View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0095_low_36 (Length: 370)

Name: NF0095_low_36
Description: NF0095
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0095_low_36
NF0095_low_36
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (23-344)||(2041-2362)
scaffold0234 (23-344)||(10932-11253)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (23-344)||(17684189-17684510)
chr6 (23-344)||(27380972-27381293)
chr6 (23-344)||(27471355-27471676)
chr6 (23-344)||(11651889-11652210)
chr6 (23-344)||(17691160-17691481)
chr6 (23-344)||(29309056-29309377)
chr6 (23-344)||(29316016-29316336)
chr6 (23-344)||(188697-189018)
chr6 (105-344)||(27296877-27297116)
chr6 (71-344)||(16394165-16394438)
chr6 (103-340)||(25536915-25537152)
chr6 (122-343)||(16559193-16559414)
chr6 (19-327)||(13359010-13359314)
chr6 (23-127)||(16566257-16566361)
chr6 (40-334)||(2669476-2669768)
chr6 (37-344)||(16789071-16789373)
chr6 (37-344)||(22859888-22860190)
chr6 (37-344)||(27508347-27508649)
chr6 (37-344)||(1586108-1586410)
chr6 (37-330)||(27527947-27528235)
chr6 (37-344)||(14074480-14074782)
chr6 (37-300)||(18019885-18020143)
chr6 (29-322)||(10359073-10359359)
chr6 (37-344)||(8612915-8613221)
chr6 (38-166)||(27925935-27926062)
chr6 (38-241)||(17850321-17850521)
chr6 (107-259)||(20736413-20736562)
chr6 (55-160)||(28172754-28172859)
chr6 (29-161)||(20553492-20553622)
chr6 (90-275)||(8510155-8510338)
chr6 (231-344)||(33317055-33317167)
chr6 (105-344)||(17120505-17120740)
chr6 (23-75)||(25537148-25537200)
chr6 (37-132)||(13995151-13995245)
chr6 (105-247)||(21994655-21994794)
chr6 (35-247)||(19218427-19218630)
chr6 (51-172)||(19347092-19347212)
chr6 (36-216)||(22560311-22560487)
chr6 (203-266)||(28172899-28172963)
chr6 (188-327)||(28756145-28756283)
chr6 (112-259)||(5758565-5758709)
chr6 (35-247)||(4073574-4073781)
chr6 (37-73)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (23-344)||(18262378-18262699)
chr4 (23-344)||(18269239-18269560)
chr4 (23-344)||(55612849-55613170)
chr4 (23-344)||(26963806-26964127)
chr4 (23-344)||(26970629-26970950)
chr4 (23-344)||(868763-869084)
chr4 (23-344)||(19926480-19926801)
chr4 (23-344)||(5707486-5707807)
chr4 (23-344)||(5714114-5714435)
chr4 (23-344)||(8858333-8858654)
chr4 (23-344)||(10621053-10621374)
chr4 (29-344)||(10628132-10628447)
chr4 (23-344)||(28392854-28393175)
chr4 (23-344)||(8845369-8845690)
chr4 (23-344)||(4426336-4426645)
chr4 (29-344)||(35223732-35224047)
chr4 (33-344)||(5667849-5668156)
chr4 (23-348)||(20311458-20311781)
chr4 (112-344)||(10677303-10677534)
chr4 (112-344)||(10890943-10891174)
chr4 (37-344)||(15461497-15461799)
chr4 (37-344)||(34975551-34975853)
chr4 (37-344)||(2677013-2677315)
chr4 (37-344)||(15815021-15815323)
chr4 (37-344)||(18111043-18111345)
chr4 (37-344)||(3369023-3369325)
chr4 (37-344)||(17299959-17300261)
chr4 (37-344)||(18163162-18163464)
chr4 (37-344)||(20243937-20244239)
chr4 (37-344)||(26531613-26531915)
chr4 (37-344)||(4675983-4676285)
chr4 (33-169)||(56516232-56516368)
chr4 (38-344)||(5870419-5870720)
chr4 (93-243)||(21453961-21454110)
chr4 (37-328)||(19365519-19365806)
chr4 (37-344)||(1941724-1942026)
chr4 (58-344)||(32646523-32646807)
chr4 (105-327)||(19362477-19362695)
chr4 (112-344)||(9487625-9487853)
chr4 (37-242)||(32636484-32636685)
chr4 (105-328)||(5528495-5528714)
chr4 (29-328)||(5616387-5616681)
chr4 (41-119)||(24700213-24700291)
chr4 (124-344)||(30040489-30040705)
chr4 (112-328)||(9538033-9538244)
chr4 (37-259)||(4546080-4546298)
chr4 (127-344)||(11421096-11421309)
chr4 (216-266)||(24701361-24701411)
chr4 (93-247)||(33888594-33888743)
chr4 (29-81)||(10677538-10677590)
chr4 (29-81)||(10891178-10891230)
chr4 (84-211)||(34777850-34777975)
chr4 (25-95)||(9937933-9938003)
chr4 (235-316)||(9937745-9937826)
chr4 (114-205)||(9937830-9937923)
chr4 (37-73)||(11421016-11421052)
chr4 (29-73)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (23-344)||(6110230-6110551)
chr3 (23-344)||(16482203-16482524)
chr3 (23-344)||(10579075-10579396)
chr3 (23-344)||(15600604-15600925)
chr3 (23-344)||(15607149-15607470)
chr3 (23-344)||(10572312-10572633)
chr3 (23-344)||(15341939-15342260)
chr3 (23-344)||(18520141-18520462)
chr3 (38-344)||(8490676-8490982)
chr3 (30-340)||(18522836-18523146)
chr3 (23-344)||(15357306-15357627)
chr3 (23-344)||(17780838-17781159)
chr3 (23-344)||(13211468-13211789)
chr3 (29-344)||(13248779-13249094)
chr3 (23-344)||(32056619-32056941)
chr3 (23-348)||(17199900-17200225)
chr3 (23-344)||(13516977-13517294)
chr3 (29-344)||(1647241-1647556)
chr3 (23-344)||(17136525-17136840)
chr3 (23-344)||(29925137-29925458)
chr3 (23-344)||(29974290-29974611)
chr3 (54-344)||(16200627-16200917)
chr3 (37-344)||(21034238-21034540)
chr3 (37-344)||(15846536-15846838)
chr3 (37-344)||(20147554-20147856)
chr3 (37-344)||(21398792-21399094)
chr3 (29-326)||(24253130-24253423)
chr3 (37-344)||(14890391-14890693)
chr3 (37-344)||(55427021-55427323)
chr3 (37-344)||(12299911-12300212)
chr3 (105-344)||(25978728-25978963)
chr3 (29-246)||(14147013-14147226)
chr3 (112-310)||(15526827-15527021)
chr3 (186-344)||(28088251-28088408)
chr3 (105-344)||(11787654-11787889)
chr3 (40-344)||(15317176-15317472)
chr3 (76-205)||(28953965-28954093)
chr3 (23-75)||(19089734-19089786)
chr3 (78-270)||(32280313-32280507)
chr3 (29-122)||(9504455-9504548)
chr3 (33-148)||(8251933-8252048)
chr3 (191-306)||(30464147-30464261)
chr3 (23-96)||(16200291-16200363)
chr3 (183-247)||(36138033-36138097)
chr3 (116-168)||(4189223-4189275)
chr3 (183-247)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (23-344)||(18252196-18252517)
chr1 (23-344)||(18532234-18532555)
chr1 (23-344)||(27131130-27131450)
chr1 (23-344)||(27310297-27310618)
chr1 (23-344)||(16358755-16359076)
chr1 (29-344)||(3855639-3855954)
chr1 (29-344)||(36816354-36816668)
chr1 (63-344)||(22641594-22641871)
chr1 (29-344)||(27277278-27277592)
chr1 (23-216)||(21171081-21171274)
chr1 (37-344)||(19706439-19706741)
chr1 (37-344)||(43802365-43802667)
chr1 (37-344)||(28134723-28135025)
chr1 (23-177)||(22657108-22657262)
chr1 (53-344)||(23507096-23507385)
chr1 (37-344)||(9456116-9456418)
chr1 (151-344)||(9916497-9916689)
chr1 (29-266)||(12014084-12014319)
chr1 (37-344)||(20391239-20391541)
chr1 (37-344)||(20779645-20779947)
chr1 (37-344)||(22670257-22670559)
chr1 (37-344)||(42816989-42817291)
chr1 (37-344)||(22612492-22612794)
chr1 (28-324)||(633925-634216)
chr1 (30-146)||(9917837-9917952)
chr1 (37-344)||(8727667-8727969)
chr1 (37-344)||(47667485-47667776)
chr1 (105-328)||(29096789-29097008)
chr1 (37-169)||(35930582-35930713)
chr1 (53-142)||(12006461-12006550)
chr1 (231-344)||(28145723-28145835)
chr1 (112-244)||(21881475-21881604)
chr1 (92-257)||(24301691-24301855)
chr1 (45-171)||(26923553-26923678)
chr1 (112-165)||(51997353-51997406)
chr1 (197-277)||(12006332-12006413)
chr1 (183-242)||(10852402-10852461)
chr1 (126-205)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (23-343)||(21940831-21941151)
chr8 (23-344)||(22171653-22171974)
chr8 (23-344)||(6094289-6094610)
chr8 (23-344)||(24642815-24643135)
chr8 (81-344)||(15326422-15326685)
chr8 (81-344)||(15506791-15507054)
chr8 (203-344)||(28548393-28548534)
chr8 (34-277)||(14983710-14983950)
chr8 (29-344)||(8371253-8371563)
chr8 (37-344)||(21969333-21969635)
chr8 (32-229)||(24797224-24797419)
chr8 (37-344)||(12562123-12562425)
chr8 (37-344)||(27007517-27007819)
chr8 (37-344)||(27014660-27014962)
chr8 (37-344)||(27880487-27880789)
chr8 (37-344)||(28020668-28020970)
chr8 (29-328)||(38232115-38232412)
chr8 (37-344)||(22130609-22130911)
chr8 (37-344)||(25611195-25611497)
chr8 (38-344)||(22659494-22659795)
chr8 (37-344)||(21916676-21916978)
chr8 (37-344)||(45534273-45534575)
chr8 (37-344)||(26240484-26240786)
chr8 (29-247)||(18835342-18835556)
chr8 (25-164)||(32872741-32872880)
chr8 (105-344)||(6430953-6431188)
chr8 (113-259)||(8781959-8782102)
chr8 (60-146)||(2375214-2375300)
chr8 (237-334)||(24796731-24796826)
chr8 (182-328)||(20535226-20535371)
chr8 (105-344)||(2962932-2963171)
chr8 (40-134)||(29645537-29645631)
chr8 (231-349)||(36970439-36970556)
chr8 (231-348)||(2375411-2375528)
chr8 (37-144)||(36970265-36970371)
chr8 (195-317)||(29645675-29645797)
chr8 (84-136)||(10920427-10920479)
chr8 (56-111)||(24535514-24535569)
chr8 (23-58)||(28555049-28555084)
chr8 (283-344)||(8968015-8968076)
chr8 (284-332)||(41368106-41368154)
chr8 (284-332)||(41375077-41375125)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (29-344)||(24695186-24695501)
chr5 (23-344)||(19714218-19714539)
chr5 (23-344)||(19706939-19707259)
chr5 (23-344)||(18569581-18569904)
chr5 (23-222)||(39538754-39538953)
chr5 (53-344)||(17298621-17298912)
chr5 (53-344)||(17285470-17285759)
chr5 (29-257)||(18806843-18807069)
chr5 (182-348)||(27347252-27347417)
chr5 (237-344)||(24701950-24702057)
chr5 (37-344)||(20941027-20941329)
chr5 (37-344)||(25805385-25805687)
chr5 (37-344)||(31899-32201)
chr5 (37-344)||(12789663-12789965)
chr5 (37-344)||(22941250-22941552)
chr5 (37-344)||(23545922-23546224)
chr5 (34-168)||(22546912-22547046)
chr5 (37-344)||(24933306-24933608)
chr5 (39-332)||(20100255-20100543)
chr5 (37-344)||(31096816-31097118)
chr5 (37-344)||(12764990-12765296)
chr5 (37-344)||(5097651-5097953)
chr5 (37-344)||(7865430-7865736)
chr5 (37-344)||(9811733-9812039)
chr5 (37-344)||(12703874-12704180)
chr5 (119-257)||(18806483-18806619)
chr5 (119-257)||(18806663-18806799)
chr5 (29-117)||(27347425-27347513)
chr5 (259-348)||(28719471-28719558)
chr5 (95-344)||(18829281-18829530)
chr5 (37-344)||(26245102-26245404)
chr5 (105-348)||(26129689-26129928)
chr5 (263-344)||(39538954-39539035)
chr5 (40-169)||(33477193-33477321)
chr5 (38-82)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (23-344)||(7273-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (23-344)||(6654-6975)
scaffold0390 (23-344)||(13670-13991)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (23-340)||(15152609-15152926)
chr7 (23-344)||(29327950-29328271)
chr7 (23-344)||(11535782-11536103)
chr7 (23-344)||(11542700-11543021)
chr7 (18-344)||(12750987-12751313)
chr7 (23-344)||(12738702-12739023)
chr7 (23-344)||(18561173-18561485)
chr7 (33-344)||(13392326-13392637)
chr7 (32-350)||(18257559-18257874)
chr7 (37-344)||(2204552-2204854)
chr7 (37-344)||(8464999-8465301)
chr7 (37-344)||(18400104-18400406)
chr7 (37-344)||(18407088-18407390)
chr7 (37-344)||(48808496-48808798)
chr7 (37-344)||(15729751-15730053)
chr7 (37-344)||(18139338-18139640)
chr7 (37-344)||(19230888-19231190)
chr7 (37-332)||(30254138-30254428)
chr7 (104-344)||(2365169-2365407)
chr7 (105-344)||(41680968-41681203)
chr7 (37-344)||(10668901-10669204)
chr7 (37-332)||(47166871-47167161)
chr7 (38-322)||(24443349-24443628)
chr7 (112-344)||(34128647-34128875)
chr7 (29-259)||(19388544-19388774)
chr7 (37-344)||(28130561-28130863)
chr7 (56-146)||(10235361-10235451)
chr7 (35-322)||(25845498-25845780)
chr7 (35-322)||(25845917-25846199)
chr7 (37-306)||(19393462-19393726)
chr7 (105-344)||(18259124-18259359)
chr7 (38-146)||(47833875-47833983)
chr7 (23-78)||(15148308-15148363)
chr7 (28-137)||(19859113-19859221)
chr7 (196-333)||(39112138-39112275)
chr7 (32-170)||(3132849-3132986)
chr7 (42-160)||(7662569-7662686)
chr7 (112-344)||(14591924-14592153)
chr7 (112-344)||(16011515-16011744)
chr7 (119-258)||(31190524-31190660)
chr7 (29-115)||(7396361-7396450)
chr7 (112-244)||(22969024-22969153)
chr7 (195-270)||(22948499-22948574)
chr7 (156-344)||(15169290-15169474)
chr7 (102-160)||(7396469-7396527)
chr7 (71-126)||(29983179-29983234)
chr7 (34-137)||(39111989-39112092)
chr7 (33-75)||(2365070-2365112)
chr7 (190-254)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (23-344)||(18454-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (23-348)||(25706-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (23-344)||(21329968-21330289)
chr2 (23-344)||(18796672-18796993)
chr2 (29-350)||(18619976-18620296)
chr2 (29-344)||(36270338-36270650)
chr2 (29-344)||(22183206-22183518)
chr2 (73-344)||(20978091-20978360)
chr2 (32-330)||(6991847-6992146)
chr2 (23-332)||(18822249-18822556)
chr2 (37-344)||(30174377-30174679)
chr2 (37-344)||(24250032-24250334)
chr2 (37-344)||(24229215-24229517)
chr2 (29-169)||(19279460-19279600)
chr2 (38-146)||(18851977-18852085)
chr2 (105-332)||(15342014-15342237)
chr2 (38-346)||(29800468-29800775)
chr2 (181-344)||(17241034-17241196)
chr2 (43-146)||(36801899-36802003)
chr2 (37-259)||(19616435-19616653)
chr2 (197-277)||(36799745-36799826)
chr2 (112-246)||(40301034-40301164)
chr2 (39-146)||(28741220-28741326)
chr2 (277-344)||(41661694-41661761)
chr2 (114-319)||(41316305-41316506)
chr2 (112-247)||(21626824-21626955)
chr2 (183-259)||(28740910-28740986)
chr2 (108-171)||(28718943-28719006)
chr2 (29-146)||(24763751-24763867)
chr2 (33-73)||(12098609-12098649)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (23-325)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (23-348)||(5695-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (88-344)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (37-344)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (37-344)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (37-344)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (37-332)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (37-306)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (37-344)||(67374-67676)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (37-344)||(39988-40290)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (37-247)||(8305-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (105-344)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (29-146)||(90033-90151)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (29-316)||(8723-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (154-344)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (112-344)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (112-247)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (38-344)||(53766-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (76-167)||(45956-46051)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (29-73)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2362 - 2041
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 2263  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 2163  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2162 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 2063  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2062 gatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 10932
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11154  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11153 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 11054  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11053 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10954  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10953 gatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17684510 - 17684189
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684510 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17684411  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684410 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17684311  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684310 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17684211  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17684210 gatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27381293 - 27380972
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381293 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27381194  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381193 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27381094  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381093 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27380994  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27380993 gatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27471676 - 27471355
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471676 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27471577  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471576 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27471477  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471476 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27471377  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27471376 gatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 11651889 - 11652210
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651889 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11651988  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651989 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattc 11652088  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11652188  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11652189 gatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17691481 - 17691160
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691481 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17691382  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691381 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17691282  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691281 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17691182  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17691181 gatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 29309056 - 29309377
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309056 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29309155  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309156 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29309255  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309256 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29309355  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29309356 gatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 29316016 - 29316336
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316016 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29316115  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316116 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29316215  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316216 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29316314  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29316315 gatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 189018 - 188697
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189018 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 188919  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188918 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 188819  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  188818 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgatt 188719  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||| |||||||| |||||||    
T  188718 gatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 71 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  71 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 170  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  171 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 270  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  271 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  103 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 202  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  203 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  303 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  122 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  222 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  322 tgatgggtactccatgaatcat 343  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13359314 - 13359010
Alignment:
Q  19 ggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 118  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13359314 ggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagt 13359215  T
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 217  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||   |  |||||  ||||||||| | |||  ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13359214 attagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtg 13359120  T
Q  218 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13359119 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagt 13359020  T
Q  318 tggttgatgg 327  Q
     |||||||||    
T  13359019 cggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16566361 - 16566257
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566361 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16566262  T
Q  123 ggagt 127  Q
    |||||    
T  16566261 ggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 334
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 139  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  140 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 238  Q
     ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  239 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 334  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789373
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 16789266  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16789267 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 16789365  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  16789366 gaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859888
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22859995  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22859994 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22859896  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  22859895 gaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27508649 - 27508347
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27508649 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27508551  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27508550 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27508454  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  27508453 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgat 27508355  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  27508354 gaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586108
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 1586215  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1586214 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 1586116  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  1586115 gaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27528235 - 27527947
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27528235 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27528137  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27528136 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27528040  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 330  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528039 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074782
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| ||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctg 14074675  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  14074676 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 14074774  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  14074775 gaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019885
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18019948  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 300  Q
    ||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019947 aaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10359359 - 10359073
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   |||    
T  10359359 aaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggta 10359262  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  10359261 atatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactct 10359166  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359165 tagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 8612915 - 8613221
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8612915 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 8613013  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 233  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  8613014 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 8613111  T
Q  234 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 333  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  8613112 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 8613210  T
Q  334 catgaatcatg 344  Q
     ||||||||||    
T  8613211 gatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926062
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactaca 166  Q
    ||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    ||||||||| ||  | | |||||||||||| |     ||| ||   |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacattg----ggttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctg 17850326  T
Q  237 aaacc 241  Q
    |||||    
T  17850325 aaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  107 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatag 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  207 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 259  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  55 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  155 gagaat 160  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20553622 - 20553492
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  20553622 aaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaata 20553524  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaata 161  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20553523 atatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 275
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  90 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 188  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  || |||||  || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  189 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 275  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  231 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 330  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  331 ctccatgaatcatg 344  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25537200 - 25537148
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 75  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537200 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 247
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 247  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 234  Q
    ||     ||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 at-----attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  235 tgaaaccactatg 247  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  51 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 150  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  151 tcatgagaatactacatagtaa 172  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  36 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 135  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  136 tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 216  Q
    || || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 266
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  203 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  188 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  288 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 327  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||  | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 259  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 234  Q
    ||||| |||||| |   | |||||||||||||||  | | ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  235 tgaaaccactatg 247  Q
    | |||||||||||    
T  4073769 taaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20736630 - 20736594
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20736630 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 20736594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 18262378 - 18262699
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262378 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18262477  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262478 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18262577  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262578 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18262677  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18262678 gatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 18269239 - 18269560
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269239 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18269338  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269339 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18269438  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269439 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18269538  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18269539 gatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 55612849 - 55613170
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612849 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 55612948  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612949 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 55613048  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613049 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 55613148  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55613149 gatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 26963806 - 26964127
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963806 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26963905  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963906 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26964005  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964006 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26964105  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26964106 gatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 26970629 - 26970950
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970629 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26970728  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970729 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26970828  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970829 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26970928  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26970929 gatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 868763 - 869084
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868763 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 868862  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  868863 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 868962  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868963 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 869062  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  869063 gatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19926801 - 19926480
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926801 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatatta 19926702  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926701 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 19926602  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926601 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19926502  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19926501 gatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 5707486 - 5707807
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707486 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5707585  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707586 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5707685  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707686 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5707785  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5707786 gatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 5714114 - 5714435
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714114 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5714213  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714214 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5714313  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714314 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5714413  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5714414 gatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 8858333 - 8858654
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858333 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatatta 8858432  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858433 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 8858532  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858533 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 8858632  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8858633 gatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10621374 - 10621053
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621374 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatttta 10621275  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621274 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttc 10621175  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621174 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10621075  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10621074 gatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10628447 - 10628132
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628447 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 10628348  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10628347 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccct 10628248  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628247 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 10628148  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  10628147 tactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28393175 - 28392854
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393175 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 28393076  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393075 gaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 28392976  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392975 cacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 28392876  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28392875 gatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 8845369 - 8845690
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8845369 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatatta 8845468  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845469 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 8845568  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845569 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggtt 8845668  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8845669 gatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4426645 - 4426336
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426645 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 4426546  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  4426545 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattc 4426458  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4426457 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggtt 4426358  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4426357 gatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 35223732 - 35224047
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35223732 aaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagta 35223831  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223832 atatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccct 35223931  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35223932 ttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtg 35224031  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35224032 tactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 33 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667849
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatat 5668059  T
Q  133 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 232  Q
    ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668058 ttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttaga 5667959  T
Q  233 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667958 cctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 5667861  T
Q  333 ccatgaatcatg 344  Q
    ||| ||||||||    
T  5667860 ccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Original strand, 20311458 - 20311781
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20311458 atcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatatta 20311557  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtatt 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||   || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20311558 ggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttat-gtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtatt 20311654  T
Q  222 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 321  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20311655 ccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggt 20311754  T
Q  322 tgatgggtactccatgaatcatgatga 348  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311755 taatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 311  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  312 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 311  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  312 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461799
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15461692  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15461693 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15461791  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  15461792 gaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975853
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 34975746  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  34975747 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 34975845  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  34975846 gaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677315
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2677208  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2677209 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2677307  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  2677308 gaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815323
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15815216  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15815217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 15815315  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  15815316 gaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111043
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18111150  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18111149 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18111051  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  18111050 gaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369023
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3369130  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  3369129 aaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 3369031  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  3369030 gaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299959
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 17300066  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| | |||  ||    
T  17300065 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgat 17299967  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  17299966 gaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163464
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 18163357  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18163358 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 18163456  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  18163457 gaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244239
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 20244132  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20244133 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20244231  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  20244232 gaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531915
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 26531808  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  26531809 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 26531907  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  26531908 gaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675983
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 4676090  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  4676089 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 4675991  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  4675990 gaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  133 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 344
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 237  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  238 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 337  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  338 aatcatg 344  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  93 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 192  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  193 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 243  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 328
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 235  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacct 19365714  T
Q  236 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365715 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 1941724 - 1942026
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1941724 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 1941822  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  1941823 attggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 1941919  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1941920 aaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 1942018  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  1942019 gaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646523
Alignment:
Q  58 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgag 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  158 aatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 256  Q
    ||| |||||||  ||| |||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  257 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgg 327  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 311  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  312 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 32636484 - 32636685
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636484 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagtaatatttat 32636582  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| || |||| ||    
T  32636583 attggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtg 32636679  T
Q  237 aaacca 242  Q
    ||||||    
T  32636680 aaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  305 atgactataaagttggttgatggg 328  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Original strand, 5616387 - 5616681
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| ||||    
T  5616387 aaagcattgagactattatgtatgtagattgatgaccacatctcatgggtcataaatat-gagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagta 5616485  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| |||||||| |   | ||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  ||    
T  5616486 atatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatgaaa-gtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatct 5616582  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    | || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616583 tagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  41 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  124 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 223  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  224 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 323  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  324 atgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 328
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 311  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  312 taaagttggttgatggg 328  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 4546080 - 4546298
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4546080 gagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 4546178  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||     
T  4546179 actggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctctttgaccta 4546275  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgt 259  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  4546276 aaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 344
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  127 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  227 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 326  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  327 ggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  216 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 247
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  93 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  193 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 247  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10677590 - 10677538
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 81  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10677590 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10891230 - 10891178
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 81  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10891230 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  84 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 183  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  184 agtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 9938003 - 9937933
Alignment:
Q  25 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 95  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938003 catcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  235 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  114 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca---tagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 205  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    |||||  | |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Original strand, 11421016 - 11421052
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421016 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 30040784 - 30040740
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040784 aaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 6110230 - 6110551
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110230 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6110329  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110330 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6110429  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110430 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 6110529  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6110530 gatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16482524 - 16482203
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482524 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16482425  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482424 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16482325  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482324 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 16482225  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16482224 gatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10579396 - 10579075
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579396 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10579297  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10579197  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579196 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10579097  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10579096 gatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15600925 - 15600604
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600925 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15600826  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600825 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15600726  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600725 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15600626  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15600625 gatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15607470 - 15607149
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607470 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15607371  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607370 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15607271  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607270 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15607171  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15607170 gatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10572633 - 10572312
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572633 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10572534  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572533 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10572434  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572433 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10572334  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10572333 gatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15342260 - 15341939
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15342260 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15342161  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342160 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15342061  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342060 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15341961  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15341960 gatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 18520141 - 18520462
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520141 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18520240  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520241 ggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18520340  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520341 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 18520440  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18520441 gatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 38 - 344
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490982
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  238 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  338 aatcatg 344  Q
    |||||||    
T  8490976 aatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 340
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  30 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  130 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  230 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  330 actccatgaat 340  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15357627 - 15357306
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15357627 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15357528  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357527 ggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15357428  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357427 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15357328  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15357327 gatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17781159 - 17780838
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17781060  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781059 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17780960  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17780959 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggtt 17780860  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17780859 gatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 13211468 - 13211789
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211468 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13211567  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211568 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 13211667  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211668 cacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13211767  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13211768 gatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 13248779 - 13249094
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248779 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 13248878  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248879 atatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 13248978  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248979 tcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 13249078  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  13249079 tactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32056941 - 32056619
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tatt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056941 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatatt 32056842  T
Q  122 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056841 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 32056742  T
Q  222 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056741 ccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 32056642  T
Q  322 tgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  32056641 tgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17200225 - 17199900
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200225 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17200126  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200125 ggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17200026  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17200025 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggtt 17199926  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatgatga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17199925 gatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 13516977 - 13517294
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516977 atcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13517076  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  13517077 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccc 13517172  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13517173 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggta 13517272  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13517273 gatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1647556 - 1647241
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1647556 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 1647457  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1647456 atgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccct 1647357  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1647356 tcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgag 1647257  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  1647256 tactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 17136525 - 17136840
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  17136525 atcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------ta 17136618  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136619 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17136718  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136719 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17136818  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  17136819 gatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 29925137 - 29925458
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29925137 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29925236  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925237 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29925336  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29925337 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29925436  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  29925437 gatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 29974290 - 29974611
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29974290 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29974389  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974390 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29974489  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29974490 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29974589  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  29974590 gatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 344
Target Start/End: Original strand, 16200627 - 16200917
Alignment:
Q  54 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtca 153  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  16200627 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccacca 16200726  T
Q  154 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 253  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16200727 tgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccct 16200826  T
Q  254 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200827 agatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034540
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21034433  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21034434 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 21034532  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  21034533 gaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846536
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15846643  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15846642 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15846544  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  15846543 gaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147554
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20147661  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20147660 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20147562  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  20147561 gaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24253423 - 24253130
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||     
T  24253423 aaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtt 24253324  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  24253323 atatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cat 24253228  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253227 tcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427323
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 55427216  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  55427217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 55427315  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  55427316 gaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 12299911 - 12300212
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagtaatatttat 12300008  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12300009 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12300105  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12300106 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12300204  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  12300205 gaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 14147013 - 14147226
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |    
T  14147013 aaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagga 14147111  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| ||    
T  14147112 atatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactct 14147208  T
Q  229 tcgacctgaaaccactat 246  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14147209 tagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 310
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 310  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 344
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088408
Alignment:
Q  186 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 285  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  286 aaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
     ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gatattttcataagatattctcac 11787750  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317176
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  140 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 239  Q
     ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaa 15317277  T
Q  240 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 339  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  15317276 ccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaa 15317181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 205
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  76 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 174  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  175 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 205  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19089786 - 19089734
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 75  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089786 atcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 270
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  78 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 177  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  178 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 270  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Original strand, 9504455 - 9504548
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504455 aaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  133 ttatattggattgatc 148  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 306
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  191 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  291 ttgtccgtaacaggat 306  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 16200291 - 16200363
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 96  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200291 atcattaaagcatggagactatt-tgtggagagactgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  183 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 247  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189275
Alignment:
Q  116 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 168  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata 4189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  183 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 247  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 18252196 - 18252517
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252196 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18252295  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18252395  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252396 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18252495  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18252496 gatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18532555 - 18532234
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532555 atcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18532456  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532455 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18532356  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532355 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18532256  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18532255 gatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27131450 - 27131130
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131450 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27131351  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131350 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27131251  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131250 cacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27131152  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27131151 gatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27310618 - 27310297
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310618 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 27310519  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310518 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattc 27310419  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27310418 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 27310319  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27310318 gatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16359076 - 16358755
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359076 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatatta 16358977  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358976 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16358877  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358876 cacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggtt 16358777  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16358776 gatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3855954 - 3855639
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855954 aaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagta 3855855  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3855854 atatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccat 3855755  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3855754 tcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccgg 3855655  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  3855654 tactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36816668 - 36816354
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816668 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 36816569  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816568 atatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccct 36816470  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36816469 ttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgatagg 36816370  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||  |||||||    
T  36816369 tactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 63 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  63 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  163 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  263 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27277592 - 27277278
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277592 aaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagta 27277493  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| | |||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27277492 atatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccct 27277394  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27277393 ttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaaggg 27277294  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||| |||||||    
T  27277293 tactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21171274 - 21171081
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171274 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21171175  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171174 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706439
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19706546  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19706545 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 19706447  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  19706446 gaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802365
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 43802472  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  43802471 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 43802373  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  43802372 gaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28135025 - 28134723
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135025 gagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28134927  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28134926 attggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28134830  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28134829 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 28134731  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  28134730 gaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22657262 - 22657108
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657262 atcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatatta 22657163  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 177  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22657162 tgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 344
Target Start/End: Original strand, 23507096 - 23507385
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  23507096 tagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccacc 23507195  T
Q  153 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 251  Q
    || ||||| ||||| || |     | |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23507196 attagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaag---cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtacc 23507292  T
Q  252 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507293 ctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456418
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 9456311  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  9456312 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 9456410  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  9456411 gaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916497
Alignment:
Q  151 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  249 accctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12014319 - 12014084
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12014319 aaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagta 12014220  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 227  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | ||||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12014219 atattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcaccc 12014123  T
Q  228 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 266  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014122 ttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391239
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| ||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctg 20391346  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20391345 aaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20391247  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  20391246 gaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779645
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20779752  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20779751 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20779653  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  20779652 gaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670257
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22670364  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22670363 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22670265  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  22670264 gaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816989
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 42817096  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  42817095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 42816997  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  42816996 gaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 22612492 - 22612794
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22612492 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatattttt 22612590  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22612591 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22612687  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||    
T  22612688 aaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgat 22612786  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  22612787 gaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 324
Target Start/End: Original strand, 633925 - 634216
Alignment:
Q  28 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 127  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  633925 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 634023  T
Q  128 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 227  Q
    |||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  634024 aatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 634120  T
Q  228 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 324  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634121 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9917952 - 9917837
Alignment:
Q  30 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 129  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9917952 aagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaa 9917854  T
Q  130 tatttatattggattga 146  Q
    |||||||||||||||||    
T  9917853 tatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 8727667 - 8727969
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8727667 gagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagtaatatttat 8727765  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| ||| ||||||    
T  8727766 actggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactcttagacctg 8727862  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
     ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | |||||||||  ||    
T  8727863 gaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgggtacttgat 8727961  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  8727962 gaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667485
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||           |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  47667677 attggattgacccaccgtga-----------agt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 47667592  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  47667591 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 47667493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 328
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  305 atgactataaagttggttgatggg 328  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 35930582 - 35930713
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35930582 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 35930680  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
    |||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930681 attggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12006550 - 12006461
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 142  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006550 tagactgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  231 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 330  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  331 ctccatgaatcatg 344  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 244  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  92 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 190  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  191 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  45 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 144  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  145 gatccgtcatgagaatactacatagta 171  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 165
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  197 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 277  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  183 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 242  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  126 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 205  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttat-gaaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 343
Target Start/End: Original strand, 21940831 - 21941151
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940831 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21940930  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21941030  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941031 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 21941130  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcat 343  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21941131 gatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 22171653 - 22171974
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171653 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 22171752  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171753 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 22171852  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171853 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 22171952  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22171953 gatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 6094289 - 6094610
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094289 atcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6094388  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094389 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6094488  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094489 cacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggtt 6094588  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6094589 gatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 24642815 - 24643135
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642815 atcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 24642914  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642915 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 24643013  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24643014 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggtt 24643113  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24643114 gatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 81 - 344
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  81 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  181 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  281 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 81 - 344
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  81 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  181 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  281 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 203 - 344
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  203 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  303 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983710
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-t 14983852  T
Q  134 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcga 232  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14983851 tatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcga 14983755  T
Q  233 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983754 cctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8371563 - 8371253
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  8371563 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagta 8371465  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||    
T  8371464 atatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctct 8371368  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  8371367 tagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatggg 8371269  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    ||||  ||||||||||    
T  8371268 tacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969635
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21969528  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21969529 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21969627  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  21969628 gaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  132 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 229  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562425
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12562318  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12562319 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 12562417  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  12562418 gaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007517
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27007624  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27007623 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27007525  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  27007524 gaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014660
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27014767  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27014766 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27014668  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  27014667 gaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880487
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27880594  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27880593 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27880495  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  27880494 gaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020668
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28020775  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  28020774 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 28020676  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  28020675 gaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38232412 - 38232115
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||    
T  38232412 aaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggta 38232313  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 227  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  38232312 atatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcc 38232216  T
Q  228 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 327  Q
    |  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  38232215 tcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatgg 38232116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130609
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 22130716  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22130715 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22130617  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  22130616 gaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 25611195 - 25611497
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611195 gagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25611293  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| ||||||    
T  25611294 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctg 25611390  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||    
T  25611391 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgat 25611489  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  25611490 gaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 237  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  238 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 337  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  338 aatcatg 344  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916978
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21916871  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||    
T  21916872 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgat 21916970  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  21916971 gaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534273
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 45534380  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  45534379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 45534281  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  45534280 gaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 26240484 - 26240786
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26240484 gagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26240582  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | ||| |||||     
T  26240583 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctcttagaccta 26240679  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  26240680 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 26240778  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  26240779 gaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 247
Target Start/End: Original strand, 18835342 - 18835556
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  18835342 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagta 18835440  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||    
T  18835441 atatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactct 18835537  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatg 247  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  18835538 tagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32872880 - 32872741
Alignment:
Q  25 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||     
T  32872880 catcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagt 32872781  T
Q  125 agtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 164  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872780 aataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  113 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  213 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 259  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375300
Alignment:
Q  60 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 146  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  182 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  282 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattct 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  |||| | |   | ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  202 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 301  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  302 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 134
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 349
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  231 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 330  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  331 ctccatgaatcatgatgat 349  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 348
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  231 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 330  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  331 ctccatgaatcatgatga 348  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  137 attggatt 144  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 317
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  195 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  295 ccgtaacaggatgactataaagt 317  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  84 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 111
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  56 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 111  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 58
Target Start/End: Original strand, 28555049 - 28555084
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagact 58  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555049 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  283 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  284 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  284 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24695501 - 24695186
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695501 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 24695402  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695401 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 24695302  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695301 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 24695202  T
Q  329 tactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  24695201 tactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19714539 - 19714218
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714539 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 19714440  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714439 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattc 19714340  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714339 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19714240  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  19714239 gatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19707259 - 19706939
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19707259 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatacta 19707160  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  19707159 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattc 19707060  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707059 cacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggtt 19706961  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19706960 gatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18569904 - 18569581
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatat 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569904 atcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatat 18569805  T
Q  121 taggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18569804 taggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtat 18569705  T
Q  221 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569704 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattgg 18569605  T
Q  321 ttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  18569604 ttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 39538754 - 39538953
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538754 atcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 39538853  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538854 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17298912 - 17298621
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 150  Q
    ||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17298912 tagactgatgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgaccca 17298813  T
Q  151 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 249  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17298812 ccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgta 17298716  T
Q  250 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298715 ccctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285470
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||       
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  153 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 251  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  17285659 atgagaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtacc 17285563  T
Q  252 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||| | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285562 ctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18807069 - 18806843
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807069 aaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagta 18806970  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 227  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18806969 atgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagtt-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccc 18806873  T
Q  228 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806872 ttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347252
Alignment:
Q  182 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  282 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 348  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941329
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20941222  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20941223 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 20941321  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  20941322 gaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805385
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  |||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctg 25805492  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  25805491 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 25805393  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  25805392 gaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32201
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 32094  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 32193  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  32194 gaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789663
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| ||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctg 12789770  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12789769 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12789671  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  12789670 gaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941552
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941250 gagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22941348  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22941349 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22941445  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  22941446 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 22941544  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  22941545 gaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546224
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 23546117  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23546118 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 23546216  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  23546217 gaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546912
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  134 tatattggattgatccgtcatgagaatactacata 168  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933306
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 24933413  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  24933412 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 24933314  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  24933313 gaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  39 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  139 tggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 238  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  239 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097118
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 31097011  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  31097012 aaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 31097110  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  31097111 gaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12765296 - 12764990
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12765296 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12765198  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 233  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12765197 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12765100  T
Q  234 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 333  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12765099 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12765001  T
Q  334 catgaatcatg 344  Q
     ||||||||||    
T  12765000 gatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 5097651 - 5097953
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5097651 gagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttat 5097749  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  5097750 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 5097846  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   ||    
T  5097847 aaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgat 5097945  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  5097946 gaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7865736 - 7865430
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7865736 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 7865638  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 233  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  7865637 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 7865540  T
Q  234 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 333  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  7865539 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 7865441  T
Q  334 catgaatcatg 344  Q
     ||||||||||    
T  7865440 gatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9812039 - 9811733
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9812039 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 9811941  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 233  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  9811940 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 9811843  T
Q  234 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 333  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  9811842 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 9811744  T
Q  334 catgaatcatg 344  Q
     ||||||||||    
T  9811743 gatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12704180 - 12703874
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12704180 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12704082  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 233  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12704081 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12703984  T
Q  234 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 333  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12703983 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12703885  T
Q  334 catgaatcatg 344  Q
     ||||||||||    
T  12703884 gatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 217  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  218 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 217  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  218 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27347513 - 27347425
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347513 aaagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  259 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  95 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 194  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  195 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 293  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  294 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 26245102 - 26245404
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245102 gagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26245200  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | ||| ||||||    
T  26245201 acttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctg 26245297  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||  ||    
T  26245298 aaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgat 26245396  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  26245397 gaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 348  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 344
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  263 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33477321 - 33477193
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 139  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  33477321 actattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttataca 33477223  T
Q  140 ggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
      ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  33477222 taattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 39535465 - 39535509
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatg 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39535465 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcataggtcatg 39535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7594
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 7372  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 7472  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7473 cacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 7572  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7573 gatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6654
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6876  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6875 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6776  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6775 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 6676  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6675 gatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13991 - 13670
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13991 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatatta 13892  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 13792  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13791 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13692  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13691 gatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 15152609 - 15152926
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152609 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15152708  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152709 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15152808  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152809 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15152908  T
Q  323 gatgggtactccatgaat 340  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15152909 gatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 29327950 - 29328271
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327950 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29328049  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328050 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29328149  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29328150 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgctt 29328249  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29328250 gatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11536103 - 11535782
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11536103 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatatta 11536004  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11536003 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11535904  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535903 caacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11535804  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11535803 gatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11543021 - 11542700
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543021 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatatta 11542922  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11542921 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11542822  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542821 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 11542722  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11542721 gatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 12750987 - 12751313
Alignment:
Q  18 tggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 117  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12750987 tggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaa 12751086  T
Q  118 tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751087 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 12751186  T
Q  218 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751187 tattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 12751286  T
Q  318 tggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751287 tggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 12738702 - 12739023
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738702 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 12738801  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738802 ctcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 12738901  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12738902 caccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggtt 12739001  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12739002 gatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 18561173 - 18561485
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561173 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18561272  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  18561273 ggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattc 18561363  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18561364 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgatt 18561463  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| |||||| || ||||||||    
T  18561464 gataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 33 - 344
Target Start/End: Original strand, 13392326 - 13392637
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13392326 catagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatat 13392425  T
Q  133 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 232  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392426 ttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttga 13392525  T
Q  233 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13392526 cctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtact 13392625  T
Q  333 ccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||||||    
T  13392626 ccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257559
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 131  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  132 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcg 231  Q
    ||||||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  232 acctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 331  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T
Q  332 tccatgaatcatgatgatg 350  Q
    |  | |||||||| |||||    
T  18257577 ttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204854
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2204747  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2204748 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2204846  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  2204847 gaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400406
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18400299  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18400300 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18400398  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  18400399 gaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407390
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18407283  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18407284 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18407382  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  18407383 gaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808496
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 48808603  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  48808602 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 48808504  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  48808503 gaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730053
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 15729946  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15729947 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 15730045  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  15730046 gaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139338
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18139445  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18139444 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgat 18139346  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  18139345 gaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231190
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19231083  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19231084 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 19231182  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  19231183 gaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| ||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttg 30254333  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254334 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 344
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  104 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  204 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 302  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  303 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668901
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 235  Q
    | | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| |||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacct 10669009  T
Q  236 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 335  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  10669008 gaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttga 10668910  T
Q  336 tgaatcatg 344  Q
    |||||||||    
T  10668909 tgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47167161 - 47166871
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47167161 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagtaatatttat 47167063  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  47167062 actagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 47166966  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  47166965 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 237  Q
     | |||| | ||  | ||||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  238 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 311  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  312 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388774
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 226  Q
    ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||     
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccact 19388741  T
Q  227 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 259  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388742 cttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 28130561 - 28130863
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28130561 gagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagtaatatttat 28130659  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | |||||||| ||    |||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||    
T  28130660 actggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattcttagacctg 28130756  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    ||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28130757 aaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttaat 28130855  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  28130856 gaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 146
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235451
Alignment:
Q  56 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 234  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  235 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 234  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  235 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19393726 - 19393462
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19393726 gagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19393628  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | | |||||| |   | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19393627 actagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctg 19393531  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 306  Q
    || ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393530 aatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  138 ttggattga 146  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 15148308 - 15148363
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 78  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148308 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 19859113 - 19859221
Alignment:
Q  28 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 127  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19859113 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19859211  T
Q  128 aatatttata 137  Q
    ||||||||||    
T  19859212 aatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 333
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  196 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  296 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 333  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 170
Target Start/End: Original strand, 3132849 - 3132986
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 131  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  3132849 gcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taata 3132947  T
Q  132 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132948 tttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  42 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 141  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  142 attgatccgtcatgagaat 160  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 311  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  312 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 311  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  312 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 218  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  219 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 258  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 115
Target Start/End: Original strand, 7396361 - 7396450
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgta---ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 115  Q
    |||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396361 aaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 244  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  195 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 270  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  156 agaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 255  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  256 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  102 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 160  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 126
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  71 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 39111989 - 39112092
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 133  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39111989 atagagactattataagggtagactaatggtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatt 39112088  T
Q  134 tata 137  Q
    ||||    
T  39112089 tata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 75
Target Start/End: Original strand, 2365070 - 2365112
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 75  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365070 catagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 254
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  190 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 254  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18774
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18454 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18553  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18653  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18753  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  18754 gat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26031 - 25706
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26031 atcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatatta 25932  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 25832  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 25732  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatgatga 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  25731 gatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21330289 - 21329968
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330289 atcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21330190  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330189 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21330090  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21330089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggtt 21329990  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21329989 gatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 18796672 - 18796993
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796672 atcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18796771  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796772 ggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattc 18796871  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18796872 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgtt 18796971  T
Q  323 gatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18796972 gatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Original strand, 18619976 - 18620296
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18619976 aaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagta 18620075  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18620076 atatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttat-gaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccct 18620174  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 328  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18620175 ttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatggg 18620274  T
Q  329 tactccatgaatcatgatgatg 350  Q
    |||||||  ||||||| |||||    
T  18620275 tactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 36270338 - 36270650
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36270338 aaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagta 36270437  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 227  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||  |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36270438 atatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-caccc 36270533  T
Q  228 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 327  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36270534 ttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgg 36270633  T
Q  328 gtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||| ||||||||||    
T  36270634 gtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22183518 - 22183206
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183518 aaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagta 22183419  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 227  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||   || |||||  |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22183418 ata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccc 22183323  T
Q  228 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 327  Q
    || ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22183322 tttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgg 22183223  T
Q  328 gtactccatgaatcatg 344  Q
    ||| |  ||||||||||    
T  22183222 gtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 344
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  73 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  173 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 271  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  272 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 129  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  130 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattat-gtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 327  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 332
Target Start/End: Original strand, 18822249 - 18822556
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18822249 atcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatatta 18822348  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtatt 221  Q
       ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||  ||| |||||  ||||  ||  |||  |||||||||  ||| |||||||||||    
T  18822349 atggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-atctcaagtcattctcatatagataagtggtgtatt 18822445  T
Q  222 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18822446 ccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggt 18822545  T
Q  322 tgatgggtact 332  Q
    | |||||||||    
T  18822546 taatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174679
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 30174572  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  30174573 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 30174671  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  30174672 gaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250032
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 24250139  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  24250138 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 24250040  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  24250039 gaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229215
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | ||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttg 24229322  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||    
T  24229321 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgat 24229223  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  24229222 gaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Original strand, 19279460 - 19279600
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  19279460 aaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagta 19279559  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279560 atatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851977
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  138 ttggattga 146  Q
    |||||||||    
T  18851985 ttggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 346
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800775
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 234  Q
    ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| |||     
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagact 29800664  T
Q  235 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 334  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||      
T  29800665 tgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatgggcacttg 29800763  T
Q  335 atgaatcatgat 346  Q
    | ||||||||||    
T  29800764 acgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 344
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  181 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  281 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  43 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 141  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  142 attga 146  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
      || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctg 19616630  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgt 259  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  19616631 aaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  197 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 246  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  39 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  139 tggattga 146  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 344
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  277 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  114 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  214 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 313  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  314 aagttg 319  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 247  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  183 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  108 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24763867 - 24763751
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  24763867 aaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagta 24763769  T
Q  129 atatttatattggattga 146  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24763768 atatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12098649 - 12098609
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098649 catagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1461
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatatta 1258  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 agagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 1358  T
Q  223 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1359 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggtt 1458  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  1459 gat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Original strand, 5695 - 6013
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5794  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||    
T  5795 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcatt 5885  T
Q  222 cca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 320  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886 ccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 5985  T
Q  321 ttgatgggtactccatgaatcatgatga 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5986 ttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 88 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  88 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  188 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  288 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 183 - 485
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 378  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 477  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  478 gaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3675
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3782  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3781 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 3683  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  3682 gaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120032
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 119925  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  119926 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 120024  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  120025 gaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13251 - 12961
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13251 gagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 13153  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  13152 accggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctg 13056  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 332  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13055 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130262
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 130331  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 306  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130330 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 67676 - 67374
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67676 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 67578  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  67577 attggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 67481  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  67480 aaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 67382  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  67381 gaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  237 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 336  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  337 gaatcatg 344  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8511
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8500  T
Q  237 aaaccactatg 247  Q
    |||||||||||    
T  8501 aaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  205 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 304  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  305 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 90151 - 90033
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 127  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  90151 aaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtat 90052  T
Q  128 aatatttatattggattga 146  Q
    || ||||||||||||||||    
T  90051 aacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Original strand, 8723 - 9005
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||| |||  |   ||||  | |||||||||||||||    
T  8723 aaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatgatcacgtctcacatgtcatagatat-gagatattaaggatatgcatatgtgtaaatattaggagta 8821  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 228  Q
    ||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |     
T  8822 atatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataatggtgtataccactcc 8918  T
Q  229 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 316  Q
    | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8919 tagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactataaag 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 344
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  154 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 253  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  254 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  209 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 308  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  309 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 344  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 211  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  212 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 247  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 344
Target Start/End: Original strand, 53766 - 54066
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 237  Q
     ||| |||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||   || || | || |||    | ||| |||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcaacatgttaatagtttatattgctcttagacctga 53961  T
Q  238 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 337  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  53962 aaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 54059  T
Q  338 aatcatg 344  Q
    |||||||    
T  54060 aatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  76 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 167  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15133 - 15089
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15133 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1358 times since January 2019
Visitors: 1298