View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9645H-LTR4-TNT-insertion-2 (Length: 397)

Name: F9645H-LTR4-TNT-insertion-2
Description: F9645H-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9645H-LTR4-TNT-insertion-2
F9645H-LTR4-TNT-insertion-2
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (193-388)||(45120936-45121131)
chr7 (193-388)||(8997405-8997600)
chr7 (201-388)||(12779294-12779481)
chr7 (201-388)||(12784152-12784339)
chr7 (201-388)||(7038604-7038786)
chr7 (193-253)||(4102734-4102794)
chr7 (195-229)||(12779255-12779289)
chr7 (195-229)||(12784113-12784147)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (193-388)||(11602-11797)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (193-374)||(21733699-21733880)
chr5 (193-374)||(21811343-21811524)
chr5 (201-388)||(8426733-8426920)
chr5 (201-388)||(27882969-27883156)
chr5 (201-388)||(37374786-37374973)
chr5 (195-229)||(8426694-8426728)
chr5 (201-229)||(37374978-37375006)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (193-388)||(21396928-21397123)
chr2 (201-388)||(28664367-28664554)
chr2 (201-388)||(37823201-37823388)
chr2 (201-388)||(41918338-41918525)
chr2 (195-229)||(28664328-28664362)
chr2 (195-229)||(37823162-37823196)
chr2 (195-229)||(41918299-41918333)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (9-177)||(46636357-46636525)
chr1 (201-388)||(6309144-6309331)
chr1 (193-388)||(2342222-2342417)
chr1 (195-229)||(6309105-6309139)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (193-374)||(16491317-16491498)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (195-388)||(34640-34833)
chr3 (257-387)||(41761929-41762059)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (201-388)||(47131-47318)
scaffold0090 (195-229)||(47092-47126)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (201-388)||(25216711-25216898)
chr8 (195-388)||(7823714-7823907)
chr8 (195-388)||(30327349-30327542)
chr8 (201-388)||(25207203-25207390)
chr8 (193-387)||(35752481-35752675)
chr8 (257-387)||(33859947-33860077)
chr8 (195-229)||(25207164-25207198)
chr8 (195-229)||(25216672-25216706)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (201-388)||(35857793-35857980)
chr4 (201-388)||(49785023-49785210)
chr4 (257-387)||(31922991-31923121)
chr4 (195-229)||(35857985-35858019)
chr4 (195-229)||(49784984-49785018)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (269-387)||(13873-13991)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (201-299)||(14974-15069)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 193 - 388
Target Start/End: Original strand, 45120936 - 45121131
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120936 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 45121035  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45121036 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 45121131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 193 - 388
Target Start/End: Original strand, 8997405 - 8997600
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8997405 aggggagttgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatatatgtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgtgc 8997504  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8997505 caggaaacatgctcagctttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggcgatcaattg 8997600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 12779294 - 12779481
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12779294 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 12779393  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12779394 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 12779481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 12784152 - 12784339
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12784152 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggatgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagt 12784251  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    |  |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12784252 acactctgctttaggattacttgatgacgacaaatagtttatagatggtatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 12784339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7038786 - 7038604
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7038786 tgtactacatgaggatactattgactgttaagaagggctgcatgagatatagatg---aaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 7038690  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7038689 acgctctgctttaggattacttgatgacgac--agagtttatagatggtattacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 7038604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4102794 - 4102734
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatatagg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4102794 aggggagttgtactacatgaggatactattgactgttcagaagggttgcatgggatatagg 4102734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 12779255 - 12779289
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12779255 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 12779289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 12784113 - 12784147
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12784113 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 12784147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 193 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11797 - 11602
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11797 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacttatgacacgttc 11698  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11697 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgatgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 11602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Original strand, 21733699 - 21733880
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21733699 aggggagttgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 21733798  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21733799 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgatgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggtt 21733880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Original strand, 21811343 - 21811524
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21811343 aggggagttgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgatcaatggacatacctatgacacgttc 21811442  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21811443 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgatgacaaagagtttttagatggtatcatggaaaatgctgagttaggtt 21811524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 8426733 - 8426920
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8426733 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 8426832  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8426833 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 8426920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27883156 - 27882969
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27883156 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 27883057  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27883056 acgctctgctttaggattacttgatggcgacagagagtttatagatggtatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 27882969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 37374973 - 37374786
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37374973 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggttgtatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 37374874  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | || |  |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37374873 acgcgctgctttaggatcacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggcaatcaattg 37374786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 8426694 - 8426728
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8426694 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 8426728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37375006 - 37374978
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375006 tgtactacatgaggatactattgaccgtt 37374978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 193 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21397123 - 21396928
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21397123 aggggagttgtactacatgaggataatgttgactgttcagaagggttgcatgggatatagttgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 21397024  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21397023 caggaagcatgctcagctttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 21396928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 28664367 - 28664554
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28664367 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 28664466  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28664467 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 28664554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 37823201 - 37823388
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37823201 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 37823300  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37823301 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 37823388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 41918338 - 41918525
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41918338 tgtactacacgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccagaaagc 41918437  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41918438 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 41918525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 28664328 - 28664362
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28664328 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 28664362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 37823162 - 37823196
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37823162 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 37823196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 41918299 - 41918333
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41918299 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 41918333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46636525 - 46636357
Alignment:
Q  9 tcaagtggcatatatagatgttttattgtcaactactataaaattttgtgtaattcagtttcttccaaaatcactgtgaaaataaaaaccaagtcttcat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46636525 tcaagtggcatatatagatgttttattgtcaactactataaaattttgtgtaattcagtttcttccaaaatcactgtgaaaataaaagccaagtcttcat 46636426  T
Q  109 aattagttaaactgaagacggtagagtaggtaataaaatccatgggaaggaattaccacaagaagaatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46636425 aattagttaaactgaagacggtagagtaggtaataaaatccatgggaaggaattaccacaagaagaatt 46636357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 6309144 - 6309331
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6309144 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaaggggtgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatggcacgttccaggaagc 6309243  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6309244 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatggtatcacggaaattggtgagttaggttcgggccatcaattg 6309331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2342417 - 2342222
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2342417 aggggagttgtactacacaaggatactattgagcattcagaagggttgcctgggatatagttgcataaaaatgattaattgacatacctatgacatgttc 2342318  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  2342317 caggaagcatgctctgctttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaattggtgagttatgttcgggccatcaattg 2342222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 6309105 - 6309139
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6309105 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 6309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16491498 - 16491317
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16491498 aggggagttgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgatcaatggacatacctatgacacgttc 16491399  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16491398 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgatgacaaagagtttttagatggtatcatggaaaatgctgagttaggtt 16491317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 195 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34833 - 34640
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttcca 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34833 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggttgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttcca 34734  T
Q  295 ggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34733 ggaagcacgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatggtatcacggaaaatggtgagttacgttcgggccatcaattg 34640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 257 - 387
Target Start/End: Original strand, 41761929 - 41762059
Alignment:
Q  257 ataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacgg 356  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41761929 ataaaaacagttaatggacatacctatgacacgttccaggaagcatgctctgctttgggattacttgatgatgacagagagtttatagatggtatcacgg 41762028  T
Q  357 aaaatgctgagttaggttcgggccatcaatt 387  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41762029 aaaatggtgagttaggttcgggcaatcaatt 41762059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 47131 - 47318
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47131 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 47230  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47231 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 47318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 47092 - 47126
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47092 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 47126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 25216711 - 25216898
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25216711 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 25216810  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25216811 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 25216898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 195 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7823907 - 7823714
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttcca 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7823907 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgttgagaagggctgcatgagatatagatgcatacaaacgattaatggacatacctatgacgcgttcca 7823808  T
Q  295 ggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
     |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7823807 agaagcacgctctactttaggattatttgatgacgacagagagtttatagatggtatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 7823714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 195 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30327542 - 30327349
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttcca 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30327542 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggttgcatgagatatagctgcataaaaatgattaatggacatacctatgacacgttcca 30327443  T
Q  295 ggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30327442 ggaagcacgctatactttaggattacttgatgacgatagagagtttatagatgatatcacggaaaatggcgagttaggttcgggccatcaattg 30327349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 25207203 - 25207390
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207203 tgtactacatgaggatactattgatcgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 25207302  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25207303 acgctctgctttaggattacttgatgtcgacagagagtttattgattgtatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 25207390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35752675 - 35752481
Alignment:
Q  193 aggggagctgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35752675 aggggagctgtactacatgaggataatgttgaccgttcagaagggttgcatgggatatatttacataaaaacagttaatggacatacctatgacacgttc 35752576  T
Q  293 caggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaatt 387  Q
    || ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  35752575 caagaagcatgctatgctttaggattacttgatgacgacatagagtttatagatggtattacggaaaatggtgagtttggttcgggtcaacaatt 35752481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 257 - 387
Target Start/End: Original strand, 33859947 - 33860077
Alignment:
Q  257 ataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacgg 356  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33859947 ataaaaacagttaatggacatacctatgacacgttccaggaagcatgctctgctttgggattacttgatgatgacagagagtttatagatggtatcacgg 33860046  T
Q  357 aaaatgctgagttaggttcgggccatcaatt 387  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33860047 aaaatggtgagttaggttcgggcaatcaatt 33860077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 25207164 - 25207198
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25207164 gggagctgtactacatgaggatagtattgaccgtt 25207198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 25216672 - 25216706
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25216672 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 25216706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35857980 - 35857793
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35857980 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 35857881  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35857880 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 35857793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 388
Target Start/End: Original strand, 49785023 - 49785210
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49785023 tgtactacatgaggatactattgaccgttaagaagggctgcatgagatatagatgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagc 49785122  T
Q  301 atgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagttaggttcgggccatcaattg 388  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49785123 acgctctgctttaggattacttgatgacgacagagagtttatagatgatatcacggaaaatggtgagttaggttcgggccatcaattg 49785210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 257 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31923121 - 31922991
Alignment:
Q  257 ataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacgg 356  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31923121 ataaaaacagttaatggacatacctatgacacgttccaggaagcatgctctgctttgggattacttgatgatgacagagagtttatagatggtatcacgg 31923022  T
Q  357 aaaatgctgagttaggttcgggccatcaatt 387  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31923021 aaaatggtgagttaggttcgggcaatcaatt 31922991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35858019 - 35857985
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35858019 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 35857985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 49784984 - 49785018
Alignment:
Q  195 gggagctgtactacatgaggatactattgaccgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49784984 gggagttgtactacatgaggatactattgaccgtt 49785018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 387
Target Start/End: Original strand, 13873 - 13991
Alignment:
Q  269 aatggacatacctatgacacgttccaggaagcatgctcaactttgggattacttgatgacgacaaagagtttatagatggtatcacggaaaatgctgagt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  13873 aatggacatacctatgacacgttccacgaagcatgctctgctttgggattacttgatgatgacagagagtttatagatggtatcacagaaaattgtgagt 13972  T
Q  369 taggttcgggccatcaatt 387  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  13973 taggtttgggcaatcaatt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15069 - 14974
Alignment:
Q  201 tgtactacatgaggatactattgaccgttcagaagggttgcatgggatataggtgcataaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069 tgtactacatgaggatactattgactgttaagaagggctgcatgagatatagatg---aaaaacgattaatggacatacctatgacacgttccaggaag 14974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 901 times since January 2019
Visitors: 1113