View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9655H-LTR4-TNT-insertion-14 (Length: 800)

Name: F9655H-LTR4-TNT-insertion-14
Description: F9655H-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9655H-LTR4-TNT-insertion-14
F9655H-LTR4-TNT-insertion-14
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (10-404)||(495432-495826)
chr1 (399-800)||(20335183-20335584)
chr1 (399-800)||(3646233-3646634)
chr1 (399-800)||(10967755-10968156)
chr1 (399-800)||(28154826-28155228)
chr1 (399-800)||(10950167-10950568)
chr1 (399-800)||(16202801-16203202)
chr1 (399-800)||(21892514-21892915)
chr1 (399-800)||(51643308-51643709)
chr1 (399-797)||(28590173-28590571)
chr1 (399-800)||(41788077-41788478)
chr1 (625-800)||(20466066-20466241)
chr1 (483-800)||(13455842-13456159)
chr1 (477-773)||(22491114-22491410)
chr1 (27-151)||(492007-492129)
chr1 (568-797)||(5626958-5627187)
chr1 (163-200)||(492151-492188)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (399-800)||(15381010-15381411)
chr4 (399-800)||(17018147-17018548)
chr4 (399-800)||(18311945-18312346)
chr4 (399-800)||(36339284-36339685)
chr4 (399-800)||(39855738-39856139)
chr4 (399-800)||(18795381-18795782)
chr4 (399-800)||(27158084-27158485)
chr4 (399-800)||(54838492-54838893)
chr4 (399-797)||(40100404-40100802)
chr4 (399-800)||(5010976-5011377)
chr4 (399-800)||(6574959-6575360)
chr4 (399-800)||(14103644-14104045)
chr4 (399-800)||(14754259-14754660)
chr4 (399-800)||(14670114-14670515)
chr4 (399-800)||(24117763-24118164)
chr4 (399-800)||(24587128-24587529)
chr4 (399-800)||(34183726-34184128)
chr4 (399-800)||(20333188-20333589)
chr4 (399-797)||(21974805-21975203)
chr4 (399-800)||(15232917-15233318)
chr4 (406-800)||(5699636-5700030)
chr4 (399-797)||(31121279-31121677)
chr4 (399-800)||(1905355-1905753)
chr4 (399-800)||(30758861-30759262)
chr4 (414-800)||(33668582-33668968)
chr4 (399-800)||(15277394-15277795)
chr4 (484-800)||(22144445-22144761)
chr4 (481-800)||(1879972-1880291)
chr4 (477-773)||(19769443-19769739)
chr4 (477-773)||(14723668-14723964)
chr4 (595-776)||(55786233-55786414)
chr4 (484-542)||(17297276-17297334)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (399-799)||(24205-24605)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (399-800)||(22075653-22076054)
chr8 (399-800)||(18795791-18796192)
chr8 (399-800)||(18714571-18714972)
chr8 (399-800)||(19679534-19679935)
chr8 (399-800)||(44566071-44566472)
chr8 (399-800)||(2131988-2132389)
chr8 (399-800)||(9359712-9360113)
chr8 (399-800)||(19911890-19912291)
chr8 (399-800)||(27603633-27604034)
chr8 (399-800)||(28356680-28357081)
chr8 (399-800)||(15772661-15773062)
chr8 (399-800)||(19693186-19693587)
chr8 (399-800)||(33247457-33247858)
chr8 (399-800)||(33263821-33264222)
chr8 (399-800)||(12087451-12087852)
chr8 (399-800)||(21342899-21343300)
chr8 (399-800)||(29834412-29834813)
chr8 (399-800)||(31484599-31485000)
chr8 (399-800)||(16288039-16288441)
chr8 (399-800)||(19203090-19203491)
chr8 (399-800)||(31359615-31360016)
chr8 (399-800)||(19656068-19656469)
chr8 (399-800)||(22137997-22138398)
chr8 (601-800)||(14562711-14562910)
chr8 (399-599)||(14568447-14568647)
chr8 (481-800)||(16770386-16770705)
chr8 (477-773)||(14214129-14214425)
chr8 (477-773)||(22414028-22414324)
chr8 (490-800)||(19846226-19846536)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (399-800)||(29885861-29886262)
chr5 (399-800)||(11328732-11329133)
chr5 (399-800)||(31436559-31436960)
chr5 (399-800)||(11554450-11554851)
chr5 (399-800)||(13319494-13319895)
chr5 (399-800)||(18123080-18123481)
chr5 (399-800)||(23631064-23631465)
chr5 (399-800)||(5642883-5643284)
chr5 (399-800)||(28654338-28654739)
chr5 (399-800)||(33297623-33298024)
chr5 (399-800)||(12137270-12137671)
chr5 (399-800)||(15653421-15653822)
chr5 (399-800)||(15753516-15753917)
chr5 (399-800)||(22993781-22994182)
chr5 (399-800)||(26485489-26485890)
chr5 (399-800)||(30034523-30034924)
chr5 (399-800)||(32590938-32591339)
chr5 (399-800)||(37746993-37747394)
chr5 (399-800)||(40468214-40468615)
chr5 (399-797)||(30157129-30157527)
chr5 (399-800)||(6879400-6879801)
chr5 (399-800)||(13181457-13181858)
chr5 (399-800)||(13437347-13437748)
chr5 (399-800)||(24974942-24975343)
chr5 (399-800)||(30173564-30173965)
chr5 (399-800)||(37760078-37760479)
chr5 (399-800)||(41679800-41680201)
chr5 (399-797)||(8660139-8660537)
chr5 (399-797)||(9322574-9322972)
chr5 (399-800)||(9545373-9545774)
chr5 (399-800)||(31821071-31821472)
chr5 (399-800)||(33782580-33782981)
chr5 (399-800)||(43083350-43083751)
chr5 (399-797)||(3794639-3795037)
chr5 (406-800)||(23896970-23897364)
chr5 (399-800)||(2516157-2516558)
chr5 (399-800)||(18495389-18495790)
chr5 (399-800)||(34621613-34622014)
chr5 (399-800)||(37353307-37353708)
chr5 (399-800)||(22893506-22893907)
chr5 (399-800)||(30939730-30940131)
chr5 (399-800)||(37666150-37666551)
chr5 (399-797)||(18370198-18370596)
chr5 (399-797)||(33521478-33521876)
chr5 (399-800)||(33880223-33880624)
chr5 (399-800)||(24729064-24729465)
chr5 (399-800)||(28954449-28954850)
chr5 (399-800)||(25205373-25205774)
chr5 (399-800)||(25269528-25269929)
chr5 (484-800)||(349988-350304)
chr5 (477-773)||(3481969-3482265)
chr5 (625-800)||(20386903-20387078)
chr5 (568-797)||(31522381-31522610)
chr5 (595-776)||(34470717-34470898)
chr5 (568-797)||(36373819-36374048)
chr5 (568-797)||(36998473-36998702)
chr5 (568-797)||(5438082-5438311)
chr5 (568-797)||(11942279-11942508)
chr5 (580-797)||(15782594-15782811)
chr5 (595-776)||(24065050-24065231)
chr5 (568-770)||(17959198-17959400)
chr5 (481-536)||(20375401-20375456)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (399-800)||(28110764-28111165)
chr3 (399-800)||(4791445-4791846)
chr3 (399-797)||(17979759-17980157)
chr3 (399-800)||(4341486-4341887)
chr3 (399-800)||(5591167-5591568)
chr3 (399-800)||(6537552-6537953)
chr3 (399-800)||(32444200-32444601)
chr3 (399-800)||(4628834-4629235)
chr3 (399-800)||(4688704-4689105)
chr3 (399-800)||(4726679-4727080)
chr3 (399-800)||(7078255-7078656)
chr3 (399-800)||(8284279-8284680)
chr3 (399-800)||(10401193-10401594)
chr3 (399-800)||(16619300-16619701)
chr3 (399-800)||(17971671-17972072)
chr3 (399-800)||(18247790-18248191)
chr3 (399-800)||(4421964-4422365)
chr3 (399-800)||(5604124-5604525)
chr3 (399-800)||(10648122-10648523)
chr3 (399-800)||(18056311-18056712)
chr3 (399-800)||(18335679-18336080)
chr3 (399-800)||(22382388-22382789)
chr3 (399-800)||(31959265-31959666)
chr3 (406-800)||(18230245-18230639)
chr3 (399-800)||(8001609-8002010)
chr3 (399-800)||(8216683-8217084)
chr3 (399-800)||(16421234-16421635)
chr3 (399-800)||(18302464-18302865)
chr3 (399-800)||(21679752-21680153)
chr3 (399-800)||(22865658-22866059)
chr3 (399-800)||(22880717-22881118)
chr3 (399-800)||(28026330-28026731)
chr3 (399-800)||(29143566-29143967)
chr3 (399-800)||(32295677-32296078)
chr3 (399-800)||(5472037-5472438)
chr3 (399-800)||(6206953-6207354)
chr3 (399-800)||(15735904-15736305)
chr3 (399-800)||(18287163-18287564)
chr3 (399-800)||(19699538-19699939)
chr3 (399-800)||(31031046-31031447)
chr3 (399-800)||(35885815-35886216)
chr3 (399-800)||(5657183-5657587)
chr3 (399-800)||(5716122-5716524)
chr3 (399-800)||(5727032-5727434)
chr3 (399-800)||(5764934-5765336)
chr3 (399-800)||(5018763-5019164)
chr3 (399-800)||(20071089-20071490)
chr3 (399-800)||(24333212-24333613)
chr3 (399-800)||(29659780-29660181)
chr3 (399-800)||(47028502-47028903)
chr3 (399-800)||(48470976-48471377)
chr3 (399-800)||(51787072-51787473)
chr3 (399-800)||(11105169-11105570)
chr3 (399-800)||(15887515-15887916)
chr3 (399-800)||(28344226-28344626)
chr3 (399-800)||(20571653-20572054)
chr3 (481-800)||(4451800-4452119)
chr3 (484-800)||(6961352-6961668)
chr3 (577-773)||(6573406-6573602)
chr3 (477-773)||(7086956-7087252)
chr3 (477-773)||(11923270-11923566)
chr3 (477-773)||(22961505-22961801)
chr3 (477-773)||(16433457-16433752)
chr3 (598-773)||(15706525-15706700)
chr3 (595-776)||(20445166-20445347)
chr3 (568-797)||(37258712-37258941)
chr3 (568-797)||(46382362-46382591)
chr3 (568-770)||(5948805-5949007)
chr3 (598-773)||(15582141-15582316)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (399-800)||(16444658-16445059)
chr7 (399-800)||(4204474-4204875)
chr7 (399-800)||(26440342-26440743)
chr7 (399-800)||(24587186-24587587)
chr7 (399-800)||(2104815-2105216)
chr7 (399-800)||(2159659-2160060)
chr7 (399-800)||(16513082-16513483)
chr7 (399-800)||(26532525-26532926)
chr7 (399-800)||(45736392-45736793)
chr7 (399-800)||(11419431-11419832)
chr7 (399-800)||(16733178-16733579)
chr7 (399-800)||(16746169-16746570)
chr7 (399-800)||(26314500-26314901)
chr7 (399-800)||(31559042-31559443)
chr7 (406-800)||(31085281-31085675)
chr7 (399-800)||(5141992-5142393)
chr7 (399-800)||(5153169-5153570)
chr7 (399-800)||(5163468-5163869)
chr7 (399-800)||(26510348-26510749)
chr7 (399-800)||(39207791-39208192)
chr7 (399-800)||(45392305-45392706)
chr7 (399-800)||(2778339-2778740)
chr7 (399-800)||(10911521-10911922)
chr7 (399-797)||(26679758-26680156)
chr7 (399-800)||(11445972-11446373)
chr7 (399-800)||(31128992-31129393)
chr7 (399-797)||(26664566-26664964)
chr7 (399-800)||(4139898-4140299)
chr7 (399-800)||(26269738-26270139)
chr7 (399-800)||(26517877-26518278)
chr7 (399-800)||(3450391-3450792)
chr7 (400-800)||(16046400-16046800)
chr7 (399-800)||(10846705-10847106)
chr7 (481-800)||(1891333-1891652)
chr7 (477-773)||(2558623-2558919)
chr7 (477-776)||(29091601-29091900)
chr7 (477-773)||(15195171-15195467)
chr7 (598-773)||(16239504-16239679)
chr7 (477-707)||(16125596-16125826)
chr7 (595-776)||(16285251-16285432)
chr7 (568-770)||(9471407-9471609)
chr7 (568-770)||(16391279-16391481)
chr7 (568-770)||(30367791-30367993)
chr7 (484-536)||(13482966-13483018)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (399-800)||(37382764-37383165)
chr2 (399-797)||(32054893-32055291)
chr2 (399-797)||(37680651-37681049)
chr2 (399-797)||(37695916-37696314)
chr2 (399-800)||(12591895-12592296)
chr2 (399-800)||(28887366-28887767)
chr2 (399-800)||(20843000-20843401)
chr2 (399-800)||(27429197-27429598)
chr2 (399-800)||(31888247-31888648)
chr2 (399-800)||(34269676-34270077)
chr2 (399-800)||(39895156-39895557)
chr2 (399-797)||(37930459-37930857)
chr2 (399-800)||(27121611-27122012)
chr2 (399-800)||(27821078-27821479)
chr2 (399-800)||(37946618-37947019)
chr2 (399-800)||(27781321-27781722)
chr2 (399-800)||(3787580-3787981)
chr2 (399-800)||(19411257-19411658)
chr2 (399-800)||(21697926-21698327)
chr2 (399-800)||(23123325-23123726)
chr2 (406-800)||(31881373-31881767)
chr2 (399-800)||(11629940-11630341)
chr2 (399-800)||(34159931-34160332)
chr2 (406-797)||(21671938-21672329)
chr2 (406-800)||(22922911-22923305)
chr2 (399-800)||(255409-255810)
chr2 (399-800)||(12660624-12661025)
chr2 (399-800)||(16166567-16166968)
chr2 (399-800)||(34296241-34296642)
chr2 (399-800)||(39046575-39046976)
chr2 (399-797)||(16824094-16824492)
chr2 (399-797)||(16896988-16897386)
chr2 (399-800)||(13931303-13931704)
chr2 (399-800)||(27808790-27809191)
chr2 (399-800)||(19451179-19451580)
chr2 (399-800)||(34866771-34867172)
chr2 (399-800)||(9344742-9345143)
chr2 (399-800)||(12711357-12711758)
chr2 (399-800)||(40238595-40238996)
chr2 (481-800)||(26722138-26722457)
chr2 (481-800)||(34532305-34532624)
chr2 (477-773)||(42395625-42395921)
chr2 (477-776)||(34703163-34703462)
chr2 (595-776)||(21758591-21758772)
chr2 (568-770)||(12385753-12385955)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (399-800)||(16754906-16755307)
chr6 (399-800)||(24300467-24300868)
chr6 (399-800)||(27490218-27490619)
chr6 (399-800)||(8900413-8900814)
chr6 (399-800)||(13293661-13294062)
chr6 (399-800)||(16679225-16679626)
chr6 (399-800)||(22929594-22929995)
chr6 (399-800)||(23852039-23852440)
chr6 (399-800)||(26790901-26791302)
chr6 (399-800)||(27356820-27357221)
chr6 (399-794)||(27285074-27285469)
chr6 (399-800)||(4777965-4778366)
chr6 (399-800)||(27024222-27024623)
chr6 (399-800)||(27062591-27062992)
chr6 (399-800)||(27184014-27184415)
chr6 (399-800)||(27264824-27265225)
chr6 (399-800)||(29554643-29555044)
chr6 (399-800)||(29578099-29578500)
chr6 (399-800)||(33371141-33371542)
chr6 (399-800)||(4530370-4530771)
chr6 (399-800)||(4762848-4763249)
chr6 (399-800)||(29506501-29506902)
chr6 (399-800)||(34459216-34459617)
chr6 (399-800)||(4718845-4719246)
chr6 (399-800)||(26925855-26926256)
chr6 (399-800)||(27199270-27199671)
chr6 (399-800)||(27249563-27249964)
chr6 (399-800)||(28212539-28212940)
chr6 (399-800)||(4540484-4540885)
chr6 (399-800)||(14140104-14140505)
chr6 (399-800)||(15407243-15407644)
chr6 (399-800)||(15419030-15419431)
chr6 (399-800)||(24868801-24869202)
chr6 (399-800)||(26773337-26773738)
chr6 (399-800)||(28165576-28165977)
chr6 (399-797)||(30552726-30553124)
chr6 (399-800)||(26111122-26111523)
chr6 (399-800)||(27624421-27624822)
chr6 (399-800)||(27012816-27013218)
chr6 (399-800)||(13518904-13519305)
chr6 (399-800)||(16938737-16939138)
chr6 (399-800)||(20173632-20174033)
chr6 (399-800)||(22161958-22162359)
chr6 (481-800)||(27546963-27547282)
chr6 (647-800)||(17087401-17087554)
chr6 (477-773)||(18210481-18210777)
chr6 (477-800)||(21363450-21363773)
chr6 (477-800)||(23967432-23967755)
chr6 (477-773)||(18121557-18121853)
chr6 (601-800)||(25709015-25709214)
chr6 (568-797)||(9134256-9134485)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (399-800)||(5373-5774)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (399-800)||(17670-18071)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (399-800)||(746-1147)
scaffold0322 (399-800)||(11133-11534)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (399-800)||(25666-26067)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (399-800)||(9048-9449)
scaffold0143 (399-800)||(32381-32782)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (399-800)||(10357-10758)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (399-800)||(11112-11513)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (399-800)||(14659-15060)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (399-800)||(3946-4347)
scaffold0159 (399-800)||(13562-13963)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (399-800)||(20958-21359)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (399-800)||(13037-13438)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (399-800)||(5155-5556)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (399-800)||(11124-11525)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (406-800)||(9702-10096)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (399-800)||(41462-41880)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (484-800)||(16270-16586)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (598-773)||(87227-87402)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (599-773)||(12309-12483)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (589-797)||(32397-32605)
scaffold0160 (484-533)||(32661-32710)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (568-770)||(31264-31466)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (598-635)||(51131-51168)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 404
Target Start/End: Original strand, 495432 - 495826
Alignment:
Q  10 aagaatattgatgctcaaaaataggacttgttgtatctagagttggaaattgctccaaagcaatgtatcgcgtccatatcttgtactgacgggggtggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  495432 aagaatattgatgctcaaaaataggacttgttgtatctagagttggaaattgctccaaagcaatgtatcgcgtccatatcttgtactgacgggggtggtg 495531  T
Q  110 gttcaaccgccttctcagtgttggactctgccctggctgatgctcaccataaggtttgtttgatagatatgtaagcaagtgtctggttgagccgtgtaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  495532 gttcaaccgccttctcagtgttggactctgccctggctgatgttcaccataaggtttgtttgatagatatgtaagcaagtgtctggttgagccgtgtaca 495631  T
Q  210 actgtcactgagtttaaagttctctcactgtgatttttagaagttttagggtgcaatttttgatttattgtgatttgagtgtttccgaacacattttacg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  495632 actgtcactgagtttaaagttctctcactgtgatttttagaagttttagggtgtaatttttgatttattgtgatttgagtgtttccaaacacattttaag 495731  T
Q  310 tattttatttgcatgtctataatatggttaagggcaaataactttataaatgcaaaatgattattttaaacaatttgtgatcacttaaagaattc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  495732 tattttatttgcatgtctataatatggttaagggcaaataactttataaatgcaaaatgattattttaaacaatttgtgatcacttaaagaattc 495826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 20335183 - 20335584
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  20335183 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatgcatacgtttttcctcaaccaaa 20335282  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  20335283 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcaacctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 20335382  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20335383 cttccataccatatacaagagagaaaggggtttccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatcccatgccagtc 20335482  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20335483 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 20335582  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  20335583 tg 20335584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 3646634 - 3646233
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  3646634 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaccgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 3646535  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  3646534 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 3646435  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3646434 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 3646335  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  3646334 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 3646235  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  3646234 tg 3646233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10968156 - 10967755
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  10968156 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10968057  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  10968056 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10967957  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10967956 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 10967857  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10967856 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10967757  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  10967756 tg 10967755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28155228 - 28154826
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgat-acgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaa 497  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  28155228 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgattatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaa 28155129  T
Q  498 gttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaact 597  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  28155128 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 28155029  T
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28155028 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 28154929  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  28154928 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 28154829  T
Q  798 atg 800  Q
    |||    
T  28154828 atg 28154826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10950568 - 10950167
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  10950568 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10950469  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  10950468 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10950369  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10950368 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 10950269  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10950268 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10950169  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  10950168 tg 10950167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 16202801 - 16203202
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||     
T  16202801 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcatccttgcttgatatgactgtccacgaaccatgacatccatacgtttttcctcaaccaaa 16202900  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16202901 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16203000  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16203001 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgctagtc 16203100  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16203101 cttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16203200  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16203201 tg 16203202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 21892514 - 21892915
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  21892514 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21892613  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  21892614 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21892713  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21892714 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgctccggttgaactgtgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21892813  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  21892814 cttataagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 21892913  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  21892914 tg 21892915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 51643709 - 51643308
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  51643709 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 51643610  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  51643609 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 51643510  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51643509 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 51643410  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  51643409 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 51643310  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  51643309 tg 51643308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 28590571 - 28590173
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28590571 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgacagtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28590472  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  28590471 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 28590372  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28590371 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28590272  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  28590271 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 28590173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 41788077 - 41788478
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  41788077 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 41788176  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  41788177 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 41788276  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41788277 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 41788376  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  41788377 cttgtaggtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 41788476  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  41788477 tg 41788478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 625 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20466241 - 20466066
Alignment:
Q  625 ggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaa 724  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  20466241 ggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcaaagcatagggcaacatctcatgccaatctttgtaggtagttaccatcttctgaa 20466142  T
Q  725 caatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20466141 caatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttatgatg 20466066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 483 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 13456159 - 13455842
Alignment:
Q  483 cttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccact 582  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |||    
T  13456159 cttttcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcatctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaact 13456060  T
Q  583 tctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggta 682  Q
    ||||  || || |  || ||||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||    
T  13456059 tctacgggaagtatcgcttccataccatacaccaaagaaaaaggagttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcatagggta 13455960  T
Q  683 gcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtata 782  Q
     |||||||||||||||||| || ||    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||  ||||    
T  13455959 acatctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgaacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcgccattcatctggggtctata 13455860  T
Q  783 aagagaagagttatgatg 800  Q
    | ||||||||||||||||    
T  13455859 aggagaagagttatgatg 13455842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 22491410 - 22491114
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  22491410 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 22491311  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  22491310 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 22491211  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  22491210 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 22491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 151
Target Start/End: Original strand, 492007 - 492129
Alignment:
Q  27 aaaataggacttgttgtatctagagttggaaattgctccaaagcaatgt---atcgcgtccatatcttgtactgacgggggtggtggttcaaccgccttc 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||   || ||||||||||||||| ||     |||||||||||||||| |||||    
T  492007 aaaatatgacttgttgtatctagagttg-aagttgctccaatgcaatgtgtgattgcgtccatatcttgttcta----gggtggtggttcaaccaccttc 492101  T
Q  124 tcagtgttggactctgccctggctgatg 151  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  492102 tcggtgttagacactgccctggctgatg 492129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Original strand, 5626958 - 5627187
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  5626958 gatggaatttcgacttctacagggagtactgcctccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 5627057  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||  | || || || ||||||||    
T  5627058 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttctcagcttcgacagcaccatt 5627157  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  5627158 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 5627187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 200
Target Start/End: Original strand, 492151 - 492188
Alignment:
Q  163 gtttgtttgatagatatgtaagcaagtgtctggttgag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  492151 gtttgtttgatagataagtaagcaagtgtttggttgag 492188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15381010 - 15381411
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15381010 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 15381109  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15381110 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 15381209  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15381210 cctccataccatatactagagagaagggggtttccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 15381309  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15381310 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttaaga 15381409  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15381410 tg 15381411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 17018548 - 17018147
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  17018548 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 17018449  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  17018448 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17018349  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17018348 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17018249  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17018248 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 17018149  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  17018148 tg 17018147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 18311945 - 18312346
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18311945 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18312044  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18312045 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18312144  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18312145 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18312244  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18312245 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18312344  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18312345 tg 18312346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 36339284 - 36339685
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  36339284 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 36339383  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||| ||    
T  36339384 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaattg 36339483  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36339484 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 36339583  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  36339584 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 36339683  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  36339684 tg 36339685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 39856139 - 39855738
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  39856139 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39856040  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  39856039 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 39855940  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39855939 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 39855840  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39855839 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 39855740  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  39855739 tg 39855738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 18795381 - 18795782
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18795381 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18795480  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18795481 ttcaactgatcataccggctttggcaccattccgcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18795580  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18795581 cttccattccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18795680  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  18795681 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18795780  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18795781 tg 18795782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 27158084 - 27158485
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27158084 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27158183  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  27158184 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 27158283  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27158284 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27158383  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27158384 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27158483  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27158484 tg 27158485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 54838893 - 54838492
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  54838893 gaattctcgaggaaggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 54838794  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  54838793 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 54838694  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54838693 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 54838594  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  54838593 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatgttcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgtggtctataaggagaagagttatga 54838494  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  54838493 tg 54838492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 40100404 - 40100802
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  40100404 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 40100503  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  40100504 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 40100603  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40100604 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 40100703  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  40100704 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 40100802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5011377 - 5010976
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  5011377 gaattctcggggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 5011278  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5011277 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5011178  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5011177 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5011078  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  5011077 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5010978  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5010977 tg 5010976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 6575360 - 6574959
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  6575360 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagctgtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6575261  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  6575260 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6575161  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6575160 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6575061  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  6575060 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 6574961  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  6574960 tg 6574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14104045 - 14103644
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  14104045 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 14103946  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  14103945 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 14103846  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14103845 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14103746  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  14103745 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14103646  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  14103645 tg 14103644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 14754259 - 14754660
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  14754259 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 14754358  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  14754359 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 14754458  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14754459 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14754558  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  14754559 cttgtaagtagttaccattttctgtacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14754658  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  14754659 tg 14754660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14670515 - 14670114
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  14670515 gaattctcgaggatggacttttttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccatgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 14670416  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14670415 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaagggagaactg 14670316  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14670315 cttccataccatatacaagaaagaaaggggttgccccggttgaaccgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14670216  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  14670215 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14670116  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  14670115 tg 14670114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 24118164 - 24117763
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24118164 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24118065  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  24118064 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaaggaagaactg 24117965  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24117964 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24117865  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24117864 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24117765  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24117764 tg 24117763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 24587128 - 24587529
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24587128 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24587227  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  24587228 ttcaactgatcataccgactttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 24587327  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24587328 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24587427  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  24587428 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctaaggtctataaggagaagaattatga 24587527  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24587528 tg 24587529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 34183726 - 34184128
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggacttt-cttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaa 497  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  34183726 gaattctcgaggatggacttttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcctcaatcaa 34183825  T
Q  498 gttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaact 597  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  34183826 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 34183925  T
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34183926 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 34184025  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  34184026 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 34184125  T
Q  798 atg 800  Q
    |||    
T  34184126 atg 34184128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 20333188 - 20333589
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  20333188 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20333287  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  20333288 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 20333387  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20333388 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatttcatgccagtc 20333487  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  20333488 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20333587  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  20333588 tg 20333589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 21975203 - 21974805
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  21975203 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21975104  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  21975103 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21975004  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21975003 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21974904  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  21974903 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 21974805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 15233318 - 15232917
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  15233318 gaattctcgaggatggactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagtcatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 15233219  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  15233218 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15233119  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  15233118 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 15233019  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15233018 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccgttcatctgaggcctataaggagaagagttatga 15232919  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15232918 tg 15232917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 406 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5700030 - 5699636
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  5700030 cgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaact 5699931  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  5699930 ggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataattttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 5699831  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5699830 accatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatccttgtaa 5699731  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  5699730 gtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatg 5699636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 31121279 - 31121677
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31121279 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31121378  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31121379 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgatgactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31121478  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31121479 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31121578  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  31121579 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 31121677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 1905753 - 1905355
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  1905753 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttga---gactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcatcaaccaaa 1905657  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  1905656 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggggagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 1905557  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1905556 cttccataccatatgcaagagaaaaaggggttgccccggttgaactacgcactgtagtacggtagctatgcagagcatagggtaacatctcatgtcagtc 1905457  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1905456 cttgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcttcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 1905357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 30759262 - 30758861
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  30759262 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30759163  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  30759162 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 30759063  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30759062 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30758963  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  30758962 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 30758863  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  30758862 tg 30758861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 414 - 800
Target Start/End: Original strand, 33668582 - 33668968
Alignment:
Q  414 gactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatac 513  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33668582 gactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaactgatcatac 33668681  T
Q  514 ctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatata 613  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  33668682 cggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccataccatata 33668781  T
Q  614 ccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaac 713  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  33668782 caagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttgtaagtggttac 33668881  T
Q  714 catcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||||||||  |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  33668882 catcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 33668968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15277394 - 15277795
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || |    
T  15277394 gaattctcgaggacggaatttcttgtcaaagacagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 15277493  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  15277494 ttcaactgatcataccggctttggtaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15277593  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  15277594 cttccataccatatgcaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 15277693  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  15277694 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttattggctgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 15277793  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15277794 tg 15277795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 484 - 800
Target Start/End: Original strand, 22144445 - 22144761
Alignment:
Q  484 ttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccactt 583  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||   ||||||| |  || |  |  || |||||||| ||||    
T  22144445 ttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcaacttccatcaagaccctcaatgacgggatttcaactt 22144544  T
Q  584 ctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtag 683  Q
    ||| ||| || | ||| ||| | |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||  | ||| ||||| |     
T  22144545 ctaccggaagtattgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacgataaccatacaaagcgtagggcaa 22144644  T
Q  684 catctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataa 783  Q
    ||||||||||||||| || || |||   ||||||||||  || |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||  |||||    
T  22144645 catctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctgaggtctataa 22144744  T
Q  784 agagaagagttatgatg 800  Q
     ||||||||||||||||    
T  22144745 ggagaagagttatgatg 22144761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 800
Target Start/End: Original strand, 1879972 - 1880291
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttcca 580  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |    
T  1879972 cgcttctcctcaatcagattcaactgatcatatctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaa 1880071  T
Q  581 cttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcataggg 680  Q
    ||||||  || || |  || ||| ||||||| ||||  || || ||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1880072 cttctacgggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcaccgaagtacggtaaccatatagagcataggg 1880171  T
Q  681 tagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgta 780  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||  ||    
T  1880172 taacatttcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtcta 1880271  T
Q  781 taaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  1880272 taaggagaagagttatgatg 1880291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 19769739 - 19769443
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  19769739 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 19769640  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  19769639 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacagagcat 19769540  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||||||||    
T  19769539 agggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcgtgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 19769443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Original strand, 14723668 - 14723964
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  14723668 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 14723767  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  14723768 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 14723867  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||| | |||||||||||    
T  14723868 agggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactaccccattcatctg 14723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 595 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 55786414 - 55786233
Alignment:
Q  595 actgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgcc 694  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || |  |  ||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  55786414 actgcctccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtatagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgcc 55786315  T
Q  695 agtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    | || || |||||    ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  55786314 aatctttataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgagg 55786233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 484 - 542
Target Start/End: Original strand, 17297276 - 17297334
Alignment:
Q  484 ttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataa 542  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  17297276 ttttcttcaaacaaattcaactgatcatacctattctgacaccattcagcttcagataa 17297334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 399 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 24605 - 24205
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605 gaattcccgaggacagactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 24506  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24505 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcttcggataacttcgcttccatcattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactt 24406  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24405 cttccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaatcatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 24306  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24305 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttatga 24206  T
Q  799 t 799  Q
    |    
T  24205 t 24205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 22075653 - 22076054
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075653 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaaatggttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 22075752  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075753 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcgaataacttcgcttccatgattacacgaagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 22075852  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075853 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccgattgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 22075952  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22075953 cttgtaactagtaaccatcttctgaataatcttcttgatattcttgttggcggcttcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagttatga 22076052  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22076053 tg 22076054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18796192 - 18795791
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18796192 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18796093  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18796092 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18795993  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18795992 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18795893  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  18795892 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 18795793  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18795792 tg 18795791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18714972 - 18714571
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18714972 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18714873  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18714872 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18714773  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18714772 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 18714673  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  18714672 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18714573  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18714572 tg 18714571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19679935 - 19679534
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  19679935 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatacgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19679836  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  19679835 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 19679736  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19679735 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 19679636  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19679635 cttgtaagtggttaccatcttctggacgatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 19679536  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19679535 tg 19679534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 44566472 - 44566071
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  44566472 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 44566373  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  44566372 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 44566273  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44566272 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 44566173  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  44566172 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 44566073  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  44566072 tg 44566071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 2131988 - 2132389
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||     
T  2131988 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 2132087  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  2132088 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcaacctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaaggaagaactg 2132187  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2132188 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2132287  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2132288 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 2132387  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  2132388 tg 2132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 9360113 - 9359712
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  9360113 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 9360014  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  9360013 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 9359914  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9359913 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9359814  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  9359813 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 9359714  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  9359713 tg 9359712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 19911890 - 19912291
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  19911890 gaattctcgaggatggaccttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19911989  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  19911990 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19912089  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19912090 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtggtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 19912189  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19912190 cttgtaagtggttaccgtcttctggacaattctcttgatattcttgttggcagcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaatagttatga 19912289  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19912290 tg 19912291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 27603633 - 27604034
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27603633 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27603732  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27603733 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27603832  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27603833 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27603932  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27603933 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27604032  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27604033 tg 27604034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 28356680 - 28357081
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28356680 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttggtatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28356779  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  28356780 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacctccaaaggaagaactg 28356879  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28356880 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28356979  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28356980 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28357079  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28357080 tg 28357081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 15773062 - 15772661
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  15773062 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15772963  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  15772962 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacgaagagatgggatctccacttccagagggagaactg 15772863  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15772862 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15772763  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  15772762 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 15772663  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15772662 tg 15772661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19693587 - 19693186
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  19693587 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19693488  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  19693487 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcctccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19693388  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19693387 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgtgcattgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 19693288  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  19693287 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19693188  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19693187 tg 19693186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33247858 - 33247457
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  33247858 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33247759  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  33247758 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33247659  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33247658 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33247559  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  33247558 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33247459  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  33247458 tg 33247457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33264222 - 33263821
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  33264222 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33264123  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  33264122 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33264023  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33264022 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33263923  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33263922 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 33263823  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  33263822 tg 33263821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 12087451 - 12087852
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  12087451 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 12087550  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  12087551 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 12087650  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12087651 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12087750  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12087751 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 12087850  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  12087851 tg 12087852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 21342899 - 21343300
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||     
T  21342899 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactatccacgagccatggcatccatacatttttcctcaatcaaa 21342998  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  21342999 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcaaataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21343098  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21343099 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21343198  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21343199 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 21343298  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  21343299 tg 21343300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29834813 - 29834412
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  29834813 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29834714  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  29834713 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttacttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 29834614  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29834613 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactacgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 29834514  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  29834513 cttgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29834414  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  29834413 tg 29834412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 31484599 - 31485000
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31484599 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31484698  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31484699 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31484798  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31484799 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 31484898  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  31484899 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31484998  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31484999 tg 31485000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16288441 - 16288039
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaacc-atggcattcatacgcttttcttcaatcaa 497  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  16288441 gaattctcgaggatggaccttcttatcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaccgtccacgagcccatggcatccatacgtttttcctcaatcaa 16288342  T
Q  498 gttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaact 597  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  16288341 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcaaataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 16288242  T
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16288241 gcttccataccatatacaagagagaaaggtgttgccccggttgaactgcgcactatagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 16288142  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16288141 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 16288042  T
Q  798 atg 800  Q
    |||    
T  16288041 atg 16288039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 19203090 - 19203491
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  19203090 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19203189  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  19203190 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataaccttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 19203289  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19203290 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagcaatgcagagcatagggtaacatttcatgccagtc 19203389  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  19203390 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19203489  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19203490 tg 19203491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 31360016 - 31359615
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31360016 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31359917  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31359916 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31359817  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31359816 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgtacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 31359717  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  31359716 cttgtaagtggtcaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31359617  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31359616 tg 31359615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 19656068 - 19656469
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| || | ||      
T  19656068 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctccaccaga 19656167  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  19656168 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19656267  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19656268 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgtcctggttgaactgcgcacggtggtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 19656367  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  19656368 cttgtaagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19656467  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19656468 tg 19656469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22138398 - 22137997
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||     
T  22138398 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtctttattcttgcttgataggactgtccacgagccatggcatccatacgcttttcctcaaccaaa 22138299  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  22138298 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcggcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaaggaagaactg 22138199  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22138198 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22138099  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    | ||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  22138098 cctgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22137999  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22137998 tg 22137997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 601 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14562910 - 14562711
Alignment:
Q  601 tccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtcct 700  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14562910 tccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtcct 14562811  T
Q  701 tgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14562810 tgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 14562711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 399 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 14568647 - 14568447
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||     
T  14568647 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttcatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttttcaatcaaa 14568548  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  14568547 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgatcacacggagagatgggatctccactaccaaagggagaactg 14568448  T
Q  599 c 599  Q
    |    
T  14568447 c 14568447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 481 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16770705 - 16770386
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttcca 580  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |    
T  16770705 cgcttctcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaa 16770606  T
Q  581 cttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcataggg 680  Q
    ||||||  || || |  || ||| ||||||| ||||  || || ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  | |||||||||    
T  16770605 cttctacaggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcataggg 16770506  T
Q  681 tagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgta 780  Q
    || |||||||||||||||||| || ||    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  ||    
T  16770505 taacatctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgactgcaccattcatctggggtcta 16770406  T
Q  781 taaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  16770405 taaggagaagagttatgatg 16770386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 14214425 - 14214129
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  14214425 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 14214326  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  14214325 tcaacctctactggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 14214226  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  14214225 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 14214129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 22414324 - 22414028
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  22414324 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 22414225  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  22414224 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 22414125  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  22414124 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 22414028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 490 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19846536 - 19846226
Alignment:
Q  490 tcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacg 589  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  |  || || || || || ||||  |    
T  19846536 tcaatcaaattcaactggtcatacctgttttggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaggaaggaatctcaacctctattg 19846437  T
Q  590 ggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctc 689  Q
    | || || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| || ||||  | ||| || |||| ||| ||    
T  19846436 gtagtacagcctccataccatataccaaagaaaaaggggttgccccggtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgtaaggtaacatttc 19846337  T
Q  690 atgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaa 789  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||| | ||| | |||    
T  19846336 acgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatttgtggcctgtaaggggaa 19846237  T
Q  790 gagttatgatg 800  Q
    || ||||||||    
T  19846236 gaattatgatg 19846226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 29885861 - 29886262
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  29885861 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29885960  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  29885961 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgattccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 29886060  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29886061 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29886160  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29886161 cttataagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 29886260  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  29886261 tg 29886262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11329133 - 11328732
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  11329133 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcttcaatcaaa 11329034  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  11329033 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 11328934  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11328933 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11328834  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11328833 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 11328734  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11328733 tg 11328732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 31436960 - 31436559
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31436960 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31436861  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31436860 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31436761  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31436760 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31436661  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  31436660 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31436561  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31436560 tg 31436559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11554851 - 11554450
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  11554851 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11554752  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  11554751 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11554652  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11554651 cttccataccatatacaagagagaagggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11554552  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  11554551 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11554452  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11554451 tg 11554450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 13319494 - 13319895
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  13319494 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13319593  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  13319594 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 13319693  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13319694 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13319793  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13319794 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13319893  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13319894 tg 13319895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 18123080 - 18123481
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18123080 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18123179  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18123180 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18123279  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18123280 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18123379  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18123380 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18123479  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18123480 tg 18123481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23631465 - 23631064
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  23631465 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 23631366  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  23631365 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 23631266  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23631265 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 23631166  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23631165 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 23631066  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  23631065 tg 23631064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5643284 - 5642883
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5643284 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5643185  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5643184 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaagggagaactg 5643085  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5643084 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 5642985  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5642984 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaaccgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5642885  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5642884 tg 5642883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28654739 - 28654338
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28654739 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28654640  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  28654639 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 28654540  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28654539 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28654440  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  28654439 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 28654340  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28654339 tg 28654338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33298024 - 33297623
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  33298024 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33297925  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  33297924 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33297825  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33297824 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33297725  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33297724 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 33297625  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  33297624 tg 33297623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12137671 - 12137270
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  12137671 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 12137572  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  12137571 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 12137472  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12137471 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12137372  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  12137371 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 12137272  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  12137271 tg 12137270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15653421 - 15653822
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  15653421 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15653520  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  15653521 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 15653620  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15653621 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15653720  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15653721 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15653820  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15653821 tg 15653822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15753516 - 15753917
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  15753516 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15753615  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  15753616 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15753715  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15753716 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15753815  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15753816 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15753915  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15753916 tg 15753917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 22993781 - 22994182
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  22993781 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22993880  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22993881 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22993980  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22993981 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22994080  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  22994081 cttgtaagtggttaccatcttctagacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22994180  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22994181 tg 22994182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26485890 - 26485489
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  26485890 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 26485791  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  26485790 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26485691  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26485690 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26485591  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26485590 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26485491  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26485490 tg 26485489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 30034924 - 30034523
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  30034924 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30034825  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  30034824 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 30034725  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30034724 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30034625  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  30034624 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 30034525  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  30034524 tg 30034523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 32590938 - 32591339
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  32590938 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 32591037  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  32591038 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32591137  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32591138 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32591237  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32591238 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 32591337  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  32591338 tg 32591339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 37746993 - 37747394
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37746993 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37747092  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  37747093 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37747192  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37747193 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37747292  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37747293 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37747392  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  37747393 tg 37747394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 40468214 - 40468615
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  40468214 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 40468313  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  40468314 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 40468413  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40468414 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 40468513  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  40468514 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 40468613  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  40468614 tg 40468615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 30157527 - 30157129
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  30157527 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30157428  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  30157427 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 30157328  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30157327 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30157228  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  30157227 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 30157129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 6879801 - 6879400
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  6879801 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6879702  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  6879701 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6879602  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6879601 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6879502  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  6879501 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 6879402  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  6879401 tg 6879400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 13181457 - 13181858
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||     
T  13181457 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcttcaatcaaa 13181556  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  13181557 ttcaactgatcataccggcttcggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacgaagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 13181656  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13181657 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgtactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13181756  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  13181757 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13181856  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13181857 tg 13181858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 13437347 - 13437748
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  13437347 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13437446  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  13437447 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccgtgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13437546  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13437547 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcctcggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13437646  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  13437647 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13437746  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13437747 tg 13437748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 24975343 - 24974942
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24975343 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24975244  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  24975243 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24975144  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24975143 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24975044  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  24975043 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 24974944  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24974943 tg 24974942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 30173965 - 30173564
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  30173965 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30173866  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  30173865 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 30173766  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30173765 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30173666  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  30173665 cttgtaagtggtcaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 30173566  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  30173565 tg 30173564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 37760479 - 37760078
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37760479 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37760380  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  37760379 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37760280  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37760279 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37760180  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  37760179 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 37760080  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  37760079 tg 37760078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 41680201 - 41679800
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  41680201 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 41680102  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  41680101 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 41680002  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41680001 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 41679902  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||    
T  41679901 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctcaggtctatagggagaagagttatga 41679802  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  41679801 tg 41679800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 8660139 - 8660537
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  8660139 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8660238  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  8660239 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8660338  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8660339 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8660438  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  8660439 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 8660537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 9322972 - 9322574
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  9322972 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 9322873  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||    
T  9322872 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctctacttccaaaggaagaactg 9322773  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9322772 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9322673  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  9322672 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 9322574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 9545373 - 9545774
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||     
T  9545373 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcacccatacgtttttcctcaatcaaa 9545472  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  9545473 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 9545572  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9545573 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9545672  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  9545673 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 9545772  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  9545773 tg 9545774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 31821071 - 31821472
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31821071 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31821170  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  31821171 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataacttcacttccatgatcacacggagagaggggatctccacttccaaaggaagaactg 31821270  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31821271 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgtcagtc 31821370  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  31821371 cttgtaagtggttaccatcttctggacgatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31821470  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31821471 tg 31821472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33782981 - 33782580
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  33782981 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33782882  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  33782881 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 33782782  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33782781 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33782682  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  33782681 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33782582  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  33782581 tg 33782580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 43083751 - 43083350
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  43083751 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 43083652  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  43083651 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctctacttccaaaggaagaactg 43083552  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43083551 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacgatagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 43083452  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  43083451 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 43083352  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  43083351 tg 43083350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 3795037 - 3794639
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  3795037 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 3794938  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  3794937 ttcaactgatcataccggctttagcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 3794838  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3794837 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacacctcatgccagtc 3794738  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  3794737 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 3794639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 406 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23897364 - 23896970
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| | |||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  23897364 cgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcgtccatacgtttttcctcaaccaaattcaact 23897265  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  23897264 gatcataccggctttggcaccattcggcctcggataactttgcttccatgatcacatggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 23897165  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23897164 accatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcataggataacatctcatgccagtccttgtaa 23897065  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    || || ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  23897064 gtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 23896970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 2516558 - 2516157
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  2516558 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2516459  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  2516458 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2516359  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2516358 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2516259  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  2516258 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 2516159  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  2516158 tg 2516157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 18495389 - 18495790
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18495389 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18495488  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18495489 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18495588  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18495589 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtatggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18495688  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18495689 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18495788  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18495789 tg 18495790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 34622014 - 34621613
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34622014 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgctcgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34621915  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  34621914 ttcaactgatcataccggctttggcaccaatcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34621815  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34621814 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34621715  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34621714 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34621615  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  34621614 tg 34621613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 37353307 - 37353708
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37353307 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37353406  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  37353407 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37353506  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37353507 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 37353606  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37353607 cttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37353706  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  37353707 tg 37353708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22893907 - 22893506
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || |    
T  22893907 gaattctcgaggacggactctcttgtcgaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 22893808  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22893807 ttcaactgatcatacccgctttggcaccattaagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22893708  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22893707 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaatatctcatgccaatc 22893608  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  22893607 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagacgagttatga 22893508  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22893507 tg 22893506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 30940131 - 30939730
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  30940131 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcattcatacgtttttcctcaatcaaa 30940032  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||     
T  30940031 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcctcggatgactttgcttccatgatcacacagagagatgggatctccacttccaaaggaagaacta 30939932  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30939931 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcaccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccgtgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30939832  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  30939831 cttgtaagtggttaccattttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatttgaggtctataaggagaagagttatga 30939732  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  30939731 tg 30939730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 37666150 - 37666551
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37666150 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37666249  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  37666250 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37666349  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37666350 cttccataccgtatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatttcatgccagtc 37666449  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  37666450 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 37666549  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  37666550 tg 37666551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 18370198 - 18370596
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18370198 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18370297  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18370298 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataattttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18370397  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18370398 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18370497  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  18370498 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 18370596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 33521876 - 33521478
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  33521876 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33521777  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||    
T  33521776 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttcccaaggaagaactg 33521677  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33521676 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33521577  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  33521576 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 33521478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33880624 - 33880223
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  33880624 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33880525  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  33880524 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 33880425  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33880424 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33880325  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  33880324 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33880225  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  33880224 tg 33880223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 24729465 - 24729064
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24729465 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24729366  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  24729365 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24729266  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24729265 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24729166  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24729165 cttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24729066  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24729065 tg 24729064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 28954449 - 28954850
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||     
T  28954449 gaattctcgagaatggactttcttgtcaaaggcagtcttcatccttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgttttttctcaatcaaa 28954548  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||    
T  28954549 ttcaactgatcataccggccttggcaccattcagcctcagataattttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaaggactg 28954648  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28954649 cttccaaaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 28954748  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28954749 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28954848  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28954849 tg 28954850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 25205774 - 25205373
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||| | || ||| ||||| ||| |||||| || || |||| |||     
T  25205774 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcaatcttcatccttgcttgatatgactgtccgcgagccatgacatccatacgtttctcctcaaccaaa 25205675  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  25205674 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacgcggagagatgggatctccacttccaacggaagaactg 25205575  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||| ||    
T  25205574 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcataaggcaacatctcatgccaatc 25205475  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  25205474 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtcatga 25205375  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  25205374 tg 25205373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 25269929 - 25269528
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||| | || ||| ||||| ||| |||||| || || |||| |||     
T  25269929 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcaatcttcatccttgcttgatatgactgtccgcgagccatgacatccatacgtttctcctcaaccaaa 25269830  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  25269829 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacgcggagagatgggatctccacttccaacggaagaactg 25269730  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||| ||    
T  25269729 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcataaggcaacatctcatgccaatc 25269630  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  25269629 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtcatga 25269530  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  25269529 tg 25269528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 484 - 800
Target Start/End: Original strand, 349988 - 350304
Alignment:
Q  484 ttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccactt 583  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||  |||||||| |  || |  |  || |||||||| ||||    
T  349988 ttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcagcttccatcaagaccctcaatgacgggatttcaactt 350087  T
Q  584 ctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtag 683  Q
    ||| ||| || |  || ||| | |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||| |||||||  | ||| ||||| |     
T  350088 ctaccggaagtatcgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgtactgaagtacgataaccatacaaagcgtagggcaa 350187  T
Q  684 catctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataa 783  Q
    ||||||||||||||| || || |||   ||||||||||  || |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||  |||||    
T  350188 catctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctgaggtctataa 350287  T
Q  784 agagaagagttatgatg 800  Q
     ||||||||||||||||    
T  350288 ggagaagagttatgatg 350304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Original strand, 3481969 - 3482265
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| |||||     
T  3481969 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaagggatc 3482068  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  3482069 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 3482168  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  3482169 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 3482265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 625 - 800
Target Start/End: Original strand, 20386903 - 20387078
Alignment:
Q  625 ggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaa 724  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||| || ||    ||||||||||  |    
T  20386903 ggggttgcccctgttgaagtacgtactgaagtacggtaaccatacaaagtatagggtaacatctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgca 20387002  T
Q  725 caatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  20387003 caatcttcttaatattcttgtttgccgcttcgaccgcaccattcatctggggtctataaggagaagaattatgatg 20387078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 31522610 - 31522381
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  31522610 gatggaatttcgacttctacagggagtactgcctccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 31522511  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  31522510 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttcgcagcttcgacagcaccatt 31522411  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  31522410 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 31522381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 34470898 - 34470717
Alignment:
Q  595 actgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgcc 694  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  34470898 actgcctccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagacgtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgcc 34470799  T
Q  695 agtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    | || || |||||    ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  34470798 aatctttataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgagg 34470717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Original strand, 36373819 - 36374048
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  36373819 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgacgtgcgtacggaagtacgatatccat 36373918  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  36373919 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacggcaccatt 36374018  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  36374019 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 36374048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Original strand, 36998473 - 36998702
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  36998473 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgacgtgcgtacggaagtacgatatccat 36998572  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  36998573 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacggcaccatt 36998672  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  36998673 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 36998702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Original strand, 5438082 - 5438311
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  5438082 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 5438181  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  5438182 gtaatgcaaaggggagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccatt 5438281  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  5438282 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 5438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Original strand, 11942279 - 11942508
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  11942279 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 11942378  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| | |||||| || || || || || ||||||||    
T  11942379 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttagattcttatttgcagcttcgacggcaccatt 11942478  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  11942479 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 11942508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 580 - 797
Target Start/End: Original strand, 15782594 - 15782811
Alignment:
Q  580 acttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagg 679  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||  | || || |  ||||| || |||||||  ||| |||    
T  15782594 acttctacagggagtactgcctccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagg 15782693  T
Q  680 gtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgt 779  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||  |    
T  15782694 gaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttcgcagcttcgacagcaccattcatttgaggtct 15782793  T
Q  780 ataaagagaagagttatg 797  Q
     ||| | |||||||||||    
T  15782794 gtaaggtgaagagttatg 15782811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 595 - 776
Target Start/End: Original strand, 24065050 - 24065231
Alignment:
Q  595 actgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgcc 694  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || |  |  ||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  24065050 actgcctccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtatagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgcc 24065149  T
Q  695 agtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    | || || |||||    ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  24065150 aatctttataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgagg 24065231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 17959400 - 17959198
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  17959400 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctattgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 17959301  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  17959300 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccatt 17959201  T
Q  768 cat 770  Q
    |||    
T  17959200 cat 17959198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 536
Target Start/End: Original strand, 20375401 - 20375456
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctc 536  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  20375401 cgcttttcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctc 20375456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 28110764 - 28111165
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28110764 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaag 28110863  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  28110864 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 28110963  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28110964 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28111063  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  28111064 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 28111163  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28111164 tg 28111165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 4791445 - 4791846
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4791445 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4791544  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4791545 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4791644  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4791645 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4791744  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  4791745 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 4791844  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4791845 tg 4791846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 17979759 - 17980157
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  17979759 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaag 17979858  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  17979859 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17979958  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17979959 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17980058  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
     ||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  17980059 tttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 17980157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 4341486 - 4341887
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4341486 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4341585  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4341586 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4341685  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4341686 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4341785  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4341786 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4341885  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4341886 tg 4341887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 5591167 - 5591568
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5591167 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5591266  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5591267 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5591366  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5591367 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5591466  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5591467 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5591566  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5591567 tg 5591568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 6537552 - 6537953
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  6537552 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6537651  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  6537652 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6537751  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6537752 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6537851  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6537852 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 6537951  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  6537952 tg 6537953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 32444601 - 32444200
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  32444601 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 32444502  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  32444501 ttcaactgatcataccgggtttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32444402  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32444401 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtggtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32444302  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32444301 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 32444202  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  32444201 tg 32444200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4629235 - 4628834
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4629235 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4629136  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4629135 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4629036  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4629035 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4628936  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4628935 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4628836  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4628835 tg 4628834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4689105 - 4688704
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4689105 gaattctcgaggatggaccttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4689006  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4689005 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagtctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4688906  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4688905 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4688806  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4688805 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4688706  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4688705 tg 4688704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4727080 - 4726679
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4727080 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactatccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4726981  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  4726980 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaagggagaactg 4726881  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4726880 cttccataccatatacaagagaggaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 4726781  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4726780 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatacggagaagagttatga 4726681  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4726680 tg 4726679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 7078656 - 7078255
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  7078656 gaattcccgaggatgaactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 7078557  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  7078556 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 7078457  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7078456 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 7078357  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7078356 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 7078257  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  7078256 tg 7078255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 8284279 - 8284680
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  8284279 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8284378  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  8284379 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8284478  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8284479 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8284578  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8284579 cttataagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 8284678  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  8284679 tg 8284680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10401594 - 10401193
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  10401594 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10401495  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  10401494 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10401395  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10401394 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 10401295  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  10401294 cttgtaagtagttaccattttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 10401195  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  10401194 tg 10401193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 16619300 - 16619701
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  16619300 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 16619399  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16619400 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16619499  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  16619500 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 16619599  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16619600 tttgtaggtagttaccatcttctgaacaatcttctggatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagatatga 16619699  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16619700 tg 16619701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 17971671 - 17972072
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  17971671 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtctccattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 17971770  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  17971771 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17971870  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17971871 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17971970  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17971971 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 17972070  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  17972071 tg 17972072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18248191 - 18247790
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18248191 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18248092  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18248091 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18247992  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18247991 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18247892  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  18247891 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18247792  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18247791 tg 18247790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4422365 - 4421964
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4422365 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccccgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4422266  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  4422265 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 4422166  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4422165 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4422066  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4422065 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4421966  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4421965 tg 4421964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 5604124 - 5604525
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5604124 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5604223  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  5604224 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacgg 5604323  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5604324 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 5604423  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  5604424 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5604523  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5604524 tg 5604525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10648523 - 10648122
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  10648523 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10648424  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  10648423 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10648324  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10648323 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 10648224  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10648223 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10648124  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  10648123 tg 10648122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18056712 - 18056311
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18056712 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18056613  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18056612 ttcaactgatcataccggctctagcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18056513  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18056512 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18056413  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18056412 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 18056313  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18056312 tg 18056311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18336080 - 18335679
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18336080 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgtcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18335981  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18335980 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18335881  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18335880 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18335781  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  18335780 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18335681  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18335680 tg 18335679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 22382388 - 22382789
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  22382388 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22382487  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22382488 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22382587  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22382588 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22382687  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22382688 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 22382787  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22382788 tg 22382789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 31959265 - 31959666
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  31959265 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 31959364  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  31959365 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctccgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 31959464  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31959465 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31959564  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31959565 cttgtaagtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 31959664  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31959665 tg 31959666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 406 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18230639 - 18230245
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  18230639 cgaggatggactttcttgtcaaaagcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaact 18230540  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  18230539 gatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 18230440  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18230439 accatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttgtaa 18230340  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    || || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  18230339 gtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatg 18230245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 8002010 - 8001609
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  8002010 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8001911  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  8001910 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8001811  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8001810 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8001711  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8001710 cttgtaagtagttaccatcttctggacgattctcttgatatttttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 8001611  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  8001610 tg 8001609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 8217084 - 8216683
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  8217084 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8216985  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  8216984 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8216885  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8216884 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacaatagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8216785  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  8216784 cttgtaagtggttaccatcttctggataattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagctatga 8216685  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  8216684 tg 8216683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16421635 - 16421234
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||      
T  16421635 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgcttttcctccaccaga 16421536  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  16421535 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagataggatctccacttccaaaggaagaactg 16421436  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16421435 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtggtgcggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 16421336  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16421335 cttgtaagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16421236  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16421235 tg 16421234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 18302464 - 18302865
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18302464 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18302563  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18302564 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18302663  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18302664 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18302763  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  18302764 cttgtaagtagttaccattttctgtacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 18302863  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18302864 tg 18302865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 21680153 - 21679752
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  21680153 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21680054  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  21680053 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataacgttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21679954  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679953 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 21679854  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  21679853 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 21679754  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  21679753 tg 21679752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 22865658 - 22866059
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  22865658 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22865757  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22865758 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22865857  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22865858 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22865957  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  22865958 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22866057  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22866058 tg 22866059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 22880717 - 22881118
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  22880717 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22880816  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22880817 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22880916  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22880917 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22881016  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  22881017 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 22881116  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22881117 tg 22881118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28026731 - 28026330
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28026731 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 28026632  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  28026631 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggatagctttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 28026532  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28026531 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28026432  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28026431 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28026332  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28026331 tg 28026330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 29143566 - 29143967
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  29143566 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29143665  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  29143666 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 29143765  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29143766 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgtcagtc 29143865  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  29143866 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29143965  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  29143966 tg 29143967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 32296078 - 32295677
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  32296078 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 32295979  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  32295978 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctccgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 32295879  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32295878 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32295779  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32295778 cttgtaagtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcgactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 32295679  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  32295678 tg 32295677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5472438 - 5472037
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||| | ||| || ||||| ||||||||     
T  5472438 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcctccatgcgtttttcctcaatcaaa 5472339  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5472338 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5472239  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5472238 cttccataccatatacaagagagaaaggagttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5472139  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5472138 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5472039  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5472038 tg 5472037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 6207354 - 6206953
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  6207354 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 6207255  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  6207254 ttcaactgatcataccggctttgacaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 6207155  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6207154 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 6207055  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||    
T  6207054 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagaattatga 6206955  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  6206954 tg 6206953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15735904 - 15736305
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  15735904 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 15736003  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  15736004 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 15736103  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15736104 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15736203  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  15736204 cttgtaagtggttaccattttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 15736303  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15736304 tg 15736305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 18287163 - 18287564
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18287163 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 18287262  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18287263 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 18287362  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18287363 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 18287462  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  18287463 cttgtaagtagttaccattttctgtacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcagctgaggtctatagggagaagagttatga 18287562  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  18287563 tg 18287564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19699939 - 19699538
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  19699939 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcatccttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 19699840  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  19699839 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacctccaaaggaagaactg 19699740  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19699739 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 19699640  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||  | ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19699639 cttgtaagtgattaccattttctgaacaatcctcttgatattcctgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 19699540  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19699539 tg 19699538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 31031046 - 31031447
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31031046 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31031145  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31031146 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggaaagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31031245  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31031246 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 31031345  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  31031346 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 31031445  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31031446 tg 31031447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 35886216 - 35885815
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||     
T  35886216 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcggtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcatttttcctcaatcaaa 35886117  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  35886116 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 35886017  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35886016 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 35885917  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  35885916 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 35885817  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  35885816 tg 35885815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5657587 - 5657183
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||     
T  5657587 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccacacgtttttcctcaatcaaa 5657488  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttct---aacgggagaa 595  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || || ||||    
T  5657487 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccttgatcacacggagagatgggatctccactacttccaaaggaagaa 5657388  T
Q  596 ctgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgcca 695  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5657387 ctgcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacgatagccatgcagagcatagggtaacatctcatgcca 5657288  T
Q  696 gtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagtta 795  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  5657287 gtccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagtta 5657188  T
Q  796 tgatg 800  Q
    |||||    
T  5657187 tgatg 5657183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5716524 - 5716122
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgctttt-cttcaatcaa 497  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  5716524 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttcctcaatcaa 5716425  T
Q  498 gttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaact 597  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  5716424 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 5716325  T
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5716324 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 5716225  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  5716224 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 5716125  T
Q  798 atg 800  Q
    |||    
T  5716124 atg 5716122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5727434 - 5727032
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgctttt-cttcaatcaa 497  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  5727434 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttcctcaatcaa 5727335  T
Q  498 gttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaact 597  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  5727334 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 5727235  T
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5727234 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 5727135  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  5727134 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 5727035  T
Q  798 atg 800  Q
    |||    
T  5727034 atg 5727032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 5764934 - 5765336
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgctttt-cttcaatcaa 497  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  5764934 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttcctcaatcaa 5765033  T
Q  498 gttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaact 597  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  5765034 attcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 5765133  T
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5765134 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 5765233  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  5765234 ccttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 5765333  T
Q  798 atg 800  Q
    |||    
T  5765334 atg 5765336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5019164 - 5018763
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5019164 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5019065  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5019064 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5018965  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5018964 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 5018865  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  5018864 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5018765  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5018764 tg 5018763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20071490 - 20071089
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  20071490 gaattctcgaggatgggctttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20071391  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  20071390 ttcaactgatcataccggttttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 20071291  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20071290 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccgtgcagagcatagggtaacatctcatgctagtc 20071191  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  20071190 cttgtaagtggttaccatcttccggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20071091  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  20071090 tg 20071089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 24333613 - 24333212
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24333613 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24333514  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  24333513 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24333414  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24333413 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 24333314  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| || || |||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24333313 cttgtaggtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcgactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24333214  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24333213 tg 24333212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 29659780 - 29660181
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  29659780 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29659879  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  29659880 ttcaactgatcatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29659979  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29659980 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29660079  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  29660080 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29660179  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  29660180 tg 29660181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 47028903 - 47028502
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  47028903 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagccttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 47028804  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  47028803 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 47028704  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47028703 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 47028604  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  47028603 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 47028504  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  47028503 tg 47028502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 48471377 - 48470976
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  48471377 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 48471278  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  48471277 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 48471178  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48471177 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 48471078  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  48471077 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 48470978  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  48470977 tg 48470976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 51787473 - 51787072
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  51787473 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 51787374  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  51787373 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 51787274  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51787273 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 51787174  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  51787173 cttgtaagtggttaccatcttctggacgatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 51787074  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  51787073 tg 51787072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 11105169 - 11105570
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  11105169 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11105268  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  11105269 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11105368  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11105369 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacgatagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 11105468  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  11105469 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11105568  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11105569 tg 11105570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15887515 - 15887916
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||     
T  15887515 gaattctcgaggatggaccttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatctatacgtttttcctcaatcaaa 15887614  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  15887615 ttcaactgatcataccggctttgacaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15887714  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15887715 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcgctgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 15887814  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||    
T  15887815 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaagtgcaccattcatctgaggtctacagggagaagagttatga 15887914  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15887915 tg 15887916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28344626 - 28344226
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28344626 gaattctcgaggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28344527  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  28344526 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgg-atctccacttccaaaggaagaactg 28344428  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28344427 cttccataccatatacaagagagaaaggggtagccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28344328  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  28344327 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaggagttatga 28344228  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28344227 tg 28344226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 20571653 - 20572054
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  20571653 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20571752  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  20571753 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgagatctccacttccaaaggaagaactg 20571852  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20571853 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgtgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 20571952  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  20571953 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20572052  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  20572053 tg 20572054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4452119 - 4451800
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttcca 580  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |    
T  4452119 cgcttttcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaa 4452020  T
Q  581 cttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcataggg 680  Q
    ||||||  ||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  | |||||| ||    
T  4452019 cttctacggggagtattgcttccataccatacaccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcataagg 4451920  T
Q  681 tagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgta 780  Q
    || ||||||||| |||||||| || ||    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||  ||    
T  4451919 taacatctcatgtcagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtcta 4451820  T
Q  781 taaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  4451819 taaggagaagaattatgatg 4451800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 484 - 800
Target Start/End: Original strand, 6961352 - 6961668
Alignment:
Q  484 ttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccactt 583  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||  |||||||| |  || |  |  || |||||||| ||||    
T  6961352 ttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcagcttccatcaagaccctcaatgacgggatttcaactt 6961451  T
Q  584 ctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtag 683  Q
    ||| ||| || |  || ||| | |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||| |||||||  | ||| |||||||     
T  6961452 ctaccggaagtatcgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgtactgaagtacgataaccatacaaagcgtagggtaa 6961551  T
Q  684 catctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataa 783  Q
    ||||||||||||||| || || |||   ||||||||||  || |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||  |||||    
T  6961552 catctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctgaggtctataa 6961651  T
Q  784 agagaagagttatgatg 800  Q
     ||||||||||||||||    
T  6961652 ggagaagagttatgatg 6961668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 577 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 6573602 - 6573406
Alignment:
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| || ||||  | |||||    
T  6573602 tccacttctactggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcat 6573503  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  6573502 aaggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 6573406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Original strand, 7086956 - 7087252
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  7086956 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 7087055  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| |||||| || ||||  | ||| |    
T  7087056 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgt 7087155  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  7087156 agggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 7087252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Original strand, 11923270 - 11923566
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  11923270 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 11923369  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || |||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  11923370 tcaacctctaccggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 11923469  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  |||||||||||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  11923470 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgctcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 11923566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 22961801 - 22961505
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  22961801 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 22961702  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  22961701 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 22961602  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  22961601 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 22961505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16433752 - 16433457
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  16433752 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 16433653  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  16433652 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccataca-agcgt 16433554  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  16433553 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 16433457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 598 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 15706700 - 15706525
Alignment:
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| |||||| || ||||  | ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15706700 gcctccataccatataccaaggagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgtagggtaacatttcatgccagt 15706601  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  15706600 ccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 15706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 595 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20445347 - 20445166
Alignment:
Q  595 actgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgcc 694  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  20445347 actgcctccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgcc 20445248  T
Q  695 agtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    | || || |||||    ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  20445247 aatctttataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcaacagcaccattcatctgagg 20445166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Original strand, 37258712 - 37258941
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  37258712 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 37258811  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  37258812 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgtttgcagcttcgacagcaccatt 37258911  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  ||||| | |||||||||||    
T  37258912 catttgaggtctataaggtgaagagttatg 37258941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 46382591 - 46382362
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  46382591 gatggaatttcgacttctacagggagtactgcctccatgccatataccagggaaaaaggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 46382492  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  46382491 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttgttcgcagcttcgacagcaccatt 46382392  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  46382391 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 46382362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 770
Target Start/End: Original strand, 5948805 - 5949007
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |  |  ||||| || ||||    
T  5948805 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatacaccagggagaagggagttgcccctgttgaagtgcgtatagaagtacgatatccat 5948904  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  5948905 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccatt 5949004  T
Q  768 cat 770  Q
    |||    
T  5949005 cat 5949007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 773
Target Start/End: Original strand, 15582141 - 15582316
Alignment:
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || |||||||  ||| |||| |||| ||||||||| |    
T  15582141 gcctccatgccgtataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtaccgaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcacctcatgccaat 15582240  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||| |||||    ||||| ||||  ||||||||||| || || ||||| || || || || ||||||||||||||    
T  15582241 ccttataagttaccaccattttctggacaatcttctttatgtttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctg 15582316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 16444658 - 16445059
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| |||     
T  16444658 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatctatacgtttttcctcaaccaaa 16444757  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||    
T  16444758 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataacttggcttccatgatcacacggagagatgggatctccactgccaaaggaagaactg 16444857  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16444858 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagtatagggtaacatctcatgccagtc 16444957  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16444958 cttgtaagtagtaaccatcttctgaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16445057  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16445058 tg 16445059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4204875 - 4204474
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4204875 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4204776  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  4204775 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 4204676  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4204675 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4204576  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4204575 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4204476  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4204475 tg 4204474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26440743 - 26440342
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26440743 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26440644  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  26440643 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttctaaaggaagaactg 26440544  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26440543 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26440444  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26440443 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26440344  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26440343 tg 26440342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 24587186 - 24587587
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24587186 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24587285  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  24587286 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaagggagaactg 24587385  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24587386 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcgtgccagtc 24587485  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24587486 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24587585  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24587586 tg 24587587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 2104815 - 2105216
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  2104815 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2104914  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  2104915 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2105014  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2105015 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccagttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2105114  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  2105115 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 2105214  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  2105215 tg 2105216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 2160060 - 2159659
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  2160060 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2159961  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  2159960 ttcaactgatcctaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2159861  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2159860 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2159761  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2159760 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 2159661  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  2159660 tg 2159659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 16513082 - 16513483
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||     
T  16513082 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatcgatacgtttttcctcaatcaaa 16513181  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16513182 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16513281  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16513282 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccctggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16513381  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16513382 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16513481  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16513482 tg 16513483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 26532525 - 26532926
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26532525 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26532624  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  26532625 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccacttccaaaggaagaactg 26532724  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26532725 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26532824  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26532825 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26532924  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26532925 tg 26532926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 45736793 - 45736392
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  45736793 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 45736694  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  45736693 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 45736594  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45736593 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 45736494  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  45736493 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 45736394  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  45736393 tg 45736392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 11419431 - 11419832
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  11419431 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11419530  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  11419531 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11419630  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11419631 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgctgagcatagggtaacatctcatgccagtc 11419730  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  11419731 cttgtaagtggttaccatcttctgaacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11419830  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11419831 tg 11419832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 16733178 - 16733579
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16733178 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16733277  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16733278 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16733377  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16733378 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16733477  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16733478 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 16733577  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16733578 tg 16733579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 16746169 - 16746570
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16746169 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16746268  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16746269 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16746368  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16746369 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16746468  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16746469 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 16746568  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16746569 tg 16746570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 26314500 - 26314901
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  26314500 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 26314599  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  26314600 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26314699  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26314700 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26314799  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26314800 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26314899  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26314900 tg 26314901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 31559042 - 31559443
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31559042 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31559141  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31559142 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31559241  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31559242 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31559341  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31559342 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 31559441  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31559442 tg 31559443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 406 - 800
Target Start/End: Original strand, 31085281 - 31085675
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31085281 cgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaact 31085380  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  31085381 gatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 31085480  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31085481 accatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttgtaa 31085580  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  31085581 gtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatg 31085675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 5141992 - 5142393
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5141992 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5142091  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5142092 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5142191  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5142192 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5142291  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| |  ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5142292 cttgtaagtggctaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5142391  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5142392 tg 5142393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5153570 - 5153169
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  5153570 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 5153471  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||    
T  5153470 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagagctg 5153371  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5153370 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 5153271  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  5153270 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5153171  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5153170 tg 5153169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5163869 - 5163468
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5163869 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccacggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5163770  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5163769 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5163670  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5163669 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5163570  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  5163569 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggtggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 5163470  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5163469 tg 5163468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 26510348 - 26510749
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26510348 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26510447  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  26510448 ttcaaccgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26510547  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26510548 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26510647  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26510648 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26510747  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26510748 tg 26510749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 39207791 - 39208192
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  39207791 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39207890  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  39207891 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 39207990  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39207991 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacctctcatgccagtc 39208090  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  39208091 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 39208190  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  39208191 tg 39208192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 45392706 - 45392305
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  45392706 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 45392607  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  45392606 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 45392507  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45392506 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 45392407  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45392406 cttgtaagtggtcaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 45392307  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  45392306 tg 45392305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 2778740 - 2778339
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  2778740 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 2778641  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  2778640 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 2778541  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2778540 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 2778441  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  2778440 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 2778341  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  2778340 tg 2778339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 10911521 - 10911922
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||     
T  10911521 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcgtccatacgtttttcctcaatcaaa 10911620  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  10911621 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 10911720  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10911721 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 10911820  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10911821 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 10911920  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  10911921 tg 10911922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 26679758 - 26680156
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26679758 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26679857  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  26679858 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26679957  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26679958 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26680057  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  26680058 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaaccgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 26680156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11446373 - 11445972
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  11446373 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11446274  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  11446273 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcatataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 11446174  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11446173 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11446074  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||    
T  11446073 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagaattatga 11445974  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11445973 tg 11445972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 31129393 - 31128992
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31129393 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccgtggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31129294  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31129293 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31129194  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31129193 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31129094  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  31129093 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31128994  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31128993 tg 31128992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 26664566 - 26664964
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26664566 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26664665  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  26664666 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 26664765  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26664766 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtt 26664865  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  26664866 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaaccgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 26664964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 4139898 - 4140299
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4139898 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4139997  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||    
T  4139998 ttcaactgatcatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctctacttccaaaggaagaactg 4140097  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4140098 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4140197  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4140198 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4140297  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4140298 tg 4140299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 26269738 - 26270139
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||||||     
T  26269738 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcctcaatcaaa 26269837  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  26269838 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 26269937  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26269938 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26270037  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26270038 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26270137  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26270138 tg 26270139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26518278 - 26517877
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26518278 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaagacagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26518179  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  26518178 ttcaactgatcataccggctttggcaacattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26518079  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26518078 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26517979  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26517978 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26517879  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26517878 tg 26517877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 3450792 - 3450391
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  3450792 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatacgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 3450693  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  3450692 ttcaactgatcatatcggctttggcaccattcagcttcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 3450593  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3450592 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 3450493  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  3450492 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 3450393  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  3450392 tg 3450391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 400 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16046800 - 16046400
Alignment:
Q  400 aattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagt 499  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |    
T  16046800 aattctcgaggatggactttcttgccaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaat 16046701  T
Q  500 tcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgc 599  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  16046700 tcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgc 16046601  T
Q  600 ctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtcc 699  Q
     ||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||     
T  16046600 ttccatacgatatacaagagaaaaaggggctgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagcgtagggcaacatctcatgccaatct 16046501  T
Q  700 ttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgat 799  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  16046500 ttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgat 16046401  T
Q  800 g 800  Q
    |    
T  16046400 g 16046400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10847106 - 10846705
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || |    
T  10847106 gaattctcaaggacgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 10847007  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||     
T  10847006 ttcaactgatcataccgactttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaacta 10846907  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  10846906 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaattgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 10846807  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10846806 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttcttggctgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 10846707  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  10846706 tg 10846705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 800
Target Start/End: Original strand, 1891333 - 1891652
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttcca 580  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |    
T  1891333 cgcttctcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgataccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaa 1891432  T
Q  581 cttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcataggg 680  Q
    ||||||  || || |  || ||| ||||||| ||||  || || ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  | |||||||||    
T  1891433 cttctacaggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcataggg 1891532  T
Q  681 tagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgta 780  Q
    || |||||||||||||||||| || ||    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||  ||    
T  1891533 taacatctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtcta 1891632  T
Q  781 taaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  1891633 taaggagaagagttatgatg 1891652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 2558919 - 2558623
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  2558919 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 2558820  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || |||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  2558819 tcaacctctaccggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 2558720  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  2558719 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 2558623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 29091900 - 29091601
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  29091900 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcatacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 29091801  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  29091800 tcaacctctataggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 29091701  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  29091700 agggtaacatttcatgtcagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgagg 29091601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 15195467 - 15195171
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  15195467 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaaatcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 15195368  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  15195367 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 15195268  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  15195267 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 15195171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 598 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16239679 - 16239504
Alignment:
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| |||||| || ||||  | ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  16239679 gcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgtaaggtaacatttcatgccagt 16239580  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| |||||||||||    
T  16239579 ccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgtagcttcaactgccccattcatctg 16239504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 707
Target Start/End: Original strand, 16125596 - 16125826
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  16125596 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 16125695  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  16125696 tcaacctctacaggtagtacagcctccaaaccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 16125795  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagt 707  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  16125796 agggtaacatttcatgccagtccttataagt 16125826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 776
Target Start/End: Original strand, 16285251 - 16285432
Alignment:
Q  595 actgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgcc 694  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  16285251 actgcctccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgcc 16285350  T
Q  695 agtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    | || || |||||    ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  16285351 aatctttataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgagg 16285432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 568 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 9471609 - 9471407
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  9471609 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 9471510  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  9471509 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccatt 9471410  T
Q  768 cat 770  Q
    |||    
T  9471409 cat 9471407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 568 - 770
Target Start/End: Original strand, 16391279 - 16391481
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  16391279 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 16391378  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  16391379 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccatt 16391478  T
Q  768 cat 770  Q
    |||    
T  16391479 cat 16391481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 568 - 770
Target Start/End: Original strand, 30367791 - 30367993
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  30367791 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 30367890  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  30367891 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccatt 30367990  T
Q  768 cat 770  Q
    |||    
T  30367991 cat 30367993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 536
Target Start/End: Original strand, 13482966 - 13483018
Alignment:
Q  484 ttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctc 536  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13482966 ttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctc 13483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 37383165 - 37382764
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37383165 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37383066  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  37383065 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataaccttgcttccatgatcacacagagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 37382966  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37382965 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 37382866  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37382865 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37382766  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  37382765 tg 37382764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 32055291 - 32054893
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  32055291 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 32055192  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  32055191 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32055092  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32055091 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32054992  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  32054991 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 32054893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 37680651 - 37681049
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37680651 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37680750  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  37680751 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37680850  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37680851 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37680950  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  37680951 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 37681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 37695916 - 37696314
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37695916 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37696015  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  37696016 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37696115  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37696116 cttccataccatataccagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37696215  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  37696216 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 37696314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12592296 - 12591895
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  12592296 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 12592197  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  12592196 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccacttccaaaggaagaactg 12592097  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12592096 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12591997  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12591996 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 12591897  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  12591896 tg 12591895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28887767 - 28887366
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28887767 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28887668  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  28887667 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataacttagcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 28887568  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28887567 cttccgtaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28887468  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  28887467 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 28887368  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28887367 tg 28887366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20843401 - 20843000
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  20843401 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 20843302  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  20843301 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccctgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 20843202  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20843201 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 20843102  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  20843101 cttgtaagtggttaccatcttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 20843002  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  20843001 tg 20843000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 27429197 - 27429598
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27429197 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27429296  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27429297 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27429396  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27429397 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27429496  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||    
T  27429497 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagatttatga 27429596  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27429597 tg 27429598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 31888247 - 31888648
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  31888247 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 31888346  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  31888347 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 31888446  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31888447 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 31888546  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  31888547 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 31888646  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  31888647 tg 31888648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 34269676 - 34270077
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34269676 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34269775  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  34269776 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34269875  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34269876 cttccataccatatacaagagagaaaggggtttccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgtagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34269975  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||    
T  34269976 cttgtaagtggttaccatcttctgaacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctacagggagaagagttatga 34270075  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  34270076 tg 34270077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 39895557 - 39895156
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  39895557 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39895458  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||    
T  39895457 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccgaaggaagaactg 39895358  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39895357 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtggtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 39895258  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  39895257 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 39895158  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  39895157 tg 39895156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 37930857 - 37930459
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  37930857 gaattctcgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 37930758  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  37930757 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 37930658  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37930657 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37930558  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  37930557 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 37930459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27122012 - 27121611
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27122012 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27121913  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27121912 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27121813  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27121812 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgctccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27121713  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27121712 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27121613  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27121612 tg 27121611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27821479 - 27821078
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27821479 gaattctcggggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27821380  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27821379 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27821280  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27821279 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27821180  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27821179 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27821080  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27821079 tg 27821078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 37946618 - 37947019
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||     
T  37946618 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcgatcaaa 37946717  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  37946718 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 37946817  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37946818 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 37946917  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37946918 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 37947017  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  37947018 tg 37947019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27781722 - 27781321
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27781722 gaattctcggggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27781623  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27781622 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27781523  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27781522 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27781423  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27781422 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcngcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27781323  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27781322 tg 27781321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 3787981 - 3787580
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  3787981 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 3787882  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  3787881 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctccgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 3787782  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3787781 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcacacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 3787682  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  3787681 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 3787582  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  3787581 tg 3787580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 19411257 - 19411658
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  19411257 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 19411356  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  19411357 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19411456  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19411457 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 19411556  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  19411557 cttgtaggtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 19411656  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19411657 tg 19411658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 21697926 - 21698327
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  21697926 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 21698025  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||    
T  21698026 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaaggactg 21698125  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21698126 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatggagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 21698225  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21698226 cttgtaagtggttaccattttctggacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 21698325  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  21698326 tg 21698327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 23123325 - 23123726
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  23123325 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 23123424  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  23123425 ttcaactgatcataccgactctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 23123524  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23123525 cttccataccatatacaagagagaagggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 23123624  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23123625 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 23123724  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  23123725 tg 23123726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 406 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 31881767 - 31881373
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31881767 cgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaact 31881668  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  31881667 gatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 31881568  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31881567 accatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttgtaa 31881468  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    || || ||||| ||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||    
T  31881467 gtggttaccattttctggataattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaggagttatgatg 31881373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 11629940 - 11630341
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  11629940 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcatttttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11630039  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  11630040 ttcaactgatcgtaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11630139  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11630140 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11630239  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  11630240 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11630339  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11630340 tg 11630341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 34160332 - 34159931
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34160332 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34160233  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  34160232 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34160133  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34160132 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 34160033  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  34160032 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 34159933  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  34159932 tg 34159931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 406 - 797
Target Start/End: Original strand, 21671938 - 21672329
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21671938 cgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaact 21672037  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    | ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  21672038 ggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 21672137  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21672138 accatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttgtaa 21672237  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  21672238 gtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatg 21672329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 406 - 800
Target Start/End: Original strand, 22922911 - 22923305
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22922911 cgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaact 22923010  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  22923011 gatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 22923110  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22923111 accatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtccttgtaa 22923210  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  22923211 gtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatgatg 22923305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 255409 - 255810
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  255409 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 255508  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  255509 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 255608  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  255609 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 255708  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||    
T  255709 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatttgaggtctatagggagaagagttatga 255808  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  255809 tg 255810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12661025 - 12660624
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||     
T  12661025 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 12660926  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  12660925 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 12660826  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12660825 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccgtgcagagcgtagggtaacatctcatgccagtc 12660726  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||    
T  12660725 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagaattatga 12660626  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  12660625 tg 12660624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16166968 - 16166567
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16166968 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16166869  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16166868 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16166769  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16166768 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatc 16166669  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16166668 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16166569  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16166568 tg 16166567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 34296642 - 34296241
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34296642 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34296543  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  34296542 ttcaactgatcatgccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34296443  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34296442 cttccacaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 34296343  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34296342 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34296243  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  34296242 tg 34296241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 39046575 - 39046976
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  39046575 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 39046674  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  39046675 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 39046774  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39046775 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 39046874  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39046875 cttgtaggtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 39046974  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  39046975 tg 39046976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 16824094 - 16824492
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16824094 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16824193  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16824194 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16824293  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16824294 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16824393  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  16824394 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 16824492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 16897386 - 16896988
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16897386 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16897287  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16897286 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16897187  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16897186 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16897087  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  16897086 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 16896988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 13931303 - 13931704
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||  | |||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||||||     
T  13931303 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattctcgcctgatatgaatgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcctcaatcaaa 13931402  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  13931403 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacctccaaaggaagaactg 13931502  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13931503 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13931602  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  13931603 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13931702  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13931703 tg 13931704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27809191 - 27808790
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27809191 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27809092  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  27809091 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 27808992  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27808991 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27808892  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27808891 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27808792  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27808791 tg 27808790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 19451179 - 19451580
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || |    
T  19451179 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccagg 19451278  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  19451279 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 19451378  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  19451379 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactatagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 19451478  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19451479 tttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttattggttgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 19451578  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  19451579 tg 19451580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 34867172 - 34866771
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34867172 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagccttcatccttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34867073  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  34867072 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaaccg 34866973  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34866972 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34866873  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34866872 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34866773  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  34866772 tg 34866771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 9344742 - 9345143
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  9344742 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 9344841  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  9344842 ttcaactgattatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 9344941  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9344942 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 9345041  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  9345042 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 9345141  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  9345142 tg 9345143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 12711357 - 12711758
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  12711357 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 12711456  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  12711457 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 12711556  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12711557 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 12711656  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  12711657 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 12711756  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  12711757 tg 12711758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 40238996 - 40238595
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  40238996 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 40238897  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  40238896 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 40238797  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40238796 cttccacaccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 40238697  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  40238696 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 40238597  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  40238596 tg 40238595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 481 - 800
Target Start/End: Original strand, 26722138 - 26722457
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttcca 580  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |    
T  26722138 cgcttctcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaa 26722237  T
Q  581 cttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcataggg 680  Q
    ||||||  || || |  || ||| ||||||| ||||  || || ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  | |||||||||    
T  26722238 cttctacaggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcataggg 26722337  T
Q  681 tagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgta 780  Q
    || |||||||||||||||||| || ||    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||  ||    
T  26722338 taacatctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtcta 26722437  T
Q  781 taaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  26722438 taaggagaagagttatgatg 26722457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 800
Target Start/End: Original strand, 34532305 - 34532624
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttcca 580  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |    
T  34532305 cgcttctcctcaatcagattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaa 34532404  T
Q  581 cttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcataggg 680  Q
    ||||||  || || |  || ||  ||||||| ||||  || || ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34532405 cttctacgggaagtatcgcttctgtaccatacaccaaggaaaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatatagagcataggg 34532504  T
Q  681 tagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgta 780  Q
    || ||| || ||||||||||| || ||    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||  ||    
T  34532505 taacatttcgtgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaatcttcttgatattcttgtttgcagcttcgaccgcaccattcatctggggtcta 34532604  T
Q  781 taaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  34532605 taaggagaagagttatgatg 34532624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 42395921 - 42395625
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||| | || || || |  |||||||| |  || |  | ||| |||||     
T  42395921 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcaacttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaagggatc 42395822  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||| | ||| |    
T  42395821 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatgcaaagcgt 42395722  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  42395721 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 42395625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 34703462 - 34703163
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  34703462 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 34703363  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  34703362 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 34703263  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  34703262 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgagg 34703163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 776
Target Start/End: Original strand, 21758591 - 21758772
Alignment:
Q  595 actgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgcc 694  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || || |  ||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  21758591 actgcctccatgccatataccaaagagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccatgtaatgcaaagggaagcatctcatgcc 21758690  T
Q  695 agtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    | || || |||||    ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  21758691 aatctttataagtcaccaccatcttctggatgatcttctttatatttttgtttgcagcttcgacagcaccattcatctgagg 21758772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 12385955 - 12385753
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || |  |  ||||| || ||||    
T  12385955 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccgtaccatataccagggagaaaggggttgcccctgttgatgtgcgtatagaagtacgatatccat 12385856  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  12385855 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatattcttatttgcagcttcgacagcaccatt 12385756  T
Q  768 cat 770  Q
    |||    
T  12385755 cat 12385753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16755307 - 16754906
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16755307 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcatcaatcaaa 16755208  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16755207 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16755108  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16755107 cttccataccatacacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16755008  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16755007 cttgtaagtagttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16754908  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16754907 tg 16754906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 24300467 - 24300868
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24300467 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24300566  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  24300567 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 24300666  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24300667 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 24300766  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24300767 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 24300866  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24300867 tg 24300868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27490619 - 27490218
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27490619 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27490520  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27490519 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27490420  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27490419 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27490320  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27490319 cttgtacgtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27490220  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27490219 tg 27490218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 8900413 - 8900814
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  8900413 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 8900512  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  8900513 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 8900612  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8900613 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 8900712  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  8900713 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 8900812  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  8900813 tg 8900814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 13293661 - 13294062
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  13293661 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13293760  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  13293761 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13293860  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13293861 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 13293960  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13293961 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13294060  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13294061 tg 13294062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16679626 - 16679225
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16679626 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgtttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16679527  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  16679526 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 16679427  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16679426 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16679327  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16679326 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 16679227  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16679226 tg 16679225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 22929594 - 22929995
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  22929594 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 22929693  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22929694 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 22929793  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22929794 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 22929893  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  22929894 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattatcttgatattcttgttggcggcctcaactgtaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 22929993  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22929994 tg 22929995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 23852039 - 23852440
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  23852039 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 23852138  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  23852139 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 23852238  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23852239 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 23852338  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  23852339 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattatcttgatattcttgttggcggcctcaactgtaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 23852438  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  23852439 tg 23852440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26791302 - 26790901
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26791302 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26791203  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  26791202 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26791103  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26791102 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26791003  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26791002 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26790903  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26790902 tg 26790901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 27356820 - 27357221
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||     
T  27356820 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccaaacgtttttcctcaatcaaa 27356919  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27356920 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27357019  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27357020 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27357119  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27357120 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27357219  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27357220 tg 27357221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 399 - 794
Target Start/End: Original strand, 27285074 - 27285469
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27285074 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27285173  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27285174 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27285273  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||    
T  27285274 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcaaagcatagggcaacatctcatgccaatc 27285373  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagtt 794  Q
     ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27285374 tttgtaggtagttaccattttctgaacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagagtt 27285469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4778366 - 4777965
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4778366 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4778267  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||    
T  4778266 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaaggactg 4778167  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4778166 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4778067  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4778066 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcagcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4777967  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4777966 tg 4777965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27024623 - 27024222
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||     
T  27024623 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggtatccatacgtttttcctcaatcaaa 27024524  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  27024523 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgagatctccacttccaaaggaagaactg 27024424  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024423 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcctcggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 27024324  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27024323 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27024224  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27024223 tg 27024222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27062992 - 27062591
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27062992 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27062893  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27062892 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27062793  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27062792 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27062693  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27062692 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcagcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 27062593  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27062592 tg 27062591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27184415 - 27184014
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27184415 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27184316  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27184315 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagttaactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27184216  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27184215 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27184116  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27184115 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27184016  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27184015 tg 27184014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 27264824 - 27265225
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27264824 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27264923  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27264924 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagttaactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27265023  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27265024 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27265123  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27265124 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27265223  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27265224 tg 27265225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29555044 - 29554643
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  29555044 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29554945  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  29554944 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29554845  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29554844 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29554745  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29554744 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 29554645  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  29554644 tg 29554643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29578500 - 29578099
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  29578500 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 29578401  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  29578400 tttaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29578301  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29578300 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29578201  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29578200 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 29578101  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  29578100 tg 29578099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 33371141 - 33371542
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  33371141 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagtagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 33371240  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  33371241 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaagggagaactg 33371340  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33371341 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 33371440  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  33371441 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 33371540  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  33371541 tg 33371542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4530771 - 4530370
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4530771 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4530672  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4530671 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcttcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4530572  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4530571 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4530472  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4530471 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4530372  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4530371 tg 4530370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4763249 - 4762848
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4763249 gaattctcgaagatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4763150  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4763149 ttcaactgatcataccgcctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4763050  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4763049 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4762950  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4762949 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4762850  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4762849 tg 4762848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29506902 - 29506501
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  29506902 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtattcattcttgcttgatacgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 29506803  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  29506802 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctccacttccaaaggaagaactg 29506703  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29506702 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 29506603  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  29506602 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 29506503  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  29506502 tg 29506501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 34459216 - 34459617
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34459216 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 34459315  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  34459316 ttcaactgatcaaaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 34459415  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34459416 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 34459515  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34459516 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 34459615  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  34459616 tg 34459617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 4718845 - 4719246
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  4718845 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 4718944  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  4718945 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 4719044  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4719045 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4719144  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4719145 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4719244  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4719245 tg 4719246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26926256 - 26925855
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26926256 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26926157  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  26926156 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacgaagggatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26926057  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26926056 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26925957  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26925956 cttgtaagtggttaccatcttctggacatttctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26925857  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26925856 tg 26925855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27199671 - 27199270
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27199671 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27199572  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27199571 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27199472  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27199471 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27199372  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27199371 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27199272  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27199271 tg 27199270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 27249563 - 27249964
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27249563 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27249662  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27249663 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 27249762  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27249763 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 27249862  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  27249863 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 27249962  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27249963 tg 27249964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28212940 - 28212539
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28212940 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28212841  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  28212840 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 28212741  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28212740 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28212641  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28212640 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 28212541  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28212540 tg 28212539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 4540484 - 4540885
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||     
T  4540484 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttccctcaatcaaa 4540583  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4540584 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 4540683  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4540684 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4540783  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4540784 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 4540883  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4540884 tg 4540885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 14140104 - 14140505
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||     
T  14140104 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatgacatccatacgtttttcctcaatcaaa 14140203  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  14140204 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 14140303  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14140304 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14140403  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  14140404 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14140503  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  14140504 tg 14140505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15407243 - 15407644
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||     
T  15407243 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacatttttcctcaatcaaa 15407342  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  15407343 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15407442  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15407443 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 15407542  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15407543 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15407642  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15407643 tg 15407644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 15419030 - 15419431
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||     
T  15419030 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacatttttcctcaatcaaa 15419129  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  15419130 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 15419229  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15419230 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcatggtagtacggtagccatgcagagcatagggtagcatctcatgccagtc 15419329  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15419330 cttgtaagtggttaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaacggcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 15419429  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  15419430 tg 15419431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 24869202 - 24868801
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  24869202 gaattctcgaggacggaccttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 24869103  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  24869102 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgtgatctccacttccaaaggaagaactg 24869003  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24869002 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcataaggtaacatctcatgccagtc 24868903  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| || || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||    
T  24868902 cttgtacgtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgatgtctatagggagaagagttatga 24868803  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  24868802 tg 24868801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 26773337 - 26773738
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26773337 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26773436  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| || || |||||||    
T  26773437 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgattacccggagagacgggatcttcacttccaaaggaagaactg 26773536  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26773537 cttccataccatatacaagagaaaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtaaccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26773636  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || |||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  26773637 cttgtaagtggtcaccatcttttggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 26773736  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26773737 tg 26773738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28165977 - 28165576
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  28165977 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgattgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 28165878  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  28165877 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctctacttccaaagggagaactg 28165778  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28165777 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacagtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 28165678  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||    
T  28165677 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttagcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaggagttatga 28165578  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  28165577 tg 28165576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 399 - 797
Target Start/End: Original strand, 30552726 - 30553124
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  30552726 gaattctcggggatggactttcttatcaaaagcagtcttcattcttacttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 30552825  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  30552826 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 30552925  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30552926 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtatccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 30553025  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  30553026 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 30553124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 26111122 - 26111523
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26111122 gaattctcgcggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 26111221  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  26111222 tttaactgatcataccggttttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 26111321  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26111322 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 26111421  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26111422 cttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26111521  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26111522 tg 26111523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 27624421 - 27624822
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  27624421 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcatctttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 27624520  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||    
T  27624521 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagacggaatctccacttccaaaggaagaactg 27624620  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||    
T  27624621 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcactgtagtacggtagccatgcaaagcatagggcaacatctcatgccaatc 27624720  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
     |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  27624721 tttgtaagtggttaccatcttctggacaatcttcttgatattcttattggctgcctcaactgcgccattcatctgaggcctataaggagaagagttgtga 27624820  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  27624821 tg 27624822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27013218 - 27012816
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  27013218 gaattcccgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 27013119  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgt-tttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaact 597  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  27013118 ttcaactgatcataccgggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccataatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaact 27013019  T
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27013018 gcttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagt 27012919  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  27012918 ccttgtaagtggttaccatcttctggatgattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatg 27012819  T
Q  798 atg 800  Q
    |||    
T  27012818 atg 27012816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 13518904 - 13519305
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  13518904 gaattctcgaggattgactttcttgtcaaaagcagtcttcattctggcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13519003  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  13519004 ttcaactggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13519103  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13519104 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13519203  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  13519204 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 13519303  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13519304 tg 13519305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 16938737 - 16939138
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16938737 gaattctcgaggatgaactttcttatcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgaatgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 16938836  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16938837 ttcaactggtcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 16938936  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16938937 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 16939036  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16939037 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcgccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 16939136  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  16939137 tg 16939138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20174033 - 20173632
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| || || ||| || ||||| ||||||||     
T  20174033 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccacggaatccatgcgtttttcctcaatcaaa 20173934  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| || || ||||||     
T  20173933 tttaactgatcgcaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccagttccaaaggaagaacta 20173834  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  20173833 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcactgtggtgcgatagccatgcaaagcattgggcagcatctcgtgccagtc 20173734  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| |||   |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20173733 cttgtaggtaactaccatcttttggacgatcttcttgatgttcttattggctgcctcaactgcaccgttcatctgaggcctataaggagaagagttatga 20173634  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  20173633 tg 20173632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 22161958 - 22162359
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| || || ||| || ||||| ||||||||     
T  22161958 gaattctcgaggacggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccacggaatccatgcgtttttcctcaatcaaa 22162057  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    || ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| || || ||||||     
T  22162058 tttaactgatcgcaccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatggaatctccagttccaaaggaagaacta 22162157  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  22162158 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcactgtggtgcgatagccatgcaaagcattgggcagcatctcgtgccagtc 22162257  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| |||   |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22162258 cttgtaggtaactaccatcttttggacgatcttcttgatgttcttattggctgcctcaactgcaccgttcatctgaggcctataaggagaagagttatga 22162357  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  22162358 tg 22162359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27547282 - 27546963
Alignment:
Q  481 cgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttcca 580  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |  || |  | ||| |||||||| |    
T  27547282 cgcttctcctcaatcaaattcaactgatcgtacctattctgacaccattcagcctctgacaactcagcttccatcaagactctcaaagacgggatttcaa 27547183  T
Q  581 cttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcataggg 680  Q
    ||||||  || || |  || ||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  | |||||||||    
T  27547182 cttctacaggaagtatcgcttccgtaccatacaccaaggagaaaggggttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacggtaaccatacaaagcataggg 27547083  T
Q  681 tagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgta 780  Q
    || |||||||||||||||||| || ||    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  ||    
T  27547082 taacatctcatgccagtccttataggtgaccaccatcttctgcacaattttcttgatattcttgtttgcagcttcgactgcaccattcatctggggtcta 27546983  T
Q  781 taaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27546982 taaggagaagagttatgatg 27546963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 647 - 800
Target Start/End: Original strand, 17087401 - 17087554
Alignment:
Q  647 gcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgtt 746  Q
    ||||||| |||||||| || || | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  17087401 gcactgtagtacggtagccgtgcaaagcataaggcagcatctcgtgccaatctttgtaggtagttaccattttctggacaatcttcttgatgttcttatt 17087500  T
Q  747 ggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  17087501 ggctgcctctactgcaccattcatctgaggcctataaggagaagatttatgatg 17087554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Original strand, 18210481 - 18210777
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  18210481 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 18210580  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  18210581 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgt 18210680  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  18210681 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 18210777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 800
Target Start/End: Original strand, 21363450 - 21363773
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  21363450 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 21363549  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| |||||| || ||||  | ||| |    
T  21363550 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccataaaccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgt 21363649  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||    
T  21363650 agggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtgg 21363749  T
Q  777 cgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
      ||||| ||||||| || |||||    
T  21363750 tctataaggagaagaattgtgatg 21363773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 800
Target Start/End: Original strand, 23967432 - 23967755
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  23967432 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 23967531  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| |||||| || ||||  | ||| |    
T  23967532 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccataaaccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgt 23967631  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgagg 776  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||    
T  23967632 agggtaacatttcatgccagtccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctgtgg 23967731  T
Q  777 cgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
      ||||| ||||||| || |||||    
T  23967732 tctataaggagaagaattgtgatg 23967755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 477 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18121853 - 18121557
Alignment:
Q  477 catacgcttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatt 576  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |  | ||| || ||     
T  18121853 catacgtttttcctcaatcaaattcaactggtcgtacctgctctggcaccattcagcttcagacaattcagcttccatcaagactcttaaagaaggaatc 18121754  T
Q  577 tccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcat 676  Q
    || || ||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||    ||| |    
T  18121753 tcaacctctacaggtagtacagcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccataccaagcgt 18121654  T
Q  677 agggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  18121653 agggtaacatttcatgccagtccttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 18121557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 601 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 25709214 - 25709015
Alignment:
Q  601 tccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtcct 700  Q
    ||||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||| |||||||||  ||||  |||||||  | | |||||| || |||||||||||||||||    
T  25709214 tccataccatacaccaaagaaaaaggagttgcccctgttgaagtacgcactgaagtacattaaccatacaaatcataggataacatctcatgccagtcct 25709115  T
Q  701 tgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    | || ||    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  25709114 tataggtgaccaccatcttctgaacaatcttcttaatattcttgtttgcagcttcgaccgcgccattcatctggggtttataaggagaagagttatgatg 25709015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 568 - 797
Target Start/End: Original strand, 9134256 - 9134485
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  9134256 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 9134355  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| | |||||| || || || || || ||||||||    
T  9134356 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttagattcttatttgcagcttcgacggcaccatt 9134455  T
Q  768 catctgaggcgtataaagagaagagttatg 797  Q
    ||| |||||  | ||| | |||||||||||    
T  9134456 catttgaggtctgtaaggtgaagagttatg 9134485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 5373 - 5774
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5373 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5472  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5473 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5572  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5573 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 5672  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5673 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5772  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5773 tg 5774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18071 - 17670
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  18071 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 17972  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  17971 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 17872  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17871 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 17772  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17771 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 17672  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  17671 tg 17670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 746
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  1147 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 1048  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  1047 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 948  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  947 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 848  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  847 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 748  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  747 tg 746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11534 - 11133
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  11534 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 11435  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  11434 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcaacctcggataactttgcctccatgatcacacggagagatggaatctccacttccaaaggaagaactg 11335  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  11334 cttccataccatatacaagagagaaagggattgccccggttgaactacgcactgtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccaatc 11235  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11234 cttgtaggtagttaccattttctggacaatcctcttgatattcttattggctgcctcaactgcaccattcatctaaggcctataaggagaaaagttatga 11135  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11134 tg 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 25666 - 26067
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  25666 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 25765  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  25766 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 25865  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25866 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtatcatctcatgccagtc 25965  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  25966 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 26065  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  26066 tg 26067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 9449 - 9048
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  9449 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 9350  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  9349 ttcaactgatcataccggctttggcaccactcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 9250  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9249 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 9150  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  9149 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 9050  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  9049 tg 9048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 32782 - 32381
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||     
T  32782 gaattctcgaggatgaactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaaccaaa 32683  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  32682 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagccttggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 32583  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32582 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 32483  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  32482 cttgtaagtggttaccattttctgaacaatcctcttgatattcttgttggcggcctcaacagcaccattcatctgaggcctataaggagaagaattatga 32383  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  32382 tg 32381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 10357 - 10758
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  10357 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 10456  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  10457 ttcaactgatcataccggctttggcaccactcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatttccacttccaaaggaagaactg 10556  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10557 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggcaacatctcatgccagtc 10656  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  10657 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagaattatga 10756  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  10757 tg 10758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11513 - 11112
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  11513 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgggccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11414  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  11413 ttcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 11314  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11313 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11214  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  11213 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11114  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11113 tg 11112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 15060 - 14659
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||     
T  15060 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgttttttctcaatcaaa 14961  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  14960 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 14861  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14860 cttccataccatatacaagagagaaaggggtcgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 14761  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  14760 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 14661  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  14660 tg 14659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 3946 - 4347
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  3946 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 4045  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  4046 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 4145  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4146 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 4245  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4246 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 4345  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  4346 tg 4347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 13562 - 13963
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  13562 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatgcgtttttcttcaatcaaa 13661  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  13662 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagggacgggatctccacttccaaaggaagaactg 13761  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13762 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13861  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13862 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13961  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13962 tg 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 20958 - 21359
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  20958 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccgcgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 21057  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  21058 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctctgataactttgcttctatgatcacacagagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 21157  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21158 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 21257  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21258 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattcttttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 21357  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  21358 tg 21359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13037
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  13438 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 13339  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  13338 ttcaactgatcataccggctttggcaccattcagcctcagataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaaccg 13239  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13238 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcgcacggtagtgcggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 13139  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13138 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttattggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 13039  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  13038 tg 13037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5556 - 5155
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  5556 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 5457  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  5456 ttctactgatcataccggctttggcaccattcagccttggataactttgcttccatgatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactg 5357  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5356 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgccccggttgaactgcacacggtagtacggtagccatgcaaagcatagggtaacatctcatgccagtc 5257  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5256 cttataagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctataaggagaagagttatga 5157  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  5156 tg 5155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11525 - 11124
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaag 498  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  11525 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcctgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaa 11426  T
Q  499 ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactg 598  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||    
T  11425 ttcaactgatcatatcggctttgacaccattcagcctctgataactttgcttccatgatcacacggagagacgggatctctacttccaaaggaagaactg 11326  T
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11325 cttccataccatatacaagagagaaaggggttgcccctgttgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccagtc 11226  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatga 798  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  11225 cttgtaagtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatga 11126  T
Q  799 tg 800  Q
    ||    
T  11125 tg 11124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 406 - 800
Target Start/End: Original strand, 9702 - 10096
Alignment:
Q  406 cgaggacggactttcttgtcaaaagcagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggcattcatacgcttttcttcaatcaagttcaact 505  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  9702 cgaggatgtactttcttgtcaaaagcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggcatccatacgtttttcctcaatcaaattcaact 9801  T
Q  506 gatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccat 605  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  9802 ggtcataccggctttggcaccattcagcctcagataattttgcttccattatcacacggagagatgggatctccacttccaaaggaagaactgcttccat 9901  T
Q  606 accatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaa 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9902 accatatacaagagagaaaggggttgccccggtcgaactgcgcacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaacatctcatgccaatccttgtaa 10001  T
Q  706 gtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagagaagagttatgatg 800  Q
    || || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  10002 gtggttaccatcttctggacaattctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctatagggagaagagttatgatg 10096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 399 - 800
Target Start/End: Original strand, 41462 - 41880
Alignment:
Q  399 gaattcccgaggacggactttcttgtcaaaag-cagttttcattcttgcttgatacgaccgcccacgaaccatggc-attcat-acgcttttc-ttcaat 494  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || ||| ||| ||||| ||||||    
T  41462 gaattctcgaggatggactttcttgtcaaaaggcagtcttcattcttgcttgatatgactgtccacgagccatggccatccattacgtttttccttcaat 41561  T
Q  495 caag-ttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttc-gcttccatgattacacggag-agatggg-atttccacttctaacgg 590  Q
    |||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| ||  |    
T  41562 caaaattcaactgatcataccggctctggcaccattcagcctcagataacttttgcttccatgatcacacggagtagatggggatctccacttccaaaag 41661  T
Q  591 ga-gaa--ctgcctccataccatataccagagag-aagggggttgcccc-ggttgaactacg-cactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagc 684  Q
    || |||  |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  41662 gaagaaacctgcttccataccatatacaagagaggaaaggggttgcccccggttgaactgcgacacagtagtacggtagccatgcagagcatagggtaac 41761  T
Q  685 atctcatgccagtccttgtaa-gtagtaaccatcttctaaacaatct-tcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtata 782  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41762 atctcatgccagtccttgtaacgtggttaccatcttctggacaatttctcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggtctata 41861  T
Q  783 -aagagaagagttatgatg 800  Q
       ||||||||||||||||    
T  41862 ggggagaagagttatgatg 41880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 484 - 800
Target Start/End: Original strand, 16270 - 16586
Alignment:
Q  484 ttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagcctcggataacttcgcttccatgattacacggagagatgggatttccactt 583  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||  |||||||| |  || |  |  || |||||||| ||||    
T  16270 ttttcctcaatcaaattcaactgatcatacctattttgacaccattcagcctctgacagctcagcttccatcaagaccctcaatgacgggatttcaactt 16369  T
Q  584 ctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtag 683  Q
    ||| ||| || |  || ||| | |||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||| |||||||  | ||| ||||| |     
T  16370 ctaccggaagtatcgcttccgtcccatataccaaagaaaaaggggttgtccctgttgaagtacgtactgaagtacgataaccatacaaagcgtagggcaa 16469  T
Q  684 catctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataa 783  Q
    ||||||||||||||| || || |||   ||||||||||  || |||||||| ||||||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||||    
T  16470 catctcatgccagtctttataggtaaccaccatcttctgcacgatcttcttaatattcttgtttgcagcttagaccgcaccattcatctgaggtctataa 16569  T
Q  784 agagaagagttatgatg 800  Q
     ||||||||||||||||    
T  16570 ggagaagagttatgatg 16586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 773
Target Start/End: Original strand, 87227 - 87402
Alignment:
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagt 697  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| |||||| || ||||  | ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  87227 gcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacgatatccatacaaagcgtagggtaacatttcatgccagt 87326  T
Q  698 ccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    |||||||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  87327 ccttgtaagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 87402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 599 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 12483 - 12309
Alignment:
Q  599 cctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatctcatgccagtc 698  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12483 cctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccctgtcgaggttcgcactgaggtacggtatccatacaaagcgtagggtaacatttcatgccagtc 12384  T
Q  699 cttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctg 773  Q
    ||| ||||||   ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  12383 cttataagtaactaccatcttctgtatgatcttcttgatgttcttgtttgcagcttcaactgccccattcatctg 12309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 589 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 32605 - 32397
Alignment:
Q  589 gggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccatgtagagcatagggtagcatct 688  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||   ||||||||| |||||| | || |||   ||||| || ||||  | |||| | |||| |||||    
T  32605 gggagtactgcctccatgccatatactaaagaaaaaatggttgcccctgttgaagtgcgtactaaagtacgatacccatacaaagcaaatggtaacatct 32506  T
Q  689 catgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccattcatctgaggcgtataaagaga 788  Q
      ||||| ||||||||||||   ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || || ||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  32505 tgtgccaatccttgtaagtaaccaccattttctgcacaatcttcttgatattcttatttgcagcttcaactgtaccactcatctgaggtctataaggaga 32406  T
Q  789 agagttatg 797  Q
    | |||||||    
T  32405 aaagttatg 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 32710 - 32661
Alignment:
Q  484 ttttcttcaatcaagttcaactgatcatacctgttttggcaccattcagc 533  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  32710 ttttcttcaatcaaattcaactggtcatatctattctggcaccattcagc 32661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 31466 - 31264
Alignment:
Q  568 gatgggatttccacttctaacgggagaactgcctccataccatataccagagagaagggggttgccccggttgaactacgcactgtggtacggtaaccat 667  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || || |  ||||| || ||||    
T  31466 gatggaatttcgacttctacaggaagtactgcctccatgccatataccagggagaagggagttgcccctgttgatgtgcgtacagaagtacgatatccat 31367  T
Q  668 gtagagcatagggtagcatctcatgccagtccttgtaagtagtaaccatcttctaaacaatcttcttgatattcttgttggcggcctcaactgcaccatt 767  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    ||||||||||  |||||| |||| ||||| || || || || || || ||||||||    
T  31366 gtaatgcaaagggaagcatttcatgccaatctttataagtcaccaccatcttctggacaatcctctttatatttttatttgcagcttcgacagcaccatt 31267  T
Q  768 cat 770  Q
    |||    
T  31266 cat 31264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 51168 - 51131
Alignment:
Q  598 gcctccataccatataccagagagaagggggttgcccc 635  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51168 gcctccataccatataccaaagagaaaggggttgcccc 51131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 953 times since January 2019
Visitors: 1117