View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0063_1D_low_13 (Length: 251)

Name: NF0063_1D_low_13
Description: NF0063_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0063_1D_low_13
NF0063_1D_low_13
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (5-251)||(19674183-19674429)
chr8 (5-251)||(16277299-16277545)
chr8 (5-251)||(2137483-2137729)
chr8 (5-251)||(27609129-27609375)
chr8 (5-251)||(3329743-3329989)
chr8 (5-251)||(14557372-14557618)
chr8 (5-251)||(19518367-19518613)
chr8 (5-251)||(28362179-28362425)
chr8 (5-251)||(19208584-19208830)
chr8 (5-251)||(29829058-29829304)
chr8 (5-251)||(19687843-19688089)
chr8 (5-251)||(31489974-31490220)
chr8 (13-251)||(33258476-33258714)
chr8 (5-248)||(18710331-18710574)
chr8 (5-251)||(12092957-12093203)
chr8 (7-251)||(16283196-16283440)
chr8 (5-251)||(31354269-31354515)
chr8 (5-219)||(19286210-19286424)
chr8 (5-212)||(22081135-22081342)
chr8 (84-206)||(19659305-19659427)
chr8 (84-206)||(44562928-44563050)
chr8 (130-206)||(9354495-9354571)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (5-251)||(5005630-5005876)
chr4 (5-251)||(27163582-27163828)
chr4 (5-251)||(24592576-24592822)
chr4 (5-251)||(30753502-30753748)
chr4 (5-251)||(6569613-6569859)
chr4 (5-251)||(21969461-21969707)
chr4 (5-251)||(17013760-17014006)
chr4 (5-251)||(18800887-18801133)
chr4 (5-251)||(33674075-33674321)
chr4 (5-251)||(14098301-14098547)
chr4 (5-251)||(14664778-14665024)
chr4 (8-251)||(40105903-40106146)
chr4 (5-251)||(31126783-31127029)
chr4 (5-251)||(39850383-39850629)
chr4 (5-251)||(14763569-14763815)
chr4 (5-186)||(19373021-19373202)
chr4 (5-219)||(54833150-54833364)
chr4 (5-219)||(36344809-36345023)
chr4 (10-206)||(1900025-1900221)
chr4 (10-206)||(15227638-15227834)
chr4 (10-206)||(15285235-15285431)
chr4 (5-251)||(14235790-14236036)
chr4 (5-219)||(24112425-24112639)
chr4 (5-219)||(34189254-34189468)
chr4 (5-212)||(15391636-15391844)
chr4 (130-206)||(24460912-24460988)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (5-251)||(28116263-28116509)
chr3 (5-251)||(4796959-4797205)
chr3 (5-251)||(7996268-7996514)
chr3 (5-251)||(10642776-10643022)
chr3 (5-251)||(4721337-4721583)
chr3 (5-251)||(7072918-7073164)
chr3 (5-251)||(11110667-11110913)
chr3 (5-251)||(35880472-35880718)
chr3 (5-251)||(6192022-6192268)
chr3 (5-251)||(21674399-21674645)
chr3 (5-251)||(17985262-17985508)
chr3 (5-251)||(47023159-47023405)
chr3 (5-251)||(18050968-18051214)
chr3 (5-251)||(29665291-29665537)
chr3 (5-251)||(36997395-36997641)
chr3 (5-251)||(18330380-18330621)
chr3 (5-251)||(20577168-20577414)
chr3 (5-251)||(28339008-28339254)
chr3 (5-251)||(31964779-31965025)
chr3 (5-251)||(50134377-50134623)
chr3 (5-251)||(5013418-5013664)
chr3 (5-251)||(5609628-5609874)
chr3 (5-251)||(6542780-6543026)
chr3 (5-251)||(24327865-24328111)
chr3 (5-251)||(29149061-29149307)
chr3 (5-251)||(51781717-51781963)
chr3 (5-251)||(8295681-8295927)
chr3 (5-219)||(15741420-15741634)
chr3 (5-251)||(48465621-48465867)
chr3 (13-251)||(51796814-51797052)
chr3 (5-251)||(4416622-4416868)
chr3 (5-251)||(18224897-18225143)
chr3 (5-251)||(18242433-18242679)
chr3 (5-251)||(22871180-22871426)
chr3 (5-251)||(22886239-22886485)
chr3 (7-251)||(15893012-15893256)
chr3 (5-251)||(10395842-10396085)
chr3 (5-251)||(8301570-8301816)
chr3 (5-219)||(20065752-20065966)
chr3 (5-251)||(18277358-18277604)
chr3 (5-251)||(18292659-18292905)
chr3 (5-251)||(18307960-18308206)
chr3 (5-219)||(8211447-8211661)
chr3 (5-206)||(5596717-5596918)
chr3 (5-219)||(5466691-5466905)
chr3 (7-219)||(28020986-28021198)
chr3 (5-219)||(4347022-4347236)
chr3 (130-251)||(5713058-5713179)
chr3 (130-251)||(5723968-5724089)
chr3 (130-251)||(5757388-5757509)
chr3 (130-251)||(5768279-5768400)
chr3 (10-206)||(16626854-16627049)
chr3 (10-206)||(18530108-18530304)
chr3 (5-219)||(4892919-4893133)
chr3 (5-219)||(22387913-22388127)
chr3 (5-219)||(32438863-32439077)
chr3 (130-206)||(17994132-17994208)
chr3 (130-205)||(4625778-4625853)
chr3 (130-206)||(5652221-5652297)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (5-251)||(16736611-16736857)
chr7 (5-251)||(16751665-16751911)
chr7 (5-251)||(17523278-17523524)
chr7 (5-251)||(17529691-17529937)
chr7 (5-251)||(5127738-5127984)
chr7 (5-251)||(45387089-45387335)
chr7 (5-251)||(11441306-11441552)
chr7 (5-251)||(2154319-2154565)
chr7 (5-251)||(5147491-5147737)
chr7 (5-251)||(11424927-11425173)
chr7 (5-251)||(10917016-10917262)
chr7 (5-251)||(24592692-24592938)
chr7 (5-251)||(26275245-26275491)
chr7 (5-251)||(26435003-26435249)
chr7 (5-251)||(31564550-31564796)
chr7 (5-251)||(26320020-26320266)
chr7 (5-251)||(26485895-26486141)
chr7 (5-251)||(26538024-26538270)
chr7 (5-251)||(26670065-26670311)
chr7 (5-251)||(31124657-31124903)
chr7 (5-251)||(3445040-3445286)
chr7 (5-251)||(9618397-9618643)
chr7 (7-251)||(16503531-16503775)
chr7 (7-251)||(16518567-16518811)
chr7 (5-251)||(4145274-4145520)
chr7 (10-200)||(16041077-16041267)
chr7 (10-198)||(16450199-16450387)
chr7 (5-219)||(5159268-5159482)
chr7 (130-206)||(31088657-31088733)
chr7 (130-206)||(45733334-45733410)
chr7 (27-62)||(22143423-22143458)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (5-251)||(11635443-11635689)
chr2 (5-251)||(11641632-11641878)
chr2 (5-251)||(13936798-13937044)
chr2 (5-251)||(32049539-32049785)
chr2 (5-251)||(34279190-34279436)
chr2 (5-251)||(21677436-21677682)
chr2 (5-251)||(28881955-28882201)
chr2 (7-251)||(23128820-23129064)
chr2 (5-251)||(12716859-12717105)
chr2 (5-251)||(37925234-37925480)
chr2 (5-251)||(261019-261265)
chr2 (5-251)||(34286095-34286341)
chr2 (5-251)||(34291155-34291401)
chr2 (5-251)||(40233240-40233486)
chr2 (5-251)||(16829592-16829838)
chr2 (5-251)||(16891643-16891889)
chr2 (5-251)||(22926282-22926528)
chr2 (5-251)||(12586542-12586788)
chr2 (5-251)||(27803433-27803679)
chr2 (5-251)||(31876022-31876268)
chr2 (5-251)||(34861421-34861667)
chr2 (5-251)||(37686163-37686409)
chr2 (5-251)||(37701428-37701674)
chr2 (5-251)||(39889803-39890049)
chr2 (5-251)||(9350248-9350494)
chr2 (5-251)||(12655283-12655529)
chr2 (5-251)||(19416753-19416999)
chr2 (5-251)||(27776948-27777194)
chr2 (5-251)||(27816715-27816961)
chr2 (5-251)||(20837659-20837905)
chr2 (5-251)||(39052082-39052328)
chr2 (7-251)||(27434698-27434942)
chr2 (5-205)||(37374902-37375102)
chr2 (10-251)||(21703415-21703656)
chr2 (10-206)||(19456717-19456913)
chr2 (5-231)||(27392734-27392960)
chr2 (84-206)||(31891624-31891746)
chr2 (130-206)||(3784523-3784599)
chr2 (130-206)||(27118557-27118633)
chr2 (130-206)||(34156880-34156956)
chr2 (130-205)||(34303600-34303675)
chr2 (130-206)||(16163468-16163544)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (5-251)||(26918122-26918368)
chr6 (5-251)||(26999815-27000061)
chr6 (5-251)||(16749596-16749842)
chr6 (5-248)||(26988743-26988986)
chr6 (5-251)||(3695805-3696051)
chr6 (5-251)||(15424525-15424771)
chr6 (5-251)||(30558224-30558470)
chr6 (5-251)||(13299159-13299405)
chr6 (5-251)||(24304826-24305072)
chr6 (5-251)||(27007454-27007700)
chr6 (5-251)||(27360218-27360464)
chr6 (5-251)||(27450561-27450807)
chr6 (5-251)||(29572755-29573001)
chr6 (5-251)||(34463569-34463815)
chr6 (5-251)||(4545992-4546238)
chr6 (5-251)||(4724351-4724597)
chr6 (5-251)||(4772739-4772985)
chr6 (5-251)||(24863459-24863705)
chr6 (5-251)||(27484859-27485105)
chr6 (5-251)||(28207184-28207430)
chr6 (5-251)||(16673869-16674115)
chr6 (5-251)||(16944235-16944481)
chr6 (5-251)||(4757503-4757749)
chr6 (5-251)||(17025004-17025250)
chr6 (5-251)||(26116627-26116873)
chr6 (5-251)||(26777835-26778081)
chr6 (7-251)||(22935085-22935329)
chr6 (7-251)||(23857530-23857774)
chr6 (5-248)||(29549220-29549463)
chr6 (5-219)||(27044132-27044346)
chr6 (5-206)||(29501148-29501349)
chr6 (5-219)||(4525031-4525245)
chr6 (59-250)||(22477482-22477673)
chr6 (10-212)||(20160454-20160653)
chr6 (10-212)||(22172178-22172377)
chr6 (130-206)||(13522323-13522399)
chr6 (130-206)||(28162527-28162603)
chr6 (130-206)||(33374506-33374582)
chr6 (130-206)||(8892560-8892636)
chr6 (130-206)||(8903795-8903871)
chr6 (127-220)||(27629948-27630041)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (5-251)||(395-641)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (5-251)||(33777241-33777487)
chr5 (5-251)||(41674463-41674709)
chr5 (5-251)||(9548705-9548951)
chr5 (5-251)||(23718150-23718396)
chr5 (5-251)||(23752612-23752858)
chr5 (5-251)||(8665637-8665883)
chr5 (5-251)||(15658922-15659168)
chr5 (5-251)||(11549108-11549354)
chr5 (5-251)||(18500910-18501156)
chr5 (5-251)||(22999276-22999522)
chr5 (5-251)||(24681191-24681437)
chr5 (5-251)||(24723718-24723964)
chr5 (5-251)||(31431182-31431428)
chr5 (5-251)||(37358817-37359063)
chr5 (5-251)||(5637664-5637910)
chr5 (5-251)||(9317205-9317451)
chr5 (5-251)||(30168223-30168469)
chr5 (5-251)||(33516110-33516356)
chr5 (5-251)||(37671654-37671900)
chr5 (5-251)||(3789280-3789526)
chr5 (5-251)||(12131909-12132155)
chr5 (5-251)||(13325006-13325252)
chr5 (5-251)||(18375574-18375820)
chr5 (5-251)||(24688319-24688565)
chr5 (5-251)||(26480146-26480392)
chr5 (5-251)||(30151772-30152018)
chr5 (5-251)||(31826581-31826827)
chr5 (5-251)||(43078003-43078249)
chr5 (5-251)||(2510805-2511051)
chr5 (5-251)||(6874056-6874302)
chr5 (5-251)||(28648980-28649226)
chr5 (5-251)||(29967228-29967474)
chr5 (5-251)||(30029169-30029415)
chr5 (5-251)||(30934390-30934636)
chr5 (5-251)||(15759019-15759265)
chr5 (5-251)||(37754722-37754968)
chr5 (5-251)||(37771161-37771407)
chr5 (5-251)||(28959960-28960206)
chr5 (5-251)||(40473714-40473960)
chr5 (5-206)||(32599676-32599877)
chr5 (5-219)||(34616275-34616489)
chr5 (97-251)||(24969870-24970024)
chr5 (7-251)||(23891962-23892206)
chr5 (7-196)||(25198788-25198977)
chr5 (7-92)||(24951866-24951951)
chr5 (5-219)||(33292282-33292496)
chr5 (65-206)||(22888287-22888428)
chr5 (130-206)||(13184852-13184928)
chr5 (130-206)||(13440698-13440774)
chr5 (130-206)||(33877129-33877205)
chr5 (130-206)||(11325676-11325752)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (5-251)||(41793573-41793819)
chr1 (5-251)||(10962414-10962660)
chr1 (5-251)||(51637962-51638208)
chr1 (5-251)||(28584725-28584971)
chr1 (10-206)||(20460857-20461053)
chr1 (130-206)||(20340642-20340718)
chr1 (10-251)||(16208290-16208531)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (5-251)||(27037-27283)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (5-251)||(30198-30444)
scaffold0124 (10-206)||(20162-20358)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (5-251)||(9331-9577)
scaffold0159 (52-251)||(19807-20006)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (5-251)||(7504-7750)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (5-251)||(15195-15441)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (5-251)||(47250-47496)
scaffold0089 (7-251)||(40334-40578)
scaffold0089 (7-251)||(29510-29754)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (5-251)||(7682-7928)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (5-251)||(26467-26713)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (5-251)||(5734-5982)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (45-248)||(1-204)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (5-219)||(7977-8191)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (5-231)||(21312-21538)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (130-206)||(2965-3041)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (117-251)||(47078-47221)
scaffold0099 (7-92)||(48572-48662)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 19674183 - 19674429
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674183 atggacatcacaagaagaaagaaacggacgtggggatggtgtcagctggagccagtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19674282  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19674283 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 19674382  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674383 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 19674429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 16277299 - 16277545
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16277299 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 16277398  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16277399 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 16277498  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16277499 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 16277545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2137729 - 2137483
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2137729 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 2137630  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2137629 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 2137530  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2137529 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 2137483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27609375 - 27609129
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27609375 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 27609276  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27609275 tccgtcatacccatatgtgtcgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 27609176  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27609175 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 27609129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3329989 - 3329743
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3329989 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctatcgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 3329890  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3329889 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 3329790  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3329789 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 3329743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 14557372 - 14557618
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14557372 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 14557471  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14557472 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaat 14557571  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14557572 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 14557618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19518613 - 19518367
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19518613 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 19518514  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19518513 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 19518414  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19518413 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 19518367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28362425 - 28362179
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362425 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 28362326  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  28362325 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 28362226  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362225 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 28362179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19208830 - 19208584
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19208830 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19208731  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  19208730 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 19208631  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208630 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 19208584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 29829058 - 29829304
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29829058 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29829157  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  29829158 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 29829257  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29829258 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgtcggttcaacaacaaca 29829304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 19687843 - 19688089
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  19687843 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcc 19687942  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19687943 tccgtcatacccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 19688042  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19688043 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgtcggttcaacaacaaca 19688089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31490220 - 31489974
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31490220 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcc 31490121  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31490120 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 31490021  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31490020 gcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaacaaca 31489974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 33258476 - 33258714
Alignment:
Q  13 cacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33258476 cacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 33258575  T
Q  113 accaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 212  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  33258576 acccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 33258675  T
Q  213 ccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33258676 ccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 33258714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 18710331 - 18710574
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18710331 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 18710430  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  18710431 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaat 18710530  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaaca 248  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18710531 gcagttgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaaca 18710574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12093203 - 12092957
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12093203 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggccaatctatggctactattgctcctatcaatgcagctcaagtgcc 12093104  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  12093103 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacagggccagcctcaagtgcccgtcaat 12093004  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12093003 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 12092957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Original strand, 16283196 - 16283440
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  16283196 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 16283295  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||    
T  16283296 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaatgc 16283395  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16283396 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16283440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 31354269 - 31354515
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31354269 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggccaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 31354368  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  31354369 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 31354468  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || || || |||||| |  |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31354469 gccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaacaaca 31354515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 19286210 - 19286424
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19286210 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19286309  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || || ||||||    
T  19286310 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 19286409  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || ||||| ||||||    
T  19286410 gccattgctcaacag 19286424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22081342 - 22081135
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | ||    
T  22081342 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccatcaatgctgctcagctacc 22081243  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| | || || ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || |   | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22081242 tccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaat 22081143  T
Q  205 gcaattgc 212  Q
    || |||||    
T  22081142 gccattgc 22081135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19659427 - 19659305
Alignment:
Q  84 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggt 183  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||  |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  19659427 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 19659328  T
Q  184 caacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  19659327 caacctcaggtacccgttaatgc 19659305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Original strand, 44562928 - 44563050
Alignment:
Q  84 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggt 183  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||     
T  44562928 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcggga 44563027  T
Q  184 caacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  44563028 caacctcaggtacccgttaatgc 44563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 9354495 - 9354571
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9354495 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 9354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 5005630 - 5005876
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005630 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 5005729  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005730 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 5005829  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005830 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 5005876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27163828 - 27163582
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163828 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 27163729  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27163728 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 27163629  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163628 gcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 27163582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24592822 - 24592576
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592822 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 24592723  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24592722 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 24592623  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24592622 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 24592576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 30753502 - 30753748
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  30753502 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatgatgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 30753601  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30753602 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 30753701  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30753702 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 30753748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 6569613 - 6569859
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6569613 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 6569712  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6569713 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 6569812  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6569813 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaacagcaaca 6569859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 21969461 - 21969707
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969461 atggacaccacaagaaaaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 21969560  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21969561 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 21969660  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21969661 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 21969707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 17013760 - 17014006
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17013760 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 17013859  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17013860 tccttcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 17013959  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17013960 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 17014006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18801133 - 18800887
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18801133 atggacaccacaagaagaaagaaacagaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 18801034  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18801033 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 18800934  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18800933 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 18800887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33674321 - 33674075
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33674321 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 33674222  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33674221 tccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccattttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 33674122  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33674121 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 33674075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 14098301 - 14098547
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098301 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 14098400  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14098401 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 14098500  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14098501 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 14098547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 14664778 - 14665024
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14664778 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcc 14664877  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14664878 tccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 14664977  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14664978 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 14665024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40106146 - 40105903
Alignment:
Q  8 gacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctcc 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40106146 gacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctcc 40106047  T
Q  108 gtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgca 207  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||     
T  40106046 gtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcg 40105947  T
Q  208 attgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40105946 attgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaacaaca 40105903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31127029 - 31126783
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31127029 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31126930  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  31126929 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 31126830  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31126829 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 31126783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 39850383 - 39850629
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39850383 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 39850482  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39850483 tccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 39850582  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39850583 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 39850629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14763815 - 14763569
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14763815 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 14763716  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  14763715 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 14763616  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || || || |||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  14763615 gccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaaca 14763569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 19373021 - 19373202
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19373021 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19373120  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaa 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19373121 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaa 19373202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 54833150 - 54833364
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54833150 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 54833249  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || || ||||||    
T  54833250 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 54833349  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || ||||| ||||||    
T  54833350 gccattgctcaacag 54833364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36345023 - 36344809
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36345023 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 36344924  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  36344923 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcctaccgttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 36344824  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  36344823 gccatcgctcaacag 36344809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 1900025 - 1900221
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||    
T  1900025 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 1900124  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1900125 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 1900221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 15227638 - 15227834
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||    
T  15227638 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 15227737  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | ||||  |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15227738 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 15227834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15285431 - 15285235
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | ||||| |    
T  15285431 catcataagaagaaagaaacagaagtatggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccat 15285332  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
      |||| ||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15285331 tgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 15285235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14236036 - 14235790
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| || ||||||||||||| || ||| | || || ||||| |||||  | ||    
T  14236036 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccatggccactgttacccctattaatgctgctcagttacc 14235937  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    || | | ||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||| |||    
T  14235936 tctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaat 14235837  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||| || || ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  14235836 gccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaaca 14235790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 24112425 - 24112639
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||| |   || ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||  | ||    
T  24112425 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcc 24112524  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
     ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  24112525 cccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaat 24112624  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  24112625 gccatcgctcaacag 24112639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34189468 - 34189254
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||| |   || ||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  34189468 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgtcgctcctatcaatgctgctcagtttcc 34189369  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
     ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  34189368 cccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaat 34189269  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  34189268 gccatcgctcaacag 34189254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15391844 - 15391636
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccg-ttgctcccatcaatgcagctcaaatgc 103  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||  | |    
T  15391844 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgctggaaccagtcaatccatggctactgtttgcccccatcaatgttgctcagctac 15391745  T
Q  104 ctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaa 203  Q
    ||||| | || || ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || |   | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15391744 ctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccatcaa 15391645  T
Q  204 tgcaattgc 212  Q
    ||| |||||    
T  15391644 tgccattgc 15391636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24460988 - 24460912
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24460988 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 24460912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28116509 - 28116263
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28116509 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 28116410  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116409 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 28116310  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116309 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 28116263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4797205 - 4796959
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4797205 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 4797106  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4797105 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 4797006  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4797005 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4796959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 7996268 - 7996514
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996268 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 7996367  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7996368 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 7996467  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996468 gcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 7996514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 10642776 - 10643022
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642776 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 10642875  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10642876 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 10642975  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642976 gcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 10643022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 4721337 - 4721583
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4721337 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4721436  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721437 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 4721536  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4721537 gcaattgctcaacagataaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 4721583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 7072918 - 7073164
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7072918 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccagtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 7073017  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7073018 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 7073117  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7073118 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 7073164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11110913 - 11110667
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11110913 atggacaccacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 11110814  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11110813 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 11110714  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11110713 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 11110667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 35880472 - 35880718
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35880472 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 35880571  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35880572 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 35880671  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35880672 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 35880718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 6192022 - 6192268
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6192022 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtatggatggtgtcagttggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 6192121  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192122 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccattttatcattagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 6192221  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6192222 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 6192268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 21674399 - 21674645
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21674399 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaacccatggctaccgtggctcctatcaatgcagctcaaatgcc 21674498  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  21674499 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatccgttctttccgccattttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccatcaac 21674598  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21674599 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaacaacaaca 21674645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17985508 - 17985262
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985508 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 17985409  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  17985408 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 17985309  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17985308 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 17985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 47023159 - 47023405
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47023159 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 47023258  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  47023259 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaat 47023358  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023359 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 47023405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 18050968 - 18051214
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18050968 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 18051067  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18051068 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 18051167  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18051168 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 18051214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29665537 - 29665291
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29665537 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29665438  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29665437 tccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 29665338  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29665337 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 29665291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36997641 - 36997395
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36997641 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 36997542  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  36997541 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgtcaat 36997442  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36997441 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 36997395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 18330380 - 18330621
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330380 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 18330479  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18330480 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccaccattttatcat-----ccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 18330574  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18330575 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 18330621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20577414 - 20577168
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20577414 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 20577315  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20577314 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 20577215  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20577214 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 20577168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 28339008 - 28339254
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28339008 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 28339107  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  28339108 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 28339207  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339208 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 28339254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31965025 - 31964779
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31965025 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31964926  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  31964925 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 31964826  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964825 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 31964779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50134623 - 50134377
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50134623 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 50134524  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  50134523 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 50134424  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134423 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 50134377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 5013418 - 5013664
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013418 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 5013517  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  5013518 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 5013617  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013618 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 5013664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5609874 - 5609628
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5609874 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 5609775  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  5609774 tccgtcatacccatatatgacgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 5609675  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609674 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 5609628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6543026 - 6542780
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6543026 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 6542927  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6542926 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 6542827  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6542826 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 6542780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 24327865 - 24328111
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24327865 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 24327964  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  24327965 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 24328064  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328065 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 24328111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29149307 - 29149061
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29149307 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactattgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 29149208  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29149207 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgttaat 29149108  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29149107 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 29149061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 51781717 - 51781963
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51781717 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 51781816  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51781817 tccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 51781916  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51781917 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 51781963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 8295681 - 8295927
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8295681 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 8295780  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  8295781 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaat 8295880  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  8295881 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaattcaacaacaaca 8295927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15741634 - 15741420
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15741634 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 15741535  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15741534 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 15741435  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    ||||| || ||||||    
T  15741434 gcaatcgctcaacag 15741420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 48465621 - 48465867
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48465621 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 48465720  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48465721 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccccgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 48465820  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48465821 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 48465867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 51796814 - 51797052
Alignment:
Q  13 cacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51796814 cacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 51796913  T
Q  113 accaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 212  Q
    ||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51796914 acccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 51797013  T
Q  213 ccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51797014 ccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 51797052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 4416622 - 4416868
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4416622 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 4416721  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4416722 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagcaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 4416821  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4416822 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4416868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 18224897 - 18225143
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18224897 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 18224996  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  18224997 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 18225096  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225097 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 18225143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 18242433 - 18242679
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18242433 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 18242532  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| || |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  18242533 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtactctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 18242632  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18242633 gcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 18242679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22871426 - 22871180
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22871426 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcc 22871327  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  22871326 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaat 22871227  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22871226 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 22871180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22886485 - 22886239
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22886485 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcc 22886386  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  22886385 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaat 22886286  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22886285 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 22886239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15893256 - 15893012
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  15893256 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctc 15893157  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15893156 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 15893057  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15893056 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 15893012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 10395842 - 10396085
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10395842 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 10395941  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  10395942 tccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 10396041  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || || || |||||| |   ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10396042 gccatcgctcaacaggt---acaacagttgccagttcaacaacaaca 10396085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8301816 - 8301570
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  8301816 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtatggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctattgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcc 8301717  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8301716 tccgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 8301617  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8301616 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 8301570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 20065752 - 20065966
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20065752 atggacatcacaagaagaaagatacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 20065851  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  20065852 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 20065951  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  20065952 gccatcgctcaacag 20065966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18277604 - 18277358
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18277604 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 18277505  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  18277504 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 18277405  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || || || |||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  18277404 gccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaaca 18277358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18292905 - 18292659
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18292905 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 18292806  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  18292805 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 18292706  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || || || |||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  18292705 gccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaaca 18292659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18308206 - 18307960
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18308206 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 18308107  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  18308106 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 18308007  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || || || |||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  18308006 gccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaaca 18307960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 8211447 - 8211661
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8211447 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 8211546  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  8211547 tccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 8211646  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  8211647 gccatcgctcaacag 8211661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5596918 - 5596717
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5596918 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 5596819  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  5596818 tccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaat 5596719  T
Q  205 gc 206  Q
    ||    
T  5596718 gc 5596717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 5466691 - 5466905
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5466691 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 5466790  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  5466791 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaat 5466890  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  5466891 gccatcgctcaacag 5466905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 28020986 - 28021198
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  28020986 ggacaccacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatccatggctactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctc 28021085  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  28021086 cgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgc 28021185  T
Q  207 aattgcccaacag 219  Q
     || || ||||||    
T  28021186 catcgctcaacag 28021198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4347236 - 4347022
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4347236 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaacgcagcccaaatgcc 4347137  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  4347136 tccgtcatacccatgtatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaat 4347037  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  4347036 gccatcgctcaacag 4347022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 251
Target Start/End: Original strand, 5713058 - 5713179
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5713058 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5713157  T
Q  230 agatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  5713158 agttgccggttcaacaacaaca 5713179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 251
Target Start/End: Original strand, 5723968 - 5724089
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5723968 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5724067  T
Q  230 agatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  5724068 agttgccggttcaacaacaaca 5724089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5757509 - 5757388
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5757509 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5757410  T
Q  230 agatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  5757409 agttgccggttcaacaacaaca 5757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5768400 - 5768279
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5768400 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5768301  T
Q  230 agatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  5768300 agttgccggttcaacaacaaca 5768279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16627049 - 16626854
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||    
T  16627049 catcataagaagaag-aaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16626951  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | ||||  ||||  |  || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  16626950 cgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgc 16626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 18530108 - 18530304
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||| | || || ||||| || ||  | ||||| |    
T  18530108 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggaactagtcaatccatggctactgttacccctattaatgctgcccagttacctccat 18530207  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | ||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18530208 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgc 18530304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 4892919 - 4893133
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||| |   || ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||    
T  4892919 atggacatcacaaaaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcc 4893018  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
     ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  4893019 cccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaat 4893118  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  4893119 gccatcgctcaacag 4893133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22388127 - 22387913
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||| |   || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||    
T  22388127 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccatggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcc 22388028  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
     ||||| ||||  ||||  || || ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  22388027 cccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaat 22387928  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  22387927 gccatcgctcaacag 22387913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 32438863 - 32439077
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||| |   || ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||  | ||    
T  32438863 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcc 32438962  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
     ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  32438963 cccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaat 32439062  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  32439063 gccatcgctcaacag 32439077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17994208 - 17994132
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17994208 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 17994132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 4625778 - 4625853
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4625778 tctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatg 4625853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 5652221 - 5652297
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | | ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5652221 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 5652297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16736857 - 16736611
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16736857 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtc 16736758  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16736757 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 16736658  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736657 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 16736611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16751911 - 16751665
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16751911 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtc 16751812  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16751811 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 16751712  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751711 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 16751665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 17523278 - 17523524
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17523278 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtc 17523377  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17523378 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 17523477  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523478 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 17523524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17529937 - 17529691
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17529937 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtc 17529838  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17529837 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 17529738  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529737 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 17529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 5127738 - 5127984
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5127738 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 5127837  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5127838 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 5127937  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5127938 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 5127984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 45387089 - 45387335
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45387089 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 45387188  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45387189 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 45387288  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387289 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 45387335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 11441306 - 11441552
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441306 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 11441405  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11441406 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 11441505  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11441506 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 11441552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 2154319 - 2154565
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2154319 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 2154418  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2154419 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaat 2154518  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2154519 gcaattgctcaacagataaaacaacagttgctggttcaacaacaaca 2154565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5147737 - 5147491
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5147737 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccattgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 5147638  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147637 tccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 5147538  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5147537 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccgattcaacaacaaca 5147491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11425173 - 11424927
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  11425173 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgtagcccaaatgcc 11425074  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11425073 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 11424974  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11424973 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 11424927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10917262 - 10917016
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10917262 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 10917163  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  10917162 ttcgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaat 10917063  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10917062 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 10917016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24592938 - 24592692
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592938 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 24592839  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  24592838 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 24592739  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592738 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 24592692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26275491 - 26275245
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26275491 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26275392  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  26275391 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 26275292  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275291 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 26275245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 26435003 - 26435249
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26435003 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcaggagccggtcagtccatggccactgttgctcctatcagtgcagctcaaatgcc 26435102  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435103 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 26435202  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26435203 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaacaacaaca 26435249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31564796 - 31564550
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31564796 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31564697  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  31564696 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 31564597  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31564596 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 31564550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26320266 - 26320020
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26320266 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26320167  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  26320166 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 26320067  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26320066 gcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaaca 26320020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26486141 - 26485895
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26486141 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26486042  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26486041 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 26485942  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26485941 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 26485895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26538270 - 26538024
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26538270 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26538171  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26538170 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 26538071  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26538070 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 26538024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26670311 - 26670065
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26670311 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26670212  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  26670211 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 26670112  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670111 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 26670065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 31124657 - 31124903
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31124657 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31124756  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  31124757 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcaaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 31124856  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31124857 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 31124903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 3445040 - 3445286
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3445040 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 3445139  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3445140 tccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 3445239  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3445240 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 3445286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 9618397 - 9618643
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9618397 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 9618496  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  9618497 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 9618596  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618597 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 9618643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16503775 - 16503531
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  16503775 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 16503676  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16503675 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16503576  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16503575 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca 16503531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16518811 - 16518567
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  16518811 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 16518712  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16518711 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16518612  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16518611 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca 16518567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4145520 - 4145274
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4145520 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4145421  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  4145420 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 4145321  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || || || |||||| |  |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4145320 gccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaacaaca 4145274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 16041077 - 16041267
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||    
T  16041077 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16041176  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 200  Q
    | |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  16041177 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgt 16041267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16450387 - 16450199
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||    
T  16450387 catcataagaagaaagaaacaaaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatagctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16450288  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtaccc 198  Q
    | ||||  || | || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16450287 cgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaccc 16450199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 5159268 - 5159482
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||| |   || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||    
T  5159268 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccatggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcc 5159367  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
     ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  5159368 cccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaat 5159467  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  5159468 gccatcgctcaacag 5159482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31088733 - 31088657
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31088733 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 31088657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 45733334 - 45733410
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45733334 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 45733410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 62
Target Start/End: Original strand, 22143423 - 22143458
Alignment:
Q  27 aacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtca 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143423 aacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtca 22143458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11635689 - 11635443
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11635689 atggacaccacaagaagaaagaagcggaagtggggatggtgtcagcaggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 11635590  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11635589 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 11635490  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11635489 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 11635443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11641878 - 11641632
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11641878 atggacaccacaagaagaaagaagcggaagtggggatggtgtcagcaggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 11641779  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641778 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 11641679  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641678 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 11641632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13937044 - 13936798
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13937044 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 13936945  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13936944 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 13936845  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13936844 gcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca 13936798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 32049539 - 32049785
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049539 atggacaccacaagaaaaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 32049638  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32049639 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 32049738  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049739 gcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 32049785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 34279190 - 34279436
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34279190 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 34279289  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34279290 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 34279389  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34279390 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 34279436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21677682 - 21677436
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21677682 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 21677583  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21677582 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 21677483  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677482 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 21677436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 28881955 - 28882201
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28881955 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 28882054  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28882055 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 28882154  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28882155 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 28882201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23129064 - 23128820
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23129064 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctc 23128965  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23128964 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 23128865  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23128864 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 23128820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12717105 - 12716859
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12717105 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 12717006  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  12717005 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaac 12716906  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12716905 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 12716859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 37925234 - 37925480
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37925234 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37925333  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37925334 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 37925433  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925434 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 37925480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 261265 - 261019
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  261265 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 261166  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  261165 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 261066  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  261065 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 261019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 34286095 - 34286341
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34286095 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaggtggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcc 34286194  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34286195 tccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaat 34286294  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286295 gcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 34286341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 34291155 - 34291401
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34291155 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaggtggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcc 34291254  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34291255 tccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaat 34291354  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291355 gcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 34291401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 40233240 - 40233486
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40233240 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 40233339  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40233340 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 40233439  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40233440 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 40233486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16829838 - 16829592
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16829838 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcc 16829739  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16829738 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 16829639  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16829638 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16829592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 16891643 - 16891889
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16891643 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcc 16891742  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16891743 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 16891842  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16891843 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16891889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22926528 - 22926282
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22926528 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 22926429  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  22926428 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 22926329  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926328 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 22926282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 12586542 - 12586788
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12586542 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 12586641  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12586642 tccgtcatatccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 12586741  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12586742 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 12586788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 27803433 - 27803679
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27803433 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 27803532  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27803533 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 27803632  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27803633 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27803679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 31876022 - 31876268
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31876022 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31876121  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  31876122 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 31876221  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876222 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 31876268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 34861421 - 34861667
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34861421 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 34861520  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  34861521 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 34861620  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861621 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 34861667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37686409 - 37686163
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37686409 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37686310  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  37686309 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 37686210  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686209 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 37686163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37701674 - 37701428
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37701674 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37701575  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  37701574 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 37701475  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701474 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 37701428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 39889803 - 39890049
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39889803 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 39889902  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  39889903 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacagggccagcctcaagtgcccgtcaat 39890002  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39890003 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 39890049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9350494 - 9350248
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9350494 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 9350395  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9350394 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgctaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 9350295  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9350294 gcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca 9350248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 12655283 - 12655529
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12655283 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtaggaatggtgtcagtcggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 12655382  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12655383 tccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 12655482  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12655483 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 12655529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19416999 - 19416753
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19416999 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcc 19416900  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  19416899 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 19416800  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416799 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 19416753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 27776948 - 27777194
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27776948 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 27777047  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27777048 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaat 27777147  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27777148 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27777194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 27816715 - 27816961
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27816715 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 27816814  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27816815 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaat 27816914  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27816915 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27816961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 20837659 - 20837905
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||     
T  20837659 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtaggaatggtgtcagtcggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgca 20837758  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20837759 tccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 20837858  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20837859 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 20837905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39052328 - 39052082
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39052328 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagcaaccgttgctcctaccaatgcagctcaaatgcc 39052229  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39052228 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaac 39052129  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39052128 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 39052082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27434942 - 27434698
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  27434942 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 27434843  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27434842 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 27434743  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27434742 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27434698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Original strand, 37374902 - 37375102
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  37374902 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaacgcaactcaaatgcc 37375001  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  37375002 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccgccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 37375101  T
Q  205 g 205  Q
    |    
T  37375102 g 37375102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21703656 - 21703415
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |  | |||||||    
T  21703656 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgt 21703557  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaat 209  Q
    | |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |    
T  21703556 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 21703457  T
Q  210 tgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
     |  ||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||    
T  21703456 cgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaaca 21703415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19456913 - 19456717
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||    
T  19456913 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 19456814  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | |||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19456813 cgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 19456717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 27392734 - 27392960
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| || |||||||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | ||    
T  27392734 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatctgtggctactgttgcccccatcgatgctgctcagctacc 27392833  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||  | ||||| ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27392834 tccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaat 27392933  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacag 231  Q
    || ||||| || || ||| ||||||||    
T  27392934 gccattgctcagcaaatgcaacaacag 27392960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31891746 - 31891624
Alignment:
Q  84 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggt 183  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||     
T  31891746 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcggga 31891647  T
Q  184 caacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  31891646 caacctcaggtacccgttaatgc 31891624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 3784523 - 3784599
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3784523 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 3784599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 27118557 - 27118633
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27118557 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 27118633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 34156880 - 34156956
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34156880 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 34156956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34303675 - 34303600
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34303675 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatg 34303600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 16163468 - 16163544
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16163468 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16163544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 26918122 - 26918368
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918122 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26918221  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918222 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 26918321  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26918322 gcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 26918368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 26999815 - 27000061
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26999815 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 26999914  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26999915 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 27000014  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27000015 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27000061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 16749596 - 16749842
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  16749596 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaacgcagctcaaatgtc 16749695  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16749696 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 16749795  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16749796 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16749842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 26988743 - 26988986
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26988743 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 26988842  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26988843 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 26988942  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaaca 248  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26988943 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaaca 26988986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 3695805 - 3696051
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3695805 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 3695904  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3695905 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 3696004  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3696005 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 3696051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15424771 - 15424525
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15424771 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 15424672  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15424671 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 15424572  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15424571 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttgaacaacaaca 15424525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30558470 - 30558224
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30558470 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 30558371  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  30558370 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 30558271  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30558270 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 30558224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13299405 - 13299159
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13299405 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 13299306  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13299305 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 13299206  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13299205 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 13299159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24305072 - 24304826
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  24305072 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgctgcccaaatgcc 24304973  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24304972 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 24304873  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  24304872 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagtttccagttcaacaacaaca 24304826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 27007454 - 27007700
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27007454 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 27007553  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27007554 tccgtcatacctatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 27007653  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27007654 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27007700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27360464 - 27360218
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27360464 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 27360365  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27360364 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 27360265  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27360264 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27360218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27450807 - 27450561
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27450807 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 27450708  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27450707 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 27450608  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27450607 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27450561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 29572755 - 29573001
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29572755 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29572854  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  29572855 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 29572954  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29572955 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 29573001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34463815 - 34463569
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34463815 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 34463716  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463715 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 34463616  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34463615 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 34463569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4546238 - 4545992
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4546238 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4546139  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4546138 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 4546039  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4546038 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4545992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4724597 - 4724351
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4724597 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4724498  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4724497 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 4724398  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4724397 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4724351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 4772739 - 4772985
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4772739 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4772838  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4772839 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 4772938  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4772939 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4772985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 24863459 - 24863705
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24863459 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 24863558  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  24863559 tccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaat 24863658  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24863659 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 24863705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 27484859 - 27485105
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27484859 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 27484958  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  27484959 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 27485058  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27485059 gcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27485105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 28207184 - 28207430
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28207184 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 28207283  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  28207284 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 28207383  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28207384 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 28207430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 16673869 - 16674115
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16673869 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 16673968  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16673969 tccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 16674068  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16674069 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16674115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16944481 - 16944235
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16944481 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 16944382  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  16944381 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 16944282  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16944281 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacagcaaca 16944235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 4757503 - 4757749
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4757503 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatcaatggctactgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4757602  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4757603 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 4757702  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4757703 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4757749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 17025004 - 17025250
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17025004 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 17025103  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  17025104 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 17025203  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17025204 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 17025250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26116873 - 26116627
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26116873 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatagctaccgttgctcctatcaatacagctcaaatgcc 26116774  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  26116773 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcattcgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 26116674  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26116673 gcaattgcccaacagataaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 26116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26778081 - 26777835
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  26778081 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgcacctatcaatacagcccaaatgcc 26777982  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  26777981 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 26777882  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26777881 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 26777835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22935329 - 22935085
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22935329 ggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagccggggccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctc 22935230  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22935229 cgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 22935130  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22935129 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 22935085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23857774 - 23857530
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23857774 ggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagccggggccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctc 23857675  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23857674 cgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23857575  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23857574 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 23857530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 29549220 - 29549463
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29549220 atggacatcacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29549319  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  29549320 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 29549419  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaaca 248  Q
    || || || |||||| || |||| ||   ||| |||||||||||    
T  29549420 gccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacaaca 29549463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 27044132 - 27044346
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27044132 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 27044231  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  27044232 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 27044331  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  27044332 gccatcgctcaacag 27044346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 29501148 - 29501349
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29501148 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29501247  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  29501248 tccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaat 29501347  T
Q  205 gc 206  Q
    ||    
T  29501348 gc 29501349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 4525031 - 4525245
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4525031 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 4525130  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  4525131 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaat 4525230  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  4525231 gccatcgctcaacag 4525245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22477673 - 22477482
Alignment:
Q  59 gtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccatttta 158  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||| ||| ||||  |||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22477673 gtcaatccatggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattcta 22477574  T
Q  159 tcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 250  Q
    |||| | || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  22477573 tcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaac 22477482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Original strand, 20160454 - 20160653
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||  ||||| | |||||      
T  20160454 catcataagaagaaggaaacagaagtagggatggaatttgctg---ccggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccac 20160550  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaat 209  Q
    ||||||  | ||  |  || ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20160551 catacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 20160650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22172377 - 22172178
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||  ||||| | |||||      
T  22172377 catcataagaagaaggaaacagaagtagggatggaatttgctg---ccggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccac 22172281  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaat 209  Q
    ||||||  | ||  |  || ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22172280 catacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 22172181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13522399 - 13522323
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13522399 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13522323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 28162527 - 28162603
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  28162527 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgc 28162603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33374582 - 33374506
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33374582 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33374506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8892636 - 8892560
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8892636 tctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8892560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8903871 - 8903795
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8903871 tctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8903795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27630041 - 27629948
Alignment:
Q  127 tattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacaga 220  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  27630041 tattctcagcatccattcttcccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacaga 27629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 641 - 395
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  641 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaactggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 542  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  541 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 442  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  441 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 33777241 - 33777487
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777241 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 33777340  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33777341 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 33777440  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33777441 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 33777487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 41674463 - 41674709
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  41674463 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcc 41674562  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41674563 tccgtcatacccatatgtgccgtatgctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaat 41674662  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41674663 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 41674709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9548951 - 9548705
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9548951 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcc 9548852  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548851 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 9548752  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9548751 gcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccgattcaacaacaaca 9548705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23718396 - 23718150
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23718396 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 23718297  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23718296 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 23718197  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23718196 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 23718150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23752858 - 23752612
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23752858 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 23752759  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23752758 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 23752659  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23752658 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 23752612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8665883 - 8665637
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8665883 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 8665784  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8665783 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 8665684  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665683 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 8665637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15659168 - 15658922
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15659168 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 15659069  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15659068 tccgtcatatccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccgttttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 15658969  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15658968 gcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 15658922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 11549108 - 11549354
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11549108 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 11549207  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11549208 tccgtcatacccatatgtgccgtattcacagcatcctttctttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 11549307  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11549308 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 11549354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18501156 - 18500910
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18501156 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 18501057  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18501056 tccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 18500957  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18500956 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 18500910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22999522 - 22999276
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22999522 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 22999423  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22999422 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaat 22999323  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22999322 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 22999276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 24681191 - 24681437
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24681191 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 24681290  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  24681291 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaac 24681390  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24681391 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 24681437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 24723718 - 24723964
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24723718 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 24723817  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  24723818 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaac 24723917  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24723918 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 24723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 31431182 - 31431428
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31431182 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31431281  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431282 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 31431381  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31431382 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 31431428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37359063 - 37358817
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37359063 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37358964  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  37358963 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 37358864  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37358863 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 37358817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 5637664 - 5637910
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5637664 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 5637763  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  5637764 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 5637863  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637864 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 5637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 9317205 - 9317451
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9317205 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 9317304  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  9317305 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 9317404  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317405 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 9317451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 30168223 - 30168469
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168223 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctactattgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 30168322  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30168323 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 30168422  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30168423 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 30168469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 33516110 - 33516356
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33516110 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcggctcaaatgcc 33516209  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  33516210 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 33516309  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33516310 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 33516356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37671900 - 37671654
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37671900 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37671801  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  37671800 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 37671701  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37671700 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 37671654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 3789280 - 3789526
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3789280 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 3789379  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  3789380 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaat 3789479  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3789480 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 3789526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 12131909 - 12132155
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12131909 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 12132008  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  12132009 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 12132108  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12132109 gcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaaca 12132155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13325252 - 13325006
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13325252 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagctggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 13325153  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  13325152 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 13325053  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13325052 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 13325006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18375820 - 18375574
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375820 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 18375721  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18375720 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 18375621  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18375620 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 18375574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24688565 - 24688319
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24688565 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 24688466  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24688465 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 24688366  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24688365 acaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 24688319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 26480146 - 26480392
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26480146 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26480245  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  26480246 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 26480345  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480346 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 26480392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 30151772 - 30152018
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30151772 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 30151871  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  30151872 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 30151971  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30151972 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 30152018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31826827 - 31826581
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31826827 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31826728  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  31826727 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 31826628  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31826627 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 31826581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 43078003 - 43078249
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43078003 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcaactggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 43078102  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43078103 tccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 43078202  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43078203 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 43078249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 2510805 - 2511051
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2510805 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 2510904  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  2510905 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgtccgtcaat 2511004  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511005 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 2511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 6874056 - 6874302
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6874056 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 6874155  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6874156 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 6874255  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6874256 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 6874302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 28648980 - 28649226
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||    
T  28648980 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgcaactatcaatacagctcaaatgcc 28649079  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  28649080 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 28649179  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28649180 gcaattgcccaacagatgaaacaacagtttccggttcaacaacaaca 28649226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29967474 - 29967228
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29967474 atggacaccacaaaaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29967375  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  29967374 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 29967275  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967274 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 29967228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 30029169 - 30029415
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30029169 atggacaccacaaaaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 30029268  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  30029269 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 30029368  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029369 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 30029415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 30934390 - 30934636
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30934390 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctaccggagccggccaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 30934489  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30934490 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 30934589  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30934590 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 30934636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15759265 - 15759019
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15759265 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagcaggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 15759166  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  15759165 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 15759066  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15759065 gcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 15759019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 37754722 - 37754968
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37754722 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 37754821  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  37754822 tccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 37754921  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37754922 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 37754968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37771407 - 37771161
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37771407 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 37771308  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  37771307 tccgtcgtatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 37771208  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37771207 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 37771161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28960206 - 28959960
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  28960206 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaacggctactgttgcacctatcaatgtagcccaaatgcc 28960107  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  28960106 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacagggccagcctcaagtgcccgtcaat 28960007  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28960006 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 28959960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40473960 - 40473714
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40473960 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcc 40473861  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||     
T  40473860 tccgtcatacccacacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaac 40473761  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40473760 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 40473714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32599877 - 32599676
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32599877 atggacaccacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 32599778  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  32599777 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaat 32599678  T
Q  205 gc 206  Q
    ||    
T  32599677 gc 32599676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 34616275 - 34616489
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34616275 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagcccaaatgcc 34616374  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| || || ||||||    
T  34616375 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggctaacctcaggttcctgtcaat 34616474  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  34616475 gccatcgctcaacag 34616489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 251
Target Start/End: Original strand, 24969870 - 24970024
Alignment:
Q  97 caaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtac 196  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  24969870 caaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtac 24969969  T
Q  197 ccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24969970 ccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca 24970024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Original strand, 23891962 - 23892206
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  23891962 ggacatcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccgatcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 23892061  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23892062 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23892161  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
     || |  || || ||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  23892162 catcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaaca 23892206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 25198788 - 25198977
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  | ||| ||||||    
T  25198788 ggacatcataagaagaaggaaacagaagtagggatggtatccgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgcttcccaattgcctc 25198887  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtac 196  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  25198888 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtac 25198977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 24951866 - 24951951
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgc 92  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24951866 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgc 24951951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 33292282 - 33292496
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||| |   || ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||    
T  33292282 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcc 33292381  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
     ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  33292382 cccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaat 33292481  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  33292482 gccatcgctcaacag 33292496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 206
Target Start/End: Original strand, 22888287 - 22888428
Alignment:
Q  65 ccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatca 164  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22888287 ccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatca 22888386  T
Q  165 ataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
     || ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  22888387 gtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgc 22888428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13184928 - 13184852
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13184928 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13184852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13440774 - 13440698
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13440774 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13440698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 33877129 - 33877205
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33877129 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33877205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 11325676 - 11325752
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  11325676 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaacctcaggtacccgttaatgc 11325752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41793819 - 41793573
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41793819 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 41793720  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41793719 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 41793620  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793619 gcaattgctccacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 41793573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 10962414 - 10962660
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10962414 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 10962513  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  10962514 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 10962613  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962614 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 10962660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 51637962 - 51638208
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51637962 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 51638061  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  51638062 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccagcctcaagtgcccgtcaat 51638161  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638162 gcaattgcccaacagataaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 51638208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 28584725 - 28584971
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28584725 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 28584824  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  28584825 tccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 28584924  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28584925 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 28584971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 20460857 - 20461053
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||| || ||  | ||||||     
T  20460857 catcataagaagaaagaaatagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgc 20460956  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | ||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20460957 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20461053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20340718 - 20340642
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20340718 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 20340642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16208531 - 16208290
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | ||||||     
T  16208531 catcataagaagaaagaaacagaagtagagatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgc 16208432  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaat 209  Q
    | || || ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||    
T  16208431 cgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccat 16208332  T
Q  210 tgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
     |  || || ||| ||||||||   || ||||||||||||||    
T  16208331 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaaca 16208290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 27037 - 27283
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27037 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 27136  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27137 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 27236  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27237 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 27283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 30198 - 30444
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30198 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 30297  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30298 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 30397  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30398 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 30444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 20162 - 20358
Alignment:
Q  10 catcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgt 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||    
T  20162 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 20261  T
Q  110 cataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20262 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9577 - 9331
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9577 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 9478  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  9477 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 9378  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 9331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 19807 - 20006
Alignment:
Q  52 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  19807 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 19906  T
Q  152 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 20006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7750 - 7504
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7750 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 7651  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  7650 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 7551  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7550 gcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaaca 7504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15441 - 15195
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 15342  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  15341 tccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 15242  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15241 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 15195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47496 - 47250
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  47496 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaacccatggctactgttgctcttatcaatgcagcccaaatgcc 47397  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47396 tccatcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 47297  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47296 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaaca 47250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40578 - 40334
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40578 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctc 40479  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    || | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40478 cgccgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgc 40379  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40378 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 40334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Original strand, 29510 - 29754
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  29510 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 29609  T
Q  107 cgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    | || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29610 catcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 29709  T
Q  207 aattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29710 aatagctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 29754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 7682 - 7928
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7682 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 7781  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7782 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 7881  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7882 gcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 7928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26713 - 26467
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26713 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26614  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  26613 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtacccgttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaat 26514  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26513 gcaattgcccaacagaggaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 26467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 5734 - 5982
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcca-tggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgc 103  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5734 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggg-atggtgtcagctggagccggtcaatcaaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgc 5832  T
Q  104 ctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc-attttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtca 202  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5833 ctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgtttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtca 5932  T
Q  203 atgcaa-ttgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5933 atgcaatttgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 5982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 204 - 1
Alignment:
Q  45 gtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttc 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  204 gtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttc 105  T
Q  145 tttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 244  Q
    || || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  104 ttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 5  T
Q  245 aaca 248  Q
    ||||    
T  4 aaca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 7977 - 8191
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7977 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 8076  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  8077 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaat 8176  T
Q  205 gcaattgcccaacag 219  Q
    || || || ||||||    
T  8177 gccatcgctcaacag 8191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 21312 - 21538
Alignment:
Q  5 atggacatcacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 104  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||  | ||    
T  21312 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccgtggctactgttgcccccatcaatgcttctcagctacc 21411  T
Q  105 tccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 204  Q
    |||| | ||||| ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21412 tccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaat 21511  T
Q  205 gcaattgcccaacagatgaaacaacag 231  Q
    || ||||| || || ||| ||||||||    
T  21512 gccattgctcagcaaatgcaacaacag 21538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3041 - 2965
Alignment:
Q  130 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3041 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47221 - 47078
Alignment:
Q  117 atatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg--ccattt-tatcatcaata-ccctctgccacc-gggtc-aacctcaagtacccgtcaatgcaatt 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||| || |||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  47221 atatgcgccgtattctcagcatccttcttttccgtcccacttctatcatcagtatcccttcgccacccgggtcgaacctcaggtacccgttaatgcaatt 47122  T
Q  211 -gcccaa-cagatgaaacaacagatgccggttc-aacaacaaca 251  Q
     || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47121 tgctcaaacagatgaaacaacagctgccggttcaaacaacaaca 47078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 48662 - 48572
Alignment:
Q  7 ggacatcacaagaagaaggaaacggaagt-ggggatggtgtc-agctggagccgg--tcaatccatggctacc-gttgctcccatcaatgc 92  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48662 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtaggggatggtgtcttgccggagccgggtccaatccatggctacctgttgctcctatcaatgc 48572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1736 times since January 2019
Visitors: 1304