View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0154_low_8 (Length: 273)

Name: NF0154_low_8
Description: NF0154
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0154_low_8
NF0154_low_8
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-273)||(18059577-18059849)
chr1 (1-273)||(17004803-17005075)
chr1 (1-273)||(38054910-38055182)
chr1 (1-273)||(19962318-19962590)
chr1 (1-273)||(17148732-17149005)
chr1 (4-273)||(22227976-22228247)
chr1 (4-213)||(22232673-22232882)
chr1 (1-216)||(46523554-46523768)
chr1 (4-223)||(5072255-5072472)
chr1 (1-216)||(22035613-22035827)
chr1 (1-216)||(7640810-7641024)
chr1 (4-174)||(2116422-2116589)
chr1 (4-174)||(45051590-45051757)
chr1 (4-156)||(18601052-18601202)
chr1 (143-217)||(15861284-15861358)
chr1 (152-222)||(18598845-18598914)
chr1 (100-216)||(51452765-51452882)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-273)||(22225557-22225829)
chr6 (10-273)||(22251385-22251648)
chr6 (1-273)||(16376192-16376464)
chr6 (1-273)||(16383516-16383788)
chr6 (1-273)||(10488864-10489136)
chr6 (1-258)||(16555973-16556230)
chr6 (1-258)||(16632529-16632786)
chr6 (1-273)||(19299402-19299674)
chr6 (1-223)||(16232057-16232279)
chr6 (1-273)||(1556170-1556444)
chr6 (1-223)||(18086692-18086914)
chr6 (1-273)||(19610183-19610457)
chr6 (1-216)||(23977934-23978149)
chr6 (1-174)||(13620712-13620885)
chr6 (62-273)||(27653801-27654009)
chr6 (1-223)||(29869645-29869866)
chr6 (65-217)||(25175792-25175945)
chr6 (4-273)||(14625948-14626214)
chr6 (1-170)||(29666038-29666208)
chr6 (4-174)||(1650022-1650189)
chr6 (41-163)||(16825678-16825799)
chr6 (100-273)||(15862744-15862921)
chr6 (158-273)||(16814816-16814930)
chr6 (100-273)||(1657561-1657738)
chr6 (143-216)||(4991396-4991470)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-273)||(7822893-7823165)
chr7 (1-273)||(7830204-7830476)
chr7 (1-273)||(27176598-27176870)
chr7 (1-273)||(27101456-27101728)
chr7 (1-273)||(27108804-27109076)
chr7 (1-273)||(38783548-38783820)
chr7 (1-273)||(15950609-15950882)
chr7 (1-223)||(18979890-18980112)
chr7 (4-273)||(2437625-2437893)
chr7 (1-273)||(15759931-15760205)
chr7 (1-223)||(15927733-15927955)
chr7 (1-216)||(13758535-13758750)
chr7 (1-273)||(14250716-14250989)
chr7 (4-273)||(16478781-16479046)
chr7 (4-273)||(10989577-10989845)
chr7 (4-273)||(13910842-13911108)
chr7 (3-223)||(13572843-13573061)
chr7 (4-174)||(48622584-48622754)
chr7 (4-174)||(18253761-18253931)
chr7 (91-174)||(15862174-15862257)
chr7 (1-174)||(16418663-16418835)
chr7 (1-174)||(10000288-10000460)
chr7 (143-217)||(15516719-15516793)
chr7 (1-216)||(13321180-13321407)
chr7 (100-216)||(7293289-7293406)
chr7 (100-216)||(30262002-30262119)
chr7 (119-216)||(11516520-11516617)
chr7 (119-216)||(15441437-15441534)
chr7 (119-174)||(14113904-14113959)
chr7 (100-174)||(14423555-14423629)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (1-273)||(21932200-21932472)
chr5 (1-273)||(21938370-21938642)
chr5 (1-273)||(35582201-35582473)
chr5 (1-273)||(36989589-36989861)
chr5 (1-273)||(22882903-22883175)
chr5 (1-273)||(10777789-10778061)
chr5 (1-273)||(17471407-17471679)
chr5 (1-269)||(11211885-11212156)
chr5 (1-273)||(23514726-23515000)
chr5 (1-242)||(35790947-35791189)
chr5 (1-216)||(1219396-1219611)
chr5 (1-223)||(7425489-7425711)
chr5 (41-273)||(18777810-18778039)
chr5 (41-273)||(19500104-19500332)
chr5 (4-273)||(29188103-29188368)
chr5 (62-271)||(21073415-21073621)
chr5 (41-273)||(22366298-22366528)
chr5 (41-271)||(12579-12806)
chr5 (4-273)||(4199803-4200069)
chr5 (4-273)||(43443216-43443479)
chr5 (41-217)||(25426833-25427009)
chr5 (3-223)||(27010008-27010226)
chr5 (143-273)||(11343008-11343138)
chr5 (1-216)||(23328723-23328937)
chr5 (1-216)||(24616327-24616541)
chr5 (1-216)||(24712703-24712917)
chr5 (1-216)||(24745721-24745935)
chr5 (143-273)||(16105967-16106097)
chr5 (1-94)||(32950859-32950952)
chr5 (119-216)||(20623262-20623359)
chr5 (119-216)||(21233401-21233498)
chr5 (119-216)||(37053037-37053134)
chr5 (238-273)||(23542696-23542731)
chr5 (119-174)||(25900321-25900376)
chr5 (119-216)||(16536490-16536587)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-273)||(31474-31746)
scaffold0107 (1-125)||(39811-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-273)||(39268-39540)
scaffold0076 (4-273)||(43165-43431)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-273)||(271179-271451)
chr8 (1-273)||(644469-644741)
chr8 (1-273)||(830204-830476)
chr8 (2-273)||(15318978-15319249)
chr8 (2-273)||(15499347-15499618)
chr8 (1-273)||(22088613-22088885)
chr8 (1-273)||(22006075-22006349)
chr8 (1-273)||(13720745-13721019)
chr8 (1-273)||(13662082-13662356)
chr8 (1-216)||(16195396-16195611)
chr8 (1-216)||(16872927-16873142)
chr8 (4-273)||(6774078-6774342)
chr8 (4-273)||(24549149-24549414)
chr8 (4-273)||(30120890-30121157)
chr8 (3-273)||(21844389-21844657)
chr8 (3-273)||(21851782-21852050)
chr8 (4-223)||(16674260-16674476)
chr8 (100-273)||(17345842-17346019)
chr8 (228-273)||(17142849-17142894)
chr8 (100-216)||(22907087-22907204)
chr8 (119-216)||(5238380-5238477)
chr8 (119-216)||(24661121-24661218)
chr8 (119-216)||(43685839-43685936)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (1-273)||(1467558-1467830)
chr3 (1-273)||(49232601-49232873)
chr3 (1-273)||(12264610-12264883)
chr3 (1-273)||(12812006-12812278)
chr3 (1-273)||(22275374-22275646)
chr3 (1-273)||(15468157-15468431)
chr3 (1-273)||(18911158-18911432)
chr3 (1-273)||(25058904-25059178)
chr3 (6-273)||(18896861-18897130)
chr3 (1-273)||(5228478-5228751)
chr3 (1-174)||(12902008-12902181)
chr3 (4-216)||(54651625-54651837)
chr3 (4-223)||(55316387-55316604)
chr3 (41-223)||(41270280-41270460)
chr3 (4-267)||(16821307-16821568)
chr3 (1-174)||(44229150-44229323)
chr3 (4-174)||(15936553-15936723)
chr3 (73-174)||(15938395-15938496)
chr3 (4-174)||(15615001-15615168)
chr3 (143-273)||(23492696-23492828)
chr3 (143-272)||(14842388-14842519)
chr3 (142-216)||(8268609-8268683)
chr3 (142-216)||(8275709-8275783)
chr3 (3-94)||(11986172-11986263)
chr3 (119-216)||(2449111-2449208)
chr3 (100-216)||(13954763-13954880)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-273)||(11231157-11231429)
chr2 (1-273)||(22513004-22513276)
chr2 (1-273)||(28775626-28775898)
chr2 (1-273)||(24685600-24685872)
chr2 (1-273)||(16935758-16936032)
chr2 (1-273)||(17006418-17006692)
chr2 (1-216)||(12728557-12728772)
chr2 (1-216)||(34824640-34824855)
chr2 (1-273)||(42177786-42178060)
chr2 (1-216)||(8944011-8944226)
chr2 (1-216)||(12635744-12635959)
chr2 (1-213)||(3798482-3798694)
chr2 (1-216)||(12641518-12641733)
chr2 (1-174)||(23777963-23778136)
chr2 (41-271)||(19886481-19886708)
chr2 (1-127)||(21142060-21142187)
chr2 (1-216)||(23774302-23774516)
chr2 (143-273)||(24826518-24826646)
chr2 (1-174)||(5888548-5888720)
chr2 (4-174)||(7507758-7507940)
chr2 (143-216)||(25213372-25213446)
chr2 (119-216)||(14906313-14906410)
chr2 (100-174)||(19689316-19689391)
chr2 (119-216)||(23820364-23820461)
chr2 (100-174)||(17396568-17396643)
chr2 (119-216)||(20015304-20015401)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (1-273)||(18169135-18169407)
chr4 (1-273)||(7131882-7132156)
chr4 (1-273)||(17145474-17145748)
chr4 (1-223)||(15287114-15287336)
chr4 (1-223)||(15294223-15294445)
chr4 (1-216)||(20000888-20001103)
chr4 (1-186)||(18248383-18248568)
chr4 (1-174)||(19020651-19020824)
chr4 (4-273)||(10644387-10644652)
chr4 (1-174)||(22738434-22738607)
chr4 (50-165)||(8378365-8378480)
chr4 (1-223)||(22351933-22352154)
chr4 (1-216)||(26339185-26339399)
chr4 (62-216)||(47357880-47358030)
chr4 (142-273)||(14996444-14996577)
chr4 (99-174)||(9795490-9795564)
chr4 (143-223)||(14952085-14952165)
chr4 (1-52)||(8374673-8374724)
chr4 (136-174)||(8378486-8378524)
chr4 (119-216)||(16608972-16609069)
chr4 (119-216)||(26680493-26680590)
chr4 (119-174)||(16327841-16327896)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (1-223)||(29327-29549)
scaffold0213 (206-273)||(29565-29631)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-273)||(153824-154098)
scaffold0023 (62-273)||(169728-169938)
scaffold0023 (70-273)||(36327-36527)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-273)||(1331-1605)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-242)||(1424-1666)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-273)||(2557-2830)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-273)||(7274-7547)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (4-273)||(20932-21200)
scaffold0139 (4-273)||(13878-14145)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (4-273)||(5029-5300)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (4-273)||(3890-4161)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (62-273)||(10565-10778)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-273)||(33975-34249)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (1-186)||(10245-10430)
scaffold0467 (237-273)||(8398-8434)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (4-273)||(3130-3400)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (4-242)||(1153-1388)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (70-273)||(31493-31693)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (143-273)||(130880-131010)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (4-174)||(54042-54212)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-223)||(6763-6984)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (4-248)||(13169-13409)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (41-223)||(64390-64570)
scaffold0026 (4-174)||(107914-108084)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-174)||(45195-45369)
scaffold0066 (1-174)||(54581-54755)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (3-242)||(202-438)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (143-273)||(17111-17241)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (4-134)||(3581-3711)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (4-174)||(9266-9433)
scaffold0215 (4-174)||(16164-16331)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-223)||(23618-23839)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (1-85)||(3-87)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-174)||(7375-7547)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (70-174)||(12045-12149)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (99-174)||(13268-13342)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (4-273)||(782-1052)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (4-216)||(5949-6160)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (150-223)||(154300-154373)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (3-94)||(56105-56196)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (100-174)||(34374-34450)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (4-94)||(41815-41905)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (119-216)||(22833-22930)
scaffold0141 (119-216)||(27088-27185)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (119-216)||(1455-1552)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (143-175)||(42677-42709)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18059849 - 18059577
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059849 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 18059750  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059749 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 18059650  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18059649 ttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 18059577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17004803 - 17005075
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17004803 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 17004902  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  17004903 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 17005002  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17005003 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 17005075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38055182 - 38054910
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  38055182 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcac 38055083  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  38055082 caacccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 38054983  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38054982 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 38054910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19962590 - 19962318
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19962590 tgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccat 19962491  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19962490 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 19962391  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19962390 ttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 19962318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17148732 - 17149005
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17148732 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcat 17148831  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagatgattattcctaacccttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  17148832 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttg 17148931  T
Q  200 cttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17148932 cttcaattcagctcctatgtcaccccacttgattcctcaagctttcccttcaaccctcttgttcttctcttcac 17149005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 22227976 - 22228247
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||  | || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22228075  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  22228076 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttc 22228175  T
Q  204 aattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||| | || | |||  ||||||||| ||||| | |||||| ||| || |||||| ||||||||||    
T  22228176 aattcagctcttaagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgttattctcttcac 22228247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 22232673 - 22232882
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||  | || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22232772  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  22232773 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttc 22232872  T
Q  204 aattcagctc 213  Q
    ||||||||||    
T  22232873 aattcagctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 46523554 - 46523768
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46523554 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 46523653  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  46523654 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-atggaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 46523752  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    || |||| | ||||||    
T  46523753 tttaatttatctccta 46523768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5072472 - 5072255
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  5072472 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 5072373  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||    
T  5072372 cccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttc 5072275  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacc 223  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  5072274 aattcagctcctaagtcacc 5072255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22035613 - 22035827
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22035613 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 22035711  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  22035712 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 22035811  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22035812 ttcaattcagctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7641024 - 7640810
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  7641024 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 7640926  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  7640925 caacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 7640826  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7640825 ttcaatttagctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 2116422 - 2116589
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  2116422 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 2116521  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2116522 cccatttttatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccctttacctt 2116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 45051590 - 45051757
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  ||  || |||||||| |||| ||||||| || ||  |||||||||||||    
T  45051590 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaa 45051689  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45051690 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--cacatgattatgataaagactaacccccttacctt 45051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18601202 - 18601052
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  18601202 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaa 18601103  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18601102 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861284
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctag 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15861284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18598914 - 18598845
Alignment:
Q  152 ataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcac 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598914 ataataactaacccccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctcctaagtcac 18598845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Original strand, 51452765 - 51452882
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  51452765 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 51452863  T
Q  198 tgcttcaattcagctccta 216  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  51452864 ggcttcaatttagctccta 51452882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22225829 - 22225557
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225829 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 22225730  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225729 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgc 22225630  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22225629 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctcttcac 22225557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251385
Alignment:
Q  10 taatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  110 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251548 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 22251449  T
Q  210 gctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22251448 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctcttcac 22251385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16376464 - 16376192
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16376464 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 16376365  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16376364 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 16376265  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16376264 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 16376192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16383788 - 16383516
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16383788 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 16383689  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16383688 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 16383589  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16383588 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 16383516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 10488864 - 10489136
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10488864 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 10488963  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  10488964 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 10489063  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10489064 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 10489136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16556230 - 16555973
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16556230 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcac 16556131  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16556130 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 16556031  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16556030 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16555973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16632786 - 16632529
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16632786 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcac 16632687  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16632686 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 16632587  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16632586 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16632529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 19299402 - 19299674
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19299402 tgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccat 19299501  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19299502 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 19299601  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19299602 ttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 19299674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16232057 - 16232279
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16232057 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 16232156  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  16232157 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 16232256  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  16232257 ttcaattcagctcctaagtcacc 16232279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1556170 - 1556444
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1556170 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 1556269  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||    
T  1556270 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgc 1556369  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||| |||||||    
T  1556370 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttttcttcac 1556444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18086914 - 18086692
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18086914 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 18086815  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  18086814 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 18086715  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  18086714 ttcaattcagctcctaagtcacc 18086692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 19610183 - 19610457
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19610183 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcat 19610282  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  19610283 caacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 19610382  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || ||| |||||||||||||    
T  19610383 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctcttctctccaaaaccctttttcttctcttcac 19610457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23977934 - 23978149
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23977934 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcat 23978033  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  23978034 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 23978133  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23978134 ttcaatttagctccta 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13620885 - 13620712
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13620885 tgaaacatgcaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 13620786  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620785 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27654009 - 27653801
Alignment:
Q  62 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  27654009 catcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcacta 27653911  T
Q  162 acccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgt 261  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||     
T  27653910 accccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgc 27653813  T
Q  262 tcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||    
T  27653812 tcttctcttcac 27653801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29869866 - 29869645
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  29869866 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 29869768  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacat-gattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  || ||| ||||    
T  29869767 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaa-attttaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttg 29869669  T
Q  200 cttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  29869668 cttcaattcagctcctaagtcacc 29869645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 25175792 - 25175945
Alignment:
Q  65 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  25175792 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-attatacatgattatggtaatcactaac 25175890  T
Q  164 ccccttacctttgaagatgattattcctaa-cccttgcttcaattcagctcctag 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25175891 ccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25175945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14626214 - 14625948
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |     
T  14626214 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataat 14626115  T
Q  104 cccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgct 201  Q
    | || || || |||||||  |||||  || ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  14626114 cacaatt-caaacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgct 14626018  T
Q  202 tcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14626017 tcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctcaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctcttcac 14625948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 29666038 - 29666208
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  29666038 tgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T
Q  101 caacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 170  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666138 caccccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1650189 - 1650022
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  ||  || |||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  1650189 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 1650090  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1650089 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16825799 - 16825678
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  16825799 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attac 16825701  T
Q  141 acatgattatgataataactaac 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  16825700 acatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 273
Target Start/End: Original strand, 15862744 - 15862921
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||    
T  15862744 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactct 15862843  T
Q  198 tgcttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  15862844 tgcttcaattcacctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaactcttgttcttctcttcac 15862921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814816
Alignment:
Q  158 actaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactc 257  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||| |||||| |||  |||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagc-ttcccttcaaacctc 16814832  T
Q  258 ttgttcttctcttcac 273  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16814831 ttgctcttctcttcac 16814816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1657738 - 1657561
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||    
T  1657738 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactct 1657639  T
Q  198 tgcttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    || ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  1657638 tgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 1657561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 216
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcct-aacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 7822893 - 7823165
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7822893 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 7822992  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7822993 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 7823092  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7823093 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 7823165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 7830204 - 7830476
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7830204 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 7830303  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7830304 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 7830403  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7830404 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 7830476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 27176598 - 27176870
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27176598 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 27176697  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27176698 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 27176797  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27176798 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 27176870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27101728 - 27101456
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27101728 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 27101629  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27101628 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 27101529  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27101528 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 27101456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27109076 - 27108804
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27109076 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 27108977  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27108976 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 27108877  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27108876 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 27108804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38783820 - 38783548
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38783820 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 38783721  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  38783720 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 38783621  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38783620 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 38783548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15950882 - 15950609
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15950882 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 15950783  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||    
T  15950782 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgc 15950683  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  15950682 ttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctatttccttcaaaacccttgttcttctcttcac 15950609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18980112 - 18979890
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18980112 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 18980013  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  18980012 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 18979913  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  18979912 ttcaattcagctcctaagtcacc 18979890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 2437625 - 2437893
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |     
T  2437625 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattat 2437724  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437725 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 2437823  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2437824 aattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcctgttcttctcttcac 2437893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15760205 - 15759931
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15760205 tgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcat 15760106  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||    
T  15760105 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgc 15760006  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||| |||||||    
T  15760005 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttttcttcac 15759931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15927733 - 15927955
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15927733 tgaaacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcat 15927832  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  15927833 caatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 15927932  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  15927933 ttcaattcagctcctaagtcacc 15927955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13758535 - 13758750
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13758535 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcat 13758634  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  13758635 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 13758734  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13758735 ttcaatttagctccta 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14250989 - 14250716
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250989 tgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 14250890  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | | ||| |||||    
T  14250889 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaagaagataact-caaactcttgc 14250791  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  14250790 ttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 14250716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16479046 - 16478781
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  16479046 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaa 16478947  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  16478946 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--taaatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttc 16478850  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16478849 acttcagctcctaggtcacc-cacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctcttcac 16478781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 10989577 - 10989845
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  10989577 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaa 10989676  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10989677 cccattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacccccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttc 10989775  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||  || |  |||||||||| ||||||||||||    
T  10989776 aattaagctcctatgtcacctcacttgattcctcaagctccccttctaacactcttgatcttctcttcac 10989845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13911108 - 13910842
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || | ||| |||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  13911108 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 13911009  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13911008 ctcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 13910910  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  13910909 aattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgctcttctcttcac 13910842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 13572843 - 13573061
Alignment:
Q  3 aaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatca 102  Q
    ||||||||||||||||| | || || |  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 13572942  T
Q  103 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||    
T  13572943 acccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctt 13573040  T
Q  203 caattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  13573041 caattcagctcctaagtcacc 13573061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48622754 - 48622584
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48622754 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaa 48622655  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  48622654 cccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18253931 - 18253761
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 18253832  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18253831 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  91 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 16418663 - 16418835
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16418663 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagcaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 16418761  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16418762 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10000460 - 10000288
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  | || || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  10000460 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaacaa-caacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcat 10000362  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  10000361 caacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatgaagacaaacccccttacctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctag 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13321180 - 13321407
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttca- 99  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||     
T  13321180 tgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccac 13321279  T
Q  100 ---------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattatt 188  Q
             ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  13321280 ttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaat 13321379  T
Q  189 cctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    || ||||   |||||| || ||||||||    
T  13321380 ccaaacctaggcttcactttagctccta 13321407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Original strand, 7293289 - 7293406
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  7293289 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 7293387  T
Q  198 tgcttcaattcagctccta 216  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  7293388 ggcttcaatttagctccta 7293406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30262119 - 30262002
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  30262119 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 30262021  T
Q  198 tgcttcaattcagctccta 216  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  30262020 ggcttcaatttagctccta 30262002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 11516520 - 11516617
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  11516520 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 11516617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15441534 - 15441437
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  15441534 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 15441437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14113959 - 14113904
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14113959 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 14113904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14423629 - 14423555
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14423629 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataa-gactaacccccttacctt 14423555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21932472 - 21932200
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932472 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 21932373  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21932372 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 21932273  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21932272 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 21932200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21938642 - 21938370
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21938642 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 21938543  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21938542 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 21938443  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21938442 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 21938370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 35582201 - 35582473
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35582201 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 35582300  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  35582301 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 35582400  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35582401 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 35582473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36989861 - 36989589
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36989861 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcac 36989762  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  36989761 caacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 36989662  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36989661 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 36989589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22883175 - 22882903
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22883175 tgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcac 22883076  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22883075 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgc 22882976  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22882975 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgatttcccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 22882903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10778061 - 10777789
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10778061 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 10777962  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10777961 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgc 10777862  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10777861 ttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagcttccccttcaactctcttgttcttctcttcac 10777789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17471679 - 17471407
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17471679 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcat 17471580  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||    
T  17471579 caacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgc 17471480  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  17471479 ttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa-atccttgttcttctcttcac 17471407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11212156 - 11211885
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11212156 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcat 11212057  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  11212056 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgc 11211957  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaa--ttgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctct 269  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||  ||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  11211956 ttcaattcagctcctagcttaccccaattttgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 11211885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 23514726 - 23515000
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23514726 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 23514825  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  23514826 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 23514925  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||| | ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  23514926 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagttattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 23515000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35791189 - 35790947
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35791189 tgaaacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 35791090  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  35791089 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 35790990  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    ||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||    
T  35790989 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 35790947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1219611 - 1219396
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1219611 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 1219512  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  1219511 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 1219412  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1219411 ttcaatttagctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 7425489 - 7425711
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7425489 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcat 7425588  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  7425589 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 7425688  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  7425689 ttcaattcagctcctaagtcacc 7425711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18778039 - 18777810
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  18778039 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attac 18777941  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaag 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  18777940 acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctcaag 18777842  T
Q  241 ctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18777841 c-ttcccttcaaccctcttgttcttctcttcac 18777810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Original strand, 19500104 - 19500332
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  19500104 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attac 19500202  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaag 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  19500203 acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcacc-cacttgattcctcaag 19500300  T
Q  241 ctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19500301 c-ttcccttcaactctcttgttcttctcttcac 19500332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29188368 - 29188103
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||| |    
T  29188368 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcga 29188269  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  29188268 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattataataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 29188172  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  29188171 aattcagctcctaggtcaccccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgctcttctcttcac 29188103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21073621 - 21073415
Alignment:
Q  62 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21073621 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataacta 21073523  T
Q  162 acccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgt 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  21073522 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgt 21073425  T
Q  262 tcttctcttc 271  Q
    ||||||||||    
T  21073424 tcttctcttc 21073415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22366528 - 22366298
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  22366528 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attac 22366430  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaag 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| || |||    
T  22366429 acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcaactcctaggtcaccccacttgattgctaaag 22366330  T
Q  241 ctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    | |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  22366329 c-ttcccttcaaccctcttgctcttctcttcac 22366298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 271
Target Start/End: Original strand, 12579 - 12806
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||      
T  12579 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaa-attac 12677  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  12678 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaag 12776  T
Q  241 ctttccctgcaacactcttgttcttctcttc 271  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12777 c-ttcccttcaaccctcttgttcttctcttc 12806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4200069 - 4199803
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  4200069 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaa 4199970  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  4199969 ctcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatccctaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 4199871  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  4199870 aattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgctcttctcttcac 4199803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43443479 - 43443216
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43443479 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaa 43443380  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43443379 tccattttcatataacatgagaatatgcaa---ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 43443283  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  43443282 aattcagctcctaggtcacc-cacttgattcct-aagc-ttcccttcaaccctcatgctcttctcttcac 43443216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 25426833 - 25427009
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  25426833 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attac 25426931  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaa-cccttgcttcaattcagctcctag 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25426932 acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25427009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 27010008 - 27010226
Alignment:
Q  3 aaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatca 102  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 27010107  T
Q  103 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||    
T  27010108 acccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctt 27010205  T
Q  203 caattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  27010206 caattcagctcctaagtcacc 27010226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343138
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  243 ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11343108 ttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 11343138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23328723 - 23328937
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  23328723 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 23328821  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  23328822 caacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 23328921  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23328922 ttcaatttagctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24616327 - 24616541
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24616327 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 24616425  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  24616426 caacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 24616525  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  24616526 ttcaatttagctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24712703 - 24712917
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24712703 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 24712801  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  24712802 caacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 24712901  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  24712902 ttcaatttagctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24745721 - 24745935
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24745721 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 24745819  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  24745820 caacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 24745919  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  24745920 ttcaatttagctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106097
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  243 ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16106067 ttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 16106097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 32950859 - 32950952
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 94  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32950859 tgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 20623262 - 20623359
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20623262 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21233498 - 21233401
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  21233498 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 21233401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 37053037 - 37053134
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  37053037 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 37053134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 23542696 - 23542731
Alignment:
Q  238 aagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23542696 aagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 23542731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25900376 - 25900321
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25900376 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 25900321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 16536490 - 16536587
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16536490 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16536587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 31474 - 31746
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31474 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 31573  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  31574 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 31673  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31674 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 31746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 39811 - 39935
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39811 tgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 39910  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgaga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39911 caacccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 39268 - 39540
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39268 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 39367  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  39368 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 39467  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39468 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 39540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 43165 - 43431
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  43165 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaa 43264  T
Q  104 cccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgctt 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||    
T  43265 cccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-at--tacatgtttgtgatagtaactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctt 43361  T
Q  203 caattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    || |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43362 cacttcagctcctagatcacc-cacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctcttcac 43431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 271451 - 271179
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  271451 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 271352  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  271351 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 271252  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  271251 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 271179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 644469 - 644741
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  644469 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 644568  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  644569 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 644668  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  644669 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 644741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 830204 - 830476
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  830204 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 830303  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  830304 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 830403  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  830404 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 830476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15319249 - 15318978
Alignment:
Q  2 gaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15319249 gaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcacc 15319150  T
Q  102 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  15319149 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgct 15319050  T
Q  202 tcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15319049 tcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgttcttctcttcac 15318978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15499618 - 15499347
Alignment:
Q  2 gaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15499618 gaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcacc 15499519  T
Q  102 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  15499518 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgct 15499419  T
Q  202 tcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15499418 tcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgttcttctcttcac 15499347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22088885 - 22088613
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22088885 tgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 22088786  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22088785 caacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 22088686  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22088685 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 22088613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22006349 - 22006075
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22006349 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 22006250  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||| |||||    
T  22006249 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgc 22006150  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  22006149 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacctttgttcttctcttcac 22006075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13721019 - 13720745
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13721019 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 13720920  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  13720919 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 13720820  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  13720819 ttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 13720745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13662356 - 13662082
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13662356 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttat 13662257  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  13662256 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 13662157  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  13662156 ttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 13662082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16195396 - 16195611
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16195396 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcat 16195495  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||    
T  16195496 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgc 16195595  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16195596 ttcaattcaactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16873142 - 16872927
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16873142 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcat 16873043  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||    
T  16873042 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgc 16872943  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16872942 ttcaatttagctccta 16872927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6774342 - 6774078
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  6774342 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 6774243  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  6774242 cccattttcatataacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 6774146  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6774145 aattcagctccta-gtcacc-cacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctcttcac 6774078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 24549149 - 24549414
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  24549149 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 24549248  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  24549249 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagttgattatccttaaccctagcttc 24549345  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24549346 acttcagctcctaggtcacc-cacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctcttcac 24549414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 30120890 - 30121157
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  30120890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 30120989  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    | ||||||||||||||||||||  || |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30120990 ctcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttc 30121089  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  30121090 aattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgctcttctcttcac 30121157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21844657 - 21844389
Alignment:
Q  3 aaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatca 102  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 21844558  T
Q  103 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgctt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||| |||     
T  21844557 acccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccgttgaagttgattatccttaatcctagctc 21844460  T
Q  203 caattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctt-tccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    || ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21844459 cacttcagcttctaggtcacc-cacttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctcttcac 21844389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21852050 - 21851782
Alignment:
Q  3 aaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatca 102  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 21851951  T
Q  103 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgctt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||     
T  21851950 acccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctc 21851853  T
Q  203 caattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctt-tccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    || ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21851852 cacttcagcttctaggtcacc-cacttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctcttcac 21851782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16674476 - 16674260
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | |||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||    
T  16674476 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaa 16674377  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| ||||||||    
T  16674376 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagatta-actcaactcttgcttc 16674280  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  16674279 aattcagctcataagtcacc 16674260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 273
Target Start/End: Original strand, 17345842 - 17346019
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||  || ||| ||    
T  17345842 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactct 17345941  T
Q  198 tgcttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||| | ||| || ||| || ||||||||| |||||||    
T  17345942 tgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagttattctctccaaaacccttgttcttttcttcac 17346019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17142894 - 17142849
Alignment:
Q  228 ttgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17142894 ttgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 17142849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22907204 - 22907087
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  22907204 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 22907106  T
Q  198 tgcttcaattcagctccta 216  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  22907105 ggcttcaatttagctccta 22907087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 5238380 - 5238477
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  5238380 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 5238477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24661218 - 24661121
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  24661218 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 24661121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 43685839 - 43685936
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  43685839 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 43685936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1467830 - 1467558
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1467830 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 1467731  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  1467730 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 1467631  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1467630 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 1467558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 49232601 - 49232873
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49232601 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 49232700  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  49232701 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 49232800  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49232801 ttcaattcagctcataggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 49232873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12264883 - 12264610
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12264883 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 12264784  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  12264783 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgc 12264684  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtca-cctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12264683 ttcaattcagctcctaggtcaccccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 12264610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 12812006 - 12812278
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12812006 tgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccat 12812105  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  12812106 caacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgc 12812205  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12812206 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 12812278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22275374 - 22275646
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22275374 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 22275473  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||    
T  22275474 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgc 22275573  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  22275574 ttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa-atccttgttcttctcttcac 22275646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15468431 - 15468157
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15468431 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcct 15468332  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||    
T  15468331 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgc 15468232  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  15468231 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 15468157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18911158 - 18911432
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18911158 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 18911257  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  18911258 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 18911357  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  18911358 ttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 18911432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 25058904 - 25059178
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25058904 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 25059003  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||   ||||    
T  25059004 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgc 25059103  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||| |||||    
T  25059104 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttcttttcac 25059178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18896861
Alignment:
Q  6 catgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacc 105  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18897130 catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc 18897031  T
Q  106 cattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  18897030 cattttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaa 18896931  T
Q  206 ttcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||| ||||||||    
T  18896930 ttcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttctcctcttcac 18896861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 5228478 - 5228751
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5228478 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat-gttcat 5228576  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||     
T  5228577 caacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgt 5228676  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  5228677 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacctttgttcttctcttcac 5228751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12902181 - 12902008
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  12902181 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcat 12902082  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902081 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 54651625 - 54651837
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54651625 aacatgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaa 54651724  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||  || |||  |||||||    
T  54651725 cccattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttc 54651824  T
Q  204 aattcagctccta 216  Q
    |||| ||||||||    
T  54651825 aattaagctccta 54651837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 55316387 - 55316604
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  55316387 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 55316486  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  55316487 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttc 55316584  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacc 223  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  55316585 aattcagctcctaagtcacc 55316604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Original strand, 41270280 - 41270460
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||      
T  41270280 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaatt-- 41270377  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41270378 acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcacc 41270460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 16821307 - 16821568
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||| ||||| |  || ||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  16821307 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaa 16821406  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||| ||||||||    
T  16821407 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttc 16821503  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttct 267  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||| | |||||| ||| || |||||||||||    
T  16821504 aattcagctcctagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgttcttct 16821568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44229150 - 44229323
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44229150 tgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcat 44229249  T
Q  101 caacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229250 caacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15936723 - 15936553
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 15936624  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  15936623 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccatacctt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15938496 - 15938395
Alignment:
Q  73 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 172  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15938496 gagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 15938397  T
Q  173 tt 174  Q
    ||    
T  15938396 tt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 15615001 - 15615168
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || | ||  || ||||| |||||||||| |  || ||| || ||||| |||||||| ||| || ||  |||||||||||||    
T  15615001 aacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaa 15615100  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15615101 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492828
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagc 241  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaaattgattcctcaagc 23492795  T
Q  242 t-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    | ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  23492796 tattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 23492828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842388
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagc 241  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| || | |||  ||||||| ||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctcaagc 14842420  T
Q  242 t-ttccctgcaacactcttgttcttctcttca 272  Q
    | ||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  14842419 tattctcttcaaaacccttgttcttctcttca 14842388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  142 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  142 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11986263 - 11986172
Alignment:
Q  3 aaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 94  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11986263 aaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2449208 - 2449111
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  2449208 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 2449111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13954880 - 13954763
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 197  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  13954880 tcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 13954782  T
Q  198 tgcttcaattcagctccta 216  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  13954781 ggcttcaatttagctccta 13954763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11231429 - 11231157
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11231429 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 11231330  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11231329 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 11231230  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11231229 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 11231157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22513276 - 22513004
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22513276 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 22513177  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22513176 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 22513077  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22513076 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 22513004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28775898 - 28775626
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28775898 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 28775799  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28775798 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 28775699  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28775698 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 28775626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24685872 - 24685600
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24685872 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcac 24685773  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  24685772 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgc 24685673  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24685672 ttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacacttttgttcttctcttcac 24685600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16935758 - 16936032
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16935758 tgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcat 16935857  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| |    
T  16935858 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttc 16935957  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  16935958 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 16936032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17006418 - 17006692
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17006418 tgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcat 17006517  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| |    
T  17006518 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttc 17006617  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  17006618 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 17006692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 12728557 - 12728772
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12728557 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 12728656  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  12728657 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 12728756  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12728757 ttcaatttagctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 34824640 - 34824855
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34824640 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 34824739  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  34824740 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 34824839  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  34824840 ttcaatttagctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42178060 - 42177786
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42178060 tgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 42177961  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||    
T  42177960 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgc 42177861  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||| ||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  42177860 ttcaattcagcccctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 42177786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 8944011 - 8944226
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8944011 tgaaacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 8944110  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  8944111 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 8944210  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8944211 ttcaatttagctccta 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12635959 - 12635744
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12635959 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 12635860  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  12635859 caacctattttcatacaacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 12635760  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12635759 ttcaatttagctccta 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3798694 - 3798482
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3798694 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcat 3798595  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  3798594 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 3798495  T
Q  201 ttcaattcagctc 213  Q
    ||||||| |||||    
T  3798494 ttcaatttagctc 3798482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12641733 - 12641518
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12641733 tgaaacatgtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcat 12641634  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||    
T  12641633 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgc 12641534  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12641533 ttcaatttagctccta 12641518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23778136 - 23777963
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23778136 tgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcat 23778037  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23778036 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19886708 - 19886481
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  19886708 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attac 19886610  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  19886609 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaag 19886511  T
Q  241 ctttccctgcaacactcttgttcttctcttc 271  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19886510 c-ttcccttcaaccctcttgttcttctcttc 19886481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 21142060 - 21142187
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21142060 tgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcat 21142159  T
Q  101 caacccattttcatacaa-catgagaaa 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142160 caacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23774302 - 23774516
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  23774302 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 23774400  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  23774401 caacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 23774500  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23774501 ttcaatttagctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826518
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||     
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagc- 24826549  T
Q  243 ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  24826548 ttcccttcaaccctcttgctcttctcttcac 24826518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5888720 - 5888548
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  5888720 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagcaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 5888622  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  5888621 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7507940 - 7507758
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttca---- 99  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||        
T  7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaataattattcattca 7507841  T
Q  100 ------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  7507840 ttcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 7507758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 216
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcct-aacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14906410 - 14906313
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  14906410 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 14906313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19689391 - 19689316
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19689391 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 19689316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 23820364 - 23820461
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  23820364 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 23820461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17396643 - 17396568
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17396643 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttacctt 17396568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 20015304 - 20015401
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20015304 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20015401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18169135 - 18169407
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18169135 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 18169234  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  |||||    
T  18169235 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaaccctaattcttgc 18169333  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  18169334 ttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 18169407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7132156 - 7131882
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7132156 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 7132057  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  7132056 caacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgc 7131957  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  7131956 ttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 7131882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17145748 - 17145474
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17145748 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcat 17145649  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||| |    
T  17145648 caactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttac 17145549  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  17145548 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 17145474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15287336 - 15287114
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15287336 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcat 15287237  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  15287236 catcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 15287137  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  15287136 ttcaattcagctcctaagtcacc 15287114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15294445 - 15294223
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15294445 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcat 15294346  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  15294345 catcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 15294246  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  15294245 ttcaattcagctcctaagtcacc 15294223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20000888 - 20001103
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20000888 tgaaacatgtaatttcacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcat 20000987  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  20000988 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 20001087  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20001088 ttcaatttagctccta 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18248383 - 18248568
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18248383 tgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcat 18248482  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18248483 caacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttaccttagatgatgatta 18248568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 19020651 - 19020824
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19020651 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcat 19020750  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020751 caacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 10644387 - 10644652
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||  | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  10644387 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 10644486  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||  ||||    
T  10644487 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttc 10644583  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    | |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10644584 acttcagctcctagatcacc-cacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctcttcac 10644652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 22738434 - 22738607
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  22738434 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcct 22738533  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  22738534 cagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaagacaaacccccttacctt 22738607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 165
Target Start/End: Original strand, 8378365 - 8378480
Alignment:
Q  50 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgatta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8378365 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgatta 8378464  T
Q  150 tgataataactaaccc 165  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378465 tgataataactaaccc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22352154 - 22351933
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  |||| || | |||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  22352154 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataacaagagcatgaatttgacatgaattgttcat 22352056  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  22352055 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 22351956  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  22351955 ttcaattcagctcctaagtcacc 22351933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 26339185 - 26339399
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  26339185 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 26339283  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  26339284 caacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 26339383  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  26339384 ttcaatttagctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Original strand, 47357880 - 47358030
Alignment:
Q  62 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  47357880 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataacta 47357976  T
Q  162 acccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  47357977 acccccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctccta 47358030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996577
Alignment:
Q  142 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaag 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  | |||  |||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaag 14996543  T
Q  241 ct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    || ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  14996544 ctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 14996577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 174
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  99 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952165
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacc 14952165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 8374673 - 8374724
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcaca 52  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8374673 tgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcaca 8374724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 8378486 - 8378524
Alignment:
Q  136 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378486 attgtacatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16609069 - 16608972
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16609069 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16608972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 26680493 - 26680590
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  26680493 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 26680590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16327896 - 16327841
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16327896 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 16327841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29327 - 29549
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327 tgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 29426  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||    
T  29427 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagc 29526  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  29527 ttcacttcagctcctaggtcacc 29549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 29565 - 29631
Alignment:
Q  206 ttcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29565 ttcagctcctaggtcacccac-ttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctcttcac 29631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 154098 - 153824
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  154098 tgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 153999  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||    
T  153998 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgc 153899  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  153898 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 153824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 169938 - 169728
Alignment:
Q  62 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  169938 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attatacatgattatgataatcacta 169840  T
Q  162 acccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgt 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||    
T  169839 acccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgccttcaactctcttgt 169740  T
Q  262 tcttctcttcac 273  Q
    |||| |||||||    
T  169739 tcttttcttcac 169728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 273
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36527
Alignment:
Q  70 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 169  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcattaaccccctt 36425  T
Q  170 acctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctct 269  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  36426 acctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagcttt-ccttcaaccctcttgctcttctct 36523  T
Q  270 tcac 273  Q
    ||||    
T  36524 tcac 36527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1605 - 1331
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1605 tgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 1506  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||    
T  1505 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgc 1406  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  1405 ttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 1331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1666 - 1424
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  1666 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcat 1567  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||    
T  1566 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgc 1467  T
Q  201 ttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    ||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||    
T  1466 ttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 2557 - 2830
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2557 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcat 2656  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga-ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||    
T  2657 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttg 2756  T
Q  200 cttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  2757 cttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa-atccttgttcttctcttcac 2830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7274
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  7547 tgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcat 7448  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||    
T  7447 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgc 7348  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  7347 ttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21200 - 20932
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||  | || ||||| || ||||| |||| ||| | |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 21101  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21100 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttc 21002  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21001 aattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttcttctcttcac 20932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14145 - 13878
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||||| |   | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacga-tttagcaagaattgtgcatcaa 14047  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14046 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttc 13948  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13947 aattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttcttctcttcac 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5300 - 5029
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5300 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaa 5201  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  5200 cccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttc 5101  T
Q  204 aattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||    
T  5100 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttaaaaacccttgttcttctcttcac 5029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 3890 - 4161
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 3989  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  3990 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttc 4089  T
Q  204 aattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| || ||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  4090 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattgccttcaaaacccttgtccttctcttcac 4161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10565
Alignment:
Q  62 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10778 catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 10679  T
Q  162 acccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactctt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||    
T  10678 acccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccacaattgattcctcaagctattctcttcaaaaccctt 10579  T
Q  260 gttcttctcttcac 273  Q
    ||||||||||||||    
T  10578 gttcttctcttcac 10565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34249 - 33975
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34249 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcat 34150  T
Q  101 caacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttg 199  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||    
T  34149 caaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttg 34051  T
Q  200 cttcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||| ||||||| || | ||   ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  34050 cttcaatttagctcctaagcttacgccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctcttcac 33975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10430 - 10245
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10430 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcat 10331  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |  || |||||||||||||| || ||||||||    
T  10330 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgatta 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 273
Target Start/End: Original strand, 8398 - 8434
Alignment:
Q  237 caagctttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8398 caagctttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 8434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 3130 - 3400
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||| | |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3130 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 3229  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| ||||||||    
T  3230 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacataattatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttc 3328  T
Q  204 aattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  3329 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctcttcac 3400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1388 - 1153
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |  | ||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  1388 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 1289  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  1288 cccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttc 1191  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||    
T  1190 aattcagctcctaagtcacc-aacttgattcctaaagct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31493
Alignment:
Q  70 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 169  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaaccccctt 31595  T
Q  170 acctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccctgcaacactcttgttcttctct 269  Q
    || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31594 acatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgctcttctct 31497  T
Q  270 tcac 273  Q
    ||||    
T  31496 tcac 31493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Original strand, 130880 - 131010
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  243 ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  130980 ttcccttcaacactcttgttcttctcttcac 131010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 54042 - 54212
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54042 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaa 54141  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  54142 cccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6763 - 6984
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6763 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 6861  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  6862 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgc 6961  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  6962 ttcaattcagctcctaagtcacc 6984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13409 - 13169
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| |||||||  |||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  13409 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 13310  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  13309 cccattttcatacaacatgagaaaatgaaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttc 13213  T
Q  204 aattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagctttccct 248  Q
    | ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  13212 acttcagttcctaggtcacc-cacttgattcctcaagcttcccct 13169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 64570 - 64390
Alignment:
Q  41 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 140  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  64570 aattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--t 64473  T
Q  141 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64472 acatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacc 64390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 107914 - 108084
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 108013  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  108014 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 45195 - 45369
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  45195 tgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcat 45294  T
Q  101 caacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45295 caacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 54581 - 54755
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  54581 tgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcat 54680  T
Q  101 caacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54681 caacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 202 - 438
Alignment:
Q  3 aaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatca 102  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 301  T
Q  103 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgctt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| || ||||    
T  302 acccattttcatataacatgag-caatgcaaa-at--tacatgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgctt 397  T
Q  203 caattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    ||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||    
T  398 caattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17111
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacctaaattgattcctcaagct 242  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 17142  T
Q  243 ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  17141 ttcctttcaacactcctgtgcttctcttcac 17111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 3581 - 3711
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  3581 aacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaa 3680  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3681 cccattttcataaaacatgagaaaatgcaaa 3711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9433 - 9266
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  9433 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 9334  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9333 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 9266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16331 - 16164
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  16331 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 16232  T
Q  104 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16231 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 16164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23839 - 23618
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||  | || || | | ||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  23839 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataagaaacaa-caacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcat 23741  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||| |||||    
T  23740 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaacccccttaacttagaagaagattaacccaaactcttgc 23641  T
Q  201 ttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  23640 ttcaattcagttcctaagtcacc 23618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 3
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  87 tgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 7375 - 7547
Alignment:
Q  1 tgaaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  7375 tgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagcaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcat 7473  T
Q  101 caacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  7474 caacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  70 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  169 tacctt 174  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  99 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 782
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| | ||| |     
T  1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
Q  104 cccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgct 201  Q
    | || || ||||||||||  |||||  || ||||  || | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| |    
T  952 cacaatt-catacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgat 856  T
Q  202 tcaattcagctcct-aggtcacctaaattgattcctcaagct-ttccctgcaacactcttgttcttctcttcac 273  Q
    |||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  855 tcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaaaatccttgttcttctcttcac 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 5949
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| | ||| |     
T  6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
Q  104 cccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttga-agatgattattcctaacccttgc 200  Q
    | || || ||||||||||  |||||  |||||||  || | |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||    
T  6060 cacaatt-catacaacatttgagaatttgcaaag--tgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataga-gattaatcctaactcttgc 5965  T
Q  201 ttcaattcagctccta 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  5964 ttcaattcagctccta 5949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154300
Alignment:
Q  150 tgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacc 154300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 56196 - 56105
Alignment:
Q  3 aaacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 94  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56196 aaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34450 - 34374
Alignment:
Q  100 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 174  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34450 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Original strand, 41815 - 41905
Alignment:
Q  4 aacatgtaatttcacccataaacatatcataatcataaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 94  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41815 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 41905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 22833 - 22930
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  22833 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 22930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 27088 - 27185
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  27088 catgaaaaattgcaaagaaggaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 27185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1552 - 1455
Alignment:
Q  119 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 216  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  1552 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 175
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  143 atgattatgataataactaacccccttaccttt 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6927 times since January 2019
Visitors: 9355