View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0063_2D_low_1 (Length: 1352)

Name: NF0063_2D_low_1
Description: NF0063_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0063_2D_low_1
NF0063_2D_low_1
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (19-1332)||(33814268-33815581)
chr5 (19-855)||(33809826-33810663)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (19-1332)||(368-1681)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (19-1332)||(54968466-54969779)
chr3 (985-1330)||(13563709-13564054)
chr3 (638-1109)||(4283901-4284369)
chr3 (301-584)||(4283592-4283876)
chr3 (1118-1222)||(4285562-4285666)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (19-923)||(4836800-4837704)
chr7 (952-1332)||(4837703-4838083)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (497-1332)||(9754048-9754877)
chr4 (44-349)||(25004482-25004785)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (408-860)||(1129775-1130219)
chr6 (17-110)||(22982393-22982486)
chr6 (17-110)||(23805922-23806015)
chr6 (591-666)||(14089317-14089392)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (565-667)||(74095-74196)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (565-667)||(15725542-15725643)
chr2 (591-666)||(33697303-33697378)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 1230; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 1230; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1332
Target Start/End: Complemental strand, 33815581 - 33814268
Alignment:
Q  19 tcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815581 tcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 33815482  T
Q  119 cggtcattctcaagacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 218  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815481 tgatcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 33815382  T
Q  219 tcttgagatattcttcttgtgacatccacaacattctttttaatcgatctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815381 tcttgagatattcttcttgtgacatccacaacattctttttgatcgatctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 33815282  T
Q  319 agcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataaaagtatgatggac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815281 agcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagatatctttgtcttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataaaagtatgatggac 33815182  T
Q  419 tctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgctgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815181 tctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgttgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 33815082  T
Q  519 ttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctccatatagatttc 618  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33815081 ttggagcctgctttaagccatataaacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaacctttaggttgctccatatagatttc 33814982  T
Q  619 ttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctataccaaggattgctctaatggatgtc 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33814981 ttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctaagtctagttttgcagctagaccaaggattgctctaatggatgtc 33814882  T
Q  719 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacctggggtttgggttgt 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33814881 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacttggggtttgggttgt 33814782  T
Q  819 tctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatgccctttttccatctggtaattttaccaggtcatacgtctcattctcctttagggattt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33814781 tctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatgccctctttccatctggtaattttaccaggtcatacgtctcattctcctttagggattt 33814682  T
Q  919 catctcttcttccatggattgcaaccatttttccttattggttatctctatagcttccatgaagctttgaggttccccttcctcagtgaaatttacatat 1018  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33814681 catctcttcttccatggattgtaaccatttttccttattggttgtctctatagcttccatgaagctttgaggttccccttcctcagtgaaatttacatat 33814582  T
Q  1019 tcacctgagaaatatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcaacatcatcatatgccatct 1118  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33814581 tcacctgagaagtatctttttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcaacatcatcatatgccatct 33814482  T
Q  1119 gctcttcatgcattgcttgattttgttctatctgatcaggctcctccatctgatttggttctgttagctgatcatgatcgtaattcatctgaggaatctc 1218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33814481 gctcttcatgcattgcttgattttgttctatctgatcaggctcctccatctgatttggttctgttagctgatcatgatcgtaattcatctgaggaatctc 33814382  T
Q  1219 tccccttgaattttgcactacaatggtctttggctttttagattgaatgtcgtggatcgtctgatcttcatagaataccacgtctctgcttcgaaccatc 1318  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33814381 tccccctgaattgtgcaccacaatggtctttggctttttagattgaatgtcgtggatcgtctgatcttcatagaataccacgtctctgcttcgaaccatc 33814282  T
Q  1319 ttcttagtagcagg 1332  Q
    ||||||||||||||    
T  33814281 ttcttagtagcagg 33814268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 711; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 33810663 - 33809826
Alignment:
Q  19 tcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810663 tcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 33810564  T
Q  119 cggtcattctcaagacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 218  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810563 tgatcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 33810464  T
Q  219 tcttgagatattcttcttgtgacatccacaacattctttttaatcgatctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810463 tcttgagatattcttcttgtgacatccacaacattctttttgatcgatctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 33810364  T
Q  319 agcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataaaagtatgatggac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810363 agcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagatatctttgtcttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataaaagtatgatggac 33810264  T
Q  419 tctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgctgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810263 tctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgttgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 33810164  T
Q  519 ttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctccatatagatttc 618  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33810163 ttggagcctgctttaagccatataaacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaacctttaggttgctccatatagatttc 33810064  T
Q  619 ttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctataccaaggattgctctaatggatgtc 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33810063 ttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctaagtctagttttgcagctagaccaaggattgctctaatggatgtc 33809964  T
Q  719 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttg-atggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacctggggtttgggttg 817  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  33809963 atcttcaccaccggggaaaacattttttcaaaatcaatgcctttcttttgaagggcaccccttcacaccaattcatgctttgtacttgggggttgggttg 33809864  T
Q  818 ttctcttcagacttg-agtttgaacacccatttattttt 855  Q
     || ||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33809863 -tccctttaaaattgaagtttgaaaacccatttattttt 33809826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 1010; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 1010; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1332
Target Start/End: Complemental strand, 1681 - 368
Alignment:
Q  19 tcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 118  Q
    |||||| |||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1681 tcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccattgcgtacataaggcttcccacagctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 1582  T
Q  119 cggtcattctcaagacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 218  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1581 tggtcattctcaggacattgtgtcttattgagtttcaaatgaccaggtagtggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 1482  T
Q  219 tcttgagatattcttcttgtgacatccacaacattctttttaatcgatctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 318  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1481 tcttgatgtaatcttcttgtgacatccacaacattcttttggaacgatctctaacgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 1382  T
Q  319 agcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataaaagtatgatggac 418  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1381 agcaaaagatttactcaaagctttcttcagagcagctatctttgctttatcttttccgacaataagcatgtcatcaacatacaataagagtatgatggat 1282  T
Q  419 tctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgctgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1281 tctccattttcatagttcttcacaaacacgcaatgatctgttgacgtctttgtgaaactgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 1182  T
Q  519 ttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctccatatagatttc 618  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1181 ttggagcctgcttcaagccatatagactttttttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaatgaaacgttcaggttgctccatatagatttc 1082  T
Q  619 ttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctataccaaggattgctctaatggatgtc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1081 ttcctctaggtctccatgcaagaatgttgttttaacatcaagttgttctatctctaagtctagttttgcagctagaccaaggattgctctaatggatgtc 982  T
Q  719 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacctggggtttgggttgt 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  981 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacgactattcgtgctttgtatctgggatttgggttgt 882  T
Q  819 tctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatgccctttttccatctggtaattttaccaggtcatacgtctcattctcctttagggattt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  881 tctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatgccctctttccatctggtaattttaccaggtcatacgtttcattctcctttagggattg 782  T
Q  919 catctcttcttccatggattgcaaccatttttccttattggttatctctatagcttccatgaagctttgaggttccccttcctcagtgaaatttacatat 1018  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  781 catctcttcttccatggattgcaaccatttttctttattggttgtctctatggcttccatgaagctttgaggttcgccttcctttgtgaagtttacatat 682  T
Q  1019 tcacctgagaaatatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcaacatcatcatatgccatct 1118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  681 tcacctgagaagtatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcatcatcatcatctgccatat 582  T
Q  1119 gctcttcatgcattgcttgattttgttctatctgatcaggctcctccatctgatttggttctgttagctgatcatgatcgtaattcatctgaggaatctc 1218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  581 gctcttcatgcattgcttgattttggtctatctgatcaggctcatccatctgattgggttctgttagctgatcacgatcgtaattcatttgaggaatctc 482  T
Q  1219 tccccttgaattttgcactacaatggtctttggctttttagattgaatgtcgtggatcgtctgatcttcatagaataccacgtctctgcttcgaaccatc 1318  Q
    ||||| |||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |      
T  481 tccccctgaattgtgtaccacaatggcctttggcttattagattgaatgtcgtgtattgtctgatcttcatagaataccacatctcttcttcgaacaagt 382  T
Q  1319 ttcttagtagcagg 1332  Q
    || |||||||||||    
T  381 tttttagtagcagg 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 998; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 998; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1332
Target Start/End: Original strand, 54968466 - 54969779
Alignment:
Q  19 tcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 118  Q
    |||||| |||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54968466 tcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccattgcgtacataaggctacccacagctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 54968565  T
Q  119 cggtcattctcaagacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 218  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54968566 tggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtagtggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 54968665  T
Q  219 tcttgagatattcttcttgtgacatccacaacattctttttaatcgatctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 318  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54968666 tcttgatataatcttcttgtgacatccacaacattcttttagaacgatctctaacgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 54968765  T
Q  319 agcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataaaagtatgatggac 418  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  54968766 agcaaaagatttgctcaaagctttcttgagagcagctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataagagtatgatggat 54968865  T
Q  419 tctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgctgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54968866 tctccattttcatagttcttcacaaacacgcaatgatctgttgacatctttgtgaaatagtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 54968965  T
Q  519 ttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctccatatagatttc 618  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54968966 ttggagcctgttttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaatgaaaccttcaggttgctccatgtagatttc 54969065  T
Q  619 ttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctataccaaggattgctctaatggatgtc 718  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54969066 ttcctctagctctccgtgcaagaatgttgttttaacatcaagttgttctatttctaagtctagttttgcagttagaccaaggattgctctaatggatgtc 54969165  T
Q  719 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacctggggtttgggttgt 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  54969166 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaacgtctttcttttgatggcaccccttcacgactattcgtgccttgtatctgggatttgggttgt 54969265  T
Q  819 tctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatgccctttttccatctggtaattttaccaggtcatacgtctcattctcctttagggattt 918  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  54969266 tctcttcagacttgagtttaaacacccatttatttttcaatgccctctttccatctggtaatttgaccaggtcatacgtgtcattctcctttagggattg 54969365  T
Q  919 catctcttcttccatggattgcaaccatttttccttattggttatctctatagcttccatgaagctttgaggttccccttcctcagtgaaatttacatat 1018  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  54969366 catctcttcttccatggattgcaaccatttttctttattggttgtctctatggcttccatgaagctttgaggttcgccttcctcggtgaagtttacatat 54969465  T
Q  1019 tcacctgagaaatatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcaacatcatcatatgccatct 1118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  54969466 tcacctgagaagtatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcatcatcatcatctgccatat 54969565  T
Q  1119 gctcttcatgcattgcttgattttgttctatctgatcaggctcctccatctgatttggttctgttagctgatcatgatcgtaattcatctgaggaatctc 1218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  54969566 gctcttcatgtattgcttgattttggtctacctgatcaggctcatccatctgattgggttctgttagctgatcacgatcataattcatttgaggaatctc 54969665  T
Q  1219 tccccttgaattttgcactacaatggtctttggctttttagattgaatgtcgtggatcgtctgatcttcatagaataccacgtctctgcttcgaaccatc 1318  Q
    ||||| |||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |      
T  54969666 tccccctgaattgtgtaccacaatggcctttggcttattagattgaatgtcgtggattgtctgatcttcatagaataccacatctctacttcgaacaagt 54969765  T
Q  1319 ttcttagtagcagg 1332  Q
    || |||||||||||    
T  54969766 tttttagtagcagg 54969779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 985 - 1330
Target Start/End: Original strand, 13563709 - 13564054
Alignment:
Q  985 ttgaggttccccttcctcagtgaaatttacatattcacctgagaaatatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgt 1084  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13563709 ttgaggttcgccttccttagtgaagtttacatattcacctgagaagtatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgt 13563808  T
Q  1085 tccatctcaacatcaacatcatcatatgccatctgctcttcatgcattgcttgattttgttctatctgatcaggctcctccatctgatttggttctgtta 1184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13563809 tccatctcaacatcatcatcatcatctgccatatgctcttcatgcattgcttgattttggtctatctgatcaggctcatccatctgattgggttctgtta 13563908  T
Q  1185 gctgatcatgatcgtaattcatctgaggaatctctccccttgaattttgcactacaatggtctttggctttttagattgaatgtcgtggatcgtctgatc 1284  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13563909 gctgatcacgatcgtaattcatttgaggaatctctccccctgaattgtgtaccacaatggcctttggcttattagattgaatgtcgtgaattgtctgatc 13564008  T
Q  1285 ttcatagaataccacgtctctgcttcgaaccatcttcttagtagca 1330  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13564009 ttcatagaataccacatctctgcttcgaacaagtttcttagtagca 13564054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 638 - 1109
Target Start/End: Original strand, 4283901 - 4284369
Alignment:
Q  638 aagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctataccaaggattgctctaatggatgtcatcttcaccaccggtgaga 737  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4283901 aagaatgcagttttaacattaatttgttctatctctaagtctaaatttgcagttataccaaggatttctctaatggatgtcatcttcatcactggtgaga 4284000  T
Q  738 atatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacctggggtttgggttgttctcttcagacttgagttt 837  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  4284001 atttttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcattccttcacgac---tcgtgctttgtacctagggtttgagttgttctattcagacatgagctt 4284097  T
Q  838 gaacacccatttatttttcaatgccctttttccatctggtaattttaccaggtcatacgtctcattctcctttagggatttcatctcttcttccatggat 937  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||    
T  4284098 gaacacccgtttatttttcaatgccctatttccattcagtaattttaccaagtcatatgtttggttctcctttagggatggcatttcttcttgaatgcat 4284197  T
Q  938 tgcaaccatttttccttattggttatctctatagcttccatgaagctttgaggttccccttcctcagtgaaatttacatattcacctgagaaatatcttc 1037  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||| || ||||  |||||| || ||      
T  4284198 tgcagccatttttgcttattggttgtctctatggcttccatgatgctttgaggttccctttcattagtaaaatttatattttcatgtgagaagtaactct 4284297  T
Q  1038 ttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcaacatcatcat 1109  Q
    ||| || | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4284298 ttgttgatcgtctagatcttgttgatcttcttaatagaggttcttgttccatctcatcatcaccatcatcat 4284369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 301 - 584
Target Start/End: Original strand, 4283592 - 4283876
Alignment:
Q  301 tgcacccaaatccttcatagcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatac 400  Q
    |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |  |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||    
T  4283592 tgcacctagatctttcataacaaaagatttgctcaatgccttcttgatagcaattatcttggtcttatctttcccaacaacaaccatatcgtcaacatac 4283691  T
Q  401 aataaaagtatgatggactctccattttcatagttct-tcacaaacacacaatggtctgctgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatca 499  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  4283692 aacaaaattatgatggattctccatttccatagttttatcacaaacacatagtggtttgctgatgtctttgtgaaattgtgttgggtcatgaagtgatcg 4283791  T
Q  500 aacttcttgtaccattgtcttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggtt 584  Q
     ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  4283792 tacttcttgtaccattattttggaacatgctttaagccatatagacttttcttcaagcaacacataagatgttctttgtctggtt 4283876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1118 - 1222
Target Start/End: Original strand, 4285562 - 4285666
Alignment:
Q  1118 tgctcttcatgcattgcttgattttgttctatctgatcaggctcctccatctgatttggttctgttagctgatcatgatcgtaattcatctgaggaatct 1217  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| || ||||| ||| |||| || |  |||||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  4285562 tgctcttcctgcattgcttggttttgttatatgtgatcaagctacttcatcttattgggttgtgctttctgatcacaatcgttattcatttgaggaatct 4285661  T
Q  1218 ctccc 1222  Q
    |||||    
T  4285662 ctccc 4285666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 725; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 725; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 923
Target Start/End: Original strand, 4836800 - 4837704
Alignment:
Q  19 tcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctct 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4836800 tcctacaacataaccgatgtctggcctcgtgtagaccatggcgtacataaggctacccacagctgaagaatagggaaccttgctcatttcttctttctct 4836899  T
Q  119 cggtcattctcaagacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 218  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4836900 tggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaatgaccaggtagtggaacatgcataggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactt 4836999  T
Q  219 tcttgagatattcttcttgtgacatccacaacattctttttaatcgatctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 318  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837000 tcttgatataatcttcttgtgacatccacaacattcttttagaacgatctctaacgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcat 4837099  T
Q  319 agcaaaagatttgctcaatgctttcttgagagcagctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataaaagtatgatggac 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4837100 agcaaaagatttgctcaaagctttcttgagagcatctatctttgctttatcttttccaacaataagcatatcatcaacatacaataagagtatgatggat 4837199  T
Q  419 tctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgctgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837200 tctccattttcatagttcttcacaaacacgcaatgatctgttgacgtctttgtgaaattgtgttgggtcatgaagagatcaaacttcttgtaccattgtc 4837299  T
Q  519 ttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctccatatagatttc 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4837300 ttggagcctgctttaagccatatagaattttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaatgaaaccttcaggttgctccatgtagatttc 4837399  T
Q  619 ttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctataccaaggattgctctaatggatgtc 718  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4837400 ttcctctaggtctccgtgcaagaatgttgttttaacatcaagttgttctatttctaagtctagttttgcagctagaccaaggattgctctaatggatgtc 4837499  T
Q  719 atcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacctggggtttgggttgt 818  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  4837500 atcctcaccactggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttctttcgatggcaccccttcacgactatttgtgctttgtatatgggatttgggttgt 4837599  T
Q  819 tctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatgccctttttccatctggtaattttaccaggtcatacgtctcattctcctttagggattt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4837600 tctcttcagacttgagtttgaacacccacttgtttttcaacgccctctttccatctggtaattttaccagatcatacgtctcattctcctttagggattg 4837699  T
Q  919 catct 923  Q
    |||||    
T  4837700 catct 4837704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 952 - 1332
Target Start/End: Original strand, 4837703 - 4838083
Alignment:
Q  952 cttattggttatctctatagcttccatgaagctttgaggttccccttcctcagtgaaatttacatattcacctgagaaatatcttcttgatggttgtcta 1051  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  4837703 cttattggttgtctctatggcttccatgaagctttgaggttccccttcctcagtgaagtttacatattcaactgagaagtatctttttgatgtttgtcta 4837802  T
Q  1052 gatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaacatcaacatcatcatatgccatctgctcttcatgcattgcttgattttgttctatct 1151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4837803 gatctcgttgatcttctcagttgaggttcttgtaccatctcaacatcatcaccatcatctgccatatgctcttcatgcattgcttgattttggtctatct 4837902  T
Q  1152 gatcaggctcctccatctgatttggttctgttagctgatcatgatcgtaattcatctgaggaatctctccccttgaattttgcactacaatggtctttgg 1251  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| | ||||||    
T  4837903 gatcaggctcatccatctgattgggttatgttagctgatcacgatcgtaattcatttgaggaatctctccccctgaattgtgtaccacaatcgcctttgg 4838002  T
Q  1252 ctttttagattgaatgtcgtggatcgtctgatcttcatagaataccacgtctctgcttcgaaccatcttcttagtagcagg 1332  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4838003 cttattagattgaatgtcgtggattgtctgatcttcatagaataccacatctctgcttcgaacaaacttcttagtagcagg 4838083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 645; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 497 - 1332
Target Start/End: Original strand, 9754048 - 9754877
Alignment:
Q  497 tcaaacttcttgtaccattgtcttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaacctt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9754048 tcaaacttcttgtaccattgtcttggagcctgcttcaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttatttgcctggttcaatgaaacctt 9754147  T
Q  597 caggttgctccatatagatttcttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctatacc 696  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  9754148 caggttgctccatgtagatttcttcctctaggtctccgtgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctaagtctagttttgcagctagacc 9754247  T
Q  697 aaggattgctctaatggatgtcatcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgct 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9754248 aaggattgctctaatggatgtcatcttccccaccgatgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacgactattcgtgct 9754347  T
Q  797 ttgtacctggggtttgggttgttctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatgccctttttccatctggtaattttaccaggtcatacg 896  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9754348 ttgtatctgggatttgggttgttctcttcagacttaagtttgaacacccatttatttttcaatgccctctttccatttggcaattttaccaggtcatacg 9754447  T
Q  897 tctcattctcctttagggatttcatctcttcttccatggattgcaaccatttttccttattggttatctctatagcttccatgaagctttgaggttcccc 996  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9754448 tctcattctcctttagggattgcatctcttcttccatggattacaaccatttttctttattggttgtctctatggcttccatgaagctttgaggttcccc 9754547  T
Q  997 ttcctcagtgaaatttacatattcacctgagaaatatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatctcaaca 1096  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  9754548 ttcctcagtgaagtttacatattcacctgagaagtatcttcttgatggttgtctagatctcgttgatcttctcaattgaggttcttgttccatc------ 9754641  T
Q  1097 tcaacatcatcatatgccatctgctcttcatgcattgcttgattttgttctatctgatcaggctcctccatctgatttggttctgttagctgatcatgat 1196  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  9754642 tcaacatcctcatctgccatctgctcttcatgcattgcttgattttggtctatatgatcaggctcatccatctgattgggttctgttagctgatcacgat 9754741  T
Q  1197 cgtaattcatctgaggaatctctccccttgaattttgcactacaatggtctttggctttttagattgaatgtcgtggatcgtctgatcttcatagaatac 1296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9754742 cgtaattcatctgaggaatctctccccctgaattgtgtaccacaatggcctttggcttattagattgaatgtcgtggattgtctaatcttcatagaatac 9754841  T
Q  1297 cacgtctctgcttcgaaccatcttcttagtagcagg 1332  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9754842 cacatctctgcttcgaacaagcttcttagtagcagg 9754877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 349
Target Start/End: Original strand, 25004482 - 25004785
Alignment:
Q  44 ctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctctcggtcattctcaagacattgtgtct 143  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||| |||| | ||  | |||||||||||| ||| ||||||||   ||| ||| |  ||    
T  25004482 ctcgtgcaaaccatgacatacgtaagactatccacaactgaagaagagggaaactaacccatttcttctttttcttggtcattccgtagatattat--ct 25004579  T
Q  144 tactgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttcttgagatattcttcttgtgacat 243  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || ||| |||| ||||||| |||||| |||| | |||| |||  |||||| ||||||    
T  25004580 tactaagtttcaaatgaccag-tagtggaacatgcacaagtggtgtattttgcacgttgaacatttcaaaaactgttttgatataaacttcttttgacat 25004678  T
Q  244 ccacaacattctttttaatcg--atctctaatgatcttcattccaagaatcttcttcactgcacccaaatccttcatagcaaaagatttgctcaatgctt 341  Q
    |||||||||| ||||  | ||  |||| ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||  |    
T  25004679 ccacaacattattttagaacgatatctttaacgattttcatt-taagaattttcttcactgcacccatgtttttcatagcaaaagatttggtcaatgtct 25004777  T
Q  342 tcttgaga 349  Q
    ||||||||    
T  25004778 tcttgaga 25004785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 207; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 408 - 860
Target Start/End: Original strand, 1129775 - 1130219
Alignment:
Q  408 gtatgatggactctccattttcatagttcttcacaaacacacaatggtctgctgacgtctttgtgaagttgtgttgggtcatgaagagatcaaacttctt 507  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | || | ||||||    |||||||||| || || |||||||||||||||||||    ||| ||    
T  1129775 gtatgatggattctccatttttatagttcttcaaaatctcatagtggtct----acgtctttgttaaattatgttgggtcatgaagagattgttcttatt 1129870  T
Q  508 gtaccattgtcttggagcctgctttaagccatatagacttttcttcaagcgacacacaaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctcc 607  Q
     || |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1129871 ttatcattatcttggagcttgctttaagccatataaaattttcttcaagcaacacacatggtattcattgcttggttctacaaaaccttcaggttgctcc 1129970  T
Q  608 atatagatttcttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttctatctctgagtctagttttgcagctataccaaggattgctc 707  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    |||||||||   ||    
T  1129971 atatagatttcttcttctaggtcttcatgcaagaatgatgttttaacatcaagttgttctatctgtaagtctagttttgaag----accaaggatctatc 1130066  T
Q  708 taatggatgtcatcttcaccaccggtgagaatatttcttcaaaatcaatgcctttcttttgatggcaccccttcacaacaattcgtgctttgtacctggg 807  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  1130067 taatggatgtcatttacaccaccgatgagaatatttcttcaaaatcattgcctttattttgatggcgccccttagcgacaattcgtgctttgtacccggg 1130166  T
Q  808 gtttgggttgttctcttcagacttgagtttgaacacccatttatttttcaatg 860  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1130167 gttcaacttgttctcttcagacttgagtttgaacatccaattatttttcaatg 1130219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 22982393 - 22982486
Alignment:
Q  17 attcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttctt 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22982393 attcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccaatgcgtacataaggctacccacaacagaagaatagggcaccttgctcatttctt 22982486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23806015 - 23805922
Alignment:
Q  17 attcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttctt 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23806015 attcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccaatgcgtacataaggctacccacaacagaagaatagggcaccttgctcatttctt 23805922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 666
Target Start/End: Original strand, 14089317 - 14089392
Alignment:
Q  591 aaccttcaggttgctccatatagatttcttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttc 666  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14089317 aaccctcaggttgatacatatatatttcctcgtctaagtctccatgcaagaaggctgtcttcacatctagttgttc 14089392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 63; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 565 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 74196 - 74095
Alignment:
Q  565 aaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctccatatagatttcttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  74196 aaggtgttctttgcctggttcaatgaaaccttcaggttattctatatagatttcttcctttaagtctccatgaaagaatg-ttttttaacatcaagttgt 74098  T
Q  665 tct 667  Q
    |||    
T  74097 tct 74095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 63; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 565 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15725643 - 15725542
Alignment:
Q  565 aaggtgttctttgcctggttcaacgaaaccttcaggttgctccatatagatttcttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  15725643 aaggtgttctttgcctggttcaatgaaaccttcaggttattctatatagatttcttcctttaagtctccatgaaagaatg-ttttttaacatcaagttgt 15725545  T
Q  665 tct 667  Q
    |||    
T  15725544 tct 15725542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 33697378 - 33697303
Alignment:
Q  591 aaccttcaggttgctccatatagatttcttcctctaggtctccatgcaagaatgctgttttaacatcaagttgttc 666  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  33697378 aaccctcaggttgatacatatatatttcctcgtctaagtctccatgcaagaaggctgtcttcacatctagttgttc 33697303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

SLOT GACOR - FITUR MAXWIN GAMPANG SCATTER HITAM DI LINK SLOT MAXWIN HARI INI

SLOT GACOR - FITUR MAXWIN GAMPANG SCATTER HITAM DI LINK SLOT MAXWIN HARI INI

Main Slot gacor sambil tembak langit pasti di link slot maxwin hari ini , daftar yuk id mu sekarang !!

Auroratoto & Situs Gacor Terpercaya

Maxi188, Hanomantoto, Togeljackpot, Wukong778

Auroratoto2 kami jamin akan bayar kemenangan Anda! Bergabung sekarang di Auroratoto, Maxi188, Hanomantoto, Togeljackpot, dan Wukong778 untuk pengalaman slot dan togel gacor dengan jackpot besar!

>
Rp.10.000
100% Tanpa Potongan
Kuantitas
Dijual oleh

Layanan Pelanggan

Jelajahi Lazada

Go where your heart beats
Download the App

Metode Pembayaran

Jasa Pengiriman

Lazada Logistics JNE Ninja Express GoSend Sicepat Grab Parcel J & T anter SAP

Verified by

ISO
PCI DSS

Lazada Southeast Asia

Follow Us

fb linkin yt pnt ins tw tiktok Lazada Blg
© Lazada 2024
Visitors: 7375