View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0136_low_3 (Length: 255)
Name: NF0136_low_3
Description: NF0136
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF0136_low_3 |
 | |
|
| [»] scaffold0129 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 335542 - 335776
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
335542 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
335641 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
335642 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
335741 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
335742 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgttgatgt |
335776 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3522653 - 3522887
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3522653 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
3522752 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3522753 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
3522852 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3522853 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
3522887 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10269442 - 10269208
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10269442 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
10269343 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10269342 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
10269243 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
10269242 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
10269208 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2272566 - 2272800
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2272566 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
2272665 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2272666 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
2272765 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2272766 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgttgatgt |
2272800 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3534880 - 3535114
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3534880 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
3534979 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3534980 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtta |
3535079 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3535080 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
3535114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12532941 - 12533175
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12532941 |
aaccagcaaaatatcctgacaaggagaatgttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
12533040 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12533041 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
12533140 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
12533141 |
tttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
12533175 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7356748 - 7356517
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7356748 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgttt--gagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
7356651 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7356650 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttggg-aattcaagcaccgacatggcataaagtca |
7356552 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
7356551 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtttgttgatgt |
7356517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23717474 - 23717240
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23717474 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
23717375 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23717374 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
23717275 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
23717274 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
23717240 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32742453 - 32742219
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32742453 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
32742354 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32742353 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
32742254 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
32742253 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
32742219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 35216397 - 35216631
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35216397 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
35216496 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35216497 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
35216596 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
35216597 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
35216631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 38223153 - 38223387
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38223153 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
38223252 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38223253 |
aagagatacaacgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
38223352 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
38223353 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
38223387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9313796 - 9313562
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9313796 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcataggagaattaattttgcagaaggc |
9313697 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9313696 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcactgacatggcataaagtca |
9313597 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
9313596 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
9313562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 42988933 - 42989167
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42988933 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
42989032 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42989033 |
aagagatacaatgaaacttctgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
42989132 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
42989133 |
tttcgtcgttttggcgagagtgagtctgttgatgt |
42989167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14218954 - 14219188
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218954 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
14219053 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219054 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
14219153 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
14219154 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
14219188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30704339 - 30704105
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30704339 |
aaccaacaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
30704240 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30704239 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacatgatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
30704140 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
30704139 |
tttcatcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
30704105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14677121 - 14677355
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14677121 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
14677220 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14677221 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
14677320 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
14677321 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
14677355 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 45106880 - 45107114
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45106880 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
45106979 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45106980 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
45107079 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
45107080 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
45107114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 21395688 - 21395911
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395688 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
21395787 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395788 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
21395887 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtggg |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395888 |
tttcgtcgttttggcgagagtggg |
21395911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1085827 - 1085593
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1085827 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgtagaaggc |
1085728 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1085727 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
1085628 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
1085627 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
1085593 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17195608 - 17195378
Alignment:
| Q |
5 |
agcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggcaaga |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17195608 |
agcaaaatatcctgatatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggcaaga |
17195509 |
T |
|
| Q |
105 |
gatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtcatttc |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17195508 |
gatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctgtacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtcatttc |
17195409 |
T |
|
| Q |
205 |
gtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17195408 |
gtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
17195378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10485435 - 10485669
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10485435 |
aaccagcaaaatatcctgacgtggagaaggttgtttatgagtggtttttacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
10485534 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10485535 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatgacttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
10485634 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
10485635 |
tttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
10485669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 49550322 - 49550105
Alignment:
| Q |
8 |
aaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggcaagagat |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49550322 |
aaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggcaagagat |
49550223 |
T |
|
| Q |
108 |
acaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtcatttcgtc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
49550222 |
acaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtcatttcatc |
49550123 |
T |
|
| Q |
208 |
gttttggcgagagtgggt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49550122 |
cttttggcgagagtgggt |
49550105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 5926539 - 5926651
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926539 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
5926638 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
5926639 |
aagagatacaatg |
5926651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27182583 - 27182471
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182583 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
27182484 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
27182483 |
aagagatacaatg |
27182471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44553535 - 44553301
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44553535 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
44553436 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44553435 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
44553336 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
44553335 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
44553301 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38518397 - 38518163
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38518397 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
38518298 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38518297 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
38518198 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
38518197 |
tttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
38518163 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34945555 - 34945789
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34945555 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaatgttgtttatgagtggtttctacaacatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
34945654 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34945655 |
aagagatacaatgaaactcttgcaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
34945754 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
34945755 |
tttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
34945789 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27644633 - 27644504
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27644633 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatattacaggagaattaattttgcagaaggc |
27644534 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctca |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27644533 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctca |
27644504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 20394868 - 20394982
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394868 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
20394967 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394968 |
aagagatacaatgaa |
20394982 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16642059 - 16641825
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16642059 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
16641960 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16641959 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
16641860 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16641859 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
16641825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 41773894 - 41774128
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41773894 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgtagaaggc |
41773993 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41773994 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
41774093 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
41774094 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
41774128 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2026661 - 2026895
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2026661 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
2026760 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2026761 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
2026860 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
2026861 |
tttcgtcgttttgtcgagagtgggtctgttgatgt |
2026895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37038994 - 37038760
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37038994 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
37038895 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37038894 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
37038795 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
37038794 |
tttcgtcgttttgacgagagtgggtctgttgatgt |
37038760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 43488054 - 43488288
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43488054 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaagttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
43488153 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43488154 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
43488253 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
43488254 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
43488288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23415647 - 23415881
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23415647 |
aaccagtaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatttcacaggagaattaattttgcagaaggc |
23415746 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23415747 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
23415846 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
23415847 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
23415881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3615270 - 3615504
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3615270 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacaacatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
3615369 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3615370 |
aagagatacaatgaaactcttataccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
3615469 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3615470 |
tttcgtcgttttgacgagagtgggtctgttgatgt |
3615504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0129 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:
Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39304 - 39080
Alignment:
| Q |
1 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39304 |
aaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaattaattttgcagaaggc |
39205 |
T |
|
| Q |
101 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39204 |
aagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacatgatggcttgggaaattcaagcaccgacatggcataaagtca |
39105 |
T |
|
| Q |
201 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggt |
225 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39104 |
tttcgtcgttttggcgagagtgggt |
39080 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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