View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0087-Insertion-5 (Length: 542)

Name: NF0087-Insertion-5
Description: NF0087
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0087-Insertion-5
NF0087-Insertion-5
[»] chr1 (92 HSPs)
chr1 (2-542)||(3281313-3281850)
chr1 (226-542)||(26644852-26645166)
chr1 (208-525)||(21536541-21536856)
chr1 (205-542)||(37069575-37069909)
chr1 (224-542)||(29651636-29651954)
chr1 (225-537)||(13598223-13598536)
chr1 (225-542)||(47703890-47704208)
chr1 (225-542)||(13604577-13604893)
chr1 (225-542)||(19072753-19073071)
chr1 (225-542)||(19120643-19120961)
chr1 (225-542)||(16124470-16124787)
chr1 (228-542)||(47098779-47099090)
chr1 (208-531)||(19361397-19361722)
chr1 (208-531)||(19380037-19380362)
chr1 (224-542)||(32889265-32889582)
chr1 (208-531)||(19358808-19359132)
chr1 (225-485)||(775499-775757)
chr1 (225-505)||(27104363-27104639)
chr1 (208-531)||(24202734-24203054)
chr1 (225-537)||(9476089-9476399)
chr1 (228-537)||(47102801-47103107)
chr1 (243-498)||(24787364-24787623)
chr1 (208-383)||(40816844-40817020)
chr1 (243-485)||(17345531-17345771)
chr1 (225-433)||(50521165-50521373)
chr1 (400-496)||(25445079-25445173)
chr1 (400-496)||(41390582-41390676)
chr1 (400-496)||(41398237-41398331)
chr1 (378-468)||(3156968-3157058)
chr1 (243-505)||(22819270-22819535)
chr1 (404-468)||(9459419-9459483)
chr1 (404-468)||(9463246-9463310)
chr1 (404-468)||(16226382-16226446)
chr1 (400-496)||(39445501-39445594)
chr1 (377-497)||(43988452-43988572)
chr1 (400-496)||(44023864-44023957)
chr1 (378-468)||(28223396-28223486)
chr1 (381-446)||(41361040-41361105)
chr1 (400-496)||(1055002-1055095)
chr1 (412-468)||(16231778-16231834)
chr1 (404-468)||(23786054-23786118)
chr1 (404-468)||(51752578-51752642)
chr1 (414-485)||(9023851-9023922)
chr1 (378-468)||(28220201-28220291)
chr1 (386-468)||(28265537-28265619)
chr1 (378-468)||(49918453-49918543)
chr1 (386-448)||(40122179-40122240)
chr1 (386-448)||(50169193-50169254)
chr1 (469-537)||(40816773-40816842)
chr1 (404-468)||(6823229-6823293)
chr1 (404-468)||(10399830-10399894)
chr1 (404-468)||(13358788-13358852)
chr1 (404-468)||(27336942-27337006)
chr1 (404-468)||(28840894-28840958)
chr1 (404-468)||(31735523-31735587)
chr1 (404-468)||(47179928-47179991)
chr1 (404-468)||(51750254-51750318)
chr1 (404-468)||(51757745-51757809)
chr1 (386-468)||(834150-834232)
chr1 (386-468)||(3847104-3847186)
chr1 (225-288)||(9024037-9024100)
chr1 (378-468)||(44455263-44455353)
chr1 (389-443)||(196893-196946)
chr1 (404-458)||(12302507-12302561)
chr1 (386-448)||(13137959-13138020)
chr1 (378-448)||(30476421-30476490)
chr1 (383-468)||(31659341-31659426)
chr1 (404-458)||(39462744-39462798)
chr1 (412-473)||(9241095-9241156)
chr1 (404-473)||(28207070-28207139)
chr1 (404-468)||(15294836-15294900)
chr1 (404-464)||(23816105-23816165)
chr1 (386-446)||(45644337-45644396)
chr1 (404-468)||(47177577-47177640)
chr1 (397-448)||(19752810-19752861)
chr1 (378-468)||(37503532-37503622)
chr1 (378-448)||(37559842-37559912)
chr1 (386-468)||(50167158-50167240)
chr1 (412-465)||(2232710-2232764)
chr1 (386-448)||(4552620-4552681)
chr1 (412-473)||(9521827-9521889)
chr1 (412-473)||(9526578-9526640)
chr1 (404-458)||(17324638-17324692)
chr1 (427-473)||(21353372-21353418)
chr1 (406-452)||(47451873-47451919)
chr1 (404-458)||(50307548-50307602)
chr1 (404-453)||(2510327-2510376)
chr1 (404-473)||(13215296-13215365)
chr1 (404-453)||(18839818-18839867)
chr1 (386-470)||(46065019-46065103)
chr1 (404-468)||(27339133-27339197)
chr1 (404-468)||(47906485-47906549)
[»] chr5 (103 HSPs)
chr5 (208-542)||(14520039-14520372)
chr5 (227-542)||(9353287-9353599)
chr5 (243-542)||(36932304-36932602)
chr5 (224-542)||(11916926-11917246)
chr5 (208-542)||(15464343-15464675)
chr5 (301-542)||(12084130-12084373)
chr5 (225-537)||(19588573-19588884)
chr5 (225-542)||(42127365-42127679)
chr5 (225-542)||(17003914-17004230)
chr5 (225-505)||(28832087-28832364)
chr5 (208-542)||(3880113-3880442)
chr5 (243-542)||(38192017-38192316)
chr5 (243-542)||(38219242-38219541)
chr5 (253-505)||(24553499-24553748)
chr5 (207-542)||(31300550-31300883)
chr5 (370-542)||(10281722-10281894)
chr5 (225-503)||(11181825-11182104)
chr5 (208-542)||(35387474-35387805)
chr5 (223-531)||(24135674-24135980)
chr5 (332-509)||(6741784-6741962)
chr5 (246-478)||(33030959-33031196)
chr5 (376-498)||(31180192-31180311)
chr5 (364-513)||(15044652-15044798)
chr5 (400-497)||(43592280-43592375)
chr5 (400-497)||(43598725-43598820)
chr5 (400-497)||(43604217-43604312)
chr5 (400-497)||(43609709-43609804)
chr5 (400-498)||(30631407-30631503)
chr5 (400-497)||(31401838-31401934)
chr5 (400-497)||(1457151-1457246)
chr5 (328-486)||(7160914-7161069)
chr5 (400-497)||(27449815-27449910)
chr5 (404-468)||(4410237-4410301)
chr5 (400-495)||(37556613-37556706)
chr5 (400-495)||(37561435-37561528)
chr5 (400-497)||(2785376-2785472)
chr5 (400-497)||(31396981-31397077)
chr5 (400-497)||(27444971-27445066)
chr5 (400-513)||(28807546-28807656)
chr5 (414-505)||(2630245-2630337)
chr5 (404-468)||(15552460-15552524)
chr5 (404-468)||(31179371-31179435)
chr5 (404-468)||(31542949-31543013)
chr5 (404-468)||(31545295-31545359)
chr5 (389-448)||(538149-538207)
chr5 (335-468)||(28278419-28278553)
chr5 (400-497)||(33768180-33768276)
chr5 (400-497)||(33791317-33791413)
chr5 (225-275)||(42126627-42126677)
chr5 (404-468)||(3373137-3373201)
chr5 (404-468)||(10749915-10749979)
chr5 (404-468)||(15354575-15354639)
chr5 (404-468)||(38960132-38960196)
chr5 (385-468)||(42428412-42428495)
chr5 (207-262)||(213790-213845)
chr5 (225-268)||(10281689-10281732)
chr5 (378-468)||(19806466-19806556)
chr5 (378-468)||(30682898-30682987)
chr5 (386-468)||(32636927-32637009)
chr5 (386-448)||(5887417-5887478)
chr5 (404-458)||(27910675-27910729)
chr5 (386-448)||(31183095-31183156)
chr5 (378-448)||(39468524-39468593)
chr5 (399-448)||(533893-533942)
chr5 (404-468)||(2175133-2175197)
chr5 (404-468)||(10757391-10757455)
chr5 (404-468)||(15356851-15356915)
chr5 (404-468)||(21684452-21684516)
chr5 (404-468)||(23665258-23665322)
chr5 (404-468)||(23741859-23741923)
chr5 (404-468)||(23793265-23793329)
chr5 (404-468)||(25921473-25921537)
chr5 (208-312)||(28537430-28537533)
chr5 (404-468)||(34477053-34477117)
chr5 (404-468)||(34479418-34479482)
chr5 (412-474)||(1170921-1170984)
chr5 (378-468)||(28750630-28750720)
chr5 (335-448)||(38747129-38747241)
chr5 (404-458)||(18466909-18466963)
chr5 (412-473)||(22672946-22673008)
chr5 (412-473)||(25445608-25445670)
chr5 (386-448)||(33831804-33831865)
chr5 (412-473)||(35385460-35385522)
chr5 (412-468)||(4236844-4236900)
chr5 (404-468)||(6745283-6745347)
chr5 (404-468)||(38882320-38882384)
chr5 (378-468)||(13488306-13488396)
chr5 (412-470)||(36263820-36263879)
chr5 (378-468)||(42426210-42426300)
chr5 (404-458)||(2724118-2724172)
chr5 (404-458)||(24127081-24127135)
chr5 (412-473)||(25452607-25452669)
chr5 (404-458)||(41585744-41585798)
chr5 (412-473)||(42238372-42238434)
chr5 (404-453)||(10474323-10474372)
chr5 (404-453)||(10529099-10529148)
chr5 (404-457)||(27912762-27912815)
chr5 (404-453)||(40221753-40221802)
chr5 (414-473)||(2298011-2298071)
chr5 (404-468)||(6747519-6747583)
chr5 (386-468)||(8565930-8566011)
chr5 (404-468)||(39798262-39798326)
chr5 (404-468)||(39854698-39854762)
[»] chr8 (79 HSPs)
chr8 (208-542)||(4455838-4456170)
chr8 (208-537)||(19175713-19176044)
chr8 (227-542)||(7412166-7412483)
chr8 (243-542)||(31071183-31071481)
chr8 (225-542)||(5702437-5702753)
chr8 (208-542)||(6127029-6127364)
chr8 (208-542)||(23799531-23799863)
chr8 (223-542)||(19752348-19752667)
chr8 (225-542)||(26403184-26403501)
chr8 (225-468)||(9765848-9766090)
chr8 (208-542)||(26287713-26288034)
chr8 (208-542)||(26312964-26313285)
chr8 (225-484)||(4696609-4696873)
chr8 (208-531)||(1261919-1262238)
chr8 (225-512)||(6813505-6813796)
chr8 (204-525)||(36979180-36979504)
chr8 (236-531)||(4760039-4760338)
chr8 (208-542)||(26300958-26301291)
chr8 (208-525)||(30655448-30655773)
chr8 (400-531)||(10689107-10689239)
chr8 (243-525)||(33037777-33038062)
chr8 (364-525)||(18853137-18853298)
chr8 (364-525)||(18870531-18870692)
chr8 (400-498)||(6311298-6311394)
chr8 (400-497)||(7289915-7290010)
chr8 (400-496)||(25328268-25328362)
chr8 (415-505)||(9054828-9054919)
chr8 (400-497)||(10684252-10684348)
chr8 (400-497)||(35745392-35745488)
chr8 (376-503)||(3051097-3051224)
chr8 (404-468)||(18813152-18813216)
chr8 (400-496)||(39784813-39784906)
chr8 (404-468)||(43079873-43079937)
chr8 (404-468)||(43082244-43082308)
chr8 (378-468)||(4733809-4733899)
chr8 (378-448)||(15212910-15212979)
chr8 (381-446)||(19491676-19491741)
chr8 (414-505)||(5990552-5990643)
chr8 (404-468)||(18810978-18811042)
chr8 (416-468)||(24873193-24873245)
chr8 (404-468)||(28251567-28251631)
chr8 (404-468)||(44721114-44721178)
chr8 (378-468)||(4731761-4731851)
chr8 (389-448)||(6599096-6599154)
chr8 (389-448)||(6674549-6674607)
chr8 (340-477)||(28307503-28307638)
chr8 (378-468)||(33352253-33352343)
chr8 (378-448)||(43036547-43036616)
chr8 (404-468)||(3874281-3874345)
chr8 (404-468)||(22684653-22684717)
chr8 (384-448)||(27811402-27811465)
chr8 (404-468)||(27829567-27829631)
chr8 (386-468)||(4743197-4743279)
chr8 (412-474)||(16757276-16757339)
chr8 (412-474)||(25684753-25684816)
chr8 (386-468)||(40321183-40321265)
chr8 (412-473)||(28890877-28890939)
chr8 (404-453)||(41385030-41385079)
chr8 (404-468)||(609005-609069)
chr8 (404-468)||(4424289-4424353)
chr8 (393-468)||(10930188-10930264)
chr8 (404-468)||(27827256-27827320)
chr8 (412-468)||(32339580-32339636)
chr8 (483-542)||(4696561-4696620)
chr8 (412-474)||(4812496-4812559)
chr8 (386-468)||(5689374-5689456)
chr8 (412-474)||(28328018-28328081)
chr8 (386-448)||(3303653-3303714)
chr8 (386-448)||(12702617-12702678)
chr8 (412-473)||(17847785-17847847)
chr8 (427-473)||(29554809-29554855)
chr8 (399-468)||(40221848-40221918)
chr8 (404-453)||(14419190-14419239)
chr8 (404-453)||(30480503-30480552)
chr8 (412-448)||(8965699-8965735)
chr8 (404-468)||(15809489-15809553)
chr8 (404-468)||(28283221-28283284)
chr8 (412-470)||(33079693-33079753)
chr8 (404-468)||(43530386-43530450)
[»] chr2 (93 HSPs)
chr2 (203-542)||(42039623-42039961)
chr2 (208-542)||(23078425-23078759)
chr2 (204-542)||(36757717-36758053)
chr2 (227-542)||(28259132-28259445)
chr2 (208-542)||(10707206-10707540)
chr2 (208-542)||(8390104-8390441)
chr2 (208-537)||(13569137-13569466)
chr2 (225-542)||(10445398-10445716)
chr2 (208-505)||(34388669-34388964)
chr2 (225-542)||(20522047-20522363)
chr2 (207-542)||(8039869-8040205)
chr2 (207-542)||(34682288-34682622)
chr2 (240-542)||(31055884-31056187)
chr2 (236-505)||(33528612-33528880)
chr2 (225-537)||(17865030-17865341)
chr2 (208-531)||(3491563-3491882)
chr2 (208-542)||(14698962-14699285)
chr2 (208-514)||(16940191-16940496)
chr2 (208-514)||(17010856-17011161)
chr2 (236-542)||(33117974-33118279)
chr2 (208-542)||(25398305-25398638)
chr2 (225-542)||(39482762-39483074)
chr2 (225-542)||(21629778-21630086)
chr2 (243-542)||(25403477-25403776)
chr2 (246-526)||(40738688-40738959)
chr2 (208-525)||(11098897-11099217)
chr2 (208-531)||(14291295-14291621)
chr2 (329-505)||(2869684-2869861)
chr2 (431-542)||(25407653-25407765)
chr2 (208-531)||(9296365-9296691)
chr2 (386-503)||(1345533-1345652)
chr2 (393-498)||(2838028-2838134)
chr2 (414-486)||(27149305-27149377)
chr2 (301-488)||(35397412-35397600)
chr2 (400-497)||(44312613-44312708)
chr2 (400-496)||(39811978-39812072)
chr2 (422-513)||(32246810-32246900)
chr2 (404-468)||(35215586-35215650)
chr2 (404-468)||(35217963-35218027)
chr2 (400-497)||(19344422-19344518)
chr2 (400-497)||(19349280-19349376)
chr2 (404-468)||(23452237-23452301)
chr2 (404-468)||(36558864-36558928)
chr2 (404-468)||(36561141-36561205)
chr2 (404-468)||(45332181-45332245)
chr2 (386-468)||(723727-723809)
chr2 (386-468)||(34139753-34139835)
chr2 (389-447)||(11690626-11690683)
chr2 (383-468)||(17057349-17057434)
chr2 (383-468)||(17085332-17085417)
chr2 (243-352)||(27149008-27149118)
chr2 (207-265)||(32178403-32178461)
chr2 (386-468)||(39284939-39285024)
chr2 (386-447)||(11151574-11151634)
chr2 (404-468)||(27104988-27105052)
chr2 (225-537)||(40014755-40015063)
chr2 (412-474)||(2736315-2736378)
chr2 (386-468)||(14633808-14633890)
chr2 (412-474)||(17462546-17462609)
chr2 (386-468)||(36773665-36773747)
chr2 (378-468)||(38312343-38312433)
chr2 (412-474)||(45679833-45679896)
chr2 (386-448)||(11067429-11067490)
chr2 (414-474)||(2741051-2741112)
chr2 (413-473)||(33670976-33671037)
chr2 (404-468)||(42064705-42064770)
chr2 (404-468)||(5375346-5375410)
chr2 (404-468)||(19502011-19502075)
chr2 (404-468)||(19504346-19504410)
chr2 (404-468)||(45279984-45280048)
chr2 (414-512)||(15903874-15903972)
chr2 (386-468)||(29867972-29868054)
chr2 (412-474)||(39680155-39680218)
chr2 (412-474)||(39687093-39687156)
chr2 (404-458)||(6264148-6264202)
chr2 (407-468)||(7462950-7463012)
chr2 (404-458)||(22163022-22163076)
chr2 (412-473)||(30479106-30479168)
chr2 (386-448)||(33162433-33162494)
chr2 (404-458)||(42923509-42923563)
chr2 (404-453)||(3022378-3022427)
chr2 (404-453)||(13910045-13910094)
chr2 (248-313)||(16388297-16388362)
chr2 (404-452)||(11739559-11739607)
chr2 (414-473)||(12781231-12781291)
chr2 (404-452)||(17848647-17848695)
chr2 (414-473)||(17943647-17943707)
chr2 (404-468)||(22287336-22287400)
chr2 (404-468)||(24162223-24162287)
chr2 (414-473)||(27517649-27517709)
chr2 (386-434)||(36317992-36318039)
chr2 (404-468)||(42452972-42453035)
chr2 (404-468)||(43623580-43623644)
[»] chr4 (114 HSPs)
chr4 (243-542)||(5396626-5396926)
chr4 (208-537)||(38152398-38152727)
chr4 (208-537)||(8689455-8689765)
chr4 (225-542)||(10047206-10047522)
chr4 (224-542)||(5147503-5147820)
chr4 (261-542)||(3777413-3777691)
chr4 (208-526)||(16630650-16630968)
chr4 (243-542)||(31985588-31985885)
chr4 (225-542)||(3796473-3796792)
chr4 (224-537)||(5143085-5143397)
chr4 (225-542)||(54867009-54867326)
chr4 (208-484)||(5269204-5269481)
chr4 (224-542)||(5269156-5269465)
chr4 (225-484)||(25862035-25862292)
chr4 (225-498)||(39245820-39246093)
chr4 (225-542)||(42599527-42599847)
chr4 (208-522)||(24333621-24333932)
chr4 (341-542)||(36315184-36315384)
chr4 (341-542)||(36329393-36329593)
chr4 (208-484)||(28468542-28468813)
chr4 (354-542)||(16623247-16623435)
chr4 (236-542)||(6743370-6743679)
chr4 (208-362)||(16624143-16624297)
chr4 (208-525)||(24741748-24742067)
chr4 (207-522)||(29760448-29760765)
chr4 (225-512)||(1983284-1983568)
chr4 (225-505)||(5112068-5112343)
chr4 (208-497)||(34495822-34496108)
chr4 (400-513)||(3814025-3814136)
chr4 (400-513)||(5732666-5732777)
chr4 (413-505)||(39774296-39774389)
chr4 (400-497)||(51520458-51520553)
chr4 (400-497)||(56146700-56146795)
chr4 (400-485)||(9224408-9224491)
chr4 (400-513)||(45357269-45357380)
chr4 (377-468)||(12743899-12743990)
chr4 (377-468)||(12745288-12745379)
chr4 (404-468)||(22782738-22782802)
chr4 (400-496)||(45347807-45347901)
chr4 (400-485)||(9229195-9229278)
chr4 (404-468)||(16931789-16931853)
chr4 (404-468)||(16934143-16934207)
chr4 (400-496)||(18855728-18855821)
chr4 (404-468)||(22780373-22780437)
chr4 (404-468)||(44599838-44599902)
chr4 (378-468)||(12739525-12739615)
chr4 (378-468)||(26175611-26175701)
chr4 (404-468)||(2484873-2484937)
chr4 (404-468)||(6765113-6765177)
chr4 (404-468)||(7941592-7941656)
chr4 (404-468)||(18709164-18709228)
chr4 (404-468)||(22132392-22132456)
chr4 (404-468)||(24348487-24348551)
chr4 (404-468)||(38409473-38409537)
chr4 (386-468)||(48893621-48893703)
chr4 (208-258)||(5397069-5397119)
chr4 (383-468)||(9927438-9927523)
chr4 (383-468)||(29254597-29254682)
chr4 (386-448)||(46147374-46147435)
chr4 (404-453)||(47868685-47868734)
chr4 (404-468)||(5198689-5198753)
chr4 (404-468)||(5635476-5635540)
chr4 (404-468)||(8631419-8631483)
chr4 (404-468)||(9148521-9148585)
chr4 (404-468)||(11008568-11008632)
chr4 (404-468)||(17662245-17662309)
chr4 (403-471)||(34670688-34670756)
chr4 (381-468)||(45687160-45687247)
chr4 (378-468)||(5429782-5429872)
chr4 (412-474)||(11853659-11853722)
chr4 (378-468)||(34570389-34570479)
chr4 (386-468)||(52467337-52467419)
chr4 (404-473)||(15831253-15831323)
chr4 (412-473)||(18587078-18587140)
chr4 (404-473)||(36769591-36769661)
chr4 (252-505)||(37781716-37781968)
chr4 (378-448)||(54199882-54199950)
chr4 (415-468)||(9176485-9176538)
chr4 (412-485)||(18377371-18377444)
chr4 (399-448)||(36463384-36463433)
chr4 (404-453)||(40091415-40091464)
chr4 (388-448)||(5871944-5872003)
chr4 (404-468)||(9174146-9174210)
chr4 (404-468)||(11435223-11435287)
chr4 (404-468)||(11437631-11437695)
chr4 (404-468)||(18847422-18847485)
chr4 (404-468)||(22044391-22044455)
chr4 (404-468)||(22046686-22046750)
chr4 (404-468)||(22134618-22134681)
chr4 (404-468)||(24889065-24889129)
chr4 (404-468)||(31849599-31849663)
chr4 (386-468)||(36994627-36994708)
chr4 (404-468)||(37089372-37089436)
chr4 (378-468)||(37740728-37740818)
chr4 (386-468)||(47038394-47038476)
chr4 (412-474)||(55822375-55822437)
chr4 (412-473)||(4884986-4885048)
chr4 (412-473)||(8529379-8529441)
chr4 (412-473)||(10113134-10113196)
chr4 (414-468)||(11006247-11006301)
chr4 (404-458)||(19096162-19096216)
chr4 (404-458)||(24879269-24879323)
chr4 (404-458)||(24880731-24880785)
chr4 (399-468)||(27416960-27417030)
chr4 (404-458)||(38928177-38928231)
chr4 (404-453)||(4215590-4215639)
chr4 (413-473)||(5336789-5336850)
chr4 (432-473)||(13072010-13072051)
chr4 (404-453)||(22800862-22800911)
chr4 (412-473)||(36378557-36378618)
chr4 (404-453)||(40637358-40637407)
chr4 (414-473)||(12102352-12102412)
chr4 (404-452)||(16455527-16455575)
chr4 (404-468)||(51015514-51015578)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (208-526)||(36803-37119)
scaffold0087 (227-542)||(43916-44227)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (227-542)||(5757433-5757744)
chr6 (227-542)||(21355867-21356179)
chr6 (208-484)||(5017482-5017759)
chr6 (225-542)||(10077119-10077435)
chr6 (225-542)||(18232672-18232988)
chr6 (225-542)||(31979340-31979656)
chr6 (207-542)||(31086427-31086750)
chr6 (225-542)||(31936414-31936719)
chr6 (249-542)||(22963550-22963841)
chr6 (249-542)||(23824552-23824843)
chr6 (225-542)||(21801298-21801618)
chr6 (329-537)||(4629883-4630092)
chr6 (243-542)||(22708863-22709151)
chr6 (208-522)||(5674743-5675057)
chr6 (367-537)||(5572200-5572369)
chr6 (225-542)||(24435925-24436236)
chr6 (355-484)||(27165639-27165767)
chr6 (225-353)||(5572739-5572866)
chr6 (400-497)||(11856975-11857070)
chr6 (400-496)||(14737566-14737660)
chr6 (400-496)||(14742426-14742520)
chr6 (400-497)||(22010686-22010781)
chr6 (400-513)||(28155542-28155653)
chr6 (400-497)||(33335930-33336026)
chr6 (400-497)||(6005418-6005514)
chr6 (400-494)||(28184506-28184598)
chr6 (400-497)||(33330433-33330529)
chr6 (404-468)||(12195515-12195579)
chr6 (389-494)||(14521663-14521769)
chr6 (400-497)||(16838745-16838841)
chr6 (404-468)||(4816231-4816295)
chr6 (404-468)||(5273216-5273280)
chr6 (400-496)||(6438502-6438595)
chr6 (404-468)||(19704567-19704631)
chr6 (404-468)||(20915356-20915420)
chr6 (404-468)||(26932562-26932626)
chr6 (404-468)||(29754709-29754773)
chr6 (404-468)||(30967451-30967515)
chr6 (404-468)||(33309106-33309170)
chr6 (243-309)||(26258185-26258252)
chr6 (404-468)||(11983029-11983093)
chr6 (404-468)||(33311375-33311439)
chr6 (412-474)||(13878837-13878900)
chr6 (412-474)||(13883585-13883648)
chr6 (386-468)||(16569125-16569207)
chr6 (412-474)||(16786029-16786092)
chr6 (413-473)||(16455433-16455494)
chr6 (404-468)||(2628886-2628950)
chr6 (404-468)||(14458767-14458831)
chr6 (404-468)||(14507176-14507240)
chr6 (404-468)||(26066124-26066188)
chr6 (404-468)||(26068395-26068459)
chr6 (378-468)||(9183006-9183096)
chr6 (412-474)||(35201335-35201398)
chr6 (404-458)||(1069718-1069772)
chr6 (412-473)||(25941781-25941843)
chr6 (420-505)||(31076932-31077018)
chr6 (386-448)||(33211168-33211229)
chr6 (412-473)||(33215939-33216001)
chr6 (404-453)||(1230249-1230298)
chr6 (404-453)||(9020191-9020240)
chr6 (405-473)||(17065964-17066033)
chr6 (404-453)||(25477547-25477596)
chr6 (404-468)||(26065232-26065295)
chr6 (404-468)||(26085201-26085264)
chr6 (404-468)||(28241321-28241385)
chr6 (404-468)||(30034603-30034667)
chr6 (410-473)||(30445770-30445834)
[»] chr3 (142 HSPs)
chr3 (207-542)||(30709734-30710069)
chr3 (224-542)||(8370431-8370748)
chr3 (225-537)||(16264176-16264487)
chr3 (243-542)||(27974896-27975191)
chr3 (207-484)||(39039995-39040270)
chr3 (208-542)||(35925292-35925622)
chr3 (225-542)||(6794657-6794972)
chr3 (208-531)||(32143133-32143453)
chr3 (224-542)||(36028931-36029236)
chr3 (243-542)||(33386620-33386909)
chr3 (236-542)||(21711064-21711365)
chr3 (225-542)||(26298809-26299131)
chr3 (225-542)||(40592726-40593046)
chr3 (225-542)||(48438041-48438357)
chr3 (208-542)||(3715946-3716279)
chr3 (236-542)||(40844490-40844794)
chr3 (243-542)||(27986400-27986687)
chr3 (208-542)||(1417435-1417766)
chr3 (208-526)||(1305761-1306075)
chr3 (243-542)||(27452803-27453101)
chr3 (329-542)||(18552827-18553040)
chr3 (208-542)||(24695108-24695439)
chr3 (329-542)||(25795710-25795924)
chr3 (280-542)||(3328301-3328561)
chr3 (329-531)||(26928555-26928757)
chr3 (344-542)||(1736249-1736447)
chr3 (225-542)||(37466118-37466433)
chr3 (223-517)||(8477187-8477481)
chr3 (208-379)||(27026754-27026925)
chr3 (208-379)||(27038100-27038270)
chr3 (243-505)||(4386908-4387173)
chr3 (400-531)||(40372760-40372891)
chr3 (208-525)||(7167051-7167371)
chr3 (364-531)||(2671550-2671716)
chr3 (364-525)||(8739033-8739193)
chr3 (364-525)||(9091271-9091431)
chr3 (210-418)||(1309668-1309872)
chr3 (385-505)||(47923887-47924006)
chr3 (421-542)||(3323635-3323756)
chr3 (206-309)||(1417074-1417177)
chr3 (226-358)||(47924000-47924128)
chr3 (296-494)||(25929435-25929633)
chr3 (400-497)||(22173184-22173279)
chr3 (400-496)||(18656436-18656530)
chr3 (404-468)||(38210565-38210629)
chr3 (335-468)||(34491315-34491449)
chr3 (225-279)||(18554493-18554547)
chr3 (400-498)||(28503864-28503960)
chr3 (208-296)||(3323752-3323839)
chr3 (400-497)||(2672919-2673015)
chr3 (400-497)||(2677075-2677171)
chr3 (400-497)||(8512218-8512314)
chr3 (400-497)||(8517098-8517194)
chr3 (208-309)||(47649551-47649652)
chr3 (400-497)||(32475486-32475580)
chr3 (400-497)||(32480344-32480438)
chr3 (404-468)||(50494194-50494258)
chr3 (404-468)||(458479-458543)
chr3 (412-468)||(6063452-6063508)
chr3 (455-542)||(8126685-8126773)
chr3 (404-468)||(10621528-10621592)
chr3 (404-468)||(43228486-43228550)
chr3 (386-468)||(9666449-9666531)
chr3 (386-468)||(29196369-29196451)
chr3 (378-468)||(29813166-29813256)
chr3 (378-468)||(40734601-40734691)
chr3 (378-468)||(51398917-51399007)
chr3 (240-379)||(8126543-8126682)
chr3 (442-503)||(21353604-21353666)
chr3 (386-448)||(23391892-23391953)
chr3 (404-468)||(456102-456166)
chr3 (404-468)||(746952-747016)
chr3 (404-468)||(1321674-1321738)
chr3 (404-468)||(5886393-5886457)
chr3 (404-468)||(5899866-5899930)
chr3 (404-468)||(7606586-7606650)
chr3 (404-468)||(25389100-25389164)
chr3 (416-468)||(28413042-28413094)
chr3 (403-505)||(29100162-29100266)
chr3 (386-446)||(31314571-31314630)
chr3 (404-468)||(38890235-38890299)
chr3 (393-468)||(40913396-40913472)
chr3 (404-464)||(53894055-53894115)
chr3 (412-474)||(10094083-10094146)
chr3 (412-474)||(10100100-10100163)
chr3 (412-474)||(10200963-10201026)
chr3 (378-468)||(40735486-40735576)
chr3 (412-473)||(10595042-10595104)
chr3 (412-473)||(10897117-10897179)
chr3 (400-497)||(24968108-24968204)
chr3 (444-498)||(28501697-28501750)
chr3 (386-444)||(32744419-32744476)
chr3 (404-458)||(47701669-47701723)
chr3 (404-458)||(53917662-53917716)
chr3 (412-473)||(54193338-54193400)
chr3 (404-453)||(27101179-27101228)
chr3 (484-537)||(39032502-39032555)
chr3 (400-468)||(44331648-44331717)
chr3 (404-453)||(51943580-51943629)
chr3 (404-468)||(3859722-3859786)
chr3 (404-468)||(4103894-4103958)
chr3 (378-442)||(5236432-5236495)
chr3 (404-468)||(5522625-5522689)
chr3 (404-468)||(6065794-6065858)
chr3 (404-468)||(10084387-10084451)
chr3 (404-468)||(10958321-10958385)
chr3 (404-468)||(35919113-35919177)
chr3 (404-468)||(43226280-43226344)
chr3 (393-468)||(46173460-46173536)
chr3 (427-474)||(6303420-6303467)
chr3 (412-474)||(10208009-10208072)
chr3 (412-474)||(27544383-27544446)
chr3 (483-542)||(47649653-47649712)
chr3 (404-458)||(1313614-1313668)
chr3 (404-458)||(3314890-3314944)
chr3 (412-473)||(5858656-5858718)
chr3 (404-458)||(6484565-6484619)
chr3 (412-473)||(10612786-10612848)
chr3 (412-473)||(22625992-22626054)
chr3 (386-448)||(23410312-23410373)
chr3 (404-458)||(27635656-27635710)
chr3 (412-473)||(29913963-29914025)
chr3 (403-473)||(32264034-32264104)
chr3 (412-473)||(36871306-36871368)
chr3 (404-458)||(42990509-42990563)
chr3 (404-458)||(48361669-48361723)
chr3 (399-448)||(39153356-39153405)
chr3 (404-453)||(41849269-41849318)
chr3 (404-453)||(42992480-42992529)
chr3 (404-453)||(43421413-43421462)
chr3 (208-275)||(2671809-2671876)
chr3 (404-468)||(4308279-4308343)
chr3 (404-468)||(9604605-9604669)
chr3 (404-468)||(10191308-10191372)
chr3 (404-468)||(10956025-10956089)
chr3 (404-468)||(11170599-11170663)
chr3 (404-452)||(15781090-15781138)
chr3 (389-468)||(22834989-22835067)
chr3 (404-468)||(25533637-25533701)
chr3 (385-468)||(29810971-29811054)
chr3 (404-468)||(30006036-30006100)
chr3 (393-468)||(30236228-30236304)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (227-542)||(2479168-2479478)
chr7 (227-542)||(44848639-44848953)
chr7 (208-542)||(9189962-9190294)
chr7 (208-542)||(49091472-49091804)
chr7 (208-542)||(29159613-29159946)
chr7 (227-537)||(47263509-47263803)
chr7 (225-542)||(55766-56090)
chr7 (225-537)||(20283916-20284226)
chr7 (225-542)||(46516264-46516581)
chr7 (225-535)||(4796628-4796940)
chr7 (208-542)||(9185129-9185449)
chr7 (224-542)||(21983108-21983428)
chr7 (225-542)||(23402968-23403283)
chr7 (225-542)||(2580215-2580532)
chr7 (224-542)||(35960640-35960959)
chr7 (225-537)||(33332409-33332720)
chr7 (208-542)||(18413453-18413782)
chr7 (243-542)||(2647650-2647949)
chr7 (208-542)||(18408576-18408906)
chr7 (224-514)||(21988732-21989022)
chr7 (243-531)||(21639654-21639940)
chr7 (208-531)||(21645818-21646138)
chr7 (208-522)||(1533417-1533730)
chr7 (225-418)||(9235634-9235827)
chr7 (243-505)||(28617216-28617480)
chr7 (364-531)||(2057931-2058098)
chr7 (298-498)||(5817268-5817469)
chr7 (225-498)||(3047079-3047354)
chr7 (400-498)||(20357547-20357643)
chr7 (369-468)||(30814539-30814637)
chr7 (400-496)||(19992314-19992408)
chr7 (400-496)||(24024316-24024410)
chr7 (378-448)||(47676111-47676180)
chr7 (400-485)||(4866731-4866814)
chr7 (400-497)||(12396912-12397007)
chr7 (400-497)||(16880074-16880169)
chr7 (400-497)||(16884930-16885025)
chr7 (404-468)||(7351652-7351716)
chr7 (400-496)||(31109573-31109667)
chr7 (400-497)||(24261311-24261407)
chr7 (400-497)||(24266190-24266286)
chr7 (400-497)||(12406332-12406427)
chr7 (341-468)||(22270076-22270204)
chr7 (404-468)||(31155911-31155975)
chr7 (378-448)||(27347941-27348010)
chr7 (378-470)||(48489532-48489624)
chr7 (404-468)||(1046925-1046989)
chr7 (404-468)||(1049296-1049360)
chr7 (404-468)||(1850206-1850270)
chr7 (404-468)||(2935493-2935557)
chr7 (404-468)||(3035949-3036013)
chr7 (404-468)||(9027194-9027258)
chr7 (404-468)||(22108291-22108355)
chr7 (404-468)||(22137302-22137366)
chr7 (404-468)||(40550051-40550115)
chr7 (404-468)||(40552329-40552393)
chr7 (386-468)||(41317417-41317499)
chr7 (386-468)||(41648994-41649076)
chr7 (386-467)||(12097850-12097931)
chr7 (378-448)||(31732944-31733013)
chr7 (386-448)||(36146391-36146452)
chr7 (407-468)||(20297587-20297648)
chr7 (404-468)||(1606604-1606668)
chr7 (416-468)||(7349285-7349337)
chr7 (474-542)||(9235537-9235605)
chr7 (404-468)||(20626263-20626327)
chr7 (404-468)||(20630154-20630218)
chr7 (404-468)||(20642573-20642637)
chr7 (404-468)||(38394211-38394275)
chr7 (404-468)||(40836743-40836807)
chr7 (378-442)||(47673919-47673982)
chr7 (412-474)||(3320059-3320122)
chr7 (412-474)||(3324807-3324870)
chr7 (378-468)||(4586264-4586354)
chr7 (378-468)||(14069808-14069898)
chr7 (378-468)||(14379836-14379926)
chr7 (403-473)||(21369754-21369825)
chr7 (412-474)||(25405503-25405566)
chr7 (404-458)||(21592143-21592197)
chr7 (400-469)||(21812254-21812322)
chr7 (378-435)||(26417452-26417509)
chr7 (404-468)||(35854-35918)
chr7 (410-473)||(6046714-6046778)
chr7 (404-468)||(7470022-7470086)
chr7 (404-468)||(7471980-7472044)
chr7 (389-468)||(8153445-8153524)
chr7 (404-468)||(20299685-20299749)
chr7 (404-468)||(25542753-25542817)
chr7 (404-468)||(40946553-40946617)
chr7 (404-468)||(44724804-44724868)
chr7 (404-468)||(48457878-48457942)
chr7 (225-260)||(2647962-2647997)
chr7 (412-458)||(6067206-6067253)
chr7 (412-474)||(7069890-7069953)
chr7 (404-451)||(28487795-28487842)
chr7 (386-448)||(1113781-1113842)
chr7 (208-315)||(2057765-2057872)
chr7 (427-473)||(2121011-2121057)
chr7 (412-473)||(8378512-8378574)
chr7 (404-458)||(13099474-13099528)
chr7 (412-473)||(25351463-25351525)
chr7 (412-473)||(25410242-25410304)
chr7 (399-445)||(30024727-30024773)
chr7 (412-473)||(34546888-34546950)
chr7 (386-444)||(38671205-38671262)
chr7 (383-448)||(18126768-18126832)
chr7 (404-473)||(31435046-31435115)
chr7 (404-468)||(44789-44853)
chr7 (381-468)||(495961-496048)
chr7 (404-468)||(3878802-3878866)
chr7 (404-468)||(18345766-18345830)
chr7 (404-468)||(38396859-38396923)
chr7 (404-448)||(42330997-42331041)
chr7 (414-473)||(44010760-44010820)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (208-542)||(85495-85825)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (245-537)||(8378-8670)
scaffold0140 (404-468)||(22339-22403)
scaffold0140 (404-468)||(24614-24678)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (225-537)||(5508-5821)
scaffold0006 (225-542)||(133234-133550)
scaffold0006 (225-542)||(2319-2635)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (225-537)||(10554-10867)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (243-484)||(45100-45337)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (243-526)||(17922-18204)
scaffold0188 (205-526)||(24015-24334)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (225-537)||(17093-17401)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (208-336)||(1217-1344)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (400-496)||(9632-9726)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (400-497)||(14297-14393)
scaffold0197 (400-497)||(19153-19249)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (400-485)||(35063-35146)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (400-496)||(364-457)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (404-468)||(265-329)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (208-312)||(29673-29777)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (208-312)||(43067-43171)
scaffold0078 (414-485)||(23542-23613)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (400-497)||(2239-2335)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (378-448)||(20390-20459)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (400-497)||(148944-149040)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (404-468)||(11473-11537)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (404-468)||(69292-69356)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (400-469)||(181980-182048)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (404-468)||(6423-6487)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (404-468)||(1453-1517)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (404-468)||(29394-29458)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (412-474)||(3078-3141)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (404-458)||(4679-4733)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (412-473)||(16994-17056)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (404-468)||(3103-3167)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (404-468)||(14382-14446)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (404-468)||(41483-41547)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (404-468)||(79409-79473)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 542
Target Start/End: Original strand, 3281313 - 3281850
Alignment:
Q  2 ccaacaaaaatatctaagttactaacaacatcttcaatgaaaatatttaagtgagtttcatgaaaaaataaacttgcnnnnnnncctccattgaagaact 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||    
T  3281313 ccaataaaaatatctaagttactaagaacatcttcaatgaaaatatttaagtgagtttcatgaaaaaataaacttgctttttttcctccactgaagaact 3281412  T
Q  102 tgacgtgagaaagtagataacatagaaattataaaagtagtt-aaataaggtataatatcataatatcttaaatggttcaaatcaagaaataatgtatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281413 tgacgtgagaaagtagataacatagaaattataaaagtagtttaaataaggtataatatcataatatcttaaatggttcaaatcaagaaataatgtatca 3281512  T
Q  201 taataagtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaa 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3281513 taataagtgttgtgaattccgttaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtg--gagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaa 3281610  T
Q  301 caacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaa 400  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3281611 caacaacaa--aaaaagacatagactttgtgtagagcaacaccacaagaataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaa 3281708  T
Q  401 agattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaat 500  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281709 agattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaat 3281808  T
Q  501 agcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  3281809 agcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 3281850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 226 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 26645166 - 26644852
Alignment:
Q  226 aaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagac 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  26645166 aaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctttaagcaacaacaacaa--aagcagacctagac 26645069  T
Q  326 tttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaa 425  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26645068 ttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 26644969  T
Q  426 tatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26644968 tatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaa 26644869  T
Q  526 ggcctaatttctgccca 542  Q
    | |||||||||| ||||    
T  26644868 gacctaatttctaccca 26644852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 208 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21536856 - 21536541
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21536856 tgttttgaattccggtaaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaatcaacaacaac 21536757  T
Q  308 aacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgt 407  Q
    ||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536756 aa--aaatagacctagacttactgtagagcaacaccacaagcatagacaaagcacaaagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgt 21536659  T
Q  408 tgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgc 507  Q
    ||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536658 tgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgc 21536559  T
Q  508 aagcttacactagaacaa 525  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21536558 aagcttacacaagaacaa 21536541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 205 - 542
Target Start/End: Original strand, 37069575 - 37069909
Alignment:
Q  205 aagtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaac 304  Q
    |||||||| ||||| | || | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  37069575 aagtgttgcgaattccattgataatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaa 37069674  T
Q  305 aacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    || || |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37069675 aaaaaaaaaacagacttagacttaatgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaacgaaataaaggaacaaacacaccaaaagat 37069774  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  37069775 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttac---aaaatagtt 37069871  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  37069872 tgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 37069909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Original strand, 29651636 - 29651954
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |  || |||||||||||| |||| |||| |||    
T  29651636 aaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctataatcaacaacaacaa-aaaacagacttag 29651734  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  29651735 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gatttttgacccagttcggt 29651832  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||  |||||||||| ||    
T  29651833 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattaacttataagcttacacaag 29651932  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  29651933 aacaagacctaatttctaccca 29651954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 13598223 - 13598536
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa-agacctag 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13598223 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaata-gttaagtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagacctag 13598321  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  13598322 atctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggt 13598419  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  13598420 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaag 13598519  T
Q  521 aacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||| | ||||||||    
T  13598520 aacaagacttaatttct 13598536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 47704208 - 47703890
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||     
T  47704208 aaaatcacatcaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcagcaacaacaa-aaaatagacctaa 47704110  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  47704109 atctaagtgtagagcaacaccacaagtttaatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaaaaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggt 47704012  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  47704011 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttacaagcttacacaag 47703912  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  47703911 aacaagacctaatttctaccca 47703890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13604893 - 13604577
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||    
T  13604893 aaaatcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaa-agcaaaacagacatag 13604796  T
Q  324 actttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  || |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  13604795 tcta-gtatagagcaacatcacaagcatatacaaagcaataaagataagtaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggtt 13604698  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  13604697 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaaga 13604598  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  13604597 acaagacctaatttctaccca 13604577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 19072753 - 19073071
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  19072753 aaaatcacaccaatgaataacaaagatatgtggaacaaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaa-aaatcagacctaaa 19072851  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19072852 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtc 19072950  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||    
T  19072951 caatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaaga 19073050  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||  |||||||||| ||||    
T  19073051 acaatacctaatttctaccca 19073071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 19120643 - 19120961
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  19120643 aaaatcacaccaatgaataacaaagatatgtggaacaaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaa-aaatcagacctaaa 19120741  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19120742 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtc 19120840  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||    
T  19120841 caatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaaga 19120940  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||  |||||||||| ||||    
T  19120941 acaatacctaatttctaccca 19120961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 16124787 - 16124470
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  16124787 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaaatgtgtccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaga 16124690  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
     ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  16124689 tctaaatgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagctatgaaagaaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgactcagttcggt 16124592  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||    
T  16124591 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacataag 16124492  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  16124491 aacaagacctaatttctaccca 16124470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 228 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 47099090 - 47098779
Alignment:
Q  228 atcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ct 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| |||||| |||||||||||   || ||||||| | ||    
T  47099090 atcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagtaacaacaacaa---aacagacctaaatct 47098994  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaa 425  Q
      |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  47098993 aagtgtagagcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaa 47098896  T
Q  426 tatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||    
T  47098895 tatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaa 47098796  T
Q  526 ggcctaatttctgccca 542  Q
    | |||||||||| ||||    
T  47098795 gtcctaatttctaccca 47098779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19361722 - 19361397
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19361722 tgttgtgaatctggttaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 19361624  T
Q  307 caacaaaaaa---gacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaag 402  Q
     || ||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19361623 aaaaaaaaaaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaagaaaaggaag-aacaaacacaccaaaag 19361526  T
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaata 501  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19361525 attgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaata 19361427  T
Q  502 gcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19361426 gtttgcaagcttacacaagaacaagaccta 19361397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19380362 - 19380037
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19380362 tgttgtgaatctggttaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 19380264  T
Q  307 caacaaaaaa---gacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaag 402  Q
     || ||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19380263 aaaaaaaaaaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaagaaaaggaag-aacaaacacaccaaaag 19380166  T
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaata 501  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19380165 attgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaata 19380067  T
Q  502 gcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19380066 gtttgcaagcttacacaagaacaagaccta 19380037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Original strand, 32889265 - 32889582
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagaccta 322  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| |||    
T  32889265 aaaaatcataccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaagaaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaa---aacagatcta 32889360  T
Q  323 ga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaa-gaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcg 419  Q
     | ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  32889361 aatctaagtgtagagcaacaccacaagtataaccaaagcaataaagataagcaatgaaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgatctagttcg 32889458  T
Q  420 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacact 518  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  32889459 gtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacaca 32889558  T
Q  519 agaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||| |||||||||| ||||    
T  32889559 agaacaagtcctaatttctaccca 32889582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19359132 - 19358808
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19359132 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 19359034  T
Q  307 caacaaaaaaga--cctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaaga 403  Q
    ||| |||| | |  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  19359033 caaaaaaatacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaagaaaaggaag-aacaaacacatcaaaaga 19358936  T
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatag 502  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19358935 ttgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatag 19358837  T
Q  503 cttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19358836 cttgcaagcttacacaagaacaagaccta 19358808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 225 - 485
Target Start/End: Original strand, 775499 - 775757
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |    
T  775499 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaaccaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaaa 775596  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||    
T  775597 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaa--gattgttgacccaattcggtc 775694  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  775695 caatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaa 775757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 225 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27104639 - 27104363
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||      || |||||||     
T  27104639 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa------aacagacctaa 27104546  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  27104545 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaataaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacacagttcggt 27104448  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27104447 ccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 27104363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24203054 - 24202734
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  24203054 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaa--acaa 24202958  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gat 404  Q
    |||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||||   | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  24202957 caacaaaacagccctaaacta-gtgtagagcaacaccacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagat 24202861  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagc 503  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24202860 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagc 24202762  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24202761 ttgcaagcttacacaagaacaagaccta 24202734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 9476089 - 9476399
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaga-aagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||   || |||| ||     
T  9476089 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtagagcaaaatgaagtagtaattaatggataaagtgtctccaagcaacaataacaa---aacagacataa 9476185  T
Q  324 acttt-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaa-gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    |  |  |||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  9476186 atataagtgtagaa-aacatcacaagcataatcaaagcaaaaaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggt 9476282  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  9476283 ccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaattagcttacaagcttacacaag 9476382  T
Q  521 aacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||| ||||||||||    
T  9476383 aacaagacctaatttct 9476399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 228 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 47103107 - 47102801
Alignment:
Q  228 atcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ct 326  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||| || |||||||||||||||   || ||||||| | ||    
T  47103107 atcacaccaatgaataataaagacgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctcaaagcaacaacaacaa---aacagacctaaatct 47103011  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaa 425  Q
      |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  47103010 aagtgtagagcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaa 47102913  T
Q  426 tatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||  |||||||    
T  47102912 tatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccactaagatgaaaatgttacaatgagttacaagaaattaacttataagcatacaaaagaacaa 47102813  T
Q  526 ggcctaatttct 537  Q
    | ||||||||||    
T  47102812 gtcctaatttct 47102801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24787623 - 24787364
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaacaacaacaaaaaaga--cctagactttgtgtagagca 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||    
T  24787623 aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagcaaaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagactta-tgtagagca 24787525  T
Q  339 acaccacaagcata---aacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    | ||||||   | |   ||||||||| | |||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||    
T  24787524 aaaccacacaaagagataacaaagcaaacaagataagcaagaaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcct 24787428  T
Q  434 aatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24787427 aatctgggggggagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaa 24787364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 208 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 40817020 - 40816844
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  40817020 tgttgtgaattcggacaaaaaacacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 40816921  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaa 383  Q
    || |||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  40816920 aa-aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacgagcataatcaaagcaataaagataagtaatgaaagaaa 40816844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17345771 - 17345531
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaa-gtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||     ||||||||||||||||  |  ||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  17345771 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtagtaatcaatgagtaaaagtagcctcaagcaacaacaacaa--agtaatcctaagacttagtgtagaacaaca 17345674  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgg 440  Q
    ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  17345673 ccataagcataatcaaagccataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaaaacat-aaaagattattaacccagttcggtctaatatgacctactctgg 17345575  T
Q  441 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    || | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  17345574 ggaa-agaggagctctccaatccactaagatgaacgtggtacaaa 17345531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 50521373 - 50521165
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaa-gtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagaccta- 322  Q
    |||||||||  ||| || || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||  |  |||   ||||||||||||||| |||||||     
T  50521373 aaaatcacatcaataaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgagtaaaagtagtctcaa---acaacaacaacaaaatagacctaa 50521277  T
Q  323 gactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | | | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||| | | ||||||||||    
T  50521276 gtcctagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaagcaataaagagaaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagatttggtaacccagttcggt 50521177  T
Q  422 ccaatatgacct 433  Q
     |||||||||||    
T  50521176 tcaatatgacct 50521165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25445173 - 25445079
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  25445173 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 25445079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 41390582 - 41390676
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  41390582 aagattgttgacccagatcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 41390676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 41398237 - 41398331
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  41398237 aagattgttgacccaggtcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 41398331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3157058 - 3156968
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  3157058 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 3156968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 505
Target Start/End: Original strand, 22819270 - 22819535
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagac-ct--agactttgtgtagagcaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||    |||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||   |||| | ||     
T  22819270 aacaaagatgtgtggagcaaagaaaatggtaatcaatggataaagtgtccttaagcaacaacaacaacaacaaacagtcttaaaactaaatgtaaaacat 22819369  T
Q  340 caccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatat 438  Q
    |||||||||||||| |||| ||  |||||||| || | ||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | ||| || |||||||||||||||| | |    
T  22819370 caccacaagcataatcaaatcaacaagataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacac-acaagatggta-acccaatttggtccaatatgacctactct 22819466  T
Q  439 gggg-gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22819467 ggggggagagagtagccctccaatccaccaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagctt 22819535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459483
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9459483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463310
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9463310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226382
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16226382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 39445501 - 39445594
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  39445501 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 39445594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43988572 - 43988452
Alignment:
Q  377 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43988572 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgtttacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 43988476  T
Q  475 agtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  43988475 tgtgttacaaaagagttacaagaa 43988452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 44023957 - 44023864
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  44023957 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 44023864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 28223396 - 28223486
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  28223396 aagagagggacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 28223486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41361105 - 41361040
Alignment:
Q  381 aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga 446  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41361105 aaagaaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggaga 41361040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1055095 - 1055002
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  1055095 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 1055002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16231834 - 16231778
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16231834 ccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16231778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786054
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 23786054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752578
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 51752578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 9023922 - 9023851
Alignment:
Q  414 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9023922 agttcgctccaatatgacctattatggggaatatagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 9023851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 28220201 - 28220291
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  28220201 aagagagggacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 28220291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 28265537 - 28265619
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  28265537 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 28265619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 49918543 - 49918453
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  49918543 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 49918453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 40122179 - 40122240
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40122179 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 40122240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 50169193 - 50169254
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  50169193 aacaaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 50169254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 40816842 - 40816773
Alignment:
Q  469 gatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40816842 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttct 40816773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6823293 - 6823229
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6823293 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 6823229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 10399830 - 10399894
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10399830 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 10399894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13358852 - 13358788
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13358852 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 13358788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 27336942 - 27337006
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27336942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27337006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28840958 - 28840894
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28840958 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 28840894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 31735523 - 31735587
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31735523 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 31735587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47179991 - 47179928
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47179991 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactat 47179928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51750318 - 51750254
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51750318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 51750254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51757809 - 51757745
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51757809 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 51757745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 834150 - 834232
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  834150 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactat 834232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 3847104 - 3847186
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  3847104 aacaaacacaccaaa-gattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactat 3847186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9024100 - 9024037
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagt 288  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||    
T  9024100 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagaagtgtggagcagagaaagtggtaatcaatggataaagt 9024037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44455353 - 44455263
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  44455353 aagagaggaacaaacacaccaaa-gatcgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 44455263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 443
Target Start/End: Original strand, 196893 - 196946
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatggggg 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  196893 aaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctggggg 196946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 12302507 - 12302561
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12302507 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctcc 12302561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 13137959 - 13138020
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  13137959 aacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagaga 13138020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 30476421 - 30476490
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||    
T  30476421 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttaacctcatatggggtagaga 30476490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31659426 - 31659341
Alignment:
Q  383 aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||   | ||||||||||||||||    
T  31659426 aggaataaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactat 31659341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 39462798 - 39462744
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39462798 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 39462744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 9241095 - 9241156
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  9241095 ccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatga 9241156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Original strand, 28207070 - 28207139
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  28207070 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatgatga 28207139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 15294836 - 15294900
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  15294836 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 15294900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 23816165 - 23816105
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 464  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||    
T  23816165 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatcca 23816105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 446
Target Start/End: Original strand, 45644337 - 45644396
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga 446  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45644337 aacaagcacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 45644396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47177640 - 47177577
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47177640 ttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactat 47177577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19752861 - 19752810
Alignment:
Q  397 caaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19752861 caaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggagagaga 19752810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 37503532 - 37503622
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||  |||| |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  37503532 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcgatccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactat 37503622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 37559842 - 37559912
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatat-gggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  37559842 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctagggggagaga 37559912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 50167158 - 50167240
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  50167158 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 50167240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2232764 - 2232710
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccac 465  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2232764 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccac 2232710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 4552620 - 4552681
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||    
T  4552620 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagaga 4552681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9521889 - 9521827
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9521889 ccagttcggtctaatgacgacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatga 9521827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9526640 - 9526578
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9526640 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 9526578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 17324638 - 17324692
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  17324638 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 17324692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 473
Target Start/End: Original strand, 21353372 - 21353418
Alignment:
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21353372 atgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 21353418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 406 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451873
Alignment:
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 452  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcag 47451873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 50307548 - 50307602
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  50307548 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 50307602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 2510327 - 2510376
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  2510327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 2510376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13215365 - 13215296
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  13215365 ttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 13215296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18839867 - 18839818
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18839867 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagc 18839818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 46065103 - 46065019
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactatga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  46065103 aacaaacacaccaaa-gattgtttacccagttcgatccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatga 46065019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 27339133 - 27339197
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  27339133 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactat 27339197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47906549 - 47906485
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  47906549 ttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 47906485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 103)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 14520039 - 14520372
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14520039 tgttgtgaattccggtgaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 14520138  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    ||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520139 aa--aaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcactgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 14520236  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttg 506  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520237 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttg 14520336  T
Q  507 caagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14520337 caagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 14520372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9353599 - 9353287
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataa-caaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagac 325  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |    
T  9353599 aatcacaccaatgaaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaaacaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctagtc 9353502  T
Q  326 tttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaa 425  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9353501 ta-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 9353404  T
Q  426 tatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9353403 tatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaacaa 9353304  T
Q  526 ggcctaatttctgccca 542  Q
    |  ||||||||| ||||    
T  9353303 gatctaatttctaccca 9353287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36932602 - 36932304
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  36932602 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaacagacctagtcta-gtgtagagcaaca 36932505  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatggg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36932504 ccacaagcataaacaaagaacaaagataagcaatgaaa-aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 36932406  T
Q  442 ggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgcc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||| ||    
T  36932405 ggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagtttacataagaacaagacttaatttctacc 36932306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11917246 - 11916926
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaa-gaccta 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || || || |||||| ||||||    
T  11917246 aaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaccta 11917147  T
Q  323 ga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcgg 420  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  11917146 gatcttagtgtagagcaacaccacaagcataaacagtgcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcgg 11917049  T
Q  421 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacta 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11917048 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaatagtttgcaagcttacacaa 11916949  T
Q  520 gaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  11916948 gaacaagacctaatttctaccca 11916926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 15464343 - 15464675
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15464343 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 15464441  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15464442 caa--aaacagacctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagatt 15464537  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15464538 gttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagct 15464637  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15464638 tgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 15464675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 301 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12084373 - 12084130
Alignment:
Q  301 caacaacaacaaaaa-agacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacca 398  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12084373 caacaaaaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacca 12084274  T
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12084273 aaatattgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 12084174  T
Q  499 atagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     || |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  12084173 ttaacttaaaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 12084130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 19588573 - 19588884
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  19588573 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagcgtctccaagcaacaacaacaa--aaaaagacctaaa 19588670  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  19588671 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacactc--aaagattgttgacccagttcggtc 19588768  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||    
T  19588769 caatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaaga 19588868  T
Q  522 acaaggcctaatttct 537  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19588869 acaagacctaatttct 19588884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 42127679 - 42127365
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||   || |||| || |    
T  42127679 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa---aacagacttaaa 42127583  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  42127582 tctaattgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgatc 42127485  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaa 522  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||    
T  42127484 taatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaa 42127385  T
Q  523 caaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||| |||| ||||| ||||    
T  42127384 caagtcctactttctaccca 42127365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17004230 - 17003914
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||     
T  17004230 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagaggtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaa 17004133  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaa-gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  17004132 atctaagtgta-agcaacaccacaagcataatcaaagcaaaaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggt 17004036  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||    
T  17004035 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaagagttacaaaaaattaacttacaagcttacacaag 17003936  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  17003935 aacaagacctaatttctaccca 17003914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 225 - 505
Target Start/End: Original strand, 28832087 - 28832364
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||      
T  28832087 aaaatcataccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtcttcaagcaacaacaacaa--aaacagacctaat 28832184  T
Q  325 ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtcc 423  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  28832185 ctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaatcaataaagataagcaatgaaagaaacaaacaaacacaccaa--gattgttgacccggttcggtcc 28832282  T
Q  424 aatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28832283 aatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagctt 28832364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 3880113 - 3880442
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||| | ||| |||||||||    
T  3880113 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaatcaacaacaa 3880211  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
     ||||     |||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  3880212 aaaca-----gacctaaatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaa-cacaccaa--gat 3880303  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagc 503  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  3880304 tgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagt 3880403  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  3880404 ttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 3880442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Original strand, 38192017 - 38192316
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  38192017 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagccctagacta-gtgtagagcaaca 38192113  T
Q  342 ccaca--agcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaata 437  Q
    |||||  ||   | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||     
T  38192114 ccacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatc 38192210  T
Q  438 tgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttc 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  38192211 tgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttc 38192310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Original strand, 38219242 - 38219541
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  38219242 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagccctagacta-gtgtagagcaaca 38219338  T
Q  342 ccaca--agcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaata 437  Q
    |||||  ||   | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||     
T  38219339 ccacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatc 38219435  T
Q  438 tgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttc 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  38219436 tgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttc 38219535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24553748 - 24553499
Alignment:
Q  253 tgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcat 351  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24553748 tgtggagcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagcaacatcaacaa--aaacagacctaaatctaagtgtagagaaacaccacaagcat 24553651  T
Q  352 aaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagc 450  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  24553650 aatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagc 24553553  T
Q  451 agctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24553552 agc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagctt 24553499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31300883 - 31300550
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaaca 305  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| | || ||||||| |||   |||||||||| ||||||| ||||    
T  31300883 gtgttgtgaatt-cggtcaaaatcacactaatgaaaaataaagatgtattgagcaaaaggaactggtaatcaatagataaagtgttttcaagcaaaaaca 31300785  T
Q  306 acaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaaga 403  Q
    ||||   || ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  31300784 acaa---aacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtgtaatcaaaacaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--ga 31300690  T
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatag 502  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgttataatgagttgcaagaaaaatag 31300590  T
Q  503 cttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  31300589 tttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctaccca 31300550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 542
Target Start/End: Original strand, 10281722 - 10281894
Alignment:
Q  370 agcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10281722 agcaaagaaagaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 10281820  T
Q  470 atgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  10281821 atgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 10281894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 225 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11182104 - 11181825
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |    
T  11182104 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagtaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacttaaa 11182005  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   || | | | |||||||||    
T  11182004 tctaagtgtagagcaataccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaga---tggtaacctagttcggtc 11181908  T
Q  423 caatatgacctaatat-gggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagc 503  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  11181907 taatatgacctactctagggggagagagcaaccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagc 11181825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 35387474 - 35387805
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35387474 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 35387572  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gat 404  Q
    ||| || ||   ||||| ||  |||||||||||| |||||||   | |||||||| |  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  35387573 caaaaacaac--cctagtcta-gtgtagagcaactccacaagagaatacaaagcaaacgagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagat 35387667  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagc 503  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35387668 tgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagc 35387766  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||    
T  35387767 ttgcaagcttacacaagaataagtcctagtttctaccca 35387805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 223 - 531
Target Start/End: Original strand, 24135674 - 24135980
Alignment:
Q  223 taaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacct 321  Q
    ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| |||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||    
T  24135674 taaaactcacaccaatgaa-aataaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagagtctccaagcaa--acaacaacaaaacagccct 24135770  T
Q  322 agactttgtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttc 418  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24135771 agacta-gtgtagagcaacaccacaag-ataatacaaagcaaacaagataagctagaaaaggaag-aacaaacacaccaagaagattgttgacccagttc 24135867  T
Q  419 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacac 517  Q
     | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24135868 ag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacac 24135966  T
Q  518 tagaacaaggccta 531  Q
     |||||||| ||||    
T  24135967 aagaacaagtccta 24135980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 509
Target Start/End: Original strand, 6741784 - 6741962
Alignment:
Q  332 tagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatga 430  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||| ||||||||    
T  6741784 tagaacaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaa-gattattaacacagttcggttcaatatga 6741882  T
Q  431 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaatagcttgcaa 509  Q
    | || | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6741883 catactctgggggatagagcagctctccaatccattaagatggaagtgatacaaagaagttacaagaaattagcttgcaa 6741962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 33031196 - 33030959
Alignment:
Q  246 aaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttc-caagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga---ctttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||||| | | |||||| |||||||||||| ||| |  || |   ||  ||||||||||| |    
T  33031196 aaagatgtgtggagcaaaggaaatagtaattaatggataaagtgatcctcaagcaccaacaacaacaacaaataaatataaatctaagtgtagagcaata 33031097  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    |||| || |||| |||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| || | ||    
T  33031096 ccacgagaataatcaaagcaataaagataaccaatgaaaataaaggaacaaacacatcaaa-gattgttaattcagttcggtcaaatatgacatactctg 33030998  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtg 478  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33030997 ggggagagagcagctctccaattcactaagatgaaagtg 33030959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 376 - 498
Target Start/End: Original strand, 31180192 - 31180311
Alignment:
Q  376 gaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31180192 gaaagaaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaa 31180287  T
Q  475 agtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  31180288 agtgttacaaagggttacaagaaa 31180311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 513
Target Start/End: Original strand, 15044652 - 15044798
Alignment:
Q  364 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 462  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044652 aagataagcaagaaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatc 15044748  T
Q  463 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 513  Q
    || ||||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||||||    
T  15044749 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctt 15044798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 43592280 - 43592375
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43592280 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43592375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 43598725 - 43598820
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43598725 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43598820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 43604217 - 43604312
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43604217 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43604312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 43609709 - 43609804
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43609709 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43609804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 498
Target Start/End: Original strand, 30631407 - 30631503
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    |||||||||||  |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30631407 aagattgttgactcagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaa 30631503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31401934 - 31401838
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31401934 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31401838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1457246 - 1457151
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1457246 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 1457151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7161069 - 7160914
Alignment:
Q  328 tgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||  || ||||| || | ||||||| || ||||||||||||||   || | |||||||| | | ||||    
T  7161069 tgtgtaaagcaacaccacaggcataatcaaagcaacaaaataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaaaa---tggtaatccagtttgattcaat 7160974  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 486  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  7160973 atgacctactataggggagagatcagctctccaatccactcagatgaaagtgatacaaag 7160914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 27449815 - 27449910
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27449815 aagattgttgacccagttcag-ccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 27449910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410237
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactat 4410237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 37556706 - 37556613
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag 495  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  37556706 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37556613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 37561528 - 37561435
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag 495  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  37561528 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37561435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 2785376 - 2785472
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2785376 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2785472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31397077 - 31396981
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31397077 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31396981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 27444971 - 27445066
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27444971 aagattgttgacccagttcaggc-aatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 27445066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28807656 - 28807546
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 499  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||      
T  28807656 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaagaatc 28807560  T
Q  500 tagcttgcaagctt 513  Q
    |||||| |||||||    
T  28807559 tagctttcaagctt 28807546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 505
Target Start/End: Original strand, 2630245 - 2630337
Alignment:
Q  414 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||    
T  2630245 agttcggtccaatatgacctgctttgagggagatagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgatacaaaagggttacaataaattagctt 2630337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552460
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 15552460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179435
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31179435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542949
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31542949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545295
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31545295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 538207 - 538149
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  538207 aaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 538149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28278553 - 28278419
Alignment:
Q  335 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||  ||||||    
T  28278553 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaagaaacacaccaaga-attgttcacccagttcggtccaacttgacct 28278455  T
Q  434 aatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    | | ||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  28278454 actctggaggagagattgatctctccaatccactat 28278419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 33768180 - 33768276
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33768180 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33768276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 33791317 - 33791413
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33791317 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33791413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42126677 - 42126627
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaat 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42126677 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaat 42126627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373201
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactat 3373201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749915
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 10749915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354639
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 15354639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 38960132 - 38960196
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38960132 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 38960196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 468
Target Start/End: Original strand, 42428412 - 42428495
Alignment:
Q  385 gaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  42428412 gaacaaacacactaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 42428495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 213845 - 213790
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa 262  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  213845 gtgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtagagcaa 213790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 10281689 - 10281732
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaag 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10281689 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaag 10281732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19806556 - 19806466
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19806556 aagagaggaacaaacaccccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 19806466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 30682898 - 30682987
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30682898 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttga-ccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 30682987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32637009 - 32636927
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  32637009 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 32636927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 5887417 - 5887478
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5887417 aacaaacacaccaaa-gattgttgatccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 5887478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31183156 - 31183095
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31183156 aacaaacacaccaaa-gaatgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 31183095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 39468524 - 39468593
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39468524 aagagaggaacaaacacactaaa-gattgttgacccagttcagtccaatttaacctaatatgggggagaga 39468593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 533942 - 533893
Alignment:
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  533942 aaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 533893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2175197 - 2175133
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2175197 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2175133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10757455 - 10757391
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10757455 ttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 10757391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 15356851 - 15356915
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15356851 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat 15356915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 21684452 - 21684516
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21684452 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 21684516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23665322 - 23665258
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  23665322 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 23665258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 23741859 - 23741923
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  23741859 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 23741923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 23793265 - 23793329
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  23793265 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 23793329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 25921473 - 25921537
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25921473 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 25921537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Original strand, 28537430 - 28537533
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||| || |||| ||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||| |||| |||||||  |  ||||||||||||||    
T  28537430 tgttgtgaatttggtcaaaa-tcataccaatgaattacaaagatgtatggagcaaaaaaggtagtaatcaatgagtaaagtagtctcaagcaacaacaac 28537528  T
Q  308 aacaa 312  Q
    |||||    
T  28537529 aacaa 28537533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 34477053 - 34477117
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34477053 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 34477117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 34479418 - 34479482
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34479418 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 34479482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1170984 - 1170921
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1170984 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 1170921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 28750630 - 28750720
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  28750630 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattattgacccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 28750720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38747241 - 38747129
Alignment:
Q  335 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| |||||| |||||||  ||||||    
T  38747241 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaattaaagaaaggaacaaatccacc--aagattattgacccagtttggtccaacttgacct 38747144  T
Q  434 aatatgggggagaga 448  Q
     || || ||||||||    
T  38747143 gatctgagggagaga 38747129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18466963 - 18466909
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18466963 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 18466909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22673008 - 22672946
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22673008 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 22672946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25445670 - 25445608
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25445670 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 25445608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33831865 - 33831804
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33831865 aacaaaaacaccaaa-gattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatatgggggagaga 33831804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 35385460 - 35385522
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35385460 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 35385522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4236900 - 4236844
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4236900 ccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 4236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6745347 - 6745283
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6745347 ttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactat 6745283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882320
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactat 38882320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13488396 - 13488306
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13488396 aagagaggaacaaagacac-aaaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactat 13488306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 470
Target Start/End: Original strand, 36263820 - 36263879
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaa-tatgggggagagagcagctctccaatccactatga 470  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36263820 ccagtccggcccaatatgacctatgtctaggggagagagcagctctccaatccactatga 36263879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 42426210 - 42426300
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  42426210 aagagaggaacaaacacac-aaaagattgttgacctagttcagtccaacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactat 42426300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 2724172 - 2724118
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  2724172 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 2724118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24127135 - 24127081
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  24127135 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 24127081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25452669 - 25452607
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25452669 ccagttcggtctaatgatgacctattctgggggagagagcagctctctgatccactataatga 25452607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 41585744 - 41585798
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41585744 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctcc 41585798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42238434 - 42238372
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  42238434 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 42238372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 10474323 - 10474372
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10474323 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 10474372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 10529099 - 10529148
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  10529099 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 10529148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27912815 - 27912762
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctc 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  27912815 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctc 27912762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 40221802 - 40221753
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  40221802 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 40221753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 473
Target Start/End: Original strand, 2298011 - 2298071
Alignment:
Q  414 agttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2298011 agttcggtctaatgatgacctagtctgggggggagagcagctctccgatccactataatga 2298071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6747583 - 6747519
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6747583 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactat 6747519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 8565930 - 8566011
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  8565930 aacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactat 8566011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39798326 - 39798262
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  39798326 ttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 39798262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39854762 - 39854698
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  39854762 ttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 39854698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 79)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 4455838 - 4456170
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4455838 tgttgtgaattcccttaaaaatcacaccaatgaatatcaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagc 4455937  T
Q  308 aacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgt 407  Q
    ||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4455938 aa--aaacagacctggacttagtgtagagcaacacaacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgc 4456035  T
Q  408 tgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgc 507  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4456036 tgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctggc 4456135  T
Q  508 aagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  4456136 aagcttacacaagaacaagacataatttctaccca 4456170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 208 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19176044 - 19175713
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaat----taatgtgtaaagtgtttccaagcaacaa 303  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19176044 tgttgtgaattctggtaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaattaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaa 19175945  T
Q  304 caacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaaga 403  Q
    ||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19175944 caacaa---agcagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaaga 19175848  T
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatag 502  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19175847 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatag 19175748  T
Q  503 cttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  19175747 cctgcaagcttacacaagaacaagacctaacttct 19175713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Original strand, 7412166 - 7412483
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaa---gacctag 323  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||   |||||||    
T  7412166 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatgaatgtgtaaagtgtctccaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaacagacctag 7412265  T
Q  324 actttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    
T  7412266 tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtc 7412363  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaa 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7412364 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaa 7412463  T
Q  523 caaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  7412464 caagacctaatttctaccca 7412483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31071481 - 31071183
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||    
T  31071481 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaaca 31071385  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31071384 ccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctg 31071287  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||     
T  31071286 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttcta 31071187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5702753 - 5702437
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  5702753 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgaataaagtgtctcctagcaacaacaacaa--aaacagacctaga 5702656  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5702655 tctaagtgtagagcatcaccacaagcataattaaagcaatagagataagctatgaaggaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtc 5702558  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  5702557 caatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 5702458  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
     |||  |||||||||| ||||    
T  5702457 gcaaaacctaatttctaccca 5702437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 6127029 - 6127364
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   | |||||| |||||||||||||||    
T  6127029 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagattaagtgtctccaagcaacaacaa 6127127  T
Q  307 caacaaaaaagacctagacttt-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    ||| |||| |||  || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||    
T  6127128 caa-aaaacagatataaatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcactaaagataagcaatgaaagagatgaacaaacacatcaaat-at 6127225  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagc 503  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6127226 tgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagc 6127325  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||  |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  6127326 ttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctaccca 6127364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23799863 - 23799531
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||| |||||| |||||||||    
T  23799863 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaaaaa-aaatatgtgtggagcaaagaaagtgttaatcaatagataaagtgtctccaagaaacaacaac 23799766  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    || |||| ||||||||| ||  |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23799765 aa-aaaatagacctagatctaagtgtagagaagtaccacaaacataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gatt 23799669  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23799668 gttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagct 23799569  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  23799568 tacaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 223 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19752667 - 19752348
Alignment:
Q  223 taaaaatcacactaatgaataa-caaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacc 320  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||   || |||||    
T  19752667 taaaaatcacaccaatgaaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatatataaagtgtctccaagcaacaacaacaa---aacagacc 19752571  T
Q  321 taga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttc 418  Q
    || | ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||    
T  19752570 taaatctaagtgtagtgcaacaccacaagcataatcaaagcaatagagataagtaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacctagttc 19752473  T
Q  419 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacac 517  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19752472 ggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacac 19752373  T
Q  518 tagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||| |||||||||| ||||    
T  19752372 aagaacaagtcctaatttctaccca 19752348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 26403501 - 26403184
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   ||| |||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||||     
T  26403501 aaaaccacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataatgtgtctccaagcaataacaacaa--aaacagacctaa 26403404  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26403403 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaaacgaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggt 26403306  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  26403305 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaaattagcttacaagcttgcacaag 26403206  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  26403205 aacaagacctaatttctaccca 26403184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 225 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9766090 - 9765848
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| || |||  |||| |    
T  9766090 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa--cctaaa 9765993  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  9765992 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaagggaacaaacacaccaat-gattgttgacccagttcggtc 9765894  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765893 caatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 26287713 - 26288034
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26287713 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 26287811  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gat 404  Q
    |||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  26287812 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagat 26287906  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||    
T  26287907 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaga--------aaaatagct 26287996  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  26287997 tgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctaccca 26288034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 26312964 - 26313285
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26312964 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 26313062  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gat 404  Q
    |||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  26313063 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagat 26313157  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||    
T  26313158 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaga--------aaaatagct 26313247  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  26313248 tgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctaccca 26313285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 225 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4696873 - 4696609
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgta-------aagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaag 317  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||   ||       |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  4696873 aaaatcacatcaatgaataacaaagatgtgtggaacaaaggaagtggtaatcaatagatactagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacag 4696776  T
Q  318 acctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccag 415  Q
    || || | ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  4696775 acataaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccag 4696678  T
Q  416 ttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4696677 ttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1262238 - 1261919
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1262238 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagtaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaa 1262140  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gat 404  Q
    |||  ||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||||   | |||| ||| | ||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  1262139 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagagaatacaa-gcaaacaagataagata-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagat 1262046  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagc 503  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1262045 tgttgacccagttcaa-ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagc 1261947  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1261946 ttgcaagcttacacaagtacaagaccta 1261919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 512
Target Start/End: Original strand, 6813505 - 6813796
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagt-gtttcca--agcaacaacaacaacaaaaaagacct 321  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||   ||| | || || |  | ||||||||||||||||| |||| |    
T  6813505 aaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgttgagcaaagtgagtggtaatcaatggacaaaatagtctcaatcaacaacaacaacaacaaaatagactt 6813603  T
Q  322 a-gactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcg 419  Q
    | | ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||    
T  6813604 aagtcttagtgtagaacaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacataccaaa-gattgttaacccagttcg 6813702  T
Q  420 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagct 512  Q
    ||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  6813703 gtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 6813796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 525
Target Start/End: Original strand, 36979180 - 36979504
Alignment:
Q  204 taagtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaac 301  Q
    ||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||| || ||||||||||||    
T  36979180 taagtgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaac 36979279  T
Q  302 aacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacac 396  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||   | | |   ||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  36979280 aacaacaa--aaacagccctagacta-gtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acac 36979373  T
Q  397 caa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag 495  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36979374 caagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 36979472  T
Q  496 aa--aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    ||  |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  36979473 aaacaatagccttcaagcttacacaagaacaa 36979504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 4760338 - 4760039
Alignment:
Q  236 aatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgta 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||||    
T  4760338 aatgaaaaacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagcaaaatggtttccaagcaacaacaacaa--aaacagccctagacta-gtgta 4760242  T
Q  334 gagcaacaccacaagcata---aacaaagcacaaa---gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
    |||||| ||||||   | |   ||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||    
T  4760241 gagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acatcaagaagattgttgacccagttcag-ccaat 4760146  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaaca 524  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  4760145 atggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaaca 4760046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 26300958 - 26301291
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||    
T  26300958 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgcgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcaacaagcaacaacaa 26301056  T
Q  307 caacaaaa-----aagacctagactttgtgtagag---caaca-ccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacac 396  Q
    ||| || |     | | ||||  || |||||| ||   ||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  26301057 caaaaacagccctatggcctaatctatgtgtaaagtgtcaacaaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacac 26301154  T
Q  397 caaaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag 495  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            
T  26301155 caaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaga-------- 26301244  T
Q  496 aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  26301245 aaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctaccca 26301291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 525
Target Start/End: Original strand, 30655448 - 30655773
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||    
T  30655448 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaaca 30655546  T
Q  306 acaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcata-----aacaaagcacaaa---gataagcaatgaaagaaagga--acaaacaca 395  Q
    |||| |||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||     ||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||| |  | ||| |||    
T  30655547 acaa-aaaacagccctagacta-gtgtagagcaaaaccaca--catagagataacaaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaaaaaaaca 30655641  T
Q  396 ccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 494  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30655642 ccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 30655740  T
Q  495 gaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    |||  |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  30655741 gaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaa 30655773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 400 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 10689239 - 10689107
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||      
T  10689239 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaac 10689141  T
Q  498 aatagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10689140 aatagccttcaagcttacacaagaacaagcccta 10689107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33038062 - 33037777
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaac 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||| || |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||  |||||||||||     
T  33038062 aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaataaaca-gccctagacta-gtgtagagcaaa 33037965  T
Q  341 accacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgaccta 434  Q
    ||||||   | | |   ||||||| ||  ||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  33037964 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaaagaa--gaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggccta 33037869  T
Q  435 atatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  33037868 atctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaa 33037777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18853298 - 18853137
Alignment:
Q  364 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 462  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18853298 aagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 18853203  T
Q  463 cactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  18853202 caatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaa 18853137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18870692 - 18870531
Alignment:
Q  364 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 462  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18870692 aagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttca-tccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 18870597  T
Q  463 cactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  18870596 caatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaa 18870531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 498
Target Start/End: Original strand, 6311298 - 6311394
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6311298 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaa 6311394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 7290010 - 7289915
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7290010 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 7289915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25328362 - 25328268
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  25328362 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 25328268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9054919 - 9054828
Alignment:
Q  415 gttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9054919 gttcagtccaatatgacctactctggaggagagagcagctctctaatccactaagatgaaagtgatacaaagtggttacaagaaattagctt 9054828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10684348 - 10684252
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10684348 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 10684252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 35745392 - 35745488
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35745392 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 35745488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 503
Target Start/End: Original strand, 3051097 - 3051224
Alignment:
Q  376 gaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaa 475  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||  | | ||| ||||||| ||||| ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3051097 gaaagaaaacaacaaacacaccaaa-gattagtaacccaattcggtctaatataacctcctctggaggagagagcacctctccaatccactaagatgaaa 3051195  T
Q  476 gtgttacaaa-gagttacaagaaaatagc 503  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3051196 gtgatacaaatgagttacaagaaattagc 3051224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18813216 - 18813152
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18813216 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactat 18813152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 39784906 - 39784813
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  39784906 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 39784813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079873
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43079873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082244
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43082244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4733899 - 4733809
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagc-agctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  4733899 aagagaggaacaaacacaccaaa-gactgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactat 4733809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15212979 - 15212910
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  15212979 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 15212910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 446
Target Start/End: Original strand, 19491676 - 19491741
Alignment:
Q  381 aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga 446  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19491676 aaagaaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggaga 19491741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5990643 - 5990552
Alignment:
Q  414 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaga-gttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5990643 agtttggtccaatatgacatattgtgggggagagagcggctctccaat-tactaagatgaaagtgatacaaagatgttacaagaaattagctt 5990552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18811042 - 18810978
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18811042 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18810978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 468
Target Start/End: Original strand, 24873193 - 24873245
Alignment:
Q  416 ttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24873193 ttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactat 24873245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 28251567 - 28251631
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28251567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 28251631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721114
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactat 44721114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4731851 - 4731761
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagc-agctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  4731851 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactat 4731761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6599154 - 6599096
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6599154 aaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6599096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6674607 - 6674549
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6674607 aaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6674549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 477
Target Start/End: Original strand, 28307503 - 28307638
Alignment:
Q  340 caccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || | ||||| | || |||||| ||||  ||||| | | |||||||||||||| |||||||| | |    
T  28307503 caccacaagcataaacaaagcaataaatataagaaa-gcaagaatgaaataaacacgccaa--gattggtaacccagttcggtccaaaatgacctactct 28307599  T
Q  439 gggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 477  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28307600 ggggatgagagcagctctccaatccactaagatggaagt 28307638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33352343 - 33352253
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  33352343 aagagaggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 33352253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43036616 - 43036547
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  43036616 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagaga 43036547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3874345 - 3874281
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3874345 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 3874281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22684653 - 22684717
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22684653 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactat 22684717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27811465 - 27811402
Alignment:
Q  384 ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  27811465 ggaaaaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27811402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27829631 - 27829567
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27829631 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27829567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 4743197 - 4743279
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  4743197 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactat 4743279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 16757276 - 16757339
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16757276 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 16757339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25684816 - 25684753
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25684816 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 25684753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40321265 - 40321183
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  40321265 aacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40321183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28890939 - 28890877
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28890939 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 28890877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41385079 - 41385030
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41385079 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 41385030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 609069 - 609005
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  609069 ttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 609005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4424353 - 4424289
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  4424353 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactat 4424289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 468
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930264
Alignment:
Q  393 acaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 10930264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27827320 - 27827256
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27827320 ttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27827256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32339636 - 32339580
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32339636 ccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 32339580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 4696620 - 4696561
Alignment:
Q  483 aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  4696620 aaagagttacaagaaattagcttataagcttacgcaagaacaagacctaatttctaccca 4696561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 4812496 - 4812559
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4812496 ccagttcggtctaattatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 4812559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5689456 - 5689374
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  5689456 aacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 5689374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 28328081 - 28328018
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  28328081 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaa 28328018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 3303653 - 3303714
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  3303653 aacaaacacaccaaa-gattgtttacccagttcggtccaacttgacctactgtgggggagaga 3303714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 12702617 - 12702678
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  12702617 aacaaacataccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 12702678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17847847 - 17847785
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  17847847 ccagtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactataatga 17847785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 473
Target Start/End: Original strand, 29554809 - 29554855
Alignment:
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29554809 atgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 29554855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40221918 - 40221848
Alignment:
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  40221918 aaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40221848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 14419190 - 14419239
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  14419190 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 14419239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 30480503 - 30480552
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  30480503 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 30480552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 448
Target Start/End: Original strand, 8965699 - 8965735
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8965699 ccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 8965735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15809553 - 15809489
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  15809553 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactat 15809489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 28283221 - 28283284
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  28283221 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 28283284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 470
Target Start/End: Original strand, 33079693 - 33079753
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgaccta-atatggggg-agagagcagctctccaatccactatga 470  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33079693 ccagttcgacccaatatgacctacatctggggggagagatcagctctccaatccactatga 33079753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43530450 - 43530386
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  43530450 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactat 43530386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 93)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 203 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 42039961 - 42039623
Alignment:
Q  203 ataagtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaaca 302  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42039961 ataattgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaaca 42039862  T
Q  303 acaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaag 402  Q
    |||||||  ||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42039861 acaacaa--aaacatacctagattaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggagcaagcacaccaaaag 42039764  T
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-ta 501  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  42039763 attgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaagaaaatta 42039664  T
Q  502 gcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  42039663 gcttgcaagcttacacaaaaacaagacctaatttctaccca 42039623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23078759 - 23078425
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23078759 tgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 23078660  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    || |||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23078659 aa-aaaacatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaatggaacaaacacaccaaaagaatg 23078561  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttg 506  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23078560 ttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaaaatagcttg 23078461  T
Q  507 caagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  23078460 caagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca 23078425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 204 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36758053 - 36757717
Alignment:
Q  204 taagtgttgtgaatt-tcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaaca 302  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36758053 taagtgttgtgaatactagtaaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaaca 36757954  T
Q  303 acaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaag 402  Q
    |||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757953 acaacaa---aacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaag 36757857  T
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatag 502  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  36757856 attgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaaaag 36757757  T
Q  503 cttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  36757756 ctttcaagcttacacaagaacaaaacctaatttctaccca 36757717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 28259445 - 28259132
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagact 326  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  28259445 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtaataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaataacaaaaaaacagacctagtct 28259346  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28259345 a-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 28259248  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28259247 atgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaag 28259148  T
Q  527 gcctaatttctgccca 542  Q
      ||||||||| ||||    
T  28259147 atctaatttctaccca 28259132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10707540 - 10707206
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10707540 tgttgtgaatttcggtaaaaatcacacccatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 10707441  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    || |||| | ||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||   ||||||    
T  10707440 aagaaaatatacctagatctaagtgtagagcaacactgcaagcataatcaaagcacaaagataagcaaagaaagaaatgaataaacacacc--gagattg 10707343  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10707342 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 10707243  T
Q  506 gcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  10707242 acaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 10707206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 8390441 - 8390104
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgtta-aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  8390441 tgttgtgaattccggtacaaaatcacaccaatgaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtatccaaacaacaacaa 8390342  T
Q  307 caacaaaaa--agacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaaga 403  Q
    |||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||      
T  8390341 caacaaaaaccagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcgatgaaagaaatgaacaaacacaccaaaa-- 8390244  T
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtt-acaaagagttacaagaaaatag 502  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattag 8390144  T
Q  503 cttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  8390143 cttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctaccca 8390104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 208 - 537
Target Start/End: Original strand, 13569137 - 13569466
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaa-tcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13569137 tgttgtgaattccggtaaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaa 13569236  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    ||| |||| || | |||| ||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  13569237 caa-aaaacaggcttagatctaagtatagagaaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataatcaatgaaagaaaggaataaacacaccaaaa--tt 13569333  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13569334 gttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagct 13569433  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
    |  ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  13569434 tataagtttacacaagaacaagacctaatttct 13569466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10445716 - 10445398
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  10445716 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaacagacctaa 10445618  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10445617 atctaagtgtagagcaaaaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgatccagttcggt 10445520  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||    
T  10445519 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaatcttacacaag 10445420  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  10445419 aacaagacctaatttctaccca 10445398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 208 - 505
Target Start/End: Original strand, 34388669 - 34388964
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  34388669 tgttgtgaattctggtaaaaatcacaccaataaataacgaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatatgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac 34388768  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    ||  ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  34388769 aa--aaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcaaaatcaaagcacaaagataaacaaagaaagaaaggaacaaacacaccga--gattg 34388864  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34388865 ttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 34388964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 20522047 - 20522363
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  20522047 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagaaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaacaa--aaaaagacataga 20522144  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20522145 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtc 20522242  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||  |||    
T  20522243 caatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaattagattataagcttacaaaaga 20522342  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| | |||||||| ||||    
T  20522343 acaagacttaatttctaccca 20522363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 207 - 542
Target Start/End: Original strand, 8039869 - 8040205
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaaca 305  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||| | ||||||||||||    
T  8039869 gtgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaaca 8039967  T
Q  306 acaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaaga 403  Q
    ||||  ||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||  ||    
T  8039968 acaa--aaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaggagaggaaaaaatacatcaa--ga 8040063  T
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa---agagttacaagaaaat 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  8040064 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaagaaatt 8040163  T
Q  501 agcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  8040164 agcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 8040205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 207 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34682622 - 34682288
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaaca 305  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||    
T  34682622 gtgttgtgaatt-cgtacaaaaccacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaaca 34682524  T
Q  306 acaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaaga 403  Q
    ||||  ||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  34682523 acaa--aaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaacaaataaatataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--ga 34682428  T
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatag 502  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  34682427 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattag 34682328  T
Q  503 cttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||| || |||||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  34682327 cttacaggcttacacaagaacaagacttaatttctaccca 34682288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 240 - 542
Target Start/End: Original strand, 31055884 - 31056187
Alignment:
Q  240 aataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||  ||||||||||    
T  31055884 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaaatctaagtgtagagca 31055981  T
Q  339 acaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaat 436  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  31055982 acaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggttcaatatgacctaat 31056080  T
Q  437 atgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaattt 535  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  31056081 ctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaattt 31056180  T
Q  536 ctgccca 542  Q
    || ||||    
T  31056181 ctaccca 31056187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 236 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 33528880 - 33528612
Alignment:
Q  236 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||   |||||    
T  33528880 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtccccaagcaacaacaacaa--aaacagacctagatctaaatgtag 33528783  T
Q  335 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33528782 agcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacct 33528685  T
Q  434 aatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33528684 aatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 33528612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 17865030 - 17865341
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||    
T  17865030 aaaatcacaccaatgaataacaaaaatgtgtggagaaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaaccaacaacaacaa--aaacatacctaga 17865127  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||    
T  17865128 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaatcacaccaa--gattgttgacccagttcagtc 17865225  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  17865226 gaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 17865325  T
Q  522 acaaggcctaatttct 537  Q
    ||||| | ||||||||    
T  17865326 acaagacataatttct 17865341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Original strand, 3491563 - 3491882
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3491563 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 3491661  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3491662 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatagaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagatt 3491756  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3491757 gttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagct 3491855  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3491856 tgcaagcttacacaagaacaagaccta 3491882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 14699285 - 14698962
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  |  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  14699285 tgttgtgaattcggacaaaaaacacatcaatgaatatcaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 14699186  T
Q  308 aacaaaaa--agacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    ||||||||  ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||            |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14699185 aacaaaaagcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatca------------aagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagat 14699100  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagc 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14699099 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaaattagc 14699001  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14699000 ttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 14698962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 208 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 16940496 - 16940191
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||    
T  16940496 tgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaac 16940397  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    ||  ||| ||||||||| ||  ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16940396 aa--aaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gatt 16940301  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  16940300 gttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagct 16940201  T
Q  505 tgcaagctta 514  Q
    |  |||||||    
T  16940200 tataagctta 16940191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 208 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17011161 - 17010856
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||    
T  17011161 tgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaac 17011062  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    ||  ||| ||||||||| ||  ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17011061 aa--aaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gatt 17010966  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  17010965 gttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagct 17010866  T
Q  505 tgcaagctta 514  Q
    |  |||||||    
T  17010865 tataagctta 17010856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 542
Target Start/End: Original strand, 33117974 - 33118279
Alignment:
Q  236 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||   |||||||| | ||| || |||||||||  ||| ||||||| | ||  ||||||    
T  33117974 aatgaataacaaagatgtgtggatcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaaacatcaacaacaa--aaacagacctaaatctaagtgtag 33118071  T
Q  335 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  33118072 agcaacaccacaagcataatcaaagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttggctcagttcggtccaatatgacct 33118169  T
Q  434 aatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaa 532  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| | |||    
T  33118170 aatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaa 33118269  T
Q  533 tttctgccca 542  Q
    ||||| ||||    
T  33118270 tttctaccca 33118279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 25398305 - 25398638
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25398305 tgttgtgaatctggttgaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 25398403  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccaca--agcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-g 402  Q
    |||  ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||  ||   | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  25398404 caa--aaacagccctagacta-gtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaag 25398498  T
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaata 501  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25398499 attgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaata 25398597  T
Q  502 gcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  25398598 gcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctaccca 25398638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 39482762 - 39483074
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    |||  |||   |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  39482762 aaaatcacacaaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaa----taac-aatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaa-aaaacagacctaaa 39482855  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  39482856 tctaagtgtagaacaacaccacaagcataaccaaagcaataaagataaacaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggtc 39482953  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  39482954 caatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 39483053  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  39483054 acaagacctaatttctaccca 39483074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 21629778 - 21630086
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  21629778 aaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa---aacagacctaga 21629873  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  |||||||||| ||||||||       |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||    
T  21629874 tctaagtgtagagcagcaccacaatt-----caaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcagtc 21629966  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||    
T  21629967 caatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttataagcttacacaaga 21630065  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| | |||||||| ||||    
T  21630066 acaagacttaatttctaccca 21630086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Original strand, 25403477 - 25403776
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  25403477 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagccctagacta-gtgtagagcaaca 25403573  T
Q  342 ccaca--agcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaata 437  Q
    |||||  ||   | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||||     
T  25403574 ccacacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcag-ccaatatgacctaatc 25403670  T
Q  438 tgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttc 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  25403671 tgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttc 25403770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 526
Target Start/End: Original strand, 40738688 - 40738959
Alignment:
Q  246 aaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaa---gacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||| ||  |||||||||||||    
T  40738688 aaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatctatatgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaaaccagatctagtcta-gtgtagagcaaca 40738786  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgg 440  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  40738787 ccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgg 40738883  T
Q  441 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40738884 ggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaga--------aaaatagcttgcaagcttacacaagaacaag 40738959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 208 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11099217 - 11098897
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||    
T  11099217 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaaca 11099118  T
Q  306 acaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa- 399  Q
    ||||  ||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||   | | |   ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||     
T  11099117 acaa--aaacagccctagacta-gtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataaggaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaag 11099024  T
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  11099023 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 11098925  T
Q  498 aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11098924 aatagcttgcaagcttacacaagaacaa 11098897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Original strand, 14291295 - 14291621
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| || |||||||||||  |||    
T  14291295 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaa-aacaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggcaaaatggtttccaagcaa--aca 14291391  T
Q  306 acaacaaaaa-agacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcacaa--agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa 399  Q
    |||||||||| || ||||||||   |||||||||| ||||||   | |   ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  14291392 acaacaaaaacagccctagactaa-tgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaa 14291487  T
Q  400 -aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa- 497  Q
     ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14291488 gaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 14291586  T
Q  498 -aatagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14291587 caatagccttcaagcttacacaagaacaagcccta 14291621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 329 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2869861 - 2869684
Alignment:
Q  329 gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||    
T  2869861 gtgtagagcaacaccataagcatattcaaagcaacaaagataagcaaataaaggaagagaacaaacacaccaata--ttgtttacccagttcggtccaat 2869764  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2869763 atgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaagaaattagctt 2869684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 431 - 542
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407765
Alignment:
Q  431 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcc 529  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcc 25407752  T
Q  530 taatttctgccca 542  Q
    || ||||| ||||    
T  25407753 tagtttctaccca 25407765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9296691 - 9296365
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| | ||| || |||||||||||  |||    
T  9296691 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagcaaaatggtttccaagcaa--aca 9296595  T
Q  306 acaacaaaaa-agacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcacaa--agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa 399  Q
    |||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||||   | |   ||||||||| ||  ||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  9296594 acaacaaaaacagccctagtcta-gtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcaaaacaagaaaagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaa 9296499  T
Q  400 -aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa- 497  Q
     ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9296498 gaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 9296400  T
Q  498 -aatagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
     |||||| | |||||||| || |||||||| ||||    
T  9296399 caatagccttcaagcttatacaagaacaagcccta 9296365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1345652 - 1345533
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccac-tatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  1345652 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccacttaagatgaaagtgatacaa 1345553  T
Q  485 a-gagttacaagaaaatagc 503  Q
    | ||||| ||||||| ||||    
T  1345552 atgagttgcaagaaattagc 1345533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2838134 - 2838028
Alignment:
Q  393 acaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagtta 491  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  2838134 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagtta 2838035  T
Q  492 caagaaa 498  Q
    |||||||    
T  2838034 caagaaa 2838028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 414 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 27149377 - 27149305
Alignment:
Q  414 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 486  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27149377 agtttggtccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaag 27149305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 488
Target Start/End: Original strand, 35397412 - 35397600
Alignment:
Q  301 caacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacca 398  Q
    |||||||||||||| | ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  35397412 caacaacaacaaaatatacctaaatctatgtgcagagcaaaaccacaagcataatcaaagcaatcaatataagcaatgaaagaaggaaacaaacacacc- 35397510  T
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgaccta-atatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagag 488  Q
     || |||||| | |||||||||| |||| | ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  35397511 -aatattgtttacccagttcggttcaatctaacctacatctggaggagatagcagctcttcaatccactaagatgaaagtgatataaagag 35397600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44312708 - 44312613
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44312708 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 44312613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 39812072 - 39811978
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  39812072 aagattgttgaaccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 39811978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 513
Target Start/End: Original strand, 32246810 - 32246900
Alignment:
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 513  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||||||    
T  32246810 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctt 32246900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215650
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218027
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35218027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 19344422 - 19344518
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19344422 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19344518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 19349280 - 19349376
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19349280 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19349376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452301
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 23452301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558928
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 36558928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561205
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 36561205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332245
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactat 45332245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 723727 - 723809
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  723727 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 723809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 34139753 - 34139835
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  34139753 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 34139835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 389 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11690683 - 11690626
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag 447  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  11690683 aaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacgtaatatgggggagag 11690626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 468
Target Start/End: Original strand, 17057349 - 17057434
Alignment:
Q  383 aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  17057349 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactat 17057434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 468
Target Start/End: Original strand, 17085332 - 17085417
Alignment:
Q  383 aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  17085332 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactat 17085417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27149118 - 27149008
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaaca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||     |||||||||||||||| || | ||| ||| | || | |||| |||||||    
T  27149118 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtgataatcaatgagtaaagtagcatcaagcaacaacaacaataacatagatctaaatctatttgtaaagcaaca 27149019  T
Q  342 ccacaagcata 352  Q
    |||||||||||    
T  27149018 ccacaagcata 27149008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 32178403 - 32178461
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaga 265  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32178403 gtgttgtgaattgcatacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaga 32178461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39285024 - 39284939
Alignment:
Q  386 aacaaacacacca--aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  39285024 aacaaacacaccattaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 39284939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 447
Target Start/End: Original strand, 11151574 - 11151634
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag 447  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  11151574 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagag 11151634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27105052 - 27104988
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27105052 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27104988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 40014755 - 40015063
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||   |||||||   |||||||||||||||||||| | | |||| |    
T  40014755 aaaatcacaccaatgacaaacaaagatgtatggagcaaaggaagtagtaatcaatgg--aaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaaca-gtcctaaa 40014851  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa--caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
     ||  ||||| | || |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||  || ||||||||  |||| | ||   ||||| ||  | |||||| | |    
T  40014852 actaagtgtaaaacatcaccacaagcataatcaaagcaacaagataagaaaccaa-gaaaggaaaacaaatatac---aagatggta-acccagttagat 40014946  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    |||||||||| || | || |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||  || || |||  ||    
T  40014947 ccaatatgacatactctgagggagagaacatccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttgcgagaaattagcttaaaaactcacaaaag 40015046  T
Q  521 aacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||| ||||||||||    
T  40015047 aacaagacctaatttct 40015063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2736378 - 2736315
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2736378 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 2736315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 14633808 - 14633890
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  14633808 aacaaacacaccaaa-gattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 14633890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 17462609 - 17462546
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17462609 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 17462546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36773747 - 36773665
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36773747 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactat 36773665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38312433 - 38312343
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  38312433 aagagaggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactat 38312343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 45679896 - 45679833
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45679896 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 45679833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11067490 - 11067429
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  11067490 aacaaacacaccaaa-gattgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 11067429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2741112 - 2741051
Alignment:
Q  414 agttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2741112 agttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 2741051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 473
Target Start/End: Original strand, 33670976 - 33671037
Alignment:
Q  413 cagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33670976 cagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 33671037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064705
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaa-tatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 42064705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 5375346 - 5375410
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  5375346 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 5375410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 19502011 - 19502075
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  19502011 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactat 19502075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 19504346 - 19504410
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  19504346 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactat 19504410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 45279984 - 45280048
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45279984 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 45280048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15903972 - 15903874
Alignment:
Q  414 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagct 512  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  15903972 agttcgatccaatatgacctactctgacggagagagaaaatctccaatccactaagataaaagtgatacaaaggggttacaag-aaatagcttacaagct 15903874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29868054 - 29867972
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29868054 aacaaacacatcaaa-gattattgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 29867972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 39680218 - 39680155
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  39680218 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaa 39680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 39687156 - 39687093
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  39687156 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaa 39687093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 6264148 - 6264202
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6264148 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 6264202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 407 - 468
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463012
Alignment:
Q  407 ttgatccagttcggtccaatat-gacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 7463012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 22163022 - 22163076
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22163022 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 22163076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30479168 - 30479106
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  30479168 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatctactataatga 30479106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 33162433 - 33162494
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  33162433 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 33162494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 42923509 - 42923563
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  42923509 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctcc 42923563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3022427 - 3022378
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  3022427 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 3022378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 13910045 - 13910094
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  13910045 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 13910094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Original strand, 16388297 - 16388362
Alignment:
Q  248 agatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||  |  |||||| |||||||||||||    
T  16388297 agatgtgtggagcaaagaaagtagtaatcaatgaataaagtagtctcaagcagcaacaacaacaaa 16388362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 452
Target Start/End: Original strand, 11739559 - 11739607
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  11739559 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 11739607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 473
Target Start/End: Original strand, 12781231 - 12781291
Alignment:
Q  414 agttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  12781231 agttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 12781291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17848695 - 17848647
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 452  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  17848695 ttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcag 17848647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17943707 - 17943647
Alignment:
Q  414 agttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17943707 agttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatga 17943647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22287336 - 22287400
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22287336 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 22287400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 24162223 - 24162287
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24162223 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactat 24162287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 473
Target Start/End: Original strand, 27517649 - 27517709
Alignment:
Q  414 agttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  27517649 agttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 27517709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 434
Target Start/End: Original strand, 36317992 - 36318039
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgaccta 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  36317992 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgaccta 36318039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42453035 - 42452972
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  42453035 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 42452972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 43623580 - 43623644
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  43623580 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactat 43623644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 114)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5396926 - 5396626
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagact---ttgtgtagagcaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   | |||||||||||    
T  5396926 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctagactaattagtgtagagcaa 5396829  T
Q  340 caccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5396828 caccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaagaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 5396729  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgc 539  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  5396728 gaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctac 5396629  T
Q  540 cca 542  Q
    |||    
T  5396628 cca 5396626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 208 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 38152727 - 38152398
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38152727 tgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtagagcaaatgaagtggtaatcaatgtatgaagtgtttccaagcaacaacaac 38152628  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    || |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38152627 aataaaacagacctagatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattg 38152530  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  38152529 ttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaaattagctt 38152430  T
Q  506 gcaagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38152429 ataagcttacacaagaacaagacctaatttct 38152398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 208 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8689765 - 8689455
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||      ||||||||| |||||| |||||||||    
T  8689765 tgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatc-----gtaaagtgtctccaagtaacaacaac 8689671  T
Q  308 aacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgt 407  Q
    ||  ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8689670 aa--aaacagacctagacttaatgcagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaagtaacaaacacaccaaaagattgt 8689573  T
Q  408 tgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||    
T  8689572 tgatccagttcggtccaatatgatctaatatggggg--agaggagctctcctatccactatgatgaaagt----------gttacaagaaaatagcttgc 8689485  T
Q  508 aagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8689484 aagcttacacaagaacaagacctaatttct 8689455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 10047206 - 10047522
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||    
T  10047206 aaaatcacaccaatgaataacaaaaatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaataacaacaa--aaatagacataga 10047303  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  10047304 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtc 10047401  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  10047402 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 10047501  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  10047502 acaagacctaatttctaccca 10047522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Original strand, 5147503 - 5147820
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |  ||||||     
T  5147503 aaaaatcacaccaatgaataacaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaataaca--gacctaa 5147600  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  5147601 atctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaaacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcggt 5147698  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5147699 ccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaag 5147798  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  5147799 aacaaggcctaatttctaccca 5147820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 261 - 542
Target Start/End: Original strand, 3777413 - 3777691
Alignment:
Q  261 aaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 359  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  3777413 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctagatctaagtgtagaacaaaaccacaagcataatcaaag 3777510  T
Q  360 cacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||    
T  3777511 cacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctcca 3777608  T
Q  460 atccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||    
T  3777609 atccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagatctaatttctaccca 3777691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 208 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16630968 - 16630650
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaa-tcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16630968 tgttgtgaatttcggtaaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaactggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcagcaacaa 16630869  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    ||  |||| | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |    
T  16630868 ca--aaaacaaacctagatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaagaacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacacc--aaggt 16630773  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagc 503  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16630772 tgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagc 16630673  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||  |||||||||| ||||||||    
T  16630672 ttataagcttacacaagaacaag 16630650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31985885 - 31985588
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||     
T  31985885 aacaaagatgtgtggtgcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaacagacctagtcta-gtgtagagcaact 31985788  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgg 440  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31985787 ccacaagcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 31985690  T
Q  441 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgc 539  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  31985689 gg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctac 31985591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 3796792 - 3796473
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||     
T  3796792 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaatcagacctaa 3796694  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  3796693 atctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttccgt 3796595  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  3796594 ccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcacaag 3796495  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  3796494 aacaagacctaatttctaccca 3796473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 224 - 537
Target Start/End: Original strand, 5143085 - 5143397
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||     
T  5143085 aaaaatcaaaccaatgaataacaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaacaa--aaacagacctaa 5143182  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | ||||||||    
T  5143183 atctaagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaaacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactga--gattgttgacctagttcggt 5143280  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5143281 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaaaatagcttgcaagcatacacaag 5143380  T
Q  521 aacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||| ||||||||||    
T  5143381 aacaagacctaatttct 5143397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 54867009 - 54867326
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54867009 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacataga 54867108  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag-cacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  54867109 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgacccagttcggtc 54867206  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  54867207 caatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaatagttataagaaattagcttataagcttacacaaga 54867305  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||  |||||||||| ||||    
T  54867306 acaatacctaatttctaccca 54867326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 208 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5269481 - 5269204
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  5269481 tgttgtgaattcggacaaaaattacactaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaac 5269382  T
Q  308 aacaaaaa-agacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    |||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  5269381 aacaaaaatatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaatataagaaatgaaagaaaggaacaaacaca--acaagat 5269284  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5269283 tgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5269465 - 5269156
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa-agaccta 322  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  5269465 aaaaattacactaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaatataccta 5269366  T
Q  323 ga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcgg 420  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||    
T  5269365 gatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaatataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaacaa--gattgttgacctagttcgg 5269268  T
Q  421 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||  |||||||||| ||    
T  5269267 tccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaattagcttataagcttacacaag 5269178  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  5269177 aacaagacctaatttctaccca 5269156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 225 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25862292 - 25862035
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |    
T  25862292 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaaa 25862195  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  25862194 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaataaacacaccaa--gattgttgactcagttcggtc 25862097  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25862096 caatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 225 - 498
Target Start/End: Original strand, 39245820 - 39246093
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  39245820 aaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagcgaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaa-aaaacagacctaaa 39245918  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  39245919 tctaagtgtagagcaacaccacaggcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtc 39246016  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 498  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39246017 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 39246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 42599847 - 42599527
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa-agacctag 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||||  |||||||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  42599847 aaaatcacactaatgaataataaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgactccaagcaacaacaacaaaacaaacaaacctag 42599748  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||    
T  42599747 atctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcagt 42599650  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagag--cagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacta 519  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  |    
T  42599649 ccaatatgacataatatgggggagagagagcaaccctccaatccactaagatgaaaatgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaa 42599550  T
Q  520 gaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  42599549 gaacaagacctaatttctaccca 42599527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 208 - 522
Target Start/End: Original strand, 24333621 - 24333932
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||    
T  24333621 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaa 24333719  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    ||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||   |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  24333720 caa-aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacac---aagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaacaaacacaccaa--gat 24333813  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagc 503  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  24333814 tgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaagagttataaaaaattagc 24333913  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaa 522  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  24333914 ttacaagcttacacaagaa 24333932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 341 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36315384 - 36315184
Alignment:
Q  341 accacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36315384 accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 36315287  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgc 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  36315286 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctac 36315187  T
Q  540 cca 542  Q
    |||    
T  36315186 cca 36315184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 341 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36329593 - 36329393
Alignment:
Q  341 accacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36329593 accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 36329496  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgc 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  36329495 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctac 36329396  T
Q  540 cca 542  Q
    |||    
T  36329395 cca 36329393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 208 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 28468813 - 28468542
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28468813 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 28468715  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28468714 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagatt 28468620  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468619 gttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 354 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 16623435 - 16623247
Alignment:
Q  354 acaaagcacaaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16623435 acaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcag 16623338  T
Q  453 ctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  16623337 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctaataagcttacagaagaacaagacctaatttctaccca 16623247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6743679 - 6743370
Alignment:
Q  236 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa---agacctaga-ctttgtg 331  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||||| | |||   | | ||| | ||  |||    
T  6743679 aatgaataacaaagaagtgtcgagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaacaaacctaaatctaaatctgagtg 6743580  T
Q  332 tagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaaga--taagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatg 429  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  6743579 tagagcaacaccacaagcataatcaaagcatatagagataagaaatggaagaaaggaacaaacacaccaaga---tgttgacccagttcggtccaatatg 6743483  T
Q  430 acctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggc 528  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||  |||||||| |    
T  6743482 acctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctacaaaaaattagctt-atagcttacaaaagaacaagac 6743384  T
Q  529 ctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||| ||||    
T  6743383 ctaatttctaccca 6743370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16624297 - 16624143
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaa-tcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16624297 tgttgtgaattccggtaaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 16624198  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactt-tgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac 362  Q
    ||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16624197 ca--aaaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagaataatcaaagcac 16624143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 525
Target Start/End: Original strand, 24741748 - 24742067
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||    
T  24741748 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaaca 24741846  T
Q  306 acaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa- 399  Q
    ||||  ||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||   | | |   ||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||     
T  24741847 acaa--aaacagccctagacta-gtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaag 24741940  T
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  24741941 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 24742039  T
Q  498 aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  24742040 aatagccttcaagcttacacaagaacaa 24742067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 522
Target Start/End: Original strand, 29760448 - 29760765
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaac 304  Q
    |||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    ||| || |||||||||||||||    
T  29760448 gtgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaacaaaatggtttccaagcaacaac 29760547  T
Q  305 aacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcacaa--agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa 399  Q
    ||||| | ||    ||||||||  ||||||||||| ||||||   | |   ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  29760548 aacaaaacaac---cctagacta-gtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaa 29760640  T
Q  400 -aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa- 497  Q
     ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29760641 gaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 29760739  T
Q  498 -aatagcttgcaagcttacactagaa 522  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||    
T  29760740 caatagcctgcaagcttacacaagaa 29760765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1983568 - 1983284
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||   ||| || |    
T  1983568 aaaatcacacaaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtaataatcaatggataaagtgggttcaagcaacaacaacaacaaact-gacttaaa 1983471  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||  || ||||| || | ||||||| || |||||||||||| |   || | | |||||||||||    
T  1983470 tctaagtgtaaagcatcaccacaaacataatcaaaacaacaatataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaata---tggtaacccagttcggtc 1983375  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagct 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  1983374 caatatgacctactatgggggagatagcagctctccaatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 1983284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 505
Target Start/End: Original strand, 5112068 - 5112343
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||    |  ||||||||||||||||||||| ||   || |    
T  5112068 aaaatcacaccaatgaa-aacaaaaatgtgtggagcaaagggagtggtaatcaatgagtaaacaagtctcaagcaacaacaacaacaaaacagttttaaa 5112166  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||  || ||||| || | | ||||| || |||||||||||| |   || | | |||||||||||    
T  5112167 actttgtgtaaagcaacaccacaggcat---caaagcaacaatataagaaa-gtacgaaagaaaacaaacacaccaaga---tggtaacccagttcggtc 5112259  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  5112260 caatatgatctactttgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaaatgggttacaagaaattagctt 5112343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 34496108 - 34495822
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||   ||| |     ||||||||||||||    
T  34496108 tgttgtgaatt-cggtcaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaggtagcggtaatcaatggacaaaatagcctcaagcaacaacaac 34496011  T
Q  308 aacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaaaagattg 406  Q
    |||||| |   || | |||  ||||| |||| || ||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||||||||| |   ||    
T  34496010 aacaaacagtcccaaaactaagtgtaaagcatcaacacaagcataatcaaagcaataaaacaagcaatgaaagaaagaaaacaaacacaccaaga---tg 34495914  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaa 497  Q
     | | | |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  34495913 gtaacctagttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgggttacaagaa 34495822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 513
Target Start/End: Original strand, 3814025 - 3814136
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 499  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  3814025 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 3814122  T
Q  500 tagcttgcaagctt 513  Q
    |||||| |||||||    
T  3814123 tagctttcaagctt 3814136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 513
Target Start/End: Original strand, 5732666 - 5732777
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 499  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||       
T  5732666 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagactc 5732763  T
Q  500 tagcttgcaagctt 513  Q
    |||||| |||||||    
T  5732764 tagctttcaagctt 5732777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 413 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39774389 - 39774296
Alignment:
Q  413 cagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaga-gttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  39774389 cagttcggtccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaaattagctt 39774296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 51520458 - 51520553
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  51520458 aagattgttgacccagttctg-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 51520553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 56146795 - 56146700
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  56146795 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 56146700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 9224491 - 9224408
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9224491 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 9224408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 45357380 - 45357269
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 499  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||       
T  45357380 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagactc 45357283  T
Q  500 tagcttgcaagctt 513  Q
    |||||| |||||||    
T  45357282 tagctttcaagctt 45357269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 468
Target Start/End: Original strand, 12743899 - 12743990
Alignment:
Q  377 aaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  12743899 aaagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 12743990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 468
Target Start/End: Original strand, 12745288 - 12745379
Alignment:
Q  377 aaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  12745288 aaagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 12745379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782802
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22782802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 45347901 - 45347807
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  45347901 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 45347807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 9229278 - 9229195
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9229278 aagattgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 9229195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931853
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16931853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934207
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16934207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 18855728 - 18855821
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  18855728 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 18855821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780437
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22780437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599902
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 44599902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 12739525 - 12739615
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  12739525 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 12739615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 26175611 - 26175701
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  26175611 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 26175701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 2484873 - 2484937
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2484873 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2484937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765113
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 6765113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941592
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 7941592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709228
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactat 18709228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22132392 - 22132456
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22132392 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactat 22132456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24348551 - 24348487
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24348551 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 24348487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38409537 - 38409473
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38409537 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 38409473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 48893621 - 48893703
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  48893621 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 48893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5397119 - 5397069
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtgga 258  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5397119 tgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgga 5397069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 468
Target Start/End: Original strand, 9927438 - 9927523
Alignment:
Q  383 aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  9927438 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 9927523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29254682 - 29254597
Alignment:
Q  383 aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  29254682 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactat 29254597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 46147374 - 46147435
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  46147374 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 46147435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47868734 - 47868685
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47868734 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 47868685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5198753 - 5198689
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5198753 ttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 5198689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 5635476 - 5635540
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5635476 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 5635540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 8631419 - 8631483
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8631419 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 8631483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9148585 - 9148521
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  9148585 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 9148521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 11008568 - 11008632
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11008568 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 11008632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 17662245 - 17662309
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17662245 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 17662309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34670756 - 34670688
Alignment:
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgat 471  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  34670756 attgtttatccagttcggtccaaaatgacctactatgaaggagatagcagctctctgatccactatgat 34670688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 468
Target Start/End: Original strand, 45687160 - 45687247
Alignment:
Q  381 aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  45687160 aaagaaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactat 45687247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5429872 - 5429782
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  5429872 aagagaggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 5429782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 11853722 - 11853659
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11853722 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 11853659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 34570389 - 34570479
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  34570389 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcgatccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 34570479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 52467337 - 52467419
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  52467337 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactat 52467419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15831323 - 15831253
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  15831323 ttgtttatccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 15831253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18587140 - 18587078
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18587140 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 18587078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36769661 - 36769591
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  36769661 ttgtttatccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 36769591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 505
Target Start/End: Original strand, 37781716 - 37781968
Alignment:
Q  252 gtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagca 350  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||| |   ||| |||||||| ||||||| | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||    
T  37781716 gtgtggagcaaaagaagtagtcattaatgagtaaagtatcatcaatcaacaacatcaacaaata-gacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaagca 37781814  T
Q  351 taaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaa-tatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||  ||||||| |||||||||| ||| | ||||   ||||| || ||||| |  ||||| | ||||||||||  || ||||||||| | | || ||||||    
T  37781815 tattcaaagcaacaaagataagaaataatagaagaaaacaa-caaaccaata--ttgtttacccagttcggtttaaatatgacctact-tcggagagaga 37781910  T
Q  449 gcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaga-gttacaagaaaatagctt 505  Q
    | | |||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37781911 gtaactctccaatccactataataaaagtgatacaaagaggttacaagaaattagctt 37781968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 54199882 - 54199950
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  54199882 aagagaggaacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttc-gtccaacttgacctaatctgggggagaga 54199950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 468
Target Start/End: Original strand, 9176485 - 9176538
Alignment:
Q  415 gttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9176485 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9176538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 485
Target Start/End: Original strand, 18377371 - 18377444
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    ||||||| || | |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  18377371 ccagttcagttctatatgacctactctggaggagagagcagccctccattccactaagatgaaagtgatacaaa 18377444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 399 - 448
Target Start/End: Original strand, 36463384 - 36463433
Alignment:
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  36463384 aaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 36463433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 40091415 - 40091464
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40091415 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 40091464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871944
Alignment:
Q  388 caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  5872003 caaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagaga 5871944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 9174146 - 9174210
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9174146 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactat 9174210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11435287 - 11435223
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11435287 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 11435223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11437695 - 11437631
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11437695 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 11437631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18847485 - 18847422
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18847485 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactat 18847422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22044391 - 22044455
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22044391 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactat 22044455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22046686 - 22046750
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22046686 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactat 22046750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 22134618 - 22134681
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22134618 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactat 22134681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24889129 - 24889065
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  24889129 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 24889065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 31849599 - 31849663
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31849599 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 31849663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36994708 - 36994627
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36994708 aacaaacacgccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaacttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 36994627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 37089372 - 37089436
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  37089372 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 37089436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 37740818 - 37740728
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  37740818 aagagaggaacaaacacacaaaaa-attgttgacacagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 37740728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 47038394 - 47038476
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| || | |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  47038394 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactat 47038476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 55822437 - 55822375
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55822437 ccagttcggtctaatgatgacctagtatgggg-agagagcagctctccgatccactataatgaa 55822375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4885048 - 4884986
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  4885048 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 4884986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8529441 - 8529379
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  8529441 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 8529379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10113196 - 10113134
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10113196 ccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatga 10113134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 11006247 - 11006301
Alignment:
Q  414 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11006247 agttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 11006301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 19096216 - 19096162
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19096216 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 19096162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24879323 - 24879269
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  24879323 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 24879269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24880785 - 24880731
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  24880785 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 24880731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 468
Target Start/End: Original strand, 27416960 - 27417030
Alignment:
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27416960 aaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 27417030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 38928177 - 38928231
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  38928177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 38928231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4215639 - 4215590
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4215639 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 4215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 473
Target Start/End: Original strand, 5336789 - 5336850
Alignment:
Q  413 cagttcggtccaatat-gacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  5336789 cagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactataatga 5336850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 473
Target Start/End: Original strand, 13072010 - 13072051
Alignment:
Q  432 ctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  13072010 ctaatatgggggagagagcagctctccattctactataatga 13072051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 22800862 - 22800911
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  22800862 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 22800911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36378618 - 36378557
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  36378618 ccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 36378557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 40637407 - 40637358
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  40637407 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 40637358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12102412 - 12102352
Alignment:
Q  414 agttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  12102412 agttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatga 12102352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16455575 - 16455527
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  16455575 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 16455527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51015578 - 51015514
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  51015578 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactat 51015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 208 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37119 - 36803
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37119 tgttgtgaattccggtgaaaatcacaccgatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 37020  T
Q  308 aacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgt 407  Q
    ||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37019 aa--aaacagacctagacttggtgtagaccaacaccacaagtataaacaaagcacaaagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgt 36922  T
Q  408 tgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgc 507  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgc 36822  T
Q  508 aagcttacactagaacaag 526  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  36821 aagcttacacaagaacaag 36803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 44227 - 43916
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagact 326  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||    
T  44227 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaatct 44130  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44129 a-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 44032  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44031 atgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaacaag 43932  T
Q  527 gcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||||| ||||    
T  43931 acctaatttctaccca 43916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5757744 - 5757433
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagact 326  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||    
T  5757744 aatcacaccaatgaaaaacaaagaagtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaatct 5757647  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5757646 a-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 5757549  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5757548 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaacaag 5757449  T
Q  527 gcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||||| ||||    
T  5757448 acctaatttctaccca 5757433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Original strand, 21355867 - 21356179
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagact 326  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  21355867 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaa--aaacagacctagtct 21355964  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21355965 a-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 21356062  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21356063 atgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaagaacaa 21356162  T
Q  526 ggcctaatttctgccca 542  Q
    | |||||||||| ||||    
T  21356163 gacctaatttctaccca 21356179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 208 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5017759 - 5017482
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||     
T  5017759 tgttgtgaattccggtaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaa 5017660  T
Q  308 aacaaaaa--agacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    || |||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5017659 aaaaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagat 5017562  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5017561 tgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10077435 - 10077119
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |    
T  10077435 aaaatcacactaatgaatagcgaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaaa 10077338  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  10077337 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcggtc 10077240  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||  |||    
T  10077239 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaaattagcttataagcttacaaaaga 10077140  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  10077139 acaagacctaatttctaccca 10077119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 18232672 - 18232988
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||||    
T  18232672 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa--cctaga 18232769  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||  ||||||    
T  18232770 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcgatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgactcaaatcggtc 18232867  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||    
T  18232868 caatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatcagcttataagcttacacaaga 18232967  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  18232968 acaagacctaatttctaccca 18232988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 31979340 - 31979656
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |    
T  31979340 aaaatcacaccactaaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaa--aaacagacctaaa 31979437  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  31979438 tctaagtgtagagcaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaatagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtc 31979535  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  31979536 caatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacaaaaga 31979635  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  31979636 acaagacctaatttctaccca 31979656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 207 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31086750 - 31086427
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  31086750 gtgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaagaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaa 31086651  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| |||| || | ||  ||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31086650 caa--aaacagacataaatctaagtgtagagcaacatcacaa----------agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gatt 31086565  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31086564 gttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaaattagct 31086465  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  31086464 tataagcttacacaagagcaagacctaatttctaccca 31086427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 31936414 - 31936719
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||      
T  31936414 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa---aacagacctta 31936510  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  31936511 atcaaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagataggaacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggt 31936608  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31936609 ccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccactaatatgaaagt----------gttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaaga 31936698  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||  |||||||||| ||||    
T  31936699 acaaatcctaatttctaccca 31936719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 249 - 542
Target Start/End: Original strand, 22963550 - 22963841
Alignment:
Q  249 gatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaa 347  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22963550 gatgtgtggagctaaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaa 22963648  T
Q  348 gcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga 446  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||    
T  22963649 gcataatcaaagcaatagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-aga 22963745  T
Q  447 gagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| | |||||| | |||||||| ||||    
T  22963746 gagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacac-aaaacaagccgtaatttctaccca 22963841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 249 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23824843 - 23824552
Alignment:
Q  249 gatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaa 347  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  23824843 gatgtgtggagctaaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaa 23824745  T
Q  348 gcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga 446  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||    
T  23824744 gcataatcaaagcaatagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-aga 23824648  T
Q  447 gagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| | |||||| | |||||||| ||||    
T  23824647 gagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacac-aaaacaagccgtaatttctaccca 23824552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 21801618 - 21801298
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  21801618 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggag--aaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaatcagacctaaa 21801522  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaa----agattgttgatccagttc 418  Q
     ||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||| |||||||    
T  21801521 tctaagtgtagaacaataccacaatcataatcaaagcaataaagataagtaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagataaaagtgttga-ccagttc 21801423  T
Q  419 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacac 517  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||     
T  21801422 agtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaaattatcttataagcttacaa 21801323  T
Q  518 tagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||| | |||||||| ||||    
T  21801322 aagaacaagacttaatttctaccca 21801298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 329 - 537
Target Start/End: Original strand, 4629883 - 4630092
Alignment:
Q  329 gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaata 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  4629883 gtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaa-gattgttgactcagttcagtccaata 4629981  T
Q  428 tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  |||||||||  ||||||||    
T  4629982 tgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaattaacttataagcttacaaaagaacaag 4630081  T
Q  527 gcctaatttct 537  Q
     ||||||||||    
T  4630082 acctaatttct 4630092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Original strand, 22708863 - 22709151
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaa-agtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||| | ||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |  ||||||||||||    
T  22708863 aacaaagatgtgtagtgcaaaggggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctagatctaatgtagagcaaca 22708960  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgg 440  Q
    |||||||  ||  |||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  22708961 ccacaagtgtatccaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgg 22709058  T
Q  441 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgcc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  22709059 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaga--------aaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacc 22709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 208 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5675057 - 5674743
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttcc-aagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||  |||||| |||||||||||    
T  5675057 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaagtttcccaagcaacaaca 5674959  T
Q  306 acaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaa-ag 402  Q
    ||||  ||  || ||||| ||  |||||||||||||||||||  | || |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5674958 acaa--aaccagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaaagagaatacaaagcaaacaatataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaaagag 5674864  T
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aat 500  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  5674863 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 5674765  T
Q  501 agcttgcaagcttacactagaa 522  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  5674764 agcttgcaagcttacacaagaa 5674743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 367 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5572369 - 5572200
Alignment:
Q  367 ataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccact 466  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5572369 ataagcagtgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccact 5572272  T
Q  467 atgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5572271 atgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttct 5572200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24436236 - 24435925
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||   |||||||| | ||| |||||||||    ||| |||| ||| |    
T  24436236 aaaataacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaagggaaatggtaatcaatagataaagtgtctacaaacaacaacaa----aaataagatctaaa 24436141  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
     ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||| || |||||||||||| |   || | | |||||||| |    
T  24436140 tctaagtgtagag--acacaacaagcataaacaaagcaacaaagataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaaga---tggtaacccagttcgat 24436047  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||  |     
T  24436046 ccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccactaggatgaaaatgttacaaatgaattacaagaaattagcttataagcttacaaaaa 24435947  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  24435946 aacaagacctaatttctaccca 24435925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 355 - 484
Target Start/End: Original strand, 27165639 - 27165767
Alignment:
Q  355 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  27165639 caaagcaaaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaccacaccaaa-gattgtttacccagt-cggtccaatatgacctactatgggggacagagtagc 27165736  T
Q  454 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  27165737 cctccaatcaactaagatgaaagtgatacaa 27165767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5572866 - 5572739
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||| || |    
T  5572866 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacagca--aaaacagacataaa 5572769  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataa 353  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5572768 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataa 5572739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 11856975 - 11857070
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11856975 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 11857070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 14737660 - 14737566
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14737660 aagattgttgatccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 14737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 14742520 - 14742426
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14742520 aagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 14742426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22010781 - 22010686
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22010781 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 22010686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28155653 - 28155542
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 499  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  28155653 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatt 28155556  T
Q  500 tagcttgcaagctt 513  Q
    |||||| |||||||    
T  28155555 tagctttcaagctt 28155542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33336026 - 33335930
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33336026 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33335930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 6005418 - 6005514
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6005418 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 6005514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 494
Target Start/End: Original strand, 28184506 - 28184598
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 494  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  28184506 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 28184598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33330529 - 33330433
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33330529 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33330433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195579
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 12195579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 494
Target Start/End: Original strand, 14521663 - 14521769
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-ga 487  Q
    ||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||||| ||    
T  14521663 aaacacaccaagaaaatgttgacctagttcggtccaatatgacctactctcgaggagagagcacctctccaattcaataagatgaaagtgatacaaatga 14521762  T
Q  488 gttacaa 494  Q
    |||||||    
T  14521763 gttacaa 14521769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 16838745 - 16838841
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16838745 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 16838841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816295
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 4816295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273280
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 5273280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 6438502 - 6438595
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  6438502 aagattgttgtcccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 6438595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704631
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 19704631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915420
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 20915420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932626
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactat 26932626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754773
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 29754773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30967515 - 30967451
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30967515 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactat 30967451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309106
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 33309106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26258252 - 26258185
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaa 309  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26258252 aacaaagatgtatggagcaaaaggaagtggtaaccaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa 26258185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 11983029 - 11983093
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11983029 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 11983093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33311439 - 33311375
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  33311439 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactat 33311375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13878900 - 13878837
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13878900 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 13878837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13883648 - 13883585
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13883648 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 13883585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16569207 - 16569125
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  16569207 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactat 16569125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16786092 - 16786029
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16786092 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 16786029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 473
Target Start/End: Original strand, 16455433 - 16455494
Alignment:
Q  413 cagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  16455433 cagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatga 16455494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 2628886 - 2628950
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2628886 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2628950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 14458767 - 14458831
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  14458767 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactat 14458831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 14507176 - 14507240
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  14507176 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 14507240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 26066124 - 26066188
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26066124 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 26066188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 26068395 - 26068459
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26068395 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 26068459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 9183006 - 9183096
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  9183006 aagagagggacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactat 9183096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 35201335 - 35201398
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35201335 ccagttcggtctaataatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 35201398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 1069718 - 1069772
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  1069718 ttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctcc 1069772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25941843 - 25941781
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  25941843 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 25941781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31077018 - 31076932
Alignment:
Q  420 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||||||||||| | |   ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  31077018 gtccaatatgacctactctctaggagatagcagctctccaatccactaagataaaagtgatacaaatgggttacaataaattagctt 31076932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 33211168 - 33211229
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  33211168 aacaaacataccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 33211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33216001 - 33215939
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  33216001 ccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggatagagcagctctccgttccactataatga 33215939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 1230249 - 1230298
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  1230249 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 1230298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9020240 - 9020191
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  9020240 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagc 9020191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17066033 - 17065964
Alignment:
Q  405 tgttgatccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||    
T  17066033 tgtttatccagttcggtctaatgatgacctactttgggggagagagcagctatccgttccactataatga 17065964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25477596 - 25477547
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25477596 ttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 25477547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065232
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  26065295 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 26065232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26085264 - 26085201
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  26085264 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 26085201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 28241321 - 28241385
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  28241321 ttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 28241385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 30034603 - 30034667
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  30034603 ttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctat 30034667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30445834 - 30445770
Alignment:
Q  410 atccagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  30445834 atccagttcagtccaatactgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatga 30445770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 142)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 207 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30710069 - 30709734
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30710069 gtgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 30709970  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| ||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709969 caa--aaacagacctagatctaagtttagagcaacaccataagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 30709872  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30709871 gttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagct 30709772  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  30709771 tataagcttacacaagagcaagacctaatttctaccca 30709734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 8370748 - 8370431
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  8370748 aaaaatcacatcaatgaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctag 8370651  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8370650 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtc 8370551  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaa 522  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  8370550 caatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaa 8370451  T
Q  523 caaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||| | |||||||| ||||    
T  8370450 caagacataatttctaccca 8370431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 16264176 - 16264487
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||   ||||||    
T  16264176 aaaatcacaccaatgaataacaaagacgtgtggagcaacagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaacaat--cctaga 16264273  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtcc 423  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  16264274 tctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcacaaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtcc 16264373  T
Q  424 aatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaac 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16264374 aatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttccacaagaac 16264473  T
Q  524 aaggcctaatttct 537  Q
    ||| ||||||||||    
T  16264474 aagacctaatttct 16264487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27975191 - 27974896
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacac 342  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  27975191 aacaaagatatgtggagtaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagcaa---aacagacctaatcta-gtgtagagcaacac 27975096  T
Q  343 cacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggg 442  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27975095 cacaagcataaataaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 27974997  T
Q  443 gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccc 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  27974996 gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccc 27974897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 207 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 39040270 - 39039995
Alignment:
Q  207 gtgttgtgaatttcgttaaaaa-tcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaaca 305  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39040270 gtgttgtgaattccggtaaaaaatcacaccaataaataataaagatgtgtggaacaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaca 39040171  T
Q  306 acaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    ||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39040170 acaa---aacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 39040074  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39040073 gttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 35925292 - 35925622
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  35925292 tgttgtgaattccggtaaaaaccacaccaatgaaaaacaaagatatgtggagcaaagcaggtggtaatcaatgtgtaaaatgtctccaagtaacaacaac 35925391  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    ||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35925392 aa--aaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacacaaagatgagcaatgaaagaaaagaacaaacacaccaaaagattg 35925489  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttg 506  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  35925490 ttgacctagttcggtccaatatgacctaatttgggag---gggcagttctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagttta 35925586  T
Q  507 caagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  35925587 taagcttacactagaacaaaacctaatttctaccca 35925622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6794972 - 6794657
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| |    
T  6794972 aaaatcacaccaatgaaaaacaacgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagaaaaagtgtctccaagcaacaacaacaa---aacagacctaaa 6794876  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  |||||||| | || ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||    
T  6794875 tctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccggttaggtc 6794778  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-tagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6794777 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaaga 6794678  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  6794677 acaagtcctaatttctaccca 6794657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Original strand, 32143133 - 32143453
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32143133 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 32143231  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32143232 caa--aaacagacctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagatt 32143326  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagct 504  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32143327 gttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagct 32143426  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32143427 tgcaagcttacacaagaacaagaccta 32143453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Original strand, 36028931 - 36029236
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  36028931 aaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctag 36029028  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
    | ||  || |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||    
T  36029029 atctaagtatagagcaacaccacaagcataaa-----------gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttctgtc 36029115  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||    
T  36029116 caatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaaga 36029215  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  36029216 acaagacctaatttctaccca 36029236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 33386909 - 33386620
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  33386909 aacaaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaacagacctagtcta-gtgtagagcaaca 33386812  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgg 440  Q
    ||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33386811 ccacaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgg 33386713  T
Q  441 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgcc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  33386712 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacc 33386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 236 - 542
Target Start/End: Original strand, 21711064 - 21711365
Alignment:
Q  236 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |    |||||    
T  21711064 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaaataga---taaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaaatcaccatgtag 21711158  T
Q  335 agcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21711159 agcaacaccataggcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacct 21711256  T
Q  434 aatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaat 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  21711257 aatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaat 21711356  T
Q  534 ttctgccca 542  Q
    |||| ||||    
T  21711357 ttctaccca 21711365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 26298809 - 26299131
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaa----gacc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    ||||    
T  26298809 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggatcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaaacaacaacaacaacaacaaaaacagacc 26298908  T
Q  321 taga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttc 418  Q
    || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  26298909 taaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaacgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttc 26299006  T
Q  419 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacac 517  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||| ||    
T  26299007 ggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttagac 26299106  T
Q  518 tagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||| |||||||||| ||||    
T  26299107 aagaacaagacctaatttctaccca 26299131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 40593046 - 40592726
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaa---agatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacct 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  40593046 aaaatcacaccaatgaataacaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacct 40592949  T
Q  322 aga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttc 418  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  40592948 aaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttc 40592851  T
Q  419 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacac 517  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40592850 ggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacac 40592751  T
Q  518 tagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||   ||||||||| ||||    
T  40592750 aagaacaaaatctaatttctaccca 40592726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 48438041 - 48438357
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||   |||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  48438041 aaaatcacatcaatgaataacaaggatgtgtggagcaaaggaaatggtaatcaatagataaagtatctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaga 48438138  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||    
T  48438139 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgacagaaaggaacaaacacaccaa--gattattgacctagttcggtc 48438236  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||    
T  48438237 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcatataagcttacacaaga 48438336  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  48438337 acaagacctaatttctaccca 48438357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 3716279 - 3715946
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||    
T  3716279 tgttgtgaattt-gtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctacaagcaacaacaa 3716181  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    |||  ||| |||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  3716180 caa--aaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcacaacaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gat 3716085  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagc 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3716084 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagc 3715985  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    || ||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  3715984 ttacaaacttacacaagaacaagacttaatttctaccca 3715946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 236 - 542
Target Start/End: Original strand, 40844490 - 40844794
Alignment:
Q  236 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| || |||  |||| | ||  ||||||    
T  40844490 aatgaataacaaagatgtgtggagtaaaagaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacaaa--cctaaatctaagtgtag 40844587  T
Q  335 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40844588 agcaacactacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacgaacacaccaa--gattgttgattcagttcggtccaatatgacct 40844685  T
Q  434 aatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaa 532  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||||    
T  40844686 aatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaa 40844784  T
Q  533 tttctgccca 542  Q
    ||||| ||||    
T  40844785 tttctaccca 40844794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27986687 - 27986400
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  27986687 aacaaagatgtatggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaa--aaatagacctagtcta-gtgtagagcaaca 27986591  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgg 440  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27986590 ccacaagcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaagaatg-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 27986493  T
Q  441 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgcc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  27986492 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaga--------aaaaaagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacc 27986402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 1417766 - 1417435
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| | ||||||||||||||    
T  1417766 tgttgtgaattttggacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaac 1417667  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    ||   || | || || | ||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  1417666 aa---aacatacataaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gatt 1417572  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  1417571 gttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaatgagttataagaaattagctt 1417472  T
Q  506 gcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
      || ||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  1417471 ataaacttacaaaagaacaagtcctaatttctaccca 1417435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 208 - 526
Target Start/End: Original strand, 1305761 - 1306075
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaga-aagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1305761 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaagaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 1305859  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1305860 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagatt 1305954  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  1305955 gttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtt 1306053  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  1306054 tgcaagcttacacaagaacaag 1306075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Original strand, 27452803 - 27453101
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa--------agacctagactttgtgta 333  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||        |||||||| ||  |||||    
T  27452803 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaacaacaacaaaaaacagacctagtcta-gtgta 27452901  T
Q  334 gagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacc 432  Q
    |||||         ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27452902 gagca---------gcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacc 27452990  T
Q  433 taatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  27452991 taatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaattccta 27453090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 329 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18553040 - 18552827
Alignment:
Q  329 gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaata 427  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18553040 gtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaaatacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaata 18552943  T
Q  428 tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  18552942 tgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaag 18552843  T
Q  527 gcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||||| ||||    
T  18552842 acctaatttctaccca 18552827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24695439 - 24695108
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||| | ||||||||||||||    
T  24695439 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacacaaatgaataataaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtcttcaagcaacaacaac 24695341  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    ||  ||| ||| ||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  24695340 aa--aaacagagctaaatctaagtatagagcaacac-acaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gatt 24695246  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24695245 gttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagct 24695146  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |  || ||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  24695145 tataaacttacaaaagaacaagacctaatttctaccca 24695108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 329 - 542
Target Start/End: Original strand, 25795710 - 25795924
Alignment:
Q  329 gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaata 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  25795710 gtgtagagcaacaccacaagcataataaaaacaataaaaataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaata 25795808  T
Q  428 tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||    
T  25795809 tgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaag 25795908  T
Q  527 gcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||||| ||||    
T  25795909 acctaatttctaccca 25795924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 280 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 3328561 - 3328301
Alignment:
Q  280 gtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatga 377  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  3328561 gtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaa--aaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatga 3328464  T
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 477  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  3328463 aagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagt 3328366  T
Q  478 gttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  3328365 gttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctaccca 3328301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 329 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 26928757 - 26928555
Alignment:
Q  329 gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaata 427  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  26928757 gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaagaaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaata 26928661  T
Q  428 tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag--aaaatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26928660 tgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaa 26928561  T
Q  526 ggccta 531  Q
    | ||||    
T  26928560 gaccta 26928555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 344 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 1736447 - 1736249
Alignment:
Q  344 acaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggg 442  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1736447 acaagcataatcaaagcaataaacataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaata--ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 1736350  T
Q  443 gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccc 541  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  1736349 gagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccc 1736250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 37466118 - 37466433
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||  | |||||| |||||  || || || || |||| |||| |  |    
T  37466118 aaaatcacaccaataaataacaaagatgtgaggagcaaaggaaatggtaatcaatggattaagtgtctccaa--aaaaaaaaaaaaaaaacagacattaa 37466215  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  37466216 tctaagtgtagagcaacattacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacacagttcggtc 37466313  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaa 522  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||  |||||||||  ||||    
T  37466314 caatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattaatttataagcttacaaaagaa 37466413  T
Q  523 caaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  37466414 caagtcctaatttctaccca 37466433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 223 - 517
Target Start/End: Original strand, 8477187 - 8477481
Alignment:
Q  223 taaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttcc-aagcaacaacaacaacaaaaaagacc 320  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||  |||||| |||||||||||||||  ||  || ||    
T  8477187 taaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaagtttcccaagcaacaacaacaa--aaccagccc 8477283  T
Q  321 tagactttgtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagtt 417  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8477284 tagacta-gtgtagaacaacaccacaaagataatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaagaagattgttgacccagtt 8477380  T
Q  418 cggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttac 515  Q
    | | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8477381 cag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttac 8477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 208 - 379
Target Start/End: Original strand, 27026754 - 27026925
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaa-atcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27026754 tgttgtgaattccggtaaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 27026853  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaa 379  Q
     |  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27026854 ga--aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaa 27026925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 208 - 379
Target Start/End: Original strand, 27038100 - 27038270
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27038100 tgttgtgaattcggtaaaaaatcacaccaatgaataactaagatgtgtggagcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac 27038199  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaa 379  Q
    |  |||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27038200 a--aaaacagatctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaa 27038270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4387173 - 4386908
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaa-gaccta-gactttgtgtagagcaac 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||      ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||  |||||| ||||    
T  4387173 aacaaaaatgtgtggagcaaagaaagtagtaatcaatgagtaaagtagccataagcaacaacaacaaaaaaaaaagacctaagtcttaatgtagaacaac 4387074  T
Q  341 accacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
     ||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||  || || ||||||||| | ||    
T  4387073 gccacatgcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaa-gattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctg 4386975  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  4386974 ggggagagagcagctctccaatccaataagataaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt 4386908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 400 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 40372891 - 40372760
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaa 498  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  40372891 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 40372793  T
Q  499 atagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40372792 atagcttgcaagcttacacaagaacaagcccta 40372760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 525
Target Start/End: Original strand, 7167051 - 7167371
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgtaaagtg-tttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  7167051 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaatggtttccaagcaacaaca 7167150  T
Q  306 acaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcacaaa---gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa 399  Q
    ||||   || || ||||||||  ||||||||||| ||||||   | |   ||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  7167151 acaa---aacagccctagacta-gtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaa 7167243  T
Q  400 -aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa- 497  Q
     ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7167244 gaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 7167342  T
Q  498 -aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  7167343 caatagccttcaagcttacacaagaacaa 7167371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2671716 - 2671550
Alignment:
Q  364 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 462  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2671716 aagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 2671621  T
Q  463 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  2671620 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagcttacacaagaccaagcccta 2671550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8739193 - 8739033
Alignment:
Q  364 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 462  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8739193 aagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 8739098  T
Q  463 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  8739097 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaa 8739033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9091431 - 9091271
Alignment:
Q  364 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 462  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9091431 aagataagcaa-gaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 9091336  T
Q  463 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  9091335 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaa 9091271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 418
Target Start/End: Original strand, 1309668 - 1309872
Alignment:
Q  210 ttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaaca 308  Q
    |||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1309668 ttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaaca 1309766  T
Q  309 acaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgt 407  Q
    |  ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1309767 a--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgt 1309861  T
Q  408 tgatccagttc 418  Q
    ||| |||||||    
T  1309862 tgacccagttc 1309872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 47924006 - 47923887
Alignment:
Q  385 gaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-a 483  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  47924006 gaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaa 47923909  T
Q  484 aagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  47923908 aagagttacaagaaattagctt 47923887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 421 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 3323756 - 3323635
Alignment:
Q  421 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||    
T  3323756 tccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaag 3323657  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||| | |||||||| ||||    
T  3323656 aacaagtcataatttctaccca 3323635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 309
Target Start/End: Original strand, 1417074 - 1417177
Alignment:
Q  206 agtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1417074 agtgttgtgaattccggacaaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaca 1417173  T
Q  306 acaa 309  Q
    ||||    
T  1417174 acaa 1417177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47924128 - 47924000
Alignment:
Q  226 aaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga- 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||     
T  47924128 aaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaaca-----aaaacagacctagat 47924034  T
Q  325 ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 358  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47924033 ctaagtgtagagcaacaccacaagcatgaacaaa 47924000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25929633 - 25929435
Alignment:
Q  296 agcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaa--caaa 391  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||| ||  ||||    
T  25929633 agcaacaacaacaacaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaacaaagataagaaa-gcaagaaagaaaaacaaa 25929535  T
Q  392 cacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagtt 490  Q
    |||||||| |   || | | |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  25929534 cacaccaaga---tggtaacccagttcggtccaatacgacctactctggggg-gagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagtt 25929439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22173279 - 22173184
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22173279 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 22173184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 18656436 - 18656530
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  18656436 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 18656530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210565
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactat 38210565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34491449 - 34491315
Alignment:
Q  335 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacct 433  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||    
T  34491449 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacacc-aaagattgttcacccagttcggtccaacttgacct 34491351  T
Q  434 aatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    | | ||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  34491350 actctggaggagagattgatctctccaatccactat 34491315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18554547 - 18554493
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaat 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554547 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaat 18554493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28503960 - 28503864
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  28503960 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaa 28503864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3323839 - 3323752
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaa 296  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  3323839 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgcataaagtgtctccaa 3323752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2673015 - 2672919
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2673015 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2672919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2677171 - 2677075
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2677171 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2677075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 8512218 - 8512314
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8512218 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8512314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 8517098 - 8517194
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8517098 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8517194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 309
Target Start/End: Original strand, 47649551 - 47649652
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  47649551 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggaacaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa 47649649  T
Q  307 caa 309  Q
    |||    
T  47649650 caa 47649652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 32475486 - 32475580
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  32475486 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32475580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 32480344 - 32480438
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  32480344 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32480438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494194
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 50494194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458479
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 458479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 468
Target Start/End: Original strand, 6063452 - 6063508
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6063452 ccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 6063508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 455 - 542
Target Start/End: Original strand, 8126685 - 8126773
Alignment:
Q  455 ctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||  | |||||||| ||||    
T  8126685 ctccaatccactacgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacttaatttctaccca 8126773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621592
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 10621592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43228550 - 43228486
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43228550 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 43228486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 9666449 - 9666531
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagc-agctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  9666449 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactat 9666531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 29196369 - 29196451
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29196369 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 29196451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29813256 - 29813166
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29813256 aagagaggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacatgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 29813166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40734691 - 40734601
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  40734691 aagagaggaacaaacactccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 40734601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51399007 - 51398917
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  51399007 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactat 51398917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 379
Target Start/End: Original strand, 8126543 - 8126682
Alignment:
Q  240 aataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||   || | ||| ||||| |||||||||||  |||| | ||||| | ||  ||||||||||    
T  8126543 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtattcaatagatacaatgtctccaaccaacaacaaca--aaaacatacctaaatctaagtgtagagca 8126640  T
Q  339 acaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaa 379  Q
    ||||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  8126641 acaccacactcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaa 8126682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 503
Target Start/End: Original strand, 21353604 - 21353666
Alignment:
Q  442 ggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  21353604 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagc 21353666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 23391892 - 23391953
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  23391892 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 23391953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 456166 - 456102
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  456166 ttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 456102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 747016 - 746952
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  747016 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactat 746952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1321738 - 1321674
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1321738 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 1321674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5886457 - 5886393
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5886457 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 5886393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5899930 - 5899866
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5899930 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 5899866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 7606586 - 7606650
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7606586 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 7606650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25389164 - 25389100
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25389164 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 25389100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 468
Target Start/End: Original strand, 28413042 - 28413094
Alignment:
Q  416 ttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28413042 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 28413094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 505
Target Start/End: Original strand, 29100162 - 29100266
Alignment:
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa-agtgttacaaaga-gttacaagaaaat 500  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||| |    
T  29100162 attgtttacccagttcggtccaaaattacccactatagggaagagagcagctctccattccactatgataaagagtgatacaaagaggttataagaaatt 29100261  T
Q  501 agctt 505  Q
    |||||    
T  29100262 agctt 29100266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 31314630 - 31314571
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga 446  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31314630 aacaaacacaccaaa-gattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatatgggggaga 31314571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38890299 - 38890235
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38890299 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactat 38890235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913396
Alignment:
Q  393 acaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40913396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 464
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894115
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 464  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 53894115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 10094083 - 10094146
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10094083 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10094146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 10100100 - 10100163
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10100100 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10100163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 10200963 - 10201026
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10200963 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10201026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40735576 - 40735486
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  40735576 aagagaggaacaaatacaccaaa-gattgctgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40735486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 10595042 - 10595104
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  10595042 ccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatga 10595104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10897179 - 10897117
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10897179 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 10897117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 24968108 - 24968204
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24968108 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24968204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501697
Alignment:
Q  444 agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaa 28501697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 444
Target Start/End: Original strand, 32744419 - 32744476
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatggggga 444  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  32744419 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggggga 32744476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 47701669 - 47701723
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  47701669 ttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctcc 47701723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 53917662 - 53917716
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  53917662 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 53917716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 54193400 - 54193338
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54193400 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 54193338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 27101179 - 27101228
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27101179 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagc 27101228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 484 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 39032555 - 39032502
Alignment:
Q  484 aagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||    
T  39032555 aagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacgcaagagcaagatctaatttct 39032502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44331717 - 44331648
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  44331717 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 44331648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 51943629 - 51943580
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51943629 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 51943580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3859786 - 3859722
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  3859786 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactat 3859722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 4103894 - 4103958
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  4103894 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactat 4103958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 442
Target Start/End: Original strand, 5236432 - 5236495
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggg 442  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  5236432 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctgggg 5236495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 5522625 - 5522689
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5522625 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactat 5522689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 6065794 - 6065858
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6065794 ttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactat 6065858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 10084387 - 10084451
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10084387 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactat 10084451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 10958321 - 10958385
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10958321 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 10958385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 35919113 - 35919177
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  35919113 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 35919177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43226344 - 43226280
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43226344 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 43226280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 46173536 - 46173460
Alignment:
Q  393 acaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  46173536 acaccaagaaattgttgatctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 46173460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6303467 - 6303420
Alignment:
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6303467 atgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 6303420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 10208009 - 10208072
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10208009 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10208072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27544446 - 27544383
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27544446 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactataatgaa 27544383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 542
Target Start/End: Original strand, 47649653 - 47649712
Alignment:
Q  483 aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  47649653 aaagagttacaagaaattaacttacaagcttccacaagaacaagacctaatttctaccca 47649712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1313668 - 1313614
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  1313668 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 1313614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 3314944 - 3314890
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  3314944 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctcc 3314890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5858718 - 5858656
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  5858718 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatga 5858656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6484619 - 6484565
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6484619 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 6484565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 10612786 - 10612848
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  10612786 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 10612848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 22625992 - 22626054
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  22625992 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagttctccgatccactataatga 22626054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 23410312 - 23410373
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  23410312 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccaattcgttccaacttgacctaatttgggggagaga 23410373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 27635656 - 27635710
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27635656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 27635710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 29913963 - 29914025
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  29913963 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatga 29914025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Original strand, 32264034 - 32264104
Alignment:
Q  403 attgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||||||| |||||||   |||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  32264034 attgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 32264104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 36871306 - 36871368
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  36871306 ccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 36871368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 42990563 - 42990509
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  42990563 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 42990509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 48361669 - 48361723
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48361669 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 48361723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 448
Target Start/End: Original strand, 39153356 - 39153405
Alignment:
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  39153356 aaagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41849318 - 41849269
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  41849318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 41849269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 42992529 - 42992480
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  42992529 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 42992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 43421413 - 43421462
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  43421413 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 43421462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2671876 - 2671809
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaat 275  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2671876 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaat 2671809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 4308279 - 4308343
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  4308279 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactat 4308343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 9604605 - 9604669
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | ||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9604605 ttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 9604669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 10191308 - 10191372
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10191308 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactat 10191372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 10956025 - 10956089
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10956025 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactat 10956089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11170663 - 11170599
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  11170663 ttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 11170599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15781138 - 15781090
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  15781138 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcag 15781090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 389 - 468
Target Start/End: Original strand, 22834989 - 22835067
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  22834989 aaacacaccaaat-attgttga-ccagttcggtccaacttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactat 22835067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25533701 - 25533637
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25533701 ttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 25533637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29811054 - 29810971
Alignment:
Q  385 gaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29811054 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 29810971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30006100 - 30006036
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  30006100 ttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactat 30006036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236228
Alignment:
Q  393 acaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| | |||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 30236228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Original strand, 2479168 - 2479478
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagact 326  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  2479168 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa--aaacagacctagtct 2479265  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2479266 a-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaat 2479363  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2479364 atgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaag 2479462  T
Q  527 gcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||||| ||||    
T  2479463 acctaatttctaccca 2479478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 227 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 44848953 - 44848639
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa-agacctagac 325  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  44848953 aatcacaccaatgaaaaacaaggatgtgtggagcaaaggtagtgctaatcaatgtgcaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaaacagacctagtc 44848854  T
Q  326 tttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaa 425  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44848853 ta-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacatacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaa 44848756  T
Q  426 tatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaa 525  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  44848755 tatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaataa 44848656  T
Q  526 ggcctaatttctgccca 542  Q
    | |||||||||| ||||    
T  44848655 gacctaatttctaccca 44848639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9190294 - 9189962
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9190294 tgttgtgaatt-cggtcaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 9190196  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    ||| | |||   |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  9190195 caaaacaaa---cctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gat 9190101  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagc 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9190100 tgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaaatagc 9190001  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  9190000 ttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctaccca 9189962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 49091472 - 49091804
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  49091472 tgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 49091571  T
Q  308 aacaaaaaagacctagacttt-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    ||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  49091572 aa--aaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacgcacc--aagattg 49091667  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctt 505  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  49091668 ttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattacctt 49091767  T
Q  506 gcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  49091768 ataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 49091804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 29159613 - 29159946
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaga-aagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  29159613 tgttgtgaatt-cgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa 29159711  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    |||  ||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  29159712 caa--aaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gat 29159807  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagc 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29159808 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagc 29159907  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  29159908 ttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca 29159946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 227 - 537
Target Start/End: Original strand, 47263509 - 47263803
Alignment:
Q  227 aatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagact 326  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||    
T  47263509 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgcgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaacaa--aaatagacctagtct 47263606  T
Q  327 ttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 426  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47263607 a-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagaataaagataagcaatgaaataa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 47263704  T
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47263705 atgacctaatatgggg--gagagcagctctccaatccactatgatgaaagt----------gttataagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaag 47263792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 55766 - 56090
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaa-------g 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||       |    
T  55766 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaataaaataaaaaaaaacag 55865  T
Q  318 acctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccag 415  Q
    ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||    
T  55866 acctagatctaagtatagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatggaaggaaaggaacaaacacaccaa--gattattgacccag 55963  T
Q  416 ttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagctta 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  55964 ttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagctta 56062  T
Q  515 cactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  56063 cacaagaacaagacctaatttctaccca 56090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 20283916 - 20284226
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |    
T  20283916 aaaatcacacctatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagaaacaacaacaa--aaacagacctaaa 20284013  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20284014 tctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtc 20284111  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaa 522  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||    
T  20284112 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgcgttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaa 20284211  T
Q  523 caaggcctaatttct 537  Q
    |||| ||||||||||    
T  20284212 caagtcctaatttct 20284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 46516581 - 46516264
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| || |    
T  46516581 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaa-aaaacagacttaaa 46516483  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  46516482 tctaagtgtaaagcaacaccaaaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtc 46516385  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  46516384 caatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaaga 46516285  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| | |||||||| ||||    
T  46516284 acaagacataatttctaccca 46516264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 225 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 4796940 - 4796628
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa-agacctag 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  4796940 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtttctccaagcaacaacaacaaaaaaaacagacctaa 4796841  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  4796840 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacacc--aagattgttaacccagttcggt 4796743  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  4796742 ccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaag 4796643  T
Q  521 aacaaggcctaattt 535  Q
    |||||| ||| ||||    
T  4796642 aacaagacctcattt 4796628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9185449 - 9185129
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9185449 tgttgtgaatt-cggtcaaaatcacactaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 9185351  T
Q  307 caacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagat 404  Q
    |||   || ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||    
T  9185350 caa---aacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacc----aagat 9185258  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagct 504  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||    
T  9185257 tgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aaga--------aaaatagct 9185167  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  9185166 tgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctaccca 9185129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Original strand, 21983108 - 21983428
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |    |||||||     
T  21983108 aaaaatcacaccaatgaaaaacaatgatgtatggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtatctccaagcaacaacaacaa-actccagacctaa 21983206  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcgg 420  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |  ||||||||| |||||||||    
T  21983207 atctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaatagagataagcaacgaaagaaaaggaacaaatgcaccga--gattgttgacccagttcgg 21983304  T
Q  421 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac--aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacact 518  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21983305 tccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacaca 21983404  T
Q  519 agaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||    
T  21983405 agaacaagacctagtttctaccca 21983428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23403283 - 23402968
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |    
T  23403283 aaaatcataccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtttccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaaa 23403186  T
Q  325 cttt-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||    
T  23403185 tgtaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaatataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactaa--gattgttgacccaattcggtc 23403088  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaa 522  Q
     ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||    
T  23403087 taatatgacctaatctgagggagtgagcagccctccaatctactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaa 23402988  T
Q  523 caaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  23402987 caagtcctaatttctaccca 23402968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 2580215 - 2580532
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||   || |||||||     
T  2580215 aaaatcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaa---aacagacctaa 2580310  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaa---aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttc 418  Q
    | ||  ||||||||  |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  2580311 atctaagtgtagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagataagcaatgaaaaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattc 2580408  T
Q  419 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacact 518  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2580409 ggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaatagcttgcaagcttacaca 2580508  T
Q  519 agaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||    
T  2580509 agaacaagtcctagtttctaccca 2580532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 224 - 542
Target Start/End: Original strand, 35960640 - 35960959
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  35960640 aaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaacaggcctaa 35960739  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  35960740 atctaagtgtagagaaacaccaccagcataaataaagcaataaagataagaaattaatgaaatgaacaaacacacc--aagattgttgaccgagttcggt 35960837  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||  ||    
T  35960838 tcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaaattagcttataagcttacaaaag 35960937  T
Q  521 aacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||  |||||||||| ||||    
T  35960938 aacaatacctaatttctaccca 35960959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 33332720 - 33332409
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||||| || |||  |||| |    
T  33332720 aaaatcacaccaatgaataaccaagatgtgtggaccaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtatccaaacaacaacaacaaaaacaaa--cctaaa 33332623  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  33332622 tctaagtgtagagcaacaccataagcataatcaaatcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgatc 33332525  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||    
T  33332524 taatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaaga 33332425  T
Q  522 acaaggcctaatttct 537  Q
    ||||| ||||||||||    
T  33332424 acaagacctaatttct 33332409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 18413453 - 18413782
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18413453 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgaggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 18413551  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18413552 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaaaagatt 18413646  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  18413647 gttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagat 18413744  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  18413745 tgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctaccca 18413782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 2647949 - 2647650
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaaca 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   |||| | | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||  || ||||||||||    
T  2647949 aacaaagatgtgtggagcaaaggaaatggtaatcaatagataaaatatctccaaacaacaacaacaa-aaaacagacctaaatctaagtttagagcaaca 2647851  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgg 440  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||    
T  2647850 ccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaa--gattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgg 2647753  T
Q  441 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgc 539  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  2647752 gggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctac 2647653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 18408576 - 18408906
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18408576 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccacgcaacaacaa 18408674  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagatt 405  Q
    |||  ||| || | ||| ||  ||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18408675 caa--aaacagccgtagtcta-gtgtagagcaacaccacaaacaaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaaaagatt 18408769  T
Q  406 gttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagct 504  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  18408770 gttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaataact 18408868  T
Q  505 tgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  18408869 tgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctaccca 18408906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 224 - 514
Target Start/End: Original strand, 21988732 - 21989022
Alignment:
Q  224 aaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    |||||||     
T  21988732 aaaaatcacaccaatgaaaaataatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcaccaagcaacaacaacaa-actccagacctaa 21988830  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcgg 420  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  21988831 atctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcgg 21988928  T
Q  421 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac--aaagagttacaagaaaatagcttgcaagctta 514  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21988929 tccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagattgcaagctta 21989022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 531
Target Start/End: Original strand, 21639654 - 21639940
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||  |||||||||||||    
T  21639654 aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaaca 21639750  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    |||||||   | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  21639751 ccacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg 21639847  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21639848 ggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagaccta 21639940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 531
Target Start/End: Original strand, 21645818 - 21646138
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21645818 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaa 21645916  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gat 404  Q
    |||  ||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||||   | ||||| || | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  21645917 caa--aaacagccctagtcta-gtgtagagcaacaccacaagagaatacaaaacaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagat 21646011  T
Q  405 tgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagc 503  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  21646012 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaaaaatagc 21646110  T
Q  504 ttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21646111 ttgcaagcttacacaagaacaagaccta 21646138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 208 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 1533730 - 1533417
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaa-agtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  1533730 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaagtttccaagcaacaacaa 1533632  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aaga 403  Q
    |||  ||  || || || ||  |||||||||||||||||||  | || |||||||| | || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1533631 caa--aaccagccccagtcta-gtgtagagcaacaccacaaagagaatacaaagcaaacaatataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaataaga 1533537  T
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 501  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  1533536 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 1533438  T
Q  502 gcttgcaagcttacactagaa 522  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1533437 gcttgcaagcttacacaagaa 1533417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 225 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9235827 - 9235634
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  9235827 aaaatcacaccaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacctaaa 9235728  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttc 418  Q
     ||   |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  9235727 tctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttc 9235634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28617480 - 28617216
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagaccta-gactttgtgtaga-gcaac 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||     |||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||| | ||| | |||||    
T  28617480 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtagcctcaagaaacaagaacaacaaaatagacctaagtcttagagtaaaagcaac 28617381  T
Q  341 accacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatat 438  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  28617380 accacaagcatattcaaagcaacaaagataagcaa-gaaaggaagaaaacaaacacaccaata--ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactct 28617284  T
Q  439 gggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-agagttacaagaaaatagctt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||    
T  28617283 gggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaatggggttacaagaaattagctt 28617216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 364 - 531
Target Start/End: Original strand, 2057931 - 2058098
Alignment:
Q  364 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 462  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2057931 aagataagcaataaaaggaag-aacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 2058027  T
Q  463 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacactagaacaaggccta 531  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  2058028 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaagcccta 2058098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 298 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5817469 - 5817268
Alignment:
Q  298 caacaacaacaacaaaaaagaccta-gactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaa-gataagcaatgaaagaaaggaacaaacaca 395  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | | | ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5817469 caacaacaacaacaaaatagacataagtcctagtgtagaacaacaccacaagcataatcaacacaataatgataagcaatgtaagaaaggaacaaacaca 5817370  T
Q  396 ccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaa 494  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||    
T  5817369 ccaaa-gattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaaggggttacaa 5817272  T
Q  495 gaaa 498  Q
    ||||    
T  5817271 gaaa 5817268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 498
Target Start/End: Original strand, 3047079 - 3047354
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac---aacaaaaaagacct 321  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||   ||||||||||||||   ||||||| ||  ||    
T  3047079 aaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtgataatcaatgagtaaagtgtcctcaagcaacaacaacaataacaaaatagttct 3047177  T
Q  322 -agactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcg 419  Q
     | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||  || | |||||||  ||||||||||||  ||||| | | | ||||||||    
T  3047178 aaaactgtgtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaatcaacaagataa-taaagcaagaaagaaaacaaacacacc--aagatcg-taacccagttcg 3047273  T
Q  420 gtccaatatgacctaatat-gggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3047274 gtccaatatgacctgctctggggggagagagccgttatccaatccactaatatgaaagtggtacaaatgagttacaagaaa 3047354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20357643 - 20357547
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 498  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20357643 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaa 20357547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30814637 - 30814539
Alignment:
Q  369 aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccacta 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  30814637 aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccacta 30814540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 19992314 - 19992408
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19992314 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 19992408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 24024410 - 24024316
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  24024410 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaatgttacaaga 24024316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 47676111 - 47676180
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47676111 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 47676180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 485
Target Start/End: Original strand, 4866731 - 4866814
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4866731 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 4866814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 12396912 - 12397007
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12396912 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 12397007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 16880074 - 16880169
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  16880074 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16880169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 16884930 - 16885025
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  16884930 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16885025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351716
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactat 7351716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31109667 - 31109573
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  31109667 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 31109573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24261407 - 24261311
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24261407 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24261311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24266286 - 24266190
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24266286 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24266190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 12406332 - 12406427
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12406332 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 12406427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22270204 - 22270076
Alignment:
Q  341 accacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  22270204 accacaatcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagaga-tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctg 22270106  T
Q  440 ggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    | |||||||   | ||||||||||||||||    
T  22270105 gaggagagattgatctctccaatccactat 22270076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155975
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31155975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27348010 - 27347941
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  27348010 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27347941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48489624 - 48489532
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactatga 470  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  48489624 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatga 48489532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 1046925 - 1046989
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1046925 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactat 1046989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049360
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 1049360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1850270 - 1850206
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1850270 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 1850206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935493
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2935493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035949
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 3035949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027258
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactat 9027258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108291
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 22108291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137302
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 22137302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550051
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 40550051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552329
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 40552329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 41317417 - 41317499
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  41317417 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 41317499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 41648994 - 41649076
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  41648994 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 41649076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 467
Target Start/End: Original strand, 12097850 - 12097931
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccacta 467  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12097850 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 31732944 - 31733013
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  31732944 aagagaggaacaaactcaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 31733013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 36146391 - 36146452
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36146391 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 36146452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20297648 - 20297587
Alignment:
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20297648 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 20297587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1606668 - 1606604
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1606668 ttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 1606604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 468
Target Start/End: Original strand, 7349285 - 7349337
Alignment:
Q  416 ttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7349285 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 7349337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9235605 - 9235537
Alignment:
Q  474 aagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  9235605 aagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctaccca 9235537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20626327 - 20626263
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20626327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 20626263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20630218 - 20630154
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20630218 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 20630154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20642637 - 20642573
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20642637 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 20642573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38394275 - 38394211
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38394275 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 38394211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 40836743 - 40836807
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40836743 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 40836807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 442
Target Start/End: Original strand, 47673919 - 47673982
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggg 442  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  47673919 aagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgattcagttcggtccaacttgacttaatatgggg 47673982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 3320059 - 3320122
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3320059 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 3320122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 3324807 - 3324870
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3324807 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 3324870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4586354 - 4586264
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  4586354 aagagaggaacaaacacacgaaa-gattgtcgacccagttcggtccaagttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactat 4586264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 14069808 - 14069898
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  14069808 aagagagggacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactat 14069898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 468
Target Start/End: Original strand, 14379836 - 14379926
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  14379836 aagagagggacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactat 14379926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21369825 - 21369754
Alignment:
Q  403 attgttgatccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  21369825 attgtttacccagttcggtccaatgatgacctactatggcggagagagcagctctccgttccactataatga 21369754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25405566 - 25405503
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25405566 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 25405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 21592143 - 21592197
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21592143 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 21592197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 400 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21812322 - 21812254
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatg 469  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21812322 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatg 21812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26417509 - 26417452
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaa 435  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  26417509 aagagaggaacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaatttgacctaa 26417452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 35918 - 35854
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  35918 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactat 35854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6046778 - 6046714
Alignment:
Q  410 atccagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  6046778 atccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatga 6046714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 7470022 - 7470086
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  7470022 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactat 7470086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 7471980 - 7472044
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  7471980 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactat 7472044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8153524 - 8153445
Alignment:
Q  389 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8153524 aaacacaccaaa-gattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 8153445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20299749 - 20299685
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20299749 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactat 20299685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25542817 - 25542753
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25542817 ttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactat 25542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40946617 - 40946553
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  40946617 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactat 40946553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44724868 - 44724804
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  44724868 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 44724804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 48457942 - 48457878
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  48457942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 48457878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2647997 - 2647962
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagc 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2647997 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagc 2647962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 458
Target Start/End: Original strand, 6067206 - 6067253
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6067206 ccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctcc 6067253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 7069953 - 7069890
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  7069953 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgaa 7069890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28487842 - 28487795
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  28487842 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 28487795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1113842 - 1113781
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  1113842 aacaaacacaccaaa-gattgttgactcaattcggtcaaacttgacctaatatgggggagaga 1113781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Original strand, 2057765 - 2057872
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaa-agaaagtggtaattaatgtgt-aaagtgtttccaagcaacaaca 305  Q
    ||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| || |||  |||||||||||  ||||    
T  2057765 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagtcaaatggtttccaagca--aaca 2057862  T
Q  306 acaacaaaaa 315  Q
    ||||||||||    
T  2057863 acaacaaaaa 2057872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2121057 - 2121011
Alignment:
Q  427 atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2121057 atgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 2121011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 8378512 - 8378574
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  8378512 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcaactctccgatccactataatga 8378574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 13099474 - 13099528
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  13099474 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 13099528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25351525 - 25351463
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25351525 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatga 25351463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25410304 - 25410242
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  25410304 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 25410242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 445
Target Start/End: Original strand, 30024727 - 30024773
Alignment:
Q  399 aaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggag 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  30024727 aaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctactctgggggag 30024773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 34546888 - 34546950
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  34546888 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 34546950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 444
Target Start/End: Original strand, 38671205 - 38671262
Alignment:
Q  386 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatggggga 444  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  38671205 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctattttggggga 38671262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18126832 - 18126768
Alignment:
Q  383 aggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||||    
T  18126832 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccaggtcggtcaaacttgacctagtctgggggagaga 18126768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Original strand, 31435046 - 31435115
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  31435046 ttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatga 31435115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44853 - 44789
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  44853 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactat 44789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 381 - 468
Target Start/End: Original strand, 495961 - 496048
Alignment:
Q  381 aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 468  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  495961 aaagaaacaaacacaccaaa-gattgttgacccggttctgtccaacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactat 496048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3878866 - 3878802
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | || || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3878866 ttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 3878802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18345830 - 18345766
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  18345830 ttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactat 18345766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38396923 - 38396859
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  38396923 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactat 38396859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 42330997 - 42331041
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  42330997 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 42331041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 473
Target Start/End: Original strand, 44010760 - 44010820
Alignment:
Q  414 agttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  44010760 agttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 44010820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 208 - 542
Target Start/End: Original strand, 85495 - 85825
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  85495 tgttgtgaattccggtaaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtagagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaat 85594  T
Q  308 aacaaaaaagacctaga-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattg 406  Q
    ||   || ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||    
T  85595 aa---aacagacctagatctaagtgtagagcaacatcacaagcataaccaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaagaacaaacacatcta--gattg 85689  T
Q  407 ttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttg 506  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  85690 ttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagctta 85789  T
Q  507 caagcttacactagaacaaggcctaatttctgccca 542  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  85790 aaagcttacacaagagcaagacctaatttctaccca 85825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 245 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8670 - 8378
Alignment:
Q  245 caaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacacc 343  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  8670 caaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaa-aaaacagacctagtcta-gtgtagagcaacacc 8573  T
Q  344 acaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggg 442  Q
    ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8572 acaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 8474  T
Q  443 gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaaggcctaatttct 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8473 gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttct 8378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22339
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 22339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24614
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 24614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 5508 - 5821
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaa-agacctag 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5508 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaata-gttaagtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagacctag 5606  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5607 atctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggt 5704  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  5705 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaag 5804  T
Q  521 aacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||| | ||||||||    
T  5805 aacaagacttaatttct 5821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 133550 - 133234
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||    
T  133550 aaaatcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaa-agcaaaacagacatag 133453  T
Q  324 actttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  || |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  133452 tcta-gtatagagcaacatcacaagcatatacaaagcaataaagataagtaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggtt 133355  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  133354 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaaga 133255  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  133254 acaagacctaatttctaccca 133234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 225 - 542
Target Start/End: Original strand, 2319 - 2635
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  2319 aaaatcacaccgaagaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgttgatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagacctaga 2416  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  2417 tctaagtgtagaacaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgctc 2514  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  2515 caatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaaattagcttataagcttacacaaga 2614  T
Q  522 acaaggcctaatttctgccca 542  Q
    |||||  ||||||||| ||||    
T  2615 acaagaactaatttctaccca 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 10554 - 10867
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaga-aagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctag 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||   ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  10554 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaagaagtggtaatcgatagataaagttactccaagcaacaacaacaa-aaaacagacctaa 10652  T
Q  324 a-ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggt 421  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  10653 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattattgacccagttcggt 10750  T
Q  422 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactag 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  10751 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacacaag 10850  T
Q  521 aacaaggcctaatttct 537  Q
    |||||| ||||||||||    
T  10851 aacaagacctaatttct 10867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 243 - 484
Target Start/End: Original strand, 45100 - 45337
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacac 342  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  45100 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa--aaacagaccaagtcta-gtgtagagcaacac 45196  T
Q  343 cacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggg 442  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45197 cacaaacatatacaaagaacaaagataagcaatgaaagaatg-aacaaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggg 45295  T
Q  443 gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45296 gagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 243 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18204 - 17922
Alignment:
Q  243 aacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||||  |||||||||||||    
T  18204 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aaaccagccctagacta-gtgtagagcaaca 18107  T
Q  342 ccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatg 439  Q
    |||||||   | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  18106 ccacaagagaatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg 18010  T
Q  440 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaatagcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18009 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaag 17922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 205 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24334 - 24015
Alignment:
Q  205 aagtgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-gaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaa 303  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24334 aagtgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaa 24236  T
Q  304 caacaacaaaaaagacctagactttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa- 401  Q
    |||||| |||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||   | |||||| | | |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||     
T  24235 caacaa-aaaccagccctagacta-gtgtagagcaacaccacaagagaatacaaagaaaacaagataagaaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaa 24140  T
Q  402 gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaat 500  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24139 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaat 24041  T
Q  501 agcttgcaagcttacactagaacaag 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24040 agcttgcaagcttacacaagaacaag 24015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 225 - 537
Target Start/End: Original strand, 17093 - 17401
Alignment:
Q  225 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaaaagacctaga 324  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||| ||||| ||||||||| |||| |     |||| |    
T  17093 aaaatcacatgaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtctccaaacaacaacaaaaacata-----cctaaa 17187  T
Q  325 -ctttgtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtc 422  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  17188 tctaagtatagagcaacaccacaagcataattaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggagcaaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggtt 17285  T
Q  423 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacactaga 521  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  17286 caatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 17385  T
Q  522 acaaggcctaatttct 537  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17386 acaagacctaatttct 17401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Original strand, 1217 - 1344
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataa-caaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaa 306  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1217 tgttgtgaattctggtaaaaatcacaccaatgaaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 1316  T
Q  307 caacaaaaaagacctagactttgtgtagag 336  Q
    ||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1317 ca--aaaacagacctagacttagtgtagag 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9726 - 9632
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9726 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 9632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14393 - 14297
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14393 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19249 - 19153
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  19249 aagattgttgacccagttcag-ccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatg-tgagtgtgttacaaaagagttacaagaa 19153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35146 - 35063
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35146 aagattgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 35063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 364 - 457
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 496  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  364 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 265
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29777 - 29673
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |   ||| ||||||||||    
T  29777 tgttgtgaattcggtcaaaaatcacaccaatgaaaaacaaaaatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaac 29678  T
Q  308 aacaa 312  Q
    |||||    
T  29677 aacaa 29673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Original strand, 43067 - 43171
Alignment:
Q  208 tgttgtgaatttcgttaaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatgtgtaaagtgtttccaagcaacaacaac 307  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |   ||| ||||||||||    
T  43067 tgttgtgaattcggtcaaaaatcacaccaatgaaaaacaaaaatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaac 43166  T
Q  308 aacaa 312  Q
    |||||    
T  43167 aacaa 43171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 485
Target Start/End: Original strand, 23542 - 23613
Alignment:
Q  414 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23542 agttcggtccaatatgacctactttaggggagaaagaagctatccaattcactaagatgaaagtgatacaaa 23613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2335 - 2239
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2335 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20459
Alignment:
Q  378 aagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20390 aagagaggaacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 149040 - 148944
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  149040 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 148944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 11473 - 11537
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11473 ttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactat 11537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69356
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactat 69356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 182048 - 181980
Alignment:
Q  400 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatg 469  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  182048 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6487 - 6423
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6487 ttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1517
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1453 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29458 - 29394
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29458 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 29394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 474
Target Start/End: Original strand, 3078 - 3141
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 474  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3078 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 3141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 458
Target Start/End: Original strand, 4679 - 4733
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 458  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  4679 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 473
Target Start/End: Original strand, 16994 - 17056
Alignment:
Q  412 ccagttcggtccaat-atgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 473  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16994 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 17056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3167 - 3103
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3167 ttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactat 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 14382 - 14446
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  14382 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactat 14446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 41483 - 41547
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  41483 ttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 41547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 79473 - 79409
Alignment:
Q  404 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 468  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  79473 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 79409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 880 times since January 2019
Visitors: 1286