View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9350-LTR4-TNT-insertion-10 (Length: 480)

Name: F9350-LTR4-TNT-insertion-10
Description: F9350-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9350-LTR4-TNT-insertion-10
F9350-LTR4-TNT-insertion-10
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (55-470)||(29885861-29886276)
chr5 (55-470)||(33297609-33298024)
chr5 (55-470)||(13319494-13319909)
chr5 (55-470)||(15653421-15653836)
chr5 (55-470)||(15753516-15753931)
chr5 (55-470)||(18123080-18123495)
chr5 (55-470)||(30034509-30034924)
chr5 (55-470)||(37746993-37747408)
chr5 (55-470)||(23631050-23631465)
chr5 (55-470)||(24974928-24975343)
chr5 (55-470)||(28654324-28654739)
chr5 (55-470)||(30173550-30173965)
chr5 (55-470)||(31436545-31436960)
chr5 (55-470)||(37760064-37760479)
chr5 (55-470)||(9545373-9545788)
chr5 (55-470)||(11328718-11329133)
chr5 (55-470)||(11554436-11554851)
chr5 (55-470)||(22993781-22994196)
chr5 (55-470)||(32590938-32591353)
chr5 (55-470)||(33782566-33782981)
chr5 (55-470)||(40468214-40468629)
chr5 (55-470)||(41679786-41680201)
chr5 (55-470)||(5642869-5643284)
chr5 (55-470)||(6879386-6879801)
chr5 (55-470)||(13181457-13181872)
chr5 (55-470)||(13437347-13437762)
chr5 (55-470)||(23896956-23897371)
chr5 (55-470)||(30157112-30157527)
chr5 (55-470)||(34621599-34622014)
chr5 (55-470)||(3794622-3795037)
chr5 (55-470)||(8660139-8660554)
chr5 (55-470)||(31821071-31821486)
chr5 (55-470)||(43083336-43083751)
chr5 (55-470)||(2516143-2516558)
chr5 (55-470)||(18370198-18370613)
chr5 (55-470)||(18495389-18495804)
chr5 (55-470)||(37353307-37353722)
chr5 (55-470)||(12137256-12137671)
chr5 (55-470)||(24729050-24729465)
chr5 (55-470)||(26485475-26485890)
chr5 (55-470)||(28954449-28954864)
chr5 (55-470)||(30939716-30940131)
chr5 (55-470)||(37666150-37666565)
chr5 (55-470)||(33521461-33521876)
chr5 (55-470)||(33880209-33880624)
chr5 (55-470)||(9322557-9322972)
chr5 (55-470)||(25205359-25205774)
chr5 (55-470)||(25269514-25269929)
chr5 (55-470)||(22893492-22893907)
chr5 (132-468)||(349980-350316)
chr5 (132-456)||(3481968-3482292)
chr5 (278-468)||(20386900-20387090)
chr5 (244-468)||(36373839-36374063)
chr5 (244-468)||(36998493-36998717)
chr5 (244-468)||(5438102-5438326)
chr5 (257-468)||(15782615-15782826)
chr5 (257-453)||(24065056-24065252)
chr5 (257-453)||(31522381-31522577)
chr5 (257-453)||(34470696-34470892)
chr5 (244-468)||(11942299-11942523)
chr5 (244-468)||(17959156-17959380)
chr5 (140-192)||(20375404-20375456)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (55-470)||(20335183-20335598)
chr1 (55-470)||(10967741-10968156)
chr1 (55-470)||(3646219-3646634)
chr1 (55-470)||(21892514-21892929)
chr1 (55-470)||(28154812-28155228)
chr1 (55-470)||(10950153-10950568)
chr1 (55-470)||(16202801-16203216)
chr1 (55-470)||(41788077-41788492)
chr1 (55-470)||(51643294-51643709)
chr1 (55-470)||(28590156-28590571)
chr1 (278-470)||(20466052-20466244)
chr1 (140-468)||(13455830-13456158)
chr1 (132-456)||(22491087-22491411)
chr1 (278-468)||(1064396-1064587)
chr1 (257-468)||(5626991-5627202)
chr1 (280-402)||(9296725-9296847)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (55-470)||(17656-18071)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (55-470)||(18795777-18796192)
chr8 (55-470)||(2131988-2132403)
chr8 (55-470)||(12087451-12087866)
chr8 (55-470)||(27603633-27604048)
chr8 (55-470)||(18714557-18714972)
chr8 (55-470)||(19679520-19679935)
chr8 (55-470)||(19693172-19693587)
chr8 (55-470)||(33247443-33247858)
chr8 (55-470)||(44566057-44566472)
chr8 (55-470)||(9359698-9360113)
chr8 (55-470)||(28356680-28357095)
chr8 (55-470)||(15772647-15773062)
chr8 (55-470)||(31484599-31485014)
chr8 (55-470)||(33263807-33264222)
chr8 (55-470)||(29834398-29834813)
chr8 (55-470)||(31359601-31360016)
chr8 (55-470)||(21342899-21343314)
chr8 (55-470)||(19203090-19203505)
chr8 (55-470)||(19911890-19912305)
chr8 (55-470)||(19656068-19656483)
chr8 (55-470)||(16288025-16288441)
chr8 (55-470)||(22137983-22138398)
chr8 (55-470)||(22075653-22076068)
chr8 (255-470)||(14562697-14562912)
chr8 (55-259)||(14568443-14568647)
chr8 (143-468)||(16770374-16770699)
chr8 (132-456)||(22414001-22414325)
chr8 (132-456)||(14214102-14214426)
chr8 (132-456)||(19846226-19846550)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (55-470)||(24300467-24300882)
chr6 (55-470)||(13293661-13294076)
chr6 (55-470)||(22929594-22930009)
chr6 (55-470)||(23852039-23852454)
chr6 (55-470)||(27356820-27357235)
chr6 (55-470)||(4777951-4778366)
chr6 (55-470)||(16754892-16755307)
chr6 (55-470)||(27490204-27490619)
chr6 (55-470)||(28212525-28212940)
chr6 (55-470)||(4530356-4530771)
chr6 (55-470)||(4762834-4763249)
chr6 (55-470)||(8900413-8900828)
chr6 (55-470)||(16679211-16679626)
chr6 (55-470)||(26790887-26791302)
chr6 (55-470)||(4718845-4719260)
chr6 (55-470)||(27062577-27062992)
chr6 (55-470)||(27184000-27184415)
chr6 (55-470)||(27199256-27199671)
chr6 (55-470)||(27249563-27249978)
chr6 (55-470)||(27264824-27265239)
chr6 (55-470)||(29554629-29555044)
chr6 (55-470)||(14140104-14140519)
chr6 (55-470)||(26925841-26926256)
chr6 (55-470)||(27024208-27024623)
chr6 (55-470)||(29578085-29578500)
chr6 (55-470)||(33371141-33371556)
chr6 (55-470)||(34459216-34459631)
chr6 (55-470)||(4540484-4540899)
chr6 (55-470)||(15407243-15407658)
chr6 (55-470)||(15419030-15419445)
chr6 (55-470)||(16938737-16939152)
chr6 (55-470)||(24868787-24869202)
chr6 (55-470)||(28165562-28165977)
chr6 (55-470)||(26111122-26111537)
chr6 (55-470)||(27285074-27285489)
chr6 (55-470)||(29506487-29506902)
chr6 (55-470)||(30552726-30553141)
chr6 (55-470)||(27012802-27013218)
chr6 (55-470)||(13518904-13519319)
chr6 (55-470)||(26773337-26773752)
chr6 (55-470)||(27624421-27624836)
chr6 (55-470)||(20173618-20174033)
chr6 (55-470)||(22161958-22162373)
chr6 (143-468)||(27546951-27547276)
chr6 (132-456)||(18210480-18210804)
chr6 (253-468)||(25709003-25709218)
chr6 (132-456)||(18121530-18121854)
chr6 (132-456)||(21363449-21363773)
chr6 (132-456)||(23967431-23967755)
chr6 (303-470)||(17087401-17087568)
chr6 (244-468)||(9134276-9134500)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (55-470)||(18311945-18312360)
chr4 (55-470)||(39855724-39856139)
chr4 (55-470)||(17018133-17018548)
chr4 (55-470)||(27158084-27158499)
chr4 (55-470)||(36339284-36339699)
chr4 (55-470)||(5010962-5011377)
chr4 (55-470)||(14103630-14104045)
chr4 (55-470)||(24117749-24118164)
chr4 (55-470)||(24587128-24587543)
chr4 (55-470)||(34183726-34184142)
chr4 (55-470)||(6574945-6575360)
chr4 (55-470)||(14754259-14754674)
chr4 (55-470)||(40100404-40100819)
chr4 (55-470)||(54838478-54838893)
chr4 (55-470)||(18795381-18795796)
chr4 (55-470)||(30758847-30759262)
chr4 (55-470)||(20333188-20333603)
chr4 (55-470)||(14670100-14670515)
chr4 (55-470)||(15232903-15233318)
chr4 (55-470)||(21974788-21975203)
chr4 (59-470)||(5699622-5700033)
chr4 (55-470)||(31121279-31121694)
chr4 (55-470)||(33668568-33668982)
chr4 (55-470)||(1905341-1905753)
chr4 (55-470)||(15277394-15277809)
chr4 (55-470)||(15381010-15381425)
chr4 (143-468)||(1879978-1880303)
chr4 (132-468)||(22144437-22144773)
chr4 (132-456)||(19769416-19769740)
chr4 (132-456)||(14723667-14723991)
chr4 (10-60)||(33718802-33718852)
chr4 (257-453)||(55786212-55786408)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (55-470)||(4791445-4791860)
chr3 (55-470)||(8284279-8284695)
chr3 (55-470)||(18247776-18248191)
chr3 (55-470)||(5591167-5591582)
chr3 (55-470)||(6537552-6537967)
chr3 (55-470)||(10648108-10648523)
chr3 (55-470)||(4341486-4341901)
chr3 (55-470)||(4628820-4629235)
chr3 (55-470)||(5604124-5604539)
chr3 (55-470)||(8001595-8002010)
chr3 (55-470)||(10401179-10401594)
chr3 (55-470)||(18056297-18056712)
chr3 (55-470)||(22865658-22866073)
chr3 (55-470)||(22880717-22881132)
chr3 (55-470)||(28110764-28111179)
chr3 (55-470)||(29143566-29143981)
chr3 (55-470)||(4421950-4422365)
chr3 (55-470)||(4688690-4689105)
chr3 (55-470)||(5472023-5472438)
chr3 (55-470)||(15735904-15736319)
chr3 (55-470)||(18335665-18336080)
chr3 (55-470)||(19699524-19699939)
chr3 (55-470)||(22382388-22382803)
chr3 (55-470)||(28026316-28026731)
chr3 (55-470)||(31031046-31031461)
chr3 (55-470)||(35885801-35886216)
chr3 (55-470)||(5716108-5716524)
chr3 (55-470)||(5727018-5727434)
chr3 (55-470)||(5764934-5765350)
chr3 (55-470)||(7078241-7078656)
chr3 (55-470)||(8216669-8217084)
chr3 (55-470)||(16619300-16619715)
chr3 (55-470)||(17979759-17980174)
chr3 (59-470)||(18230231-18230642)
chr3 (55-470)||(18302464-18302879)
chr3 (55-470)||(48470962-48471377)
chr3 (55-470)||(51787058-51787473)
chr3 (55-470)||(5657169-5657587)
chr3 (55-470)||(4726665-4727080)
chr3 (55-470)||(6206939-6207354)
chr3 (55-470)||(11105169-11105584)
chr3 (55-470)||(15887515-15887930)
chr3 (55-470)||(17971671-17972086)
chr3 (55-470)||(18287163-18287578)
chr3 (55-470)||(31959265-31959680)
chr3 (55-470)||(5018749-5019164)
chr3 (55-470)||(21679738-21680153)
chr3 (55-470)||(24333198-24333613)
chr3 (55-470)||(29659780-29660195)
chr3 (55-470)||(32295663-32296078)
chr3 (55-470)||(32444186-32444601)
chr3 (55-470)||(47028488-47028903)
chr3 (55-470)||(28344212-28344626)
chr3 (55-470)||(16421220-16421635)
chr3 (55-470)||(20071075-20071490)
chr3 (55-470)||(20571653-20572068)
chr3 (132-468)||(6961344-6961680)
chr3 (140-468)||(4451788-4452116)
chr3 (132-456)||(22961478-22961802)
chr3 (132-456)||(16433430-16433753)
chr3 (132-456)||(7086955-7087279)
chr3 (132-456)||(11923269-11923593)
chr3 (132-456)||(6573379-6573703)
chr3 (257-444)||(15706510-15706697)
chr3 (257-453)||(20445145-20445341)
chr3 (244-468)||(37258732-37258956)
chr3 (245-468)||(15582132-15582355)
chr3 (257-468)||(46382347-46382558)
chr3 (244-468)||(5948825-5949049)
chr3 (132-186)||(15706768-15706822)
chr3 (245-390)||(15920580-15920725)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (55-470)||(4204460-4204875)
chr7 (55-470)||(16444658-16445073)
chr7 (55-470)||(26440328-26440743)
chr7 (55-470)||(45736378-45736793)
chr7 (55-470)||(2159645-2160060)
chr7 (55-470)||(16733178-16733593)
chr7 (55-470)||(16746169-16746584)
chr7 (55-470)||(31559042-31559457)
chr7 (55-470)||(5141992-5142407)
chr7 (55-470)||(5163454-5163869)
chr7 (55-470)||(16513082-16513497)
chr7 (55-470)||(26532525-26532940)
chr7 (55-470)||(39207791-39208206)
chr7 (55-470)||(45392291-45392706)
chr7 (55-470)||(2104815-2105230)
chr7 (55-470)||(2778325-2778740)
chr7 (55-470)||(10911521-10911936)
chr7 (55-470)||(11419431-11419846)
chr7 (55-470)||(24587186-24587601)
chr7 (55-470)||(11445958-11446373)
chr7 (55-470)||(26510348-26510763)
chr7 (55-470)||(31128978-31129393)
chr7 (55-470)||(4139898-4140313)
chr7 (55-470)||(26269738-26270153)
chr7 (55-470)||(26517863-26518278)
chr7 (61-470)||(31085280-31085689)
chr7 (55-470)||(5153155-5153570)
chr7 (55-470)||(26679758-26680173)
chr7 (55-470)||(26314500-26314915)
chr7 (55-470)||(26664566-26664981)
chr7 (55-470)||(3450377-3450792)
chr7 (56-467)||(16046389-16046800)
chr7 (55-470)||(10846691-10847106)
chr7 (143-468)||(1891339-1891664)
chr7 (132-456)||(29091577-29091901)
chr7 (132-456)||(15195144-15195468)
chr7 (132-456)||(2558596-2558920)
chr7 (132-456)||(16239477-16239801)
chr7 (132-363)||(16125595-16125826)
chr7 (244-468)||(9471365-9471589)
chr7 (257-453)||(16285257-16285453)
chr7 (244-468)||(16391299-16391523)
chr7 (257-453)||(796401-796597)
chr7 (244-468)||(30367811-30368035)
chr7 (132-192)||(13482958-13483018)
chr7 (387-456)||(16125826-16125895)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (55-470)||(20842986-20843401)
chr2 (55-470)||(32054876-32055291)
chr2 (55-470)||(37382750-37383165)
chr2 (55-470)||(37680651-37681066)
chr2 (55-470)||(37695916-37696331)
chr2 (55-470)||(12591881-12592296)
chr2 (55-470)||(23123325-23123740)
chr2 (55-470)||(27429197-27429612)
chr2 (55-470)||(31888247-31888662)
chr2 (55-470)||(34269676-34270091)
chr2 (55-470)||(21697926-21698341)
chr2 (55-470)||(27821064-27821479)
chr2 (55-470)||(37930442-37930857)
chr2 (55-470)||(27781307-27781722)
chr2 (55-470)||(255409-255824)
chr2 (55-470)||(12660610-12661025)
chr2 (55-470)||(16166553-16166968)
chr2 (55-470)||(19411257-19411672)
chr2 (55-470)||(27121597-27122012)
chr2 (55-470)||(28887352-28887767)
chr2 (55-470)||(37946618-37947033)
chr2 (55-470)||(39046575-39046990)
chr2 (55-470)||(39895142-39895557)
chr2 (55-470)||(11629940-11630355)
chr2 (55-470)||(12711357-12711772)
chr2 (55-470)||(27808776-27809191)
chr2 (55-470)||(34159917-34160332)
chr2 (55-468)||(31881361-31881774)
chr2 (55-470)||(3787566-3787981)
chr2 (55-470)||(21671931-21672346)
chr2 (55-470)||(22922904-22923319)
chr2 (55-470)||(34296227-34296642)
chr2 (55-470)||(34866757-34867172)
chr2 (55-470)||(9344742-9345157)
chr2 (55-470)||(13931303-13931718)
chr2 (55-470)||(16824094-16824509)
chr2 (55-470)||(16896971-16897386)
chr2 (55-470)||(40238581-40238996)
chr2 (55-470)||(19451179-19451594)
chr2 (143-468)||(26722144-26722469)
chr2 (278-468)||(34532446-34532636)
chr2 (132-456)||(34703139-34703463)
chr2 (132-456)||(42395598-42395922)
chr2 (257-453)||(21758597-21758793)
chr2 (244-468)||(12385711-12385935)
chr2 (244-468)||(22951444-22951668)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (55-470)||(5373-5788)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (55-470)||(732-1147)
scaffold0322 (55-470)||(11119-11534)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (55-470)||(13023-13438)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (55-470)||(14645-15060)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (55-470)||(25666-26081)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (55-470)||(5141-5556)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (55-470)||(10357-10772)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (55-470)||(11098-11513)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (55-470)||(3946-4361)
scaffold0159 (55-470)||(13562-13977)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (55-470)||(32367-32782)
scaffold0143 (55-470)||(9034-9449)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (55-470)||(20958-21373)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (55-470)||(11110-11525)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (59-470)||(9699-10110)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (55-470)||(24190-24605)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (55-465)||(41462-41889)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (138-468)||(16268-16598)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (132-456)||(12282-12606)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (132-456)||(87105-87429)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (227-468)||(32382-32623)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (251-468)||(33238-33455)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (244-468)||(31222-31446)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (132-189)||(51233-51290)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (278-401)||(154558-154681)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 29885861 - 29886276
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29885861 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29885960  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29885961 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 29886060  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29886061 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29886160  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29886161 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 29886260  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  29886261 tgctcaattttgaatt 29886276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33298024 - 33297609
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298024 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33297925  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33297924 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33297825  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33297824 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33297725  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33297724 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 33297625  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33297624 tgctcaattttgaatt 33297609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 13319494 - 13319909
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319494 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13319593  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13319594 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 13319693  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319694 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13319793  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319794 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13319893  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13319894 tgctcaattttgaatt 13319909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15653421 - 15653836
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15653421 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15653520  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15653521 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 15653620  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15653621 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15653720  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15653721 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15653820  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15653821 tgctcaattttgaatt 15653836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15753516 - 15753931
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753516 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15753615  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15753616 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15753715  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753716 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15753815  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753816 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15753915  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15753916 tgctcaattttgaatt 15753931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 18123080 - 18123495
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18123080 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18123179  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18123180 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18123279  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18123280 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18123379  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18123380 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18123479  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18123480 tgctcaattttgaatt 18123495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30034924 - 30034509
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034924 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30034825  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30034824 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 30034725  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034724 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30034625  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034624 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 30034525  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  30034524 tgctcaattttgaatt 30034509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 37746993 - 37747408
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746993 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37747092  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37747093 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37747192  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37747193 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37747292  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37747293 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37747392  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37747393 tgctcaattttgaatt 37747408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23631465 - 23631050
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631465 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 23631366  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23631365 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 23631266  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631265 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 23631166  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631165 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 23631066  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || |||||||||||||    
T  23631065 tgttcaattttgaatt 23631050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24975343 - 24974928
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24975343 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24975244  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24975243 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24975144  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24975143 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24975044  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24975043 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 24974944  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24974943 tgctcaattttgaatt 24974928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28654739 - 28654324
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28654739 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28654640  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28654639 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 28654540  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28654539 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28654440  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28654439 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 28654340  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28654339 tgctcaattttgaatt 28654324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30173965 - 30173550
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30173965 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30173866  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30173865 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 30173766  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30173765 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30173666  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30173665 cttgtaagtggtcaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 30173566  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  30173565 tgctcaattttgaatt 30173550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31436960 - 31436545
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31436960 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31436861  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31436860 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31436761  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31436760 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31436661  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31436660 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31436561  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31436560 tgctcaattttgaatt 31436545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37760479 - 37760064
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37760479 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37760380  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37760379 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37760280  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37760279 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37760180  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37760179 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 37760080  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37760079 tgctcaattttgaatt 37760064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 9545373 - 9545788
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9545373 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcacccatacgtttttcctcaatcaaa 9545472  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9545473 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 9545572  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9545573 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9545672  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9545673 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 9545772  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  9545773 tgctcaattttgaatt 9545788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11329133 - 11328718
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11329133 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcttcaatcaaa 11329034  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11329033 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 11328934  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11328933 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11328834  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11328833 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 11328734  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11328733 tgctcaattttgaatt 11328718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11554851 - 11554436
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11554851 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11554752  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11554751 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11554652  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11554651 cttccataccatatacaagagagaagggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11554552  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11554551 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11554452  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11554451 tgctcaattttgaatt 11554436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22993781 - 22994196
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993781 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22993880  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22993881 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22993980  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993981 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22994080  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22994081 cttgtaagtggttaccatcttctagacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22994180  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22994181 tgctcaattttgaatt 22994196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 32590938 - 32591353
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590938 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 32591037  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32591038 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32591137  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32591138 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32591237  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32591238 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 32591337  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  32591338 tgctcaattttgaatt 32591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33782981 - 33782566
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33782981 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33782882  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33782881 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33782782  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33782781 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33782682  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33782681 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33782582  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33782581 tgctcaattttgaatt 33782566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 40468214 - 40468629
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40468214 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 40468313  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40468314 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 40468413  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40468414 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 40468513  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40468514 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 40468613  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  40468614 tgctcaattttgaatt 40468629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41680201 - 41679786
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680201 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 41680102  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41680101 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 41680002  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680001 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 41679902  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41679901 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctcaggtctatagggagaagagttatga 41679802  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||| ||||||    
T  41679801 tgctcaattctgaatt 41679786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5643284 - 5642869
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643284 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5643185  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5643184 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaagggagaactg 5643085  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5643084 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 5642985  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5642984 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaaccgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5642885  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5642884 tgctcaattttgaatt 5642869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6879801 - 6879386
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6879801 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6879702  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6879701 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6879602  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6879601 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6879502  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6879501 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 6879402  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  6879401 tgctcaattttgaatt 6879386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 13181457 - 13181872
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13181457 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcttcaatcaaa 13181556  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13181557 ttcaactgatcataccggcttcggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacgaagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 13181656  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13181657 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgtactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13181756  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13181757 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13181856  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13181857 tgctcaattttgaatt 13181872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 13437347 - 13437762
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13437347 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13437446  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13437447 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccgtgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13437546  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13437547 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcctcggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13437646  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13437647 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13437746  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13437747 tgctcaattttgaatt 13437762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23897371 - 23896956
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23897371 gaattttcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcgtccatacgtttttcctcaaccaaa 23897272  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23897271 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcggcctcggataactttgcttccatgatcacatggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 23897172  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23897171 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcataggataacatctcatgccagtc 23897072  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897071 cttgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 23896972  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  23896971 tgctcaattttgaatt 23896956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30157527 - 30157112
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30157527 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30157428  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  30157427 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 30157328  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30157327 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30157228  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30157227 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 30157128  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  30157127 tgctcaattttgaatt 30157112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34622014 - 34621599
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622014 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgctcgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34621915  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34621914 ttcaactgatcataccggctttggcaccaatcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34621815  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34621814 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34621715  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34621714 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34621615  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  34621614 tgctcaattttgaatt 34621599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3795037 - 3794622
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795037 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 3794938  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3794937 ttcaactgatcataccggctttagcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 3794838  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3794837 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacacctcatgccagtc 3794738  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3794737 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 3794638  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3794637 tgctcgattttgaatt 3794622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 8660139 - 8660554
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8660139 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8660238  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8660239 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8660338  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8660339 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8660438  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8660439 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 8660538  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  8660539 tgctcaattttgaatt 8660554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 31821071 - 31821486
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31821071 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31821170  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31821171 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataacttcacttccatgatcacacggagagaggggatctccacttccaaaggaagaactg 31821270  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31821271 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgtcagtc 31821370  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31821371 cttgtaagtggttaccatcttctggacgatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31821470  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31821471 tgctcaattttgaatt 31821486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 43083751 - 43083336
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083751 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 43083652  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43083651 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctctacttccaaaggaagaactg 43083552  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083551 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacgatagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 43083452  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43083451 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 43083352  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  43083351 tgctcaattttgaatt 43083336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2516558 - 2516143
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2516558 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2516459  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2516458 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2516359  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2516358 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2516259  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2516258 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 2516159  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  2516158 tgctcaattttgaatt 2516143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 18370198 - 18370613
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18370198 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18370297  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18370298 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataattttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18370397  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18370398 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18370497  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18370498 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 18370597  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18370598 tgctcaattttgaatt 18370613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 18495389 - 18495804
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18495389 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18495488  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18495489 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18495588  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18495589 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtatggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18495688  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18495689 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18495788  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18495789 tgctcaattttgaatt 18495804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 37353307 - 37353722
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37353307 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37353406  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37353407 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37353506  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37353507 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 37353606  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37353607 cttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37353706  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37353707 tgctcaattttgaatt 37353722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12137671 - 12137256
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12137671 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 12137572  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12137571 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 12137472  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12137471 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12137372  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12137371 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 12137272  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  12137271 tgctcaattttgaatt 12137256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24729465 - 24729050
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729465 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24729366  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24729365 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24729266  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729265 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24729166  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729165 cttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24729066  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24729065 tgctcaattttgaatt 24729050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26485890 - 26485475
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26485890 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 26485791  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26485790 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26485691  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26485690 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26485591  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26485590 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26485491  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26485490 tgctcaattttgaatt 26485475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 28954449 - 28954864
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28954449 gaattctcgagaatggactttcttgtcaaaggcagtcttcatccttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgttttttctcaatcaaa 28954548  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  28954549 ttcaactgatcataccggccttggcaccattcagcctcagataattttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaaggactg 28954648  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28954649 cttccaaaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 28954748  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28954749 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28954848  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28954849 tgctcaattttgaatt 28954864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30940131 - 30939716
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30940131 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcattcatacgtttttcctcaatcaaa 30940032  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30940031 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcctcggatgactttgcttccatgatcacacagagagatgggatctccacttccaaaggaagaacta 30939932  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939931 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcaccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccgtgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30939832  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30939831 cttgtaagtggttaccattttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatttgaggtctataaggagaagagttatga 30939732  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  30939731 tgctcaattttgaatt 30939716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 37666150 - 37666565
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37666150 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37666249  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37666250 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37666349  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37666350 cttccataccgtatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatttcatgccagtc 37666449  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37666450 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 37666549  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37666550 tgctcaattttgaatt 37666565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33521876 - 33521461
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33521876 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33521777  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33521776 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttcccaaggaagaactg 33521677  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33521676 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33521577  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33521576 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 33521477  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33521476 tgctcaattttgaatt 33521461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33880624 - 33880209
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33880624 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33880525  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33880524 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 33880425  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33880424 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33880325  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33880324 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33880225  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33880224 tgctcaattttgaatt 33880209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9322972 - 9322557
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9322972 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 9322873  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9322872 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctctacttccaaaggaagaactg 9322773  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322772 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9322673  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9322672 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 9322573  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  9322572 tgctcaattttgaatt 9322557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 25205774 - 25205359
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25205774 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcaatcttcatccttgcttgatatgactgtccgcgagccatgacatccatacgtttctcctcaaccaaa 25205675  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25205674 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacgcggagagatgggatctccacttccaacggaagaactg 25205575  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  25205574 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcataaggcaacatctcatgccaatc 25205475  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25205474 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtcatga 25205375  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  25205374 tgctcaattttgaatt 25205359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 25269929 - 25269514
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25269929 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcaatcttcatccttgcttgatatgactgtccgcgagccatgacatccatacgtttctcctcaaccaaa 25269830  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25269829 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacgcggagagatgggatctccacttccaacggaagaactg 25269730  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  25269729 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcataaggcaacatctcatgccaatc 25269630  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25269629 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtcatga 25269530  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  25269529 tgctcaattttgaatt 25269514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22893907 - 22893492
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  22893907 gaattctcgaggacggactctcttgtcgaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 22893808  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22893807 ttcaactgatcatacccgctttggcaccattaagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22893708  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22893707 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaatatctcatgccaatc 22893608  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22893607 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagacgagttatga 22893508  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22893507 tgctcaattttgaatt 22893492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 468
Target Start/End: Original strand, 349980 - 350316
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| || | ||  | |||||| |  || |  |  || |||||    
T  349980 ccatgcgtttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcagcttccatcaagaccctcaatgacgggat 350079  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
     || ||||| |  ||||| | ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| | || |||| |||||| ||||||| || |||     
T  350080 ttcaacttctaccggaagtatcgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgtactgaagtacgataaccatacaaagcg 350179  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  350180 tagggcaacatctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctgag 350279  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  350280 gtctataaggagaagagttatgatgctcgatcttgaa 350316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 3481968 - 3482292
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| |||||    
T  3481968 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaagggat 3482067  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  3482068 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 3482167  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  3482168 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 3482267  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  3482268 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 3482292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 278 - 468
Target Start/End: Original strand, 20386900 - 20387090
Alignment:
Q  278 aaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttct 377  Q
    |||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||    
T  20386900 aaaggggttgcccctgttgaagtacgtactgaagtacggtaaccatacaaagtatagggtaacatctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttct 20386999  T
Q  378 gaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20387000 gcacaatcttcttaatattcttgtttgccgcttcgaccgcaccattcatctggggtctataaggagaagaattatgatgctcaatcttgaa 20387090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 36373839 - 36374063
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  36373839 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgacgtgcgtacggaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 36373938  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  36373939 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacggcaccattcatttgaggtctgtaaggtg 36374038  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  36374039 aagagttatggtgctcgattttgaa 36374063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 36998493 - 36998717
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  36998493 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgacgtgcgtacggaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 36998592  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  36998593 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacggcaccattcatttgaggtctgtaaggtg 36998692  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  36998693 aagagttatggtgctcgattttgaa 36998717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 5438102 - 5438326
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  5438102 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaaggggagcatt 5438201  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  5438202 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccattcatttgaggtctgtaaggtg 5438301  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  5438302 aagagttatggtgctcgatcttgaa 5438326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 468
Target Start/End: Original strand, 15782615 - 15782826
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | ||| |||||||| || |    
T  15782615 tccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctt 15782714  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||||||    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15782715 tataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttcgcagcttcgacagcaccattcatttgaggtctgtaaggtgaagagttatggtg 15782814  T
Q  457 ctcaattttgaa 468  Q
    ||| || |||||    
T  15782815 ctcgatcttgaa 15782826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Original strand, 24065056 - 24065252
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| |  | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  24065056 tccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtatagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgccaatctt 24065155  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24065156 tataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgaggtctgtaaggcgaagaattatg 24065252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31522577 - 31522381
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | ||| |||||||| || |    
T  31522577 tccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctt 31522478  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31522477 tataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttcgcagcttcgacagcaccattcatttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 31522381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34470892 - 34470696
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| || |  ||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  34470892 tccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagacgtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgccaatctt 34470793  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  34470792 tataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgaggtctgtaaggcgaagaattatg 34470696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 11942299 - 11942523
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  11942299 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 11942398  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| | |||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  11942399 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttagattcttatttgcagcttcgacggcaccattcatttgaggtctgtaaggtg 11942498  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  11942499 aagagttatggtgctcgatcttgaa 11942523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17959380 - 17959156
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  17959380 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctattgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 17959281  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  17959280 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccattcatttggggtctgtaaggtg 17959181  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  17959180 aagagttatggtgctcgatcttgaa 17959156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 20375404 - 20375456
Alignment:
Q  140 ttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctc 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||||||||    
T  20375404 ttttcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctc 20375456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 20335183 - 20335598
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20335183 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatgcatacgtttttcctcaaccaaa 20335282  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20335283 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcaacctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 20335382  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20335383 cttccataccatatacaagagagaaaggggtttccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatcccatgccagtc 20335482  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335483 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 20335582  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  20335583 tgctcaattttgaatt 20335598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10968156 - 10967741
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968156 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10968057  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10968056 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10967957  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10967956 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 10967857  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10967856 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10967757  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  10967756 tgctcaattttgaatt 10967741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3646634 - 3646219
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3646634 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaccgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 3646535  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3646534 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 3646435  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3646434 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 3646335  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3646334 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 3646235  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  3646234 tgctcaattttgaatt 3646219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 21892514 - 21892929
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892514 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21892613  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21892614 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21892713  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892714 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgctccggttgaactgtgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21892813  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21892814 cttataagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 21892913  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  21892914 tgctcaattttgaatt 21892929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28155228 - 28154812
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgat-atgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28155228 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgattatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaa 28155129  T
Q  154 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28155128 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 28155029  T
Q  254 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155028 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 28154929  T
Q  354 ccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28154928 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 28154829  T
Q  454 atgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||||||||||||    
T  28154828 atgctcaattttgaatt 28154812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10950568 - 10950153
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10950568 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10950469  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10950468 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10950369  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10950368 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 10950269  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10950268 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10950169  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  10950168 tgctcaattttgaatt 10950153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16202801 - 16203216
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16202801 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcatccttgcttgatatgactgtccacgaaccatgacatccatacgtttttcctcaaccaaa 16202900  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16202901 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16203000  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16203001 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgctagtc 16203100  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16203101 cttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16203200  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16203201 tgctcaattttgaatt 16203216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 41788077 - 41788492
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41788077 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 41788176  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41788177 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 41788276  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41788277 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 41788376  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41788377 cttgtaggtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 41788476  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  41788477 tgctcaattttgaatt 41788492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 51643709 - 51643294
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643709 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 51643610  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  51643609 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 51643510  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643509 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 51643410  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643409 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 51643310  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  51643309 tgctcaattttgaatt 51643294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28590571 - 28590156
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28590571 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgacagtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28590472  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28590471 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 28590372  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28590371 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28590272  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28590271 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 28590172  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28590171 tgctcaattttgaatt 28590156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 278 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20466244 - 20466052
Alignment:
Q  278 aaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  20466244 aaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcaaagcatagggcaacatctcatgccaatctttgtaggtagttaccatcttct 20466145  T
Q  378 gaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466144 gaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaatt 20466052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 140 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13456158 - 13455830
Alignment:
Q  140 ttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccactt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||||| || || ||||  | |||||| |  || |  | ||| ||||| || ||||    
T  13456158 ttttcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcatctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaactt 13456059  T
Q  240 ccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaa 339  Q
    | |  ||||| | ||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13456058 ctacgggaagtatcgcttccataccatacaccaaagaaaaaggagttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcatagggtaa 13455959  T
Q  340 catctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataa 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||||    
T  13455958 catctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgaacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcgccattcatctggggtctataa 13455859  T
Q  440 ggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13455858 ggagaagagttatgatgctcaatcttgaa 13455830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22491411 - 22491087
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  22491411 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 22491312  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  22491311 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 22491212  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  22491211 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 22491112  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  22491111 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 22491087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 468
Target Start/End: Original strand, 1064396 - 1064587
Alignment:
Q  278 aaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcctt-ataagtagtaaccatcttc 376  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||| || ||||| |  ||| | |||| ||| ||||||||||| || |||||||   |||||||||    
T  1064396 aaagggtttgcccctgttgaagtgtgcactgaagtacgatacccatgtaaggcaaatggtagcatttcatgccagtcttttataagtaactaccatcttc 1064495  T
Q  377 tgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    || |||||||||||| |||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  1064496 tggacaatcttcttgttatttttatttgcagcttcgacagcaccattcatctggggtctgtaaggagaggaattatgatgctcaatcttgaa 1064587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 468
Target Start/End: Original strand, 5626991 - 5627202
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | ||| |||||||| || |    
T  5626991 tccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctt 5627090  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  | || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  5627091 tataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttctcagcttcgacagcaccattcatttgaggtctgtaaggtgaagagttatggtg 5627190  T
Q  457 ctcaattttgaa 468  Q
    ||| || |||||    
T  5627191 ctcgatcttgaa 5627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9296847 - 9296725
Alignment:
Q  280 aggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctga 379  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| || |||||| ||||||||||  ||  | |||| |||||||| | |||| ||||||||| |  ||||||| ||     
T  9296847 aggggttgcctctgttgaagtgcgcattgaagtacgataaccatgcaaggcgaacggtagcatctcatactagtctttataagtaatttccatcttttgg 9296748  T
Q  380 acaatcttcttgatattcttgtt 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  9296747 acaatcttcttgatatttttgtt 9296725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18071 - 17656
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 17972  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17971 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17872  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17772  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17771 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 17672  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  17671 tgctcaattttgaatt 17656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18796192 - 18795777
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796192 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18796093  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18796092 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18795993  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795992 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18795893  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18795892 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 18795793  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18795792 tgctcaattttgaatt 18795777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 2131988 - 2132403
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2131988 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 2132087  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2132088 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcaacctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaaggaagaactg 2132187  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2132188 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2132287  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2132288 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 2132387  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  2132388 tgctcaattttgaatt 2132403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 12087451 - 12087866
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12087451 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 12087550  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12087551 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 12087650  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12087651 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12087750  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12087751 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 12087850  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  12087851 tgctcaattttgaatt 12087866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27603633 - 27604048
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603633 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27603732  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27603733 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27603832  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603833 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27603932  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27603933 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27604032  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27604033 tgctcaattttgaatt 27604048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18714972 - 18714557
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18714972 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18714873  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18714872 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18714773  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18714772 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 18714673  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18714672 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18714573  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18714572 tgctcaattttgaatt 18714557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19679935 - 19679520
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19679935 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatacgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19679836  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19679835 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 19679736  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19679735 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 19679636  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19679635 cttgtaagtggttaccatcttctggacgatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 19679536  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  19679535 tgctcaattttgaatt 19679520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19693587 - 19693172
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19693587 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19693488  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19693487 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcctccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19693388  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19693387 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgtgcattgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 19693288  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19693287 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19693188  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  19693187 tgctcaattttgaatt 19693172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33247858 - 33247443
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33247858 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33247759  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33247758 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33247659  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33247658 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33247559  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33247558 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33247459  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33247458 tgctcaattttgaatt 33247443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 44566472 - 44566057
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566472 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 44566373  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44566372 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 44566273  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44566272 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 44566173  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44566172 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 44566073  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  44566072 tgctcaattttgaatt 44566057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9360113 - 9359698
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360113 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 9360014  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9360013 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 9359914  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9359913 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9359814  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9359813 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 9359714  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  9359713 tgctcaattttgaatt 9359698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 28356680 - 28357095
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356680 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttggtatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28356779  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28356780 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacctccaaaggaagaactg 28356879  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356880 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28356979  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356980 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28357079  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28357080 tgctcaattttgaatt 28357095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15773062 - 15772647
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773062 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15772963  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  15772962 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacgaagagatgggatctccacttccagagggagaactg 15772863  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15772862 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15772763  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15772762 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 15772663  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15772662 tgctcaattttgaatt 15772647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 31484599 - 31485014
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484599 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31484698  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31484699 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31484798  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31484799 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 31484898  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31484899 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31484998  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31484999 tgctcaattttgaatt 31485014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33264222 - 33263807
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264222 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33264123  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33264122 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33264023  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264022 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33263923  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33263922 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 33263823  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33263822 tgctcaattttgaatt 33263807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29834813 - 29834398
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29834813 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29834714  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29834713 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttacttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 29834614  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29834613 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactacgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 29834514  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29834513 cttgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29834414  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  29834413 tgctcaattttgaatt 29834398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31360016 - 31359601
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360016 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31359917  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31359916 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31359817  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31359816 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgtacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 31359717  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31359716 cttgtaagtggtcaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31359617  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31359616 tgctcaattttgaatt 31359601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 21342899 - 21343314
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342899 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactatccacgagccatggcatccatacatttttcctcaatcaaa 21342998  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21342999 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcaaataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21343098  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343099 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21343198  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343199 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 21343298  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || |||||||||||||    
T  21343299 tgttcaattttgaatt 21343314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 19203090 - 19203505
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19203090 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19203189  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19203190 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataaccttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 19203289  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19203290 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagcaatgcagagcatagggtaacatttcatgccagtc 19203389  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19203390 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19203489  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  19203490 tgctcaattttgaatt 19203505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 19911890 - 19912305
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911890 gaattctcgaggatggaccttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19911989  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19911990 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19912089  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19912090 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtggtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 19912189  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19912190 cttgtaagtggttaccgtcttctggacaattctcttgatattcttgttggcagcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaatagttatga 19912289  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  19912290 tgctcaattttgaatt 19912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 19656068 - 19656483
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  19656068 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctccaccaga 19656167  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19656168 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19656267  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656268 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgtcctggttgaactgcgcacggtggtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 19656367  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19656368 cttgtaagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19656467  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  19656468 tgctcaattttgaatt 19656483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16288441 - 16288025
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagcc-atggcatccatacgtttttcctcaatcaa 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16288441 gaattctcgaggatggaccttcttatcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaccgtccacgagcccatggcatccatacgtttttcctcaatcaa 16288342  T
Q  154 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16288341 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcaaataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 16288242  T
Q  254 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16288241 gcttccataccatatacaagagagaaaggtgttgccccggttgaactgcgcactatagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 16288142  T
Q  354 ccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16288141 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 16288042  T
Q  454 atgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||||||||||||    
T  16288041 atgctcaattttgaatt 16288025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22138398 - 22137983
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22138398 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtctttattcttgcttgataggactgtccacgagccatggcatccatacgcttttcctcaaccaaa 22138299  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22138298 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcggcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaaggaagaactg 22138199  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138198 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22138099  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    | | ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22138098 cctgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22137999  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22137998 tgctcaattttgaatt 22137983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22075653 - 22076068
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  22075653 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaaatggttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 22075752  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  22075753 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcgaataacttcgcttccatgattacacgaagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 22075852  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22075853 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccgattgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 22075952  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22075953 cttgtaactagtaaccatcttctgaataatcttcttgatattcttgttggcggcttcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttatga 22076052  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22076053 tgctcaattttgaatt 22076068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 255 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14562912 - 14562697
Alignment:
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14562912 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14562813  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14562812 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 14562713  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  14562712 tgctcaattttgaatt 14562697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 55 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14568647 - 14568443
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14568647 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttcatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttttcaatcaaa 14568548  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  14568547 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgatcacacggagagatgggatctccactaccaaagggagaactg 14568448  T
Q  255 cttcc 259  Q
    |||||    
T  14568447 cttcc 14568443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 143 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16770699 - 16770374
Alignment:
Q  143 tcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttcca 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   | || |||||||||||||| || ||||  | |||||| |  || |  | ||| ||||| || ||||| |    
T  16770699 tcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaacttcta 16770600  T
Q  243 aaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacat 342  Q
     |||||| | ||||||| ||||||| || |  || |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16770599 caggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcatagggtaacat 16770500  T
Q  343 ctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataagga 442  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16770499 ctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgactgcaccattcatctggggtctataagga 16770400  T
Q  443 gaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16770399 gaagagttatgatgctcaatcttgaa 16770374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22414325 - 22414001
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  22414325 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 22414226  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  22414225 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 22414126  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  22414125 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 22414026  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  22414025 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 22414001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14214426 - 14214102
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  14214426 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 14214327  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || |  || || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  14214326 ctcaacctctactggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 14214227  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  14214226 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 14214127  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  14214126 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 14214102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19846550 - 19846226
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  |  || || ||    
T  19846550 ccatgcgtttctcctcaatcaaattcaactggtcatacctgttttggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaggaaggaat 19846451  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || |  || || || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||  ||||| || |||| || |||     
T  19846450 ctcaacctctattggtagtacagcctccataccatataccaaagaaaaaggggttgccccggtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcg 19846351  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    || |||||||| ||| |||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |    
T  19846350 taaggtaacatttcacgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatttgtg 19846251  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||    
T  19846250 gcctgtaaggggaagaattatgatg 19846226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 24300467 - 24300882
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24300467 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24300566  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24300567 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24300666  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24300667 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24300766  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24300767 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24300866  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24300867 tgctcaattttgaatt 24300882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 13293661 - 13294076
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293661 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13293760  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13293761 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13293860  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13293861 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 13293960  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293961 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13294060  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13294061 tgctcaattttgaatt 13294076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22929594 - 22930009
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929594 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22929693  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22929694 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22929793  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929794 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22929893  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22929894 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattatcttgatattcttgttggcggcctcaactgtaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 22929993  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22929994 tgctcaattttgaatt 22930009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 23852039 - 23852454
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23852039 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 23852138  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23852139 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 23852238  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23852239 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 23852338  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23852339 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattatcttgatattcttgttggcggcctcaactgtaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 23852438  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  23852439 tgctcaattttgaatt 23852454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27356820 - 27357235
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27356820 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccaaacgtttttcctcaatcaaa 27356919  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27356920 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27357019  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357020 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27357119  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27357120 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27357219  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27357220 tgctcaattttgaatt 27357235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4778366 - 4777951
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778366 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4778267  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4778266 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaaggactg 4778167  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778166 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4778067  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778066 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcagcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4777967  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4777966 tgctcaattttgaatt 4777951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16755307 - 16754892
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16755307 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcatcaatcaaa 16755208  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16755207 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16755108  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755107 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16755008  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16755007 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16754908  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16754907 tgctcaattttgaatt 16754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27490619 - 27490204
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27490619 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27490520  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27490519 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27490420  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27490419 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27490320  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27490319 cttgtacgtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27490220  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27490219 tgctcaattttgaatt 27490204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28212940 - 28212525
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28212940 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28212841  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28212840 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 28212741  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28212740 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28212641  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28212640 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28212541  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28212540 tgctcaattttgaatt 28212525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4530771 - 4530356
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4530771 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4530672  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4530671 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcttcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4530572  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4530571 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4530472  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4530471 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4530372  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4530371 tgctcaattttgaatt 4530356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4763249 - 4762834
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763249 gaattctcgaagatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4763150  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4763149 ttcaactgatcataccgcctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4763050  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763049 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4762950  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4762949 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4762850  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4762849 tgctcaattttgaatt 4762834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 8900413 - 8900828
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8900413 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8900512  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8900513 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8900612  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8900613 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8900712  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8900713 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 8900812  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  8900813 tgctcaattttgaatt 8900828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16679626 - 16679211
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16679626 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16679527  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16679526 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 16679427  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16679426 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16679327  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16679326 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16679227  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16679226 tgctcaattttgaatt 16679211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26791302 - 26790887
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791302 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26791203  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26791202 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26791103  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791102 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26791003  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791002 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26790903  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26790902 tgctcaattttgaatt 26790887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 4718845 - 4719260
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718845 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4718944  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718945 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 4719044  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4719045 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4719144  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4719145 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4719244  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4719245 tgctcaattttgaatt 4719260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27062992 - 27062577
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27062992 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27062893  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27062892 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27062793  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27062792 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27062693  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27062692 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcagcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27062593  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27062592 tgctcaattttgaatt 27062577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27184415 - 27184000
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184415 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27184316  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27184315 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagttaactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27184216  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184215 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27184116  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27184115 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27184016  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27184015 tgctcaattttgaatt 27184000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27199671 - 27199256
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27199671 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27199572  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27199571 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27199472  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27199471 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27199372  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27199371 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27199272  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27199271 tgctcaattttgaatt 27199256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27249563 - 27249978
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249563 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27249662  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27249663 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27249762  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249763 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27249862  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27249863 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27249962  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27249963 tgctcaattttgaatt 27249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27264824 - 27265239
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27264824 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27264923  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27264924 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagttaactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27265023  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27265024 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27265123  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27265124 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27265223  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27265224 tgctcaattttgaatt 27265239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29555044 - 29554629
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555044 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29554945  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29554944 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29554845  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29554844 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29554745  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29554744 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 29554645  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  29554644 tgctcaattttgaatt 29554629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 14140104 - 14140519
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14140104 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 14140203  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14140204 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 14140303  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140304 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14140403  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14140404 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14140503  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  14140504 tgctcaattttgaatt 14140519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26926256 - 26925841
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926256 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26926157  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26926156 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacgaagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26926057  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926056 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26925957  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26925956 cttgtaagtggttaccatcttctggacatttctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26925857  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26925856 tgctcaattttgaatt 26925841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27024623 - 27024208
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27024623 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggtatccatacgtttttcctcaatcaaa 27024524  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27024523 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgagatctccacttccaaaggaagaactg 27024424  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27024423 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcctcggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 27024324  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024323 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27024224  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27024223 tgctcaattttgaatt 27024208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29578500 - 29578085
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29578500 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 29578401  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29578400 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29578301  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29578300 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29578201  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29578200 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 29578101  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  29578100 tgctcaattttgaatt 29578085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 33371141 - 33371556
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33371141 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagtagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33371240  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  33371241 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaagggagaactg 33371340  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33371341 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33371440  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33371441 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33371540  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33371541 tgctcaattttgaatt 33371556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 34459216 - 34459631
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34459216 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34459315  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34459316 ttcaactgatcaaaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34459415  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34459416 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34459515  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34459516 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34459615  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  34459616 tgctcgattttgaatt 34459631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 4540484 - 4540899
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4540484 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttccctcaatcaaa 4540583  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4540584 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4540683  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4540684 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4540783  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4540784 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4540883  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4540884 tgctcaattttgaatt 4540899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15407243 - 15407658
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15407243 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacatttttcctcaatcaaa 15407342  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15407343 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15407442  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15407443 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 15407542  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15407543 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15407642  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15407643 tgctcaattttgaatt 15407658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15419030 - 15419445
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15419030 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacatttttcctcaatcaaa 15419129  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15419130 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15419229  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15419230 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 15419329  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15419330 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15419429  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15419430 tgctcaattttgaatt 15419445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16938737 - 16939152
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938737 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16938836  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16938837 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16938936  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938937 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16939036  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16939037 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 16939136  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16939137 tgctcaattttgaatt 16939152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24869202 - 24868787
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869202 gaattctcgaggacggaccttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24869103  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24869102 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgtgatctccacttccaaaggaagaactg 24869003  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24869002 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 24868903  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24868902 cttgtacgtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgatgtctatagggagaagagttatga 24868803  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24868802 tgctcaattttgaatt 24868787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28165977 - 28165562
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28165977 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28165878  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  28165877 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaagggagaactg 28165778  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28165777 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacagtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28165678  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28165677 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaggagttatga 28165578  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28165577 tgctcaattttgaatt 28165562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26111122 - 26111537
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111122 gaattctcgcggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26111221  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26111222 tttaactgatcataccggttttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26111321  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111322 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26111421  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111422 cttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26111521  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26111522 tgctcaattttgaatt 26111537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27285074 - 27285489
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27285074 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27285173  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27285174 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27285273  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27285274 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcaaagcatagggcaacatctcatgccaatc 27285373  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  27285374 tttgtaggtagttaccattttctgaacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttgtaa 27285473  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27285474 tgctcaattttgaatt 27285489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29506902 - 29506487
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29506902 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtattcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29506803  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29506802 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29506703  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29506702 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29506603  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29506602 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29506503  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  29506502 tgctcaattttgaatt 29506487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 30552726 - 30553141
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552726 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30552825  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30552826 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 30552925  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552926 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30553025  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  30553026 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 30553125  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  30553126 tgctcaattttgaatt 30553141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27013218 - 27012802
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013218 gaattcccgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27013119  T
Q  155 ttcaactgatcataccgg-ctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacc 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27013118 ttcaactgatcataccgggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 27013019  T
Q  254 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013018 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 27012919  T
Q  354 ccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27012918 ccttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 27012819  T
Q  454 atgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||||||||||||    
T  27012818 atgctcaattttgaatt 27012802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 13518904 - 13519319
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518904 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13519003  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13519004 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13519103  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13519104 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13519203  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13519204 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13519303  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13519304 tgctcaattttgaatt 13519319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26773337 - 26773752
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26773337 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26773436  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26773437 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgattacccggagagacgggatcttcacttccaaaggaagaactg 26773536  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26773537 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26773636  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26773637 cttgtaagtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26773736  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26773737 tgctcaattttgaatt 26773752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27624421 - 27624836
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27624421 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcatctttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 27624520  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  27624521 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacggaatctccacttccaaaggaagaactg 27624620  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27624621 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcaaagcatagggcaacatctcatgccaatc 27624720  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27624721 tttgtaagtggttaccatcttctggacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcgccattcatctgaggcctataaggagaagagttgtga 27624820  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27624821 tgctcaattttgaatt 27624836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20174033 - 20173618
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  20174033 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccacggaatccatgcgtttttcctcaatcaaa 20173934  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  20173933 tttaactgatcgcaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccagttccaaaggaagaacta 20173834  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  20173833 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcactgtggtgcgatagccatgcaaagcattgggcagcatctcgtgccagtc 20173734  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || |||   |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20173733 cttgtaggtaactaccatcttttggacgatcttcttgatgttcttattggctgcctcaactgcaccgttcatctgaggcctataaggagaagagttatga 20173634  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || || || |||||||    
T  20173633 tgttcgatcttgaatt 20173618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22161958 - 22162373
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22161958 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccacggaatccatgcgtttttcctcaatcaaa 22162057  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  22162058 tttaactgatcgcaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccagttccaaaggaagaacta 22162157  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  22162158 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcactgtggtgcgatagccatgcaaagcattgggcagcatctcgtgccagtc 22162257  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || |||   |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22162258 cttgtaggtaactaccatcttttggacgatcttcttgatgttcttattggctgcctcaactgcaccgttcatctgaggcctataaggagaagagttatga 22162357  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || || || |||||||    
T  22162358 tgttcgatcttgaatt 22162373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27547276 - 27546951
Alignment:
Q  143 tcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttcca 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   | || |||||||||||||| || ||||  | |||||| |  || |  | ||| ||||| || ||||| |    
T  27547276 tcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaacttcta 27547177  T
Q  243 aaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacat 342  Q
     |||||| | ||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27547176 caggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggagaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcatagggtaacat 27547077  T
Q  343 ctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataagga 442  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27547076 ctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgactgcaccattcatctggggtctataagga 27546977  T
Q  443 gaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  27546976 gaagagttatgatgctcaatcttgaa 27546951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 18210480 - 18210804
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  18210480 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 18210579  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  18210580 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 18210679  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  18210680 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 18210779  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  18210780 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 18210804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 253 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25709218 - 25709003
Alignment:
Q  253 cgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccag 352  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||  ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  25709218 cgcttccataccatacaccaaagaaaaaggagttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacattaaccatacaaatcataggataacatctcatgccag 25709119  T
Q  353 tccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttat 452  Q
    |||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25709118 tccttataggtgaccaccatcttctgaacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcgccattcatctggggtttataaggagaagagttat 25709019  T
Q  453 gatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| |||||    
T  25709018 gatgctcaatcttgaa 25709003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18121854 - 18121530
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  18121854 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 18121755  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| |  |||     
T  18121754 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccataccaagcg 18121655  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  18121654 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 18121555  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  18121554 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 18121530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 21363449 - 21363773
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  21363449 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 21363548  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| || |||| || |||     
T  21363549 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccataaaccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcg 21363648  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  21363649 tagggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 21363748  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  21363749 gtctataaggagaagaattgtgatg 21363773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 23967431 - 23967755
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  23967431 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 23967530  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| || |||| || |||     
T  23967531 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccataaaccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcg 23967630  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  23967631 tagggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 23967730  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  23967731 gtctataaggagaagaattgtgatg 23967755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 303 - 470
Target Start/End: Original strand, 17087401 - 17087568
Alignment:
Q  303 gcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgtt 402  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| || | |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  17087401 gcactgtagtacggtagccgtgcaaagcataaggcagcatctcgtgccaatctttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttatt 17087500  T
Q  403 ggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaatt 470  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  17087501 ggctgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagatttatgatgttcgattttgaatt 17087568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 9134276 - 9134500
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  9134276 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 9134375  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| | |||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  9134376 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttagattcttatttgcagcttcgacggcaccattcatttgaggtctgtaaggtg 9134475  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  9134476 aagagttatggtgctcgatcttgaa 9134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 18311945 - 18312360
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18311945 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18312044  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18312045 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18312144  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18312145 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18312244  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18312245 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18312344  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18312345 tgctcaattttgaatt 18312360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39856139 - 39855724
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856139 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39856040  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39856039 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 39855940  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39855939 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 39855840  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39855839 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 39855740  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  39855739 tgctcaattttgaatt 39855724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17018548 - 17018133
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17018548 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 17018449  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17018448 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17018349  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17018348 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17018249  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17018248 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 17018149  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  17018148 tgctcaattttgaatt 17018133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27158084 - 27158499
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27158084 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27158183  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27158184 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 27158283  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27158284 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27158383  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27158384 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27158483  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27158484 tgctcaattttgaatt 27158499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 36339284 - 36339699
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36339284 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 36339383  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36339384 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaattg 36339483  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36339484 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 36339583  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36339584 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 36339683  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||| |||||||    
T  36339684 tgctcaatcttgaatt 36339699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5011377 - 5010962
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5011377 gaattctcggggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 5011278  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5011277 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5011178  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011177 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5011078  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5011077 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5010978  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||| |||||||    
T  5010977 tgctcaatcttgaatt 5010962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14104045 - 14103630
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104045 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 14103946  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14103945 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 14103846  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103845 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14103746  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14103745 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14103646  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||| |||||||    
T  14103645 tgctcaatcttgaatt 14103630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24118164 - 24117749
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118164 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24118065  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24118064 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaaggaagaactg 24117965  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24117964 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24117865  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24117864 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24117765  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24117764 tgctcaattttgaatt 24117749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 24587128 - 24587543
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587128 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24587227  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24587228 ttcaactgatcataccgactttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 24587327  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587328 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24587427  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24587428 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctaaggtctataaggagaagaattatga 24587527  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24587528 tgctcaattttgaatt 24587543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 34183726 - 34184142
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggacttt-cttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34183726 gaattctcgaggatggacttttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcctcaatcaa 34183825  T
Q  154 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34183826 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 34183925  T
Q  254 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183926 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 34184025  T
Q  354 ccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34184026 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 34184125  T
Q  454 atgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||||||||||||    
T  34184126 atgctcaattttgaatt 34184142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6575360 - 6574945
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575360 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagctgtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6575261  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6575260 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6575161  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575160 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6575061  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6575060 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 6574961  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  6574960 tgctcaattttgaatt 6574945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 14754259 - 14754674
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14754259 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 14754358  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14754359 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 14754458  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14754459 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14754558  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14754559 cttgtaagtagttaccattttctgtacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14754658  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  14754659 tgctcaattttgaatt 14754674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 40100404 - 40100819
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40100404 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 40100503  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  40100504 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 40100603  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40100604 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 40100703  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40100704 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 40100803  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  40100804 tgctcaattttgaatt 40100819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 54838893 - 54838478
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54838893 gaattctcgaggaaggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 54838794  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54838793 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 54838694  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54838693 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 54838594  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54838593 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatgttcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgtggtctataaggagaagagttatga 54838494  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  54838493 tgctcaattttgaatt 54838478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 18795381 - 18795796
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795381 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18795480  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18795481 ttcaactgatcataccggctttggcaccattccgcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18795580  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795581 cttccattccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18795680  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18795681 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18795780  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18795781 tgctcaattttgaatt 18795796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30759262 - 30758847
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759262 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30759163  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759162 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 30759063  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759062 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30758963  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30758962 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 30758863  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  30758862 tgctcaattttgaatt 30758847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 20333188 - 20333603
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20333188 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20333287  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20333288 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 20333387  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20333388 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatttcatgccagtc 20333487  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20333488 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20333587  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  20333588 tgctcaattttgaatt 20333603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14670515 - 14670100
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670515 gaattctcgaggatggacttttttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccatgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 14670416  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14670415 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaagggagaactg 14670316  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670315 cttccataccatatacaagaaagaaaggggttgccccggttgaaccgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14670216  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14670215 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14670116  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  14670115 tgctcaattttgaatt 14670100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15233318 - 15232903
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15233318 gaattctcgaggatggactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagtcatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 15233219  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15233218 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15233119  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15233118 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 15233019  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15233018 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccgttcatctgaggcctataaggagaagagttatga 15232919  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15232918 tgctcaattttgaatt 15232903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21975203 - 21974788
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975203 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21975104  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21975103 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21975004  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975003 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21974904  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21974903 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 21974804  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  21974803 tgctcaattttgaatt 21974788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5700033 - 5699622
Alignment:
Q  59 tctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattca 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700033 tctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattca 5699934  T
Q  159 actgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccgcttc 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5699933 actggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataattttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttc 5699834  T
Q  259 cataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcctta 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5699833 cataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatccttg 5699734  T
Q  359 taagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgct 458  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5699733 taagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatgct 5699634  T
Q  459 caattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||    
T  5699633 caattttgaatt 5699622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 31121279 - 31121694
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31121279 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31121378  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31121379 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgatgactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31121478  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31121479 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31121578  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31121579 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 31121678  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31121679 tgctcaattttgaatt 31121694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 33668568 - 33668982
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668568 gaattctcgaggatg-actttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33668666  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33668667 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33668766  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668767 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33668866  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668867 cttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 33668966  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  33668967 tgctcaattttgaatt 33668982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1905753 - 1905341
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1905753 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttga---gactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcatcaaccaaa 1905657  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1905656 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggggagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 1905557  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1905556 cttccataccatatgcaagagaaaaaggggttgccccggttgaactacgcactgtagtacggtagctatgcagagcatagggtaacatctcatgtcagtc 1905457  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1905456 cttgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcttcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 1905357  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  1905356 tgctcaattttgaatt 1905341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15277394 - 15277809
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  15277394 gaattctcgaggacggaatttcttgtcaaagacagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 15277493  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15277494 ttcaactgatcataccggctttggtaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15277593  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15277594 cttccataccatatgcaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 15277693  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15277694 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttattggctgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 15277793  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || || || |||||||    
T  15277794 tgttcgatcttgaatt 15277809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15381010 - 15381425
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  15381010 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 15381109  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  15381110 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 15381209  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15381210 cctccataccatatactagagagaagggggtttccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 15381309  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15381310 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttaaga 15381409  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15381410 tgctcaattttgaatt 15381425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 468
Target Start/End: Original strand, 1879978 - 1880303
Alignment:
Q  143 tcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttcca 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |   | || |||||||||||||| || ||||  | |||||| |  || |  | ||| ||||| || ||||| |    
T  1879978 tcctcaatcagattcaactgatcatatctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaacttcta 1880077  T
Q  243 aaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacat 342  Q
      ||||| | ||||||| ||||||| || |  || |||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1880078 cgggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcaccgaagtacggtaaccatatagagcatagggtaacat 1880177  T
Q  343 ctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataagga 442  Q
     ||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1880178 ttcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtctataagga 1880277  T
Q  443 gaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1880278 gaagagttatgatgctcaatcttgaa 1880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 468
Target Start/End: Original strand, 22144437 - 22144773
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| || | ||    |||||| |  || |  |  || |||||    
T  22144437 ccatgcgtttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcaacttccatcaagaccctcaatgacgggat 22144536  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
     || ||||| |  ||||| |  |||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||| || |||     
T  22144537 ttcaacttctaccggaagtattgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacgataaccatacaaagcg 22144636  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  22144637 tagggcaacatctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctgag 22144736  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22144737 gtctataaggagaagagttatgatgctcgatcttgaa 22144773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19769740 - 19769416
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  19769740 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 19769641  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  19769640 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacagagca 19769541  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  19769540 tagggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcgtgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 19769441  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  19769440 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 19769416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 14723667 - 14723991
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  14723667 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 14723766  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  14723767 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 14723866  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||||| |    
T  14723867 tagggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactaccccattcatctgtg 14723966  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  14723967 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 14723991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 33718802 - 33718852
Alignment:
Q  10 ttcatctcccggattccaccatcggaagcagcagcagcatggagcgaattc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33718802 ttcatctcccggattccaccatcggaagcagcagcagcatggagcgaattc 33718852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 55786408 - 55786212
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| |  | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  55786408 tccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtatagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgccaatctt 55786309  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  55786308 tataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgaggtctgtaaggcgaagaattatg 55786212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 4791445 - 4791860
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4791445 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4791544  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4791545 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4791644  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4791645 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4791744  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4791745 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 4791844  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4791845 tgctcaattttgaatt 4791860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 8284279 - 8284695
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8284279 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8284378  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8284379 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8284478  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8284479 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8284578  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8284579 cttataagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 8284678  T
Q  455 tgctc-aattttgaatt 470  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8284679 tgctcaaattttgaatt 8284695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18248191 - 18247776
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248191 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18248092  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18248091 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18247992  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247991 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18247892  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18247891 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18247792  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18247791 tgctcaattttgaatt 18247776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 5591167 - 5591582
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5591167 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5591266  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5591267 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5591366  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5591367 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5591466  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5591467 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5591566  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5591567 tgctcaattttgaatt 5591582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 6537552 - 6537967
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6537552 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6537651  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6537652 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6537751  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6537752 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6537851  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6537852 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 6537951  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  6537952 tgctcaattttgaatt 6537967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10648523 - 10648108
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10648523 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10648424  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10648423 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10648324  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10648323 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 10648224  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10648223 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10648124  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  10648123 tgctcaattttgaatt 10648108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 4341486 - 4341901
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4341486 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4341585  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4341586 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4341685  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4341686 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4341785  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4341786 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4341885  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  4341886 tgctcgattttgaatt 4341901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4629235 - 4628820
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629235 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4629136  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4629135 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4629036  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629035 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4628936  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4628935 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4628836  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4628835 tgctcaattttgaatt 4628820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 5604124 - 5604539
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5604124 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5604223  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5604224 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacgg 5604323  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5604324 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 5604423  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5604424 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5604523  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5604524 tgctcaattttgaatt 5604539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8002010 - 8001595
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002010 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8001911  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8001910 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8001811  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8001810 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8001711  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8001710 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatatttttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 8001611  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  8001610 tgctcaattttgaatt 8001595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10401594 - 10401179
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10401594 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10401495  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10401494 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10401395  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10401394 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 10401295  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10401294 cttgtaagtagttaccattttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 10401195  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  10401194 tgctcaattttgaatt 10401179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18056712 - 18056297
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18056712 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18056613  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18056612 ttcaactgatcataccggctctagcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18056513  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18056512 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18056413  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18056412 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18056313  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || |||||||||||||    
T  18056312 tgttcaattttgaatt 18056297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22865658 - 22866073
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865658 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22865757  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22865758 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22865857  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865858 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22865957  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22865958 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22866057  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22866058 tgctcaattttgaatt 22866073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22880717 - 22881132
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880717 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22880816  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22880817 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22880916  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880917 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22881016  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22881017 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22881116  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22881117 tgctcaattttgaatt 22881132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 28110764 - 28111179
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28110764 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaag 28110863  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28110864 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 28110963  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110964 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28111063  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28111064 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 28111163  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||| |||||||    
T  28111164 tgctcaatcttgaatt 28111179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 29143566 - 29143981
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143566 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29143665  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29143666 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 29143765  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29143766 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgtcagtc 29143865  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29143866 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29143965  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  29143966 tgctcaattttgaatt 29143981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4422365 - 4421950
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422365 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccccgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4422266  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4422265 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 4422166  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422165 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4422066  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4422065 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4421966  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4421965 tgctcaattttgaatt 4421950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4689105 - 4688690
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689105 gaattctcgaggatggaccttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4689006  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4689005 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagtctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4688906  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4688905 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4688806  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4688805 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4688706  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || |||||||||||||    
T  4688705 tgttcaattttgaatt 4688690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5472438 - 5472023
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5472438 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcctccatgcgtttttcctcaatcaaa 5472339  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5472338 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5472239  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472238 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5472139  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472138 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5472039  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5472038 tgctcaattttgaatt 5472023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15735904 - 15736319
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735904 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15736003  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15736004 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 15736103  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15736104 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15736203  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15736204 cttgtaagtggttaccattttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 15736303  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15736304 tgctcaattttgaatt 15736319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18336080 - 18335665
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18336080 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgtcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18335981  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18335980 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18335881  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18335880 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18335781  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18335780 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18335681  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18335680 tgctcaattttgaatt 18335665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19699939 - 19699524
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19699939 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcatccttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 19699840  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19699839 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacctccaaaggaagaactg 19699740  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19699739 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 19699640  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19699639 cttgtaagtgattaccattttctgaacaatcctcttgatattcctgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 19699540  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  19699539 tgctcaattttgaatt 19699524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22382388 - 22382803
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22382388 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22382487  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22382488 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22382587  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22382588 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22382687  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22382688 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 22382787  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22382788 tgctcaattttgaatt 22382803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28026731 - 28026316
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28026731 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 28026632  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28026631 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggatagctttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 28026532  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28026531 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28026432  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28026431 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28026332  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  28026331 tgctcgattttgaatt 28026316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 31031046 - 31031461
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31031046 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31031145  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31031146 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggaaagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31031245  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31031246 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 31031345  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31031346 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 31031445  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31031446 tgctcaattttgaatt 31031461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 35886216 - 35885801
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35886216 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcatttttcctcaatcaaa 35886117  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35886116 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 35886017  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886016 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 35885917  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35885916 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 35885817  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  35885816 tgctcaattttgaatt 35885801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5716524 - 5716108
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttt-cctcaatcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5716524 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttcctcaatcaa 5716425  T
Q  154 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5716424 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 5716325  T
Q  254 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5716324 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 5716225  T
Q  354 ccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5716224 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 5716125  T
Q  454 atgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||||||||||||    
T  5716124 atgctcaattttgaatt 5716108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5727434 - 5727018
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttt-cctcaatcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5727434 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttcctcaatcaa 5727335  T
Q  154 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5727334 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 5727235  T
Q  254 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727234 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 5727135  T
Q  354 ccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5727134 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 5727035  T
Q  454 atgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||||||||||||    
T  5727034 atgctcaattttgaatt 5727018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 5764934 - 5765350
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttt-tcctcaatcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5764934 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttcctcaatcaa 5765033  T
Q  154 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5765034 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 5765133  T
Q  254 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765134 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 5765233  T
Q  354 ccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5765234 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 5765333  T
Q  454 atgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||||||||||||    
T  5765334 atgctcaattttgaatt 5765350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7078656 - 7078241
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078656 gaattcccgaggatgaactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 7078557  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7078556 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 7078457  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078456 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 7078357  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078356 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 7078257  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  7078256 tgctcaattttgaatt 7078241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8217084 - 8216669
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217084 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8216985  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8216984 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8216885  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216884 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacaatagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8216785  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8216784 cttgtaagtggttaccatcttctggataattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagctatga 8216685  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  8216684 tgctcaattttgaatt 8216669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16619300 - 16619715
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16619300 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 16619399  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16619400 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16619499  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16619500 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 16619599  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16619600 tttgtaggtagttaccatcttctgaacaatcttctggatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagatatga 16619699  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16619700 tgctcaattttgaatt 16619715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 17979759 - 17980174
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17979759 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaag 17979858  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17979859 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17979958  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979959 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17980058  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17980059 tttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 17980158  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  17980159 tgctcaattttgaatt 17980174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18230642 - 18230231
Alignment:
Q  59 tctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18230642 tctcgaggatggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattca 18230543  T
Q  159 actgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccgcttc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18230542 actgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttc 18230443  T
Q  259 cataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcctta 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18230442 cataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttg 18230343  T
Q  359 taagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgct 458  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18230342 taagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatgct 18230243  T
Q  459 caattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||    
T  18230242 caattttgaatt 18230231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 18302464 - 18302879
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302464 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18302563  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18302564 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18302663  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302664 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18302763  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18302764 cttgtaagtagttaccattttctgtacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18302863  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18302864 tgctcaattttgaatt 18302879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48471377 - 48470962
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471377 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 48471278  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48471277 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 48471178  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471177 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 48471078  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48471077 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 48470978  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  48470977 tgctcaattttgaatt 48470962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 51787473 - 51787058
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787473 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 51787374  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51787373 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 51787274  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787273 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 51787174  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787173 cttgtaagtggttaccatcttctggacgatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 51787074  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  51787073 tgctcaattttgaatt 51787058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5657587 - 5657169
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5657587 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccacacgtttttcctcaatcaaa 5657488  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccact---tccaaaggaagaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5657487 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccttgatcacacggagagatgggatctccactacttccaaaggaagaa 5657388  T
Q  252 ccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgcca 351  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657387 ctgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacgatagccatgcagagcatagggtaacatctcatgcca 5657288  T
Q  352 gtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtta 451  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657287 gtccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtta 5657188  T
Q  452 tgatgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  5657187 tgatgcttaattttgaatt 5657169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4727080 - 4726665
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727080 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactatccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4726981  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4726980 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaagggagaactg 4726881  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4726880 cttccataccatatacaagagaggaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 4726781  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4726780 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatacggagaagagttatga 4726681  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||| |||||||    
T  4726680 tgctcaatcttgaatt 4726665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6207354 - 6206939
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207354 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6207255  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6207254 ttcaactgatcataccggctttgacaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6207155  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207154 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6207055  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6207054 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagaattatga 6206955  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  6206954 tgctcaattttgaatt 6206939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 11105169 - 11105584
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11105169 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11105268  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11105269 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11105368  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11105369 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacgatagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 11105468  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11105469 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11105568  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11105569 tgctcaattttgaatt 11105584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 15887515 - 15887930
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15887515 gaattctcgaggatggaccttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatctatacgtttttcctcaatcaaa 15887614  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15887615 ttcaactgatcataccggctttgacaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15887714  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15887715 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcgctgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15887814  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15887815 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaagtgcaccattcatctgaggtctacagggagaagagttatga 15887914  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  15887915 tgctcaattttgaatt 15887930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 17971671 - 17972086
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971671 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtctccattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 17971770  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17971771 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17971870  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971871 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17971970  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971971 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 17972070  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17972071 tgctcgattttgaatt 17972086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 18287163 - 18287578
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287163 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18287262  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18287263 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18287362  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287363 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18287462  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18287463 cttgtaagtagttaccattttctgtacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcagctgaggtctatagggagaagagttatga 18287562  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  18287563 tgctcaattttgaatt 18287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 31959265 - 31959680
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31959265 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 31959364  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31959365 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctccgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 31959464  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959465 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31959564  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959565 cttgtaagtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 31959664  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31959665 tgctcaattttgaatt 31959680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5019164 - 5018749
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019164 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5019065  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5019064 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5018965  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5018964 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 5018865  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5018864 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5018765  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5018764 tgctcaattttgaatt 5018749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21680153 - 21679738
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680153 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21680054  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21680053 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataacgttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21679954  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21679953 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 21679854  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21679853 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 21679754  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  21679753 tgctcaattttgaatt 21679738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24333613 - 24333198
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24333613 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24333514  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24333513 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24333414  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24333413 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 24333314  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || || || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24333313 cttgtaggtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcgactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24333214  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24333213 tgctcaattttgaatt 24333198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 29659780 - 29660195
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659780 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29659879  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29659880 ttcaactgatcatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29659979  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659980 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29660079  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29660080 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29660179  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  29660180 tgctcaattttgaatt 29660195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32296078 - 32295663
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32296078 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 32295979  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32295978 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctccgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 32295879  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32295878 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32295779  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32295778 cttgtaagtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcgactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 32295679  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  32295678 tgctcaattttgaatt 32295663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32444601 - 32444186
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32444601 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 32444502  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32444501 ttcaactgatcataccgggtttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32444402  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32444401 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtggtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32444302  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32444301 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 32444202  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  32444201 tgctcaattttgaatt 32444186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 47028903 - 47028488
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47028903 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagccttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 47028804  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47028803 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 47028704  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47028703 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 47028604  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47028603 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 47028504  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  47028503 tgctcaattttgaatt 47028488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28344626 - 28344212
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28344626 gaattctcgaggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28344527  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28344526 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgg-atctccacttccaaaggaagaactg 28344428  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28344427 cttccataccatatacaagagagaaaggggtagccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28344328  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28344327 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaggagttatga 28344228  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28344227 tgctcaattttgaatt 28344212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16421635 - 16421220
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |    
T  16421635 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgcttttcctccaccaga 16421536  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16421535 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagataggatctccacttccaaaggaagaactg 16421436  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16421435 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtggtgcggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 16421336  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16421335 cttgtaagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16421236  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16421235 tgctcaattttgaatt 16421220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20071490 - 20071075
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071490 gaattctcgaggatgggctttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20071391  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20071390 ttcaactgatcataccggttttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 20071291  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20071290 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccgtgcagagcatagggtaacatctcatgctagtc 20071191  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20071190 cttgtaagtggttaccatcttccggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20071091  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  20071090 tgctcaattttgaatt 20071075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 20571653 - 20572068
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571653 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20571752  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  20571753 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgagatctccacttccaaaggaagaactg 20571852  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571853 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgtgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 20571952  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20571953 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20572052  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  20572053 tgctcaattttgaatt 20572068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 468
Target Start/End: Original strand, 6961344 - 6961680
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| || | ||  | |||||| |  || |  |  || |||||    
T  6961344 ccatgcgtttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcagcttccatcaagaccctcaatgacgggat 6961443  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
     || ||||| |  ||||| | ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| | || |||| |||||| ||||||| || |||     
T  6961444 ttcaacttctaccggaagtatcgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgtactgaagtacgataaccatacaaagcg 6961543  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  6961544 tagggtaacatctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctgag 6961643  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6961644 gtctataaggagaagagttatgatgctcgatcttgaa 6961680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4452116 - 4451788
Alignment:
Q  140 ttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccactt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   | || |||||||||||||| || ||||  | |||||| |  || |  | ||| ||||| || ||||    
T  4452116 ttttcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaactt 4452017  T
Q  240 ccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaa 339  Q
    | |  || || |  |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  4452016 ctacggggagtattgcttccataccatacaccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcataaggtaa 4451917  T
Q  340 catctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataa 439  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||    
T  4451916 catctcatgtcagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtctataa 4451817  T
Q  440 ggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4451816 ggagaagaattatgatgctcaatcttgaa 4451788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22961802 - 22961478
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  22961802 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 22961703  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  22961702 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 22961603  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  22961602 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 22961503  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  22961502 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 22961478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16433753 - 16433430
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  16433753 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 16433654  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  16433653 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccataca-agcg 16433555  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  16433554 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 16433455  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  16433454 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 16433430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 7086955 - 7087279
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  7086955 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 7087054  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| || |||| || |||     
T  7087055 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcg 7087154  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  7087155 tagggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 7087254  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  7087255 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 7087279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 11923269 - 11923593
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  11923269 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 11923368  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || |  || || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  11923369 ctcaacctctaccggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 11923468  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  11923469 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgctcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 11923568  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  11923569 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 11923593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 6573703 - 6573379
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| || || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  6573703 ccatgcgtttctcctcaatcaaattcaactggtcgtacctactctggcaccattctgcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 6573604  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||||||||| |  || || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| || |||| || ||||    
T  6573603 ctccacttctactggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagca 6573504  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  6573503 taaggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 6573404  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    | || || |||||||| || |||||    
T  6573403 gcctgtagggagaagaattgtgatg 6573379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15706697 - 15706510
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15706697 tccataccatataccaaggagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgtagggtaacatttcatgccagtcct 15706598  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggaga 444  Q
    | ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  15706597 tgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtggcctgtaaggaga 15706510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20445341 - 20445145
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  20445341 tccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgccaatctt 20445242  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20445241 tataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcaacagcaccattcatctgaggtctgtaaggcgaagaattatg 20445145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 37258732 - 37258956
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  37258732 aggaagtactgcctccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 37258831  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37258832 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgtttgcagcttcgacagcaccattcatttgaggtctataaggtg 37258931  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  37258932 aagagttatggtgctcgatcttgaa 37258956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 468
Target Start/End: Original strand, 15582132 - 15582355
Alignment:
Q  245 ggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatct 344  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | || ||    
T  15582132 ggaagtaccgcctccatgccgtataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtaccgaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcacct 15582231  T
Q  345 catgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggaga 444  Q
    ||||||| |||||||||||    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  15582232 catgccaatccttataagttaccaccattttctggacaatcttctttatgtttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgcggtctgtacggcga 15582331  T
Q  445 agagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  15582332 agagttatggtgctcgattttgaa 15582355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 46382558 - 46382347
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | ||| |||||||| || |    
T  46382558 tccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctt 46382459  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||||||    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  46382458 tataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttcgcagcttcgacagcaccattcatttgaggtctgtaaggtgaagagttatggtg 46382359  T
Q  457 ctcaattttgaa 468  Q
    ||| || |||||    
T  46382358 ctcgatcttgaa 46382347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 5948825 - 5949049
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||| |||| |  | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  5948825 aggaagtactgcctccatgccatacaccagggagaagggagttgcccctgttgaagtgcgtatagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 5948924  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  5948925 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccattcatttggggtctgtaaggtg 5949024  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  5949025 aagagttatggtgctcgatcttgaa 5949049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15706822 - 15706768
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||||||    
T  15706822 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctactctgacaccattc 15706768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15920725 - 15920580
Alignment:
Q  245 ggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatct 344  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | || ||    
T  15920725 ggaagtaccgcctccatgccgtataccaaagagaaatgggttgcccctgttgatgtgcgtaccgaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcacct 15920626  T
Q  345 catgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttctt 390  Q
    ||||||| |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||    
T  15920625 catgccaatccttataagttactaccattttctggacaatcttctt 15920580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4204875 - 4204460
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4204875 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4204776  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4204775 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 4204676  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4204675 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4204576  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4204575 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4204476  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4204475 tgctcaattttgaatt 4204460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16444658 - 16445073
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16444658 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatctatacgtttttcctcaaccaaa 16444757  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16444758 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataacttggcttccatgatcacacggagagatgggatctccactgccaaaggaagaactg 16444857  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16444858 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagtatagggtaacatctcatgccagtc 16444957  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16444958 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16445057  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16445058 tgctcaattttgaatt 16445073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26440743 - 26440328
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440743 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26440644  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26440643 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttctaaaggaagaactg 26440544  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440543 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26440444  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440443 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26440344  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26440343 tgctcaattttgaatt 26440328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 45736793 - 45736378
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45736793 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 45736694  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45736693 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 45736594  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45736593 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 45736494  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45736493 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 45736394  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  45736393 tgctcaattttgaatt 45736378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2160060 - 2159645
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160060 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2159961  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2159960 ttcaactgatcctaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2159861  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2159860 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2159761  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2159760 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 2159661  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || |||||||||||||    
T  2159660 tgttcaattttgaatt 2159645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16733178 - 16733593
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16733178 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16733277  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16733278 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16733377  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16733378 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16733477  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16733478 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 16733577  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16733578 tgctcaattttgaatt 16733593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16746169 - 16746584
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746169 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16746268  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16746269 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16746368  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746369 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16746468  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746469 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 16746568  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16746569 tgctcaattttgaatt 16746584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 31559042 - 31559457
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31559042 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31559141  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31559142 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31559241  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31559242 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31559341  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31559342 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 31559441  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31559442 tgctcaattttgaatt 31559457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 5141992 - 5142407
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141992 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5142091  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5142092 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5142191  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5142192 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5142291  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5142292 cttgtaagtggctaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5142391  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5142392 tgctcaattttgaatt 5142407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5163869 - 5163454
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5163869 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccacggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5163770  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5163769 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5163670  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5163669 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5163570  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5163569 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggtggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5163470  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5163469 tgctcaattttgaatt 5163454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16513082 - 16513497
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16513082 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatcgatacgtttttcctcaatcaaa 16513181  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16513182 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16513281  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16513282 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccctggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16513381  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16513382 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16513481  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16513482 tgctcaattttgaatt 16513497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26532525 - 26532940
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532525 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26532624  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26532625 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccacttccaaaggaagaactg 26532724  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532725 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26532824  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26532825 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26532924  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26532925 tgctcaattttgaatt 26532940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 39207791 - 39208206
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207791 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39207890  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39207891 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 39207990  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39207991 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacctctcatgccagtc 39208090  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39208091 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 39208190  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  39208191 tgctcaattttgaatt 39208206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 45392706 - 45392291
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45392706 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 45392607  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  45392606 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 45392507  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45392506 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 45392407  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45392406 cttgtaagtggtcaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 45392307  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  45392306 tgctcaattttgaatt 45392291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 2104815 - 2105230
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2104815 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2104914  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2104915 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2105014  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2105015 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccagttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2105114  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2105115 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 2105214  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  2105215 tgctcgattttgaatt 2105230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2778740 - 2778325
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2778740 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2778641  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2778640 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2778541  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2778540 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2778441  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2778440 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 2778341  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  2778340 tgctcaattttgaatt 2778325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 10911521 - 10911936
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10911521 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcgtccatacgtttttcctcaatcaaa 10911620  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10911621 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10911720  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911721 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 10911820  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911821 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10911920  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  10911921 tgctcaattttgaatt 10911936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 11419431 - 11419846
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419431 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11419530  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11419531 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11419630  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419631 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgctgagcatagggtaacatctcatgccagtc 11419730  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11419731 cttgtaagtggttaccatcttctgaacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11419830  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11419831 tgctcaattttgaatt 11419846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 24587186 - 24587601
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587186 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24587285  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24587286 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaagggagaactg 24587385  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24587386 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 24587485  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587486 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24587585  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  24587586 tgctcaattttgaatt 24587601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11446373 - 11445958
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446373 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11446274  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11446273 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcatataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 11446174  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446173 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11446074  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11446073 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagaattatga 11445974  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11445973 tgctcaattttgaatt 11445958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26510348 - 26510763
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26510348 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26510447  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26510448 ttcaaccgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26510547  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26510548 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26510647  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26510648 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26510747  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26510748 tgctcaattttgaatt 26510763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31129393 - 31128978
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129393 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccgtggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31129294  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31129293 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31129194  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129193 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31129094  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31129093 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31128994  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31128993 tgctcaattttgaatt 31128978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 4139898 - 4140313
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139898 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4139997  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4139998 ttcaactgatcatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctctacttccaaaggaagaactg 4140097  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4140098 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4140197  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4140198 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4140297  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4140298 tgctcaattttgaatt 4140313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26269738 - 26270153
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26269738 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcctcaatcaaa 26269837  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269838 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 26269937  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269938 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26270037  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26270038 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26270137  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26270138 tgctcaattttgaatt 26270153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26518278 - 26517863
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518278 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaagacagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26518179  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26518178 ttcaactgatcataccggctttggcaacattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26518079  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518078 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26517979  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26517978 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26517879  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26517878 tgctcaattttgaatt 26517863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 470
Target Start/End: Original strand, 31085280 - 31085689
Alignment:
Q  61 tcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaac 160  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31085280 tcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaac 31085379  T
Q  161 tgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccgcttcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31085380 tgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactgcttcca 31085479  T
Q  261 taccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttata 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31085480 taccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttgta 31085579  T
Q  361 agtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgctca 460  Q
    ||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31085580 agtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatgctca 31085679  T
Q  461 attttgaatt 470  Q
    || |||||||    
T  31085680 atcttgaatt 31085689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5153570 - 5153155
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5153570 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 5153471  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  5153470 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagagctg 5153371  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5153370 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 5153271  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5153270 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5153171  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5153170 tgctcaattttgaatt 5153155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26679758 - 26680173
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679758 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26679857  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26679858 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26679957  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679958 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26680057  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26680058 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaaccgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 26680157  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26680158 tgctcaattttgaatt 26680173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26314500 - 26314915
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26314500 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 26314599  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26314600 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26314699  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314700 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26314799  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26314800 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26314899  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26314900 tgctcaattttgaatt 26314915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 26664566 - 26664981
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664566 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26664665  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26664666 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26664765  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26664766 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtt 26664865  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26664866 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaaccgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 26664965  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26664966 tgctcaattttgaatt 26664981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3450792 - 3450377
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3450792 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatacgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 3450693  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3450692 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcttcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 3450593  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3450592 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 3450493  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3450492 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 3450393  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  3450392 tgctcaattttgaatt 3450377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16046800 - 16046389
Alignment:
Q  56 aattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16046800 aattctcgaggatggactttcttgccaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaat 16046701  T
Q  156 tcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccgc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16046700 tcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgc 16046601  T
Q  256 ttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcc 355  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  16046600 ttccatacgatatacaagagaaaaaggggctgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagcgtagggcaacatctcatgccaatct 16046501  T
Q  356 ttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgat 455  Q
    || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16046500 ttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgat 16046401  T
Q  456 gctcaattttga 467  Q
    ||||||||||||    
T  16046400 gctcaattttga 16046389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10847106 - 10846691
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  10847106 gaattctcaaggacgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 10847007  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10847006 ttcaactgatcataccgactttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacta 10846907  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10846906 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaattgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 10846807  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10846806 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttcttggctgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 10846707  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || || || |||||||    
T  10846706 tgttcgatcttgaatt 10846691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 468
Target Start/End: Original strand, 1891339 - 1891664
Alignment:
Q  143 tcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttcca 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||  ||||||||||||| || ||||  | |||||| |  || |  | ||| ||||| || ||||| |    
T  1891339 tcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgataccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaacttcta 1891438  T
Q  243 aaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacat 342  Q
     |||||| | ||||||| ||||||| || |  || |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1891439 caggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcatagggtaacat 1891538  T
Q  343 ctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataagga 442  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1891539 ctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtctataagga 1891638  T
Q  443 gaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1891639 gaagagttatgatgctcaatcttgaa 1891664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29091901 - 29091577
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  29091901 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcatacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 29091802  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  29091801 ctcaacctctataggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 29091702  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  29091701 tagggtaacatttcatgtcagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgag 29091602  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  29091601 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 29091577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15195468 - 15195144
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  15195468 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 15195369  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  15195368 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 15195269  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  15195268 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 15195169  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  15195168 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 15195144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2558920 - 2558596
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  2558920 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 2558821  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || |  || || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  2558820 ctcaacctctaccggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 2558721  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  2558720 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 2558621  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  2558620 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 2558596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16239801 - 16239477
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  16239801 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacttgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 16239702  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| || |||| || |||     
T  16239701 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcg 16239602  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| ||||||||||| |    
T  16239601 taaggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgtagcttcaactgccccattcatctgtg 16239502  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  16239501 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 16239477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 363
Target Start/End: Original strand, 16125595 - 16125826
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  16125595 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 16125694  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  16125695 ctcaacctctacaggtagtacagcctccaaaccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 16125794  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagt 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16125795 tagggtaacatttcatgccagtccttataagt 16125826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9471589 - 9471365
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  9471589 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 9471490  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  9471489 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccattcatttggggtctgtaaggtg 9471390  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  9471389 aagagttatggtgctcgatcttgaa 9471365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Original strand, 16285257 - 16285453
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  16285257 tccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgccaatctt 16285356  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16285357 tataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgaggtctgtaaggcgaagaattatg 16285453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 16391299 - 16391523
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  16391299 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 16391398  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  16391399 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccattcatttggggtctgtaaggtg 16391498  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  16391499 aagagttatggtgctcgatcttgaa 16391523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Original strand, 796401 - 796597
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| |  | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  796401 tccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtatagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgccaatctt 796500  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  796501 tataagtcaccaccatcttctggatgattttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgaggtctgtaaggcgaagaattatg 796597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 30367811 - 30368035
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  30367811 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 30367910  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  30367911 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccattcatttggggtctgtaaggtg 30368010  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  30368011 aagagttatggtgctcgatcttgaa 30368035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Original strand, 13482958 - 13483018
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctc 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  13482958 ccatgcgtttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctc 13483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 456
Target Start/End: Original strand, 16125826 - 16125895
Alignment:
Q  387 tcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16125826 tcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgaggtctgtaaggagaagaattgtgatg 16125895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20843401 - 20842986
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843401 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20843302  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20843301 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccctgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 20843202  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843201 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 20843102  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20843101 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20843002  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  20843001 tgctcaattttgaatt 20842986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32055291 - 32054876
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055291 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 32055192  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32055191 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32055092  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055091 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32054992  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32054991 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 32054892  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  32054891 tgctcaattttgaatt 32054876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37383165 - 37382750
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383165 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37383066  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  37383065 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataaccttgcttccatgatcacacagagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 37382966  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37382965 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 37382866  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37382865 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37382766  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37382765 tgctcaattttgaatt 37382750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 37680651 - 37681066
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680651 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37680750  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37680751 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37680850  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680851 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37680950  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37680951 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 37681050  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37681051 tgctcaattttgaatt 37681066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 37695916 - 37696331
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695916 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37696015  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37696016 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37696115  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37696116 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37696215  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37696216 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 37696315  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37696316 tgctcaattttgaatt 37696331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12592296 - 12591881
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592296 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 12592197  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12592196 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccacttccaaaggaagaactg 12592097  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592096 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12591997  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591996 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 12591897  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||| |||||||    
T  12591896 tgctcaatcttgaatt 12591881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 23123325 - 23123740
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123325 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 23123424  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123425 ttcaactgatcataccgactctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 23123524  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123525 cttccataccatatacaagagagaagggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 23123624  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123625 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 23123724  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  23123725 tgctcaattttgaatt 23123740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 27429197 - 27429612
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27429197 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27429296  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27429297 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27429396  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27429397 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27429496  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27429497 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagatttatga 27429596  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27429597 tgctcaattttgaatt 27429612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 31888247 - 31888662
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31888247 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31888346  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31888347 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31888446  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31888447 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31888546  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31888547 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31888646  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  31888647 tgctcaattttgaatt 31888662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 34269676 - 34270091
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269676 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34269775  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34269776 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34269875  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269876 cttccataccatatacaagagagaaaggggtttccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34269975  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34269976 cttgtaagtggttaccatcttctgaacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctacagggagaagagttatga 34270075  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  34270076 tgctcaattttgaatt 34270091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 21697926 - 21698341
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697926 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 21698025  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21698026 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaaggactg 21698125  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21698126 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatggagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 21698225  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21698226 cttgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 21698325  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  21698326 tgctcaattttgaatt 21698341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27821479 - 27821064
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821479 gaattctcggggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27821380  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27821379 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27821280  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821279 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27821180  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27821179 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27821080  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27821079 tgctcaattttgaatt 27821064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37930857 - 37930442
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37930857 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37930758  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37930757 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37930658  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37930657 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37930558  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37930557 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 37930458  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  37930457 tgctcaattttgaatt 37930442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27781722 - 27781307
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781722 gaattctcggggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27781623  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27781622 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27781523  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781522 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27781423  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27781422 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcngcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27781323  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27781322 tgctcaattttgaatt 27781307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 255409 - 255824
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  255409 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 255508  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  255509 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 255608  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  255609 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 255708  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  255709 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatttgaggtctatagggagaagagttatga 255808  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  255809 tgctcaattttgaatt 255824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12661025 - 12660610
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12661025 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 12660926  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12660925 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 12660826  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12660825 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccgtgcagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 12660726  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12660725 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagaattatga 12660626  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  12660625 tgctcaattttgaatt 12660610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16166968 - 16166553
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16166968 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16166869  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16166868 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16166769  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16166768 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 16166669  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16166668 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16166569  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16166568 tgctcaattttgaatt 16166553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 19411257 - 19411672
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19411257 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19411356  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19411357 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19411456  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19411457 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 19411556  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19411557 cttgtaggtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19411656  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  19411657 tgctcaattttgaatt 19411672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27122012 - 27121597
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122012 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27121913  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27121912 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27121813  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27121812 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgctccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27121713  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27121712 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27121613  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  27121612 tgctcgattttgaatt 27121597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28887767 - 28887352
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28887767 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28887668  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28887667 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataacttagcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 28887568  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28887567 cttccgtaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28887468  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28887467 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 28887368  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  28887367 tgctcaattttgaatt 28887352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 37946618 - 37947033
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37946618 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcgatcaaa 37946717  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37946718 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37946817  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946818 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37946917  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946918 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37947017  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    |||||||| |||||||    
T  37947018 tgctcaatcttgaatt 37947033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 39046575 - 39046990
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046575 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39046674  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39046675 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 39046774  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046775 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 39046874  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046875 cttgtaggtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 39046974  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  39046975 tgctcaattttgaatt 39046990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39895557 - 39895142
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39895557 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39895458  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  39895457 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccgaaggaagaactg 39895358  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39895357 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtggtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 39895258  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39895257 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 39895158  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  39895157 tgctcaattttgaatt 39895142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 11629940 - 11630355
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629940 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcatttttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11630039  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11630040 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11630139  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11630140 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11630239  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11630240 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11630339  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11630340 tgctcaattttgaatt 11630355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 12711357 - 12711772
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711357 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 12711456  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711457 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 12711556  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711557 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12711656  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12711657 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 12711756  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  12711757 tgctcaattttgaatt 12711772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27809191 - 27808776
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809191 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27809092  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27809091 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 27808992  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27808991 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27808892  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27808891 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27808792  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  27808791 tgctcaattttgaatt 27808776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34160332 - 34159917
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160332 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34160233  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34160232 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34160133  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34160132 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 34160033  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34160032 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 34159933  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  34159932 tgctcaattttgaatt 34159917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31881774 - 31881361
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31881774 gaatcctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31881675  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31881674 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31881575  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31881574 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31881475  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31881474 cttgtaagtggttaccattttctggataattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaggagttatga 31881375  T
Q  455 tgctcaattttgaa 468  Q
    ||||||||||||||    
T  31881374 tgctcaattttgaa 31881361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3787981 - 3787566
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3787981 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 3787882  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3787881 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctccgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 3787782  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3787781 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcacacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 3787682  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3787681 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 3787582  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  3787581 tgctcaattttgaatt 3787566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 21671931 - 21672346
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671931 gaatcctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21672030  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21672031 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21672130  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21672131 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21672230  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21672231 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgg 21672330  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  21672331 tgctcaattttgaatt 21672346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 22922904 - 22923319
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922904 gaatcctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22923003  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22923004 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22923103  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22923104 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22923203  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22923204 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 22923303  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  22923304 tgctcaattttgaatt 22923319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34296642 - 34296227
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34296642 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34296543  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34296542 ttcaactgatcatgccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34296443  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34296442 cttccacaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 34296343  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34296342 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34296243  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  34296242 tgctcaattttgaatt 34296227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34867172 - 34866757
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867172 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagccttcatccttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34867073  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867072 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaaccg 34866973  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34866972 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34866873  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34866872 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34866773  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  34866772 tgctcaattttgaatt 34866757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 9344742 - 9345157
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344742 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 9344841  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9344842 ttcaactgattatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 9344941  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344942 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9345041  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9345042 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 9345141  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  9345142 tgctcaattttgaatt 9345157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 13931303 - 13931718
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13931303 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattctcgcctgatatgaatgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcctcaatcaaa 13931402  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13931403 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacctccaaaggaagaactg 13931502  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13931503 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13931602  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13931603 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13931702  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13931703 tgctcaattttgaatt 13931718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 16824094 - 16824509
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16824094 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16824193  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16824194 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16824293  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16824294 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16824393  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16824394 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 16824493  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16824494 tgctcaattttgaatt 16824509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16897386 - 16896971
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897386 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16897287  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16897286 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16897187  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897186 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16897087  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16897086 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgg 16896987  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  16896986 tgctcaattttgaatt 16896971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 40238996 - 40238581
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40238996 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 40238897  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40238896 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 40238797  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40238796 cttccacaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 40238697  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40238696 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 40238597  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  40238596 tgctcaattttgaatt 40238581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 19451179 - 19451594
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  19451179 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 19451278  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19451279 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19451378  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19451379 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactatagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 19451478  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19451479 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttattggttgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 19451578  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    || || || |||||||    
T  19451579 tgttcgatcttgaatt 19451594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 468
Target Start/End: Original strand, 26722144 - 26722469
Alignment:
Q  143 tcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttcca 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   | || |||||||||||||| || ||||  | |||||| |  || |  | ||| ||||| || ||||| |    
T  26722144 tcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaacttcta 26722243  T
Q  243 aaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacat 342  Q
     |||||| | ||||||| ||||||| || |  || |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26722244 caggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcatagggtaacat 26722343  T
Q  343 ctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataagga 442  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26722344 ctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtctataagga 26722443  T
Q  443 gaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  26722444 gaagagttatgatgctcaatcttgaa 26722469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 468
Target Start/End: Original strand, 34532446 - 34532636
Alignment:
Q  278 aaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttct 377  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    ||||||||||    
T  34532446 aaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatatagagcatagggtaacatttcgtgccagtccttataggtgaccaccatcttct 34532545  T
Q  378 gaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34532546 gcacaatcttcttgatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtctataaggagaagagttatgatgctcaatcttgaa 34532636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34703463 - 34703139
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  34703463 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 34703364  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  34703363 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 34703264  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  34703263 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgag 34703164  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  34703163 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 34703139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 42395922 - 42395598
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| | || || || |  | |||||| |  || |  | ||| |||||    
T  42395922 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcaacttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaagggat 42395823  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| ||||||| |||     
T  42395822 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatgcaaagcg 42395723  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  42395722 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 42395623  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  42395622 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 42395598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Original strand, 21758597 - 21758793
Alignment:
Q  257 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 356  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  21758597 tccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgccaatctt 21758696  T
Q  357 tataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 453  Q
    |||||||    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21758697 tataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgaggtctgtaaggcgaagaattatg 21758793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12385935 - 12385711
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| |  | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  12385935 aggaagtactgcctccgtaccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtatagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 12385836  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  12385835 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccattcatttggggtctgtaaggtg 12385736  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  12385735 aagagttatggtgctcgatcttgaa 12385711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22951668 - 22951444
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  22951668 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggagttgcacctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 22951569  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || || || ||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22951568 tcatgccaatctttataagttaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacgacaccattcatttgaggtctgtaaggtg 22951469  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    || ||||||| ||||| || |||||    
T  22951468 aatagttatggtgctcgatcttgaa 22951444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 5373 - 5788
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5373 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5472  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5473 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5572  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5573 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5672  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5673 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5772  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5773 tgctcaattttgaatt 5788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 732
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1147 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 1048  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1047 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 948  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  947 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 848  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  847 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 748  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  747 tgctcaattttgaatt 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11534 - 11119
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11534 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 11435  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11434 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcaacctcggataactttgcctccatgatcacacggagagatggaatctccacttccaaaggaagaactg 11335  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11334 cttccataccatatacaagagagaaagggattgccccggttgaactacgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 11235  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  11234 cttgtaggtagttaccattttctggacaatcctcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccattcatctaaggcctataaggagaaaagttatga 11135  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11134 tgctcaattttgaatt 11119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13023
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13438 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13339  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13338 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 13239  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13238 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13139  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13138 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13039  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13038 tgctcaattttgaatt 13023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15060 - 14645
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15060 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttctcaatcaaa 14961  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14960 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 14861  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14860 cttccataccatatacaagagagaaaggggtcgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14761  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14760 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14661  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  14660 tgctcaattttgaatt 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 25666 - 26081
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25666 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 25765  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25766 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 25865  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25866 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtatcatctcatgccagtc 25965  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25966 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26065  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  26066 tgctcaattttgaatt 26081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5556 - 5141
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5556 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5457  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5456 ttctactgatcataccggctttggcaccattcagccttggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5357  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5356 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcacacggtagtacggtagccatgcaaagcatagggtaacatctcatgccagtc 5257  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5256 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5157  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  5156 tgctcaattttgaatt 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 10357 - 10772
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10456  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10457 ttcaactgatcataccggctttggcaccactcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 10556  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10557 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 10656  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10657 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 10756  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  10757 tgctcaattttgaatt 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11513 - 11098
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11513 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11414  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11413 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11314  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11313 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11214  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11213 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11114  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11113 tgctcaattttgaatt 11098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 3946 - 4361
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3946 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 4045  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4046 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 4145  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4146 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4245  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4246 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4345  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  4346 tgctcaattttgaatt 4361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 13562 - 13977
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13562 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 13661  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13662 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13761  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13861  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13862 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13961  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  13962 tgctcaattttgaatt 13977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32782 - 32367
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32782 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 32683  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32682 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagccttggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32583  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32582 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32483  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32482 cttgtaagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 32383  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  32382 tgctcaattttgaatt 32367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9449 - 9034
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9449 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 9350  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9349 ttcaactgatcataccggctttggcaccactcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 9250  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9249 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 9150  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9149 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 9050  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  9049 tgctcaattttgaatt 9034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Original strand, 20958 - 21373
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20958 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21057  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21058 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttctatgatcacacagagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21157  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21158 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21257  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21258 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 21357  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||| ||||||||||    
T  21358 tgctcgattttgaatt 21373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11525 - 11110
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11525 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcctgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11426  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11425 ttcaactgatcatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctctacttccaaaggaagaactg 11326  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11226  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11225 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11126  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||||||    
T  11125 tgctcaattttgaatt 11110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 470
Target Start/End: Original strand, 9699 - 10110
Alignment:
Q  59 tctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattca 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9699 tctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattca 9798  T
Q  159 actgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccgcttc 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9799 actggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataattttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttc 9898  T
Q  259 cataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcctta 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9899 cataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatccttg 9998  T
Q  359 taagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatgct 458  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9999 taagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatgct 10098  T
Q  459 caattttgaatt 470  Q
    ||||||||||||    
T  10099 caattttgaatt 10110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 55 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24605 - 24190
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 154  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24605 gaattcccgaggacagactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 24506  T
Q  155 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 254  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||      
T  24505 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcttcggataacttcgcttccatcattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactt 24406  T
Q  255 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24405 cttccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaatcatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 24306  T
Q  355 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24305 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttatga 24206  T
Q  455 tgctcaattttgaatt 470  Q
    | ||||||||||||||    
T  24205 tactcaattttgaatt 24190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 55 - 465
Target Start/End: Original strand, 41462 - 41889
Alignment:
Q  55 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaa-ggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggc-atccat-acgtttttcct-caat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  41462 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggccatccattacgtttttccttcaat 41561  T
Q  151 caaa-ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataacttt-gattccatgatcacacggag-agatggg-atctccacttccaaa-g 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  41562 caaaattcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataacttttgcttccatgatcacacggagtagatggggatctccacttccaaaag 41661  T
Q  246 gaagaacc--gcttccataccatatacaagagag-aaaggggttgcccc-ggttgaactgcg-cactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaac 340  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41662 gaagaaacctgcttccataccatatacaagagaggaaaggggttgcccccggttgaactgcgacacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaac 41761  T
Q  341 atctcatgccagtccttataa-gtagtaaccatcttctgaacaatct-tcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctata 438  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41762 atctcatgccagtccttgtaacgtggttaccatcttctggacaatttctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctata 41861  T
Q  439 -aggagaagagttatgatgctcaatttt 465  Q
      ||||||||||||||||||||||||||    
T  41862 ggggagaagagttatgatgctcaatttt 41889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 468
Target Start/End: Original strand, 16268 - 16598
Alignment:
Q  138 gtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccac 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| || | ||  | |||||| |  || |  |  || ||||| || ||    
T  16268 gtttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcagcttccatcaagaccctcaatgacgggatttcaac 16367  T
Q  238 ttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggt 337  Q
    ||| |  ||||| | ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||| | || |||| |||||| ||||||| || ||| |||||     
T  16368 ttctaccggaagtatcgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgtccctgttgaagtacgtactgaagtacgataaccatacaaagcgtagggc 16467  T
Q  338 aacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctat 437  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||||||||||||||    
T  16468 aacatctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttagaccgcaccattcatctgaggtctat 16567  T
Q  438 aaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16568 aaggagaagagttatgatgctcaatcttgaa 16598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12606 - 12282
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  12606 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 12507  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| |  || | ||| || ||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  |||||||| |||| || |||     
T  12506 ctcaatctctacaggtagtacaacctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcg 12407  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  12406 tagggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 12307  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  12306 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 12282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 456
Target Start/End: Original strand, 87105 - 87429
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| || || || |  | |||||| |  || |  | ||| || ||    
T  87105 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccactcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaat 87204  T
Q  232 ctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagca 331  Q
    ||| || || | ||| || || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| || |||| || |||     
T  87205 ctcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcg 87304  T
Q  332 tagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgag 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  87305 tagggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtg 87404  T
Q  432 gtctataaggagaagagttatgatg 456  Q
    |||| ||||||||||| || |||||    
T  87405 gtctgtaaggagaagaattgtgatg 87429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32623 - 32382
Alignment:
Q  227 gggatctccacttccaaaggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgca 326  Q
    |||||||| || |||| ||| || || || ||||| |||||||| | ||| |||  ||||||||| |||||| |||| |||  |||||| || |||| ||    
T  32623 gggatctcaacctccacagggagtactgcctccatgccatatactaaagaaaaaatggttgcccctgttgaagtgcgtactaaagtacgatacccataca 32524  T
Q  327 gagcatagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcat 426  Q
     |||| | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||| |||| ||||    
T  32523 aagcaaatggtaacatcttgtgccaatccttgtaagtaaccaccattttctgcacaatcttcttgatattcttatttgcagcttcaactgtaccactcat 32424  T
Q  427 ctgaggtctataaggagaagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||    
T  32423 ctgaggtctataaggagaaaagttatggggctcaatcttgaa 32382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 468
Target Start/End: Original strand, 33238 - 33455
Alignment:
Q  251 accgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgcc 350  Q
    ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || ||  |||| || | |||||| || |||||||  ||| |||| | |||||||||||    
T  33238 accgcctccatgccgtataccaaagagaaaggggttgcccctgtggatgtgcgtaccgaagtacgatatccatgcaatgcaaagggaagcatctcatgcc 33337  T
Q  351 agtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtt 450  Q
    | |||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| || || || || || || || ||  ||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  33338 aatccttataagttactaccatcttctggacaatcttctttatgtttttatttgcagcttcgacaacaccattcatctgcggtctgtacggcgaagagtt 33437  T
Q  451 atgatgctcaattttgaa 468  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  33438 atggtgctcgattttgaa 33455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31446 - 31222
Alignment:
Q  244 aggaagaaccgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatc 343  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||| || | |||||| || ||||| |  ||| |||| | |||     
T  31446 aggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatt 31347  T
Q  344 tcatgccagtccttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggag 443  Q
    |||||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  31346 tcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatatttttatttgcagcttcgacagcaccattcatttggggtctgtaaggtg 31247  T
Q  444 aagagttatgatgctcaattttgaa 468  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  31246 aagagttatggtgctcgatcttgaa 31222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51290 - 51233
Alignment:
Q  132 ccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcataccggctttggcaccattcagc 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  51290 ccatgcgtttttcctcaatcaaattcaattggtcgtacctgctctggcaccattcagc 51233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 154681 - 154558
Alignment:
Q  278 aaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttataagtagtaaccatcttct 377  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| || || ||||  ||  | |||| ||||| ||| ||||| || ||| |||   |||||||||    
T  154681 aaaggggttgcccctgttgaagtgcgtactgaagtacgatacccgtgcaaggcgaacggtagcatcttatgtcagtctttgtaactagatgccatcttct 154582  T
Q  378 gaacaatcttcttgatattcttgt 401  Q
    | ||||||||||||||||| ||||    
T  154581 ggacaatcttcttgatatttttgt 154558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 402 times since January 2019
Visitors: 971