View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0154_2D_high_1 (Length: 1679)

Name: NF0154_2D_high_1
Description: NF0154_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0154_2D_high_1
NF0154_2D_high_1
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (23-1656)||(35968739-35970374)
chr4 (135-543)||(35974244-35974651)
chr4 (890-1523)||(28125361-28126001)
chr4 (802-1636)||(36635747-36636584)
chr4 (1036-1523)||(29677038-29677526)
chr4 (15-174)||(35970275-35970434)
chr4 (1032-1598)||(36612402-36612972)
chr4 (167-521)||(36634109-36634464)
chr4 (1198-1649)||(36909985-36910436)
chr4 (785-1161)||(18360931-18361312)
chr4 (866-1398)||(55965713-55966248)
chr4 (1245-1523)||(20211127-20211405)
chr4 (785-1161)||(36601616-36601998)
chr4 (1167-1442)||(36627383-36627658)
chr4 (658-996)||(36642259-36642601)
chr4 (870-1118)||(36627091-36627342)
chr4 (1354-1650)||(18364634-18364930)
chr4 (1354-1650)||(36597995-36598291)
chr4 (658-992)||(36630399-36630747)
chr4 (347-504)||(36641580-36641737)
chr4 (1486-1650)||(36665400-36665564)
chr4 (318-478)||(36663912-36664073)
chr4 (1486-1649)||(36643123-36643286)
chr4 (75-182)||(35970321-35970426)
chr4 (662-909)||(36910721-36910978)
chr4 (652-995)||(36664524-36664872)
chr4 (167-280)||(36641430-36641542)
chr4 (370-521)||(36661371-36661517)
chr4 (1198-1315)||(18364990-18365107)
chr4 (1198-1315)||(36597818-36597935)
chr4 (1025-1101)||(43941954-43942030)
chr4 (1494-1629)||(36629772-36629907)
chr4 (374-461)||(36632048-36632135)
chr4 (128-218)||(36911673-36911761)
chr4 (1212-1514)||(18083626-18083928)
chr4 (1212-1514)||(36616752-36617054)
chr4 (171-277)||(36663768-36663873)
chr4 (1036-1118)||(36664919-36665001)
chr4 (1041-1118)||(36616590-36616667)
chr4 (1354-1519)||(38862637-38862804)
chr4 (1036-1118)||(18084012-18084094)
chr4 (870-960)||(18365336-18365426)
chr4 (1040-1118)||(36630273-36630351)
chr4 (1053-1118)||(18365178-18365243)
chr4 (1053-1118)||(36597682-36597747)
chr4 (1349-1442)||(36642953-36643046)
chr4 (1053-1118)||(36910512-36910577)
chr4 (1024-1260)||(36655955-36656190)
chr4 (325-521)||(36911391-36911592)
chr4 (378-485)||(29678661-29678768)
chr4 (870-937)||(36597498-36597565)
chr4 (371-461)||(18361845-18361935)
chr4 (371-461)||(36600992-36601082)
chr4 (1053-1118)||(36642658-36642723)
chr4 (1040-1129)||(52187783-52187872)
chr4 (634-704)||(36635571-36635641)
chr4 (1359-1401)||(36665240-36665282)
chr4 (652-937)||(18084195-18084485)
chr4 (678-775)||(18365527-18365624)
chr4 (678-775)||(36597301-36597398)
chr4 (1357-1440)||(36629952-36630035)
chr4 (1354-1441)||(18360665-18360756)
chr4 (83-128)||(35974604-35974649)
chr4 (1354-1441)||(36602173-36602264)
chr4 (1243-1304)||(36642844-36642905)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (1033-1656)||(33839341-33839954)
chr6 (866-1412)||(33843078-33843630)
chr6 (866-994)||(33839162-33839290)
chr6 (1347-1628)||(10812471-10812752)
chr6 (1347-1640)||(10811887-10812181)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1054-1652)||(42601950-42602540)
chr1 (790-994)||(42601686-42601890)
chr1 (518-582)||(42601472-42601535)
chr1 (1053-1118)||(28927459-28927524)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (790-1118)||(35336719-35337047)
chr8 (1349-1402)||(35336427-35336480)
chr8 (1240-1315)||(35336514-35336589)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (1032-1118)||(19657373-19657459)
chr5 (1032-1118)||(19674217-19674303)
chr5 (870-929)||(19657217-19657276)
chr5 (870-929)||(19674061-19674120)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (1054-1118)||(30597242-30597306)
chr7 (1053-1113)||(6849712-6849772)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (1243-1304)||(5356548-5356609)
chr3 (1053-1118)||(7119802-7119867)
chr3 (1554-1628)||(25597361-25597435)
chr3 (1053-1118)||(13460643-13460708)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (1054-1112)||(43429258-43429316)
chr2 (1053-1118)||(43863138-43863203)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 1482; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 1482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 1656
Target Start/End: Complemental strand, 35970374 - 35968739
Alignment:
Q  23 acaatatagtatctgagacatactctaagatggtcgctaag--agtatatcacaacaatata-tatccgagccatactctgagatggtcgctaaataagt 119  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35970374 acaatata-tatccgagccatactctgagatggtcgctaaataagtatatcacaacaatatagtatcccagacatactctgagatggttgctaaataagt 35970276  T
Q  120 a------tatcacaacaatatagtatccgagacatactctgagatggtcgctgaataagtatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctag 213  Q
    |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35970275 actactatatcacaacaatatagtatccgagacatactctgagatggtcgctaaataagtatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctag 35970176  T
Q  214 atgaatctcatggacctcaaatgaagaggtcgtgtgatagaccaagtgcttggcaaatcaaacatgtagtaaagtcagaaaatttgattctttttcagtc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35970175 atgaatctcatggacctcaaatgaagaggtcgtgtgatagaccaagtgcttggcaaatcaaacatgtagtaaagtcagaaaatttgattctttttcagtc 35970076  T
Q  314 acttatctaatatcttaaaagaaaggcttgcaaagaagacattgtaacttgtaggaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35970075 acttatctaatatcttaaaagaaaggcccgcaaataagacattgtaacttgtaggaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtc 35969976  T
Q  414 gctgttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatcgtcctgtaggcagaaaaagtaacaatgttgattatcactgcaaaatcaatct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969975 gctgttatgttggtgcttccccaccttctcttcattggatgatttatcgtcctgtaggcagaaaaggtaacaatgttgattatcactgcaaaatcaatct 35969876  T
Q  514 tatgaaaatgcatgtgaggaatgttaccttttcagtgtgagagagattggagattgagaggtgcagcaacagaagcaggagcagcggcagcggcagaagc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||    
T  35969875 tatgaaaatgcatgtgaggaatgttaccttttcagtgtgacagagattggagattgagaggtgcagcaacagaagcaggagcggcggcag------aagc 35969782  T
Q  614 aggtgtggtagatgaggagaaggcagacgcggcaaactgcgaatgatagttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgtttaataacagtc 713  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969781 aggtgtggtagatgaggaggaggcagacgcggcaaactgcgaatgatagttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgtttaataacagtc 35969682  T
Q  714 aatcataaactcttcttatatttatttaatttaatattatctaacctcagattctcacaaaagttatcaccgctcacttatggttttcaaataactacct 813  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969681 aatcacaaactcttcttatatttatttaatttaatattatctaacctcagattctcacaaaagttattaccgctcacttatggttttcaaataactacct 35969582  T
Q  814 ccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggagg 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969581 ccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggagg 35969482  T
Q  914 aggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttctttaacatggcattcactacgcggggtaat 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969481 aggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttactcgacttggcagcaactttctttaacatggcattcactacgcggggtaat 35969382  T
Q  1014 cccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaa 1113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35969381 cccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaatatatcaggaactaaggagagaa 35969282  T
Q  1114 tctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaaacaaaattttgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagt 1213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969281 tctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaaacaaaattttgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagt 35969182  T
Q  1214 aaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaac 1313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969181 aaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaac 35969082  T
Q  1314 cataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccg 1413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35969081 cataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccg 35968982  T
Q  1414 gtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgata 1513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35968981 gtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtagacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatagctaaatcgacaagtgtctcacttgata 35968882  T
Q  1514 tcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcacc 1613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35968881 tcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcacc 35968782  T
Q  1614 ccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaatgctggc 1656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35968781 ccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaatgctggc 35968739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 135 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35974651 - 35974244
Alignment:
Q  135 agtatccgagacatactctgagatggtcgctgaataagtatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctagatgaatctcatggacctcaaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35974651 agtatccaagacatactctgagatggtcgctaattaattatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctagatgaatctcatggacctcaaa 35974552  T
Q  235 tgaagaggtcgtgtgatagaccaagtgcttggcaaatcaaacatgtagtaaagtcagaaaatttgattctttttcagtcacttatctaatatcttaaaag 334  Q
    ||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35974551 tgaagagatcatgcgatagaccaaatgcttggcaaatcaaacatgtagtaaagtcatgaaaattgatt-tttttcagtcacttatctaatatcttaaaag 35974453  T
Q  335 aaaggcttgcaaagaagacattgtaacttgtaggaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccc 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  35974452 aaaggctcgcaaagaagacattgtaacttgtaggaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcggtgataggttggtgcttccc 35974353  T
Q  435 caccttctcttgattggatgatttatcgtcctgtaggcagaaaaagtaacaatgttgattatcactgcaaaatcaatcttatgaaaatgcatgtgaggaa 534  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35974352 caccttatcttcattggatgatttattgtcctaaaggcagagaaagtaacaatgtcagttattactgcaaaatcaatcttatgaaaatgcatgtgaggaa 35974253  T
Q  535 tgttacctt 543  Q
    |||||||||    
T  35974252 tgttacctt 35974244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 890 - 1523
Target Start/End: Complemental strand, 28126001 - 28125361
Alignment:
Q  890 aactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgactt-ggcagcaactttctttaa 988  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| || ||||||||  |  |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  28126001 aactattccgtccggtatgggaggtggttcagaacctgcttcaaattctgtttgtaacccgtcagcttcttcacgtgactttggcagcagctttctttaa 28125902  T
Q  989 catggcatt---cactacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacc 1085  Q
    ||||  |||   | |||    |||||||  |  ||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28125901 catgcgatttttcgctatttagggtaataacccttgtgcttgaggtggtgccaattttatttccatcgacttcaagtaacacaaagaacggagcttaacc 28125802  T
Q  1086 tctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaa----acaaaattt 1181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    |||||        
T  28125801 tctagtaaatcaggaactaaggagagaatctaaacaatgaaggatgaaagtgaaataagatcagttatgcatgtcaattgattttaattaaacaaataca 28125702  T
Q  1182 tgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttaca 1281  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |   |  |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||     
T  28125701 tgaaataccatacagaatcttaacaagaaagtaaaattaaagtcccggaacatgccaatgtacctgaagagtagttgaagagaatgtcaatgactttact 28125602  T
Q  1282 ttggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagac 1381  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||| | |||| || | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28125601 ttggcaaggcctagcagccaactcaatagaaccattggaggctcgtcccaatgtaaatgaatgtctgcagcaatatttacatgtttcacagaagaaagac 28125502  T
Q  1382 cgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatg 1481  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||   ||  ||||||||| || ||| |  ||||||| || |||    
T  28125501 tgcttccacatattttctgatcaggaataccggtaaaagtaaaggaacaaagactcggaccaga-tactcaattttggcaaagtcggatgaatcattatg 28125403  T
Q  1482 catggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggat 1523  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28125402 catagctaaaacgacaagtgtctcgcttgatatgtttaggat 28125361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 802 - 1636
Target Start/End: Original strand, 36635747 - 36636584
Alignment:
Q  802 aaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatc 901  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||||  |||||||||||| ||     | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36635747 aaataactacctgcttaagattaaaacaagccgggtaatttgttgtgatgttaacttcggcggattgcgagttttgacgcaagaattcaactattccatc 36635846  T
Q  902 tggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttctttaacatggcat---tc 998  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||    
T  36635847 aggtatgggaggtggttccaaacgtgctttaaaagcctttcttaacttggcagcttctttacgtgacttggcagcagctttctttaacatggcttctttc 36635946  T
Q  999 actacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggtt-ccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatca 1097  Q
    || | |  ||||||| ||| |||| ||   | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  36635947 accaggttgggtaatgccatttga-ttactacaggtttccagttttatttccatagacttcaagttacacaaagaaggcagcttaacctctagtaaatca 36636045  T
Q  1098 ggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaaacaaaattttgaaataacgtaaaga 1197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | ||| || |||||| ||  ||   ||||| |||||||   ||| ||||||| ||||  ||||||  | ||||    
T  36636046 ggaactaatgagagaatctaaacaattaggaatgaaagtgaattagaatagcttatgaaagtcaagtgattctaaacaatatttaaaaataaaatgaaga 36636145  T
Q  1198 atcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagca 1297  Q
    | ||  | |||| ||||| ||||| |||||||||||| |  |  |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36636146 acctcgataagagagtaatattaaagcttcaaaacattcaaacatacccgaagagtagttgaagagaccatcaatgattttacattggcaaggtttagca 36636245  T
Q  1298 gccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatatttt 1397  Q
    |||||   ||||||| || ||||| ||| ||  |  |||||  ||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36636246 gccagtcgaatagaatcaaaggaggctcatcccatcttgaaaacatttctgctttaatctttacttgtttgacagaagaaagaccactcccacatatttt 36636345  T
Q  1398 ctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgaca 1497  Q
    ||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||  | ||| |    ||||| || | ||||    |||| ||||    
T  36636346 ctgaacaggagtaccagtaaaagtaaaggtacaaagacttggagcacataactcaatttttgcaaagtcttctgaataattacgcattttaaaattgaca 36636445  T
Q  1498 agtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacac 1597  Q
    || || |||||||||||| |||||||||| ||||||  || | ||||||    || |||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| ||| |||    
T  36636446 agggtttcacttgatatcctgaggatttgtgcatcccttaccctacaactacgaatgaccaaactagtcaacttgggaaaggccaaaaagggctcagcac 36636545  T
Q  1598 agccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagat 1636  Q
    | || |||| | |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  36636546 aaccattttcaccaccgcaaaagttgaaatttgttagat 36636584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1036 - 1523
Target Start/End: Complemental strand, 29677526 - 29677038
Alignment:
Q  1036 ccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagag 1135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | || || |||||    
T  29677526 ccaatttaatttccatcgacttcaagttacacaaagagtggagcttaacctctggtaaatcaggaactaaggagagaatctgaacaatgaataatgagag 29677427  T
Q  1136 tgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaaacaaaattttgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatg 1235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||| |    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||    
T  29677426 tgaaataagatcagttatgcatatcaattgattttaaacagatacatgaaataacatacagaatattaacaagaaggtaaaattaaagtctcggaacatg 29677327  T
Q  1236 cctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaattt 1335  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||      
T  29677326 ccaatgtacctgaagagtagttgaagagaatgtcaatgactttacattggcaaggccttgcagccaactcaatagaaccattggaggctcctcccaatgg 29677227  T
Q  1336 gaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagac 1435  Q
     |||| || | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| || | ||||| ||| |||||||    
T  29677226 aaatgaatgtctgcagcaatatttacatgtttcacagaagaaagaccgcttccacatatttgctgatcaggactaccagtgaaagtaagggtacaaagac 29677127  T
Q  1436 t-aggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggat 1523  Q
    | |||||| || ||||||||||  | ||| |  ||||| |||  |||| |  |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  29677126 tcaggagtagataactcaatttttgcaaagtcggatgacttactatgcgtatctaaattgacaagtgtctcgcttgatatgtttaggat 29677038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35970434 - 35970275
Alignment:
Q  15 tggacatcacaatatagtatctgagacatactctaagatggtcgctaagagtatatcacaacaatatatatccgagccatactctgagatggtcgctaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35970434 tggacatcacaatatagtatctgagacatactctaagatggtcgctaagagtatatcacaacaatatatatccgagccatactctgagatggtcgctaaa 35970335  T
Q  115 taagtatatcacaacaatatagtatccgagacatactctgagatggtcgctgaataagta 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35970334 taagtatatcacaacaatatagtatcccagacatactctgagatggttgctaaataagta 35970275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1032 - 1598
Target Start/End: Original strand, 36612402 - 36612972
Alignment:
Q  1032 ggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacg 1131  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   | ||| |    
T  36612402 ggttccaattttatttctatagactttaagttgcacaaagaagggagcttaacctctaataaatcaggaattaaggagagaatctaagcaacaaggaatg 36612501  T
Q  1132 agagtgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaaacaaaattttgaaataacgtaaagaatct---taacaagaaagtaaaat-taatgcttc 1227  Q
    ||  |||| || ||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||  | |     
T  36612502 aggatgaattaggatcatttaggcaagtcaattaatttttaacaaaatttagacataaaataaagaatcttaataagaagaaagtaaaataaaaaacctg 36612601  T
Q  1228 aaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcct 1327  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| || | ||||| ||||| || ||  |    
T  36612602 aaaacatgacaaagtacctgaagagtagttgaagaaactgtcaatgattttacatcggcaagatcttgcagccaactgagtagaagcatagcaggctttt 36612701  T
Q  1328 caaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggt 1427  Q
    |  ||    |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||||||||    
T  36612702 cccaacaaaaatatatttctgcagcaatatttactagtttaacagaagaaagaccactcccacatattctctgatcaggatgaccggtataagtaaaggt 36612801  T
Q  1428 gcaaagactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttga 1527  Q
     ||||||||  ||||  | |||| ||||| |  ||| | | ||||| | | |||||| |||||||  || |||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  36612802 acaaagactctgagtaaataactgaattttgtcaaagtcatatgaactttcatgcatagctaaatttactagtgtctcgcttgatatcctgagggtttgt 36612901  T
Q  1528 gcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacaca 1598  Q
    ||||||   ||   ||| |  | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  36612902 gcatccctaattgcacatctatcaatgaccaaactattcaacttggtaaaggcggaagagggttcaacaca 36612972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 167 - 521
Target Start/End: Original strand, 36634109 - 36634464
Alignment:
Q  167 aataagtatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctagatgaatctcatggacctcaaatgaagaggtcgtgtgatagaccaagtgcttgg 266  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||      
T  36634109 aataagtatattacaatttggctttaaaattggagactaccagttagatgaa-ctcatggacctcaaatgaagagttcatgtgatcaaccaaatgcttct 36634207  T
Q  267 caaatcaaacatgt---agtaaagtcagaaaatttgattctttttcagtcacttatctaatatcttaaaagaaaggcttgcaaagaagacattgtaactt 363  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  ||  ||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |  || ||||| ||| |||| ||    
T  36634208 caaatcaaacatgtttcagtaaagtcagccaaactga-tatttttcagttacttatctgatgtcttaaaagaaaggttcacagagaaggcatcgtaattt 36634306  T
Q  364 gtaggaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatcgt 463  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||| || | ||| ||| ||| ||| |    
T  36634307 gtatgaaatatgagaactcttcactgctcattatctagaagtggagagttgttgttaggttggtgcttatccaccttatcgtcatttgattattaatcct 36634406  T
Q  464 cctgtaggcagaaaaagtaacaatgttgattatcactgcaaaatcaatcttatgaaaa 521  Q
    |||  |||||||||||| |||| |||   || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  36634407 cctaaaggcagaaaaagaaacactgtcagttgtcactgcaaaattaatcatatgaaaa 36634464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1198 - 1649
Target Start/End: Complemental strand, 36910436 - 36909985
Alignment:
Q  1198 atcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagca 1297  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  36910436 atcttaagaagaaagtaaaaataaagcttgaaaacatgacaaggtacctgaagagtagttgaagtgactgccaatgattctacattggcaaggtcttgca 36910337  T
Q  1298 gccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcat-ttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattt 1396  Q
    || |||| ||||||||||||| ||| |||||  ||| | ||  | | || |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||    
T  36910336 gcaagcttaatagaaccatagcagaatcctccgaatat-aacacttcttgtgcatcgatatttacttgtttaatagaagagagactgctcccatatattt 36910238  T
Q  1397 tctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgac 1496  Q
    |||||  | |   |||||||| ||||||||| |||||||| ||||  || ||||  | || |  ||| | |  | ||||||  |||| |||||||| |||    
T  36910237 tctgaagaaggtcaccggtaaaagtaaaggtacaaagacttggagcagataacttgaatttgacaaagtcaagtaaattatcgtgcagggctaaattgac 36910138  T
Q  1497 aagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaaca 1596  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| |    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||    
T  36910137 aagtgtctcacttgatatgttgaggatttgagcatcctttacctcacagctactaatgaccaaactattcaacttggtaaaggcgaaaaagggctcagca 36910038  T
Q  1597 cagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaa 1649  Q
    || ||||||| |  ||| |||||||| || |||  ||||| |||| |||||||    
T  36910037 caaccgttttcactaccgcaaaaggcaaagttttctagatacaaggtggtcaa 36909985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 785 - 1161
Target Start/End: Complemental strand, 18361312 - 18360931
Alignment:
Q  785 gctcacttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaag 884  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||  ||||| |||||||||||  |||  |||||| |||| | |||||    
T  18361312 gctcccttatggttttcaaataactacttgcttaagattaaatcaattcgaataatctgttaagatgttaactttggccgtcggtgaatttttttgcaag 18361213  T
Q  885 aaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttct 984  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||| |||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18361212 aagtcaactattccatcaggtatgggagatggtttcaaacttgcttcaaatgcctttcctaacttagcagcttctttacgtgacttggcagcaactttct 18361113  T
Q  985 ttaacatggcat---tcactacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagct- 1080  Q
    ||||||||||||   |||||| |  ||||||||||| |||  |   | |  |||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||     
T  18361112 ttaacatggcatcgctcactatgttgggtaatccca-ttggatgctaggtagttccagttttatttctgtagacttcaagttacacaaagaagatagctt 18361014  T
Q  1081 --caacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtca 1161  Q
       |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | ||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  18361013 aataacctctagtaaataaggaactaaggagagtatctaaagaatgaggattgagagtgaattaggataagttatgcaagtca 18360931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 866 - 1398
Target Start/End: Original strand, 55965713 - 55966248
Alignment:
Q  866 cggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttactt 965  Q
    ||||||||||||  | ||||| || |||||||||   ||||| | ||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |      
T  55965713 cggtgagttttgaagtaagaagtccactattcca---ggtattgaaggtggttttaaacccgcttcaaatgctttttgtaacttggtagcttcttcgcaa 55965809  T
Q  966 gacttggcagcaactttctttaacatggcat---tcactacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagt 1062  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |   ||| || | |||||||| |||  | |  || | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55965810 gactcggcagcatctttctttaacatggcttctttcattaagtggggtaattccatatcatctttaggtggttccaattctatttccgtcgacttcaagt 55965909  T
Q  1063 tacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtcaa 1162  Q
    ||||||||||| |||| |  | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || | | |||  || ||||| || || |||||||| |||||||    
T  55965910 tacacaaagaagggagtttgagctccaataaattgggaactaaggagagaatctaagcaataaggaataagggtgaattaggaccagttatgtaagtcaa 55966009  T
Q  1163 ccaattttaaacaaaattttg---aaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattga 1259  Q
       |||| ||| ||||  | |   ||||||  ||||||||| ||| | ||| |||||||| | || | ||  |||||| |||||||||||||||  || |    
T  55966010 ttgatttgaaaaaaaaaatggtagaaataaaataaagaatcctaagatgaatgtaaaattgaagcataaattcatgccaaggtacctgaagagttgttaa 55966109  T
Q  1260 agagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatattt 1359  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||   ||  |  |  |||| ||||||||    
T  55966110 agagactttcaatgatcttacactagcaaggtctagcagccagctcaatagaaccataggaggcttcacccaatcataaatcgctcgtgcaccaatattt 55966209  T
Q  1360 acttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttc 1398  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  55966210 acttgtttaacagaagaaagagcactcccacatattttc 55966248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1245 - 1523
Target Start/End: Original strand, 20211127 - 20211405
Alignment:
Q  1245 ctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcatt 1344  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||| |||| ||| ||  ||| | |||| ||     
T  20211127 ctgaagagtatttgaagagaatgtcaatgactttacattggcaaggcctagcaaccaaatcaatagaaccattggaggctcgtcccaatgtaaatgaatg 20211226  T
Q  1345 tttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtgg 1444  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||   |    
T  20211227 tttgcagcaatatttacatgtttcacagaagaaagaccgcttccacatattttctgatcaggaataccggtaaaagtaaaggtacaaagactcggaccag 20211326  T
Q  1445 acaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggat 1523  Q
    | |||||||||| || ||| |  ||||||| || |||||| ||||||  |||||||||||  |||||||| || |||||    
T  20211327 ataactcaattttggcaaagtcggatgaatcattatgcatagctaaaatgacaagtgtcttgcttgatatatttaggat 20211405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 785 - 1161
Target Start/End: Original strand, 36601616 - 36601998
Alignment:
Q  785 gctcacttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtc-gcaa 883  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||  ||||| |||||||||||  |||  |||||| |||| |  ||||    
T  36601616 gctcccttatggttttcaaataactacttgcttaagattaaatcaattcgaataatctgttaagatgttaactttggccgtcggtgaattttttttgcaa 36601715  T
Q  884 gaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttc 983  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||| |||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36601716 gaagtcaactattccatcaggtatgggagatggtttcaaacttgcttcaaatgcctttcctaacttagcagcttctttacgtgacttggcagcaactttc 36601815  T
Q  984 tttaacatggcat---tcactacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagct 1080  Q
    |||||||||||||   |||||| |  ||||||||||| |||  |   | |  |||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||    
T  36601816 tttaacatggcatcgctcactatgttgggtaatccca-ttggatgctaggtagttccagttttatttctgtagacttcaagttacacaaagaagatagct 36601914  T
Q  1081 ---caacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtca 1161  Q
        |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | ||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  36601915 taataacctctagtaaataaggaactaaggagagtatctaaagaatgaggattgagagtgaattaggataagttatgcaagtca 36601998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1167 - 1442
Target Start/End: Original strand, 36627383 - 36627658
Alignment:
Q  1167 ttttaaacaaaattttgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagact 1266  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||| | ||||||||| |||||| |||| || ||     
T  36627383 ttttaaacaaaatttagaaataaaataaagaatcttaagaagaaagaaaaattaaagccttaaaacatgacaaggtacctgcagagtagttgaggaaaca 36627482  T
Q  1267 atcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtt 1366  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |||||||| | ||||||||||||||||  |  ||     |||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  36627483 atcaatgattttacattggtaaattctcgcagccagttaaatagaaccataggagctttatccccgattgaatacattactgcagcaatatttacttgtt 36627582  T
Q  1367 taacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagt 1442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||   ||||||| |||||||| |||||    
T  36627583 taacagaagaaagaccgctcccacatattttatgaaaaggtataccggtaaacttaaaggtacaaagacttggagt 36627658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 658 - 996
Target Start/End: Original strand, 36642259 - 36642601
Alignment:
Q  658 gatagttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgtttaataacagtcaatcataaactcttcttatatttatttaatttaatattatctaa 757  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||  || ||| |||| | | |||||||    
T  36642259 gatagctgatgatcttagcgccctttatagattctacaacctgcttagtaacaaacaatcacaaactcttcttatggttgtttcatttgaaactatctaa 36642358  T
Q  758 cctcagattctcacaaaagttatcacc----gctcacttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgtt 853  Q
     || ||||||||| || | ||| |||     |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| | ||||||    
T  36642359 gctgagattctcaaaagaattaccacactcagctcccttatggattttaaataacaacctgcttaagattaaaacaatccgagtaatctgtaaagatgtt 36642458  T
Q  854 aacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggta 953  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||  |||  |||||| | |    
T  36642459 aacttccgcagacggtgagttttgtcgcaagaagtctactattccattaggtatggcaggtggttccaaacgagctttaaatgtctttcttaacttagca 36642558  T
Q  954 gcttctttacttgacttggcagcaactttctttaacatggcat 996  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  36642559 acttctttacttgacatggcagcatctttctttaacaaggcat 36642601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 870 - 1118
Target Start/End: Original strand, 36627091 - 36627342
Alignment:
Q  870 gagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgact 969  Q
    ||||||||  ||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||      
T  36627091 gagttttgaagcaagaagttgactattccatcaggtatggaaggtggtttccaacctgctttaaatgcttttcgtacctttgcagcttctttacgtgatg 36627190  T
Q  970 tggcagcaactttctttaacatggcat---tcactacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttaca 1066  Q
    |||||  | || |||||||||||||||   ||| || |  ||||||||| || |||  ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  36627191 tggcaatagctctctttaacatggcatctttcaatatgaagggtaatcctagctgaacttcgattggttccaattttatttccattgacttcaagttacc 36627290  T
Q  1067 caaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36627291 gaaagaagggagctcaacctccaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 36627342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1354 - 1650
Target Start/End: Complemental strand, 18364930 - 18364634
Alignment:
Q  1354 atatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaa 1453  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||   || ||||| |    
T  18364930 atatttatttttttaacagaaaaaagactgctcccacatattttctgaacaagcataccggaaaaagtaaaggtacaaagactaggaacagataactcga 18364831  T
Q  1454 tttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaag 1553  Q
    ||| || ||   | || |||  || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | || |||||||||  |||     
T  18364830 ttttggcaattcttgaagaacaataatgcatcgcaaaattgacaagtgtctcacttgatatgctgagaatttgagcatcttttaccttacaaccagaaat 18364731  T
Q  1554 gaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaat 1650  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||  |||| || |||||| ||| ||||||||    
T  18364730 aaccaaactattcaacttgggaaaggcggaaaagggctcagcacaaccgttttcaccaccgcaaaaggaaaaatgtgatagatctaagttggtcaat 18364634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1354 - 1650
Target Start/End: Original strand, 36597995 - 36598291
Alignment:
Q  1354 atatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaa 1453  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||   || ||||| |    
T  36597995 atatttatttttttaacagaaaaaagactgctcccacatattttctgaacaagcataccggaaaaagtaaaggtacaaagactaggaacagataactcga 36598094  T
Q  1454 tttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaag 1553  Q
    ||| || ||   | || |||  || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | || |||||||||  |||     
T  36598095 ttttggcaattcttgaagaacaataatgcatcgcaaaattgacaagtgtctcacttgatatgctgagaatttgagcatcttttaccttacaaccagaaat 36598194  T
Q  1554 gaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaat 1650  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||  |||| || |||||| ||| ||||||||    
T  36598195 aaccaaactattcaacttgggaaaggcggaaaagggctcagcacaaccgttttcaccaccgcaaaaggaaaaatgtgatagatctaagttggtcaat 36598291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 658 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 36630747 - 36630399
Alignment:
Q  658 gatagttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgtttaataa-------cagtcaatcataaactcttcttatatttatttaatttaatat 750  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||||| |||       ||  |||||| |||||||||||||   | ||| |||||| ||    
T  36630747 gatagttgataatcttctcaccctttatagattcttcaacctgtttagtaattagtatcaaccaatcacaaactcttcttatggctgtttcatttaaaat 36630648  T
Q  751 tatctaacctcagattctcacaaaagttatcacc-------gctcacttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattg 843  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||| | || |||       |||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||  ||    
T  36630647 tatctaagcttagattgtcaaaaaaataattaccacacttggctcccttatgacttttaaataactacctgcttaagattaaaacaacctgggtaatctg 36630548  T
Q  844 ttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttg 943  Q
    ||  |||||||||||| |||  ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   ||| |||||||||||||| || |||      
T  36630547 ttgtgatgttaacttcagccgacgacgggttttgtcgcaagaagtcaactattccatcaggtatggcaggtaattctaaacctgctttaaacgcctttct 36630448  T
Q  944 taacttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttctttaacatg 992  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36630447 taacttatcggcttctttacttgacttagcagcaactttctttaacatg 36630399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 347 - 504
Target Start/End: Original strand, 36641580 - 36641737
Alignment:
Q  347 agaagacattgtaacttgtaggaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccccaccttctcttg 446  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||  ||| ||||     
T  36641580 agaaggcatcgtaatttgtatgaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcggtgttagattggtgcttctccttcttatcttc 36641679  T
Q  447 attggatgatttatcgtcctgtaggcagaaaaagtaacaatgttgattatcactgcaa 504  Q
    |   ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  36641680 agctgatgatttatcatcctaaaggcagaaaaaataacactgtcaattatcactgcaa 36641737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1486 - 1650
Target Start/End: Original strand, 36665400 - 36665564
Alignment:
Q  1486 gctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaa 1585  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||    |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  36665400 gctaaattggcaagtgtatcacttgatatggtgaggatttgagcatcctttaccttacaactactaagggccaaactattcaacatggtaaagacggaaa 36665499  T
Q  1586 aggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaat 1650  Q
    |||| ||| |||| ||| ||| | |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36665500 agggctcagcacaaccgctttcaccaccgcagaaggcgaaatttgttatatctaagctggtcaat 36665564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 478
Target Start/End: Original strand, 36663912 - 36664073
Alignment:
Q  318 atctaatatcttaaaagaaaggcttgcaaagaagacattgtaacttgta-ggaaatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgct 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||||  | | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  36663912 atctgatatcttaaaagaaaggttcacaaaggaggcattgtaacaagaaaggcaatatgagaactcttcactggccattatctagaagtggtgagtcggt 36664011  T
Q  417 gttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatcgtcctgtaggcagaaaa 478  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  36664012 gttaggttggcgcttctccacctcatcttcatttgatgatttatcatcctaaaggcagaaaa 36664073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1486 - 1649
Target Start/End: Original strand, 36643123 - 36643286
Alignment:
Q  1486 gctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaa 1585  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    || | |||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  36643123 gctaaattgacaagtgtctcacttgatatgttgaggatttgagcatcctttatcttacaacaacgaatgcccaaactattcaactttggaaaggccaaaa 36643222  T
Q  1586 aggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaa 1649  Q
    |||| ||| |||| ||| ||| | |||| |||||| | ||||||| || ||| ||| |||||||    
T  36643223 agggatcagcacaaccgctttcaccaccgcaaaagactaaatttgctaaatctaagttggtcaa 36643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35970426 - 35970321
Alignment:
Q  75 acaatata-tatccgagccatactctgagatggtcgctaaataagtatatcacaacaatatagtatccgagacatactctgagatggtcgctgaataagt 173  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35970426 acaatatagtatctgagacatactctaagatggtcgctaag--agtatatcacaacaatata-tatccgagccatactctgagatggtcgctaaataagt 35970330  T
Q  174 atatcacaa 182  Q
    |||||||||    
T  35970329 atatcacaa 35970321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 662 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 36910978 - 36910721
Alignment:
Q  662 gttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgtttaataacagtcaatcataaactcttcttatatttatttaatttaatattatctaacctc 761  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||| | |||||||||||||  || | | |||||| ||||||||| |||    
T  36910978 gttgataatcttcgcgccctttatagattctacaacctgtttagtaacaaccaattacaaactcttcttatggttgtgtcatttaaaattatctaagctc 36910879  T
Q  762 agattctca--caaaagttatca----ccgctcacttatggttttcaaataa----ctacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatg 851  Q
    |||||||||   |||| ||| ||    | |||| | ||||||||| ||||||    |||||| ||||||||||||| || |  |||||  ||||  ||||    
T  36910878 agattctcaacaaaaaattaacacactcagctcccatatggtttttaaataactagctacctgcttaagattaaaataaataaagtaatctgttgtgatg 36910779  T
Q  852 ttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgg 909  Q
    |||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36910778 ttaacttccgctgagggcgagttttgtcgcaagaagtcaactattccatcaggtatgg 36910721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 652 - 995
Target Start/End: Original strand, 36664524 - 36664872
Alignment:
Q  652 gcgaatgatagttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgtttaataacagtcaatcataaactcttcttata-tttatttaatttaatat 750  Q
    ||||| ||||| |||| ||| | || |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  ||| ||| |||| | ||    
T  36664524 gcgaacgatagctgatgatcttcgcaccctttatagattctgcaacctgtttagtaacagccaatcacaaactcttcatatggtttgtttgatttcaaat 36664623  T
Q  751 tatctaacctcagattctcacaaaagttatcacc----gctcacttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgtta 846  Q
       |||| |||||||||||| |||| ||| |||     |||| |||| | |||| ||||| |||||| |||| |||| |||  ||  ||| ||  |||      
T  36664624 atactaaactcagattctcaaaaaaattaccacacacagctcccttaagatttttaaatacctacctgcttaggatttaaaacatgcgagaaatctgtgg 36664723  T
Q  847 ggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaa 946  Q
     |||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |||  |||    
T  36664724 tgatgttaacttccgctgatggcgagttttgtcgcaagaagtcaaccataccgtcaggtatggcacgtggttccaaacgtgctttgaatgcctttcttaa 36664823  T
Q  947 cttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttctttaacatggca 995  Q
    ||| | | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36664824 cttagcaacttctttacgagacttggcagcagctttctttaacatggca 36664872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Original strand, 36641430 - 36641542
Alignment:
Q  167 aataagtatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctagatgaatctcatggacctcaaatgaagaggtcgtgtgatagaccaagtgcttgg 266  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||     
T  36641430 aataagtatattacaatttggctttaaaattggagactaccagttagataaag-tcatggacctcaaatgaagagttcatgtgatcgaccaaatgcttgt 36641528  T
Q  267 caaatcaaacatgt 280  Q
    ||| ||||||||||    
T  36641529 caagtcaaacatgt 36641542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 521
Target Start/End: Original strand, 36661371 - 36661517
Alignment:
Q  370 aatatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatcgtcctgta 469  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| | ||||  |||| ||| |||||||||     ||  |    
T  36661371 aatatgagaactcttcactggccattatctagaagtggagagtaggtgttaggttggcgcttctcgacctcatctttatttgatgattta-----ctaaa 36661465  T
Q  470 ggcagaaaaagtaacaatgttgattatcactgcaaaatcaatcttatgaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| |||  | | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36661466 ggcagaaaaagtaacactgtcaactgtcactgcaaaaacaatcatatgaaaa 36661517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1198 - 1315
Target Start/End: Complemental strand, 18365107 - 18364990
Alignment:
Q  1198 atcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagca 1297  Q
    ||||||| ||||||||||||  || | || |||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  18365107 atcttaagaagaaagtaaaaacaaaggtttaaaacatgacaaggaacctgaagagtagttgaagtgactgccaatgattctacattggcaaggtcttgca 18365008  T
Q  1298 gccagctcaatagaacca 1315  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  18365007 gccagcttaatagaacca 18364990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1198 - 1315
Target Start/End: Original strand, 36597818 - 36597935
Alignment:
Q  1198 atcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagca 1297  Q
    ||||||| ||||||||||||  || | || |||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  36597818 atcttaagaagaaagtaaaaacaaaggtttaaaacatgacaaggaacctgaagagtagttgaagtgactgccaatgattctacattggcaaggtcttgca 36597917  T
Q  1298 gccagctcaatagaacca 1315  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  36597918 gccagcttaatagaacca 36597935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1025 - 1101
Target Start/End: Complemental strand, 43942030 - 43941954
Alignment:
Q  1025 ttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaa 1101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  43942030 ttgaagtggttccaattttatttccatagactttaagttacacaaagaagggagcttaacttctaataaaccaggaa 43941954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1494 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 36629907 - 36629772
Alignment:
Q  1494 gacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtca 1593  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || || |||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||    
T  36629907 gacaagggtctcacttgatatgctgaggatttgagcatcctttacctcacaactacgaaggatcaaactattcaactttgtaaaggtcgaaaagggctca 36629808  T
Q  1594 acacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaattt 1629  Q
     |||| ||||||| | | || |||||||| ||||||    
T  36629807 gcacaaccgttttcaccgccgcaaaaggcaaaattt 36629772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 36632135 - 36632048
Alignment:
Q  374 tgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatc 461  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  36632135 tgagaactcttcaatgcacattatctagaagtgaagagttgatgttaggttggtgcttctccaccttatcttcatttgatgatttatc 36632048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36911761 - 36911673
Alignment:
Q  128 acaatatagtatccgagacatactctgagatggtcgctgaataagtatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctagatgaa 218  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36911761 acaatttagtatcccatacatactctgagatggtagctaaataagtata--acaatttggctttaaaattggagaccatcagctagatgaa 36911673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1212 - 1514
Target Start/End: Complemental strand, 18083928 - 18083626
Alignment:
Q  1212 gtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaataga 1311  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||| |||||||| | ||||||    
T  18083928 gtaaaattaaagtctcaaatcatgccaaggtacctggagagtaattgaagagactttcaatgattttacagctaaaagctcttgcagccagttgaataga 18083829  T
Q  1312 accataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaatac 1411  Q
    |||||||||  || ||| |||  ||  | |||   ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||  ||| |  ||||||||  |||  ||||| |    
T  18083828 accataggaagcttctccaaagatgtgtccatgcgtgcataaattttgacttctttaacagaagaaagattgcttctgcatattttgggatgtggaatcc 18083729  T
Q  1412 cggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttga 1511  Q
    ||  || ||||||||| || || || |||||||| | |||||||| || ||  |||| |||| ||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  18083728 cgtaaaaagtaaaggtacagaggcttggagtggatagctcaattttggcaattttaggtgaactataaagcatagcaaaattgacaagtgtttcacttga 18083629  T
Q  1512 tat 1514  Q
    |||    
T  18083628 tat 18083626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1212 - 1514
Target Start/End: Original strand, 36616752 - 36617054
Alignment:
Q  1212 gtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaataga 1311  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||| |||||||| | ||||||    
T  36616752 gtaaaattaaagtctcaaatcatgccaaggtacctggagagtaattgaagagactttcaatgattttacagctaaaagctcttgcagccagttgaataga 36616851  T
Q  1312 accataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaatac 1411  Q
    |||||||||  || ||| |||  ||  | |||   ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||  ||| |  ||||||||  |||  ||||| |    
T  36616852 accataggaagcttctccaaagatgtgtccatgcgtgcataaattttgacttctttaacagaagaaagattgcttctgcatattttgggatgtggaatcc 36616951  T
Q  1412 cggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttga 1511  Q
    ||  || ||||||||| || || || |||||||| | |||||||| || ||  |||| |||| ||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  36616952 cgtaaaaagtaaaggtacagaggcttggagtggatagctcaattttggcaattttaggtgaactataaagcatagcaaaattgacaagtgtttcacttga 36617051  T
Q  1512 tat 1514  Q
    |||    
T  36617052 tat 36617054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 277
Target Start/End: Original strand, 36663768 - 36663873
Alignment:
Q  171 agtatatcacaatatggcttcaaaattggagactatcagctagatgaatctcatggacctcaaatgaagaggtcgtgtgatagaccaagtgcttggcaaa 270  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||   |||| ||||    
T  36663768 agtatattacaatttcgctttaaaattggagactaccaactagatgaa-ctcatggacctcaaatgaagaactcatgtgatagaccaaacacttgtcaaa 36663866  T
Q  271 tcaaaca 277  Q
    |||||||    
T  36663867 tcaaaca 36663873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1036 - 1118
Target Start/End: Original strand, 36664919 - 36665001
Alignment:
Q  1036 ccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||| || |||||  |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36664919 ccaattctacttccaatgacttcaagttacataacgaagggagcttaacctccaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 36665001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1041 - 1118
Target Start/End: Original strand, 36616590 - 36616667
Alignment:
Q  1041 tttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36616590 tttatttccaccaacttcaagttacataaagaagggagcttaacctccaatagatcaggaactaaggacagaatctaa 36616667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1354 - 1519
Target Start/End: Original strand, 38862637 - 38862804
Alignment:
Q  1354 atatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcc--cacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaactc 1451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| || | |||    
T  38862637 atatttactcgtttaacagaagaaagaccactcccacacatattatatgattaggactaccgctaaaagtaaaggtacatagacttggagtagatagctc 38862736  T
Q  1452 aatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttga 1519  Q
    |||||    ||| ||  |||||||||  ||||| ||||||| |||||||   ||||||||||| ||||    
T  38862737 aattttctcaaatttgaatgaattattgtgcatagctaaattgacaagttgttcacttgatatgttga 38862804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1036 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 18084094 - 18084012
Alignment:
Q  1036 ccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||| || |||||  |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18084094 ccaattctacttccaatgacttcaagttacataacgaagggagcttaacctccaataaatcaggaactaaggacagaatctaa 18084012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 870 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 18365426 - 18365336
Alignment:
Q  870 gagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctt 960  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||| || | |||||| | ||||||||    
T  18365426 gagttttgtcgcaggaagtcaactattccatcaggtatgggaggtggttgcaaaccagcattaaatgccttgtttaacttagcagcttctt 18365336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1040 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 36630351 - 36630273
Alignment:
Q  1040 ttttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36630351 ttttacttccaatgacctcaagttacaaaaagaagggagcttaacctccaataaatcaggaaccaaggagagaatctaa 36630273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 18365243 - 18365178
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18365243 gacttcaagttacacaaagaagtgaacttaacctccaataaatcaggaacaaaggagagaatctaa 18365178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Original strand, 36597682 - 36597747
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36597682 gacttcaagttacacaaagaagtgaacttaacctccaataaatcaggaacaaaggagagaatctaa 36597747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1349 - 1442
Target Start/End: Original strand, 36642953 - 36643046
Alignment:
Q  1349 catcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagt 1442  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| || || ||||  ||| |||||| || |||||||| |||||    
T  36642953 catcaatatttacttgtttaacagaggaaagtccgctcccgcatattttttgaataagactaccaataaaagtaaatgtacaaagacttggagt 36643046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 36910577 - 36910512
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36910577 gacttcaagttacataaagaatggaatttaacctccaataaatcaggaactaaggacagaatctaa 36910512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1024 - 1260
Target Start/End: Original strand, 36655955 - 36656190
Alignment:
Q  1024 tttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagt 1123  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||| | | || || ||  ||||||| |||||||||||||||||||| || | |    
T  36655955 tttgaagtgattccagttctatttccagtgacttcaagttacacaaagaaggtatcttaaacttcaataaattaggaactaaggagagaatctgaa-aat 36656053  T
Q  1124 caagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaaacaaaattttgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatg 1223  Q
     | ||| |||||| || || | | |||||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||   ||  ||| |  |  ||| ||||||||||| |    
T  36656054 gaggaatgagagtaaattacggtaagttatgcaattcaattgattttaaacaaaattaagaaataaaagaagaaatttctagcagatagtaaaattaaag 36656153  T
Q  1224 cttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattgaa 1260  Q
    | | |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  36656154 ccttaaaacatgcaaaggtacctgaagagtacttgaa 36656190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 36911592 - 36911391
Alignment:
Q  325 atcttaaaagaaaggcttgcaaagaagacattgtaacttgta-ggaaatatgagaactcttcactgcc----cattatctagaagtggagagtcgctgtt 419  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||  |    ||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  36911592 atcttaaaagaaaagttcacaaagaaggcattgtaacttgtaaggtggtatgagaactcttcactatcagttcattatctagaagtggacagttggagtt 36911493  T
Q  420 atgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatcgtcctgtaggcagaaaaagtaacaatgttgattatcactgcaaaatcaatcttatgaa 519  Q
    |  |  ||||||| ||||||| |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | || ||| ||||||  ||||||||| ||| ||    
T  36911492 agatcagtgcttctccaccttatcttcaattgatgatttgtcgtcctaaaggcagaaaaagtaacacttttaattgtcactgtgaaatcaatcatataaa 36911393  T
Q  520 aa 521  Q
    ||    
T  36911392 aa 36911391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29678768 - 29678661
Alignment:
Q  378 aactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatcgtcctgtaggcagaaa 477  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| || |||| |||| ||| || |||||||| ||||  |||  ||||    
T  29678768 aactcttcactgccctttatctagaagttgagagtttgtgttaggttggtgcttctccgccttatcttcatttgacgatttatcttcctaaaggtggaaa 29678669  T
Q  478 aagtaaca 485  Q
    ||||||||    
T  29678668 aagtaaca 29678661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 870 - 937
Target Start/End: Original strand, 36597498 - 36597565
Alignment:
Q  870 gagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgc 937  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  36597498 gagttttgtcgcaggaagtcaactattccatcaggtatgggaggtggttgcaaaccagcattaaatgc 36597565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 18361935 - 18361845
Alignment:
Q  371 atatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatc 461  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  18361935 atatgataacttttcactgcccattatcaagaagtggagagtttctgtaaggttggagcttctcaaccttatcttcattagatgatttatc 18361845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 36600992 - 36601082
Alignment:
Q  371 atatgagaactcttcactgcccattatctagaagtggagagtcgctgttatgttggtgcttccccaccttctcttgattggatgatttatc 461  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  36600992 atatgataacttttcactgcccattatcaagaagtggagagtttctgtaaggttggagcttctcaaccttatcttcattagatgatttatc 36601082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Original strand, 36642658 - 36642723
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36642658 gacttcaagttacataaagaatgtagcttaaccttcgataaatcaggaactatggagagaatctaa 36642723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1040 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 52187872 - 52187783
Alignment:
Q  1040 ttttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaa 1129  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || |||||||    
T  52187872 ttttattttcagtgacttcaaggtacacaaggaatggaactcaaccttcaataaatcaggaactaaagaaagaacctaagcaatcaagaa 52187783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 634 - 704
Target Start/End: Original strand, 36635571 - 36635641
Alignment:
Q  634 aggcagacgcggcaaactgcgaatgatagttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgttta 704  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36635571 aggcaggcacggcgaattgcgaatgatagttgataaccttcgcaccctttatagattcttcaacctgttta 36635641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1359 - 1401
Target Start/End: Original strand, 36665240 - 36665282
Alignment:
Q  1359 tacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctga 1401  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36665240 tacttgtttaacagaagaaagtccgctcccacatatttcctga 36665282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 652 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 18084485 - 18084195
Alignment:
Q  652 gcgaatgatagttgataatcctggcgccctttatagattctttaacctgtttaataacagtcaatcataaactcttcttat-atttatttaatttaatat 750  Q
    ||||| ||||| |||| ||| | || |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  ||| ||| |||| | ||    
T  18084485 gcgaacgatagctgatgatcttcgcaccctttatagattctgcaacctgtttagtaacagccaatcacaaactcttcatatggtttgtttgatttcaaat 18084386  T
Q  751 tatctaacctcagattctcacaaaagtta----tcaccgctcacttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgtta 846  Q
       |||| |||||||||||| |||| |||     ||| |||| |||| | |||| ||||| |||||| |||| |||| |||  ||  ||| ||  |||      
T  18084385 atactaaactcagattctcaaaaaaattaccacacacagctcccttaagatttttaaatacctacctgcttaggatttaaaacatgcgagaaatctgtgg 18084286  T
Q  847 ggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgc 937  Q
     |||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||| | | |||||||||| |||||| |||||    
T  18084285 tgatgttaacttccgctgatggcgagttttgtcgcaagaagtcaaccataccgtcaggtatggcacgtggttccaaacgtgctttgaatgc 18084195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18365624 - 18365527
Alignment:
Q  678 ccctttatagattctttaacctgtttaataacagtcaatcataaactcttcttatatttatttaatttaatattatctaacctcagattctcacaaaa 775  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||  || || ||||| |  ||||| || |||||||||||| ||||    
T  18365624 ccctttatggattcttcaacctgtttagtaacaaccaatcacaaactcttcttatggttgttaaatttgaatttatcaaagctcagattctcaaaaaa 18365527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 775
Target Start/End: Original strand, 36597301 - 36597398
Alignment:
Q  678 ccctttatagattctttaacctgtttaataacagtcaatcataaactcttcttatatttatttaatttaatattatctaacctcagattctcacaaaa 775  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||  || || ||||| |  ||||| || |||||||||||| ||||    
T  36597301 ccctttatggattcttcaacctgtttagtaacaaccaatcacaaactcttcttatggttgttaaatttgaatttatcaaagctcagattctcaaaaaa 36597398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1357 - 1440
Target Start/End: Complemental strand, 36630035 - 36629952
Alignment:
Q  1357 tttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactagga 1440  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |   |||||||| ||| ||||| |||||||| |||    
T  36630035 tttacttgtttaatagaagagagactgctcccacaaattttctgaataaggtcaccggtaaaagtgaaggtacaaagacttgga 36629952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1354 - 1441
Target Start/End: Complemental strand, 18360756 - 18360665
Alignment:
Q  1354 atatttacttgtttaaca---gaa-gaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggag 1441  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||  |||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  18360756 atatttacttgtttaacaacagaacgaaagaccgctcccaaatattttctgaaccggaaacccggcaaaagtaaaggtacaaagacttggag 18360665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35974649 - 35974604
Alignment:
Q  83 tatccgagccatactctgagatggtcgctaaataagtatatcacaa 128  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35974649 tatccaagacatactctgagatggtcgctaattaattatatcacaa 35974604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1354 - 1441
Target Start/End: Original strand, 36602173 - 36602264
Alignment:
Q  1354 atatttacttgtttaaca---gaa-gaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggag 1441  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||  |||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  36602173 atatttacttgtttaacaacagaacgaaagaccgctcccaaatattttctgaaccggaaacccggcaaaagtaaaggtacaaagacttggag 36602264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1243 - 1304
Target Start/End: Original strand, 36642844 - 36642905
Alignment:
Q  1243 acctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagct 1304  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  36642844 acctgaagagtagttgaagtgactctaaatgattctacattcgcaaagtctagcagccagct 36642905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 126; Significance: 3e-64; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1033 - 1656
Target Start/End: Original strand, 33839341 - 33839954
Alignment:
Q  1033 gttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacga 1132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||| ||    
T  33839341 gttccaattttatttccaccgacttcaagttacacaaagaaggaagcttaacctccaataaatcaggaactaaggagagaatctaagcattaaggaatga 33839440  T
Q  1133 gagtgaaataagatcagttatgcaagtcaaccaattttaaacaaaattttgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaac 1232  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||    ||||  || |||||     |||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  || || ||||| |    
T  33839441 gggtgaattaggatcagttatgcaagtcagtggattt--aaaaaaat-----aataa--taaagaatcttaagatgaatgtaaaa-caaagcctcaaatc 33839530  T
Q  1233 atgcctaggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaa 1332  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||  || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |      
T  33839531 atgccaaagtacctgaagagtacttgaagagactgttaatgattctatgttagcaaggtctagcagccagctgaatagaatcataggagacttgtctact 33839630  T
Q  1333 tttgaatgcatttttgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaa 1432  Q
    ||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||   || |||||||||||| |    
T  33839631 tttgaaaacatatgtgcatcaatgtttacttctttaacggaagaaaatccactcccacatattttctgtttaggagtaccataaaaagtaaaggtgcaga 33839730  T
Q  1433 gactaggagtggacaactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatc 1532  Q
    |||| ||||  |  | ||| |||| |  ||| ||  || |||| | || ||    ||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  33839731 gactcggagcagctagctcgattttgtcaaagttgaataaattcttatacaaatataaattgtctagtgtctcacttgatatccggaggatttgtgcatc 33839830  T
Q  1533 ctctatcttacaaccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgtt 1632  Q
    ||  | | ||||||    || || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| | ||||| |||||| || |||| ||||   |||    
T  33839831 cttaaccatacaacgactaatgatcaagctattcaacttggtaaaggctgaaaagggctcagcacaacggttttcatcaccgcagaaggtgaaaccagtt 33839930  T
Q  1633 agatccaagctggtcaatgctggc 1656  Q
    |||||||||||||| || ||||||    
T  33839931 agatccaagctggttaacgctggc 33839954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 866 - 1412
Target Start/End: Original strand, 33843078 - 33843630
Alignment:
Q  866 cggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttactt 965  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||| || ||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |    
T  33843078 cggtgagttttgaagcaagaagtccactattccatcaggtacggaaggtggtcgcaaacccgctttaaatgcttttcgtagcttggaagcttctttgcgt 33843177  T
Q  966 gacttggcagcaactttctttaacatggcat---tcactacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagt 1062  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| |     ||||      |||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33843178 gacttggcagcagctttctttaacatggcttctttcactaagtacaataattttgtgtgatcttcaagtggctccaattttatttccatcgacttcaagt 33843277  T
Q  1063 tacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagttatgcaagtcaa 1162  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || | |  || ||| ||||| || |||||| |||||||||||     
T  33843278 tactcaaagaaggaagcttaacctccaataaattgggaactaaggagagaatctaagcattaagtaatgagggtgaattaggatcagatatgcaagtcag 33843377  T
Q  1163 ccaattttaaac----aaaattttgaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaagagtaattg 1258  Q
       |||| |||     |||| || | |||||  ||||||| ||| | | ||| ||||||| || ||  |||| |||||| |||||||||||||||  |||    
T  33843378 tagatttcaaaacaaaaaaagttagcaataaaataaagaaacttgagatgaatgtaaaataaa-gccgcaaatcatgccaaggtacctgaagagtttttg 33843476  T
Q  1259 aagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgcatcaatatt 1358  Q
    ||| |||| | ||||||| ||  || || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  || || | ||||  ||||||||||||||| ||    
T  33843477 aagtgactgttaatgattctaagttagcaaggtctagcagccagcataatagaatcataggagacttgtcgaattctgaaaacatttttgcatcaatgtt 33843576  T
Q  1359 tacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaatacc 1412  Q
    ||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  33843577 tacttctttaacagaagaaaatccactcccatatattttctgatcaggagtacc 33843630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 866 - 994
Target Start/End: Original strand, 33839162 - 33839290
Alignment:
Q  866 cggtgagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttactt 965  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |    
T  33839162 cggtgagttttgaagcaagaagtccactattccatcaggtatggaaggtggttctaaacccgctttaaatgcttttcgtaacttggaagcttctttgcgt 33839261  T
Q  966 gacttggcagcaactttctttaacatggc 994  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33839262 gactttgcagcagctttctttaacatggc 33839290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1347 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 10812752 - 10812471
Alignment:
Q  1347 tgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggac 1446  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||   || |||| ||||||| |||  ||||| |||  || |||||| || |||||  | ||||||||     
T  10812752 tgcataaatattgacttctttaacagaagagagattacttccacctattttcggatgtggaatcccgtaaaaagtaaacgtacaaaggtttggagtggat 10812653  T
Q  1447 aactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaac 1546  Q
    | |||||||| || ||  ||||||||| ||| || ||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||  |||||||||||    
T  10812652 agctcaattttggcaattttagatgaactataatccatagcaaaatttacaagtgtctcacttgatatgttgatgatttgtgtgtccattatcttacaac 10812553  T
Q  1547 cgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatt 1628  Q
    | | || || |||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| || |||||| | ||||  |||||| ||||||    
T  10812552 catgaatgatcaaactcttcaatttggtaaaggccgagaagggctcaacatagtcgttttcaccaccgtaaaaggtgaaatt 10812471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1347 - 1640
Target Start/End: Original strand, 10811887 - 10812181
Alignment:
Q  1347 tgcatcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaata-gtaaaggtgcaaagactaggagtgga 1445  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||   || |||| |||||||||||  ||||| |||  || | ||||| || ||||| || ||||||||    
T  10811887 tgcataaatattgacttctttaacataagagagattacttccacctattttctgatgtggaatcccgtaaaaaagtaaacgtacaaaggcttggagtgga 10811986  T
Q  1446 caactcaatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaa 1545  Q
     ||||||||||  | ||  ||||||||| ||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||  || |||||||    
T  10811987 taactcaattttagcaattttagatgaactataatgcatagcaaaattaacaagtgtctcacttgatatgttgatgatttgtgtgtccattaccttacaa 10812086  T
Q  1546 ccgtaaaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagatccaa 1640  Q
    ||   || || |||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||  || ||||||||| | ||||  ||||||  |||||  ||||||||||    
T  10812087 ccacgaatgatcaaactcttcaatttggtaaaggccgagaagggctctgcatagccgttttcaccaccgtaaaaggtcaaattgcttagatccaa 10812181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 5e-57; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1054 - 1652
Target Start/End: Original strand, 42601950 - 42602540
Alignment:
Q  1054 acttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaaacagtcaagaacgagagtgaaataagatcagtt-- 1151  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |       ||| ||||| || ||||||||      
T  42601950 acttcaagttacacaacgaagtgagcttaacctccaataaatcaggaactaaggagagaatctaagaaat-------gagggtgaattaggatcagtttt 42602042  T
Q  1152 atgcaagtcaaccaattttaaacaaaatttt-gaaataacgtaaagaatcttaacaagaaagtaaaattaatgcttcaaaacatgcctaggtacctgaag 1250  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||  |   |||||||| | | |||||||||     
T  42602043 atgcaagtcaactgaattttaacaaaatttaagaaataaaa-aaagaatcttaagaagaaagtaaaataaagtccg-aaaacatggcaaagtacctgaat 42602140  T
Q  1251 agtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaaccataggagactcctcaaaatttgaatgcatttttgca 1350  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |  |||| || ||||  |||||  |||    |||    ||  |||    
T  42602141 aataggtgaagtgactttcaatgattctacattggcaaggtctagcaaccagctaagaagaatcaaaggatgctccttcaaagcaaaatattgttgagca 42602240  T
Q  1351 tcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgattaggaataccggtaatagtaaaggtgcaaagactaggagtggacaact 1450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | || | ||| | |||||||| |  ||||| || ||||  || ||||    
T  42602241 tcaatatttacatgtttaacagaaga--gaccgctcccacatattttctgatcaagactgccgttgatagtaaatgcacaaaggcttggagcagataact 42602338  T
Q  1451 caatttgggaaaaattagatgaattatgatgcatggctaaatcgacaagtgtctcacttgatatcttgaggatttgagcatcctctatcttacaaccgta 1550  Q
    | |||| || |||   ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || | |||||| |      
T  42602339 cgattttggtaaaggaagatgaaatattatgcatagctaaattgacaagtgtctcacttgatatcctgaggatttgtgcatcttttaccgtacaactgct 42602438  T
Q  1551 aaggaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatttgttagatccaagctggtcaat 1650  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||   ||||||| ||| |||  || |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42602439 aatgaccaaactattcaacctggtaaaggtcaaaaagggttcagcacgaccattttcatcaccgcaaaaggcaaaatttgtgagatccaagctggtcaat 42602538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 790 - 994
Target Start/End: Original strand, 42601686 - 42601890
Alignment:
Q  790 cttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatc 889  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||  ||||| ||| ||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||    
T  42601686 cttatggtttttaaataactacctgcttaagatcaaaagaactcgggtaatctgttaagattttaacttccaccgacggcaagttttgtcgcaagaaatc 42601785  T
Q  890 aactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttctttaac 989  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| | |||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  42601786 aactattccatcgggtatgggaggtggttttaaacccgctttaaattcctttcttaacttagcagcttctttacgtgacttggcagcagctttctttaac 42601885  T
Q  990 atggc 994  Q
    |||||    
T  42601886 atggc 42601890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 518 - 582
Target Start/End: Original strand, 42601472 - 42601535
Alignment:
Q  518 aaaatgcatgtgaggaatgttaccttttcagtgtgagagagattggagattgagaggtgcagcaa 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  42601472 aaaatgcatgtgaggaatgttaccttttcagcgcaacagaga-tgaagattgagaggtgcagcaa 42601535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Original strand, 28927459 - 28927524
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28927459 gacttcaatttacacaaggaatggaactcaaccttgaataaatcaggaattaaggtgagaacctaa 28927524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 80; Significance: 9e-37; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 790 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 35337047 - 35336719
Alignment:
Q  790 cttatggttttcaaataactacctccttaagattaaaacaatttgagtaaattgttaggatgttaacttccgccagcggtgagttttgtcgcaagaaatc 889  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||   | |||  |||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  35337047 cttatggtttttaaacaactacctgcttaatattaaaataacccgtgtactttgttgtgatgttaactttcgccgacggtgagttttgttgcaagaagtc 35336948  T
Q  890 aactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgctttaaatgctttttgtaacttggtagcttctttacttgacttggcagcaactttctttaac 989  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||  |||||| | |||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  35336947 aactattccatcaggtatgggaggtggtctcaaacctgctttaaatgtctttcttaactttgcagcttcattacaggacttggcagccgctttctttaac 35336848  T
Q  990 atggcatt---cactacgcggggtaatcccagttgagtttgaagaggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacct 1086  Q
    ||||||||   || ||  ||| |||||    || ||   | ||  ||   || || ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35336847 atggcattttccattatacggagtaat---ggtcgataatcaaatggcatcatttctatttccaatgacttcaagttacacaaagaagggagcttaacct 35336751  T
Q  1087 ctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35336750 ccaataaatcaggaactaaggagagaacctaa 35336719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1349 - 1402
Target Start/End: Complemental strand, 35336480 - 35336427
Alignment:
Q  1349 catcaatatttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgat 1402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35336480 catcaatgtttacttgtttaacagaagaaagaccgctcccacatattttctgat 35336427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1240 - 1315
Target Start/End: Complemental strand, 35336589 - 35336514
Alignment:
Q  1240 ggtacctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagctcaatagaacca 1315  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  35336589 ggtacctgaagagtaattgaagtggttgtcaatgattctacattggtaaggtctcgcagccaggttaatagaacca 35336514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 55; Significance: 7e-22; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1032 - 1118
Target Start/End: Original strand, 19657373 - 19657459
Alignment:
Q  1032 ggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19657373 ggttccagttttatttccatagactttaagttgcacaaagaagggagcttaagctctaataattcaggaactaaggagagaatctaa 19657459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1032 - 1118
Target Start/End: Original strand, 19674217 - 19674303
Alignment:
Q  1032 ggttccaattttatttccatcgacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19674217 ggttccagttttatttccatagactttaagttgcacaaagaagggagcttaagctctaataattcaggaactaaggagagaatctaa 19674303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 870 - 929
Target Start/End: Original strand, 19657217 - 19657276
Alignment:
Q  870 gagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgct 929  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19657217 gagttttgaagcaagaaggcaactattccatctggtatgggaggtggtttcaaacctgct 19657276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 870 - 929
Target Start/End: Original strand, 19674061 - 19674120
Alignment:
Q  870 gagttttgtcgcaagaaatcaactattccatctggtatgggaggaggttccaaacctgct 929  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19674061 gagttttgaagcaagaaggcaactattccatctggtatgggaggtggtttcaaacctgct 19674120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1054 - 1118
Target Start/End: Original strand, 30597242 - 30597306
Alignment:
Q  1054 acttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30597242 acttcaagttacacaaggaatggaactcaaccttcaataaatcaggaactaacgagagaacctaa 30597306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1113
Target Start/End: Complemental strand, 6849772 - 6849712
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaa 1113  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6849772 gacttcaagtcccacaaggaatggaattcaaccttcaataaatcaggaactaaggagagaa 6849712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 38; Significance: 0.00000000001; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1243 - 1304
Target Start/End: Complemental strand, 5356609 - 5356548
Alignment:
Q  1243 acctgaagagtaattgaagagactatcaatgattttacattggcgaggtctagcagccagct 1304  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  5356609 acctgaagagtattagaagagactgtcaatgattttatattggcaagctctagcagccagct 5356548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 7119867 - 7119802
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7119867 gacttcaagttacacaaggaaggtagcttaaccttcaataaatcaggaactaaggagagaacctaa 7119802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1554 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 25597435 - 25597361
Alignment:
Q  1554 gaccaaactattcaacttagtaaaggcggaaaaggggtcaacacagccgtttttatcaccccaaaaggcgaaatt 1628  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||| | | ||| |||||| |||||||| |||||    
T  25597435 gaccaaactattcaacattttaaaggcgaaaaagggctcaacacaactgctttcatcaccgcaaaaggcaaaatt 25597361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Complemental strand, 13460708 - 13460643
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13460708 gacttcaagttacgcaaagaagagagcttaaccctcaataaattaggaactaaggagagaacctaa 13460643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1054 - 1112
Target Start/End: Original strand, 43429258 - 43429316
Alignment:
Q  1054 acttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagaga 1112  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  43429258 acttcaagttacacaaagaagagaacttaacctccgataaatcaggaattaaggagaga 43429316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1118
Target Start/End: Original strand, 43863138 - 43863203
Alignment:
Q  1053 gacttcaagttacacaaagaatggagctcaacctctaataaatcaggaactaaggagagaatctaa 1118  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  43863138 gacttcaagttacacaaggaagggagctctaccttcaataaaccacgaactaaggaaagaacctaa 43863203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1472 times since January 2019
Visitors: 2192