View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0100_low_12 (Length: 262)

Name: NF0100_low_12
Description: NF0100
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0100_low_12
NF0100_low_12
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (18-176)||(29763549-29763707)
chr8 (18-176)||(21579887-21580046)
chr8 (18-159)||(42560208-42560350)
chr8 (58-168)||(32807285-32807396)
chr8 (48-176)||(41680833-41680962)
chr8 (18-159)||(18760564-18760706)
chr8 (49-137)||(27472391-27472478)
chr8 (49-137)||(38550086-38550173)
chr8 (48-137)||(1327119-1327207)
chr8 (39-173)||(39833887-39834023)
chr8 (18-117)||(3273212-3273310)
chr8 (77-150)||(20982747-20982820)
chr8 (88-137)||(39936813-39936862)
chr8 (88-136)||(19139966-19140014)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (18-176)||(12122202-12122361)
chr5 (18-176)||(21557726-21557885)
chr5 (18-176)||(21555060-21555219)
chr5 (31-171)||(24212385-24212526)
chr5 (18-176)||(30615768-30615926)
chr5 (20-176)||(31455702-31455862)
chr5 (31-168)||(35852643-35852781)
chr5 (18-159)||(36460199-36460341)
chr5 (20-176)||(31455089-31455249)
chr5 (18-176)||(5889092-5889252)
chr5 (77-170)||(17875232-17875326)
chr5 (48-137)||(5889269-5889357)
chr5 (48-137)||(29915167-29915255)
chr5 (48-137)||(21871656-21871743)
chr5 (48-137)||(21875936-21876023)
chr5 (111-139)||(21871593-21871621)
chr5 (111-139)||(21875873-21875901)
chr5 (111-139)||(22120217-22120245)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (18-176)||(33186114-33186273)
chr4 (31-168)||(15880717-15880855)
chr4 (18-176)||(13844584-13844744)
chr4 (18-159)||(35812171-35812312)
chr4 (48-137)||(52873251-52873339)
chr4 (49-137)||(362185-362272)
chr4 (58-159)||(9923326-9923427)
chr4 (58-159)||(11479432-11479533)
chr4 (48-137)||(46642773-46642861)
chr4 (18-171)||(46642884-46643038)
chr4 (48-137)||(13844478-13844566)
chr4 (18-97)||(14185252-14185331)
chr4 (48-137)||(15868794-15868881)
chr4 (51-156)||(630862-630966)
chr4 (88-137)||(19609524-19609573)
chr4 (99-166)||(15190360-15190428)
chr4 (64-148)||(21189751-21189834)
chr4 (99-176)||(15099383-15099461)
chr4 (111-139)||(630796-630824)
chr4 (111-139)||(13812831-13812859)
chr4 (111-139)||(15868731-15868759)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (18-168)||(6359-6510)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (18-176)||(31224635-31224794)
chr3 (18-176)||(15447681-15447837)
chr3 (50-176)||(31415416-31415543)
chr3 (18-144)||(11912966-11913092)
chr3 (35-168)||(6808157-6808291)
chr3 (48-159)||(49969963-49970075)
chr3 (18-137)||(1988912-1989032)
chr3 (48-137)||(18439941-18440029)
chr3 (48-137)||(20630191-20630279)
chr3 (58-137)||(49389772-49389852)
chr3 (79-159)||(40812015-40812096)
chr3 (18-171)||(12269620-12269773)
chr3 (48-137)||(12269509-12269597)
chr3 (58-159)||(5841958-5842061)
chr3 (75-137)||(30175304-30175366)
chr3 (88-159)||(40807173-40807245)
chr3 (99-176)||(1465419-1465497)
chr3 (99-176)||(18439845-18439923)
chr3 (88-159)||(22307386-22307458)
chr3 (111-139)||(12852390-12852418)
chr3 (88-159)||(17538284-17538356)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (18-176)||(30820937-30821096)
chr7 (21-176)||(36685934-36686090)
chr7 (18-168)||(11085019-11085170)
chr7 (18-168)||(11092757-11092908)
chr7 (19-159)||(15213728-15213869)
chr7 (50-176)||(38480249-38480376)
chr7 (31-168)||(9320423-9320561)
chr7 (18-146)||(15439328-15439457)
chr7 (48-137)||(8468366-8468454)
chr7 (48-137)||(14270138-14270226)
chr7 (18-137)||(37727607-37727727)
chr7 (49-137)||(45847735-45847822)
chr7 (48-137)||(17232560-17232648)
chr7 (30-159)||(11391870-11392001)
chr7 (88-159)||(12371455-12371527)
chr7 (88-159)||(13148275-13148347)
chr7 (79-137)||(8851959-8852017)
chr7 (99-176)||(9389705-9389783)
chr7 (99-176)||(17232666-17232744)
chr7 (91-137)||(32434396-32434442)
chr7 (88-125)||(11066680-11066717)
chr7 (48-137)||(18302107-18302194)
chr7 (111-139)||(39267712-39267740)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (19-176)||(1578-1736)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (19-176)||(24865452-24865610)
chr2 (30-176)||(22501001-22501148)
chr2 (30-176)||(22508935-22509082)
chr2 (19-176)||(7672240-7672392)
chr2 (18-134)||(2524410-2524526)
chr2 (20-159)||(6576403-6576543)
chr2 (77-144)||(22501128-22501195)
chr2 (77-144)||(22509062-22509129)
chr2 (77-159)||(24883630-24883713)
chr2 (58-122)||(24436258-24436321)
chr2 (88-159)||(24781643-24781715)
chr2 (88-159)||(5032127-5032199)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (18-176)||(14352-14511)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (18-168)||(20734128-20734279)
chr6 (31-168)||(2201139-2201277)
chr6 (33-168)||(22420987-22421123)
chr6 (21-159)||(34296953-34297092)
chr6 (18-176)||(27851213-27851373)
chr6 (52-159)||(19399787-19399895)
chr6 (18-176)||(25956537-25956697)
chr6 (48-137)||(25956715-25956803)
chr6 (58-159)||(18927853-18927954)
chr6 (48-156)||(27851087-27851195)
chr6 (49-137)||(31630622-31630709)
chr6 (88-159)||(27322221-27322293)
chr6 (58-159)||(28708651-28708754)
chr6 (88-137)||(18708700-18708749)
chr6 (88-137)||(23151069-23151118)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (20-148)||(12328538-12328666)
chr1 (39-168)||(51274290-51274420)
chr1 (31-139)||(8885447-8885555)
chr1 (58-139)||(51326893-51326974)
chr1 (18-176)||(28194365-28194525)
chr1 (18-176)||(43697418-43697578)
chr1 (48-137)||(28194543-28194631)
chr1 (48-117)||(43543069-43543137)
chr1 (48-137)||(43697312-43697400)
chr1 (49-137)||(46382652-46382737)
chr1 (99-176)||(20636883-20636961)
chr1 (79-159)||(48301040-48301121)
chr1 (99-170)||(49261380-49261452)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (18-144)||(4660-4786)
scaffold0599 (18-144)||(242-368)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (31-176)||(10907-11053)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (62-176)||(496-611)
[»] scaffold0116 (4 HSPs)
scaffold0116 (18-176)||(43700-43860)
scaffold0116 (18-176)||(47620-47780)
scaffold0116 (48-137)||(43878-43966)
scaffold0116 (48-88)||(47798-47837)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (48-137)||(6770-6859)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (29-165)||(15419-15556)
scaffold0061 (29-165)||(24477-24614)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (26-168)||(59295-59437)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (48-137)||(36142-36230)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (48-137)||(85187-85275)
scaffold0009 (99-169)||(85300-85371)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (18-159)||(3093-3234)
[»] scaffold0810 (2 HSPs)
scaffold0810 (57-137)||(2984-3063)
scaffold0810 (18-87)||(3066-3136)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (58-159)||(834-935)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (48-137)||(10963-11051)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (48-117)||(362964-363032)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (58-137)||(76942-77019)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (58-137)||(5478-5556)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (48-137)||(8379-8466)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (88-159)||(10029-10101)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (58-159)||(2449-2552)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (89-159)||(9106-9177)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (88-159)||(8189-8261)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (99-176)||(2300-2378)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (48-137)||(24739-24826)
scaffold0124 (111-139)||(24676-24704)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (111-139)||(9927-9955)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (111-139)||(7670-7698)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 29763549 - 29763707
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763549 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 29763648  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtgattgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763649 tgttatatatgatgattattatcgatggtgattgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 29763707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 21579887 - 21580046
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21579887 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21579986  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21579987 tgttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 21580046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 42560208 - 42560350
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42560208 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaaattgtaat 42560307  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  42560308 tgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 42560350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32807396 - 32807285
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgca 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32807396 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 32807297  T
Q  157 tatgtttaaatg 168  Q
    ||||| ||||||    
T  32807296 tatgtctaaatg 32807285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Original strand, 41680833 - 41680962
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtg 147  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41680833 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatattgatatcaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 41680932  T
Q  148 a-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41680933 acttgctgcatatgtttaaatggtgatgtc 41680962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18760706 - 18760564
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18760706 cagagagtatgaataagatgattaatattgtgggtttaagtagatgattaaatgtgaaaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataat 18760607  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
     ||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  18760606 ggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 18760564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 27472391 - 27472478
Alignment:
Q  49 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  27472391 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 27472478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 38550086 - 38550173
Alignment:
Q  49 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  38550086 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 38550173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 1327119 - 1327207
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  1327119 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaacgatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 1327207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 39834023 - 39833887
Alignment:
Q  39 ttaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttg-taattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  39834023 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataacgtgaatgttgttgatatgaagttgcaaatggttatatatgaagattatt 39833924  T
Q  138 atcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgat 173  Q
    || |||||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  39833923 attgatggttactcgctgtatatgtttaaatgatgat 39833887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3273310 - 3273212
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  3273310 cagagagtatgaataagatgattaatgttatggatttaagttgatgattaaatgtg-aaagatttatatattgtgaaaaatgttggtatgaagttgtaat 3273212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 20982747 - 20982820
Alignment:
Q  77 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtgatt 150  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | |||| |||||    
T  20982747 atatatatatattgtgaaagatattgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgatt 20982820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Original strand, 39936813 - 39936862
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  39936813 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattatt 39936862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19140014 - 19139966
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattat 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  19140014 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattat 19139966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 12122202 - 12122361
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122202 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 12122301  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12122302 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtc 12122361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 21557726 - 21557885
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557726 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21557825  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21557826 tgttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 21557885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 21555060 - 21555219
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21555060 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgacataaagttgtaat 21555159  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21555160 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 21555219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24212526 - 24212385
Alignment:
Q  31 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212526 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 24212427  T
Q  131 gattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatg 171  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24212426 gattaatattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatgatg 24212385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30615926 - 30615768
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30615926 cagagaggatgaataagatgattaatattgataatttacttttatgattaaatgtgaaaatatt-atatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 30615828  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30615827 tgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtc 30615768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31455862 - 31455702
Alignment:
Q  20 gagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31455862 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatatgaagttgtaatcg 31455763  T
Q  120 ttatatatga---tgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31455762 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 31455702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35852781 - 35852643
Alignment:
Q  31 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  35852781 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatacgat 35852682  T
Q  131 gattattatcgatggt-gattgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  35852681 gattattattgatggtggcttgctgcatatgtctaaatg 35852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36460341 - 36460199
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36460341 cagagaggatgaacaagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 36460242  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  36460241 tgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 36460199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31455249 - 31455089
Alignment:
Q  20 gagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  31455249 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatattaagttgtaatcg 31455150  T
Q  120 ttatatatga---tgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||| ||||   |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31455149 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 31455089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 5889092 - 5889252
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  5889092 cagagaggatgattatgatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 5889191  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5889192 ttgttatacatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 5889252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17875326 - 17875232
Alignment:
Q  77 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgat 170  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17875326 atatttatataatgataaagacgttgatatgaagttctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgat 17875232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 5889269 - 5889357
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5889269 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 5889357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 29915167 - 29915255
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  29915167 atgatctactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 29915255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 21871656 - 21871743
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  21871656 atgatttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattatt 21871743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 21875936 - 21876023
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  21875936 atgatttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattatt 21876023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 21871593 - 21871621
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21871593 ttgtaattgttatatatgatgattattat 21871621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 21875873 - 21875901
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21875873 ttgtaattgttatatatgatgattattat 21875901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 22120217 - 22120245
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120217 ttgtaattgttatatatgatgattattat 22120245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33186273 - 33186114
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33186273 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaat 33186174  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33186173 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtc 33186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15880855 - 15880717
Alignment:
Q  31 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 130  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15880855 taagatgatcaatattgatgatttactttgattattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 15880756  T
Q  131 gattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  15880755 gattattattgatggtgacttgctacatatgtctaaatg 15880717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13844744 - 13844584
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  13844744 cagagaggatgattaagatgatttaatattattgatttacgttgatgattaaatgtgaaaatatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 13844645  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  13844644 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtc 13844584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 35812171 - 35812312
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35812171 cagagagtataaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtggaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 35812269  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
     |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  35812270 ggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 35812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 52873251 - 52873339
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  52873251 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 52873339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 362272 - 362185
Alignment:
Q  49 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||    
T  362272 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattatt 362185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9923427 - 9923326
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgca 156  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  9923427 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 9923329  T
Q  157 tat 159  Q
    |||    
T  9923328 tat 9923326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 11479432 - 11479533
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgca 156  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  11479432 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 11479530  T
Q  157 tat 159  Q
    |||    
T  11479531 tat 11479533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 46642861 - 46642773
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46642861 atgatttaatttgatgattaa-tgtgagaagatttataaactgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattatt 46642773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 46643038 - 46642884
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  || || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  46643038 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tgcgaaaagatttatatattgtgaaagttgttaatatgaagttgtaa 46642940  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatg 171  Q
    |||||| |||||| || |||||| | |||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  46642939 ttgttacatatgaagaatattattggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatg 46642884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13844566 - 13844478
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  13844566 atgatttactttgattattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgattattatt 13844478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14185331 - 14185252
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||  || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14185331 cagagagtatgaataagatgattaacgttgttgttttaagttgatggttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 14185252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 15868794 - 15868881
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15868794 atgatttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattatatctgatgattatt 15868881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 156
Target Start/End: Original strand, 630862 - 630966
Alignment:
Q  51 atttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-t 149  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||| ||| |    
T  630862 atttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattattgatgttgact 630959  T
Q  150 tgctgca 156  Q
    |||||||    
T  630960 tgctgca 630966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19609573 - 19609524
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19609573 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattatt 19609524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15190428 - 15190360
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaa 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||    
T  15190428 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Original strand, 21189751 - 21189834
Alignment:
Q  64 attaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga 148  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21189751 attaaaagtggaaatatttatatgttatgaaagatgttgatat-cagttatacttgttgtatatgatgattattattgttggtga 21189834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15099461 - 15099383
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  15099461 gttgatatgaagttgaaattgttatacataaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaaagatgttgtc 15099383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 630796 - 630824
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  630796 ttgtaattgttatatatgatgattattat 630824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 13812831 - 13812859
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812831 ttgtaattgttatatatgatgattattat 13812859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 15868731 - 15868759
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15868731 ttgtaattgttatatatgatgattattat 15868759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 6359 - 6510
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6359 cagagaggatgaataagatgattaataataatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 6458  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6459 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 6510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 31224635 - 31224794
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224635 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 31224734  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31224735 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 31224794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 15447681 - 15447837
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447681 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 15447780  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||   ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15447781 tgttatat---atgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 15447837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31415543 - 31415416
Alignment:
Q  50 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga- 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31415543 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 31415444  T
Q  149 ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31415443 ttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 31415416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11913092 - 11912966
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11913092 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11912993  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatg 144  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11912992 tgttatatatgattattattattgatg 11912966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6808291 - 6808157
Alignment:
Q  35 atgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgatt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6808291 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatataatgatt 6808192  T
Q  135 attatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||| ||||||    
T  6808191 attattgatggtgacttccttcatatgtctaaatg 6808157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 159
Target Start/End: Original strand, 49969963 - 49970075
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  49969963 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttg 49970062  T
Q  148 a-ttgctgcatat 159  Q
    | |||||||||||    
T  49970063 acttgctgcatat 49970075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 1988912 - 1989032
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1988912 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgattcacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 1989011  T
Q  117 ttgttatatatgatgattatt 137  Q
    | ||| ||| |||||||||||    
T  1989012 tggttgtatttgatgattatt 1989032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 18439941 - 18440029
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18439941 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatctatatattgtgaaagatgatgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 18440029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 20630191 - 20630279
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  20630191 atgatttactttgacgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 20630279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 49389772 - 49389852
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatattta--tatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49389772 ttgatgattaaatgtgaaaatatttagatatattgtgaa-gttgttgatatgaagttgtaattgttatatttgatgattatt 49389852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40812096 - 40812015
Alignment:
Q  79 atttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  40812096 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40812015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12269773 - 12269620
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  || || |  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  12269773 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tga-aaaagatttatatattgtgaaagttgttgatatgaagttgtat 12269676  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatg 171  Q
    || ||| |||||| || |||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  12269675 tttttacatatgaagaatattatcggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatg 12269620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12269597 - 12269509
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  12269597 atgatttaagttgatgattaa-tgtgagaagatttataaattttgaaggacgttgatatgaagttgtaatgattatatttgatgattatt 12269509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5842061 - 5841958
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgc 155  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  5842061 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgc 5841962  T
Q  156 atat 159  Q
    ||||    
T  5841961 atat 5841958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Original strand, 30175304 - 30175366
Alignment:
Q  75 aaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  30175304 aaatatttatatactgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggatatatgggatgattatt 30175366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40807245 - 40807173
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  40807245 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40807173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 1465419 - 1465497
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  1465419 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctctatatgtttaaatgatgttgtc 1465497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 18439845 - 18439923
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  18439845 gttgatatgtagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtc 18439923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 22307386 - 22307458
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  22307386 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 22307458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 12852390 - 12852418
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852390 ttgtaattgttatatatgatgattattat 12852418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17538356 - 17538284
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  17538356 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtattgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 17538284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 30820937 - 30821096
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30820937 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaagttgtaat 30821036  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30821037 tgttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 30821096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 36685934 - 36686090
Alignment:
Q  21 agaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36685934 agaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgctgatatgaagttttaattgt 36686033  T
Q  121 tatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36686034 tatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 36686090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11085170 - 11085019
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11085170 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaactatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11085071  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  11085070 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatacgattaaatg 11085019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11092908 - 11092757
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11092908 cagagagtgtgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaat 11092809  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11092808 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgttgcatacgtttaaatg 11092757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15213869 - 15213728
Alignment:
Q  19 agagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15213869 agagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacattgatatgaaattgtaatt 15213770  T
Q  119 gttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  15213769 gttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 15213728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38480376 - 38480249
Alignment:
Q  50 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga- 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  38480376 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 38480277  T
Q  149 ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38480276 ttgctgcatatatttaaatgatgttgtc 38480249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Original strand, 9320423 - 9320561
Alignment:
Q  31 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9320423 taagatgattaatattgatgatttattttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 9320522  T
Q  131 gattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  9320523 gattattattgatggtgacttgttgcatatgtctaaatg 9320561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15439457 - 15439328
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15439457 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 15439358  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggt 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15439357 ttgttatatatgaagattattattgatggt 15439328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8468454 - 8468366
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8468454 atgatttactttgatgattaa-tgtgataatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 8468366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 14270138 - 14270226
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  14270138 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 14270226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 37727607 - 37727727
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  37727607 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgctttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgtagatatgaagttgtaa 37727706  T
Q  117 ttgttatatatgatgattatt 137  Q
    | ||| ||| |||||||||||    
T  37727707 tggttgtatttgatgattatt 37727727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 45847735 - 45847822
Alignment:
Q  49 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  45847735 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 45847822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17232648 - 17232560
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||    
T  17232648 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttggaatggttgtattagatgattatt 17232560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 159
Target Start/End: Original strand, 11391870 - 11392001
Alignment:
Q  30 ataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatg 128  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  11391870 ataagatgattaatgttgtggatttaaattgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattgg 11391969  T
Q  129 atgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  11391970 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 11392001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12371527 - 12371455
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  12371527 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 12371455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 13148275 - 13148347
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  13148275 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 13148347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Original strand, 8851959 - 8852017
Alignment:
Q  79 atttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  8851959 atttatatattgtgaaagattttgatataaagttgtaatggttatatgggatgattatt 8852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 9389705 - 9389783
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9389705 gttgatatgaagttgaaattgatatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 9389783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17232744 - 17232666
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||  |||||| | ||| || |||||||||||||||||||||    
T  17232744 gttgatatggagttgcaaatgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgatgtc 17232666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Original strand, 32434396 - 32434442
Alignment:
Q  91 tgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  32434396 tgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattatt 32434442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11066717 - 11066680
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatat 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11066717 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttatat 11066680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18302194 - 18302107
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  18302194 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgaagatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattatt 18302107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 39267712 - 39267740
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267712 ttgtaattgttatatatgatgattattat 39267740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1736 - 1578
Alignment:
Q  19 agagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736 agagaggattaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 1637  T
Q  119 gttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1636 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 24865452 - 24865610
Alignment:
Q  19 agagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24865452 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatt 24865551  T
Q  119 gttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24865552 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 24865610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22501148 - 22501001
Alignment:
Q  30 ataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22501148 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22501049  T
Q  130 tgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22501048 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtc 22501001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22509082 - 22508935
Alignment:
Q  30 ataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22509082 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22508983  T
Q  130 tgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22508982 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtc 22508935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 7672240 - 7672392
Alignment:
Q  19 agagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  7672240 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaag------tt 7672333  T
Q  119 gttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  7672334 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatacgtttaaatgatgctgtc 7672392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 2524410 - 2524526
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2524410 cagagagtatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatcaaattgtaat 2524509  T
Q  118 tgttatatatgatgatt 134  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2524510 tgttacatatgatgatt 2524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6576543 - 6576403
Alignment:
Q  20 gagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6576543 gagagtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaaagtgaaaaaatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgg 6576444  T
Q  120 ttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  6576443 ttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 6576403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22501195 - 22501128
Alignment:
Q  77 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatg 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  22501195 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22501128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22509129 - 22509062
Alignment:
Q  77 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatg 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  22509129 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22509062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24883713 - 24883630
Alignment:
Q  77 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  24883713 atatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24883630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24436321 - 24436258
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgtta 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  24436321 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaatggtta 24436258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 24781643 - 24781715
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  24781643 ttgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24781715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 5032127 - 5032199
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  5032127 ttgtgaaaaatgttgatatgaagttataatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 5032199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14511 - 14352
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14511 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 14412  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14411 tgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 14352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20734128 - 20734279
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20734128 cagagaggatgaataaaatgatttatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 20734227  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20734228 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 20734279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2201277 - 2201139
Alignment:
Q  31 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2201277 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatatgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 2201178  T
Q  131 gattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2201177 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatg 2201139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22421123 - 22420987
Alignment:
Q  33 agatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatga 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22421123 agatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatga 22421024  T
Q  133 ttattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    ||||||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  22421023 ttattattgatagtgacttgttgcatatgtctaaatg 22420987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 34296953 - 34297092
Alignment:
Q  21 agaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34296953 agaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattagatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgt 34297052  T
Q  121 tatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  34297053 tatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 34297092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27851373 - 27851213
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa- 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27851373 cagagaggatgaataagatgatttatattgatgatttaccttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 27851274  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  27851273 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtgtatgtttaaatgatgttgtc 27851213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19399895 - 19399787
Alignment:
Q  52 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-tt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||    
T  19399895 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgactt 19399796  T
Q  151 gctgcatat 159  Q
    |||||||||    
T  19399795 gctgcatat 19399787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 25956537 - 25956697
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  25956537 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 25956636  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25956637 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 25956697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 25956715 - 25956803
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  25956715 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 25956803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18927954 - 18927853
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgca 156  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  18927954 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 18927856  T
Q  157 tat 159  Q
    |||    
T  18927855 tat 18927853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27851195 - 27851087
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtg 147  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  27851195 atgatttactttgatgcttaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgattattgtcgatgttg 27851097  T
Q  148 a-ttgctgca 156  Q
    | ||||||||    
T  27851096 acttgctgca 27851087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 31630622 - 31630709
Alignment:
Q  49 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||    
T  31630622 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattatt 31630709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 27322221 - 27322293
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  27322221 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 27322293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28708754 - 28708651
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgc 155  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  28708754 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgc 28708655  T
Q  156 atat 159  Q
    ||||    
T  28708654 atat 28708651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18708749 - 18708700
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  18708749 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattatt 18708700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Original strand, 23151069 - 23151118
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23151069 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattatt 23151118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Original strand, 12328538 - 12328666
Alignment:
Q  20 gagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12328538 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatttgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagatgtaattg 12328637  T
Q  120 ttatatatgatgattattatcgatggtga 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12328638 ttatatatgatgattattattgatggtga 12328666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 168
Target Start/End: Original strand, 51274290 - 51274420
Alignment:
Q  39 ttaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatta 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51274290 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattatta 51274389  T
Q  139 tcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51274390 ttgatggtgacttgatgcatatgtttaaatg 51274420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8885555 - 8885447
Alignment:
Q  31 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8885555 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgtaatatatgat 8885456  T
Q  131 gattattat 139  Q
    |||| ||||    
T  8885455 gattgttat 8885447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 51326974 - 51326893
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51326974 ttgatgattaaatgtgaacatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgttgattattat 51326893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 28194365 - 28194525
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  28194365 cagagaagatgattaggatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaaaatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 28194464  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28194465 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 28194525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43697578 - 43697418
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  43697578 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaagatctatatagtgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43697479  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
     |||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  43697478 atgttatatatgaagattattattgttggttacttgctgtatatgtttatatgatgctgtc 43697418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 28194543 - 28194631
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  28194543 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 28194631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 43543137 - 43543069
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43543137 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 43543069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 43697400 - 43697312
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  43697400 atgatttactttgatgattaa-tgtgagattattgatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttttatttgatgattatt 43697312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 46382652 - 46382737
Alignment:
Q  49 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  46382652 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttata--ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttttattagatgattatt 46382737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20636961 - 20636883
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20636961 gttgacatgaagttgtaattgttatacatgaatattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 20636883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48301121 - 48301040
Alignment:
Q  79 atttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  48301121 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttacatgagattattattgttgatgttgacttgctgcatat 48301040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 49261452 - 49261380
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgat 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| |  |||||||||||||||    
T  49261452 gttgatatgaagttgtaattgttatacatgaagattattattgatggttacttgttatatatgtttaaatgat 49261380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4786 - 4660
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4786 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 4687  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatg 144  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4686 tgttatatatgattattattattgatg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 242
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  368 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattatatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 269  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatg 144  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  268 tgttatatatgattattattattgatg 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11053 - 10907
Alignment:
Q  31 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 130  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11053 taagatgattaatgttgatgatttactatgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaatttttaattgttatatatgat 10954  T
Q  131 gattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10953 gattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 10907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 611 - 496
Alignment:
Q  62 tgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatg 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  611 tgattaaatgagaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattataattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 512  T
Q  161 tttaaatgatgatgtc 176  Q
    || |||||||| ||||    
T  511 ttaaaatgatgttgtc 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43860
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  43700 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43799  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43800 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 43860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 47620 - 47780
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  47620 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 47719  T
Q  117 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  47720 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtc 47780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 43878 - 43966
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  43878 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 43966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Original strand, 47798 - 47837
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatat 88  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47798 atgatttactttgatgatt-aatgtgagaatatttatatat 47837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 6770 - 6859
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  6770 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatggagttgtaatgattatatttgatgattatt 6859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 15419 - 15556
Alignment:
Q  29 aataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatg 128  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  15419 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 15518  T
Q  129 atgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaa 165  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  15519 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 24477 - 24614
Alignment:
Q  29 aataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatg 128  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  24477 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 24576  T
Q  129 atgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaa 165  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  24577 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 24614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 59295 - 59437
Alignment:
Q  26 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatat 125  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59295 atgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatat 59393  T
Q  126 atgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatg 168  Q
      |||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  59394 tggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatg 59437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 36142 - 36230
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36142 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattatt 36230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 85275 - 85187
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  85275 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttgtatttgatgattatt 85187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 85371 - 85300
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatga 169  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  85371 gttgatatggagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgatgtatatgtttaaatga 85300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3234 - 3093
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3234 cagagagtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatatcgtgaaaaatgttgatatgaagttgtaat 3136  T
Q  118 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
     |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  3135 ggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3063 - 2984
Alignment:
Q  57 tttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3063 tttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 2984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3066
Alignment:
Q  18 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatata 87  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3136 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatata 3066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 834
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgca 156  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  935 ttgatgattaaatgtgaaag-attaatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 837  T
Q  157 tat 159  Q
    |||    
T  836 tat 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 10963 - 11051
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  10963 atgatttactttgatgattta-tgtgagaatatttatatattgtaaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattatt 11051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 363032 - 362964
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  363032 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattttgaaagatgttgatatgaagttgtaat 362964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 77019 - 76942
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  77019 ttgatgattaaatgtgaaaat--ttatatattgtgaaagatgtggatatgaagttgtaatggttatattggatgattatt 76942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 5478 - 5556
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  5478 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaggtgttgatatgaagttgtaatgtttatattggatgattatt 5556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 8379 - 8466
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  8379 atgatttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattatt 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 10029 - 10101
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  10029 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2552
Alignment:
Q  58 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgc 155  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  2449 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgc 2548  T
Q  156 atat 159  Q
    ||||    
T  2549 atat 2552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Original strand, 9106 - 9177
Alignment:
Q  89 tgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  9106 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 8189 - 8261
Alignment:
Q  88 ttgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || | |||| ||| |||||||||||    
T  8189 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattgttgttgatgttgacttgctgcatat 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2378
Alignment:
Q  99 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||  |||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  2300 gttgatatgaagttgaaattgttgtacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgtc 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 24739 - 24826
Alignment:
Q  48 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  24739 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattatt 24826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 24676 - 24704
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676 ttgtaattgttatatatgatgattattat 24704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9955 - 9927
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955 ttgtaattgttatatatgatgattattat 9927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 139
Target Start/End: Original strand, 7670 - 7698
Alignment:
Q  111 ttgtaattgttatatatgatgattattat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7670 ttgtaattgttatatatgatgattattat 7698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1722 times since January 2019
Visitors: 1426