View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0057_low_5 (Length: 385)

Name: NF0057_low_5
Description: NF0057
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0057_low_5
NF0057_low_5
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (91-385)||(9299766-9300060)
chr1 (91-385)||(9257650-9257943)
chr1 (92-383)||(9466877-9467168)
chr1 (92-364)||(9364070-9364342)
chr1 (92-364)||(9337211-9337483)
chr1 (92-338)||(9242728-9242974)
chr1 (127-385)||(8962012-8962270)
chr1 (127-385)||(8939085-8939343)
chr1 (127-385)||(8926659-8926917)
chr1 (166-333)||(9437962-9438129)
chr1 (166-333)||(9420879-9421046)
chr1 (274-383)||(8979344-8979453)
chr1 (304-356)||(8861971-8862023)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (85-385)||(9171163-9171463)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (100-385)||(1287-1572)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (100-364)||(15910555-15910819)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 91 - 385
Target Start/End: Original strand, 9299766 - 9300060
Alignment:
Q  91 catttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaaga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9299766 catttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattataaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaaga 9299865  T
Q  191 gaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9299866 gaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgct 9299965  T
Q  291 caataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgctttt 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  9299966 caataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaacaatgggcaaaatccaccatctcaatgttgtccgtttgcttggctttt 9300060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 91 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9257943 - 9257650
Alignment:
Q  91 catttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaaga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9257943 catttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattataaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacatcaaga 9257844  T
Q  191 gaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9257843 gaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcaaggagctgtttacaaagg-caattatcaagtcaaattctagttgctgttaagatgat 9257745  T
Q  291 caataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgctttt 385  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9257744 caataacgcagaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactatgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgcttggctttt 9257650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 92 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9467168 - 9466877
Alignment:
Q  92 atttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagag 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9467168 atttcaagatgaaaggcgaagatcatgtaagaatcgaaaactttttgaaggattataaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagag 9467069  T
Q  192 aattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctc 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9467068 aattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattgtcaagccaaattctcgttgccgttaagatgctc 9466969  T
Q  292 aataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgctt 383  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||    
T  9466968 aataacactgagggagatggtaaggagttcataaatgaagtgggaactatgggaaaaatccatcatcttaatgttgtccgtttgcttggctt 9466877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 364
Target Start/End: Original strand, 9364070 - 9364342
Alignment:
Q  92 atttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagag 191  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||    
T  9364070 attttaagatgaaaagcgaagatcatacaagaattgaaaactttttgaaggattacagggctttaaagccaactaggttctcttatgcagacttaaagag 9364169  T
Q  192 aattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctc 291  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  9364170 aattacaaataaatttaaagataagataggcgaaggggctcatggagctgtttataaaggtaagttatcgaaccaaattctagtagccgtgaagattctt 9364269  T
Q  292 aataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatg 364  Q
    |||||  |  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  9364270 aataatacaaaggaagatgggaaggaattcataaatgaagtgggaaccatgggcaaaattcaccatctcaatg 9364342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 364
Target Start/End: Original strand, 9337211 - 9337483
Alignment:
Q  92 atttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcag-gctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaaga 190  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||    
T  9337211 attttaagatgaaaagcgaagatcatacaagaattgaaaactttttgaaggatta-cagtgctttaaagccaactaggttctcttatgcagacttaaaga 9337309  T
Q  191 gaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgct 290  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||| ||| || || ||||| ||    
T  9337310 gaattacaaataaatttaaagataagataggcgaaggggctcatggagctgtttataaaggtaagttatcgaaccaaattctagtagccgtgaagattct 9337409  T
Q  291 caataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatg 364  Q
     |||||  |  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  9337410 taataatacataggaagatgggaaggaattcataaatgaagtgggaaccatgggcaaaattcaccatctcaatg 9337483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9242974 - 9242728
Alignment:
Q  92 atttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagag 191  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  9242974 attttaagatgaaaagtgaagatcatacaagaattgaaaactttttgaaggattacagggctttaaagccaactaggttctcttatgcagacataaagag 9242875  T
Q  192 aattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctc 291  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  9242874 aattacaaataaatttgaagataagataggcgaagggactcatggagctgtttataaaggtaaattatcgaaccaaattctagtagccgtgaagattctt 9242775  T
Q  292 aataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaac 338  Q
    ||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9242774 aataatgcagaggaagatgggaaggaattcataaatgaagtgggaac 9242728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 385
Target Start/End: Original strand, 8962012 - 8962270
Alignment:
Q  127 gaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagagaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaag 226  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||  |  |||| ||||| ||| | || ||||    
T  8962012 gaaaactttttgaaggattatgaagcgtcaaagccaactagattttcttatgccgatatcaagagaattactgatcaattcaaggaaaagctgggcgaag 8962111  T
Q  227 gagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctcaataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaa 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||  |||||||||||    
T  8962112 gagctcatggagctgtctacaaaggtaaattatcgagtcaaattcttgttgctgtgaagatgcttaataatacagaaggagatgggagagagttcataaa 8962211  T
Q  327 tgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgctttt 385  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||| |||||| || ||| ||||||    
T  8962212 tgaagtaggaactatgggaaaaatccatcatgttaatgttgtccggttacttggctttt 8962270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 385
Target Start/End: Original strand, 8939085 - 8939343
Alignment:
Q  127 gaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagagaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaag 226  Q
    ||||||||||||||||||||  | || | ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||| |  |||| || || ||| | || ||||    
T  8939085 gaaaactttttgaaggattacgaagcgtcaaagccaacaagattttcttatgcagatatcaagagaattacagatcaattcaaagaaaagctaggggaag 8939184  T
Q  227 gagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctcaataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaa 326  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| | |||  | || ||||||||||  |||||||||||    
T  8939185 gagctcatggagctgtctataaaggtaaattatcgagtcaaattcttgttgccgtgaagatgcttagtaataccgagggagatgggagagagttcataaa 8939284  T
Q  327 tgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgctttt 385  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||| | |||| |||||| |||||| ||||||    
T  8939285 tgaagtgggaactatgggaaaaattcatcatgttaatgttgtccggttgcttggctttt 8939343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 385
Target Start/End: Original strand, 8926659 - 8926917
Alignment:
Q  127 gaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagagaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaag 226  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||  |  | || || || ||| | || ||||    
T  8926659 gaaaactttttgaaggattatgaagcgtcaaagccaactagattttcttatgcagatatcaagagaattacggatcagttcaaagaaaagctaggcgaag 8926758  T
Q  227 gagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctcaataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaa 326  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||   |||||||| |||||||| | |||  | || ||||||||||  |||||||||||    
T  8926759 gagctcatggagctgtctataaaggtaaattatcgaatcaaattatggttgctgtgaagatgcttagtaatacagagggagatgggagtgagttcataaa 8926858  T
Q  327 tgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgctttt 385  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| | |||| ||| || |||||| ||||||    
T  8926859 tgaggtgggaactatgggaaaaatccatcatgttaatgttgttcggttgcttggctttt 8926917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9438129 - 9437962
Alignment:
Q  166 agattctcctatgctgacataaagagaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtc 265  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||  || | || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |     
T  9438129 agattctcttatgctgatataaagaggattacaaataattttagggaagagttaggtgaaggagctcatggtgcagttttcaaaggtaaattatctaatg 9438030  T
Q  266 aaattcaagttgctgttaagatgctcaataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtg 333  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || ||| | || || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  9438029 aaattcttgtggctgtgaagatgcttaaaaacaccgagggcgatggaaaagagttcattaacgaagtg 9437962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9421046 - 9420879
Alignment:
Q  166 agattctcctatgctgacataaagagaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtc 265  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || |||| |||  || | || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |     
T  9421046 agattctcttatgttgatataaagaggattacaaataattttagggaagagttaggtgaaggagctcatggtgcagttttcaaaggtaaattatctaatg 9420947  T
Q  266 aaattcaagttgctgttaagatgctcaataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtg 333  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || ||| | || || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  9420946 aaattcttgtggctgtgaagatgcttaaaaacaccgagggcgatggaaaagagttcattaacgaagtg 9420879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8979453 - 8979344
Alignment:
Q  274 gttgctgttaagatgctcaataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgct 373  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| ||| || |    
T  8979453 gttgctgtgaagattctcaacaatacagaaggagacgggaaagagttcattagcgaagtgggaattatgggaaaaatccaccacatcaatgttgttcgat 8979354  T
Q  374 tgctttgctt 383  Q
    ||||| ||||    
T  8979353 tgcttggctt 8979344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8862023 - 8861971
Alignment:
Q  304 ggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccacca 356  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  8862023 ggagaagggaaagagttcatcaatgaagtgggaattatgggcaaaatccacca 8861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 85 - 385
Target Start/End: Original strand, 9171163 - 9171463
Alignment:
Q  85 catcatcatttcaagatgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171163 catcatcatttcaagatgaaaggcgaagatcataaaagaatcgaaaactttttgaaggattacaaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgaca 9171262  T
Q  185 taaagagaattacaaacaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaa 284  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  9171263 taaagagaatcacaaataaatttaaggataagttaggcgaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagccaaattctagttggtgttaa 9171362  T
Q  285 gatgctcaataacgctgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgcttt 384  Q
    |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||    
T  9171363 gatgctaaataacacagagggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactatgggcaaaatccaccatctaaatgttgtccgtttgcttggcttt 9171462  T
Q  385 t 385  Q
    |    
T  9171463 t 9171463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 385
Target Start/End: Original strand, 1287 - 1572
Alignment:
Q  100 atgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagagaattacaa 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  1287 atgaaaggcgaagatcatacaagaattgaaaactttttgaaggattacagggctttaaagccaactaggttctcttatgcagacttgaagagaattacaa 1386  T
Q  200 acaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctcaataacgc 299  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| || || ||||| || ||||| ||    
T  1387 ataaatttaaagataagataggggaaggggctcatggagctgtttataaaggtaaattatcgaaccaaattctagtagccgtgaagattcttaataatgc 1486  T
Q  300 tgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatgctgtccgcttgctttgctttt 385  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||    
T  1487 agagggagatgggaaggaattcataaatgaagtgggaaccatgggcaaaatccaccatctcaatgtcgttcgtttgcttggctttt 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15910819 - 15910555
Alignment:
Q  100 atgaaaggcgaagatcatgaaagaatcgaaaactttttgaaggattatcaggctttaaagccaaccagattctcctatgctgacataaagagaattacaa 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||||| ||||||    
T  15910819 atgaaaggcgaagatcatacaagaattgaaaactttttgaaggattacagggctttaaagccaactaggttctcttatgcagacttgaagagatttacaa 15910720  T
Q  200 acaaatttaaggataagatcggagaaggagctcatggagctgtttacaaaggtaaattatcaagtcaaattcaagttgctgttaagatgctcaataacgc 299  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| || || ||||| || ||||| ||    
T  15910719 ataaatttaaagataagataggggaaggggctcatggagctgtttataaaggtaaattatcgaaccaaattctagtagccgtgaagattcttaataatgc 15910620  T
Q  300 tgaaggagatgggaaggagttcataaatgaagtgggaactgtgggtaaaatccaccatctcaatg 364  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15910619 agagggagatgggaaggaattcataaatgaagtgggaaccatgggcaaaatccaccatctcaatg 15910555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 837 times since January 2019
Visitors: 1285