View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0070-INSERTION-2 (Length: 475)

Name: NF0070-INSERTION-2
Description: NF0070
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0070-INSERTION-2
NF0070-INSERTION-2
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (19-475)||(26549732-26550193)
chr5 (19-475)||(28563939-28564400)
chr5 (19-475)||(19687676-19688139)
chr5 (19-475)||(30762919-30763379)
chr5 (19-475)||(2454922-2455385)
chr5 (19-468)||(22938704-22939156)
chr5 (32-211)||(35382240-35382418)
chr5 (19-394)||(2838285-2838667)
chr5 (19-469)||(21333993-21334447)
chr5 (301-465)||(35382437-35382599)
chr5 (121-469)||(34134618-34134971)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (19-475)||(4059-4520)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (19-475)||(9156435-9156897)
chr3 (19-243)||(30159640-30159866)
chr3 (19-463)||(22995193-22995636)
chr3 (19-457)||(18540785-18541222)
chr3 (19-469)||(19302969-19303426)
chr3 (121-433)||(10961411-10961727)
chr3 (121-433)||(10964920-10965236)
chr3 (19-469)||(2776947-2777397)
chr3 (19-469)||(28328812-28329264)
chr3 (95-468)||(24126953-24127327)
chr3 (95-468)||(13556568-13556942)
chr3 (121-469)||(22025723-22026076)
chr3 (19-469)||(7831725-7832181)
chr3 (128-393)||(12541782-12542050)
chr3 (19-465)||(47052894-47053344)
chr3 (128-469)||(10882942-10883286)
chr3 (95-468)||(55033344-55033722)
chr3 (123-466)||(36534425-36534771)
chr3 (213-469)||(15196933-15197192)
chr3 (121-172)||(15196861-15196912)
chr3 (19-75)||(10883336-10883392)
chr3 (19-75)||(22026119-22026175)
chr3 (19-56)||(13558253-13558290)
chr3 (19-56)||(15196761-15196798)
chr3 (19-75)||(10961763-10961819)
chr3 (19-75)||(10965272-10965328)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (19-475)||(8652-9102)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (19-470)||(31983043-31983500)
chr8 (19-465)||(22223931-22224377)
chr8 (19-465)||(22230273-22230719)
chr8 (19-468)||(33878892-33879337)
chr8 (291-472)||(39658599-39658776)
chr8 (19-468)||(12584386-12584838)
chr8 (121-469)||(38250079-38250432)
chr8 (95-394)||(23945536-23945837)
chr8 (128-469)||(17929195-17929543)
chr8 (123-468)||(23645206-23645557)
chr8 (129-466)||(25593298-25593640)
chr8 (19-77)||(17929563-17929621)
chr8 (415-469)||(23945837-23945890)
chr8 (183-295)||(39658464-39658581)
chr8 (19-75)||(23645603-23645659)
chr8 (123-159)||(7945935-7945971)
chr8 (19-75)||(22175536-22175592)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (19-470)||(225401-225858)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (19-475)||(32111177-32111639)
chr6 (19-465)||(21632485-21632932)
chr6 (19-465)||(25978252-25978699)
chr6 (19-475)||(14967708-14968166)
chr6 (28-433)||(7836161-7836569)
chr6 (34-469)||(23841155-23841594)
chr6 (19-469)||(22959085-22959539)
chr6 (19-469)||(23828853-23829307)
chr6 (19-467)||(28109234-28109686)
chr6 (19-469)||(23380467-23380919)
chr6 (128-469)||(18139656-18140002)
chr6 (19-375)||(11127213-11127576)
chr6 (19-469)||(12744883-12745336)
chr6 (19-394)||(12981809-12982188)
chr6 (95-469)||(24408461-24408839)
chr6 (128-269)||(25455747-25455890)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (19-472)||(49717750-49718208)
chr1 (121-450)||(22454979-22455314)
chr1 (121-469)||(21020090-21020443)
chr1 (19-242)||(45939765-45939985)
chr1 (19-75)||(21019990-21020046)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (32-310)||(16222354-16222637)
chr7 (19-469)||(9274636-9275094)
chr7 (32-277)||(13810964-13811209)
chr7 (19-468)||(45288776-45289226)
chr7 (19-469)||(26137386-26137838)
chr7 (95-469)||(22255365-22255743)
chr7 (121-469)||(22231022-22231374)
chr7 (19-469)||(4543851-4544303)
chr7 (19-475)||(20594801-20595259)
chr7 (19-75)||(22255761-22255817)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (19-277)||(26061411-26061669)
chr4 (19-468)||(39499811-39500259)
chr4 (19-468)||(49638108-49638561)
chr4 (19-468)||(27678601-27679051)
chr4 (19-468)||(19825699-19826151)
chr4 (19-469)||(5671940-5672391)
chr4 (19-421)||(15161320-15161726)
chr4 (95-469)||(56196908-56197288)
chr4 (121-469)||(19861903-19862258)
chr4 (19-468)||(3799436-3799887)
chr4 (19-125)||(53894752-53894857)
chr4 (19-269)||(15432639-15432889)
chr4 (413-469)||(15403781-15403836)
chr4 (286-328)||(22091675-22091717)
chr4 (122-186)||(22091463-22091527)
chr4 (435-475)||(22091818-22091858)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (19-468)||(1695-2145)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (19-151)||(11058275-11058407)
chr2 (19-465)||(31429063-31429509)
chr2 (19-465)||(16789052-16789498)
chr2 (19-469)||(25872126-25872577)
chr2 (121-469)||(25958111-25958461)
chr2 (95-469)||(24236455-24236833)
chr2 (121-468)||(1505045-1505397)
chr2 (19-468)||(13973447-13973896)
chr2 (121-469)||(45455223-45455576)
chr2 (19-330)||(9186976-9187294)
chr2 (410-469)||(9187352-9187410)
chr2 (121-186)||(11186510-11186575)
chr2 (19-75)||(25958012-25958068)
chr2 (19-75)||(30151016-30151072)
chr2 (19-56)||(45455639-45455676)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (95-451)||(1295-1655)
[»] scaffold0321 (2 HSPs)
scaffold0321 (95-468)||(4549-4930)
scaffold0321 (19-56)||(4474-4511)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (19-469)||(10673-11127)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (95-469)||(27353-27731)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (121-469)||(111651-112005)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (200-469)||(21422-21694)
scaffold0214 (19-170)||(25940-26089)
scaffold0214 (19-172)||(11915-12066)
[»] scaffold0048 (3 HSPs)
scaffold0048 (121-469)||(27175-27528)
scaffold0048 (121-469)||(13919-14276)
scaffold0048 (19-153)||(23316-23448)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (121-469)||(27403-27758)
scaffold0084 (19-75)||(27801-27857)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (19-239)||(49938-50158)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (213-468)||(12673-12932)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (213-469)||(96998-97253)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (95-469)||(61175-61550)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (338-468)||(294387-294516)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (19-56)||(99762-99799)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26550193 - 26549732
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26550193 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacacagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 26550094  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26550093 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggcacaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaagg 26549994  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26549993 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 26549894  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26549893 tctatataagtaaattgaaaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacacttcg 26549794  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26549793 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaaacaatt 26549732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Original strand, 28563939 - 28564400
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28563939 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacacagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 28564038  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28564039 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaagcctaccggcacaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaagg 28564138  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28564139 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 28564238  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28564239 tctatataagtaaattgaaaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacacttcg 28564338  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28564339 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaaacaatt 28564400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19688139 - 19687676
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgttt-agcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688139 aattccaataacaaccccaaacttattgttttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctc 19688040  T
Q  118 aatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19688039 aatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaagtcagggtaggcttgaaaag 19687940  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19687939 gctcacatgaccaaacacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatttagttgcacggaaca 19687840  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatg-ttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  19687839 ctctatataagtaaattgaaaaaaataaaatttggctataaaccttacaatgtttagatttctgggagttgagactacctataacacatgtcgtacactt 19687740  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19687739 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 19687676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 30763379 - 30762919
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30763379 aattccgaaagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataacatttttgggtcaaatcgtaaaagtccctaggctca 30763280  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30763279 atatgtagcttgtcaccgaataaaaagatctaaacttaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggctggaaaagg 30763180  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatca-----acagtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30763179 ctcacaagaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcaatggtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 30763080  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    ||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30763079 tctatataagtaaatt-aaaaaaataaaatatggctatgaaccttacagtgttagatttcagggaattgcaactacctatcacacatgccatacacttcg 30762981  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30762980 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 30762919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 2455385 - 2454922
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2455385 aattccaaaagcaaccccaaacttattcttcagcaacaccctacatagcctaactcaaatataacattttttggtcaaattctaaaagtctctaggctca 2455286  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa-ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  2455285 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggatttcaaaaaggataaatttcaattagaatcagggtaggcttcaaaag 2455186  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2455185 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatgtgacaaagatcaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaaca 2455086  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaa-atttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2455085 ctctatataagtaaattgaaaaaaacaaatatttggctatgaaccttacgctgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgccgtacactt 2454986  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2454985 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 2454922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 22938704 - 22939156
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  22938704 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 22938799  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-ga 213  Q
        |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||  | |||||  || | ||||||||||||  |    
T  22938800 tgtaatgtagtttgtcaccgtacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggc-taaaaaaatgataatatttcaaataataacagggtaggcttcaa 22938898  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatca----acagtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||    | || || | |||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  22938899 aaaggctcacaggaccatgcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 22938998  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtac 407  Q
    ||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||    
T  22938999 acactctttataagtaaattg-gaaaaataaaatttggctatgaaccttaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttaactgccgtac 22939095  T
Q  408 gcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22939096 acttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 22939156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 35382240 - 35382418
Alignment:
Q  32 accccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  35382240 accccaaacttattgtttagcaacaccctgcttagccaaactcaaatataacatttt-gggttaaatcctaaaagtctctacgctaaatatgtagtttgt 35382338  T
Q  132 caccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||    
T  35382339 caccgaacaaaaagatctaaacataccggctcaatttggctttcaaaaaggataatttcaaattaaataagggtaggctt 35382418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 394
Target Start/End: Original strand, 2838285 - 2838667
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||  | |||||||| |||||| ||||| |||  ||||| |||||||| ||| | |      
T  2838285 aattccaatagcaacccaaaacttattatttagcaacattctacaatgtctaactcagatataacatttt-gggaaaaatcataaaagtctctaagtttg 2838383  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| |  |||| | ||||||||||||||| |||     
T  2838384 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctatcggctcaatttggctta-aaacaggataaaatatcaattataatcagggtaggcttcaaac 2838482  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaac 311  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||     ||| ||||| |||||||||| | |  || | |||||    
T  2838483 ggctcacagaaccaagcacttttgtctcaatgtgtatatgacaaagattaatcgacagtaaagaaacgatgcaagttctagaaatgcacatgaatggaac 2838582  T
Q  312 actctatataagtaaattg--nnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc 394  Q
    ||||| |||||||||||||         ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2838583 actctttataagtaaattgaaaaaaaaataaaaattggccatgaaccttatagtgttagatttctgggagttgtgactacctatc 2838667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 21333993 - 21334447
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||| | ||| |||    
T  21333993 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagcctctaagct 21334088  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaa-ggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttga 213  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||   ||| |  || | |||||||||||| |    
T  21334089 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccgcctcaaattagctaaaaaaaaaggataatatttcgaataataacagggtaggcttca 21334188  T
Q  214 aaa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacg 307  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||     | | |||| |||||| ||| |||  |||| |    
T  21334189 aaaaggctcacaggaccaatcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacaatagagaaaaattgcaagttctaaaaatgtaaatgcatg 21334288  T
Q  308 gaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgta 406  Q
    ||||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || |||| ||    
T  21334289 gaacactctttagaagtaaattggaaaa--taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccata 21334385  T
Q  407 cgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | |||||| || |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21334386 cacttcgcattagaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacctcttgaacaa 21334447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 301 - 465
Target Start/End: Original strand, 35382437 - 35382599
Alignment:
Q  301 ttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacat 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35382437 ttgcacggaacactctatatatgtaaattgaaaaa--taaaatttgcctatgaaacttacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatat 35382534  T
Q  401 gccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
    |  |||| ||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35382535 gttgtacactttgcctttgaatttcaagttactccctccttatgaacttttggaataccacttga 35382599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Original strand, 34134618 - 34134971
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||| |||||     
T  34134618 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccagctcaatttggctaa-agaaaggataaaatttcaaa-acaatcagggtaggcttcaaaagg 34134715  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     || | |||| ||||||||||  ||  |||| |||||||    
T  34134716 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatataaatgcatggaacac 34134815  T
Q  314 tctatataagtaaatt-gnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacac-atgccgtacgct 410  Q
    ||| || ||||||||| |        ||||| |||| |||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  |||||||| ||    
T  34134816 tctttagaagtaaattggaaaaaaaaaaaatatggccatgaacctgaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttcgctgccgtacact 34134913  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | |||||  ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34134914 ttgccttcaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 34134971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4520 - 4059
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4520 aatttcaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtcc-taggctca 4422  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4421 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaatctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaagg 4322  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4321 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctataaatgtagttgcacggaacac 4222  T
Q  314 tctatataagtaaattg--nnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4221 tctatataattaaattgaaaaaaaaataaaatttggctatgaaccttacggtgtt-gatttctgagagttgagactacctatcacacatgccgtacactt 4123  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4122 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgattttttggaataccacttgaacaagcaatt 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9156897 - 9156435
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatattttt--gggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9156897 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 9156798  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9156797 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaatatcagggtaggcttgaaaa 9156698  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaac 311  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||    
T  9156697 ggctcacaggaccgagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaattaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatctagttgcagagaac 9156598  T
Q  312 actctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||||||||  |||       |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9156597 actctatataagtattttg-aaaaaataaaatttggctatgaaccttaaagtgttagatttatgggagttgcgactacctatcacacatgtcgtacgctt 9156499  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9156498 cgcctttgaaatacaagtcacgacctccttatgtacttttggaataccacttgaacaaacaatt 9156435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Original strand, 30159640 - 30159866
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttt--tgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30159640 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 30159739  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30159740 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 30159839  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcct 243  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  30159840 ggctcacagaaccaagcacttttgcct 30159866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 22995193 - 22995636
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||| || || ||||| || |||||||      
T  22995193 aattccaaaagcaacctcaaacttattgtttagcaacaccctacttagcctaactaaaaaataa-atctttgggttaattc-taaaattctctaggcttc 22995290  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||     
T  22995291 atatgtagtttgtcaacgaacaaaaagatttaaacctaccggttcaatttggatttcaaaaaggataaattcaaataaaatcagggtaagctt-caaagg 22995389  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||     || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22995390 ctcaaatgaccaagcac-tttgcctcagtgtgtaaatgacaaaaaccaatcaacattaaagaaacaatgcaagttcttgaaatgtagttgcacggaacac 22995488  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
     ||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  22995489 actatataagtaaattg--aaaaataaaatctggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatatgccgtacactttg 22995586  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccactt 463  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22995587 cctttgaatttcaagtcacttcctccttatgaacttttggaatatcactt 22995636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18541222 - 18540785
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| | | ||||| |    
T  18541222 aatttcaatagcaaccccaaacttattgtttagctacaccctacatagc-taactcaaatacaat-tttttaggtcaattcctaaaagactcaaggctta 18541125  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
      |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||| |     
T  18541124 taatgtagtttgtcactaaacaaaaaaatctaaacctatcggctcaaattggttttcaaaactgataactttaattaaaatcaaggtaggcttcaaagg- 18541026  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaa-----caatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18541025 ctcacatgaccaagcacttttacctcaatgtgtaaatgacaaagaccaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 18540926  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| | |  | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18540925 tctatataagtaaattg--aaaattaaaatttggctatgaaccttatagtcat-gatatctgggagttgtgactaccgatcacacatgccgtacacttcg 18540829  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaata 457  Q
    ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  18540828 cctttgagattcaagtcaatacttccatatgaacttttggaata 18540785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 19302969 - 19303426
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  |||||||||| || ||| ||||  |||| || | ||||||||| |||||||      
T  19302969 aattccaatagcaaccccaaacttattatt-agcaacattctacaatgcctaactcagatgtaacattt--gggttaatttctaaaagtctctaggcttc 19303065  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaag-atctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt----caatcaaaatcagggtaggcttga 213  Q
    |  ||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |    |||| |||| |||||||||||| |    
T  19303066 acttgtaatttgccaccgaacaaaaaggacctaaacctactggctcaatttggctt--aaaaaggataaaatataacaattaaaagcagggtaggcttca 19303163  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||     |||||||| |||||||||| ||||||||| |     
T  19303164 aaaggctcataggacaaagcacttttgcctcagtctgtatatgacaaagaccaatcaacagtagagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcatga 19303263  T
Q  309 aacactctatataagtaaa-ttgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgta 406  Q
    |||||| |||||||||||| |||       ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | |||||    
T  19303264 aacactttatataagtaaaattgaaaaaaataaaatttggccatgaaacttacagtgttagatttatgggagttgtgactacctatctcgcactaccgta 19303363  T
Q  407 cgcttcgcctttgaaata-caagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | | || |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303364 cacctcacctttgaaatattaagtcact-cctccttatgaacttttggaataccatttgaacaa 19303426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10961727 - 10961411
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||  ||||     
T  10961727 atgtagtttatcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctttcaaaaaggataaatttcaaatcataatcagggtaggctt-caaagg 10961629  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10961628 ctcacaggaccaagcac-tttgcctcaatgtgtaaatgacatagatcaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 10961530  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgcttc 412  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||  |||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||   |  ||||||||  |||    
T  10961529 tctatataagtaaattg--aaaaataaaatttggtcatgaaccttacagtattagatttttgtgagttgtgactacctatctttaattgccgtacatttc 10961432  T
Q  413 gcctttgaaatacaagtcact 433  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10961431 gcctttgaaacacaagtcact 10961411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10965236 - 10964920
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||  ||||     
T  10965236 atgtagtttatcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctttcaaaaaggataaatttcaaatcataatcagggtaggctt-caaagg 10965138  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10965137 ctcacaggaccaagcac-tttgcctcaatgtgtaaatgacatagatcaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 10965039  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgcttc 412  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||  |||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||   |  ||||||||  |||    
T  10965038 tctatataagtaaattg--aaaaataaaatttggtcatgaaccttacagtattagatttttgtgagttgtgactacctatctttaattgccgtacatttc 10964941  T
Q  413 gcctttgaaatacaagtcact 433  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10964940 gcctttgaaacacaagtcact 10964920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 2777397 - 2776947
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  2777397 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaatac----gggataaatcctaaaagtctctaagct 2777302  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||   |||||  || | |||||||||||| ||    
T  2777301 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggcta--aaaaaagataatatttcaaataataacagggtaggcttcaa 2777204  T
Q  215 aa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |     | | |||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  2777203 aaaggctcacatgaccaagcacttttgcctcagtgtgcatatgacaa-gatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaagtgcatgg 2777105  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    |||||||| || |||||||||        ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||    
T  2777104 aacactctttaaaagtaaatt--tgaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgagactacctatctttcactgccgtac 2777008  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2777007 acttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 2776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28329264 - 28328812
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | || |     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  28329264 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaaaaa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 28329169  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||| ||    
T  28329168 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaaggataaaatttcaaa-acaatcagggtaggcttcaa 28329071  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     || || | |||| |||||||||  |||  |||| |||    
T  28329070 aaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaattgtaaatgcatgga 28328971  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   || || |||||    
T  28328970 acactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttcactgtcgtac 28328873  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     |||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28328872 acttcgcctttgaaacacaagtcgct-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 28328812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24127327 - 24126953
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||||||||||  |||||    
T  24127327 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccagctcaatttggctaa-agaaaggataaaatttcaa 24127229  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgt 287  Q
      | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |     | | |||| ||    
T  24127228 a-acaatcagggtaggctc-aaaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagt 24127131  T
Q  288 tctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgact 387  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||  | |||||||||        ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  24127130 tctagaaatgtaaatgcatggaacactcttaagaagtaaatt--tgaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgttact 24127034  T
Q  388 acctatcacaca-tgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||   || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24127033 acctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 24126953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13556942 - 13556568
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||||||||||  |||||    
T  13556942 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccagctcaatttggctaa-agaaaggataaaatttcaa 13556844  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgt 287  Q
      | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |     | | |||| ||    
T  13556843 a-acaatcagggtaggctc-aaaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagt 13556746  T
Q  288 tctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgact 387  Q
    | |||||| |||  |||| ||||||||||  | |||||||||        ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  13556745 tatagaaatgtaaatgcatggaacactcttaagaagtaaatt--tgaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgttact 13556649  T
Q  388 acctatcacaca-tgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||   || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13556648 acctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 13556568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22026076 - 22025723
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-g 217  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||   |||||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  22026076 atgtagtttgttaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-acaaaggataatatttcaat-ataatcagggtaggcttcaaaaag 22025979  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| ||||||    
T  22025978 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcaacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaaca 22025879  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacac-atgccgtacgct 410  Q
    |||| || ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  ||| |||  ||    
T  22025878 ctctttagaagtaaattggaaaaattaaaatttggctatgaacctgaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttcgctgcagtatact 22025781  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22025780 tcgcccttgaatcacaagtcact-cctcctttagaacttttggaataccacttgaacaa 22025723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7832181 - 7831725
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||| | |||  ||||  |||  |||||||||||||| ||| |||      
T  7832181 aatttcaatagcaatcccaaacttattatttagcaacattttacaatgcctaaatcagaaatacaattt--gggataaatcctaaaagtctctaagcttg 7832084  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   ||| ||||||||  |||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  7832083 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctatcggcttaatttggctaa-aaagaggataaaatttcaaatataatcagggtaggcttcaaaa 7831985  T
Q  217 -gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
     | |||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||| | ||||     | | |||| |||||||||| |||    || ||||    
T  7831984 aggctcacaagattaagcacttttgcctcagtgtgctaatggcaaagatcaatcgatagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaaaacatggaa 7831885  T
Q  311 cactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgc 409  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    | || ||||| |    
T  7831884 cactctatataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccataaaccttacagttttagatttctgggagttgtgactacctatctttaactgtcgtacac 7831786  T
Q  410 ttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttgga--ataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7831785 ttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatataccacttgaacaa 7831725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 393
Target Start/End: Original strand, 12541782 - 12542050
Alignment:
Q  128 ttgtcaccgaacaaaaa-gatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcaca 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   | || |||||| ||  |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12541782 ttgtcaccgaacaaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaacggataatttttcaat-acaatcagggtaggcttcaaaaggctcaca 12541879  T
Q  225 ggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactctata 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| |||||||||| ||    
T  12541880 ggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatcacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactcttta 12541979  T
Q  320 taagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctat 393  Q
     ||||||||||       |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12541980 gaagtaaattg--gaaaataaaatttggctatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgagactacctat 12542050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 47053344 - 47052894
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||  |||| ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  47053344 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacgatgcctaactcagaaatacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 47053249  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||  ||||||  | || ||||||| |||| ||    
T  47053248 tgtaacgtagtttatcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaaggataattattcaaatataaacagggtatgcttcaa 47053150  T
Q  215 aa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||| |     | | |||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  47053149 aaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgg 47053050  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    |||||||| |||||||||||||       ||||||||||| || |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||     | ||  ||||    
T  47053049 aacactctttataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccataaaccttacaattat-gatatctgggagttgtgactacctatatttaactgttgtac 47052952  T
Q  408 gcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47052951 acttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttga 47052894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10883286 - 10882942
Alignment:
Q  128 ttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-gaaaagactcaca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  | |||||  || | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  10883286 ttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggc--taaaaaaagataatatttcaaataataacagggtaggcttcaaaaaggctcaca 10883189  T
Q  225 ggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactctata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   || | ||||||||||| ||     || || | |||| |||| ||||| |||  |||| |||||||||| ||    
T  10883188 ggaccaagcatttttgcctcagtgtgctaataacaaagatcaatcgacaatagagaaaaattgcaagttccagaaatgtaaatgcatggaacactcttta 10883089  T
Q  320 taagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgcttcgccttt 418  Q
     ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || || |||||  |||||||||    
T  10883088 gaagtaaattg--aaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgtcgtacagttcgccttt 10882992  T
Q  419 gaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     ||  |||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10882991 caatcacaagtcact-cctcattttgaaattttggaataccacttgaacaa 10882942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 468
Target Start/End: Original strand, 55033344 - 55033722
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa-att--ca 191  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||   |    
T  55033344 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcatcgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggc--taaaaaaggataatatttaaa 55033441  T
Q  192 atcaaaatcagggtaggctt-gaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcat 285  Q
    || | ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||| ||     || || | ||||     
T  55033442 ataataat-agggtaggcttcaaaaaggctcacaggaccaagcacttttgcctccgtgtgctaatgacaaagatcaatcgacattagagaaaaattgcaa 55033540  T
Q  286 gttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcg 384  Q
    |||||||||| |||  | || |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||  ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |    
T  55033541 gttctagaaatgtaaatacatggaacactctttataagtaaattg-gaaaaataaaatttggtcatgaaccttaca--gttatgatatctgggagttgtg 55033637  T
Q  385 actacctatc-acacatgccgtacgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    ||||||||||   |  || ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55033638 actacctatctttaactgtcgtacacttcacctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 55033722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 466
Target Start/End: Original strand, 36534425 - 36534771
Alignment:
Q  123 gtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaagact 220  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||  |   |||| | || || ||||||||| |||||  |    
T  36534425 gtagtttgtcaccgaacaaaa-gttctaaacctaccggctcaaattggctaa-agaaaggatatttaaacaattataaacaaggtaggcttcaaaaggat 36534522  T
Q  221 cacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||| |||| ||| ||     |||||||| ||| || ||| |||   ||| |||||||||    
T  36534523 cacaggaccaagcacttttgcctcggtgtgctaatgacaaagattaatcgacaatagagaaacaatgcaagttatataaatgtaaacgcatggaacactc 36534622  T
Q  316 tatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgcttcgc 414  Q
    | |||||||||||||        ||| |||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  36534623 tttataagtaaattgaaaaata-aaattttggccatgaatcatacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtacacttcgc 36534720  T
Q  415 ctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaa 466  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36534721 ctttgaaacacaagtcact-cctcctttagaacttttggaataccacttgaa 36534771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 469
Target Start/End: Original strand, 15196933 - 15197192
Alignment:
Q  213 aaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacg 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||| ||     | | |||| |||||||||| |||  |||| |    
T  15196933 aaaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcaatgtgctagtgacaaagatcaatcaacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatg 15197032  T
Q  308 gaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcac-acatgccgt 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||   | ||| |||    
T  15197033 gaacactctttataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttaca--gttatgatatctgg-agttgtgactacctatctttaaatgtcgt 15197128  T
Q  406 acgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15197129 acacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccgtttgaacttttggaataccacttgaacaa 15197192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 172
Target Start/End: Original strand, 15196861 - 15196912
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggct 172  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196861 atgtagtttgtcatcgaggaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggct 15196912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10883392 - 10883336
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  10883392 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactca 10883336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22026175 - 22026119
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  22026175 aattccaatagcaaccccaaacttaatattaagcaacatcctacaatgcctaactca 22026119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 13558290 - 13558253
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13558290 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaaca 13558253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 15196761 - 15196798
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15196761 aattccaatagcaaccccaaaattattatttagcaaca 15196798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10961819 - 10961763
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||  ||||||||||    
T  10961819 aattcctatagcaaccccaaacttattttttaacaacattctacaatgcctaactca 10961763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10965328 - 10965272
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||  ||||||||||    
T  10965328 aattcctatagcaaccccaaacttattttttaacaacattctacaatgcctaactca 10965272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9102 - 8652
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9102 aattccaaatgcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataacattttttggtcaaattctaaaagtctctaggctca 9003  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa-ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  9002 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctttcaaaaaggataaatttcaattagaatcagggtaggcttcaaaag 8903  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactcta 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8902 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgggtatatgacaaagatcaatc------aacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactcta 8809  T
Q  318 tataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcgcctt 417  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8808 tataagtaaattg-aaaaaataaaatttggctatgaaccttacggtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgccgtaaacttcgcctt 8710  T
Q  418 tgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709 tcaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 8652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31983500 - 31983043
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  31983500 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacactctacatagcctaactcaaataaaacatttt-gggtcaattcctaaaagtctctaggctta 31983402  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa-ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaag 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  31983401 atatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacataccggttcaatttggctttcaaaaaggataaatttcaattagaatcagggtaggcttcaaaag 31983302  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31983301 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaaca 31983202  T
Q  313 ctctatataagtaaattg-nnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31983201 ctctatataagtaaattgaaaaaaactaaaatttggctatgaaccttacggtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgccgtacactt 31983102  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaag 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31983101 cgcctttgaaatataagtcactacctccatatgaacttttggaatatcacttgaacaag 31983043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 22223931 - 22224377
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  22223931 aattccaaaagcaacctcaa-cttattgtttagcaacaccctacttagcctaactcaaatataacatttt-gggttaaatcctaaaagtctctaggctaa 22224028  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||  ||||     
T  22224029 atatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatttaaacctaccggctcaatttggctttcaaaaaggataatttcaaattaaataagggtaggctt-caaagg 22224127  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||     || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22224128 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtaaatgacaaagaccgatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 22224227  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22224228 tctatataagtaaattg--aaaaataaaatttgactattaaccttacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatatgccgtaaacttcg 22224325  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22224326 ccttgtaatttcaagtcactacctccttatgaacttttggaatactacttga 22224377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 22230273 - 22230719
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  22230273 aattccaaaagcaacctcaa-cttattgtttagcaacaccctacttagcctaactcaaatataacatttt-gggttaaatcctaaaagtctctaggctaa 22230370  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||  ||||     
T  22230371 atatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatttaaacctaccggctcaatttggctttcaaaaaggataatttcaaattaaataagggtaggctt-caaagg 22230469  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||     || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22230470 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtaaatgacaaagaccgatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 22230569  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22230570 tctatataagtaaattg--aaaaataaaatttgactattaaccttacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatatgccgtaaacttcg 22230667  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22230668 ccttgtaatttcaagtcactacctccttatgaacttttggaatactacttga 22230719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 33878892 - 33879337
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  33878892 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 33878987  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||   | ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||    
T  33878988 -----tgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggcacaatttgactaa-agaaaggataaaatttcaat-acaatcagggtaggcttcaa 33879080  T
Q  215 aaga-ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||     | | |||| |||||||||| |||  |||| |     
T  33879081 aagggctcacaggaccaagcacgtttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcaacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatga 33879180  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    |||||||| |||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || |||| |||    
T  33879181 aacactctttataagtaaattggaaaa--taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccatac 33879277  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
     ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33879278 acttcgccttagaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 33879337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 472
Target Start/End: Original strand, 39658599 - 39658776
Alignment:
Q  291 agaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactac 389  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  39658599 agaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa--taaaatttggccatgaaccttaca--gttatgattcctgggagttgtgactac 39658694  T
Q  390 ctatcacacatgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagca 472  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39658695 ctatcacttatgccgaacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttatgaacttttggaataccacttgaataagca 39658776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12584838 - 12584386
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||||||| | | || | |   || | |||||||||||||| ||| |||      
T  12584838 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacaatctacaatgcctaactcagaaaaaacaataagggat-aaatcctaaaagtctctaagcttg 12584740  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-gaaa 215  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  | |||||  || | ||||||||||||  |||    
T  12584739 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggc--taaaaaaggataatatttcaaataataacagggtaggcttcaaaa 12584642  T
Q  216 agactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||| | |||     || | |||| |||||||||| |||  |||| ||||    
T  12584641 aggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaaaatcaatcgatagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaa 12584542  T
Q  311 cactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacg 408  Q
    |||||| ||||||||||| |       ||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | ||| ||||| |||| ||||||   |  ||||||||     
T  12584541 cactctttataagtaaatcg-aaaaaataaaatttggccatgaacattaca--gttatgatatttggaagttgtgactgcctatctttaactgccgtaca 12584445  T
Q  409 cttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    ||||  |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12584444 cttcatctttaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 12584386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Original strand, 38250079 - 38250432
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-g 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||  ||||||  | || || ||||||||| |||| |    
T  38250079 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttgactaagaaaa-ggataataattcaaatataaacatggtaggcttcaaaaag 38250177  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||  | ||||     |||||||| |||||||||| |||   ||| ||||||    
T  38250178 gctcacaggaccaaacacgtttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaattgatagtagagaaacaatgcaagttctagaaatgtaaaagcatggaaca 38250277  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||   ||||||| ||||||||||     | |||||||| |||    
T  38250278 ctctatataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagattttgtggagttgtgactacctatttttaactgccgtacactt 38250375  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38250376 cgcctttgaatcacaagtcact-cttccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 38250432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 394
Target Start/End: Original strand, 23945536 - 23945837
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||| |||||  |||||    
T  23945536 aaatcctaaaagtctctaagcttgtcatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaagaataaaatttcaa 23945634  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgt 287  Q
    | | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||     || || | |||| ||    
T  23945635 t-acaatcagggtaggcttcaaaaggctcacaagaccaagcacttttgccttagtgtatatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagt 23945733  T
Q  288 tctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgact 387  Q
    |||| ||| | |  |||| |||||||||| || ||||||||||       ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  23945734 tctaaaaatgcaaatgcatggaacactctttagaagtaaattg--gaaaataaaatttgaccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgact 23945830  T
Q  388 acctatc 394  Q
    |||||||    
T  23945831 acctatc 23945837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17929543 - 17929195
Alignment:
Q  128 ttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga-ctcaca 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |||| ||||||   |||||  | ||| ||||||||||| || | | ||||||    
T  17929543 ttgtcaccgaacaaaaagatttaaacctaccagctcaatttggctaagaaaa-ggataacatttcaaatataataagggtaggcttcaagaaagctcaca 17929445  T
Q  225 ggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactctata 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||     ||||||||  ||||||||| |||   | | |||||||||| ||    
T  17929444 ggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaacaatgcaacttctagaaatgtaaaaggatggaacactcttta 17929345  T
Q  320 taagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtt-agatttctgggagttgcgactacctatcac-acatgccgtacgcttcgcctt 417  Q
    ||||||||||        ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||| ||||    | |||| |||| |||||||||    
T  17929344 taagtaaatt-agaaaaataaaatttggccatgaaccttacagtgtttagatttctaggagttgtggctaactatatttaaatgcggtacacttcgcctt 17929246  T
Q  418 tgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17929245 tgaaacaaaagtcact-cctccttttgaacttttgaaataccacttgaacaa 17929195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23645557 - 23645206
Alignment:
Q  123 gtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-gac 219  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||  ||||||  | || |||||||||||| |||| | |    
T  23645557 gtagtttgtctccgaaaaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaaggataattattcaaatataaacagggtaggcttcaaaaaggc 23645459  T
Q  220 tcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacact 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| | | ||     | | |||| |||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  23645458 tcacatgaccaaacacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgatattagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacact 23645359  T
Q  315 ctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgcttcg 413  Q
    || |||||||||||||       ||||||||||| |||||||||| |||  | ||| || |||||||| |||||||||||    | |||| ||| |||||    
T  23645358 ctttataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttataattat-gatatccgggagttgtgactacctatctttaactgccatacacttcg 23645261  T
Q  414 cctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23645260 cctttgaaatcacaagtcact-cctccttttaaacttttggaataccacttgaaca 23645206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 466
Target Start/End: Original strand, 25593298 - 25593640
Alignment:
Q  129 tgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggctt-gaaaagactcacag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||| |||||  ||||||  | || ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25593298 tgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggc-taaagaaaagataattattcaaatataaacagggtaggcttcaaaaaggctcacag 25593396  T
Q  226 gaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactctatat 320  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||  ||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| |||||||||| ||     
T  25593397 gaccaaacacttttgtctcagtgtgttagtgacaaaggtcaattgacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttag 25593496  T
Q  321 aagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgcttcgccttt 418  Q
    ||||||||||       ||||||||||  |||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  || ||||| ||||||||||    
T  25593497 aagtaaattg--gaaaataaaatttggtcatgaaccttata--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttaactgtcgtacacttcgccttt 25593592  T
Q  419 gaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaa 466  Q
     |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25593593 aaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaa 25593640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17929621 - 17929563
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaa 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  17929621 aattccaatagcaaccccaaacttattatttagcaacattctacaatgcctaactcaaa 17929563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 469
Target Start/End: Original strand, 23945837 - 23945890
Alignment:
Q  415 ctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23945837 ctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 23945890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Original strand, 39658464 - 39658581
Alignment:
Q  183 ataaattcaatcaaaa-tcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----a 276  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||     |    
T  39658464 ataaattcaataaaaaatcatggtaggcttcaaagg-ctcacaggaccaaacactttcgcctcaatgtgtaaatgatcgagaccaatcaacagtaaagaa 39658562  T
Q  277 acaatgcatgttctagaaa 295  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  39658563 acaatgcaagttctagaaa 39658581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23645659 - 23645603
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  23645659 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactca 23645603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Original strand, 7945935 - 7945971
Alignment:
Q  123 gtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccg 159  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7945935 gtagtttgtcaccgaacaaaatgatctaaacctaccg 7945971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 22175536 - 22175592
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  22175536 aattctaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactca 22175592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 19 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 225858 - 225401
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  225858 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacactctacatagcctaactcaaataaaacatttt-gggtcaattcctaaaagtctctaggctta 225760  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa-ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaag 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  225759 atatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacataccggttcaatttggctttcaaaaaggataaatttcaattagaatcagggtaggcttcaaaag 225660  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  225659 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaaca 225560  T
Q  313 ctctatataagtaaattg-nnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  225559 ctctatataagtaaattgaaaaaaactaatatttggctatgaaccttacgttgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgccgtacactt 225460  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaag 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  225459 cgcctttgaaatataagtcactacctccatatgaacttttggaatatcacttgaacaag 225401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 32111639 - 32111177
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32111639 aatttcaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacattctacaaagcctaactcaaatataacatttttgtgtcaaatcctaaaagtccctaggctca 32111540  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  32111539 atatgtagtttgtcaccgaacaaaaatatctaaacctaccggctcaaataggctttcataaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaggg 32111440  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     || |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32111439 ctcacatgaccaatcactttttccttagtgtgtatatgacaaagatcaatcaacagtcaagaaataatgtaagttctagaaatttagttgcacggaacac 32111340  T
Q  314 tctatataagtaaattg--nnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgctt 411  Q
    ||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  32111339 tctatataagt-aattgaaaaaaaaataaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgtgattacctatcacacatgccgtacactt 32111241  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaac-ttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32111240 cgcctttgaaatacaagtcact-cctccttatgaactttttggaatatcacttgaacaagcaatt 32111177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21632932 - 21632485
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  21632932 aattccaaaagcaaccccaaactcattgtttagcaacaccctactcagcctaactcaaatataacatttt-gggttaaatcctaaaagtctctaggctaa 21632834  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||  ||||     
T  21632833 atatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacataccggctcaatttgtctttcaaaaaggataatttcaaattaaataagggtaggctt-caaagg 21632735  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatca-----acagtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||     | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  21632734 ctcacaggaccaagcactttcgcctcaatgtgtaaatgacaaagaccaatcaataataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacat 21632635  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  21632634 tctatataagtaaattg--aaaaataaaatttggctatgaaccttacattgttagatttctgagagttgtgactacctatcacatatgtcgtacacttcg 21632537  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21632536 cctttgaatttcaagtcactgcctccttatgaacttctggaatacctcttga 21632485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 25978699 - 25978252
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  25978699 aattccaaaagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacttagccgaactcaaatataacatttt-gggttaaatcctaaaagtctctaggctaa 25978601  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||  ||||     
T  25978600 atatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctatcggctcaatttggctttcaaaaaggataattttaaattaaataagggtaggctt-caaagg 25978502  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25978501 ctcacatgatcaagcactttcgcctcagtgtgtaaatgacaaagaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacac 25978402  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcg 413  Q
    |||||||||||||| ||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  25978401 tctatataagtaaactg--aaaaataaaatttggttatgaaccttacagtgttagatatctgggagttgtgactacctatcacatatgtcgtacacttcg 25978304  T
Q  414 cctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
    ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25978303 cctttgaatgtcaaatcactacctccttatgaacttttggaataccgcttga 25978252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14968166 - 14967708
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaa-gtccctaggctc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||  |||||||||| | | |  ||||  |||  ||||||||||| ||| ||| |||     
T  14968166 aattccaatagcaaccccaaacttattatttagcaatattctacaatgcctaactcagaaaaacaattt--gggataaatcctaaaaagtctctaagctt 14968069  T
Q  118 aatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaa 215  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14968068 gtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctagacctaccggctcaatttgg-ttaaaaagatgataaaatttcaattaaaatcagggtaggcttcaaa 14967970  T
Q  216 agactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaa-----caatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||     ||||||| ||| |||||| |||  |||| ||||    
T  14967969 aggctcacatgaccaagcacttttgcctcagtgtgtatataacaaagatcaatcgatagtaaagaaacaatgcaagttttagaaatgtaaatgcatggaa 14967870  T
Q  311 cactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgct 410  Q
    ||||  ||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14967869 cact--atataagtaaattgaaaaaa-taaaatttggccatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgtcgtacact 14967773  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14967772 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 14967708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7836569 - 7836161
Alignment:
Q  28 agcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || || |||     
T  7836569 agcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataaca-ttttgggttattttctaaaagtctctaggcttaagatttagt 7836471  T
Q  128 ttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata-aattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacagg 226  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||      
T  7836470 ttgtcaccgaac-aaaggatctaaaccgaccggctcaaattggctttcaaaaaggatatatttcaattaaactaagggtaggcttcaaaaggcttacaac 7836372  T
Q  227 accaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactctatata 321  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7836371 accaaccacttttgtctcagtgtgaatatgacaaagatcaatcaacagtaaagaaacaatgaaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatata 7836272  T
Q  322 agtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacgcttcgcctttgaa 421  Q
    |||||||||       ||| |||  || |||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  7836271 agtaaattg--aaaaataacattcagccatgagccttacagtgttagatttctggtatttgtggctacctatcacatatgcggtacacttcgcctttgaa 7836174  T
Q  422 ata-caagtcact 433  Q
    ||| |||||||||    
T  7836173 atatcaagtcact 7836161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 469
Target Start/End: Original strand, 23841155 - 23841594
Alignment:
Q  34 cccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtca 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||   |||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||| ||| | |    |||||| ||||||    
T  23841155 cccaaacttattatttagcaacattctacgatgcctaactcagatataacaattttggat-aaatcctaaaagtctctaagtttgtaatgtagtttgtca 23841253  T
Q  134 ccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23841254 ccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttgg-ttaagaaaaggataaaatatcaatcaacatcagggtaggcttcaaaaggctcacgggaccaa 23841352  T
Q  232 gcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaa 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||    
T  23841353 acacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaacactctttataaataa 23841452  T
Q  327 attgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgcttcgcctttgaaatac 425  Q
    ||||       ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||   |  ||  |||| |||||||||||||| ||    
T  23841453 attg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttacggtgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgttgtacacttcgcctttgaaagac 23841551  T
Q  426 aagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23841552 aagtcgct-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 23841594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22959539 - 22959085
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||  ||| || | |||||| | ||||||||||||||  || | |      
T  22959539 aattctaatagcaaccacaaacttattatttagcaacattctacaatgcctaactcttatacaacaattttggat-aaatcctaaaagtctataagtttg 22959441  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  |||| || |||||||||||||| ||||    
T  22959440 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaagaaaa-ggataaaatatcaattaacatcagggtaggcttcaaaa 22959342  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaac 311  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||     ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  22959341 agctcacaggaccaagtacttttgcctcagtgtttatctgacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaac 22959242  T
Q  312 actctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgct 410  Q
    ||||| ||||| |||||||       ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |  |||| ||| ||    
T  22959241 actctttataaataaattg-gaaaaataaaatttggtcatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgccatacact 22959143  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22959142 tcgcttttgaaacacaggtcact-cctccttttgaacctttggaataccacttgaacaa 22959085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 23828853 - 23829307
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||  ||| || | |||||| | ||||||||||||||  || | |      
T  23828853 aattctaatagcaaccacaaacttattatttagcaacattctacaatgcctaactcttatacaacaattttggat-aaatcctaaaagtctataagtttg 23828951  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  |||| || |||||||||||||| ||||    
T  23828952 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaagaaaa-ggataaaatatcaattaacatcagggtaggcttcaaaa 23829050  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaac 311  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||     ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  23829051 agctcacaggaccaagtacttttgcctcagtgtttatctgacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaac 23829150  T
Q  312 actctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgct 410  Q
    ||||| ||||| |||||||       ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |  |||| ||| ||    
T  23829151 actctttataaataaattg-gaaaaataaaatttggtcatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgccatacact 23829249  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23829250 tcgcttttgaaacacaggtcact-cctccttttgaacctttggaataccacttgaacaa 23829307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 467
Target Start/End: Original strand, 28109234 - 28109686
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||  | |||||||| |||||| | ||| || | |||||||||||||| ||| |||      
T  28109234 aattccaatatcaacctcaaacttattatttagcaacattctacaatgtctaactcagatataacaatttgggat-aaatcctaaaagtctctaagcttg 28109332  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||| || |||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  28109333 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaatctaccggctcaatttggc-taaaaagagtataaaatttcaat-ataatcagggaaggcttcaaaa 28109430  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt------aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||      || |||||| |||||||||| |||| | || ||||    
T  28109431 ggctcacatgaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatgaatcgacagtagagaaaaaaatgcaagttctagaaatgtagattcatggaa 28109530  T
Q  311 cactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgc 409  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||   |  | |||||| |    
T  28109531 cactctatataagtaaattg-gaaaaataaaatttggcaatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgtgactacatatctttaacttccgtacac 28109629  T
Q  410 ttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaac 467  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  28109630 ttcgcctttgaatcacaagtcac-acctccttttgaactttaggtataccacttgaac 28109686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 23380467 - 23380919
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||||||| | | |  |||||  ||| |||||||||||||| ||| |||      
T  23380467 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaatttt--ggttaaatcctaaaagtctctaagcttg 23380564  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||| ||||   |||||  || | |||||||||||| ||||    
T  23380565 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctatcggctcaaattggctaaagaaaag-ataatatttcaaataataacagggtaggcttcaaaa 23380663  T
Q  217 -gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |     | | |||| |||||||||| |||  |||| ||||    
T  23380664 aggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaa-gatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaa 23380762  T
Q  311 cactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgc 409  Q
    |||||| || ||||||||||        |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||| |    
T  23380763 cactctttaaaagtaaattggaaaata-aaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgagactacctatctttcactgccgtacac 23380860  T
Q  410 ttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23380861 ttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 23380919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 469
Target Start/End: Original strand, 18139656 - 18140002
Alignment:
Q  128 ttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt--caatcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||| ||||||| |  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18139656 ttgtcaccgaataaaaagatctaaacctaccggcttaatttggctaagaaaa-ggataaaatatcaattaacatcagggtaggcttcaaaaggctcacag 18139754  T
Q  226 gaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacactctatat 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     ||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||    
T  18139755 gaccaaacacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatgaaacactctttat 18139854  T
Q  321 aagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgcttcgcctttg 419  Q
    || |||||||       ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   |  ||  |||  |||||||||||    
T  18139855 aaataaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgtagtatacttcgcctttg 18139953  T
Q  420 aaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18139954 aaacacaagttact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 18140002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 11127213 - 11127576
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  11127213 aattccaatagtaaccccaaacttataatttagcaacattctacaatgcctaactcaaatataacattttt-ggtcaattcctaaaagtctctaggctta 11127311  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaa-gatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || | | ||||||||||||||||| |||    
T  11127312 atatgtagctggtcaccaaacaaaaaggatctaaacctaccggctaaaattggttttcaaaaaggatatattttaattaaaaatcagggtaggcttcaaa 11127411  T
Q  216 agactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
    || |||  |||| |||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     ||||| ||| ||||||||||  ||   ||| |||     
T  11127412 aggctcgaaggaacaagcatttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaacgcaagttctagaaatataaaagcatggat 11127511  T
Q  311 cactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatg-ttagatttctg 375  Q
    |||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11127512 cactctttataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttacaatgtttagatttctg 11127576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12745336 - 12744883
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||| |||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  12745336 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgccttactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 12745241  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||  ||||||  |  | || | ||||||| ||    
T  12745240 tgtaatgcagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaaggataattattcaaataggaacacgataggcttcaa 12745142  T
Q  215 aa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||     ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  12745141 aaaggctcacaggaccaatcacttttgcctcagtgtgtatataacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtaaatgcatgg 12745042  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||   |  || |||||    
T  12745041 aacactctatataagtaaattg-gaaaaataaaatatggccatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgtg---acctatctttaattgtcgtac 12744946  T
Q  408 gcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaac-ttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12744945 acttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaactttttggaataccacttgaacaa 12744883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 394
Target Start/End: Original strand, 12981809 - 12982188
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||   |||||||| | | |||| ||||  |||  ||||||||||| || ||| ||| |    
T  12981809 aattccaatagcaatcccaaacttattatttagcaacattctacgatgcctaacttagaaataaaattt--gggataaatcctaaaaatctctaagctta 12981906  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-gaaa 215  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||  | |||||  | |||||||||||||||  |||    
T  12981907 taatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggc-taaaaagaggataacatttcaaatataatcagggtaggcttcaaaa 12982005  T
Q  216 agactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||     || || | |||| |||||||||| |||| ||||  |||    
T  12982006 aggctca-aggaccaagcaattttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtagatgcatagaa 12982104  T
Q  311 cactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatg-ttagatttctgggagttgcgactacctatc 394  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  12982105 cactctatataagtaaattg-aaaaaataaaatttggccatgaaccttacaatgtttagatttatgggagttgtgactatctatc 12982188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24408839 - 24408461
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggat-aaattcaat 193  Q
    |||||||||||||| ||| |||    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||    
T  24408839 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgcagtttgtcaccgaagaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggc-taaagaaaggataaaattccat 24408741  T
Q  194 caaaatcagggtaggctt-gaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgt 287  Q
     | |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||     || | |||| ||    
T  24408740 -ataatcagggtaggcttcaaaaaggctcacatgaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaattgacagtagagaaaaattgcaagt 24408642  T
Q  288 tctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgac 386  Q
    |||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||| |  |||| ||| ||||||||||  |||    
T  24408641 tctagaaatgtaaatgcatggaacaatctatataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttata--gttatgatatctgggagttatgac 24408545  T
Q  387 tacctatc-acacatgccgtacgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||   |  ||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24408544 tacctatctttaactgtagtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaaaaccacttgaacaa 24408461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25455890 - 25455747
Alignment:
Q  128 ttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-gaaaagactcaca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||  | |||||  | ||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  25455890 ttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggc-taaaaagaggataacatttcaaatataatcatggtaggcttcaaaaaggctcaca 25455792  T
Q  225 ggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatc 269  Q
     ||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||    
T  25455791 tgaccaagcacttttgtctcagtgtgctaatgacaaagatcaatc 25455747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 49718208 - 49717750
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  49718208 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacactctacatagtctaactcaaatataacatttttgggtcatatcctaaaagtctctaggcttg 49718109  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  49718108 taatgtagttggtcaccgaacaaaaagatat-aacctaccggctcaatttggttttcaaaaaggataaaatttcaat-aaaatcagggtagacttcaaaa 49718011  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaac 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||     ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  49718010 ggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagattaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaac 49717911  T
Q  312 actctat--ataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacg 408  Q
    |||||||  ||||||||||||        |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||     
T  49717910 actctatacataagtaaattgaaaaag--aaaatttggccatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaactgccgtaca 49717813  T
Q  409 cttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagca 472  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49717812 cttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttatgaactcttggaataccacttgaagaagca 49717750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 450
Target Start/End: Original strand, 22454979 - 22455314
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-g 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||   |||||  | ||||||||||||||| |||| |    
T  22454979 atgtagtttgtcaccgaacaaaaatatccaaacctaccggctcaatttggctaa-aaagaggataacatttcaaatataatcagggtaggcttcaaaaag 22455077  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     || | |||| |||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  22455078 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgta-tcgcatggaaca 22455176  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatg-ttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgct 410  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |  || ||||| ||    
T  22455177 ctctatataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttacaatgtttagatttatgggagttgtgactacctatctttaattgtcgtacact 22455275  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttt 450  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22455276 tcgcctttgaagcacaagtcact-cctccttttgaacttt 22455314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Original strand, 21020090 - 21020443
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggctt-gaaaag 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||  ||||||| | || ||||||| ||||  |||||    
T  21020090 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagttctaaacctaccggctcaatttggc-taaagaaaggataattattcaattataaacagggtaagcttcaaaaag 21020188  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||| |||||     || | |||| ||||||||||  ||  ||||  |||||    
T  21020189 gctcacaggaccaaacacttttgcctcagtgtgctaatgacaaaaatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatataaatgcatagaaca 21020288  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgctt 411  Q
    |||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||| |||||||||||   || || ||||| |||    
T  21020289 ctctttataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttgcagt-ttagatttatgggagttgtgactacctatctttcactgtcgtacactt 21020386  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||||  |||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21020387 cgcctttgaatcacaagtcagt-cttccttttgaacttttgaaataccacttgaacaa 21020443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45939985 - 45939765
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  45939985 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 45939890  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||   |||||| | ||||| ||||||||| ||    
T  45939889 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatttaaacctaccggctcaaattggcta--aaaaaggataatatttcaat-acaatcaaggtaggcttcaa 45939793  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcc 242  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  45939792 aaggctaacaggaccaagcacttttgcc 45939765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 21019990 - 21020046
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  21019990 aattccaatagcaactccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactca 21020046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16222637 - 16222354
Alignment:
Q  32 accccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16222637 accccaaacttattatttagcaacaacctacatagcctaactcaaatataacatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgt 16222538  T
Q  132 caccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaa 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16222537 caccgaacaaaaagatcgaaacctatcggctcaaatttgctttcaaaaaggataaattcaataaaaataagagtaggcttgaaaaggctcacaggaccaa 16222438  T
Q  232 gcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16222437 gcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaaagaaacaacgcaagttctagaaatgtagttgcacggaa 16222354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 9274636 - 9275094
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||  |||||||||| |||||| ||||  |||| |||| ||| ||||| || ||||      
T  9274636 aattccaatagcaaccccaaacttattatttaacaacattctacaatgcctaactcatatataacattt--gggttaaattctagaagtctctgggcttc 9274733  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaaga-tctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt----caatcaaaatcagggtaggcttga 213  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||| |    
T  9274734 atttgtagtttgtcactaaacaaaaagaatctaaaccttccggctcaatttggctta-aaaaaggataaaatataacaattaaaatcagggtaggcttca 9274832  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||     ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  9274833 aaaggctcacaggaccaagaacttttgcctcagtgtgtatatgataaataccactcaacagtagagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcatgg 9274932  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    ||||||||||||||||||| |        ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || |||||    
T  9274933 aacactctatataagtaaaattgaaaaaataaaatttggtcatgaaccttacagtgttagatttctgggagttgtgacttcctatccggcactgtcgtac 9275032  T
Q  408 gcttcgcctttgaaata-caagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     |||| | ||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9275033 acttcactttttaaacatcaagtcact-cctccttgtgaactttcggaataccacttgaacaa 9275094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 13810964 - 13811209
Alignment:
Q  32 accccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgt 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  13810964 accccaaacttattgtttagtaacactctacatagcctaactcaaatataacatttt-gggttatttcctaaaagtcc-taggcataatatgtagtttgt 13811061  T
Q  132 caccgaacaaaaa-gatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaatt-caatcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggacc 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  13811062 caccgaacaaaaatgatctaaacctaccagctcaaattggttttcaaaaaggatatatttcaattaaaatcagggtaggcttcaaaaggctcacaagacc 13811161  T
Q  230 aagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaa 277  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13811162 aaacacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcaacagtaa 13811209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 45288776 - 45289226
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactc--aaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||||||  ||| | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  45288776 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcggaaaaacaataa----ggggtaaatcctaaaagtctctaagct 45288871  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||   | ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||| ||    
T  45288872 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccaactcaatttggctga-agaaaggataaaatttcaaa-acaatcagggtaggctttaa 45288969  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |     | | |||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  45288970 aaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 45289069  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacg 408  Q
    ||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||     
T  45289070 acactctttagaagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttacatt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtaca 45289167  T
Q  409 cttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45289168 cttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 45289226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 26137386 - 26137838
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  26137386 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 26137481  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  ||||||  | || |||||||||||| ||    
T  26137482 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggc-taaagaaaggataattattcaaatataaacagggtaggcttcaa 26137580  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     || | |||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  26137581 aaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 26137680  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacac-atgccgtac 407  Q
    ||||||| |||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||    
T  26137681 acactctttataagtaaattggaaaagg-aaaatttggccatgaaccttaca--gttatgatttctgggagttgtgactacctatctttcgctgccgtac 26137777  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26137778 acttcgcccttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 26137838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22255743 - 22255365
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||| |||||  |||||    
T  22255743 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaagaataaaatttcaa 22255645  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgt 287  Q
      | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     || || | |||| ||    
T  22255644 a-acaatcagggtaggcttcaaaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacaacaaagaaaaattgcaagt 22255546  T
Q  288 tctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgac 386  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||| |        |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||| |||    
T  22255545 tctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgaca--gttatgatttctggaagttgtgac 22255448  T
Q  387 tacctatcacaca-tgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||   || |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22255447 tacctatctttcactgccatacacttcgcctttaaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 22255365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Original strand, 22231022 - 22231374
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||| |||||  |||||  | ||||||||||||||| |||||     
T  22231022 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaagaataaaatttcaaa-acaatcagggtaggcttcaaaagg 22231119  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| |||||||    
T  22231120 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacac 22231219  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgctt 411  Q
    ||| |||||||||| |        |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||   || |||| ||| |||    
T  22231220 tctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgaca--gttatgatttctggaagttgtgactacctatctttcactgccatacactt 22231317  T
Q  412 cgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22231318 cgcctttaaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 22231374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4544303 - 4543851
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactc--aaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||||||  ||| | || |     |||  ||||| |||||||| ||| |||    
T  4544303 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaaaa----agggataaatcataaaagtctctaagct 4544208  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  | |||| |||||  |||||  | ||||||||||||||| ||    
T  4544207 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacccaccggctcaatttggc-taaagaaagaataaaatttcaa-aacaatcagggtaggcttcaa 4544110  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  4544109 aaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacaacaaagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 4544010  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacac-atgccgtac 407  Q
    ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||    
T  4544009 acactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttctctgccgtac 4543912  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4543911 acttcgcctttgaaacacaagtcact-tctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 4543851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20595259 - 20594801
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactc--aaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||  |||||||||  ||| | ||||     |||  ||||||| |||||| ||| |||    
T  20595259 aattccaatagcaaccccaaacttaatattaagcaacatcctacaatgcctaactcagaaaaacaata----agggataaatcct-aaagtctctaagct 20595165  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggctt-ga 213  Q
        |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |  | |||||||||  |||||   |||| ||||||||||||  |    
T  20595164 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagttctaaacctacgggcttaacttggc-taaagaaaggataattattcatataaaaacagggtaggcttcaa 20595066  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     || | | || |||||||||| |||  |||| ||    
T  20595065 aaaggctcacaggacaaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattacaagttctagaaaagtaaatgcatgg 20594966  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    |||||||| |||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||   || ||||||||    
T  20594965 aacactctttataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgtgagctgtgactacctatctttcactgccgtac 20594868  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20594867 acttcgcctttgaattacaattcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacaatt 20594801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22255817 - 22255761
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||  ||||||||||    
T  22255817 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagtaacattctacaatgcctaactca 22255761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 26061411 - 26061669
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26061411 aatttcaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccttacatagcctaactcaaatataacatttttgggttaaatcctaaaagtctctaggctca 26061510  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26061511 atatgtcgtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggttcaaattggctttcaaaaaggataaattcaatcaaaatcaaggtaggcttgaataga 26061610  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagtaa 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26061611 ctcacatgaccaagcacttttgcctcagtctatatatgacaaagatcaatcaacagtaa 26061669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39500259 - 39499811
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactc--aaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||  |||||||||  ||| | ||||     |||  || ||||||||||| ||| |||    
T  39500259 aattccaatagcaaccccaaacttaatattaagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaata----agggataactcctaaaagtctctaagct 39500164  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39500163 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggc-taaagaaaggataatatttcaat-aaaatcagggtaggcttcaa 39500066  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  39500065 aaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatga-caagatcaatcgacaacagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 39499967  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacg 408  Q
    ||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||     
T  39499966 acactctttaaaagtaaattg--gaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgagactacctatctttcactgccgtaca 39499870  T
Q  409 cttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39499869 cttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 39499811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 49638108 - 49638561
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaa-gtccctaggctc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |  |||||||||| | | |  ||||  |||  ||||||||||| ||| ||| |||     
T  49638108 aattccaatagcaaccccaaacttattatttagcaacattctataatgcctaactcagaaaaacaattt--gggataaatcctaaaaagtctctaagctt 49638205  T
Q  118 aatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaag--gataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttga 213  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  49638206 gtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctagacctaccggctcaatttggct---aaaaagaagataaaatttcaattaaaatcagggtaggcttca 49638302  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||     ||||||||| ||| |||||| |||  |||| ||    
T  49638303 aaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatataacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaatgcaagttttagaaatgtaaatgcatgg 49638402  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgta 406  Q
    |||||||| |||||||||| |        |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   || ||||||     
T  49638403 aacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttcattgccgtg 49638500  T
Q  407 cgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49638501 cacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 49638561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 27678601 - 27679051
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | |||||    |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  27678601 aattccaatagcaaccccaaacttactatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaatat----gggataaatcctaaaagtctctaagct 27678696  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||   |||||  |  | || ||||||||| ||    
T  27678697 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggcta--aaaacggataatatttcaaatactaacatggtaggcttcaa 27678794  T
Q  215 aa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||     | | |||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  27678795 aaagactcacatgaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacaatagagaaagattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgg 27678894  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    |||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || |||| |||    
T  27678895 aacactctttagaagtaaattggaaaa--taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccatac 27678991  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
     ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27678992 acttcgccttcgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 27679051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19826151 - 19825699
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactc--aaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||||||  ||| | ||||     |||  ||||||||||| || |||  ||    
T  19826151 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacactgcctaactcagaaaaacaata----agggataaatcctaaaattctctaaact 19826056  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-ga 213  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  | |||||  || | ||||||||||||  |    
T  19826055 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggc--taaaaaaagataatatttcaaataataacagggtaggcttcaa 19825958  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||| |||||     || | |||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  19825957 aaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagattaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgg 19825858  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgta 406  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  |||||||    
T  19825857 aacactctatataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttgca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttaactgccgta 19825761  T
Q  407 cgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19825760 cacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 19825699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5672391 - 5671940
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  ||||| |||||||| ||| |||    
T  5672391 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcataaaagtctctaagct 5672296  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||   |||||  || |  | ||||||||| ||    
T  5672295 tgtaatgtagtttgtcactgaacaaaaatatctaaacctaccggctcaaattggcta--aaaaaggataatatttcaaataataaaaaggtaggcttcaa 5672198  T
Q  215 aa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaaca-----gtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||     | || | |||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  5672197 aaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcaacaaaagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgg 5672098  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    |||||||| || |||||||||        ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||    
T  5672097 aacactctttagaagtaaatt--agaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtac 5672001  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     |||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5672000 acttcgcctttgaatcacaagtcact-catccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 5671940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15161726 - 15161320
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    |||||| |||| ||||||||||| |||||||      
T  15161726 aattccaatagcaatctcaaacttattgtttagtaacactctacattgcctaactcaaatata--cattttggctcaattcctaaaagtcactaggcttc 15161629  T
Q  119 atatgtag-cttgtcacc-gaacaaaaa-gatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa-ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
    ||| | ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||  |    
T  15161628 atacgcagttttgtcacctgaacaaaaaggatctaaacctaccgtctcaatttggtttgcaaaaaggataaatttcaaataaaatcaaggtaggctt-ca 15161530  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgt-agttgcacgg 308  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| || ||||||||     ||||||||| ||| |||||| || | ||||||||    
T  15161529 aaggctcacatgaccaagcac-tttgcctcagtgtataaatgacatagaccattcaacagtaaagaaacaatgcaagttgtagaaatgtaatttgcacgg 15161431  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacg 408  Q
     |||||||||||||||||||||       ||||||||| | || ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||     
T  15161430 -acactctatataagtaaattg-gaaaaataaaatttgaccataaaccttatagtgttaaatttctgagagttgtgactacctacctcacatgccgaaca 15161333  T
Q  409 cttcgcctttgaa 421  Q
    |||||||||||||    
T  15161332 cttcgcctttgaa 15161320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 56197288 - 56196908
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||   | |||||||||  ||||||    
T  56197288 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagttctaaacctaccagctcaatttggctaa-agaaaggataattattcaa 56197190  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaaaa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatg 286  Q
    | | || ||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||   |||| ||||||||||| ||||||     | | |||| |    
T  56197189 ttataaacattgtaggcttcaaaaaggctcacaggaccaagcacttttgtcttagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaag 56197090  T
Q  287 ttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgac 386  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||| || |||||||||        ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  56197089 ttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaatt-tggaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgac 56196992  T
Q  387 tacctatcacaca-tgccgtacgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||   || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56196991 tacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 56196908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Original strand, 19861903 - 19862258
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaagg-ataaa-ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-g 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||| ||||| || |||  ||| |||||||||||| |||| |    
T  19861903 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctaaatttggctaaagaaaagggataaaatttaatataaa-cagggtaggcttcaaaaag 19862001  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
      ||||||||| | ||||||||| |||||||||   |||| || |||||||| ||||||     | | |||| |||||||||| |||  |||| ||||||    
T  19862002 gttcacaggactaggcacttttgtctcagtgtgctaatgacaatgatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaaca 19862101  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtt-agatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgct 410  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |  |||||||| ||    
T  19862102 ctctatataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttacaatgtttagatttctgggagttgtgactacctatctttaactgccgtacact 19862200  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19862201 tcgcctttgaaacacaagtcact-cccccttttgaacttttggaataccactttaacaa 19862258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 3799436 - 3799887
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  | ||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  3799436 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgtctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 3799531  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-ga 213  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  | |||||  || | ||||||||||||  |    
T  3799532 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaatttgc--taaaaaaggataatatttcaaataataacagggtaggcttcaa 3799629  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||||   |||||||||||||||| |||||     || | |||| |||||||||| |||  ||||       
T  3799630 aaaggctcacatgaccaaacacttttgctttagtgtgctaatgataaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcataa 3799729  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgta 406  Q
    |||||||| |||||||||||||       |||||||| || |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  |||||||    
T  3799730 aacactctttataagtaaattg-gaaaaataaaatttagcaatgaactttaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttaattgccgta 3799826  T
Q  407 cgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    | ||||| |||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3799827 cacttcgtctttgaatcataagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 3799887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 53894857 - 53894752
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |    
T  53894857 aattccaaaagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacttagcctaactcaaatataaca-ttttgggttaaatcttaatagtctctaggctaa 53894759  T
Q  119 atatgta 125  Q
    |||||||    
T  53894758 atatgta 53894752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 15432639 - 15432889
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  15432639 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 15432734  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggctt-ga 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | |||||||||  ||||||  | || ||||||||||||  |    
T  15432735 tgtagtgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacataccggctcaatttggc-taaagaaaggataattattcaaatataaacagggtaggcttcaa 15432833  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatc 269  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  15432834 aaaggctcacaggaccaaacacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatc 15432889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 469
Target Start/End: Original strand, 15403781 - 15403836
Alignment:
Q  413 gcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15403781 gcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 15403836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 328
Target Start/End: Original strand, 22091675 - 22091717
Alignment:
Q  286 gttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaat 328  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22091675 gttctagaaatgtagttgcatggaacactctatataagtaaat 22091717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Original strand, 22091463 - 22091527
Alignment:
Q  122 tgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa 186  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22091463 tgtagtttgtcatcgaacaaaaggctctacacctaccggctcaaattgacttttcaaaaggataa 22091527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 435 - 475
Target Start/End: Original strand, 22091818 - 22091858
Alignment:
Q  435 cctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaatt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  22091818 cctccttatgaacttttgggataccacttgatcaaacaatt 22091858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 1695 - 2145
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  1695 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggaaaaatcctaaaagtctctaagct 1790  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  1791 tgtaatgtagtttgtcaccaaactaaaagatctaaacctaccgactcaaattggctaa-agaaaggataaaatttcaat-acaataagggtaggcttcaa 1888  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |     | | |||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  1889 aaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 1988  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacg 408  Q
    ||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||     
T  1989 acactctttagaagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtaca 2086  T
Q  409 cttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2087 cttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 2145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11058407 - 11058275
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058407 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 11058308  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058307 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaa 11058275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 31429063 - 31429509
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | || |     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  31429063 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaaaaa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 31429158  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||| |||||  |||||  | |||||||||||| || ||    
T  31429159 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaagaataaaatttcaaa-acaatcagggtaggtttcaa 31429256  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     | | |||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  31429257 aaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 31429356  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacg 408  Q
    ||||||| || ||||||||||       ||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||     
T  31429357 acactctttagaagtaaattggaaaa--taaaatttggacatgaacattacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtaca 31429453  T
Q  409 cttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31429454 cttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttga 31429509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 16789052 - 16789498
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | || |     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  16789052 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaaaaa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 16789147  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||| |||||  |||||  | |||||||||||| || ||    
T  16789148 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaagaataaaatttcaaa-acaatcagggtaggtttcaa 16789245  T
Q  215 aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgga 309  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     | |||||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  16789246 aaggctcacaggaccaaacatttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaaatgcaagttctagaaatgtaaatgcatgga 16789345  T
Q  310 acactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacg 408  Q
    ||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||   || ||||||||     
T  16789346 acactctttagaagtaaattggagaa--taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctaggagttgtgactacctatctttcactgccgtaca 16789442  T
Q  409 cttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttga 465  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16789443 ctgcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttga 16789498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25872577 - 25872126
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  25872577 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 25872482  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||   |||||  || | |||||||||||| ||    
T  25872481 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggcta--aaaaaggataatatttcaaataataacagggtaggcttcaa 25872384  T
Q  215 -aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   | || ||||||||||  ||| ||     | | |||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  25872383 gaaggctcacaggaccaagcacttttgccttagtgtgctaaagacaaagatcaatagacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaattgcatgg 25872284  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtac 407  Q
    |||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||    
T  25872283 aacactctttagaagtaaattggaaaa--taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtac 25872187  T
Q  408 gcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25872186 acttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggactaccacttgaacaa 25872126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Original strand, 25958111 - 25958461
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   | |||||||||   |||||| | ||||||||||||||| |||||     
T  25958111 atgtaggttgtcatcgaacaaaaagatctaaacctatcggctcaatttggctaa-agaaaggataatatttcaat-acaatcagggtaggcttcaaaagg 25958208  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| |||||||    
T  25958209 ctcacaagaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgacaaagatcaatcgacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacac 25958308  T
Q  314 tctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgcttc 412  Q
    ||| || ||||||||||       |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    || |||||||| ||||    
T  25958309 tctttagaagtaaattg--gaaaataaaatttggctatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgagacttcctattcttcactgccgtacacttc 25958405  T
Q  413 gcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25958406 gcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacctgaacaa 25958461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24236833 - 24236455
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaa-ggataaa--ttca 191  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||  ||||    
T  24236833 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcgccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctaaaaaaaaaggataaaatttca 24236734  T
Q  192 atcaaaatcagggtaggcttgaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatg 286  Q
    |  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||| ||| ||     | | |||| |    
T  24236733 aa-acaatcagggtaggcttcaaaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaaagacaaagatcaatcgacaatagagaaaaattgcaag 24236635  T
Q  287 ttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgac 386  Q
    ||||||||| ||   |||| |||||||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  24236634 ttctagaaatgtgaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaa--taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgac 24236538  T
Q  387 tacctatcacaca-tgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||   || || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  24236537 tacctatctttcactgtcgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggactagcacttgaacaa 24236455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 468
Target Start/End: Original strand, 1505045 - 1505397
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-g 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||  ||||||  | || |||||||||||| |||| |    
T  1505045 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagttctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaaggataattattcaaatataaacagggtaggcttcaaaaag 1505143  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     || | |||| |||||||||| |||  |||| ||||||    
T  1505144 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaaca 1505243  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctat-cacacatgccgtacgctt 411  Q
    |||| || |||||||||        ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  |  ||| |||| |||    
T  1505244 ctctttagaagtaaatt--agaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttgtgactacctatccttaactgcagtacactt 1505340  T
Q  412 cgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1505341 cgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 1505397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 13973447 - 13973896
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |  |||||  |||||||||||| | |  ||    |||  |||||||||||||| ||| |||      
T  13973447 aattccaataacaaccccaaacttaatatttagcaatattctacaatgcctaactcaaaaaaacaataa--gggataaatcctaaaagtctctaagcttg 13973544  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
      |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13973545 taatgtagtttgccaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaaggataaaatttcaat-acaatcagggtaggcttcaaaa 13973642  T
Q  217 gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaac 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||     || || | |||| |||||||||| |||  || | |||||    
T  13973643 ggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtttatatgacaaagatcaatcgacaacagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgtatggaac 13973742  T
Q  312 actctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgct 410  Q
    ||||| || ||||||||||       ||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||   || |||||||| ||    
T  13973743 actctttagaagtaaattg--gaaaataaaatttggccaagaaccttacagt-ttagttttcttggagttgtgactacctatctttcactgccgtacact 13973839  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13973840 tcacctttgaatcacaagtcact-ccttcttttgaacttttggaattccacttgaaca 13973896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 45455576 - 45455223
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-g 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||||  ||||||| | || ||||||||| || |||| |    
T  45455576 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagttctaaacctaccggctcaatttggctaa-agaaatgataattattcaattataaacagggtaggtttcaaaaag 45455478  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| || |||     | | |||| |||||||||| |||  |||| ||||||    
T  45455477 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgaaaaagatcaatcgacggtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtatatgcatggaaca 45455378  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagtt-gcgactacctatcacaca-tgccgtacgct 410  Q
    |||| |  ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||   || |||||||| ||    
T  45455377 ctctttggaagtaaattggaaaa--taaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagtttgtgactacctatctttcactgccgtacact 45455281  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | || ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45455280 ttgcatttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttgaaataccacttgaacaa 45455223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 330
Target Start/End: Original strand, 9186976 - 9187294
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  9186976 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaaagcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 9187071  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaa 214  Q
        |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||   |||||  || | |||||||||||| ||    
T  9187072 tgtaatgtagttcgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccagctcaaattgactaaaaaaaaggataatatttcaaataataacagggtaggcttcaa 9187171  T
Q  215 aa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-agt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacg 307  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| || |||     || | |||| |||||||||| |||  |||| |    
T  9187172 aaaggcttacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgactagtagtgaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatg 9187271  T
Q  308 gaacactctatataagtaaattg 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  9187272 gaacactctttataagtaaattg 9187294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 469
Target Start/End: Original strand, 9187352 - 9187410
Alignment:
Q  410 ttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9187352 ttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 9187410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11186575 - 11186510
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  11186575 atgtaacttgtcaccgaacaaaaagttataaatctacaggctcaaattgactttacaaaaggataa 11186510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 25958012 - 25958068
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  25958012 aattccaatagcaaccccaaacttaatattaagcaacatcctacaatgcctaactca 25958068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 30151072 - 30151016
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  30151072 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactca 30151016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 45455676 - 45455639
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45455676 aattccaatagcaaccccaaacttattatttagtaaca 45455639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 451
Target Start/End: Original strand, 1295 - 1655
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||  ||||||    
T  1295 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaatttggcta-cagaaatgataatcattcaa 1393  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaaaa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatg 286  Q
      | ||  ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||     | | |||| |    
T  1394 gtataaatagggtaggcttcaaaaaggctcacaggacaaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaag 1493  T
Q  287 ttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgac 386  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |    
T  1494 ttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaa-taaaatttggtcatgaaccttacaatattagatttctgggagtcgtgtc 1592  T
Q  387 tacctatcacacatgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaactttt 451  Q
    ||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1593 tacctatgaatcatgccgtacacttcgcctttg-aattcaagtcact-cctccttatgaactttt 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 468
Target Start/End: Original strand, 4549 - 4930
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||    
T  4549 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgccaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctaaaaaaaaggataatatttcaa 4648  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggctt-gaaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatg 286  Q
      || | ||||| ||||||  |||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     || | |||| |    
T  4649 ataataacagggaaggcttcaaaaaggataacagaaccaaacacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaag 4748  T
Q  287 ttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatg-ttagatttctgggagttgcga 385  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  4749 ttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgaaccttacagtgtttagatttctgggagttgtga 4847  T
Q  386 ctacctatc-acacatgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||||||   |  | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4848 ctacctatctttaactaccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttgaaataccacttgaaca 4930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 4474 - 4511
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4474 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaaca 4511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 10673 - 11127
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca--aatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  ||||||||||  || | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  10673 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaataa----gggataaatcctaaaagtctctaagct 10768  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-ga 213  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||  | |||||  || | ||||||||||||  |    
T  10769 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcagattagc-taaaaaaaggataatatttcaaataataacagggtaggcttcaa 10867  T
Q  214 aaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacgg 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||| | |||     || | |||| |||||||||| | |  |||| ||    
T  10868 aaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagcctgttaatgacaaagatcaatcgatagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgaaaatgcatgg 10967  T
Q  309 aacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatg-ttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgta 406  Q
    |||||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| || |||||| |||||||||||   |  |||||||    
T  10968 aacactctttataagtaaattg--gaatataaaatttggccatgaaccgtacagtgtttagatttatgagagttgtgactacctatctttaactgccgta 11065  T
Q  407 cgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11066 cacttcgcctttgaaacacaagtcgct-cctccttttgaacttttggaataccacttaaacaa 11127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27731 - 27353
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | |||||||||  ||||||    
T  27731 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccagctcaatttggctaa-agaaaggataattattcaa 27633  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaaaa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatg 286  Q
      |  |  ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||     ||||||||| |    
T  27632 atatgaatagggtaggcttcaaaaaggctcataggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatataacaaagatcaatcgacagtaaagaaacaatgcaag 27533  T
Q  287 ttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcga- 385  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||     
T  27532 ttctagaaatgtaaatgcatggaacactctatataagtaaattg-gaaaaataaaatttggccatgtcccttacagtgttagatttcttggagttgtgac 27434  T
Q  386 ctacctatcacacatgccgtacgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||  || | ||   | | |||| ||||| | ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27433 ctgtctttaac---ttctgtacacttcgtccttgaaatcacaagtcact-tctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 27353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Original strand, 111651 - 112005
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa-g 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||| |||||||   |||||  | || |||||||||||| |||| |    
T  111651 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctatcggctcaatttggctaa-aaagaggataacatttcaaatataaacagggtaggcttcaaaaag 111749  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||     | | |||| ||| |||||| |||  |||| ||||||    
T  111750 gctcacatgaccaatcacttttgcctcaatgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttatagaaatgtaaatgcatggaaca 111849  T
Q  313 ctctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttag-atttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgct 410  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||  ||||  || ||||||||||  |||||||||||    | |||||||| ||    
T  111850 ctctatataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttaca--gttatcatatctgggagttatgactacctatctttaactgccgtacact 111946  T
Q  411 tcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  111947 tcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 112005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21694 - 21422
Alignment:
Q  200 cagggtaggcttgaaaa-gactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctaga 293  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||     |||||||| ||||||||    
T  21694 cagggtaggcttcaaaaaggctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacaatagagaaacaatgcaagttctaga 21595  T
Q  294 aacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcga-ctaccta 392  Q
    |  | |   ||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  21594 actgaaaaagcatggaatactctatataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttactgtgttagatttctgggagttgtgatctatctt 21496  T
Q  393 tcacacatgccgtacgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21495 taac---tgccgtacacttcgcctttgaaattacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 21422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26089 - 25940
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| | | || | |||||| | |||||||||||||| ||| |||      
T  26089 aatttcaatagcaaccccaaacttattatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaa-aacaattttggat-aaatcctaaaagtctctaagcttg 25992  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattgg 170  Q
      |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25991 taatgtagtttgttaccgaacaaaaagatctagacctaccggctcaaattgg 25940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12066 - 11915
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggctca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| | | | || | |||| | | |||||||||||||| ||| |||      
T  12066 aatttcaatagcaaccccaaacttattatttagcaacattctacaatgcctaacttagaaa-aacaattttagat-aaatcctaaaagtctctaagcttg 11969  T
Q  119 atatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggct 172  Q
      |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11968 taatgtagtttgttaccgaacaaaaagatctagacctaccggctcaaattggct 11915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27528 - 27175
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataaa--ttcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaaga 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||| |||||     
T  27528 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccagctcaatttggctaa-agaaaggataaaatttcaaa-acaatcagggtaggcttcaaaagg 27431  T
Q  219 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagt-----aacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaacac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||     || | |||| ||||||||||  ||  |||| |||||||    
T  27430 ctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatataaatgcatggaacac 27331  T
Q  314 tctatataagtaaatt-gnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacac-atgccgtacgct 410  Q
    ||| || ||||||||| |        ||||| |||| |||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |  |||||||| ||    
T  27330 tctttagaagtaaattggaaaaaaaaaaaatatggccatgaacctgaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatctttcgctgccgtacact 27233  T
Q  411 tcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | |||||  ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27232 ttgccttcaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 27175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14276 - 13919
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaa-ag 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||  | |||||  || | |||||||||||| ||| ||    
T  14276 atgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctaaaaaaaatgataatatttcaaataataacagggtaggcttcaaagag 14177  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||| || |||||||  ||     || || | |||| |||||||||| |||  |||| ||||||    
T  14176 gctcgcaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctagtgacaacgatcaattgacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaaca 14077  T
Q  313 ctctatataagt-aaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgc 409  Q
    |||| ||||||| ||||||        ||  |||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||   |  |||||||| |    
T  14076 ctctttataagtaaaattggaaaaataaatttttggccatgaacgttaca--gttatgatatctgggagttgtgacttcctatctttaattgccgtacac 13979  T
Q  410 ttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13978 ttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 13919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23448 - 23316
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactc--aaatataatatttttgggtcaaatcctaaaagtccctaggct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||||||  ||| | ||||     |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  23448 aattccaatagcaaccccaaacttaatatttagcaacattctacaatgcctaactcagaaaaacaata----agggataaatcctaaaagtctctaagct 23353  T
Q  117 caatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaac 153  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23352 tgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagatctaaac 23316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27758 - 27403
Alignment:
Q  121 atgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata--aattcaatcaaaatcagggtaggctt-gaaaag 217  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||  | |||||  || | ||||||||||||  |||||    
T  27758 atgtagtttgtcaccgaacgaaaagatctaaacataccggctcaaattggc-taaaaaaaggataatatttcaaataataacagggtaggcttcaaaaag 27660  T
Q  218 actcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatgttctagaaacgtagttgcacggaaca 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || |||||||  ||     || || | ||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  27659 gctcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgctagtgacaacgatcaattgacaatagagaaaaattgcatgttctagaaatgtaaatgcatggaaca 27560  T
Q  313 ctctatataagt-aaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgactacctatc-acacatgccgtacgct 410  Q
    |||| ||||||| ||||||        ||  |||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||| ||||||   |  |||||||| ||    
T  27559 ctctttataagtaaaattggaaaaataaatttttggccatgaaccttacaat-tatgatatctgggagttgtgacttcctatctttaattgccgtacact 27461  T
Q  411 tcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27460 tcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaac-tttggaataccacttgaacaa 27403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 27857 - 27801
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactca 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||  ||||||||||    
T  27857 aattccaatagcaaccccaaacttattataaagtaacatcctacaatgcctaactca 27801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 49938 - 50158
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaacaccctacatagcctaactcaaatataatatttttgggtcaaatc-ctaaaagtccctaggctc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||  || |||| || || |||||| |||||||     
T  49938 aattccaatagcaaccccaaacttatttcttagcaatatcctacatagcctaactcaaattcaaaatttcagg-tcaattcacttaaagtctctaggctt 50036  T
Q  118 aatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggata-aattcaatcaaaatcagggtaggcttgaaaa 216  Q
       |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  50037 gtaatgtagtttatcaccgaacaaaaagatctaaacctaccagcttaagttcgttttcaaaatggatataaatcaattaaaat-agggtaggcttcaaaa 50135  T
Q  217 gactcacaggaccaagcactttt 239  Q
    | ||| || ||||||||||||||    
T  50136 ggctcgcatgaccaagcactttt 50158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12932 - 12673
Alignment:
Q  213 aaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacg 307  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||| |||||| |||| ||||||     | | |||| |||||||||| |||  |||| |    
T  12932 aaaaggctcacaggacgaagcacttttgtcttagtgtgctactgacaaagattaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatg 12833  T
Q  308 gaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||  | || ||| ||||||||||| ||||||||||     | || |||    
T  12832 gaacactctatataagtaaattggaaaaa-taaaatttggccatgaaccttaca--gctatgatatctgggagttgtgactacctatttttaactgtcgt 12736  T
Q  406 acgcttcgcctttgaaat-acaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12735 acacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 12673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 469
Target Start/End: Original strand, 96998 - 97253
Alignment:
Q  213 aaaagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaacagta-----acaatgcatgttctagaaacgtagttgcacg 307  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||     | | |||| |||||||||| |||  |||| |    
T  96998 aaaaggctcacaggaccaaacacttttgcctcagtgtgctaatgacaaagatcaatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatg 97097  T
Q  308 gaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgta 406  Q
    ||||||||| || ||||||||||        ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||| ||| ||| ||| || ||||||||     |||||||    
T  97098 gaacactct-tagaagtaaattgaaaaa---aaaatatggccatgaaccttaca--gttatgatatcttggatttgtgattacctatcttgactgccgta 97191  T
Q  407 cgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  97192 cacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 97253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 61550 - 61175
Alignment:
Q  95 aaatcctaaaagtccctaggctcaatatgtagcttgtcaccgaacaaaaagatctaaacctaccggctcaaattggctttcaaaaaggataa--attcaa 192  Q
    |||||||||||||| ||| |||    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||||||  || |||    
T  61550 aaatcctaaaagtctctaagcttgtaatgtagtttgtcaccgaacaaaaagttctaaacctaccggctcagtttggc-taaagaaaggataattatacaa 61452  T
Q  193 tcaaaatcagggtaggcttgaa-aagactcacaggaccaagcacttttgcctcagtgtgtatatgataaagatcaatcaac-----agtaacaatgcatg 286  Q
      | ||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||   |||| ||||||||||| ||     || || | |||| |    
T  61451 atataaatagggtaggcttcaagaaggctcacaggaccatacacttttgcctcggtgtgctaatgacaaagatcaatcgacggtagagaaaaattgcaag 61352  T
Q  287 ttctagaaacgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgnnnnnnntaaaatttggctatgaaccttacaatgttagatttctgggagttgcgac 386  Q
    ||||| ||| |||  |||| |||||||||| || ||||||||||         |||||| || ||||| |||||||| |  ||| ||||||||||| |||    
T  61351 ttctataaatgtaaatgcatggaacactct-tagaagtaaattgaaaaat---aaatttcgccatgaaacttacaat-tatgatatctgggagttgtgac 61257  T
Q  387 tacctatcacacatgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaa 469  Q
    ||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  61256 tacctatctttactaccgtacacttcgcctttgaataacaattcac-ccctccttttgaacttttggaataccacttgaacaa 61175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 294516 - 294387
Alignment:
Q  338 taaaatttggctatgaaccttacaatgtta-gatttctgggagttgcgactacctatcacaca-tgccgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcactac 435  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    | ||| |||| |||||||||||||  |||||||||| |    
T  294516 taaagtttggctatgaacctgaca--gttatgatatctgggagttgtgactacctatcttttactgctgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-c 294420  T
Q  436 ctccttatgaacttttggaataccacttgaaca 468  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  294419 ctccttttgaacttttggaataccacttgaaca 294387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 99762 - 99799
Alignment:
Q  19 aattccaatagcaaccccaaacttattgtttagcaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  99762 aattccaatagcaaccccaaacttatcatttagcaaca 99799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 725 times since January 2019
Visitors: 1282