
Target Start/End: Original strand, 21340037 - 21340124
Alignment:
Q  488 tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  21340037 tatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 21340124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 35613708 - 35613621
Alignment:
Q  488 tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  35613708 tatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 35613621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 15122104 - 15122149
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15122104 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 15122149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 17048614 - 17048659
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17048614 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 17048659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 35170403 - 35170309
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||    
T  35170403 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgaatatgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgattatgatgttaat 35170309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 23838189 - 23838089
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||   ||| ||||||||||    
T  23838189 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--aagtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-agatgatgttaattat 23838093  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  23838092 gatt 23838089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 7798579 - 7798513
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  7798579 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 7798513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 15125347 - 15125390
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15125347 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 15125390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 20157730 - 20157788
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||    
T  20157730 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttacattgtcgcatttgtcgagtcaaa 20157788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23843289 - 23843246
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23843289 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 23843246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 30235422 - 30235489
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||| ||||| |||||||    
T  30235422 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaaattacttaagattggttatgatgttaat 30235489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15093584 - 15093508
Alignment:
Q  409 gggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15093584 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgtattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatg 15093508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 15223860 - 15223804
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15223860 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 15223804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 14053619 - 14053682
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  14053619 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtc 14053682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 28569696 - 28569874
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg-ttatgttattgat-gatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||  | |||||||  | ||||||    
T  28569696 gattggtaccacatgcatataagagtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagttgtttatgctattgataaaagattgaa--gttgtgat 28569791  T
Q  520 tacttgat-aattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||| || |||||||||||||||| ||| || || ||| || ||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  28569792 tatgtgataaaatgtttatcaaagatgctatgttgatttagactgattaagatgttgattatgatttgaaattacattgatta 28569874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12423532 - 12423473
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12423532 attaatactatgatgttgggggctcatgtcctgaattggtaccaaatgcatataagaggt 12423473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12773879 - 12773821
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  12773879 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 12773821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14038499 - 14038441
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  14038499 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 14038441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 44675443 - 44675400
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44675443 tgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggt 44675400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 13515046 - 13515000
Alignment:
Q  555 ttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13515046 ttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 13515000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 564 - 601
Target Start/End: Original strand, 15125529 - 15125567
Alignment:
Q  564 tttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15125529 tttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 15125567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 451
Target Start/End: Original strand, 14174 - 14211
Alignment:
Q  415 atgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14174 atgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttta 14211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 12288542 - 12288571
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288542 gattggtaccacatgcatataagaggttta 12288571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12569719 - 12569679
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12569719 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 12569679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15093404 - 15093364
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15093404 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 15093364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15093498 - 15093419
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || ||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15093498 aagatattatgttatttatgatgttt-aaacgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 15093419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17046290 - 17046227
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  17046290 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 17046227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 11595428 - 11595625
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11595428 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 11595526  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11595527 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgattatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 11595625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 11557662 - 11557872
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11557662 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagagtcttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 11557761  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11557762 tgttattgatgatgattg-aatgaagtgattacttgataactgtttaacaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 11557860  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  11557861 ttatattgatta 11557872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 390 - 600
Target Start/End: Original strand, 1983088 - 1983296
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1983088 attaatactatgatgttggggcctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 1983186  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1983187 tgttattgatgatgattgaa-tgatgtgattacttgataattatttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 1983285  T
Q  590 ttatattgatt 600  Q
    ||||| |||||    
T  1983286 ttataatgatt 1983296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 42325769 - 42325572
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42325769 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 42325671  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42325670 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgattatgttgttaatcatgattttgaattatattgatta 42325572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 7793636 - 7793812
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7793636 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgttgtgatta 7793733  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7793734 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgttgttaattatgatttcgaattatattgatta 7793812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 327451 - 327627
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  327451 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 327548  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  327549 cttgttaattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 327627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 20461786 - 20461962
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20461786 gattgataccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 20461883  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20461884 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 20461962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 423 - 601
Target Start/End: Original strand, 2898110 - 2898291
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttat-----tgatgatgattgaaatgatgtg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     || ||||| ||||| |||||||    
T  2898110 attggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttatgttattggtgatggttgaa-tgatgtg 2898207  T
Q  518 attacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898208 attacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagactgtttatgatgttaattatgattttgaattatattgatta 2898291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15482495 - 15482318
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15482495 gattggtaccacatgcatataagagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctgaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatt 15482398  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15482397 acttgataactgtttatcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatga-ttcgaattatattgatta 15482318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 403 - 559
Target Start/End: Original strand, 3403246 - 3403402
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatga 501  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3403246 tgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgca-ttgtcgagtcgaaagatgttttgttattgatga 3403344  T
Q  502 tgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttat-caaagatgcaatgatgcttaag 559  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  3403345 tgattg-aatgatgtgattacttgataattgtttatccaaatatgcaaagatgtttaag 3403402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 457 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 7574792 - 7574650
Alignment:
Q  457 gcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgctt 556  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7574792 gcattgtcgcatttgtcgagtctaa-gatgttatgttattgatgatgattgaaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgatt 7574695  T
Q  557 aagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7574694 aagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 7574650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 31097829 - 31098005
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31097829 gattggtaccacatgcata-aagagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaa-gatgttatgttattgatgatgattgaa-tgttgtgatt 31097924  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31097925 acttggtaattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 31098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 322422 - 322206
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  322422 attaatactataatgctgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 322325  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |    
T  322324 agatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgacatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgataattacg 322227  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  322226 attgttgaattatattgatta 322206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 11849145 - 11848930
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  11849145 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 11849048  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11849047 agatgttatgatatttatgatcattgaa-tgagatgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat-gtttatgttgttaattacg 11848950  T
Q  582 attttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11848949 attttgaattatattgatta 11848930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12496089 - 12495872
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa------- 481  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||           
T  12496089 attaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgccgcatt-gtcgagtcaaatgatgtt 12495992  T
Q  482 -agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  12495991 aagatgttatgttatttatgataattgaa-tgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattac 12495894  T
Q  581 gatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12495893 gattgttgaattatattgatta 12495872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 18384202 - 18384417
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  18384202 attaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggttccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 18384299  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  18384300 agatgtaat-ttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatatttgattgtcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattacg 18384396  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  18384397 attgttgaattatattgatta 18384417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 3833504 - 3833328
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  3833504 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaatgatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 3833409  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3833408 acttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagaatgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 3833328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 390 - 572
Target Start/End: Original strand, 19726188 - 19726375
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------- 480  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||            
T  19726188 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgtt 19726285  T
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttg 572  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  19726286 aagatgttatgttatttatgatgattg-aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttg 19726375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 26196707 - 26196923
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  ||| ||||||||||       |    
T  26196707 attaatactatgatgttgggggctcatgccctttattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtctcatt-gtcgagtcaatttatgaa 26196804  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  26196805 agatgttatgttgtttatgatgattg-aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatactatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattata 26196902  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  26196903 attgttgaattatattgatta 26196923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 11862623 - 11862409
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  11862623 attaatactataatgatgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 11862526  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  11862525 agatgttatgatatttatgatgattgaatt-agatgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattacg 11862428  T
Q  582 att-ttgaattatattgat 599  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  11862427 attgttgaattatattgat 11862409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 38814214 - 38814037
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  38814214 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaatgatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 38814119  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaa-ttatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  38814118 acttgataattggttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaatttatgatttcgaattacattgatta 38814037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 16809155 - 16809330
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  16809155 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttgaagatgtttatgttattgatgatgat-gaaa-gatctgatt 16809249  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16809250 atgtgataattgtttatcaaagatgtaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 16809330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17241804 - 17241628
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  17241804 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 17241709  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  17241708 atgtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagaatgattatgatgttaattacgattccgtattatattgatta 17241628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 494 - 601
Target Start/End: Original strand, 23419705 - 23419810
Alignment:
Q  494 attgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattat 593  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23419705 attgatgatgattgaagt--tgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattat 23419802  T
Q  594 attgatta 601  Q
    ||||||||    
T  23419803 attgatta 23419810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 17318163 - 17318239
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17318163 atgttatgttattgatgatgatcgaaa-gttgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 17318239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 4108265 - 4108341
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4108265 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 4108341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 4112117 - 4112193
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4112117 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 4112193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 7108779 - 7108703
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7108779 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 7108703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 7112714 - 7112638
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7112714 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 7112638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 11166554 - 11166630
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11166554 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 11166630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 14159841 - 14159917
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14159841 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 14159917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15616718 - 15616642
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15616718 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 15616642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15964019 - 15963943
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15964019 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 15963943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15967943 - 15967867
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15967943 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 15967867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15971867 - 15971791
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15971867 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 15971791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22320747 - 22320671
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22320747 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 22320671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22335802 - 22335726
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22335802 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 22335726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 28948925 - 28948849
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28948925 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 28948849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 30064930 - 30064854
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30064930 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 30064854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 55022068 - 55021992
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  55022068 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 55021992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 20722765 - 20722665
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  20722765 aagatgttatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 20722669  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  20722668 gatt 20722665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 12172626 - 12172455
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg-- 486  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| | |||||||||||||  |||      
T  12172626 attaatattaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattctcgca-ttgtcgagtcaaataatgaa 12172529  T
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
      |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||  ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  12172528 agatgttatttatgatgattg-aatggagtgattacttaatattttattatcaatgatgctatgatatttaagat 12172455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11069228 - 11069155
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11069228 ttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 11069155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 14498488 - 14498412
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  14498488 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatatttaagat 14498412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 1598755 - 1598930
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||| | |   | ||||||    
T  1598755 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtagagtctcaaagatgtttatgttgttgatgatgaataa---gctgtgat 1598849  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1598850 tatgtgatacatgtttattaaagatgcaatgttgattaagaatgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 1598930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 12852812 - 12852903
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  12852812 attaatactatgatgttgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttttg-gttgcattgttgcatttgtcgagtcaaa 12852903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 452
Target Start/End: Original strand, 11298819 - 11298880
Alignment:
Q  392 taatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttag 452  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298819 taatactataatgttgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag 11298880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 545
Target Start/End: Original strand, 27411104 - 27411164
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27411104 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatg 27411164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Original strand, 28368800 - 28368894
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  28368800 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 28368894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Original strand, 28376618 - 28376712
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  28376618 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 28376712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Original strand, 28384440 - 28384534
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  28384440 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 28384534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 9512729 - 9512670
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  9512729 tgattggtaccacatgcatataagaggttta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 9512670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 9520704 - 9520645
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  9520704 tgattggtaccacatgcatataagaggttta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 9520645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 544
Target Start/End: Original strand, 14067599 - 14067658
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagat 544  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14067599 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 14067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 24187533 - 24187433
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  24187533 aagatgctatgttgttgatgatgattgaa--tatgtgattacgtgataattgcttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 24187437  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  24187436 gatt 24187433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Original strand, 49668388 - 49668447
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  49668388 tgattggtaccacatgcatataagaggttta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 49668447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 55148734 - 55148634
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  55148734 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatacaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 55148638  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  55148637 gatt 55148634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 12891070 - 12891003
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  12891070 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 12891003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 13320641 - 13320574
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  13320641 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 13320574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14665224 - 14665166
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14665224 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 14665166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14668380 - 14668322
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14668380 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 14668322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 16696552 - 16696441
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatttt 586  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||| || |||||| || | | | |||| |||||||||||    
T  16696552 ttatgctattgatgatgattgaa--gatgtgtttatatgataaatatttatcaaagatgcaatgttgattaagactgctaa-gatgttgattatgatttt 16696456  T
Q  587 gaattatattgatta 601  Q
    |||||| ||||||||    
T  16696455 gaattacattgatta 16696441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 17253498 - 17253565
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  17253498 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 17253565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 855954 - 855908
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  855954 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 855908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15067497 - 15067451
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15067497 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 15067451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Original strand, 16751668 - 16751729
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16751668 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 16751729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 839002 - 838908
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||    
T  839002 aagatgctatgttgttgatgatggttgaat--atgtgaatacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgattatgatgttaat 838908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 15942180 - 15942355
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | |   | ||||||    
T  15942180 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatatgtcgagtttcaaagatgtttatgttgttgatgatgaataa---gctgtgat 15942274  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  15942275 tatgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagaccgattatgatgttaattatga-attgtattatattgatta 15942355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 15878356 - 15878399
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15878356 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 15878399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23408241 - 23408198
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23408241 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 23408198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 32307468 - 32307410
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  32307468 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 32307410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16909688 - 16909642
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16909688 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacttgcatataagaggt 16909642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19774496 - 19774435
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19774496 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattttttatcaaagatgc 19774435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14572408 - 14572352
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  14572408 tgattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtc 14572352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 16332928 - 16332850
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||    
T  16332928 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atatgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagat 16332850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16796112 - 16796067
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16796112 gttgggggctcatgccctaaattggtaccacatgcatataagaggt 16796067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Original strand, 13210645 - 13210711
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  13210645 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 13210711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16369208 - 16369169
Alignment:
Q  410 ggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16369208 ggctcatgccctgcattggtaccacatgcatataagaggt 16369169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 606656 - 606685
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  606656 gattggtaccacatgcatataagaggttta 606685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 545
Target Start/End: Original strand, 11298921 - 11298985
Alignment:
Q  480 aaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatg 545  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11298921 aaagatgttatgttatttattatgattgaaa-gaaatgagtacttgatatttgattatcaaagatg 11298985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14234268 - 14234239
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234268 gattggtaccacatgcatataagaggttta 14234239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16097166 - 16097102
Alignment:
Q  413 tcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagt 477  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||    
T  16097166 tcatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagt 16097102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 17499143 - 17499106
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499143 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggttta 17499106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 22110683 - 22110712
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110683 gattggtaccacatgcatataagaggttta 22110712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 37251457 - 37251486
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251457 gattggtaccacatgcatataagaggttta 37251486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 52524060 - 52524089
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52524060 gattggtaccacatgcatataagaggttta 52524089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 12038226 - 12038274
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgc 437  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12038226 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 12038274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15467667 - 15467612
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  15467667 gattggtaccacatacatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtc 15467612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 23083677 - 23083740
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  23083677 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 23083740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 451
Target Start/End: Original strand, 53301857 - 53301885
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301857 attggtaccacatgcatataagaggttta 53301885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 3705343 - 3705552
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3705343 attaatactatgatgttgggggctcatgccctggttggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 3705441  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3705442 tgttattgatgatgattgaa-tgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcactgatgcttaagattgtttatgttgttaataatgattttgaa 3705540  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  3705541 ttatattgatta 3705552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 33050305 - 33050502
Alignment:
Q  403 tgttgggggctca-tgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatga 501  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33050305 tgttgggggctcactgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatt-gcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatga 33050402  T
Q  502 tgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33050403 tgattgaaatgatgtgattacttaataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 33050502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 18394254 - 18394449
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18394254 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttatatttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagaatgttatgttattgatgat 18394352  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18394353 gattg-aatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgcaatgatg-ttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 18394449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 403 - 600
Target Start/End: Original strand, 45490032 - 45490217
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45490032 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata---gaggtttagatttacattgt---------cgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 45490119  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatt 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45490120 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgattatgttgttaattatgattttgaattatattgatt 45490217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 21172832 - 21172656
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21172832 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 21172735  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21172734 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 21172656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 36819583 - 36819760
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  36819583 gattgataccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttatagatgatgattgaa-tgctgtgatta 36819680  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36819681 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 36819760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 21312948 - 21312772
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  21312948 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgttgggatta 21312851  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21312850 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 21312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 16080690 - 16080864
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  16080690 gattggtaccacatgcatataagagtgtcta-agttgcattgttgcatttgtcgagtctaaaggtgttatgttattgatgat---tgaa-tgatgtgatt 16080784  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16080785 acttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 16080864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Original strand, 3473209 - 3473385
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-------aa 481  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||       ||    
T  3473209 attaatactataatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttag-tttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaattgatgaa 3473306  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3473307 agatgttatgttatttatg-ttatttgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagat 3473385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 8761916 - 8762135
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtat-------ttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||       |||| ||||||||    
T  8761916 attaatactaaactgttggggtctcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgcattgtcgcattgttgagtcaaa 8762014  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatga-tgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |   ||||||| ||| | |||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  8762015 agatgttatgttgttgatgatgattg-aatgaagtgatgacttgatattatattatcaatgatactatgattgtttaaga-tgtatatgttgttaattat 8762112  T
Q  581 gatt--ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  8762113 gatttgttgaattatattgatta 8762135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 18182405 - 18182628
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa------- 481  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||           
T  18182405 attaatactaaaatgttgggg-ctcatgccatgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgttgcatt-gtcgagtcaaatgatgaa 18182501  T
Q  482 --------agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgt 573  Q
            ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18182502 agatgttaagatgttatgttatttatgatgattg-aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttgt 18182599  T
Q  574 taattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18182600 taattatgattgttgaattatattgatta 18182628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 20137914 - 20137739
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |||||||    
T  20137914 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttatcgattatgattgaagt--tgtgatt 20137819  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20137818 acttgataattgtt-atcaaagatggtatgttgtttgagattgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 20137739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 17678873 - 17679084
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  17678873 attaatactaaactgttgggggatcatgctctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcgaatgatgtt 17678970  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaa--ttatgatt-- 584  Q
    | | | || ||| | |||  ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||  || |||||      
T  17678971 aagatgtt-atg-ttatttgaatgaagtgattgcttgatatttgattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtatatgttgttaattttttgattcg 17679067  T
Q  585 ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||    
T  17679068 ttgaattatattgatta 17679084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 18882222 - 18882047
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  18882222 gattggtactacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 18882127  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18882126 atgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 18882047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 46975321 - 46975143
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatga-ttgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||| ||||||| | || |||||  | ||||||    
T  46975321 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaatgatgtatatgctattgattaagacttgaa--gctgtgat 46975226  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaa-ttatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  46975225 tacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaatttatgatttcgaattacattgatta 46975143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 484 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 52634874 - 52634788
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttg 572  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  52634874 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttg 52634788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 534 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 30644009 - 30643942
Alignment:
Q  534 ttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30644009 ttatcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 30643942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 1009803 - 1009727
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1009803 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 1009727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 1926179 - 1926255
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1926179 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 1926255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 16376430 - 16376506
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16376430 atgttatgttattgatgatgatc-aaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgccatgatgtttaagat 16376506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 20925193 - 20925269
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20925193 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 20925269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 20091762 - 20091821
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20091762 attaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 20091821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 22831671 - 22831730
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22831671 attaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22831730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 33796653 - 33796577
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33796653 atgttatgttattgaagatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 33796577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 23762967 - 23762867
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  23762967 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 23762871  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  23762870 gatt 23762867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12646702 - 12646525
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  12646702 gattggaaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaggatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 12646607  T
Q  521 acttgataattgtttat-caaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  12646606 atgtgataaatgtttattcaaagatgtaatgttgattaagaatgattatgatgttaattacgattccgtattatattgatta 12646525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 22449552 - 22449611
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22449552 attaatactaaaatgttgggggctcattccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 22449611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 601
Target Start/End: Original strand, 24783484 - 24783551
Alignment:
Q  535 tatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24783484 tatcaatgatgcaatgattcttacgatcgtttatgttgttaattatgatttttgaattatattgatta 24783551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 19111212 - 19111063
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta-gatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||   ||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  19111212 gattggtaccacatgcatataaggagtctaaga---gcattgtcgtatt-gtcgtgtctaa-gatgctatgttgttgatgatgattgaa--tatgtgatt 19111120  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  19111119 acgtgataattctttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 19111063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 50888194 - 50888261
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  50888194 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 50888261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Original strand, 39244979 - 39245040
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39244979 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 39245040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Original strand, 39248534 - 39248595
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39248534 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 39248595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 465
Target Start/End: Original strand, 41781789 - 41781864
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  41781789 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatacatataagaggtcta-atttgcatagtcg 41781864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 48603081 - 48603037
Alignment:
Q  405 ttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48603081 ttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 48603037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20248071 - 20248013
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  20248071 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 20248013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21714359 - 21714316
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21714359 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 21714316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 21788349 - 21788392
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21788349 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 21788392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 22469007 - 22469050
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22469007 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22469050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 33680796 - 33680738
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  33680796 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 33680738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 546
Target Start/End: Original strand, 41389430 - 41389488
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41389430 ttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 41389488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 42865519 - 42865562
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42865519 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 42865562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6151663 - 6151617
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6151663 tgttgggggctcatgccttgaattggtaccacatgcatataagaggt 6151617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21022395 - 21022349
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21022395 tgttggggcctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 21022349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21753837 - 21753779
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  21753837 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtggagtcaaa 21753779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 22922200 - 22922258
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  22922200 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgaatcaaa 22922258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 52928302 - 52928360
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  52928302 gattggtatcacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 52928360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 553
Target Start/End: Original strand, 18626681 - 18626748
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg 553  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  18626681 atgttatgttgttgatgatgattg--attatgtgattacgtgataaatgcttattaaagatacaatgatg 18626748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 564 - 601
Target Start/End: Original strand, 20091959 - 20091997
Alignment:
Q  564 tttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20091959 tttatgttgttaattatgattattgaattatattgatta 20091997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 480
Target Start/End: Original strand, 20229543 - 20229599
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20229543 gattggtaccacatgcatataa-atgttta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 20229599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 481
Target Start/End: Original strand, 20847461 - 20847517
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  20847461 attggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgta-ttgtcgagtcaaa 20847517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21161539 - 21161486
Alignment:
Q  424 ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  21161539 ttggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtc 21161486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 16368616 - 16368645
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368616 gattggtaccacatgcatataagaggttta 16368645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16758443 - 16758414
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758443 gattggtaccacatgcatataagaggttta 16758414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 22123434 - 22123479
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22123434 gttgggggcttgtgccctggattggtaccacatgcatataagaggt 22123479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 22131385 - 22131430
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22131385 gttgggggctcatgccctgaattgataccacatgaatataagaggt 22131430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 29297913 - 29297884
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29297913 gattggtaccacatgcatataagaggttta 29297884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 35261367 - 35261396
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261367 gattggtaccacatgcatataagaggttta 35261396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 41050367 - 41050396
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050367 gattggtaccacatgcatataagaggttta 41050396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 38801705 - 38801768
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  38801705 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 38801768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 8388 - 8191
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8388 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 8290  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8289 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttcagattgattatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 8191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4528
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4724 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatt-gcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 4627  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626 gattgaaatgatgtgattacttaataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 20569884 - 20570081
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20569884 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgtata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 20569982  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20569983 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatgatgcttaagattgattatgtcgttaattatgattttgaattatattgatta 20570081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 404 - 601
Target Start/End: Original strand, 9446450 - 9446646
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9446450 gttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcataaaagaggtttagatttgcattcttgcatttgtcgagtcaaaagttgttatgttattgatgatg 9446549  T
Q  504 attgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9446550 attg-aatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgcaatgatgattaagattgtttatgttgctaattatgattttgaattatattgatta 9446646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 42203835 - 42203626
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42203835 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagattcgcattgtcgcatctgtcgagtcaaaagatgtta 42203737  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42203736 tgttattgatgacgattgaa-tgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagattgtttgtgttgttaattatgatcttgaa 42203638  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  42203637 ttatattgatta 42203626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12317956 - 12317779
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12317956 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 12317859  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12317858 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 12317779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 14429714 - 14429498
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  14429714 attaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 14429617  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14429616 agatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattatg 14429519  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  14429518 attgttgaattatattgatta 14429498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 2759969 - 2759752
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  2759969 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgttgcatt-gtcgagtcaaatgatgtt 2759872  T
Q  489 a--------tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |        || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||     
T  2759871 aaaatgttatgatattgatgatgattgaa-tgaagtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgctgttaattac 2759774  T
Q  581 gatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  2759773 gtttgttgaattatattgatta 2759752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 395
Target Start/End: Original strand, 7680286 - 7680454
Alignment:
Q  225 gttttaactccactttttagtccgttacaagacaatcgattttaaaaattactttttaagttgataagatttttcctgatttaaaaggtcacacatgcta 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  7680286 gttttaactccactttttagtcggttacaagacaatcgattttaaaaattactttttaagtttgtaagttttttactgatttaaaaggtcacacttggta 7680385  T
Q  325 agtttggataatcagaatcatctgcagaaccaacttnnnnnnngtcttctagaactgactgtataattaat 395  Q
    ||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7680386 agtcttgataaatagaatcatctgtagaaccaactt--aaaaagtcttctagaactgactgtataattaat 7680454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 421 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 9593178 - 9593001
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  9593178 tgattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaa--gctgtgat 9593083  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9593082 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 9593001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 423 - 601
Target Start/End: Original strand, 14152280 - 14152455
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattac 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  14152280 attggtaccacatgcatataaaaggtcta-agttgcattgtcgcatttgttgagtctaaggatgttatgttattaatgatgattgaa-tgctgtgattac 14152377  T
Q  523 ttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14152378 ttgataattgtt-atcaaagatgcaatgacgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcaaattatattgatta 14152455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 423 - 561
Target Start/End: Original strand, 15605549 - 15605685
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattac 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15605549 attggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattg-aatgctgtgattac 15605646  T
Q  523 ttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15605647 ttgataattgtttatcaaagatacaatgatgattaagat 15605685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 455 - 601
Target Start/End: Original strand, 13635770 - 13635914
Alignment:
Q  455 ttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgc 554  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13635770 ttgcattgtcgcatttgtcgagtctgaagatgctatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgattaattgataactgtttatcaaagatgcaatgatga 13635868  T
Q  555 ttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13635869 ttaagactgtttatgatgttaattatga-ttcgaattatattgatta 13635914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 13148985 - 13148809
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  13148985 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 13148890  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13148889 acttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 13148809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 421 - 601
Target Start/End: Original strand, 20627 - 20804
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  20627 tgattggtaccaaatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttatttatgatgattgaagt--tgtgat 20722  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20723 tatgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 20804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 16457631 - 16457807
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt--atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |  ||||||    
T  16457631 gattggtaccacatgcatataattgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagatgttttatgttgttgatgatgattgaagt--tgtgat 16457725  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||| | |||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16457726 tatgtgataaatatttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgattttgaactatattgatta 16457807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 8917257 - 8917081
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||| || |  ||||||    
T  8917257 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagttttaaagatgtttatgtcattgatgatgattaaagt--tgtgat 8917163  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8917162 taagtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgtttaagactgattatgatgttatttatgatttcgaattatattgatta 8917081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 487 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 13461526 - 13461414
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatttt 586  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| |||||||||     
T  13461526 ttatgtcattgatgatgattgaagt--tgtgattaagtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgtttaagactgattatgatgttatttatgatttc 13461429  T
Q  587 gaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||    
T  13461428 gaattatattgatta 13461414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 6801043 - 6800867
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  6801043 gattggtaccacatgcatttaagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttgttgatgatgaatgaagt--tgtgatt 6800948  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||    
T  6800947 atgtgataaatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagaatgattatgatgtcaattacgattccgtattatattgatta 6800867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 3271610 - 3271480
Alignment:
Q  469 ttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttat 568  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| || ||||    
T  3271610 ttgtcgagtcaaatgttgttatgttaattatgatgattg-aatga-gtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgattat 3271514  T
Q  569 gttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3271513 gttgttgattatgattgttgaattatattgatta 3271480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 32189 - 32113
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32189 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 32113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 71833 - 71909
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  71833 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 71909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 75942 - 76018
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  75942 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 76018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 12705693 - 12705769
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12705693 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 12705769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18301905 - 18301814
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18301905 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatacatataagaggttttg-gttgcattgttgtatttgtcgagtcaaa 18301814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 423 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16583086 - 16583000
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaa 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16583086 attggtaccacatgcatgtaagagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctgaagatgttatgttattgatgatgattgaa 16583000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 600
Target Start/End: Original strand, 16724906 - 16725083
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgag-tcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||||||| |  ||||||    
T  16724906 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagctttaaagatgtttatgttattgacgaagattgaagt--tgtgat 16725001  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatt 600  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || || || ||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  16725002 tatgtgatacttgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattttgatgttggttatgatttttgaattataatgatt 16725083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 600
Target Start/End: Original strand, 17701920 - 17702097
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgag-tcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||||||| |  ||||||    
T  17701920 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagctttaaagatgtttatgttattgacgaagattgaagt--tgtgat 17702015  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatt 600  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || || || ||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  17702016 tatgtgatacttgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattttgatgttggttatgatttttgaattataatgatt 17702097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 12714004 - 12713928
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12714004 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 12713928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 18278523 - 18278447
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18278523 atgttatgttattgatgatgatcgaattt-tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 18278447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 18282486 - 18282410
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18282486 atgttatgttattgatgatgatcgaattt-tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 18282410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 45171057 - 45171133
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  45171057 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatttttaagat 45171133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 11262084 - 11261984
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  11262084 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 11261988  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  11261987 gatt 11261984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26419755 - 26419655
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  26419755 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 26419659  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  26419658 gatt 26419655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 14216690 - 14216578
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  14216690 ttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttt 14216593  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  14216592 tgaattataatgatt 14216578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 501
Target Start/End: Original strand, 14933050 - 14933128
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatga 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  14933050 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatga 14933128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 501
Target Start/End: Original strand, 15356485 - 15356563
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatga 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  15356485 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatga 15356563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 501
Target Start/End: Original strand, 15360599 - 15360677
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatga 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  15360599 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatga 15360677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9703074 - 9703032
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703074 tgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggt 9703032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12717828 - 12717767
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12717828 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 12717767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12722739 - 12722678
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 546  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12722739 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 12722678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16275290 - 16275179
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  16275290 ttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgattatgtgatacttctttatcaaagatgcaaagttgattaagattgattatgatgttagttatgatttt 16275193  T
Q  586 tgaattatattgat 599  Q
    ||||||||| ||||    
T  16275192 tgaattataatgat 16275179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 12692251 - 12692151
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  12692251 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattatgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 12692155  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  12692154 gatt 12692151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 14126161 - 14126102
Alignment:
Q  542 gatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14126161 gatgcaatgatgtttaagat-gtttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 14126102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Original strand, 44408660 - 44408760
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  44408660 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattatgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 44408756  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  44408757 gatt 44408760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 6017613 - 6017680
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  6017613 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 6017680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 583
Target Start/End: Original strand, 11548617 - 11548716
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  11548617 aagatgctatgttgttgatgacgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 11548713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15580408 - 15580322
Alignment:
Q  515 gtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15580408 gtgattatctgatatttgtttatcaatgatactatgatgtttaagat-gtttatgttgttaattataattgttgaattatattgatta 15580322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 17138363 - 17138409
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17138363 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 17138409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 18556801 - 18556627
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||  ||| ||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |  |||||||    
T  18556801 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcacatt-gtcaagtttaaagatgtttatgt-attgatgatgactgaagt--tgtgatt 18556708  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  ||||||||||||||||||||||   ||  | |||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  18556707 atgtgataattgtttatcaaagatgtgttgtcgattaagactgtttatgatgttatttatgattccgaattatattgatta 18556627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 563
Target Start/End: Original strand, 11555213 - 11555293
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattg 563  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||    
T  11555213 aagatgctatgttgttgatgacgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg 11555293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 15728090 - 15727978
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||| | ||||| |||||| |||    
T  15728090 ttatgttattaatgaagattgaagt--tgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattacgatgttagttatgatttt 15727993  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  15727992 tgaattataatgatt 15727978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 18155145 - 18155188
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18155145 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 18155188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24054277 - 24054234
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24054277 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 24054234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 14952980 - 14952913
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatg 550  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14952980 aagatgctatgttgttgatgatgattgaa--tatgtgattacgtgataatcgtttatcaaatatgcaatg 14952913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 14958919 - 14958852
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatg 550  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14958919 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgtaatg 14958852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 15380573 - 15380506
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatg 550  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15380573 aagatgctatgttgttgatgatgattgaa--tatgtgattacgtgataatcgtttatcaaatatgcaatg 15380506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 481
Target Start/End: Original strand, 811467 - 811523
Alignment:
Q  424 ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  811467 ttggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 811523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 561 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15211100 - 15211059
Alignment:
Q  561 ttgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15211100 ttgtttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 15211059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15211268 - 15211223
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15211268 gttgggggctcatgccctgtattggtgccacatgcatataagaggt 15211223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 18424549 - 18424493
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18424549 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 18424493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 440
Target Start/End: Original strand, 12322032 - 12322079
Alignment:
Q  394 atactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 440  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12322032 atactaaaatgttgggggctcatcccctgaattggtaccacatgcata 12322079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 15144356 - 15144414
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  15144356 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 15144414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Original strand, 15755269 - 15755335
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  15755269 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 15755335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16582982 - 16582943
Alignment:
Q  470 tgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582982 tgtcgagtctgaagatgttatgttattgatgatgattgaa 16582943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 19649794 - 19649837
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19649794 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatggatataagaggt 19649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20487411 - 20487352
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  20487411 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattgataccatatgcatataagaggt 20487352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 35151406 - 35151294
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||  |||||| ||||||||||  |||  ||| || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  35151406 ttatgttattgatgaagattgaa--gttgtgattatgtgataagtgtttatcaactatgttatgttgtttaagactgattatgatgttagttatgatttt 35151309  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  35151308 tgaattataatgatt 35151294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 44013968 - 44013910
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  44013968 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 44013910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12186833 - 12186787
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12186833 tgttggaggctcatgccctaaattggtaccacatgcatataagaggt 12186787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 601
Target Start/End: Original strand, 48813926 - 48813972
Alignment:
Q  555 ttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48813926 ttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 48813972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 2282581 - 2282610
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2282581 gattggtaccacatgcatataagaggttta 2282610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16056118 - 16056089
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16056118 gattggtaccacatgcatataagaggttta 16056089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 448
Target Start/End: Original strand, 16220041 - 16220074
Alignment:
Q  415 atgccctgattggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16220041 atgccctggttggtaccacatgcatataagaggt 16220074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 11996345 - 11996408
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  11996345 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 11996408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 16402753 - 16402816
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  16402753 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 16402816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40443257 - 40443194
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  40443257 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 40443194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 10573 - 10781
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10573 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtctagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 10671  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10672 tgttattgatgatgattgaat--atgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagattgtttatgttgttaattatgatttcgaa 10769  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  10770 ttatattgatta 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 475
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2797
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcga 475  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2713 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtctagatttgcattgtcgcatttgtcga 2797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 390 - 602
Target Start/End: Original strand, 414325 - 414537
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  414325 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggcaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgtta 414424  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtga-ttacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  414425 tgttattgatgatgattg-aatgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattatgattgttg 414522  T
Q  588 aattatattgattag 602  Q
    |||||||||||||||    
T  414523 aattatattgattag 414537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 421 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 100903 - 100727
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||    
T  100903 tgattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtctaaaggtgtttatgttattgatggtgattgaa--gctgtgat 100809  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  100808 tacttgataattgtttatcaaaaatgcaatgatgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 100727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 514 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 139453 - 139382
Alignment:
Q  514 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattt 585  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  139453 tgtgattatgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgattt 139382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 4492 - 4687
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  4492 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgaatcaaagaatgttatgttattgatgat 4590  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4591 gattg-aatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgcaatgatg-ttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 4687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 2010 - 1802
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2010 attaatactataatgttgggggctaatgccttgattggtaccacatgcata-aagaggtttagattttcattgtcgcatttgtcgagtcagaagatgtta 1912  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 589  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1911 tattattgatgatgattgaa-tgaagtgattacttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgtttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaa 1814  T
Q  590 ttatattgatta 601  Q
    ||||||||||||    
T  1813 ttatattgatta 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 403 - 601
Target Start/End: Original strand, 205352 - 205549
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  205352 tgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcata-aataggattagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatgttttgttattgatgat 205450  T
Q  503 gattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  205451 gattgaaatgatgtgattacttgataattggttattgaagatgcaatgaagcttaagattgattatgttgttaattaagactttgaattatattgatta 205549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 7314 - 7105
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  7314 attaatactatgatgttgagggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttatatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaacatg-ta 7216  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttga 588  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7215 tgttattgatgatgattg-aatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcattgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattatgattgttga 7118  T
Q  589 attatattgatta 601  Q
    |||||||||||||    
T  7117 attatattgatta 7105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 390 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 68706 - 68546
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  68706 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaaagatatta 68607  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatg 550  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  68606 tgttattgttgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgcaatg 68546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 66701 - 66877
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  66701 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 66798  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  66799 cttgttaattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 66877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 1630 - 1421
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1630 attaatactataatgttgggcgctcatgccatgaattgataccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcattt-tcgagtcaaaagatgtt 1533  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttg 587  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1532 atgttattgatgatgattgaa-tgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattatgatttttg 1435  T
Q  588 aattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||    
T  1434 aattatattgatta 1421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 39095213 - 39095411
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39095213 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaaagatgtta 39095311  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttga 588  Q
    ||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39095312 tgttat------------gaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatacaatgatgtttaaga-tgttcatgttgttaattatgattgttga 39095398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 20856714 - 20856926
Alignment:
Q  390 attaatact-aaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagt---caaaaga 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||    |||| |    
T  20856714 attaatacttaaactgttgggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtc-tcattgtcgagttaaaaaaaaa 20856811  T
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20856812 tgttatgttattgatgatgattg-aatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg-ttaaga-tgtttatgtagttaattatgatt 20856908  T
Q  585 -ttgaattatattgatta 601  Q
     |||||||||||||||||    
T  20856909 gttgaattatattgatta 20856926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 22044715 - 22044539
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  22044715 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaa--gctgtgatt 22044620  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22044619 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgacgattaagattgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 22044539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 22010953 - 22011162
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  22010953 attaatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gttgagtcaaaagatgtt 22011050  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    | ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22011051 aagttattgatgatgattg-aatgaaatgactacttgatattttattatcaatgatgatatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattatgattgttg 22011148  T
Q  588 aattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||    
T  22011149 aattatattgatta 22011162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 16231749 - 16231925
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  16231749 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaa--gctgtgatt 16231844  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231845 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 16231925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 17926991 - 17927207
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------a 481  Q
    |||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |    
T  17926991 attaatactataatgctggaggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaa 17927088  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    |||||  |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17927089 agatgcaatgttagttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatattttattattaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattatg 17927186  T
Q  582 att-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  17927187 attgttgaattatattgatta 17927207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 23847290 - 23847466
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  23847290 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 23847385  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23847386 acttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 23847466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 390 - 528
Target Start/End: Original strand, 16861611 - 16861747
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16861611 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcacatt-gtcgagtcaaaagatgtt 16861708  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgata 528  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  16861709 atgttgttgatgatgattg-aatgaagtgattgcttgata 16861747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 598
Target Start/End: Original strand, 30643578 - 30643799
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------- 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||            
T  30643578 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgaa 30643675  T
Q  481 -------aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgt 573  Q
           |||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  30643676 agatgttaagatgttatgttatttataatgattg-aatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttgt 30643773  T
Q  574 taattatgatt-ttgaattatattga 598  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||    
T  30643774 taattacgattgttgaattatattga 30643799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 422 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 23834004 - 23833828
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  23834004 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgat 23833909  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttg-aattatattgat 599  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23833908 tatgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaaattatattgat 23833828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 30309028 - 30309203
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||    
T  30309028 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagttttaaagatgtttatgtcattgatgatgattgaagt--tgtgat 30309122  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30309123 taagtgataattgtt-atcaaagatgcaatgttgttaaagattgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 30309203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 601
Target Start/End: Original strand, 15611756 - 15611931
Alignment:
Q  432 acatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa--------aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattact 523  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||        |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  15611756 acatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgttaagatgttatgttatttatgataattg-aatgaagtgattact 15611852  T
Q  524 tgataattgtttatcaaagatgcaatgatg-cttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  15611853 tgatattttattatcaatgatgctatgatgttttaaga-tgtttatgttgttaattacgattgttgtattatattgatta 15611931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 390 - 545
Target Start/End: Original strand, 16410534 - 16410694
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-------aa 481  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |       ||    
T  16410534 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacattcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagttaaatgatgaa 16410631  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatg 545  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  16410632 agatgttatgttatttattatgattg-aatgaaatgagtacttgatatttgattaccaaagatg 16410694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 21829002 - 21829078
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21829002 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 21829078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 21977658 - 21977734
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21977658 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 21977734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22111131 - 22111055
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22111131 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 22111055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 30941136 - 30941212
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30941136 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 30941212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 43250891 - 43250815
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43250891 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 43250815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 377100 - 377041
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  377100 attaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 377041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 601
Target Start/End: Original strand, 15603304 - 15603479
Alignment:
Q  432 acatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa--------aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattact 523  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||        | |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  15603304 acatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgttatgatgttatgttatttatgataattgaa-tgaagtgattact 15603400  T
Q  524 tgataattgtttatcaaagatgcaatgatgctt-aagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15603401 tgatattttattatcaatgatgctatgatgttttaagat-gtttatgttgttaattatgattgctgtattatattgatta 15603479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 18863661 - 18863737
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  18863661 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttgtcaaagatgctatgatgtttaagat 18863737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 21973567 - 21973643
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21973567 atgttatgttattgataatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 21973643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 585
Target Start/End: Original strand, 17828858 - 17829018
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | |   | ||||||    
T  17828858 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttcaaagatgtttatgttgttgatgatgaataa---gttgtgat 17828952  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattt 585  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  17828953 tatgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgattt 17829018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 32604976 - 32604864
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  32604976 ttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgattatgtgataaatgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttt 32604879  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  32604878 tgaattataatgatt 32604864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15440415 - 15440240
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | |   | ||||||    
T  15440415 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttcaaagatgtttatgttgttgatgatgaataa---gctgtgat 15440321  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||| ||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15440320 tatatgatacatgtttattaaagatacaatgttgattaagactgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 15440240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15531719 - 15531544
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | |   | ||||||    
T  15531719 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttcaaagatgtttatgttgttgatgatgaataa---gctgtgat 15531625  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||| ||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15531624 tatatgatacatgtttattaaagatacaatgttgattaagactgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 15531544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15538278 - 15538103
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa-agatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   | ||||||| ||||| |||||||||| | |   | ||||||    
T  15538278 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttcagagatgtttatgttgttgatgatgaataa---gctgtgat 15538184  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15538183 tatatgatacatgtttattaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatga-tttgtattatattgatta 15538103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 3215929 - 3215862
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  3215929 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 3215862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 6520153 - 6520095
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6520153 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgtatttgtcgagtcaaa 6520095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23913886 - 23913827
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23913886 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 23913827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 26935618 - 26935685
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  26935618 atgatgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 26935685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 480
Target Start/End: Original strand, 20466344 - 20466420
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa 480  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  20466344 tgttggaggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 20466420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 24755570 - 24755362
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa---------------aagatgtta 489  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||               || ||||||    
T  24755570 tgggggctcaagccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgaaagatgttaaaatgtta 24755473  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttga 588  Q
     ||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| | |||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24755472 ggttatttgtgatg-tttaaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctacgatatttaaga-tgtttatgttgttaattacgattgttga 24755375  T
Q  589 attatattgatta 601  Q
    |||||||||||||    
T  24755374 attatattgatta 24755362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 20527205 - 20527105
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | || |||||| ||  |||| ||||||||||    
T  20527205 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgatagttgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagaatg-atatgatgttaattat 20527109  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  20527108 gatt 20527105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Original strand, 21162365 - 21162424
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  21162365 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 21162424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 24445782 - 24445957
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | |   | ||||||    
T  24445782 gattggtaccacatgcatataactgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttcaaagatgtttatgttgttgatgatgaataa---gctgtgat 24445876  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24445877 tatgtgatacatgtttaccaaagatgcaatgttgattaagactgattatgacgttaattatga-tttgtattatattgatta 24445957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 23777140 - 23777183
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23777140 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 23777183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 32598444 - 32598332
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | || |||||  |  ||||| ||||| |||||| |||    
T  32598444 ttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgattatgtgataaatgtttatcaaagatgcaaagttgattaaggctaattatgatgttagttatgatttt 32598347  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  32598346 tgaattataatgatt 32598332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 16184443 - 16184355
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgtt 571  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  16184443 aagatgttatgttatttatgatcttt-aaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgtt 16184355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16184534 - 16184492
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataaga 445  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16184534 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaga 16184492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 601
Target Start/End: Original strand, 16862036 - 16862104
Alignment:
Q  534 ttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattt--tgaattatattgatta 601  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16862036 ttatcaatgatgctatgatgtttaagat-gtatatgttgttaattatgatttgctgaattatattgatta 16862104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 19259851 - 19259897
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19259851 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacgtgcatataagaggt 19259897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 408 - 448
Target Start/End: Original strand, 22873574 - 22873615
Alignment:
Q  408 ggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22873574 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 22873615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19898906 - 19898863
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19898906 tgggggcgcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 19898863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 23761176 - 23761234
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  23761176 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 23761234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 26355993 - 26356051
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || | |||||||||||||||    
T  26355993 gattggtaccacatgcatacaagaggttta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 26356051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 44385153 - 44385196
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44385153 tgggggctcatgcccttaattggtaccacatgcatataagaggt 44385196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 476
Target Start/End: Original strand, 21389768 - 21389829
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||    
T  21389768 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgag 21389829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 476
Target Start/End: Original strand, 21779094 - 21779155
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||    
T  21779094 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgag 21779155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 983737 - 983766
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983737 gattggtaccacatgcatataagaggttta 983766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 15203617 - 15203646
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203617 gattggtaccacatgcatataagaggttta 15203646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 584
Target Start/End: Original strand, 20705995 - 20706088
Alignment:
Q  488 tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt 584  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  20705995 tatgttgttgatgacgattgaat--atgtaattacgtgatgattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattatgatt 20706088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 376975 - 376935
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  376975 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 376935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 16184349 - 16184309
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16184349 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 16184309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Original strand, 21169038 - 21169097
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  21169038 tgggggctcatgccatgtattagtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 21169097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21249188 - 21249125
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  21249188 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 21249125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21255026 - 21254963
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  21255026 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 21254963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31971104 - 31971041
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  31971104 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 31971041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 53385 - 53209
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  53385 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatta 53288  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53287 cttgataattgtt-atcaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 53209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 225 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 111389 - 111221
Alignment:
Q  225 gttttaactccactttttagtccgttacaagacaatcgattttaaaaattactttttaagttgataagatttttcctgatttaaaaggtcacacatgcta 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  111389 gttttaactccactttttagtcggttacaagacaatcgattttaaaaattactttttaagttgataaattttttactgatttaaaaggtcacacatgcta 111290  T
Q  325 agtttggataatcagaatcatctgcagaaccaacttnnnnnnngtcttctagaactgactgtataattaat 395  Q
    ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  111289 agtcttgataaatagaatcatctgcagaaccaactt--aaaaagtcttctagaactgactgtataattaat 111221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 15499 - 15697
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||     
T  15499 attaatactaaattgttgggggctcatgccctaattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgttg 15597  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttga 588  Q
    ||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15598 tgttat------------gaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatacaatgatgtttaaga-tgttcatgttgttaattatgattgttga 15684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 20021 - 20219
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||     
T  20021 attaatactaaattgttgggggctcatgccctaattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgttg 20119  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttga 588  Q
    ||||||             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20120 tgttat------------gaattatgtgattacttgataattgtttatcaaagatacaatgatgtttaaga-tgttcatgttgttaattatgattgttga 20206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 193279 - 193325
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  193279 tgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataagaggt 193325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 564 - 601
Target Start/End: Original strand, 193451 - 193489
Alignment:
Q  564 tttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  193451 tttatgttgttaattatgattattgaattatattgatta 193489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 18906 - 19084
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  18906 gattggtaccacatgcatataagagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tactgtgatt 19003  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19004 acttgataattgtttctcaaagatgcaatgatgattaagactgcttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 19084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 16763 - 16973
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16763 attaatactaaacagttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaaaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaaagatgtt 16860  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt--tt 586  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |   ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  16861 atgttgttgatgatgattg-aatgaagtgattgcttgatattatattatcaatgatgcaatgatgattaaga-tgtatatgttgttaattatgatttgtt 16958  T
Q  587 gaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||    
T  16959 gaattatattgatta 16973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 19016 - 19062
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19016 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataggaggt 19062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 20136 - 20165
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20136 gattggtaccacatgcatataagaggttta 20165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 422809 - 423008
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta 489  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  422809 attaatactatgatgttgggggctcatgccctgattggtaccagatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaaagacgtta 422907  T
Q  490 tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatga-tgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    ||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  422908 tgttat------------gaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgattgtttaaga-tgtttatgttgttaattatgattgttg 422994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 422 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 173124 - 172999
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  173124 gattggtaccacatgcata-aagagtgtcta-agttgcattgtcacatttgtcgactctaa-gatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatt 173029  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatg 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173028 acttgataattgtttatcaaagatgcaatg 172999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 178738 - 178702
Alignment:
Q  514 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatg 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178738 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatg 178702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 204694 - 204655
Alignment:
Q  407 gggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataaga 445  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  204694 gggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataaga 204655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 21811 - 22028
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa------- 481  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||           
T  21811 attaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaatgatgtt 21908  T
Q  482 -agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||     
T  21909 aagatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatattttattatcaaagatgcaatgatgtttatga-tgtttatgttgttaattac 22006  T
Q  581 gatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  22007 gattgttgaattatattgatta 22028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 23001 - 23059
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  23001 gattggtaccacatgcatataagagatcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 23059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 421 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 19021 - 18843
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19021 tgattggtaccacatgcatataagagtgtcta-agttgcattgtcgcgtttgtcgagtctgaagatgttatgttattgatgatgattgaa-tgttgtgat 18924  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18923 tacttgataactgtttatcaaagatgcattgatgattaagactgtttatgatgttaattatga-ttcgaattatattgatta 18843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 421 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12737 - 12619
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12737 tgattggtaccacatgcatataagagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctgaagatgttatgttattgatgatgattg-aatgctgtgat 12640  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaa 540  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  12639 tacttgataactgtttatcaa 12619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12610 - 12541
Alignment:
Q  531 tgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12610 tgtttatcaaagatgcattgatgattaagactgtttatgatgttaattatga-ttcgaattatattgatta 12541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 1077 - 916
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatga 504  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1077 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgttattgatgatga 979  T
Q  505 ttgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatg 569  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  978 ttg-aatgctgtgattacttgataatag-ttattaaagatgcaatgatgattaagactgtttatg 916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 2946 - 3123
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||     
T  2946 gattgataccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaaagatgttatgt-attgatgatgattgaa-tgttttgattt 3042  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaa-gatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3043 cttggtaattgtttatcaaaagatgcaatgatgattaagactgtttatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 81499 - 81675
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  81499 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgatt 81594  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  81595 atgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 81675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Original strand, 19575 - 19744
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19575 attaatactaaactgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaaagatgtt 19672  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |   ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19673 atgttgttgatgatgattg-aatgaagtgattgcttgatattatattatcaatgatgctatgatgtttaagat 19744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 392 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 1658 - 1443
Alignment:
Q  392 taatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta- 489  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1658 taatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccatatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgtatt-gtcgagtcaaaagatgttaa 1561  T
Q  490 -------tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga 582  Q
           |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1560 gatgttatgttatttgtgatgattgaa-tgaagtgattacttgatatttgattaccaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattacga 1463  T
Q  583 tt-ttgaattatattgatta 601  Q
    || |||||||||||||||||    
T  1462 ttgttgaattatattgatta 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 392 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 9341 - 9126
Alignment:
Q  392 taatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtta- 489  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  9341 taatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccatatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgtatt-gtcgagtcaaaagatgttaa 9244  T
Q  490 -------tgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga 582  Q
           |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9243 gatgttatgttatttgtgatgattgaa-tgaagtgattacttgatatttgattaccaaagatgcaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattacga 9146  T
Q  583 tt-ttgaattatattgatta 601  Q
    || |||||||||||||||||    
T  9145 ttgttgaattatattgatta 9126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 455 - 601
Target Start/End: Original strand, 20319 - 20463
Alignment:
Q  455 ttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgc 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20319 ttgcattgtcgcatttgtcgagtctac-gatgttatgttatcgatgatgattgaa-tgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgt 20416  T
Q  555 ttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20417 ttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatactgatta 20463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 33277 - 33335
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||||||    
T  33277 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcacatttgtcgagtcaaa 33335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 45728 - 45670
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||||||    
T  45728 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcacatttgtcgagtcaaa 45670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 33381 - 33163
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatt-------tgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||       ||| ||||||||    
T  33381 attaatactaaactgtcgggggctcatgccctgaattcgtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcattgtcgcattgttgagtcaaa 33283  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatg 581  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |   ||||||| ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33282 agatgttatgttgttgatgatgattg-aatgaagtgattgcttgatattatattatcaatgatgctatgatttttaaga-tgtatatgttgttaattatg 33185  T
Q  582 att--ttgaattatattgatta 601  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  33184 atttgttgaattatattgatta 33163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 9939 - 10114
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  | |||| ||    
T  9939 gattggtaccacatgcatataagtgtctgag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtctaa-gatgtttatgttattgatgatgattgaa--gctgtgttt 10033  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10034 aattaataattgtttatcaaagatgcaatgatgattaagattgattgtgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 10114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 9251 - 9075
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  9251 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttattgattatgattgaa--gctgtgatt 9156  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9155 acttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattacattgatta 9075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 25244 - 25419
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||   | |||||||    
T  25244 gattggtaccacatgcatataagatgtcta-agttgcattgtcgcatttgtctagtctaa-gatgttattttattgaagatgattgaat--aagtgatta 25339  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25340 cttgataattgtttatcgaagatgcaatgatgattaagactgtttatgacgttatttatgatttcgaattatatttatta 25419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 1767 - 1975
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  1767 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatatatgaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtc-aatgatgtt 1863  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttg 587  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||  ||    
T  1864 atgttatttatgatgatag-aatgaagtaattacttgatattttattatcaatgatgttatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaattgcgattgatg 1961  T
Q  588 aattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||    
T  1962 aattatattgatta 1975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 42459 - 42290
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt 488  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  42459 attaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttatcgagtcaaatgatgtt 42362  T
Q  489 atgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||| | |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  42361 atgttatttatgatgatag-aatgaagtggtaacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 42290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25189
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataag-aggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  25097 attaatactatgatgtttggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagtaggttttg-gttgcattgttgcatttgtcgagtcaaa 25189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 423 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 2390 - 2216
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattac 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2390 attggtaccacatgcatataagaggttttg-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgttgttatgttaattatgatgattg-aatga-gtgattac 2295  T
Q  523 ttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2294 ttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgattatgttgttgattatgattgttgaattatattgatta 2216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 433 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 8350 - 8169
Alignment:
Q  433 catgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttg 525  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8350 catgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgaaagatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttg 8254  T
Q  526 ataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat--------tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8253 atatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttaagatgtttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 8169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 5424 - 5247
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccct-gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------- 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||            
T  5424 attaatactaaactgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgtt 5327  T
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5326 aagatgttatgttatttacgatgattg-aatgaagtgattaattgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 5247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 6619 - 6442
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccct-gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa-------- 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||            
T  6619 attaatactaaactgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatgtt 6522  T
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  6521 aagatgttatgttatttacgatgattg-aatgaagtgattaattgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 6442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 421 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 63686 - 63509
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgt-tatgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||||    
T  63686 tgattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtttaaagatgtatatgttattgattatgactgaa--gctgtgat 63591  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  63590 tacttgataattgtttatcaaagaagctgtgttgtttaagactgattatgatgttaattatgatttcgacttacattgatta 63509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 486
Target Start/End: Original strand, 35223 - 35302
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  35223 tgggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaatgatg 35302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 35315 - 35391
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  35315 atgttaggttatttatgatgttt-aaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 35391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22871
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatg-ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  23048 gattggcaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagttttaaagatgattatgttattgatgatgattgaagt--tgtgat 22953  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22952 tatgtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattttgatgttaattatgatttcgaattatattaatta 22871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 241813 - 241713
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  241813 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 241717  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  241716 gatt 241713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 117957 - 117986
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117957 gattggtaccacatgcatataagaggttta 117986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 6516 - 6691
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |    ||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  6516 gattggtaccacatgcatataagtgtccaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgatt 6610  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6611 atgcgataattgtttatcaaagatgtaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 423 - 601
Target Start/End: Original strand, 14036 - 14219
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa--------agatgttatgttattgatgatgattgaaatgat 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||        ||||||||||||||| ||||| |||||| |||     
T  14036 attggtaccacatgcatataagaggtttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaaatgatgttaagatgttatgttatttatgataattgaa-tgaa 14132  T
Q  515 gtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14133 gtgattacttgatattttattatcaatgatgcaatgaagtataaga-tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 14219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 6691 - 6781
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  6691 attaatactataatgccgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 6781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 480 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 1226 - 1106
Alignment:
Q  480 aaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaatta 579  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1226 aaagatgttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatatttgattttcaaagatacaatgatgtttaaga-tgtttatgttgttaatta 1129  T
Q  580 tgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  1128 cgattgttgaattatattgatta 1106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7640
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa------- 481  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||           
T  7416 attaatactaaaatgttgggggctcatgccctgtattggttccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatt-gtcgagtcaaatgatgaa 7513  T
Q  482 --------agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgt 573  Q
            ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  7514 agatgttaagatgttatgttatttatgatgtttgaa-tgtagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttgt 7611  T
Q  574 taattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7612 taattacgattgttgaattatattgatta 7640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17621
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg-- 486  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||      
T  17397 attaatactaaattgttgggggctcatgccctgtattagtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattatcgcatt-gtcgagtcaaatgatgaa 17494  T
Q  487 -------------ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgt 573  Q
                 |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  17495 agatgttaagtagttatgttatttatgatgattgaa-tgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaaga-tgtttatgttgt 17592  T
Q  574 taattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17593 taattatgattgatgaattatattgatta 17621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 6791 - 6616
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |    ||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  6791 gattggtaccacatgcatataagtgtccaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagtttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgatt 6697  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6696 atgcgataattgtttatcaaagatgtaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 6616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 513 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 42923 - 42859
Alignment:
Q  513 atgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  42923 atgtgaatacgtgataattgtttatcaaacatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 42859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 550
Target Start/End: Original strand, 228645 - 228770
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagag-gtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  228645 gattggtaccacatgcata-aagagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtctaa-gatgttatgttattgatgatgattgaa-tgctgtgatt 228740  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatg 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  228741 acttgataactgtttatcaaagatgcaatg 228770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 406 - 553
Target Start/End: Original strand, 34146 - 34291
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgttatgttattgatgatga 504  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  34146 tgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatatgagagatttaggtt-gcattgtcgcatt-gtcgagtcaattgatgttatgttatttatgatga 34243  T
Q  505 ttgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatg 553  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  34244 ttg-aatgaagtgattacttgataatttattatcaatgatgctatgatg 34291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 15031 - 15089
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  15031 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 16509 - 16333
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  |||||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  16509 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcatcgtcgcatttgtcgagttttaaagatgtttatgttattgatgatgattgaagt--tgtgat 16414  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    ||  |||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16413 tatgtgataaatgtttgtcaat-atgcaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 196 - 22
Alignment:
Q  424 ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatta 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  196 ttggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagttttaaagatgtttatgtcattgatgatgattgaagt--tgtgatta 102  T
Q  522 cttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatt 600  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||    
T  101 agtgataattgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatgttagttataatttttgaattataatgatt 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 4884 - 4960
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4884 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 4960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 33712 - 33788
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33712 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 33788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 15146 - 15222
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15146 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 15222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 68206 - 68282
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  68206 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 68282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 509 - 601
Target Start/End: Original strand, 13578 - 13668
Alignment:
Q  509 aatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13578 aatgctgtgattacttgataattatt-atcgaagatgcaatgatgattaagactgtt-atgatgttaattatgatttcgaattatattgatta 13668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 79652 - 79577
Alignment:
Q  485 tgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  79652 tgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 79577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 15166 - 14990
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| ||| |||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  15166 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcaagtttaaaggtgtttatgttattgatgaagattgaagt--tgtgatt 15072  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttttgaattatattgatta 601  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15071 atgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttttgaattataatgatta 14990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14919 - 14860
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14919 attaatactaaattgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 14860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 226 - 51
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-------aa 481  Q
    |||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||       ||    
T  226 attaatactataatgctaggggctcatgccctgaattggtaccgcatgcatataagaggtttag-gttgcattgt-gca-ttgtcgagtcaaatgatgaa 130  T
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  129 agatgttatgttatttacgatgattg-aatgaagtgattacctgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 51  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 561
Target Start/End: Original strand, 6045 - 6121
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6045 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatatttaagat 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 630
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg 486  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  725 attaatactataatgttgggggctcatgccctaaattggtaccacatgcatataagaggtttag-gttgcattgtcgca-ttgtcgagttaaatgatg 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 484 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 11582 - 11496
Alignment:
Q  484 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttg 572  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||    
T  11582 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattacttggtagttgtttatcaaagatactatgatgtttaaga-tgtttatgttg 11496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 8092 - 8183
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  8092 attaatactatgatgttgggggctaatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttttg-gttgcattgttgcatttgtcgagtcaaa 8183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 48
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  107 attaatactaaattgttaggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 48  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Original strand, 6341 - 6453
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| |||| || |  ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  6341 ttatgttattgatgaagattaaagt--tgtgattaagtgatacttgtttatcaaagatgaaatgttgattaagactgattatgatgttaattatgatttt 6438  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  6439 tgaattataatgatt 6453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 600
Target Start/End: Original strand, 8340 - 8452
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| |||| || |  ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  8340 ttatgttattgatgaagattaaagt--tgtgattaagtgatacttgtttatcaaagatgaaatgtttattaagactgattatgatgttaattatgatttt 8437  T
Q  586 tgaattatattgatt 600  Q
    ||||||||| |||||    
T  8438 tgaattataatgatt 8452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 47015 - 47074
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47015 attaatactaaaatgttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 47074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Original strand, 47120 - 47199
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  47120 aagatgttatgttatttatgatgattg-aatgaagtgattacttgatattttaatatcaatgatgctatgatgtttaagat 47199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Original strand, 5200 - 5279
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagat 561  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5200 aagatgttatgttatttatgatgatt-aaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagat 5279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Original strand, 5111 - 5170
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  5111 tgggggctcataccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 5170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Original strand, 5294 - 5334
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5294 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 5334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 601
Target Start/End: Original strand, 17004 - 17117
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatga-ttt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  17004 ttatgttattgatgaagattgaagttatg--attatgtgatacttgtttatcaaagatgcaaagttgattaagactgattatgatgttagttatgatttt 17101  T
Q  586 tgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||| ||||||    
T  17102 tgaattataatgatta 17117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4260 - 4201
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4260 attaatactaaaatgttgggggttcatgccctgaattggtaccacatgtatataagaggt 4201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 29383 - 29325
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29383 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 29325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2647 - 2585
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  2647 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 2585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6313 - 6251
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  6313 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 40425 - 40483
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40425 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgtatttgtcgagtcaaa 40483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 38781 - 38827
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38781 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 38827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 100140 - 100082
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||||||    
T  100140 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcacatttgtcgagtcaaa 100082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 101328 - 101271
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  101328 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agctgcatagtcgcatttgtcgagtcaa 101271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 551
Target Start/End: Original strand, 29183 - 29251
Alignment:
Q  482 agatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatga 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||    
T  29183 agatgttatgttatttatgatgatt-aaatgaagtgattacttgacattttattatcaatgatgctatga 29251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 452
Target Start/End: Original strand, 74069 - 74116
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttag 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74069 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttag 74116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 44392 - 44363
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44392 gattggtaccacatgcatataagaggttta 44363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 78113 - 78084
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78113 gattggtaccacatgcatataagaggttta 78084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1892
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1938 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 1892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 3481 - 3424
Alignment:
Q  423 attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  3481 attggtaccacatgcatataagaggttta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 10306 - 10260
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10306 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttta 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 9733 - 9559
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| ||| |||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| ||    
T  9733 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcaagtttaaagttgtttatgctattgatgatgattgaagt--tgtgttt 9639  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| | |||||||||||||||||| || |||||| || | | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9638 atgtgataaatatttatcaaagatgcaatgttgattaagactgctaa-gatgttgattatgattttgaattacattgatta 9559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 281198 - 281244
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  281198 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 281244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 451
Target Start/End: Original strand, 8122 - 8167
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctgattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8122 tgggggctcatgccctaaatggtaccacatgcatataagaggttta 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 9924 - 9808
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  9924 aagatgctatgttgttgatgacgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttattaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 9828  T
Q  581 gattttgaattatattgatta 601  Q
    || || |||||| ||||||||    
T  9827 ga-ttcgaattacattgatta 9808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3332 - 3287
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3332 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 3287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7394 - 7350
Alignment:
Q  405 ttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7394 ttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 7350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 28043 - 28072
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28043 gattggtaccacatgcatataagaggttta 28072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 48749 - 48794
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48749 gttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 48794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 19051 - 18993
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  19051 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 459 - 415
Alignment:
Q  405 ttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  459 ttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 19331 - 19231
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  19331 aagatgctaagttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgatagttgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 19235  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  19234 gatt 19231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 25478 - 25378
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattat 580  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  25478 aagatgctaagttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgatatttgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg-atatgatgttaattat 25382  T
Q  581 gatt 584  Q
    ||||    
T  25381 gatt 25378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16713
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16654 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 16713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 513 - 577
Target Start/End: Original strand, 15433 - 15497
Alignment:
Q  513 atgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  15433 atgtgaatacgtgataattgtttatcaaaaatgcaaagttacttaagattgattatgatgttaat 15497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14475 - 14416
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  14475 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 14416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23491 - 23432
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  23491 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 23432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38915 - 38856
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  38915 tgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 38856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 132505 - 132446
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  132505 tgattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 132446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1905 - 1847
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  1905 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 1847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 6322 - 6264
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  6322 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 6264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 601
Target Start/End: Original strand, 2487 - 2573
Alignment:
Q  515 gtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||  |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2487 gtgattacttgatattttattatcaaagatgttatgatttttaaga-tatttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 448
Target Start/End: Original strand, 2383 - 2425
Alignment:
Q  407 gggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2383 gggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 2425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 6382 - 6441
Alignment:
Q  390 attaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6382 attaatactatgatgttgagggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 6441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 10823 - 10866
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10823 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 10866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3553 - 3510
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3553 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 3510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7984 - 7941
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7984 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19793 - 19750
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19793 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 19750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 36138 - 35978
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtca-aaagatgtt-atgttattgatgatgattgaaatgatgtgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | || |  ||||||    
T  36138 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatt-gtcgagttttaaagatgtttatgttgttgatgatgaataaagt--tgtgat 36044  T
Q  520 tacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattt 585  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  36043 tatgtgatacatgtttatcaaagatgcaatgttgattaagactgattatgatattaattatgattt 35978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32258 - 32215
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32258 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 32215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 564 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 32076 - 32038
Alignment:
Q  564 tttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32076 tttatgttgttaattatgattgttgaattatattgatta 32038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9311
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9268 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 9311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 18005
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18048 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 18005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 77447 - 77622
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg-ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| | | |||||||||| |||| || ||||| |||||| || |||||||  | |||||||    
T  77447 gattggtaccacatgcatataagagtctaag--ttgcattgttgca-ttgtcgagtctaaagttgtttatgctattgacgaagattgaa--gttgtgatt 77541  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| ||| || ||||   || ||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  77542 atgtgataaatgtttatcaaagatgctatgttgattaaagctgattaagatgttgattatgatttgaaattacattgatta 77622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 178712 - 178669
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  178712 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 178669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 69606 - 69563
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  69606 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 69563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2091 - 2030
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcg 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  2091 gttgggggctcatgccctgtatttgtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcattgtcg 2030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1694 - 1652
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataag 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1694 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataag 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 408 - 448
Target Start/End: Original strand, 995 - 1036
Alignment:
Q  408 ggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  995 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 1108 - 1027
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgat-aattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattg 563  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||||    
T  1108 aagatgctatgttgttgatgatgattgaa--tatgtgattacgtgataaattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattg 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Original strand, 3420 - 3479
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  3420 tgattggtaccacatgcatataagaggtct-gagttgcatagtcgcatttttcgagtcaaa 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 7981 - 8039
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  7981 gattggtaccacatgcatataagaggtct-gagttgcatagtcgcatttttcgagtcaaa 8039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Original strand, 16920 - 16975
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||    
T  16920 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtc 16975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 31907 - 31848
Alignment:
Q  421 tgattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  31907 tgattggtatcacatgcatataagaggtcta-agttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaa 31848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0862 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0862
Description:

Target: scaffold0862; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 5036 - 4969
Alignment:
Q  510 atgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| | ||||| |||||||    
T  5036 atgatgtgattgcgtgataattgtttatcaaatatgcaaagttacttaagatcgattatgatgttaat 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 4612 - 4560
Alignment:
Q  487 ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaa 541  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4612 ttatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattacgtgataattgtttatcaaa 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1108
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1151 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcataaaagaggt 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36267 - 36224
Alignment:
Q  406 tgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36267 tgggggctcatgccctgaattagtaccacatgcatataagaggt 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 481
Target Start/End: Original strand, 46123 - 46181
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  46123 gattggtaccacatgcatataagaggtata-agttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 46181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 9166 - 8991
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaagatg-ttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgatt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||| | |||||||||  |||| || |||||  |||||||| |||||||  | | |||||    
T  9166 gattggtaccacatgcatataagagtctaag--ttgcattgtcgca-ttgtcgagtttaaagttgtttatgccattgatgaagattgaa--gttatgatt 9072  T
Q  521 acttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaattatgattttgaattatattgatta 601  Q
    || |||||| ||||||||||  |||  ||| || |||||| |||||| | |||| ||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  9071 acgtgataaatgtttatcaactatgttatgttgtttaagactgtttaagatgttgattatgaattgaaattacattgatta 8991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 14744 - 14649
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataa-ttgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||| |||||||    
T  14744 aagatgctatgttgttgatgatgattgaat--atgtgattccgtgataaattgtttatcaaatatgcaaagttgtttaagattgaatatgatgttaat 14649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 22107 - 22153
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  22107 tgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatatacgaggt 22153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 29999 - 30045
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  29999 tgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatatacgaggt 30045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7110 - 7064
Alignment:
Q  403 tgttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7110 tgttgggggctcataccctgaattggtgccacatgcatataagaggt 7064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 6938 - 6898
Alignment:
Q  562 tgtttatgttgttaattatgatt-ttgaattatattgatta 601  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6938 tgtttatgttgttaattacgattgttgaattatattgatta 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 341 - 312
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  341 gattggtaccacatgcatataagaggttta 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5908 - 5863
Alignment:
Q  404 gttgggggctcatgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggt 448  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5908 gttgggggcttatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggt 5863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 16394 - 16423
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394 gattggtaccacatgcatataagaggttta 16423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 577
Target Start/End: Original strand, 14891 - 14985
Alignment:
Q  481 aagatgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgcttaagattgtttatgttgttaat 577  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| | ||||| |||||||    
T  14891 aagatgctatgttgatgatgatgattgaat--atgtgaatacgtgataattgtttatcaaatgtgcaaagttgcttatgatcgattatgatgttaat 14985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 451
Target Start/End: Original strand, 8404 - 8433
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8404 gattggtaccacatgcatataagaggttta 8433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 451
Target Start/End: Original strand, 53872 - 53909
Alignment:
Q  415 atgccctga-ttggtaccacatgcatataagaggttta 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53872 atgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttta 53909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6608 - 6549
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaa 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| || | ||||||||||||||||    
T  6608 gattggtaccacatgcatataagaggtct-cagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaaa 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Original strand, 10742 - 10805
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  10742 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 10805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38609 - 38542
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtcaaaa 482  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |||||| |||||||||    
T  38609 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgttgagtcaaaa 38542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Original strand, 24215 - 24270
Alignment:
Q  422 gattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  24215 gattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 24270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 46798 - 46735
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  46798 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 46735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 51384 - 51321
Alignment:
Q  415 atgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgcattgtcgtatttgtcgagtc 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||    
T  51384 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatagttgcatttgtcgagtc 51321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University