View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9508H-LTR4-TNT-insertion-2 (Length: 375)

Name: F9508H-LTR4-TNT-insertion-2
Description: F9508H-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9508H-LTR4-TNT-insertion-2
F9508H-LTR4-TNT-insertion-2
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (152-364)||(4199906-4200118)
chr5 (152-364)||(18777913-18778125)
chr5 (152-364)||(22366402-22366614)
chr5 (152-364)||(25426747-25426959)
chr5 (152-364)||(19500018-19500230)
chr5 (152-364)||(43443318-43443528)
chr5 (152-364)||(12493-12705)
chr5 (152-364)||(21073516-21073728)
chr5 (152-364)||(29188207-29188417)
chr5 (152-364)||(27009960-27010171)
chr5 (231-364)||(23507083-23507216)
chr5 (152-315)||(11211989-11212153)
chr5 (152-363)||(1219444-1219657)
chr5 (152-363)||(10777894-10778107)
chr5 (152-315)||(7425492-7425656)
chr5 (152-315)||(35791022-35791186)
chr5 (231-358)||(34939401-34939528)
chr5 (231-364)||(22053845-22053978)
chr5 (152-315)||(23514729-23514893)
chr5 (231-364)||(18531079-18531212)
chr5 (152-315)||(17471512-17471676)
chr5 (251-364)||(27182579-27182692)
chr5 (152-363)||(21932305-21932518)
chr5 (152-363)||(21938475-21938688)
chr5 (152-363)||(35582155-35582368)
chr5 (231-356)||(20623095-20623220)
chr5 (231-356)||(21233540-21233665)
chr5 (152-363)||(22883008-22883221)
chr5 (152-363)||(36989694-36989907)
chr5 (231-356)||(25900418-25900543)
chr5 (231-356)||(16536323-16536448)
chr5 (231-356)||(37052870-37052995)
chr5 (152-251)||(23328789-23328889)
chr5 (152-251)||(24616393-24616493)
chr5 (152-251)||(24712769-24712869)
chr5 (152-251)||(24745787-24745887)
chr5 (234-315)||(32950862-32950943)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (152-364)||(13910945-13911157)
chr7 (153-364)||(10989528-10989739)
chr7 (152-364)||(2437576-2437788)
chr7 (152-364)||(16478885-16479095)
chr7 (10-136)||(48688591-48688717)
chr7 (152-364)||(13572795-13573006)
chr7 (152-364)||(18253767-18253980)
chr7 (231-364)||(47481043-47481176)
chr7 (152-363)||(15950715-15950928)
chr7 (152-315)||(13758538-13758702)
chr7 (152-315)||(18979945-18980109)
chr7 (231-364)||(11580751-11580884)
chr7 (231-364)||(16211884-16212017)
chr7 (152-315)||(15927736-15927900)
chr7 (231-364)||(13037026-13037159)
chr7 (251-364)||(36052782-36052895)
chr7 (231-315)||(13321183-13321267)
chr7 (152-315)||(15760038-15760202)
chr7 (253-364)||(25292372-25292483)
chr7 (152-363)||(7822847-7823060)
chr7 (152-363)||(7830158-7830371)
chr7 (152-363)||(27101561-27101774)
chr7 (152-363)||(27108909-27109122)
chr7 (152-363)||(27176552-27176765)
chr7 (152-363)||(38783653-38783866)
chr7 (184-317)||(48622623-48622756)
chr7 (184-315)||(14250855-14250986)
chr7 (231-364)||(3060084-3060217)
chr7 (231-356)||(11516353-11516478)
chr7 (231-356)||(15441576-15441701)
chr7 (231-356)||(30262141-30262266)
chr7 (231-356)||(7293142-7293267)
chr7 (219-349)||(295966-296096)
chr7 (152-228)||(15862174-15862251)
chr7 (182-251)||(16418729-16418798)
chr7 (182-313)||(10000325-10000455)
chr7 (235-319)||(28722272-28722357)
chr7 (235-317)||(16914928-16915011)
chr7 (235-319)||(13448827-13448912)
chr7 (235-319)||(14935522-14935607)
chr7 (235-319)||(15363115-15363200)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (152-364)||(31596-31808)
scaffold0008 (251-364)||(128201-128314)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (152-364)||(30120841-30121054)
chr8 (152-364)||(16674314-16674525)
chr8 (152-364)||(6774181-6774391)
chr8 (152-364)||(24549100-24549310)
chr8 (152-364)||(21844494-21844705)
chr8 (152-364)||(21851887-21852098)
chr8 (223-364)||(43373472-43373613)
chr8 (152-315)||(13720852-13721016)
chr8 (152-363)||(22006182-22006395)
chr8 (231-364)||(16193728-16193861)
chr8 (152-315)||(16872975-16873139)
chr8 (217-364)||(16404973-16405120)
chr8 (231-364)||(24928803-24928936)
chr8 (164-315)||(16195399-16195551)
chr8 (152-363)||(13662189-13662402)
chr8 (235-358)||(17345693-17345816)
chr8 (294-364)||(222754-222824)
chr8 (294-364)||(736377-736447)
chr8 (294-364)||(860272-860342)
chr8 (152-363)||(271284-271497)
chr8 (152-363)||(644423-644636)
chr8 (152-363)||(830158-830371)
chr8 (152-363)||(22088718-22088931)
chr8 (294-355)||(691909-691970)
chr8 (231-356)||(5238213-5238338)
chr8 (231-356)||(22907226-22907351)
chr8 (231-356)||(24661260-24661385)
chr8 (231-356)||(43685672-43685797)
chr8 (152-315)||(15319083-15319247)
chr8 (152-315)||(15499452-15499616)
chr8 (235-317)||(26011658-26011741)
chr8 (235-319)||(24552570-24552655)
chr8 (235-319)||(45465126-45465211)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (152-364)||(36212-36424)
scaffold0023 (152-270)||(169833-169951)
scaffold0023 (231-364)||(48716-48849)
scaffold0023 (152-363)||(153931-154144)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (151-364)||(27653903-27654116)
chr6 (157-361)||(16825678-16825884)
chr6 (152-364)||(25175682-25175895)
chr6 (152-364)||(1650028-1650238)
chr6 (231-364)||(14626130-14626263)
chr6 (231-364)||(35009451-35009584)
chr6 (152-315)||(16232060-16232224)
chr6 (233-364)||(23153565-23153696)
chr6 (152-315)||(1556173-1556337)
chr6 (152-315)||(18086747-18086911)
chr6 (164-315)||(23977937-23978089)
chr6 (231-358)||(1657760-1657887)
chr6 (233-358)||(15862595-15862720)
chr6 (152-315)||(19610186-19610350)
chr6 (153-363)||(22225663-22225875)
chr6 (168-315)||(13620734-13620882)
chr6 (152-363)||(10488818-10489031)
chr6 (152-363)||(16376297-16376510)
chr6 (152-363)||(16383621-16383834)
chr6 (153-282)||(22251491-22251621)
chr6 (167-315)||(29666041-29666191)
chr6 (152-363)||(16556063-16556276)
chr6 (152-363)||(16632619-16632832)
chr6 (232-304)||(27751603-27751675)
chr6 (152-251)||(29869700-29869800)
chr6 (152-249)||(19299471-19299569)
chr6 (235-319)||(19854317-19854402)
chr6 (235-319)||(29605612-29605696)
chr6 (235-317)||(18629608-18629691)
chr6 (237-319)||(17083200-17083282)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (152-364)||(19886582-19886794)
chr2 (219-364)||(7507844-7507989)
chr2 (152-315)||(3798527-3798691)
chr2 (152-315)||(34824643-34824807)
chr2 (231-364)||(25265402-25265535)
chr2 (152-315)||(8944014-8944178)
chr2 (152-315)||(12728560-12728724)
chr2 (154-315)||(23777971-23778133)
chr2 (231-364)||(462856-462989)
chr2 (231-364)||(36982453-36982586)
chr2 (231-364)||(43642969-43643102)
chr2 (152-315)||(12635792-12635956)
chr2 (152-315)||(12641566-12641730)
chr2 (152-315)||(42177893-42178057)
chr2 (234-364)||(19794719-19794849)
chr2 (234-364)||(20627328-20627458)
chr2 (231-364)||(8891360-8891493)
chr2 (231-364)||(17396665-17396797)
chr2 (251-364)||(24341421-24341534)
chr2 (152-315)||(16935761-16935925)
chr2 (152-315)||(17006421-17006585)
chr2 (152-363)||(11231262-11231475)
chr2 (152-363)||(22513109-22513322)
chr2 (152-363)||(24685705-24685918)
chr2 (152-363)||(28775731-28775944)
chr2 (231-356)||(19689413-19689538)
chr2 (231-356)||(23820197-23820322)
chr2 (231-356)||(14906452-14906577)
chr2 (200-315)||(21142063-21142178)
chr2 (182-251)||(5888585-5888654)
chr2 (152-251)||(23774368-23774468)
chr2 (231-356)||(20015137-20015262)
chr2 (81-136)||(25805571-25805626)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (153-364)||(1227-1437)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (154-364)||(55316338-55316547)
chr3 (152-364)||(41270194-41270405)
chr3 (152-364)||(15614952-15615162)
chr3 (152-364)||(16821258-16821468)
chr3 (184-364)||(15936592-15936772)
chr3 (152-364)||(15938401-15938614)
chr3 (231-364)||(51158030-51158163)
chr3 (231-364)||(15859036-15859169)
chr3 (152-315)||(12902014-12902178)
chr3 (152-315)||(18911161-18911325)
chr3 (152-363)||(49232555-49232768)
chr3 (219-364)||(13839012-13839157)
chr3 (231-364)||(14842573-14842706)
chr3 (152-315)||(12264716-12264880)
chr3 (167-364)||(54651575-54651774)
chr3 (152-363)||(25058858-25059071)
chr3 (231-364)||(12030159-12030292)
chr3 (152-315)||(22275377-22275541)
chr3 (253-364)||(17912516-17912627)
chr3 (152-315)||(15468264-15468428)
chr3 (231-364)||(2049928-2050061)
chr3 (152-363)||(1467663-1467876)
chr3 (152-313)||(18896968-18897130)
chr3 (231-364)||(13975734-13975866)
chr3 (231-364)||(45860924-45861056)
chr3 (152-315)||(5228481-5228644)
chr3 (231-356)||(2449250-2449375)
chr3 (231-364)||(13954902-13955034)
chr3 (200-315)||(44229153-44229268)
chr3 (152-363)||(12811960-12812173)
chr3 (253-356)||(16744149-16744252)
chr3 (234-315)||(11986181-11986262)
chr3 (235-319)||(31412333-31412418)
chr3 (235-319)||(41661727-41661812)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (152-364)||(47357773-47357983)
chr4 (152-364)||(10644338-10644548)
chr4 (152-363)||(18169089-18169302)
chr4 (251-364)||(122007-122120)
chr4 (231-364)||(54118256-54118389)
chr4 (152-315)||(7131989-7132153)
chr4 (231-364)||(15675101-15675234)
chr4 (152-315)||(17145581-17145745)
chr4 (152-315)||(20000891-20001055)
chr4 (251-364)||(10104282-10104395)
chr4 (251-364)||(13246548-13246661)
chr4 (167-315)||(19020654-19020803)
chr4 (251-364)||(31115747-31115860)
chr4 (259-364)||(13048261-13048366)
chr4 (152-315)||(15287169-15287333)
chr4 (152-315)||(15294278-15294442)
chr4 (231-356)||(26680326-26680451)
chr4 (152-315)||(18248386-18248550)
chr4 (155-257)||(8378377-8378480)
chr4 (184-315)||(22738437-22738568)
chr4 (231-356)||(10488688-10488813)
chr4 (231-356)||(16327938-16328063)
chr4 (259-363)||(40885594-40885698)
chr4 (152-251)||(22351988-22352088)
chr4 (152-251)||(26339251-26339351)
chr4 (235-319)||(18238157-18238242)
chr4 (231-282)||(33240900-33240951)
chr4 (235-319)||(13442676-13442761)
chr4 (235-319)||(40904934-40905019)
chr4 (236-319)||(47468349-47468433)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (152-364)||(5072310-5072521)
chr1 (184-364)||(18601071-18601251)
chr1 (154-364)||(2116373-2116581)
chr1 (152-364)||(45051541-45051751)
chr1 (152-343)||(22227948-22228140)
chr1 (152-343)||(22232645-22232837)
chr1 (231-364)||(20931463-20931596)
chr1 (231-364)||(20913148-20913281)
chr1 (152-315)||(46523557-46523720)
chr1 (153-315)||(17148735-17148898)
chr1 (152-363)||(18059682-18059895)
chr1 (231-364)||(20445797-20445930)
chr1 (231-364)||(41394340-41394473)
chr1 (251-364)||(20893658-20893771)
chr1 (231-364)||(20531562-20531695)
chr1 (152-363)||(17004757-17004970)
chr1 (152-363)||(38055015-38055228)
chr1 (253-317)||(37844484-37844548)
chr1 (253-356)||(51452618-51452721)
chr1 (152-251)||(22035679-22035779)
chr1 (152-249)||(19962423-19962521)
chr1 (152-251)||(7640858-7640958)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (152-364)||(13248-13458)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (152-364)||(21037-21249)
scaffold0139 (152-364)||(13983-14194)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (152-364)||(9272-9482)
scaffold0215 (152-364)||(16170-16380)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (164-364)||(3081-3281)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (152-364)||(154-363)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (179-364)||(43116-43302)
scaffold0076 (152-363)||(39222-39435)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (152-364)||(64445-64661)
scaffold0026 (152-364)||(107865-108078)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (164-364)||(5148-5349)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (164-341)||(3863-4042)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (219-364)||(5647-5792)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (231-364)||(12231-12364)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (231-360)||(3594-3723)
scaffold0266 (231-364)||(1242-1375)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (231-364)||(19324-19457)
scaffold0195 (231-364)||(21408-21541)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (231-364)||(123176-123309)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (234-364)||(36928-37058)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (231-364)||(8996-9129)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (231-364)||(6076-6209)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (231-364)||(968-1101)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (231-364)||(48305-48438)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (251-364)||(148839-148952)
scaffold0025 (231-364)||(8967-9100)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (234-364)||(41766-41896)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (231-364)||(8192-8325)
scaffold0162 (231-364)||(26427-26560)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (231-364)||(13624-13757)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (231-364)||(51194-51327)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (152-315)||(1438-1602)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (168-315)||(10279-10427)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (231-317)||(34472-34558)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (167-315)||(45198-45348)
scaffold0066 (167-315)||(54584-54734)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (231-364)||(546-679)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (231-364)||(89466-89599)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (251-364)||(172023-172136)
scaffold0001 (251-364)||(177726-177839)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (152-315)||(1499-1663)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (152-315)||(2560-2725)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (152-257)||(10672-10778)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (223-312)||(3360-3449)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (259-364)||(5101-5206)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (231-364)||(41847-41980)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (152-315)||(7380-7544)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (152-363)||(31428-31641)
scaffold0107 (194-315)||(39814-39935)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (184-317)||(3579-3712)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (184-317)||(54040-54173)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (259-364)||(272143-272248)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (152-257)||(29388-29494)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (219-356)||(22666-22803)
scaffold0141 (231-356)||(26921-27046)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (231-360)||(247454-247583)
scaffold0012 (167-315)||(34097-34246)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (231-356)||(1594-1719)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (231-356)||(37078-37203)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (152-251)||(6829-6929)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (182-251)||(7441-7510)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (182-247)||(23704-23769)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (234-315)||(56114-56195)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (152-249)||(12051-12149)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (235-319)||(14198-14283)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (235-319)||(108171-108256)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (232-315)||(1-84)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (235-344)||(8626-8737)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (235-319)||(3413-3498)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (235-319)||(27659-27744)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 4199906 - 4200118
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199906 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 4200005  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200006 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 4200105  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||    
T  4200106 taaattggtgaat 4200118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 18777913 - 18778125
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  18777913 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgct 18778012  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18778013 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 18778112  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||    
T  18778113 taaattggtgaat 18778125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 22366402 - 22366614
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22366402 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgct 22366501  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22366502 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 22366601  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||    
T  22366602 taaattggtgaat 22366614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25426959 - 25426747
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  25426959 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 25426860  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25426859 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 25426760  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||| ||||||||    
T  25426759 taaagtggtgaat 25426747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19500230 - 19500018
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  19500230 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgct 19500131  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19500130 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 19500031  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||| ||||||||    
T  19500030 taaagtggtgaat 19500018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 43443318 - 43443528
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  43443318 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgct 43443415  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43443416 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 43443515  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  43443516 tcaattggtgaat 43443528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12705 - 12493
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  12705 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 12606  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  12605 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 12506  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||| ||||||||    
T  12505 taaagtggtgaat 12493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 21073516 - 21073728
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21073516 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 21073615  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21073616 gtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 21073715  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||| ||||||||    
T  21073716 taaagtggtgaat 21073728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 29188207 - 29188417
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  29188207 agggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 29188304  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||    
T  29188305 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  29188405 tcaattggtgaat 29188417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27010171 - 27009960
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  27010171 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 27010073  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  27010072 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtac 27009973  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  27009972 tcaattggtgaat 27009960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23507083
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 23507117  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  23507116 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 23507083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 11211989 - 11212153
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  11211989 agggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgc 11212088  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11212089 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 1219444 - 1219657
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  1219444 agggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 1219543  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  1219544 tgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 1219642  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  1219643 tgcttaattgatgaa 1219657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 10777894 - 10778107
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  10777894 aggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 10777993  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  10777994 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 10778092  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  10778093 tgcttaattgatgaa 10778107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7425656 - 7425492
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  7425656 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgc 7425557  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7425556 tgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7425492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 35791022 - 35791186
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  35791022 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 35791121  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35791122 tgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtt 35791186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939401
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattg 358  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 34939401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22053978
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 22053944  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  22053945 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 22053978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23514893 - 23514729
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  23514893 agggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 23514794  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23514793 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531212
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 18531178  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| || | |||||||||||    
T  18531179 gtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaat 18531212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 17471512 - 17471676
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  17471512 agggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgc 17471611  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17471612 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Original strand, 27182579 - 27182692
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||| ||    
T  27182579 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 27182678  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  27182679 ctcaattggtgaat 27182692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 21932305 - 21932518
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  21932305 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 21932404  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  21932405 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 21932503  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  21932504 tgcttaattgatgaa 21932518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 21938475 - 21938688
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  21938475 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 21938574  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  21938575 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 21938673  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  21938674 tgcttaattgatgaa 21938688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35582368 - 35582155
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  35582368 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 35582269  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  35582268 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 35582170  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  35582169 tgcttaattgatgaa 35582155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623095
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 20623121  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  20623120 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 20623095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233665
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 21233639  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  21233640 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 21233665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 22883008 - 22883221
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || |||||| |||||||||     
T  22883008 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgc 22883107  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  22883108 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 22883206  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  22883207 tgcttaattgatgaa 22883221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 36989694 - 36989907
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || |||||||||||||| |     
T  36989694 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagc 36989793  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  36989794 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 36989892  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  36989893 tgcttaattgatgaa 36989907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900543
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||   |||||  |||||    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaat 25900517  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  25900518 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 25900543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536323
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16536349  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  16536348 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 16536323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052870
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||   ||||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaat 37052896  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  37052895 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 37052870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23328889 - 23328789
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  23328889 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 23328790  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  23328789 t 23328789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24616493 - 24616393
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  24616493 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 24616394  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  24616393 t 24616393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24712869 - 24712769
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  24712869 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 24712770  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  24712769 t 24712769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24745887 - 24745787
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  24745887 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 24745788  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  24745787 t 24745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950862
Alignment:
Q  234 taaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| || || || |||| |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 13910945 - 13911157
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13910945 agggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtt 13911044  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911045 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 13911144  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  13911145 tcaattggtgaat 13911157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10989739 - 10989528
Alignment:
Q  153 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  10989739 gggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 10989640  T
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10989639 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 10989540  T
Q  353 aaattggtgaat 364  Q
     |||||||||||    
T  10989539 caattggtgaat 10989528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2437788 - 2437576
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2437788 agggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 2437689  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  2437688 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgt 2437589  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  2437588 tcaattggtgaat 2437576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 16478885 - 16479095
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||  |    
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttact 16478982  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  16478983 gcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 16479082  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  16479083 tcaattggtgaat 16479095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 48688717 - 48688591
Alignment:
Q  10 agaaagctatgggaaatgaggcgtggtaggaagatggtgcaggagagttgctgctttgagtggcagaatttaattgcagaagcatctaggcaaggctttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48688717 agaaagctatgggaaatgaggcgtggtaggaagatggtgcaggagagttgctgctttgagtggcagaatttaattgcagaagcatctaggcaaggctttg 48688618  T
Q  110 ttggtcaggaagagctgcaatggaatt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48688617 ttggtcaggaagagctgcaatggaatt 48688591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13573006 - 13572795
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  13573006 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 13572908  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13572907 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13572808  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  13572807 tcaattggtgaat 13572795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 18253767 - 18253980
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||        
T  18253767 agggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaac 18253866  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  18253867 tgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 18253966  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  18253967 ctcaattggtgaat 18253980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481176
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| || | |||||||||||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaat 47481176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 15950715 - 15950928
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  15950715 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 15950814  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  15950815 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 15950913  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  15950914 tgcttaattgatgaa 15950928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13758702 - 13758538
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  13758702 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgt 13758603  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13758602 tgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 18979945 - 18980109
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  18979945 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 18980044  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18980045 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580884
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 11580850  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  11580851 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 11580884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211884
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaat 16211918  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  16211917 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 16211884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15927900 - 15927736
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15927900 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgt 15927801  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15927800 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037159
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | | ||||    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaat 13037125  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  13037126 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 13037159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36052895 - 36052782
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  36052895 tgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 36052796  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  36052795 ctcaattggtgaat 36052782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321183
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13321183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 15760038 - 15760202
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  15760038 agggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgc 15760137  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  15760138 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 364
Target Start/End: Original strand, 25292372 - 25292483
Alignment:
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 352  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  25292372 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgct 25292471  T
Q  353 aaattggtgaat 364  Q
     |||||||||||    
T  25292472 caattggtgaat 25292483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7823060 - 7822847
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  7823060 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 7822961  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  7822960 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 7822862  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  7822861 tgcttaattgatgaa 7822847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7830371 - 7830158
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  7830371 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 7830272  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  7830271 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 7830173  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  7830172 tgcttaattgatgaa 7830158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 27101561 - 27101774
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  27101561 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27101660  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  27101661 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 27101759  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  27101760 tgcttaattgatgaa 27101774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 27108909 - 27109122
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  27108909 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27109008  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  27109009 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 27109107  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  27109108 tgcttaattgatgaa 27109122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27176765 - 27176552
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  27176765 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27176666  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  27176665 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 27176567  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  27176566 tgcttaattgatgaa 27176552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 38783653 - 38783866
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  38783653 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 38783752  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  38783753 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 38783851  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  38783852 tgcttaattgatgaa 38783866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Original strand, 48622623 - 48622756
Alignment:
Q  184 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 283  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  48622623 ttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatga 48622722  T
Q  284 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48622723 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 48622756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Original strand, 14250855 - 14250986
Alignment:
Q  184 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  14250855 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatga 14250954  T
Q  284 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    |  | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  14250955 ttatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 14250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3060084
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3060118  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| || |||| |||||||| || ||||||||    
T  3060117 gataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaat 3060084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516353
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 11516379  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  11516378 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 11516353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441701
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 15441675  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  15441676 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 15441701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262266
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 30262240  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  30262241 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 30262266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293142
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 7293168  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  7293167 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 7293142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 349
Target Start/End: Original strand, 295966 - 296096
Alignment:
Q  219 atgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcat 318  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||| |||||| |     
T  295966 atgaataattgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaa 296065  T
Q  319 atatgcaaaaatgataagttatgaatattat 349  Q
     |||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  296066 ttatgtaaaaatgagaagttataaaaattat 296096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15862251 - 15862174
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataatt 228  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15862251 agggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16418798 - 16418729
Alignment:
Q  182 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16418798 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 16418729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 313
Target Start/End: Original strand, 10000325 - 10000455
Alignment:
Q  182 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgat 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| || |||| | ||  ||| |||||||||||    
T  10000325 aattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttcttatacatgaattgat 10000423  T
Q  282 gttagttgtatgattgttggtgaaattacatg 313  Q
    | |  | ||||| |||| | ||||||||||||    
T  10000424 gattatggtatgtttgtggatgaaattacatg 10000455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28722357 - 28722272
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  28722357 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 28722272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915011
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 16915011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 13448827 - 13448912
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||  | |||||| ||| || || ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13448827 aaattcatgctcttgttatcatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcata 13448912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14935607 - 14935522
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  14935607 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 14935522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15363200 - 15363115
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15363200 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 15363115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 31596 - 31808
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31596 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtg 31695  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31696 gtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 31795  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  31796 tcaattggtgaat 31808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Original strand, 128201 - 128314
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| |||| ||| ||    
T  128201 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtg 128300  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||| ||||    
T  128301 ctcaattggcgaat 128314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30121054 - 30120841
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  30121054 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 30120955  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30120954 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtg 30120855  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  30120854 ctcaattggtgaat 30120841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 16674314 - 16674525
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  16674314 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttct 16674412  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16674413 gtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 16674512  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  16674513 ttaattggtgaat 16674525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 6774181 - 6774391
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 6774278  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  6774279 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 6774378  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  6774379 tcaattggtgaat 6774391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24549310 - 24549100
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 24549213  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||    
T  24549212 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 24549113  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  24549112 tcaattggtgaat 24549100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 21844494 - 21844705
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  21844494 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 21844592  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21844593 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  21844693 tcaattggtgaat 21844705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 21851887 - 21852098
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  21851887 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 21851985  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21851986 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  21852086 tcaattggtgaat 21852098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 364
Target Start/End: Original strand, 43373472 - 43373613
Alignment:
Q  223 ataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatat 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43373472 ataattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatat 43373571  T
Q  323 gcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  43373572 gtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 43373613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 13720852 - 13721016
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  13720852 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 13720951  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13720952 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 22006182 - 22006395
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  22006182 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 22006281  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  22006282 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 22006380  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  22006381 tgcttaattgatgaa 22006395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193861
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 16193827  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  16193828 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 16193861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 16872975 - 16873139
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  16872975 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgt 16873074  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16873075 tgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 364
Target Start/End: Original strand, 16404973 - 16405120
Alignment:
Q  217 tgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 316  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404973 tgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 16405072  T
Q  317 atatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    | ||| | | ||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  16405073 aaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 16405120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24928936
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 24928902  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  24928903 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 24928936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16195551 - 16195399
Alignment:
Q  164 attatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatg 262  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  16195551 attatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatg 16195452  T
Q  263 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16195451 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 13662189 - 13662402
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||     
T  13662189 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 13662288  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  13662289 tgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 13662387  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  13662388 tgcttaattgatgaa 13662402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345693
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 334  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  335 agttatgaatattatgctaaattg 358  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattg 17345693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222824
Alignment:
Q  294 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaat 222824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736447
Alignment:
Q  294 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaat 736447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860342
Alignment:
Q  294 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaat 860342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 271284 - 271497
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  271284 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 271383  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  271384 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 271482  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  271483 tgcttaattgatgaa 271497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 644636 - 644423
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  644636 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 644537  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  644536 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 644438  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  644437 tgcttaattgatgaa 644423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 830371 - 830158
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  830371 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 830272  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  830271 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 830173  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  830172 tgcttaattgatgaa 830158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 22088718 - 22088931
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  22088718 agggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22088817  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  22088818 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 22088916  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  22088917 tgcttaattgatgaa 22088931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691970
Alignment:
Q  294 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238213
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 5238239  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  5238238 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 5238213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907351
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 22907325  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  22907326 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 22907351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661385
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 24661359  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  24661360 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 24661385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685672
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 43685698  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  43685697 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 43685672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 15319083 - 15319247
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  15319083 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 15319182  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||  ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  15319183 tgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 15319247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 15499452 - 15499616
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  15499452 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 15499551  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||  ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  15499552 tgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 15499616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011658
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 26011658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 24552570 - 24552655
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24552570 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 24552655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 45465126 - 45465211
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  45465126 aaattcgtgctcctgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 45465211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36424 - 36212
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  36424 agggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgta 36325  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36324 gtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||    
T  36224 taaattggtgaat 36212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 270
Target Start/End: Original strand, 169833 - 169951
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  169833 agggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 169932  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatg 270  Q
    |||||||||||||||||||    
T  169933 gtgatgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48716
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaat 48750  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| | |||||||||    
T  48749 gataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaat 48716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 153931 - 154144
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  153931 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 154030  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  154031 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 154129  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  154130 tgcttaattgatgaa 154144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 151 - 364
Target Start/End: Original strand, 27653903 - 27654116
Alignment:
Q  151 gagggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  27653903 gagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgc 27654002  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27654003 tgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 27654102  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||||    
T  27654103 ctaaattggtgaat 27654116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 157 - 361
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825884
Alignment:
Q  157 gttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgat 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  257 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--tgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  355 attggtg 361  Q
    |||||||    
T  16825878 attggtg 16825884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25175895 - 25175682
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatatt-ctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25175895 agggggttagtgattaccataatcatgtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 25175796  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25175795 tgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 25175696  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||||    
T  25175695 ctaaattggtgaat 25175682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 1650028 - 1650238
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  1650028 agggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 1650125  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||    
T  1650126 gtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgc 1650225  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  1650226 tcaattggtgaat 1650238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 14626130 - 14626263
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14626130 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 14626229  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||    
T  14626230 gataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaat 14626263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009584
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaat 35009584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16232224 - 16232060
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  16232224 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 16232125  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16232124 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153565
Alignment:
Q  233 ctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 332  Q
    ||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||    
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatga 23153597  T
Q  333 taagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  23153596 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 23153565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1556337 - 1556173
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  1556337 agggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 1556238  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1556237 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 18086747 - 18086911
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  18086747 agggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 18086846  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18086847 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23978089 - 23977937
Alignment:
Q  164 attatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatg 262  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23978089 attatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatt 23977990  T
Q  263 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23977989 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 358
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657887
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattg 358  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 1657887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862595
Alignment:
Q  233 ctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 332  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||     
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  333 taagttatgaatattatgctaaattg 358  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||    
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgctcaattg 15862595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19610350 - 19610186
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  19610350 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgc 19610251  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19610250 tgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19610186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 363
Target Start/End: Original strand, 22225663 - 22225875
Alignment:
Q  153 gggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||  |    
T  22225663 gggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttct 22225762  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattat 349  Q
    |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  22225763 gtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attat 22225861  T
Q  350 gctaaattggtgaa 363  Q
    ||| ||||| ||||    
T  22225862 gcttaattgatgaa 22225875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 315
Target Start/End: Original strand, 13620734 - 13620882
Alignment:
Q  168 tcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttg 266  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||      
T  13620734 tcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttct 13620833  T
Q  267 tatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  13620834 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtt 13620882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10489031 - 10488818
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  10489031 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 10488932  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  10488931 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 10488833  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  10488832 tgcttaattgatgaa 10488818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 16376297 - 16376510
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  16376297 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 16376396  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  16376397 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 16376495  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16376496 tgcttaattgatgaa 16376510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 16383621 - 16383834
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  16383621 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 16383720  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  16383721 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 16383819  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16383820 tgcttaattgatgaa 16383834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Original strand, 22251491 - 22251621
Alignment:
Q  153 gggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |    
T  22251491 gggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgct 22251590  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 282  Q
    |||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251591 gtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29666191 - 29666041
Alignment:
Q  167 atcataatcatgtgtaatt-ttgcatattctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtt 264  Q
    |||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  29666191 atcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttatttt 29666092  T
Q  265 tgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
      |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29666091 cttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 29666041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 16556063 - 16556276
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||| ||     
T  16556063 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgc 16556162  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  16556163 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 16556261  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16556262 tgcttaattgatgaa 16556276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 16632619 - 16632832
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||| ||     
T  16632619 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgc 16632718  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  16632719 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 16632817  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16632818 tgcttaattgatgaa 16632832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  232 gctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtga 304  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 29869700 - 29869800
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  29869700 agggggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 29869799  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  29869800 t 29869800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19299569 - 19299471
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttg 249  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||    
T  19299569 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19299471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854317
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 19854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    |||||||||||||  || || || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629691
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18629691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083282
Alignment:
Q  237 attcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    |||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 17083282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 19886582 - 19886794
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886582 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 19886681  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  19886682 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 19886781  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||| ||||||||    
T  19886782 taaagtggtgaat 19886794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 364
Target Start/End: Original strand, 7507844 - 7507989
Alignment:
Q  219 atgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcat 318  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7507844 atgaataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 7507943  T
Q  319 atatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  7507944 atatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaat 7507989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 3798527 - 3798691
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  3798527 agggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgt 3798626  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3798627 tgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34824807 - 34824643
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  34824807 agggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 34824708  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34824707 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265535
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 25265535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8944178 - 8944014
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  8944178 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 8944079  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  8944078 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtt 8944014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12728724 - 12728560
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  12728724 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 12728625  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12728624 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 315
Target Start/End: Original strand, 23777971 - 23778133
Alignment:
Q  154 ggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 252  Q
    ||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23777971 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctg 23778070  T
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  23778071 tgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462856
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 462890  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| || | |||||||||||    
T  462889 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaat 462856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982586
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 36982552  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  36982553 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 36982586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 43642969 - 43643102
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  43642969 tgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 43643068  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    | |||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  43643069 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 43643102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 12635792 - 12635956
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  12635792 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 12635891  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12635892 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 12641566 - 12641730
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  12641566 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgt 12641665  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  12641666 tgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtt 12641730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 42177893 - 42178057
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  42177893 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 42177992  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  42177993 tgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 42178057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 364
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794849
Alignment:
Q  234 taaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 333  Q
    |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||    
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  334 aagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 19794849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 364
Target Start/End: Original strand, 20627328 - 20627458
Alignment:
Q  234 taaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 333  Q
    |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  20627328 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgat 20627427  T
Q  334 aagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    || || |||| ||| |||| |||||||||||    
T  20627428 aacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 20627458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891360
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaat 8891394  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  8891393 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 8891360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396797
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaat 17396763  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17396764 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaat 17396797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Original strand, 24341421 - 24341534
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  ||||| |||| ||| ||    
T  24341421 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 24341520  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  24341521 ctcaattggtgaat 24341534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16935925 - 16935761
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||     
T  16935925 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgc 16935826  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  16935825 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 16935761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17006585 - 17006421
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||     
T  17006585 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgc 17006486  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  17006485 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 17006421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 11231262 - 11231475
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  11231262 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 11231361  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  11231362 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 11231460  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  11231461 tgcttaattgatgaa 11231475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 22513109 - 22513322
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  22513109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22513208  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  22513209 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 22513307  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  22513308 tgcttaattgatgaa 22513322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 24685705 - 24685918
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  24685705 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 24685804  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  24685805 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 24685903  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  24685904 tgcttaattgatgaa 24685918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 28775731 - 28775944
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  28775731 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 28775830  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  28775831 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 28775929  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  28775930 tgcttaattgatgaa 28775944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689538
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 19689512  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  19689513 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 19689538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820197
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 23820223  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  23820222 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 23820197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906577
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 14906551  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  14906552 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 14906577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21142178 - 21142063
Alignment:
Q  200 gttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgtt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| ||||     
T  21142178 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtg 21142079  T
Q  300 ggtgaaattacatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||    
T  21142078 gatgaaattacatgtt 21142063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Original strand, 5888585 - 5888654
Alignment:
Q  182 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5888585 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 5888654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23774468 - 23774368
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  23774468 agggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 23774369  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  23774368 t 23774368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015137
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 20015163  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  20015162 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 20015137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25805626 - 25805571
Alignment:
Q  81 aattgcagaagcatctaggcaaggctttgttggtcaggaagagctgcaatggaatt 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  25805626 aattccagaaacatctaggcaaggctttgttggtcgggatgagatgcagtggaatt 25805571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 364
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1437
Alignment:
Q  153 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 252  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1227 gggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 1325  T
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1326 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 1425  T
Q  353 aaattggtgaat 364  Q
     |||||||||||    
T  1426 caattggtgaat 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 154 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55316547 - 55316338
Alignment:
Q  154 ggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgt 253  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55316547 ggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 55316449  T
Q  254 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgcta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  55316448 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctc 55316349  T
Q  354 aattggtgaat 364  Q
    |||||||||||    
T  55316348 aattggtgaat 55316338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41270405 - 41270194
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41270405 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 41270307  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41270306 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 41270207  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  41270206 tcaattggtgaat 41270194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15615162 - 15614952
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  15615162 agggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctcttact 15615065  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  15615064 gtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgc 15614965  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  15614964 tcaattggtgaat 15614952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16821468 - 16821258
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||| |||||||||| |    
T  16821468 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgct 16821371  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||    
T  16821370 gtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgc 16821271  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||    
T  16821270 taaattggtgaat 16821258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 15936592 - 15936772
Alignment:
Q  184 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15936592 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 15936691  T
Q  284 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  15936692 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 15936772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 15938401 - 15938614
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||| |||||||        
T  15938401 agggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctccaac 15938500  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  15938501 tgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 15938600  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  15938601 ctcaattggtgaat 15938614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158163
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 51158129  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  51158130 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 51158163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859169
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaat 15859135  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  15859136 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 15859169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 12902014 - 12902178
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  12902014 agggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgc 12902113  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12902114 tgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18911325 - 18911161
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  18911325 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 18911226  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18911225 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 49232768 - 49232555
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  49232768 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 49232669  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  49232668 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 49232570  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  49232569 tgcttaattgatgaa 49232555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 219 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13839157 - 13839012
Alignment:
Q  219 atgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcat 318  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13839157 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaa 13839058  T
Q  319 atatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  13839057 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 13839012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 14842573 - 14842706
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  14842573 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaat 14842672  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  14842673 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaat 14842706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 12264716 - 12264880
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  12264716 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 12264815  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12264816 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54651774 - 54651575
Alignment:
Q  167 atcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgttt 265  Q
    |||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||     
T  54651774 atcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 54651675  T
Q  266 gtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt-cata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaa 363  Q
     | |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||| || | |||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  54651674 ttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggtgaa 54651576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25059071 - 25058858
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  25059071 agggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 25058972  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  25058971 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 25058873  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  25058872 tgcttaattgatgaa 25058858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030292
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagt 12030258  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| ||||  || |||| |||||||||||    
T  12030259 gataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaat 12030292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22275541 - 22275377
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  22275541 agggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 22275442  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    |||||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22275441 tgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 364
Target Start/End: Original strand, 17912516 - 17912627
Alignment:
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||     
T  17912516 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 17912615  T
Q  353 aaattggtgaat 364  Q
    |||||| |||||    
T  17912616 aaattgatgaat 17912627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 15468264 - 15468428
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  15468264 agggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 15468363  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15468364 tatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049928
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacat 2049962  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||    
T  2049961 gataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 2049928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 1467663 - 1467876
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  1467663 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 1467762  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  1467763 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 1467861  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  1467862 tgcttaattgatgaa 1467876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 18896968 - 18897130
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  18896968 agggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgc 18897067  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg 313  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  18897068 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975866
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13975832  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13975833 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaat 13975866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860924
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 45860958  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45860957 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaat 45860924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5228644 - 5228481
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||     
T  5228644 agggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgc 5228546  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5228545 tgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449375
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 2449349  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  2449350 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 2449375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13955034
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13955000  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  13955001 gatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaat 13955034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44229268 - 44229153
Alignment:
Q  200 gttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgtt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||     
T  44229268 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtg 44229169  T
Q  300 ggtgaaattacatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||    
T  44229168 gatgaaattacatgtt 44229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12812173 - 12811960
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||     
T  12812173 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 12812074  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||| ||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||| ||||||||| |||| | |||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  12812073 tgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaat-tta 12811975  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  12811974 tgcttaattgatgaa 12811960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 356
Target Start/End: Original strand, 16744149 - 16744252
Alignment:
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 352  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||     
T  16744149 tgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 16744248  T
Q  353 aaat 356  Q
    ||||    
T  16744249 aaat 16744252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986262
Alignment:
Q  234 taaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 31412333 - 31412418
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  31412333 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 31412418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661727
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| || ||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 41661727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47357983 - 47357773
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  47357983 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 47357886  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  47357885 gtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 47357786  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||    
T  47357785 taaattggtgaat 47357773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10644548 - 10644338
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 10644451  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  10644450 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 10644351  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||    
T  10644350 taaattggtgaat 10644338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18169302 - 18169089
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||     
T  18169302 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 18169203  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  18169202 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 18169104  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  18169103 tgcttaattgatgaa 18169089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 122120 - 122007
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  122120 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 122021  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  122020 ctcaattggtgaat 122007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118389
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaatt 54118355  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  54118356 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 54118389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 7131989 - 7132153
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7131989 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 7132088  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7132089 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675234
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 15675200  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  15675201 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 15675234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 17145581 - 17145745
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||      
T  17145581 agggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttac 17145680  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17145681 tgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20001055 - 20000891
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  20001055 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgt 20000956  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  20000955 tgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtt 20000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Original strand, 10104282 - 10104395
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| ||| ||    
T  10104282 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 10104381  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  10104382 ctcaattggtgaat 10104395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13246661 - 13246548
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||| ||    
T  13246661 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 13246562  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  13246561 ctcaattggtgaat 13246548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19020803 - 19020654
Alignment:
Q  167 atcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgttt 265  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||     
T  19020803 atcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 19020704  T
Q  266 gtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
     | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19020703 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31115860 - 31115747
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| ||||||    
T  31115860 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatg 31115761  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  31115760 ctcaattggtgaat 31115747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048366
Alignment:
Q  259 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattg 358  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  359 gtgaat 364  Q
     |||||    
T  13048361 atgaat 13048366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 15287169 - 15287333
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||||     
T  15287169 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgc 15287268  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15287269 tgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 15294278 - 15294442
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||||     
T  15294278 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgc 15294377  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15294378 tgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680326
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 26680352  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  26680351 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 26680326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18248550 - 18248386
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttg-catattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||     
T  18248550 agggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgc 18248451  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  18248450 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 18248386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  155 gggttagggattatcataatcatgtgtaattttg-catattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgt 253  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  254 gatg 257  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738437
Alignment:
Q  184 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  284 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488688
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 10488714  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  10488713 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 10488688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328063
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16328037  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  16328038 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 16328063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 363
Target Start/End: Original strand, 40885594 - 40885698
Alignment:
Q  259 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  40885594 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-attatgctcaatt 40885692  T
Q  358 ggtgaa 363  Q
    ||||||    
T  40885693 ggtgaa 40885698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 22351988 - 22352088
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  22351988 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgt 22352087  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  22352088 t 22352088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26339351 - 26339251
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  26339351 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 26339252  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  26339251 t 26339251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 18238157 - 18238242
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatga-attgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18238157 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 18238242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240900
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 282  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 13442676 - 13442761
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13442676 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgtttgtgaaattgcatgttcata 13442761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 40904934 - 40905019
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  40904934 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 40905019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 319
Target Start/End: Original strand, 47468349 - 47468433
Alignment:
Q  236 aattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  47468349 aattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 47468433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 5072310 - 5072521
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  5072310 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 5072408  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5072409 gtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 5072508  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  5072509 tcaattggtgaat 5072521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601251
Alignment:
Q  184 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 283  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  284 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaat 18601251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2116581 - 2116373
Alignment:
Q  154 ggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||    
T  2116581 ggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttttactgt 2116484  T
Q  254 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgcta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||     
T  2116483 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctc 2116384  T
Q  354 aattggtgaat 364  Q
    |||||||||||    
T  2116383 aattggtgaat 2116373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45051751 - 45051541
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  45051751 agggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttcttact 45051654  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  45051653 gtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  45051553 tcaattggtgaat 45051541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22228140 - 22227948
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22228140 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgc 22228041  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 343  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22228040 tgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 22227948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22232837 - 22232645
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22232837 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgc 22232738  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 343  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22232737 tgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 22232645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931463
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20931497  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20931496 gataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaat 20931463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913148
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20913182  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  20913181 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaat 20913148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46523720 - 46523557
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  46523720 agggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgtt 46523621  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    |||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  46523620 gtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtt 46523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17148898 - 17148735
Alignment:
Q  153 gggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  17148898 gggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgtt 17148799  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    || ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17148798 gtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 18059682 - 18059895
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  18059682 agggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 18059781  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  18059782 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 18059880  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  18059881 tgcttaattgatgaa 18059895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445797
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20445831  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||  |||| ||| |||| |||||||||||    
T  20445830 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaat 20445797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394340
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaat 41394374  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  41394373 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 41394340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Original strand, 20893658 - 20893771
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||| ||    
T  20893658 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 20893757  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  20893758 ctcaattggtgaat 20893771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20531695 - 20531562
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||    
T  20531695 tgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20531596  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||  |||| ||| |||| |||||||||||    
T  20531595 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaat 20531562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17004970 - 17004757
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  17004970 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 17004871  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  17004870 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 17004772  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  17004771 tgcttaattgatgaa 17004757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 38055015 - 38055228
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || |||||||||||| ||      
T  38055015 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttac 38055114  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  38055115 tgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 38055213  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  38055214 tgcttaattgatgaa 38055228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 317
Target Start/End: Original strand, 37844484 - 37844548
Alignment:
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844484 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 37844548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51452721 - 51452618
Alignment:
Q  253 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||| |||     
T  51452721 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 51452622  T
Q  353 aaat 356  Q
    ||||    
T  51452621 aaat 51452618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22035779 - 22035679
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  22035779 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 22035680  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  22035679 t 22035679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Original strand, 19962423 - 19962521
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttg 249  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||    
T  19962423 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19962521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 7640858 - 7640958
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  7640858 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 7640957  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  7640958 t 7640958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 13248 - 13458
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  13248 agggggttagtgattatcataatcatgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagt 13345  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||    
T  13346 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  13446 tcaattggtgaat 13458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 21037 - 21249
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21037 agggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 21136  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  21137 gtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagc 21236  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  21237 tcaattggtgaat 21249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 13983 - 14194
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  13983 agggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaat-cgtgctcttgct 14081  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14082 gtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  14182 tcaattggtgaat 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 9272 - 9482
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  9272 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgct 9369  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||    
T  9370 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 9469  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  9470 tcaattggtgaat 9482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 16170 - 16380
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  16170 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgct 16267  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||    
T  16268 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 16367  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  16368 tcaattggtgaat 16380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3281 - 3081
Alignment:
Q  164 attatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgt 263  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3281 attatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgt 3182  T
Q  264 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaa 363  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  3181 ttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaa 3082  T
Q  364 t 364  Q
    |    
T  3081 t 3081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 154
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  363 agggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcat-tgctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 267  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  266 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgc 167  T
Q  352 taaattggtgaat 364  Q
    | |||||||||||    
T  166 tcaattggtgaat 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43302 - 43116
Alignment:
Q  179 tgtaattttgcatatt-ctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 277  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  43302 tgtaattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaat 43203  T
Q  278 tgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43202 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattggtgaat 43116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39435 - 39222
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  39435 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 39336  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  39335 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 39237  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  39236 tgcttaattgatgaa 39222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 64445 - 64661
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  64445 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 64543  T
Q  252 gtgatgttatgtttgtatgcatga-----attgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatat 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||     ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  64544 gtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatat 64643  T
Q  347 tatgctaaattggtgaat 364  Q
    | |||| |||||||||||    
T  64644 tgtgctcaattggtgaat 64661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 108078 - 107865
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||        
T  108078 agggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaac 107979  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||| ||    
T  107978 tgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtg 107879  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  107878 ctcaattggtgaat 107865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 5148 - 5349
Alignment:
Q  164 attatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatg 262  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||     
T  5148 attatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 5247  T
Q  263 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtga 362  Q
    ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  5248 ttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtga 5347  T
Q  363 at 364  Q
    ||    
T  5348 at 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4042 - 3863
Alignment:
Q  164 attatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatg 262  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4042 attatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatt 3943  T
Q  263 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatg-caaaaatgataagttatg 341  Q
    ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  3942 ttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatg 3863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5647
Alignment:
Q  219 atgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcat 318  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  5792 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 5693  T
Q  319 atatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  5692 atatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaat 5647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12364 - 12231
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | || || ||||||    
T  12364 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaat 12265  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  12264 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaat 12231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 360
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3723
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3693  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggt 360  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  3694 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggt 3723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1242
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1276  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  1275 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19324
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 19358  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  19357 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 19324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21408
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 21442  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  21441 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 21408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123309
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 123275  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  123276 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 123309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 364
Target Start/End: Original strand, 36928 - 37058
Alignment:
Q  234 taaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 333  Q
    |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36928 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat 37027  T
Q  334 aagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  37028 aagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaat 37058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 8996
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9030  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    | |||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  9029 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 8996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6209
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6076 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6175  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
     ||||||| | || ||| |||| |||||||||||    
T  6176 aataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaat 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 968 - 1101
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  968 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1067  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
     ||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  1068 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaat 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48305
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaat 48339  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  48338 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 48305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 148952 - 148839
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  148952 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 148853  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    || |||||||||||    
T  148852 ctcaattggtgaat 148839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8967
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9001  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  9000 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 8967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41766
Alignment:
Q  234 taaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 333  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||      
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtg 41797  T
Q  334 aagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| |||| ||| || | |||||||||||    
T  41796 aagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaat 41766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8325
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 8325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26560
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 26526  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| | || |||||||||||    
T  26527 gataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaat 26560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13757 - 13624
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  13757 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 13658  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |  ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  13657 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaat 13624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51327
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaat 51293  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  51294 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 51327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 1438 - 1602
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1438 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 1537  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  1538 tgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 315
Target Start/End: Original strand, 10279 - 10427
Alignment:
Q  168 tcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttg 266  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||      
T  10279 tcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttct 10378  T
Q  267 tatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10379 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 317
Target Start/End: Original strand, 34472 - 34558
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34472 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 34558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45348 - 45198
Alignment:
Q  167 atcataatcatgtgtaatt-ttgcatattctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtt 264  Q
    |||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  45348 atcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctatttt 45249  T
Q  265 tgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45248 gatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 54734 - 54584
Alignment:
Q  167 atcataatcatgtgtaatt-ttgcatattctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtt 264  Q
    |||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||  |||| ||||||| ||| ||    
T  54734 atcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctatttt 54635  T
Q  265 tgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54634 cttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtt 54584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 546 - 679
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 645  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||| |||| |||| ||| | || |||||||||||    
T  646 gatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaat 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89599
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 89565  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
     ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  89566 tataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 89599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 172136 - 172023
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||| ||    
T  172136 tgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 172037  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||||    
T  172036 ctaaattggtgaat 172023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 177839 - 177726
Alignment:
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 350  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||| ||    
T  177839 tgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 177740  T
Q  351 ctaaattggtgaat 364  Q
    ||||||||||||||    
T  177739 ctaaattggtgaat 177726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 1499 - 1663
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||     
T  1499 agggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgc 1598  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1599 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2725 - 2560
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaa--ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttg 249  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  2725 agggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttg 2626  T
Q  250 ttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
      |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2625 ccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 257
Target Start/End: Original strand, 10672 - 10778
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  10672 agggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgt 10771  T
Q  251 tgtgatg 257  Q
    |||||||    
T  10772 tgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3449 - 3360
Alignment:
Q  223 ataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3449 ataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Original strand, 5101 - 5206
Alignment:
Q  259 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattg 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  5101 tatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 5200  T
Q  359 gtgaat 364  Q
    ||||||    
T  5201 gtgaat 5206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41847
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaat 41881  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaat 364  Q
    ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||    
T  41880 gataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 41847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 7380 - 7544
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  7380 agggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgt 7479  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  7480 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31641 - 31428
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  31641 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 31542  T
Q  251 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatatta 348  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  31541 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-atta 31443  T
Q  349 tgctaaattggtgaa 363  Q
    |||| ||||| ||||    
T  31442 tgcttaattgatgaa 31428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39814
Alignment:
Q  194 tctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatg 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  294 attgttggtgaaattacatgtt 315  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtt 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3579
Alignment:
Q  184 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 283  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  284 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttca 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 54173 - 54040
Alignment:
Q  184 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 283  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| | | ||  | ||||||||||||||     
T  54173 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatga 54074  T
Q  284 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttca 317  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  54073 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 54040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 272248 - 272143
Alignment:
Q  259 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattg 358  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  272248 tatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattg 272149  T
Q  359 gtgaat 364  Q
    ||||||    
T  272148 gtgaat 272143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29494 - 29388
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||     
T  29494 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 29395  T
Q  251 tgtgatg 257  Q
    |||||||    
T  29394 tgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22803 - 22666
Alignment:
Q  219 atgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcat 318  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||       
T  22803 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 22704  T
Q  319 atatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||    
T  22703 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 22666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26921
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 26947  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  26946 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 26921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 360
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247583
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| | | ||||    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaat 247553  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaattggt 360  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  247554 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggt 247583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Original strand, 34097 - 34246
Alignment:
Q  167 atcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtt 264  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||    
T  34097 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctatttt 34195  T
Q  265 tgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34196 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1719
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 1693  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  1694 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 1719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37203
Alignment:
Q  231 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 330  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 37177  T
Q  331 gataagttatgaatattatgctaaat 356  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||    
T  37178 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 37203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6929 - 6829
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgt 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  6929 agggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 6830  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  6829 t 6829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7510 - 7441
Alignment:
Q  182 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 251  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  7510 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 7441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 23704 - 23769
Alignment:
Q  182 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctct 247  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  23704 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56195
Alignment:
Q  234 taaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Original strand, 12051 - 12149
Alignment:
Q  152 agggggttagggattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatg-ttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttg 249  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  12051 agggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14283 - 14198
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  14283 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttcata 14198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 108256 - 108171
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  108256 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 108171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Original strand, 1 - 84
Alignment:
Q  232 gctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8737 - 8626
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||| || || ||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  8737 aaattcgtgctcttgttgtgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 8638  T
Q  333 taagttatgaat 344  Q
    ||  ||||||||    
T  8637 tatattatgaat 8626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3498 - 3413
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3498 aaattcgtgcgcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 3413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27744 - 27659
Alignment:
Q  235 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  27744 aaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcata 27659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University