View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0154_low_2 (Length: 409)

Name: NF0154_low_2
Description: NF0154
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0154_low_2
NF0154_low_2
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (72-398)||(34967012-34967338)
chr6 (72-398)||(17013412-17013741)
chr6 (79-398)||(22461873-22462192)
chr6 (72-394)||(23222896-23223219)
chr6 (78-357)||(19854306-19854586)
chr6 (78-398)||(23222067-23222388)
chr6 (130-396)||(29158163-29158428)
chr6 (90-398)||(19175314-19175622)
chr6 (90-398)||(21931367-21931675)
chr6 (83-398)||(31467379-31467688)
chr6 (90-342)||(16136426-16136678)
chr6 (90-398)||(22585330-22585638)
chr6 (90-398)||(22590161-22590469)
chr6 (72-311)||(32352192-32352431)
chr6 (90-397)||(15889491-15889798)
chr6 (78-398)||(22848166-22848483)
chr6 (79-398)||(18629386-18629703)
chr6 (93-398)||(15004692-15004995)
chr6 (79-398)||(17556808-17557112)
chr6 (79-398)||(33538147-33538464)
chr6 (72-331)||(17083043-17083299)
chr6 (78-268)||(29605601-29605790)
chr6 (90-331)||(17374772-17375011)
chr6 (130-272)||(14856630-14856772)
chr6 (240-398)||(17856234-17856391)
chr6 (72-168)||(19672431-19672527)
chr6 (240-356)||(18733218-18733334)
chr6 (79-280)||(22361662-22361860)
chr6 (79-151)||(25651389-25651461)
chr6 (79-330)||(21623320-21623571)
chr6 (79-182)||(18381675-18381778)
chr6 (91-241)||(16887726-16887875)
chr6 (72-134)||(29160343-29160405)
chr6 (345-398)||(32352426-32352479)
chr6 (91-280)||(35135908-35136095)
chr6 (78-159)||(28195108-28195189)
chr6 (78-173)||(18399089-18399184)
chr6 (91-179)||(33324857-33324944)
chr6 (90-224)||(25640514-25640647)
chr6 (153-398)||(25654350-25654593)
chr6 (91-174)||(14626134-14626216)
chr6 (72-135)||(15740374-15740437)
chr6 (93-152)||(26512308-26512367)
chr6 (93-152)||(26517424-26517483)
chr6 (361-398)||(14856516-14856553)
chr6 (337-398)||(29605800-29605860)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (72-395)||(7454-7777)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (72-398)||(18041308-18041634)
chr8 (72-397)||(33172373-33172695)
chr8 (72-398)||(24552346-24552672)
chr8 (72-398)||(22496984-22497311)
chr8 (72-398)||(45558714-45559039)
chr8 (78-398)||(45464904-45465222)
chr8 (78-398)||(16002149-16002469)
chr8 (90-398)||(22887927-22888233)
chr8 (72-398)||(18261250-18261573)
chr8 (72-348)||(19331143-19331416)
chr8 (72-398)||(38635426-38635750)
chr8 (102-398)||(27232869-27233162)
chr8 (90-398)||(17502324-17502632)
chr8 (72-280)||(22742909-22743116)
chr8 (79-398)||(15933450-15933768)
chr8 (79-398)||(5854766-5855083)
chr8 (95-359)||(22314239-22314504)
chr8 (188-398)||(24239875-24240086)
chr8 (90-398)||(18118064-18118373)
chr8 (91-359)||(20175587-20175857)
chr8 (91-359)||(20220314-20220584)
chr8 (79-398)||(26011646-26011960)
chr8 (235-398)||(31590310-31590473)
chr8 (72-398)||(33528570-33528895)
chr8 (93-398)||(23218043-23218349)
chr8 (143-342)||(22723393-22723594)
chr8 (72-398)||(29306562-29306890)
chr8 (243-398)||(4234397-4234551)
chr8 (79-280)||(33610949-33611148)
chr8 (79-243)||(21198084-21198247)
chr8 (72-180)||(37653610-37653718)
chr8 (79-280)||(17285356-17285557)
chr8 (72-179)||(25296303-25296410)
chr8 (79-227)||(23149930-23150078)
chr8 (79-280)||(23837350-23837550)
chr8 (91-179)||(25758342-25758430)
chr8 (91-218)||(23151790-23151916)
chr8 (303-398)||(22745110-22745204)
chr8 (79-176)||(22981425-22981522)
chr8 (72-280)||(15969966-15970171)
chr8 (90-224)||(21259449-21259583)
chr8 (95-180)||(23158329-23158414)
chr8 (94-179)||(23226071-23226156)
chr8 (164-272)||(22366232-22366342)
chr8 (250-348)||(37652242-37652340)
chr8 (78-228)||(38533800-38533949)
chr8 (188-249)||(31017704-31017767)
chr8 (78-176)||(20573190-20573288)
chr8 (361-398)||(19331104-19331141)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (72-398)||(8267504-8267830)
chr7 (82-398)||(46474157-46474474)
chr7 (72-398)||(9319340-9319665)
chr7 (72-398)||(33559792-33560118)
chr7 (78-398)||(45149735-45150056)
chr7 (72-398)||(13448603-13448929)
chr7 (72-398)||(9723581-9723909)
chr7 (118-398)||(9250630-9250909)
chr7 (78-398)||(28390463-28390771)
chr7 (72-398)||(4446357-4446684)
chr7 (72-398)||(38424364-38424688)
chr7 (72-398)||(4438928-4439255)
chr7 (90-398)||(8563122-8563431)
chr7 (72-398)||(31501318-31501641)
chr7 (72-351)||(28722255-28722533)
chr7 (79-398)||(9611460-9611778)
chr7 (79-398)||(9839031-9839349)
chr7 (72-351)||(14935505-14935785)
chr7 (72-351)||(15363098-15363378)
chr7 (72-398)||(20583333-20583656)
chr7 (79-398)||(48356796-48357113)
chr7 (72-327)||(15358942-15359195)
chr7 (72-398)||(4484872-4485188)
chr7 (90-398)||(13352115-13352424)
chr7 (91-359)||(44304826-44305096)
chr7 (240-398)||(18079273-18079430)
chr7 (79-398)||(16914705-16915023)
chr7 (79-398)||(34240984-34241302)
chr7 (95-398)||(16383851-16384155)
chr7 (243-398)||(39285953-39286108)
chr7 (72-185)||(17947581-17947694)
chr7 (194-398)||(14942269-14942472)
chr7 (194-398)||(15369862-15370065)
chr7 (90-351)||(15977670-15977933)
chr7 (72-269)||(14271806-14272001)
chr7 (209-359)||(21537611-21537761)
chr7 (72-183)||(14940900-14941008)
chr7 (72-183)||(15368493-15368601)
chr7 (243-326)||(21675389-21675472)
chr7 (163-354)||(19070098-19070291)
chr7 (79-280)||(17223832-17224033)
chr7 (79-173)||(13377681-13377775)
chr7 (93-224)||(39291467-39291598)
chr7 (84-159)||(49047689-49047764)
chr7 (79-280)||(13274929-13275127)
chr7 (78-228)||(16569952-16570101)
chr7 (78-228)||(16595561-16595710)
chr7 (89-174)||(13911028-13911112)
chr7 (113-146)||(17947546-17947579)
chr7 (111-180)||(17984750-17984819)
chr7 (91-138)||(16919723-16919770)
chr7 (308-397)||(17984616-17984706)
chr7 (190-280)||(25124391-25124480)
chr7 (89-174)||(2437621-2437705)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (72-398)||(21109895-21110221)
chr5 (72-398)||(23234258-23234587)
chr5 (72-398)||(26559592-26559917)
chr5 (78-398)||(16835074-16835395)
chr5 (99-398)||(19873933-19874233)
chr5 (78-398)||(23417393-23417713)
chr5 (90-394)||(11763283-11763588)
chr5 (124-398)||(5621571-5621844)
chr5 (80-398)||(29918118-29918435)
chr5 (72-351)||(6456769-6457044)
chr5 (72-396)||(24084222-24084534)
chr5 (79-398)||(37983516-37983834)
chr5 (78-319)||(22885793-22886022)
chr5 (79-354)||(21617168-21617442)
chr5 (79-398)||(21222387-21222703)
chr5 (79-280)||(19862361-19862561)
chr5 (72-280)||(21310605-21310811)
chr5 (129-398)||(24225124-24225391)
chr5 (72-280)||(21297071-21297277)
chr5 (83-176)||(23981514-23981607)
chr5 (72-218)||(432608-432753)
chr5 (79-159)||(5450858-5450938)
chr5 (79-227)||(3674014-3674161)
chr5 (78-218)||(32966106-32966245)
chr5 (79-137)||(7728572-7728630)
chr5 (79-280)||(16595659-16595858)
chr5 (79-227)||(28902343-28902490)
chr5 (79-227)||(28938738-28938885)
chr5 (90-177)||(22662680-22662767)
chr5 (77-127)||(23466587-23466637)
chr5 (89-174)||(4199989-4200073)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (78-398)||(54398534-54398853)
chr4 (72-398)||(47468125-47468450)
chr4 (72-398)||(50219720-50220042)
chr4 (78-398)||(13442453-13442772)
chr4 (72-398)||(13589848-13590176)
chr4 (78-398)||(40904708-40905030)
chr4 (80-398)||(41916520-41916820)
chr4 (72-256)||(18238075-18238259)
chr4 (78-398)||(15013062-15013378)
chr4 (78-398)||(38764860-38765177)
chr4 (72-398)||(41256147-41256471)
chr4 (93-398)||(12133384-12133690)
chr4 (79-398)||(7964490-7964806)
chr4 (240-394)||(10237048-10237202)
chr4 (95-398)||(54363068-54363374)
chr4 (252-398)||(18235976-18236122)
chr4 (90-398)||(19559522-19559831)
chr4 (79-398)||(18276586-18276903)
chr4 (72-323)||(7185697-7185946)
chr4 (95-398)||(15213398-15213704)
chr4 (206-396)||(28428029-28428219)
chr4 (90-398)||(49071850-49072155)
chr4 (79-174)||(47535065-47535160)
chr4 (121-325)||(17375155-17375358)
chr4 (78-280)||(13809407-13809606)
chr4 (79-227)||(15044980-15045127)
chr4 (188-325)||(17372921-17373057)
chr4 (91-283)||(21417471-21417664)
chr4 (79-280)||(52265405-52265603)
chr4 (79-159)||(15109364-15109444)
chr4 (322-398)||(24238012-24238088)
chr4 (93-280)||(14901398-14901582)
chr4 (72-180)||(37957019-37957127)
chr4 (79-159)||(41165961-41166041)
chr4 (78-280)||(30232393-30232592)
chr4 (83-133)||(40885610-40885660)
chr4 (216-354)||(47534901-47535040)
chr4 (77-127)||(18494374-18494424)
chr4 (90-272)||(34177552-34177732)
chr4 (361-394)||(10374964-10374997)
chr4 (90-178)||(16225167-16225255)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (72-398)||(5767946-5768271)
chr1 (72-398)||(40436044-40436371)
chr1 (72-398)||(25094004-25094328)
chr1 (81-398)||(20194179-20194498)
chr1 (78-398)||(33397503-33397817)
chr1 (72-398)||(52400776-52401100)
chr1 (72-398)||(49997059-49997383)
chr1 (134-398)||(76194-76458)
chr1 (72-398)||(21195159-21195483)
chr1 (78-348)||(8537737-8538006)
chr1 (78-348)||(8602976-8603245)
chr1 (240-398)||(20822937-20823095)
chr1 (240-396)||(20836741-20836897)
chr1 (163-398)||(18852493-18852729)
chr1 (79-398)||(17609080-17609398)
chr1 (79-398)||(37233638-37233955)
chr1 (79-383)||(20177327-20177632)
chr1 (83-398)||(22143139-22143452)
chr1 (84-280)||(13376754-13376949)
chr1 (72-228)||(19603242-19603397)
chr1 (72-173)||(38033675-38033776)
chr1 (79-227)||(16646064-16646211)
chr1 (79-227)||(16656790-16656937)
chr1 (72-159)||(20955454-20955541)
chr1 (72-278)||(22829324-22829527)
chr1 (72-173)||(27674941-27675042)
chr1 (72-173)||(36356294-36356395)
chr1 (78-159)||(51627679-51627760)
chr1 (158-283)||(21978003-21978130)
chr1 (78-173)||(27329757-27329851)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (72-398)||(43427291-43427618)
chr3 (78-398)||(8604976-8605295)
chr3 (78-398)||(10913037-10913356)
chr3 (78-398)||(38375472-38375792)
chr3 (72-398)||(41661710-41662035)
chr3 (124-398)||(21166858-21167131)
chr3 (72-398)||(14814542-14814867)
chr3 (72-272)||(50313332-50313532)
chr3 (95-398)||(17758384-17758688)
chr3 (95-398)||(19059704-19060008)
chr3 (72-398)||(4161983-4162307)
chr3 (213-398)||(31411415-31411599)
chr3 (72-220)||(31412287-31412435)
chr3 (78-398)||(33368706-33369023)
chr3 (182-398)||(11638553-11638769)
chr3 (139-398)||(25103767-25104028)
chr3 (90-395)||(12538849-12539153)
chr3 (78-319)||(13301326-13301565)
chr3 (78-319)||(13311982-13312221)
chr3 (188-398)||(40038706-40038917)
chr3 (108-292)||(11515373-11515556)
chr3 (78-280)||(11882115-11882314)
chr3 (83-218)||(15517787-15517921)
chr3 (90-280)||(11402753-11402943)
chr3 (90-300)||(17393597-17393808)
chr3 (72-174)||(6228625-6228727)
chr3 (79-280)||(12953116-12953317)
chr3 (277-398)||(50313564-50313686)
chr3 (111-398)||(37915069-37915356)
chr3 (79-227)||(9590702-9590849)
chr3 (72-202)||(4145787-4145915)
chr3 (233-398)||(6224863-6225027)
chr3 (79-356)||(17191693-17191970)
chr3 (90-395)||(18970084-18970390)
chr3 (91-398)||(3576215-3576521)
chr3 (79-354)||(17204833-17205108)
chr3 (80-159)||(34560052-34560131)
chr3 (79-182)||(47784758-47784861)
chr3 (90-280)||(48421740-48421928)
chr3 (79-227)||(39656678-39656825)
chr3 (78-124)||(11638508-11638554)
chr3 (79-173)||(30207368-30207462)
chr3 (83-179)||(14080665-14080761)
chr3 (78-173)||(17139659-17139754)
chr3 (307-394)||(17586711-17586797)
chr3 (72-137)||(1990947-1991012)
chr3 (72-176)||(55440846-55440950)
chr3 (78-173)||(14059214-14059309)
chr3 (90-177)||(15550761-15550848)
chr3 (193-280)||(34560133-34560219)
chr3 (79-173)||(16880275-16880369)
chr3 (79-138)||(12488762-12488821)
chr3 (79-176)||(15876220-15876317)
chr3 (72-173)||(17960314-17960415)
chr3 (190-280)||(51961033-51961122)
chr3 (79-125)||(11329010-11329056)
chr3 (79-280)||(12560133-12560331)
chr3 (90-127)||(14177065-14177102)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (72-397)||(9636890-9637214)
chr2 (72-398)||(24277906-24278231)
chr2 (78-398)||(16292577-16292897)
chr2 (129-398)||(6094888-6095156)
chr2 (78-398)||(25595171-25595491)
chr2 (78-398)||(18536907-18537227)
chr2 (180-397)||(9637227-9637443)
chr2 (180-397)||(9637456-9637672)
chr2 (180-397)||(9637685-9637901)
chr2 (90-359)||(20279574-20279845)
chr2 (209-398)||(29114651-29114841)
chr2 (78-330)||(19660031-19660281)
chr2 (83-289)||(19666684-19666887)
chr2 (83-227)||(24087335-24087478)
chr2 (79-183)||(24884838-24884942)
chr2 (108-280)||(23821536-23821705)
chr2 (108-280)||(23830615-23830784)
chr2 (72-227)||(722536-722690)
chr2 (79-173)||(68144-68238)
chr2 (233-398)||(24884944-24885108)
chr2 (143-282)||(45573312-45573452)
chr2 (143-282)||(45576979-45577119)
chr2 (143-282)||(45580646-45580786)
chr2 (143-282)||(45584313-45584453)
chr2 (143-282)||(45587980-45588120)
chr2 (143-282)||(45591647-45591787)
chr2 (143-282)||(45595314-45595454)
chr2 (143-282)||(45598981-45599121)
chr2 (143-282)||(45602648-45602788)
chr2 (143-282)||(45606315-45606455)
chr2 (143-282)||(45609982-45610122)
chr2 (143-282)||(45613649-45613789)
chr2 (143-282)||(45617316-45617456)
chr2 (79-182)||(43646045-43646148)
chr2 (82-272)||(19669013-19669201)
chr2 (323-398)||(11010095-11010170)
chr2 (79-173)||(22775206-22775300)
chr2 (79-173)||(22780584-22780678)
chr2 (72-173)||(3248-3349)
chr2 (79-159)||(31146196-31146276)
chr2 (72-135)||(24294562-24294625)
chr2 (72-176)||(24571290-24571394)
chr2 (72-106)||(6094861-6094895)
chr2 (93-177)||(7321683-7321767)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (72-398)||(67674-67999)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (72-398)||(8635-8960)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (78-398)||(37709-38028)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (78-398)||(655-976)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (72-398)||(27642-27967)
scaffold0004 (78-396)||(86508-86825)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (72-398)||(25491-25820)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (72-398)||(131960-132284)
scaffold0022 (78-398)||(67732-68053)
scaffold0022 (79-227)||(102870-103017)
scaffold0022 (79-158)||(109742-109821)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (78-398)||(22150-22469)
scaffold0165 (72-395)||(30109-30433)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (78-398)||(2547-2868)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (78-398)||(14187-14506)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (72-398)||(740-1064)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (78-398)||(33189-33509)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (78-398)||(108160-108479)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (72-348)||(3396-3672)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (93-398)||(19710-20016)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (90-398)||(12929-13239)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (78-354)||(12551-12829)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (72-398)||(4750-5073)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (72-398)||(6689-7013)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (113-398)||(26769-27051)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (110-398)||(5595-5880)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (72-348)||(23500-23774)
scaffold0080 (91-354)||(43619-43881)
scaffold0080 (361-398)||(23461-23498)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (90-398)||(6854-7162)
scaffold0013 (79-398)||(35630-35950)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (95-398)||(2561-2866)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (79-398)||(197031-197348)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (79-398)||(31172-31490)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (90-398)||(43898-44206)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (95-359)||(55144-55409)
scaffold0084 (95-359)||(2851-3116)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (79-398)||(69609-69928)
scaffold0009 (240-359)||(244578-244697)
scaffold0009 (240-313)||(244709-244782)
scaffold0009 (90-180)||(244827-244918)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (79-398)||(2677-2995)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (90-359)||(12416-12687)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (176-329)||(113963-114116)
scaffold0014 (72-176)||(159445-159549)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (191-374)||(3645-3828)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (80-280)||(53499-53697)
scaffold0025 (72-227)||(85678-85831)
scaffold0025 (250-398)||(85836-85980)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (95-359)||(34273-34537)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (79-398)||(96976-97293)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (251-398)||(11303-11449)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (190-398)||(2287-2494)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (90-359)||(115989-116259)
scaffold0032 (83-319)||(104480-104714)
scaffold0032 (78-175)||(93772-93869)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (79-328)||(76693-76942)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (259-398)||(6200-6340)
scaffold0057 (90-203)||(6046-6159)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (72-280)||(1244-1450)
scaffold0409 (72-280)||(9499-9705)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (83-280)||(8166-8361)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (79-354)||(6845-7120)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (91-354)||(22243-22505)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (72-159)||(7547-7634)
scaffold0253 (72-159)||(16972-17059)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (251-354)||(13471-13574)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (302-398)||(180657-180753)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (79-182)||(6813-6916)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (83-228)||(1493-1637)
scaffold0456 (83-228)||(8638-8782)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (95-280)||(10860-11046)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (79-173)||(2317-2411)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (79-172)||(28688-28781)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (90-159)||(1348-1416)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (79-159)||(11246-11326)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (90-284)||(1402-1593)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (90-227)||(269-406)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (82-243)||(79694-79854)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (91-179)||(22424-22512)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (83-173)||(10818-10908)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (317-398)||(12399-12480)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (83-159)||(450-526)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (79-228)||(7957-8105)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (79-280)||(3471-3669)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (72-176)||(8880-8984)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (95-201)||(1522-1628)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (95-263)||(1-171)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (79-176)||(33814-33911)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (72-176)||(11833-11937)
scaffold0021 (72-176)||(16044-16148)
scaffold0021 (72-176)||(25575-25679)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (91-174)||(3128-3210)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (77-176)||(6092-6191)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (91-158)||(70323-70389)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (91-158)||(89880-89946)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (78-176)||(574-672)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (78-176)||(2067-2165)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (79-125)||(173-219)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (113-227)||(116506-116619)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 34967012 - 34967338
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34967012 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcacgaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 34967111  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34967112 tttcaacaactaagagaaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 34967211  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34967212 cccttacctcaataagcaataatcttagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 34967311  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34967312 tttcctcttctcttgaactttctctct 34967338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17013741 - 17013412
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013741 atatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 17013642  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatt-agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17013641 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaac 17013542  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacc 369  Q
     | ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17013541 tcccttacctcaattagcaactaatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaacc 17013442  T
Q  370 attttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||    
T  17013441 cttttgctccttctcttgaactttctctct 17013412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22462192 - 22461873
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22462192 tttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagaacgaatttcaac 22462093  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22462092 aactaagtgaaaaataataacttattcaaataagcacttatgcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattattattgaaatctaacccccttac 22461993  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct- 377  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||     
T  22461992 ctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaattttgctcctagaatctctatcacctcttgatccttcaagc-tttatcccttttaaccctttttctc 22461894  T
Q  378 cttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22461893 cttctcttgaactttctctct 22461873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Original strand, 23222896 - 23223219
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23222896 atatcattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataaaaagagcacgaa 23222995  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23222996 tttcaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatatgattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 23223095  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||     
T  23223096 acccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttctttaggc-tttctcccttctaaccc 23223194  T
Q  371 ttttcctc-ttctcttgaactttct 394  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||    
T  23223195 ttttgctcattctctagaactttct 23223219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Original strand, 19854306 - 19854586
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19854306 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaa 19854405  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19854406 cagctaagagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattgtgattgaactctaaccccctta 19854505  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttc 357  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19854506 ccttaattagcaaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttc 19854586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 23222067 - 23222388
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23222067 ttttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataacaagattacgaatttcaa 23222166  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    | | |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  23222167 ctattaagtgtaaaataatcacttattcaattaatcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatttaacaccctt 23222266  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||| |||| |    
T  23222267 acctcaataaacaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-ttcctctcttttaacccttttgc 23222365  T
Q  377 t-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  23222366 tccttctctagaactttctctct 23222388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29158428 - 29158163
Alignment:
Q  130 aatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29158428 aatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatatcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaatt 29158329  T
Q  230 agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctc 329  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  29158328 agggaaaaattagaactaaatgattatgattgaaatctaaccctcttacttcaataaacaataaccatagcaaaaacttcaatttatctcctagaatctc 29158229  T
Q  330 tatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctct 396  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29158228 taccacctcttggttcttcaagc-tttcttccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctct 29158163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 19175314 - 19175622
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  19175314 atgaacatgcaattttatcaacaacaattcaattatcatcaattttatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactaactgca 19175413  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    |||||||||||| || || ||||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||| || |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  19175414 aaataatcactttttcaaataagcacatatgcatagaattagggaagaaacta-aactgagagattatgaatgaaatctaatccccttacctcaataagc 19175512  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttga 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| || || |||||||    
T  19175513 aataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaag-ttttctctcttctaaccctttttctcctcctcttga 19175611  T
Q  388 actttctctct 398  Q
    |||||||||||    
T  19175612 actttctctct 19175622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 21931367 - 21931675
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||| |||    
T  21931367 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatatcatcttaacaagagtacaaatttcaacttctaagtgca 21931466  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21931467 aaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaacta-aactaggagattatgattgaaatctaacccccttacctcagtaagc 21931565  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttga 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||| || ||||||||||    
T  21931566 aataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatatctatcacctcttggttcttcacgc-tttctcccttctaatccttttgctccttctcttga 21931664  T
Q  388 actttctctct 398  Q
    |||||||||||    
T  21931665 actttctctct 21931675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 83 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31467688 - 31467379
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31467688 acataccatgaacatgcaatttcattaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataataagagcatgaatttcaacaact 31467589  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagg-gaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctc 281  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31467588 aagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaattaggaaaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctt 31467489  T
Q  282 aataagcaataattctagcaaaagcttca-atttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctctt 380  Q
    | | ||||| ||| |||||       ||| | ||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  31467488 agttagcaaaaatcctagc-------tcagacttagctcctagaatcaccaccacctcttagttcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctctt 31467397  T
Q  381 ctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||| |||||||||||    
T  31467396 ctcttgtactttctctct 31467379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 342
Target Start/End: Original strand, 16136426 - 16136678
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16136426 atgaacatgcaatttcatcaaaaactattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatattatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgca 16136525  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattaggga-aaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16136526 aaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaattagggatgaaacta-aactaagagattatcattgaaatctaactcccttacctcaataagc 16136624  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16136625 aataatcctagcaaaagcttcaattaagctcctagaatctctagctcctcttgg 16136678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22585638 - 22585330
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  ||    
T  22585638 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22585539  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22585538 aaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaattagc 22585439  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaa 388  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22585438 aataatcctagcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-ttttctcccttctaacccttttcatcttctcttgaa 22585340  T
Q  389 ctttctctct 398  Q
    ||||||||||    
T  22585339 ctttctctct 22585330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22590469 - 22590161
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  ||    
T  22590469 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22590370  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22590369 aaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaattagc 22590270  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaa 388  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22590269 aataatcctagcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-ttttctcccttctaacccttttcatcttctcttgaa 22590171  T
Q  389 ctttctctct 398  Q
    ||||||||||    
T  22590170 ctttctctct 22590161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 311
Target Start/End: Original strand, 32352192 - 32352431
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||| |||    
T  32352192 atatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccataaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaatataccatcatagaaagagcatgaa 32352291  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32352292 tttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 32352391  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaa 311  Q
      ||  ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  32352392 tcctcgcctcaattagcaataatcatagccaaagcttcaa 32352431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 90 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15889798 - 15889491
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    |  |  ||    
T  15889798 atgaacatgcaatttcatcatcaacaaatcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttca 15889699  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa---attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataa 286  Q
     ||||||||| |||| || ||| |||||| ||||| ||  || || ||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15889698 caataatcacgtattcaaataaacacttatgcatagaaaaagagagaagaaatta--actaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaatta 15889601  T
Q  287 gcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttg 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15889600 gcaataattcttgcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacatcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaaccctttttctcttctcttg 15889502  T
Q  387 aactttctctc 397  Q
    |||||||||||    
T  15889501 aactttctctc 15889491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 22848166 - 22848483
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  22848166 ttttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaa 22848265  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||    
T  22848266 caactatga--acaataatcaattattcaactaagcacttaaacatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaattccctta 22848363  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaaccattttcc 376  Q
    ||| ||  ||||  ||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||    
T  22848364 ccttaaatagcacaaatcctagtccaagcttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag--tctctcctcttctaacccttttcc 22848461  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
     ||||||||| || ||||||||    
T  22848462 ccttctcttgcaccttctctct 22848483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18629703 - 18629386
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  18629703 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 18629604  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |   ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18629603 aactatgaac-aattaatcacttattcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 18629506  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct 377  Q
    || | | ||||  |||| |||||  |||||||| |||| ||| ||| |||| || ||| |||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||||    
T  18629505 cttagttagcacaaattcctagcccaagcttcactttacctcctaggatctataccacttcttgaatcttcaaacttct-tcccctcaaaccattttcct 18629407  T
Q  378 cttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  18629406 cttctcttgcactttctctct 18629386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15004995 - 15004692
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaa 192  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  || ||    
T  15004995 aacatgcaatttcctcatcaacaattcaatcaacatcaaatt-acatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaa 15004897  T
Q  193 taatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaat 291  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  15004896 taatctcttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatttaaccc-cttacctcaattagcaat 15004798  T
Q  292 aattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactt 391  Q
     || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004797 tatcctagcaaaaacttcaatttagctcctaaaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactt 15004699  T
Q  392 tctctct 398  Q
    |||||||    
T  15004698 tctctct 15004692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17557112 - 17556808
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  17557112 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgca-tcaaacatatcatcataattagagcacgaattt-aac 17557015  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17557014 aactatgaac-aaataatcaattattcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattac-actagatgattatgattgaattctaacccccttac 17556917  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc 378  Q
    || ||| |||   ||| |||||  |||||||| |||| ||| |||| |||  | ||| |||| |||||           || ||||||||||||||||||    
T  17556916 cttaattagctcaaatcctagcctaagcttcactttatctcctagattcttcaccacttcttaggtct-----------tctcttctaaccattttcctc 17556828  T
Q  379 ttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  17556827 ttctcttgcactttctctct 17556808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33538464 - 33538147
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||   ||||||||||||| |||    
T  33538464 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaac 33538366  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33538365 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 33538268  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    || | |  |||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||| |||||| ||||||  ||||| || |||||    
T  33538267 cttagttcgcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatctttaagcttcttctcc--tctaaccctttttc 33538170  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  33538169 atcttctcttgcactttctctct 33538147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17083299 - 17083043
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17083299 atatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaa 17083201  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    | | |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||  | |||| |||||||    
T  17083200 tattaacaactatgaac-aattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgatta-aaatgaattctaacc 17083104  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctcta 331  Q
    | ||||||| | | ||||| |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  17083103 cccttaccttagttagcaattaatcctagccgaagcttcactttagctcctaggatctcta 17083043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Original strand, 29605601 - 29605790
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29605601 ttttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaa 29605699  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaac-taagtgattatgattgaaatcta 268  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||  || |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  29605700 caactatgaac-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcatttaatgagaaattacaacttaattgattatggttgaattcta 29605790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17375011 - 17374772
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  17375011 atgaacatgtaatttcatcatcaataattcaattatcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttca 17374912  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17374911 taata--cacttatctcaattaagcacttatgcatagaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaaccc-cttacctcaataaa 17374816  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctcta 331  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17374815 caataatcctagccaaagcttcaattaagctcatagaatctcta 17374772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14856772 - 14856630
Alignment:
Q  130 aatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatt 229  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||    
T  14856772 aatttcttgtattcaaacatatcgtcgtaacaagagcacaaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaaacactcaaacatgcaatt 14856673  T
Q  230 agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccc 272  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14856672 aaggaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaaccc 14856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17856391 - 17856234
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17856391 tacaactaagagattatgattgaaatctaaccccct-acctcaataaacaataatcctaacaaaaacttcaattaagctcctagaatctctatcacctct 17856293  T
Q  340 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| || |||||| |||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17856292 tggttcatcaagc-tttccctcttataaccatttttctccttctcttgaactttctctct 17856234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 168
Target Start/End: Original strand, 19672431 - 19672527
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcac 168  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19672431 atatcattttcacatattatgaacatgcaatttcattaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataataagagcac 19672527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 240 - 356
Target Start/End: Original strand, 18733218 - 18733334
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 339  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||    
T  18733218 tacaagtaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataaggaataatcctagcaaaggcttcaattaagctcctagaatctctagctcctct 18733317  T
Q  340 tgggtcttcaagctttt 356  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  18733318 tggttcttcaagttttt 18733334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22361860 - 22361662
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |    
T  22361860 tttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatc 22361761  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | ||| || | || |||||| ||  | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22361760 atctatgaac-aattaatcatttgctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattacta--aaatgattatgattgaattctaacccccttac 22361664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 151
Target Start/End: Original strand, 25651389 - 25651461
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatat 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25651389 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatat 25651461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 330
Target Start/End: Original strand, 21623320 - 21623571
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  21623320 tttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaac 21623419  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    |  || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||  |  || ||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21623420 atttatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 21623518  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctct 330  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  21623519 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctct 21623571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18381778 - 18381675
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  |||    
T  18381778 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataac 18381679  T
Q  179 aact 182  Q
    ||||    
T  18381678 aact 18381675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16887875 - 16887726
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | |    
T  16887875 tgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-a 16887777  T
Q  191 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaatta 241  Q
    | |||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||    
T  16887776 attaatcatttattcaattaatcacttattcatacaataattgaaaaatta 16887726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29160405 - 29160343
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 134  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29160405 atatcattttcacataccatgaacatgcaatttcactaacaacaattcaattatcaccaattt 29160343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 32352426 - 32352479
Alignment:
Q  345 cttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32352426 cttcaagcttttctcccttctaaccattttcctattctcttgaactttctctct 32352479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35136095 - 35135908
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||| || | |    
T  35136095 tgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaac-a 35135998  T
Q  191 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatta-gggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    | |||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||||||||||   || ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35135997 attaatcaattatctaattaatcacttattcatacaataattgaaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 35135908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28195189 - 28195108
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  28195189 ttttctcatactatgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataa 28195108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 18399089 - 18399184
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  18399089 ttttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 18399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Original strand, 33324857 - 33324944
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||    
T  33324857 tgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaaca 33324944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25640647 - 25640514
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |  |  |  ||    
T  25640647 atgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcct-acaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttca 25640549  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcata 224  Q
     |||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  25640548 caataatcacttattcaaataagcacttatgcata 25640514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 25654350 - 25654593
Alignment:
Q  153 atcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtga 252  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||  || |||  ||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| |||    
T  25654350 atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaat-taatcacctactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattaca-ctaaatga 25654447  T
Q  253 ttatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattc-tagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 351  Q
    |||  |   || |||||||| ||||||| ||| ||||   |||| ||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  25654448 ttagcaca-aattctaacccccttaccttaattagcacagattcctagcgcaagtttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 25654546  T
Q  352 ctt-ttctcccttctaaccatttt-cctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25654547 cttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 25654593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14626216 - 14626134
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14626216 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 14626134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Original strand, 15740374 - 15740437
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 135  Q
    ||||| |||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15740374 atatcatttttatatactttgatcattcaatttcaccaacaaccaatcaattatcaccaatttc 15740437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 26512308 - 26512367
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatc 152  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  26512308 aacatgtaatttcaacaacaacaattcaaatatcatcaaattcttgtacccaaacatatc 26512367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 26517424 - 26517483
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatc 152  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  26517424 aacatgtaatttcaacaacaacaattcaaatatcatcaaattcttgtacccaaacatatc 26517483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14856553 - 14856516
Alignment:
Q  361 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14856553 cttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 14856516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 398
Target Start/End: Original strand, 29605800 - 29605860
Alignment:
Q  337 tcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29605800 tcttaggtcttcaag-tcttctctcttctaactcttttcctcttctcttgcactttctctct 29605860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 72 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7777 - 7454
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7777 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtagtcaaacatatcatcataacaagagcacaaa 7678  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7677 tttcaacaactaagaacaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaac 7578  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7577 ccctttcctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcttagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 7478  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctc 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  7477 tttcctcttctcctgaactttctc 7454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18041634 - 18041308
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18041634 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtactcaaacatatcgtcataacaagagcacgaa 18041535  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18041534 tttcagcaactaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaattagggaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaaac 18041435  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18041434 cccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttaactcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 18041335  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18041334 tttcctcttcttttgaactttctctct 18041308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 72 - 397
Target Start/End: Original strand, 33172373 - 33172695
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  33172373 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacaaa 33172472  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33172473 tttcaacaacta-gagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-ttacaactaattgattatgattgaaatctaacc 33172570  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33172571 cccttacctcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagcttttagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 33172670  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctc 397  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33172671 ttt-ctcttctcttgaactttctctc 33172695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24552672 - 24552346
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24552672 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 24552573  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24552572 tttcaacaactaaaagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaacaaagtgattatgattgaaatctaacc 24552473  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| ||| | ||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24552472 cccttaccttaattaacaataatccttgcaaaaacttcaatttagctcctagaatctttatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 24552373  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24552372 ttttctcttctcttgaactttctctct 24552346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22497311 - 22496984
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22497311 atatcattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 22497212  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22497211 tttcaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctgac 22497112  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  22497111 ccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagtttcaatttagctcatagaatctctatcacatcttggttcttcaagc-tctctcccttctaaccc 22497013  T
Q  371 ttttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22497012 ttttgctcattctcttgaactttctctct 22496984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45559039 - 45558714
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45559039 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcatgaa 45558940  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45558939 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaaataatcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaacc 45558840  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45558839 cccttaccttaattagcaataatcatagccaaagcttcaatttttctcctagaatctttatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 45558740  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45558739 ttt-ctcttctcttgaactttctctct 45558714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45465222 - 45464904
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45465222 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaatttcaa 45465123  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  45465122 caacta--agcaaaataatcacttactcaattaagcatttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaaccccctta 45465025  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  45465024 cctcaattagcaaataatcctagccaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-c 45464926  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45464925 tcttctcttgaactttctctct 45464904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 16002149 - 16002469
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16002149 ttttcacatatcatgaacatacaatttcatcaacaacaattaaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcatgaatttcaa 16002248  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16002249 caactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaatttgggaagaaatta-agctaagagattatgattgaaatctaaccccctt 16002347  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  16002348 acctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttagttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 16002446  T
Q  377 tc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  16002447 tcattctcttgaactttctctct 16002469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 22887927 - 22888233
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22887927 atgaacatgcaatttcatcaacaa---ttcaaatatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaactaagtgca 22888023  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaa--aattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22888024 aaataatcacttattcaaataagcacttatgcataaaattaggggaagaaatta-aactaaaggattatgaataaaatctaacccccttacctcaataag 22888122  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttg 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  22888123 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttg 22888221  T
Q  387 aactttctctct 398  Q
    |||| |||||||    
T  22888222 aactctctctct 22888233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18261573 - 18261250
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18261573 atatcattttcacatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataactagagcacgaa 18261474  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18261473 tttcaacaactatgaac-aaagaatcacttattcaattaaacacttaatcatgcaattaatg-aaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacc 18261376  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttcta-acca 370  Q
    | ||||||| | | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||  ||     
T  18261375 c-cttaccttagttagcaaaaatcctagctcaagcttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctacccct 18261278  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18261277 ttttcctcttctcttgcactttctctct 18261250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19331416 - 19331143
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19331416 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaa---ttcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatagtcataacaagagcacgaa 19331320  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19331319 tttcaacaaccaagagaaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 19331220  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 348  Q
    | ||||| | | | || || ||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||| | |||||||    
T  19331219 cccttacattagttagaaaaaatcctagctcaagcttcaatttacctcctagaatcaccaccacctcctaggtcttc 19331143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 38635750 - 38635426
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  38635750 atatcattttcgcatattatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaa 38635651  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  38635650 tttcaacaactatgaac-aaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacc 38635552  T
Q  272 ctcttacctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaacc 369  Q
    | ||||||| | | ||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||| || ||||  |||||||||    
T  38635551 cccttaccttagttagcaaaaaatcctagccaaagcttcactttaactcatagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaacc 38635454  T
Q  370 attttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38635453 ctttt-ctcttctcttgcactttctctct 38635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27233162 - 27232869
Alignment:
Q  102 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  27233162 tttcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaac-taataatcactt 27233064  T
Q  202 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 301  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||     
T  27233063 attcaattaagcacttaaccatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccc-cttaccttagttagcaaaaatcctagcc 27232965  T
Q  302 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
     || |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27232964 caaacttcaatttatctcctagaatcttcaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttccaaccattttcctcttttcttgcactttctctct 27232869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 17502324 - 17502632
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||  | |  |  ||    
T  17502324 atgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttca 17502423  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
     |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  17502424 taataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttatctcaattagc 17502523  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaa 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17502524 aataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaatccttttcctcatctcttgaa 17502622  T
Q  389 ctttctctct 398  Q
    ||||||||||    
T  17502623 ctttctctct 17502632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Original strand, 22742909 - 22743116
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  22742909 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaa 22743008  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22743009 tttcaacaactatgaac-aaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacc 22743107  T
Q  272 ctcttacct 280  Q
    | |||||||    
T  22743108 cccttacct 22743116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 15933450 - 15933768
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  15933450 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaac 15933549  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  15933550 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgatttaattctaacccccttac 15933647  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    || ||| ||||  | || |||||  | |||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||    
T  15933648 cttaattagcacaatttcctagcccaggcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttc 15933745  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  15933746 ctcttctcttgcactttctctct 15933768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 5854766 - 5855083
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  5854766 tttcatatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 5854865  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  5854866 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacctccttac 5854963  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || ||| ||||  | | |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  5854964 cttaattagcacaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcc 5855061  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  5855062 tcttctcttgcactttctctct 5855083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 359
Target Start/End: Original strand, 22314239 - 22314504
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||| ||||  || ||||    
T  22314239 catgcaatttctacatcaacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaacaattaagttcacaata 22314338  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22314339 atcacttatctcaaataagcacttatgcatagaattagggaaaaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaacgcccttacctcaataagcaata 22314437  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22314438 atcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagcttttctc 22314504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 398
Target Start/End: Original strand, 24239875 - 24240086
Alignment:
Q  188 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaata 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24239875 caaaataatcacttatttcaattaagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaacccccttacctcaata 24239973  T
Q  286 agcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctct 384  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  24239974 agcaataatcccagcaaaagcttcaatttagctccttgaatctctatcacctcttggttcctcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctct 24240072  T
Q  385 tgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||    
T  24240073 tgaactttctctct 24240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18118373 - 18118064
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||  ||    
T  18118373 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaatttatatacgcaaacatatctctataacacgagcacgaatttcaacgattaagttca 18118274  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||   |||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||  ||    
T  18118273 caataatcacttatttcaaataagcatttttacataaaattagggaagagatta-aactaagagattatgaatgaaaactagcccccttacctcaactag 18118175  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttg 386  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||  ||||  | |||||||||    
T  18118174 aaataatcctagcaaaagcttcaattaagctcatagaatctctatcacctcttgattcttcaagc-tttctcccttttaacacttttgttccttctcttg 18118076  T
Q  387 aactttctctct 398  Q
    ||||||||||||    
T  18118075 aactttctctct 18118064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20175857 - 20175587
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||  ||     
T  20175857 tgaacatgcaatttctacatcaacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcac 20175758  T
Q  191 aataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  20175757 aataatcacttatctcaaataagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaaatgattatgattgaaatctaacccctttacttcaataagc 20175658  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | | |||||| |||||||| |||||||    
T  20175657 aataatcctagcaaaagcttcaagtaagctcctaaaatctctagctcatcttggttcttcaagtttttctc 20175587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20220584 - 20220314
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||  ||     
T  20220584 tgaacatgcaatttctacatcaacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcac 20220485  T
Q  191 aataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  20220484 aataatcacttatctcaaataagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaaatgattatgattgaaatctaacccctttacttcaataagc 20220385  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | | |||||| |||||||| |||||||    
T  20220384 aataatcctagcaaaagcttcaagtaagctcctaaaatctctagctcatcttggttcttcaagtttttctc 20220314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 26011646 - 26011960
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  26011646 tttcacatactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 26011745  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||| |||||    
T  26011746 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaaacacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaa---taacccccttac 26011840  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcct 377  Q
    || ||| ||||  | | |||||  |||||||| |||| ||| ||  ||||||| ||| |||||  ||||||||||| | || | ||||| || |||||||    
T  26011841 cttaattagcacaattcctagcccaagcttcactttacctcctatgatctctaccacttcttgaatcttcaagcttctttctc-tctaaccctttttcct 26011939  T
Q  378 cttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26011940 cttctcttgcactttctctct 26011960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 398
Target Start/End: Original strand, 31590310 - 31590473
Alignment:
Q  235 aaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatc 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31590310 aaaattacaactaattgattatgattgaactctaacccccttatctcaattagcaaataatccttgccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatc 31590409  T
Q  334 acctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31590410 acctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 31590473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 33528570 - 33528895
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  33528570 atatcattttcatatactaagaagatacaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgga 33528669  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
     ||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33528670 attcaacatctaagaac-aattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacc 33528767  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-c 368  Q
    | ||||||| | | ||||  |||| |||||  || ||||| |||||||| ||| |||||||  || |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| |    
T  33528768 cccttaccttagttagcacaaattcctagctcaaacttcactttagctcctaggatctctactacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaacc 33528865  T
Q  369 cattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33528866 ctttttcctcttcttttgcactttctctct 33528895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 398
Target Start/End: Original strand, 23218043 - 23218349
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaa 192  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||| || |  |||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||| |  |  |  || ||    
T  23218043 aacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttcacaa 23218142  T
Q  193 taatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccc-tcttacctcaataagcaa 290  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  23218143 taatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaaccccttttacctcaattagcaa 23218242  T
Q  291 taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaact 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23218243 taatcctagcaaaagcttcaatttagcgcctagaatctctaacatctattgggtcttcacgc-tttatcccttctaaccatttttctcttctcttgaact 23218341  T
Q  391 ttctctct 398  Q
    ||||||||    
T  23218342 ttctctct 23218349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 22723393 - 22723594
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt-atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-t 240  Q
    |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||   || ||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||| | ||  |    
T  22723393 caaacattacatcaaaacataagcacgaatttcatcaattaatttcataataatcactttatacaaataagcacttatgcatataattagggtagaagat 22723492  T
Q  241 acaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctctt 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22723493 acaactaaatgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagcttctagaatctctatcacctctt 22723592  T
Q  341 gg 342  Q
    ||    
T  22723593 gg 22723594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 29306562 - 29306890
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||||||||    
T  29306562 atatcattttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaa 29306661  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa-c 270  Q
    | | |||| ||| || | ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| ||||| |    
T  29306662 tattaacatctatgaac-aatcaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacc 29306760  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctccct-tctaac 368  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||  |||||||  || |||||  |||||||||  |||||| | ||||||    
T  29306761 cctcttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcagtttagctcctaagatctctacgacttcttgaatcttcaagc--ttctccttctctaac 29306858  T
Q  369 c--attttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29306859 ccatttttcctcttctcttgcactttctctct 29306890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Original strand, 4234397 - 4234551
Alignment:
Q  243 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||| ||||     
T  4234397 aactaagtgattatgcttgaaatctaacgcccttacctcaattagcaataaccctagcaaaagcttcaatttagttcctaaaacctttatcaccgcttga 4234496  T
Q  343 gtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4234497 gtattcaaac-tttctcccttctaacccttttcctgttctcttgaactttctctct 4234551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33611148 - 33610949
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||    
T  33611148 tttcacatactttgaacatgaattttcaccaacaacaatctaatgatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcatagttagagcacaaattttaac 33611049  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33611048 aactatgaac-aattaatcacttattcaattaatcacttaaacatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 33610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21198247 - 21198084
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  21198247 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatc 21198148  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattaca 243  Q
    | ||| || | || |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  21198147 atctatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattaca 21198084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37653718 - 37653610
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||| |||||  | ||||||||    
T  37653718 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaacacatcaccataattaaagcacgaa 37653619  T
Q  172 tttcaacaa 180  Q
    |||||||||    
T  37653618 tttcaacaa 37653610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 17285356 - 17285557
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  17285356 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaattctaac 17285455  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaact--aagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    || || || | || || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||| |||| |||  || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  17285456 aattatgaac-aattattcaattattcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatgattgaattctaaccccctt 17285553  T
Q  277 acct 280  Q
    ||||    
T  17285554 acct 17285557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 179
Target Start/End: Original strand, 25296303 - 25296410
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||    
T  25296303 atatcattttcacaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaa 25296402  T
Q  172 tttcaaca 179  Q
    ||| ||||    
T  25296403 ttttaaca 25296410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 23149930 - 23150078
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaa-catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  23149930 tttcacatattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaa 23150029  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    ||| || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  23150030 caattatgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttactcatacaa 23150078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 23837350 - 23837550
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  23837350 tttctcatactttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatc 23837449  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | ||| || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||  |  |||||  || |   || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23837450 atctatgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatctatattaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 23837548  T
Q  279 ct 280  Q
    ||    
T  23837549 ct 23837550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Original strand, 25758342 - 25758430
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||||| ||||    
T  25758342 tgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaaca 25758430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23151916 - 23151790
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||| || || | |    
T  23151916 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaac-a 23151818  T
Q  191 aataatcacttatttaattaagcactta 218  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||    
T  23151817 attaatcatttactgaattaagcactta 23151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 303 - 398
Target Start/End: Original strand, 22745110 - 22745204
Alignment:
Q  303 aagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22745110 aagcttcaatttagctcttagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag--tctctcctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 22745204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 22981425 - 22981522
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  22981425 tttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttca 22981522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Original strand, 15969966 - 15970171
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     |||||||| ||||||||   |||||||||    
T  15969966 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttctttcgtacaaacataacatcataattggagcacgaa 15970065  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| ||||| || || | || |||||| ||| | ||||||||| |||  |||||||| |  |||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  15970066 ttttaacaattatgaac-aattaatcatttactcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattgc-actaaatgattatga-tgaattccaacc 15970162  T
Q  272 ctcttacct 280  Q
    | |||||||    
T  15970163 cccttacct 15970171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21259583 - 21259449
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |  |  |  ||    
T  21259583 atgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttca 21259484  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcata 224  Q
     |||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  21259483 caataatcacttattcaaataagcacttatgcata 21259449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 23158329 - 23158414
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaa 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||    
T  23158329 catgaaatttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaa 23158414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23226156 - 23226071
Alignment:
Q  94 acatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||    
T  23226156 acatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaaca 23226071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 272
Target Start/End: Original strand, 22366232 - 22366342
Alignment:
Q  164 agcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt-atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattg 261  Q
    ||||||||||||| ||| |||   || ||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  22366232 agcacgaatttcatcaattaatttcataataatcactttatacaaataagcacttatgcatataattagggtagaagctacaactaagtgattatgattg 22366331  T
Q  262 aaatctaaccc 272  Q
    |||||||||||    
T  22366332 aaatctaaccc 22366342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37652340 - 37652242
Alignment:
Q  250 tgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 348  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  37652340 tgattatgattgaattctaacccccttaccttaattaacacaaattctagcacaagcttcactttagatcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 37652242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 38533800 - 38533949
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   ||| |||||||  ||    
T  38533800 ttttctcatactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaa 38533899  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    ||| || || | || || ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  38533900 caattatgaac-aattagtcaattacttaattaagcacttattcatacaat 38533949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31017767 - 31017704
Alignment:
Q  188 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattaggg-aaaaattacaactaag 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||    
T  31017767 caaaataatcacttattttaattaagcacttatgcatagaattagggtagaagttacaactaag 31017704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20573288 - 20573190
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  20573288 ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttca 20573190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19331141 - 19331104
Alignment:
Q  361 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19331141 cttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 19331104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8267830 - 8267504
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8267830 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacaaa 8267731  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8267730 tttcaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatacaattagggaaaaattacaactaagtggttatgattgaaatctaacc 8267631  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8267630 tctttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 8267531  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8267530 tttcctcttctcttgaactttctctct 8267504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 82 - 398
Target Start/End: Original strand, 46474157 - 46474474
Alignment:
Q  82 cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaac 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46474157 cacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaac 46474256  T
Q  182 taagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  46474257 taagagtaaaataatcacttactcaattaaacacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccccattatct 46474356  T
Q  281 caataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctctt 380  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  46474357 caataagcaataatcctagcaaaagctacaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttttctctt 46474456  T
Q  381 ctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46474457 ctcttgaactttctctct 46474474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9319665 - 9319340
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9319665 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataacaagagtacgaa 9319566  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9319565 tttcaacaactaagcgcaaaatgatcacttattcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 9319466  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
      ||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9319465 tccttacctcaattaacaataatcgtagcaaaatcttcaatttagcttctagaatctctatcacctcttaggtcttcaagc-tttctcccttctaaccct 9319367  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  9319366 ttctctcttctcttgaactttctctct 9319340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 33559792 - 33560118
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  33559792 atatcattttctcatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattttaacatatcatcatagcaagaggacgaa 33559891  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33559892 tttcaacagctatgaacaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattaattatgattgaaatctaacc 33559991  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33559992 cccttacctcaattagcaataaccctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 33560091  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33560092 tttcctcttctcttgaactttctctct 33560118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 45149735 - 45150056
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45149735 ttttcacatattgtgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaa 45149834  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  45149835 caactaagtgcaaaacaatcacttattcaaataagcacttgtgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgaatgaaatctaaccccctt 45149934  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  45149935 acctcaataagcaataatcctagcaaaaacttcaatttagctcgtagaatctctatcacttcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 45150033  T
Q  377 t-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  45150034 tccttctcttgaactttctctct 45150056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13448929 - 13448603
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  13448929 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatgataacaagagcatgaa 13448830  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  13448829 tttcaacaactaagagtaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaacttattgattatggttgaactctaacc 13448730  T
Q  272 ctcttacctcaataag-caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
    | ||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  13448729 cccttacctcaattagtaaataatcctagccaaagcttcaatttaactcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagtttttctcccttctaaccc 13448630  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13448629 tttt-ctcttctcttgaactttctctct 13448603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9723909 - 9723581
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9723909 atatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaa 9723810  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaa- 269  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9723809 tttcaacaattaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattagggaaaatattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 9723710  T
Q  270 ccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-c 368  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  9723709 cccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctcgaatctttatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacc 9723611  T
Q  369 cattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  9723610 catttgctccttctcttgaactttctctct 9723581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 118 - 398
Target Start/End: Original strand, 9250630 - 9250909
Alignment:
Q  118 tcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcactt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9250630 tcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaacaactaagcgcaaaatgatcacttattcaattaagcactt 9250729  T
Q  218 aagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  9250730 aagcatacaattagggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacctccttacctcaattaacaataatcgtagcaaaatcttcaatttagc 9250829  T
Q  318 tcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  9250830 ttctagaatctctatcacctcttaggtcttcaagc-tttctcccttctaaccctttctctcttctcttgaactttctctct 9250909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 28390463 - 28390771
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28390463 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttgaa 28390562  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||             ||||    
T  28390563 caactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgatt------------cctta 28390650  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28390651 cctcaattagcaaataatcctaccgaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcatctcttgagtcttcaaacttttctcccttctaaccatttt-c 28390749  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28390750 tcttctcttgaactttctctct 28390771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 4446357 - 4446684
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4446357 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatatcatcataactagagcacgta 4446456  T
Q  172 ttt-caacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||   ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4446457 ttttcaacaattaagagcaacataatcagttatccaattaagcacttaatcatgatattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaac 4446556  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
    || |||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||     
T  4446557 ccccttacctccattagcaacaatcctagccaaagctttaatttagctcatagaatctctaccacctcttgtgtcttcaagcttttctcttctctaaccc 4446656  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4446657 ttttcctcctctcttgaactttctctct 4446684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 38424364 - 38424688
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38424364 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataaccagagcacgaa 38424463  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  38424464 tttcaacaactatgaac-aaagaatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgtttatggttgaaatctaacc 38424562  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
      ||||||| | | ||||| ||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |    
T  38424563 tccttaccttagttagcaaaaatcctagcccaaacttcaatttagctcctagaatctccatcacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacctt 38424661  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38424662 tttcctcttctcttgcactttctctct 38424688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 4438928 - 4439255
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  4438928 atatcattttaacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatattatcataactatagcacgaa 4439027  T
Q  172 ttt-caacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    ||| || ||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4439028 ttttcagcagttaagagcaacataatcacttatccaattaagcactcaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaac 4439127  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
     | ||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||     
T  4439128 tcccttgcctcaattagcaacaatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctagcacctcttgtgtcttcaagcttttctcttcactaacct 4439227  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4439228 ttttcctcttctcttgaactttctctct 4439255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8563431 - 8563122
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||    
T  8563431 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactgagttca 8563332  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8563331 caataatcacttatatcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaaata-aactaagagattatgaatgaaatataacccccttacctcaataag 8563233  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttg 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||| |||    
T  8563232 caataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacgtcttggttcttcaagc-tttcttccttctaacccttttgctccttcttttg 8563134  T
Q  387 aactttctctct 398  Q
    |  |||||||||    
T  8563133 agttttctctct 8563122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 31501318 - 31501641
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||| ||    
T  31501318 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaa 31501417  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  31501418 tttcatcaactatgaac-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatg-aaaattacaactaattgattattgttgaattctaacc 31501515  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| | | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||  |    
T  31501516 cccttaccttagttagcaaaaatcctagcccaagcttcaatttagctcttagaatgtccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaactct 31501614  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31501615 tttcctcttctcttgcactttctctct 31501641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 351
Target Start/End: Original strand, 28722255 - 28722533
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28722255 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaa 28722354  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  28722355 tttcaacaactatgaac-aaagattcacttattcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacc 28722453  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 351  Q
    | ||||||| | | | ||||||| | |||  || ||||| |||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  28722454 cccttaccttagttaacaataatccaagcccaaacttcactttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag 28722533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 9611460 - 9611778
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  9611460 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 9611559  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || ||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9611560 aactatgaac-aattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaaccctcttac 9611657  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    || ||| ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||    
T  9611658 cttaattagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttc 9611755  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  9611756 ctcttctcttgcactttctctct 9611778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 9839031 - 9839349
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  9839031 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 9839130  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || ||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9839131 aactatgaac-aattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaaccctcttac 9839228  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    || ||| ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||    
T  9839229 cttaattagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttc 9839326  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  9839327 ctcttctcttgcactttctctct 9839349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 351
Target Start/End: Original strand, 14935505 - 14935785
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14935505 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaa 14935604  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac- 270  Q
    |||||||||||  || | ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  14935605 tttcaacaactgtga-ccaaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacg 14935703  T
Q  271 -cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 351  Q
     || ||||||| ||| ||||| ||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  14935704 gccccttaccttaattagcaaaaatcctagcccaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag 14935785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 351
Target Start/End: Original strand, 15363098 - 15363378
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15363098 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaa 15363197  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac- 270  Q
    |||||||||||  || | ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  15363198 tttcaacaactgtga-ccaaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacg 15363296  T
Q  271 -cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 351  Q
     || ||||||| ||| ||||| ||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  15363297 gccccttaccttaattagcaaaaatcctagcccaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag 15363378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20583656 - 20583333
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||  ||    
T  20583656 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcttcataattagggcaaaaa 20583557  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20583556 tttcaacaactatgaac-aaataatcacttattcaattaggcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacc 20583458  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaacca 370  Q
    | ||||||| | | ||||| ||| ||| |  ||||| || |||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| || ||||  |||||||||     
T  20583457 cccttaccttagttagcaaaaatcctaccccaagctacactttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaaccc 20583360  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  20583359 tttt-atcttctcttgcactttctctct 20583333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 48356796 - 48357113
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  48356796 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaac 48356895  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48356896 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 48356993  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || ||| ||||  | | |||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  48356994 cttaattagcacaattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttattctcc--tctaaccctttttcc 48357091  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  48357092 tcttctcttgcactttctctct 48357113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 327
Target Start/End: Original strand, 15358942 - 15359195
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  | | ||||||    
T  15358942 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaa 15359041  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15359042 tttcaacaactatga--acaataatcagttattcaactaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccactaaatgattatgattgaattctaacc 15359139  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatc 327  Q
    | ||||||| ||| ||||  ||| |||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  15359140 cccttaccttaattagcacaaatcctagcccaagcttcaatttagatcctagaatc 15359195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 4484872 - 4485188
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||    
T  4484872 atatcattttcacatacaatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatattagga-cacgaa 4484970  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  4484971 tttcaacaactatgaac-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgatattaatg-aaaattacaactaattgattatggttgaattctaacc 4485068  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    |  |||||| | | ||||| ||| |||||  |      |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| |||| |||| |    
T  4485069 cctttaccttagttagcaaaaatcctagccca------aatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttcaaaccct 4485161  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  4485162 tttccttttctcttgtactttctctct 4485188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 13352115 - 13352424
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| || |  |||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||    |  |  ||    
T  13352115 atgaacatgcaatttcaccatcaacaaatcaaatatcatcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttca 13352214  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
     |||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||  || || ||   || || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13352215 caataatcacttattcaaataaacacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaattaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaataagc 13352314  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttga 387  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  13352315 aataatcctagaaaaagctacaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttga 13352413  T
Q  388 actttctctct 398  Q
    |||||||||||    
T  13352414 actttctctct 13352424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44305096 - 44304826
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||  ||     
T  44305096 tgaacatgcaatttctacatcaacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcac 44304997  T
Q  191 aataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  44304996 aataatcacttatctcaaataagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaaatgattatgattgaaatctaacccctttacttcaataagc 44304897  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | | |||||| |||||||| |||||||    
T  44304896 aataatcctagcaaaagcttcaagtaagctcctaaaatctctagctcatcttggttcttcaagtttttctc 44304826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 240 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18079430 - 18079273
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18079430 tacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaaccttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 18079331  T
Q  340 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  18079330 tggttcttcaagc-tttcttccttctaacccttttgaccttctcttgaactttctctct 18079273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16915023 - 16914705
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  16915023 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 16914924  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  16914923 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaagttac-actaaatgattgtgattgaattctaacccctttac 16914826  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    || ||| || |  |||| |||||  || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||   ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||    
T  16914825 cttaattaggacaaattcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttcaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttc 16914728  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  16914727 ctgttctcttgcactttctctct 16914705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34241302 - 34240984
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  | | ||||||||| | |    
T  34241302 tttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatc 34241203  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34241202 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 34241105  T
Q  279 ctcaataagcaataattc-tagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    || | | ||||  ||||| || |  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||    
T  34241104 cttagttagcacaaattcttaacccaagcttcactttagctcataggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttc 34241007  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  34241006 ctcttctcttgcactttctctct 34240984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 398
Target Start/End: Original strand, 16383851 - 16384155
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  |||| |||||||| ||| |||    ||||||    
T  16383851 catgtaatttcatcatcaacaacttgattatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcatgaatttcatcaattaaatataaaata 16383950  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||| |    
T  16383951 atcacttatttcaattaagcacttacgcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattatgattgaaatctaacccccttaccttggttagcaaaa 16384050  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaacttt 392  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  16384051 atcctagcccaagcttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcttcttctcttgcacttt 16384149  T
Q  393 ctctct 398  Q
    ||||||    
T  16384150 ctctct 16384155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 39286108 - 39285953
Alignment:
Q  243 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||    
T  39286108 aactaagtgattatgcttgaaatcttacccccttacctcaaaaagcaataattctagccaaagcttcaattaagctcctagaatctgtagctcctcttgg 39286009  T
Q  343 gtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39286008 ttcttcaag-ttttctcccttctaacccttttactcattctcttgaactttctctct 39285953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17947694 - 17947581
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17947694 atatcattttcacatactatgcacattcagtttaaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcatcataacaagagcacgta 17947595  T
Q  172 tttcaacaactaag 185  Q
    ||||||||||||||    
T  17947594 tttcaacaactaag 17947581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 398
Target Start/End: Original strand, 14942269 - 14942472
Alignment:
Q  194 aatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataa 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  14942269 aatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttaattagcaaaaa 14942368  T
Q  294 ttctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttc 393  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||||||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14942369 tcctagcccaagctacaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag-tctcctatcttctaacccttttcctcttctcttgcactttc 14942467  T
Q  394 tctct 398  Q
    |||||    
T  14942468 tctct 14942472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 398
Target Start/End: Original strand, 15369862 - 15370065
Alignment:
Q  194 aatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataa 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  15369862 aatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttaattagcaaaaa 15369961  T
Q  294 ttctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttc 393  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||||||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15369962 tcctagcccaagctacaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag-tctcctatcttctaacccttttcctcttctcttgcactttc 15370060  T
Q  394 tctct 398  Q
    |||||    
T  15370061 tctct 15370065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15977933 - 15977670
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||  | | ||  ||    
T  15977933 atgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattatcaacaaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaaacatttagttca 15977834  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  15977833 taataatcacttatctcaattaagcacttatgtatagaattagagaagaagctacaactaaaatattatgattgaaatctatctcccttacttcaataag 15977734  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 351  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  15977733 caataatcctagccaaagcttcaattaagctcctagaatctctaactcctcttggttcttcaag 15977670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14272001 - 14271806
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14272001 atatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaa 14271902  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa 269  Q
    |||  ||||||| || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||    
T  14271901 ttt-gacaactatgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaa 14271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21537761 - 21537611
Alignment:
Q  209 taagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagct 307  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  21537761 taagcacttatgcatagaattggggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatttaacccccttacctcaataagcaataaccctagccaaagct 21537663  T
Q  308 tcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  21537662 tcaattaagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagcttttctc 21537611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 14940900 - 14941008
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14940900 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaa---tttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaa 14940996  T
Q  172 tttcaacaacta 183  Q
    ||||||||||||    
T  14940997 tttcaacaacta 14941008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 15368493 - 15368601
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15368493 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaa---tttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaa 15368589  T
Q  172 tttcaacaacta 183  Q
    ||||||||||||    
T  15368590 tttcaacaacta 15368601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21675472 - 21675389
Alignment:
Q  243 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21675472 aactaagtgattatgattgaattctaacccccttacatcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaat 21675389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 354
Target Start/End: Original strand, 19070098 - 19070291
Alignment:
Q  163 gagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgatt 260  Q
    |||||||||||||| ||| |||   || ||| |||| |||||| || |||||||||  ||||| |||||| |||   |||||||||||   ||||||| |    
T  19070098 gagcacgaatttcaccaattaaattcacaatgatcatttatttcaaataagcacttttgcatataattagagaatggattacaactaataaattatgaat 19070197  T
Q  261 gaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  19070198 gaaatctaacccccttacctcaattggtaataatcctagcaaaaacttcaatttaactcctagaatttctatcacctcttgattcttcaagctt 19070291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17224033 - 17223832
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  17224033 tttctcatactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataac 17223934  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaact--aagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    ||||  || | || |||| | ||| | |||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  17223933 aactttgaac-aattaattatttactcaattaagcacttaatcataaaataattgaaaaattac-actaaaaatgattatgattgaattctaaccccctt 17223836  T
Q  277 acct 280  Q
    ||||    
T  17223835 acct 17223832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 13377681 - 13377775
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  13377681 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39291598 - 39291467
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaa 192  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |  || |  || ||    
T  39291598 aacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaa 39291499  T
Q  193 taatcacttatttaattaagcacttaagcata 224  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| |||||    
T  39291498 taatcacttattcaaataagtacttatgcata 39291467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49047764 - 49047689
Alignment:
Q  84 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||| ||||    
T  49047764 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataa 49047689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 13274929 - 13275127
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||| ||| || | ||||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  13274929 tttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaac 13275028  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  13275029 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaatggcaa-taaatgattatga-tgaattctaacccccttac 13275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16570101 - 16569952
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||   || |||||  |  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||     
T  16570101 ttttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcat 16570002  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    ||  || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  16570001 catttatgagc-aaataatcaattatccaattaagcacttattcatacaat 16569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 16595561 - 16595710
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||   || |||||  |  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||     
T  16595561 ttttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcat 16595660  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    ||  || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  16595661 catttatgagc-aaataatcaattatccaattaagcacttattcatacaat 16595710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13911112 - 13911028
Alignment:
Q  89 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||| |||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13911112 tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaattt 13911028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17947579 - 17947546
Alignment:
Q  113 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17947579 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaa 17947546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17984819 - 17984750
Alignment:
Q  111 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaa 180  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |  ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  17984819 caacaattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactaaaacaagagcacgaatttcaacaa 17984750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 138
Target Start/End: Original strand, 16919723 - 16919770
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatg 138  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16919723 tgaacatgaaatttcaccaataacaattcgattatcaacaatttcatg 16919770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17984706 - 17984616
Alignment:
Q  308 tcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctc-ttgaactttctctc 397  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  17984706 tcaattaagctcctagaatctctatcacctcttgtttcttcaag-tcttctctcttctaaccctttttttcattctctttgaactttctctc 17984616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 280
Target Start/End: Original strand, 25124391 - 25124480
Alignment:
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  25124391 aaataatcacttatttcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaagactaacccccttacct 25124480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Original strand, 2437621 - 2437705
Alignment:
Q  89 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2437621 tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaattt 2437705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 21109895 - 21110221
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21109895 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaacatatcatcagaacaagagcacgaa 21109994  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21109995 tttcaacaactaagagcaaaataataatttgtttaaataagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 21110094  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21110095 tccttacctcaattagcaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctgtcacctcttgggtcttcaagcttttcccccttctaaccat 21110194  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21110195 tttcctcttctcttgaattttctctct 21110221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23234587 - 23234258
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23234587 atatcattttcacatactataaacatgcaattacaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtacttaaacatatcatcataacaagagcacgaa 23234488  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattag----ggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatct 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23234487 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattagaaaaaaaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatca 23234388  T
Q  268 aaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa 367  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||    
T  23234387 aatccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcgtgcttttct-tcttctaa 23234289  T
Q  368 ccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23234288 cccttttcctcttctcttggactctctctct 23234258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26559917 - 26559592
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26559917 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaa 26559818  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26559817 tttcaacaactatgattaaaataatcatttattcaattaagcacttaaacatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattataattgaaatctaacc 26559718  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26559717 c-cttacctcaattagcaataatcctagctaaaacatcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 26559619  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  26559618 ttttatcttctcttgaactttctctct 26559592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16835395 - 16835074
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16835395 ttttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaaatcaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaa 16835296  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16835295 caactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccccctt 16835196  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  16835195 acctcagtaagaaataatcctaacaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctctcggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 16835097  T
Q  377 tc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  16835096 tcattctcttgaactttctctct 16835074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 99 - 398
Target Start/End: Original strand, 19873933 - 19874233
Alignment:
Q  99 caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatca 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19873933 caatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatca 19874032  T
Q  199 cttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattct 297  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  19874033 cttattcaaataagcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgatggaaatctaacccccttacctcaataaacaataatcct 19874132  T
Q  298 agcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctct 396  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  19874133 agcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctctcttttaacccttttgctccttctcttgaactttctct 19874231  T
Q  397 ct 398  Q
    ||    
T  19874232 ct 19874233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 23417393 - 23417713
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23417393 ttttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaatcatcaccaaattcatgtactcaaacaaatcatcataacaagagcacgaatttcaa 23417492  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  23417493 caattaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatataaccccctt 23417591  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  23417592 acctcaataagaaataatcctagcaaaaacttcaatttagctcctcgaatctttatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 23417690  T
Q  377 t-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  23417691 tccttctcttgaactttctctct 23417713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11763588 - 11763283
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  11763588 atgaacatgaaatttcatcaacatcaactcaattatcatcaaattcatctactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaatttcaacaactaagtgca 11763489  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagg-gaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11763488 aaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattaggagaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaacccccttacctcaataag 11763390  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttg 386  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  11763389 caacaatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaaccctttttctccttctcttg 11763291  T
Q  387 aactttct 394  Q
    ||||||||    
T  11763290 aactttct 11763283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 124 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5621844 - 5621571
Alignment:
Q  124 atcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcat 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5621844 atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagcaaaaacacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcat 5621745  T
Q  224 acaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatag 323  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| | ||| |||    
T  5621744 gcaattaatgaaaaattacaactaattaattatgattgaactttaacccccttacctcaattagcaataatcatagccaaagcttcaattcatctcttag 5621645  T
Q  324 aatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5621644 aatctctatcacatcttgagtcttcaagtttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 5621571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 398
Target Start/End: Original strand, 29918118 - 29918435
Alignment:
Q  80 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29918118 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttcaaca 29918217  T
Q  180 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 279  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29918218 actatgaacaaaa-aatcacttattcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaagttacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttacc 29918316  T
Q  280 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatag-aatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc 378  Q
    | | | ||  |  || |||||  || |||||||||||||| | | |||||| | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  29918317 ttagttagtgaacatcctagcccaaacttcaatttagctcttggaaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tcttctctcttctaacccttttcctc 29918415  T
Q  379 ttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  29918416 ttctcttgcattttctctct 29918435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 351
Target Start/End: Original strand, 6456769 - 6457044
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  6456769 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaa---ttcaattatcgccaatttcatgtattcaaacgtatcttcataattagagcacgaa 6456865  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6456866 tttcaacaactatgaacaaa-taatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacc 6456964  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 351  Q
    | |||| || | | ||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  6456965 cccttatcttagttagcaaaaatcctaacccaagcttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag 6457044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 396
Target Start/End: Original strand, 24084222 - 24084534
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||    
T  24084222 atatcattttcacatactatgaacatgtaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagggcacgaa 24084321  T
Q  172 tttcaacaactaa-gagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    | ||| ||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  24084322 tgtcaccaattaatgaac-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaat 24084420  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
    || ||||||| | | || || ||| |||||             |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||     
T  24084421 ccccttaccttagttagaaaaaatcctagc-----------cctagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tcttctctcttctaaccc 24084508  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctct 396  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  24084509 ttttcctcttctcttgcactttctct 24084534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 37983516 - 37983834
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||   ||||||| ||||| |||    
T  37983516 tttcacatactttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaac 37983615  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37983616 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 37983713  T
Q  279 ctcaataagca-ataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    || | | |||| | | |||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |||  || || ||||||    
T  37983714 cttagttagcacaaatttctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttct-cctcttaccctttttcc 37983812  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  37983813 tcttctcttgcactttctctct 37983834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 319
Target Start/End: Original strand, 22885793 - 22886022
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  22885793 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttcaa 22885892  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||| | || | |||| |||| ||||| |||||||||||||           | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22885893 caaccatgaac-aaattatcaattattcaattaagcactta-----------atgaaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaaccccctta 22885980  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctc 319  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22885981 cctcaattagcacaaatcctagcctaagcttcaatttagctc 22886022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 354
Target Start/End: Original strand, 21617168 - 21617442
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  21617168 tttcatatacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaac 21617267  T
Q  179 aactaa-gagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| || | || ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21617268 aactaatgaac-aattaatcccttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaaccccctta 21617365  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
    ||| ||| ||||  | | |||||  || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  21617366 ccttaattagcacaattcctagcccaaccttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagctt 21617442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21222703 - 21222387
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  21222703 tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaac 21222604  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || ||||||  || | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| | |||    
T  21222603 aactatgaac-aattaatca-atactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaataattatgattgaactctaacccccatac 21222507  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||    
T  21222506 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttcttcttc--tctaacccttttcc 21222409  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||  ||||| |||||    
T  21222408 tcttctcttacactttttctct 21222387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 19862361 - 19862561
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  19862361 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 19862460  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | ||| || | || |||||||||| | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19862461 atctatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 19862559  T
Q  279 ct 280  Q
    ||    
T  19862560 ct 19862561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21310811 - 21310605
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21310811 atatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaa 21310712  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| ||||  || || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||   || ||||||||| |||| | |||||    
T  21310711 ttttaacatttatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattttaacc 21310614  T
Q  272 ctcttacct 280  Q
    | |||||||    
T  21310613 cccttacct 21310605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24225391 - 24225124
Alignment:
Q  129 caatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||| |||||||     
T  24225391 caatttcatatatacaaacatatcaccataattaaggcacgaaattcaacatctaagaacaat-taatcacttaatcaattaagcacttaaccatacaac 24225293  T
Q  229 tagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatct 328  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| | | ||||  | | |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  24225292 tagtgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatct 24225194  T
Q  329 ctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaacca-ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24225193 ctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccatttttcctcttctcttgcactttctctct 24225124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21297277 - 21297071
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   |||| |||||    
T  21297277 atatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaa 21297178  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| ||||  || || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||   || | ||||||| |||| |||||||    
T  21297177 ttttaacatttatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatga-tgaattctaacc 21297080  T
Q  272 ctcttacct 280  Q
    | |||||||    
T  21297079 cccttacct 21297071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23981607 - 23981514
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23981607 acatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttca 23981514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 432608 - 432753
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  432608 atatcattttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaa 432707  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcactta 218  Q
    ||| ||||| || || | || |||||| ||| | |||||||||||||    
T  432708 ttttaacaattatgatc-aattaatcatttactcaattaagcactta 432753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5450938 - 5450858
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  5450938 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa 5450858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 3674014 - 3674161
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  3674014 tttctcatactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaac 3674113  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  3674114 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa 3674161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32966245 - 32966106
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || |||||| ||||||||   |||||||||||| ||    
T  32966245 ttttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcttacattccaacataacatcataattggagcacgaattttaa 32966146  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcactta 218  Q
    ||| || || | || |||||| ||| | |||||||||||||    
T  32966145 caattatgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta 32966106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Original strand, 7728572 - 7728630
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat 137  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7728572 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcat 7728630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 16595659 - 16595858
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  16595659 tttctcatactttgaacatgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 16595758  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    || || || | || || ||| ||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||| |||||   || ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  16595759 aattatgaac-aattagtcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaatgattatga-tgaattctaacccccttac 16595856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 28902343 - 28902490
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  28902343 tttctcatactttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 28902442  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  28902443 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa 28902490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 28938738 - 28938885
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  28938738 tttctcatactttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 28938837  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  28938838 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa 28938885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22662767 - 22662680
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  22662767 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaatttcaa 22662680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 127
Target Start/End: Original strand, 23466587 - 23466637
Alignment:
Q  77 tttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 127  Q
    |||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23466587 tttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatca 23466637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4200073 - 4199989
Alignment:
Q  89 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4200073 tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaattt 4199989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 54398534 - 54398853
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54398534 ttttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacgaatttcaa 54398633  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54398634 aaactaagagcaaaataatcccttattcaattaagcacttaagcatacaattagagaaaaattacaactaagtgattatgattgagatctaaccccctta 54398733  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct 377  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  54398734 cctcaattagcaataatcctagcaaaaacttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ct 54398832  T
Q  378 cttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  54398833 cttctcttgaactttgtctct 54398853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47468450 - 47468125
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47468450 atatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 47468351  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47468350 ttacaacagctaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgcaattaggggaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacc 47468251  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  47468250 atcttacctcaataagcaataatcctagcaaaagtttcaatttagctcctacaatctctattacctcttgggtcttcaagc-tttatcccttctaaccct 47468152  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  47468151 tttcctcttctcttgaactttctctct 47468125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 50220042 - 50219720
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  50220042 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaa 50219943  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50219942 tttcaacaactaa---caaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaattgattatgatcgaaatctaacc 50219846  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  50219845 cccttacctcaattaacaataatcctagcaaaaacttcaatttaactcctagaatctatatcacctcttaggtcttcaagc-tttctcccttctaaccct 50219747  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50219746 tttcatcttctcttgaactttctctct 50219720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13442772 - 13442453
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13442772 ttttcacatactatgaacatgcaatttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaa 13442673  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13442672 caactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaatta-ataaaaattacaactaattgattatgattgaactctaaccccctta 13442574  T
Q  278 cctcaataag-caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| | |||| |    
T  13442573 cctcaattagtaaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctttatcatctcttgagttttcaagtttttctcccttctaatcctttt-c 13442475  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13442474 tcttctcttgaactttctctct 13442453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13590176 - 13589848
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13590176 atatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaa 13590077  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaa- 269  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13590076 tttcaacaattaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattagggaaaatattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 13589977  T
Q  270 ccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-c 368  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  13589976 cccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctcgaatctttatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacc 13589878  T
Q  369 cattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13589877 catttgctccttctcttgaactttctctct 13589848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40905030 - 40904708
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40905030 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaa 40904931  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40904930 caactatgaacaaagtaatcatttattcaattaagcacttaaccatgcaattattgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaaccccctta 40904831  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    ||| ||  ||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  40904830 cctgaagtagcaaataatcctagtcaaagcttcaatttagctcctagattctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaaccctttttc 40904731  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  40904730 ctattctcttgcactttctctct 40904708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 80 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41916820 - 41916520
Alignment:
Q  80 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41916820 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattatattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaaca 41916721  T
Q  180 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 279  Q
    ||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41916720 actaagagcaaaataa----------------gcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaaccc-cttacc 41916638  T
Q  280 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctct 379  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||    
T  41916637 tcaattagcaataatcctaacaaaaatttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaaacttttctcccttctattcctttt-ctct 41916539  T
Q  380 tctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41916538 tctcttgaactttctctct 41916520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18238259 - 18238075
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18238259 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 18238160  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18238159 tttcaacaactaagagcaaaataatcacctattcaattaagcacttaagcatacaattaaggaaaaattacaactaattgattat 18238075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15013378 - 15013062
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  15013378 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattc-aacatatcatcataattagagcacgaatttaaa 15013280  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15013279 caactatgaac-aattaatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatg-aaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaccccctta 15013182  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct 377  Q
    ||| | | ||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||    
T  15013181 ccttagttagcacaaatcctagctcaagcttcactttagctcctagaatcttcaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcct 15013083  T
Q  378 cttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15013082 cttctcttgcactttctctct 15013062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 38764860 - 38765177
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||||  | ||||||||||||||    
T  38764860 ttttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaa 38764959  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38764960 caactatga--aaaataatcaattattcaactaagcactttatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctctta 38765057  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||| ||| ||||  |||  ||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| |    
T  38765058 ccttaattagcacaaatcatagcccaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaacctttttgc 38765155  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  38765156 tcttctcttgcactttctctct 38765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41256471 - 41256147
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  41256471 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattc-aacatttcatcataattagagcacgaa 41256373  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41256372 tttcaacaactatgaac-aattaatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacc 41256274  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-cca 370  Q
    | ||||||| | | | ||  ||| |||||  |||||| |||||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| | | ||  ||||||| ||     
T  41256273 cccttaccttagttaacacaaatcctagcccaagctttaatttaactcctagaatcttcaccacctcttaggtcttcaag-tctcctatcttctaaccct 41256175  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41256174 ttttcctcttctcttgcactttctctct 41256147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 93 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12133690 - 12133384
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaa 192  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  12133690 aacatgcaatttcatcattaacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcaccaatttcaacaattaagt-cacaa 12133592  T
Q  193 taatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa 290  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| ||||  || ||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12133591 taatcacttatctcaaataagcacttatgcattgaaatagggaagaagctacaacttagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaa 12133492  T
Q  291 taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaac 389  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  12133491 taatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaag-ttttatcccttctaacccttttgctccttatcttgaac 12133393  T
Q  390 tttctctct 398  Q
    |||||||||    
T  12133392 tttctctct 12133384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7964806 - 7964490
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||    
T  7964806 tttcacatact-tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaac 7964708  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || || ||||||| | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7964707 aactatgaac-aattactcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 7964610  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    || | | ||||  |||| || ||  || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  7964609 cttagttagcacaaattccttgcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaacccttttcc 7964512  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  7964511 tcttctcttgcactttctctct 7964490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 240 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10237202 - 10237048
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 339  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10237202 tacaactaagttattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaaaaatcctagcaaaagcttcaatttaggtcctagaatctctatcacctct 10237103  T
Q  340 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10237102 tgagtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 10237048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 54363374 - 54363068
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||    
T  54363374 catgtaatttcatcatcaacaacttgattatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaattcaaaata 54363275  T
Q  195 atcacttattt--aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctc-ttacctcaataagcaa 290  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  54363274 atcacttatttttaattaagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaaccccccttacctcaacaaacaa 54363176  T
Q  291 taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaac 389  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  54363175 taatcctagcaaaagcttcaatttagctcctaaaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttcccccttctaacccttttgctcattctcttgaac 54363077  T
Q  390 tttctctct 398  Q
    |||||||||    
T  54363076 tttctctct 54363068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18236122 - 18235976
Alignment:
Q  252 attatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 351  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18236122 attatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaaaaatcctagcaaaagcttcaatttagcttctagaatctctatcacgtcttgggtctgcaag 18236023  T
Q  352 cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18236022 cttttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 18235976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 19559522 - 19559831
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| || |  | |||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |  |  |  ||    
T  19559522 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacatgctcaaacatatcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtaca 19559621  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa---attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataa 286  Q
     |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19559622 taataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaatta--actaattgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaatta 19559719  T
Q  287 gcaataattctagcaaaa-gcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctctt 385  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19559720 gcaataatcctagaaaaaagcttcaatttacctcttagaatctctatcatctcttgagtcttcaagcttt-ctcccttctaacccttttcctcttctctt 19559818  T
Q  386 gaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||    
T  19559819 gaactttctctct 19559831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 18276586 - 18276903
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  18276586 tttcacatgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaac 18276685  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || ||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  18276686 aactatgaac-aattaatcacatactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaatcgc-actaaatgattatgattgaattctaaccccgttac 18276783  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || ||| || |  | | |||||  |||||||| |||||||| ||| |||| || ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  18276784 cttaattagtacaattcctagctcaagcttcactttagctcctaggatctgtaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcc 18276881  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  18276882 tcttctcttgcactttctctct 18276903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7185946 - 7185697
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  7185946 atatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaa 7185847  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  7185846 ttttaacaactatgaac-aattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaacc 7185750  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatag 323  Q
      ||||||| ||| ||||  |||| |||||  || ||||| ||||||||||||    
T  7185749 tccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctcatag 7185697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15213704 - 15213398
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||| | ||| |||   |||| ||    
T  15213704 catgtaatttcatcatcaacaacttgattatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaattttatcaattaaattcaaacta 15213605  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15213604 atcacttatttcaattaagcacttatgcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattgtgattgaa-tctaacccccttacctcaataagcaata 15213506  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctc---ttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaa 388  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15213505 atcctag-aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctctaattggtttttcaagc-tttctcctttctaacccttttgctcattctcttgaa 15213408  T
Q  389 ctttctctct 398  Q
    ||||||||||    
T  15213407 ctttctctct 15213398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 206 - 396
Target Start/End: Original strand, 28428029 - 28428219
Alignment:
Q  206 aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaa 304  Q
    ||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||    
T  28428029 aattaagcacttaaatatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaactctaacccccttacctcaattagcaaataatcctagctaaa 28428128  T
Q  305 gcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctct 396  Q
     |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  28428129 acttcaatttaactcctagaatctccatcacctcttgggtcttcaagtttttctcccttctaacccttct-atcttctcttgaactctctct 28428219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 49071850 - 49072155
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||| || |  |||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||   |  |  ||    
T  49071850 atgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattaacatcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttca 49071949  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca 289  Q
     ||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || |   |  ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  49071950 caatgatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagaga---tgaaactaagagattatgcttgaaatctaacccccctacctcaataagca 49072046  T
Q  290 ataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaa 388  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  49072047 ataatcgtagcaaaagcttcaattaagctcctagaatctctaacacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaa 49072145  T
Q  389 ctttctctct 398  Q
    || |||||||    
T  49072146 ctctctctct 49072155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 47535160 - 47535065
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 174  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47535160 tttctcatactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 47535065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17375358 - 17375155
Alignment:
Q  121 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaa 219  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| ||||||  | |||     
T  17375358 attatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaattcaaaataatcacttatttcaattaatta-ttat 17375260  T
Q  220 gcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagct 318  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17375259 gcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaatccccttacctcaataagcaacaattctagcaaaagc-tcaatttagtt 17375162  T
Q  319 catagaa 325  Q
    | |||||    
T  17375161 cctagaa 17375155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13809606 - 13809407
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||    
T  13809606 ttttctcatactttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaa 13809507  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||| || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  13809506 caattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaatggcaa-taaatgattatga-tgaattctaaccccctta 13809410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 15044980 - 15045127
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  15044980 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 15045079  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  15045080 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa 15045127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17373057 - 17372921
Alignment:
Q  188 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaata 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17373057 caaaataatcacttatttcaattaatta-ttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaaccctcttacctcaata 17372960  T
Q  286 agcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaa 325  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  17372959 aacaacaatcctagcaaaagc-tcaatttagttcctagaa 17372921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 21417471 - 21417664
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||   | |||||||| |  ||||||||||| ||||  ||     
T  21417471 tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatctctaaaacaagagtagaaatttcaacaattaagctcac 21417570  T
Q  191 aataatcacttat-ttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaa 283  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||| | |||||| |||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21417571 aataatcacttatcccaaataagcacttatgcaaagaattagagaagggattacaactaagagattatgaatgaaatctaaccc-cttacctcaa 21417664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52265603 - 52265405
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  52265603 tttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatc 52265504  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | ||| || | || |||||| |||   |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  52265503 atctatgaac-aattaatcaattacccaattaaacacttattcatacaataattgaaaaattgcaa-taaatgattatga-tgaattctaacccccttac 52265407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15109444 - 15109364
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15109444 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa 15109364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 398
Target Start/End: Original strand, 24238012 - 24238088
Alignment:
Q  322 agaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24238012 agaatctctatcacctcttggttgttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctctttctcttgaactttctctct 24238088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Original strand, 14901398 - 14901582
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaa 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||||| || || | ||     
T  14901398 aacatgaaatttcaccaacaacaa-tcaattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaac-aat 14901495  T
Q  193 taatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||| |||  || ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14901496 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaaatgattatga-tgaaatttaacccccttacct 14901582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37957127 - 37957019
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |  |  |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  37957127 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaactaatcaattaccaccaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaa 37957028  T
Q  172 tttcaacaa 180  Q
    || ||||||    
T  37957027 ttccaacaa 37957019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41166041 - 41165961
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||| |||||||    
T  41166041 tttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataa 41165961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30232592 - 30232393
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||  ||||||| |||||||||   |||||||||||  ||    
T  30232592 ttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatca-taacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaa 30232494  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatta-gggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    ||| || || | || |||||| |||   |||||||||||||  ||||| || |  | ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30232493 caattatgaac-aattaatcaattacacaattaagcacttattcataccataattgaaaaaattgcaa-taagtgattatga-tgaattctaaccctctt 30232397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40885660 - 40885610
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatt 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40885660 acatactttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaatt 40885610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47535040 - 47534901
Alignment:
Q  216 ttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaattt 314  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| || ||  |||||||| |||    
T  47535040 ttaatcatacaataatggaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcacttt 47534941  T
Q  315 agctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||    
T  47534940 agctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctt 47534901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18494424 - 18494374
Alignment:
Q  77 tttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 127  Q
    |||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18494424 tttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatca 18494374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34177732 - 34177552
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||   | || |  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||  |  | |     ||    
T  34177732 atgaacatgcaattttatcatcaacaattcaattatcatgtaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattca 34177633  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccc 272  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  34177632 caataatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaaccc 34177552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 10374964 - 10374997
Alignment:
Q  361 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 394  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10374964 cttctaacccttttcctcttctcttgaactttct 10374997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16225255 - 16225167
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||| ||||||  |  ||| ||||| ||||||||||    
T  16225255 atgaacatgtaatttaaacaacaacaattcaaataccatcaaattcatgtacccaaatatatcactagtacatgagcatgaatttcaac 16225167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5768271 - 5767946
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768271 atatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 5768172  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5768171 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgcaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 5768072  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5768071 cccttacctcaattagcaaatatcctagcaaaaactttaatttagctcctagaatctctatcacttcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaaccct 5767973  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5767972 tttcctcttctcttgaactttctctct 5767946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40436371 - 40436044
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40436371 atatcattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 40436272  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  40436271 tttcaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattaaggaaaagattataattaagtgattgtgattgaaatctaac 40436172  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  40436171 ccccttacctcaataaacaataatcctagcaaaagtttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaaccc 40436073  T
Q  371 ttttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  40436072 ttttgctccttctcttgaactttctctct 40436044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 25094004 - 25094328
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25094004 atatcattttctcatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 25094103  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25094104 tttcaacagttaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcataga--tagggaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 25094201  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  25094202 cccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacttcttggttcttcaagc-tttctccattctaaacct 25094300  T
Q  372 tttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25094301 tttgctcattctcttgaactttctctct 25094328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 81 - 398
Target Start/End: Original strand, 20194179 - 20194498
Alignment:
Q  81 tcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaa-catatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20194179 tcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatatactcaaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 20194278  T
Q  180 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  20194279 actaagtgcaaaataatcatttattcaaataagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaagtctaacttccttac 20194378  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct- 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||     
T  20194379 ctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcatggttcttcaagc-tttctcccttctgactcttttgctc 20194477  T
Q  378 cttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20194478 cttctcttgaactttctctct 20194498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 33397503 - 33397817
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33397503 ttttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaactcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 33397602  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
             |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33397603 at-------gcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattaaggaaaagattataactaagtgattatgattgaaatctaaccccctt 33397695  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  33397696 acctcaataagcaataatcctagcaaaaggttcgatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcctcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 33397794  T
Q  377 tc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    || |||||||| |||| ||||||    
T  33397795 tcattctcttggacttcctctct 33397817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 52400776 - 52401100
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  52400776 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaactatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaa 52400875  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
      |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  52400876 agtcaacaactatgaacaaa-taatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacc 52400974  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    ||||||||| | | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||| ||| |    
T  52400975 ctcttaccttagttagcaaaaatcctagcccaagcttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctgaccct 52401073  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52401074 tttcctcttcttttgcactttctctct 52401100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 49997383 - 49997059
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| || |||| ||    
T  49997383 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaa 49997284  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||  | || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  49997283 tttcaacaatcatgaac-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgtttgaattctaacc 49997185  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| | | ||||| ||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | |  || |||||||||||    
T  49997184 cccttaccttagttagcaaaaatcctagctcaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tatcttctcttctaaccat 49997086  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  49997085 tttcctcttctcttgcactttctctct 49997059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 134 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 76458 - 76194
Alignment:
Q  134 tcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattaggg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||| || || ||||||||    
T  76458 tcatgtactcaaacatatcatcataacaaaagcacgaatttcaacaacttagtgcaaaataatcacttattcaaataagcaattatgcttagaattaggg 76359  T
Q  234 aa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctat 332  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  76358 aagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcatagcaaaagcttcaatttaactcctagaatctctat 76260  T
Q  333 cacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  76259 cacctcttggttcttcaagc-ttactcccttctgacccttttgctcattctcttgaactttctctct 76194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 21195159 - 21195483
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  21195159 atatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaa 21195258  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  21195259 ttttaacaactatgaac-aattaatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaac 21195357  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaacca 370  Q
    | ||||||| | | ||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||  |||||||||     
T  21195358 cccttaccttagttagcacaaatcctagcccaagcttcactttagctcctagaatcaccatcacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaaccc 21195455  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21195456 ttttcctcttctcttgcactttctctct 21195483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8538006 - 8537737
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8538006 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaa 8537907  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||| | || |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  8537906 caaccatgaac-gaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactccctta 8537808  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 348  Q
    ||| | | ||||  ||| |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  8537807 ccttagttagcacaaatcctagcccaagcttcactttaactcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 8537737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8603245 - 8602976
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8603245 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaa 8603146  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||| | || |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  8603145 caaccatgaac-gaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactccctta 8603047  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 348  Q
    ||| | | ||||  ||| |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  8603046 ccttagttagcacaaatcctagcccaagcttcactttaactcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 8602976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 398
Target Start/End: Original strand, 20822937 - 20823095
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20822937 tacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatccttgcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 20823036  T
Q  340 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20823037 tggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 20823095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 240 - 396
Target Start/End: Original strand, 20836741 - 20836897
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20836741 tacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 20836840  T
Q  340 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctct 396  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20836841 tcgttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctct 20836897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 163 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18852729 - 18852493
Alignment:
Q  163 gagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattg 261  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| | |||||||| ||  |||||||||  |||||||||||    
T  18852729 gagcacgaatttcaacgattaagtacacgataatcacttattcaaataagcacttatgcatatatttagggaagaagctacaactaaa-gattatgattg 18852631  T
Q  262 aaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctccc 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18852630 aaatctaacccccttacctcaataaacaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaaac-tttctccc 18852532  T
Q  362 ttctaac-cattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  18852531 ttctaactctttttgctccttctcttgaactttctctct 18852493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 17609080 - 17609398
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  17609080 tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaac 17609179  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17609180 aactatgatc-aactaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 17609277  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || | | ||||  |||| ||| |  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| | || | ||||| || ||||||    
T  17609278 cttagttagcacaaattcctaacccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttct-tcgcctctaaccctttttcc 17609376  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
     ||||||||| |||| ||||||    
T  17609377 ccttctcttgcacttgctctct 17609398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37233955 - 37233638
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
T  37233955 tttcatatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaac 37233856  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    |||||  | | || || ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37233855 aactattaac-aattactcacttactcaattaagcacttaataatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 37233758  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || ||| ||||  | | |||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||||| || ||||||    
T  37233757 cttaattagcacaattcctagcccaagcttcactttacctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttcttc--tctaaccctttttcc 37233660  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  37233659 tcttctcttacactttctctct 37233638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 383
Target Start/End: Original strand, 20177327 - 20177632
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | | ||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  20177327 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaac 20177426  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  20177427 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttaaacatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccattac 20177525  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||  |||||  |||||||||| |||| |  ||||| || ||||||    
T  20177526 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccctttttcc 20177625  T
Q  377 tcttctc 383  Q
    |||||||    
T  20177626 tcttctc 20177632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22143452 - 22143139
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| ||    
T  22143452 acatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatct 22143353  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    | || | || |||||| ||||  |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||   || ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |    
T  22143352 atgaac-aattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattctaaccc-cttacctta 22143256  T
Q  283 ataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattt--tcctc 378  Q
     | ||||| |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |||   | | | |||||  ||||||||||| |||||   ||||||| |||  |||||    
T  22143255 gttagcaattaatcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaagcttcttctc---tctaacccttttctcctc 22143159  T
Q  379 ttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  22143158 ttctcttgcactttctctct 22143139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13376949 - 13376754
Alignment:
Q  84 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaacta 183  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| || |||    
T  13376949 catactttgaacatgaaatttcaacgacaacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatcta 13376850  T
Q  184 agagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
     || | || |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13376849 tgaac-aattaatcaattactaaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 13376754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 19603242 - 19603397
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  19603242 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaa 19603341  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    ||| ||||| || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  19603342 ttttaacaattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaat 19603397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38033776 - 38033675
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |  |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  38033776 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaa 38033677  T
Q  172 tt 173  Q
    ||    
T  38033676 tt 38033675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 16646064 - 16646211
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  16646064 tttctcatactttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 16646163  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  16646164 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa 16646211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 16656790 - 16656937
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  16656790 tttctcatactttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 16656889  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  16656890 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa 16656937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20955541 - 20955454
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    ||||| || ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  20955541 atatcattctcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacagatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataa 20955454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22829527 - 22829324
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| || || ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  22829527 atatcattttcatatgctttgaccattcaatttcactaacaacaaatcaattatcaccagtttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaa 22829428  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||  ||||| || ||   || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  22829427 ttctaacaattatga-ataattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgc-actaaatgattatga-tgaattctaacc 22829331  T
Q  272 ctcttac 278  Q
    | |||||    
T  22829330 cccttac 22829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Original strand, 27674941 - 27675042
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  27674941 atatcatttccatatactttgatcattcaatttcaccaataacaaatcaattatcaccaatttcttacattcaaacataacatcataattggagcacgaa 27675040  T
Q  172 tt 173  Q
    ||    
T  27675041 tt 27675042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36356395 - 36356294
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |  |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  36356395 atatcattttcatatactttgatccttcaatttcaccaacaacatttcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaa 36356296  T
Q  172 tt 173  Q
    ||    
T  36356295 tt 36356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 51627760 - 51627679
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  51627760 ttttctcatactttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataa 51627679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 21978003 - 21978130
Alignment:
Q  158 aacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttat-ttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgatta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |||||| ||| ||||  |||||| ||| | || ||||||||   ||||    
T  21978003 aacaagagcacgaatttcaacaattaagctcacaataatcacttatctcaaataagcatttatgcattgaattagagaagagatcacaactaaaatatta 21978102  T
Q  256 tgattgaaatctaaccctcttacctcaa 283  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21978103 tgaatgaaatctaacccccttacttcaa 21978130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27329851 - 27329757
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||  ||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  27329851 ttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatca-taacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 27329757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43427618 - 43427291
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactca---aacatatcatcataacaagagcac 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  43427618 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcatcaaacatatcaccataacaagagcac 43427519  T
Q  169 gaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatcta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43427518 gaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttatgcatacaattagg-aaaaattacaactaagtgattatgattgaaatcta 43427420  T
Q  269 accctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaac 368  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43427419 acccccttacctcaattagcaataatcctagcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttatcccttctaac 43427321  T
Q  369 cattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43427320 ccttttcctcttctcttgaactttttctct 43427291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 8604976 - 8605295
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8604976 ttttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 8605075  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||    
T  8605076 caactaagagcaaaataatgacttgttcaaataagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactatgtgattatgattgaactctaactct-tta 8605174  T
Q  278 cctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  8605175 ccttaattagcaattaatcctagccaaagcttcaatttagctcctagattctctaacacctcttgagtcttcaagc-ttcctctattctaaccattttcc 8605273  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  8605274 tcttctcttgcactttctctct 8605295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 10913037 - 10913356
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913037 ttttcacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 10913136  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  10913137 caactaagtgaaaaataatcacttattcacataagcacttatgcatagatttagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaaccccctt 10913235  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |    
T  10913236 atctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcctttctaacccttttgc 10913334  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  10913335 ccttctcttgaactttctctct 10913356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 38375792 - 38375472
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38375792 ttttcacaaattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 38375693  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  38375692 caattaagtgcaaaataatcactcattcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagatattatgattgaaatctaactctctt 38375594  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  38375593 acctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 38375495  T
Q  377 tc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  38375494 tcattctcttgaactttctctct 38375472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 41661710 - 41662035
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41661710 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaa 41661809  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||    
T  41661810 ttttaacaact-agagcaaaataatcacttaatcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaattaattgattatgattaaactttaacc 41661908  T
Q  272 ctcttacctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41661909 cccttacctcaattagcaaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaacca 41662008  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41662009 tttt-ctcttctcttgaactttctctct 41662035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 124 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21167131 - 21166858
Alignment:
Q  124 atcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcat 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21167131 atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagcaaaaacacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcat 21167032  T
Q  224 acaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatag 323  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| | ||| |||    
T  21167031 gcaattaatgaaaaattacaactaattaattatgattgaactttaacccccttacctcaattagcaataatcatagccaaagcttcaattcatctcttag 21166932  T
Q  324 aatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21166931 aatctctatcacatcttgagtcttcaagtttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 21166858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14814867 - 14814542
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  14814867 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaa 14814768  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14814767 tttcaacaactatgagc-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacc 14814669  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaacca 370  Q
    | ||||||| | | ||||| ||| |||||  |||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| ||  |||  | ||||||||    
T  14814668 cccttaccttagttagcaaaaatcctagccgaagcttaaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcctctttc-tctaacca 14814570  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14814569 ttttcctcttctcttgccctttctctct 14814542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 50313332 - 50313532
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50313332 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaa 50313431  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  50313432 tttcaacaactatgagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattacgattgaactctaacc 50313531  T
Q  272 c 272  Q
    |    
T  50313532 c 50313532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17758688 - 17758384
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||    
T  17758688 catgtaatttcatcatcaacaacttgattatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcacaagcacgaatttcatcaattaacttcaaaata 17758589  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17758588 atcacttatttcaattaagcacttatgcatagaattagggtagaagctacaactaagatattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaata 17758489  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaacttt 392  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17758488 atcctagcaaaagcttcaatttggctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaacttt 17758390  T
Q  393 ctctct 398  Q
    ||||||    
T  17758389 ctctct 17758384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19060008 - 19059704
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||    
T  19060008 catgtaatttcatcatcaacaacttgattatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcacaagcacgaatttcatcaattaacttcaaaata 19059909  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19059908 atcacttatttcaattaagcacttatgcatagaattagggtagaagctacaactaagatattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaata 19059809  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaacttt 392  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19059808 atcctagcaaaagcttcaatttggctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaacttt 19059710  T
Q  393 ctctct 398  Q
    ||||||    
T  19059709 ctctct 19059704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4162307 - 4161983
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||   ||| |||||    
T  4162307 atatcattttcacatactatgaacttgtaatttcaccaacagcaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaa 4162208  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  4162207 tttcaacaactatgaacaaa-taatcacttattcaattaagcacttaatcatgcctttaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaacc 4162109  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| | | ||||| ||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| || |||||| |    
T  4162108 cccttaccttagttagcaaaaatcctagcccaaacttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctctcctaaccct 4162010  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4162009 tttcctcttctcttgcactttctctct 4161983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 213 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31411599 - 31411415
Alignment:
Q  213 cacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaat 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31411599 cacttaagcatacaattaaggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaat 31411500  T
Q  313 ttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31411499 ttaactcttagaatctctatcacctcttggttcttcaagcttttct-ccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 31411415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31412435 - 31412287
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412435 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 31412336  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaag 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31412335 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaag 31412287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33369023 - 33368706
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  33369023 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccacaattaaagcacgaatttcaa 33368924  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| || | ||||||| | ||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33368923 caactatgaac-aaataattaattattcaaataagcacttaatcatgcaattaatg-aaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccccctta 33368826  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaaccattttcc 376  Q
    |||   | ||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  33368825 cctttgttagcacaaatcctagccaaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag--tctctcctcttctaaccattttcc 33368728  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  33368727 tcttctcttgcactttctctct 33368706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 398
Target Start/End: Original strand, 11638553 - 11638769
Alignment:
Q  182 taagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctc 281  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11638553 taagagcaaaataatcaattactcaattaagcacttaagcatgcagttaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaacccccttacctc 11638652  T
Q  282 aataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctctt 380  Q
    ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||    
T  11638653 aattagcaaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagttttcaagcttttctccattctaaccctttt-atctt 11638751  T
Q  381 ctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11638752 ctcttgaactttctctct 11638769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 139 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25104028 - 25103767
Alignment:
Q  139 tactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt-atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa 237  Q
    |||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||   || ||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||  | |    
T  25104028 tactcaaacattacatcaaaacataagcacgaatttcatcaattaatttcataataatcactttatacaaataagcacttatgcatagaattaggataga 25103929  T
Q  238 at-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacc 336  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25103928 agctacaactaaatgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagtaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacc 25103829  T
Q  337 tcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25103828 tcttggttcttcaag-ttttctcccttttaacctttttgctccttctcttgaactttctctct 25103767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12539153 - 12538849
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  12539153 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatactcaaccatatcactaaaacaagagcacgaatttcaacaataaagctca 12539054  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||||||||||| | || | |||||||| ||| | ||||||  || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||     
T  12539053 caataatcacttatctcaaatgagcacttatgcaaagaattagataagagattacaactaagagattatgaatgaaatctaacccccttactgcaataaa 12538954  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttg 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||   ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  12538953 caataatcctagcaaaagcttcaatttagttcctaaaatatctatca---cttggttattcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttg 12538858  T
Q  387 aactttctc 395  Q
    |||||||||    
T  12538857 aactttctc 12538849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13301565 - 13301326
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  13301565 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaa 13301466  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    || |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  13301465 catctaagaac-caataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcac-actaaatgattatga-tgaattctaaccccctta 13301369  T
Q  278 cctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctc 319  Q
    ||| ||| ||||  |||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  13301368 ccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctc 13301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13312221 - 13311982
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  13312221 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaa 13312122  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    || |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  13312121 catctaagaac-caataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcac-actaaatgattatga-tgaattctaaccccctta 13312025  T
Q  278 cctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctc 319  Q
    ||| ||| ||||  |||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  13312024 ccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctc 13311982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40038917 - 40038706
Alignment:
Q  188 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaata 285  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40038917 caaaataatcatttatttcaattaagcacttatgcatagaattagggtagaagctacaactaagagattatgattgaaatctaaccccct-acctcaata 40038819  T
Q  286 agcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctct 384  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  40038818 agcaataatcctagcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttagttcttcaagc-tttctcccttgtaacccttttgctcattctct 40038720  T
Q  385 tgaactttctctct 398  Q
    ||||| ||||||||    
T  40038719 tgaaccttctctct 40038706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11515556 - 11515373
Alignment:
Q  108 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  11515556 caacaacaattcaattatcatcaaatccatatactcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaacaactaagtg-aaaataatcacttattcaa 11515458  T
Q  208 ttaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11515457 ataagcacttatgcatagaattagggaagaaaata-aactaagaaattatgaatgaaatctaaccccctgacctcaataagcaata 11515373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11882314 - 11882115
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||    
T  11882314 ttttcacatactatgaacattcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcatgaaattcaa 11882215  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |   |||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  11882214 catctaagaac-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttac-actaaatgattatga-tgaattctaaccccctta 11882118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 218
Target Start/End: Original strand, 15517787 - 15517921
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |    
T  15517787 acataccatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacattt 15517886  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcactta 218  Q
    | || | || |||||||||| | |||||||||||||    
T  15517887 atgaac-aattaatcacttactcaattaagcactta 15517921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 280
Target Start/End: Original strand, 11402753 - 11402943
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||  ||    
T  11402753 atgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcactataatatgagcacgaatttcaacaattaagttca 11402852  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
     |||||||||||||| || |||||||||  ||||| || ||| ||| || |  ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11402853 caataatcacttattcaaataagcacttgtgcatagaactagagaagaaatgaaactaagagattatgaatgaaatctaacccacttacct 11402943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 300
Target Start/End: Original strand, 17393597 - 17393808
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||| || |  ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  17393597 atgaacatgcaatttcatcgtcaataattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttca 17393696  T
Q  190 aaataatcacttat-ttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17393697 taataatcacttatctcaattaagcaattatgcatagaattagggaagaagctacaact-agagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataag 17393795  T
Q  288 caataattctagc 300  Q
    ||||||| |||||    
T  17393796 caataatcctagc 17393808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6228727 - 6228625
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  6228727 atatcattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaa 6228628  T
Q  172 ttt 174  Q
    |||    
T  6228627 ttt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 12953116 - 12953317
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||    
T  12953116 tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaac 12953215  T
Q  179 aactaa-gagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||   || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  12953216 aactaatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacagtaattgaaaaattacactaaattgattatgattgaattctaatcccctta 12953314  T
Q  278 cct 280  Q
    |||    
T  12953315 cct 12953317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 398
Target Start/End: Original strand, 50313564 - 50313686
Alignment:
Q  277 acctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttc 375  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50313564 acctcaattagcaaataatcctagccaaaacttcaatttagctcctggaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaaccattttc 50313663  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  50313664 ctcttctcttgcactttctctct 50313686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37915356 - 37915069
Alignment:
Q  111 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 209  Q
    |||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |  ||| |||||| | || |    
T  37915356 caacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagt-cacagcaataacttatctcaaat 37915258  T
Q  210 aagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 308  Q
    || ||| || ||||| || ||||||| ||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||    
T  37915257 aaacacctatgcatagaaatagggaagaaggtacaacttagagattatgattgacatctaacccccttacctcaataaacaataatcatagcaaaaactt 37915158  T
Q  309 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  37915157 caatttagctcctagaataactatcacctctt-gttcttcaagc-cttctcccttctaaccctttttctcattctcttgaactttttctct 37915069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9590849 - 9590702
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||   |||||||| |||| |||    
T  9590849 tttcacatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaac 9590750  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    ||||| || | || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9590749 aactatgaac-aattaaccacttattcaattaagcacttaatcatacaa 9590702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4145915 - 4145787
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||   ||| |||||    
T  4145915 atatcattttcacatactatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaa 4145817  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcactta 202  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4145816 tttcaacaactatgaac-aaataatcactta 4145787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6225027 - 6224863
Alignment:
Q  233 gaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctat 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  6225027 gaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttagttagcaaaaatcctaacacaagcttcaatttagctcctagaatctccac 6224928  T
Q  333 cacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  6224927 cacctcttaggtcttcaag-actcctttcttctaacccttttcctcttctctcgcactttctctct 6224863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Original strand, 17191693 - 17191970
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  17191693 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatc 17191792  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | ||| || | || |||||| ||| | ||||||||| ||   |||||||  |  |||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  17191793 atctatgaac-aattaatcatttactcaattaagcaattgttcatacaacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttac 17191891  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctttt 356  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||||    
T  17191892 cttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctttt 17191970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 395
Target Start/End: Original strand, 18970084 - 18970390
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||| || |  |||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  ||    
T  18970084 atgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 18970183  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc 288  Q
     |||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||  || |||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||    
T  18970184 taataatcacttattcaaataatcacttatgcatagaaaaagagaaaagaaactaactaagtggttatgattgaaatctaacccccttaccttagttagc 18970283  T
Q  289 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttga 387  Q
    |  ||| |||||  || | |||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||| || ||||||||||||||||     
T  18970284 acaaatcctagcccaaacatcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaaccctttttcctcttctcttgc 18970382  T
Q  388 actttctc 395  Q
    ||||||||    
T  18970383 actttctc 18970390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3576521 - 3576215
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||  || | |    
T  3576521 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaac-a 3576423  T
Q  191 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa 290  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||  | |||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||     
T  3576422 attaatcatttactcaattaagcacttattcgtacaacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcac 3576323  T
Q  291 taatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaa 388  Q
     |||| |||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||  ||  |||||  | |||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||||  |    
T  3576322 aaattcctagcccaagcttcactttacctcctaggatctcttccaattcttgaatattcaagctcttcttc--tctaaccctttttcctcttctcttaca 3576225  T
Q  389 ctttctctct 398  Q
    ||||||||||    
T  3576224 ctttctctct 3576215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 354
Target Start/End: Original strand, 17204833 - 17205108
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  17204833 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatc 17204932  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | ||| || | || |||||| ||| | ||||||||||||   | ||| |  |  |||||||||||   || |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  17204933 atctatgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttgttcgtaccacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatggaattctaacccccttac 17205031  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| || |||| ||  |||||  |||||||||||    
T  17205032 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatttctaccaattcttgaatcttcaagctt 17205108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 159
Target Start/End: Original strand, 34560052 - 34560131
Alignment:
Q  80 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  34560052 ttcacatattttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattataa 34560131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47784861 - 47784758
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  47784861 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataac 47784762  T
Q  179 aact 182  Q
    ||||    
T  47784761 aact 47784758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 280
Target Start/End: Original strand, 48421740 - 48421928
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||  | |  |  ||    
T  48421740 atgaacatgcaatttcatcaccaacaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttca 48421839  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  48421840 caataatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaactctcttacct 48421928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 39656678 - 39656825
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||   ||||||| |||| |||    
T  39656678 tttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaac 39656777  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  39656778 aattatgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 39656825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 124
Target Start/End: Original strand, 11638508 - 11638554
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11638508 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta 11638554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 30207368 - 30207462
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  30207368 tttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 30207462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Original strand, 14080665 - 14080761
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    |||||||||||| ||||    
T  14080665 acatactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaaca 14080761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 17139659 - 17139754
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  17139659 ttttctcatagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 17139754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17586797 - 17586711
Alignment:
Q  307 ttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17586797 ttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttagatcttcaag-tctcctctcttctaaccattttcatcttctcttgaactttct 17586711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 137
Target Start/End: Original strand, 1990947 - 1991012
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat 137  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1990947 atatcattttcatctactatgaacatgcaatttcacaaacaataattcaattattaccaatttcat 1991012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 55440950 - 55440846
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||   || |||||  | |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  55440950 atatcattttctcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaa 55440851  T
Q  172 tttca 176  Q
    |||||    
T  55440850 tttca 55440846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14059309 - 14059214
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  14059309 ttttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 14059214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Original strand, 15550761 - 15550848
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  15550761 atgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaa 15550848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 280
Target Start/End: Original strand, 34560133 - 34560219
Alignment:
Q  193 taatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  34560133 taatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgatcatgattgaattctaacccccttacct 34560219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 16880275 - 16880369
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  16880275 tttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaatt 16880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12488821 - 12488762
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatg 138  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12488821 tttctcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatg 12488762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 15876220 - 15876317
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    |||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||| | | |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15876220 tttctcatacttggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttca 15876317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17960415 - 17960314
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  |  ||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  17960415 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcacccacaaaaaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacgaa 17960316  T
Q  172 tt 173  Q
    ||    
T  17960315 tt 17960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 51961122 - 51961033
Alignment:
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  51961122 aaataatcacttatttcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaagactaacccccttacct 51961033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11329056 - 11329010
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat 125  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11329056 tttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattat 11329010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12560331 - 12560133
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||  || |||| | | |||| |||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  12560331 tttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaac 12560232  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||| |||| | |||||| |||||    
T  12560231 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaa-taaatgattatga-tgaattttaacccccttac 12560135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14177102 - 14177065
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 127  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14177102 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatca 14177065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 72 - 397
Target Start/End: Original strand, 9636890 - 9637214
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9636890 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacaaa 9636989  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  9636990 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatc 9637089  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  9637090 cccttacctcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttctaaccct 9637189  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctc 397  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  9637190 ttt-atcttctcttgaactttctctc 9637214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 24277906 - 24278231
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24277906 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 24278005  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24278006 tttca-caactaagagaaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 24278104  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24278105 cccttaccttaattagaaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccct 24278204  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24278205 tttcctcttctcttaaactttctctct 24278231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16292897 - 16292577
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16292897 ttttcgcatactatgaacatgcaatttcaccaacaacagttcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaatagcacaaatttcaa 16292798  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16292797 caactaagagcaaaataatcacttacttaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaaccccctta 16292698  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  16292697 cctcaattagcaaataatcctagccaaaacttcaatttagctcctagaatctctaacacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-c 16292599  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16292598 tcttctcttgaactttctctct 16292577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 129 - 398
Target Start/End: Original strand, 6094888 - 6095156
Alignment:
Q  129 caatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6094888 caatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaat 6094987  T
Q  229 tagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6094988 tagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaaatttcaatttagctcgtagaatct 6095087  T
Q  329 ctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6095088 ctatcacctcttggttcctcaagc-tttctcccttctaacccttttcctcttctcttaaactttctctct 6095156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 25595171 - 25595491
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25595171 ttttcacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcatttatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcccaaatttcaa 25595270  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa-ccctct 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25595271 caactaagtgcaaaataatcacttagtcacataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaacccccct 25595369  T
Q  276 tacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  25595370 tacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaag-ttttctcccttctaacctttttg 25595468  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  25595469 cccttctcttgaactttctctct 25595491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 18536907 - 18537227
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18536907 ttttcacatattatgaacatgcaatttcatctacagcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcga 18537006  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    ||| |||| | |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18537007 caattaagtgaaaaataatcactcattcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaaccccctt 18537105  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||  |    
T  18537106 acctcaataagcaataatcctagcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaaac-tttctcccttctaaccctttagc 18537204  T
Q  377 t-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  18537205 tccttctcttgaactttctctct 18537227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 397
Target Start/End: Original strand, 9637227 - 9637443
Alignment:
Q  180 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
T  9637227 actaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatccccttacc 9637326  T
Q  280 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctct 379  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  9637327 tcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttctaaccctttt-atct 9637425  T
Q  380 tctcttgaactttctctc 397  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9637426 tctcttgaactttctctc 9637443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 397
Target Start/End: Original strand, 9637456 - 9637672
Alignment:
Q  180 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
T  9637456 actaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatccccttacc 9637555  T
Q  280 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctct 379  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  9637556 tcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttctaaccctttt-atct 9637654  T
Q  380 tctcttgaactttctctc 397  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9637655 tctcttgaactttctctc 9637672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 180 - 397
Target Start/End: Original strand, 9637685 - 9637901
Alignment:
Q  180 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
T  9637685 actaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatccccttacc 9637784  T
Q  280 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctct 379  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  9637785 tcaattagcaattatcctagcaaaagtttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttataacc-tttttctct 9637883  T
Q  380 tctcttgaactttctctc 397  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9637884 tctcttgaactttctctc 9637901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 359
Target Start/End: Original strand, 20279574 - 20279845
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||  ||    
T  20279574 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatacccaaacatatctctataacatgagcacgaatttcaacgattaagttca 20279673  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  20279674 ccataatcacttatttcaattaagcacttttacatacaattagggaagaagctacaactaaaagattatgaatgaaatctaatccccttacctcaataag 20279773  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20279774 caataatcctagcaaaagcttcaattaagctccgagaatctctatctccccttggttcttcaagcttctctc 20279845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 398
Target Start/End: Original strand, 29114651 - 29114841
Alignment:
Q  209 taagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagct 307  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29114651 taagcacttatgcatataattagagaaaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagct 29114750  T
Q  308 tcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  29114751 tcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttcttccttctaacccttttgctcattctcttaaactttctctct 29114841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Original strand, 19660031 - 19660281
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  19660031 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaa 19660130  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    || |||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  19660131 catctaagaac-aaataatcacttattccattaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaagtgattatga-tgaattctaaccc-ctta 19660227  T
Q  278 cctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctct 330  Q
    ||| ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  19660228 ccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctct 19660281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 19666684 - 19666887
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||   |||||| |||||| |||||||    
T  19666684 acatactttgaacatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaact 19666783  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    | || | || |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |    
T  19666784 atgaac-aattaatcacttattcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta 19666880  T
Q  283 ataagca 289  Q
    || ||||    
T  19666881 attagca 19666887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24087478 - 24087335
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  |    
T  24087478 acataccatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgctcaaacatatcatcataattagagcccgaattttaacattt 24087379  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    | ||   || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  24087378 atga-ataattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaa 24087335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 183
Target Start/End: Original strand, 24884838 - 24884942
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||    
T  24884838 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaac 24884937  T
Q  179 aacta 183  Q
    |||||    
T  24884938 aacta 24884942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23821705 - 23821536
Alignment:
Q  108 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||| | ||    
T  23821705 caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcacttactcaa 23821607  T
Q  208 ttaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  23821606 ttaagcacttaagcatgcaataattgaaaaattac-actaaatgattat-aatgaaatctaacccccttacct 23821536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23830784 - 23830615
Alignment:
Q  108 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||| | ||    
T  23830784 caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcacttactcaa 23830686  T
Q  208 ttaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  23830685 ttaagcacttaagcatgcaataattgaaaaattac-actaaatgattat-aatgaaatctaacccccttacct 23830615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 227
Target Start/End: Original strand, 722536 - 722690
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||   |||||||||    
T  722536 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatatcataattggagcacgaa 722635  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    ||| ||||| || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  722636 ttttaacaattatgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 722690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 68144 - 68238
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  68144 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 398
Target Start/End: Original strand, 24884944 - 24885108
Alignment:
Q  233 gaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaa-aagcttcaatttagctcatagaatctcta 331  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||||  | | |||||   || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  24884944 gaaaaattaca-ctaaatgattatgattgaattataacccccttaccttagtaagcacaattcctagccccaaacttcaatttagctcctaggatctcta 24885042  T
Q  332 tcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
     ||  |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24885043 ccagttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 24885108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45573452 - 45573312
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45573452 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45573353  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45573352 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45573312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45577119 - 45576979
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45577119 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45577020  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45577019 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45576979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45580786 - 45580646
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45580786 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45580687  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45580686 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45580646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45584453 - 45584313
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45584453 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45584354  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45584353 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45584313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45588120 - 45587980
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45588120 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45588021  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45588020 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45587980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45591787 - 45591647
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45591787 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45591688  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45591687 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45591647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45595454 - 45595314
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45595454 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45595355  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45595354 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45595314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45599121 - 45598981
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45599121 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45599022  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45599021 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45598981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45602788 - 45602648
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45602788 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45602689  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45602688 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45602648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45606455 - 45606315
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45606455 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45606356  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45606355 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45606315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45610122 - 45609982
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45610122 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45610023  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45610022 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45609982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45613789 - 45613649
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45613789 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45613690  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45613689 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45613649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45617456 - 45617316
Alignment:
Q  143 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 241  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
T  45617456 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45617357  T
Q  242 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45617356 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45617316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 182
Target Start/End: Original strand, 43646045 - 43646148
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||    
T  43646045 tttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataac 43646144  T
Q  179 aact 182  Q
    ||||    
T  43646145 aact 43646148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19669201 - 19669013
Alignment:
Q  82 cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaac 181  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||   |||||| | |||| |||| |    
T  19669201 cacatacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatc 19669102  T
Q  182 taagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccc 272  Q
    || || | || |||||| ||||  |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||||   || ||||||||| |||| ||||||||    
T  19669101 tatgaac-aattaatcatttatccaattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattctaaccc 19669013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 398
Target Start/End: Original strand, 11010095 - 11010170
Alignment:
Q  323 gaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||    
T  11010095 gaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaaatttctctct 11010170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22775300 - 22775206
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  22775300 tttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22780678 - 22780584
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  22780678 tttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3349 - 3248
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |  |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  3349 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaa 3250  T
Q  172 tt 173  Q
    ||    
T  3249 tt 3248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31146276 - 31146196
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  31146276 tttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataa 31146196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24294625 - 24294562
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 135  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24294625 atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttc 24294562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24571394 - 24571290
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  ||| |||||| | |||||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  24571394 atatcattttctcataccttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaa 24571295  T
Q  172 tttca 176  Q
    |||||    
T  24571294 tttca 24571290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 106
Target Start/End: Original strand, 6094861 - 6094895
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttca 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094861 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 6094895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 7321683 - 7321767
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  7321683 aacatgaaatttcatcataaaaaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaa 7321767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 67999 - 67674
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67999 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcacgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 67900  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  67899 tttcaacaactaagagcaaagtaatcacttattcaattaatcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaattggttatgtttgaaatctaacc 67800  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  67799 cccttacctcaattagcaaaaatcctagcaaaagcttcaatttagcacctagaatatctatcacctcttgcgtcttcaagcttttctcccttctaaccct 67700  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||    
T  67699 tat-ctctactcttgaactttctctct 67674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 8635 - 8960
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8635 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcacaacaagagcacgaa 8734  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8735 tttcaataactaagaacaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaattaaggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 8834  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8835 cccttacctcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaattgagctcctataatctctatcacttcttaagtcttcaagcttctctcccttctaaccct 8934  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  8935 ttt-atcttctcttgaactttctctct 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 37709 - 38028
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37709 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaa 37808  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  37809 caact-agagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaactctaacctcctta 37907  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37908 cctcaattagcaaataatcctagctaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagttttcaagcttttctcccttctaaccatttt-c 38006  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38007 tcttctcttgaactttctctct 38028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 655
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  976 ttttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatttactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 877  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  876 caactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgtatagaattggggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccccctt 777  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  776 acctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatctcctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 678  T
Q  377 t-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  677 tccttctcttgaactttctctct 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 27642 - 27967
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27642 atatcattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaa 27741  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27742 tttcaacaactatgagcaaaataatcatttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 27841  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  27842 cccttaccttaattagcaataatcctagccaaagctgcaatttagatcctagaatctctatcacctcttgggtctttaagtttttctcccttctaaccct 27941  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27942 ttt-ctcttcccttgaactttctctct 27967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 78 - 396
Target Start/End: Original strand, 86508 - 86825
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  86508 ttttcacatactatgaacatccaatttcaccaacaaaaattcaattatcacaaatttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacggatttcaa 86607  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  86608 caactaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgcaattaggg-aaaattacaactaattgattatgattgaaatctaaccccctta 86706  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct 377  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  86707 ccttaattagcaataatcctaacaaaagtttcaatttagctcctagattctctatcacatcttggatcttcaaacttttctcccttttaaccatttttct 86806  T
Q  378 cttctcttgaactttctct 396  Q
    |||||||||||||||||||    
T  86807 cttctcttgaactttctct 86825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 25491 - 25820
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25491 atatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 25590  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatt-agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  25591 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaac 25690  T
Q  271 cctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacc 369  Q
     | ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25691 tcccttacctcaattagcaactaatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaacc 25790  T
Q  370 attttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25791 cttttgctccttctcttgaactttctctct 25820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 131960 - 132284
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131960 atatcattttcacatactacgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 132059  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  132060 ttttaacaact-agag-aaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 132157  T
Q  272 ctcttacctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacca 370  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  132158 cccttacctcaattagcaaataatcatagccaacgcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaacc- 132256  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  132257 tttttctcttctcttgaactttctctct 132284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 68053 - 67732
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68053 ttttcacatattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcaccaaattcatgtacttaaacatatcatcataacaagaacacgaatttcaa 67954  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa-ccctct 275  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  67953 caattaattgcaaaataatcactcattcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaacccccct 67855  T
Q  276 tacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||     
T  67854 tacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaaactttttg 67756  T
Q  376 ct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  67755 ctccttcttttgaactttctctct 67732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 103017 - 102870
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||  |||    
T  103017 tttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaac 102918  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  102917 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa 102870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Original strand, 109742 - 109821
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcata 158  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  109742 tttctcatactttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcata 109821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 22150 - 22469
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22150 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactcaaacataacatcatagcaagagcacgaatttcaa 22249  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22250 caactatgagaaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatg-aaaattacaactaattgactatgattgaaatctaaccccctta 22348  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22349 cctcaattagcaaataatcctagccaaagcttcaatttatcttctaggatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-c 22447  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22448 tcttctcttgaactttctctct 22469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 72 - 395
Target Start/End: Original strand, 30109 - 30433
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30109 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcacctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaa 30208  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatta--gggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa 269  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  30209 ttttaactact-agagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaataaaaaaaattacaacaaattgattatgattgaactctaa 30307  T
Q  270 ccctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaac 368  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30308 cccccttacctcaattagcaactaatcctagtcaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaac 30407  T
Q  369 cattttcctcttctcttgaactttctc 395  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  30408 cctttt-ctcttgtcttgaactttctc 30433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2547
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2868 ttttcacatattatgaaaatgcaattttatcaacaacgattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaa 2769  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  2768 caactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcagttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatataacccccgt 2669  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  2668 acctcaacaagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctataatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgc 2570  T
Q  377 tc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  2569 tcattctcttgaactttctctct 2547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 14187 - 14506
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14187 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattttaa 14286  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14287 caact-agagcaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaagaattataactaattgattatgattgaactctaaccccctta 14385  T
Q  278 cctcaataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  14386 cctcaattagcaaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcaactcttgagccttcaagcttttctcccttctaactctttt-c 14484  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  14485 tcttctcatgaactttctctct 14506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1064 - 740
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  1064 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaa 965  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  964 ttttaacaactatgaacaaa-taatcacttatttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacc 866  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccat 371  Q
    | ||||||| | | || || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |    
T  865 cccttaccttagttagaaaaaatcctagcccaagcttcaatttagctcatagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaaccct 767  T
Q  372 tttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  766 tttcctattctcttgcactttctctct 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33509 - 33189
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33509 ttttctcatattatgaacattcaatttcatctacatcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 33410  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctt 276  Q
     || ||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  33409 aaattaagtacaaaataatcactcattcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaaccccctt 33311  T
Q  277 acctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  33310 acctcaataagaaataatcctagcaaaagcttcaatttagttcctagaatctatatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgt 33212  T
Q  377 tc-ttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  33211 tcattctcttgaactttctctct 33189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 78 - 398
Target Start/End: Original strand, 108160 - 108479
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  108160 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaa 108259  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctctta 277  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  108260 catgtaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccccctta 108359  T
Q  278 cctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcc 376  Q
    ||| | | ||||| |||  ||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| || || ||||  ||| ||||| ||||||    
T  108360 ccttagttagcaaaaatcgtagcccaagcgtcaatttatctcctagaatcactaccacctcttaggtcttccagtctcttct--cttttaacccttttcc 108457  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  108458 tcttctcttgcactttctctct 108479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 348
Target Start/End: Original strand, 3396 - 3672
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3396 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagcgcacgaa 3495  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3496 tttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatgaaattagggaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaacc 3595  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 348  Q
    | ||| ||| ||| |||   ||| |||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | | || ||||| |||||||    
T  3596 cccttgccttaattagctcaaatcctagcccaagcttcactttaactcctagaatcaccaccaactcttaggtcttc 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20016 - 19710
Alignment:
Q  93 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaa 192  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  20016 aacatgcaatttccacatcaacaattcaattatcatcaatttcacatacccaaacataacactaaaacatgagcacgaatttcaacaattaagttcacaa 19917  T
Q  193 taatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa 290  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19916 taatcacttatctcaaataaacacttatgcatagaattagggaagaaattaga-ctaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaa 19818  T
Q  291 taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaac 389  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  19817 aaatcctagcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctattacctcttggtttttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaac 19719  T
Q  390 tttctctct 398  Q
    |||||||||    
T  19718 tttctctct 19710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Original strand, 12929 - 13239
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | ||||||||| | ||||| ||| |||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  12929 atgaacatgcaatttcatcattagcaattcaagtatgaacaatttcatatcctcaatcatgtcactaaaactagagcacgaatttcaacaaataagctca 13028  T
Q  190 aaataatcacttatttaat-taagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     |||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||  |||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13029 caataatcacttatccaaaataatcacttatgcatgaaattagggtagaagctacaactaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataag 13128  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttga 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13129 caataatcctagcaaaagcttcacttaagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagcttttctcccttctaacccttttcctcttctcttga 13228  T
Q  388 actttctctct 398  Q
    ||| |||||||    
T  13229 actctctctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12829 - 12551
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 177  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  12829 ttttaacatattatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatgaataatttcatatcctcaaacatatcactaaaactagagcacgaatttcaa 12730  T
Q  178 caactaagagcaaaataatcacttatttaa-ttaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctct 275  Q
    ||| ||||  || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12729 caaataagctcacaataatcacttatccaaattaaggacttatgcaaagaattagagaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccccct 12630  T
Q  276 tacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  12629 tacctcaataagcaataatcctaacaaaagcttccatttagcccttagaatctctagctcctcttggttcttcaagctt 12551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 4750 - 5073
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  | | ||||||    
T  4750 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaa 4849  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4850 tttcaacaactatga--acaataatcagttattcaactaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccactaaatgattatgattgaattctaacc 4947  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaacca 370  Q
    | ||||||| ||| ||||  ||| |||||  |||||||||||||| || ||||||| | | |||||| | ||||||||||  |  |||| ||||||||      
T  4948 cccttaccttaattagcacaaatcctagcccaagcttcaatttagatcctagaatcaccaccacctcataggtcttcaag--tcgctcctcttctaacgc 5045  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5046 ttttcctcttctcttgcactttcactct 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 398
Target Start/End: Original strand, 6689 - 7013
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||    
T  6689 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaattccatgtatttaaacatatcaccataattagaacacaaa 6788  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    ||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || || |||||||    
T  6789 tttcatcaactatgaac-aaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacacctaattggttatggttaaattctaacc 6887  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaacca 370  Q
    | ||||||| | | ||||| |||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||     
T  6888 cccttaccttagttagcaaaaatcatagcccaagcttcaatttagctcctagaatcatcaccaccgcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaaccc 6985  T
Q  371 ttttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  6986 ttgtcctcttctcttgcactttctctct 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 113 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27051 - 26769
Alignment:
Q  113 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||  | || |||| |||||||||||| |||||||    
T  27051 acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattatagcacgattttcaacaatgatgaacaaa-taatcacttattcaattaag 26953  T
Q  213 cacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaat 312  Q
    ||||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  26952 cacttaa-catggaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagcacaagcttcaat 26854  T
Q  313 ttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26853 ttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 26769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 398
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5880
Alignment:
Q  110 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||  | || | ||||||||||||||| ||||    
T  5595 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaaaaatgatgaac-aaataatcacttattcaatt 5693  T
Q  210 aagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttc 309  Q
    |||||||||| |||  |||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||  |||||||    
T  5694 aagcacttaa-catggaattaataaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagcccaagcttc 5792  T
Q  310 aatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5793 aatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 5880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23774 - 23500
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  23774 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatatcaccataattaaagcacgaa 23675  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacc 271  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  23674 tttcaacaactatgaac-aaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaa-tcattatgattgaattctaacc 23577  T
Q  272 ctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 348  Q
    | |||| || ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  23576 cccttatcttaattagcaaaaatcctagcccaagcttcactttagctcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 23500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43881 - 43619
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||||| || | |    
T  43881 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactatgaac-a 43783  T
Q  191 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa 290  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||     
T  43782 attaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcac 43684  T
Q  291 taatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
     |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||   |||||||||||    
T  43683 aaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttaaatcttcaagctt 43619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23498 - 23461
Alignment:
Q  361 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23498 cttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 23461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7162 - 6854
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| || |  ||| ||| ||||| |  | ||| |||| ||||||||||||||  |||  ||    
T  7162 atgaacatgcaaattcatcatcaacaattcaattatcaacaagttaacatacccaatcatataactaaaactagagaacgaatttcaacaagcaagttca 7063  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     | ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  7062 ta-taatcacttatctcaaataagcacttaagcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatataacccctttacctcaataag 6965  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttg 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  6964 caataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctaggatctctatcaccttttggttcttcaagc-tttatcccttctaacccttttgctctttctcttg 6866  T
Q  387 aactttctctct 398  Q
    ||||||||||||    
T  6865 aactttctctct 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 35630 - 35950
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||| |   |||||||||||  ||     
T  35630 tttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataag 35729  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||  || | || |||||  ||| | |||||||||| ||  |||||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35730 aactttgaac-aattaatcttttactcaattaagcacctattcatacaacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 35828  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||  |||||  |||||||||| |||| |  ||||| || ||||||    
T  35829 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccctttttcc 35928  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||| |  |||||||||||    
T  35929 tcttctccttcactttctctct 35950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2866 - 2561
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||    
T  2866 catgtaatttcatcatcaacaacttgattatcaacaaattcatatacacaaacatcacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaattcaaaata 2767  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2766 atcacttatttcaattaagcacttatgcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattatgattgaaatctaacccacttacctcaataagcaata 2667  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccatttt-cctcttctcttgaactt 391  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||    
T  2666 attctagcaaaaactttaatttagctcctagaatctctatcccgtcttggttcttcaaactttt-tcccttctaacccttttgcaacttgtcttgaactt 2568  T
Q  392 tctctct 398  Q
    |||||||    
T  2567 tctctct 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 197348 - 197031
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  197348 tttcacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaac 197249  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | |||||| | || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  197248 atctaagaac-aattaatcacttatccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 197151  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcc 376  Q
    || ||| ||||  | | |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  197150 cttaattagcacaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcc 197053  T
Q  377 tcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  197052 tcttctcttgcactttctctct 197031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 31172 - 31490
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  31172 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaac 31271  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31272 aactatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 31369  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccatt-ttc 375  Q
    || ||| ||||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| || ||||  |  |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| || |||    
T  31370 cttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctagtatttctacaaattcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaacccttgttc 31467  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  31468 ctcttcccttgcactttctctct 31490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44206 - 43898
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | || |  ||    
T  44206 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttca 44107  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatac--aattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataa 286  Q
     |||||||||||||| || ||| |||||| |||||   ||  || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  44106 caataatcacttattcaaataatcacttatgcatagcaaaagagagaagaaatta--actaagtgattatgattgaaatctaaccccgttacctcaatta 44009  T
Q  287 gcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttg 386  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44008 gcaataatcctagcaaaaacctcaatttaactcctaaaatctctatcacctcttgagtcttcaagctttt-tcccttctgacccttttccttttctcttg 43910  T
Q  387 aactttctctct 398  Q
    ||||||||||||    
T  43909 aactttctctct 43898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 359
Target Start/End: Original strand, 55144 - 55409
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||||  |||||||  |||  ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  55144 catgcaatttctacatcaacaattcagttatcatgaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcaaaata 55243  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55244 atcacttatctcaaataagcacttatgcataaaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaata 55342  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    || |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  55343 atcctagaaaaatcttcaattaagctcctagaatctccagctcctcttggttcttcaagcttttctc 55409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 359
Target Start/End: Original strand, 2851 - 3116
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||| ||  ||||  |||  ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  2851 catgcaatttctacatcaacaattcagttatcatcagattcacataccgaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcacaata 2950  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||| ||| |   ||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2951 atcacttatctcaaataagcacttatgcatagaattagcgaagacgctacaactaaat-attacgtttgaaatctaacccccttacctcaataaacaata 3049  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | | |||||| | ||||||||||||||||    
T  3050 atcctagcataagcttcaattaagctcctaaaatctccagctcctcttcgttcttcaagcttttctc 3116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 69609 - 69928
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  69609 tttcacatactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 69708  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  69709 aactatgaac-aattaatcactttctcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttat 69806  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaacc--atttt 374  Q
    || ||| ||||  |||| |||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||   ||||    
T  69807 cttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttt 69904  T
Q  375 cctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||| |||||| |||||||||||    
T  69905 cctctactcttgcactttctctct 69928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 244697 - 244578
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  244697 tacaactaagagattatgattgaaatctagttcccttacctaaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 244598  T
Q  340 tgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    | | ||||||||||| ||||    
T  244597 tagttcttcaagcttctctc 244578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 244782 - 244709
Alignment:
Q  240 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatt 313  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  244782 tacaactaatagattatgattgaaatctagtccccttaccacaataagcaattatcctagcaaaagtttcaatt 244709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 244918 - 244827
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatc-atcataacaagagcacgaatttcaacaa 180  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||||||||||| ||| || |  ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  244918 atgaacatacaatttcatcatccataattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatctataaaaacaagagcacgaatttcaacaa 244827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Original strand, 2677 - 2995
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  2677 tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 2776  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||||| | |||||| ||  ||| | |||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2777 aactatgaac-aattaatcacttactgaattaatcatctaatcttacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccgcttac 2874  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttc 375  Q
    || | | ||||| |||| |||||  || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||    
T  2875 cttagttagcaaaaattcctagctcaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttc 2972  T
Q  376 ctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  2973 ctcttctcttgctctttctctct 2995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12416
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| || |  ||| ||| |||||||  | ||| ||||||| |||||||||||  |||  ||    
T  12687 atgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattatcaacaagttaacatacccaatcatatcactaaaactagagcacaaatttcaacaagcaagttca 12588  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||||||||||| | || || ||||||| ||||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12587 taataatcacttatctcaaatatgcacttatgcatagaattaggaaagaagctacaactaagagattatgattgaaatctaaccccattacctcaataag 12488  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  12487 caataatcctagcaaaagcttcaattaagctcctagaatctctagctcctcttggttctccaagcttttctc 12416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 329
Target Start/End: Original strand, 113963 - 114116
Alignment:
Q  176 aacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctc 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  113963 aacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattaaggaaaagattataactaagtgattatgattgaaatctaacccg- 114061  T
Q  275 ttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctc 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  114062 ttacctcaataagcaatatttctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctc 114116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 159445 - 159549
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||||   || |||||  | |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  159445 atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaa 159544  T
Q  172 tttca 176  Q
    |||||    
T  159545 tttca 159549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3828 - 3645
Alignment:
Q  191 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca 289  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  3828 aataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccctttacctcaattagca 3729  T
Q  290 ataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccatttt 374  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3728 ataatcctaacaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaaccctttt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 280
Target Start/End: Original strand, 53499 - 53697
Alignment:
Q  80 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||  ||||    
T  53499 ttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaaca 53598  T
Q  180 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 279  Q
    |||| || | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53599 actatgaac-aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttacc 53696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 227
Target Start/End: Original strand, 85678 - 85831
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  85678 atatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgca-ttaaacatatcatcataattagagcacgaa 85776  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  85777 tttcaacaactatgaac-aattaatcacttattcaattaagcatttaaacatacaa 85831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Original strand, 85836 - 85980
Alignment:
Q  250 tgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttca 349  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||  |||| || |   |||||||| ||||||||    
T  85836 tgattatgattgaattcaaacccccttaccttaattagcacaaattctaacccaagcttcactttagcttctagactcac---cacctcttaggtcttca 85932  T
Q  350 agcttttctcc-cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  85933 ag--tctctcatcttctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 85980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34537 - 34273
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  34537 catgcaatttccacatcaacagttcagttatcatcaatttcacatactcaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcacaata 34438  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 292  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34437 atcacttatctcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaata 34339  T
Q  293 attctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||| || || || || |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  34338 atcctagcaaaagctccaataaagctccta-aaactttagcttctcttggttcttcaagcttttctc 34273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 97293 - 96976
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  97293 tttcacatactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaac 97194  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    ||||| || | || |||||||| | | |||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  97193 aactatgaac-aattaatcactcactcaattaaacactaaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttac 97096  T
Q  279 ctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcct 377  Q
    ||  || ||||  | | |||||  |||||||| |||| ||| ||  ||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||| ||| | | || |||||||    
T  97095 cttcattagcacaattcctagcccaagcttcactttacctcctacgatctctaccatttcttgaatcttcaagcttcttct-cctccaaccctttttcct 96997  T
Q  378 cttctcttgaactttctctct 398  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  96996 cttctcttgcacttcctctct 96976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 398
Target Start/End: Original strand, 11303 - 11449
Alignment:
Q  251 gattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaa 350  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11303 gattatgaatgaaaactagccc-cttacctcaataagcaataatcttagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcctcaa 11401  T
Q  351 gcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  11402 gc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 11449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 190 - 398
Target Start/End: Original strand, 2287 - 2494
Alignment:
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||    
T  2287 aaataatcatttattcaatgaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttaccttagttagca 2386  T
Q  290 ataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaac 389  Q
    | ||| |||||  |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  2387 aaaatcctagcccaagcttcaatttagttcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaaccctttttctcttctcttgcac 2485  T
Q  390 tttctctct 398  Q
    |||||||||    
T  2486 tttctctct 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 116259 - 115989
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| || |  |||  || |||||||  | ||| ||||||||||||||||| |  |||  ||    
T  116259 atgaacatgcaattttaccatcagcaattcaattatcaacaagttaacatacctaatcatatcactaaaactagagcacgaatttcaactagcaagttca 116160  T
Q  190 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag 287  Q
     ||||||||||||| | || ||| |||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  116159 taataatcacttatctcaaataatcacttatgcatagaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaacccctttacctcaataag 116061  T
Q  288 caataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 359  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||    
T  116060 caataaccctagcaaaagcttcaattatgctcctagaatctctagctcctcttgattcctcaagcttttctc 115989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 104714 - 104480
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||   |||||| |||||| |||| ||    
T  104714 acatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatct 104615  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 282  Q
    | || | || |||||||||| | ||||||||| |||  |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |    
T  104614 atgaac-aattaatcacttactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaacccacttacctta 104518  T
Q  283 ataagcaataattc-tagcaaaagcttcaatttagctc 319  Q
    || ||||  ||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  104517 attagcacaaattcttagcccaagcttcactttagctc 104480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 93869 - 93772
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttc 175  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||  || |||||| |  || ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  93869 ttttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttc 93772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 76942 - 76693
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |    
T  76942 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatc 76843  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    | ||| || | || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  76842 atctatgaac-aattactcaattactcaattaagtacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 76744  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatct 328  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  76743 cttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatct 76693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 398
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6340
Alignment:
Q  259 ttgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttct 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |     
T  6200 ttgaaatctaaccctgttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaattaagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagttttccc 6299  T
Q  359 cccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    || |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
T  6300 cctttctaacccttttgctccttctcttgaactctctctct 6340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 203
Target Start/End: Original strand, 6046 - 6159
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||  |||  ||    
T  6046 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaacaagcaagttca 6145  T
Q  190 aaataatcacttat 203  Q
     |||||||||||||    
T  6146 taataatcacttat 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1244
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1450 atatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaa 1351  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaa-gtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    ||| |||| ||| || | || |||||| ||||  |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||    
T  1350 ttttaacatctatgaac-aattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattac-actaatatgattatga-tgaattctaac 1254  T
Q  271 cctcttacct 280  Q
    || |||||||    
T  1253 ccccttacct 1244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9705 - 9499
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  9705 atatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaa 9606  T
Q  172 tttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaa-gtgattatgattgaaatctaac 270  Q
    ||| |||| ||| || | || |||||| ||||  |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||    
T  9605 ttttaacatctatgaac-aattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattac-actaatatgattatga-tgaattctaac 9509  T
Q  271 cctcttacct 280  Q
    || |||||||    
T  9508 ccccttacct 9499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 280
Target Start/End: Original strand, 8166 - 8361
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||    
T  8166 acatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatct 8265  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    | || | || |||||| ||||  |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||||   || ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  8266 atgaac-aattaatcatttatccaattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacattaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 8361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7120 - 6845
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||    
T  7120 tttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgac 7021  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    || || || ||| | ||||| ||| | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  7020 aattatgaacaaca-aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttac 6922  T
Q  279 ctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
    || ||| | ||  |||| |||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||    
T  6921 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctt 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22505 - 22243
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| || | |    
T  22505 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaac-a 22407  T
Q  191 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca- 289  Q
    | || |||||||||  |||||||| |||   ||||||  |  || ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||     
T  22406 attattcacttattctattaagcatttattaatacaacaaatgagaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcag 22308  T
Q  290 ataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 354  Q
     |||| |||||  || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||    
T  22307 ttaatcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctt 22243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Original strand, 7547 - 7634
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7547 atatcattttcacatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataa 7634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Original strand, 16972 - 17059
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16972 atatcattttcacatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataa 17059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 251 - 354
Target Start/End: Original strand, 13471 - 13574
Alignment:
Q  251 gattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaa 350  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13471 gattatgaatgaaatctataccgcttacctcaattagcgataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgattcttcaa 13570  T
Q  351 gctt 354  Q
    ||||    
T  13571 gctt 13574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 180753 - 180657
Alignment:
Q  302 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  180753 aaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttcttctttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 180657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 182
Target Start/End: Original strand, 6813 - 6916
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||    
T  6813 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaattataac 6912  T
Q  179 aact 182  Q
    ||||    
T  6913 aact 6916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1637 - 1493
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||    
T  1637 acatacttttaacaagcaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatct 1538  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    | || | || |||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  1537 atgaac-aattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaat 1493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8782 - 8638
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 182  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||    
T  8782 acatacttttaacaagcaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatct 8683  T
Q  183 aagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    | || | || |||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  8682 atgaac-aattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaat 8638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11046 - 10860
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||| | || ||| ||||  |||||||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| ||| | || ||||    
T  11046 catgtaatttcatcatcaacaactcaatcaacatcaaattcacatactcaaacattacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaaatcataata 10947  T
Q  195 atcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaa-ttacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 280  Q
    | |||||    || |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10946 accactttgcaaaataagcacttatgcatagaattagagaaaaggttacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacct 10860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2411 - 2317
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  2411 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 172
Target Start/End: Original strand, 28688 - 28781
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaat 172  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28688 tttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 28781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 159
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1416
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1348 atgaacatgcaatttccccaacaacaactcaattatcactaatttcatgta-tcaaacatatcatcataa 1416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 11246 - 11326
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11246 tttcacacactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataa 11326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1593 - 1402
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  ||    
T  1593 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 1494  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaat 284  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |  | |||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  1493 caataatcatttattcaattaagcacttattcatacaacaaatg-aaaactac-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctcaat 1402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Original strand, 269 - 406
Alignment:
Q  90 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||  | |  |  ||    
T  269 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttca 368  T
Q  190 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaa 227  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  369 caataatcacttattcaattaagcacttattcatacaa 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 79694 - 79854
Alignment:
Q  82 cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaac 181  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   || |||||||||| | || |    
T  79694 cacatacttagaacatgcaatttcaccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatc 79793  T
Q  182 taagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattaca 243  Q
    || || | || |||||| ||||  |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||||    
T  79794 tatgaac-aattaatcatttatccaattaatcacttattcatacaataattgaaaaattaca 79854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22512 - 22424
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||| ||   ||||||||||||| ||||    
T  22512 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaaca 22424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 173
Target Start/End: Original strand, 10818 - 10908
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 173  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  10818 acatactttgaacatgcaaattctccgacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12480 - 12399
Alignment:
Q  317 ctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 398  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  12480 ctcatagaatctttatcacttcttgattcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 12399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 450 - 526
Alignment:
Q  83 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 159  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  450 acatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 7957 - 8105
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  7957 tttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 8056  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 228  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  8057 aaatatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaat 8105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 3471 - 3669
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 178  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||    
T  3471 tttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 3570  T
Q  179 aactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 278  Q
    || || || | || |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| |  | |||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  3571 aattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgtaaaattgcaa-taaatgattatga-tgaattctaacccccttac 3667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8984 - 8880
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  | |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  8984 atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaa 8885  T
Q  172 tttca 176  Q
    |||||    
T  8884 tttca 8880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 201
Target Start/End: Original strand, 1522 - 1628
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||  |||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  1522 catgtaatttcatcaacaacaacttaattatcatcaaattcatgtatccaaatatggcatcaaaacataagcacgaatttcaacaattaaaatcacaata 1621  T
Q  195 atcactt 201  Q
    |||||||    
T  1622 atcactt 1628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 171 - 1
Alignment:
Q  95 catgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaata 194  Q
    |||| ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||| | ||| |||   |||| ||    
T  171 catgtaatttcatcatcaacaacttgattatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaattttatcaattaaattcaaacta 72  T
Q  195 atcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattaggg-aaaaattacaactaagtgattatgattgaa 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  71 atcacttatttcaattaagcacttatgcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattgtgattgaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 33814 - 33911
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  33814 tttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttca 33911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 11833 - 11937
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  | | |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  11833 atatctttttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaa 11932  T
Q  172 tttca 176  Q
     ||||    
T  11933 attca 11937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 16044 - 16148
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  | |||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  16044 atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgga 16143  T
Q  172 tttca 176  Q
    |||||    
T  16144 tttca 16148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 25575 - 25679
Alignment:
Q  72 atatctttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 171  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  | | |||||| |||||||||  |||||||| |    
T  25575 atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacatgtcatcataattagagcacgga 25674  T
Q  172 tttca 176  Q
    |||||    
T  25675 tttca 25679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Original strand, 3128 - 3210
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  3128 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 176
Target Start/End: Original strand, 6092 - 6191
Alignment:
Q  77 tttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||   || |||||  | |||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  6092 tttttctcatactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttca 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 70389 - 70323
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcata 158  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  70389 tgaacatgcaaattcac-aacaataattgaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcata 70323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 89946 - 89880
Alignment:
Q  91 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcata 158  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  89946 tgaacatacaaattcac-aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcata 89880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 574
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||  |  ||||||||||| ||||||   ||||||||  | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  672 ttttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttca 574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 2067 - 2165
Alignment:
Q  78 ttttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 176  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  2067 ttttcgcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttca 2165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Original strand, 173 - 219
Alignment:
Q  79 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat 125  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  173 tttctcatactttgaacatgcaattcaaccaacaacaattcaattat 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 116619 - 116506
Alignment:
Q  113 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaag 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || |||| || |||| | ||| | |||||||    
T  116619 acaattcaattatcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgagc-aattaataatttactcaattaag 116521  T
Q  213 cacttaagcatacaa 227  Q
    ||||||  |||||||    
T  116520 cacttattcatacaa 116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6779 times since January 2019
Visitors: 9313