View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0088_low_13 (Length: 341)

Name: NF0088_low_13
Description: NF0088
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0088_low_13
NF0088_low_13
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-257)||(7266-7522)
scaffold0106 (1-257)||(1289-1545)
scaffold0106 (204-254)||(15306-15356)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (1-257)||(20309108-20309364)
chr2 (1-257)||(37978-38235)
chr2 (3-257)||(23285865-23286118)
chr2 (1-257)||(23654248-23654507)
chr2 (11-254)||(298686-298933)
chr2 (18-257)||(22731113-22731355)
chr2 (3-257)||(22738044-22738300)
chr2 (140-257)||(23103399-23103516)
chr2 (3-257)||(22337115-22337372)
chr2 (39-257)||(23076442-23076663)
chr2 (39-257)||(23060513-23060733)
chr2 (3-257)||(23660023-23660279)
chr2 (185-257)||(23071998-23072070)
chr2 (44-171)||(40622114-40622244)
chr2 (144-254)||(22105412-22105524)
chr2 (185-253)||(7679589-7679657)
chr2 (181-257)||(8946657-8946732)
chr2 (144-254)||(26505379-26505490)
chr2 (144-254)||(26507857-26507968)
chr2 (185-252)||(28405981-28406048)
chr2 (184-241)||(22413186-22413243)
chr2 (204-257)||(23040257-23040310)
chr2 (184-241)||(23207293-23207350)
chr2 (144-256)||(32214972-32215085)
chr2 (185-257)||(19671830-19671902)
chr2 (185-253)||(25175854-25175922)
chr2 (185-256)||(22134256-22134326)
chr2 (186-241)||(25108903-25108958)
chr2 (140-241)||(7735-7838)
chr2 (144-254)||(571397-571508)
chr2 (144-254)||(18808943-18809054)
chr2 (186-241)||(20520243-20520298)
chr2 (144-254)||(23130862-23130973)
chr2 (144-254)||(23133329-23133440)
chr2 (144-254)||(23135590-23135701)
chr2 (144-254)||(23709583-23709694)
chr2 (144-254)||(23712064-23712175)
chr2 (186-241)||(23791289-23791344)
chr2 (144-254)||(34402573-34402684)
chr2 (144-254)||(39682313-39682424)
chr2 (195-254)||(45029958-45030016)
chr2 (204-254)||(6725995-6726045)
chr2 (204-254)||(28577099-28577149)
chr2 (159-240)||(32451949-32452033)
chr2 (204-254)||(38967374-38967424)
chr2 (185-238)||(18786952-18787005)
chr2 (185-238)||(23708668-23708721)
chr2 (159-254)||(24529595-24529691)
chr2 (204-252)||(43137301-43137349)
chr2 (204-251)||(21155172-21155219)
chr2 (186-241)||(23004764-23004819)
chr2 (144-238)||(24367790-24367885)
chr2 (204-251)||(24643062-24643109)
chr2 (186-241)||(24697657-24697712)
chr2 (204-254)||(32039610-32039660)
chr2 (186-242)||(23287378-23287433)
chr2 (144-254)||(24898246-24898358)
chr2 (144-254)||(24900729-24900841)
chr2 (144-254)||(24903206-24903318)
chr2 (144-254)||(24905683-24905795)
chr2 (144-254)||(24908158-24908270)
chr2 (1-105)||(27753730-27753834)
chr2 (187-242)||(26392397-26392451)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-257)||(16282-16538)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (1-257)||(27847695-27847951)
chr7 (1-255)||(40443393-40443648)
chr7 (4-257)||(16386112-16386369)
chr7 (1-257)||(9509189-9509448)
chr7 (1-257)||(12698831-12699091)
chr7 (4-257)||(10589039-10589294)
chr7 (11-257)||(26211995-26212245)
chr7 (45-254)||(18456319-18456530)
chr7 (4-257)||(38227481-38227736)
chr7 (185-257)||(16495402-16495474)
chr7 (4-254)||(3564229-3564482)
chr7 (185-257)||(28505347-28505419)
chr7 (185-257)||(34200786-34200858)
chr7 (144-257)||(13647325-13647440)
chr7 (185-257)||(11996076-11996148)
chr7 (44-253)||(12187019-12187227)
chr7 (185-257)||(67745-67817)
chr7 (138-257)||(16219717-16219835)
chr7 (185-253)||(44014182-44014250)
chr7 (185-257)||(47831807-47831879)
chr7 (44-159)||(17137969-17138083)
chr7 (140-238)||(2280121-2280221)
chr7 (185-257)||(15754936-15755008)
chr7 (140-254)||(48273392-48273508)
chr7 (144-254)||(17061966-17062077)
chr7 (185-253)||(811180-811248)
chr7 (185-253)||(18005650-18005718)
chr7 (189-257)||(22072913-22072981)
chr7 (181-238)||(12901342-12901399)
chr7 (186-241)||(20220238-20220293)
chr7 (184-238)||(1868043-1868097)
chr7 (185-235)||(12255842-12255892)
chr7 (144-254)||(24704688-24704796)
chr7 (184-241)||(15008547-15008604)
chr7 (138-254)||(16213684-16213801)
chr7 (204-257)||(18430709-18430762)
chr7 (184-241)||(48991196-48991253)
chr7 (144-254)||(456321-456432)
chr7 (144-254)||(11972496-11972607)
chr7 (144-254)||(14949173-14949284)
chr7 (144-254)||(15376764-15376875)
chr7 (144-254)||(16232520-16232631)
chr7 (144-254)||(16410059-16410170)
chr7 (144-254)||(18640272-18640383)
chr7 (144-254)||(20385174-20385285)
chr7 (144-254)||(21189646-21189757)
chr7 (144-238)||(24275187-24275282)
chr7 (144-254)||(32125491-32125602)
chr7 (144-254)||(41522917-41523028)
chr7 (144-254)||(41525379-41525490)
chr7 (204-254)||(3386333-3386383)
chr7 (144-253)||(11393338-11393448)
chr7 (204-254)||(13869346-13869396)
chr7 (204-254)||(20110556-20110606)
chr7 (204-254)||(24702238-24702288)
chr7 (186-238)||(14044765-14044817)
chr7 (186-238)||(14354795-14354847)
chr7 (195-254)||(13831373-13831431)
chr7 (140-238)||(16056347-16056446)
chr7 (144-254)||(27216860-27216971)
chr7 (144-254)||(44116509-44116620)
chr7 (188-242)||(9177718-9177772)
chr7 (204-238)||(15144105-15144139)
chr7 (185-257)||(19486793-19486865)
chr7 (140-238)||(38898423-38898523)
chr7 (186-229)||(14036282-14036325)
chr7 (186-229)||(14346312-14346355)
chr7 (186-241)||(18203828-18203882)
chr7 (204-238)||(18154909-18154943)
chr7 (204-253)||(19649557-19649606)
chr7 (204-256)||(2832509-2832561)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-257)||(914-1170)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (1-257)||(16920495-16920751)
chr6 (1-257)||(22831503-22831761)
chr6 (12-245)||(11185517-11185750)
chr6 (85-257)||(35245586-35245758)
chr6 (8-257)||(20360829-20361081)
chr6 (1-257)||(20638145-20638404)
chr6 (4-257)||(29060540-29060796)
chr6 (39-257)||(19303441-19303661)
chr6 (3-256)||(18409691-18409947)
chr6 (4-257)||(25629220-25629476)
chr6 (2-257)||(22780090-22780348)
chr6 (138-257)||(16496244-16496365)
chr6 (50-257)||(20593773-20593983)
chr6 (3-257)||(17287660-17287917)
chr6 (138-257)||(20076700-20076817)
chr6 (185-257)||(27333267-27333339)
chr6 (185-257)||(27394007-27394079)
chr6 (185-257)||(1561303-1561375)
chr6 (185-253)||(19652199-19652267)
chr6 (185-257)||(28496520-28496592)
chr6 (185-257)||(29808931-29809003)
chr6 (157-254)||(25656629-25656727)
chr6 (185-238)||(9098563-9098616)
chr6 (186-239)||(23076748-23076801)
chr6 (185-238)||(25644339-25644392)
chr6 (186-239)||(35008166-35008219)
chr6 (144-254)||(22782227-22782338)
chr6 (185-238)||(20109157-20109210)
chr6 (204-257)||(25714417-25714470)
chr6 (144-254)||(1595549-1595660)
chr6 (144-254)||(12742317-12742428)
chr6 (144-254)||(18334643-18334754)
chr6 (144-254)||(19005046-19005157)
chr6 (144-254)||(19858970-19859081)
chr6 (210-257)||(22080799-22080846)
chr6 (144-254)||(24422547-24422658)
chr6 (144-254)||(25754809-25754920)
chr6 (144-254)||(33861794-33861905)
chr6 (144-254)||(33864278-33864389)
chr6 (204-254)||(2291292-2291342)
chr6 (204-254)||(8055029-8055079)
chr6 (192-238)||(19668390-19668436)
chr6 (204-254)||(26924752-26924802)
chr6 (204-241)||(18456732-18456769)
chr6 (204-241)||(18461892-18461929)
chr6 (204-241)||(18821912-18821949)
chr6 (185-257)||(23019408-23019478)
chr6 (144-256)||(30676761-30676874)
chr6 (204-254)||(1541023-1541073)
chr6 (204-254)||(3852129-3852179)
chr6 (204-254)||(20557004-20557054)
chr6 (184-242)||(33443062-33443119)
chr6 (185-234)||(4185870-4185919)
chr6 (212-257)||(8227587-8227632)
chr6 (144-256)||(34963371-34963484)
chr6 (159-238)||(25688518-25688598)
chr6 (204-251)||(16448639-16448686)
chr6 (191-242)||(18177729-18177779)
chr6 (191-242)||(18204092-18204142)
chr6 (139-204)||(27415942-27416008)
chr6 (204-253)||(19862978-19863027)
chr6 (204-253)||(19873120-19873169)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-257)||(51582-51838)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (39-257)||(21389353-21389571)
chr8 (52-257)||(21395896-21396101)
chr8 (52-257)||(21790389-21790594)
chr8 (57-257)||(21778697-21778897)
chr8 (1-257)||(16199508-16199765)
chr8 (1-257)||(31971257-31971514)
chr8 (1-257)||(45130860-45131117)
chr8 (1-257)||(21918862-21919121)
chr8 (1-257)||(18879099-18879352)
chr8 (1-257)||(20536208-20536467)
chr8 (3-256)||(28648908-28649164)
chr8 (3-257)||(22626736-22626992)
chr8 (18-257)||(18818288-18818530)
chr8 (3-257)||(21923792-21924049)
chr8 (4-260)||(6759255-6759512)
chr8 (4-257)||(16092206-16092463)
chr8 (185-257)||(5866323-5866395)
chr8 (44-257)||(7372778-7372986)
chr8 (144-257)||(17140916-17141031)
chr8 (44-257)||(22875065-22875281)
chr8 (185-257)||(21490995-21491067)
chr8 (3-121)||(25363004-25363123)
chr8 (44-257)||(23406379-23406597)
chr8 (185-257)||(6520368-6520440)
chr8 (185-257)||(38855300-38855372)
chr8 (185-257)||(23760893-23760962)
chr8 (140-241)||(20498578-20498681)
chr8 (185-253)||(26355747-26355815)
chr8 (3-256)||(23648554-23648810)
chr8 (185-238)||(21285616-21285669)
chr8 (185-257)||(17612159-17612231)
chr8 (186-241)||(17267044-17267099)
chr8 (207-257)||(21249384-21249434)
chr8 (207-257)||(21255222-21255272)
chr8 (185-238)||(983455-983508)
chr8 (144-254)||(14409495-14409606)
chr8 (186-241)||(17439557-17439612)
chr8 (186-241)||(24353036-24353091)
chr8 (186-241)||(37116363-37116418)
chr8 (184-241)||(19154935-19154992)
chr8 (189-238)||(21673723-21673772)
chr8 (140-238)||(26219733-26219831)
chr8 (144-254)||(1484402-1484513)
chr8 (144-254)||(5853343-5853454)
chr8 (144-238)||(16413367-16413462)
chr8 (144-254)||(20403227-20403338)
chr8 (144-254)||(22001753-22001864)
chr8 (204-254)||(4542485-4542535)
chr8 (204-254)||(19896265-19896315)
chr8 (204-254)||(20046307-20046357)
chr8 (204-254)||(26225359-26225409)
chr8 (189-250)||(13508138-13508199)
chr8 (204-260)||(19937118-19937174)
chr8 (144-254)||(41598188-41598299)
chr8 (188-250)||(13597669-13597731)
chr8 (204-238)||(15070574-15070608)
chr8 (204-254)||(15203343-15203393)
chr8 (204-238)||(45290807-45290841)
chr8 (204-241)||(19801493-19801530)
chr8 (186-242)||(22525573-22525628)
chr8 (211-254)||(4483281-4483324)
chr8 (204-254)||(25484380-25484430)
chr8 (194-242)||(22419471-22419519)
chr8 (189-241)||(28397566-28397617)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-254)||(4993-5246)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (20-257)||(17046487-17046724)
chr4 (1-257)||(14053164-14053422)
chr4 (3-257)||(12902757-12903014)
chr4 (1-257)||(7088877-7089136)
chr4 (3-255)||(22636437-22636691)
chr4 (1-257)||(44052829-44053088)
chr4 (11-250)||(23374231-23374473)
chr4 (3-254)||(16377387-16377639)
chr4 (50-257)||(16270147-16270356)
chr4 (3-257)||(16239834-16240090)
chr4 (76-257)||(7798774-7798958)
chr4 (2-257)||(7893703-7893958)
chr4 (4-252)||(14038653-14038904)
chr4 (180-257)||(15551817-15551894)
chr4 (181-257)||(3096293-3096368)
chr4 (185-257)||(39706337-39706409)
chr4 (138-257)||(52873367-52873488)
chr4 (1-131)||(3096772-3096902)
chr4 (83-171)||(15121747-15121834)
chr4 (185-253)||(12774011-12774079)
chr4 (138-257)||(6899891-6900011)
chr4 (185-238)||(12288259-12288312)
chr4 (185-238)||(52243245-52243298)
chr4 (140-241)||(13853-13956)
chr4 (3-121)||(17047936-17048055)
chr4 (140-254)||(54798756-54798872)
chr4 (185-253)||(8846360-8846428)
chr4 (140-254)||(14280316-14280431)
chr4 (144-254)||(18215325-18215436)
chr4 (204-255)||(22353835-22353886)
chr4 (140-254)||(44928926-44929042)
chr4 (159-240)||(6190479-6190563)
chr4 (192-238)||(43198611-43198657)
chr4 (184-241)||(46640504-46640561)
chr4 (204-260)||(19242693-19242749)
chr4 (144-254)||(12358-12469)
chr4 (144-254)||(15118403-15118514)
chr4 (144-254)||(23803316-23803427)
chr4 (144-254)||(44615288-44615399)
chr4 (144-254)||(44773138-44773249)
chr4 (144-254)||(51463919-51464030)
chr4 (144-254)||(52312510-52312621)
chr4 (186-241)||(53082202-53082257)
chr4 (204-254)||(1837621-1837671)
chr4 (204-254)||(7641294-7641344)
chr4 (204-254)||(12610950-12611000)
chr4 (204-254)||(18239531-18239581)
chr4 (204-254)||(44102214-44102264)
chr4 (204-254)||(50222451-50222501)
chr4 (204-257)||(15367690-15367743)
chr4 (204-257)||(15370018-15370071)
chr4 (204-257)||(15371202-15371255)
chr4 (204-257)||(15373483-15373536)
chr4 (204-257)||(15402703-15402756)
chr4 (204-257)||(16223532-16223585)
chr4 (144-256)||(19618223-19618336)
chr4 (144-254)||(3515007-3515118)
chr4 (204-238)||(8574935-8574969)
chr4 (204-238)||(15355437-15355471)
chr4 (206-241)||(21815699-21815734)
chr4 (204-238)||(14970819-14970853)
chr4 (139-204)||(43256161-43256227)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (6-257)||(38801258-38801508)
chr1 (1-257)||(27250591-27250850)
chr1 (3-256)||(50210077-50210333)
chr1 (11-257)||(21026680-21026929)
chr1 (7-254)||(34509783-34510033)
chr1 (3-257)||(22532269-22532526)
chr1 (3-179)||(22354436-22354613)
chr1 (157-257)||(20847173-20847275)
chr1 (185-257)||(14295600-14295672)
chr1 (185-253)||(22921918-22921986)
chr1 (144-257)||(45574893-45575008)
chr1 (185-238)||(21754064-21754117)
chr1 (140-241)||(21896258-21896361)
chr1 (185-257)||(33681010-33681079)
chr1 (185-257)||(52928019-52928088)
chr1 (185-253)||(20248283-20248351)
chr1 (140-241)||(21861572-21861675)
chr1 (1-131)||(22356036-22356168)
chr1 (1-131)||(22357722-22357854)
chr1 (3-256)||(20135188-20135444)
chr1 (108-241)||(35261051-35261183)
chr1 (44-121)||(48603652-48603730)
chr1 (185-238)||(16758668-16758721)
chr1 (185-238)||(20918623-20918676)
chr1 (186-241)||(50614167-50614222)
chr1 (186-241)||(50621995-50622050)
chr1 (157-238)||(22123131-22123214)
chr1 (189-257)||(22237630-22237695)
chr1 (204-257)||(13212974-13213027)
chr1 (188-241)||(16368338-16368391)
chr1 (188-256)||(20454606-20454673)
chr1 (204-260)||(21342090-21342146)
chr1 (144-254)||(13988866-13988977)
chr1 (195-254)||(21707167-21707225)
chr1 (195-254)||(21711709-21711767)
chr1 (144-254)||(21923342-21923453)
chr1 (144-254)||(23593786-23593897)
chr1 (144-254)||(29776688-29776799)
chr1 (140-254)||(31612313-31612428)
chr1 (140-254)||(433012-433125)
chr1 (204-254)||(21346961-21347011)
chr1 (204-254)||(29298137-29298187)
chr1 (184-241)||(41050084-41050141)
chr1 (204-260)||(15860121-15860177)
chr1 (159-254)||(16275430-16275526)
chr1 (144-255)||(21840766-21840878)
chr1 (50-256)||(22468608-22468816)
chr1 (144-254)||(21475138-21475249)
chr1 (206-256)||(16361915-16361965)
chr1 (187-241)||(50686627-50686681)
chr1 (204-253)||(21714546-21714595)
chr1 (186-242)||(21533923-21533978)
chr1 (184-239)||(16093933-16093988)
chr1 (186-241)||(26064954-26065009)
chr1 (204-256)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-257)||(10288-10544)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-257)||(32067-32323)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-257)||(46995-47245)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-257)||(13497-13754)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-257)||(4712-4970)
scaffold0358 (1-179)||(16-194)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-257)||(15327-15584)
scaffold0114 (83-171)||(7378-7465)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (5-257)||(21292836-21293090)
chr5 (3-257)||(8286706-8286964)
chr5 (1-257)||(23390358-23390617)
chr5 (3-257)||(24493569-24493825)
chr5 (3-254)||(24529223-24529477)
chr5 (3-257)||(25421532-25421789)
chr5 (82-250)||(37723910-37724080)
chr5 (11-257)||(22075018-22075268)
chr5 (3-257)||(13025311-13025567)
chr5 (3-257)||(13095495-13095751)
chr5 (7-257)||(9077952-9078205)
chr5 (138-257)||(21729064-21729185)
chr5 (138-257)||(21808389-21808510)
chr5 (3-237)||(25431414-25431651)
chr5 (185-257)||(19660884-19660956)
chr5 (185-257)||(36314577-36314649)
chr5 (44-257)||(1096467-1096683)
chr5 (157-257)||(21997553-21997655)
chr5 (44-253)||(22032323-22032529)
chr5 (185-257)||(21329546-21329618)
chr5 (44-159)||(18769910-18770024)
chr5 (141-241)||(20026942-20027046)
chr5 (140-254)||(22412187-22412302)
chr5 (185-253)||(22959581-22959649)
chr5 (83-159)||(23572178-23572254)
chr5 (185-257)||(19668898-19668970)
chr5 (185-257)||(21502205-21502277)
chr5 (185-253)||(21565546-21565614)
chr5 (3-122)||(22107237-22107357)
chr5 (184-241)||(22178269-22178326)
chr5 (185-241)||(22144065-22144121)
chr5 (3-121)||(21986011-21986130)
chr5 (185-238)||(26012084-26012137)
chr5 (144-254)||(264819-264930)
chr5 (144-254)||(10732991-10733102)
chr5 (203-254)||(20909012-20909063)
chr5 (144-254)||(39363384-39363495)
chr5 (204-254)||(2154726-2154776)
chr5 (204-254)||(11581311-11581361)
chr5 (204-254)||(20918060-20918110)
chr5 (204-254)||(29329934-29329984)
chr5 (204-254)||(36154892-36154942)
chr5 (204-254)||(38619434-38619484)
chr5 (204-254)||(39245136-39245186)
chr5 (204-253)||(23064512-23064561)
chr5 (206-254)||(10775790-10775838)
chr5 (159-238)||(20902075-20902155)
chr5 (144-254)||(32027393-32027504)
chr5 (144-254)||(42245416-42245527)
chr5 (138-238)||(18418599-18418699)
chr5 (204-254)||(29345980-29346030)
chr5 (204-254)||(31061068-31061118)
chr5 (204-251)||(18319146-18319193)
chr5 (207-254)||(29348453-29348500)
chr5 (207-254)||(29350926-29350973)
chr5 (188-242)||(15796434-15796487)
chr5 (139-204)||(18356367-18356433)
chr5 (204-254)||(20806854-20806904)
chr5 (139-204)||(20910800-20910866)
chr5 (204-238)||(26704090-26704124)
chr5 (211-241)||(26740720-26740750)
chr5 (204-238)||(26973823-26973857)
chr5 (211-241)||(27989004-27989034)
chr5 (187-236)||(26732884-26732932)
chr5 (212-257)||(40725853-40725898)
chr5 (45-93)||(22412340-22412388)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-257)||(911-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-257)||(167841-168099)
scaffold0011 (3-257)||(51913-52170)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (1-257)||(20698298-20698556)
chr3 (16-257)||(12399209-12399453)
chr3 (1-257)||(17487856-17488115)
chr3 (1-257)||(13442274-13442533)
chr3 (1-257)||(17499338-17499597)
chr3 (4-257)||(14972854-14973110)
chr3 (7-257)||(18438534-18438787)
chr3 (3-238)||(14576697-14576934)
chr3 (44-257)||(26686887-26687103)
chr3 (44-257)||(43840932-43841148)
chr3 (4-257)||(23083226-23083482)
chr3 (45-254)||(24153115-24153326)
chr3 (3-257)||(25476249-25476506)
chr3 (3-254)||(40213585-40213838)
chr3 (185-257)||(13210376-13210448)
chr3 (3-238)||(14572608-14572845)
chr3 (3-257)||(11424627-11424880)
chr3 (5-238)||(42386429-42386666)
chr3 (185-253)||(49668125-49668193)
chr3 (185-241)||(52523778-52523834)
chr3 (185-253)||(9512924-9512992)
chr3 (185-253)||(9520899-9520967)
chr3 (185-253)||(12174308-12174376)
chr3 (189-253)||(16097332-16097396)
chr3 (144-254)||(17672626-17672737)
chr3 (185-257)||(15470927-15470996)
chr3 (185-238)||(32307696-32307749)
chr3 (44-121)||(14179570-14179648)
chr3 (4-121)||(16796685-16796803)
chr3 (192-254)||(28194693-28194755)
chr3 (207-257)||(43550594-43550644)
chr3 (185-254)||(27165250-27165319)
chr3 (140-254)||(36166598-36166712)
chr3 (185-257)||(14234487-14234559)
chr3 (185-253)||(16103784-16103852)
chr3 (44-253)||(856140-856348)
chr3 (144-254)||(9707658-9707769)
chr3 (186-241)||(22110402-22110457)
chr3 (144-254)||(29172634-29172745)
chr3 (186-241)||(43925974-43926029)
chr3 (184-253)||(37251216-37251283)
chr3 (185-254)||(53301600-53301669)
chr3 (142-254)||(55500942-55501055)
chr3 (185-257)||(24340772-24340844)
chr3 (144-254)||(6469185-6469296)
chr3 (144-254)||(7781398-7781509)
chr3 (144-254)||(17463178-17463289)
chr3 (144-254)||(28848662-28848773)
chr3 (144-254)||(34159326-34159437)
chr3 (144-254)||(45606958-45607069)
chr3 (144-254)||(55476491-55476602)
chr3 (204-254)||(8499518-8499568)
chr3 (204-254)||(10556985-10557035)
chr3 (204-254)||(15412429-15412479)
chr3 (204-254)||(15977515-15977565)
chr3 (204-254)||(17737236-17737286)
chr3 (204-254)||(45577950-45578000)
chr3 (188-241)||(606378-606431)
chr3 (140-238)||(21618465-21618563)
chr3 (204-241)||(53070765-53070802)
chr3 (184-240)||(12377938-12377994)
chr3 (204-252)||(16282923-16282971)
chr3 (204-252)||(41123892-41123940)
chr3 (144-254)||(8899094-8899205)
chr3 (204-255)||(13544024-13544075)
chr3 (144-254)||(16454332-16454443)
chr3 (144-238)||(38961942-38962037)
chr3 (204-254)||(10247835-10247885)
chr3 (204-254)||(12119837-12119887)
chr3 (204-238)||(12567576-12567610)
chr3 (204-254)||(44494809-44494859)
chr3 (204-238)||(50242838-50242872)
chr3 (185-238)||(23274706-23274759)
chr3 (144-254)||(13151841-13151953)
chr3 (144-254)||(13154306-13154418)
chr3 (185-257)||(37642314-37642386)
chr3 (144-254)||(17446706-17446816)
chr3 (1-123)||(30029975-30030098)
chr3 (185-238)||(1644723-1644775)
chr3 (204-253)||(15878119-15878168)
chr3 (186-242)||(13919344-13919399)
chr3 (204-256)||(14665398-14665450)
chr3 (204-256)||(14668554-14668606)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-257)||(1952-2211)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-257)||(13211-13470)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (43-257)||(4849-5066)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (44-256)||(174767-174980)
scaffold0021 (1-165)||(124679-124844)
scaffold0021 (187-257)||(121766-121835)
scaffold0021 (181-241)||(136414-136474)
scaffold0021 (181-241)||(145122-145182)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-257)||(1851-2110)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-257)||(5983-6245)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (18-257)||(3470-3712)
scaffold0292 (3-257)||(343-599)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (7-255)||(39479-39729)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-255)||(75083-75333)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (3-257)||(3015-3271)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (3-257)||(38761-39017)
scaffold0145 (50-257)||(32942-33151)
scaffold0145 (204-259)||(9744-9799)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (7-254)||(339818-340065)
scaffold0003 (144-254)||(158501-158612)
scaffold0003 (139-204)||(71353-71419)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (4-257)||(20910-21167)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (3-256)||(17079-17337)
scaffold0056 (204-241)||(79396-79433)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (44-238)||(24206-24405)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (4-250)||(25930-26179)
scaffold0122 (140-254)||(44709-44825)
scaffold0122 (4-107)||(33360-33463)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (56-256)||(3103-3306)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (3-257)||(25896-26152)
scaffold0026 (3-257)||(39858-40113)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (5-257)||(16466-16721)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (3-254)||(22886-23139)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (185-257)||(1118-1190)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (44-257)||(8438-8650)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (4-257)||(4508-4763)
scaffold0228 (4-257)||(12090-12345)
scaffold0228 (4-257)||(22042-22297)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-197)||(6669-6869)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (137-257)||(28414-28536)
scaffold0046 (185-257)||(11292-11364)
scaffold0046 (185-257)||(1997-2069)
scaffold0046 (201-257)||(4552-4608)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (181-257)||(34123-34199)
scaffold0175 (44-207)||(13141-13308)
scaffold0175 (204-257)||(273-326)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (44-171)||(26911-27036)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (3-257)||(39913-40169)
scaffold0080 (184-241)||(19933-19990)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (142-257)||(11447-11564)
scaffold0235 (3-67)||(11377-11441)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (185-257)||(119875-119947)
scaffold0023 (185-253)||(100378-100446)
scaffold0023 (185-253)||(101503-101571)
scaffold0023 (186-253)||(40224-40291)
scaffold0023 (140-254)||(44454-44570)
scaffold0023 (144-254)||(94411-94522)
scaffold0023 (144-238)||(17491-17586)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (3-257)||(8479-8732)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (82-257)||(32901-33077)
scaffold0120 (82-257)||(45928-46104)
scaffold0120 (50-257)||(16113-16322)
scaffold0120 (204-257)||(17397-17450)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (140-238)||(8485-8585)
scaffold0621 (185-257)||(6535-6607)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (185-257)||(6611-6683)
scaffold0333 (185-257)||(13991-14063)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (185-257)||(15826-15898)
scaffold0020 (204-238)||(178913-178947)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (140-241)||(1048-1151)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (185-257)||(1083-1155)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (44-159)||(12857-12971)
scaffold0029 (144-237)||(11305-11399)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (185-238)||(1101-1154)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (181-254)||(15664-15737)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (141-257)||(12942-13057)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (185-253)||(2855-2923)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (140-241)||(13144-13247)
scaffold0357 (186-241)||(2677-2732)
scaffold0357 (185-238)||(16149-16202)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (185-257)||(6172-6244)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (185-253)||(2694-2762)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (185-253)||(19268-19336)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (44-159)||(1975-2089)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (3-121)||(1052-1171)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (44-159)||(21712-21826)
scaffold0210 (44-159)||(29604-29718)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (4-178)||(27911-28086)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (185-257)||(23932-24001)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (185-253)||(133-201)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (185-241)||(6828-6884)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (189-257)||(12766-12834)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (140-241)||(12584-12687)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (193-253)||(32102-32162)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (185-253)||(160688-160756)
scaffold0001 (204-254)||(85692-85742)
scaffold0001 (204-238)||(501100-501134)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (186-253)||(14747-14814)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (185-257)||(10590-10659)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (3-93)||(3648-3738)
scaffold0165 (3-93)||(7712-7802)
scaffold0165 (185-238)||(27798-27851)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (185-238)||(5662-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (181-238)||(8119-8176)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (185-238)||(10546-10599)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (185-253)||(45841-45909)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (193-253)||(132662-132722)
scaffold0028 (185-238)||(62217-62270)
scaffold0028 (144-254)||(136680-136791)
scaffold0028 (144-254)||(139149-139260)
scaffold0028 (144-254)||(144087-144198)
scaffold0028 (144-254)||(134211-134322)
scaffold0028 (144-254)||(141618-141729)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (181-241)||(60761-60821)
scaffold0010 (185-238)||(129924-129977)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (75-236)||(4545-4709)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (186-241)||(129021-129075)
scaffold0022 (140-254)||(116430-116544)
scaffold0022 (188-241)||(78338-78391)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (191-241)||(13793-13843)
scaffold0420 (184-241)||(6332-6389)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (184-238)||(25125-25179)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (185-257)||(22719-22788)
scaffold0037 (144-254)||(82072-82183)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (188-241)||(566-619)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (185-254)||(38751-38820)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (185-238)||(32555-32608)
scaffold0034 (159-240)||(51904-51987)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (185-257)||(11464-11536)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (185-257)||(38305-38377)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (140-241)||(53551-53654)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (144-254)||(13392-13503)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (190-257)||(4888-4954)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (144-254)||(20747-20858)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (144-254)||(37821-37932)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (39-179)||(3429-3571)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (204-254)||(16784-16834)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (184-234)||(38339-38389)
scaffold0139 (204-253)||(19980-20029)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (204-241)||(11979-12016)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (185-253)||(28818-28887)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (184-241)||(2691-2748)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (4-93)||(10330-10419)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (204-241)||(20490-20527)
scaffold0031 (203-257)||(128751-128805)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (184-241)||(267676-267733)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (144-255)||(10772-10884)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (193-257)||(18084-18148)
scaffold0247 (204-238)||(2241-2275)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (204-251)||(4300-4347)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (144-238)||(4710-4805)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (204-255)||(9241-9292)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (144-254)||(13947-14058)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (186-241)||(97021-97076)
scaffold0006 (186-241)||(106299-106354)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (204-254)||(106-156)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (204-238)||(29948-29982)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (139-204)||(15417-15483)
scaffold0107 (188-242)||(36195-36248)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (204-254)||(40400-40450)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (208-254)||(161206-161252)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (138-241)||(8059-8166)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (204-253)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (204-253)||(36454-36503)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (206-254)||(4214-4262)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (204-256)||(12361-12413)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (210-254)||(12064-12108)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (204-251)||(1393-1440)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (184-238)||(103679-103733)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (212-241)||(1874-1903)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (3-80)||(17851-17928)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-66)||(20597-20662)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (204-253)||(69794-69843)


Alignment Details
Target: scaffold0106 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7266
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7522 tcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 7423  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7422 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgt 7323  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7322 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1545 - 1289
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545 tcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 1446  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||     
T  1445 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgc 1346  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1345 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20309364 - 20309108
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20309364 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtta 20309265  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20309264 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgc 20309165  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309164 tatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 37978 - 38235
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37978 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgata 38077  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  38078 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgtt 38177  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38178 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23286118 - 23285865
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23286118 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 23286019  T
Q  103 atg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgtt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| |    
T  23286018 atgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgct 23285920  T
Q  202 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285919 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 23654248 - 23654507
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    
T  23654248 tcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgata 23654347  T
Q  101 taatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct---attgtatactgcctatg 196  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |    |||||| |||||||||    
T  23654348 taatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatg 23654447  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654448 ctgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 298686 - 298933
Alignment:
Q  11 aacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-a 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |    
T  298686 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgtttta 298785  T
Q  110 tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttg 206  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  298786 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttg 298885  T
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  298886 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 22731113 - 22731355
Alignment:
Q  18 gggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcatta 116  Q
    |||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  22731113 gggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 22731212  T
Q  117 cttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttattta 213  Q
    |||||||||| |||| ||   ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22731213 cttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttattta 22731311  T
Q  214 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22731312 actaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 22738044 - 22738300
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||| ||||||| | |||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22738044 gagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22738143  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||| ||    
T  22738144 atgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-tt 22738242  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22738243 aatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  239 atgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22337372 - 22337115
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22337372 gagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatata 22337273  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgtt 198  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   |||| |||| ||||    
T  22337272 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgtt 22337173  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22337172 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23076663 - 23076442
Alignment:
Q  39 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 137  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||       
T  23076663 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 23076564  T
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    |||||| ||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076563 taagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23076465  T
Q  235 taagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||  | |||||||||||||||    
T  23076464 taagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23060733 - 23060513
Alignment:
Q  39 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 137  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  ||       
T  23060733 atgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatt 23060635  T
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060634 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23060536  T
Q  235 taagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  23060535 taagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23660279 - 23660023
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| ||||||    |||| ||||| |||||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  23660279 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23660180  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| || |||||||||||   ||| ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  23660179 atgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttg 23660080  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23660079 ctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Original strand, 40622114 - 40622244
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtt-----tgtatgcat 138  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||| |||    
T  40622114 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacat 40622212  T
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattat 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40622213 aagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 40622244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105412
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  22105425 gattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505379
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  26505392 gattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507857
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  26507870 gattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040310
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215085
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||| |||||    
T  32215070 gattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571397
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  571410 gattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808943
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  18808956 gattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130862
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23130875 gattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133329
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23133342 gattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135590
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23135603 gattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709694
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23709681 gattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712175
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23712162 gattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402684
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  34402671 gattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682313
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  39682326 gattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 45029958 - 45030016
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029958 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6726045 - 6725995
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726045 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 32451949 - 32452033
Alignment:
Q  159 ttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |   || |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451949 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 23708668 - 23708721
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  159 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43137349 - 43137301
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137349 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 21155172 - 21155219
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24367885 - 24367790
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367885 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 24643062 - 24643109
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643062 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039660
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 24898246 - 24898358
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24898246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24898343  T
Q  240 tgttgaagatgatga 254  Q
    || | ||||||||||    
T  24898344 tgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 24900729 - 24900841
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24900729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24900826  T
Q  240 tgttgaagatgatga 254  Q
    || | ||||||||||    
T  24900827 tgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 24903206 - 24903318
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24903206 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24903303  T
Q  240 tgttgaagatgatga 254  Q
    || | ||||||||||    
T  24903304 tgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 24905683 - 24905795
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24905683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24905780  T
Q  240 tgttgaagatgatga 254  Q
    || | ||||||||||    
T  24905781 tgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 24908158 - 24908270
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24908158 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24908255  T
Q  240 tgttgaagatgatga 254  Q
    || | ||||||||||    
T  24908256 tgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27753834 - 27753730
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||| | | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  27753834 tcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 27753735  T
Q  101 taatg 105  Q
    |||||    
T  27753734 taatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16538 - 16282
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16538 tcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtta 16439  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16438 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgc 16339  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16338 tgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 27847695 - 27847951
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27847695 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtga 27847794  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||     
T  27847795 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgc 27847894  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847895 tgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40443648 - 40443393
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  40443648 tcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgata 40443549  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  40443548 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttg 40443449  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 255  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443448 ctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 16386112 - 16386369
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16386112 agagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataa 16386211  T
Q  104 tgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||| ||   ||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| |    
T  16386212 tgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcg 16386311  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386312 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9509448 - 9509189
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  9509448 tcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 9509349  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct---attgtatactgcctatg 196  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  9509348 tagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatg 9509249  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9509248 ttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12699091 - 12698831
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||| || |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  12699091 tcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 12698992  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat----tgtatactgcctat 195  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  12698991 taatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctat 12698892  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12698891 gttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10589294 - 10589039
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  10589294 agagttggacctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataa 10589195  T
Q  104 tgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |     ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||   || | ||||||||||| |||||||     
T  10589194 tgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgc 10589095  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589094 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26212245 - 26211995
Alignment:
Q  11 aacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-a 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |    
T  26212245 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgtttta 26212146  T
Q  110 tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttg 206  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |    
T  26212145 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-g 26212047  T
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212046 ttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  45 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38227736 - 38227481
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||||| || ||| |||||    
T  38227736 agagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataa 38227637  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgt 200  Q
    || | | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||     
T  38227636 tgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgc 38227537  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38227536 tatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 3564229 - 3564482
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    |||||| |||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||    
T  3564229 agagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaa 3564328  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||    
T  3564329 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttg 3564428  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3564429 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647325
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 13647342  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13647341 gttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12187227 - 12187019
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  12187227 gttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 12187129  T
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct----attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |    ||||||  |||||||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  12187128 gttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataaga 12187033  T
Q  240 tgttgaagatgatg 253  Q
    || | |||||||||    
T  12187032 tgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  236 aagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 17137969 - 17138083
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  17137969 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 17138067  T
Q  144 gttgatgaattgaatt 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  17138068 gttgatgaattgaatt 17138083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  238 g 238  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  237 agatgttgaagatgatga 254  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062077
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  17062065 attaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704688
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 243  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  244 gaagatgatga 254  Q
     ||||||||||    
T  24704698 taagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16213801 - 16213684
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213801 taagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16213704  T
Q  235 taagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  16213703 taagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18430762 - 18430709
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430762 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456321
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  456334 gattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972496
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  11972509 gattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949284
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  14949271 gattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376875
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  15376862 gattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232520
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  16232533 gattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410059
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  16410072 gattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640272
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  18640285 gattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385285
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  20385272 gattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189757
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  21189744 gattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275187
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125491
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  32125504 gattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522917
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  41522930 gattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525379
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  41525392 gattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386333
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 253
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393448
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T
Q  241 gttgaagatgatg 253  Q
    | | |||||||||    
T  11393436 gattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24702288 - 24702238
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702288 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13831431 - 13831373
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831431 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27216971 - 27216860
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27216971 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 27216874  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  27216873 gattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 15144105 - 15144139
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144105 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486865
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 38898423 - 38898523
Alignment:
Q  140 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38898423 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttt 38898520  T
Q  236 aag 238  Q
    |||    
T  38898521 aag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203828
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaagatg 18203828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154943
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 914 - 1170
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  914 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgtta 1013  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  1014 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttga 1113  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114 tgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 16920495 - 16920751
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  16920495 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggta 16920594  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||     
T  16920595 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgc 16920694  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920695 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22831761 - 22831503
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831761 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtta 22831662  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgca--taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| | | ||||||||||    
T  22831661 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgtt 22831562  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831561 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11185750 - 11185517
Alignment:
Q  12 acccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatg 111  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11185750 acccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatg 11185651  T
Q  112 cattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  11185650 cattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatt 11185551  T
Q  212 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185550 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  85 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt 184  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Original strand, 20360829 - 20361081
Alignment:
Q  8 ttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20360829 ttgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt 20360928  T
Q  108 -tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgt 203  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | |||||| |||||||||||| ||     
T  20360929 atatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg- 20361027  T
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361028 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 20638145 - 20638404
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||  |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  20638145 tcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 20638244  T
Q  101 taatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||    
T  20638245 taacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatg 20638344  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638345 ttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29060796 - 29060540
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    |||| |||||| | |||||| ||| |||||| |  ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | |||||    
T  29060796 agagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataa 29060697  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| | |||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||    
T  29060696 tgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttg 29060597  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29060596 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 19303441 - 19303661
Alignment:
Q  39 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 137  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  |||  |||||       
T  19303441 atgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataat 19303540  T
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303541 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 19303639  T
Q  236 aagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  19303640 aagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 18409691 - 18409947
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  18409691 gagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 18409790  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| |||| |||| |||||  |||  || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||    
T  18409791 atgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgtt 18409890  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18409891 gctg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 25629220 - 25629476
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  25629220 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 25629319  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||   ||||||||| | ||||     
T  25629320 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttc 25629419  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25629420 ctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 22780090 - 22780348
Alignment:
Q  2 cgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttat 101  Q
    ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |  |||| |||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||    
T  22780090 cgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatat 22780189  T
Q  102 aatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||   |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| |||||||||    
T  22780190 aatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgt 22780289  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  22780290 ttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16496365 - 16496244
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496365 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16496267  T
Q  235 taagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16496266 taagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20593983 - 20593773
Alignment:
Q  50 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttga 148  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||| ||||||   | ||||||||     
T  20593983 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgt 20593884  T
Q  149 tgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 245  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||    
T  20593883 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatga 20593785  T
Q  246 agatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||    
T  20593784 agatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 17287660 - 17287917
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||    
T  17287660 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacata 17287759  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |   |||||||| ||||||||    
T  17287760 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgtt 17287859  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17287860 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076700
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  236 aagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656629
Alignment:
Q  157 atttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25644392 - 25644339
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644392 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22782338 - 22782227
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22782241  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  22782240 gattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20109210 - 20109157
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109210 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714417
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742317
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  12742330 gattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334754
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  18334741 gattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005046
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  19005059 gattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859081
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  19859068 gattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 257
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  210 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422547
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  24422560 gattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754809
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  25754822 gattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861794
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  33861807 gattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864278
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  33864291 gattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 2291292 - 2291342
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8055079 - 8055029
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055079 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  192 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 26924752 - 26924802
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924752 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18456769 - 18456732
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456769 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18461929 - 18461892
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821949
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23019478 - 23019408
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23019478 atactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676874
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||| |||||    
T  30676859 gattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 1541023 - 1541073
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541023 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 3852129 - 3852179
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852129 ttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20557004 - 20557054
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20557004 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185919
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 257
Target Start/End: Original strand, 8227587 - 8227632
Alignment:
Q  212 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227587 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34963484 - 34963371
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34963484 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 34963387  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||| |||||    
T  34963386 gattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  159 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 18177729 - 18177779
Alignment:
Q  191 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18177729 cctatgttgttgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18177779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18204142 - 18204092
Alignment:
Q  191 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18204142 cctatgttgttgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18204092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 27415942 - 27416008
Alignment:
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  27415942 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51838 - 51582
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51838 tcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgtta 51739  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  51738 taatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgc 51639  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51638 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389571
Alignment:
Q  39 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat 138  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 21389452  T
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389453 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T
Q  239 atgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21389553 atgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 52 - 257
Target Start/End: Original strand, 21395896 - 21396101
Alignment:
Q  52 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395896 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 21395995  T
Q  152 attgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395996 attgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 21396095  T
Q  252 tgatgt 257  Q
    ||||||    
T  21396096 tgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 52 - 257
Target Start/End: Original strand, 21790389 - 21790594
Alignment:
Q  52 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790389 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 21790488  T
Q  152 attgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790489 attgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 21790588  T
Q  252 tgatgt 257  Q
    ||||||    
T  21790589 tgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 57 - 257
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  57 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattga 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  157 atttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  257 t 257  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 16199508 - 16199765
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16199508 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaata 16199607  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||    
T  16199608 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttg 16199707  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199708 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31971514 - 31971257
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31971514 tcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgata 31971415  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  31971414 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgtt 31971315  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971314 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 45130860 - 45131117
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||    
T  45130860 tcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgata 45130959  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaa-ttgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  45130960 taatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgtt 45131059  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131060 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 21918862 - 21919121
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||    
T  21918862 tcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgata 21918961  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatg-tttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  21918962 taatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 21919061  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919062 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 18879099 - 18879352
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| || ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||    
T  18879099 tcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgata 18879197  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  18879198 taatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttg 18879295  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18879296 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20536467 - 20536208
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  20536467 tcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgata 20536368  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  20536367 taatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 20536268  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20536267 tttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 28648908 - 28649164
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  28648908 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 28649007  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| ||  |||||||||||  |||  |||||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  28649008 atgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgtt 28649107  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28649108 gct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22626992 - 22626736
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||    
T  22626992 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatata 22626893  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  22626892 atgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttg 22626793  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22626792 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 18818288 - 18818530
Alignment:
Q  18 gggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcatta 116  Q
    |||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||    
T  18818288 gggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcatta 18818387  T
Q  117 cttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttattta 213  Q
    ||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18818388 cttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttattta 18818486  T
Q  214 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18818487 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 21923792 - 21924049
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||    
T  21923792 gagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaata 21923891  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    | ||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| | ||||||| || |||||||| | ||   ||| ||||||||||||    
T  21923892 aggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgtt 21923991  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21923992 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6759512 - 6759255
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  6759512 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 6759413  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| || |||||| |||||  |||  |||||   | |||||||||    ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||    
T  6759412 atgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgtt 6759316  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6759315 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 16092206 - 16092463
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    ||||||||||| | |||||  ||| |||||| || |||| ||||| |||||| || |||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16092206 agagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 16092305  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| || ||||||||| ||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||    
T  16092306 atgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgtt 16092405  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16092406 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    | || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140916
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct--attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  142 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  240 tgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 25363004 - 25363123
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25363004 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtata 25363103  T
Q  103 atg-tttatgcattacttga 121  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  25363104 atgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 142  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  143 tgtt--gatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    || |  | ||| ||| | ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  238 gatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6520440 - 6520368
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6520440 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgta--tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23648810 - 23648554
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||| | |  |||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  23648810 gagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23648711  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||   |||||||||| || |||| |  |||||| |||||||||   || | |||||  |||||||||||    
T  23648710 atgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgtt 23648611  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    | |  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  23648610 gct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21285669 - 21285616
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21285669 atactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaag 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409606
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  14409593 gattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484402
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  1484415 gattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853454
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  5853441 gattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413462
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403227
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  20403240 gattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001753
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  22001766 gattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 4542485 - 4542535
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542485 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896265
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20046307 - 20046357
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046307 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Original strand, 13508138 - 13508199
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508138 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41598299 - 41598188
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598299 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  41598201 gattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 250  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070574
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 15203343 - 15203393
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203343 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290841
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 19801493 - 19801530
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801493 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4483324 - 4483281
Alignment:
Q  211 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483324 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 22419471 - 22419519
Alignment:
Q  194 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22419471 atgttgttgtatattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22419519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397566
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatg 28397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 4993 - 5246
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  4993 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgtta 5092  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||     
T  5093 taatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttga 5192  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5193 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  20 gtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 119  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  120 gaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 17046525  T
Q  220 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046524 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 14053164 - 14053422
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14053164 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgata 14053263  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag-atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  14053264 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgct 14053363  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053364 gttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12903014 - 12902757
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12903014 gagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 12902915  T
Q  103 atg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  12902914 atgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 12902815  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902814 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7089136 - 7088877
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||    
T  7089136 tcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgata 7089037  T
Q  101 taatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  7089036 taatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 7088937  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088936 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22636691 - 22636437
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||| ||||||| | |||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  22636691 gagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatata 22636593  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||| |||| |||||||    
T  22636592 atgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgtt 22636493  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22636492 gttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44053088 - 44052829
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||    
T  44053088 tcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgata 44052989  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  44052988 taatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 44052889  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  44052888 ttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 23374231 - 23374473
Alignment:
Q  11 aacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-a 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  23374231 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 23374330  T
Q  110 tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttg 206  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |    
T  23374331 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-g 23374429  T
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374430 ttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Original strand, 16377387 - 16377639
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16377387 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 16377486  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  16377487 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgc 16377586  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16377587 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 16270147 - 16270356
Alignment:
Q  50 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttga 148  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||||||     
T  16270147 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 16270246  T
Q  149 tgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 246  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16270247 taacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa 16270345  T
Q  247 gatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||    
T  16270346 gatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 16239834 - 16240090
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||  | |||||| |||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||    
T  16239834 gagagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatata 16239933  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | |||||||||| ||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  16239934 atgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttg 16240033  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240034 ct-attgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 174  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  175 atgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7893958 - 7893703
Alignment:
Q  2 cgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttat 101  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  ||    
T  7893958 cgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaat 7893862  T
Q  102 aatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgt 197  Q
    |||| | | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  7893861 aatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 7893762  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893761 tgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14038904 - 14038653
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  ||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  14038904 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14038805  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| | ||   ||||||||| | |||||    
T  14038804 tgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttg 14038705  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 252  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  14038704 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15551894 - 15551817
Alignment:
Q  180 attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551894 attgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  235 taagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3096902 - 3096772
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | ||    
T  3096902 tcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagata 3096803  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 131  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096802 caatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 171
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121834
Alignment:
Q  83 gttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 171  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6900011 - 6899891
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| | ||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6900011 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtct 6899913  T
Q  236 aagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  6899912 aagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13956
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  13953 gatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 17047936 - 17048055
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||  ||| || || |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17047936 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 17048035  T
Q  103 atg-tttatgcattacttga 121  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17048036 atgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  237 agatgttgaagatgatga 254  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  237 agatgttgaagatgatga 254  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215436
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  18215423 gattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353835
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 44928926 - 44929042
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928926 agatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T
Q  237 agatgttgaagatgatga 254  Q
    || || | ||||||||||    
T  44929025 agttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190479
Alignment:
Q  159 ttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |   || |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  192 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242693
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12469
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  12456 gattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118514
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  15118501 gattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615288
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  44615301 gattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773249
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  44773236 gattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464030
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  51464017 gattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312510
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  52312523 gattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 1837621 - 1837671
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837621 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641344
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610950
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239581
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 50222451 - 50222501
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222451 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618336
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||| |||||    
T  19618321 gattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515007
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  3515020 gattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 8574935 - 8574969
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574935 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8574969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355471
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 241
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970853
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 38801258 - 38801508
Alignment:
Q  6 agttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38801258 agttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatg 38801357  T
Q  106 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgttt 205  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  38801358 tttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgttt 38801457  T
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801458 gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 27250591 - 27250850
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  27250591 tcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 27250690  T
Q  101 taatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27250691 taatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 27250790  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27250791 ttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 50210077 - 50210333
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  50210077 gagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 50210176  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||  | ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||   || | ||||||||||||||||||    
T  50210177 atgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 50210276  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50210277 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21026929 - 21026680
Alignment:
Q  11 aacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-a 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  21026929 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgtttta 21026830  T
Q  110 tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttg 206  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||||    ||||||||||||||| ||| |||| |    
T  21026829 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-g 21026731  T
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026730 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34510033 - 34509783
Alignment:
Q  7 gttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 106  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  34510033 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgt 34509934  T
Q  107 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttg 202  Q
    | || |||||||||||   |||  |||||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||    
T  34509933 tataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 34509834  T
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34509833 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22532526 - 22532269
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||| |||||| |  |||| ||||  ||| | |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22532526 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22532427  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||  |||  || ||   |||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22532426 atgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 22532327  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22532326 gctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 22354436 - 22354613
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22354436 gagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22354535  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct 179  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  22354536 atgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgct 22354613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  157 atttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45575008
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 45574991  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||    
T  45574992 gttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754064
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 22356036 - 22356168
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgtt 99  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| |    
T  22356036 tcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgat 22356135  T
Q  100 ataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 131  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22356136 ataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22356168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 22357722 - 22357854
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgtt 99  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| |    
T  22357722 tcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgat 22357821  T
Q  100 ataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 131  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22357822 ataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22357854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20135444 - 20135188
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| | |||||| | |  |||  ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||    
T  20135444 gagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatata 20135345  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgctattgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |  ||| || | |||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||   ||| | |||||  ||||||||| |    
T  20135344 atgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgct 20135245  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    | |  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  20135244 gct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Original strand, 35261051 - 35261183
Alignment:
Q  108 tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgttt 205  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||||||||||   ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||| |||||    
T  35261051 tatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgttt 35261147  T
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261148 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918623
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 238
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123214
Alignment:
Q  157 atttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22237695 - 22237630
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237695 tgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988866
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  13988879 gattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707167
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707225 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711709
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711767 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923453
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  21923440 gattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593897
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23593884 gattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29776799 - 29776688
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29776799 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29776702  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  29776701 gattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31612428 - 31612313
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612428 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T
Q  237 agatgttgaagatgatga 254  Q
    || || | ||||||||||    
T  31612330 agttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433012
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||   ||| | ||||||||||||| |||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  237 agatgttgaagatgatga 254  Q
    || || | ||||||||||    
T  433029 agttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298137
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275526
Alignment:
Q  159 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  241 gttgaagatgatgat 255  Q
    | | |||||| ||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 22468608 - 22468816
Alignment:
Q  50 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttga 148  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || || |||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| ||   ||||||||||     
T  22468608 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgt 22468706  T
Q  149 tgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 245  Q
    ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||   |  |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |    
T  22468707 tgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgatta 22468805  T
Q  246 agatgatgatg 256  Q
    ||||| |||||    
T  22468806 agatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 21475138 - 21475249
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21475138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 21475235  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  21475236 gattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533978
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 239
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 10288 - 10544
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  10288 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgata 10387  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10388 taatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgc 10487  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10488 tgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32323 - 32067
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  32323 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgata 32224  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  32223 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttg 32124  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32123 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47245 - 46995
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  47245 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgata 47152  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  47151 taatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgt 47052  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47051 tgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13754 - 13497
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  13754 tcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgata 13655  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  13654 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgtt 13555  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13554 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4712
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4970 tcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgata 4871  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  4870 taatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 4771  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4770 tgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 194 - 16
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  194 tcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgata 95  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  94 taatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgct 16  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 15327 - 15584
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  15327 tcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 15426  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  15427 taatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgtt 15526  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15527 gct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7378
Alignment:
Q  83 gttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 171  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Original strand, 21292836 - 21293090
Alignment:
Q  5 gagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataat 104  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  21292836 gagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 21292935  T
Q  105 gtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaa-ttgaat-ttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgtt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |    
T  21292936 gtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgct 21293035  T
Q  202 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293036 g-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 8286706 - 8286964
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | || ||||| |||| | ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  8286706 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 8286805  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt----gtatactgcctatgt 197  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||||    
T  8286806 atgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgt 8286905  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286906 tgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 23390358 - 23390617
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  | || ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  23390358 tcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 23390457  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||||    
T  23390458 taatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatg 23390557  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23390558 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24493825 - 24493569
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24493825 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatata 24493726  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | ||||| |||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  24493725 atgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg 24493626  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24493625 ct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24529477 - 24529223
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  24529477 gagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatata 24529378  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| || |||||||||||   |||  |||||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||    
T  24529377 atgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 24529278  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24529277 gttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25421789 - 25421532
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  25421789 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 25421690  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||    
T  25421689 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 25421590  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25421589 gttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37724080 - 37723910
Alignment:
Q  82 tgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct 179  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37724080 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgct 37723981  T
Q  180 attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 250  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37723980 gttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22075268 - 22075018
Alignment:
Q  11 aacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-a 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  22075268 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 22075169  T
Q  110 tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttg 206  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |    ||||||||| ||||||||| |||| |    
T  22075168 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-g 22075070  T
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075069 ttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13025567 - 13025311
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  13025567 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatata 13025468  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13025467 atgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg 13025368  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13025367 ctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13095751 - 13095495
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  13095751 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatata 13095652  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13095651 atgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg 13095552  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13095551 ctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9078205 - 9077952
Alignment:
Q  7 gttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 106  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  9078205 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 9078106  T
Q  107 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttg 202  Q
    | || |||||||||||   |||  |||||   | |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||    
T  9078105 tatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg 9078006  T
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  9078005 tt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Original strand, 21729064 - 21729185
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729064 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21729162  T
Q  235 taagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21729163 taagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 257
Target Start/End: Original strand, 21808389 - 21808510
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808389 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21808487  T
Q  235 taagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21808488 taagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25431651 - 25431414
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  25431651 gagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 25431552  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| |    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||    
T  25431551 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 25431452  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431451 gctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 142  Q
    ||||| ||||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  143 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || |   ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  240 tgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  157 atttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22032529 - 22032323
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  22032529 gttaactgcaatctgtgaagctga-tacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 22032431  T
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct--attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |   |||||  |||||||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  22032430 gttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatg 22032335  T
Q  242 ttgaagatgatg 253  Q
     | |||||||||    
T  22032334 attaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 21329546 - 21329618
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21329546 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 18769910 - 18770024
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  18769910 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 18770008  T
Q  144 gttgatgaattgaatt 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  18770009 gttgatgaattgaatt 18770024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  141 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc----tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  237 agatg 241  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  238 gatgttgaagatgatga 254  Q
    | || | ||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572178
Alignment:
Q  83 gttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatt 159  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21565614 - 21565546
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21565614 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 22107237 - 22107357
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22107237 gagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatata 22107336  T
Q  103 atgt-ttatgcattacttgaa 122  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  22107337 atatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 21986011 - 21986130
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| || |    
T  21986011 gagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaa 21986110  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttga 121  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  21986111 atgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012137
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264930
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  264917 gattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733102
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  10733089 gattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20909063 - 20909012
Alignment:
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909063 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363384
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  39363397 gattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 11581311 - 11581361
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581311 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918110
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29329984 - 29329934
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329984 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154942
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39245186 - 39245136
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245186 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  159 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32027504 - 32027393
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  32027504 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagtt 32027407  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  32027406 gattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 42245416 - 42245527
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  42245416 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 42245513  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  42245514 gattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418599
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  236 aag 238  Q
    |||    
T  18418601 aag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29346030 - 29345980
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346030 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348453
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350926
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18356433 - 18356367
Alignment:
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||    
T  18356433 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 20910800 - 20910866
Alignment:
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20910800 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704090
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 241
Target Start/End: Original strand, 26740720 - 26740750
Alignment:
Q  211 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740720 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973823
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 241
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  211 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40725898 - 40725853
Alignment:
Q  212 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725898 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412340
Alignment:
Q  45 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 93  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 22412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 911 - 1169
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| ||    
T  911 tcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgata 1010  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1011 taatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgt 1110  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1111 tgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 167841 - 168099
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| ||    
T  167841 tcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgata 167940  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  167941 taatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgt 168040  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168041 tgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51913
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  52170 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatata 52071  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||    
T  52070 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgtt 51971  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51970 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 20698298 - 20698556
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| ||    
T  20698298 tcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgata 20698397  T
Q  101 taatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  20698398 taatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 20698497  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698498 tgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12399453 - 12399209
Alignment:
Q  16 ttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcat 114  Q
    |||||||| |||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  12399453 ttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcat 12399354  T
Q  115 tacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatt 211  Q
    |||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12399353 tacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt 12399255  T
Q  212 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399254 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17488115 - 17487856
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  17488115 tcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 17488016  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||| ||||     
T  17488015 taatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatt 17487916  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17487915 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13442533 - 13442274
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtaga-attaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtt 99  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  13442533 tcgagagttgaacc-ttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 13442435  T
Q  100 ataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctat 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  13442434 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctat 13442335  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442334 gttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17499597 - 17499338
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||    
T  17499597 tcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgata 17499498  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||| ||||     
T  17499497 taatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatt 17499398  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17499397 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14973110 - 14972854
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  14973110 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14973011  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| |||||||||||||||  |||  |||||  || |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||    
T  14973010 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttg 14972911  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14972910 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18438787 - 18438534
Alignment:
Q  7 gttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 106  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  18438787 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgt 18438688  T
Q  107 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttg 202  Q
    | ||||||||||||||   |||  |||||  | ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||    
T  18438687 tatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 18438588  T
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18438587 tt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 14576697 - 14576934
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| || |  |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  14576697 gagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 14576796  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattg--tatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  14576797 atgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttg 14576896  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
     || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576897 ctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  143 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  240 tgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840932
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  143 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 43840950  T
Q  240 tgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43840949 tgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 23083226 - 23083482
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||||||||    |||| ||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  23083226 agagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataa 23083325  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| | ||||||||| |||| |   ||| ||   |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  23083326 tgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttg 23083425  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23083426 ctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  45 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| ||   ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 25476249 - 25476506
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||| |||||| |  | || ||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||    
T  25476249 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatata 25476348  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||||    
T  25476349 atgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgtt 25476448  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25476449 gctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Original strand, 40213585 - 40213838
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  40213585 gagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 40213684  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| || |||||||||| |  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||| || ||||    
T  40213685 atgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgtt 40213783  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40213784 gatg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14572845 - 14572608
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||  ||||| |||||| ||| ||||    
T  14572845 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatata 14572746  T
Q  103 atgtttatg-cattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||| |  ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| |   | ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  14572745 atgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttg 14572646  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572645 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 11424627 - 11424880
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||    
T  11424627 gagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatata 11424726  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||  || ||   | ||||||||||   |||   |||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11424727 atgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg 11424823  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  11424824 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42386666 - 42386429
Alignment:
Q  5 gagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    |||||||||| | |||||| |||  ||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||    
T  42386666 gagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataa 42386567  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| |||||||| ||||||  |||  || ||   | |||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  42386566 tgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 42386467  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386466 ctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15470996 - 15470927
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470996 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16796803 - 16796685
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||| ||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  16796803 agagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataa 16796704  T
Q  104 tg-tttatgcattacttga 121  Q
    || ||||||||||||||||    
T  16796703 tgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  192 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 257
Target Start/End: Original strand, 43550594 - 43550644
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43550594 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  238 gatgttgaagatgatga 254  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14234559 - 14234487
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||    
T  14234559 atactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 856348 - 856140
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  856348 gttaactgcaatctgtgaagctta-tatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagat 856250  T
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||  | | || | |||||  |||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  856249 gttgttgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatg 856152  T
Q  242 ttgaagatgatg 253  Q
     | |||||||||    
T  856151 attaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707769
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  9707756 gattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172745
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  29172732 gattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 253
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  142 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  239 atgttgaagatgatga 254  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 24340772 - 24340844
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340772 atactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469296
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  6469283 gattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 7781398 - 7781509
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781398 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7781495  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  7781496 gattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463178
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  17463191 gattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848773
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  28848760 gattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159326
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  34159339 gattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607069
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  45607056 gattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476491
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  55476504 gattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15977565 - 15977515
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737236
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 53070765 - 53070802
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070765 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Original strand, 16282923 - 16282971
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282923 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8899205 - 8899094
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8899205 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 8899108  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  8899107 gattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13544075 - 13544024
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544075 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 16454332 - 16454443
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16454332 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 16454429  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  16454430 gattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 38961942 - 38962037
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961942 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 10247835 - 10247885
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247835 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119887
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12567610 - 12567576
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567610 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50242872 - 50242838
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242872 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 13151841 - 13151953
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13151841 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13151938  T
Q  240 tgttgaagatgatga 254  Q
    || | ||||||||||    
T  13151939 tgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 13154306 - 13154418
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 239  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13154306 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13154403  T
Q  240 tgttgaagatgatga 254  Q
    || | ||||||||||    
T  13154404 tgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642386
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 17446706 - 17446816
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17446706 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagtt 17446802  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  17446803 gattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 30030098 - 30029975
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||||||||  |||||| | |||   |||||||||| ||| ||    
T  30030098 tcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgata 30029999  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaag 123  Q
    ||||||| | | ||||||||||||    
T  30029998 taatgttgtgtacattacttgaag 30029975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 1644723 - 1644775
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  1644723 atactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaag 1644775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2211 - 1952
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  || ||||||   ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||    
T  2211 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagata 2112  T
Q  101 taatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatg 196  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  2111 taatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatg 2012  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2011 tcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13470 - 13211
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||| ||||||||| | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  13470 tcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 13371  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  13370 taatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 13271  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13270 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5066 - 4849
Alignment:
Q  43 ggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| || | ||||    
T  5066 ggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaag 4967  T
Q  142 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4966 atgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaag 4868  T
Q  239 atgttgaagatgatgatgt 257  Q
     ||||||||||||||||||    
T  4867 ttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 174980 - 174767
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 141  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || |||  | ||    
T  174980 gttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgag 174882  T
Q  142 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174881 atgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 174782  T
Q  242 ttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||| ||||||||    
T  174781 ttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 124844 - 124679
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  124844 tcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 124745  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatat 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| | |||||||||||| | |||||||    
T  124744 taatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2110 - 1851
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |  | || ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  2110 tcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 2011  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||||    
T  2010 taatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatg 1911  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1910 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 5983 - 6245
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||| ||||| | || ||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  5983 tcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 6082  T
Q  101 taatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||   ||||||| ||||||    
T  6083 taatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatg 6182  T
Q  197 ttgttgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6183 ttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3470
Alignment:
Q  18 gggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcatta 116  Q
    |||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  3712 gggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcatta 3613  T
Q  117 cttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttattta 213  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  3612 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttattta 3514  T
Q  214 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3513 actaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 343
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  | || ||||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  599 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 500  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   |||||||||| ||| ||  | ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  499 atgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgtta 400  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  399 ttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39729 - 39479
Alignment:
Q  7 gttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 106  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  39729 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 39630  T
Q  107 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgt 203  Q
    | | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||     
T  39629 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg- 39531  T
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39530 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 75083 - 75333
Alignment:
Q  7 gttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 106  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  75083 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 75182  T
Q  107 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgt 203  Q
    | | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||     
T  75183 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg- 75281  T
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 3015 - 3271
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  3015 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 3114  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  3115 atgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttg 3214  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3215 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39017 - 38761
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  39017 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 38918  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  38917 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg 38818  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  38817 ct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33151 - 32942
Alignment:
Q  50 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttga 148  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||||||     
T  33151 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 33052  T
Q  149 tgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 246  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  33051 taacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa 32953  T
Q  247 gatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||    
T  32952 gatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9744
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 339818 - 340065
Alignment:
Q  7 gttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 106  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  339818 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 339917  T
Q  107 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgttgttgt 203  Q
    | ||  |||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||     
T  339918 tatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg- 340015  T
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  340016 -tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158612
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  158599 gattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 71419 - 71353
Alignment:
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  71419 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21167 - 20910
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  21167 agagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataa 21068  T
Q  104 tgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttg 199  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||| ||  ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | || |   ||| |||||||||||    
T  21067 tgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttg 20968  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20967 ctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 17079 - 17337
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  17079 gagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatata 17178  T
Q  103 atgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-----gtatactgcctatg 196  Q
    ||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||     ||||||||||||||    
T  17179 atgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatg 17278  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17279 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79433
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  142 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat----tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 25930 - 26179
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    |||| |||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  25930 agagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 26029  T
Q  104 tgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | ||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  26030 tgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 26129  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 250  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26130 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  237 agatgttgaagatgatga 254  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 33360 - 33463
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  33360 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataa 33459  T
Q  104 tgtt 107  Q
    ||||    
T  33460 tgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 256
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  56 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 154  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  155 gaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
      ||||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  252 tgatg 256  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26152 - 25896
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26152 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 26053  T
Q  103 atgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26052 atgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttg 25953  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  25952 ctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40113 - 39858
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |  | || ||||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  40113 gagagttgaacc-ttgggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 40015  T
Q  103 atgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  40014 atgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttg 39915  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39914 ctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16721
Alignment:
Q  5 gagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataat 104  Q
    |||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  16466 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataat 16565  T
Q  105 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||| || ||||||||||||  |||  ||||| | | ||||| || ||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||     
T  16566 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgc 16665  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16666 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23139 - 22886
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  23139 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatata 23040  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||  | ||||    
T  23039 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgtt 22941  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22940 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  143 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttg----ctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  8634 gatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4508
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  4763 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 4664  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | || |||||||| | |||||    
T  4663 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 4564  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  4563 ctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12345 - 12090
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  12345 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 12246  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | || |||||||| | |||||    
T  12245 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 12146  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  12145 ctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22297 - 22042
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  22297 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 22198  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | || |||||||| | |||||    
T  22197 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 22098  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  22097 ctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6869 - 6669
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgtta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |  || ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6869 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgata 6770  T
Q  101 taatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatg 196  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  6769 taacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatg 6670  T
Q  197 t 197  Q
    |    
T  6669 t 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28536 - 28414
Alignment:
Q  137 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 233  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28536 ataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28438  T
Q  234 ctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  28437 ctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13141
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 142  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  13308 gttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 13209  T
Q  143 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgt 207  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13208 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27036 - 26911
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27036 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 26938  T
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattat 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26937 gttgatgaattgaa-ttgatataattat 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40169 - 39913
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  40169 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 40070  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  |   ||   |||||||||  |||  || ||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  40069 atgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttg 39970  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39969 ctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  142 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  239 atgttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 11377 - 11441
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctga 67  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11377 gagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctga 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 100446 - 100378
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  100446 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 253
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44570 - 44454
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt----gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44570 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 44473  T
Q  236 aagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  44472 aagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94411
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  94424 gattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 17491 - 17586
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8479
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||| |  |||| ||||| || ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||    
T  8732 gagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----ta 8637  T
Q  103 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||| |   ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| || ||   ||||||| ||||||||    
T  8636 atgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgtt 8537  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8536 gctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  82 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta 180  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||     
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  181 tt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||  ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  82 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta 180  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||     
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  181 tt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||  ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16322 - 16113
Alignment:
Q  50 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttga 148  Q
    |||||||||||||||||  | | | |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  ||||| | | ||||| ||     
T  16322 tataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgt 16224  T
Q  149 tgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 245  Q
    ||  ||| ||||||||| || || || |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16223 tggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16125  T
Q  246 agatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||    
T  16124 agatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17450
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8485
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8486  T
Q  238 g 238  Q
    |    
T  8485 g 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12971 - 12857
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  12971 gttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 12873  T
Q  144 gttgatgaattgaatt 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  12872 gttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11305
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  141 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  239 atgttgaagatgatgatgt 257  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 2855 - 2923
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2855 atactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16202
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2089 - 1975
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||   ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2089 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagat 1991  T
Q  144 gttgatgaattgaatt 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  1990 gttgatgaattgaatt 1975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1052
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttata 102  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| |  | |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1171 gagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 1072  T
Q  103 atg-tttatgcattacttga 121  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  1071 atgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 21712 - 21826
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  21712 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 21810  T
Q  144 gttgatgaattgaatt 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  21811 gttgatgaattgaatt 21826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 29604 - 29718
Alignment:
Q  44 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  29604 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 29702  T
Q  144 gttgatgaattgaatt 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  29703 gttgatgaattgaatt 29718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28086 - 27911
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataa 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  28086 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataa 27987  T
Q  104 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc 178  Q
    |||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27986 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  193 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 501134 - 501100
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501134 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 253
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 10590 - 10659
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  10590 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3738 - 3648
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 93  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3738 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 7802 - 7712
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 93  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7802 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 27798 - 27851
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27798 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10546
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10599 atactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaag 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  193 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136680
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  136693 gattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139149
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  139162 gattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144087
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  144100 gattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 134322 - 134211
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  134322 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgtt 134225  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  134224 gattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 141729 - 141618
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  141729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 141632  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  141631 gattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 129977 - 129924
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129977 atactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaag 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4545
Alignment:
Q  75 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 173  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||   |||||||||| ||||||  ||||||||| || || |    
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  174 catgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    | ||||  |||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  238 gatgttgaagatgatga 254  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  191 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 22719 - 22788
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22719 atactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82072
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  82085 gattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Original strand, 38751 - 38820
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  38751 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32555
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 51904 - 51987
Alignment:
Q  159 ttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |   || |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51904 ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53654
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 237  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  238 gatg 241  Q
    ||||    
T  53651 gatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13392
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  13405 gattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 257
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  190 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20747
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  20760 gattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37821
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  37834 gattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 3429 - 3571
Alignment:
Q  39 atgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgc 136  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||      
T  3429 atgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataa 3528  T
Q  137 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct 179  Q
     | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3529 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 3571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16834 - 16784
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16834 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11979
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 10419 - 10330
Alignment:
Q  4 agagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 93  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10419 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 10330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 20490 - 20527
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20490 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  241 gttgaagatgatgat 255  Q
    | | |||||| ||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 18084 - 18148
Alignment:
Q  193 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18084 tatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4347 - 4300
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4347 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4710
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9292 - 9241
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14058 - 13947
Alignment:
Q  144 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 240  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14058 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagtt 13961  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  13960 gattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 106
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  156 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29982 - 29948
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  139 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36195
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 242  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40450 - 40400
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40450 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161252
Alignment:
Q  208 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  138 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--cta--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 233  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||  ||   ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  234 ctaagatg 241  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4214
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 12361 - 12413
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12361 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12064
Alignment:
Q  210 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 241
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  212 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Original strand, 17851 - 17928
Alignment:
Q  3 gagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttg 80  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  17851 gagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20662 - 20597
Alignment:
Q  1 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctg 66  Q
    |||||||||||||| | |  ||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20662 tcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctg 20597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1717 times since January 2019
Visitors: 1304