View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0054-Insertion-16 (Length: 586)

Name: NF0054-Insertion-16
Description: NF0054
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0054-Insertion-16
NF0054-Insertion-16
[»] chr4 (158 HSPs)
chr4 (213-586)||(8631408-8631782)
chr4 (235-586)||(24348210-24348562)
chr4 (213-586)||(40637048-40637418)
chr4 (235-584)||(38409195-38409546)
chr4 (222-586)||(2484862-2485223)
chr4 (213-586)||(6764813-6765188)
chr4 (213-586)||(47868375-47868745)
chr4 (235-586)||(22044380-22044727)
chr4 (223-586)||(14633304-14633662)
chr4 (235-586)||(22046675-22047022)
chr4 (236-586)||(37089361-37089710)
chr4 (235-586)||(9148247-9148596)
chr4 (235-586)||(24888792-24889140)
chr4 (236-586)||(11434952-11435298)
chr4 (236-586)||(7941316-7941667)
chr4 (235-586)||(22800851-22801199)
chr4 (235-586)||(51015242-51015589)
chr4 (235-586)||(17662234-17662575)
chr4 (235-586)||(22802723-22803071)
chr4 (236-586)||(11006226-11006577)
chr4 (235-586)||(5198416-5198764)
chr4 (235-586)||(40091404-40091752)
chr4 (235-586)||(36921482-36921832)
chr4 (277-586)||(11008557-11008865)
chr4 (235-578)||(22132389-22132736)
chr4 (235-586)||(48486315-48486663)
chr4 (236-586)||(18847150-18847496)
chr4 (281-586)||(31849588-31849894)
chr4 (235-586)||(47274723-47275069)
chr4 (235-586)||(36919573-36919924)
chr4 (235-516)||(5637524-5637806)
chr4 (235-577)||(44599836-44600175)
chr4 (235-586)||(24878985-24879334)
chr4 (235-586)||(24880447-24880796)
chr4 (281-586)||(38928166-38928473)
chr4 (235-581)||(14787423-14787770)
chr4 (236-578)||(16934140-16934479)
chr4 (235-571)||(47210756-47211083)
chr4 (242-578)||(9176471-9176804)
chr4 (279-586)||(16453345-16453654)
chr4 (235-578)||(18709161-18709508)
chr4 (277-578)||(22134615-22134913)
chr4 (236-578)||(9174143-9174482)
chr4 (236-578)||(16931786-16932125)
chr4 (281-586)||(12395834-12396140)
chr4 (277-577)||(22780371-22780672)
chr4 (277-577)||(22782736-22783037)
chr4 (316-586)||(26085966-26086236)
chr4 (235-518)||(3824627-3824910)
chr4 (281-586)||(12400796-12401102)
chr4 (281-586)||(33415477-33415782)
chr4 (235-583)||(53405123-53405474)
chr4 (281-586)||(19095920-19096227)
chr4 (234-586)||(36378287-36378637)
chr4 (235-586)||(619437-619784)
chr4 (281-585)||(37313055-37313361)
chr4 (242-555)||(13543957-13544272)
chr4 (243-582)||(19322701-19323035)
chr4 (281-571)||(56030482-56030770)
chr4 (319-586)||(36380425-36380694)
chr4 (242-578)||(41997495-41997828)
chr4 (437-586)||(5635465-5635614)
chr4 (237-578)||(18537470-18537806)
chr4 (292-578)||(18409344-18409631)
chr4 (356-581)||(16455354-16455581)
chr4 (436-586)||(11437557-11437706)
chr4 (235-497)||(52942537-52942784)
chr4 (419-586)||(4215483-4215650)
chr4 (326-586)||(27499128-27499386)
chr4 (391-586)||(13547303-13547498)
chr4 (281-578)||(18534828-18535124)
chr4 (384-586)||(2891433-2891636)
chr4 (323-578)||(38890221-38890476)
chr4 (281-468)||(3937316-3937504)
chr4 (235-578)||(8756247-8756587)
chr4 (288-565)||(15032557-15032824)
chr4 (281-460)||(6132911-6133090)
chr4 (377-578)||(12102221-12102425)
chr4 (332-586)||(30136641-30136894)
chr4 (443-586)||(5101130-5101272)
chr4 (378-578)||(28453818-28454020)
chr4 (377-538)||(31983564-31983727)
chr4 (237-403)||(38270158-38270321)
chr4 (393-578)||(16185831-16186018)
chr4 (286-360)||(2891360-2891434)
chr4 (281-403)||(24446756-24446874)
chr4 (392-564)||(3982186-3982362)
chr4 (462-586)||(24446643-24446754)
chr4 (490-586)||(47563009-47563105)
chr4 (378-578)||(25357772-25357979)
chr4 (378-578)||(9863842-9864049)
chr4 (235-378)||(5100993-5101133)
chr4 (378-578)||(47150889-47151092)
chr4 (378-534)||(40998990-40999148)
chr4 (378-569)||(10113003-10113198)
chr4 (510-581)||(14789422-14789495)
chr4 (510-586)||(6133105-6133181)
chr4 (464-582)||(49088791-49088911)
chr4 (393-455)||(7050378-7050439)
chr4 (393-577)||(11853549-11853732)
chr4 (511-575)||(10047383-10047447)
chr4 (511-575)||(38152468-38152532)
chr4 (511-575)||(39245998-39246062)
chr4 (396-455)||(4556180-4556238)
chr4 (396-455)||(4558314-4558372)
chr4 (396-455)||(8529270-8529328)
chr4 (378-425)||(10114463-10114510)
chr4 (396-455)||(15316961-15317019)
chr4 (396-455)||(18586969-18587027)
chr4 (396-455)||(31300427-31300485)
chr4 (536-586)||(52942477-52942527)
chr4 (393-455)||(55822265-55822326)
chr4 (396-581)||(16688934-16689119)
chr4 (491-578)||(26557833-26557922)
chr4 (511-575)||(5269220-5269284)
chr4 (510-581)||(18587082-18587154)
chr4 (396-455)||(15831144-15831202)
chr4 (396-455)||(16489352-16489410)
chr4 (396-455)||(25699752-25699810)
chr4 (511-574)||(36315258-36315321)
chr4 (511-574)||(36329467-36329530)
chr4 (393-455)||(4570094-4570155)
chr4 (549-586)||(3937263-3937300)
chr4 (510-581)||(4884990-4885062)
chr4 (393-586)||(5336769-5336964)
chr4 (511-575)||(5396700-5396764)
chr4 (510-581)||(8529383-8529455)
chr4 (511-575)||(24333813-24333877)
chr4 (235-309)||(25357633-25357709)
chr4 (531-575)||(46147391-46147435)
chr4 (555-586)||(3824599-3824630)
chr4 (511-574)||(6743444-6743507)
chr4 (213-263)||(15312152-15312203)
chr4 (521-575)||(5147681-5147735)
chr4 (393-455)||(36771396-36771457)
chr4 (213-253)||(4556370-4556411)
chr4 (396-441)||(4884877-4884922)
chr4 (213-253)||(15830971-15831012)
chr4 (213-253)||(18586796-18586837)
chr4 (213-253)||(31300254-31300295)
chr4 (512-565)||(34495853-34495906)
chr4 (511-575)||(5143263-5143327)
chr4 (531-575)||(12739550-12739594)
chr4 (531-575)||(12743925-12743969)
chr4 (531-575)||(12745314-12745358)
chr4 (511-575)||(16623322-16623386)
chr4 (511-575)||(16630709-16630773)
chr4 (511-575)||(25862051-25862115)
chr4 (531-575)||(26175636-26175680)
chr4 (531-575)||(29254618-29254662)
chr4 (511-575)||(31985663-31985726)
chr4 (531-575)||(36463389-36463433)
chr4 (510-581)||(36769595-36769667)
chr4 (437-465)||(38270120-38270148)
chr4 (531-575)||(45687182-45687226)
chr4 (531-575)||(47038411-47038455)
chr4 (531-575)||(48893638-48893682)
chr4 (523-575)||(54867188-54867239)
[»] chr7 (149 HSPs)
chr7 (213-586)||(40946254-40946628)
chr7 (213-586)||(48457579-48457953)
chr7 (235-586)||(38393934-38394286)
chr7 (242-586)||(7470011-7470356)
chr7 (242-586)||(7471969-7472314)
chr7 (248-586)||(3878540-3878877)
chr7 (244-586)||(20625995-20626338)
chr7 (244-586)||(20629886-20630229)
chr7 (244-586)||(20642305-20642648)
chr7 (235-586)||(3035669-3036024)
chr7 (235-586)||(1849917-1850281)
chr7 (288-586)||(44724580-44724879)
chr7 (235-586)||(20299406-20299760)
chr7 (236-586)||(1049285-1049631)
chr7 (236-586)||(40836732-40837078)
chr7 (235-586)||(18345489-18345841)
chr7 (277-586)||(1046914-1047223)
chr7 (235-586)||(44516-44864)
chr7 (235-586)||(31435035-31435384)
chr7 (235-586)||(35581-35929)
chr7 (235-581)||(27306224-27306566)
chr7 (235-586)||(20297310-20297662)
chr7 (243-586)||(28487509-28487853)
chr7 (236-586)||(25542484-25542828)
chr7 (235-586)||(28485514-28485865)
chr7 (235-578)||(7351649-7351995)
chr7 (235-586)||(43253506-43253861)
chr7 (235-578)||(31155908-31156248)
chr7 (281-586)||(20137098-20137404)
chr7 (235-586)||(13099463-13099813)
chr7 (281-586)||(4295923-4296230)
chr7 (281-583)||(11355252-11355555)
chr7 (281-586)||(21592132-21592438)
chr7 (235-521)||(11757176-11757465)
chr7 (235-586)||(42330986-42331336)
chr7 (235-563)||(7349285-7349616)
chr7 (237-586)||(9680768-9681120)
chr7 (242-586)||(9679013-9679359)
chr7 (286-586)||(24748593-24748895)
chr7 (235-586)||(443547-443896)
chr7 (290-586)||(21990153-21990450)
chr7 (288-586)||(37412114-37412416)
chr7 (281-581)||(21678060-21678361)
chr7 (281-583)||(21680021-21680327)
chr7 (287-586)||(39145975-39146276)
chr7 (363-586)||(38396712-38396934)
chr7 (295-585)||(42223165-42223457)
chr7 (364-586)||(7092202-7092423)
chr7 (357-586)||(7094449-7094678)
chr7 (293-581)||(27832631-27832916)
chr7 (281-563)||(24258457-24258744)
chr7 (237-518)||(25276095-25276374)
chr7 (281-479)||(26804563-26804765)
chr7 (392-578)||(2935374-2935560)
chr7 (9-210)||(40945704-40945908)
chr7 (281-535)||(22828672-22828928)
chr7 (290-565)||(24817362-24817635)
chr7 (392-586)||(22137184-22137377)
chr7 (392-586)||(40552211-40552404)
chr7 (392-578)||(1606486-1606671)
chr7 (392-586)||(22108173-22108366)
chr7 (316-578)||(24813494-24813755)
chr7 (392-586)||(40549933-40550126)
chr7 (235-578)||(7188495-7188833)
chr7 (236-518)||(22251602-22251878)
chr7 (392-578)||(9027191-9027376)
chr7 (235-541)||(20091581-20091878)
chr7 (9-196)||(40959669-40959854)
chr7 (235-404)||(18567565-18567731)
chr7 (440-586)||(22393876-22394023)
chr7 (437-581)||(26295598-26295743)
chr7 (324-578)||(24465578-24465829)
chr7 (393-578)||(6332326-6332514)
chr7 (244-325)||(7094673-7094754)
chr7 (378-578)||(16297018-16297222)
chr7 (437-510)||(6348933-6349006)
chr7 (242-325)||(7092426-7092509)
chr7 (235-420)||(22392425-22392595)
chr7 (393-581)||(25351353-25351539)
chr7 (297-578)||(11081522-11081803)
chr7 (523-586)||(11759364-11759427)
chr7 (277-348)||(38396306-38396377)
chr7 (393-581)||(25357047-25357233)
chr7 (393-581)||(2120899-2121087)
chr7 (393-581)||(25410130-25410318)
chr7 (393-455)||(3320171-3320232)
chr7 (393-455)||(3324919-3324980)
chr7 (393-455)||(7069780-7069841)
chr7 (393-455)||(7074787-7074848)
chr7 (393-577)||(25405393-25405576)
chr7 (393-455)||(42006663-42006724)
chr7 (378-455)||(11084467-11084544)
chr7 (434-563)||(6046641-6046772)
chr7 (512-575)||(9190038-9190101)
chr7 (512-575)||(20284093-20284156)
chr7 (396-455)||(30246973-30247031)
chr7 (396-455)||(44512646-44512704)
chr7 (393-455)||(8378625-8378686)
chr7 (393-455)||(15541116-15541177)
chr7 (511-575)||(21983288-21983352)
chr7 (538-586)||(26804762-26804810)
chr7 (396-444)||(44143997-44144045)
chr7 (511-575)||(46516339-46516403)
chr7 (512-575)||(2580394-2580457)
chr7 (378-546)||(6048961-6049133)
chr7 (396-455)||(34546984-34547042)
chr7 (236-282)||(22108114-22108160)
chr7 (236-282)||(22137125-22137171)
chr7 (236-282)||(40549874-40549920)
chr7 (236-282)||(40552152-40552198)
chr7 (235-280)||(1606422-1606467)
chr7 (396-441)||(7464652-7464697)
chr7 (511-575)||(2647725-2647789)
chr7 (510-577)||(3320049-3320117)
chr7 (510-577)||(3324797-3324865)
chr7 (511-575)||(4796696-4796760)
chr7 (511-575)||(29159807-29159871)
chr7 (531-575)||(31732969-31733013)
chr7 (510-581)||(34546874-34546946)
chr7 (531-575)||(41649011-41649055)
chr7 (510-580)||(6067193-6067264)
chr7 (512-575)||(9185195-9185258)
chr7 (393-424)||(21369642-21369673)
chr7 (555-586)||(22251574-22251605)
chr7 (512-575)||(28617255-28617318)
chr7 (512-575)||(33332480-33332543)
chr7 (381-486)||(40281466-40281572)
chr7 (511-572)||(55955-56015)
chr7 (213-253)||(7464829-7464870)
chr7 (236-281)||(9027395-9027440)
chr7 (213-253)||(25351184-25351225)
chr7 (213-253)||(25356878-25356919)
chr7 (213-253)||(25409961-25410002)
chr7 (213-253)||(30246800-30246841)
chr7 (213-253)||(34547174-34547215)
chr7 (396-441)||(44010884-44010929)
chr7 (213-253)||(44512836-44512877)
chr7 (510-581)||(2075231-2075303)
chr7 (236-284)||(2935306-2935354)
chr7 (531-575)||(4586285-4586329)
chr7 (510-577)||(7069895-7069963)
chr7 (510-581)||(7464513-7464585)
chr7 (531-575)||(27347941-27347985)
chr7 (531-575)||(30814560-30814604)
chr7 (511-575)||(35960820-35960884)
chr7 (535-575)||(38671222-38671262)
chr7 (531-575)||(41317434-41317478)
chr7 (396-444)||(44016792-44016840)
chr7 (511-575)||(44848713-44848777)
[»] chr3 (177 HSPs)
chr3 (213-586)||(4308268-4308638)
chr3 (213-586)||(43228191-43228561)
chr3 (213-581)||(43225986-43226350)
chr3 (236-586)||(38889962-38890310)
chr3 (213-586)||(51726994-51727363)
chr3 (237-586)||(10084376-10084726)
chr3 (235-586)||(4103883-4104234)
chr3 (236-585)||(11170327-11170673)
chr3 (215-586)||(27101168-27101540)
chr3 (213-586)||(9604594-9604969)
chr3 (213-586)||(30005719-30006111)
chr3 (235-586)||(25533356-25533712)
chr3 (248-586)||(18099157-18099493)
chr3 (236-586)||(3859451-3859797)
chr3 (277-586)||(42990264-42990574)
chr3 (236-586)||(18096887-18097235)
chr3 (235-586)||(45882861-45883210)
chr3 (236-586)||(5191576-5191921)
chr3 (236-586)||(22114292-22114639)
chr3 (235-578)||(10191305-10191648)
chr3 (242-586)||(10956014-10956355)
chr3 (242-583)||(10958313-10958651)
chr3 (235-577)||(458202-458545)
chr3 (235-578)||(746673-747019)
chr3 (235-586)||(1313332-1313679)
chr3 (321-586)||(1321483-1321749)
chr3 (236-578)||(6063441-6063782)
chr3 (235-577)||(455825-456168)
chr3 (236-577)||(50493922-50494260)
chr3 (213-573)||(35917944-35918306)
chr3 (277-578)||(25388866-25389167)
chr3 (281-586)||(1626670-1626976)
chr3 (236-586)||(5522614-5522949)
chr3 (235-586)||(26720470-26720817)
chr3 (236-578)||(6065791-6066131)
chr3 (281-586)||(28101989-28102295)
chr3 (281-586)||(43423450-43423756)
chr3 (235-586)||(24979629-24979978)
chr3 (287-586)||(53917651-53917951)
chr3 (281-586)||(3314648-3314955)
chr3 (213-537)||(29956564-29956907)
chr3 (277-578)||(10621525-10621827)
chr3 (235-586)||(51943293-51943640)
chr3 (274-577)||(38210327-38210631)
chr3 (235-586)||(32264025-32264378)
chr3 (229-578)||(47148890-47149241)
chr3 (235-586)||(18162586-18162933)
chr3 (281-586)||(43421402-43421708)
chr3 (235-586)||(53915483-53915831)
chr3 (281-582)||(5926755-5927057)
chr3 (339-586)||(7606575-7606822)
chr3 (235-586)||(12267962-12268301)
chr3 (288-586)||(53468440-53468741)
chr3 (235-586)||(42992204-42992540)
chr3 (281-586)||(880438-880745)
chr3 (235-586)||(48361658-48362005)
chr3 (315-586)||(28413018-28413291)
chr3 (238-532)||(6561735-6562028)
chr3 (288-586)||(36011798-36012097)
chr3 (235-585)||(15780782-15781148)
chr3 (235-586)||(32219017-32219355)
chr3 (367-586)||(25688147-25688367)
chr3 (281-586)||(51674753-51675048)
chr3 (290-586)||(39715442-39715735)
chr3 (380-586)||(11168165-11168371)
chr3 (236-481)||(35777344-35777587)
chr3 (377-586)||(5886261-5886468)
chr3 (377-586)||(5899734-5899941)
chr3 (332-586)||(6484374-6484630)
chr3 (235-585)||(28761415-28761763)
chr3 (297-583)||(54691564-54691851)
chr3 (293-567)||(889779-890052)
chr3 (363-586)||(6231848-6232070)
chr3 (343-575)||(53591210-53591442)
chr3 (281-468)||(28100146-28100334)
chr3 (281-580)||(31151312-31151609)
chr3 (364-586)||(4666562-4666784)
chr3 (281-586)||(27635645-27635920)
chr3 (235-586)||(23633382-23633723)
chr3 (235-569)||(53597163-53597491)
chr3 (443-584)||(47701660-47701801)
chr3 (324-586)||(17795269-17795529)
chr3 (324-586)||(19103709-19103969)
chr3 (281-468)||(28180988-28181174)
chr3 (324-536)||(13420222-13420432)
chr3 (288-578)||(561769-562058)
chr3 (281-528)||(54884121-54884367)
chr3 (236-384)||(11163073-11163218)
chr3 (324-578)||(25635391-25635644)
chr3 (281-493)||(23636991-23637200)
chr3 (281-464)||(28137415-28137588)
chr3 (289-578)||(36871295-36871583)
chr3 (235-408)||(41849064-41849244)
chr3 (394-586)||(3306839-3307030)
chr3 (434-578)||(24181498-24181644)
chr3 (317-504)||(1673975-1674160)
chr3 (500-586)||(41849243-41849329)
chr3 (509-586)||(35919102-35919179)
chr3 (288-363)||(47701806-47701881)
chr3 (509-586)||(53894044-53894121)
chr3 (378-528)||(14634486-14634638)
chr3 (281-363)||(6231413-6231495)
chr3 (224-420)||(24177191-24177380)
chr3 (213-275)||(25690651-25690713)
chr3 (378-576)||(1620457-1620657)
chr3 (213-290)||(27101540-27101617)
chr3 (459-578)||(25634030-25634150)
chr3 (396-581)||(29913949-29914132)
chr3 (288-360)||(3306770-3306842)
chr3 (235-510)||(4560355-4560600)
chr3 (393-455)||(10094195-10094256)
chr3 (393-455)||(10201075-10201136)
chr3 (393-455)||(16462203-16462264)
chr3 (393-455)||(22626105-22626166)
chr3 (393-455)||(47883003-47883064)
chr3 (235-317)||(1321363-1321441)
chr3 (396-581)||(10897008-10897193)
chr3 (396-581)||(47878165-47878350)
chr3 (511-575)||(1736324-1736388)
chr3 (511-575)||(18552902-18552966)
chr3 (511-575)||(30709809-30709873)
chr3 (396-455)||(54193229-54193287)
chr3 (393-455)||(10100212-10100273)
chr3 (393-455)||(10208121-10208182)
chr3 (236-289)||(6719392-6719445)
chr3 (235-309)||(1618920-1618993)
chr3 (393-441)||(6303310-6303358)
chr3 (511-575)||(8370505-8370569)
chr3 (324-426)||(25633930-25634030)
chr3 (511-575)||(26298992-26299056)
chr3 (511-575)||(27974971-27975035)
chr3 (511-575)||(27986465-27986529)
chr3 (236-280)||(53896486-53896530)
chr3 (512-575)||(1417510-1417573)
chr3 (296-420)||(13419864-13419983)
chr3 (396-455)||(20031439-20031497)
chr3 (396-455)||(27762107-27762165)
chr3 (396-455)||(54188512-54188570)
chr3 (511-572)||(48438221-48438282)
chr3 (378-418)||(7768632-7768672)
chr3 (510-577)||(10094073-10094141)
chr3 (510-577)||(10100090-10100158)
chr3 (510-577)||(10200953-10201021)
chr3 (510-581)||(10595028-10595100)
chr3 (510-581)||(10612772-10612844)
chr3 (511-575)||(16264354-16264418)
chr3 (511-575)||(21711227-21711291)
chr3 (531-575)||(23391909-23391953)
chr3 (531-575)||(29196386-29196430)
chr3 (511-575)||(32143325-32143389)
chr3 (511-575)||(33386685-33386749)
chr3 (393-453)||(38002869-38002928)
chr3 (531-575)||(40734622-40734666)
chr3 (537-585)||(42992607-42992655)
chr3 (510-577)||(54193342-54193410)
chr3 (393-455)||(5858546-5858605)
chr3 (396-455)||(10595155-10595213)
chr3 (396-455)||(10612899-10612957)
chr3 (512-575)||(37466295-37466358)
chr3 (401-455)||(4535622-4535675)
chr3 (397-455)||(10949381-10949438)
chr3 (393-455)||(11079517-11079578)
chr3 (393-455)||(27544273-27544334)
chr3 (213-253)||(5858376-5858417)
chr3 (510-551)||(6303425-6303466)
chr3 (213-253)||(10595342-10595383)
chr3 (378-418)||(31021300-31021341)
chr3 (213-253)||(47878482-47878523)
chr3 (281-330)||(53591159-53591208)
chr3 (213-253)||(54188338-54188379)
chr3 (511-575)||(6794732-6794796)
chr3 (365-405)||(7606828-7606868)
chr3 (511-575)||(27452962-27453026)
chr3 (510-577)||(27544388-27544456)
chr3 (511-575)||(36029097-36029161)
chr3 (531-575)||(40913417-40913461)
chr3 (531-575)||(44331669-44331713)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (213-586)||(41472-41843)
[»] chr6 (106 HSPs)
chr6 (213-586)||(28241310-28241681)
chr6 (213-586)||(1230238-1230608)
chr6 (236-586)||(11983018-11983365)
chr6 (235-586)||(30967175-30967526)
chr6 (213-586)||(26064936-26065306)
chr6 (213-586)||(26084905-26085275)
chr6 (277-586)||(4816220-4816530)
chr6 (235-586)||(30034592-30034944)
chr6 (244-586)||(14458756-14459093)
chr6 (235-586)||(14507165-14507512)
chr6 (238-586)||(19704556-19704909)
chr6 (236-580)||(20915351-20915694)
chr6 (235-586)||(9019903-9020251)
chr6 (235-586)||(2628875-2629227)
chr6 (281-586)||(13057213-13057520)
chr6 (235-586)||(26932550-26932907)
chr6 (235-575)||(12195515-12195852)
chr6 (235-586)||(3390356-3390705)
chr6 (236-586)||(15541129-15541476)
chr6 (235-586)||(30728813-30729165)
chr6 (243-586)||(32279982-32280322)
chr6 (281-586)||(3629854-3630159)
chr6 (281-585)||(25477293-25477606)
chr6 (292-586)||(13039784-13040080)
chr6 (281-586)||(3631928-3632233)
chr6 (235-583)||(15532674-15533018)
chr6 (235-532)||(15530166-15530459)
chr6 (286-586)||(3233714-3234021)
chr6 (364-578)||(5273213-5273427)
chr6 (236-468)||(19227515-19227744)
chr6 (281-586)||(24338437-24338743)
chr6 (290-586)||(12161547-12161841)
chr6 (392-578)||(26066121-26066307)
chr6 (381-583)||(1069710-1069913)
chr6 (392-586)||(29754698-29754892)
chr6 (392-578)||(33308988-33309173)
chr6 (392-578)||(26068392-26068578)
chr6 (392-578)||(33311257-33311442)
chr6 (235-540)||(3027888-3028187)
chr6 (281-510)||(22490658-22490889)
chr6 (324-578)||(15719708-15719961)
chr6 (297-578)||(16455421-16455701)
chr6 (339-586)||(14466399-14466649)
chr6 (377-586)||(12186060-12186271)
chr6 (374-578)||(15367144-15367349)
chr6 (376-578)||(26945258-26945463)
chr6 (235-385)||(1072067-1072214)
chr6 (436-578)||(15346522-15346664)
chr6 (324-508)||(17012105-17012287)
chr6 (235-361)||(8995456-8995578)
chr6 (281-393)||(32447497-32447611)
chr6 (244-395)||(13870602-13870749)
chr6 (378-578)||(22857949-22858152)
chr6 (235-363)||(17852519-17852643)
chr6 (378-578)||(19696556-19696759)
chr6 (456-578)||(25465587-25465710)
chr6 (493-586)||(10584227-10584321)
chr6 (235-283)||(18318003-18318051)
chr6 (378-536)||(20526922-20527081)
chr6 (379-578)||(28037722-28037927)
chr6 (437-567)||(30445699-30445832)
chr6 (512-575)||(31979517-31979580)
chr6 (393-577)||(13878727-13878910)
chr6 (393-455)||(13883475-13883536)
chr6 (393-577)||(16785919-16786102)
chr6 (393-455)||(26887345-26887406)
chr6 (393-455)||(31248835-31248896)
chr6 (393-455)||(35201447-35201508)
chr6 (296-353)||(10584155-10584212)
chr6 (393-455)||(3577636-3577696)
chr6 (396-455)||(17036058-17036116)
chr6 (396-455)||(17694972-17695030)
chr6 (491-578)||(12911442-12911531)
chr6 (511-575)||(5757507-5757571)
chr6 (511-575)||(10077194-10077258)
chr6 (393-539)||(12937229-12937376)
chr6 (460-578)||(25078554-25078673)
chr6 (460-578)||(28078191-28078310)
chr6 (400-455)||(12166267-12166321)
chr6 (396-455)||(22351973-22352031)
chr6 (396-453)||(19701985-19702041)
chr6 (399-455)||(25941650-25941704)
chr6 (236-289)||(29754979-29755032)
chr6 (511-575)||(5572270-5572334)
chr6 (392-506)||(7542452-7542567)
chr6 (378-453)||(11138423-11138499)
chr6 (396-455)||(13467585-13467642)
chr6 (510-577)||(13883590-13883658)
chr6 (511-575)||(21356040-21356104)
chr6 (510-581)||(25941785-25941857)
chr6 (236-280)||(26066320-26066364)
chr6 (236-280)||(26068591-26068635)
chr6 (510-577)||(35201325-35201393)
chr6 (396-455)||(22342922-22342980)
chr6 (396-455)||(26643179-26643237)
chr6 (396-455)||(26749145-26749203)
chr6 (512-575)||(31936591-31936654)
chr6 (396-455)||(33215830-33215888)
chr6 (213-253)||(17695162-17695203)
chr6 (512-569)||(24436001-24436058)
chr6 (213-253)||(25466210-25466251)
chr6 (213-253)||(25941475-25941516)
chr6 (531-575)||(9183031-9183075)
chr6 (531-575)||(26954286-26954330)
chr6 (531-575)||(33211185-33211229)
chr6 (510-581)||(33215943-33216015)
[»] chr2 (128 HSPs)
chr2 (213-586)||(45279973-45280344)
chr2 (235-586)||(23452226-23452578)
chr2 (236-586)||(27104718-27105063)
chr2 (236-586)||(19504335-19504681)
chr2 (242-586)||(19502000-19502341)
chr2 (235-586)||(42064433-42064781)
chr2 (235-586)||(42452701-42453046)
chr2 (236-586)||(13910034-13910380)
chr2 (235-586)||(21520682-21521032)
chr2 (236-586)||(24162212-24162548)
chr2 (235-585)||(40032043-40032395)
chr2 (235-586)||(42923498-42923848)
chr2 (237-586)||(19007560-19007906)
chr2 (235-586)||(43623569-43623905)
chr2 (235-586)||(22287325-22287673)
chr2 (235-577)||(35215584-35215933)
chr2 (277-577)||(35217961-35218262)
chr2 (242-586)||(6264137-6264475)
chr2 (235-586)||(6258806-6259152)
chr2 (281-586)||(11739548-11739855)
chr2 (281-586)||(28196597-28196901)
chr2 (370-586)||(5375335-5375550)
chr2 (281-586)||(34979566-34979874)
chr2 (281-586)||(17849077-17849383)
chr2 (281-586)||(17848403-17848706)
chr2 (281-586)||(14837233-14837534)
chr2 (281-579)||(31732772-31733060)
chr2 (237-586)||(44289056-44289403)
chr2 (270-552)||(45239000-45239282)
chr2 (242-586)||(3022088-3022438)
chr2 (392-586)||(36558853-36559047)
chr2 (392-586)||(36561130-36561324)
chr2 (223-578)||(11578104-11578453)
chr2 (213-363)||(5377642-5377792)
chr2 (288-497)||(15539553-15539763)
chr2 (434-586)||(22407443-22407595)
chr2 (392-577)||(45332179-45332364)
chr2 (324-586)||(22874137-22874397)
chr2 (327-586)||(18800302-18800559)
chr2 (297-578)||(20146604-20146884)
chr2 (332-586)||(28459179-28459434)
chr2 (280-477)||(38020161-38020349)
chr2 (446-572)||(7462950-7463077)
chr2 (376-578)||(40699429-40699634)
chr2 (298-578)||(17897242-17897519)
chr2 (237-417)||(22163106-22163282)
chr2 (235-389)||(22407595-22407746)
chr2 (456-586)||(22707740-22707872)
chr2 (486-586)||(22163011-22163111)
chr2 (455-584)||(23870951-23871080)
chr2 (377-578)||(37962938-37963137)
chr2 (316-586)||(35107294-35107562)
chr2 (393-510)||(20589763-20589881)
chr2 (375-578)||(27136127-27136326)
chr2 (357-462)||(38414194-38414297)
chr2 (396-581)||(17943540-17943723)
chr2 (511-575)||(8390179-8390243)
chr2 (393-577)||(2736205-2736388)
chr2 (393-455)||(17462436-17462497)
chr2 (393-455)||(20054886-20054947)
chr2 (393-455)||(22712637-22712698)
chr2 (393-455)||(22717346-22717407)
chr2 (393-455)||(39680045-39680106)
chr2 (393-455)||(39686983-39687044)
chr2 (393-455)||(45567409-45567470)
chr2 (510-575)||(34682362-34682427)
chr2 (378-510)||(43139432-43139564)
chr2 (511-575)||(14699036-14699100)
chr2 (511-575)||(28259206-28259270)
chr2 (396-455)||(12781342-12781400)
chr2 (378-455)||(17921754-17921833)
chr2 (396-455)||(17932637-17932695)
chr2 (377-420)||(26345661-26345704)
chr2 (396-455)||(27517760-27517818)
chr2 (393-455)||(2740941-2741002)
chr2 (513-581)||(1345572-1345640)
chr2 (511-575)||(13569332-13569396)
chr2 (392-510)||(15693974-15694094)
chr2 (511-575)||(20522224-20522288)
chr2 (511-575)||(33118140-33118204)
chr2 (551-586)||(15539518-15539553)
chr2 (396-455)||(37170873-37170931)
chr2 (393-455)||(28458949-28459011)
chr2 (281-335)||(38020103-38020157)
chr2 (379-420)||(27583494-27583535)
chr2 (511-575)||(8040064-8040128)
chr2 (511-575)||(10445473-10445537)
chr2 (511-575)||(16940238-16940302)
chr2 (511-575)||(17010903-17010967)
chr2 (531-575)||(17057369-17057413)
chr2 (531-575)||(17085352-17085396)
chr2 (510-577)||(17462551-17462619)
chr2 (510-581)||(30479110-30479182)
chr2 (531-575)||(36773686-36773730)
chr2 (393-441)||(38190997-38191045)
chr2 (531-575)||(38312364-38312408)
chr2 (511-575)||(39482935-39482999)
chr2 (510-577)||(45679838-45679906)
chr2 (396-455)||(30478997-30479055)
chr2 (223-289)||(20589567-20589633)
chr2 (510-551)||(2741056-2741097)
chr2 (528-581)||(2838076-2838129)
chr2 (213-253)||(12781531-12781572)
chr2 (213-253)||(17943368-17943409)
chr2 (510-581)||(20050015-20050088)
chr2 (213-253)||(20050333-20050374)
chr2 (213-253)||(20055076-20055117)
chr2 (213-253)||(22712827-22712868)
chr2 (213-253)||(27517952-27517993)
chr2 (531-572)||(29867993-29868034)
chr2 (510-551)||(33670992-33671033)
chr2 (393-540)||(35028647-35028796)
chr2 (213-253)||(35894572-35894613)
chr2 (236-281)||(36559066-36559111)
chr2 (236-281)||(36561343-36561388)
chr2 (236-281)||(45332383-45332428)
chr2 (531-575)||(723744-723788)
chr2 (511-575)||(10707281-10707345)
chr2 (460-578)||(13828338-13828458)
chr2 (511-575)||(17865207-17865271)
chr2 (393-441)||(20050156-20050204)
chr2 (511-575)||(33528650-33528714)
chr2 (491-542)||(33604092-33604144)
chr2 (531-575)||(34139770-34139814)
chr2 (511-575)||(34388862-34388926)
chr2 (531-575)||(39284960-39285004)
chr2 (510-577)||(39680160-39680228)
chr2 (510-577)||(39687098-39687166)
[»] chr1 (133 HSPs)
chr1 (236-586)||(51749982-51750329)
chr1 (235-586)||(28840620-28840969)
chr1 (235-586)||(24325598-24325953)
chr1 (213-586)||(2617438-2617806)
chr1 (235-586)||(31735512-31735864)
chr1 (235-586)||(27336931-27337281)
chr1 (236-586)||(6822958-6823304)
chr1 (243-586)||(10399819-10400159)
chr1 (235-586)||(15823488-15823836)
chr1 (242-539)||(21948226-21948523)
chr1 (242-586)||(15294825-15295180)
chr1 (235-586)||(47906206-47906560)
chr1 (235-586)||(28842435-28842784)
chr1 (235-586)||(27339122-27339473)
chr1 (229-586)||(12302496-12302855)
chr1 (236-586)||(13761780-13762126)
chr1 (277-586)||(46431697-46432009)
chr1 (235-586)||(2510316-2510667)
chr1 (242-586)||(39932020-39932364)
chr1 (244-586)||(20302410-20302748)
chr1 (236-577)||(47179652-47179993)
chr1 (235-585)||(13215023-13215375)
chr1 (288-586)||(17324627-17324926)
chr1 (236-577)||(16226110-16226448)
chr1 (236-586)||(51752308-51752653)
chr1 (235-578)||(9463243-9463589)
chr1 (235-586)||(14097960-14098309)
chr1 (235-586)||(41646862-41647210)
chr1 (236-577)||(47177301-47177642)
chr1 (235-578)||(9459416-9459762)
chr1 (235-586)||(38925472-38925817)
chr1 (236-583)||(20291400-20291743)
chr1 (235-586)||(39462461-39462809)
chr1 (290-583)||(50307540-50307835)
chr1 (281-582)||(18839571-18839874)
chr1 (286-586)||(16428642-16428944)
chr1 (281-586)||(6995691-6995997)
chr1 (279-586)||(4131366-4131678)
chr1 (281-586)||(2949223-2949528)
chr1 (237-586)||(50076663-50077009)
chr1 (234-583)||(9241079-9241426)
chr1 (281-586)||(18307093-18307399)
chr1 (235-586)||(3579608-3579957)
chr1 (244-586)||(17186118-17186458)
chr1 (277-586)||(25127852-25128163)
chr1 (281-586)||(11457466-11457772)
chr1 (242-586)||(25251265-25251607)
chr1 (235-586)||(28207059-28207405)
chr1 (235-518)||(48665113-48665400)
chr1 (235-586)||(28998244-28998592)
chr1 (235-586)||(29003960-29004308)
chr1 (281-586)||(50078811-50079118)
chr1 (288-586)||(31425006-31425309)
chr1 (286-583)||(6756516-6756815)
chr1 (281-586)||(31489899-31490202)
chr1 (281-586)||(50248561-50248869)
chr1 (235-573)||(47451590-47451919)
chr1 (290-586)||(40133937-40134235)
chr1 (281-586)||(17318877-17319177)
chr1 (281-586)||(31422851-31423171)
chr1 (236-495)||(6823827-6824091)
chr1 (391-586)||(51757626-51757820)
chr1 (281-581)||(17324049-17324349)
chr1 (392-578)||(23785935-23786121)
chr1 (364-577)||(16231631-16231843)
chr1 (437-586)||(23816027-23816176)
chr1 (381-586)||(16429042-16429248)
chr1 (357-586)||(25248542-25248772)
chr1 (288-586)||(16432396-16432686)
chr1 (237-586)||(14183581-14183923)
chr1 (286-578)||(42922223-42922514)
chr1 (376-586)||(6115093-6115304)
chr1 (281-564)||(8347284-8347566)
chr1 (321-539)||(15669431-15669648)
chr1 (235-578)||(18800570-18800908)
chr1 (281-578)||(8349049-8349345)
chr1 (377-581)||(49495206-49495411)
chr1 (501-586)||(13358778-13358863)
chr1 (288-578)||(13125455-13125746)
chr1 (378-578)||(30738625-30738830)
chr1 (470-578)||(15916564-15916674)
chr1 (374-578)||(16561544-16561751)
chr1 (378-578)||(26613237-26613440)
chr1 (376-576)||(30790401-30790602)
chr1 (396-581)||(21353342-21353525)
chr1 (378-553)||(155788-155963)
chr1 (378-578)||(27916576-27916780)
chr1 (236-337)||(16231544-16231641)
chr1 (213-261)||(13449861-13449909)
chr1 (10-114)||(28183610-28183714)
chr1 (281-336)||(25248756-25248811)
chr1 (378-453)||(26332613-26332688)
chr1 (238-484)||(26520206-26520454)
chr1 (393-455)||(2232597-2232658)
chr1 (392-518)||(28279361-28279489)
chr1 (396-455)||(2401342-2401400)
chr1 (396-455)||(9526469-9526527)
chr1 (396-455)||(25134074-25134132)
chr1 (393-455)||(4144804-4144865)
chr1 (549-586)||(13447264-13447301)
chr1 (511-575)||(13598402-13598466)
chr1 (511-575)||(16124545-16124609)
chr1 (511-575)||(37069774-37069838)
chr1 (511-575)||(47703965-47704029)
chr1 (396-455)||(9521718-9521776)
chr1 (512-575)||(19072932-19072995)
chr1 (512-575)||(19120822-19120885)
chr1 (378-425)||(26332714-26332761)
chr1 (382-534)||(43104245-43104400)
chr1 (512-575)||(47098854-47098917)
chr1 (213-251)||(9521546-9521584)
chr1 (486-578)||(13127685-13127779)
chr1 (510-575)||(21536597-21536662)
chr1 (511-572)||(29651818-29651879)
chr1 (511-575)||(9476265-9476329)
chr1 (515-575)||(26644930-26644990)
chr1 (512-575)||(47102871-47102934)
chr1 (396-454)||(2393404-2393461)
chr1 (514-572)||(3281715-3281773)
chr1 (213-253)||(9526296-9526337)
chr1 (235-309)||(49495468-49495538)
chr1 (531-575)||(834167-834211)
chr1 (514-577)||(2232710-2232774)
chr1 (531-575)||(3156989-3157033)
chr1 (510-577)||(9526582-9526650)
chr1 (381-420)||(10115868-10115908)
chr1 (511-575)||(13604652-13604716)
chr1 (511-575)||(27104401-27104465)
chr1 (531-575)||(28220226-28220270)
chr1 (531-575)||(28223421-28223465)
chr1 (531-575)||(28265554-28265598)
chr1 (213-261)||(43104080-43104127)
chr1 (531-575)||(49918474-49918518)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (235-586)||(69281-69632)
scaffold0025 (235-389)||(73209-73364)
scaffold0025 (364-402)||(73160-73198)
[»] chr5 (117 HSPs)
chr5 (213-586)||(39854404-39854773)
chr5 (213-586)||(6744981-6745358)
chr5 (216-583)||(10529091-10529455)
chr5 (235-586)||(4236571-4236918)
chr5 (235-586)||(25921462-25921810)
chr5 (236-586)||(38882048-38882395)
chr5 (235-586)||(16776099-16776447)
chr5 (237-586)||(2174863-2175208)
chr5 (242-585)||(18466629-18466973)
chr5 (213-586)||(6747224-6747594)
chr5 (235-586)||(21947969-21948316)
chr5 (235-584)||(18468949-18469297)
chr5 (235-586)||(27910387-27910740)
chr5 (235-586)||(27912472-27912826)
chr5 (277-586)||(25804005-25804314)
chr5 (244-586)||(18511201-18511542)
chr5 (277-586)||(34477042-34477353)
chr5 (236-578)||(31545023-31545362)
chr5 (277-586)||(21684441-21684750)
chr5 (235-586)||(2818324-2818673)
chr5 (277-586)||(34479407-34479718)
chr5 (236-578)||(31542678-31543016)
chr5 (229-586)||(1189596-1189957)
chr5 (236-578)||(31179368-31179707)
chr5 (234-586)||(40221463-40221813)
chr5 (235-586)||(26097675-26098021)
chr5 (242-586)||(18509307-18509649)
chr5 (286-586)||(10474312-10474613)
chr5 (235-578)||(15552177-15552527)
chr5 (319-586)||(658345-658610)
chr5 (281-586)||(25904087-25904393)
chr5 (281-584)||(17072867-17073172)
chr5 (235-586)||(18596589-18596936)
chr5 (290-586)||(17818481-17818776)
chr5 (279-586)||(16092188-16092497)
chr5 (281-586)||(31472601-31472908)
chr5 (281-586)||(24126840-24127146)
chr5 (235-586)||(6756436-6756782)
chr5 (235-586)||(10586781-10587122)
chr5 (295-586)||(2954414-2954706)
chr5 (357-586)||(4410084-4410312)
chr5 (235-586)||(36402317-36402665)
chr5 (288-586)||(695880-696168)
chr5 (290-586)||(39397982-39398279)
chr5 (281-581)||(37705774-37706075)
chr5 (356-586)||(41585733-41585963)
chr5 (372-586)||(39798123-39798337)
chr5 (235-586)||(12555912-12556260)
chr5 (375-586)||(20505832-20506041)
chr5 (236-585)||(31465979-31466314)
chr5 (392-582)||(10749796-10749986)
chr5 (281-518)||(34530722-34530961)
chr5 (281-585)||(21288748-21289050)
chr5 (392-582)||(10757273-10757462)
chr5 (392-586)||(15354564-15354757)
chr5 (392-586)||(23665140-23665333)
chr5 (392-586)||(23793254-23793447)
chr5 (392-578)||(38960129-38960314)
chr5 (364-586)||(2723970-2724183)
chr5 (237-454)||(20042994-20043208)
chr5 (237-458)||(20044954-20045172)
chr5 (392-578)||(3373134-3373320)
chr5 (392-586)||(15356840-15357033)
chr5 (399-586)||(23741848-23742034)
chr5 (238-578)||(6661181-6661516)
chr5 (213-337)||(4409977-4410101)
chr5 (286-586)||(20053836-20054127)
chr5 (377-586)||(9020299-9020510)
chr5 (377-585)||(36208656-36208865)
chr5 (235-424)||(26098402-26098588)
chr5 (378-541)||(17413200-17413365)
chr5 (378-578)||(15143547-15143750)
chr5 (235-363)||(20507675-20507799)
chr5 (486-583)||(26098280-26098378)
chr5 (474-579)||(23667497-23667601)
chr5 (437-511)||(42770951-42771025)
chr5 (396-578)||(4897828-4898013)
chr5 (396-581)||(22672837-22673022)
chr5 (393-577)||(1170811-1170994)
chr5 (470-578)||(15445263-15445372)
chr5 (528-586)||(20043222-20043280)
chr5 (393-455)||(35385573-35385634)
chr5 (398-581)||(25445501-25445684)
chr5 (396-455)||(25452498-25452556)
chr5 (393-455)||(2298122-2298183)
chr5 (378-546)||(2144591-2144763)
chr5 (510-575)||(11917000-11917065)
chr5 (511-575)||(9353361-9353425)
chr5 (511-575)||(36932379-36932443)
chr5 (396-455)||(28786407-28786465)
chr5 (512-575)||(28832263-28832326)
chr5 (393-455)||(1240428-1240489)
chr5 (236-282)||(23665081-23665127)
chr5 (236-282)||(23667356-23667402)
chr5 (236-282)||(23742055-23742101)
chr5 (236-282)||(23793460-23793506)
chr5 (235-280)||(3373333-3373378)
chr5 (511-575)||(10281755-10281819)
chr5 (236-284)||(15354770-15354818)
chr5 (236-284)||(15357046-15357094)
chr5 (511-575)||(15464536-15464600)
chr5 (511-575)||(17003989-17004053)
chr5 (510-577)||(35385450-35385518)
chr5 (213-253)||(40222594-40222634)
chr5 (510-581)||(42238376-42238448)
chr5 (396-455)||(11962554-11962612)
chr5 (396-455)||(17841370-17841428)
chr5 (397-464)||(42770867-42770934)
chr5 (393-454)||(16093413-16093473)
chr5 (213-253)||(35385763-35385804)
chr5 (236-281)||(38960333-38960378)
chr5 (531-575)||(533893-533937)
chr5 (511-575)||(12084204-12084268)
chr5 (531-575)||(19806487-19806531)
chr5 (531-575)||(32636948-32636992)
chr5 (392-420)||(34033725-34033753)
chr5 (531-575)||(42428430-42428474)
[»] chr8 (107 HSPs)
chr8 (238-583)||(608727-609077)
chr8 (235-586)||(3874004-3874356)
chr8 (213-586)||(22684642-22685025)
chr8 (235-586)||(32339303-32339655)
chr8 (235-586)||(27829295-27829642)
chr8 (235-586)||(28251556-28251904)
chr8 (235-586)||(15809213-15809564)
chr8 (235-586)||(27826984-27827331)
chr8 (235-586)||(14807749-14808107)
chr8 (236-586)||(18810707-18811053)
chr8 (235-586)||(15072708-15073057)
chr8 (235-586)||(4424016-4424364)
chr8 (236-578)||(44720842-44721181)
chr8 (235-586)||(43530122-43530461)
chr8 (235-586)||(28283210-28283562)
chr8 (235-586)||(15067979-15068327)
chr8 (281-586)||(30480492-30480798)
chr8 (235-578)||(24873178-24873524)
chr8 (289-578)||(43079650-43079940)
chr8 (281-586)||(27106886-27107192)
chr8 (277-578)||(43082009-43082311)
chr8 (236-586)||(18812892-18813227)
chr8 (281-586)||(27911055-27911359)
chr8 (281-586)||(27957474-27957778)
chr8 (235-586)||(14419179-14419528)
chr8 (281-586)||(1225206-1225513)
chr8 (235-583)||(41384743-41385087)
chr8 (235-582)||(13858477-13858821)
chr8 (286-586)||(36865583-36865883)
chr8 (281-586)||(25952561-25952867)
chr8 (235-586)||(41382671-41383008)
chr8 (290-583)||(5372168-5372464)
chr8 (281-586)||(33541399-33541683)
chr8 (237-484)||(14477276-14477520)
chr8 (332-585)||(15956052-15956303)
chr8 (324-578)||(21482397-21482649)
chr8 (294-583)||(15185706-15185992)
chr8 (324-569)||(21480589-21480832)
chr8 (235-578)||(31162211-31162551)
chr8 (281-581)||(3005624-3005922)
chr8 (234-417)||(26775198-26775378)
chr8 (281-424)||(5622889-5623033)
chr8 (364-511)||(181623-181772)
chr8 (235-352)||(12517248-12517363)
chr8 (375-578)||(31035252-31035459)
chr8 (378-578)||(31578273-31578476)
chr8 (281-403)||(35872555-35872673)
chr8 (446-578)||(2468126-2468259)
chr8 (235-341)||(3886153-3886255)
chr8 (462-586)||(35872442-35872553)
chr8 (332-458)||(37214317-37214435)
chr8 (378-507)||(31573794-31573924)
chr8 (520-586)||(37214253-37214319)
chr8 (393-455)||(28332631-28332692)
chr8 (393-455)||(9021228-9021289)
chr8 (393-455)||(16752643-16752704)
chr8 (393-455)||(16757388-16757449)
chr8 (393-455)||(28327908-28327969)
chr8 (393-455)||(28895502-28895563)
chr8 (511-575)||(23799606-23799670)
chr8 (396-455)||(590797-590855)
chr8 (378-568)||(17847661-17847848)
chr8 (396-455)||(33032657-33032715)
chr8 (281-328)||(37214458-37214505)
chr8 (374-420)||(2468261-2468307)
chr8 (393-455)||(4812608-4812669)
chr8 (316-412)||(31035144-31035238)
chr8 (396-453)||(29554908-29554964)
chr8 (235-336)||(181535-181632)
chr8 (511-575)||(4696625-4696689)
chr8 (511-575)||(7412345-7412409)
chr8 (213-253)||(9021418-9021458)
chr8 (511-575)||(9765848-9765912)
chr8 (511-575)||(26403259-26403323)
chr8 (396-455)||(3276347-3276405)
chr8 (509-586)||(14477519-14477597)
chr8 (480-576)||(16833789-16833886)
chr8 (531-575)||(4743214-4743258)
chr8 (510-577)||(4812486-4812554)
chr8 (511-575)||(5702512-5702576)
chr8 (511-575)||(6127225-6127289)
chr8 (393-578)||(6376141-6376328)
chr8 (510-577)||(16757266-16757334)
chr8 (393-441)||(17799558-17799606)
chr8 (510-577)||(25684758-25684826)
chr8 (510-577)||(28890881-28890949)
chr8 (511-575)||(31071258-31071322)
chr8 (512-575)||(19752424-19752487)
chr8 (378-420)||(33839077-33839120)
chr8 (531-581)||(10930193-10930243)
chr8 (393-455)||(21033870-21033930)
chr8 (235-313)||(2468361-2468435)
chr8 (481-541)||(3896063-3896124)
chr8 (213-253)||(21033700-21033741)
chr8 (510-551)||(29554810-29554851)
chr8 (213-253)||(29555096-29555137)
chr8 (531-575)||(6599096-6599140)
chr8 (531-575)||(6674549-6674593)
chr8 (531-575)||(15212910-15212954)
chr8 (510-581)||(17799418-17799490)
chr8 (511-575)||(19175783-19175847)
chr8 (510-581)||(23179555-23179627)
chr8 (396-444)||(23179692-23179740)
chr8 (531-575)||(27811402-27811446)
chr8 (510-577)||(28328023-28328091)
chr8 (531-575)||(33352274-33352318)
chr8 (531-575)||(40321204-40321248)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (223-586)||(183630-183988)
scaffold0005 (235-581)||(51960-52307)
scaffold0005 (510-581)||(50235-50308)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (249-581)||(14376-14707)
scaffold0131 (235-581)||(14970-15313)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (281-586)||(79178-79484)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (235-544)||(1987-2298)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (235-586)||(3948-4294)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (236-586)||(2832-3178)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (236-578)||(6151-6490)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (277-586)||(29160-29469)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (235-586)||(11462-11810)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (277-578)||(30-332)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (355-586)||(1442-1673)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (281-586)||(79852-80158)
scaffold0004 (393-455)||(188363-188424)
scaffold0004 (213-253)||(188553-188594)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (296-586)||(85238-85530)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (293-467)||(35644-35819)
scaffold0011 (510-586)||(35817-35893)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (392-586)||(22221-22414)
scaffold0140 (392-586)||(24496-24689)
scaffold0140 (511-575)||(8448-8512)
scaffold0140 (236-282)||(22162-22208)
scaffold0140 (236-282)||(24437-24483)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (280-578)||(1638-1927)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (286-578)||(15817-16108)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (281-578)||(16646-16942)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (213-354)||(1053-1190)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (378-569)||(4901-5095)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (521-586)||(4668-4733)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (393-455)||(224819-224880)
scaffold0006 (511-575)||(5687-5751)
scaffold0006 (511-575)||(2496-2560)
scaffold0006 (511-575)||(133309-133373)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (543-586)||(1440-1483)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (396-455)||(16328-16386)
[»] scaffold0209 (3 HSPs)
scaffold0209 (510-581)||(16980-17052)
scaffold0209 (396-455)||(17107-17165)
scaffold0209 (213-253)||(17297-17338)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (512-572)||(10736-10796)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (393-551)||(57452-57613)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (510-577)||(3068-3136)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (511-575)||(43990-44054)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (511-575)||(45257-45321)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (531-575)||(20415-20459)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 158)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8631782 - 8631408
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  8631782 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 8631683  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8631682 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 8631583  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631582 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 8631483  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631482 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 8631408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 24348210 - 24348562
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagc-aaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  24348210 tacttttactataaatatagaccttgtatca-agctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggt 24348308  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24348309 ttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 24348408  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348409 ctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 24348508  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348509 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 24348562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 40637048 - 40637418
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| ||    
T  40637048 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 40637143  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  40637144 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgag 40637243  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637244 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 40637343  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637344 tagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 40637418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 235 - 584
Target Start/End: Original strand, 38409195 - 38409546
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag--agacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38409195 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactaggg 38409294  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38409295 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 38409394  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409395 gctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 38409493  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 584  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409494 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 38409546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 222 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2485223 - 2484862
Alignment:
Q  222 ttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2485223 ttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctaga---agggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaa 2485127  T
Q  322 caaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485126 caaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 2485027  T
Q  421 tacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatc 520  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485026 tacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatc 2484928  T
Q  521 ggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2484927 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtg 2484862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 6764813 - 6765188
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| ||    
T  6764813 ttgtttcatttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaa 6764908  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctcttt-----ggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattagga 406  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6764909 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttagga 6765008  T
Q  407 ttgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 506  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765009 ttgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 6765108  T
Q  507 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765109 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6765188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 47868375 - 47868745
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||    |||||||| ||||||||| ||    
T  47868375 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagag----ggctgaaagaagggtttagaa 47868470  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47868471 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 47868570  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47868571 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 47868670  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47868671 tagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtg 47868745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22044727 - 22044380
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22044727 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 22044632  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22044631 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 22044532  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044531 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 22044433  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044432 ctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22044380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 223 - 586
Target Start/End: Original strand, 14633304 - 14633662
Alignment:
Q  223 tttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaac 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||      |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14633304 tttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaa-----gggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaac 14633398  T
Q  323 aaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtt 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633399 aaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 14633498  T
Q  422 acgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 521  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  14633499 acg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacg 14633597  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633598 gagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 14633662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22047022 - 22046675
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22047022 tacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 22046927  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22046926 tgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 22046827  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046826 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 22046728  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046727 ctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22046675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37089710 - 37089361
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  37089710 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactt-gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 37089612  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  37089611 gtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggct 37089512  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37089511 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 37089413  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089412 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 37089361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 9148247 - 9148596
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  9148247 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagata--gagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatt 9148344  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9148345 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 9148444  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9148445 tgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 9148543  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148544 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 9148596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 24888792 - 24889140
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  24888792 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt----agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggat 24888887  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  24888888 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagac 24888987  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24888988 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctct 24889087  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889088 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 24889140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435298
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11435047  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||    
T  11435048 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtct 11435147  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435148 aggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 11435246  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435247 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 11435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 7941316 - 7941667
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7941316 acttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaacc--gggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 7941413  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac---ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  7941414 gtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagg 7941513  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7941514 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 7941613  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941614 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 7941667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22801199 - 22800851
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  22801199 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtt 22801104  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22801103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggc 22801004  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22801003 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 22800904  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800903 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22800851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 51015242 - 51015589
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  51015242 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 51015337  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51015338 tgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 51015437  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51015438 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctct 51015536  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015537 ctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 51015589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17662575 - 17662234
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17662575 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 17662476  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||           ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  17662475 tgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 17662287  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662286 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 17662234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22803071 - 22802723
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22803071 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 22802976  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacct-agggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22802975 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 22802876  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  22802875 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctct 22802776  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22802775 ctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 22802723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11006577 - 11006226
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |   |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11006577 acttttactataaatatagaccttgtatcagactattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11006478  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  11006477 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggc 11006378  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006377 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11006279  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11006278 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtg 11006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 5198416 - 5198764
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  5198416 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatt 5198511  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||      
T  5198512 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagat 5198611  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5198612 tggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 5198711  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5198712 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtg 5198764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40091752 - 40091404
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  40091752 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggat 40091657  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40091656 tgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggc 40091557  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  40091556 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 40091457  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091456 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 40091404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36921832 - 36921482
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36921832 tacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagata--gaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 36921736  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36921735 tgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 36921636  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36921635 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctc 36921536  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921535 tctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 36921482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11008865 - 11008557
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11008865 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 11008766  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11008765 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 11008666  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11008665 acccattgatttct---ttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 11008569  T
Q  575 aattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||    
T  11008568 aattcttttgtg 11008557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22132736 - 22132389
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag-----ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22132736 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactt 22132637  T
Q  330 gtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagga 428  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22132636 gggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22132538  T
Q  429 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22132537 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggct 22132439  T
Q  529 gctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132438 gctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 48486315 - 48486663
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  48486315 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 48486410  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  48486411 tgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 48486510  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  48486511 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 48486610  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  48486611 ctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtg 48486663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 18847150 - 18847496
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18847150 acttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagataga----gggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18847245  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||      
T  18847246 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagat 18847345  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18847346 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 18847444  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847445 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 18847496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31849894 - 31849588
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggttt-gtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  31849894 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggt 31849795  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31849794 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaaccc 31849695  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31849694 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaatt 31849596  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  31849595 cttttgtg 31849588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 47274723 - 47275069
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47274723 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 47274818  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  47274819 tgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagc 47274917  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47274918 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 47275017  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47275018 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtg 47275069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36919924 - 36919573
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36919924 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatag--ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 36919827  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36919826 tggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 36919727  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||    
T  36919726 ctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctc 36919627  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919626 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 36919573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 235 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 5637806 - 5637524
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5637806 tacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 5637707  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5637706 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 5637607  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 516  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637606 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 235 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 44600175 - 44599836
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  44600175 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 44600080  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  44600079 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 44599980  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44599979 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 44599881  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44599880 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 44599836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 24878985 - 24879334
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||     |||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  24878985 tacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaactt----ggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 24879080  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  24879081 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 24879180  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  24879181 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctc 24879280  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24879281 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtg 24879334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 24880447 - 24880796
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||     |||| |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24880447 tacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaactt----ggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 24880542  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  24880543 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 24880642  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  24880643 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctc 24880742  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24880743 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtg 24880796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38928473 - 38928166
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  38928473 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 38928374  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38928373 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38928274  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928273 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38928174  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  38928173 cttttgtg 38928166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 235 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14787770 - 14787423
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  14787770 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 14787673  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  14787672 tgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 14787573  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc- 532  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  14787572 tgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 14787473  T
Q  533 -tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14787472 ctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16934479 - 16934140
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16934479 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 16934384  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  16934383 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 16934284  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16934283 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16934185  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16934184 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 16934140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 235 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 47211083 - 47210756
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag--agacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  47211083 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 47210984  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||            || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  47210983 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 47210796  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtca 571  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  47210795 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 242 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9176804 - 9176471
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  9176804 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataa 9176709  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggac 439  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || |||    
T  9176708 agtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagac 9176609  T
Q  440 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9176608 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 9176510  T
Q  540 caaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9176509 cagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatt 9176471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 279 - 586
Target Start/End: Original strand, 16453345 - 16453654
Alignment:
Q  279 gagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtggg 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16453345 gagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 16453444  T
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 477  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16453445 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacc 16453544  T
Q  478 cattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  16453545 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaa 16453644  T
Q  577 ttcttttgtg 586  Q
    ||||||||||    
T  16453645 ttcttttgtg 16453654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18709508 - 18709161
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacaga----gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactag 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18709508 tacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 18709409  T
Q  331 tgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggag 429  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  18709408 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaag 18709309  T
Q  430 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 529  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18709308 agattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactg 18709210  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18709209 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 18709161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 277 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22134913 - 22134615
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  22134913 gagagagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtg 22134816  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22134815 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22134716  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134715 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22134618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9174482 - 9174143
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  9174482 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 9174387  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||      
T  9174386 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagat 9174287  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9174286 tgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttct 9174188  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174187 ctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 9174143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16932125 - 16931786
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16932125 acttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 16932030  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  16932029 gtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 16931930  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16931929 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16931831  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16931830 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 16931786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12396140 - 12395834
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||    
T  12396140 gagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggtt 12396041  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12396040 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaaccca 12395941  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12395940 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactc 12395841  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  12395840 ttttgtg 12395834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 277 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22780672 - 22780371
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22780672 gagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtg 22780573  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22780572 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgta 22780473  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22780472 acccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 22780374  T
Q  575 aat 577  Q
    |||    
T  22780373 aat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 277 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22783037 - 22782736
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22783037 gagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtg 22782938  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22782937 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 22782838  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  22782837 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaaca 22782739  T
Q  575 aat 577  Q
    |||    
T  22782738 aat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 316 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085966
Alignment:
Q  316 caacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtct 414  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  415 cttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 514  Q
    |||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  515 tggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtg 26085966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 235 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3824910 - 3824627
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaa-ctttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |   |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  3824910 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 3824813  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  3824812 ttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagagg 3824713  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824712 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12401102 - 12400796
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||    
T  12401102 gagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggtt 12401003  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12401002 gattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaaccca 12400903  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12400902 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactc 12400803  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  12400802 ttttgtg 12400796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 33415782 - 33415477
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  33415782 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggtt 33415684  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33415683 gattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 33415584  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33415583 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattc 33415484  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  33415483 ttttgtg 33415477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 235 - 583
Target Start/End: Original strand, 53405123 - 53405474
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  53405123 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 53405221  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||    
T  53405222 tgtatagagtttgtctctttagaacaaaactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggaga------cttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 528  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagct 53405421  T
Q  529 gctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53405422 g--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctttt 53405474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 19095920 - 19096227
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  19095920 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 19096019  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19096020 tgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccc 19096119  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19096120 attgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 19096219  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  19096220 cttttgtg 19096227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Original strand, 36378287 - 36378637
Alignment:
Q  234 ttactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  36378287 ttacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagac----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 36378382  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||     
T  36378383 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagaga 36378482  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 531  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36378483 ttgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 36378582  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36378583 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtg 36378637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 619784 - 619437
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  619784 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtt 619689  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||      
T  619688 tgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagat 619589  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  619588 tgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctct 619489  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  619488 ct-cccctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 619437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 281 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37313361 - 37313055
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||    
T  37313361 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagtt 37313262  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37313261 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 37313162  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  37313161 ttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaatt 37313062  T
Q  579 cttttgt 585  Q
    |||||||    
T  37313061 cttttgt 37313055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 555
Target Start/End: Original strand, 13543957 - 13544272
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcata-gcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtata 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13543957 actataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 13544056  T
Q  341 gagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctggga 438  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||    
T  13544057 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattggga 13544155  T
Q  439 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||  |    
T  13544156 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttc 13544255  T
Q  539 ccaaactatgtcaattt 555  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  13544256 ccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 243 - 582
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323035
Alignment:
Q  243 ctataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtataga 342  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||| |||    ||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtataga 19322795  T
Q  343 gtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |||||    
T  19322796 gtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 19322892  T
Q  442 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19322893 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctccccc 19322992  T
Q  541 aaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 582  Q
    | |||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19322993 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattcttt 19323035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 281 - 571
Target Start/End: Original strand, 56030482 - 56030770
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  56030482 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 56030581  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  56030582 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 56030681  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtca 571  Q
    ||||  | ||||||||||||||| ||||||||   || | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56030682 ttgacatttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 319 - 586
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380694
Alignment:
Q  319 caacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacc--tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctct 416  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaa-aaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatct 36380523  T
Q  417 tggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagt 515  Q
    |||||||  | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  516 ggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtg 36380694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 242 - 578
Target Start/End: Original strand, 41997495 - 41997828
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| | |    ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41997495 actataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaa----gggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatag 41997590  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||  || || |    
T  41997591 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagatt 41997690  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccc 539  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||    
T  41997691 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccc 41997789  T
Q  540 caaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41997790 cagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 437 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635465
Alignment:
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  537 ccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 5635465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 237 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537470
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||| |||    ||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||| ||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagataga----gggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt 18537713  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |    
T  18537712 gtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 18537616  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18537615 gagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 18537516  T
Q  534 ctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| | || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537515 ctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 292 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18409631 - 18409344
Alignment:
Q  292 ggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacctta 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||     
T  18409631 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttc 18409532  T
Q  391 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||  || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18409531 gggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctct 18409432  T
Q  491 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | ||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409431 tttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 356 - 581
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455581
Alignment:
Q  356 gaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattag 454  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  455 gcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat 553  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 16455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 436 - 586
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437706
Alignment:
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 11437706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 52942784 - 52942537
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgttt--catagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  52942784 tactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 52942690  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |         
T  52942689 tttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg----- 52942595  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaa 497  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52942594 --------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 419 - 586
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215650
Alignment:
Q  419 gttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 518  Q
    |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  519 tcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 4215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 326 - 586
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499386
Alignment:
Q  326 actagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 424  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  425 aggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgga 523  Q
    |  ||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||| ||||||||||| |||| || | || |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  524 gggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27499325 gggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtg 27499386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 391 - 586
Target Start/End: Original strand, 13547303 - 13547498
Alignment:
Q  391 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||    
T  13547303 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatct 13547402  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13547403 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtg 13547498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 281 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18535124 - 18534828
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  |||    
T  18535124 gagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggt 18535030  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18535029 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 18534930  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| || |  |||||||||||| |||| ||||||    
T  18534929 attgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaa 18534830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 384 - 586
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891636
Alignment:
Q  384 caccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga 483  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  484 tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 582  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  583 tgtg 586  Q
    ||||    
T  2891633 tgtg 2891636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 323 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  323 aaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |  || ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttg-gggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatca 38890379  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    || | ||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |     
T  38890378 cgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaaca 38890279  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||||||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890278 gagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3937504 - 3937316
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  3937504 gagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 3937405  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 468  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3937404 gattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttatt 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 8756587 - 8756247
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||     |||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| |||  |    
T  8756587 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaa----ggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggat 8756493  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgaggagag 431  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||||    
T  8756492 ttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagag 8756396  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 530  Q
      || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| || |||    
T  8756395 attgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgc 8756296  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||| ||| |||| |||   |||||| |||||||||| ||||||||    
T  8756295 tctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt 8756247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15032824 - 15032557
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcacc 387  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||         || || ||||||||      
T  15032824 agggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa---------tgagg-ttgattcata 15032737  T
Q  388 ttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttc 487  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  15032736 tttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatc 15032637  T
Q  488 tcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaact 565  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  15032636 tcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 460
Target Start/End: Original strand, 6132911 - 6133090
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  6132911 gagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggtt 6133009  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 460  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  6133010 gagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 377 - 578
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  574 aaatt 578  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 332 - 586
Target Start/End: Original strand, 30136641 - 30136894
Alignment:
Q  332 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggaga 430  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||    
T  30136641 gtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaaga 30136737  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 529  Q
       || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | || |||||    
T  30136738 aattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctg 30136837  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  30136838 ctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtg 30136894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 443 - 586
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101272
Alignment:
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||     
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccag 5101228  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 5101272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454020
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 477  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  478 cattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
      ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||| |||| || | | |||||||||||||||| |||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaa 28454017  T
Q  576 att 578  Q
    |||    
T  28454018 att 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | | | ||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 538  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga-aga---ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38270226  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactatta 403  Q
    | |||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38270225 tgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||| ||||| | || |    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-t 16185920  T
Q  492 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 360
Target Start/End: Original strand, 2891360 - 2891434
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaaca 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891360 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24446874 - 24446756
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||    
T  24446874 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggtt 24446780  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactatta 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  24446779 gattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 392 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 3982362 - 3982186
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctc 489  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  | ||||||||||||||||||| |   || |||| ||| ||||||| | ||||| ||||    
T  3982362 gaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctc 3982263  T
Q  490 ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaac 564  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||    
T  3982262 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 462 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446643
Alignment:
Q  462 acttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccg 561  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||             ||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 24446668  T
Q  562 aactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24446667 aactgggtcaacaaattcttttgtg 24446643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 490 - 586
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563105
Alignment:
Q  490 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 47563105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357979
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggta----gaattaggcggga-gacttatttttg 472  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||||  ||||||||||| ||    |||||| |   || |||||||| |||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  473 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtc 570  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| | |||| |||| | ||||||| ||||||||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  571 aacaaatt 578  Q
    ||||||||    
T  25357972 aacaaatt 25357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Original strand, 9863842 - 9864049
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| ||   | ||||| ||| |||||||    
T  9863842 ttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaac 9863941  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggctgctctct--cccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggt 569  Q
    |  ||||| |||| ||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  9863942 cttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggt 9864040  T
Q  570 caacaaatt 578  Q
     ||||||||    
T  9864041 aaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 378
Target Start/End: Original strand, 5100993 - 5101133
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||  | |||| |||||| |||    |||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  5100993 tacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagataga----ggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 5101088  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5101089 tgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150889
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | ||  | || | ||||||| | |||| |||||| |||||||||| ||||| |||     
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaact 47150893  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  47150892 aatt 47150889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40998990
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||   | |||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||    
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaac 40999049  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||    
T  40999048 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 569
Target Start/End: Original strand, 10113003 - 10113198
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagg-agaggctgggactttgggtagaattag-gcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||||||    
T  10113003 ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaa 10113102  T
Q  476 cc-cattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggt 569  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| | |||| || | | ||||||||||||||||    
T  10113103 cctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789422
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctc--ccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133181
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtg 6133181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 582
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  464 ttatttttgtaacccattgatttct-cttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa-actatgtcaatttggaccg 561  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||  || ||||||||||| | |||| |||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  562 aactgggtcaacaaattcttt 582  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 577
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853732
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||| ||| ||||    ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 11853644  T
Q  492 ttgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    | |||| |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  11853645 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 11853732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 425
Target Start/End: Original strand, 10114463 - 10114510
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacga 425  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10114463 ttgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacga 10114510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300485
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942477
Alignment:
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtg 52942477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688934
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| ||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 16689025  T
Q  495 taacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 578
Target Start/End: Original strand, 26557833 - 26557922
Alignment:
Q  491 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557833 tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 18587082 - 18587154
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18587082 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831202
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 574
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 574
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 549 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3937300 - 3937263
Alignment:
Q  549 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3937300 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtg 3937263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 4884990 - 4885062
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4884990 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336769
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| |||||| ||  | || ||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  492 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |   || |  | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtg 5336769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 8529383 - 8529455
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  8529383 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24333877 - 24333813
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| || |||||    
T  24333877 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 24333813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Original strand, 25357633 - 25357709
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag-ggggctg-aaacaagggttta 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25357633 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggttta 25357709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147391
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824599
Alignment:
Q  555 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 574
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | | || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 263
Target Start/End: Original strand, 15312152 - 15312203
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatatagaccttgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15312152 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatataagccttgttt 15312203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 521 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5147735 - 5147681
Alignment:
Q  521 ggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5147735 ggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5147681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771457
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattagg 36771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4556411 - 4556370
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4556411 ttgtttcagttttttaaggggttactttccactataaatata 4556370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 441
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884922
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 15830971 - 15831012
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15830971 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 15831012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 18586796 - 18586837
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18586796 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 18586837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 31300254 - 31300295
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31300254 ttgtttcagttttttaaggggttactttccactataaatata 31300295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 565
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34495906
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaact 565  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaact 34495906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143263
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630773
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| ||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862115
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 29254618 - 29254662
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29254618 tctctctcccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29254662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 36769595 - 36769667
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||| | |||||||||||    
T  36769595 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 36769667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 437 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38270148 - 38270120
Alignment:
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagactt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270148 gactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45687226 - 45687182
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45687226 tctctcctccatattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45687182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038411
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 523 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  523 agggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 149)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 40946254 - 40946628
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40946254 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaa 40946353  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  40946354 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgag 40946453  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946454 tctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 40946553  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946554 tagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 40946628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 48457579 - 48457953
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  48457579 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 48457678  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48457679 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgag 48457778  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457779 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 48457878  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457879 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 48457953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 38393934 - 38394286
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38393934 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38394033  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38394034 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38394233  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394234 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 38394286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7470356 - 7470011
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7470356 actataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 7470257  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7470256 agattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 7470157  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7470156 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctccccc 7470057  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470056 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 7470011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7472314 - 7471969
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7472314 actataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 7472215  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  7472214 agattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaact 7472115  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7472114 ttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctccccc 7472015  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472014 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 7471969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Original strand, 3878540 - 3878877
Alignment:
Q  248 aatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttg 347  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3878540 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 3878637  T
Q  348 tctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggt 446  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  3878638 tctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 3878737  T
Q  447 agaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaacta 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3878738 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacta 3878837  T
Q  547 tgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878838 tgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3878877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Original strand, 20625995 - 20626338
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20625995 tataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 20626094  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggacttt 442  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20626095 tttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 20626194  T
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20626195 gggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 20626294  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626295 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 20626338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Original strand, 20629886 - 20630229
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20629886 tataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 20629985  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggacttt 442  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20629986 tttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 20630085  T
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20630086 gggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 20630185  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630186 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 20630229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Original strand, 20642305 - 20642648
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20642305 tataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 20642404  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggacttt 442  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20642405 tttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 20642504  T
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20642505 gggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 20642604  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642605 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 20642648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 3035669 - 3036024
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3035669 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 3035768  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacg---aggaga 430  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  3035769 tttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 3035968  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3036024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 1849917 - 1850281
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag------------ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaac 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1849917 tacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaa 1850016  T
Q  323 aaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtt 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1850017 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgctt 1850116  T
Q  422 acgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 521  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850117 acgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 1850216  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850217 gagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1850281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Original strand, 44724580 - 44724879
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44724580 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 44724679  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44724680 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 44724779  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724780 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 44724879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 20299406 - 20299760
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaaggg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||    
T  20299406 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 20299505  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggttt-gtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20299506 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgct 20299705  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299706 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 20299760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049285
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 1049536  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1049535 gtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 1049436  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1049435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctc 1049337  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049336 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1049285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836732
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||   ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaa-tttg---gagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40836983  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40836982 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 40836883  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836882 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 40836784  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836783 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 40836732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 18345489 - 18345841
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||     ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18345489 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 18345588  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18345589 tgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggc 18345688  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18345689 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttct 18345788  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18345789 ctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtg 18345841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1047223 - 1046914
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1047223 gagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 1047124  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1047123 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1047024  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047023 cccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1046925  T
Q  576 attcttttgtg 586  Q
    |||||||||||    
T  1046924 attcttttgtg 1046914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 44516 - 44864
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44516 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 44611  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||     
T  44612 tgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggt 44711  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  44712 tgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgcttt 44811  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44812 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 44864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31435384 - 31435035
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31435384 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 31435289  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31435288 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 31435189  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31435188 tggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctc 31435089  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435088 tctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 31435035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 35581 - 35929
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||    
T  35581 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtt 35676  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35677 tgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggc 35776  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  35777 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgcttt 35876  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35877 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtg 35929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 235 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27306566 - 27306224
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27306566 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27306471  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27306470 t-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 27306372  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27306371 tgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 27306272  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27306271 ctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 27306224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 20297310 - 20297662
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  20297310 tacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtt 20297409  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  20297410 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 20297509  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20297510 tggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 20297609  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20297610 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtg 20297662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 243 - 586
Target Start/End: Original strand, 28487509 - 28487853
Alignment:
Q  243 ctataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtataga 342  Q
    ||||||||||||||| ||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28487509 ctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtataga 28487608  T
Q  343 gtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| |||    
T  28487609 gtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctt 28487708  T
Q  442 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28487709 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctccccca 28487808  T
Q  542 aactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28487809 gactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtg 28487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542828
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||     ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga-----ggggctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggttt 25542578  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||    
T  25542579 gtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagact 25542677  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25542678 gggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctc 25542776  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542777 tcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 25542828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 28485514 - 28485865
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28485514 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 28485613  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  28485614 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctct 28485813  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485814 ct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 28485865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7351995 - 7351649
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  7351995 tacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggc 7351896  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggaga 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  7351895 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 7351796  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351795 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 7351697  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7351696 tctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 7351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 43253861 - 43253506
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagg----gggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactag 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||     |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  43253861 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactag 43253762  T
Q  331 tgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggag 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  43253761 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaag 43253663  T
Q  430 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 529  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43253662 aggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 43253563  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43253562 ctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtg 43253506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31156248 - 31155908
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31156248 tacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 31156153  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||     
T  31156152 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagaga 31156053  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31156052 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctc 31155954  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31155953 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31155908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20137404 - 20137098
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  20137404 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 20137305  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20137304 gattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 20137205  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137204 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20137106  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  20137105 cttttgtg 20137098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13099813 - 13099463
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| ||    |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13099813 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaacctt----gagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 13099718  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||      
T  13099717 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagat 13099618  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 531  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  13099617 tggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgct 13099518  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099517 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 13099463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4296230 - 4295923
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  4296230 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggt 4296131  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4296130 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 4296031  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4296030 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaatt 4295931  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  4295930 cttttgtg 4295923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Original strand, 11355252 - 11355555
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||    
T  11355252 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggtt 11355351  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11355352 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 11355451  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355452 ttgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 11355551  T
Q  580 tttt 583  Q
    ||||    
T  11355552 tttt 11355555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21592438 - 21592132
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21592438 gagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 21592339  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21592338 gattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactca 21592239  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592238 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 21592139  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  21592138 ttttgtg 21592132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 235 - 521
Target Start/End: Original strand, 11757176 - 11757465
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaaggg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||    
T  11757176 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 11757275  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggttt-gtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11757276 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 11757465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 42331336 - 42330986
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||    
T  42331336 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtt 42331241  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagg--agag 431  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||    
T  42331240 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagag 42331141  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||  |    
T  42331140 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctatt 42331041  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331040 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 42330986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 235 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 7349616 - 7349285
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7349616 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 7349517  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggaga 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  7349516 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 7349417  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7349416 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 7349318  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaa 563  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  7349317 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681120
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcata-gcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 9681067  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  9681068 ctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtg 9681120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Original strand, 9679013 - 9679359
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcata-gcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtata 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9679013 actataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 9679112  T
Q  341 gagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctggga 438  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||    
T  9679113 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattggga 9679211  T
Q  439 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||  |    
T  9679212 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttc 9679311  T
Q  539 ccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9679312 ccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtg 9679359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 286 - 586
Target Start/End: Original strand, 24748593 - 24748895
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24748593 agagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 24748692  T
Q  385 accttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24748693 accctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 24748792  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24748793 atctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctttt 24748892  T
Q  584 gtg 586  Q
    |||    
T  24748893 gtg 24748895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 443547 - 443896
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||    |||| |||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  443547 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaacctt----gagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 443642  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||      
T  443643 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagat 443742  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  443743 tgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctct 443842  T
Q  534 ct-cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443843 ctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 443896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Original strand, 21990153 - 21990450
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacct 388  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21990153 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 21990252  T
Q  389 taggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 488  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||    
T  21990253 tgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatct 21990352  T
Q  489 cttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990353 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 21990450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37412416 - 37412114
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattca 385  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37412416 agggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattca 37412317  T
Q  386 ccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatt 485  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  37412316 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgata 37412217  T
Q  486 tctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37412216 tctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattctttt 37412117  T
Q  584 gtg 586  Q
    |||    
T  37412116 gtg 37412114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 281 - 581
Target Start/End: Original strand, 21678060 - 21678361
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  21678060 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 21678159  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21678160 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaaccca 21678259  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21678260 ttgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc 21678359  T
Q  580 tt 581  Q
    ||    
T  21678360 tt 21678361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Original strand, 21680021 - 21680327
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  21680021 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggtt 21680120  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21680121 gattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaaccca 21680220  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaa---ctgggtcaacaaa 576  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||   |||||||||||||    
T  21680221 atgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaa 21680320  T
Q  577 ttctttt 583  Q
    | |||||    
T  21680321 tactttt 21680327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 287 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 39146276 - 39145975
Alignment:
Q  287 gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattca 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  39146276 gagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattca 39146177  T
Q  386 ccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatt 485  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  39146176 ccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgata 39146077  T
Q  486 tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 584  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39146076 tctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttg 39145977  T
Q  585 tg 586  Q
    ||    
T  39145976 tg 39145975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 363 - 586
Target Start/End: Original strand, 38396712 - 38396934
Alignment:
Q  363 cctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 462  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396712 cctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  463 cttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccga 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  38396812 cttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 38396910  T
Q  563 actgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38396911 actgggtcaacaaattcttttgtg 38396934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 295 - 585
Target Start/End: Original strand, 42223165 - 42223457
Alignment:
Q  295 tgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttagg 392  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  42223165 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga 42223264  T
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||  |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  42223265 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttt 42223364  T
Q  493 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223365 tgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 42223457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 364 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7092423 - 7092202
Alignment:
Q  364 ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 463  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7092423 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 7092324  T
Q  464 ttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaa 563  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7092323 ttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaa 7092225  T
Q  564 ctgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7092224 ctgggtcaacaaattcttttgtg 7092202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 357 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094449
Alignment:
Q  357 aacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggc 456  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaacatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggc 7094579  T
Q  457 gggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttg 556  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7094578 gggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 7094479  T
Q  557 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7094478 gactgaactgggtcaataaattcttttgtg 7094449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27832916 - 27832631
Alignment:
Q  293 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttag 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27832916 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgg 27832817  T
Q  392 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27832816 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27832717  T
Q  492 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832716 ctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 281 - 563
Target Start/End: Original strand, 24258457 - 24258744
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||    
T  24258457 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggtt 24258556  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||  || |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  24258557 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaaccca 24258656  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaa 563  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||    
T  24258657 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 237 - 518
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276374
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25276190  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  25276191 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 25276290  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 518  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25276291 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 26804563 - 26804765
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac----ctagggtttgtgg 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||    
T  26804563 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagg 26804662  T
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26804663 gttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26804762  T
Q  477 cca 479  Q
    |||    
T  26804763 cca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2935474 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 40945704 - 40945908
Alignment:
Q  9 tgaagtgtgtgacaaattattcacagctatgtgtcagggaaaaatcattgatcctcttcttgaatgcttgggagagtggaacggtgctcctcttcctatt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40945704 tgaagtgtgtgacaaattattcacagctatgtgtcagggaaaaatcattgatcctcttcttgaatgcttgggagagtggaacggtgctcctcttccaatt 40945803  T
Q  109 tgttaacnnnnnnngttattttataaaatgctttat---ttgtattttatacaagtgtatcaataatcatatagtttattcgtgcctttaacaaattaat 205  Q
    |||||||       |||| ||   ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||  |||||||||||||||||    
T  40945804 tgttaactttgttggttaattatgaaaatgctttatttgttgtattttatacaagtgtatcaaaaatcatgtaggtttttcaagcctttaacaaattaat 40945903  T
Q  206 atgga 210  Q
    |||||    
T  40945904 atgga 40945908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 281 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22828928 - 22828672
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||| |||||  ||||    
T  22828928 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggtt 22828829  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22828828 gattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22828729  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||    
T  22828728 ttgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 290 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 24817635 - 24817362
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacct 388  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  24817635 ggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcacct 24817541  T
Q  389 taggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 488  Q
    | | || || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  24817540 tggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtct 24817441  T
Q  489 cttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaact 565  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  24817440 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137377
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22137283 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 22137377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552404
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40552310 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 40552404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1606585 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108366
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22108272 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 22108366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 316 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813494
Alignment:
Q  316 caacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtct 414  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  415 cttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 513  Q
    |||||| ||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  514 gtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 24813494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550126
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40550032 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 40550126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Original strand, 7188495 - 7188833
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||    ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| |||    
T  7188495 tacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtt 7188589  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||      
T  7188590 tgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagat 7188686  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7188687 tgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctc 7188786  T
Q  533 tctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||| |||||  ||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188787 tcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251602
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||| |||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagataga----ggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagttt 22251783  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  22251782 gtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagatt 22251691  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 518  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22251690 gaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9027277 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 20091878 - 20091581
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | ||| || |||| |||||| |||    ||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||||||||| ||    
T  20091878 tacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggt 20091785  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||  |  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | ||||      
T  20091784 ttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagat 20091687  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  20091686 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctct 20091589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 40959669 - 40959854
Alignment:
Q  9 tgaagtgtgtgacaaattattcacagctatgtgtcagggaaaaatcattgatcctcttcttgaatgcttgggagagtggaacggtgctcctcttcctatt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40959669 tgaagtgtgtgacaaattattcacagctatgtgtcagggaaaaatcattgatcctcttcttgaatgcttgggagagtggaacggtgctcctcttccaatt 40959768  T
Q  109 tgttaacnnnnnnngttattttataaaatgctttatttgtattttatacaagtgtatcaataatcatatagtttattcgtgcctttaa 196  Q
    |||||||       |||| ||   |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  40959769 tgttaactttgttggttaattctgaaaatgttttatttgta-tctatacaagtgtaacaataatcat-taggtttttcatgcctttaa 40959854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 404
Target Start/End: Original strand, 18567565 - 18567731
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18567565 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 18567660  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18567661 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 440 - 586
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394023
Alignment:
Q  440 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  539 ccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtg 22394023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 437 - 581
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295743
Alignment:
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    || ||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 324 - 578
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465829
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||   |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtca 24465673  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
     | | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||| || | ||    
T  24465674 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacg 24465772  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |  | ||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  24465773 ggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 578
Target Start/End: Original strand, 6332326 - 6332514
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggc-gggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||  || |||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  6332326 aaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctctt 6332425  T
Q  492 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6332426 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7094754 - 7094673
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaa 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7094754 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaa 7094673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattag-gcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  || ||||||||||||||||||    | ||| | ||| |||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  477 cc-attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    ||  || || ||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  574 aaatt 578  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 437 - 510
Target Start/End: Original strand, 6348933 - 6349006
Alignment:
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  6348933 gactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7092509 - 7092426
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaa 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7092509 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 7092426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 420
Target Start/End: Original strand, 22392425 - 22392595
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||          ||||||| |||    
T  22392425 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtt 22392512  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    |||||||| |||| || || | ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22392513 tgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 22392595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 581
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351539
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| |    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25351447  T
Q  492 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 578
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081803
Alignment:
Q  297 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa 395  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||   ||||| | ||||||| ||||||||    | ||||||||| || |||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccatt--gatttctcttt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||  | ||| |||| ||| |||||||   || |||| ||| ||||||||| ||  ||| ||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  493 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||| | | | |||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 523 - 586
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759427
Alignment:
Q  523 agggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 11759427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 348
Target Start/End: Original strand, 38396306 - 38396377
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgt 348  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38396306 gagagagagggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 581
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357233
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| |    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25357141  T
Q  492 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||| || | || ||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 581
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2121087
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| |    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 2120993  T
Q  492 ttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2120994 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaattctt 2121087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 581
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410318
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| |    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25410224  T
Q  492 ttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25410225 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069841
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 577
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405576
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||| ||| ||||    ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 25405488  T
Q  492 ttgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    | |||| |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  25405489 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 434 - 563
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046772
Alignment:
Q  434 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 531  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  | || ||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgct 6046739  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaa 563  Q
    |||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  6046740 ctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 586
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804810
Alignment:
Q  538 cccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtg 26804810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 546
Target Start/End: Original strand, 6048961 - 6049133
Alignment:
Q  378 ttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 475  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   || |||||||| ||||||||||   | |||| |||| || |||    
T  6048961 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataa 6049060  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatc---atatagtggatcggagggctgctctctcccccaaacta 546  Q
    ||| ||||| || | ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||    
T  6049061 ccctttgatatc-cctttgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatacta 6049133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 22108114 - 22108160
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22108114 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagaga 22108160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 22137125 - 22137171
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22137125 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagaga 22137171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 40549874 - 40549920
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40549874 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagaga 40549920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 40552152 - 40552198
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40552152 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagaga 40552198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Original strand, 1606422 - 1606467
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1606422 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 1606467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 396 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7464697 - 7464652
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  7464697 cactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggactt 7464652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 3320117 - 3320049
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3320117 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 3324865 - 3324797
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3324865 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732969
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546874
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41649011
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 6067264 - 6067193
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattct 580  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6067264 tatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattct 6067193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 424
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369673
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacg 21369673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251574
Alignment:
Q  555 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22251574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  || || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  381 attcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||| ||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  480 ttgattt 486  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || ||||  |||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7464870 - 7464829
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7464870 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 7464829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9027440 - 9027395
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  9027440 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagag 9027395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 25351184 - 25351225
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25351184 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 25351225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 25356878 - 25356919
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25356878 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 25356919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 25409961 - 25410002
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25409961 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 25410002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 30246800 - 30246841
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30246800 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 30246841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34547215 - 34547174
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34547215 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 34547174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44010929 - 44010884
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  44010929 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggactt 44010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44512877 - 44512836
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44512877 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 44512836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 2075231 - 2075303
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  2075231 tatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 2935306 - 2935354
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaga 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  2935306 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagtgaga 2935354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 4586285 - 4586329
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4586285 tctctcccccatattatgtcaacttggaccgaactgggtcgacaa 4586329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 7069895 - 7069963
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  7069895 tatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 7069963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 7464585 - 7464513
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  7464585 tatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960820
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 535 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 38671262 - 38671222
Alignment:
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38671262 tcccccaaaataggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38671222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44016840 - 44016792
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgg 444  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||    
T  44016840 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggaatttgg 44016792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848777
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||   || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 177)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4308638 - 4308268
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||    
T  4308638 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 4308543  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4308542 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 4308443  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308442 tctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 4308343  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308342 tagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 4308268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 43228191 - 43228561
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| ||||| ||    
T  43228191 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagagtttagaa 43228286  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43228287 aggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 43228386  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228387 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 43228486  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43228487 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtg 43228561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 213 - 581
Target Start/End: Original strand, 43225986 - 43226350
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| ||    
T  43225986 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 43226081  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43226082 aggcaacaacaaaactac-gtttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 43226180  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226181 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 43226280  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226281 tagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43226350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 38889962 - 38890310
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  38889962 acttttactataaatatagaccttgt---atagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 38890058  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  38890059 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 38890158  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890159 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 38890258  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890259 tcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 38890310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 51727363 - 51726994
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||| ||    
T  51727363 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaa----gggggctgaaacaagggtttagaa 51727268  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagt 412  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51727267 aggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 51727168  T
Q  413 ctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 512  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727167 ctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 51727068  T
Q  513 agtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51727067 agtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 51726994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10084726 - 10084376
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10084726 cttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttg 10084627  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  10084626 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctg 10084527  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084526 ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 10084427  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10084426 ccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 10084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4104234 - 4103883
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4104234 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4104135  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4104134 tgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctat 4103936  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103935 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 4103883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 236 - 585
Target Start/End: Original strand, 11170327 - 11170673
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11170327 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11170422  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  11170423 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggct 11170522  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11170523 gggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 11170622  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11170623 tcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgt 11170673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 215 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27101540 - 27101168
Alignment:
Q  215 gtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27101540 gtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaag 27101441  T
Q  315 gcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtc 413  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27101440 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27101341  T
Q  414 tcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 513  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27101340 tcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatata 27101241  T
Q  514 gtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27101240 gtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtg 27101168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9604969 - 9604594
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaa 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||     
T  9604969 ttgttttagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttag 9604871  T
Q  311 aaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg 409  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9604870 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 9604771  T
Q  410 agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca 509  Q
    |||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604770 agtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca 9604671  T
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9604670 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 9604594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 30005719 - 30006111
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag------------------ggggc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||                  |||||    
T  30005719 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagactttgtattagagcaaactttgagagagagagagagagagagagagatagagggggc 30005818  T
Q  295 tgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttagga 393  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30005819 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 30005918  T
Q  394 aacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttt 493  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30005919 aacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttt 30006018  T
Q  494 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006019 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 30006111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 25533356 - 25533712
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaacttt----gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactag 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25533356 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 25533455  T
Q  331 tgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggag 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  25533456 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaag 25533555  T
Q  430 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 529  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533556 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 25533655  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25533656 ctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtg 25533712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18099493 - 18099157
Alignment:
Q  248 aatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttg 347  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18099493 aatatagaccttgtatcagagtaaactt---gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 18099397  T
Q  348 tctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggt 446  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18099396 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 18099297  T
Q  447 agaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaacta 546  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  18099296 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagacta 18099197  T
Q  547 tgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099196 ggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 18099157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859797
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3859546  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3859547 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 3859646  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3859647 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctc 3859745  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859746 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3859797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Original strand, 42990264 - 42990574
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacct-agggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |    
T  42990264 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgag 42990363  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42990364 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 42990463  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990464 ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42990563  T
Q  576 attcttttgtg 586  Q
    |||||||||||    
T  42990564 attcttttgtg 42990574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18097235 - 18096887
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  18097235 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactt---gagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 18097139  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18097138 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 18097039  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18097038 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctc 18096939  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18096938 tcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtg 18096887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 45882861 - 45883210
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  45882861 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 45882956  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  45882957 tgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggt 45883056  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45883057 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 45883156  T
Q  534 ctccccc-aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883157 ctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 45883210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 5191576 - 5191921
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5191576 acttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 5191671  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5191672 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 5191771  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5191772 gggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctc 5191870  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191871 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 5191921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114292
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggttt 22114544  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22114543 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 22114444  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  22114443 gggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctc 22114344  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114343 tcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22114292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10191648 - 10191305
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  10191648 tacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtt 10191549  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||    
T  10191548 tttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggc 10191449  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191448 tgg-actttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10191350  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191349 ctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10956355 - 10956014
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| |   || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10956355 actataaatatagaccttgtatcagagtaaacat---ga-agatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccacc 10956060  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956059 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 10956014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 242 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 10958651 - 10958313
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| |    | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10958651 actataaatatagaccttgtatcagagtaaacat----aaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 10958356  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958355 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10958313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 235 - 577
Target Start/End: Original strand, 458202 - 458545
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  458202 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 458301  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  458302 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 458401  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  458402 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 458500  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  458501 tctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaat 458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Original strand, 746673 - 747019
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  746673 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 746772  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggaga 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  746773 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 746872  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  746873 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgc 746971  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  746972 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 747019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 1313332 - 1313679
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| ||    |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  1313332 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaa-ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtt 1313426  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||      
T  1313427 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagat 1313526  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1313527 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 1313626  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313627 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1313679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 321 - 586
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321749
Alignment:
Q  321 acaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttgg 419  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  420 ttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 519  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  520 cggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1321749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6063782 - 6063441
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6063782 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6063685  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  6063684 gtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 6063585  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6063584 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 6063486  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  6063485 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatt 6063441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 235 - 577
Target Start/End: Original strand, 455825 - 456168
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  455825 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 455924  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  455925 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 456024  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  456025 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 456123  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  456124 tctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaat 456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 236 - 577
Target Start/End: Original strand, 50493922 - 50494260
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  50493922 actttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 50494017  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |      
T  50494018 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggat 50494117  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50494118 tgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 50494216  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50494217 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 35918306 - 35917944
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||    
T  35918306 ttgttttagtttttaaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 35918211  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-------ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattagg 405  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  35918210 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattaga 35918111  T
Q  406 attgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918110 attgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 35918011  T
Q  506 atcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  35918010 attatatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 277 - 578
Target Start/End: Original strand, 25388866 - 25389167
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25388866 gagagagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 25388965  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25388966 ggttgattcacctt-ggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgta 25389064  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25389065 acccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 25389163  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  25389164 aatt 25389167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1626976 - 1626670
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  1626976 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 1626877  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1626876 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaaccca 1626777  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1626776 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattc 1626677  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  1626676 ttttgtg 1626670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522614
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 5522854  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    ||           ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5522853 gt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 5522765  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522764 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 5522666  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522665 tcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 5522614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 26720470 - 26720817
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26720470 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 26720565  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  26720566 tgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggc 26720664  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  26720665 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctct 26720764  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26720765 ctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtg 26720817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065791
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6066035  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  6066034 gtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 6065935  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6065934 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctct 6065836  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||| | |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  6065835 ctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatt 6065791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28102295 - 28101989
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28102295 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 28102196  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28102195 gattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28102096  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28102095 ttgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattc 28101996  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  28101995 ttttgtg 28101989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 43423756 - 43423450
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  43423756 gagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 43423657  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  43423656 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactca 43423557  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423556 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 43423457  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  43423456 ttttgtg 43423450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 24979629 - 24979978
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  24979629 tactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 24979724  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||      
T  24979725 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagat 24979824  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaa-cgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  24979825 tgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctc 24979924  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24979925 tctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtg 24979978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 287 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 53917951 - 53917651
Alignment:
Q  287 gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattca 385  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53917951 gagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 53917852  T
Q  386 ccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatt 485  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  53917851 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 53917752  T
Q  486 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917751 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 53917652  T
Q  586 g 586  Q
    |    
T  53917651 g 53917651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 3314648 - 3314955
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3314648 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 3314747  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3314748 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3314847  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314848 ttgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3314947  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  3314948 cttttgtg 3314955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 537
Target Start/End: Original strand, 29956564 - 29956907
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag------------------ggggc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||                  |||||    
T  29956564 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagactttgtattagagcaaactttgagagagagagagagagagagagagatagagggggc 29956663  T
Q  295 tgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacct-agggtttgtgggttgattcaccttagga 393  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  29956664 tgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttggga 29956763  T
Q  394 aacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttt 493  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29956764 aacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttt 29956863  T
Q  494 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29956864 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 277 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10621827 - 10621525
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  10621827 gagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtg 10621728  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10621727 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 10621628  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  10621627 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaaca 10621529  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  10621528 aatt 10621525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 51943293 - 51943640
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| | |||| |||    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  51943293 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagataga----gggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 51943388  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  51943389 tgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 51943488  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  51943489 tggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 51943587  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51943588 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtg 51943640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 274 - 577
Target Start/End: Original strand, 38210327 - 38210631
Alignment:
Q  274 tttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggttt 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38210327 tttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggttt 38210426  T
Q  373 gtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattttt 471  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38210427 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 38210526  T
Q  472 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtca 571  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  38210527 gtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtca 38210625  T
Q  572 acaaat 577  Q
    ||||||    
T  38210626 acaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 32264378 - 32264025
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| |      |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  32264378 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtt 32264279  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  32264278 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 32264179  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 531  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32264178 tggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 32264079  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  32264078 ctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtg 32264025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 229 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 47149241 - 47148890
Alignment:
Q  229 agggattactttcactataaatatagaccttgtttcata-gcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaac 327  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | | |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47149241 agggattgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac 47149142  T
Q  328 tagtgtttgtatagagtttgtctctttggaa-caaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacga 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  47149141 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacctt-ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgg 47149043  T
Q  426 ggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagg 525  Q
    | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  47149042 gaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagagg 47148943  T
Q  526 gctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47148942 actgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 18162586 - 18162933
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcat-agcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18162586 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagataga------gggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 18162679  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  18162680 ttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 18162779  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18162780 ttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 18162879  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18162880 ctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtg 18162933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 43421708 - 43421402
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  43421708 gagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 43421609  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43421608 gattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaaccca 43421509  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421508 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 43421409  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  43421408 ttttgtg 43421402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 53915831 - 53915483
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| || ||| |||    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||    
T  53915831 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagataga----gggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtt 53915736  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  53915735 tgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 53915636  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  53915635 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctct 53915536  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53915535 ctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtg 53915483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 281 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 5927057 - 5926755
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5927057 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggtt 5926958  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5926957 gattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 5926858  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    || || | |||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926857 tttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 5926758  T
Q  580 ttt 582  Q
    |||    
T  5926757 ttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606575
Alignment:
Q  339 tagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctggg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  438 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  538 cccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 7606575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12268301 - 12267962
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaa-ctagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||    ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  12268301 tacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagataga----gggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggt 12268206  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12268205 ttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 12268106  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  12268105 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 12268017  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268016 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 12267962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 53468741 - 53468440
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||    
T  53468741 agggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccag-gtttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcac 53468643  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  53468642 cttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 53468543  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccc--aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468542 ctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 53468443  T
Q  584 gtg 586  Q
    |||    
T  53468442 gtg 53468440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 42992204 - 42992540
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42992204 tacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtt 42992303  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||      
T  42992304 tgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagag 42992403  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    | |||||||||||||               ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42992404 t-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctct 42992487  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42992488 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtg 42992540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 880745 - 880438
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  880745 gagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 880646  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  880645 tgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaaccc 880546  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  880545 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaatt 880446  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  880445 cttttgtg 880438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 48362005 - 48361658
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |    |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||    
T  48362005 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagataca----gggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtt 48361911  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||      
T  48361910 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagat 48361811  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||    
T  48361810 tggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctct 48361711  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48361710 ctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtg 48361658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 315 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28413291 - 28413018
Alignment:
Q  315 gcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattga-gt 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28413291 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagt 28413192  T
Q  413 ctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 512  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  28413191 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatat 28413093  T
Q  513 agtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtg 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  28413092 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtg 28413018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 238 - 532
Target Start/End: Original strand, 6561735 - 6562028
Alignment:
Q  238 tttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgt 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6561735 tttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6561830  T
Q  338 atagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||    
T  6561831 atagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 6561930  T
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6561931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Original strand, 36011798 - 36012097
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  36011798 agggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcac 36011897  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  36011898 gttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatat 36011997  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36011998 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtg 36012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Original strand, 15780782 - 15781148
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15780782 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 15780877  T
Q  335 tgtatagagtttgt-----------ctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||||||||||           ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15780878 tgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggtta 15780977  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattg----atttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgg 517  Q
    || | |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  15780978 cgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtgg 15781077  T
Q  518 atcggaggg---ctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    | || ||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781078 aacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 15781148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 32219017 - 32219355
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||        
T  32219017 tactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag---- 32219108  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
           |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||      
T  32219109 -------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagat 32219201  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  32219202 tgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctc 32219301  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219302 tctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 32219355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 367 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688147
Alignment:
Q  367 gggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 466  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  467 tttttgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaact 565  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  566 gggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtg 25688147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 51675048 - 51674753
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||          || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51675048 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta----------ag-gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggtt 51674960  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  51674959 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 51674860  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51674859 ttgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 51674760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Original strand, 39715442 - 39715735
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacct 388  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39715442 ggggctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 39715541  T
Q  389 taggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 488  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  39715542 tgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatct 39715641  T
Q  489 cttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| | | || || ||  |||||||||| ||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39715642 cttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtg 39715735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168371
Alignment:
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  11168365 ttttgtg 11168371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 236 - 481
Target Start/End: Original strand, 35777344 - 35777587
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  35777344 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 35777439  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||      
T  35777440 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 35777539  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccatt 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35777540 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 586
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886468
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5886261 gttgattcacctt-ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtcttt-gaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  577 ttcttttgtg 586  Q
    ||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtg 5886468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 586
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899941
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5899734 gttgattcacctt-ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctcttt-gcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  577 ttcttttgtg 586  Q
    ||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtg 5899941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 332 - 586
Target Start/End: Original strand, 6484374 - 6484630
Alignment:
Q  332 gtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggag 429  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||  |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  6484374 gtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaag 6484473  T
Q  430 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 529  Q
    ||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6484474 agattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctg 6484573  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484574 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6484630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 28761763 - 28761415
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  28761763 tacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaacctt----gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 28761668  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||| |||||| ||||| | ||||||| | |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||       
T  28761667 tgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatat 28761569  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  28761568 tgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctc 28761469  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28761468 tctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgt 28761415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 297 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 54691851 - 54691564
Alignment:
Q  297 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa 395  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  54691851 aaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 54691752  T
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt 495  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| | | ||||  | || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||    
T  54691751 cactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgt 54691652  T
Q  496 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  54691651 aacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattctttt 54691564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 293 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 890052 - 889779
Alignment:
Q  293 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacctta 390  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||     
T  890052 gctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttg 889955  T
Q  391 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  889954 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagt-tggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctct 889856  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgg 567  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  889855 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 363 - 586
Target Start/End: Original strand, 6231848 - 6232070
Alignment:
Q  363 cctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6231848 cctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  463 cttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccg 561  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  562 aactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaattcttttgtg 6232070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 575
Target Start/End: Original strand, 53591210 - 53591442
Alignment:
Q  343 gtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||  | ||| ||    
T  53591210 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattt 53591309  T
Q  442 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||    
T  53591310 tgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-cccca 53591408  T
Q  542 aactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
     |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53591409 gactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 281 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28100334 - 28100146
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28100334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 28100235  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 468  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100234 gattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttatt 28100146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 281 - 580
Target Start/End: Original strand, 31151312 - 31151609
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||| |  |||    
T  31151312 gagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggt 31151407  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31151408 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc 31151507  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactca-tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
      |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | ||||||||| ||||||    
T  31151508 --tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaa 31151605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 364 - 586
Target Start/End: Original strand, 4666562 - 4666784
Alignment:
Q  364 ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga- 462  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  4666562 ctagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagat 4666661  T
Q  463 -cttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggacc 560  Q
     |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||    
T  4666662 ccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaatttggacc 4666758  T
Q  561 gaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4666759 gaactggatcaacaaattcttttgtg 4666784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27635920 - 27635645
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||              
T  27635920 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg---------- 27635831  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
             | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||      ||||      ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  27635830 ---------tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacg------ggct------ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactca 27635752  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635751 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27635652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 23633382 - 23633723
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| ||| ||    |||| |||||||| |||| || | |||||| |||||||| |||    
T  23633382 tacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagag----ggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtt 23633476  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||      
T  23633477 tgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttaccg--ggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 23633571  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  23633572 tgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctc 23633670  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23633671 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtg 23633723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 569
Target Start/End: Original strand, 53597163 - 53597491
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||     |||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||| | |    
T  53597163 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-----ggggatgaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggt 53597256  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||      
T  53597257 tgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagat 53597353  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || || |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  53597354 tgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctc 53597453  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggt 569  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  53597454 tctcccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 443 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701660
Alignment:
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 584  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttg 47701660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 324 - 586
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795529
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||| ||||||||   |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    ||   ||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtg 17795529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 324 - 586
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103969
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||| ||||||||   |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    ||   ||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtg 19103969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 468
Target Start/End: Original strand, 28180988 - 28181174
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||    
T  28180988 gagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggtt 28181085  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 468  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28181086 gattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtatt 28181174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 324 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420222
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    || | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  522 gagggctgctctctc 536  Q
    ||| |||||||||||    
T  13420236 gagagctgctctctc 13420222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561769
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||    |||||||||||    
T  562058 agggggttgaaacaagggttt-agaagtcaac-atgaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--caggttgattcac 561964  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |    
T  561963 attgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatat 561864  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-ccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  561863 cttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 528
Target Start/End: Original strand, 54884121 - 54884367
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  54884121 gagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggtt 54884218  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||  ||  ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| | |    
T  54884219 gattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagactta-ttttgtaatcta 54884317  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 528  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54884318 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163218
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11163168  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11163169 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 324 - 578
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    || | ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| | |     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| ||||||||||||    ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 493
Target Start/End: Original strand, 23636991 - 23637200
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||  ||||    
T  23636991 gagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggtt 23637086  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | | | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23637087 gatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 23637186  T
Q  480 ttgatttctctttt 493  Q
    ||||| ||||||||    
T  23637187 ttgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28137588 - 28137415
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  28137588 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggatt 28137500  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137499 gattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871295
Alignment:
Q  289 gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacc 387  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||| |  | ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcacc 36871488  T
Q  388 ttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||   ||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||| ||| | |    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871387 ctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 235 - 408
Target Start/End: Original strand, 41849064 - 41849244
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca------gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaact 328  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  41849064 tacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaactttgagagagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaact 41849163  T
Q  329 agtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt 408  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  41849164 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 394 - 586
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307030
Alignment:
Q  394 aacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||   |||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  494 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||  || | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtg 3307030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 434 - 578
Target Start/End: Original strand, 24181498 - 24181644
Alignment:
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  24181498 tgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctc 24181597  T
Q  533 tctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181598 tctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 317 - 504
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674160
Alignment:
Q  317 aacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctc 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  416 ttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 504  Q
    ||| | ||| | ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 500 - 586
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849329
Alignment:
Q  500 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 41849329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 509 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919102
Alignment:
Q  509 atatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 35919102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 288 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47701881 - 47701806
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47701881 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaac 47701806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 509 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894044
Alignment:
Q  509 atatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 53894044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634486
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggct 528  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggct 14634486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 363
Target Start/End: Original strand, 6231413 - 6231495
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 363  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6231413 gagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaac 6231495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 420
Target Start/End: Original strand, 24177191 - 24177380
Alignment:
Q  224 ttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaac 322  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||    ||||||||||| |||| ||||| |  | ||||||     
T  24177191 ttttaagggat-acttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctaga----gggggctgaaaacaagagtttagat-gtcaacaag 24177284  T
Q  323 aaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177285 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25690713 - 25690651
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25690713 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 378 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||   | || ||  || |||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    || ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||| |||| ||| ||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  575 aa 576  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27101617 - 27101540
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||||    
T  27101617 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagagagagatagagg 27101540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 459 - 578
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  459 gagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttgg 557  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| ||| |||| | |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  558 accgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913949
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| ||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 29914038  T
Q  495 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 360
Target Start/End: Original strand, 3306770 - 3306842
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaaca 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3306770 agggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 4560600 - 4560355
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||| |||||| |||    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||        
T  4560600 tactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagataga----gggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag---- 4560509  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
           |||||||||||    ||||   |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  |    
T  4560508 -------agtttgtctct----aaca---ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagatt 4560423  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    ||  |||||||||||||||||| |         |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  4560422 ggagctttgggtagaattaggcag--------cttttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 1321363 - 1321441
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggca 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1321363 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 581
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897193
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||||||| ||   || ||||||| |    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 10897102  T
Q  495 taacgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878165
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| ||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 47878256  T
Q  495 taacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100212
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 10100212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208121
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6719445 - 6719392
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6719445 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagag 6719392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1618993 - 1618920
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctg-aaacaagggttta 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1618993 tactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaacctt--gagagacagagggggctgaaaacaagggttta 1618920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 441
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303358
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 426
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634030
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| | |  | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtca 25634026  T
Q  423 cgag 426  Q
    ||||    
T  25634027 cgag 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298992
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 53896530 - 53896486
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53896530 actttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 53896486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 420
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13419983
Alignment:
Q  296 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaa 394  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  | |||||||||||| ||||    
T  13419864 gaaacaaaggtttaaaa-gccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaa 13419957  T
Q  395 acactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  13419958 acactattaggatcaagtctcttggt 13419983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188570
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 418
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttg 418  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 10094141 - 10094073
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10094141 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 10100158 - 10100090
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10100158 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10100090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 10201021 - 10200953
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10201021 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10200953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 10595100 - 10595028
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10595100 tatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 10612844 - 10612772
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10612844 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10612772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391909
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196386
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 453
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatta 453  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734666
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 585
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992655
Alignment:
Q  537 ccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgt 42992655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 54193342 - 54193410
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  54193342 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858605
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 5858605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612899
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10612899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 455
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  401 ttaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949381
Alignment:
Q  397 actattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaac-ttgggttgaattagg 10949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079578
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| || ||||||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattagg 11079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544334
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 5858376 - 5858417
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5858376 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 5858417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Original strand, 6303425 - 6303466
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  6303425 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10595383 - 10595342
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10595383 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 10595342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31021341 - 31021300
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttag-gaaacactattaggattgagtctcttg 418  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021341 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47878523 - 47878482
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47878523 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 47878482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 330
Target Start/End: Original strand, 53591159 - 53591208
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactag 330  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  53591159 gagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactag 53591208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 54188338 - 54188379
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54188338 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 54188379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794796
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaa 6794796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 365 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 7606868 - 7606828
Alignment:
Q  365 tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattagg 405  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7606868 taggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452962
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  | || ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 27544388 - 27544456
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  27544388 tatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 27544456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36029097
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||| | || ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 41843 - 41472
Alignment:
Q  213 ttgtttcagtttttt-aagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  41843 ttgtttcagtttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt----agagatagagggggctgaaacaagggtttaga 41748  T
Q  312 aaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattga 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41747 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 41648  T
Q  411 gtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 41548  T
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41547 atagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 41472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 106)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28241681 - 28241310
Alignment:
Q  213 ttgtttcagtttttt-aagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28241681 ttgtttcagtttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt----agagatagagggggctgaaacaagggtttaga 28241586  T
Q  312 aaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattga 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28241585 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 28241486  T
Q  411 gtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241485 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28241386  T
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241385 atagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 28241310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1230608 - 1230238
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    || ||||||||||||||| ||    
T  1230608 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagag----ggttgaaacaagggtttagaa 1230513  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1230512 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgac 1230413  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230412 tctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 1230313  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230312 tagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1230238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11983018
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11983270  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11983269 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 11983170  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983169 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 11983070  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983069 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 11983018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 30967175 - 30967526
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagc--aaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  30967175 tacttttactataaatatagaccttgt---ataggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatgg 30967271  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30967272 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 30967371  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30967372 gctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgct 30967471  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967472 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 30967526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 26064936 - 26065306
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaa-ctttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26064936 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 26065035  T
Q  312 aaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26065036 atggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaaaca--ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 26065133  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    
T  26065134 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttata 26065232  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26065233 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 26065306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 26084905 - 26085275
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaa-ctttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26084905 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 26085004  T
Q  312 aaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26085005 atggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaaaca--ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 26085102  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    
T  26085103 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttata 26085201  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26085202 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 26085275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4816530 - 4816220
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4816530 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 4816431  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4816430 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 4816331  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816330 cccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T
Q  576 attcttttgtg 586  Q
    |||||||||||    
T  4816230 attcttttgtg 4816220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30034944 - 30034592
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  30034944 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtt 30034845  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||    
T  30034844 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctct 30034645  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034644 ctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 30034592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458756
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 14458998  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggacttt 442  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14458997 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 14458900  T
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14458899 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 14458800  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458799 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 14458756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14507512 - 14507165
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14507512 tacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagataga----gggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 14507417  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14507416 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 14507317  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14507316 tgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctct 14507218  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507217 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 14507165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 238 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19704909 - 19704556
Alignment:
Q  238 tttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19704909 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19704810  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  19704809 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 19704710  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19704709 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 19704610  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19704609 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 19704556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 20915694 - 20915351
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  20915694 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa--ttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattt 20915597  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||      
T  20915596 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagat 20915497  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20915496 tgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 20915398  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 580  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915397 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 9019903 - 9020251
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9019903 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaact----gagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 9019998  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||      
T  9019999 tgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagat 9020098  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  9020099 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctct 9020198  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020199 ctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 9020251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2629227 - 2628875
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag-ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2629227 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2629128  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  2629127 ttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 2629028  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
     |||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629027 ttgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctc 2628929  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2628928 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtg 2628875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 13057213 - 13057520
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  13057213 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 13057312  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13057313 gattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 13057412  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13057413 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaatt 13057512  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  13057513 cttttgtg 13057520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26932907 - 26932550
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacaga----gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactag 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  26932907 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactag 26932808  T
Q  331 tgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagga 428  Q
     |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  26932807 ggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 26932708  T
Q  429 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 528  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  26932707 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggtt 26932609  T
Q  529 gctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26932608 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtg 26932550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 235 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12195852 - 12195515
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  12195852 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 12195757  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  12195756 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 12195657  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
     |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12195656 ttgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 12195558  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12195557 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 3390356 - 3390705
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||    |||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3390356 tacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagac----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 3390451  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||      
T  3390452 tgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagat 3390551  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  3390552 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctc 3390651  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3390652 tctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15541476 - 15541129
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  15541476 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggttt 15541381  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  15541380 gtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagatt 15541281  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||  |||||||||    
T  15541280 gggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctc 15541181  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15541180 tcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtg 15541129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30729165 - 30728813
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||| |||    |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| | |||    
T  30729165 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtt 30729070  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30729069 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggc 30728970  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 529  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  30728969 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctg 30728870  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30728869 ctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtg 30728813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 243 - 586
Target Start/End: Original strand, 32279982 - 32280322
Alignment:
Q  243 ctataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtataga 342  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32279982 ctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagataga-----ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtataga 32280076  T
Q  343 gtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  32280077 gtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 32280176  T
Q  442 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  32280177 caggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctccccc 32280276  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  32280277 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtg 32280322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3630159 - 3629854
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  3630159 gagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggtt 3630060  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3630059 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaaccca 3629960  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629959 ttgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3629861  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  3629860 ttttgtg 3629854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 281 - 585
Target Start/End: Original strand, 25477293 - 25477606
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  25477293 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25477392  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25477393 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25477492  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaa-------cgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtca 571  Q
    ||||| ||||||||||||       |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25477493 ttgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtca 25477592  T
Q  572 acaaattcttttgt 585  Q
    ||||||||||||||    
T  25477593 acaaattcttttgt 25477606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 292 - 586
Target Start/End: Original strand, 13039784 - 13040080
Alignment:
Q  292 ggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacctta 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  13039784 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 13039883  T
Q  391 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13039884 gaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctct 13039983  T
Q  491 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039984 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 13040080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3632233 - 3631928
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||    
T  3632233 gagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggtt 3632134  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3632133 gattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccca 3632034  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632033 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3631936  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  3631935 cttttgtg 3631928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 235 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15533018 - 15532674
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  15533018 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtt 15532923  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||      
T  15532922 tgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagat 15532823  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15532822 tgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 15532723  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
     | ||| | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15532722 at-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 235 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 15530459 - 15530166
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||    | |||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15530459 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaact----gggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtt 15530364  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  15530363 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 15530264  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15530263 tgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 286 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3234021 - 3233714
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgatt 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3234021 agagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgatt 3233922  T
Q  384 caccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga 483  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3233921 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattga 3233822  T
Q  484 tttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggacc-----gaactgggtcaacaaatt 578  Q
      ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||     ||||||||||||||||||    
T  3233821 catctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaatt 3233722  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  3233721 cttttgtg 3233714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 364 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 5273427 - 5273213
Alignment:
Q  364 ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273427 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 5273328  T
Q  463 cttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccga 562  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5273327 cttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 5273229  T
Q  563 actgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||||||||    
T  5273228 actgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 236 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227515
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | |    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaa----gggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19227649  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19227648 gtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 19227549  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227548 gagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 19227515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24338743 - 24338437
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctaggg-tttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | ||||||| |||||| |||| ||||    
T  24338743 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggt 24338644  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||  |  |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  24338643 tgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaaccc 24338544  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24338543 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T
Q  578 tcttttgtg 586  Q
      |||||||    
T  24338445 atttttgtg 24338437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12161841 - 12161547
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacct 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |    
T  12161841 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgt 12161744  T
Q  389 taggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 488  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||  || |||||| |||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  12161743 tgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatct 12161644  T
Q  489 cttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12161643 cttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtg 12161547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066121
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066207 tt-gtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26066121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 381 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069710
Alignment:
Q  381 attcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccat 480  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  481 tgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  580 tttt 583  Q
    ||||    
T  1069713 tttt 1069710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754698
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29754792 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 29754698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309173
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33309087 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33309173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068392
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068478 tt-gtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26068392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311442
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33311356 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33311442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 235 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 3028187 - 3027888
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||| | |     |||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||| ||    
T  3028187 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaa----ggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggt 3028094  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||     
T  3028093 ttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagaga 3027997  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 531  Q
     || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3027996 ttgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 3027897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 281 - 510
Target Start/End: Original strand, 22490658 - 22490889
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaa-aaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||      
T  22490658 gagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggag 22490757  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
      || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  22490758 gtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaaccc 22490857  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  22490858 attgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 324 - 578
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719961
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||| ||||||||   | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtca 15719803  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
     | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  15719804 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 15719903  T
Q  522 gagggctgctctct-cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||| | |||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15719904 gagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 297 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455421
Alignment:
Q  297 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa 395  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt 495  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgt 16455506  T
Q  496 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16455505 aaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466649
Alignment:
Q  339 tagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggttt-gtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgg 436  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| | ||||| | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtg 14466649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 377 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186060
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  575 aattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||    
T  12186071 aattattttgtg 12186060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 374 - 578
Target Start/End: Original strand, 15367144 - 15367349
Alignment:
Q  374 tgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgt 473  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||  ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  15367144 tgggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgt 15367243  T
Q  474 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc-ccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15367244 aacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaa 15367343  T
Q  573 caaatt 578  Q
    ||||||    
T  15367344 caaatt 15367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 376 - 578
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||| |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  573 caaatt 578  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1072214 - 1072067
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||  |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1072214 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggag----ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtt 1072119  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattca 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1072118 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 436 - 578
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346664
Alignment:
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 324 - 508
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012287
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtca 17012201  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 508  Q
    |||| ||||  ||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17012202 cgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 361
Target Start/End: Original strand, 8995456 - 8995578
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8995456 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaact----gagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 8995551  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8995552 tgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32447611 - 32447497
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctag-ggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||| ||||    
T  32447611 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggt 32447512  T
Q  379 tgattcaccttagga 393  Q
    |||||||||| ||||    
T  32447511 tgattcacctaagga 32447497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870602
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| |||     |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagataga-----ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaag 13870655  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa 395  Q
    |||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13870654 tttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttatgaaa 13870602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857949
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||  || |||||| |||||| |||||   || |||| ||| |||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaac 22858053  T
Q  477 ccatt-gatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    || || ||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| || |||    
T  22858052 ccttttgatatatcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaac 22857954  T
Q  574 aaatt 578  Q
    |||||    
T  22857953 aaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 363
Target Start/End: Original strand, 17852519 - 17852643
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  17852519 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtt 17852614  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17852615 tgtatagagtttgtctctttcgaacaaac 17852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696759
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||    ||||  || |||||||| ||||||||||   || |||||||| ||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    || ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||  ||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  19696756 aatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465587
Alignment:
Q  456 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat- 553  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  554 ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt 25465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 493 - 586
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584321
Alignment:
Q  493 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtg 10584321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Original strand, 18318003 - 18318051
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagag 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18318003 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagag 18318051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 536
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527081
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 536  Q
    |  ||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20527022 cttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttatttttgtaacc 477  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||   | ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||| ||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  478 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgga---tcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    || | |||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  573 caaatt 578  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 567
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445832
Alignment:
Q  437 gactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgg 567  Q
    ||| ||| |||| |||| | |||||| |||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 577
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878910
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||| ||| ||||    ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 13878822  T
Q  492 ttgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    | |||| |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  13878823 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 577
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786102
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||| ||| ||||    ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 16786014  T
Q  492 ttgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    | |||| |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16786015 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 10584155 - 10584212
Alignment:
Q  296 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctt 353  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10584155 gaaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12911531 - 12911442
Alignment:
Q  491 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12911531 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937229
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||  ||  ||||| ||||||||||||   || | || ||| ||||||||  || || ||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  492 ttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccc 539  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12937276 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 12937229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25078673 - 25078554
Alignment:
Q  460 agacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttgg 557  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||  ||||  ||| |||| | ||||    
T  25078673 agacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattgg 25078575  T
Q  558 accgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  25078574 accgaactgggtaaacaaatt 25078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078191
Alignment:
Q  460 agacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaa-tttgg 557  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   | | |||||||||||| || |||| ||||| ||| |    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  558 accgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatt 28078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  400 attaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 396 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatta 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 399 - 455
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  399 tattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29755032 - 29754979
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  29755032 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagagagag 29754979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7542567 - 7542452
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag-gctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctc 489  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||   ||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  7542567 gaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc 7542468  T
Q  490 ttttgtaacgttactca 506  Q
     ||||||| ||||||||    
T  7542467 -tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 453
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttag-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatta 453  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||   |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 13883590 - 13883658
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  13883590 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13883658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941857
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26066364 - 26066320
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26066364 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 26066320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26068635 - 26068591
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26068635 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 26068591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 35201393 - 35201325
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  35201393 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643237
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26643237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749203
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26749203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33215888
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattagg 33215888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17695203 - 17695162
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17695203 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 17695162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 569
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggt 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||  ||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25466251 - 25466210
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25466251 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 25466210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 25941475 - 25941516
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25941475 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 25941516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9183075 - 9183031
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9183075 tctctcctccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 9183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26954330 - 26954286
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26954330 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 26954286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 33215943 - 33216015
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  33215943 tatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 33216015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 128)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45280344 - 45279973
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggttta-aa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||    
T  45280344 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 45280249  T
Q  312 aaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattga 410  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45280248 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattga 45280149  T
Q  411 gtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280148 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 45280049  T
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45280048 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtg 45279973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23452578 - 23452226
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23452578 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 23452479  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23452478 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 23452279  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452278 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 23452226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27105063
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27104813  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27104814 gtatagagtttgtctcttcgaaacaaaactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 27104913  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104914 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 27105012  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105013 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 27105063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504335
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19504586  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19504585 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggct 19504487  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19504486 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatc 19504387  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504386 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 19504335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19502341 - 19502000
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19502341 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaa----gggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctccccc 19502046  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502045 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 19502000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 42064433 - 42064781
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42064433 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 42064528  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42064529 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 42064628  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064629 tgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 42064727  T
Q  534 ctcccccaaactatgtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064728 ctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 42064781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 42452701 - 42453046
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42452701 tacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtt 42452796  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42452797 tgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 42452894  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452895 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 42452994  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452995 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 42453046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13910380 - 13910034
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 13910285  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  13910284 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagact 13910185  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13910184 ggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctc 13910086  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910085 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 13910034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21521032 - 21520682
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  21521032 tacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagata--gatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggct 21520935  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  21520934 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggc 21520835  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  21520834 taggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 21520735  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21520734 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtg 21520682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162212
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 24162453  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||          |||    
T  24162452 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt----------gct 24162363  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24162362 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctc 24162264  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24162263 tcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtg 24162212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 40032395 - 40032043
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40032395 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 40032300  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||     
T  40032299 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggt 40032200  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 528  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  40032199 taggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcc 40032100  T
Q  529 gctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032099 gctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 40032043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 42923848 - 42923498
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||    
T  42923848 tacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagata--gaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatt 42923751  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||      
T  42923750 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagat 42923651  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  42923650 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctct 42923551  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923550 ctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 42923498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007906
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttg 19007655  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||  ||    
T  19007656 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattg 19007755  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  19007756 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctct 19007855  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19007856 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 19007906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 43623905 - 43623569
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||    | |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  43623905 tacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaact----gggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 43623810  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||            ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43623809 tgtatagagtttgtctca-----------ctaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 43623721  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43623720 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 43623621  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43623620 tcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 43623569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22287673 - 22287325
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22287673 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatata----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 22287578  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacct-agggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||      
T  22287577 tgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagat 22287478  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22287477 tgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 22287378  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287377 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22287325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 235 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 35215933 - 35215584
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag------ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaact 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35215933 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact 35215834  T
Q  329 agtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgag 426  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  35215833 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 35215734  T
Q  427 gagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 526  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  35215733 aagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 35215635  T
Q  527 ctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35215634 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 277 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 35218262 - 35217961
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  35218262 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtg 35218163  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35218162 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgta 35218063  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  35218062 acccgttgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 35217964  T
Q  575 aat 577  Q
    |||    
T  35217963 aat 35217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6264475 - 6264137
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    | ||||||||||    
T  6264475 actataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||  |||| ||    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccc 539  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6264184  T
Q  540 caaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264183 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6264137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6259152 - 6258806
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | |  ||||||||||| |||    || || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  6259152 tacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagataga----ggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtt 6259057  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||       
T  6259056 tgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagat-- 6258959  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  6258958 tggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctc 6258859  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258858 tct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6258806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11739855 - 11739548
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11739855 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggtt 11739756  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  11739755 gattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatcca 11739656  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739655 ttgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 11739556  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  11739555 cttttgtg 11739548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 28196597 - 28196901
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacct-agggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||  |||||    
T  28196597 gagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggtt 28196696  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  || | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  28196697 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaaccca 28196796  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28196797 ttgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattc 28196894  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  28196895 ttttgtg 28196901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 370 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375335
Alignment:
Q  370 tttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattt 469  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  470 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  570 caacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtg 5375335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34979874 - 34979566
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34979874 gagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 34979775  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34979774 gattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 34979675  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct-ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    || || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34979674 tttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 34979575  T
Q  578 tcttttgtg 586  Q
    |||||||||    
T  34979574 tcttttgtg 34979566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 17849077 - 17849383
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  17849077 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggtt 17849176  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849177 gattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 17849276  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  17849277 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaatt 17849375  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  17849376 cttttgtg 17849383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 17848403 - 17848706
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  17848403 gagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggt 17848502  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||     
T  17848503 tgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaacc- 17848598  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17848599 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 17848698  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  17848699 cttttgtg 17848706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 14837233 - 14837534
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14837233 gagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 14837332  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      | ||||  || ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  14837333 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactca 14837426  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14837427 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaatt 14837526  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  14837527 cttttgtg 14837534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 281 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 31733060 - 31732772
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||    
T  31733060 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggtt 31732961  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31732960 gattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 31732873  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31732872 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaatt 31732773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289056
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||    || | ||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaacctt----gatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttg 44289308  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||    
T  44289307 tatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattg 44289208  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||| ||||||||||| | || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| | | || || ||||||     
T  44289207 ggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctt 44289108  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289107 tcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 44289056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 270 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 45239282 - 45239000
Alignment:
Q  270 aaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctag 367  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||    
T  45239282 aaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagacttt--ctctttggcaacaaacactag 45239185  T
Q  368 ggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 467  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  45239184 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttat 45239085  T
Q  468 ttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaa 552  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  45239084 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Original strand, 3022088 - 3022438
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| | |    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3022088 actataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatata----ggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 3022183  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  || |  |    
T  3022184 agtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtt 3022283  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca----------tatagtggatcggagggctgc 530  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||          |||| || | | || ||||||    
T  3022284 ttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgc 3022382  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022383 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3022438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558853
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36558947 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 36558853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561130
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36561224 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 36561130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 223 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 11578453 - 11578104
Alignment:
Q  223 tttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaac 322  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||  | |||  |||||| |||    | ||||||||||||||||||| || | ||||||     
T  11578453 tttttgagggattgcttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagataga----gtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaa 11578359  T
Q  323 aaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11578358 aaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac-tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 11578262  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||    
T  11578261 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacg 11578162  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  11578161 gagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 213 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5377792 - 5377642
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5377792 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaa 5377693  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 363  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5377692 aggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 5377642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 288 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15539763 - 15539553
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15539763 agggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcac 15539664  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15539663 cttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 15539564  T
Q  487 ctcttttgtaa 497  Q
     ||||||||||    
T  15539563 atcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 434 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22407595 - 22407443
Alignment:
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22407595 tgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 22407496  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22407495 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 22407443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 392 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332179
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 324 - 586
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874397
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||   ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtca 22874232  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    || | ||||  || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  22874233 cgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaact 22874332  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  22874333 gagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtg 22874397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 327 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800302
Alignment:
Q  327 ctagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacga 425  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacag 18800464  T
Q  426 ggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggag 524  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  18800463 gaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggag 18800364  T
Q  525 ggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||| ||||| || | ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18800363 ggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtg 18800302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146604
Alignment:
Q  297 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa 395  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||| |  | |||||||||||| |||||    
T  20146884 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt 495  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||| | | ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  20146788 caatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgt 20146689  T
Q  496 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20146688 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 332 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28459434 - 28459179
Alignment:
Q  332 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggaga 430  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28459434 gtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 28459335  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 529  Q
    |  |||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||     
T  28459334 gtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctt 28459235  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||  || | |||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  28459234 ctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtg 28459179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 280 - 477
Target Start/End: Original strand, 38020161 - 38020349
Alignment:
Q  280 agagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||    
T  38020161 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggt 38020260  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 477  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||   |          ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020261 tgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggtattg----------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 446 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  446 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaact 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  546 atgtcaa-tttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 376 - 578
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||| |||| | || ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  573 caaatt 578  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 298 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17897519 - 17897242
Alignment:
Q  298 aacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaac 396  Q
    |||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||    
T  17897519 aacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaac 17897425  T
Q  397 actattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgta 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||  || || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  17897424 actattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgta 17897325  T
Q  497 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    | ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897324 aagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagataga----gggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttg 22163187  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt 417  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163186 tatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22407746 - 22407595
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| | |    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22407746 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatata----gggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 22407651  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacctt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22407650 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 22407595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 456 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707740
Alignment:
Q  456 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc--tctcccccaaactatgtcaat 553  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  554 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtg 22707740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 486 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163011
Alignment:
Q  486 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 22163012  T
Q  586 g 586  Q
    |    
T  22163011 g 22163011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 455 - 584
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871080
Alignment:
Q  455 gcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatt 554  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  | | || |||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  555 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 584  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttg 23871080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962938
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||  | ||||  || | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||   |||||||| |||| |||||| ||||||| | | | || ||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  37963037 ccattgattt---ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaa 37962941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 586
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107562
Alignment:
Q  316 caacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctc 415  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||| |  | ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaac--agggttgg--gattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctc 35107388  T
Q  416 ttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattag--gcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tat 512  Q
    ||||| ||| | ||||  || ||||||||||||||||||     | ||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  35107389 ttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattat 35107487  T
Q  513 agtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| || || |||||  |||| |||| |||| | |||||||||| | ||| |||||||  |||||||    
T  35107488 agtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtg 35107562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 510
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  492 ttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 375 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27136326 - 27136127
Alignment:
Q  375 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgt 473  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||   |||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  27136326 gggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgt 27136227  T
Q  474 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||      |||| || | ||||| || ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| || ||    
T  27136226 aactcattgatatctcttttgtaaagttactc------tagtagaacagagggttgttctctccccaaaactaagtcagtattggaccgaactgagtaaa 27136133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 357 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38414297 - 38414194
Alignment:
Q  357 aacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggc 456  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  38414297 aacaaaactagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattaggc 38414200  T
Q  457 gggaga 462  Q
    ||||||    
T  38414199 gggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 396 - 581
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943723
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| ||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 17943634  T
Q  495 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||| |  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattctt 17943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 577
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736388
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||   || |||| ||| ||| ||| ||||    ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 2736300  T
Q  492 ttgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    | |||| |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  2736301 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 575
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 510
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139564
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaac 43139531  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43139532 cttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  378 ttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct-gggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 420
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345704
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggt 26345704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517760
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 513 - 581
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345640
Alignment:
Q  513 agtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 1345640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 510
Target Start/End: Original strand, 15693974 - 15694094
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctc 489  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||  | |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||  ||||| ||||    
T  15693974 gaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc 15694073  T
Q  490 ttttgtaacgttactcatcat 510  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15694074 ttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118140
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaa 33118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539518
Alignment:
Q  551 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 15539518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||   ||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 335
Target Start/End: Original strand, 38020103 - 38020157
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38020103 gagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 379 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583494
Alignment:
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 27583494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 16940238 - 16940302
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16940238 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 16940302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 17010903 - 17010967
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  17010903 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 17010967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 17462551 - 17462619
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  17462551 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 30479110 - 30479182
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  30479110 tatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 441
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679906
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479055
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 20589567 - 20589633
Alignment:
Q  223 tttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag 289  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  20589567 tttttgagggattgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagagagagag 20589633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Original strand, 2741056 - 2741097
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2741056 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 581
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838129
Alignment:
Q  528 tgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 2838129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12781572 - 12781531
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12781572 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 12781531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 17943368 - 17943409
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17943368 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 17943409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20050088 - 20050015
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaa-actatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20050088 tatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 20050015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20050374 - 20050333
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20050374 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 20050333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20055117 - 20055076
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20055117 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 20055076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22712868 - 22712827
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22712868 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 22712827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27517993 - 27517952
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27517993 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 27517952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 572
Target Start/End: Original strand, 29867993 - 29868034
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  29867993 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 29868034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670992
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 540
Target Start/End: Original strand, 35028647 - 35028796
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||  ||  |||||||||||||||| |   | | ||| ||| ||||||||  || || ||||||    
T  35028647 aaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctctt 35028746  T
Q  492 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    || |||  |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35028747 ttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctctccccc 35028796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35894613 - 35894572
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35894613 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 35894572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36559111 - 36559066
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  36559111 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagag 36559066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36561388 - 36561343
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  36561388 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagag 36561343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45332428 - 45332383
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  45332428 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagag 45332383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707345
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| | || ||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 460 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13828458 - 13828338
Alignment:
Q  460 agacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatt-tgg 557  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||| | |   ||| |||||||||| | |||| |||| || |||    
T  13828458 agacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattatagtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctgg 13828359  T
Q  558 accgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||| | ||||||||    
T  13828358 accgaactggataaacaaatt 13828338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050156
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggactt 20050156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 33528650 - 33528714
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33528650 atagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 542
Target Start/End: Original strand, 33604092 - 33604144
Alignment:
Q  491 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  33604092 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccaa 33604144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388862
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| | || ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 34388862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 39680160 - 39680228
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39680160 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 39687098 - 39687166
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39687098 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 133)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750329
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 51750077  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  51750078 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 51750177  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750178 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 51750277  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750278 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 51750329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 28840620 - 28840969
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  28840620 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacag--ggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtt 28840717  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28840718 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 28840817  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840818 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28840916  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840917 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 28840969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 24325598 - 24325953
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacaga----gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactag 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24325598 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactag 24325696  T
Q  331 tgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggag 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24325697 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 24325796  T
Q  430 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 529  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  24325797 aggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctg 24325896  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325897 ctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 24325953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 2617438 - 2617806
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    || |||||||||||||||||| ||    
T  2617438 ttgtttcagttttttaagggat--ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----ggaggctgaaacaagggtttagaa 2617531  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2617532 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 2617631  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617632 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 2617731  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2617732 tagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtg 2617806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31735864 - 31735512
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31735864 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 31735765  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  31735764 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31735565  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735564 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 31735512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27337281 - 27336931
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27337281 tacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27337182  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  27337181 tttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggc 27337083  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337082 tgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27336984  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336983 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 27336931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 6822958 - 6823304
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6822958 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6823053  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||    
T  6823054 gtatagagtttgtctcttaggaacaaaactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 6823153  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823154 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 6823253  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823254 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6823304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 243 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10400159 - 10399819
Alignment:
Q  243 ctataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtataga 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    | |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10400159 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaact----gggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtataga 10400064  T
Q  343 gtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  10400063 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 10399964  T
Q  442 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 541  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399963 tcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 10399864  T
Q  542 aactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399863 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 10399819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 15823488 - 15823836
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15823488 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactt----agagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 15823583  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15823584 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggc 15823683  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15823684 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 15823783  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823784 ctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 15823836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 242 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21948523 - 21948226
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21948523 actataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 21948424  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  21948423 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggact 21948325  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21948324 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15295180 - 15294825
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagaggg----------ggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagt 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15295180 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 15295081  T
Q  332 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggaga 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15295080 gtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 15294981  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294980 ggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 15294881  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294880 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 15294825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 47906206 - 47906560
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |    
T  47906206 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatgg 47906305  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47906306 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 47906505  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906506 ctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 47906560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 28842435 - 28842784
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28842435 tacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 28842532  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  28842533 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggc 28842632  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  28842633 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatct 28842731  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  28842732 ctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtg 28842784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27339473 - 27339122
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  27339473 tacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtt 27339374  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  27339373 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggc 27339274  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27339273 tgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatct 27339175  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27339174 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 27339122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 229 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12302855 - 12302496
Alignment:
Q  229 agggattactttcactataaatatagaccttgtttcata-gcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaac 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12302855 agggattacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaac 12302756  T
Q  328 tagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgag 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12302755 tagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 12302656  T
Q  427 gagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 526  Q
     ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12302655 aagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 12302556  T
Q  527 ctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302555 ctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 12302496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762126
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagag----ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggttt 13761875  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  13761876 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtct 13761975  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13761976 gtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctc 13762074  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13762075 tcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtg 13762126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 46432009 - 46431697
Alignment:
Q  277 gagagagacaga-gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgt 374  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46432009 gagagagagagatgggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgt 46431910  T
Q  375 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46431909 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 46431810  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct--cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46431809 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 46431711  T
Q  573 caaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||    
T  46431710 caaattcttttgtg 46431697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2510667 - 2510316
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  2510667 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtt 2510568  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||      
T  2510567 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggcag-agacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 2510369  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510368 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 2510316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Original strand, 39932020 - 39932364
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| | | |  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39932020 actataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 39932117  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||    
T  39932118 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagact 39932217  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc-tcccc 539  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39932218 ttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccc 39932317  T
Q  540 caaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39932318 catactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtg 39932364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Original strand, 20302410 - 20302748
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20302410 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 20302505  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggacttt 442  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  20302506 tttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggacttt 20302605  T
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  20302606 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccag 20302704  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20302705 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 20302748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 236 - 577
Target Start/End: Original strand, 47179652 - 47179993
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  47179652 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 47179751  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||      
T  47179752 gtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 47179851  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47179852 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47179950  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47179951 ct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Original strand, 13215023 - 13215375
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13215023 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 13215118  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||      
T  13215119 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 13215218  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13215219 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggct 13215318  T
Q  529 gctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215319 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17324926 - 17324627
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17324926 agggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 17324827  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  17324826 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatat 17324727  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324726 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 17324627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 236 - 577
Target Start/End: Original strand, 16226110 - 16226448
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16226110 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----ggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 16226205  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  16226206 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 16226305  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16226306 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16226404  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16226405 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752653
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | ||    
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggctt 51752403  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  51752404 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggct 51752502  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51752503 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctc 51752601  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752602 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 51752653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9463589 - 9463243
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9463589 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 9463490  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggaga 430  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  9463489 tttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9463390  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463389 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 9463291  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9463290 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9463243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14098309 - 14097960
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14098309 tactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagataga----ggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtt 14098214  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  14098213 tgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 14098114  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaa-cgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    | |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14098113 tagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 14098014  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098013 tctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 14097960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 41646862 - 41647210
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41646862 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 41646957  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||      
T  41646958 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagat 41647057  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41647058 tgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 41647157  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41647158 ctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtg 41647210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 236 - 577
Target Start/End: Original strand, 47177301 - 47177642
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  47177301 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 47177400  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggat-tgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||      
T  47177401 gtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagat 47177500  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47177501 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47177599  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    || ||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  47177600 ct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9459762 - 9459416
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  9459762 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactaggg 9459663  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgaggaga 430  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  9459662 tttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9459563  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459562 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 9459464  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9459463 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9459416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38925817 - 38925472
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  38925817 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38925722  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  38925721 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 38925622  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||    
T  38925621 tgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctct 38925524  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38925523 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtg 38925472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 236 - 583
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291743
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagataga----gggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 20291495  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||    
T  20291496 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagact 20291595  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20291596 aggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctc 20291694  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291695 tcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 20291743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 39462461 - 39462809
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||| |     ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  39462461 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaa----ggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtt 39462556  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  39462557 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 39462656  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  39462657 tgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctct 39462756  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462757 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 39462809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 290 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 50307835 - 50307540
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacc 387  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  50307835 ggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 50307736  T
Q  388 ttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttc 487  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||    
T  50307735 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatc 50307636  T
Q  488 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307635 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 50307540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 582
Target Start/End: Original strand, 18839571 - 18839874
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-tagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||    
T  18839571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggtt 18839670  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18839671 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18839770  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839771 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 18839870  T
Q  579 cttt 582  Q
    ||||    
T  18839871 cttt 18839874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 286 - 586
Target Start/End: Original strand, 16428642 - 16428944
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  16428642 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattc 16428741  T
Q  385 accttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16428742 accttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgat 16428841  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
     |||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16428842 atctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctttt 16428941  T
Q  584 gtg 586  Q
    |||    
T  16428942 gtg 16428944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6995997 - 6995691
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  6995997 gagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggtt 6995898  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||    
T  6995897 gattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactca 6995798  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6995797 ttgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 6995698  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  6995697 ttttgtg 6995691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 279 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4131678 - 4131366
Alignment:
Q  279 gagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtggg 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4131678 gagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 4131579  T
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 477  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4131578 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacc 4131480  T
Q  478 cattga----tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    ||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||    
T  4131479 cattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaa 4131380  T
Q  573 caaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||    
T  4131379 caaattcttttgtg 4131366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2949528 - 2949223
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||    
T  2949528 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggtt 2949429  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  2949428 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 2949329  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949328 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 2949230  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  2949229 ttttgtg 2949223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076663
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||| |||||| ||| |    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaa----gggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 50076914  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  50076913 tataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 50076814  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  50076813 ggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctc 50076714  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076713 t-ccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 50076663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 234 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 9241426 - 9241079
Alignment:
Q  234 ttactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||| || |||| || ||| |||    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9241426 ttacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagag---gggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9241331  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9241330 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagaga 9241231  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 531  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9241230 ttggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 9241131  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9241130 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattctttt 9241079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 18307093 - 18307399
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18307093 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 18307192  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||    
T  18307193 gattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgca 18307292  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18307293 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaatt 18307391  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  18307392 cttttgtg 18307399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3579957 - 3579608
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||    
T  3579957 tacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagataga--gggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtt 3579860  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||      
T  3579859 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagat 3579760  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |  ||||||    
T  3579759 tggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctct 3579661  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579660 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3579608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17186458 - 17186118
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17186458 tataaatatagattttgtatcagagcaaacctt----gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 17186363  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggacttt 442  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  | | |||||    
T  17186362 tttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaacttt 17186263  T
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccca 541  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17186262 gggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctccccca 17186163  T
Q  542 aactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17186162 gactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtg 17186118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Original strand, 25127852 - 25128163
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |    
T  25127852 gagagagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgag 25127951  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25127952 ggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25128051  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25128052 ttcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaaca 25128151  T
Q  575 aattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||    
T  25128152 aattcttttgtg 25128163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11457772 - 11457466
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||   |||||||||| |||||    
T  11457772 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggtt 11457673  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11457672 gattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 11457573  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11457572 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 11457473  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  11457472 ttttgtg 11457466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25251607 - 25251265
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  25251607 actataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
     ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 539  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  540 caaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 25251265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28207405 - 28207059
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  28207405 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 28207310  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||      
T  28207309 tgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagat 28207210  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  28207209 tggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctct 28207112  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207111 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 28207059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 235 - 518
Target Start/End: Original strand, 48665113 - 48665400
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacag--agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| || ||| |||  |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48665113 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 48665212  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagga-ga 430  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  48665213 tttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28998592 - 28998244
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| |||    || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  28998592 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagataga----ggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 28998497  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||      
T  28998496 tgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagat 28998397  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |||    
T  28998396 tggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttct 28998297  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998296 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 28998244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29004308 - 29003960
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| |||    || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  29004308 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagataga----ggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 29004213  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||      
T  29004212 tgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagat 29004113  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |||    
T  29004112 tggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttct 29004013  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004012 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 29003960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 50079118 - 50078811
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  50079118 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 50079019  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50079018 gattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaaccca 50078919  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  50078918 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaatt 50078819  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  50078818 cttttgtg 50078811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31425309 - 31425006
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattca 385  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31425309 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 31425210  T
Q  386 ccttaggaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattg 482  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  31425209 ccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattg 31425110  T
Q  483 atttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425109 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 31425011  T
Q  582 ttgtg 586  Q
    |||||    
T  31425010 ttgtg 31425006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 286 - 583
Target Start/End: Original strand, 6756516 - 6756815
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgatt 383  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6756516 agaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgatt 6756615  T
Q  384 caccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga 483  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6756616 caccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattga 6756713  T
Q  484 tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6756714 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattctt 6756813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 31489899 - 31490202
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  31489899 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggtt 31489996  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  31489997 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactca 31490096  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  31490097 ttgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattc 31490195  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  31490196 ttttgtg 31490202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 50248869 - 50248561
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50248869 gagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 50248770  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  50248769 gattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 50248670  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg--ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | | || || ||  |||||||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50248669 ttgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaat 50248570  T
Q  578 tcttttgtg 586  Q
    |||||||||    
T  50248569 tcttttgtg 50248561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 235 - 573
Target Start/End: Original strand, 47451590 - 47451919
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||    
T  47451590 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtt 47451685  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  47451686 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagat 47451779  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | |||||||    
T  47451780 tggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctct 47451879  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47451880 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134235
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacct 388  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  389 taggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 488  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  489 cttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  40134137 cttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtg 40134235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 17318877 - 17319177
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  ||||    
T  17318877 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggtt 17318976  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |    
T  17318977 gattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaactta 17319070  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319071 ttgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 17319169  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  17319170 cttttgtg 17319177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31423171 - 31422851
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaac-aaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||   ||    
T  31423171 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagt 31423072  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31423071 tgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 31422972  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata------------gtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaact 565  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||            ||| | | |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  31422971 attgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagct 31422872  T
Q  566 gggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  31422871 gggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 495
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824091
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagag---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6823923  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgagg 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||| |     
T  6823924 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacggga 6824023  T
Q  428 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgt 495  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6824024 agagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 391 - 586
Target Start/End: Original strand, 51757626 - 51757820
Alignment:
Q  391 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||     
T  51757626 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctc- 51757724  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51757725 tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 51757820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 281 - 581
Target Start/End: Original strand, 17324049 - 17324349
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  17324049 gagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaactgattttt--atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 17324146  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324147 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 17324246  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17324247 ttgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 17324346  T
Q  579 ctt 581  Q
    |||    
T  17324347 ctt 17324349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23786035 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 364 - 577
Target Start/End: Original strand, 16231631 - 16231843
Alignment:
Q  364 ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  16231631 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggaga 16231730  T
Q  463 cttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccga 562  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  16231731 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  563 actgggtcaacaaat 577  Q
    ||| |||||||||||    
T  16231830 act-ggtcaacaaat 16231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 437 - 586
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816176
Alignment:
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  537 ccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 23816176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 381 - 586
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429248
Alignment:
Q  381 attcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccat 480  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  481 tgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  16429242 ttttgtg 16429248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 357 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25248772 - 25248542
Alignment:
Q  357 aacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggc 456  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||  || |||||| |||||||||||||    
T  25248772 aacaaaactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggc 25248673  T
Q  457 gggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaattt 555  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  25248672 gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaattt 25248573  T
Q  556 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248572 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 25248542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432686
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||           ||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||  ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaa-actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 584  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 16432684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183581
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| ||| ||    ||||||||||||||||| | || ||||||   ||||||| |||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagag----ggctgaaacaagggttt-agaatgcaaca--caaactagggtttg 14183831  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  |     
T  14183830 tatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagatta 14183734  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  14183733 gaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctc 14183634  T
Q  535 tcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14183633 tcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 286 - 578
Target Start/End: Original strand, 42922223 - 42922514
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||    |||||||||    
T  42922223 agagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattc 42922318  T
Q  385 accttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42922319 accttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgat 42922418  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||  |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42922419 atctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 376 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115093
Alignment:
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  575 aattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||    
T  6115104 aattattttgtg 6115093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 281 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 8347566 - 8347284
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||| | | |||| |  ||||    
T  8347566 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggtt 8347471  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8347470 gattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 8347371  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaac 564  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| ||||  ||||||||||||    
T  8347370 ttgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 321 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669431
Alignment:
Q  321 acaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttgg 419  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  420 ttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 518  Q
    | ||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||||||    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T
Q  519 tcggagggctgctctctcccc 539  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  15669451 acggatggctgctctctcccc 15669431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18800908 - 18800570
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| | |     ||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||  |||    
T  18800908 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaa----ggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtt 18800814  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||  |||||||| |  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||      
T  18800813 tgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagat 18800717  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||    
T  18800716 ttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctc 18800617  T
Q  533 tctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18800616 tctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatt 18800570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 8349345 - 8349049
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  ||||    
T  8349345 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtt 8349250  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  8349249 tattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactca 8349150  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  8349149 ttggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaat 8349050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 377 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495206
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||   ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  49495311 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaa 49495212  T
Q  576 attctt 581  Q
    ||||||    
T  49495211 attctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 501 - 586
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358863
Alignment:
Q  501 tactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 13358863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13125746 - 13125455
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg-tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattca 385  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||    ||||||||||    
T  13125746 agggggctgaaacaagggtt-aagaagccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattca 13125651  T
Q  386 ccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    | || |||||| || ||||||||||| |||||||| | | | ||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  13125650 cattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgat 13125551  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  |||| |||| | | |||||||||| ||| ||||||||    
T  13125550 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738625
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||  ||||| ||||||||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca---tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||| |||| | ||||||| |||| ||| ||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaa 30738631  T
Q  573 caaatt 578  Q
    ||||||    
T  30738630 caaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 578
Target Start/End: Original strand, 15916564 - 15916674
Alignment:
Q  470 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaa-tttggaccgaactgg 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15916564 ttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaactgg 15916663  T
Q  568 gtcaacaaatt 578  Q
    || ||||||||    
T  15916664 gtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 374 - 578
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561751
Alignment:
Q  374 tgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttg 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||   | ||  || |||||||||||||| ||||   || |||||||| |||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttg 16561643  T
Q  473 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtc 570  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |  |||| |||||||||||  | |||| |||| | ||||||||||||| ||     
T  16561644 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgta 16561743  T
Q  571 aacaaatt 578  Q
    ||||||||    
T  16561744 aacaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613237
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||  || | |||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    || ||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||| | || |||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  26613240 aatt 26613237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 376 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 30790405  T
Q  573 caaa 576  Q
    ||||    
T  30790404 caaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353342
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||||||| ||   || ||||||| |    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 21353431  T
Q  495 taacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 378 - 553
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||   | ||| | ||| |||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat 553  Q
    |  ||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Original strand, 27916576 - 27916780
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| ||| || ||||    
T  27916576 ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaac 27916675  T
Q  477 c--cattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    |  | ||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||| ||    
T  27916676 cttctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaa 27916774  T
Q  573 caaatt 578  Q
    ||||||    
T  27916775 caaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 337
Target Start/End: Original strand, 16231544 - 16231641
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16231544 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggttt 16231639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13449909 - 13449861
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgt 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13449909 ttgtttcagttttttaagggataactttcactataaatatagaccttgt 13449861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28183714 - 28183610
Alignment:
Q  10 gaagtgtgtgacaaattattcacagctatgtgtcagggaaaaatcattgatcctcttcttgaatgcttgggagagtggaacggtgctcctcttcctattt 109  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||||||||| | |||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28183714 gaagagtgcgacaaattgttcacagctatgtgccaaggtaaaattgttgatcctcttatggaatgtctcggagagtggaacggcgctcctcttccaattt 28183615  T
Q  110 gttaa 114  Q
    |||||    
T  28183614 gttaa 28183610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25248811 - 25248756
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25248811 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatta 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26520454 - 26520206
Alignment:
Q  238 tttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||    ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| |||||||| ||||     
T  26520454 tttctctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagag---gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttc 26520359  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgaggag 429  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||| | ||    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      || ||| | ||    
T  26520358 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattga--ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaag 26520262  T
Q  430 aggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26520261 agattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 518
Target Start/End: Original strand, 28279361 - 28279489
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| |||||   |||||    
T  28279361 gaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctct 28279460  T
Q  491 tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 518  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28279461 tttgtaaagttactcatcattatagtgga 28279489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 549 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447264
Alignment:
Q  549 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 13447264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26332761 - 26332714
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacga 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26332761 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacga 26332714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 534
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104400
Alignment:
Q  382 ttcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattt-ttgtaaccca 479  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||  | |||   ||  ||||||||||||||||||   || || || ||| |||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 251
Target Start/End: Original strand, 9521546 - 9521584
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaata 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9521546 ttgtttcagttttttaagggtttactttcactataaata 9521584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13127779 - 13127685
Alignment:
Q  486 tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||| || | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127779 tctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 510 - 575
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644990
Alignment:
Q  515 tggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393404
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattag 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||| ||||||||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 514 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281715
Alignment:
Q  514 gtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 9526296 - 9526337
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9526296 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 9526337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49495538 - 49495468
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggttta 309  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||    |||||||||||||||||||||    
T  49495538 tacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggttta 49495468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 514 - 577
Target Start/End: Original strand, 2232710 - 2232774
Alignment:
Q  514 gtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  2232710 gtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2232774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 9526582 - 9526650
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  9526582 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 381 - 420
Target Start/End: Original strand, 10115868 - 10115908
Alignment:
Q  381 attcaccttag-gaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10115868 attcaccttagagaaatactattaggattgagtctcttggt 10115908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604716
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13604652 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 13604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 261
Target Start/End: Original strand, 43104080 - 43104127
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgt 261  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43104080 ttgttccagttttttgagggat-acttttactataaatatagaccttgt 43104127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 49918474 - 49918518
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49918474 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 49918518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 69632 - 69281
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  69632 tacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 69533  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  69532 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggt 69433  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  69432 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 69334  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69333 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 69281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 73364 - 73209
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  73364 tacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtt 73265  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacctt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  73264 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 73209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 73198 - 73160
Alignment:
Q  364 ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactatt 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73198 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 117)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 39854404 - 39854773
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| ||    
T  39854404 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttagaa 39854498  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39854499 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 39854598  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    |||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39854599 tctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcata 39854698  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39854699 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 39854773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 6744981 - 6745358
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacaga----gggggctgaaacaagggttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    |||||||| |||    ||||||||||||||| ||||    
T  6744981 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagagagagagagagataaagggggctgaaacaagtgttt 6745080  T
Q  309 aaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggat 407  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6745081 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 6745179  T
Q  408 tgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 507  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745180 tgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 6745279  T
Q  508 catatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745280 catatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6745358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 216 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 10529455 - 10529091
Alignment:
Q  216 tttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaagg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  10529455 tttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gtgggttgaaacaagggtttagaaagg 10529360  T
Q  316 caacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtct 414  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10529359 caacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 10529260  T
Q  415 cttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 514  Q
    |||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529259 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 10529160  T
Q  515 tggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529159 tgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 4236571 - 4236918
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4236571 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaa----gggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4236666  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4236667 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 4236766  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236767 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 4236866  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4236867 ctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtg 4236918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25921810 - 25921462
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  25921810 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 25921715  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25921714 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 25921615  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25921614 tgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctct 25921515  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921514 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 25921462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882395
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagag---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38882144  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38882145 gtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38882244  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882245 gggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 38882343  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882344 tcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 38882395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 16776099 - 16776447
Alignment:
Q  235 tactttcactataaa-tatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16776099 tacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggt 16776194  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16776195 ttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 16776294  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16776295 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgcta 16776393  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776394 tctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 16776447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Original strand, 2174863 - 2175208
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2174863 cttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 2174958  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2174959 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctg 2175058  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175059 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctct 2175157  T
Q  536 cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175158 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 2175208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 242 - 585
Target Start/End: Original strand, 18466629 - 18466973
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18466629 actataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatag 18466728  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18466729 agtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggact 18466828  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18466829 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctccccc 18466928  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466929 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 18466973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Original strand, 6747224 - 6747594
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6747224 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaaga--gaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6747321  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgag 411  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6747322 aagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6747420  T
Q  412 tctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6747421 tctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcata 6747519  T
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747520 tagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6747594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 21947969 - 21948316
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  21947969 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 21948063  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  21948064 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 21948163  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21948164 tgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 21948263  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21948264 ctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtg 21948316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 584
Target Start/End: Original strand, 18468949 - 18469297
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18468949 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 18469048  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18469049 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 18469148  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  18469149 tgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctct 18469248  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 584  Q
    ||  |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18469249 ct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttg 18469297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 27910387 - 27910740
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag--ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27910387 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactaggg 27910485  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  27910486 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgct 27910685  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910686 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 27910740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 27912472 - 27912826
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27912472 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 27912571  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27912572 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgct 27912771  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912772 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 27912826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Original strand, 25804005 - 25804314
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  25804005 gagagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgag 25804104  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25804105 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25804204  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25804205 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataa 25804303  T
Q  576 attcttttgtg 586  Q
    |||||||||||    
T  25804304 attcttttgtg 25804314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18511542 - 18511201
Alignment:
Q  244 tataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagag 343  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18511542 tataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagag 18511445  T
Q  344 tttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggacttt 442  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  18511444 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 18511345  T
Q  443 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaa 542  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |     
T  18511344 ggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 18511245  T
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18511244 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 18511201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34477353 - 34477042
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34477353 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 34477254  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgt 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  34477253 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34477154  T
Q  474 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34477153 aacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 34477055  T
Q  574 aaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| |||||    
T  34477054 aaattctcttgtg 34477042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Original strand, 31545023 - 31545362
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31545023 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaa----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31545118  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||       
T  31545119 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaat 31545218  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31545219 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctct 31545317  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31545318 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31545362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21684750 - 21684441
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  21684750 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatg 21684651  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21684650 ggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 21684551  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684550 ctcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 21684452  T
Q  576 attcttttgtg 586  Q
    |||| ||||||    
T  21684451 attcgtttgtg 21684441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2818673 - 2818324
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  2818673 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtt 2818578  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt-gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||    
T  2818577 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaagg 2818478  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  2818477 ctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctc 2818378  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2818377 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 2818324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34479718 - 34479407
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34479718 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 34479619  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgt 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  34479618 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34479519  T
Q  474 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34479518 aacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 34479420  T
Q  574 aaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||    
T  34479419 aaattcttttgtg 34479407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Original strand, 31542678 - 31543016
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31542678 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31542773  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||      
T  31542774 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 31542873  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31542874 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctct 31542971  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31542972 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31543016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 229 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1189957 - 1189596
Alignment:
Q  229 agggattactttcactataaatatagaccttgtttcata-gcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaac 327  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1189957 agggattgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaac 1189858  T
Q  328 tagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgag 426  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  1189857 tacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacagg 1189758  T
Q  427 gagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagg 525  Q
     ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1189757 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagg 1189658  T
Q  526 gctgctctctcc-cccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189657 gatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1189596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179368
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagataga----gggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31179612  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      
T  31179611 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 31179512  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31179511 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 31179413  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31179412 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Original strand, 40221463 - 40221813
Alignment:
Q  234 ttactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  40221463 ttacttttactataaatatagacattgactcagagtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 40221558  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||     
T  40221559 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaga 40221658  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 531  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  40221659 ttgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgct 40221758  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40221759 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 40221813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 26097675 - 26098021
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  26097675 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 26097770  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||    
T  26097771 tggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgc 26097869  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  26097870 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctct 26097968  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097969 ctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 26098021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 242 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18509649 - 18509307
Alignment:
Q  242 actataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18509649 actataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagag---gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  342 agtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggact 440  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  441 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 540  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  18509452 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccct 18509353  T
Q  541 aaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18509352 agactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 18509307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 286 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10474613 - 10474312
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  10474613 agagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatac 10474514  T
Q  385 accttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474513 accttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 10474414  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 584  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10474413 atctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 10474314  T
Q  585 tg 586  Q
    ||    
T  10474313 tg 10474312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Original strand, 15552177 - 15552527
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag------ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaact 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||      ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15552177 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact 15552276  T
Q  329 agtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgag 426  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  15552277 agggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacggg 15552376  T
Q  427 gagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 526  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15552377 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 15552475  T
Q  527 ctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15552476 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 15552527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 319 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658345
Alignment:
Q  319 caacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt 417  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  418 ggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgg 517  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  518 atcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    | |||| |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 658345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 25904087 - 25904393
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25904087 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 25904186  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25904187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacaca 25904286  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25904287 ttgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatta 25904386  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  25904387 ttttgtg 25904393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 281 - 584
Target Start/End: Original strand, 17072867 - 17073172
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17072867 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 17072966  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||  |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  17072967 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactca 17073066  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073067 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 17073166  T
Q  579 cttttg 584  Q
    ||||||    
T  17073167 cttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 18596589 - 18596936
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| ||| || |||    |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||    
T  18596589 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggataga----gggggctgaaacaagggtataaaga--caacaacaaaactagggtt 18596682  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  18596683 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagat 18596782  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  18596783 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctc 18596882  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18596883 tctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtg 18596936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17818776 - 17818481
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacct 388  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  17818776 ggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttacct 17818677  T
Q  389 taggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 488  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17818676 tgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 17818577  T
Q  489 cttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818576 cttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 17818481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 279 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16092497 - 16092188
Alignment:
Q  279 gagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtggg 377  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  16092497 gagagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgaggg 16092398  T
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 477  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092397 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 16092298  T
Q  478 cattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| | | |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16092297 cattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaa 16092198  T
Q  577 ttcttttgtg 586  Q
    ||||||||||    
T  16092197 ttcttttgtg 16092188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31472908 - 31472601
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  31472908 gagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggtt 31472809  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | | || || |||||||    
T  31472808 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaaccca 31472709  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31472708 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 31472609  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  31472608 cttttgtg 31472601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 24126840 - 24127146
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||  | ||    
T  24126840 gagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagatt 24126939  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  24126940 gattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactca 24127039  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127040 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 24127139  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  24127140 ttttgtg 24127146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 6756436 - 6756782
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  6756436 tacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagataga----gggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtt 6756531  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||      
T  6756532 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagat 6756631  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  6756632 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctc 6756728  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6756729 tctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtg 6756782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 10586781 - 10587122
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||        
T  10586781 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag---- 10586875  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacc-tagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
           ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||     
T  10586876 -------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagaga 10586968  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586969 ttgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 10587067  T
Q  533 tct-cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10587068 tctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 10587122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 295 - 586
Target Start/End: Original strand, 2954414 - 2954706
Alignment:
Q  295 tgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttagg 392  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| || |     
T  2954414 tgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgga 2954513  T
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  2954514 aaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tt 2954612  T
Q  493 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954613 tgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 2954706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 357 - 586
Target Start/End: Original strand, 4410084 - 4410312
Alignment:
Q  357 aacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggc 456  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410084 aacaaaactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 4410183  T
Q  457 gggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttg 556  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||    
T  4410184 gggagacttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattg 4410282  T
Q  557 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410283 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 4410312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36402665 - 36402317
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||  || ||||||| |||    
T  36402665 tacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgtt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtt 36402570  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||      
T  36402569 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagat 36402470  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||    
T  36402469 tggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctct 36402370  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36402369 ctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtg 36402317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 586
Target Start/End: Original strand, 695880 - 696168
Alignment:
Q  288 agggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcac 386  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  695880 agggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 695968  T
Q  387 cttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  695969 ctt-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 696067  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  696068 ctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgt 696167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 39398279 - 39397982
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacc 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  39398279 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcacc 39398181  T
Q  388 ttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttc 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  39398180 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatc 39398081  T
Q  488 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||  | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  39398080 tcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtg 39397982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 281 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 37706075 - 37705774
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  37706075 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 37705976  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37705975 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 37705876  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37705875 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 37705776  T
Q  580 tt 581  Q
    ||    
T  37705775 tt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 356 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 41585963 - 41585733
Alignment:
Q  356 gaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  41585963 gaacaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 41585864  T
Q  456 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaattt 555  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41585863 caggagacttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaattt 41585764  T
Q  556 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585763 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 41585733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 372 - 586
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798337
Alignment:
Q  372 tgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattttt 471  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 39798222  T
Q  472 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtca 571  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39798223 gtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtca 39798322  T
Q  572 acaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||    
T  39798323 acaaattcttttgtg 39798337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12556260 - 12555912
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  12556260 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtt 12556165  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| |     
T  12556164 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaaga-ga 12556066  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    | ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||     
T  12556065 ttggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgcta 12555966  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12555965 tctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtg 12555912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 375 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505832
Alignment:
Q  375 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc--tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 20505844  T
Q  575 aattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||    
T  20505843 aattcttttgtg 20505832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31465979
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| | |     ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaa----ggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggttt 31466219  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  31466218 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 31466119  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||    
T  31466118 tggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctc 31466030  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
     |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31466029 acccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgt 31465979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 392 - 582
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749986
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 582  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749896 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 281 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 34530961 - 34530722
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||    
T  34530961 gagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggtt 34530862  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  34530861 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactca 34530762  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 518  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34530761 ttgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtgga 34530722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 281 - 585
Target Start/End: Original strand, 21288748 - 21289050
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-------tagggtttg 373  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  21288748 gagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttg 21288847  T
Q  374 tgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgt 473  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  21288848 agggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgt 21288946  T
Q  474 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    ||| |||        |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21288947 aactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac 21289038  T
Q  574 aaattcttttgt 585  Q
    ||||||||||||    
T  21289039 aaattcttttgt 21289050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 582
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757462
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 582  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10757372 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354564
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15354658 tt-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 15354564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665333
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23665239 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 23665333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793254
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23793348 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 23793254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960129
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38960215 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 38960129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 364 - 586
Target Start/End: Original strand, 2723970 - 2724183
Alignment:
Q  364 ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 463  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||         |||||||||||||| ||     
T  2723970 ctagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcgggtgat 2724060  T
Q  464 ttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaa 563  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2724061 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 2724160  T
Q  564 ctgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2724161 ctgggtcaacaaattcttttgtg 2724183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 454
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 20043089  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  20043090 tatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 20043189  T
Q  436 ggactttgggtagaattag 454  Q
     |||||||| |||||||||    
T  20043190 agactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 458
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgaga----cagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttg 20045049  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||  ||    
T  20045050 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattg 20045149  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20045150 ggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373134
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3373221 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 3373134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356840
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15356934 tt-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 15356840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 399 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741848
Alignment:
Q  399 tattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaa 23741937  T
Q  498 cgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 23741848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 238 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6661516 - 6661181
Alignment:
Q  238 tttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||    |||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||| || |||    
T  6661516 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaacctt----gagatagagagggttgaaacaagggttt-agaagtcaacaagaaaattagggtatgt 6661422  T
Q  338 atagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgg 436  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||   ||     
T  6661421 atagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattga 6661325  T
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 535  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | |||||||||    
T  6661324 gattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctct 6661225  T
Q  536 cccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6661224 ccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 337
Target Start/End: Original strand, 4409977 - 4410101
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4409977 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 4410076  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgt 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  4410077 aggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 286 - 586
Target Start/End: Original strand, 20053836 - 20054127
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||    |||||||||    
T  20053836 agagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattc 20053931  T
Q  385 accttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||   |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||    
T  20053932 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttt---ggagat--tgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gat 20054023  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 582  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20054024 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattcttt 20054123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 377 - 586
Target Start/End: Original strand, 9020299 - 9020510
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 476  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9020299 gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 9020398  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtc-aatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||   ||||||||||||||| | |||     
T  9020399 ccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaacc 9020498  T
Q  575 aattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||    
T  9020499 aattcttttgtg 9020510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 377 - 585
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208865
Alignment:
Q  377 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||| | ||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-ttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36208854  T
Q  575 aattcttttgt 585  Q
    |||||||||||    
T  36208855 aattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26098588 - 26098402
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| | |||| |||    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  26098588 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagataga----gggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtt 26098493  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 424  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26098492 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacg 26098402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 378 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 17413365 - 17413200
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||  || |||||| ||||||||||||   || | |||||| |||||||    
T  17413365 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaac 17413266  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccca 541  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17413265 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctccccca 17413200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143750
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||| | |||| |||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  15143747 aatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20507799 - 20507675
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||    
T  20507799 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtt 20507704  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20507703 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac 20507675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26098378 - 26098280
Alignment:
Q  486 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc-ccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26098378 tctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctttt 26098280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 579
Target Start/End: Original strand, 23667497 - 23667601
Alignment:
Q  474 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaac 573  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  23667497 aacccattgatttctcttt-gtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaac 23667595  T
Q  574 aaattc 579  Q
    ||||||    
T  23667596 aaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 437 - 511
Target Start/End: Original strand, 42770951 - 42771025
Alignment:
Q  437 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42770951 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 396 - 578
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898013
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggc-gggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  495 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| | | |||||||| ||||||||| |||| |||| | || ||| ||||||||| ||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt 4898013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 396 - 581
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673022
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||| ||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 22672931  T
Q  495 taacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22672932 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 577
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170994
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||| ||| ||||    ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 1170906  T
Q  492 ttgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    | |||| |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  1170907 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15445372 - 15445263
Alignment:
Q  470 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgg 567  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||| |||| |||| | |||||| |||||||    
T  15445372 ttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgg 15445274  T
Q  568 gtcaacaaatt 578  Q
    || ||||||||    
T  15445273 gtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 586
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043280
Alignment:
Q  528 tgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtg 20043280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 581
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445684
Alignment:
Q  398 ctattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgta 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| |||| || ||   || |||| ||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-tttgta 25445595  T
Q  497 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144591
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttag-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg-ggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||  |  ||||||||||| ||||||||   || |||| ||| |||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  475 acccattg-atttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaacta 546  Q
    |||  ||  || ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2144663 accttttttatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaacta 2144591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 575
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786465
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 23665081 - 23665127
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23665081 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagaga 23665127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 23667356 - 23667402
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23667356 actttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagaga 23667402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742055
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagaga 23742055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23793506 - 23793460
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23793506 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagaga 23793460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3373378 - 3373333
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3373378 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 3373333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15354818 - 15354770
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaga 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15354818 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgggagaga 15354770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15357094 - 15357046
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaga 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15357094 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgggagaga 15357046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004053
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 35385518 - 35385450
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  35385518 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 40222594 - 40222634
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatata 253  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40222594 ttgtttcaattttttaaaggattactttcactataaatata 40222634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238448
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841370
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattagg 17841370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 464
Target Start/End: Original strand, 42770867 - 42770934
Alignment:
Q  397 actattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 464  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||  || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770867 actattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattag 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35385804 - 35385763
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35385804 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 35385763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38960378 - 38960333
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  38960378 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagag 38960333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 12084204 - 12084268
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | || ||||   |||||||||||||||||||||    
T  12084204 atagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaa 12084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 34033753 - 34033725
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34033753 gaaacactattaggattgagtctcttggt 34033725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 107)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 238 - 583
Target Start/End: Original strand, 608727 - 609077
Alignment:
Q  238 tttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacaga----gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  608727 tttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggt 608826  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  608827 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 608926  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608927 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 609026  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  609027 tctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 3874004 - 3874356
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||    
T  3874004 tacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtt 3874103  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  3874104 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3874303  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874304 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3874356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 213 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22685025 - 22684642
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagag------ggggctgaaacaagggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||      | |||||||||||||||    
T  22685025 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggt 22684926  T
Q  307 ttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattagg 405  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22684925 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattagg 22684826  T
Q  406 attgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc---attgatttctcttttgtaacgtta 502  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  22684825 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgtta 22684726  T
Q  503 ctcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684725 ctcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22684642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 32339303 - 32339655
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32339303 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 32339402  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  32339403 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 32339602  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32339603 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtg 32339655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 27829295 - 27829642
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27829295 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27829390  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27829391 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 27829490  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829491 tgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27829589  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829590 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 27829642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28251904 - 28251556
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  28251904 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagataga----gtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 28251809  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28251808 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 28251709  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251708 tgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28251609  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251608 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 28251556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 15809213 - 15809564
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15809213 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 15809312  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |    
T  15809313 tgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 15809511  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809512 cttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 15809564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 27826984 - 27827331
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27826984 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27827079  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  27827080 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggc 27827179  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827180 tgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27827278  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827279 ctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 27827331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 14807749 - 14808107
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14807749 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 14807844  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14807845 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 14807944  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg---- 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        
T  14807945 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 14808044  T
Q  530 ------ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
          |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808045 ctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 14808107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 18810707 - 18811053
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18810707 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18810802  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  18810803 gtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggct 18810902  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18810903 gggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctc 18811001  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811002 tcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 18811053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 15072708 - 15073057
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  15072708 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtt 15072803  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15072804 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggg 15072903  T
Q  434 t-gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15072904 ttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctc 15073003  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15073004 tctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 15073057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 4424016 - 4424364
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4424016 tacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4424111  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  4424112 tgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 4424211  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4424212 tggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctct 4424311  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424312 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 4424364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Original strand, 44720842 - 44721181
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||    
T  44720842 acttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgtttt 44720937  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44720938 gtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 44721037  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44721038 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctct 44721136  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721137 ctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 44721181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 43530122 - 43530461
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||                
T  43530122 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------ 43530209  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  43530210 -gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggc 43530308  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43530309 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgt 43530408  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530409 ctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 43530461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28283562 - 28283210
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  28283562 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggg 28283463  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  28283462 tttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 531  Q
      |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 28283264  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283263 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 28283210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 15067979 - 15068327
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  15067979 tacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtt 15068074  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||     
T  15068075 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggt 15068174  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15068175 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctct 15068274  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15068275 ctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtg 15068327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30480798 - 30480492
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30480798 gagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30480699  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30480698 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 30480599  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480598 ttgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30480499  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  30480498 ttttgtg 30480492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24873524 - 24873178
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagaca--gagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24873524 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 24873425  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggaga 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  24873424 tttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaaga 24873325  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 530  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24873324 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 24873226  T
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  24873225 tctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 289 - 578
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079940
Alignment:
Q  289 gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacc 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  388 ttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgattt 486  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  487 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43079850 ctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43079940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27107192 - 27106886
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  27107192 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggtt 27107093  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27107092 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27106993  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27106992 tagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatta 27106893  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  27106892 ttttgtg 27106886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 277 - 578
Target Start/End: Original strand, 43082009 - 43082311
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43082009 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 43082108  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43082109 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgta 43082208  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  43082209 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 43082307  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  43082308 aatt 43082311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 18812892 - 18813227
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  18812892 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagataga----ggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag----- 18812982  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
          |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  18812983 ------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggct 18813076  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18813077 gtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctc 18813175  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18813176 tcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 18813227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 27911055 - 27911359
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  27911055 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 27911153  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  27911154 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactca 27911253  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27911254 ttgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattc 27911352  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  27911353 ttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 27957474 - 27957778
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  27957474 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 27957572  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  27957573 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactca 27957672  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27957673 ttgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattc 27957771  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  27957772 ttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14419528 - 14419179
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  14419528 tacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtt 14419433  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||      
T  14419432 tgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagat 14419333  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||    
T  14419332 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctc 14419233  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419232 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 14419179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 1225206 - 1225513
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  1225206 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggtt 1225305  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  1225306 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 1225405  T
Q  480 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1225406 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 1225505  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  1225506 cttttgtg 1225513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 235 - 583
Target Start/End: Original strand, 41384743 - 41385087
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||  |||||| |||     |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||    
T  41384743 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagataga-----ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtt 41384837  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  41384838 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 41384937  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||  |||| |||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  41384938 tggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 41385037  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385038 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 41385087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 235 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 13858821 - 13858477
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13858821 tacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 13858726  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||      
T  13858725 tgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagat 13858626  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  13858625 tggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctc 13858527  T
Q  533 tctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 582  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13858526 tctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 286 - 586
Target Start/End: Original strand, 36865583 - 36865883
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  36865583 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattc 36865682  T
Q  385 accttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  36865683 accttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaat 36865779  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaa-actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 582  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  36865780 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctct 36865879  T
Q  583 tgtg 586  Q
    ||||    
T  36865880 tgtg 36865883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 25952561 - 25952867
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  25952561 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 25952659  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  25952660 gattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactca 25952759  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25952760 ttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 25952859  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  25952860 cttttgtg 25952867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 41382671 - 41383008
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| |||||| |||     |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||    
T  41382671 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagat----ggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtt 41382766  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||||| | ||||      
T  41382767 tgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagat 41382855  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  41382856 tggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 41382955  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41382956 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 41383008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 290 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 5372464 - 5372168
Alignment:
Q  290 ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcacct 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  5372464 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcacct 5372365  T
Q  389 taggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 488  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  5372364 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatct 5372265  T
Q  489 cttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-cccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5372264 tttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattatttt 5372168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 33541683 - 33541399
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33541683 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 33541584  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||                      ||    
T  33541583 gattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg----------------------ca 33541506  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  33541505 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttc 33541406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 484
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477520
Alignment:
Q  237 ctttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 336  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| |||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagataga----gggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 14477371  T
Q  337 tatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctg 435  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  14477372 tataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 14477471  T
Q  436 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14477472 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 585
Target Start/End: Original strand, 15956052 - 15956303
Alignment:
Q  332 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggaga 430  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| | |||    
T  15956052 gtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaaga 15956147  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 529  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |     
T  15956148 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttt 15956247  T
Q  530 ctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 585  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15956248 ctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgt 15956303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 324 - 578
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482649
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 21482492  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
     | | ||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  | | ||    
T  21482493 tgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacg 21482592  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21482593 gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15185992 - 15185706
Alignment:
Q  294 ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttagg 392  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||  |||| |||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||       
T  15185992 ctgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgta 15185893  T
Q  393 aaacactattaggattgagtctct--tggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||        |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  15185892 aaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctct 15185800  T
Q  491 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 583  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185799 tttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 15185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 324 - 569
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480832
Alignment:
Q  324 aaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtta 422  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 21480684  T
Q  423 cgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 521  Q
    || | |||   ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  21480685 cgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 21480784  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggt 569  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21480785 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 578
Target Start/End: Original strand, 31162211 - 31162551
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaa-caacaaaactagtg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||    ||||||| ||| ||| |||||| |||  ||| |||||||  |||||    
T  31162211 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaaga----gggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtg 31162303  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagag 431  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||  ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  31162304 tttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagag 31162400  T
Q  432 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 530  Q
      |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  31162401 attgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgc 31162500  T
Q  531 tctct--cccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||  |||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31162501 tctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 281 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 3005922 - 3005624
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctg-aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacc-tagggtttgtgggt 378  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||  |||||||   || |    
T  3005922 gagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt---ggat 3005829  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3005828 tgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcc 3005729  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  3005728 attgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 3005629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Original strand, 26775198 - 26775378
Alignment:
Q  234 ttactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  26775198 ttacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggt 26775293  T
Q  334 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775294 ttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5623033 - 5622889
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  5623033 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggtt 5622934  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 424  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  5622933 gattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacg 5622889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 511
Target Start/End: Original strand, 181623 - 181772
Alignment:
Q  364 ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacgagg--agaggctgggactttgggtagaattaggcggga 460  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  181623 ctagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcggaa 181722  T
Q  461 gacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  181723 gacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 235 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12517363 - 12517248
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12517363 tacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 12517266  T
Q  335 tgtatagagtttgtctct 352  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12517265 tgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 375 - 578
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  375 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgt 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  | ||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  474 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactat--gtcaat-ttggaccgaactgggt 569  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  570 caacaaatt 578  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 378 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | | | ||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||| | | |||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35872673 - 35872555
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||    
T  35872673 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggtt 35872579  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactatta 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  35872578 gattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 446 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  446 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaac 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| |||| |     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  545 tatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3886255 - 3886153
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3886255 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 3886160  T
Q  335 tgtatag 341  Q
    |||||||    
T  3886159 tgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 462 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872442
Alignment:
Q  462 acttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccg 561  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||             ||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 35872467  T
Q  562 aactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35872466 aactgggtcaacaaattcttttgtg 35872442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 37214435 - 37214317
Alignment:
Q  332 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggaga 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||| | ||     
T  37214435 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagc 37214345  T
Q  431 ggctgggactttgggtagaattaggcgg 458  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37214344 gattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 476  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 31573825  T
Q  477 ccattgatttctcttttgtaacgttactcat 507  Q
     | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31573824 tctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214253
Alignment:
Q  520 cggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 37214253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 568
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847848
Alignment:
Q  378 ttgattcacctt--aggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 474  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactggg 568  Q
    | || ||||| ||||||||||||    | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37214505 - 37214458
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaact 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37214505 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 37214458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2468307 - 2468261
Alignment:
Q  374 tgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468307 tgggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 412
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  316 caacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagt 412  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554908
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatta 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 336
Target Start/End: Original strand, 181535 - 181632
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||    
T  181535 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtt 181630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9021458 - 9021418
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9021458 ttgtttcagttttttaagggtttactttcactataaatata 9021418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 586
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477597
Alignment:
Q  509 atatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactg-ggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| | |||| |||| |||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtg 14477597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 480 - 576
Target Start/End: Original strand, 16833789 - 16833886
Alignment:
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||| || |||| |||| ||| |  |||||||||| ||||||    
T  16833789 ttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttggacgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743214
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 4812554 - 4812486
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  4812554 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702576
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127225
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 578
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376328
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctctt 491  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  | ||||  || ||||||  |||||||||||   || |||| ||| |||| |||  ||||| ||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  492 ttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  6376241 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 16757334 - 16757266
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16757334 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799558
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 25684758 - 25684826
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  25684758 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890949
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  378 ttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggt 420  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 531 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930193
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21033930
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcac-aggaagggctgggac-ttgggtagaaatagg 21033930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2468435 - 2468361
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||    |||| |||||| |||||||||||| |||| |||    
T  2468435 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 541
Target Start/End: Original strand, 3896063 - 3896124
Alignment:
Q  481 tgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccca 541  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  3896063 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctccccca 3896124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 21033700 - 21033741
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21033700 ttgtttcagttttttaaggggttactttccactataaatata 21033741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29554851 - 29554810
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  29554851 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29555137 - 29555096
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattac-tttcactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29555137 ttgtttcagttttttaagggtttacttttcactataaatata 29555096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 17799490 - 17799418
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17799490 tatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 23179627 - 23179555
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  23179627 tatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179692
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Original strand, 28328023 - 28328091
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28328023 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 223 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 183988 - 183630
Alignment:
Q  223 tttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaac 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||      |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  183988 tttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaa-----gggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaac 183894  T
Q  323 aaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtt 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183893 aaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 183794  T
Q  422 acgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 521  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  183793 acg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacg 183695  T
Q  522 gagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183694 gagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 183630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 235 - 581
Target Start/End: Original strand, 51960 - 52307
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  51960 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagata--gagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 52057  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  52058 tgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 52157  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg--ct 531  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||    
T  52158 tgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 52257  T
Q  532 ctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52258 ctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50308
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctct--ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 249 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14376
Alignment:
Q  249 atatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgt 348  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagata--gagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 14610  T
Q  349 ctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggta 447  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  14609 ctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggta 14510  T
Q  448 gaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactat 547  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||     
T  14509 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactag 14410  T
Q  548 gtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409 gtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 235 - 581
Target Start/End: Original strand, 14970 - 15313
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14970 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 15065  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||      
T  15066 tttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagat 15165  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  15166 tcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgt 15265  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15266 ctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattctt 15313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 79178 - 79484
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggtt 379  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  79178 gagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggtt 79277  T
Q  380 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  79278 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 79377  T
Q  480 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  79378 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatta 79477  T
Q  580 ttttgtg 586  Q
    |||||||    
T  79478 ttttgtg 79484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 235 - 544
Target Start/End: Original strand, 1987 - 2298
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga--gacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1987 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 2086  T
Q  333 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagagg 432  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  2087 tttgtacagagtttgtctcttcggaataaaactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagg 2186  T
Q  433 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2187 ctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactc 2286  T
Q  533 tctcccccaaac 544  Q
    ||||||| ||||    
T  2287 tctccccaaaac 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 3948 - 4294
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3948 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4043  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  4044 tgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagc 4142  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4143 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 4242  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4243 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtg 4294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3178
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 2927  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  2928 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 3027  T
Q  435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 534  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3028 tggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatc 3126  T
Q  535 tcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  3127 tccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtg 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 236 - 578
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6490
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgttt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggttt 6246  T
Q  336 gtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||      
T  6247 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagat 6346  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6347 tgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 6445  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  6446 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatt 6490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 277 - 586
Target Start/End: Original strand, 29160 - 29469
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  29160 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatg 29259  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 475  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29260 ggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 29359  T
Q  476 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29360 ctcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 29458  T
Q  576 attcttttgtg 586  Q
    |||| ||||||    
T  29459 attcgtttgtg 29469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11462
Alignment:
Q  235 tactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| | |||| |||    ||||||||||||| || |||| || | ||||||||||||||| |||    
T  11810 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagataga----gggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11715  T
Q  335 tgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggc 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  11714 tgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 11615  T
Q  434 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11614 tgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctct 11515  T
Q  534 ctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11514 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtg 11462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 277 - 578
Target Start/End: Original strand, 30 - 332
Alignment:
Q  277 gagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtg 129  T
Q  376 ggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 474  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgta 229  T
Q  475 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaaca 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  230 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 328  T
Q  575 aatt 578  Q
    ||||    
T  329 aatt 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 355 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1442
Alignment:
Q  355 ggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaatta 453  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  454 ggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat 553  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  554 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 586
Target Start/End: Original strand, 79852 - 80158
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacct-agggtttgtgggt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||    
T  79852 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggt 79951  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |    
T  79952 tgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactc 80050  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  80051 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaatt 80150  T
Q  579 cttttgtg 586  Q
    ||||||||    
T  80151 cttttgtg 80158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 188594 - 188553
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  188594 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 188553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 296 - 586
Target Start/End: Original strand, 85238 - 85530
Alignment:
Q  296 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttaggaa 394  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  85238 gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaa 85337  T
Q  395 acactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 494  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  85338 acactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcg 85437  T
Q  495 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  85438 taaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtg 85530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 293 - 467
Target Start/End: Original strand, 35644 - 35819
Alignment:
Q  293 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattcaccttag 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  35644 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagg 35743  T
Q  392 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 467  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744 gaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35893
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtg 35893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22414
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22320 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 22414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 586
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24689
Alignment:
Q  392 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  491 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24595 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 24689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 22162 - 22208
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  22162 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagaga 22208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Original strand, 24437 - 24483
Alignment:
Q  236 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  24437 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagaga 24483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 280 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1927 - 1638
Alignment:
Q  280 agagacagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||          ||||||| |||||||| |||| |    
T  1927 agagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggtt-gtgg-t 1840  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1839 tgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaaccc 1740  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  1739 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaa 1640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 286 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16108 - 15817
Alignment:
Q  286 agagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggttgattc 384  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||    |||||||||    
T  16108 agagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattc 16013  T
Q  385 accttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 484  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16012 accttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgat 15913  T
Q  485 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 578  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||  |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15912 atctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 281 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16646
Alignment:
Q  281 gagacagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac-ctagggtttgtgggt 378  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  | |    
T  16942 gagatagaggaggctgaaaacaagggtttgaaa-gacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gat 16848  T
Q  379 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16847 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaaccc 16748  T
Q  479 attgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 576  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |  |||| |  ||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16747 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 16648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1053
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaaaa 312  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| ||    
T  1190 ttgtttcaatttgttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaa 1095  T
Q  313 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctcttt 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1094 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 378 - 569
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5095
Alignment:
Q  378 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 477  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  478 cattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaat-ttggaccgaactgggt 569  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |  ||  ||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||||| |||||    
T  5001 cattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 521 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4668
Alignment:
Q  521 ggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtg 4668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133373
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  133309 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1483 - 1440
Alignment:
Q  543 actatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1483 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 17052 - 16980
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17052 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17107
Alignment:
Q  396 cactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggctgggactttgggtagaattagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattagg 17107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17338 - 17297
Alignment:
Q  213 ttgtttcagttttttaagggattacttt-cactataaatata 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17338 ttgtttcagttttttaagggtttactttccactataaatata 17297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10736
Alignment:
Q  512 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaa 572  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57452
Alignment:
Q  393 aaacactattaggattgagtctcttggttacgaggagaggct-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctct 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |   | ||||  | |||||||||||| ||||||||   || ||  |||| ||||||||| ||||| ||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  491 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca 551  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  57513 tttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3068
Alignment:
Q  510 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 577  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45257
Alignment:
Q  511 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaa 45257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  531 tctctcccccaaactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 575  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1114 times since January 2019
Visitors: 1291