View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0154_1D_high_6 (Length: 318)

Name: NF0154_1D_high_6
Description: NF0154_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0154_1D_high_6
NF0154_1D_high_6
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (25-300)||(2087-2362)
scaffold0234 (25-300)||(10978-11253)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (25-300)||(18454-18729)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (25-300)||(21940831-21941106)
chr8 (25-300)||(22171653-22171928)
chr8 (29-300)||(6094289-6094560)
chr8 (32-300)||(24642815-24643082)
chr8 (25-242)||(15326422-15326639)
chr8 (25-242)||(15506791-15507008)
chr8 (46-289)||(14983710-14983950)
chr8 (94-291)||(24797224-24797419)
chr8 (28-295)||(21969324-21969586)
chr8 (25-120)||(28548393-28548488)
chr8 (28-295)||(8371302-8371564)
chr8 (28-295)||(12562114-12562376)
chr8 (28-295)||(25611186-25611448)
chr8 (99-296)||(38232219-38232414)
chr8 (28-295)||(22130658-22130920)
chr8 (28-295)||(27007566-27007828)
chr8 (28-295)||(27014709-27014971)
chr8 (28-295)||(27880536-27880798)
chr8 (28-295)||(28020717-28020979)
chr8 (28-295)||(21916667-21916929)
chr8 (76-295)||(18835341-18835556)
chr8 (28-295)||(45534322-45534584)
chr8 (28-285)||(22659543-22659795)
chr8 (120-295)||(26240475-26240646)
chr8 (76-210)||(8781971-8782102)
chr8 (88-263)||(2375214-2375386)
chr8 (159-294)||(32872741-32872876)
chr8 (103-218)||(6430953-6431065)
chr8 (28-182)||(20535259-20535409)
chr8 (189-283)||(29645537-29645631)
chr8 (31-86)||(24796771-24796826)
chr8 (76-295)||(2963028-2963247)
chr8 (265-300)||(28555049-28555084)
chr8 (179-286)||(36970265-36970371)
chr8 (187-239)||(10920427-10920479)
chr8 (212-267)||(24535514-24535569)
chr8 (153-212)||(34659059-34659118)
chr8 (83-128)||(29645675-29645720)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (25-300)||(15152609-15152884)
chr7 (25-300)||(29327950-29328225)
chr7 (25-300)||(11535828-11536103)
chr7 (28-300)||(11542749-11543021)
chr7 (25-305)||(12750987-12751267)
chr7 (29-300)||(12738702-12738973)
chr7 (25-300)||(18561173-18561439)
chr7 (29-298)||(13392318-13392587)
chr7 (29-291)||(18257615-18257874)
chr7 (28-295)||(2204543-2204805)
chr7 (28-295)||(18400095-18400357)
chr7 (28-295)||(18407079-18407341)
chr7 (28-295)||(48808545-48808807)
chr7 (76-286)||(8464999-8465205)
chr7 (29-295)||(19230879-19231140)
chr7 (28-295)||(30254129-30254391)
chr7 (28-295)||(18139387-18139649)
chr7 (28-295)||(15729742-15730004)
chr7 (46-219)||(2365169-2365340)
chr7 (28-295)||(10668950-10669213)
chr7 (28-218)||(41681017-41681203)
chr7 (154-267)||(10235361-10235474)
chr7 (76-285)||(24443423-24443628)
chr7 (76-294)||(19388544-19388762)
chr7 (28-295)||(19393473-19393735)
chr7 (76-295)||(47166955-47167170)
chr7 (245-300)||(15148308-15148363)
chr7 (34-288)||(25845531-25845780)
chr7 (34-288)||(25845950-25846199)
chr7 (76-211)||(14591924-14592056)
chr7 (76-211)||(16011515-16011647)
chr7 (177-285)||(47833875-47833983)
chr7 (78-204)||(31190537-31190660)
chr7 (163-281)||(7662569-7662686)
chr7 (79-211)||(22969024-22969153)
chr7 (186-286)||(19859122-19859221)
chr7 (208-297)||(7396358-7396450)
chr7 (120-295)||(28130552-28130723)
chr7 (153-291)||(3132849-3132986)
chr7 (76-211)||(34128647-34128779)
chr7 (28-218)||(18259173-18259359)
chr7 (53-128)||(22948499-22948574)
chr7 (248-298)||(2365062-2365112)
chr7 (76-167)||(15169386-15169474)
chr7 (186-298)||(39111980-39112092)
chr7 (197-252)||(29983179-29983234)
chr7 (179-221)||(7396469-7396511)
chr7 (69-133)||(29984308-29984372)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (25-300)||(17684235-17684510)
chr6 (25-300)||(27381018-27381293)
chr6 (25-300)||(27471401-27471676)
chr6 (25-300)||(11651889-11652164)
chr6 (25-300)||(17691206-17691481)
chr6 (25-300)||(29309056-29309331)
chr6 (25-300)||(29316016-29316290)
chr6 (35-300)||(188753-189018)
chr6 (25-218)||(27296877-27297070)
chr6 (28-252)||(16394214-16394438)
chr6 (25-220)||(25536957-25537152)
chr6 (25-201)||(16559238-16559414)
chr6 (53-304)||(13359067-13359314)
chr6 (196-300)||(16566257-16566361)
chr6 (76-295)||(16789062-16789277)
chr6 (120-295)||(18019981-18020152)
chr6 (76-295)||(22859984-22860199)
chr6 (28-295)||(27508396-27508658)
chr6 (28-295)||(27527982-27528244)
chr6 (28-295)||(1586157-1586419)
chr6 (57-283)||(2669476-2669700)
chr6 (113-298)||(27925922-27926103)
chr6 (82-298)||(17850321-17850534)
chr6 (163-268)||(28172754-28172859)
chr6 (25-295)||(10359097-10359360)
chr6 (124-295)||(14074471-14074638)
chr6 (76-295)||(8612906-8613125)
chr6 (162-297)||(20553492-20553625)
chr6 (76-216)||(20736425-20736562)
chr6 (29-288)||(19218427-19218676)
chr6 (48-233)||(8510155-8510338)
chr6 (76-218)||(21994655-21994794)
chr6 (107-287)||(22560311-22560487)
chr6 (248-300)||(25537148-25537200)
chr6 (151-272)||(19347092-19347212)
chr6 (191-295)||(13995151-13995254)
chr6 (76-288)||(4073574-4073781)
chr6 (76-211)||(5758577-5758709)
chr6 (28-218)||(17120554-17120740)
chr6 (69-120)||(28172899-28172951)
chr6 (250-295)||(20736594-20736639)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (25-300)||(18262378-18262653)
chr4 (25-300)||(18269239-18269514)
chr4 (25-300)||(55612849-55613124)
chr4 (25-300)||(26963806-26964081)
chr4 (25-300)||(26970629-26970904)
chr4 (25-300)||(868763-869038)
chr4 (25-300)||(19926526-19926801)
chr4 (25-300)||(5707486-5707761)
chr4 (25-300)||(5714114-5714389)
chr4 (25-300)||(8858333-8858608)
chr4 (25-300)||(10621099-10621374)
chr4 (25-297)||(10628178-10628450)
chr4 (25-300)||(28392900-28393175)
chr4 (25-300)||(8845369-8845644)
chr4 (25-300)||(4426382-4426645)
chr4 (28-298)||(35223728-35223998)
chr4 (28-298)||(5667898-5668164)
chr4 (25-300)||(20311458-20311731)
chr4 (29-211)||(10677352-10677534)
chr4 (29-211)||(10890992-10891174)
chr4 (28-295)||(15461488-15461750)
chr4 (154-297)||(56516225-56516368)
chr4 (28-295)||(34975542-34975804)
chr4 (80-230)||(21453961-21454110)
chr4 (28-295)||(2677004-2677266)
chr4 (28-295)||(15815012-15815274)
chr4 (28-295)||(17300008-17300270)
chr4 (28-295)||(18111092-18111354)
chr4 (76-295)||(3369119-3369334)
chr4 (28-295)||(26531604-26531866)
chr4 (76-285)||(5870419-5870624)
chr4 (28-295)||(18163153-18163415)
chr4 (28-295)||(20243928-20244190)
chr4 (120-295)||(4676123-4676294)
chr4 (28-286)||(19365519-19365773)
chr4 (74-308)||(32646618-32646850)
chr4 (81-295)||(32636475-32636685)
chr4 (76-295)||(1941715-1941930)
chr4 (29-295)||(5616386-5616647)
chr4 (76-218)||(19362477-19362616)
chr4 (204-282)||(24700213-24700291)
chr4 (76-295)||(4546071-4546286)
chr4 (46-199)||(30040556-30040705)
chr4 (76-211)||(9487625-9487757)
chr4 (31-295)||(5528531-5528790)
chr4 (76-230)||(33888594-33888743)
chr4 (112-239)||(34777850-34777975)
chr4 (120-211)||(9538033-9538121)
chr4 (242-298)||(10677538-10677594)
chr4 (242-298)||(10891178-10891234)
chr4 (76-196)||(11421096-11421213)
chr4 (57-107)||(24701361-24701411)
chr4 (228-293)||(9937933-9937998)
chr4 (250-295)||(11421007-11421052)
chr4 (250-295)||(30040740-30040785)
chr4 (118-209)||(9937830-9937923)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (25-300)||(6110230-6110505)
chr3 (25-300)||(15600650-15600925)
chr3 (25-300)||(15607195-15607470)
chr3 (25-300)||(16482249-16482524)
chr3 (25-300)||(10579121-10579396)
chr3 (25-300)||(10572358-10572633)
chr3 (27-300)||(18520141-18520414)
chr3 (25-300)||(17780884-17781159)
chr3 (25-300)||(18522829-18523104)
chr3 (25-300)||(15357352-15357627)
chr3 (25-285)||(8490676-8490936)
chr3 (25-300)||(13211468-13211743)
chr3 (25-300)||(15341985-15342260)
chr3 (25-298)||(13248775-13249048)
chr3 (25-300)||(32056665-32056941)
chr3 (29-300)||(17199954-17200225)
chr3 (25-300)||(13516977-13517248)
chr3 (25-297)||(1647287-1647559)
chr3 (25-300)||(17136525-17136794)
chr3 (28-300)||(29925137-29925409)
chr3 (28-300)||(29974290-29974562)
chr3 (28-299)||(16200598-16200868)
chr3 (46-298)||(24253179-24253427)
chr3 (28-295)||(15846585-15846847)
chr3 (28-295)||(21034229-21034491)
chr3 (28-295)||(20147603-20147865)
chr3 (120-286)||(14890391-14890553)
chr3 (28-286)||(21398792-21399045)
chr3 (28-295)||(55427012-55427274)
chr3 (77-295)||(14147012-14147226)
chr3 (76-295)||(12299902-12300116)
chr3 (28-295)||(25978777-25979039)
chr3 (28-211)||(15526827-15527006)
chr3 (248-300)||(19089734-19089786)
chr3 (53-245)||(32280313-32280507)
chr3 (120-295)||(11787578-11787749)
chr3 (76-283)||(15317269-15317472)
chr3 (201-296)||(9504453-9504548)
chr3 (118-247)||(28953965-28954093)
chr3 (227-300)||(16200291-16200363)
chr3 (175-290)||(8251933-8252048)
chr3 (28-164)||(28088227-28088359)
chr3 (76-132)||(30464147-30464203)
chr3 (76-140)||(36138033-36138097)
chr3 (76-140)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (25-300)||(18252196-18252471)
chr1 (25-300)||(18532280-18532555)
chr1 (25-300)||(27131176-27131450)
chr1 (28-300)||(27310346-27310618)
chr1 (25-300)||(16358801-16359076)
chr1 (28-298)||(36816403-36816672)
chr1 (25-297)||(3855685-3855957)
chr1 (107-300)||(21171081-21171274)
chr1 (29-298)||(27277328-27277596)
chr1 (28-260)||(22641643-22641871)
chr1 (146-300)||(22657108-22657262)
chr1 (28-295)||(28134772-28135034)
chr1 (28-295)||(19706488-19706750)
chr1 (64-270)||(23507096-23507300)
chr1 (28-295)||(43802414-43802676)
chr1 (57-297)||(12014084-12014322)
chr1 (28-295)||(9456107-9456369)
chr1 (28-295)||(20779694-20779956)
chr1 (28-295)||(22670306-22670568)
chr1 (28-295)||(42817038-42817300)
chr1 (28-295)||(20391288-20391550)
chr1 (25-171)||(9916543-9916688)
chr1 (28-295)||(22612483-22612745)
chr1 (177-298)||(9917837-9917957)
chr1 (28-286)||(633934-634187)
chr1 (28-295)||(8727658-8727920)
chr1 (177-295)||(47667668-47667785)
chr1 (154-295)||(35930573-35930713)
chr1 (76-218)||(29096789-29096928)
chr1 (79-211)||(21881475-21881604)
chr1 (181-270)||(12006461-12006550)
chr1 (76-211)||(51997353-51997485)
chr1 (152-278)||(26923553-26923678)
chr1 (88-231)||(24301713-24301855)
chr1 (81-140)||(10852402-10852461)
chr1 (46-126)||(12006332-12006413)
chr1 (118-197)||(31236402-31236478)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (27-300)||(6702-6975)
scaffold0390 (25-300)||(13716-13991)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (25-300)||(7273-7548)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (25-300)||(24695232-24695507)
chr5 (25-300)||(19714264-19714539)
chr5 (25-300)||(18569627-18569904)
chr5 (25-300)||(19706985-19707259)
chr5 (101-300)||(39538754-39538953)
chr5 (73-295)||(18806850-18807070)
chr5 (25-270)||(17298667-17298912)
chr5 (69-270)||(17285560-17285759)
chr5 (112-298)||(22546872-22547055)
chr5 (28-295)||(20941018-20941280)
chr5 (28-295)||(25805434-25805696)
chr5 (35-153)||(27347311-27347428)
chr5 (28-295)||(31890-32152)
chr5 (28-295)||(22941241-22941503)
chr5 (28-295)||(23545913-23546175)
chr5 (28-295)||(12789712-12789974)
chr5 (28-295)||(24933355-24933617)
chr5 (28-295)||(31096807-31097069)
chr5 (28-284)||(20100292-20100543)
chr5 (29-295)||(5097642-5097903)
chr5 (76-295)||(12765086-12765305)
chr5 (73-204)||(18806490-18806619)
chr5 (73-204)||(18806670-18806799)
chr5 (206-298)||(27347425-27347517)
chr5 (76-295)||(7865526-7865745)
chr5 (73-228)||(18829377-18829530)
chr5 (25-86)||(24701996-24702057)
chr5 (76-295)||(9811829-9812048)
chr5 (76-295)||(12703970-12704189)
chr5 (120-295)||(26245093-26245264)
chr5 (76-218)||(26129789-26129928)
chr5 (112-295)||(31651917-31652095)
chr5 (154-283)||(33477193-33477321)
chr5 (241-285)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (25-300)||(25756-26031)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (25-300)||(21330014-21330289)
chr2 (29-300)||(18796672-18796943)
chr2 (37-297)||(18619973-18620232)
chr2 (46-298)||(22183273-22183522)
chr2 (46-298)||(36270334-36270583)
chr2 (48-291)||(6991903-6992146)
chr2 (48-300)||(18822249-18822499)
chr2 (47-250)||(20978091-20978292)
chr2 (28-295)||(30174368-30174630)
chr2 (76-295)||(24250128-24250343)
chr2 (154-296)||(19279458-19279600)
chr2 (156-285)||(18851956-18852085)
chr2 (103-295)||(24229338-24229526)
chr2 (76-218)||(15342098-15342237)
chr2 (76-285)||(29800468-29800677)
chr2 (29-142)||(17241034-17241146)
chr2 (177-280)||(36801899-36802003)
chr2 (76-286)||(19616435-19616641)
chr2 (77-211)||(40301034-40301164)
chr2 (76-211)||(21626824-21626955)
chr2 (177-284)||(28741220-28741326)
chr2 (46-126)||(36799745-36799826)
chr2 (177-295)||(24763751-24763868)
chr2 (112-209)||(41316412-41316506)
chr2 (250-295)||(12098609-12098654)
chr2 (76-140)||(28740922-28740986)
chr2 (152-215)||(28718943-28719006)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (25-300)||(1159-1434)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (25-300)||(5695-5963)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-235)||(230160-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (28-295)||(174-436)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (28-295)||(130273-130535)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (76-295)||(8296-8511)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (28-295)||(3724-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (28-295)||(119721-119983)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (29-286)||(40038-40290)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (29-295)||(12999-13260)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (48-218)||(26609-26775)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-295)||(67423-67685)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (163-297)||(90019-90154)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (31-295)||(8722-8981)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (76-211)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (120-285)||(53766-53927)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (29-169)||(102-238)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (152-211)||(11699-11758)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (156-247)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (103-199)||(11328-11421)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (250-295)||(15089-15134)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 2087 - 2362
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2087 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 2186  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2187 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 2286  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2287 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 10978 - 11253
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10978 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 11077  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11078 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 11177  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11178 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 11253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18729 - 18454
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18729 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 18630  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18629 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18530  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18529 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21941106 - 21940831
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941106 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 21941007  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941006 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 21940907  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940906 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 21940831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22171928 - 22171653
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171928 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 22171829  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22171828 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagac 22171729  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171728 ttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 22171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6094560 - 6094289
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094560 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 6094461  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094460 cttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 6094361  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6094360 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatataatagtctctatgctttaatgat 6094289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24643082 - 24642815
Alignment:
Q  32 acgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatctt 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24643082 acgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatctt 24642983  T
Q  132 atgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642982 atgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 24642884  T
Q  232 ctctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642883 ctctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatactttaatgat 24642815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15326639 - 15326422
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326639 acggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 15326540  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326539 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 15326440  T
Q  225 ttgataactctttatcca 242  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15326439 ttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15507008 - 15506791
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507008 acggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 15506909  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506908 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 15506809  T
Q  225 ttgataactctttatcca 242  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15506808 ttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 289
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983950
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttca 144  Q
    |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  145 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 244  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatg 14983905  T
Q  245 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 289  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14983906 atccgtgagatatgatcattagtctacccacataatagtccctat 14983950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 291
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  94 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  194 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 291  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21969586 - 21969324
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  21969586 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 21969488  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21969487 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 21969391  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  21969390 atatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 21969324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28548488 - 28548393
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548488 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 8371302 - 8371564
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  8371302 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 8371400  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  8371401 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttg 8371497  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8371498 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttta 8371564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12562376 - 12562114
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  12562376 gacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 12562278  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12562277 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 12562181  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12562180 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 12562114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25611448 - 25611186
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  25611448 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaata 25611350  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25611349 tcttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 25611253  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  25611252 atatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 25611186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 296
Target Start/End: Original strand, 38232219 - 38232414
Alignment:
Q  99 tggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 197  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38232219 tggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaatattac 38232315  T
Q  198 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaa 296  Q
     | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  38232316 ccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctttaa 38232414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 22130658 - 22130920
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  22130658 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 22130756  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22130757 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 22130853  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22130854 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22130920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 27007566 - 27007828
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  27007566 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 27007664  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27007665 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 27007761  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  27007762 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 27007828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 27014709 - 27014971
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  27014709 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 27014807  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27014808 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 27014904  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  27014905 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 27014971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 27880536 - 27880798
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  27880536 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 27880634  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27880635 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 27880731  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  27880732 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 27880798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 28020717 - 28020979
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  28020717 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 28020815  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28020816 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 28020912  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28020913 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 28020979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21916929 - 21916667
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  21916929 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 21916831  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  21916830 tcttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttg 21916734  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  21916733 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 21916667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835341
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttta 18835341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 45534322 - 45534584
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||    
T  45534322 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaata 45534420  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  45534421 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagactta 45534517  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  45534518 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 45534584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 285
Target Start/End: Original strand, 22659543 - 22659795
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  22659543 gacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata 22659641  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  22659642 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagactta 22659738  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 285  Q
    ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  22659739 atatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacataatagtct 22659795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26240646 - 26240475
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26240646 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgta 26240550  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  26240549 tatacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacataatagtctcgacgcttta 26240475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 210
Target Start/End: Original strand, 8781971 - 8782102
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| || ||    
T  8781971 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacag--actatgtagtattctcacggtgg 8782067  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttat 210  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782068 atcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2375386 - 2375214
Alignment:
Q  88 aggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 186  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||   ||| ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||    
T  2375386 aggtcaaatggttgaatacaccacttatcactatgagaataact-atgagt-tttacataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaat 2375291  T
Q  187 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 263  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375290 atacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 294
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872876
Alignment:
Q  159 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 258  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  259 atcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 294  Q
    ||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgcttt 32872876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6431065 - 6430953
Alignment:
Q  103 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta 202  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||    
T  6431065 atacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactccta 6430969  T
Q  203 atatttatatctatgt 218  Q
    ||||||||| ||||||    
T  6430968 atatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Original strand, 20535259 - 20535409
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  ||||| ||  |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  20535259 gacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaata 20535357  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 182  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  20535358 tcttatgacac-tttcataac--atactatgcaatattctcatggtgggtcaatc 20535409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  189 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 283  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Original strand, 24796771 - 24796826
Alignment:
Q  31 aacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggttt 86  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24796771 aacgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 2963028 - 2963247
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 172  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| ||    ||||||  | |||||||||||||||||  ||    
T  2963028 catagtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcgg 2963125  T
Q  173 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  || | |  ||||||  | |||| |||||||     
T  2963126 taggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttataacccatgagatacggtcattagtctaca 2963224  T
Q  273 tacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  2963225 tacataatagtctctacgcttta 2963247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555049
Alignment:
Q  265 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 28555049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970265
Alignment:
Q  179 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacatg 36970273  T
Q  279 atagtctc 286  Q
    ||||||||    
T  36970272 atagtctc 36970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  187 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535514
Alignment:
Q  212 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659059
Alignment:
Q  153 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 212  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatat 34659059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29645720 - 29645675
Alignment:
Q  83 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  29645720 gtttcaggtcgaatggtgaagtacatcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15152884 - 15152609
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152884 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 15152785  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152784 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 15152685  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152684 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15152609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29328225 - 29327950
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328225 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 29328126  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 29328026  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328025 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 29327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 11535828 - 11536103
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11535828 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgaga 11535927  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11535928 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagac 11536027  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536028 tggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 11536103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 11542749 - 11543021
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11542749 gacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaata 11542848  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11542849 tcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactag 11542948  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542949 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 11543021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12751267 - 12750987
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751267 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacctagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 12751168  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  12751167 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaa 12751068  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatgtcca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12751067 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatgatatcca 12750987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12738973 - 12738702
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738973 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacatagtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatat 12738874  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738873 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttga 12738774  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12738773 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 12738702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18561439 - 18561173
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  18561439 acggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---- 18561344  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561343 -----ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18561249  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18561248 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 18561173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13392587 - 13392318
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392587 acaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacatagtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 13392488  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  13392487 cttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtcaatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacagga 13392388  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  13392387 taactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaatacaatagtctctatgttttaatg 13392318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 291
Target Start/End: Original strand, 18257615 - 18257874
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||    
T  18257615 acaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatat 18257713  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257714 cttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacggtgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 18257811  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||    
T  18257812 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatccacataatagtctttatgc 18257874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2204805 - 2204543
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  2204805 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 2204707  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2204706 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 2204610  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2204609 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 2204543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18400357 - 18400095
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  18400357 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 18400259  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18400258 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 18400162  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18400161 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18400095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18407341 - 18407079
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  18407341 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 18407243  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18407242 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 18407146  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18407145 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18407079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 48808545 - 48808807
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  48808545 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 48808643  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  48808644 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 48808740  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  48808741 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 48808807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8465205 - 8464999
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8465205 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8465109  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8465108 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8465010  T
Q  276 ataatagtctc 286  Q
    |||||||||||    
T  8465009 ataatagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19231140 - 19230879
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||    
T  19231140 acaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat 19231042  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19231041 cttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttga 19230945  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    || |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19230944 tatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 19230879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30254391 - 30254129
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||| ||| ||| ||   |||||  | ||||| | ||||||||    
T  30254391 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaagtctaagagtaatatacattattatcattgtgagaata 30254293  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30254292 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 30254196  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  30254195 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 30254129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 18139387 - 18139649
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  18139387 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 18139485  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18139486 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctg 18139582  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18139583 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18139649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15730004 - 15729742
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||    
T  15730004 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaata 15729906  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  15729905 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagactta 15729809  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  15729808 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15729742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2365340 - 2365169
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttca 144  Q
    |||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  2365340 acaaagtacttgactccaaggtctagggtacatagtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttaca 2365242  T
Q  145 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    ||||||   |||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365241 taacttc--ctatgtagcattttcatggtgggtcaatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 10668950 - 10669213
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaat 126  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| |   ||||||    
T  10668950 gacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaat 10669048  T
Q  127 atcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactt 226  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  10669049 atcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagactt 10669145  T
Q  227 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  10669146 aatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 10669213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 41681017 - 41681203
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  41681017 gacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata 41681115  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681116 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235361
Alignment:
Q  154 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 253  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgag 10235375  T
Q  254 atgtgatcatcagt 267  Q
    ||||||||||||||    
T  10235374 atgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 285
Target Start/End: Original strand, 24443423 - 24443628
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||    
T  24443423 cataatggtttcaagtctaagagtgttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtgg 24443519  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     | |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  24443520 gttaatctagtataaatattactcctaatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 24443618  T
Q  276 ataatagtct 285  Q
    ||||||||||    
T  24443619 ataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19388762 - 19388544
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactt--ttactatgtagtattctcatggc 173  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |   |||||||||||||||||      
T  19388762 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacacttt-cataacatactatatatgtagtattctcatgat 19388664  T
Q  174 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 273  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || |||||| ||||  |    
T  19388663 tgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtcatcaatctatat 19388565  T
Q  274 acataatagtctctatgcttt 294  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  19388564 acataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 19393473 - 19393735
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  19393473 gacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaata 19393571  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  19393572 tcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagactta 19393668  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||  |||| |  ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19393669 atatctc-atatttatgacccatgaaatgtggtcattagtctacatacataatagtctcgacgcttta 19393735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 47166955 - 47167170
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  47166955 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 47167051  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  47167052 gtctatctagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 47167150  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  47167151 ataatagtctcgacgcttta 47167170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148308
Alignment:
Q  245 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15148308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 25845531 - 25845780
Alignment:
Q  34 gtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 133  Q
    ||||||||||  | |||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||    
T  25845531 gtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatatcttat 25845629  T
Q  134 gacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataact 233  Q
    || | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||| ||| ||    
T  25845630 gata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcctaatattgacacatacgtatagacttaatatct 25845726  T
Q  234 ctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 288  Q
    |  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25845727 c-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 25845950 - 25846199
Alignment:
Q  34 gtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 133  Q
    ||||||||||  | |||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||    
T  25845950 gtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatatcttat 25846048  T
Q  134 gacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataact 233  Q
    || | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||| ||| ||    
T  25846049 gata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcctaatattgacacatacgtatagacttaatatct 25846145  T
Q  234 ctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 288  Q
    |  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25846146 c-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 285
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 276  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  277 taatagtct 285  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Original strand, 31190537 - 31190660
Alignment:
Q  78 tagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 177  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  || ||||||||||||||||| || |    
T  31190537 tagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataacat--acaatgtagtattctcatggtgggt 31190633  T
Q  178 caatccaatataaatattactcctaat 204  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190634 caatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 281
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  163 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 262  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  263 tcagtctacctacataata 281  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  79 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 178  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  179 aatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859122
Alignment:
Q  186 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396358
Alignment:
Q  208 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgctttaat 7396358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28130723 - 28130552
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  28130723 tgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtaatattctcacagtgggtcaatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgta 28130627  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  28130626 tagacttaatatctc-atatttatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatgcataatagtctcgacgcttta 28130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  153 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 252  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  253 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 291  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34128779 - 34128647
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | |||||||||||||||||| | | |||||| |  |||||||||||||||||    ||    
T  34128779 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacaatgg 34128683  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128682 atctatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 18259173 - 18259359
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| ||| |||||  ||||  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  18259173 gacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcataagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata 18259271  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
    |||||||||| | | ||||||||  |||||| |||||||||| || || || ||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259272 tcttatgacaatct-cataactt--actatgcagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  53 actcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365062
Alignment:
Q  248 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatg 2365062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Original strand, 15169386 - 15169474
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 167  Q
    ||||||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15169386 catagtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111980
Alignment:
Q  186 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   ||||||||||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  286 ctatgctttaatg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  39111992 ctatattttaatg 39111980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  197 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 252  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7396511 - 7396469
Alignment:
Q  179 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396511 aatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  69 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 133  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 17684235 - 17684510
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684235 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 17684334  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684335 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 17684434  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684435 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 17684510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 27381018 - 27381293
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381018 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 27381117  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381118 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 27381217  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381218 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 27381293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 27471401 - 27471676
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471401 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 27471500  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471501 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 27471600  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471601 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 27471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11652164 - 11651889
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11652164 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgaga 11652065  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652064 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 11651965  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11651964 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 11651889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 17691206 - 17691481
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691206 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 17691305  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691306 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 17691405  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17691406 ttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 17691481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29309331 - 29309056
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309331 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 29309232  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309231 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 29309132  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309131 ttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 29309056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29316290 - 29316016
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316290 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 29316192  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316191 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 29316092  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316091 ttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 29316016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 300
Target Start/End: Original strand, 188753 - 189018
Alignment:
Q  35 tttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatg 134  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188753 tttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatg 188852  T
Q  135 acacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188853 acacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc 188952  T
Q  235 tttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  188953 tttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27297070 - 27296877
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297070 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 27296971  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296970 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 252
Target Start/End: Original strand, 16394214 - 16394438
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394214 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacatagtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaata 16394313  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394314 tcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 16394413  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtga 252  Q
    |||||| |||||||||||| |||||    
T  16394414 ataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 25536957 - 25537152
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25536957 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgaga 25537056  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537057 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 16559238 - 16559414
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559238 acggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacatagcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 16559337  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559338 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatcaatccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Original strand, 13359067 - 13359314
Alignment:
Q  53 actcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttt 151  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||    
T  13359067 actcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataatttt 13359165  T
Q  152 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 251  Q
     |  |||||||||||  |||| |   |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |    
T  13359166 ca--atgtagtattc--atggtgagacaattcaatataaatactacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcg 13359261  T
Q  252 agatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatgtcc 304  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13359262 agatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgctttaatgttgtcc 13359314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 196 - 300
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566361
Alignment:
Q  196 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  296 atgat 300  Q
    |||||    
T  16566357 atgat 16566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16789277 - 16789062
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  16789277 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 16789181  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  16789180 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 16789082  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  16789081 ataatagtctcgacgcttta 16789062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Original strand, 18019981 - 18020152
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18019981 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 18020077  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18020078 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18020152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 22859984 - 22860199
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  22859984 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 22860080  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22860081 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22860179  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  22860180 ataatagtctcgacgcttta 22860199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 27508396 - 27508658
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  27508396 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 27508494  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27508495 tcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 27508591  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  27508592 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctcgacgcttta 27508658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 27527982 - 27528244
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  27527982 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 27528080  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27528081 tcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 27528177  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  27528178 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctcgacgcttta 27528244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 1586157 - 1586419
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||    
T  1586157 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaata 1586255  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  1586256 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagactta 1586352  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1586353 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 1586419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2669700 - 2669476
Alignment:
Q  57 gactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttact 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  ||    
T  2669700 gactcctacatctagagtacataatgatttcaggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ct 2669604  T
Q  156 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 255  Q
    |||||||||| |||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   ||||||    
T  2669603 atgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagat 2669504  T
Q  256 gtgatcatcagtctacctacataatagt 283  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2669503 gtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27926103 - 27925922
Alignment:
Q  113 atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 212  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||  || ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  27926103 atcactatgataataacctatgaca-tttacataatttt--ctgtgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatat 27926008  T
Q  213 ctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||| ||||    
T  27926007 ctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatgagatcatcagtttatccacataatagtctttgtgcttcaatg 27925922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 298
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850534
Alignment:
Q  82 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||     |  |||||||||||| | || || |||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatactta-cataaaaccca--atgtagtattcttaaggagggtcaat 17850417  T
Q  182 ccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 281  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17850418 ccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataata 17850517  T
Q  282 gtctctatgctttaatg 298  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  17850518 gtctatatacttgaatg 17850534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  163 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 262  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  263 tcagtc 268  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 10359097 - 10359360
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||    
T  10359097 acggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgaga 10359195  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||    
T  10359196 atatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattacctataatatttatatctatgtatagac 10359291  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    || ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  10359292 ttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgcttta 10359360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14074638 - 14074471
Alignment:
Q  124 aatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaaga 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  14074638 aatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtataga 14074542  T
Q  224 cttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  14074541 cttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 14074471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8613125 - 8612906
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 172  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  8613125 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 8613028  T
Q  173 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||||||||||     
T  8613027 tgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctaca 8612929  T
Q  273 tacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  8612928 tacataatagtctcgacgcttta 8612906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 297
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553625
Alignment:
Q  162 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 261  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  262 atcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaat 20553625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Original strand, 20736425 - 20736562
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |  | ||||||||||||||| |  ||    
T  20736425 catagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagtattctcacgatgg 20736521  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736522 atcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19218676 - 19218427
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    ||||||||||||||   | ||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||    
T  19218676 acaacgtttgaatgacaataaaacacttgagtccaa-atttagggatcatagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatat 19218578  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || || |     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| |    
T  19218577 cttatga-aattttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggt-----caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaa 19218486  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 288  Q
    || |||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19218485 tatctc-atattcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatacataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510155
Alignment:
Q  48 aaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa 147  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| || |||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  148 cttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 233  Q
    | ||  |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  107 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 206  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| |  | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  207 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 287  Q
    ||| | ||||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537200
Alignment:
Q  248 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 25537200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 272
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  151 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  251 gagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995254
Alignment:
Q  191 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 13995249  T
Q  291 cttta 295  Q
    |||||    
T  13995250 cttta 13995254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073574
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||  |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||  ||    
T  4073685 gtcaatcaaatataaatattacctctaatatttacacttatgtatagacttaatatctc-atattcatgacctatgggatgtgatcctcaatctacaaac 4073587  T
Q  276 ataatagtctcta 288  Q
    |||||||||||||    
T  4073586 ataatagtctcta 4073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Original strand, 5758577 - 5758709
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | | |||||| |  |||||||||||||||||  | ||    
T  5758577 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacagtgg 5758673  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758674 atctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 17120554 - 17120740
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  17120554 gacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catatagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 17120652  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
    ||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120653 tcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtcaatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28172951 - 28172899
Alignment:
Q  69 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 120  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172951 tagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 20736594 - 20736639
Alignment:
Q  250 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20736594 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20736639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18262653 - 18262378
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262653 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 18262554  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262553 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18262454  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262453 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18262378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18269514 - 18269239
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269514 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 18269415  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269414 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18269315  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269314 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18269239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 55613124 - 55612849
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613124 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 55613025  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613024 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 55612925  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612924 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 55612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26964081 - 26963806
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964081 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 26963982  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26963981 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagac 26963882  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963881 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 26963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26970904 - 26970629
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970904 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 26970805  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26970804 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagac 26970705  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970704 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 26970629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 869038 - 868763
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  869038 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgaga 868939  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868938 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 868839  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868838 ttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 868763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 19926526 - 19926801
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926526 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 19926625  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19926626 atatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagac 19926725  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926726 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 19926801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5707761 - 5707486
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5707761 acggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgaga 5707662  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5707661 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagac 5707562  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707561 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 5707486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5714389 - 5714114
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5714389 acggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgaga 5714290  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5714289 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagac 5714190  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714189 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 5714114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8858608 - 8858333
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858608 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 8858509  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8858508 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagac 8858409  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8858408 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgat 8858333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 10621099 - 10621374
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10621099 acggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgaga 10621198  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10621199 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagac 10621298  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621299 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 10621374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 10628178 - 10628450
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10628178 acggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgaga 10628277  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628278 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 10628377  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628378 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 10628450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 28392900 - 28393175
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392900 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 28392999  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28393000 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagac 28393099  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28393100 ttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 28393175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8845644 - 8845369
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8845644 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgaga 8845545  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  8845544 atatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaa 8845445  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8845444 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgat 8845369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 4426382 - 4426645
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426382 acggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 4426481  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |            |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426482 a------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 4426569  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4426570 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 4426645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35223998 - 35223728
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35223998 gacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacatcgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaata 35223899  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  35223898 tcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatg 35223799  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35223798 ataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacataatagtctatatgctttaatg 35223728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 5667898 - 5668164
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667898 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacatagtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 5667995  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    
T  5667996 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatg 5668095  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  5668096 ataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacataatagtctctatgatttaatg 5668164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20311731 - 20311458
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgag 123  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20311731 acggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggtaaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgag 20311632  T
Q  124 aatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaaga 223  Q
    ||||   ||||| | ||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20311631 aataatgtatgatagtta-cataactgt--ctatgtagtattctcatgacaggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaaga 20311535  T
Q  224 cttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20311534 cttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctacccacaaaatagtctctatgctttaatgat 20311458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Original strand, 10677352 - 10677534
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10677352 acaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatat 10677451  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677452 cttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Original strand, 10890992 - 10891174
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10890992 acaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatat 10891091  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891092 cttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15461750 - 15461488
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  15461750 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 15461652  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15461651 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 15461555  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  15461554 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15461488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516225
Alignment:
Q  154 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 253  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  254 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatgttttaat 56516225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34975804 - 34975542
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  34975804 gacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 34975706  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34975705 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 34975609  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  34975608 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 34975542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  80 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 179  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  180 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2677266 - 2677004
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  2677266 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 2677168  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2677167 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 2677071  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2677070 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 2677004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15815274 - 15815012
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  15815274 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 15815176  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15815175 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 15815079  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  15815078 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15815012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 17300008 - 17300270
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  17300008 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 17300106  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17300107 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 17300203  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  17300204 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 17300270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 18111092 - 18111354
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  18111092 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 18111190  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18111191 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 18111287  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18111288 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18111354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 3369119 - 3369334
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  3369119 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 3369215  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  3369216 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 3369314  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  3369315 ataatagtctcgacgcttta 3369334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26531866 - 26531604
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  26531866 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 26531768  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  26531767 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttg 26531671  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  26531670 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 26531604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5870624 - 5870419
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  5870624 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 5870528  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  5870527 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 5870429  T
Q  276 ataatagtct 285  Q
    ||||||||||    
T  5870428 ataatagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18163415 - 18163153
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||    
T  18163415 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaata 18163317  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  18163316 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagactta 18163220  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18163219 atatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18163153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20244190 - 20243928
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||    
T  20244190 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaata 20244092  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  20244091 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagactta 20243995  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20243994 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Original strand, 4676123 - 4676294
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4676123 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 4676219  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  4676220 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 4676294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19365773 - 19365519
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcacta-tgagaat 126  Q
    |||||||||||||||   | |||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |  |||||||    
T  19365773 gacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacaccattatcattggtgagaat 19365675  T
Q  127 atcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  19365674 atcttatgacacttt-cataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagattt 19365578  T
Q  227 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 286  Q
     ||| |||  ||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19365577 aatatctc-atactcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacgtatataatagtctc 19365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 308
Target Start/End: Original strand, 32646618 - 32646850
Alignment:
Q  74 tacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 172  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | | |||||| |||  ||||||| ||||| ||||    
T  32646618 tacagagttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatgg 32646714  T
Q  173 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
      | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||   || |    
T  32646715 taggtcaatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatcaacatatc 32646814  T
Q  273 tacataatagtctctatgctttaatgatgtccatct 308  Q
     ||||||||||||  || |||||||| | |||||||    
T  32646815 cacataatagtcttcattctttaatgttatccatct 32646850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636475
Alignment:
Q  81 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 180  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  181 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 32636490  T
Q  281 agtctctatgcttta 295  Q
    |||||| | ||||||    
T  32636489 agtctccacgcttta 32636475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1941930 - 1941715
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  1941930 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 1941834  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  |||    
T  1941833 gttaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatac 1941735  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  1941734 ataatagtctcgacgcttta 1941715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5616647 - 5616386
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||    
T  5616647 acaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatctaagattggtatacaccattatcattgtaagaatat 5616549  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | |||| |    
T  5616548 cttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatattacttctaatatttatacctacgtatatacttaa 5616452  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5616451 catctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgcttta 5616386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19362616 - 19362477
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  19362616 catagtggtttcaggtttaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgg 19362520  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19362519 gtcaatccagtataaatattactcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  204 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4546286 - 4546071
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  4546286 catagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 4546190  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| ||| ||||||| || |||    
T  4546189 gtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcgattatcagtcaacatac 4546091  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  4546090 ataatagtctcgacgcttta 4546071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Original strand, 30040556 - 30040705
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcat 145  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  30040556 acaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcat 30040653  T
Q  146 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 199  Q
    |||   |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  30040654 aac--atactatgtagtactctcatggtgggtcaatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9487757 - 9487625
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  9487757 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacgatgg 9487661  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487660 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 5528531 - 5528790
Alignment:
Q  31 aacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatct 130  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || |||| ||| |||||  |||||  |||||||||  ||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5528531 aacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtataagagtgttatacaccattatcattatgagaatatct 5528629  T
Q  131 tatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 230  Q
    |||| || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | || | |||    
T  5528630 tatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatatcactcctaatatttatacctatgtatatacataata 5528726  T
Q  231 actctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     |||  ||| ||||| | |||||||||| |||| | |||||  |||||||||||| || ||||||    
T  5528727 tctc-gtattcatgacccgtgagatgtggtcataattctacaaacataatagtctatacgcttta 5528790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||| |  |  ||||| ||||| |||||| ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 230  Q
     ||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888645 gtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 239
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  112 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |   | | |||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  212 tctatgtgaagacttgataactctttat 239  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9538121 - 9538033
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9538121 tgagaatatcttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatattactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677594
Alignment:
Q  242 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatg 10677594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891234
Alignment:
Q  242 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatg 10891234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11421213 - 11421096
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | || ||    
T  11421213 catagtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgg 11421117  T
Q  176 atcaatccaatataaatatta 196  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11421116 gtcaatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  57 gactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 107  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 293
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9937998
Alignment:
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 293  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgctt 9937998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421007
Alignment:
Q  250 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgaagcttta 11421007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040785
Alignment:
Q  250 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttta 30040785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  118 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttacta---tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6110505 - 6110230
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110505 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 6110406  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110405 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 6110306  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110305 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 6110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 15600650 - 15600925
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600650 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 15600749  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600750 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 15600849  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600850 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 15607195 - 15607470
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607195 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 15607294  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607295 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 15607394  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607395 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15607470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 16482249 - 16482524
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482249 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 16482348  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482349 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 16482448  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482449 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 16482524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 10579121 - 10579396
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579121 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 10579220  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579221 atatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 10579320  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579321 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 10579396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 10572358 - 10572633
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572358 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 10572457  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572458 atatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 10572557  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572558 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 10572633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18520414 - 18520141
Alignment:
Q  27 ggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520414 ggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaat 18520315  T
Q  127 atcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520314 atcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactt 18520215  T
Q  227 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520214 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18520141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 17780884 - 17781159
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780884 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 17780983  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780984 atatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 17781083  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781084 ttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 17781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18523104 - 18522829
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18523104 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgaga 18523005  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523004 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18522905  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18522904 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttaaatgat 18522829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 15357352 - 15357627
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357352 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 15357451  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15357452 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagac 15357551  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15357552 tagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgat 15357627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8490936 - 8490676
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490936 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 8490837  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490836 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 8490737  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8490736 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatcgtct 8490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13211743 - 13211468
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211743 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 13211644  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211643 atatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 13211544  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211543 ttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 13211468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 15341985 - 15342260
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341985 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 15342084  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15342085 atatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagac 15342184  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15342185 tagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgat 15342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13249048 - 13248775
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249048 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 13248949  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248948 atatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 13248849  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248848 ttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 13248775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 32056665 - 32056941
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056665 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 32056764  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaaga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32056765 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaaga 32056864  T
Q  224 cttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32056865 cttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 32056941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Original strand, 17199954 - 17200225
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199954 acaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 17200053  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200054 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcgggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 17200153  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17200154 taactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 17200225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13517248 - 13516977
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||    
T  13517248 acggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgaga 13517153  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517152 atatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 13517053  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13517052 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctgtgctttaatgat 13516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 1647287 - 1647559
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647287 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatggga 1647386  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1647387 atatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtcaatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagac 1647486  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1647487 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaat 1647559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17136794 - 17136525
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136794 acggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 17136695  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  17136694 atatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagac 17136601  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17136600 ttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgttttaatgat 17136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29925409 - 29925137
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925409 gacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaata 29925310  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29925309 tcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactta 29925210  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29925209 atgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacataatagcctccatgctttaatgat 29925137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29974562 - 29974290
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974562 gacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaata 29974463  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29974462 tcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactta 29974363  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29974362 atgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacataatagcctccatgctttaatgat 29974290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16200868 - 16200598
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16200868 gacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacatagtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaata 16200769  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  16200768 tcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttg 16200669  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatga 299  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16200668 ataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtcttcatgctttaatga 16200598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Original strand, 24253179 - 24253427
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcat 145  Q
    |||||| |||||| ||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||    
T  24253179 acaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaatg-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-at 24253276  T
Q  146 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 245  Q
    ||| ||  ||||| | ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24253277 aacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataa 24253374  T
Q  246 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    |  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24253375 ttcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctctatgctttaatg 24253427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 15846585 - 15846847
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  15846585 gacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 15846683  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15846684 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 15846780  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  15846781 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15846847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21034491 - 21034229
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  21034491 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 21034393  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21034392 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 21034296  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  21034295 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 21034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 20147603 - 20147865
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  20147603 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 20147701  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20147702 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 20147798  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20147799 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20147865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14890553 - 14890391
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14890553 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 14890457  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 286  Q
     |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14890456 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21399045 - 21398792
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | ||||||    
T  21399045 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaata 21398947  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  21398946 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttg 21398850  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 286  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21398849 atatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacataatagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 55427274 - 55427012
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||    
T  55427274 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaata 55427176  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  55427175 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagactta 55427079  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  55427078 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 55427012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147012
Alignment:
Q  77 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 176  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 276  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  277 taatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttta 14147012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12300116 - 12299902
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  12300116 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 12300020  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  12300019 gtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 12299922  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  12299921 ataatagtctcgacgcttta 12299902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 25978777 - 25979039
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  25978777 gacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata 25978875  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||     
T  25978876 tcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaataattatacctatgtatagactta 25978972  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| || | |  ||||||| | | ||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  25978973 atatctc-atatctataacccatgagatgcggttatcagtcaacatacataatagtctcgacgcttta 25979039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15527006 - 15526827
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || | | ||||||    
T  15527006 gacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccattaacattgtaagaata 15526908  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    |||||||||| |||||||| |   |||||| ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526907 tcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089786
Alignment:
Q  248 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgat 19089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  53 actcgactccaacatttagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataac 148  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  149 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 245  Q
      | |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11787749 - 11787578
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  11787749 tgagaatatcttatga-aaatatcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgta 11787653  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | | ||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  11787652 tagacttaatatctc-atatctataaccaatgagatgcggttatcagtcaacatacataatagtctcgacgcttta 11787578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 283
Target Start/End: Original strand, 15317269 - 15317472
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  15317269 catagtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 15317365  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||| ||||| |||    
T  15317366 gtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatac 15317464  T
Q  276 ataatagt 283  Q
    ||||||||    
T  15317465 ataatagt 15317472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504453
Alignment:
Q  201 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaa 296  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatcctttaa 9504453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  118 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  217 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 247  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200291
Alignment:
Q  227 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgat 16200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 290
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  175 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | | |    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  275 cataatagtctctatg 290  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28088359 - 28088227
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  28088359 gacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata 28088261  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 164  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088260 tcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30464203 - 30464147
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatctta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  30464203 catagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatcattatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18252471 - 18252196
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252471 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 18252372  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252371 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18252272  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252271 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18252196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 18532280 - 18532555
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532280 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 18532379  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532380 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18532479  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532480 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacataatagtctctatgctttaatgat 18532555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 27131176 - 27131450
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131176 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 27131274  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131275 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 27131374  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27131375 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 27131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27310346 - 27310618
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27310346 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaata 27310445  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27310446 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttg 27310545  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27310546 ataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 27310618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 16358801 - 16359076
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358801 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 16358900  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16358901 atatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggc 16359000  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16359001 ttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 16359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 36816403 - 36816672
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  36816403 gacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataatt 36816502  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36816503 t-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttg 36816601  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816602 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatg 36816672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 3855685 - 3855957
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3855685 acggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacatagtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgaga 3855784  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3855785 atatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagac 3855884  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  3855885 tttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgtaatagtctccatgctttaat 3855957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 107 - 300
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171274
Alignment:
Q  107 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  207 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 21171274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Original strand, 27277328 - 27277596
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277328 acaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacatagtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatat 27277427  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  27277428 cttatggcacttt-catgacttttactatgcaatattcttatggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatga 27277526  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27277527 taactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacataatagtctctatgctttaatg 27277596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 22641643 - 22641871
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22641643 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaata 22641742  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||     
T  22641743 tcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtcaatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacactta 22641838  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641839 ataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657262
Alignment:
Q  146 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  246 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgat 22657262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 28134772 - 28135034
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  28134772 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 28134870  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28134871 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 28134967  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  28134968 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataattgtctcgacgcttta 28135034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 19706488 - 19706750
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  19706488 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 19706586  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19706587 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 19706683  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19706684 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 19706750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23507300 - 23507096
Alignment:
Q  64 acatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagt 162  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| || ||| ||  || |||||     
T  23507300 acatctagggtacacagtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg-ctttttacacaacgtt--ctctgtagc 23507204  T
Q  163 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 262  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23507203 attctaatggtgggttaatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatca 23507104  T
Q  263 tcagtcta 270  Q
    ||||||||    
T  23507103 tcagtcta 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 43802414 - 43802676
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  43802414 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 43802512  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43802513 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 43802609  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  43802610 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 43802676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 297
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014322
Alignment:
Q  57 gactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttact 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||| | |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  156 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 255  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagat 12014280  T
Q  256 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  12014281 gtgatcatcattctacccacataatggtctttacgctttaat 12014322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9456369 - 9456107
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  9456369 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 9456271  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9456270 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 9456174  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  9456173 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 9456107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 20779694 - 20779956
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  20779694 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 20779792  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20779793 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 20779889  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20779890 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20779956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 22670306 - 22670568
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  22670306 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 22670404  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22670405 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 22670501  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22670502 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22670568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 42817038 - 42817300
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  42817038 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 42817136  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42817137 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 42817233  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  42817234 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 42817300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 20391288 - 20391550
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | ||||||||    
T  20391288 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaata 20391386  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  20391387 tcttatgaaaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttg 20391483  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20391484 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20391550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 171
Target Start/End: Original strand, 9916543 - 9916688
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatga 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9916543 acggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacatagtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatga 9916642  T
Q  123 gaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 171  Q
    |||||  |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916643 gaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22612745 - 22612483
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  22612745 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 22612647  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  22612646 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttg 22612550  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22612549 atatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22612483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917957
Alignment:
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 276  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  277 taatagtctctatgctttaatg 298  Q
    || || ||||||||||| ||||    
T  9917936 tagtattctctatgcttcaatg 9917957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 634187 - 633934
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  634187 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata 634089  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  634088 tcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagactta 633992  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 286  Q
    ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  633991 atatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 633934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8727920 - 8727658
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  ||| |||||  |||||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| |||||||    
T  8727920 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcatagtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaata 8727822  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||     
T  8727821 tcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatcaatccagtataaatattacttctaatatttatacttatgtatagactta 8727725  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  8727724 atatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatagataatagtctcgacgcttta 8727658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 47667668 - 47667785
Alignment:
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  47667668 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacataca 47667766  T
Q  277 taatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  47667767 taatagtctcgacgcttta 47667785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930573
Alignment:
Q  154 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 253  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  254 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| | |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgcttta 35930573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29096928 - 29096789
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||| || || ||    
T  29096928 catagtggtttcatgtctaagagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataacatg--ctatgtagtattcacacggtgg 29096832  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096831 atcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  79 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 178  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  179 aatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 270
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  181 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 270  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 51997485 - 51997353
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | || ||||| |||||||||| ||||||| || || |||||  |||  || ||||||||||||||| ||    
T  51997485 catagtagtttctggtctaagcgtggtatatatcattatcaatatgagaataacttatgatacatt-cataatattt--tacgtagtattctcatggtgg 51997389  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997388 gtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 278
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  152 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 251  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  252 agatgtgatcatcagtctacctacata 278  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Original strand, 24301713 - 24301855
Alignment:
Q  88 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaata 187  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  | ||||||| |||||||| ||  || |   || ||||    
T  24301713 aggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtattctcgtgatgggtatttctaata 24301810  T
Q  188 -taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 231  Q
      |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24301811 gcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaaatcttgataa 24301855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  81 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 126  Q
    |||||| ||| |||| | |||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  118 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacacttt-cataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Original strand, 6702 - 6975
Alignment:
Q  27 ggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6702 ggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaat 6801  T
Q  127 atcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6802 atcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactt 6901  T
Q  227 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 13716 - 13991
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13716 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 13815  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13816 atatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagac 13915  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13916 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7548 - 7273
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7548 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 7449  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7448 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 7349  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7348 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 24695232 - 24695507
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695232 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 24695331  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695332 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 24695431  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24695432 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttattgat 24695507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 19714264 - 19714539
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19714264 acggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgaga 19714363  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714364 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 19714463  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714464 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 19714539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 18569627 - 18569904
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18569627 acggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgata 18569726  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569727 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 18569826  T
Q  225 ttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18569827 ttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaacataatagtctttatgctttaatgat 18569904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 19706985 - 19707259
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19706985 acggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacatagttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgaga 19707083  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19707084 aaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagat 19707183  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19707184 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 19707259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538754
Alignment:
Q  101 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  201 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgat 39538754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 295
Target Start/End: Original strand, 18806850 - 18807070
Alignment:
Q  73 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||  |||||||  |||||||||    
T  18806850 gtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagtta-caaaacttt--ctatgtatcattctcatg 18806946  T
Q  172 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 271  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  18806947 gtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatcagtctac 18807046  T
Q  272 ctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  18807047 ccgcataatagtctctatgcttta 18807070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 17298667 - 17298912
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgag 123  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17298667 acggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacatattggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgag 17298766  T
Q  124 aatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaaga 223  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17298767 aataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaaga 17298863  T
Q  224 cttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 270  Q
     || |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298864 tttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 17285560 - 17285759
Alignment:
Q  69 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 167  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||    
T  17285560 tagggtacatattgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattct 17285656  T
Q  168 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 267  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17285657 cattgtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagt 17285756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 112 - 298
Target Start/End: Original strand, 22546872 - 22547055
Alignment:
Q  112 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22546872 tatcattatgaaaataacttatgata-tttacataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttata 22546968  T
Q  212 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  22546969 tctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcggtctatccacataatagtctctatattttaatg 22547055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20941280 - 20941018
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  20941280 gacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 20941182  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20941181 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 20941085  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20941084 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20941018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 25805434 - 25805696
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  25805434 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 25805532  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25805533 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 25805629  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  25805630 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 25805696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Original strand, 27347311 - 27347428
Alignment:
Q  35 tttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatg 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27347311 tttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatg 27347410  T
Q  135 acacttttcataactttta 153  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27347411 acac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32152 - 31890
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  32152 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 32054  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32053 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 31957  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  31956 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22941503 - 22941241
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  22941503 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 22941405  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  22941404 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttg 22941308  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22941307 atatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22941241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23546175 - 23545913
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  23546175 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 23546077  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23546076 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 23545980  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23545979 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 23545913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 12789712 - 12789974
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | ||||||||    
T  12789712 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaata 12789810  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  12789811 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttg 12789907  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12789908 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 12789974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 24933355 - 24933617
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||    
T  24933355 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaata 24933453  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  24933454 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagactta 24933550  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  24933551 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 24933617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31097069 - 31096807
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  31097069 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 31096971  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||     
T  31096970 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagactta 31096874  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  31096873 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 31096807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 284
Target Start/End: Original strand, 20100292 - 20100543
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||| | |||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  20100292 gacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatgtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaata 20100390  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||     
T  20100391 tcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataagtattactcctaatattgatacctatctatagactta 20100487  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 284  Q
    ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20100488 atatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5097903 - 5097642
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| | |||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||     
T  5097903 acaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataa 5097805  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| |    
T  5097804 cttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaa 5097708  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    || |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  5097707 tatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 5097642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 12765086 - 12765305
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatgg 172  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| |   | |||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  12765086 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataac--ttactatgtagtattctcacgg 12765183  T
Q  173 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||     
T  12765184 tgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctaca 12765282  T
Q  273 tacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  12765283 tacataatagtctcgacgcttta 12765305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 18806490 - 18806619
Alignment:
Q  73 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  |||||||||    
T  18806490 gtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcattctcatg 18806586  T
Q  172 gcggatcaatccaatataaatattactcctaat 204  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806587 gtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 18806670 - 18806799
Alignment:
Q  73 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  |||||||||    
T  18806670 gtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcattctcatg 18806766  T
Q  172 gcggatcaatccaatataaatattactcctaat 204  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806767 gtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 298
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347517
Alignment:
Q  206 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgctttaatg 27347517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 7865526 - 7865745
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 172  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  7865526 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 7865623  T
Q  173 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||||||||||     
T  7865624 tgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctaca 7865722  T
Q  273 tacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  7865723 tacataatagtctcgacgcttta 7865745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829530
Alignment:
Q  73 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  172 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 24701996 - 24702057
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggttt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24701996 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 9811829 - 9812048
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 172  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  9811829 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 9811926  T
Q  173 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||     
T  9811927 tgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctaca 9812025  T
Q  273 tacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||| ||||||| | ||||||    
T  9812026 tacatagtagtctcgacgcttta 9812048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 12703970 - 12704189
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 172  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  12703970 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 12704067  T
Q  173 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||     
T  12704068 tgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctaca 12704166  T
Q  273 tacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||| ||||||| | ||||||    
T  12704167 tacatagtagtctcgacgcttta 12704189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26245264 - 26245093
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26245264 tgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgcagtattctgacagtggatcaatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgta 26245168  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  26245167 taaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 26245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 26129789 - 26129928
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||| || ||    
T  26129789 catagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtgg 26129885  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129886 gtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Original strand, 31651917 - 31652095
Alignment:
Q  112 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   ||||||||| ||||||||| |  | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  31651917 tatcactatgagaatatcttatgatac--ttcataac--atactatgtaatattctcatagtaggtcaatccattattaatgttactcctaatattttta 31652012  T
Q  212 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     | ||||  | |||| ||| |||  |||| |||| | ||||||  |  |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  31652013 ccaatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccgtgagacttagtcatcagtctacatacatagtagtctctatgtttta 31652095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477321
Alignment:
Q  154 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 253  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  254 atgtgatcatcagtctacctacataatagt 283  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataatagt 33477321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  241 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 25756 - 26031
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25756 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 25855  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25856 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtc 25955  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25956 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtcgctatgctttaatgat 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 21330014 - 21330289
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330014 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 21330113  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21330114 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagac 21330213  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330214 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacataatagtctctatgctttaatgat 21330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18796943 - 18796672
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18796943 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatat 18796844  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796843 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 18796744  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18796743 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctcaatgctttaatgat 18796672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18620232 - 18619973
Alignment:
Q  37 tgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgac 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18620232 tgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgac 18620133  T
Q  137 acttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18620132 acttt-cataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctt 18620034  T
Q  237 tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18620033 tatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacccacataatagtctatatgctttaat 18619973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Original strand, 22183273 - 22183522
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttca 144  Q
    |||||| |||||||||| ||||  || |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  ||| ||    
T  22183273 acaaagtactcgactcctacatcaagagtacacgttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttaca 22183371  T
Q  145 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 244  Q
    |||| ||   ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  22183372 taacatta--tatgtaacattgtcatggcgggtcaatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaag 22183468  T
Q  245 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  22183469 atctgtgagatttgatcatcaatctacccacgtaatagtctctatactttaatg 22183522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36270583 - 36270334
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttca 144  Q
    |||||| | |||||||  |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| ||    
T  36270583 acaaagtattcgactcatacatctagggtgcatggtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttaca 36270486  T
Q  145 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 244  Q
    ||| |||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || |||    
T  36270485 taatttt--ctatgtaacattctcatggcgagtcaatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatg 36270388  T
Q  245 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatg 298  Q
    |   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  36270387 actcgtgagatgtgatcatcagtctacccacacaatagtctttatactttaatg 36270334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 291
Target Start/End: Original strand, 6991903 - 6992146
Alignment:
Q  48 aaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcata 146  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||    
T  6991903 aaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggccgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcactta-cata 6992001  T
Q  147 acttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatg 244  Q
    | |||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||     
T  6992002 atttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataaatattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttata 6992099  T
Q  245 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 291  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||    
T  6992100 atctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatctttatgc 6992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18822499 - 18822249
Alignment:
Q  48 aaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcata 146  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  |||| ||||    
T  18822499 aaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacata 18822401  T
Q  147 acttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 246  Q
    || |||  ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  18822400 acgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatataaatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgat 18822303  T
Q  247 ctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  18822302 ccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatctgctttaatgat 18822249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20978292 - 20978091
Alignment:
Q  47 caaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcat 145  Q
    ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  20978292 caaagtactcgaatcctacatctagggtacatagtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcat 20978194  T
Q  146 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 245  Q
    || |||  | || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978193 aatttt--ccatataaaattctcatggcgggtcaatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatga 20978096  T
Q  246 tctgt 250  Q
    |||||    
T  20978095 tctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30174630 - 30174368
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  30174630 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 30174532  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30174531 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 30174435  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  30174434 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 30174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 24250128 - 24250343
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  24250128 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 24250224  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  24250225 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 24250323  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  24250324 ataatagtctcgacgcttta 24250343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279458
Alignment:
Q  154 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 253  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  254 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaa 296  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgctttaa 19279458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852085
Alignment:
Q  156 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 255  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagat 18852055  T
Q  256 gtgatcatcagtctacctacataatagtct 285  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18852056 gggatcattagtctaccgacataatagtct 18852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 295
Target Start/End: Original strand, 24229338 - 24229526
Alignment:
Q  103 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta 202  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  24229338 atacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactccta 24229434  T
Q  203 atatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  24229435 atatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 24229526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 15342098 - 15342237
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || ||    
T  15342098 catagtggtttcaggtctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacac-tttcataac--atactatgtagtattttcacggtgg 15342194  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342195 gttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29800677 - 29800468
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  29800677 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtgg 29800581  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt---atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 272  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| || | | | |   |||||||| |  || |||||||||||||||||||     
T  29800580 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacccatgtatatacttaattaatatctcacatccatgacccatgggatgtgatcatcagtctaca 29800481  T
Q  273 tacataatagtct 285  Q
    |||||||||||||    
T  29800480 tacataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17241146 - 17241034
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17241146 acaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacatagtggttttaggtcgaagg-tgaaatacaccattatcactatgagaatat 17241048  T
Q  129 cttatgacactttt 142  Q
    ||||| ||||||||    
T  17241047 cttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 280
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  276 ataat 280  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19616641 - 19616435
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||| || ||    
T  19616641 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataaaat--actatgtagtattctcacggtgg 19616545  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||   |||  ||||    ||||||||| |||||||||||| |||    
T  19616544 gtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct-aatatttatgactcatgagatgtggtcatcagtctacatac 19616446  T
Q  276 ataatagtctc 286  Q
    |||||||||||    
T  19616445 ataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 211
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  77 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 176  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||   |||||||||||||||| ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 276  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  277 taatagtc 284  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  46 acaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763868
Alignment:
Q  177 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 276  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||  | || |||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacgtaatatctc-atgtctatgacccatgagacgtggtcatcagtctacataaa 24763849  T
Q  277 taatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24763850 taatagtctcgatgcttta 24763868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 41316412 - 41316506
Alignment:
Q  112 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| || ||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  41316412 tatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataatattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098654
Alignment:
Q  250 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatgtttta 12098654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 28740922 - 28740986
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 140  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740922 catagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 215
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  152 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 215  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1434 - 1159
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1434 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga 1335  T
Q  125 atatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagac 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  1334 atatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatggcaagac 1235  T
Q  225 ttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1234 ttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5963 - 5695
Alignment:
Q  25 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||         ||||||    
T  5963 acggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggtacatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgag 5873  T
Q  124 aatatcttatgacactttt-cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5872 aatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag 5773  T
Q  223 acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5772 acttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 230160 - 230367
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  230160 gacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaata 230259  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230260 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 230359  T
Q  228 ataactct 235  Q
    ||||||||    
T  230360 ataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 174
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  436 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 338  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  337 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 241  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  240 atatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacataatagtctcgacgcttta 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 130273 - 130535
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  130273 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 130371  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  130372 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 130468  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  130469 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 130535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8296
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  276 ataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  8315 ataatagtctcgacgcttta 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 3724 - 3986
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  3724 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 3822  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3823 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 3919  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3920 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 3986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 119983 - 119721
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||    
T  119983 gacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata 119885  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  119884 tcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttg 119788  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  119787 atatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacataatagtctcgacgcttta 119721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 286
Target Start/End: Original strand, 40038 - 40290
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||    
T  40038 acaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcatagtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatat 40136  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  40137 cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaa 40233  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 286  Q
    || |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40234 tatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacataatagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Original strand, 12999 - 13260
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| |||||||||||    
T  12999 acaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattatgagaatat 13097  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 228  Q
    ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  13098 cttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaa 13194  T
Q  229 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    || |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  13195 tatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctcgacgcttta 13260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26775 - 26609
Alignment:
Q  48 aaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa 147  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26775 aaagcactcgagtcca-catatagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataa 26678  T
Q  148 cttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 218  Q
    | |  ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26677 cat--actatatagtattctcaaggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 67423 - 67685
Alignment:
Q  28 gacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 127  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||    
T  67423 gacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata 67521  T
Q  128 tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttg 227  Q
    ||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  67522 tctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagactta 67618  T
Q  228 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  67619 atatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgcttta 67685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 297
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90154
Alignment:
Q  163 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtgagatgtgatc 261  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||     
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgatt 90118  T
Q  262 atcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 297  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  90119 atcagtctatctacatagtagtctttatgctttaat 90154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8981 - 8722
Alignment:
Q  31 aacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatct 130  Q
    ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8981 aacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatacaccattatcactatgagaatatct 8883  T
Q  131 tatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 230  Q
    ||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||||   |  ||| |||    
T  8882 tatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatatttacacatatgcatatccttaata 8786  T
Q  231 actctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
     |||  |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  8785 tctc-atatctatgacatgtgagacgtgatcatcaatctacatacatattagtctctacgcttta 8722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  76 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 175  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacacctt-cgtaacat--actatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  176 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 53927 - 53766
Alignment:
Q  120 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |||| ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  53927 tgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgta 53831  T
Q  220 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 285  Q
     ||| || ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  53830 tagaattaatacctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacataatagtct 53766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 238 - 102
Alignment:
Q  29 acaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 128  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| ||| |||||  || |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||    
T  238 acaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcagagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatat 140  T
Q  129 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 169  Q
    |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  139 cttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Original strand, 11699 - 11758
Alignment:
Q  152 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 211  Q
    ||||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11699 tactatgtagtattctcacagtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  156 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta----atatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 247  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11328
Alignment:
Q  103 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 199  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||    
T  11421 atacaccattatcactattagaataacttataaca-tcttcataacat--actatgtagtattctcatggtgggtaaatccatcataaatattactc 11328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15134
Alignment:
Q  250 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 295  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttta 15134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1966 times since January 2019
Visitors: 2201