View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0063_1D_low_17 (Length: 239)

Name: NF0063_1D_low_17
Description: NF0063_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0063_1D_low_17
NF0063_1D_low_17
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-225)||(19286576-19286800)
chr8 (1-225)||(12092601-12092825)
chr8 (1-225)||(29829436-29829660)
chr8 (1-225)||(31489627-31489851)
chr8 (1-225)||(3329384-3329608)
chr8 (1-225)||(31354638-31354862)
chr8 (1-225)||(19208237-19208461)
chr8 (1-225)||(19674555-19674779)
chr8 (1-225)||(27608782-27609006)
chr8 (1-225)||(28361832-28362056)
chr8 (1-225)||(14557738-14557962)
chr8 (1-225)||(16277668-16277892)
chr8 (1-225)||(19688212-19688436)
chr8 (1-225)||(33258837-33259061)
chr8 (1-225)||(2137136-2137360)
chr8 (1-225)||(16283563-16283787)
chr8 (1-225)||(18710700-18710924)
chr8 (49-225)||(189256-189432)
chr8 (24-225)||(9354759-9354961)
chr8 (1-193)||(22080787-22080979)
chr8 (24-216)||(19658926-19659117)
chr8 (24-211)||(44563238-44563423)
chr8 (24-210)||(33244802-33244988)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-225)||(26435372-26435596)
chr7 (1-225)||(5147144-5147368)
chr7 (1-225)||(31564194-31564418)
chr7 (1-225)||(4144927-4145151)
chr7 (1-225)||(26537674-26537898)
chr7 (1-227)||(5128107-5128333)
chr7 (1-225)||(24592345-24592569)
chr7 (1-225)||(26319673-26319897)
chr7 (1-225)||(31125035-31125259)
chr7 (1-225)||(9618766-9618990)
chr7 (1-225)||(11424580-11424804)
chr7 (1-225)||(11441687-11441911)
chr7 (1-225)||(26274898-26275122)
chr7 (1-225)||(26669718-26669942)
chr7 (1-225)||(45387458-45387682)
chr7 (3-225)||(16736264-16736486)
chr7 (3-225)||(16751318-16751540)
chr7 (3-225)||(17523649-17523871)
chr7 (3-225)||(17529344-17529566)
chr7 (1-225)||(2154688-2154912)
chr7 (1-225)||(10916672-10916896)
chr7 (1-225)||(3445421-3445645)
chr7 (1-224)||(16503185-16503408)
chr7 (1-224)||(16518221-16518444)
chr7 (3-225)||(26484811-26485033)
chr7 (3-211)||(2108823-2109031)
chr7 (3-225)||(2775476-2775698)
chr7 (3-225)||(39210827-39211049)
chr7 (1-217)||(16449810-16450026)
chr7 (1-223)||(16041438-16041660)
chr7 (24-225)||(4200685-4200886)
chr7 (3-190)||(18540916-18541103)
chr7 (24-225)||(26682804-26683005)
chr7 (3-187)||(5159636-5159820)
chr7 (24-211)||(31088282-31088469)
chr7 (24-211)||(45733598-45733785)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-225)||(29549586-29549810)
chr6 (1-225)||(4723995-4724219)
chr6 (1-225)||(4773117-4773341)
chr6 (1-225)||(16674250-16674474)
chr6 (1-225)||(29501526-29501750)
chr6 (1-225)||(34463207-34463431)
chr6 (1-225)||(27044498-27044723)
chr6 (1-225)||(4545636-4545860)
chr6 (1-226)||(27359852-27360077)
chr6 (1-226)||(27450195-27450420)
chr6 (1-225)||(3696192-3696416)
chr6 (1-225)||(4757875-4758099)
chr6 (1-225)||(26116271-26116495)
chr6 (1-225)||(27007838-27008062)
chr6 (1-225)||(28207565-28207789)
chr6 (1-225)||(29573124-29573348)
chr6 (1-222)||(16749965-16750186)
chr6 (1-226)||(26777475-26777700)
chr6 (1-225)||(27485240-27485464)
chr6 (3-225)||(17025390-17025612)
chr6 (1-225)||(4525397-4525621)
chr6 (1-225)||(24304479-24304703)
chr6 (1-225)||(24863828-24864052)
chr6 (1-225)||(26918491-26918715)
chr6 (1-225)||(30557877-30558101)
chr6 (1-225)||(26989112-26989336)
chr6 (1-219)||(27000184-27000402)
chr6 (1-225)||(15424178-15424402)
chr6 (1-225)||(13298812-13299036)
chr6 (1-225)||(16943888-16944112)
chr6 (1-225)||(22934741-22934965)
chr6 (1-225)||(23857186-23857410)
chr6 (2-225)||(27272441-27272664)
chr6 (3-220)||(20160814-20161031)
chr6 (3-220)||(22171800-22172017)
chr6 (3-225)||(14143146-14143368)
chr6 (3-225)||(26788057-26788279)
chr6 (3-225)||(27196430-27196652)
chr6 (3-225)||(27252588-27252810)
chr6 (18-225)||(27290231-27290438)
chr6 (1-225)||(22456795-22457019)
chr6 (24-220)||(13521939-13522135)
chr6 (24-211)||(33374131-33374318)
chr6 (24-211)||(8892186-8892372)
chr6 (24-211)||(8903421-8903607)
chr6 (1-119)||(22477240-22477358)
chr6 (24-211)||(28162791-28162978)
chr6 (96-225)||(17092301-17092430)
chr6 (19-133)||(27629653-27629767)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-225)||(15658575-15658799)
chr5 (1-225)||(28649358-28649582)
chr5 (1-225)||(3789664-3789888)
chr5 (1-225)||(9548358-9548582)
chr5 (1-225)||(8665290-8665514)
chr5 (1-217)||(18500553-18500769)
chr5 (1-225)||(23752265-23752489)
chr5 (1-225)||(30152141-30152365)
chr5 (1-225)||(34616641-34616865)
chr5 (1-225)||(37671298-37671522)
chr5 (1-225)||(43078375-43078599)
chr5 (3-225)||(13324644-13324866)
chr5 (1-225)||(9317574-9317798)
chr5 (1-225)||(12132278-12132502)
chr5 (1-225)||(15758672-15758896)
chr5 (1-225)||(31431563-31431787)
chr5 (1-225)||(37358458-37358682)
chr5 (1-225)||(37755103-37755327)
chr5 (3-225)||(40473364-40473586)
chr5 (1-226)||(28959600-28959825)
chr5 (1-225)||(2511174-2511398)
chr5 (1-225)||(6874428-6874652)
chr5 (1-225)||(23717803-23718027)
chr5 (1-225)||(37770802-37771026)
chr5 (3-225)||(24681565-24681787)
chr5 (3-225)||(24724092-24724314)
chr5 (1-225)||(22998929-22999153)
chr5 (1-225)||(26480515-26480739)
chr5 (1-225)||(33516479-33516703)
chr5 (1-226)||(32599286-32599511)
chr5 (1-225)||(11549477-11549701)
chr5 (1-225)||(18375227-18375451)
chr5 (1-225)||(31826222-31826446)
chr5 (1-225)||(5638033-5638257)
chr5 (1-225)||(24687972-24688196)
chr5 (1-225)||(33777610-33777834)
chr5 (1-225)||(29966881-29967105)
chr5 (1-225)||(30029538-30029762)
chr5 (1-225)||(30168592-30168816)
chr5 (1-225)||(30934756-30934980)
chr5 (1-225)||(24970141-24970365)
chr5 (1-225)||(29888897-29889121)
chr5 (1-225)||(23892329-23892553)
chr5 (1-190)||(41674832-41675021)
chr5 (1-223)||(22888593-22888815)
chr5 (3-223)||(25199154-25199374)
chr5 (24-220)||(33877393-33877589)
chr5 (24-211)||(11325940-11326127)
chr5 (3-190)||(33292650-33292837)
chr5 (24-211)||(13184477-13184664)
chr5 (24-211)||(13440323-13440510)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-225)||(6569982-6570206)
chr4 (1-225)||(54833516-54833740)
chr4 (1-225)||(18800531-18800755)
chr4 (1-225)||(30753883-30754107)
chr4 (1-225)||(14763222-14763446)
chr4 (1-225)||(27163235-27163459)
chr4 (1-225)||(33673716-33673940)
chr4 (1-225)||(36344433-36344657)
chr4 (1-225)||(40105556-40105780)
chr4 (1-225)||(5006002-5006226)
chr4 (1-225)||(31126436-31126660)
chr4 (3-225)||(39850769-39850991)
chr4 (1-225)||(14098670-14098894)
chr4 (3-225)||(21969832-21970054)
chr4 (1-225)||(14665147-14665371)
chr4 (1-225)||(24592232-24592456)
chr4 (1-225)||(17014129-17014353)
chr4 (1-220)||(15284851-15285070)
chr4 (18-223)||(1900403-1900608)
chr4 (3-190)||(34188913-34189100)
chr4 (3-190)||(24112793-24112980)
chr4 (24-190)||(14235478-14235644)
chr4 (1-223)||(15227999-15228221)
chr4 (1-193)||(15391288-15391480)
chr4 (24-211)||(24460537-24460724)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-225)||(7073287-7073511)
chr3 (1-225)||(8211813-8212037)
chr3 (1-225)||(10396208-10396432)
chr3 (1-225)||(48466002-48466226)
chr3 (1-225)||(4346646-4346870)
chr3 (1-225)||(5596316-5596540)
chr3 (1-225)||(28115913-28116137)
chr3 (1-225)||(4416994-4417218)
chr3 (1-225)||(5467060-5467284)
chr3 (1-225)||(18242814-18243038)
chr3 (1-225)||(18277011-18277235)
chr3 (1-225)||(18292312-18292536)
chr3 (1-225)||(18307613-18307837)
chr3 (1-225)||(21674768-21674992)
chr3 (1-225)||(22870815-22871039)
chr3 (1-225)||(22885874-22886098)
chr3 (1-225)||(29148714-29148938)
chr3 (3-225)||(20576806-20577028)
chr3 (3-225)||(29664929-29665151)
chr3 (1-225)||(22387537-22387761)
chr3 (1-225)||(31964432-31964656)
chr3 (1-225)||(50134030-50134254)
chr3 (1-225)||(51782098-51782322)
chr3 (3-225)||(28021352-28021574)
chr3 (1-225)||(4796612-4796836)
chr3 (1-225)||(6192391-6192615)
chr3 (1-225)||(6542421-6542645)
chr3 (1-225)||(11110308-11110532)
chr3 (1-225)||(35880841-35881065)
chr3 (7-225)||(51797194-51797412)
chr3 (1-225)||(18330744-18330968)
chr3 (1-225)||(28339377-28339601)
chr3 (1-225)||(5013787-5014011)
chr3 (1-225)||(5609281-5609505)
chr3 (1-225)||(8296047-8296271)
chr3 (1-225)||(15741053-15741277)
chr3 (1-225)||(36997036-36997260)
chr3 (1-225)||(47023528-47023752)
chr3 (1-225)||(8301226-8301450)
chr3 (1-225)||(17984915-17985139)
chr3 (1-225)||(24328234-24328458)
chr3 (1-225)||(7996637-7996861)
chr3 (1-225)||(10643145-10643369)
chr3 (1-225)||(15892665-15892889)
chr3 (1-225)||(18225266-18225490)
chr3 (1-225)||(4721706-4721930)
chr3 (1-225)||(18051337-18051561)
chr3 (1-211)||(5713302-5713512)
chr3 (1-211)||(5724212-5724422)
chr3 (1-211)||(5757055-5757265)
chr3 (1-211)||(5767946-5768156)
chr3 (3-225)||(31034076-31034298)
chr3 (3-225)||(32292829-32293051)
chr3 (3-190)||(32439231-32439418)
chr3 (24-216)||(5652485-5652677)
chr3 (1-220)||(16626470-16626689)
chr3 (3-190)||(20066120-20066307)
chr3 (1-223)||(18530463-18530685)
chr3 (24-211)||(17993757-17993944)
chr3 (24-211)||(4626042-4626229)
chr3 (3-100)||(4893287-4893384)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-225)||(9680-9904)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-225)||(51638331-51638555)
chr1 (1-225)||(41793226-41793450)
chr1 (1-225)||(10962783-10963007)
chr1 (1-225)||(28585094-28585318)
chr1 (1-223)||(16207951-16208173)
chr1 (3-225)||(20340253-20340475)
chr1 (3-225)||(28151977-28152199)
chr1 (1-223)||(20461194-20461416)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (3-225)||(27777334-27777556)
chr2 (3-225)||(27817092-27817314)
chr2 (1-225)||(21677089-21677313)
chr2 (1-225)||(37375271-37375495)
chr2 (1-225)||(39890184-39890408)
chr2 (3-225)||(13936451-13936673)
chr2 (3-225)||(39051729-39051951)
chr2 (1-225)||(23128473-23128697)
chr2 (1-225)||(32049908-32050132)
chr2 (3-222)||(27803819-27804038)
chr2 (3-225)||(12586922-12587144)
chr2 (3-225)||(12716509-12716731)
chr2 (1-225)||(260660-260884)
chr2 (1-225)||(16829245-16829469)
chr2 (1-225)||(16892012-16892236)
chr2 (1-225)||(34861790-34862014)
chr2 (1-225)||(37685816-37686040)
chr2 (1-225)||(37701081-37701305)
chr2 (1-225)||(40233621-40233845)
chr2 (1-225)||(19416406-19416630)
chr2 (1-225)||(28882324-28882548)
chr2 (1-225)||(37925603-37925827)
chr2 (1-225)||(11635093-11635317)
chr2 (1-225)||(11641282-11641506)
chr2 (1-225)||(12655652-12655876)
chr2 (1-225)||(31876391-31876615)
chr2 (1-193)||(34286464-34286656)
chr2 (1-193)||(34291524-34291716)
chr2 (1-225)||(27434351-27434575)
chr2 (1-225)||(20838028-20838252)
chr2 (1-225)||(22925935-22926159)
chr2 (1-139)||(34279559-34279697)
chr2 (3-211)||(9349903-9350111)
chr2 (1-223)||(21703073-21703295)
chr2 (1-211)||(31891249-31891459)
chr2 (1-220)||(19456333-19456552)
chr2 (1-193)||(27393079-27393271)
chr2 (24-225)||(34303210-34303411)
chr2 (24-216)||(27118821-27119013)
chr2 (24-211)||(3784787-3784974)
chr2 (24-211)||(16163732-16163919)
chr2 (24-211)||(34157144-34157330)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-225)||(8063-8287)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-225)||(7157-7381)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-225)||(14848-15072)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-225)||(8984-9208)
scaffold0159 (1-225)||(20129-20353)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-225)||(30566-30790)
scaffold0124 (1-223)||(20502-20723)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-217)||(6126-6344)
scaffold0415 (1-223)||(1838-2059)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (8-225)||(26119-26336)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-225)||(46903-47127)
scaffold0089 (9-225)||(39987-40203)
scaffold0089 (1-225)||(29877-30101)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-224)||(27406-27629)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-225)||(47-271)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-225)||(46717-46951)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (3-225)||(2576-2798)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (9-166)||(5-162)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (33-193)||(568-728)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-193)||(21675-21867)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (19-133)||(221-335)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19286576 - 19286800
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286576 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 19286675  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286676 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 19286775  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19286776 gaggaagctcctagacttgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12092825 - 12092601
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092825 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 12092726  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092725 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 12092626  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12092625 gaggaagctcctagacttgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 29829436 - 29829660
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829436 tgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29829535  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829536 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 29829635  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29829636 gaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31489851 - 31489627
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489851 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31489752  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489751 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31489652  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  31489651 gaagaagctccgagacttgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3329608 - 3329384
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329608 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3329509  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3329508 gctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgt 3329409  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3329408 gaggaagctcctagacttgatgtcc 3329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 31354638 - 31354862
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354638 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31354737  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354738 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31354837  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  31354838 gaggaagctcccagacttgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19208461 - 19208237
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208461 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 19208362  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208361 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 19208262  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  19208261 gaagaagctccgagacttgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19674555 - 19674779
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19674555 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 19674654  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674655 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 19674754  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19674755 gaggaagctcctagacttgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27609006 - 27608782
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27609006 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27608907  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27608906 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 27608807  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27608806 gaggaagctcctagacttgatgtcc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28362056 - 28361832
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362056 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28361957  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28361956 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28361857  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  28361856 gaagaagctccgagacttgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 14557738 - 14557962
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14557738 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 14557837  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  14557838 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgt 14557937  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14557938 gaggaagctcctagacttgatgtcc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16277668 - 16277892
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16277668 tgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 16277767  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  16277768 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgt 16277867  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16277868 gaggaagctcctagacttgatgtcc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19688212 - 19688436
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19688212 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaa 19688311  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  19688312 gctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgc 19688411  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19688412 gaggaagctcctagacttgatgtcc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 33258837 - 33259061
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33258837 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 33258936  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33258937 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgt 33259036  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  33259037 gaagaagctccgagacttgatgtcc 33259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2137360 - 2137136
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2137360 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaa 2137261  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  2137260 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgt 2137161  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  2137160 gagaaagctcctagacttgatgtcc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16283563 - 16283787
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16283563 tgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 16283662  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  16283663 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgt 16283762  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  16283763 gaggaagctcctagacttgttgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18710700 - 18710924
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710700 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18710799  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  18710800 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 18710899  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||    
T  18710900 gaggaagctcccggacttgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189432
Alignment:
Q  49 ctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgt 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  149 cctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 9354759 - 9354961
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt-gaagaaactcattgatcaaggaaagctg 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| || || || || |||| ||| || ||  || |||||||| || ||||||||  ||    
T  9354759 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattg 9354858  T
Q  123 actttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 222  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9354859 acctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatg 9354958  T
Q  223 tcc 225  Q
    |||    
T  9354959 tcc 9354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22080979 - 22080787
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  22080979 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaa 22080880  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 193  Q
     |||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  22080879 gctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 22080787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19659117 - 19658926
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  19659117 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagaccaaggaaaattga 19659019  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 216  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||    
T  19659018 cctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 44563238 - 44563423
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||| |||    
T  44563238 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttga 44563336  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    |||| |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  44563337 cttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 44563423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 33244802 - 33244988
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  33244802 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 33244901  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctc 210  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || || | |||||||||||    
T  33244902 cctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctc 33244988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 26435372 - 26435596
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435372 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26435471  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435472 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26435571  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26435572 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5147368 - 5147144
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147368 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5147269  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5147268 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgc 5147169  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5147168 gaggaagctcctagacttgatgtcc 5147144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31564418 - 31564194
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564418 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31564319  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564318 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31564219  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31564218 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4145151 - 4144927
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145151 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4145052  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145051 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4144952  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  4144951 gaagaagctccgagacttgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26537898 - 26537674
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26537898 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26537799  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26537798 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26537699  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26537698 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 5128107 - 5128333
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  5128107 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 5128206  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5128207 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 5128306  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtccat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5128307 gaggaagctcctagacttgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24592569 - 24592345
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592569 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 24592470  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24592469 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 24592370  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24592369 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26319897 - 26319673
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319897 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26319798  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26319797 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgt 26319698  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  26319697 gaagaagctccgagacttgatgtcc 26319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 31125035 - 31125259
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31125035 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31125134  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31125135 actcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31125234  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31125235 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 9618766 - 9618990
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618766 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 9618865  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618866 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 9618965  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  9618966 gaagaagctccgagacttgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11424804 - 11424580
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424804 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11424705  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11424704 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 11424605  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11424604 gaggaaactcctagacttgatgtcc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 11441687 - 11441911
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11441687 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11441786  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11441787 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 11441886  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11441887 gaggaagctcctagacttgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26275122 - 26274898
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275122 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26275023  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26275022 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgt 26274923  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  26274922 gaagaagctccgagacttgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26669942 - 26669718
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26669942 tgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26669843  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26669842 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26669743  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  26669742 gaagaagctccgagacttgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 45387458 - 45387682
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387458 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 45387557  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387558 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 45387657  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| || ||||||||||    
T  45387658 gaagaagctccgaggcttgatgtcc 45387682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16736486 - 16736264
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16736486 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 16736387  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16736386 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtga 16736287  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  16736286 ggaagctcctaggcttgatgtcc 16736264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16751540 - 16751318
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16751540 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 16751441  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16751440 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtga 16751341  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  16751340 ggaagctcctaggcttgatgtcc 16751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 17523649 - 17523871
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17523649 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 17523748  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17523749 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtga 17523848  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  17523849 ggaagctcctaggcttgatgtcc 17523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17529566 - 17529344
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17529566 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 17529467  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17529466 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtga 17529367  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  17529366 ggaagctcctaggcttgatgtcc 17529344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 2154688 - 2154912
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  2154688 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 2154787  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2154788 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 2154887  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2154888 gaggaagctcctagacttgatgtcc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10916896 - 10916672
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10916896 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 10916797  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10916796 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 10916697  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10916696 gaggaagctcctagacttgatgtcc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 3445421 - 3445645
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3445421 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 3445520  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3445521 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgt 3445620  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  3445621 gaggaaactcctagacttgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16503408 - 16503185
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16503408 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaa 16503309  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16503308 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 16503209  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16503208 gaggaagctcctagacttgatgtc 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16518444 - 16518221
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16518444 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaa 16518345  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16518344 gctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 16518245  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16518244 gaggaagctcctagacttgatgtc 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 26484811 - 26485033
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  26484811 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 26484910  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  26484911 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 26485010  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  26485011 ggaagctcccggacttgacgtcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2109031 - 2108823
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  2109031 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 2108932  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  2108931 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 2108832  T
Q  203 ggaagctcc 211  Q
    |||||||||    
T  2108831 ggaagctcc 2108823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 2775476 - 2775698
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  | || |||||||| |    
T  2775476 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagc 2775575  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  2775576 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 2775675  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  2775676 ggaagctcccggacttgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39211049 - 39210827
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  39211049 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 39210950  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  39210949 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 39210850  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  39210849 ggaagctcccggacttgacgtcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16450026 - 16449810
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  16450026 tgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaa 16449927  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  16449926 gctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 16449827  T
Q  201 gaggaagctcctagact 217  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16449826 gaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16041438 - 16041660
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||    
T  16041438 tgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaa 16041537  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |      
T  16041538 gctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatac 16041637  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  16041638 gaggaagctcccagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 4200685 - 4200886
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  | || |||||||| |||||| | ||||||||| |||    
T  4200685 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttga 4200784  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||    
T  4200785 cttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgt 4200884  T
Q  224 cc 225  Q
    ||    
T  4200885 cc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 18540916 - 18541103
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  18540916 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 18541015  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  18541016 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 18541103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26683005 - 26682804
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||  | || |||||||| || ||||||||  |||    
T  26683005 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 26682906  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    | || |||||||| || || || ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||    
T  26682905 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgt 26682806  T
Q  224 cc 225  Q
    ||    
T  26682805 cc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 5159636 - 5159820
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  5159636 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 5159735  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatat 187  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||||||    
T  5159736 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatat 5159820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31088469 - 31088282
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  31088469 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 31088370  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  31088369 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31088282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 45733598 - 45733785
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  45733598 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 45733697  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  45733698 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 45733785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 29549586 - 29549810
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549586 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29549685  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29549686 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgt 29549785  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  29549786 gaggaagctcctggacttgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4724219 - 4723995
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4724120  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724119 actcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4724020  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4724019 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 4773117 - 4773341
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773117 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4773216  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773217 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4773316  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4773317 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16674250 - 16674474
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674250 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 16674349  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674350 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 16674449  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16674450 gaggaagctcctagacttgatgtcc 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 29501526 - 29501750
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501526 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29501625  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501626 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 29501725  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29501726 gaggaagctcctagacttgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34463431 - 34463207
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463431 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34463332  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463331 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 34463232  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34463231 gaggaagctcctagacttgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 27044498 - 27044723
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtg-ttatgctttgaagtatatcgtgaaga 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27044498 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaaga 27044597  T
Q  100 aactcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtg 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044598 aactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtg 27044697  T
Q  200 tgaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27044698 tgaggaagctcctagacttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4545860 - 4545636
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4545761  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545760 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4545661  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4545660 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27360077 - 27359852
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27360077 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27359978  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27359977 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27359878  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27359877 gaggaagctcctagacttgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27450420 - 27450195
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450420 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27450321  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450320 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27450221  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27450220 gaggaagctcctagacttgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 3696192 - 3696416
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3696192 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3696291  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3696292 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgt 3696391  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  3696392 gatgaagctcctagacttgatgtcc 3696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 4757875 - 4758099
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757875 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4757974  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757975 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4758074  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4758075 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26116495 - 26116271
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116495 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26116396  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116395 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26116296  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26116295 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 27007838 - 27008062
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007838 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27007937  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007938 gctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27008037  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27008038 aaggaagctcctagacttgatgtcc 27008062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 28207565 - 28207789
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 28207664  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207665 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28207764  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28207765 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 29573124 - 29573348
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573124 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29573223  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573224 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 29573323  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  29573324 gaagaagctccgagacttgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16749965 - 16750186
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16749965 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 16750064  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16750065 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 16750164  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16750165 gaggaagctcctagacttgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26777700 - 26777475
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777700 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26777601  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777600 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26777501  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcca 226  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||    
T  26777500 gaggaaaatcctagacttgatgtcca 26777475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 27485240 - 27485464
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485240 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27485339  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485340 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27485439  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  27485440 gaggaagctcctaggcttgatgtcc 27485464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 17025390 - 17025612
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17025390 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 17025489  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17025490 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 17025589  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17025590 ggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 4525397 - 4525621
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4525397 tgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 4525496  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4525497 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4525596  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4525597 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24304703 - 24304479
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24304703 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaa 24304604  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24304603 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 24304504  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24304503 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 24863828 - 24864052
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24863828 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 24863927  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24863928 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 24864027  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24864028 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 26918491 - 26918715
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  26918491 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaa 26918590  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26918591 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 26918690  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26918691 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30558101 - 30557877
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30558101 tgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30558002  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30558001 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgt 30557902  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  30557901 gaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 26989112 - 26989336
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26989112 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaa 26989211  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26989212 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 26989311  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26989312 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 27000184 - 27000402
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27000184 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaa 27000283  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27000284 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 27000383  T
Q  201 gaggaagctcctagacttg 219  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  27000384 gaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15424402 - 15424178
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15424402 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaa 15424303  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  15424302 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgt 15424203  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15424202 gaggaagctcctagacttgatgtcc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13299036 - 13298812
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  13299036 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaa 13298937  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13298936 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 13298837  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13298836 gaggaagctcctagacttgatgtcc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16944112 - 16943888
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16944112 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 16944013  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16944012 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgt 16943913  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  16943912 gaagaagctccgagacttgatgtcc 16943888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22934965 - 22934741
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22934965 tgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22934866  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22934865 gctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 22934766  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22934765 gaggaagctcctagacttgatgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23857410 - 23857186
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23857410 tgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 23857311  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23857310 gctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 23857211  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23857210 gaggaagctcctagacttgatgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27272664 - 27272441
Alignment:
Q  2 gcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaa 101  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  27272664 gcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaag 27272565  T
Q  102 ctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27272564 ctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 27272465  T
Q  202 aggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  27272464 aggtagctcctagacttgatgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 20160814 - 20161031
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  20160814 cctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagc 20160913  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||| || ||| | |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20160914 tcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtga 20161013  T
Q  203 ggaagctcctagacttga 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20161014 ggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22172017 - 22171800
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22172017 cctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagc 22171918  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||| || ||| | |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  22171917 tcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtga 22171818  T
Q  203 ggaagctcctagacttga 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22171817 ggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14143368 - 14143146
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  14143368 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 14143269  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  14143268 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 14143169  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  14143168 ggaagctcccggacttgacgtcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 26788057 - 26788279
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  26788057 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 26788156  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  26788157 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 26788256  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  26788257 ggaagctcccggacttgacgtcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 27196430 - 27196652
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  27196430 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 27196529  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  27196530 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 27196629  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  27196630 ggaagctcccggacttgacgtcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27252810 - 27252588
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  27252810 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 27252711  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  27252710 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 27252611  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  27252610 ggaagctcccggacttgacgtcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27290438 - 27290231
Alignment:
Q  18 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaa 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  27290438 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 27290339  T
Q  118 agctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 217  Q
    || | ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  27290338 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagact 27290239  T
Q  218 tgatgtcc 225  Q
    ||||||||    
T  27290238 tgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22457019 - 22456795
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22457019 tgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaa 22456920  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| || || | |    
T  22456919 gctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatat 22456820  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  22456819 gaggaagctcccagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13522135 - 13521939
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  | || |||||||| |||||| | ||||||||| |||    
T  13522135 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttga 13522036  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 220  Q
    |||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  |||||||    
T  13522035 cttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33374318 - 33374131
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  33374318 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 33374219  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    |||| |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||    
T  33374218 cttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33374131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8892372 - 8892186
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  8892372 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagaccaaggaaaattga 8892274  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8892273 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8892186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8903607 - 8903421
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  8903607 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagaccaaggaaaattga 8903509  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8903508 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8903421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22477358 - 22477240
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22477358 tgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaa 22477259  T
Q  101 actcattgatcaaggaaag 119  Q
     ||||| || |||||||||    
T  22477258 gctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 28162791 - 28162978
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  28162791 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 28162890  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  28162891 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 28162978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17092430 - 17092301
Alignment:
Q  96 aagaaactcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaag 195  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||   || || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||  || |    
T  17092430 aagaagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgagg 17092331  T
Q  196 tgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    | |||||||||||| | | |||||||||||    
T  17092330 tatgtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27629767 - 27629653
Alignment:
Q  19 ctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaa 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||| ||||||||    
T  27629767 ctgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaa 27629668  T
Q  119 gctgactttcgagaa 133  Q
    ||||||||| |||||    
T  27629667 gctgacttttgagaa 27629653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15658799 - 15658575
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658799 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 15658700  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15658699 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgt 15658600  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15658599 gaggaagctcctagacttgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 28649358 - 28649582
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649358 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28649457  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649458 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28649557  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28649558 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 3789664 - 3789888
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789664 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3789763  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789764 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 3789863  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3789864 gaggaagctcctagacttgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9548582 - 9548358
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9548582 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 9548483  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548482 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 9548383  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9548382 gaggaagctcctagacttgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8665514 - 8665290
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665514 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8665415  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665414 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8665315  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  8665314 gaggaagttcctagacttgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18500769 - 18500553
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500769 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18500670  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500669 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18500570  T
Q  201 gaggaagctcctagact 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  18500569 gaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23752489 - 23752265
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23752489 tgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 23752390  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23752389 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 23752290  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23752289 gaggaagctcctagacttgatgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30152141 - 30152365
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152141 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30152240  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152241 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 30152340  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30152341 gaggaagctcctagacttgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 34616641 - 34616865
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616641 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34616740  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616741 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 34616840  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  34616841 gaggaagttcctagacttgatgtcc 34616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37671522 - 37671298
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671522 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37671423  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671422 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37671323  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37671322 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 43078375 - 43078599
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078375 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 43078474  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078475 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 43078574  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43078575 gaggaagctcctagacttgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13324866 - 13324644
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13324866 cctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 13324767  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13324766 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 13324667  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13324666 ggaagctcctagacttgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 9317574 - 9317798
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317574 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 9317673  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317674 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 9317773  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  9317774 gaagaagctccgagacttgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 12132278 - 12132502
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132278 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 12132377  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132378 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 12132477  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  12132478 gaagaagctccgagacttgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15758896 - 15758672
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758896 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 15758797  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758796 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 15758697  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15758696 gaggaagctcctagacttgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 31431563 - 31431787
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431563 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31431662  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431663 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31431762  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31431763 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37358682 - 37358458
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37358682 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 37358583  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358582 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37358483  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37358482 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 37755103 - 37755327
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37755103 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37755202  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37755203 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37755302  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37755303 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40473586 - 40473364
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40473586 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 40473487  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473486 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 40473387  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40473386 ggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28959825 - 28959600
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28959825 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28959726  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28959725 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgt 28959626  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcca 226  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
T  28959625 gaggagactcctagacttgatgtcca 28959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 2511174 - 2511398
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511174 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 2511273  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511274 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 2511373  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  2511374 gaggaagctcctaggcttgatgtcc 2511398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 6874428 - 6874652
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874428 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 6874527  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874528 gcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 6874627  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6874628 gaggaagctcctagacttgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23718027 - 23717803
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23718027 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 23717928  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23717927 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 23717828  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23717827 gaggaagctcctagacttgatgtcc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37771026 - 37770802
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37771026 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaa 37770927  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37770926 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37770827  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  37770826 gaggaagcttctagacttgatgtcc 37770802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 24681565 - 24681787
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24681565 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 24681664  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24681665 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtga 24681764  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24681765 ggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 24724092 - 24724314
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24724092 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 24724191  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24724192 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtga 24724291  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24724292 ggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22999153 - 22998929
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22999153 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22999054  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22999053 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 22998954  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22998953 gaggaagctcctagacttgatgtcc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 26480515 - 26480739
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480515 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26480614  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480615 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26480714  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  26480715 gaagaagctccgagacttgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 33516479 - 33516703
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516479 tgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 33516578  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33516579 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgt 33516678  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  33516679 gaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32599511 - 32599286
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599511 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 32599412  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599411 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 32599312  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcca 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  32599311 gaggaagcccctagacttgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 11549477 - 11549701
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11549477 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11549576  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  11549577 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgc 11549676  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11549677 gaggaagctcctagacttgatgtcc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18375451 - 18375227
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375451 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18375352  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18375351 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgt 18375252  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18375251 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31826446 - 31826222
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31826446 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 31826347  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31826346 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 31826247  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  31826246 gaggaaactcctagacttgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 5638033 - 5638257
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5638033 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5638132  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5638133 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgt 5638232  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  5638233 gaagaagctccgagacttgatgtcc 5638257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24688196 - 24687972
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24688196 tgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaa 24688097  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24688096 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 24687997  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24687996 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 33777610 - 33777834
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  33777610 tgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaa 33777709  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  33777710 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgt 33777809  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33777810 gaggaagctcctagacttgatgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29967105 - 29966881
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967105 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29967006  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967005 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 29966906  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  29966905 gaagaagctccgagacttgatgtcc 29966881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30029538 - 30029762
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029538 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30029637  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029638 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 30029737  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  30029738 gaagaagctccgagacttgatgtcc 30029762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30168592 - 30168816
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168592 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30168691  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30168692 gctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 30168791  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || ||| ||||||||||||||||||    
T  30168792 gaagaaactcctagacttgatgtcc 30168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30934756 - 30934980
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30934756 tgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30934855  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30934856 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgt 30934955  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30934956 gaggaagctcctagacttgatgtcc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 24970141 - 24970365
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24970141 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 24970240  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||    
T  24970241 gctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgt 24970340  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24970341 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29889121 - 29888897
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  29889121 tgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaa 29889022  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |    
T  29889021 gctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtat 29888922  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  29888921 gaggaagctcccagacttgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 23892329 - 23892553
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  23892329 tgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaa 23892428  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || | |    
T  23892429 gctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatat 23892528  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  23892529 gaggaagctcccagacttgatgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 41674832 - 41675021
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||    
T  41674832 tgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaa 41674931  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
     || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  41674932 gcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 41675021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22888593 - 22888815
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  22888593 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaa 22888692  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  22888693 gctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 22888792  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22888793 gaggaagctcctagactcgatgt 22888815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 25199154 - 25199374
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  25199154 cctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagc 25199253  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||    
T  25199254 tcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatga 25199353  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    | |||| || |||||||||||    
T  25199354 gaaagcccccagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Original strand, 33877393 - 33877589
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  | || |||||||| |||||| | ||||||||| |||    
T  33877393 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttga 33877492  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 220  Q
    |||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  |||||||    
T  33877493 cttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 11325940 - 11326127
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||||||| |||    
T  11325940 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttga 11326039  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    |||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  11326040 cttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 11326127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 33292650 - 33292837
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  33292650 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 33292749  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  || |||||||||||    
T  33292750 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgat 33292837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13184664 - 13184477
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  13184664 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 13184565  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  13184564 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13184477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13440510 - 13440323
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  13440510 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 13440411  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  13440410 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13440323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 6569982 - 6570206
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569982 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 6570081  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570082 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 6570181  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6570182 gaggaagctcctagacttgatgtcc 6570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 54833516 - 54833740
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833516 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 54833615  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833616 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 54833715  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  54833716 gaggaagctcctagacttgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18800755 - 18800531
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800755 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18800656  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800655 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18800556  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18800555 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30753883 - 30754107
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753883 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30753982  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753983 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 30754082  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30754083 gaggaagctcctagacttgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14763446 - 14763222
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763446 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 14763347  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763346 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 14763247  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14763246 gaggaagctcctagacttgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27163459 - 27163235
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27163459 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaa 27163360  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163359 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27163260  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27163259 gaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33673940 - 33673716
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33673940 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 33673841  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33673840 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 33673741  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  33673740 gaggaagttcctagacttgatgtcc 33673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36344657 - 36344433
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344657 tgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 36344558  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344557 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 36344458  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36344457 gaggaagctcctagacttgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40105780 - 40105556
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105780 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 40105681  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105680 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 40105581  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  40105580 gaagaagctccgagacttgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 5006002 - 5006226
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5006002 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5006101  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5006102 gctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 5006201  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5006202 gaggaagctcctagacttgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31126660 - 31126436
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31126660 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31126561  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31126560 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgt 31126461  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  31126460 gaagaagctccgagacttgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 39850769 - 39850991
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39850769 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 39850868  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850869 tcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 39850968  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39850969 ggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 14098670 - 14098894
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098670 tgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 14098769  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098770 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 14098869  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  14098870 gaagaagctccgagacttgatgtcc 14098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 21969832 - 21970054
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21969832 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 21969931  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21969932 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtga 21970031  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  21970032 ggaagttcctagacttgatgtcc 21970054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 14665147 - 14665371
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14665147 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 14665246  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14665247 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 14665346  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14665347 gaggaagctcctagacttgatgtcc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24592456 - 24592232
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24592456 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 24592357  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24592356 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 24592257  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24592256 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 17014129 - 17014353
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17014129 tgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 17014228  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17014229 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 17014328  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17014329 gaggaagctcctagacttgatgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15285070 - 15284851
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||    
T  15285070 tgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 15284971  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || |||    
T  15284970 gctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgt 15284871  T
Q  201 gaggaagctcctagacttga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15284870 gaggaagctcccagacttga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 1900403 - 1900608
Alignment:
Q  18 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaa 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1900403 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 1900502  T
Q  118 agctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 217  Q
    || | ||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  1900503 agttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 1900602  T
Q  218 tgatgt 223  Q
     |||||    
T  1900603 cgatgt 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34189100 - 34188913
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  34189100 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 34189001  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  34189000 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34188913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 24112793 - 24112980
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  24112793 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 24112892  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  24112893 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 24112980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14235644 - 14235478
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||| ||||| || || |||||| | |    
T  14235644 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaa 14235545  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  14235544 cttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 14235478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15227999 - 15228221
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  15227999 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaa 15228098  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||| | || || |||||||| || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || | |    
T  15228099 gctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatat 15228198  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    |||  |||||| |||||||||||    
T  15228199 gagatagctcccagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15391480 - 15391288
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  15391480 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaa 15391381  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 193  Q
     ||||||||  | |||||| | ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||||||    
T  15391380 gctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 15391288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24460724 - 24460537
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  24460724 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 24460625  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24460624 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 24460537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 7073287 - 7073511
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073287 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 7073386  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7073387 gctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgt 7073486  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7073487 gaggaagctcctagacttgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 8211813 - 8212037
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8211912  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211913 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8212012  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8212013 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 10396208 - 10396432
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396208 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 10396307  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396308 gctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 10396407  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10396408 gaggaagctcctagacttgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 48466002 - 48466226
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48466002 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 48466101  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48466102 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 48466201  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48466202 gaggaagctcctagacttgatgtcc 48466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4346870 - 4346646
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346870 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4346771  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346770 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4346671  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4346670 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5596540 - 5596316
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596540 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5596441  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596440 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 5596341  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5596340 gaggaagctcctagacttgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28116137 - 28115913
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116137 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28116038  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28116037 gctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgc 28115938  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28115937 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 4416994 - 4417218
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4416994 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 4417093  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4417094 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4417193  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4417194 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 5467060 - 5467284
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5467060 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5467159  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5467160 gctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 5467259  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5467260 gaggaagctcctagacttgatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18242814 - 18243038
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242814 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18242913  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242914 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18243013  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18243014 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18277235 - 18277011
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277235 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18277136  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277135 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18277036  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18277035 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18292536 - 18292312
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292536 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18292437  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292436 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18292337  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18292336 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18307837 - 18307613
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307837 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18307738  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307737 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18307638  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18307637 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21674768 - 21674992
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674768 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 21674867  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674868 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 21674967  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21674968 gaggaagctcctagacttgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22871039 - 22870815
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871039 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22870940  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22870939 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 22870840  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22870839 gaggaagttcctagacttgatgtcc 22870815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22886098 - 22885874
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886098 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22885999  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22885998 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 22885899  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22885898 gaggaagttcctagacttgatgtcc 22885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29148938 - 29148714
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29148938 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29148839  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29148838 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 29148739  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29148738 gaggaagctcctagacttgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20577028 - 20576806
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20577028 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 20576929  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20576928 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 20576829  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20576828 ggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29665151 - 29664929
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29665151 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 29665052  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665051 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 29664952  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29664951 ggaagctcctagacttgatgtcc 29664929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22387761 - 22387537
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22387761 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22387662  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22387661 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 22387562  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22387561 gaggaagctcctagacttgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31964656 - 31964432
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964656 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31964557  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964556 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31964457  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31964456 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50134254 - 50134030
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134254 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 50134155  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134154 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 50134055  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50134054 gaggaagctcctagacttgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 51782098 - 51782322
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51782098 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 51782197  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51782198 gctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 51782297  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  51782298 gaggaagctcctagacttgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 28021352 - 28021574
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28021352 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 28021451  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28021452 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtga 28021551  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28021552 ggaagctcctagacttgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4796836 - 4796612
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4796836 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaa 4796737  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4796736 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 4796637  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4796636 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 6192391 - 6192615
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6192391 tgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 6192490  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6192491 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 6192590  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6192591 gaggaagctcctagacttgatgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6542645 - 6542421
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542645 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 6542546  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542545 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 6542446  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  6542445 aaggaagctcctagacttgatgtcc 6542421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11110532 - 11110308
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11110532 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11110433  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11110432 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgt 11110333  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  11110332 gaggaagctccaagacttgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 35880841 - 35881065
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35880841 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaa 35880940  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35880941 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 35881040  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  35881041 gaggaaactcctagacttgatgtcc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 51797194 - 51797412
Alignment:
Q  7 caaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51797194 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 51797293  T
Q  107 tgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 206  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51797294 cgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 51797393  T
Q  207 gctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51797394 gctcctagacttgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18330744 - 18330968
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18330744 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 18330843  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18330844 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 18330943  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18330944 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 28339377 - 28339601
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339377 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28339476  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339477 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28339576  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  28339577 gaagaagctccgagacttgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 5013787 - 5014011
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013787 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5013886  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013887 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 5013986  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  5013987 gaagaagctccgagacttgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5609505 - 5609281
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609505 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5609406  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609405 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 5609306  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  5609305 gaggaagctcctaggcttgatgtcc 5609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 8296047 - 8296271
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8296047 tgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8296146  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8296147 gctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 8296246  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8296247 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15741277 - 15741053
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15741277 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 15741178  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15741177 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 15741078  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15741077 gaggaagctcctagacttgatgtcc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36997260 - 36997036
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36997260 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 36997161  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36997160 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 36997061  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  36997060 gaggaaactcctagacttgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 47023528 - 47023752
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023528 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 47023627  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47023628 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgt 47023727  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  47023728 gaagaagctccgagacttgatgtcc 47023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8301450 - 8301226
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8301450 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8301351  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8301350 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgt 8301251  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8301250 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17985139 - 17984915
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985139 tgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 17985040  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985039 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 17984940  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  17984939 gaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 24328234 - 24328458
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24328234 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaa 24328333  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328334 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 24328433  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  24328434 gaagaagctccgagacttgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 7996637 - 7996861
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7996637 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaa 7996736  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996737 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 7996836  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| || ||||||||||    
T  7996837 gaagaagctccgaggcttgatgtcc 7996861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 10643145 - 10643369
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10643145 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaa 10643244  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643245 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 10643344  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| || ||||||||||    
T  10643345 gaagaagctccgaggcttgatgtcc 10643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15892889 - 15892665
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15892889 tgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 15892790  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15892789 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 15892690  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15892689 gaggaagctcctagacttgatgtcc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18225266 - 18225490
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225266 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18225365  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18225366 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgt 18225465  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  18225466 gaagaagctcctaggcttgatgtcc 18225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 4721706 - 4721930
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||    
T  4721706 tgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaa 4721805  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4721806 tctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgt 4721905  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  4721906 gaggaagctcctagactcgatgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18051337 - 18051561
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18051337 tgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18051436  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  18051437 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgt 18051536  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  18051537 gagaaagctcctagacttgatgtcc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 5713302 - 5713512
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713302 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5713401  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  5713402 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 5713501  T
Q  201 gaggaagctcc 211  Q
    |||||||||||    
T  5713502 gaggaagctcc 5713512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 5724212 - 5724422
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724212 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5724311  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  5724312 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 5724411  T
Q  201 gaggaagctcc 211  Q
    |||||||||||    
T  5724412 gaggaagctcc 5724422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5757265 - 5757055
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757265 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5757166  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  5757165 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 5757066  T
Q  201 gaggaagctcc 211  Q
    |||||||||||    
T  5757065 gaggaagctcc 5757055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5768156 - 5767946
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768156 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 5768057  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  5768056 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 5767957  T
Q  201 gaggaagctcc 211  Q
    |||||||||||    
T  5767956 gaggaagctcc 5767946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31034298 - 31034076
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  31034298 cctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 31034199  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  31034198 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 31034099  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  31034098 ggaagctcccggacttgacgtcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 32292829 - 32293051
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  32292829 cctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 32292928  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  32292929 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 32293028  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  32293029 ggaagctcccggacttgacgtcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 32439231 - 32439418
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  32439231 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 32439330  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  32439331 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 32439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 5652485 - 5652677
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  5652485 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 5652584  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 216  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  5652585 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16626689 - 16626470
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||    
T  16626689 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 16626590  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||| || || | |    
T  16626589 gctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatat 16626490  T
Q  201 gaggaagctcctagacttga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  16626489 gaggaagctcccagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 20066120 - 20066307
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  20066120 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 20066219  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 190  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  20066220 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 20066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18530463 - 18530685
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||    
T  18530463 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 18530562  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  18530563 gctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 18530662  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    |||| |||||| |||||| ||||    
T  18530663 gagggagctcccagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17993944 - 17993757
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  17993944 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 17993845  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  17993844 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 17993757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 4626042 - 4626229
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  4626042 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 4626141  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||| |||||||    
T  4626142 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 4626229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 4893287 - 4893384
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||||||||   |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||    
T  4893287 cctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaa 4893384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 9680 - 9904
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9680 tgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 9779  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9780 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 9879  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9880 gaggaagctcctagacttgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 51638331 - 51638555
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51638331 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 51638430  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638431 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 51638530  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  51638531 gaggaagctcctagacttgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41793450 - 41793226
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793450 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 41793351  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793350 gctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 41793251  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41793250 gaggaagctcctagacttgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 10962783 - 10963007
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962783 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 10962882  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10962883 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgt 10962982  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  10962983 gaagaagctccgagacttgatgtcc 10963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 28585094 - 28585318
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28585094 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28585193  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28585194 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28585293  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  28585294 gaagaagctccgagacttgatgtcc 28585318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16208173 - 16207951
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  16208173 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaa 16208074  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  16208073 gctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 16207974  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  16207973 gagaaagctcccagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20340475 - 20340253
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| |    
T  20340475 cctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagc 20340376  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  20340375 tcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 20340276  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  20340275 ggaagctcccagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 28151977 - 28152199
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  28151977 cctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 28152076  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  | | |||    
T  28152077 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatga 28152176  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  28152177 ggaagctcccggacttgacgtcc 28152199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20461194 - 20461416
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  20461194 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 20461293  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| || ||||||||  |||| || || ||||  || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||| || || | |    
T  20461294 gctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatat 20461393  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    ||| ||||||  |||||||||||    
T  20461394 gagcaagctcgcagacttgatgt 20461416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 27777334 - 27777556
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27777334 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 27777433  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27777434 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 27777533  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27777534 ggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 27817092 - 27817314
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27817092 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 27817191  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27817192 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 27817291  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27817292 ggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21677313 - 21677089
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677313 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 21677214  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677213 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 21677114  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21677113 gaggaagttcctagacttgatgtcc 21677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 37375271 - 37375495
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375271 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37375370  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375371 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37375470  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  37375471 ggggaagctcctagacttgatgtcc 37375495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 39890184 - 39890408
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39890184 tgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaa 39890283  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39890284 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 39890383  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39890384 gaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13936673 - 13936451
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13936673 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagc 13936574  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936573 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 13936474  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13936473 ggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39051951 - 39051729
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39051951 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 39051852  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39051851 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 39051752  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39051751 ggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23128697 - 23128473
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23128697 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 23128598  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23128597 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 23128498  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23128497 gaggaagctcctagacttgatgtcc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 32049908 - 32050132
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049908 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 32050007  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32050008 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgt 32050107  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  32050108 gaggaagttcctagacttgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 27803819 - 27804038
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27803819 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 27803918  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27803919 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 27804018  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27804019 ggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 12586922 - 12587144
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12586922 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 12587021  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587022 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 12587121  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12587122 ggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12716731 - 12716509
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12716731 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 12716632  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12716631 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtga 12716532  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12716531 ggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 260884 - 260660
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 260785  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  260784 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgc 260685  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  260684 gaggaagttcctagacttgatgtcc 260660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16829469 - 16829245
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829469 tgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 16829370  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16829369 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgt 16829270  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  16829269 gaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16892012 - 16892236
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16892012 tgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 16892111  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16892112 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgt 16892211  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  16892212 gaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 34861790 - 34862014
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861790 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34861889  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861890 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 34861989  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| ||||| |||||||    
T  34861990 gaagaagctccgagactagatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37686040 - 37685816
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686040 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37685941  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37685940 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37685841  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  37685840 gaagaagctccgagacttgatgtcc 37685816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37701305 - 37701081
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701305 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37701206  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701205 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37701106  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  37701105 gaagaagctccgagacttgatgtcc 37701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 40233621 - 40233845
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233621 tgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 40233720  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40233721 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgt 40233820  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40233821 gaggaagctcctagacttgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19416630 - 19416406
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19416630 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaa 19416531  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416530 actcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 19416431  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  19416430 gaagaagctccgagacttgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 28882324 - 28882548
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28882324 tgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28882423  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28882424 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 28882523  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28882524 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 37925603 - 37925827
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925603 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37925702  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925703 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37925802  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  37925803 gaagaagctccgagacttgatgtcc 37925827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11635317 - 11635093
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11635317 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaa 11635218  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11635217 gcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgc 11635118  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11635117 gaggaagctcctagacttgatgtcc 11635093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11641506 - 11641282
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11641506 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaa 11641407  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11641406 gcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgc 11641307  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11641306 gaggaagctcctagacttgatgtcc 11641282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 12655652 - 12655876
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12655652 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 12655751  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  12655752 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgt 12655851  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12655852 gaggaagctcctagacttgatgtcc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 31876391 - 31876615
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876391 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31876490  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876491 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31876590  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  31876591 gaagaagctccgagacttgatgtcc 31876615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 34286464 - 34286656
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286464 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34286563  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 193  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34286564 gctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcga 34286656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 34291524 - 34291716
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291524 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34291623  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 193  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34291624 gctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcga 34291716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27434575 - 27434351
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| | |||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27434575 tgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27434476  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27434475 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 27434376  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27434375 gaggaagctcctagacttgatgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20838028 - 20838252
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20838028 tgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 20838127  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  20838128 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgt 20838227  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20838228 gaggaagctcctagacttgatgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22926159 - 22925935
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926159 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22926060  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  22926059 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 22925960  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||    
T  22925959 gaggaagctcccggacttgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 34279559 - 34279697
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279559 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34279658  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgt 139  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34279659 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 34279697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9350111 - 9349903
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9350111 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 9350012  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  9350011 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 9349912  T
Q  203 ggaagctcc 211  Q
    |||||||||    
T  9349911 ggaagctcc 9349903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21703295 - 21703073
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  21703295 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaa 21703196  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  21703195 gctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 21703096  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  21703095 gaggaagctcccagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31891459 - 31891249
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || || || ||    
T  31891459 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa 31891360  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    |||||| || ||||||||  |||| ||  ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  31891359 actcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 31891260  T
Q  201 gaggaagctcc 211  Q
    |||||||||||    
T  31891259 gaggaagctcc 31891249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19456552 - 19456333
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |  || || ||||||||||| || || || ||    
T  19456552 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 19456453  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||| || || |||    
T  19456452 gctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgt 19456353  T
Q  201 gaggaagctcctagacttga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  19456352 gaggaagctcccagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 27393079 - 27393271
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  27393079 tgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaa 27393178  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 193  Q
     ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||||||    
T  27393179 gctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcga 27393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34303411 - 34303210
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  34303411 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 34303312  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||    
T  34303311 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 34303212  T
Q  224 cc 225  Q
    ||    
T  34303211 cc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 27118821 - 27119013
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  27118821 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 27118920  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 216  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||    
T  27118921 cctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 3784787 - 3784974
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  3784787 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 3784886  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  3784887 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 3784974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 16163732 - 16163919
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  16163732 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 16163831  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  16163832 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16163919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 34157144 - 34157330
Alignment:
Q  24 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || || || |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||  |||    
T  34157144 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagaccaaggaaaattga 34157242  T
Q  124 ctttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 211  Q
    | || |||||||| || || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  34157243 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34157330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 8063 - 8287
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 8162  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8163 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8262  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8263 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7381 - 7157
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7381 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 7282  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7281 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgt 7182  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  7181 gaagaagctccgagacttgatgtcc 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15072 - 14848
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 14973  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14972 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgt 14873  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14872 gaggaagctcctagacttgatgtcc 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9208 - 8984
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9208 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 9109  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9108 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 9009  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  9008 gaggaagctcctaggcttgatgtcc 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20129 - 20353
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20129 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 20228  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 20328  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  20329 gaggaagctcctaggcttgatgtcc 20353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30566 - 30790
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30566 tgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30665  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  30666 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 30765  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30766 gaggaagctcctagacttgatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20502 - 20723
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20502 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaa 20601  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  20602 gctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 20700  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  20701 gaagaagctcccagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 6126 - 6344
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatttt-catcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt-gaagtatatcgtgaag 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6126 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaag 6225  T
Q  99 aaactcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 198  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6226 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 6325  T
Q  199 gtgaggaagctcctagact 217  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6326 gtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1838
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  2059 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaa 1960  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |    
T  1959 gctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatat 1861  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgt 223  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  1860 gaagaagctcccagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26336 - 26119
Alignment:
Q  8 aaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatt 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26336 aaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatc 26237  T
Q  108 gatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaag 207  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26236 gatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaag 26137  T
Q  208 ctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26136 ctccgagacttgatgtcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47127 - 46903
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47127 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 47028  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  47027 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 46928  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  46927 gaggaagctcctagacttgatgtcc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40203 - 39987
Alignment:
Q  9 aggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattg 108  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40203 aggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattg 40104  T
Q  109 atcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagc 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40103 atcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagc 40004  T
Q  209 tcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  40003 tcctagacttgatgtcc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 29877 - 30101
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29877 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29976  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  29977 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgt 30076  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  30077 gaggaagctcttagacttgatgtcc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27406 - 27629
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27406 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27505  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27506 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 27605  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27606 gaggaagctcctagacttgatgtc 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 271 - 47
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  271 tgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaa 172  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  171 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgt 72  T
Q  201 gaggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  71 gaggaagctcctagacttgatgtcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46951 - 46717
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcg-ggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtc--atg-atgtcgaggggtgt-tatgctttgaagtatatcgtg 95  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  46951 tgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgctttgaagtatatcgtg 46852  T
Q  96 aagaaactcattgatcaagg-aaagctgac-tttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatg-atcg 192  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||     
T  46851 aagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgaatca 46752  T
Q  193 aagtgtgtga-ggaagctcct-agacttgatgtcc 225  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46751 aagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtcc 46717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2798 - 2576
Alignment:
Q  3 cctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 102  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| |    
T  2798 cctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagc 2699  T
Q  103 tcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 202  Q
    ||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  2698 tcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 2599  T
Q  203 ggaagctcctagacttgatgtcc 225  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  2598 ggaagctcccagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 162 - 5
Alignment:
Q  9 aggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattg 108  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  162 aggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattg 63  T
Q  109 atcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttcc 166  Q
    |||| |||||| | || |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  62 atcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 568
Alignment:
Q  33 gattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaagctgactttcgaga 132  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  133 ataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 193  Q
    ||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 21675 - 21867
Alignment:
Q  1 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  21675 tgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaa 21774  T
Q  101 actcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 193  Q
     |||||||| || |||||| | |||||  |||| ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  21775 gctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 21867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 221 - 335
Alignment:
Q  19 ctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggaaa 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||| ||||||||    
T  221 ctgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaa 320  T
Q  119 gctgactttcgagaa 133  Q
    ||||||||| |||||    
T  321 gctgacttttgagaa 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1633 times since January 2019
Visitors: 1303