View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0088_low_19 (Length: 310)

Name: NF0088_low_19
Description: NF0088
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0088_low_19
NF0088_low_19
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (1-226)||(21395876-21396101)
chr8 (1-226)||(21790369-21790594)
chr8 (4-226)||(21389349-21389571)
chr8 (26-226)||(21778697-21778897)
chr8 (13-226)||(16199551-16199765)
chr8 (13-226)||(31971257-31971471)
chr8 (13-226)||(45130903-45131117)
chr8 (23-226)||(21918915-21919121)
chr8 (13-226)||(20536208-20536424)
chr8 (21-226)||(18879150-18879352)
chr8 (13-225)||(28648949-28649164)
chr8 (13-226)||(22626736-22626951)
chr8 (13-226)||(18818314-18818530)
chr8 (38-226)||(16092272-16092463)
chr8 (13-226)||(7372778-7372986)
chr8 (13-226)||(21923833-21924049)
chr8 (13-226)||(22875065-22875281)
chr8 (13-229)||(6759255-6759472)
chr8 (154-226)||(5866323-5866395)
chr8 (113-226)||(17140916-17141031)
chr8 (154-226)||(21490995-21491067)
chr8 (13-226)||(23406379-23406597)
chr8 (110-226)||(6520368-6520486)
chr8 (154-226)||(38855300-38855372)
chr8 (154-226)||(23760893-23760962)
chr8 (109-210)||(20498578-20498681)
chr8 (113-223)||(14409495-14409606)
chr8 (13-225)||(23648554-23648769)
chr8 (154-207)||(983455-983508)
chr8 (154-226)||(21249384-21249457)
chr8 (154-226)||(21255222-21255295)
chr8 (109-207)||(21285616-21285716)
chr8 (154-222)||(26355747-26355815)
chr8 (113-223)||(1484402-1484513)
chr8 (113-223)||(5853343-5853454)
chr8 (113-207)||(16413367-16413462)
chr8 (113-223)||(20403227-20403338)
chr8 (113-223)||(22001753-22001864)
chr8 (155-210)||(24353036-24353091)
chr8 (155-210)||(37116363-37116418)
chr8 (153-210)||(19154935-19154992)
chr8 (130-219)||(13508108-13508199)
chr8 (154-226)||(17612159-17612231)
chr8 (15-90)||(25363047-25363123)
chr8 (155-210)||(17267044-17267099)
chr8 (113-223)||(20046246-20046357)
chr8 (113-223)||(41598188-41598299)
chr8 (126-223)||(15203295-15203393)
chr8 (109-207)||(26219733-26219831)
chr8 (109-223)||(26225295-26225409)
chr8 (113-223)||(4483281-4483391)
chr8 (164-223)||(4542477-4542535)
chr8 (155-210)||(17439557-17439612)
chr8 (164-223)||(19896265-19896323)
chr8 (157-219)||(13597669-13597731)
chr8 (126-207)||(15070574-15070656)
chr8 (127-210)||(19801447-19801530)
chr8 (126-207)||(45290759-45290841)
chr8 (158-207)||(21673723-21673772)
chr8 (173-229)||(19937118-19937174)
chr8 (1-35)||(17353831-17353865)
chr8 (107-224)||(18678102-18678221)
chr8 (157-211)||(20502154-20502207)
chr8 (173-223)||(25484380-25484430)
chr8 (107-224)||(32121734-32121853)
chr8 (155-211)||(22525573-22525628)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (21-226)||(16282-16487)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (21-226)||(1289-1494)
scaffold0106 (21-226)||(7266-7471)
scaffold0106 (157-223)||(15291-15356)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (21-226)||(20309108-20309313)
chr2 (13-226)||(38021-38235)
chr2 (8-226)||(23285865-23286082)
chr2 (1-226)||(23103290-23103516)
chr2 (13-226)||(22731139-22731355)
chr2 (8-223)||(298714-298933)
chr2 (8-226)||(23654286-23654507)
chr2 (13-226)||(22738085-22738300)
chr2 (13-226)||(23076442-23076658)
chr2 (13-226)||(23060513-23060728)
chr2 (13-226)||(22337115-22337331)
chr2 (13-226)||(23660023-23660238)
chr2 (1-222)||(40622102-40622327)
chr2 (113-223)||(22105412-22105524)
chr2 (154-226)||(23071998-23072070)
chr2 (154-222)||(7679589-7679657)
chr2 (150-226)||(8946657-8946732)
chr2 (154-221)||(28405981-28406048)
chr2 (153-210)||(23207293-23207350)
chr2 (109-210)||(7735-7838)
chr2 (154-226)||(19671830-19671902)
chr2 (162-226)||(23040247-23040310)
chr2 (154-222)||(25175854-25175922)
chr2 (113-223)||(571397-571508)
chr2 (113-223)||(18808943-18809054)
chr2 (154-225)||(22134256-22134326)
chr2 (113-223)||(23130862-23130973)
chr2 (113-223)||(23133329-23133440)
chr2 (113-223)||(23135590-23135701)
chr2 (113-223)||(23709583-23709694)
chr2 (113-223)||(23712064-23712175)
chr2 (113-223)||(26505379-26505490)
chr2 (113-223)||(26507857-26507968)
chr2 (113-223)||(34402573-34402684)
chr2 (113-223)||(39682313-39682424)
chr2 (126-223)||(6725995-6726093)
chr2 (77-207)||(23708589-23708721)
chr2 (113-225)||(32214972-32215085)
chr2 (155-210)||(20520243-20520298)
chr2 (113-207)||(24367790-24367885)
chr2 (154-207)||(18786952-18787005)
chr2 (128-220)||(21155126-21155219)
chr2 (153-210)||(22413186-22413243)
chr2 (113-223)||(24898246-24898358)
chr2 (113-223)||(24900729-24900841)
chr2 (113-223)||(24903206-24903318)
chr2 (113-223)||(24905683-24905795)
chr2 (113-223)||(24908158-24908270)
chr2 (157-209)||(32451981-32452033)
chr2 (155-210)||(23004764-23004819)
chr2 (155-210)||(25108903-25108958)
chr2 (113-223)||(32039549-32039660)
chr2 (173-223)||(28577099-28577149)
chr2 (173-223)||(38967374-38967424)
chr2 (173-223)||(45029966-45030016)
chr2 (164-221)||(43137301-43137357)
chr2 (155-211)||(23287378-23287433)
chr2 (128-223)||(24529595-24529691)
chr2 (164-220)||(24643054-24643109)
chr2 (155-210)||(23791289-23791344)
chr2 (156-211)||(26392397-26392451)
chr2 (155-210)||(24697657-24697712)
chr2 (107-207)||(25616204-25616306)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (13-226)||(17046487-17046700)
chr4 (13-226)||(14053207-14053422)
chr4 (8-226)||(12902757-12902978)
chr4 (8-226)||(7088877-7089098)
chr4 (13-224)||(22636437-22636650)
chr4 (13-226)||(44052829-44053045)
chr4 (8-219)||(23374259-23374473)
chr4 (13-223)||(16377428-16377639)
chr4 (21-226)||(16270149-16270356)
chr4 (45-226)||(7798774-7798958)
chr4 (13-226)||(16239875-16240090)
chr4 (14-221)||(14038653-14038863)
chr4 (154-226)||(15551817-15551889)
chr4 (107-226)||(52873367-52873488)
chr4 (1-140)||(15121697-15121834)
chr4 (13-226)||(7893703-7893916)
chr4 (150-226)||(3096293-3096368)
chr4 (107-226)||(6899891-6900011)
chr4 (109-210)||(13853-13956)
chr4 (154-222)||(12774011-12774079)
chr4 (154-226)||(39706337-39706409)
chr4 (110-207)||(12288211-12288312)
chr4 (109-223)||(54798756-54798872)
chr4 (154-207)||(52243245-52243298)
chr4 (109-223)||(14280316-14280431)
chr4 (113-223)||(18215325-18215436)
chr4 (109-223)||(44928926-44929042)
chr4 (154-222)||(8846360-8846428)
chr4 (113-223)||(12358-12469)
chr4 (113-223)||(15118403-15118514)
chr4 (157-224)||(22353835-22353901)
chr4 (113-223)||(23803316-23803427)
chr4 (113-223)||(44615288-44615399)
chr4 (113-223)||(44773138-44773249)
chr4 (113-223)||(51463919-51464030)
chr4 (113-223)||(52312510-52312621)
chr4 (161-207)||(43198611-43198657)
chr4 (113-229)||(19242693-19242810)
chr4 (113-225)||(19618223-19618336)
chr4 (153-210)||(46640504-46640561)
chr4 (157-209)||(6190479-6190531)
chr4 (113-223)||(1837560-1837671)
chr4 (13-100)||(3096772-3096859)
chr4 (113-223)||(3515007-3515118)
chr4 (113-223)||(18239470-18239581)
chr4 (113-223)||(50222390-50222501)
chr4 (155-210)||(53082202-53082257)
chr4 (126-207)||(15355389-15355471)
chr4 (109-207)||(8574871-8574969)
chr4 (126-226)||(15367690-15367791)
chr4 (126-226)||(15370018-15370119)
chr4 (126-226)||(15371202-15371303)
chr4 (126-226)||(15373483-15373584)
chr4 (126-226)||(15402703-15402804)
chr4 (164-223)||(7641286-7641344)
chr4 (164-223)||(12610950-12611008)
chr4 (25-90)||(17047989-17048055)
chr4 (108-173)||(43256161-43256227)
chr4 (173-223)||(44102214-44102264)
chr4 (173-226)||(16223532-16223585)
chr4 (113-207)||(14970758-14970853)
chr4 (175-210)||(21815699-21815734)
chr4 (154-188)||(16596686-16596720)
chr4 (155-211)||(17333292-17333347)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (21-226)||(27847746-27847951)
chr7 (13-224)||(40443393-40443605)
chr7 (13-226)||(12698831-12699048)
chr7 (13-226)||(9509189-9509405)
chr7 (8-226)||(16386147-16386369)
chr7 (13-226)||(10589039-10589254)
chr7 (8-226)||(26211995-26212217)
chr7 (14-223)||(18456319-18456530)
chr7 (1-222)||(17137957-17138177)
chr7 (13-226)||(38227481-38227696)
chr7 (13-223)||(3564269-3564482)
chr7 (113-226)||(13647325-13647440)
chr7 (1-222)||(12187019-12187239)
chr7 (154-226)||(16495402-16495474)
chr7 (154-226)||(28505347-28505419)
chr7 (154-226)||(34200786-34200858)
chr7 (154-226)||(67745-67817)
chr7 (109-223)||(48273392-48273508)
chr7 (154-226)||(11996076-11996148)
chr7 (107-226)||(16219717-16219835)
chr7 (109-207)||(2280121-2280221)
chr7 (154-222)||(811180-811248)
chr7 (154-222)||(18005650-18005718)
chr7 (154-222)||(44014182-44014250)
chr7 (154-226)||(47831807-47831879)
chr7 (107-223)||(16213684-16213801)
chr7 (113-223)||(17061966-17062077)
chr7 (154-226)||(15754936-15755008)
chr7 (113-223)||(456321-456432)
chr7 (113-223)||(11972496-11972607)
chr7 (113-223)||(14949173-14949284)
chr7 (113-223)||(15376764-15376875)
chr7 (113-223)||(16232520-16232631)
chr7 (113-223)||(16410059-16410170)
chr7 (113-223)||(18640272-18640383)
chr7 (113-223)||(20385174-20385285)
chr7 (113-223)||(21189646-21189757)
chr7 (113-207)||(24275187-24275282)
chr7 (113-223)||(32125491-32125602)
chr7 (113-223)||(41522917-41523028)
chr7 (113-223)||(41525379-41525490)
chr7 (113-222)||(11393338-11393448)
chr7 (109-226)||(18430709-18430827)
chr7 (109-226)||(22072913-22073033)
chr7 (113-223)||(24704688-24704796)
chr7 (109-207)||(16056347-16056446)
chr7 (113-223)||(24702238-24702349)
chr7 (113-223)||(27216860-27216971)
chr7 (113-223)||(44116509-44116620)
chr7 (126-223)||(13869346-13869444)
chr7 (150-207)||(12901342-12901399)
chr7 (155-207)||(14044765-14044817)
chr7 (155-207)||(14354795-14354847)
chr7 (164-223)||(3386333-3386391)
chr7 (130-226)||(10063841-10063939)
chr7 (155-210)||(20220238-20220293)
chr7 (153-207)||(1868043-1868097)
chr7 (154-204)||(12255842-12255892)
chr7 (173-223)||(20110556-20110606)
chr7 (153-210)||(15008547-15008604)
chr7 (153-210)||(48991196-48991253)
chr7 (163-207)||(15144096-15144139)
chr7 (154-226)||(19486793-19486865)
chr7 (155-198)||(14036282-14036325)
chr7 (155-198)||(14346312-14346355)
chr7 (148-207)||(18154885-18154943)
chr7 (108-173)||(2530139-2530205)
chr7 (173-223)||(13831373-13831423)
chr7 (109-207)||(38898423-38898523)
chr7 (157-211)||(9177718-9177772)
chr7 (173-222)||(19649557-19649606)
chr7 (173-225)||(2832509-2832561)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (21-226)||(51582-51787)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (21-226)||(965-1170)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (13-223)||(5036-5246)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (21-226)||(16920546-16920751)
chr6 (21-226)||(22831503-22831710)
chr6 (20-214)||(11185517-11185711)
chr6 (54-226)||(35245586-35245758)
chr6 (13-226)||(20360865-20361081)
chr6 (13-226)||(20638188-20638404)
chr6 (14-226)||(29060540-29060755)
chr6 (13-226)||(19303446-19303661)
chr6 (107-226)||(16496244-16496365)
chr6 (13-226)||(25629260-25629476)
chr6 (13-225)||(18409732-18409947)
chr6 (15-226)||(20593773-20593987)
chr6 (107-226)||(20076700-20076817)
chr6 (13-226)||(17287701-17287917)
chr6 (21-226)||(22780140-22780348)
chr6 (154-226)||(27333267-27333339)
chr6 (154-226)||(27394007-27394079)
chr6 (154-226)||(28496520-28496592)
chr6 (154-226)||(29808931-29809003)
chr6 (126-223)||(25656629-25656727)
chr6 (113-223)||(22782227-22782338)
chr6 (109-207)||(25644339-25644440)
chr6 (154-207)||(9098563-9098616)
chr6 (109-207)||(20109157-20109257)
chr6 (154-226)||(1561303-1561375)
chr6 (154-222)||(19652199-19652267)
chr6 (113-223)||(1595549-1595660)
chr6 (113-223)||(12742317-12742428)
chr6 (113-223)||(18334643-18334754)
chr6 (113-223)||(19005046-19005157)
chr6 (113-223)||(19858970-19859081)
chr6 (113-223)||(24422547-24422658)
chr6 (113-223)||(25754809-25754920)
chr6 (113-223)||(33861794-33861905)
chr6 (113-223)||(33864278-33864389)
chr6 (109-226)||(23019408-23019525)
chr6 (113-225)||(30676761-30676874)
chr6 (113-223)||(2291231-2291342)
chr6 (113-223)||(8055029-8055140)
chr6 (113-223)||(26924691-26924802)
chr6 (113-210)||(18456732-18456830)
chr6 (113-210)||(18461892-18461990)
chr6 (161-207)||(19668390-19668436)
chr6 (164-226)||(25714417-25714478)
chr6 (113-203)||(4185827-4185919)
chr6 (155-208)||(23076748-23076801)
chr6 (113-225)||(34963371-34963484)
chr6 (155-208)||(35008166-35008219)
chr6 (128-207)||(25688518-25688598)
chr6 (113-223)||(1540962-1541073)
chr6 (126-220)||(16448591-16448686)
chr6 (113-223)||(20556943-20557054)
chr6 (179-226)||(22080799-22080846)
chr6 (164-210)||(18821904-18821949)
chr6 (108-173)||(27415942-27416008)
chr6 (153-211)||(33443062-33443119)
chr6 (154-226)||(8227560-8227632)
chr6 (164-223)||(3852121-3852179)
chr6 (113-203)||(4186390-4186482)
chr6 (160-211)||(18199473-18199523)
chr6 (148-222)||(19873120-19873193)
chr6 (148-222)||(22432249-22432322)
chr6 (148-222)||(22438799-22438872)
chr6 (173-222)||(19862978-19863027)
chr6 (2-78)||(22438951-22439026)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (21-226)||(38801304-38801508)
chr1 (8-226)||(27250629-27250850)
chr1 (8-226)||(21026680-21026901)
chr1 (13-225)||(50210118-50210333)
chr1 (13-223)||(34509783-34509996)
chr1 (25-226)||(22532269-22532473)
chr1 (126-226)||(20847173-20847275)
chr1 (113-226)||(45574893-45575008)
chr1 (154-226)||(14295600-14295672)
chr1 (13-151)||(22354477-22354616)
chr1 (109-210)||(21896258-21896361)
chr1 (1-90)||(48603652-48603742)
chr1 (109-210)||(21861572-21861675)
chr1 (154-222)||(22921918-22921986)
chr1 (13-225)||(20135188-20135403)
chr1 (154-226)||(33681010-33681079)
chr1 (77-210)||(35261051-35261183)
chr1 (109-226)||(22237630-22237746)
chr1 (154-207)||(16758668-16758721)
chr1 (154-207)||(20918623-20918676)
chr1 (154-207)||(21754064-21754117)
chr1 (113-223)||(13988866-13988977)
chr1 (113-223)||(21923342-21923453)
chr1 (113-223)||(23593786-23593897)
chr1 (109-223)||(31612313-31612428)
chr1 (155-210)||(50614167-50614222)
chr1 (155-210)||(50621995-50622050)
chr1 (154-226)||(52928019-52928088)
chr1 (157-210)||(16368338-16368391)
chr1 (154-222)||(20248283-20248351)
chr1 (157-225)||(20454606-20454673)
chr1 (113-224)||(21840766-21840878)
chr1 (15-225)||(22468604-22468816)
chr1 (113-223)||(21475138-21475249)
chr1 (109-223)||(433012-433125)
chr1 (126-207)||(22123131-22123214)
chr1 (173-226)||(13212974-13213027)
chr1 (153-210)||(41050084-41050141)
chr1 (173-229)||(21342090-21342146)
chr1 (164-223)||(29298137-29298195)
chr1 (164-223)||(29776688-29776746)
chr1 (173-223)||(21346961-21347011)
chr1 (173-223)||(21707167-21707217)
chr1 (173-223)||(21711709-21711759)
chr1 (156-210)||(50686627-50686681)
chr1 (13-100)||(22356079-22356168)
chr1 (13-100)||(22357765-22357854)
chr1 (173-229)||(15860121-15860177)
chr1 (128-223)||(16275430-16275526)
chr1 (153-208)||(16093933-16093988)
chr1 (155-210)||(26064954-26065009)
chr1 (175-225)||(16361915-16361965)
chr1 (148-222)||(21714546-21714619)
chr1 (108-173)||(33797573-33797639)
chr1 (1-91)||(21714684-21714775)
chr1 (164-222)||(21161720-21161778)
chr1 (181-211)||(21533948-21533978)
chr1 (173-225)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (13-226)||(10331-10544)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (21-226)||(46995-47200)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (13-226)||(32067-32280)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (13-226)||(13497-13711)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (13-226)||(15370-15584)
scaffold0114 (1-222)||(7295-7515)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (21-226)||(4712-4919)
scaffold0358 (21-151)||(13-143)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (13-226)||(21292875-21293090)
chr5 (1-219)||(37723910-37724129)
chr5 (8-226)||(8286742-8286964)
chr5 (13-226)||(23390401-23390617)
chr5 (8-226)||(22075018-22075240)
chr5 (13-226)||(24493569-24493784)
chr5 (13-226)||(9077952-9078168)
chr5 (13-226)||(25421532-25421748)
chr5 (107-226)||(21729064-21729185)
chr5 (107-226)||(21808389-21808510)
chr5 (21-223)||(24529223-24529428)
chr5 (13-226)||(13025311-13025526)
chr5 (13-226)||(13095495-13095710)
chr5 (1-222)||(22032323-22032541)
chr5 (1-222)||(18769898-18770118)
chr5 (13-206)||(25431414-25431610)
chr5 (154-226)||(19660884-19660956)
chr5 (154-226)||(36314577-36314649)
chr5 (13-226)||(1096467-1096683)
chr5 (126-226)||(21997553-21997655)
chr5 (110-226)||(21329500-21329618)
chr5 (110-210)||(20026942-20027046)
chr5 (1-128)||(23572178-23572304)
chr5 (154-222)||(22959581-22959649)
chr5 (107-226)||(21502156-21502277)
chr5 (111-222)||(21565546-21565659)
chr5 (109-223)||(22412187-22412302)
chr5 (113-223)||(264819-264930)
chr5 (113-223)||(10732991-10733102)
chr5 (113-223)||(20909012-20909123)
chr5 (113-223)||(39363384-39363495)
chr5 (126-223)||(39245136-39245234)
chr5 (154-207)||(26012084-26012137)
chr5 (154-226)||(19668898-19668970)
chr5 (128-207)||(20902075-20902155)
chr5 (154-210)||(22144065-22144121)
chr5 (113-223)||(29329934-29330045)
chr5 (113-223)||(42245416-42245527)
chr5 (126-223)||(11581263-11581361)
chr5 (113-223)||(36154834-36154942)
chr5 (153-210)||(22178269-22178326)
chr5 (128-223)||(2154680-2154776)
chr5 (8-91)||(22107273-22107357)
chr5 (126-220)||(18319098-18319193)
chr5 (164-223)||(20918052-20918110)
chr5 (113-223)||(29345980-29346091)
chr5 (126-223)||(10775740-10775838)
chr5 (108-173)||(18356367-18356433)
chr5 (107-207)||(18418599-18418699)
chr5 (108-173)||(20910800-20910866)
chr5 (126-223)||(31061068-31061166)
chr5 (173-223)||(38619434-38619484)
chr5 (173-222)||(23064512-23064561)
chr5 (1-199)||(21873277-21873474)
chr5 (113-223)||(29348453-29348564)
chr5 (113-223)||(29350926-29351037)
chr5 (113-223)||(32027393-32027504)
chr5 (157-211)||(15796434-15796487)
chr5 (156-210)||(26740697-26740750)
chr5 (156-205)||(26732884-26732932)
chr5 (154-226)||(40725853-40725925)
chr5 (148-207)||(26704090-26704148)
chr5 (148-207)||(26973823-26973881)
chr5 (173-223)||(20806854-20806904)
chr5 (157-211)||(23469818-23469871)
chr5 (1-35)||(23501239-23501273)
chr5 (180-210)||(27989004-27989034)
chr5 (14-62)||(22412340-22412388)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-225)||(174767-174992)
scaffold0021 (156-226)||(121766-121835)
scaffold0021 (13-134)||(124679-124801)
scaffold0021 (150-210)||(136414-136474)
scaffold0021 (150-210)||(145122-145182)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (13-226)||(20698341-20698556)
chr3 (8-226)||(12399209-12399430)
chr3 (13-226)||(13442274-13442490)
chr3 (13-226)||(17487856-17488072)
chr3 (13-226)||(14972854-14973070)
chr3 (13-226)||(17499338-17499554)
chr3 (21-226)||(18438534-18438742)
chr3 (13-226)||(26686887-26687103)
chr3 (13-207)||(14576738-14576934)
chr3 (14-223)||(24153115-24153326)
chr3 (13-226)||(23083266-23083482)
chr3 (13-226)||(43840932-43841148)
chr3 (13-226)||(25476290-25476506)
chr3 (13-226)||(11424668-11424880)
chr3 (154-226)||(13210376-13210448)
chr3 (1-222)||(856140-856360)
chr3 (21-207)||(42386429-42386619)
chr3 (13-223)||(40213626-40213838)
chr3 (154-222)||(49668125-49668193)
chr3 (1-90)||(14179570-14179660)
chr3 (109-226)||(15470927-15471043)
chr3 (154-222)||(9512924-9512992)
chr3 (154-222)||(9520899-9520967)
chr3 (154-222)||(12174308-12174376)
chr3 (128-207)||(14572608-14572688)
chr3 (113-226)||(43550529-43550644)
chr3 (154-207)||(32307696-32307749)
chr3 (109-223)||(36166598-36166712)
chr3 (154-210)||(52523778-52523834)
chr3 (113-223)||(9707658-9707769)
chr3 (110-226)||(14234487-14234605)
chr3 (113-223)||(17672626-17672737)
chr3 (113-223)||(29172634-29172745)
chr3 (161-223)||(28194693-28194755)
chr3 (154-223)||(27165250-27165319)
chr3 (111-223)||(55500942-55501055)
chr3 (158-222)||(16097332-16097396)
chr3 (154-222)||(16103784-16103852)
chr3 (113-223)||(6469185-6469296)
chr3 (113-223)||(7781398-7781509)
chr3 (113-223)||(17463178-17463289)
chr3 (155-210)||(22110402-22110457)
chr3 (130-226)||(24340746-24340844)
chr3 (113-223)||(28848662-28848773)
chr3 (113-223)||(34159326-34159437)
chr3 (155-210)||(43925974-43926029)
chr3 (113-223)||(45606958-45607069)
chr3 (113-223)||(55476491-55476602)
chr3 (153-222)||(37251216-37251283)
chr3 (109-207)||(21618465-21618563)
chr3 (154-223)||(53301600-53301669)
chr3 (113-223)||(8899094-8899205)
chr3 (113-223)||(16454332-16454443)
chr3 (113-207)||(38961942-38962037)
chr3 (126-223)||(12119789-12119887)
chr3 (126-223)||(15412429-15412527)
chr3 (113-210)||(53070704-53070802)
chr3 (157-210)||(606378-606431)
chr3 (153-209)||(12377938-12377994)
chr3 (113-223)||(13151841-13151953)
chr3 (113-223)||(13154306-13154418)
chr3 (113-224)||(13544024-13544136)
chr3 (126-223)||(17737236-17737337)
chr3 (113-223)||(10247774-10247885)
chr3 (113-207)||(12567576-12567671)
chr3 (164-223)||(15977515-15977573)
chr3 (131-221)||(16282880-16282971)
chr3 (113-223)||(17446706-17446816)
chr3 (113-207)||(50242838-50242933)
chr3 (173-223)||(8499518-8499568)
chr3 (173-223)||(10556985-10557035)
chr3 (126-223)||(44494809-44494907)
chr3 (173-223)||(45577950-45578000)
chr3 (154-207)||(23274706-23274759)
chr3 (154-226)||(37642314-37642386)
chr3 (173-221)||(41123892-41123940)
chr3 (155-211)||(13919344-13919399)
chr3 (15-90)||(16796685-16796761)
chr3 (148-222)||(15878095-15878168)
chr3 (107-224)||(46822267-46822386)
chr3 (157-222)||(23077530-23077594)
chr3 (173-225)||(14665398-14665450)
chr3 (173-225)||(14668554-14668606)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (8-226)||(949-1169)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (21-226)||(4849-5057)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (13-226)||(13211-13427)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (8-226)||(167879-168099)
scaffold0011 (13-226)||(51913-52129)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (21-226)||(1952-2160)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (13-226)||(3470-3686)
scaffold0292 (13-226)||(343-558)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (13-226)||(1851-2067)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (13-226)||(6026-6245)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (13-226)||(3056-3271)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (13-207)||(24206-24405)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (13-226)||(38761-38976)
scaffold0145 (21-226)||(32942-33149)
scaffold0145 (128-228)||(9744-9845)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (13-224)||(39479-39692)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-224)||(75120-75333)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (25-225)||(3103-3306)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (13-225)||(17120-17337)
scaffold0056 (164-210)||(79388-79433)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (13-219)||(25970-26179)
scaffold0122 (109-223)||(44709-44825)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (3-210)||(26840-27046)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (13-226)||(8438-8650)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (8-226)||(20910-21132)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (13-223)||(339855-340065)
scaffold0003 (113-223)||(158501-158612)
scaffold0003 (108-173)||(71353-71419)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (13-226)||(16505-16721)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (13-226)||(25896-26111)
scaffold0026 (13-226)||(39858-40073)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (21-223)||(22886-23090)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-222)||(1881-2101)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (13-226)||(4508-4723)
scaffold0228 (13-226)||(12090-12305)
scaffold0228 (13-226)||(22042-22257)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (51-226)||(32901-33077)
scaffold0120 (51-226)||(45928-46104)
scaffold0120 (44-226)||(16113-16298)
scaffold0120 (164-226)||(17389-17450)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (106-226)||(28414-28536)
scaffold0046 (154-226)||(11292-11364)
scaffold0046 (154-226)||(1997-2069)
scaffold0046 (170-226)||(4552-4608)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (154-226)||(1118-1190)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (154-226)||(119875-119947)
scaffold0023 (109-222)||(100378-100493)
scaffold0023 (109-223)||(44454-44570)
scaffold0023 (155-222)||(40224-40291)
scaffold0023 (113-223)||(94411-94522)
scaffold0023 (154-222)||(101503-101571)
scaffold0023 (113-207)||(17491-17586)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-222)||(21700-21920)
scaffold0210 (1-222)||(29592-29812)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-128)||(12857-12983)
scaffold0029 (113-206)||(11305-11399)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (149-226)||(34123-34200)
scaffold0175 (8-176)||(13141-13313)
scaffold0175 (173-226)||(273-326)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (13-226)||(39913-40128)
scaffold0080 (109-210)||(19885-19990)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (109-210)||(1048-1151)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (111-226)||(11447-11564)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (13-226)||(8479-8691)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (109-207)||(8485-8585)
scaffold0621 (154-226)||(6535-6607)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (109-222)||(2808-2923)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (21-166)||(6669-6818)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (150-223)||(15664-15737)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (109-210)||(12584-12687)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (154-226)||(6611-6683)
scaffold0333 (154-226)||(13991-14063)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (154-226)||(6172-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (154-222)||(19268-19336)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (154-226)||(15826-15898)
scaffold0020 (173-207)||(178913-178947)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (109-226)||(10543-10659)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (154-226)||(23932-24001)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (110-226)||(12942-13057)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (154-210)||(6828-6884)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (154-226)||(1083-1155)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (109-210)||(13144-13247)
scaffold0357 (155-210)||(2677-2732)
scaffold0357 (154-207)||(16149-16202)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (154-222)||(2694-2762)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (154-222)||(160688-160756)
scaffold0001 (126-223)||(85644-85742)
scaffold0001 (113-207)||(501100-501195)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (155-222)||(14747-14814)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (109-226)||(22672-22788)
scaffold0037 (113-223)||(82072-82183)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (154-207)||(1101-1154)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (154-207)||(5662-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (150-207)||(8119-8176)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (109-223)||(38704-38820)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (109-223)||(116430-116544)
scaffold0022 (155-210)||(129021-129075)
scaffold0022 (157-210)||(78338-78391)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (109-207)||(129924-130024)
scaffold0010 (150-210)||(60761-60821)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (154-222)||(45841-45909)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (109-210)||(53551-53654)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (162-222)||(132662-132722)
scaffold0028 (113-223)||(136680-136791)
scaffold0028 (113-223)||(139149-139260)
scaffold0028 (113-223)||(144087-144198)
scaffold0028 (154-207)||(62217-62270)
scaffold0028 (113-223)||(134211-134322)
scaffold0028 (113-223)||(141618-141729)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (110-226)||(12766-12884)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (113-223)||(13392-13503)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (113-223)||(20747-20858)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (113-223)||(37821-37932)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (153-207)||(25125-25179)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (157-210)||(566-619)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (153-210)||(6332-6389)
scaffold0420 (160-210)||(13793-13843)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (109-207)||(10546-10646)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (154-207)||(32555-32608)
scaffold0034 (157-209)||(51936-51987)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (154-222)||(133-201)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (154-226)||(11464-11536)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (113-224)||(10772-10884)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (162-222)||(32102-32162)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (154-226)||(38305-38377)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (113-210)||(20430-20527)
scaffold0031 (107-226)||(128751-128871)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (113-207)||(4710-4805)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (159-226)||(4888-4954)
scaffold0395 (26-166)||(881-1021)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (130-226)||(18050-18148)
scaffold0247 (173-207)||(2241-2275)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (113-223)||(13947-14058)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (113-223)||(16784-16895)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (13-147)||(27911-28046)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (44-205)||(4545-4709)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (153-203)||(38339-38389)
scaffold0139 (173-222)||(19980-20029)
scaffold0139 (1-91)||(20117-20208)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (107-210)||(8059-8166)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (154-222)||(28818-28887)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (109-207)||(27751-27851)
scaffold0165 (15-62)||(3648-3695)
scaffold0165 (15-62)||(7712-7759)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (153-210)||(2691-2748)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (15-90)||(1052-1128)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (13-151)||(3434-3574)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (128-207)||(29948-30028)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (113-223)||(40400-40511)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (155-210)||(97021-97076)
scaffold0006 (155-210)||(106299-106354)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (126-223)||(4214-4312)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (164-210)||(11979-12024)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (108-173)||(15417-15483)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (128-220)||(4300-4393)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (113-225)||(12300-12413)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (153-210)||(267676-267733)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (164-224)||(9241-9300)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (109-223)||(161136-161252)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (164-223)||(106-164)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (148-222)||(23843-23916)
scaffold0198 (1-76)||(23995-24069)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (153-207)||(103679-103733)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (113-223)||(12064-12169)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (173-222)||(36454-36503)
scaffold0131 (1-91)||(36592-36683)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (173-220)||(1393-1440)
scaffold0101 (1-35)||(8851-8885)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (155-205)||(206575-206624)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (148-222)||(69794-69867)
scaffold0004 (1-91)||(69930-70021)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (181-210)||(1874-1903)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (157-222)||(10575-10639)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-88)||(16243-16330)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21395876 - 21396101
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395876 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 21395975  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395976 tatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 21396075  T
Q  201 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21396076 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21790369 - 21790594
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790369 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 21790468  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790469 tatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 21790568  T
Q  201 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21790569 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 21389349 - 21389571
Alignment:
Q  4 atataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtat 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389349 atatatgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtat 21389448  T
Q  104 gcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389449 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21389549 taagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  26 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  226 t 226  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 16199551 - 16199765
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16199551 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 16199650  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199651 gtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 16199750  T
Q  212 tgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||    
T  16199751 tgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31971471 - 31971257
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31971471 gttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 31971372  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31971371 gttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  31971272 ttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 45130903 - 45131117
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  45130903 gttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 45131002  T
Q  113 gttgatgaa-ttgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131003 gttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 45131101  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  45131102 ttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919121
Alignment:
Q  23 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg-tttgtatgcataagatgttgatgaa 121  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  122 ttgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 218  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  219 gatgatgt 226  Q
    ||||||||    
T  21919114 gatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20536424 - 20536208
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  20536424 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20536325  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20536324 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20536226  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  20536225 tgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 18879150 - 18879352
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  18879150 taatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 18879248  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 219  Q
    ||||| | ||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18879249 aattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T
Q  220 atgatgt 226  Q
    |||||||    
T  18879346 atgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 28648949 - 28649164
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  |||||   |||||    
T  28648949 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaaga 28649048  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28649049 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 28649147  T
Q  209 tgttgaagatgatgatg 225  Q
    || ||||||||||||||    
T  28649148 tgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626736
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22626753  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  22626752 gatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 18818314 - 18818530
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  18818314 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 18818413  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18818414 tgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18818512  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  18818513 tgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 16092272 - 16092463
Alignment:
Q  38 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 136  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  16092272 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatta 16092371  T
Q  137 ttatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16092372 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    | || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 21923833 - 21924049
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  21923833 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 21923932  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| || |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21923933 tgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21924031  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  21924032 tgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  111 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6759472 - 6759255
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||  |||  |||||   | ||    
T  6759472 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgag 6759373  T
Q  111 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759372 atgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6759277  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgtcca 229  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  6759276 ttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140916
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  112 tgtt--gatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    || |  | ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  110 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgt 226  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409606
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  14409593 gattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23648769 - 23648554
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||   |||||    
T  23648769 gttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaga 23648670  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| || |||| |  |||||| |||||||||   || |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  23648669 tgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23648571  T
Q  209 tgttgaagatgatgatg 225  Q
    || | |||||| |||||    
T  23648570 tgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21249457 - 21249384
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249457 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21255295 - 21255222
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255295 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484402
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  1484415 gattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853454
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  5853441 gattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413462
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403227
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  20403240 gattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001753
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  22001766 gattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 219
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  130 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 219  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 25363047 - 25363123
Alignment:
Q  15 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 90  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363047 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046357
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  20046344 gattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41598299 - 41598188
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598299 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  41598201 gattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Original strand, 15203295 - 15203393
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  15203295 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 26225295 - 26225409
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225295 agatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26225392  T
Q  207 gatgttgaagatgatga 223  Q
    | || | ||||||||||    
T  26225393 gttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4483391 - 4483281
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4483295  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  4483294 gattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 219  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15070656 - 15070574
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070656 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Original strand, 19801447 - 19801530
Alignment:
Q  127 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801447 tttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 45290759 - 45290841
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290759 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  158 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 17353831 - 17353865
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17353831 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 17353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgat 224  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgat 224  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16282
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16487 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 16288  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  16287 tgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1289
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1494 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 1395  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1394 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1295  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  1294 tgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7266
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7471 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 7372  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371 attgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 7272  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  7271 tgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20309313 - 20309108
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20309313 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 20309114  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  20309113 tgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 38021 - 38235
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38021 gttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 38120  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38121 gatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  38220 ttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23286082 - 23285865
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||       
T  23286082 aagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatt 23285983  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285982 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23285885  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23285884 gttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 23103290 - 23103516
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtt 98  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||  | ||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||  |||      
T  23103290 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttggatttgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaa 23103388  T
Q  99 tgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 197  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgag 23103487  T
Q  198 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103488 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 22731139 - 22731355
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||| |    
T  22731139 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaata 22731238  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22731239 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaact 22731337  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  22731338 tgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 298714 - 298933
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  298714 aagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 298813  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298814 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298913  T
Q  204 taagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  298914 taagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 23654286 - 23654507
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||       
T  23654286 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatt 23654385  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654386 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23654485 taagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 22738085 - 22738300
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  22738085 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22738184  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22738185 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22738282  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || | |||||||||||||    
T  22738283 tgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    | ||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
     | |||||||||||||||    
T  23076459 ggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23060728 - 23060513
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  ||   |||||    
T  23060728 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 23060630  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060629 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23060531  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  23060530 tgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22337331 - 22337115
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  22337331 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22337232  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22337231 tgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22337133  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  22337132 tgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23660238 - 23660023
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| ||| ||   |||||    
T  23660238 gttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaaga 23660139  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  23660138 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagtt 23660040  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  23660039 gatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 40622102 - 40622327
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtt-- 98  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  40622102 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttg 40622200  T
Q  99 ---tgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 193  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40622201 tactgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgca 40622298  T
Q  194 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  40622299 tgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105412
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  22105425 gattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  162 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571397
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  571410 gattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808943
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  18808956 gattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130862
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  23130875 gattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133329
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  23133342 gattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135590
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  23135603 gattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709694
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  23709681 gattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712175
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  23712162 gattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505379
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  26505392 gattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507857
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  26507870 gattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402684
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  34402671 gattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682313
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  39682326 gattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6726093 - 6725995
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  6726093 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Original strand, 23708589 - 23708721
Alignment:
Q  77 tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgttt 174  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||  | |||||| ||||| ||| | |||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||| | |    
T  23708589 tatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatct 23708688  T
Q  175 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708689 gttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215085
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  210 gttgaagatgatgatg 225  Q
    | | |||||| |||||    
T  32215070 gattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24367885 - 24367790
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367885 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 21155126 - 21155219
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155126 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 24898246 - 24898358
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24898246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24898343  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  24898344 tgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 24900729 - 24900841
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24900729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24900826  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  24900827 tgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 24903206 - 24903318
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24903206 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24903303  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  24903304 tgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 24905683 - 24905795
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24905683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24905780  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  24905781 tgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 24908158 - 24908270
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24908158 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24908255  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  24908256 tgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 32039549 - 32039660
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32039549 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagtt 32039646  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  32039647 gattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030016
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137301
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  156 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616204
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  204 taag 207  Q
    ||||    
T  25616207 taag 25616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046487
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 17046601  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046600 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 17046501  T
Q  213 gaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||    
T  17046500 gaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 14053207 - 14053422
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag-a 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14053207 gttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaa 14053306  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14053307 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatg 14053406  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  14053407 ttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12902978 - 12902757
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  12902978 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 12902879  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902878 taagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12902779 taagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7089098 - 7088877
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  7089098 aagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatg 7088999  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088998 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  7088899 taagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22636650 - 22636437
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  22636650 gttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22636552  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22636551 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22636453  T
Q  209 tgttgaagatgatgat 224  Q
    || |||||||||||||    
T  22636452 tgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44053045 - 44052829
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  44053045 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 44052946  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  44052945 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagt 44052847  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  44052846 tgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 23374259 - 23374473
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  23374259 aagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 23374358  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23374359 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttc 23374457  T
Q  204 taagatgttgaagatg 219  Q
    |||| |||||||||||    
T  23374458 taagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 16377428 - 16377639
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  16377428 gttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 16377527  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377528 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  211 ttgaagatgatga 223  Q
     ||||||| ||||    
T  16377627 atgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270356
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 217  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  218 tgatgatgt 226  Q
    |||||||||    
T  16270348 tgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  45 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 143  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  144 atgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 16239875 - 16240090
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||| ||   |||||    
T  16239875 gttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaaga 16239974  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  16239975 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagtt 16240073  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  16240074 gatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038653
Alignment:
Q  14 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  210 gttgaagatgat 221  Q
    | ||||||||||    
T  14038664 gatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 15121697 - 15121834
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  15121697 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaggctga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 15121795  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 140  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15121796 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7893916 - 7893703
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  |||||| | | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  7893916 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 7893820  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7893819 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagt 7893721  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  7893720 tgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6900011 - 6899891
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6900011 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtct 6899913  T
Q  205 aagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  6899912 aagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13956
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  13953 gatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 207
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288312
Alignment:
Q  110 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  12288311 ag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  206 agatgttgaagatgatga 223  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  206 agatgttgaagatgatga 223  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215436
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  18215423 gattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 44928926 - 44929042
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928926 agatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T
Q  206 agatgttgaagatgatga 223  Q
    || || | ||||||||||    
T  44929025 agttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12469
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  12456 gattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118514
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  15118501 gattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353835
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615288
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  44615301 gattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773249
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  44773236 gattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464030
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  51464017 gattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312510
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  52312523 gattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  161 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19242810 - 19242693
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19242810 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19242713  T
Q  210 gttgaagatgatgatgtcca 229  Q
    | | |||||||||| |||||    
T  19242712 gattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618336
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  210 gttgaagatgatgatg 225  Q
    | | |||||| |||||    
T  19618321 gattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 1837560 - 1837671
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1837560 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1837657  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  1837658 gattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3096859 - 3096772
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096859 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515007
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  3515020 gattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18239470 - 18239581
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239470 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18239567  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  18239568 gattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 50222390 - 50222501
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222390 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50222487  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  50222488 gattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 15355389 - 15355471
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355389 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15367791 - 15367690
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15367791 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15367694  T
Q  223 atgt 226  Q
    ||||    
T  15367693 atgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15370119 - 15370018
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15370119 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15370022  T
Q  223 atgt 226  Q
    ||||    
T  15370021 atgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15371303 - 15371202
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15371303 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15371206  T
Q  223 atgt 226  Q
    ||||    
T  15371205 atgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15373584 - 15373483
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15373584 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15373487  T
Q  223 atgt 226  Q
    ||||    
T  15373486 atgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15402804 - 15402703
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15402804 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15402707  T
Q  223 atgt 226  Q
    ||||    
T  15402706 atgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  25 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 90  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Original strand, 14970758 - 14970853
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970758 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  175 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16596720 - 16596686
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596720 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 27847746 - 27847951
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27847746 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatga 27847945  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  27847946 tgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40443605 - 40443393
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40443605 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 40443506  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40443505 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgt 40443406  T
Q  212 tgaagatgatgat 224  Q
    |||||||||||||    
T  40443405 tgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698831
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt----tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12698850  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgt 226  Q
     || |||||||||||||||    
T  12698849 ttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9509405 - 9509189
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  9509405 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 9509306  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9509305 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9509207  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  9509206 tgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 16386147 - 16386369
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||       
T  16386147 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatt 16386246  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386247 taagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16386346  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16386347 taagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10589254 - 10589039
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |     |||||    
T  10589254 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagat 10589155  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 10589056  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    || ||||||||||||||    
T  10589055 gtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26212217 - 26211995
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T
Q  204 taagatgttgaag-atgatgatgt 226  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  26212018 taagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  14 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  211 ttgaagatgatga 223  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17137957 - 17138177
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  17137957 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 17138055  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  17138056 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagt 17138153  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  17138154 cgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38227696 - 38227481
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||    
T  38227696 gttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaaga 38227597  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38227596 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagta 38227498  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  38227497 gatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 3564269 - 3564482
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  3564269 gttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 3564368  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3564369 tgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 3564467  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || ||||||||||||    
T  3564468 tgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647325
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 13647342  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13647341 gttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12187239 - 12187019
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  12187239 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 12187141  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct----gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 196  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |     |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  12187140 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatga 12187045  T
Q  197 gtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||    
T  12187044 gtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  206 agatgttgaagatgatga 223  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  205 aagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16213801 - 16213684
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213801 taagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16213704  T
Q  204 taagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  16213703 taagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062077
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  211 ttgaagatgatga 223  Q
     | ||||||||||    
T  17062065 attaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456321
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  456334 gattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972496
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  11972509 gattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949284
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  14949271 gattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376875
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  15376862 gattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232520
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  16232533 gattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410059
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  16410072 gattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640272
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  18640285 gattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385285
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  20385272 gattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189757
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  21189744 gattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275187
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125491
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  32125504 gattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522917
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  41522930 gattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525379
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  41525392 gattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393448
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T
Q  210 gttgaagatgatg 222  Q
    | | |||||||||    
T  11393436 gattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18430827 - 18430709
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430827 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18430730  T
Q  206 agatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || || | |||||||||||||    
T  18430729 agttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  206 agatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || || | |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704688
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  213 gaagatgatga 223  Q
     ||||||||||    
T  24704698 taagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24702349 - 24702238
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24702349 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24702252  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  24702251 gattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27216971 - 27216860
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27216971 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 27216874  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  27216873 gattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13869444 - 13869346
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  13869444 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  130 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 207
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 207
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  163 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486865
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Original strand, 18154885 - 18154943
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154885 tgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831373
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Original strand, 38898423 - 38898523
Alignment:
Q  109 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38898423 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttt 38898520  T
Q  205 aag 207  Q
    |||    
T  38898521 aag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51582
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  51787 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatga 51588  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  51587 tgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 965 - 1170
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  965 taatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1164  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  1165 tgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5246
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 5135  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 5235  T
Q  213 gaagatgatga 223  Q
    |||||||||||    
T  5236 gaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 16920546 - 16920751
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16920546 taatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 16920645  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16920646 atggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatga 16920745  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  16920746 tgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22831710 - 22831503
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat--aagatgttgat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22831710 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 22831611  T
Q  119 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22831610 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 22831511  T
Q  219 gatgatgt 226  Q
    ||||||||    
T  22831510 gatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11185711 - 11185517
Alignment:
Q  20 gtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  11185711 gtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  54 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt 153  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 20360865 - 20361081
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  20360865 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20360964  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20360965 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagt 20361063  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||| ||||||||||    
T  20361064 tgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 20638188 - 20638404
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||    
T  20638188 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaaga 20638287  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20638288 tgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 20638386  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  20638387 tgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060540
Alignment:
Q  14 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||| | | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303661
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgaga 19303545  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303546 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 19303644  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  19303645 gatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16496365 - 16496244
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496365 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16496267  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16496266 taagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629476
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25629458  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  25629459 tgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 18409732 - 18409947
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||  || |||  | |||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgaga 18409831  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18409832 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagt 18409930  T
Q  209 tgttgaagatgatgatg 225  Q
    || ||||||||||||||    
T  18409931 tgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20593987 - 20593773
Alignment:
Q  15 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||| ||||||   | |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  114 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttg 20593789  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
     |||||||||||||||    
T  20593788 atgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076700
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  205 aagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287917
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17287899  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || | |||||||||||||    
T  17287900 tgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780348
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 216  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  217 atgatgatgt 226  Q
    ||||||||||    
T  22780339 atgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656629
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22782338 - 22782227
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22782241  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  22782240 gattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20109257 - 20109157
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| | ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20109257 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20109158  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  20109157 g 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742317
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  12742330 gattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334754
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  18334741 gattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005046
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  19005059 gattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859081
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  19859068 gattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422547
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  24422560 gattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754809
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  25754822 gattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861794
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  33861807 gattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864278
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  33864291 gattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676874
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  210 gttgaagatgatgatg 225  Q
    | | |||||| |||||    
T  30676859 gattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 2291231 - 2291342
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2291231 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2291328  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  2291329 gattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8055140 - 8055029
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055140 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8055043  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  8055042 gattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 26924691 - 26924802
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26924691 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26924788  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  26924789 gattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18456830 - 18456732
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456830 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18461990 - 18461892
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461990 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18461893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  161 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34963484 - 34963371
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34963484 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 34963387  T
Q  210 gttgaagatgatgatg 225  Q
    | | |||||| |||||    
T  34963386 gattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 1540962 - 1541073
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1540962 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 1541059  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  1541060 gattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 220
Target Start/End: Original strand, 16448591 - 16448686
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448591 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557054
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 20557040  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  20557041 gattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  179 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 27415942 - 27416008
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27415942 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 8227560 - 8227632
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227560 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 211
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  160 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19873193 - 19873120
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873193 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22432322 - 22432249
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432322 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22438872 - 22438799
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438872 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22439026 - 22438951
Alignment:
Q  2 ctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 78  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  22439026 ctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagttta 22438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 38801304 - 38801508
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||    
T  38801304 taatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatga 38801502  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  38801503 tgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 27250629 - 27250850
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  27250629 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 27250728  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250729 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27250828 taagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21026901 - 21026680
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  21026901 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 21026802  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026801 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  21026702 taagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 50210118 - 50210333
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||    
T  50210118 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 50210217  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50210218 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 50210316  T
Q  209 tgttgaagatgatgatg 225  Q
    || ||||||||||||||    
T  50210317 tgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34509996 - 34509783
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   |||||    
T  34509996 gttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 34509897  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509896 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 34509798  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || ||||||||||||    
T  34509797 tgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  25 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 123  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  || ||   |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  124 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    | | | ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  22532274 tgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  223 atgt 226  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45575008
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 45574991  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||| ||||||||||    
T  45574992 gttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Original strand, 22354477 - 22354616
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  22354477 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22354576  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22354577 tgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 48603742 - 48603652
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603742 cctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135188
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| || | |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||||||| |  |||||| ||||||||   ||| |||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 20135205  T
Q  209 tgttgaagatgatgatg 225  Q
    || | |||||| |||||    
T  20135204 tgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Original strand, 35261051 - 35261183
Alignment:
Q  77 tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgttt 174  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||||||||||   ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  35261051 tatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgttt 35261147  T
Q  175 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261148 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918623
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754064
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988866
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  13988879 gattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923453
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  21923440 gattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593897
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  23593884 gattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31612428 - 31612313
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612428 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T
Q  206 agatgttgaagatgatga 223  Q
    || || | ||||||||||    
T  31612330 agttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 225
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  210 gttgaagatgatgat 224  Q
    | | |||||| ||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  15 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| ||   |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  114 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||   |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  211 ttgaagatgatgatg 225  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 21475138 - 21475249
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21475138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 21475235  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  21475236 gattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433012
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  206 agatgttgaagatgatga 223  Q
    || || | ||||||||||    
T  433029 agttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123214
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776688
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  156 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 22356079 - 22356168
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22356079 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22356168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 22357765 - 22357854
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22357765 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22357854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275526
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 208
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  175 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21714619 - 21714546
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714619 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33797639 - 33797573
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  33797639 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21714775 - 21714684
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 91  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21714775 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 21714684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 211
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  181 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10544
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagat 10430  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 212  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10431 gttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgtt 10530  T
Q  213 gaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||    
T  10531 gaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 46995
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatga 47001  T
Q  221 tgatgt 226  Q
    ||||||    
T  47000 tgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32280 - 32067
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  32280 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 32181  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32180 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 32082  T
Q  212 tgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||    
T  32081 tgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13711 - 13497
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13711 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 13612  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13611 gttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||| |||||||||    
T  13512 ttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15584
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagat 15469  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15470 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T
Q  211 ttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  15569 ttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7515 - 7295
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| || || |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  7515 cctatataagaagttaactgcaatctatgaaactga-tatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 7417  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  7416 tatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagt 7319  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  7318 cgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4712
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 4820  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 217  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4819 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T
Q  218 tgatgatgt 226  Q
    |||||||||    
T  4720 tgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 13
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 120  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 44  T
Q  121 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  43 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 21292875 - 21293090
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  21292875 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 21292974  T
Q  113 gttgatgaa-ttgaat-ttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21292975 gttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 21293073  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  21293074 gttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37724129 - 37723910
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtt 98  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |  || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||      
T  37724129 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaa 37724031  T
Q  99 tgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    || |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37724030 tgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagt 37723931  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatg 219  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  37723930 cagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 8286742 - 8286964
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |       
T  8286742 aagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatt 8286841  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 202  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286842 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8286940  T
Q  203 ctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  8286941 ctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 23390401 - 23390617
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  23390401 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 23390500  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23390501 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23390599  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  23390600 tgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22075240 - 22075018
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T
Q  204 taagatgttgaag-atgatgatgt 226  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  22075041 taagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24493784 - 24493569
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  24493784 gttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaaga 24493685  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24493684 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 24493586  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  24493585 gatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9078168 - 9077952
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   | |||    
T  9078168 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgaga 9078069  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  9078068 tgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagt 9077970  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  9077969 tgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25421748 - 25421532
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  25421748 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 25421649  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25421648 tgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25421550  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  25421549 tgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 21729064 - 21729185
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729064 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21729162  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21729163 taagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 21808389 - 21808510
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808389 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21808487  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21808488 taagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24529428 - 24529223
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   |||||||||| ||    
T  24529428 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 24529329  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 216  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24529328 acttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 24529230  T
Q  217 atgatga 223  Q
    |||||||    
T  24529229 atgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13025526 - 13025311
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||    
T  13025526 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13025427  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13025426 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13025328  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  13025327 gatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13095710 - 13095495
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||    
T  13095710 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13095611  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13095610 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13095512  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  13095511 gatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22032541 - 22032323
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  22032541 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 22032443  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct--gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22032442 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagt 22032347  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  22032346 cgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18769898 - 18770118
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  18769898 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 18769996  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| |||||||||    
T  18769997 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagt 18770094  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  18770095 cgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25431610 - 25431414
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |    |||||    
T  25431610 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaaga 25431511  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431510 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |   ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  223 atgt 226  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  110 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgt 226  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  110 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  206 agatg 210  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23572304 - 23572178
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  23572304 cctatataagaagttaactgcaatttgtgaagttga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 23572206  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatt 128  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23572205 tatacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 21502156 - 21502277
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21502156 taagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 21502255  T
Q  205 aagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||| || | |||||||||||||    
T  21502256 aagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  111 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  209 tgttgaagatgatg 222  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  207 gatgttgaagatgatga 223  Q
    | || | ||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264930
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  264917 gattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733102
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  10733089 gattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20909123 - 20909012
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909123 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20909026  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  20909025 gattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363384
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  39363397 gattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39245234 - 39245136
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  39245234 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012137
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29330045 - 29329934
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29330045 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29329948  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  29329947 gattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 42245416 - 42245527
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  42245416 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 42245513  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  42245514 gattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Original strand, 11581263 - 11581361
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11581263 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 36154834 - 36154942
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36154834 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 36154928  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  36154929 gattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 22107273 - 22107357
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 91  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107273 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 220
Target Start/End: Original strand, 18319098 - 18319193
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319098 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29346091 - 29345980
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29346091 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29345994  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  29345993 gattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Original strand, 10775740 - 10775838
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  10775740 atttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18356433 - 18356367
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18356433 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418599
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  205 aag 207  Q
    |||    
T  18418601 aag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 20910800 - 20910866
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  20910800 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31061166 - 31061068
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  31061166 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21873474 - 21873277
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaaga-atgtt 98  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||  |    
T  21873474 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattat 21873377  T
Q  99 tgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 195  Q
    || |||  |||||||||||   | |||  ||||||| || | |||||||||   |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21873376 tgaatggttaagatgttga---aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatg 21873281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29348564 - 29348453
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29348564 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29348467  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  29348466 gattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29351037 - 29350926
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29351037 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29350940  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  29350939 gattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32027504 - 32027393
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  32027504 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagtt 32027407  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  32027406 gattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  156 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 205
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  156 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40725925 - 40725853
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725925 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26704148 - 26704090
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704148 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26973881 - 26973823
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973881 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 23501239 - 23501273
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 35  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23501239 cctatataagaagttaattgcaatctgtgaagctg 23501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 210
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  180 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412340
Alignment:
Q  14 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 62  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 22412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 174992 - 174767
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtt 98  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||      
T  174992 cctatataagaagttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaa 174894  T
Q  99 tgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    || |||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174893 tgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 174794  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  174793 cggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  156 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 124801 - 124679
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |    
T  124801 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaa 124702  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatat 134  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  124701 cgttgatgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 20698341 - 20698556
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  20698341 gttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagat 20698440  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20698441 gttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20698539  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  20698540 gatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12399430 - 12399209
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||| ||       
T  12399430 aagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatt 12399331  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399330 taagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12399232  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12399231 taagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13442490 - 13442274
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  13442490 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13442391  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13442390 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13442292  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  13442291 tgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17488072 - 17487856
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  17488072 gttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17487973  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17487972 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17487874  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  17487873 tgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14973070 - 14972854
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||  || |||    
T  14973070 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgaga 14972971  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14972970 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14972872  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  14972871 tgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17499554 - 17499338
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  17499554 gttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17499455  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17499454 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17499356  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  17499355 tgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18438742 - 18438534
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||  | ||||||||| ||    
T  18438742 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttg 18438643  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 216  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T
Q  217 atgatgatgt 226  Q
    ||||||||||    
T  18438543 atgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 14576738 - 14576934
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  14576738 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 14576837  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576838 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  14 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| ||   ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  211 ttgaagatgatga 223  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 23083266 - 23083482
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| |   ||| ||   |||||    
T  23083266 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaaga 23083365  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23083366 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23083464  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  23083465 tgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840932
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 43840950  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43840949 tgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476506
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 25476389  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25476390 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagt 25476488  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  25476489 tgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424880
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  || ||   | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||||||   |||   |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 11424863  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  11424864 gatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 856360 - 856140
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |  |||    
T  856360 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctta-tatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattg 856262  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  856261 tatacataagatgttgttgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagt 856164  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  856163 cgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42386619 - 42386429
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 118  Q
    |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  || ||   | |||||||| |    
T  42386619 taatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgtt 42386520  T
Q  119 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386519 gacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 40213626 - 40213838
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |  |||  |||||   | |||    
T  40213626 gttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgaga 40213725  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  40213726 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 40213823  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  40213824 tgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14179660 - 14179570
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14179660 cctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572608
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550644
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 43550627  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43550628 gttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  207 gatgttgaagatgatga 223  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707769
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  9707756 gattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  110 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgt 226  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172745
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  29172732 gattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  161 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  111 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  208 atgttgaagatgatga 223  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  158 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469296
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  6469283 gattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 7781398 - 7781509
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781398 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7781495  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  7781496 gattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463178
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  17463191 gattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  130 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848773
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  28848760 gattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159326
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  34159339 gattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607069
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  45607056 gattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476491
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  55476504 gattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8899205 - 8899094
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8899205 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 8899108  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  8899107 gattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 16454332 - 16454443
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16454332 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 16454429  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  16454430 gattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Original strand, 38961942 - 38962037
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961942 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Original strand, 12119789 - 12119887
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  12119789 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15412527 - 15412429
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  15412527 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Original strand, 53070704 - 53070802
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070704 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 53070801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 13151841 - 13151953
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13151841 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13151938  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  13151939 tgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 13154306 - 13154418
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13154306 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13154403  T
Q  209 tgttgaagatgatga 223  Q
    || | ||||||||||    
T  13154404 tgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13544136 - 13544024
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13544136 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13544039  T
Q  210 gttgaagatgatgat 224  Q
    | | |||||| ||||    
T  13544038 gattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgttgt------atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||      ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T
Q  220 atga 223  Q
    ||||    
T  17737239 atga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 10247774 - 10247885
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10247774 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 10247871  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  10247872 gattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12567671 - 12567576
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567671 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977515
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  131 atataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 221  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 17446706 - 17446816
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17446706 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagtt 17446802  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  17446803 gattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50242933 - 50242838
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242933 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44494907 - 44494809
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  44494907 atttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642386
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 211  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16796761 - 16796685
Alignment:
Q  15 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttga 90  Q
    ||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16796761 taattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Original strand, 15878095 - 15878168
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878095 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822267
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgat 224  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 949 - 1169
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat 107  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |    
T  949 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1147  T
Q  205 aagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  1148 aagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5057 - 4849
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| || | |||||||||| ||    
T  5057 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttg 4958  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 216  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4957 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 4859  T
Q  217 atgatgatgt 226  Q
    ||||||||||    
T  4858 atgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13427 - 13211
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  13427 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13328  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13327 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13229  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  13228 tgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 167879 - 168099
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat 107  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |    
T  167879 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167979 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 168077  T
Q  205 aagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  168078 aagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52129 - 51913
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  52129 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 52030  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52029 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 51931  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  51930 tgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1952
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 216  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  217 atgatgatgt 226  Q
    ||||||||||    
T  1961 atgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3686 - 3470
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  3686 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 3587  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3586 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 3488  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  3487 tgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 343
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||  | ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 360  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | | |||||||||||||    
T  359 gataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1851
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  2067 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 1968  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1967 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1869  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  1868 tgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 6026 - 6245
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  6026 gttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 6125  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6126 tgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6225  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    | || |||||||||||||||    
T  6226 gttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 3056 - 3271
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  3056 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 3155  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3156 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3254  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  3255 gatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  111 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38976 - 38761
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  38976 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 38877  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  38876 tgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagtt 38778  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  38777 gatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32942
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 217  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  218 tgatgatgt 226  Q
    |||||||||    
T  32950 tgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  225 gtcc 228  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39692 - 39479
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  39692 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 39593  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39592 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39494  T
Q  210 gttgaagatgatgat 224  Q
    | |||||| ||||||    
T  39493 gatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 75120 - 75333
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  75120 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 75219  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  75220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 75318  T
Q  210 gttgaagatgatgat 224  Q
    | |||||| ||||||    
T  75319 gatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  25 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 123  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  124 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  221 tgatg 225  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 17120 - 17337
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||    
T  17120 gttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 17219  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17318  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatg 225  Q
    | || ||||||||||||||    
T  17319 gttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 25970 - 26179
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||    
T  25970 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 26069  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
     |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26070 cgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26168  T
Q  209 tgttgaagatg 219  Q
    || ||||||||    
T  26169 tgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  206 agatgttgaagatgatga 223  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26840
Alignment:
Q  3 tatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgta 102  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27046 tatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgta 26948  T
Q  103 tgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26947 tacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcg 26850  T
Q  201 gtctaagatg 210  Q
     | |||||||    
T  26849 atataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  8634 gatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21132 - 20910
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||  |    
T  21132 aagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatata 21033  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |   ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21032 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T
Q  204 taagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    
T  20932 taagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 339855 - 340065
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||| | | |||    
T  339855 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgaga 339954  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  339955 tgttgttgacttga-tttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 340051  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    |  |||||||||||    
T  340052 gacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158612
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  158599 gattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 71419 - 71353
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  71419 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 16505 - 16721
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||| | | |||    
T  16505 gttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 16604  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    || || ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16605 tgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 16703  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  16704 tgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25896
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 25913  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | ||||||| |||||||    
T  25912 gatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39858
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagtt 39875  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  39874 gatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23090 - 22886
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  23090 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22991  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 216  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  22990 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22893  T
Q  217 atgatga 223  Q
    |||||||    
T  22892 atgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2101 - 1881
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||   ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2101 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattg 2003  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  2002 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagt 1905  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  1904 cgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4723 - 4508
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  4723 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 4624  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4623 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 4526  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  4525 tgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12305 - 12090
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  12305 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 12206  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12205 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 12108  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  12107 tgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22257 - 22042
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  22257 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22158  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22157 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 22060  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  22059 tgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 226
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  51 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 149  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  150 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  51 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 149  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  150 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16298 - 16113
Alignment:
Q  44 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 142  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  ||||| | | ||||| || ||  ||| ||||||||| || || |    
T  16298 atgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatat 16199  T
Q  143 catgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16198 cttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28536 - 28414
Alignment:
Q  106 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28536 ataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28438  T
Q  203 ctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  28437 ctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  170 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  207 gatgttgaagatgatg 222  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44570 - 44454
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44570 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 44473  T
Q  205 aagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  44472 aagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94411
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  94424 gattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Original strand, 17491 - 17586
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21700 - 21920
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  21700 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 21798  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21799 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagt 21896  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  21897 cgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 29592 - 29812
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  29592 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 29690  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  29691 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagt 29788  T
Q  199 cggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    || | ||||||| | |||||||||    
T  29789 cgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12983 - 12857
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  12983 cctatataagaagttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 12885  T
Q  101 tatgcataagatgttgatgaattgaatt 128  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 tatacataagatgttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11305
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34123
Alignment:
Q  149 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13141
Alignment:
Q  8 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 106  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||       
T  13313 aagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 13214  T
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgt 176  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  13213 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40128 - 39913
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |   ||   |||||    
T  40128 gttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaaga 40029  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    ||||  |||  || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  40028 tgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagtt 39930  T
Q  210 gttgaagatgatgatgt 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  39929 gatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19990
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgtata--ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtct 19984  T
Q  205 aagatg 210  Q
    ||||||    
T  19985 aagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  111 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgt 226  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8691 - 8479
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||||||| |   ||| |||  |||||    
T  8691 gttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaaga 8596  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 208  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8595 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 8497  T
Q  209 tgttgaagatgatgatgt 226  Q
    || |||||||||||||||    
T  8496 tgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8485
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8486  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  8485 g 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  207 gatgttgaagatgatg 222  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6669
Alignment:
Q  21 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 119  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||| ||    
T  6818 taatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 6719  T
Q  120 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgt 166  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  6718 aattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  110 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgt 226  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16202
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Original strand, 85644 - 85742
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  85644 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 501195 - 501100
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501195 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  207 gatgttgaagatgatgatgt 226  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82072
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  82085 gattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 207
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  207 gatgttgaagatgatga 223  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  207 gatgttgaagatgatga 223  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  150 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53654
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  207 gatg 210  Q
    ||||    
T  53651 gatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  162 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136680
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  136693 gattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139149
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  139162 gattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144087
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  144100 gattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 134322 - 134211
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  134322 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgtt 134225  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  134224 gattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 141729 - 141618
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  141729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 141632  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  141631 gattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  110 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  208 atgttgaagatgatgatgt 226  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13392
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  13405 gattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20747
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  20760 gattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37821
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  37834 gattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  160 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32555
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51987
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  210 gttgaagatgatgat 224  Q
    | | |||||| ||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  162 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20527
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 128871 - 128751
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  || | |  |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  128871 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtct 128773  T
Q  205 aagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||  || | |||||||||||||    
T  128772 aatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4710
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  159 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  26 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 124  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| ||   | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  125 aatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgt 166  Q
     ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  981 catt-gatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  130 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14058 - 13947
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14058 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagtt 13961  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  13960 gattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16784
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  16797 gattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28046 - 27911
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 111  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||    
T  28046 gttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 27947  T
Q  112 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc 147  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27946 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4545
Alignment:
Q  44 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 142  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||   |||||||||| ||||||  ||||||||| || || |    
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  143 catgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    | ||||| |||   |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20208 - 20117
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 91  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20208 cctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 20117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  107 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 202  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  203 ctaagatg 210  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  154 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Original strand, 27751 - 27851
Alignment:
Q  109 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 206  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27751 agatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 27850  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  27851 g 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3648
Alignment:
Q  15 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 62  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3695 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7712
Alignment:
Q  15 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 62  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7759 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 1052
Alignment:
Q  15 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 90  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1128 taattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  13 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  111 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40511 - 40400
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40511 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 40414  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  40413 gattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4312 - 4214
Alignment:
Q  126 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  4312 atttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  108 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4300
Alignment:
Q  128 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4393 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 12300 - 12413
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||   |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12300 gttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 12397  T
Q  210 gttgaagatgatgatg 225  Q
    | | |||||| |||||    
T  12398 gattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9241
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 161136 - 161252
Alignment:
Q  109 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 204  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  161136 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtct 161233  T
Q  205 aagatgttgaagatgatga 223  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  161234 aagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 106
Alignment:
Q  164 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23916 - 23843
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23916 tgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24069 - 23995
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt 76  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24069 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt 23995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 207
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  153 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12169 - 12064
Alignment:
Q  113 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12169 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12078  T
Q  210 gttgaagatgatga 223  Q
    | | ||||||||||    
T  12077 gattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36683 - 36592
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 91  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  36683 cctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 36592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  173 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 8851 - 8885
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 35  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8851 cctatataagaagttaactgtaatctgtgaagctg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  155 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 205  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 69867 - 69794
Alignment:
Q  148 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69867 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 70021 - 69930
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 91  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  70021 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 210
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  181 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  157 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16243 - 16330
Alignment:
Q  1 cctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 88  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16243 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 16330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1587 times since January 2019
Visitors: 1303