View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0157_low_16 (Length: 345)

Name: NF0157_low_16
Description: NF0157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0157_low_16
NF0157_low_16
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (1-325)||(25421532-25421856)
chr5 (2-325)||(25431395-25431717)
chr5 (1-325)||(24493569-24493892)
chr5 (1-325)||(23390294-23390617)
chr5 (1-325)||(13025311-13025634)
chr5 (1-325)||(13095495-13095818)
chr5 (1-325)||(8286640-8286964)
chr5 (1-322)||(24529223-24529544)
chr5 (1-325)||(9077952-9078276)
chr5 (1-325)||(1096467-1096791)
chr5 (1-325)||(22075018-22075342)
chr5 (1-325)||(21292768-21293090)
chr5 (158-325)||(21808343-21808510)
chr5 (158-325)||(21729018-21729185)
chr5 (1-221)||(21985944-21986164)
chr5 (159-322)||(42245365-42245527)
chr5 (114-311)||(18418594-18418789)
chr5 (217-325)||(21997547-21997655)
chr5 (159-322)||(264768-264930)
chr5 (159-322)||(39363384-39363546)
chr5 (176-322)||(10732957-10733102)
chr5 (121-322)||(22412187-22412377)
chr5 (159-322)||(20909012-20909174)
chr5 (159-322)||(29329934-29330096)
chr5 (159-322)||(29345980-29346142)
chr5 (159-322)||(32027393-32027555)
chr5 (176-322)||(39245136-39245281)
chr5 (159-322)||(36154783-36154942)
chr5 (178-322)||(11581218-11581361)
chr5 (171-323)||(17517168-17517320)
chr5 (159-322)||(29348453-29348615)
chr5 (159-322)||(29350926-29351088)
chr5 (34-306)||(22144068-22144341)
chr5 (210-322)||(20902060-20902172)
chr5 (210-322)||(2154665-2154776)
chr5 (214-322)||(31061068-31061175)
chr5 (159-319)||(18319033-18319193)
chr5 (1-188)||(22107171-22107357)
chr5 (159-322)||(10775675-10775838)
chr5 (214-322)||(38619434-38619541)
chr5 (146-321)||(21873254-21873426)
chr5 (214-321)||(23064512-23064618)
chr5 (228-322)||(20918017-20918110)
chr5 (150-276)||(18356364-18356488)
chr5 (147-318)||(37723910-37724080)
chr5 (249-325)||(19660879-19660956)
chr5 (249-325)||(21329541-21329618)
chr5 (214-319)||(24067110-24067214)
chr5 (150-276)||(20910745-20910869)
chr5 (202-325)||(21502154-21502277)
chr5 (207-306)||(20026942-20027043)
chr5 (199-321)||(21565546-21565668)
chr5 (249-321)||(22959576-22959649)
chr5 (179-259)||(20766095-20766174)
chr5 (227-325)||(36314577-36314675)
chr5 (147-321)||(22032323-22032492)
chr5 (116-325)||(40725853-40726063)
chr5 (206-325)||(26012037-26012154)
chr5 (236-321)||(26704075-26704160)
chr5 (236-321)||(26973808-26973893)
chr5 (147-321)||(18769947-18770118)
chr5 (251-321)||(23501402-23501472)
chr5 (249-325)||(19668898-19668975)
chr5 (236-321)||(23201360-23201445)
chr5 (206-306)||(22178221-22178323)
chr5 (148-321)||(23572084-23572254)
chr5 (268-322)||(20806850-20806904)
chr5 (236-321)||(14079149-14079234)
chr5 (257-298)||(20805575-20805616)
chr5 (256-309)||(26732884-26732937)
chr5 (206-276)||(29448052-29448123)
chr5 (258-298)||(20766997-20767037)
chr5 (176-324)||(24767518-24767665)
chr5 (262-298)||(26680605-26680641)
chr5 (262-298)||(26952212-26952248)
chr5 (262-321)||(21366722-21366781)
chr5 (34-89)||(36154658-36154713)
chr5 (256-306)||(26740697-26740747)
chr5 (273-313)||(26742806-26742847)
chr5 (262-298)||(123363-123399)
chr5 (262-298)||(12028623-12028659)
chr5 (262-298)||(17919209-17919245)
chr5 (262-298)||(22757148-22757184)
chr5 (262-298)||(23535637-23535673)
chr5 (262-298)||(31342170-31342206)
[»] chr2 (74 HSPs)
chr2 (1-325)||(23076442-23076765)
chr2 (20-325)||(23060513-23060815)
chr2 (1-325)||(22737978-22738300)
chr2 (1-325)||(22731031-22731355)
chr2 (1-325)||(22337115-22337439)
chr2 (1-325)||(23660023-23660346)
chr2 (1-325)||(23285865-23286184)
chr2 (5-325)||(23654188-23654507)
chr2 (1-322)||(298612-298933)
chr2 (1-325)||(37914-38235)
chr2 (1-325)||(20309108-20309428)
chr2 (159-322)||(22105412-22105575)
chr2 (159-319)||(21155060-21155219)
chr2 (159-322)||(18808943-18809105)
chr2 (159-322)||(23130862-23131024)
chr2 (159-322)||(23133329-23133491)
chr2 (159-322)||(23709532-23709694)
chr2 (159-322)||(23712013-23712175)
chr2 (159-322)||(26505379-26505541)
chr2 (159-322)||(26507857-26508019)
chr2 (159-322)||(34402522-34402684)
chr2 (159-322)||(39682313-39682475)
chr2 (176-322)||(23135590-23135735)
chr2 (1-167)||(27753733-27753898)
chr2 (159-324)||(32214921-32215085)
chr2 (159-322)||(571397-571559)
chr2 (159-322)||(6725995-6726157)
chr2 (159-322)||(24367774-24367936)
chr2 (34-325)||(23708448-23708738)
chr2 (159-322)||(24898195-24898358)
chr2 (159-322)||(24900678-24900841)
chr2 (159-322)||(24903155-24903318)
chr2 (159-322)||(24905632-24905795)
chr2 (159-322)||(24908107-24908270)
chr2 (171-318)||(25616192-25616339)
chr2 (159-322)||(32039498-32039660)
chr2 (159-322)||(28577099-28577261)
chr2 (1-306)||(32451727-32452031)
chr2 (176-322)||(45029871-45030016)
chr2 (159-320)||(43137301-43137461)
chr2 (146-321)||(22799068-22799243)
chr2 (199-320)||(28405981-28406103)
chr2 (210-322)||(24529580-24529691)
chr2 (146-321)||(23019648-23019823)
chr2 (156-325)||(23103348-23103516)
chr2 (159-322)||(38967374-38967537)
chr2 (248-325)||(8946657-8946734)
chr2 (143-325)||(19671830-19672010)
chr2 (262-325)||(23040247-23040310)
chr2 (199-321)||(25175854-25175976)
chr2 (202-321)||(7679589-7679707)
chr2 (243-319)||(24643034-24643109)
chr2 (249-324)||(22134251-22134326)
chr2 (227-325)||(23071972-23072070)
chr2 (178-295)||(7707-7824)
chr2 (176-298)||(25963688-25963809)
chr2 (146-321)||(22740902-22741081)
chr2 (176-321)||(21916071-21916215)
chr2 (206-306)||(23207296-23207398)
chr2 (257-321)||(40622263-40622327)
chr2 (249-310)||(18786947-18787009)
chr2 (34-84)||(19672068-19672118)
chr2 (121-306)||(20520109-20520295)
chr2 (236-321)||(22758751-22758836)
chr2 (255-304)||(23287384-23287433)
chr2 (159-236)||(24642856-24642933)
chr2 (262-298)||(24655396-24655432)
chr2 (262-298)||(24869903-24869939)
chr2 (262-298)||(25961592-25961628)
chr2 (256-304)||(26392403-26392451)
chr2 (248-306)||(22413181-22413240)
chr2 (262-321)||(22811969-22812028)
chr2 (236-298)||(23038054-23038116)
chr2 (262-298)||(24174823-24174859)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-322)||(22886-23206)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (1-325)||(18818207-18818530)
chr8 (1-325)||(23406379-23406704)
chr8 (1-325)||(21923726-21924049)
chr8 (1-325)||(20536208-20536531)
chr8 (1-325)||(22626736-22627059)
chr8 (6-325)||(7372778-7373088)
chr8 (11-324)||(28648851-28649164)
chr8 (1-324)||(23648554-23648877)
chr8 (1-325)||(18879035-18879352)
chr8 (1-325)||(21918798-21919121)
chr8 (1-328)||(6759255-6759580)
chr8 (1-325)||(16092138-16092463)
chr8 (1-325)||(22875065-22875389)
chr8 (2-325)||(31971257-31971577)
chr8 (1-325)||(45130796-45131117)
chr8 (1-325)||(16199444-16199765)
chr8 (159-322)||(14409444-14409606)
chr8 (159-322)||(1484402-1484564)
chr8 (159-322)||(5853292-5853454)
chr8 (159-318)||(16413316-16413474)
chr8 (159-322)||(20403227-20403389)
chr8 (159-322)||(22001753-22001915)
chr8 (171-323)||(18678069-18678221)
chr8 (171-323)||(32121734-32121886)
chr8 (159-322)||(15203231-15203393)
chr8 (159-322)||(41598188-41598350)
chr8 (159-322)||(4483281-4483442)
chr8 (159-322)||(4542373-4542535)
chr8 (159-322)||(20046195-20046357)
chr8 (1-187)||(25362938-25363123)
chr8 (159-322)||(19896265-19896430)
chr8 (159-324)||(26223917-26224081)
chr8 (179-322)||(26219717-26219858)
chr8 (34-318)||(13507914-13508199)
chr8 (122-325)||(21389371-21389571)
chr8 (122-325)||(21778697-21778897)
chr8 (159-322)||(14823774-14823935)
chr8 (121-325)||(21395900-21396101)
chr8 (121-325)||(21790393-21790594)
chr8 (142-321)||(23776773-23776952)
chr8 (179-322)||(26225268-26225409)
chr8 (34-318)||(13597446-13597731)
chr8 (214-328)||(19937061-19937174)
chr8 (159-318)||(45290694-45290853)
chr8 (214-309)||(15070571-15070665)
chr8 (199-325)||(38855246-38855372)
chr8 (159-322)||(25484275-25484430)
chr8 (202-325)||(6520368-6520491)
chr8 (143-306)||(20498581-20498744)
chr8 (116-306)||(19801339-19801527)
chr8 (227-325)||(17140916-17141014)
chr8 (228-325)||(21490995-21491092)
chr8 (210-325)||(5866280-5866395)
chr8 (206-321)||(21285601-21285716)
chr8 (153-325)||(17612059-17612231)
chr8 (207-310)||(983407-983512)
chr8 (254-321)||(23760893-23760961)
chr8 (148-298)||(20465982-20466132)
chr8 (199-313)||(21673716-21673830)
chr8 (236-321)||(17353975-17354060)
chr8 (249-321)||(26355742-26355815)
chr8 (176-321)||(30643264-30643408)
chr8 (143-306)||(37116366-37116530)
chr8 (176-298)||(16410226-16410347)
chr8 (275-325)||(21249384-21249434)
chr8 (275-325)||(21255222-21255272)
chr8 (122-299)||(17439423-17439602)
chr8 (176-298)||(17926678-17926799)
chr8 (206-306)||(24353039-24353140)
chr8 (202-299)||(19154883-19154982)
chr8 (257-321)||(21162111-21162175)
chr8 (257-321)||(21168784-21168848)
chr8 (255-299)||(22963464-22963508)
chr8 (257-321)||(24755714-24755778)
chr8 (262-298)||(39094982-39095018)
chr8 (1-89)||(41598420-41598508)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (1-325)||(22532269-22532593)
chr1 (1-324)||(50210010-50210333)
chr1 (1-322)||(34509783-34510104)
chr1 (1-325)||(27250527-27250850)
chr1 (1-325)||(21026680-21027003)
chr1 (2-324)||(20135188-20135510)
chr1 (1-248)||(22354370-22354616)
chr1 (121-324)||(22468614-22468816)
chr1 (4-213)||(22355974-22356184)
chr1 (4-213)||(22357660-22357870)
chr1 (143-322)||(23593719-23593897)
chr1 (159-322)||(13988866-13989028)
chr1 (159-322)||(21923291-21923453)
chr1 (1-325)||(38801189-38801508)
chr1 (159-325)||(45574842-45575008)
chr1 (1-322)||(433012-433331)
chr1 (159-322)||(21475087-21475249)
chr1 (159-322)||(31612313-31612475)
chr1 (159-322)||(16275363-16275526)
chr1 (159-323)||(21840766-21840929)
chr1 (159-322)||(29298137-29298298)
chr1 (159-322)||(29776688-29776850)
chr1 (143-324)||(16361915-16362095)
chr1 (142-321)||(21787980-21788159)
chr1 (225-325)||(20847175-20847275)
chr1 (143-306)||(21896195-21896358)
chr1 (214-325)||(13212917-13213027)
chr1 (214-328)||(15860064-15860177)
chr1 (214-328)||(21342090-21342203)
chr1 (34-322)||(21346961-21347249)
chr1 (196-322)||(21707167-21707292)
chr1 (196-322)||(21711709-21711834)
chr1 (159-322)||(22123067-22123230)
chr1 (34-310)||(16758664-16758942)
chr1 (214-319)||(40389157-40389261)
chr1 (144-306)||(21861510-21861672)
chr1 (199-321)||(33681011-33681133)
chr1 (150-276)||(33797570-33797694)
chr1 (257-324)||(20454606-20454673)
chr1 (199-321)||(22921864-22921986)
chr1 (1-70)||(20847017-20847085)
chr1 (206-318)||(21754052-21754163)
chr1 (210-321)||(20248283-20248394)
chr1 (121-187)||(48603652-48603718)
chr1 (236-321)||(21714546-21714631)
chr1 (210-325)||(14295557-14295672)
chr1 (122-306)||(35260998-35261180)
chr1 (199-321)||(22237631-22237753)
chr1 (176-321)||(18182093-18182237)
chr1 (236-321)||(42865245-42865330)
chr1 (210-309)||(20918620-20918719)
chr1 (264-321)||(21161720-21161778)
chr1 (206-306)||(50614117-50614219)
chr1 (206-306)||(50621945-50622047)
chr1 (34-84)||(21342334-21342384)
chr1 (206-306)||(41050036-41050138)
chr1 (249-310)||(52928014-52928076)
chr1 (261-321)||(20091533-20091593)
chr1 (206-306)||(16368287-16368388)
chr1 (262-324)||(24783150-24783212)
chr1 (262-298)||(3472980-3473016)
chr1 (262-298)||(3705122-3705158)
chr1 (262-298)||(18394023-18394059)
chr1 (257-321)||(21022631-21022695)
chr1 (262-298)||(45310426-45310462)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-325)||(38761-39084)
scaffold0145 (121-325)||(32942-33145)
scaffold0145 (210-327)||(9744-9860)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (1-325)||(26686887-26687210)
chr3 (1-321)||(14576630-14576949)
chr3 (1-325)||(43840932-43841255)
chr3 (1-325)||(13442274-13442597)
chr3 (1-325)||(23083159-23083482)
chr3 (1-325)||(17487856-17488180)
chr3 (1-325)||(18438534-18438858)
chr3 (1-325)||(25476182-25476506)
chr3 (1-325)||(20698234-20698556)
chr3 (19-325)||(17499338-17499643)
chr3 (1-325)||(14972854-14973178)
chr3 (1-312)||(14572602-14572912)
chr3 (1-322)||(40213518-40213838)
chr3 (1-325)||(11424560-11424880)
chr3 (34-307)||(42386428-42386702)
chr3 (121-322)||(24153126-24153326)
chr3 (1-325)||(12399209-12399529)
chr3 (27-310)||(30029855-30030136)
chr3 (159-322)||(16454281-16454443)
chr3 (143-322)||(29172567-29172745)
chr3 (159-322)||(9707607-9707769)
chr3 (159-322)||(17463178-17463340)
chr3 (159-322)||(34159326-34159488)
chr3 (159-322)||(45606907-45607069)
chr3 (159-322)||(55476491-55476653)
chr3 (176-322)||(28848628-28848773)
chr3 (159-322)||(7781347-7781509)
chr3 (159-322)||(8899094-8899256)
chr3 (159-322)||(17672626-17672788)
chr3 (159-322)||(38961891-38962053)
chr3 (159-322)||(13151790-13151953)
chr3 (159-322)||(13154255-13154418)
chr3 (159-323)||(13544024-13544187)
chr3 (171-323)||(46822267-46822419)
chr3 (159-322)||(6469134-6469296)
chr3 (159-322)||(10247723-10247885)
chr3 (159-318)||(12567564-12567722)
chr3 (159-322)||(17446655-17446816)
chr3 (179-322)||(36166598-36166739)
chr3 (208-322)||(55500942-55501055)
chr3 (147-323)||(12511059-12511236)
chr3 (159-320)||(16282811-16282971)
chr3 (178-325)||(43550497-43550644)
chr3 (159-322)||(50242822-50242984)
chr3 (159-320)||(41123892-41124049)
chr3 (34-307)||(23274705-23274979)
chr3 (159-306)||(53070653-53070799)
chr3 (196-322)||(15977515-15977640)
chr3 (214-322)||(12119780-12119887)
chr3 (214-322)||(15412429-15412536)
chr3 (179-311)||(21618460-21618590)
chr3 (1-187)||(16796685-16796870)
chr3 (225-322)||(44494809-44494905)
chr3 (214-322)||(8499518-8499625)
chr3 (116-325)||(24340634-24340844)
chr3 (34-306)||(52523557-52523831)
chr3 (206-322)||(10556985-10557101)
chr3 (181-322)||(53301527-53301669)
chr3 (210-325)||(13210333-13210448)
chr3 (143-322)||(27165250-27165429)
chr3 (225-322)||(17737236-17737335)
chr3 (202-325)||(14234487-14234610)
chr3 (206-321)||(15470928-15471043)
chr3 (199-321)||(16103784-16103905)
chr3 (116-325)||(37642176-37642386)
chr3 (249-321)||(12174303-12174376)
chr3 (206-318)||(32307684-32307795)
chr3 (179-321)||(856140-856280)
chr3 (199-321)||(16097332-16097454)
chr3 (121-187)||(14179570-14179636)
chr3 (249-321)||(49668120-49668193)
chr3 (176-324)||(14665398-14665545)
chr3 (176-324)||(14668554-14668701)
chr3 (257-321)||(23077530-23077594)
chr3 (176-298)||(11298500-11298621)
chr3 (261-322)||(28194693-28194755)
chr3 (249-321)||(9512924-9512997)
chr3 (249-321)||(9520899-9520972)
chr3 (269-322)||(45577947-45578000)
chr3 (143-243)||(2051138-2051238)
chr3 (236-321)||(15878083-15878168)
chr3 (236-321)||(17525190-17525275)
chr3 (257-321)||(14878569-14878633)
chr3 (178-298)||(19725886-19726004)
chr3 (206-306)||(37251168-37251270)
chr3 (206-306)||(43925977-43926079)
chr3 (249-318)||(1644718-1644787)
chr3 (236-321)||(23408428-23408513)
chr3 (262-298)||(3389994-3390030)
chr3 (206-306)||(22110352-22110454)
chr3 (146-325)||(22147467-22147646)
chr3 (273-321)||(26196500-26196548)
chr3 (262-321)||(12172796-12172855)
chr3 (176-298)||(12496280-12496402)
chr3 (262-321)||(18383973-18384032)
chr3 (34-89)||(53070528-53070583)
chr3 (202-306)||(12377940-12378046)
chr3 (256-298)||(15051531-15051573)
chr3 (256-298)||(15060307-15060349)
chr3 (150-298)||(11862816-11862964)
chr3 (272-321)||(12038019-12038068)
chr3 (255-304)||(13919350-13919399)
chr3 (262-298)||(1982868-1982904)
chr3 (34-78)||(2051029-2051073)
chr3 (262-298)||(2897873-2897909)
chr3 (262-298)||(3403014-3403050)
chr3 (262-298)||(11595197-11595233)
chr3 (257-317)||(23053140-23053200)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-325)||(51913-52235)
scaffold0011 (1-325)||(167777-168099)
[»] chr4 (81 HSPs)
chr4 (1-325)||(16239767-16240090)
chr4 (1-325)||(44052829-44053152)
chr4 (1-325)||(12902757-12903080)
chr4 (1-325)||(7893703-7894024)
chr4 (1-322)||(16377319-16377639)
chr4 (1-323)||(22636437-22636757)
chr4 (1-320)||(14038653-14038972)
chr4 (1-325)||(7088877-7089200)
chr4 (121-325)||(16270153-16270356)
chr4 (142-325)||(7798774-7798957)
chr4 (1-318)||(23374157-23374473)
chr4 (153-325)||(6899891-6900062)
chr4 (1-325)||(14053100-14053422)
chr4 (200-325)||(52873363-52873488)
chr4 (1-322)||(44928720-44929042)
chr4 (159-322)||(18215274-18215436)
chr4 (179-322)||(54798729-54798872)
chr4 (159-322)||(12307-12469)
chr4 (143-322)||(1837494-1837671)
chr4 (159-322)||(15118352-15118514)
chr4 (159-322)||(52312510-52312672)
chr4 (1-187)||(17047870-17048055)
chr4 (159-328)||(19242693-19242861)
chr4 (159-324)||(19618172-19618336)
chr4 (159-322)||(3515007-3515169)
chr4 (199-322)||(14280316-14280438)
chr4 (159-322)||(23803265-23803427)
chr4 (159-322)||(44615288-44615450)
chr4 (159-322)||(44773087-44773249)
chr4 (159-322)||(50222339-50222501)
chr4 (176-322)||(18239436-18239581)
chr4 (1-210)||(3096759-3096966)
chr4 (34-322)||(44102214-44102501)
chr4 (159-322)||(51463868-51464030)
chr4 (159-318)||(15355324-15355483)
chr4 (239-325)||(3096293-3096379)
chr4 (179-324)||(14970727-14970871)
chr4 (159-322)||(12610950-12611105)
chr4 (116-325)||(15367690-15367899)
chr4 (116-325)||(15402703-15402912)
chr4 (116-310)||(52243105-52243302)
chr4 (95-325)||(17046487-17046714)
chr4 (143-306)||(13790-13953)
chr4 (179-322)||(8574844-8574985)
chr4 (214-325)||(15370018-15370128)
chr4 (214-325)||(15371202-15371312)
chr4 (214-325)||(15373483-15373593)
chr4 (176-306)||(21815602-21815731)
chr4 (159-322)||(7641192-7641344)
chr4 (4-306)||(6190481-6190782)
chr4 (1-128)||(15091093-15091220)
chr4 (146-321)||(15093775-15093950)
chr4 (214-325)||(16223532-16223642)
chr4 (214-319)||(20149832-20149936)
chr4 (159-323)||(22353835-22353999)
chr4 (143-310)||(43198492-43198661)
chr4 (1-69)||(7798953-7799020)
chr4 (254-325)||(15551817-15551889)
chr4 (202-325)||(39706286-39706409)
chr4 (150-276)||(43256106-43256230)
chr4 (249-321)||(12774011-12774084)
chr4 (207-310)||(12288211-12288316)
chr4 (176-298)||(16356924-16357045)
chr4 (249-321)||(8846360-8846433)
chr4 (176-321)||(16488050-16488194)
chr4 (148-321)||(15121747-15121917)
chr4 (176-298)||(16348636-16348757)
chr4 (262-324)||(20157517-20157579)
chr4 (236-321)||(13569502-13569587)
chr4 (176-321)||(13812991-13813135)
chr4 (262-298)||(11250619-11250655)
chr4 (262-298)||(15353365-15353401)
chr4 (261-321)||(23843478-23843538)
chr4 (176-250)||(15464903-15464977)
chr4 (121-165)||(14280462-14280507)
chr4 (121-161)||(54798680-54798721)
chr4 (257-321)||(12570014-12570078)
chr4 (227-290)||(16596683-16596746)
chr4 (262-298)||(25555503-25555539)
chr4 (206-306)||(46640456-46640558)
chr4 (34-90)||(52243023-52243079)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (1-325)||(9509189-9509512)
chr7 (2-325)||(12698831-12699154)
chr7 (1-325)||(38227481-38227804)
chr7 (1-322)||(3564161-3564482)
chr7 (1-325)||(10589039-10589361)
chr7 (1-325)||(26211995-26212319)
chr7 (121-322)||(18456330-18456530)
chr7 (1-325)||(16386045-16386369)
chr7 (1-323)||(40443393-40443712)
chr7 (1-310)||(15143834-15144143)
chr7 (1-325)||(27847631-27847951)
chr7 (159-325)||(13647325-13647491)
chr7 (143-322)||(16213684-16213861)
chr7 (206-322)||(48273392-48273508)
chr7 (159-322)||(456321-456483)
chr7 (159-322)||(11972496-11972658)
chr7 (159-322)||(14949122-14949284)
chr7 (159-322)||(15376713-15376875)
chr7 (159-322)||(16232520-16232682)
chr7 (159-322)||(18640272-18640434)
chr7 (159-322)||(20385123-20385285)
chr7 (159-322)||(21189595-21189757)
chr7 (159-322)||(32125491-32125653)
chr7 (159-322)||(41522917-41523079)
chr7 (159-322)||(41525379-41525541)
chr7 (34-325)||(2279948-2280238)
chr7 (159-321)||(11393287-11393448)
chr7 (159-325)||(18430709-18430874)
chr7 (176-318)||(24275175-24275316)
chr7 (179-322)||(16410059-16410201)
chr7 (159-322)||(24702238-24702400)
chr7 (159-322)||(27216860-27217022)
chr7 (159-322)||(44116509-44116671)
chr7 (156-321)||(14932685-14932851)
chr7 (156-321)||(15356120-15356286)
chr7 (156-321)||(15360234-15360400)
chr7 (179-322)||(3386333-3386475)
chr7 (159-322)||(24704688-24704847)
chr7 (214-322)||(13869346-13869453)
chr7 (116-322)||(17061872-17062077)
chr7 (196-322)||(13831373-13831498)
chr7 (142-322)||(20110556-20110724)
chr7 (159-318)||(38898376-38898535)
chr7 (206-325)||(67745-67864)
chr7 (206-325)||(22072913-22073033)
chr7 (210-325)||(34200786-34200901)
chr7 (227-325)||(28505321-28505419)
chr7 (149-298)||(15211484-15211633)
chr7 (159-259)||(26355983-26356083)
chr7 (159-259)||(26358435-26358535)
chr7 (159-286)||(12756671-12756797)
chr7 (199-321)||(18005650-18005772)
chr7 (202-321)||(811129-811248)
chr7 (202-321)||(16219715-16219834)
chr7 (210-325)||(16495402-16495517)
chr7 (202-325)||(47831807-47831930)
chr7 (116-325)||(19486655-19486865)
chr7 (116-310)||(1867907-1868101)
chr7 (195-276)||(2530129-2530208)
chr7 (228-325)||(11996051-11996148)
chr7 (212-321)||(44014182-44014291)
chr7 (147-321)||(17138006-17138177)
chr7 (236-319)||(18154873-18154956)
chr7 (196-325)||(10063810-10063939)
chr7 (206-310)||(16056343-16056446)
chr7 (257-321)||(12187019-12187083)
chr7 (210-325)||(15754893-15755008)
chr7 (262-324)||(2832499-2832561)
chr7 (34-298)||(12255621-12255887)
chr7 (148-298)||(12321685-12321835)
chr7 (121-299)||(15008415-15008594)
chr7 (236-321)||(9703263-9703348)
chr7 (236-321)||(19649521-19649606)
chr7 (262-298)||(9446216-9446252)
chr7 (262-298)||(20569654-20569690)
chr7 (257-321)||(32216601-32216665)
chr7 (262-321)||(9751812-9751871)
chr7 (34-89)||(12756546-12756601)
chr7 (248-310)||(12901338-12901401)
chr7 (255-306)||(18203831-18203882)
chr7 (262-321)||(39267957-39268016)
chr7 (272-321)||(14429883-14429932)
chr7 (121-165)||(48273538-48273583)
chr7 (255-310)||(14044761-14044817)
chr7 (255-310)||(14354791-14354847)
chr7 (34-78)||(17061790-17061834)
chr7 (262-298)||(42204017-42204053)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-325)||(8330-8650)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-325)||(13211-13534)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-325)||(39913-40236)
scaffold0080 (146-298)||(18597-18749)
scaffold0080 (206-306)||(19885-19987)
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (1-325)||(20360758-20361081)
chr6 (1-325)||(29060540-29060864)
chr6 (3-325)||(17287596-17287917)
chr6 (1-325)||(25629152-25629476)
chr6 (2-325)||(20638082-20638404)
chr6 (1-325)||(22780025-22780348)
chr6 (9-324)||(18409632-18409947)
chr6 (1-325)||(20593773-20594097)
chr6 (1-325)||(19303338-19303661)
chr6 (158-325)||(16496244-16496411)
chr6 (158-325)||(20076700-20076863)
chr6 (1-325)||(16920431-16920751)
chr6 (159-324)||(34963371-34963535)
chr6 (159-322)||(12742317-12742479)
chr6 (159-322)||(18334592-18334754)
chr6 (159-322)||(19005046-19005208)
chr6 (159-322)||(19858919-19859081)
chr6 (159-322)||(22782227-22782389)
chr6 (159-322)||(24422547-24422709)
chr6 (179-322)||(25688502-25688644)
chr6 (159-322)||(33861794-33861956)
chr6 (159-322)||(33864278-33864440)
chr6 (176-322)||(1540928-1541073)
chr6 (159-324)||(30676710-30676874)
chr6 (159-322)||(2291180-2291342)
chr6 (159-322)||(8055029-8055191)
chr6 (159-322)||(25754809-25754971)
chr6 (159-322)||(26924640-26924802)
chr6 (34-310)||(25644335-25644613)
chr6 (179-322)||(25656629-25656771)
chr6 (178-322)||(1595549-1595692)
chr6 (116-306)||(18456735-18456924)
chr6 (159-322)||(3852017-3852179)
chr6 (176-306)||(18461895-18462024)
chr6 (150-325)||(35245586-35245758)
chr6 (159-319)||(16448526-16448686)
chr6 (210-322)||(20556943-20557054)
chr6 (1-325)||(22831503-22831825)
chr6 (171-323)||(23992429-23992578)
chr6 (121-298)||(15041468-15041644)
chr6 (198-323)||(19847989-19848114)
chr6 (143-325)||(20109140-20109322)
chr6 (153-306)||(18821795-18821946)
chr6 (121-298)||(25603302-25603478)
chr6 (124-298)||(25611643-25611816)
chr6 (249-325)||(27333262-27333339)
chr6 (249-325)||(27394002-27394079)
chr6 (116-325)||(8227422-8227632)
chr6 (1-84)||(18821617-18821699)
chr6 (264-325)||(25714417-25714478)
chr6 (150-276)||(27415887-27416011)
chr6 (210-325)||(28496477-28496592)
chr6 (210-325)||(29808888-29809003)
chr6 (176-298)||(21766718-21766839)
chr6 (206-325)||(23019408-23019525)
chr6 (206-321)||(19652199-19652313)
chr6 (176-321)||(18907111-18907255)
chr6 (236-321)||(19873120-19873205)
chr6 (236-321)||(22432249-22432334)
chr6 (236-321)||(22438799-22438884)
chr6 (210-325)||(1561303-1561418)
chr6 (248-310)||(9098557-9098620)
chr6 (207-310)||(19668386-19668491)
chr6 (146-321)||(25642125-25642304)
chr6 (236-321)||(19862978-19863063)
chr6 (272-321)||(31155465-31155514)
chr6 (248-304)||(33443068-33443124)
chr6 (1-58)||(11185769-11185825)
chr6 (254-313)||(4185870-4185930)
chr6 (262-298)||(19790837-19790873)
chr6 (261-321)||(22334954-22335014)
chr6 (262-321)||(16523441-16523500)
chr6 (278-325)||(22080799-22080846)
chr6 (176-306)||(11185524-11185652)
chr6 (28-84)||(18456956-18457013)
chr6 (257-321)||(15894491-15894555)
chr6 (262-298)||(20908039-20908075)
chr6 (262-298)||(27553629-27553665)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-325)||(343-666)
scaffold0292 (1-325)||(3470-3793)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-325)||(1851-2174)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (7-325)||(25896-26213)
scaffold0026 (1-325)||(39858-40180)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (25-325)||(2974-3271)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-273)||(13144-13415)
scaffold0175 (250-325)||(34123-34199)
scaffold0175 (269-325)||(273-329)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-307)||(24099-24406)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-325)||(8479-8798)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (1-324)||(17012-17337)
scaffold0056 (123-306)||(79248-79430)
scaffold0056 (257-321)||(14139-14203)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (9-325)||(5927-6245)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-318)||(25862-26179)
scaffold0122 (1-188)||(33292-33479)
scaffold0122 (179-322)||(44682-44825)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-323)||(39479-39800)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-323)||(75012-75333)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (1-322)||(339748-340065)
scaffold0003 (159-322)||(158450-158612)
scaffold0003 (150-276)||(71350-71474)
scaffold0003 (262-294)||(414108-414140)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-325)||(847-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (4-325)||(4508-4828)
scaffold0228 (4-325)||(12090-12410)
scaffold0228 (4-325)||(22042-22362)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-325)||(16397-16721)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-325)||(4849-5171)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (1-325)||(32756-33077)
scaffold0120 (1-325)||(45928-46249)
scaffold0120 (121-325)||(16113-16316)
scaffold0120 (2-78)||(16334-16410)
scaffold0120 (264-325)||(17389-17450)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-325)||(20910-21234)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-325)||(1952-2275)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (1-266)||(760-1021)
scaffold0395 (259-325)||(4888-4954)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-244)||(27911-28154)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (121-324)||(3103-3306)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-325)||(10224-10544)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-235)||(124675-124908)
scaffold0021 (147-324)||(174767-174943)
scaffold0021 (256-325)||(121766-121835)
scaffold0021 (207-306)||(136370-136471)
scaffold0021 (207-306)||(145078-145179)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-325)||(15263-15584)
scaffold0114 (257-321)||(7295-7359)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-325)||(13497-13818)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-325)||(4712-5035)
scaffold0358 (1-260)||(1-259)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-325)||(32067-32387)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (13-304)||(4545-4835)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-266)||(6669-6933)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (195-325)||(28414-28544)
scaffold0046 (210-325)||(11292-11407)
scaffold0046 (210-325)||(1997-2112)
scaffold0046 (272-325)||(4552-4605)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-325)||(16282-16602)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-325)||(850-1170)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (158-325)||(128751-128917)
scaffold0031 (34-306)||(20255-20524)
scaffold0031 (236-297)||(65830-65891)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-165)||(10323-10487)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-325)||(1289-1609)
scaffold0106 (1-325)||(7266-7586)
scaffold0106 (257-322)||(15291-15356)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-187)||(1052-1237)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (99-262)||(3424-3588)
scaffold0327 (262-321)||(289-348)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (159-322)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (159-322)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (159-322)||(94411-94573)
scaffold0023 (159-318)||(17440-17598)
scaffold0023 (176-322)||(44454-44600)
scaffold0023 (146-321)||(38421-38596)
scaffold0023 (198-321)||(100378-100501)
scaffold0023 (254-325)||(119875-119947)
scaffold0023 (199-321)||(40169-40291)
scaffold0023 (146-233)||(23608-23695)
scaffold0023 (249-321)||(101503-101576)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (176-322)||(13392-13537)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (159-324)||(11286-11450)
scaffold0029 (148-321)||(12763-12933)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (159-322)||(4694-4856)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (159-322)||(13947-14109)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-325)||(51582-51902)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (159-322)||(136680-136842)
scaffold0028 (159-322)||(139149-139311)
scaffold0028 (159-322)||(144087-144249)
scaffold0028 (159-322)||(134211-134373)
scaffold0028 (159-322)||(141618-141780)
scaffold0028 (199-323)||(62200-62321)
scaffold0028 (239-321)||(132662-132745)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (159-323)||(10772-10935)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (159-322)||(16784-16946)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (159-322)||(82072-82234)
scaffold0037 (199-310)||(22665-22776)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (159-318)||(501088-501246)
scaffold0001 (116-322)||(85536-85742)
scaffold0001 (199-321)||(160688-160809)
scaffold0001 (262-298)||(422589-422625)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (159-319)||(4300-4459)
scaffold0761 (176-321)||(6281-6425)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-325)||(46995-47309)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (3-166)||(3640-3802)
scaffold0165 (3-166)||(7704-7866)
scaffold0165 (116-310)||(27660-27855)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (159-322)||(40400-40562)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (159-324)||(12249-12413)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (2-306)||(51683-51985)
scaffold0034 (206-325)||(32538-32654)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (159-322)||(4214-4377)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (159-323)||(9241-9404)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (159-322)||(106-268)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (179-322)||(116430-116571)
scaffold0022 (206-306)||(128971-129072)
scaffold0022 (262-321)||(73824-73883)
scaffold0022 (206-299)||(78348-78442)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (203-325)||(11442-11564)
scaffold0235 (2-136)||(11312-11445)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-322)||(4929-5246)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (143-310)||(8481-8650)
scaffold0621 (199-325)||(6535-6661)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (160-321)||(29558-29720)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (179-308)||(29946-30074)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (159-322)||(12064-12220)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (6-146)||(17790-17929)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (34-306)||(13147-13421)
scaffold0357 (116-310)||(16011-16206)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-133)||(20595-20726)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (159-322)||(161089-161252)
scaffold0007 (116-242)||(164547-164674)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (143-325)||(11464-11646)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (116-325)||(17938-18148)
scaffold0247 (214-322)||(2184-2291)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (143-325)||(38195-38377)
scaffold0124 (262-321)||(42627-42686)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (146-321)||(4746-4921)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (214-319)||(1336-1440)
scaffold0101 (236-321)||(8995-9080)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (146-298)||(16291-16442)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (143-322)||(38641-38820)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (199-321)||(19268-19390)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (156-298)||(29117-29262)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (143-295)||(53488-53640)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (150-276)||(15362-15486)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (199-321)||(2801-2923)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (34-268)||(225465-225698)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (199-313)||(129917-130031)
scaffold0010 (121-299)||(60631-60811)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (199-321)||(14692-14814)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (210-322)||(15664-15776)
scaffold0261 (236-321)||(1339-1424)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (202-325)||(6121-6244)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (199-313)||(5655-5769)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (143-304)||(7998-8161)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (249-325)||(6611-6688)
scaffold0333 (249-325)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (249-325)||(15821-15898)
scaffold0020 (258-321)||(178898-178961)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (199-306)||(1051-1158)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (199-310)||(10536-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (143-306)||(12587-12749)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (210-325)||(1075-1190)
scaffold0184 (262-298)||(4284-4320)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (199-321)||(133-255)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (176-321)||(1881-2024)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (149-298)||(192920-193070)
scaffold0017 (262-298)||(15268-15304)
scaffold0017 (262-298)||(19790-19826)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (236-321)||(23843-23928)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (254-325)||(1083-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (202-325)||(12766-12889)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (257-321)||(10575-10639)
scaffold0297 (261-321)||(15736-15796)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (147-321)||(26828-26999)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (147-321)||(21749-21920)
scaffold0210 (147-321)||(29641-29812)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (254-321)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (202-321)||(12943-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (206-321)||(45794-45909)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (249-321)||(28813-28887)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (176-298)||(920-1041)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (176-298)||(1853-1974)
scaffold0104 (176-298)||(9536-9656)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (249-321)||(1086-1159)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (249-321)||(23927-24000)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (236-321)||(69794-69879)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (146-234)||(1169-1257)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (206-306)||(6284-6386)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (207-310)||(8075-8180)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (148-298)||(46670-46820)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (176-298)||(44104-44225)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (5-66)||(163-224)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (249-313)||(6824-6889)
scaffold0556 (206-250)||(8090-8134)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (176-321)||(159-304)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (206-310)||(10542-10646)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (236-321)||(18236-18321)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (255-304)||(206575-206624)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (257-321)||(6095-6159)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (206-310)||(25121-25226)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (227-321)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (258-321)||(36454-36517)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (148-321)||(4430-4603)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (264-306)||(11982-12024)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (260-298)||(4999-5037)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (176-321)||(393-537)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (206-299)||(38342-38437)
scaffold0139 (236-321)||(19980-20065)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (257-321)||(7870-7934)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (262-298)||(7328-7364)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (176-324)||(10015-10162)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (257-321)||(14664-14728)
scaffold0081 (257-321)||(23679-23743)
scaffold0081 (257-321)||(39103-39167)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (206-306)||(267679-267781)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (207-306)||(569-669)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (262-321)||(1494-1553)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (143-306)||(97024-97188)
scaffold0006 (143-306)||(106302-106466)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (176-298)||(2057-2178)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (176-298)||(6387-6508)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (199-268)||(2213-2281)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (1-74)||(1874-1947)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (176-237)||(13092-13153)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (262-298)||(8583-8619)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (262-298)||(7494-7530)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (262-298)||(2191-2227)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (262-298)||(35569-35605)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25421856 - 25421532
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  25421856 gcctcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagactta 25421757  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421756 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 25421657  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25421656 atttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 25421557  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25421556 tctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25431717 - 25431395
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||||||    
T  25431717 cctcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaa 25431618  T
Q  102 tgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25431617 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaaca 25431518  T
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25431517 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggt 25431418  T
Q  302 ctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  25431417 ctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24493892 - 24493569
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  24493892 gcctcgtgagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagactta 24493793  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || |||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24493792 ataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaat 24493693  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  24493692 atttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcgg 24493594  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24493593 tctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23390294 - 23390617
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  23390294 gcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagatttt-gtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagactta 23390392  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23390393 atgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat 23390492  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23390493 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23390592  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23390593 tctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13025634 - 13025311
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  13025634 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagactta 13025535  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13025534 atgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaat 13025435  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||     
T  13025434 atttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcgg 13025336  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13025335 tctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13095818 - 13095495
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  13095818 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagactta 13095719  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13095718 atgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaat 13095619  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||     
T  13095618 atttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcgg 13095520  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13095519 tctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8286640 - 8286964
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||    
T  8286640 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagactta 8286738  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  8286739 atgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgatt 8286838  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8286839 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 8286938  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  8286939 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24529544 - 24529223
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  24529544 gcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaactta 24529445  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| | || ||    
T  24529444 atgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtat 24529345  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  24529344 aattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 24529245  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24529244 tctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9078276 - 9077952
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  9078276 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagactta 9078177  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| | || ||    
T  9078176 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtat 9078077  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||      
T  9078076 aattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcag 9077977  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9077976 tctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1096791 - 1096467
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  1096791 gcctcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagactta 1096692  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || ||    
T  1096691 atgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtat 1096592  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1096591 atgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1096492  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  1096491 tctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22075342 - 22075018
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaa-caaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||  |||||    
T  22075342 gcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgacttgttag--ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagactt 22075245  T
Q  100 aatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||||| || |||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    || |||||    
T  22075244 aatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaa 22075145  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22075144 tatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcg 22075045  T
Q  300 atctaagttgatgaag-atgatgatgt 325  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075044 gtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 21292768 - 21293090
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | || ||| |||  ||||||    
T  21292768 gcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagactta 21292866  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || |||| |||| |||| | |||||||| ||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21292867 ataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtat 21292965  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaat--tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |  |||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21292966 acctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatc 21293063  T
Q  299 gatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||| || |||||||||||||||    
T  21293064 ggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  158 atgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  158 atgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    |||||||||| | || | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21985944 - 21986164
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||     
T  21985944 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttg 21986043  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| ||||  ||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||  ||| | |  ||    
T  21986044 atgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgagatatgaatttat 21986143  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttg 221  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  21986144 aatgaagatgttgttgacttg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18418789 - 18418594
Alignment:
Q  114 ttatgacctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 212  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  18418789 ttataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaagatgtt 18418691  T
Q  213 gttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgat 311  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18418690 g-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 217 - 325
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  217 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaaga 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  317 tgatgatgt 325  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Original strand, 10732957 - 10733102
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10732957 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 10733055  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10733056 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22412377 - 22412187
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  22412377 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 22412288  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22412287 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgat 22412189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39245281 - 39245136
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| ||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  39245281 tgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 39245183  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39245182 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Original strand, 11581218 - 11581361
Alignment:
Q  178 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 277  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11581218 cattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 11581316  T
Q  278 tttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11581317 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 323
Target Start/End: Original strand, 17517168 - 17517320
Alignment:
Q  171 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 270  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  17517168 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 17517267  T
Q  271 gttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  17517268 attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22144341 - 22144068
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||    ||  | ||||  ||| | ||||||||||||| ||||    
T  22144341 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgtt 22144242  T
Q  134 -taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
     |||||||  ||||||||| |||  |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22144241 ataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatatt 22144142  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
     |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22144141 gttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Original strand, 20902060 - 20902172
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttg 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20902060 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T
Q  310 -atgaagatgatga 322  Q
     || ||||||||||    
T  20902159 aattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Original strand, 2154665 - 2154776
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttg 309  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2154665 gttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2154763  T
Q  310 atgaagatgatga 322  Q
    || ||||||||||    
T  2154764 attaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061068
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 31061077  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  31061076 agatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22107171 - 22107357
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||  ||||||    
T  22107171 gcctcgcgagtgacccggaaatagagtgccttgtga-tactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagactta 22107269  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaa 188  Q
    |||| || |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||    
T  22107270 atgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619434
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 38619443  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  38619442 agatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21873426 - 21873254
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||   |  ||  ||||||||||| | ||||||||    
T  21873426 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaagatgttg---aaatgagattgatattatgaagtcatgct 21873330  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    | | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  21873329 gatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064512
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23064520  T
Q  314 agatgatg 321  Q
    ||||||||    
T  23064519 agatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 322
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  228 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  250 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37724080 - 37723910
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||| ||  | ||||||| || ||||||||||    
T  37724080 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgct 37723981  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  37723980 gtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24067214 - 24067110
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| |    
T  24067214 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgatta 24067116  T
Q  314 agatga 319  Q
    ||||||    
T  24067115 agatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| || ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||     
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  304 aag 306  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 259
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766174
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 259  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  227 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 246  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgat- 22032398  T
Q  247 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    | ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22032397 tgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40726063 - 40725853
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  40726063 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgt 40725964  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    | |||| |    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  40725963 ttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttga 40725865  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  40725864 agatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Original strand, 26012037 - 26012154
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26012037 agatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26012135  T
Q  305 agttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  26012136 agttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 321
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 245  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 18770042  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  18770043 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 321
Target Start/End: Original strand, 23501402 - 23501472
Alignment:
Q  251 tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23501402 tgtattctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668898
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201360
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatg 23201360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 22178221 - 22178323
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  22178221 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 22178319  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  22178320 taag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572084
Alignment:
Q  148 gttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-g 246  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | |    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattg 23572159  T
Q  247 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||   ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23572158 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  268 gctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14079234 - 14079149
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||    
T  14079234 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgattaagatgatg 14079149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  256 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttg 309  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29448123 - 29448052
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448123 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 24767518 - 24767665
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || || || ||  |||   |||  |||| |||| ||||    
T  24767518 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattataaagttatactattgatgtgatctgattatgctgctattgt 24767616  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||| |||| ||||||||||||    
T  24767617 tatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 24767665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 21366722 - 21366781
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  21366722 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21366781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 89
Target Start/End: Original strand, 36154658 - 36154713
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagt 89  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  36154658 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 36154713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 306
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  256 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 313
Target Start/End: Original strand, 26742806 - 26742847
Alignment:
Q  273 tgttatttaactaagttgcatgagtc-gatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26742806 tgttatttaactaagttgcatgagtctgaactaagttgatga 26742847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 123363 - 123399
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  123363 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 123399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 12028623 - 12028659
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12028623 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 12028659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 17919209 - 17919245
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17919209 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 17919245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22757184 - 22757148
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22757184 tatgttgctgctgttatttaactaagttacatgagtc 22757148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 23535637 - 23535673
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23535637 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 23535673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31342206 - 31342170
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31342206 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 31342170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 74)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23076765 - 23076442
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  23076765 gcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggatttt 23076667  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076666 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 23076567  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23076566 atttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23076467  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  23076466 tctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  20 aacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 23060718  T
Q  120 cctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 219  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23060717 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 23060619  T
Q  220 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23060618 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  320 tgatgt 325  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22737978 - 22738300
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  22737978 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagactta 22738076  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22738077 atgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat 22738176  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22738177 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22738275  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  22738276 tctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22731031 - 22731355
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggga-tagtattgggactt 99  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||  |||||||  |||||    
T  22731031 gcctcacgagtcacccagaaacagagtgccttgttaggtttt-gcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagactt 22731129  T
Q  100 aatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22731130 aatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaa 22731229  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22731230 tatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 22731329  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  22731330 gtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22337439 - 22337115
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||    
T  22337439 gcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagactta 22337340  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || ||    
T  22337339 atgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat 22337240  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22337239 atttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22337140  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22337139 tctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23660346 - 23660023
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23660346 gcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagactta 23660247  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
     |||||| |||| |||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||    
T  23660246 ttgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaat 23660147  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||     
T  23660146 atttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcgg 23660048  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23660047 tctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23286184 - 23285865
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||    
T  23286184 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagactta 23286086  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | | ||||||    
T  23286085 atgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaat 23285986  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23285985 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23285890  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23285889 tctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 23654188 - 23654507
Alignment:
Q  5 cgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatga 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||  ||||||||||    
T  23654188 cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatga 23654286  T
Q  105 tgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 204  Q
     || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  23654287 agaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatattt 23654386  T
Q  205 aagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23654387 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23654486  T
Q  305 agttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  23654487 agttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 298612 - 298933
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||  ||||||    
T  298612 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagactta 298710  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || ||||  ||| |  ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    || ||||||    
T  298711 atgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat 298810  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  298811 atttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 298910  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatga 322  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  298911 gtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 37914 - 38235
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  37914 gcctcgcgagcgacccagaaacatagtgacttgttagacttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactta 38012  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| |||| |||| | || ||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| ||    
T  38013 acaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtat 38111  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |  ||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  38112 acataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 38210  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  38211 tctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20309428 - 20309108
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  20309428 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagatttt-gcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactta 20309330  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  20309329 agaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtat 20309231  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20309230 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcg 20309134  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  20309133 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23135735 - 23135590
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23135735 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 23135637  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23135636 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27753898 - 27753733
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  ||||||    
T  27753898 gcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagactta 27753800  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 167  Q
    ||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27753799 atgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 27753733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  571459 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Original strand, 23708448 - 23708738
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||    ||  | ||||  ||| | |||| |||||||||||||    
T  23708448 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgatagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgtt 23708547  T
Q  134 -taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  23708548 ataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatatt 23708647  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  23708648 gttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25616339 - 25616192
Alignment:
Q  171 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 270  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  25616339 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 25616240  T
Q  271 gttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  25616239 attgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 32451727 - 32452031
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||  |||||     
T  32451727 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttg 32451825  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttga-ttatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattga 198  Q
    |  ||||  ||| |||  |  |||||||||||| |  |||  ||| ||||||| ||||||||||||||  || |||  |||||||||||||| ||| |||    
T  32451826 aatatgatattaattacaatttgtgaagctgttatgggat--gttaatgttgatttatgatgtgatattatg-tatacgcattacttgaagtttaaatga 32451922  T
Q  199 atatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgag 296  Q
    ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||    
T  32451923 ataattgagatgattgttggcttgc-attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgag 32452021  T
Q  297 tcgatctaag 306  Q
    ||| ||||||    
T  32452022 tcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Original strand, 45029871 - 45030016
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||| ||||||    
T  45029871 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgttgttgt 45029969  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45029970 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtata-t 43137363  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43137362 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 22799068 - 22799243
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| |    
T  22799068 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgat 22799167  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  22799168 gttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Original strand, 24529580 - 24529691
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttg 309  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  24529580 gttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 24529678  T
Q  310 atgaagatgatga 322  Q
    || ||||||||||    
T  24529679 attaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 23019648 - 23019823
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| |    
T  23019648 atgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgtt 23019747  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23019748 gttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 325
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103516
Alignment:
Q  156 tgatgtgatatagtgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 254  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  248 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671830
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  19672010 ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671912 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |  ||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7679707 - 7679589
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||      
T  7679707 tttatgatgttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcag 7679610  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  7679609 tctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 324
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  227 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 295
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7824
Alignment:
Q  178 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 7805  T
Q  277 atttaactaagttgcatga 295  Q
      ||||||||| |||||||    
T  7806 tattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 25963688 - 25963809
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  25963688 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 25963786  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  25963787 tattgaactaagttgcatgagtc 25963809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 22740902 - 22741081
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg- 243  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||  ||   ||||||||  |||||| |||     
T  22740902 atgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttgttttt--attgatatcgttatgtgatgt 22740999  T
Q  244 ----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
        ||||| |||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22741000 catactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Original strand, 21916071 - 21916215
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||||| || ||||   |||  ||||||| | ||||    
T  21916071 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgtttttgt 21916169  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  21916170 tatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21916215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23207398 - 23207296
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  23207398 agatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23207300  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  23207299 taag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 40622263 - 40622327
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  40622263 ctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19672118 - 19672068
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggg 84  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19672118 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 19672068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Original strand, 20520109 - 20520295
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 219  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||| | | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| | ||| |||||||||||| |    
T  20520109 ctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatt 20520207  T
Q  220 tgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20520208 tgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 22758751 - 22758836
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22758751 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaactagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22758836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 236
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatta 236  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  256 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Original strand, 22413181 - 22413240
Alignment:
Q  248 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22413181 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 22811969 - 22812028
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  22811969 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 22812028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038054
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtc 23038054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24174859 - 24174823
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24174859 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24174823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23206 - 22886
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23206 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagactta 23107  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23106 atgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 23007  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23006 atttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22908  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  22907 tctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 18818207 - 18818530
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||    
T  18818207 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagactta 18818305  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818306 atgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 18818405  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18818406 atttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 18818505  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18818506 tctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23406704 - 23406379
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23406704 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttt-gtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggactta 23406606  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406605 atgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 23406506  T
Q  201 atttaagatg--ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406505 atttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 23406406  T
Q  299 gatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  23406405 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 21923726 - 21924049
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||    
T  21923726 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagactta 21923824  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923825 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaat 21923924  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21923925 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 21924024  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21924025 tctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20536531 - 20536208
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  20536531 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagactta 20536433  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20536432 atgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat 20536333  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20536332 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 20536233  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20536232 tctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22627059 - 22626736
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22627059 gcctcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagactta 22626960  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  22626959 atgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaat 22626860  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22626859 atttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22626761  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22626760 tctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7373088 - 7372778
Alignment:
Q  6 gcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||     
T  7373088 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgag 7372990  T
Q  106 gacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 205  Q
    || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372989 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatattta 7372898  T
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaa 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7372897 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7372798  T
Q  306 gttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7372797 gttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 28648851 - 28649164
Alignment:
Q  11 tgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  28648851 tgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgt 28648950  T
Q  111 tatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg 210  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||| | || ||| ||||||||    
T  28648951 taattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatg 28649050  T
Q  211 ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28649051 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 28649150  T
Q  311 tgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||    
T  28649151 tgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23648877 - 23648554
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||    
T  23648877 gcctcgtgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagaccta 23648778  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  23648777 atgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaat 23648678  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||      
T  23648677 atttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcag 23648578  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||| |||||| |||||    
T  23648577 tctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 18879035 - 18879352
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||   ||||||    
T  18879035 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagactta 18879133  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| ||||  ||| | ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  18879134 atgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaat 18879232  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18879233 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 18879327  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18879328 tctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 21918798 - 21919121
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | || ||  |||  ||||||    
T  21918798 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagactta 21918896  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaa 199  Q
    | ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||| |||    
T  21918897 acgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattatttgaa 21918995  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21918996 tatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 21919095  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  21919096 gtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6759580 - 6759255
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||| |||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  6759580 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 6759481  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| | || |    
T  6759480 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgta 6759381  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    || || ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6759380 taattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 6759284  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgtcca 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759283 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16092138 - 16092463
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  16092138 gcctcccgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagactta 16092237  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    | ||||| |||| |||| |  || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||| | || |    
T  16092238 aggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgta 16092337  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16092338 tatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 16092437  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  16092438 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22875389 - 22875065
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||    
T  22875389 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgta 22875290  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || |    
T  22875289 atggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgta 22875190  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  22875189 tatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcg 22875091  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  22875090 gtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31971577 - 31971257
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaa 101  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||  |||||||    
T  31971577 cctcgcgagcgacccagaaatagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaa 31971479  T
Q  102 tgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
      |||| |||| |||| | |||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||    
T  31971478 caatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtata 31971380  T
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgat 301  Q
      |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31971379 cataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 31971281  T
Q  302 ctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  31971280 ctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 45130796 - 45131117
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | || ||| |||  ||||||    
T  45130796 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagactta 45130894  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || |||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  45130895 ataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtat 45130993  T
Q  201 atttaagatgttgttgactt-gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45130994 acctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 45131091  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  45131092 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16199444 - 16199765
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  16199444 gcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttatt-ggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactta 16199542  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  16199543 acaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtat 16199641  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16199642 acctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 16199739  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  16199740 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 171 - 323
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678221
Alignment:
Q  171 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 270  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 18678168  T
Q  271 gttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  18678169 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 171 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121734
Alignment:
Q  171 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 270  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 32121787  T
Q  271 gttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121786 attgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
      || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 25362938 - 25363123
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||    
T  25362938 gcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-gcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagactta 25363036  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttga 187  Q
    |||| || | || |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||    
T  25363037 atgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 255  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  256 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    || |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| || || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | || | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 318
Target Start/End: Original strand, 13507914 - 13508199
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgt- 132  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||    ||||| || |  ||| | |||| ||||||| |||      
T  13507914 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13508013  T
Q  133 ttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
    ||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||    
T  13508014 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 13508113  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    ||||| ||||| || || || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  13508114 attatatcatgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 325
Target Start/End: Original strand, 21389371 - 21389571
Alignment:
Q  122 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 221  Q
    ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  21389371 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21389469  T
Q  222 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  21389470 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21389566  T
Q  321 gatgt 325  Q
    |||||    
T  21389567 gatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 325
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  122 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 221  Q
    ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  222 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  321 gatgt 325  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 325
Target Start/End: Original strand, 21395900 - 21396101
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||  ||||||  |||| | |||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  21395900 ctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 21395998  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    | | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  21395999 gaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 21396095  T
Q  320 tgatgt 325  Q
    ||||||    
T  21396096 tgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 325
Target Start/End: Original strand, 21790393 - 21790594
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||  ||||||  |||| | |||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  21790393 ctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 21790491  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    | | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  21790492 gaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 21790588  T
Q  320 tgatgt 325  Q
    ||||||    
T  21790589 tgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 321
Target Start/End: Original strand, 23776773 - 23776952
Alignment:
Q  142 gttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtca 241  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | ||||    
T  23776773 gttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtca 23776872  T
Q  242 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| | ||||   ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  23776873 tgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 318
Target Start/End: Original strand, 13597446 - 13597731
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgt- 132  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||    ||||| || |  ||| | |||| ||||||| |||      
T  13597446 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13597545  T
Q  133 ttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
    ||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||    
T  13597546 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatatt 13597645  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  13597646 attatatcatgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937174
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 19937159  T
Q  314 agatgatgatgtcca 328  Q
    ||||||||| |||||    
T  19937160 agatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttg 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 325
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
           | |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 306
Target Start/End: Original strand, 19801339 - 19801527
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||    
T  19801339 atgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 19801437  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  19801438 tgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  227 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  228 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  305 agttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 325
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  153 ttatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 252  Q
    |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  253 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  305 agttga 310  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 321
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  254 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466132
Alignment:
Q  148 gttgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 246  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| ||    
T  20465982 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 20466080  T
Q  247 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    || ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20466081 ttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  298 cgatctaagttgatga 313  Q
    || |||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Original strand, 30643264 - 30643408
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  30643264 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 30643362  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  30643363 tatttaactaagttgcatgagtctattcaagatgattaagatgatg 30643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37116530 - 37116366
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  37116530 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37116432  T
Q  243 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |  ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37116431 gaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 16410226 - 16410347
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || ||||| |||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16410226 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16410324  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16410325 tatttcactaagttgcatgagtc 16410347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  275 ttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  275 ttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 299
Target Start/End: Original strand, 17439423 - 17439602
Alignment:
Q  122 tgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||| ||| |||  || |||||||| || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||| |||||||||||| ||    
T  17439423 tgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgattt 17439521  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  17439522 gcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17439602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 17926678 - 17926799
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| | |  | |||||||| || |   ||||||||| | || ||||    
T  17926678 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgt 17926776  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17926777 tatttaactaagttgcatgagtc 17926799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24353140 - 24353039
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  24353140 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 24353043  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  24353042 taag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 299
Target Start/End: Original strand, 19154883 - 19154982
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  | | | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19154883 tttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 19154982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 21162111 - 21162175
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  21162111 ctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21162175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 21168784 - 21168848
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  21168784 ctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21168848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 299
Target Start/End: Original strand, 22963464 - 22963508
Alignment:
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  22963464 tactgcctatgttgctgttgtatattaattaagttgcatgagtcg 22963508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24755778 - 24755714
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  24755778 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 24755714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 39094982 - 39095018
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39094982 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 39095018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 41598508 - 41598420
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagt 89  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| | ||| |  ||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41598508 gcctcgcgagtgacctagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 41598420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22532593 - 22532269
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  22532593 gcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagactta 22532494  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  22532493 atgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaat 22532394  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  22532393 atttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttgg 22532294  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22532293 tctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 50210010 - 50210333
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  50210010 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagactta 50210109  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||| | || ||    
T  50210110 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtat 50210209  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  50210210 acttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 50210309  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  50210310 tctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34510104 - 34509783
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  34510104 gcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagactta 34510005  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| | || ||    
T  34510004 atgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtat 34509905  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  34509904 aattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 34509805  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34509804 tctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 27250527 - 27250850
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||  |||||    
T  27250527 gcctcgcgagtgacacagaaacagagtcccttgttatatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatactta 27250625  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  27250626 atgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaat 27250725  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  27250726 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcgg 27250825  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  27250826 tctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21027003 - 21026680
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||  ||||||    
T  21027003 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagactta 21026905  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    || ||||||    
T  21026904 atgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat 21026805  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21026804 atttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 21026705  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026704 tctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20135510 - 20135188
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||| |||    
T  20135510 cctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaa 20135411  T
Q  102 tgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
    |||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20135410 tgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaata 20135311  T
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgat 301  Q
     ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  20135310 cttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagt 20135211  T
Q  302 ctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  20135210 ctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 22354370 - 22354616
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||  ||||||    
T  22354370 gcctcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagactta 22354468  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  22354469 atgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaat 22354568  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354569 atttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 324
Target Start/End: Original strand, 22468614 - 22468816
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22468614 ctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaatt 22468712  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  22468713 gcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 22468812  T
Q  321 gatg 324  Q
    ||||    
T  22468813 gatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 22355974 - 22356184
Alignment:
Q  4 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgcc-ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaat 102  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  22355974 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagatttt-gagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaat 22356072  T
Q  103 gatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatg-ttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22356073 gatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaata 22356172  T
Q  202 tttaagatgttg 213  Q
    |||| |||||||    
T  22356173 tttatgatgttg 22356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 22357660 - 22357870
Alignment:
Q  4 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgcc-ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaat 102  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  22357660 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagatttt-gagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaat 22357758  T
Q  103 gatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatg-ttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22357759 gatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaata 22357858  T
Q  202 tttaagatgttg 213  Q
    |||| |||||||    
T  22357859 tttatgatgttg 22357870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593897
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 38801189 - 38801508
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  38801189 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagactta 38801287  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || ||||  |||  ||| |  ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  38801288 ataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtat 38801386  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    || ||| |||||| ||| ||| | ||||||| |||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38801387 atataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  38801484 -tctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 433331 - 433012
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||   ||    |||    
T  433331 gcctcgcgagtgacccagttgcaaaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaatatta 433232  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
       || |  ||| | |||| |||| |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  433231 taaataatattaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa 433132  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  433131 taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcg 433035  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatga 322  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  433034 gtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||||| | ||  |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361915
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | ||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  16361995 gttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 321
Target Start/End: Original strand, 21787980 - 21788159
Alignment:
Q  142 gttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtca 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | ||||    
T  21787980 gttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtca 21788079  T
Q  242 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||   ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  21788080 tgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847275
Alignment:
Q  225 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 20847274  T
Q  325 t 325  Q
    |    
T  20847275 t 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| | |||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Original strand, 13212917 - 13213027
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  13212917 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13213015  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||    
T  13213016 agatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860177
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 15860162  T
Q  314 agatgatgatgtcca 328  Q
    ||||||||| |||||    
T  15860163 agatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21342203 - 21342090
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  21342203 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21342105  T
Q  314 agatgatgatgtcca 328  Q
    ||||||||| |||||    
T  21342104 agatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21347249 - 21346961
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctg-t 132  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||    ||||| || |  ||| |  ||   |||||||||| |    
T  21347249 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtggttatgaatattaattataatattaatgctgtattgtgaagctgat 21347150  T
Q  133 ttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatat 231  Q
    ||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  21347149 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatat 21347051  T
Q  232 tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21347050 tattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21707292 - 21707167
Alignment:
Q  196 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 295  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21707292 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 21707194  T
Q  296 gtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21707193 gtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21711834 - 21711709
Alignment:
Q  196 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 295  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21711834 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 21711736  T
Q  296 gtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21711735 gtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| || |  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  259 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16758942 - 16758664
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||    ||  | ||||  ||| | |||| |||||||||||||    
T  16758942 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgtt 16758843  T
Q  134 -taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
     ||| |||  ||| ||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||   ||||||||||  ||| | ||||||||    
T  16758842 ataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-gatgttgttgtattgtatttgatatt 16758744  T
Q  233 attatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
     |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16758743 gttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40389261 - 40389157
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |    
T  40389261 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgatta 40389163  T
Q  314 agatga 319  Q
    ||||||    
T  40389162 agatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 306
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  144 tgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg 243  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  244 ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681011
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || |||||||||| || |||||||    
T  33681034 cggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 324
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || |||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 20847017 - 20847085
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgag 70  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20847017 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgag 20847085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21754163 - 21754052
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21754163 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21754066  T
Q  305 agttgatgaagatg 318  Q
    ||||||||| ||||    
T  21754065 agttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  309 gatgaagatgatg 321  Q
    ||||| |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48603718 - 48603652
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttga 187  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  48603718 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295672
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaat 14295655  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  14295656 gttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 306
Target Start/End: Original strand, 35260998 - 35261180
Alignment:
Q  122 tgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||||||| | || ||||||| || |  ||| ||||||||||||| |||   ||||| ||| |||||||| |   ||    
T  35260998 tgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---tt 35261094  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35261095 gcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237631
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || |||||||||| || |||||||    
T  22237654 cggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Original strand, 18182093 - 18182237
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  |  |||||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  18182093 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaata-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 18182191  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  18182192 tatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18182237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  264 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 50614117 - 50614219
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  50614117 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50614215  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  50614216 taag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 50621945 - 50622047
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  50621945 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50622043  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  50622044 taag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21342384 - 21342334
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggg 84  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342384 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 21342334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 41050036 - 41050138
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||| |||    
T  41050036 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtct 41050135  T
Q  304 aag 306  Q
    |||    
T  41050136 aag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Original strand, 20091533 - 20091593
Alignment:
Q  261 ctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20091533 ctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 20091593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 16368287 - 16368388
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||    
T  16368287 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 16368385  T
Q  304 aag 306  Q
    |||    
T  16368386 aag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783212
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 3472980 - 3473016
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3472980 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 3473016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 3705122 - 3705158
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3705122 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 3705158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 18394023 - 18394059
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18394023 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 18394059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21022695 - 21022631
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  21022695 ctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21022631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 45310426 - 45310462
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45310426 tatgctgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtc 45310462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39084 - 38761
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  39084 gcctcgcgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagactta 38985  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38984 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 38885  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||     
T  38884 atttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcgg 38786  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38785 tctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 121 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33145 - 32942
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33145 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaactt 33046  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33045 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 32947  T
Q  321 gatgt 325  Q
    |||||    
T  32946 gatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9860 - 9744
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttg 309  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9860 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9762  T
Q  310 atgaagatgatgatgtcc 327  Q
    || |||||||||| ||||    
T  9761 attaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26687210 - 26686887
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26687210 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttta-cgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggactta 26687112  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26687111 atgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaat 26687012  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26687011 atttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 26686912  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  26686911 tctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 14576630 - 14576949
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||    
T  14576630 gcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagattta 14576729  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14576730 atgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaat 14576829  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14576830 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcgg 14576928  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  14576929 tctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43841255 - 43840932
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  43841255 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggactta 43841157  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    | || || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841156 acgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 43841057  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  43841056 atttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 43840957  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  43840956 tttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13442597 - 13442274
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||  ||||||    
T  13442597 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagactta 13442499  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13442498 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat 13442399  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13442398 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 13442299  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13442298 tctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23083159 - 23083482
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||  ||||||    
T  23083159 gcctcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagactta 23083257  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
     |||||| |||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23083258 gtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaat 23083357  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  23083358 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23083457  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23083458 tctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17488180 - 17487856
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaa-caaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||    
T  17488180 gcctcgcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagactt 17488082  T
Q  100 aatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  17488081 aatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaa 17487982  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17487981 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 17487882  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  17487881 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18438858 - 18438534
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18438858 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagactta 18438759  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| | || ||    
T  18438758 atgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtat 18438659  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  18438658 aaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcgg 18438559  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18438558 tctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 25476182 - 25476506
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  25476182 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagactta 25476281  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | || ||    
T  25476282 atgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtat 25476381  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||     
T  25476382 acttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcgg 25476481  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25476482 tctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20698234 - 20698556
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||  ||||||    
T  20698234 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagactta 20698332  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  20698333 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaat 20698431  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20698432 atataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 20698531  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20698532 tctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17499643 - 17499338
Alignment:
Q  19 aaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatg 118  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||     
T  17499643 aaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattata 17499545  T
Q  119 acctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac 218  Q
    |  |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  17499544 atttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa 17499445  T
Q  219 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17499444 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17499345  T
Q  319 atgatgt 325  Q
    |||||||    
T  17499344 atgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14973178 - 14972854
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  14973178 gcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 14973079  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || ||    
T  14973078 atgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtat 14972979  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14972978 atatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 14972879  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14972878 tctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14572912 - 14572602
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  14572912 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagactta 14572813  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||    
T  14572812 atgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaat 14572713  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14572712 atttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 14572614  T
Q  301 tctaagttgatg 312  Q
    ||||||||||||    
T  14572613 tctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 40213518 - 40213838
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  40213518 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagactta 40213617  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||| | || ||    
T  40213618 atgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtat 40213717  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||     
T  40213718 aattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcgg 40213816  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  40213817 tctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 11424560 - 11424880
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11424560 gcctcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagactta 11424659  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||| ||| |||| || | | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || ||    
T  11424660 atgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcat 11424759  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  11424760 aattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcag 11424855  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11424856 tctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 42386702 - 42386428
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||| |||| | || | |||||||||||||    
T  42386702 ttaggattttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgtt 42386603  T
Q  134 t-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386602 ttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 42386503  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagt 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  42386502 gttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 322
Target Start/End: Original strand, 24153126 - 24153326
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153126 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 24153225  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24153226 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24153324  T
Q  321 ga 322  Q
    ||    
T  24153325 ga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12399529 - 12399209
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  || | | || || ||| |||  ||| ||    
T  12399529 gcctcacgagtgacccagaaaca--gtgacttgttag--ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacata 12399434  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || ||||  ||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||    || ||||||    
T  12399433 atgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaat 12399334  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12399333 atttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 12399234  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  12399233 tctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30030136 - 30029855
Alignment:
Q  27 tgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtga 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||  ||  ||||||||||||| |||   ||| |  |||||    
T  30030136 tgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtga 30030038  T
Q  127 agctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaatt 226  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  30030037 agctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaat 30029939  T
Q  227 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30029938 gatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Original strand, 29172567 - 29172745
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    |||||||||||  |  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29172567 ttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29172666  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29172667 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Original strand, 28848628 - 28848773
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  28848628 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 28848726  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28848727 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822267
Alignment:
Q  171 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 270  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgct 46822320  T
Q  271 gttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  46822319 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||  ||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg-tctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  208 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagt 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  308 tgatgaagatgatga 322  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12511236 - 12511059
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    |||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |    
T  12511236 tgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgtt 12511137  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    |||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  12511136 gttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 320
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 325
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550644
Alignment:
Q  178 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 277  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  278 tttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    |    |  || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23274979 - 23274705
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgt- 132  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||    ||||| || |  ||| | |||| |||||||||||      
T  23274979 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgagccttgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgaa 23274880  T
Q  133 ttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
    ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||| || |  ||| | | ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||    
T  23274879 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 23274780  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagt 307  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23274779 attatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 306
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15977640 - 15977515
Alignment:
Q  196 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 295  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15977640 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 15977542  T
Q  296 gtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15977541 gtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119887
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12119878  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  12119879 agatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412429
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15412438  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  15412437 agatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgat 311  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16796870 - 16796685
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  16796870 gcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-gcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaagactta 16796772  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttga 187  Q
    |||| || | || |||| |  ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  16796771 atgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  225 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499518
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  8499526 agatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Original strand, 24340634 - 24340844
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  24340634 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgt 24340733  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    | ||||||  | ||||||||||| ||||| || || || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  24340734 ttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 24340832  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  24340833 agatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 52523557 - 52523831
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgg-gacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgt 132  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||  || |  || | ||  ||| | |||| ||| ||||||||    
T  52523557 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgagaagctgt 52523655  T
Q  133 t-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatat 231  Q
    | |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  52523656 tataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatat 52523754  T
Q  232 tattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    | |||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52523755 tgttatatcatgaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10557101 - 10556985
Alignment:
Q  206 agatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10557101 agatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10557003  T
Q  305 agttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  10557002 agttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 322
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  181 tacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt-tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttat 278  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165250
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |  |||  ||| ||||| || ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | |||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  225 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||      
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  305 agttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16103905 - 16103784
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  16103905 atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagt 16103808  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  16103807 cggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Original strand, 37642176 - 37642386
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  37642176 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgt 37642275  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    | |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  37642276 ttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttga 37642374  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  37642375 agatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32307795 - 32307684
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32307795 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32307698  T
Q  305 agttgatgaagatg 318  Q
    ||||||||| ||||    
T  32307697 agttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 856280 - 856140
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 277  Q
    |||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  856280 attacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgctattgtta 856184  T
Q  278 tttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  856183 ttcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16097454 - 16097332
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| | ||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16097454 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16097356  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  16097355 cggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14179636 - 14179570
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttga 187  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  14179636 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14665545 - 14665398
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| | | || || |||||  |||   |||  ||||||||| ||||    
T  14665545 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattttaaagttatactgttgatgtgatctgattatgttgctattgt 14665447  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  14665446 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14668701 - 14668554
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || || |||||  |||   |||  |||| |||| ||||    
T  14668701 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattataaagttatactgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 14668603  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  14668602 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 11298500 - 11298621
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  11298500 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 11298598  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11298599 tatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  261 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 322
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  269 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 243
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  243 g 243  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 17525190 - 17525275
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  17525190 atgtcatactgttgttgcactctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 17525275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878633
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Original strand, 19725886 - 19726004
Alignment:
Q  178 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 277  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||  |||   |||  |||| |||| ||||||    
T  19725886 cattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatga-gtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 19725983  T
Q  278 tttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19725984 tttaactaagttgcatgagtc 19726004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43926079 - 43925977
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  43926079 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 43925981  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  43925980 taag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 318
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23408513 - 23408428
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23408513 atgtcacgctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 22110352 - 22110454
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22110352 agatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 22110450  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  22110451 taag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 325
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147646
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    |||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| |    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    | ||||| |||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||| ||||||| ||| || |||| | |||||||| ||||||    
T  22147567 g-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  273 tgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12172855 - 12172796
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||    
T  12172855 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattatgatgatg 12172796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12496402 - 12496280
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgata-ttattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 274  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||| |||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| |||    
T  12496402 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtagaaatg-aattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttg 12496304  T
Q  275 ttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12496303 ttatttaactaagttgcatgagtc 12496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 18383973 - 18384032
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  18383973 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18384032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 89
Target Start/End: Original strand, 53070528 - 53070583
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagt 89  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  53070528 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 53070583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12378046 - 12377940
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||||    
T  12378046 tttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcg 12377947  T
Q  300 atctaag 306  Q
     ||||||    
T  12377946 gtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15051573 - 15051531
Alignment:
Q  256 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15051573 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15060349 - 15060307
Alignment:
Q  256 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15060349 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11862964 - 11862816
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||||||||||| || || |||  ||||||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||  | ||    
T  11862964 tgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttataatatt 11862866  T
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    || ||   |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11862865 ttggtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11862816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 321
Target Start/End: Original strand, 12038019 - 12038068
Alignment:
Q  272 ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||    
T  12038019 ttgttatttaactaagttgcatgagtttatataagatgattaagatgatg 12038068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 1982868 - 1982904
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1982868 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 1982904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 2051029 - 2051073
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaac 78  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2051029 ttaggattttgcgatctttgtcgcatgagttgttgagagttgaac 2051073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 2897873 - 2897909
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2897873 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 2897909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 3403014 - 3403050
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3403014 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 3403050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 11595197 - 11595233
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11595197 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11595233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Original strand, 23053140 - 23053200
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagat 317  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  23053140 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatataagatgattaagat 23053200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 52235 - 51913
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  52235 gcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggtttt-gcgacctt-gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagactta 52138  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52137 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 52038  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  52037 atttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 51938  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 167777 - 168099
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  167777 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagactta 167875  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  167876 atgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaat 167974  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  167975 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 168074  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  168075 tctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 81)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16239767 - 16240090
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  16239767 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagactta 16239866  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16239867 atgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaat 16239966  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |     
T  16239967 atttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttgg 16240065  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16240066 tctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44053152 - 44052829
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  44053152 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagactta 44053054  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  44053053 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaat 44052954  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||     
T  44052953 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcgg 44052854  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  44052853 cctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12903080 - 12902757
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  12903080 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagactta 12902982  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  12902981 atgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaat 12902882  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12902881 atttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 12902782  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  12902781 tctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7894024 - 7893703
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||    
T  7894024 gcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagactta 7893925  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    | ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893924 acgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaat 7893828  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||     
T  7893827 atttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcgg 7893728  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7893727 tctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 16377319 - 16377639
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgt-tgagagttgaactttgggatagtattgggactt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16377319 gcctcacgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagactt 16377418  T
Q  100 aatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || |    
T  16377419 aatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgta 16377518  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16377519 taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 16377616  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatga 322  Q
     ||||||||||||||||| ||||    
T  16377617 gtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22636757 - 22636437
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  22636757 gcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagactta 22636659  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    | || || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22636658 acgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat 22636560  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22636559 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22636460  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22636459 tctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14038972 - 14038653
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  14038972 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 14038873  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||||||  ||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||    
T  14038872 atgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtat 14038773  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  14038772 aattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcag 14038673  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgat 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14038672 tctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7089200 - 7088877
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  ||| |||  ||||||    
T  7089200 gcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgttagatttt-gcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagactta 7089102  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  7089101 atgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaat 7089002  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7089001 atgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 7088902  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7088901 tctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 121 - 325
Target Start/End: Original strand, 16270153 - 16270356
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16270153 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaactt 16270252  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16270253 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 16270351  T
Q  321 gatgt 325  Q
    |||||    
T  16270352 gatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7798957 - 7798774
Alignment:
Q  142 gttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtca 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7798957 gttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtca 7798858  T
Q  242 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7798857 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 23374157 - 23374473
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||  ||||||    
T  23374157 gcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcaacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagactta 23374255  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || ||||  ||| | || ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    || ||||||    
T  23374256 atgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat 23374355  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23374356 atttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgt 23374455  T
Q  301 tctaagttgatgaagatg 318  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  23374456 tctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  153 ttatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttg 6899964  T
Q  253 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 14053100 - 14053422
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  14053100 gccttgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactta 14053198  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| |||| |||| | ||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  14053199 acaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtat 14053297  T
Q  201 atttaaga-tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
       ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053298 gcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtc 14053395  T
Q  299 gatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||| || |||||||||||||||    
T  14053396 gatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 200 - 325
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 44928720 - 44929042
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||| |  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||    |||    
T  44928720 gcctcgcgagtgacccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtagttatgaatatta 44928819  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
       || |  ||| | |||| ||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  44928820 tatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa 44928919  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44928920 taattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 44929019  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatga 322  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  44929020 gtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798872
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837671
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 17047870 - 17048055
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||    
T  17047870 gcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagactta 17047968  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttga 187  Q
    |||| ||   || |||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  17047969 atgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgtcca 328  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14280340  T
Q  299 gatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  14280339 ggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Original strand, 18239436 - 18239581
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||    
T  18239436 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgt 18239534  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18239535 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3096966 - 3096759
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||    |||||    
T  3096966 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatactta 3096868  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| | |||| | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  3096867 atgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaat 3096769  T
Q  201 atttaagatg 210  Q
    ||||| ||||    
T  3096768 atttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44102501 - 44102214
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctg-t 132  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    |||   || |  ||| | |||| ||||||||||| |    
T  44102501 ttaggattttgcgatctttgtagcacgagtcgttgagagttgaaccttgggatagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgat 44102402  T
Q  133 ttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
    ||| ||||  |||||| || ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  44102401 ttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatatt 44102303  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44102302 attatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 239 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  239 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Original strand, 14970727 - 14970871
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  14970727 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgttgttat 14970825  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||    
T  14970826 ttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15367899 - 15367690
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg- 213  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||     
T  15367899 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttga 15367801  T
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  15367800 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15367702  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  15367701 agatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15402912 - 15402703
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg- 213  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||     
T  15402912 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttga 15402814  T
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  15402813 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15402715  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  15402714 agatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Original strand, 52243105 - 52243302
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||||||||    
T  52243105 atgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgt 52243204  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    ||| || || |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52243205 tgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17046714 - 17046487
Alignment:
Q  95 gacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataa 194  Q
    |||||||| || | |||| |||| | |||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| |||| | | |||||||||||| ||      
T  17046714 gacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgt 17046616  T
Q  195 ttgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcat 293  Q
    ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17046615 ttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 17046519  T
Q  294 gagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  17046518 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370018
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15370030  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  15370029 agatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371202
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15371214  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  15371213 agatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373483
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15373495  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  15373494 agatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 306
Target Start/End: Original strand, 21815602 - 21815731
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||    
T  21815602 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgt 21815700  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21815701 tatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190481
Alignment:
Q  4 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatg 103  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||| |||  ||||| |      
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaat 6190684  T
Q  104 atgacgttatttatgacctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgat-tatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
    ||||  ||| |||  |   ||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  6190683 atgatattaattacaattcgtgaagctgttatgagatg--ttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaata 6190587  T
Q  202 tttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
     || ||||| |||||  ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  6190586 attgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcg 6190488  T
Q  300 atctaag 306  Q
     ||||||    
T  6190487 gtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15091220 - 15091093
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15091220 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 15091121  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaag 128  Q
    |||| || |||| |||| | ||||||||    
T  15091120 atgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15093950 - 15093775
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||| ||||||| ||  || |||||||||||| | ||||||||    
T  15093950 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgct 15093851  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| ||||   ||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  15093850 gttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223532
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 16223544  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  16223543 agatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20149936 - 20149832
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20149936 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgatta 20149838  T
Q  314 agatga 319  Q
    ||||||    
T  20149837 agatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 310
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  243 g-ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |  |  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7799020 - 7798953
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttga 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7799020 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgtttcacgagttgttga 7798953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  254 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Original strand, 39706286 - 39706409
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39706384  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  39706385 tctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  304 aagttga 310  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 16356924 - 16357045
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16356924 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16357022  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16357023 tatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Original strand, 16488050 - 16488194
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || |||||| ||||||   |||  |||| |||| ||||    
T  16488050 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaag-aattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgt 16488148  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  16488149 tatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16488194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121917
Alignment:
Q  148 gttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 247  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| |      
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat--catgatta 15121842  T
Q  248 tt-ttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || |||||  ||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15121843 ttgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 16348636 - 16348757
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16348636 tgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16348734  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16348735 tatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Original strand, 20157517 - 20157579
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  20157517 tatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13569587 - 13569502
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  13569587 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 13569502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Original strand, 13812991 - 13813135
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | ||  |  |||| | |||  |||  |||| |||| ||||    
T  13812991 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttttaatgttgtggtaatctgattatgctgctattgt 13813089  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  13813090 tatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 13813135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23843538 - 23843478
Alignment:
Q  261 ctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  23843538 ctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 23843478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 15464903 - 15464977
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 250  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464903 tgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14280507 - 14280462
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgata 165  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14280507 ctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 14280462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 161
Target Start/End: Original strand, 54798680 - 54798721
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgt 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54798680 ctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 54798721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12570078 - 12570014
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  12570078 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12570014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596683
Alignment:
Q  227 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttg 290  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagttg 16596683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25555539 - 25555503
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25555539 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 25555503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 46640456 - 46640558
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  46640456 agatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 46640554  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  46640555 taag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 90
Target Start/End: Original strand, 52243023 - 52243079
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagta 90  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  52243023 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgtaaagagttgaactttggggtagta 52243079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9509512 - 9509189
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  9509512 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagactta 9509414  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9509413 atgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat 9509314  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9509313 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 9509214  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9509213 tctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12699154 - 12698831
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||  || ||||    
T  12699154 cctcgtgagtgacccagaaacaaagtgacttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaa 12699056  T
Q  102 tgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
    ||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12699055 tgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaata 12698956  T
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12698955 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 12698856  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12698855 tctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38227804 - 38227481
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  38227804 gcctcgcgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagactta 38227705  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38227704 atgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaat 38227605  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  38227604 atttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcgg 38227506  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  38227505 tctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 3564161 - 3564482
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  3564161 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagactta 3564260  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||| | || ||    
T  3564261 atgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat 3564360  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3564361 aattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 3564460  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3564461 tctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10589361 - 10589039
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| || || || ||| |||  ||||||    
T  10589361 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgaccttttttgcacgagttgtctagagttggacctttgggtaggattaagactta 10589263  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| ||| |||||     
T  10589262 atgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattgcttgaagaatatttgaac 10589164  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10589163 attgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcga 10589064  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589063 tctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26212319 - 26211995
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaa-caaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||  |||||    
T  26212319 gcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgatttgttag--ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagactt 26212222  T
Q  100 aatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||    || |||||    
T  26212221 aatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaa 26212122  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26212121 tatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcg 26212022  T
Q  300 atctaagttgatgaag-atgatgatgt 325  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212021 gtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 121 - 322
Target Start/End: Original strand, 18456330 - 18456530
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456330 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 18456429  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18456430 gcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18456528  T
Q  321 ga 322  Q
    ||    
T  18456529 ga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16386045 - 16386369
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || || ||  |||  ||||||    
T  16386045 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagactta 16386143  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || ||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    |  ||||||    
T  16386144 atgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaat 16386243  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16386244 atttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 16386343  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  16386344 gtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40443712 - 40443393
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||| |||  ||||||    
T  40443712 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttatt-ggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagactta 40443614  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  40443613 acaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtat 40443515  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40443514 acctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcg 40443417  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
     |||||| || |||||||||||||    
T  40443416 gtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 15143834 - 15144143
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||| |  ||||||    
T  15143834 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagactta 15143933  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||||||| |||   ||| | |||| |||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| || ||| | || |    
T  15143934 atgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgta 15144033  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15144034 tacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 15144132  T
Q  300 atctaagttga 310  Q
     ||||||||||    
T  15144133 gtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 27847631 - 27847951
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  27847631 gcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactta 27847729  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || ||||  |||  ||| | |||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| ||    
T  27847730 ataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtat 27847828  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||    
T  27847829 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcg 27847925  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  27847926 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213684
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaa 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  306 gttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Original strand, 2279948 - 2280238
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||    ||| | ||||  | | | |||| |||||||||||||    
T  2279948 ttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattatttatgatatcaatgatgatctgtgaagctgtt 2280047  T
Q  134 -taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| | |||| || |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2280048 ataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2280147  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  2280148 attatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 321
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410059
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttat 16410103  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16410102 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| |||||| |||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  156 tgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 254  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  156 tgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 254  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  156 tgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 254  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3386475 - 3386333
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  3386475 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttat 3386377  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3386376 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869346
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13869355  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  13869354 agatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 322
Target Start/End: Original strand, 17061872 - 17062077
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||     
T  17061872 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgc 17061970  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  17061971 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 17062068  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  17062069 agatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13831498 - 13831373
Alignment:
Q  196 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 295  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13831498 tgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  296 gtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110556
Alignment:
Q  142 gttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtca 241  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  242 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    || || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 67864 - 67745
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  67864 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 67766  T
Q  305 agttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  67765 agttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||  ||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  305 agttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  227 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  149 ttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | |||  |||||||| | |||||||| || ||||||||| || ||  || ||||||| |||||||||| ||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  249 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 259
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  259 g 259  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 259
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  259 g 259  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 286
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756797
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| | ||  |||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaa 286  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18005772 - 18005650
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 18005674  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  18005673 cggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 321
Target Start/End: Original strand, 811129 - 811248
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  811129 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  811228 tctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 321
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||     
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495402
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16495419  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  16495418 gttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47831930 - 47831807
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | | | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  47831930 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  47831831 tctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Original strand, 19486655 - 19486865
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  19486655 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgt 19486754  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    | |||| |    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  19486755 ttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttga 19486853  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  19486854 agatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Original strand, 1867907 - 1868101
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtt 215  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||| ||||||||||    
T  1867907 atgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgtt 1868005  T
Q  216 gacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
     | ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1868006 catttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 2530129 - 2530208
Alignment:
Q  195 ttgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530129 ttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 325
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  228 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  212 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  311 tgaagatgatg 321  Q
    ||| |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 321
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 245  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 17138101  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  17138102 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 319
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 325
Target Start/End: Original strand, 10063810 - 10063939
Alignment:
Q  196 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatg 294  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10063810 tgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatg 10063908  T
Q  295 agtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||  ||||||| | ||||| || ||||||    
T  10063909 agtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T
Q  305 agttga 310  Q
    ||||||    
T  16056348 agttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12187083 - 12187019
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  12187083 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755008
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  15754992 gttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 298
Target Start/End: Original strand, 12255621 - 12255887
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattg-ggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgt 132  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  || |  || || |  ||| | |||| || ||||| |||    
T  12255621 ttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataat-atattaatgatgatctatgaagttgt 12255719  T
Q  133 t-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatat 231  Q
    | |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| || |||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||| || || || |||||||    
T  12255720 tataagatg-attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatat 12255818  T
Q  232 tattatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    | |||| |||||  |   |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12255819 tgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12255887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Original strand, 12321685 - 12321835
Alignment:
Q  148 gttgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 246  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||  ||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||||||    
T  12321685 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctg 12321783  T
Q  247 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    || ||||   |||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12321784 ttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtc 12321835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 299
Target Start/End: Original strand, 15008415 - 15008594
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 219  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  || || ||| || ||||||||| |    
T  15008415 ctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatt 15008513  T
Q  220 tgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||| |||||| ||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  15008514 tgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 15008594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9703348 - 9703263
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  9703348 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 9703263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||  |||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 32216601 - 32216665
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  32216601 ctgcctatgctgctattattatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 32216665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 9751812 - 9751871
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  9751812 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 9751871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 89
Target Start/End: Original strand, 12756546 - 12756601
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagt 89  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12756546 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 12756601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  248 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 39267957 - 39268016
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  39267957 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgatcaagatgatg 39268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14429932 - 14429883
Alignment:
Q  272 ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  14429932 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 14429883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48273583 - 48273538
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgata 165  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  48273583 ctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  255 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  255 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 17061790 - 17061834
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaac 78  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17061790 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaac 17061834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42204053 - 42204017
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42204053 tatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatgagtc 42204017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8330 - 8650
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggga-tagtattgggactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  8330 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttt-gcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggactt 8428  T
Q  100 aatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8429 aatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 8528  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8529 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcg 8624  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  8625 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13534 - 13211
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  13534 gcctcgcgagtgacctagaatcagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagactta 13436  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  13435 atgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat 13336  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  13335 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcag 13236  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13235 tctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40236 - 39913
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  40236 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagactta 40137  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  40136 atgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaat 40037  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |     
T  40036 atttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttgg 39938  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39937 tctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Original strand, 18597 - 18749
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc 244  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||  | ||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || || |    
T  18597 atgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaacg-aattgatattatgaagttattc 18695  T
Q  245 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18696 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||| ||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20360758 - 20361081
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||  ||||||    
T  20360758 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagactta 20360856  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  20360857 atgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat 20360956  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20360957 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcga 20361056  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361057 tctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29060864 - 29060540
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29060864 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagactta 29060765  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||    
T  29060764 atgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtat 29060665  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29060664 acttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 29060565  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  29060564 tctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 17287596 - 17287917
Alignment:
Q  3 ctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaat 102  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  17287596 ctcgtgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggttt-gctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaat 17287694  T
Q  103 gatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 202  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287695 gaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 17287794  T
Q  203 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17287795 ttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17287894  T
Q  303 taagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  17287895 taagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 25629152 - 25629476
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  25629152 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 25629251  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || ||    
T  25629252 atgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat 25629351  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  25629352 aattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcgg 25629451  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25629452 tctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 20638082 - 20638404
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  |||||||    
T  20638082 cctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaa 20638180  T
Q  102 tgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 201  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||  |||||||    
T  20638181 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaata 20638280  T
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgat 301  Q
    || ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  20638281 ttaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggt 20638380  T
Q  302 ctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20638381 ctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22780025 - 22780348
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||||   ||||||    
T  22780025 gcctcgcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttaggtttt-gtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagactta 22780123  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780124 atgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaat 22780223  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||      
T  22780224 atttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcag 22780323  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22780324 tctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 18409632 - 18409947
Alignment:
Q  9 agtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||     
T  18409632 agtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgat 18409731  T
Q  109 gttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 208  Q
    |||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||| | || ||  || |||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgaga 18409831  T
Q  209 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  18409832 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagtt 18409931  T
Q  309 gatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  18409932 gatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20594097 - 20593773
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20594097 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagactta 20593998  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||| | | || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||| ||    
T  20593997 atgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtat 20593898  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||     
T  20593897 aattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcgg 20593798  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20593797 tctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 19303338 - 19303661
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||| ||||| ||| | || || |||    
T  19303338 gcctcgagagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaatta 19303437  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | || ||    
T  19303438 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtat 19303537  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19303538 aattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 19303636  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  19303637 tctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  158 atgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    |||||||||| | || | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  158 atgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16920431 - 16920751
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  16920431 gccttgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgtt-ggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagactta 16920529  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  16920530 agaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtat 16920628  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| | | | |||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16920629 acataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 16920725  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     || ||| || |||||||||||||||    
T  16920726 gtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Original strand, 1540928 - 1541073
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1540928 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 1541026  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1541027 tatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25644613 - 25644335
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagt-attgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgt 132  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||   || |  || ||||  ||| | |||| |||||||||||     
T  25644613 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgctgagagttgaaccttggggtagttataaagattatat-atgatattaatgatgatctgtgaagctga 25644515  T
Q  133 t-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatat 231  Q
    | || ||||  ||||||||| || |||||||||||| |  |||  |||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  25644514 tatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatat 25644415  T
Q  232 tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25644414 tgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25656771 - 25656629
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25656771 attagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttat 25656673  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25656672 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  178 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 277  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgtta 1595594  T
Q  278 tttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1595593 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18456924 - 18456735
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||    
T  18456924 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 18456826  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18456825 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
       | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 249  Q
    |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  250 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557054
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttg 309  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 20557041  T
Q  310 atgaagatgatga 322  Q
    || ||||||||||    
T  20557042 attaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22831825 - 22831503
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||  | || ||| |||  |||||     
T  22831825 gcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgacttgtt-ggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttg 22831727  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| ||    
T  22831726 agaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtat 22831628  T
Q  201 --atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
      || |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22831627 acatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22831531  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    || ||||   || |||||||||||||||    
T  22831530 cggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23992578 - 23992429
Alignment:
Q  171 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 270  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  23992578 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 23992482  T
Q  271 gttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  23992481 attgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 298
Target Start/End: Original strand, 15041468 - 15041644
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| || | || ||| |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||| |||| ||    
T  15041468 ctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcattacttgagattttattgaatacttaagatgttattgaatt 15041566  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15041567 gcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 323
Target Start/End: Original strand, 19847989 - 19848114
Alignment:
Q  198 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19847989 aatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19848088  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  19848089 cagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgtt--atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 240  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||  || | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  241 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Original strand, 18821795 - 18821946
Alignment:
Q  153 ttatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 251  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18821795 ttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatggcatgctgttttt 18821892  T
Q  252 gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18821893 gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 298
Target Start/End: Original strand, 25603302 - 25603478
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||  | |   ||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||| | |||||||| || |||||| || || ||    
T  25603302 ctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-gaatt 25603400  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
      || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25603401 ataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 298
Target Start/End: Original strand, 25611643 - 25611816
Alignment:
Q  124 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgca 223  Q
    |||||||||||||||||  | |   ||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||| | |||||||| || |||||| || || ||  |    
T  25611643 tgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-gaattata 25611741  T
Q  224 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    | ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25611742 aatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Original strand, 8227422 - 8227632
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  8227422 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgt 8227521  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    | |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || |||||| |||    
T  8227522 ttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttga 8227620  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  8227621 agatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 18821617 - 18821699
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggg 84  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18821617 gcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 18821699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  264 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | |||||||| | ||| || ||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496592
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
      |||||||||||||||    
T  28496576 tttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809003
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
      |||||||||||||||    
T  29808987 tttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766718
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  305 agttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    || |||  |||||||||||||    
T  23019426 agatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19652313 - 19652199
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19652313 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 19652216  T
Q  305 agttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||||||    
T  19652215 agttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18907255 - 18907111
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  18907255 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 18907157  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  18907156 tatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561303
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  1561319 gttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  248 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  304 aagttga 310  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 25642125 - 25642304
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg- 243  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||  ||   ||||||||  |||||| |||     
T  25642125 atgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttgttttt--attgatatcgttatgtgatgt 25642222  T
Q  244 ----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
        ||||| |||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  25642223 catactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 321
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  272 ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  248 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 11185825 - 11185769
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgca 58  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11185825 gcctcgtgagtgacccagaaacatagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgca 11185769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 313
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185930
Alignment:
Q  254 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Original strand, 22334954 - 22335014
Alignment:
Q  261 ctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22334954 ctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22335014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 16523441 - 16523500
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  16523441 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16523500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 325
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  278 tttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11185652 - 11185524
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-g 274  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||   |||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| |    
T  11185652 tgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttg 11185556  T
Q  275 ttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11185555 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18457013 - 18456956
Alignment:
Q  28 gccttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggg 84  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18457013 gccttgttcaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggg 18456956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 15894491 - 15894555
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  15894491 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 15894555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 20908039 - 20908075
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20908039 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20908075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 27553629 - 27553665
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27553629 tatgctgctgttgttctttaactaagttgcatgagtc 27553665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 343
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  666 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagactta 567  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  566 atgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaat 467  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  466 atttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 368  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  367 tctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3793 - 3470
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||    
T  3793 gcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagactta 3695  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  3694 atgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaat 3595  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||     
T  3594 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcgg 3495  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3494 tctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2174 - 1851
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  2174 gcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagatttt-gtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagactta 2076  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2075 atgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat 1976  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1975 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1876  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1875 tctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  7 cgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatg 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  107 acgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 206  Q
    | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  307 ttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40180 - 39858
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  40180 gcctcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaaccttggg-tagcattgagactta 40082  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40081 atgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaat 39982  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |     
T  39981 atttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttgg 39883  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39882 tctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 325
Target Start/End: Original strand, 2974 - 3271
Alignment:
Q  25 agtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgt 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  2974 agtgccttgtt--gtttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgt 3071  T
Q  125 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||     
T  3072 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcat 3171  T
Q  225 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3172 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13415 - 13144
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13415 gcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggactta 13317  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316 atgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 13217  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13216 atttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  250 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  269 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 24099 - 24406
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24099 gcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagactta 24197  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttg-attatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
     ||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24198 ttgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaa 24297  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24298 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24397  T
Q  299 gatctaagt 307  Q
    | |||||||    
T  24398 ggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8798 - 8479
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||    
T  8798 gcctcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagactta 8700  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8699 atgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaat 8604  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||     
T  8603 gtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcgg 8504  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8503 tctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 17012 - 17337
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17012 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagactta 17111  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || |||| |||| |||| | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||| | || ||    
T  17112 atcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtat 17211  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg--tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17212 acttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 17311  T
Q  299 gatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  17312 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Original strand, 79248 - 79430
Alignment:
Q  123 gtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 221  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||    
T  79248 gtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttg 79346  T
Q  222 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  79347 catttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 14139 - 14203
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  14139 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 5927 - 6245
Alignment:
Q  9 agtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||     
T  5927 agtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgat 6025  T
Q  109 gttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 208  Q
    |||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6026 gttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 6125  T
Q  209 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaa 305  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6126 tgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6225  T
Q  306 gttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6226 gttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 25862 - 26179
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  25862 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagactta 25961  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||| | || ||    
T  25962 atgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtat 26061  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26062 acttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 26161  T
Q  301 tctaagttgatgaagatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26162 tctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 33292 - 33479
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||   || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  33292 gcctcgcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 33391  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaa 188  Q
    ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  33392 atgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaa 33479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39800 - 39479
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  39800 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagactta 39701  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || |||| |||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||    
T  39700 ataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtat 39601  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  39600 atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39502  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  39501 tctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 75012 - 75333
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  75012 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagactta 75111  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || |||| |||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||    
T  75112 ataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtat 75211  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  75212 atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 75310  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  75311 tctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 339748 - 340065
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  339748 gcctcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagactta 339846  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||| | || ||    
T  339847 atgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtat 339946  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||     
T  339947 acttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcgg 340043  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  340044 tctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | |||||||| | ||| || ||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 294
Target Start/End: Original strand, 414108 - 414140
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  414108 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatg 414140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 847 - 1169
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  847 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagactta 945  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  946 atgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaat 1044  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1045 atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1144  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  1145 tctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4828 - 4508
Alignment:
Q  4 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  4828 tcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 4729  T
Q  104 atgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 203  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || |||||    
T  4728 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatt 4629  T
Q  204 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  4628 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtct 4530  T
Q  304 aagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  4529 aagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12410 - 12090
Alignment:
Q  4 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  12410 tcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 12311  T
Q  104 atgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 203  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || |||||    
T  12310 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatt 12211  T
Q  204 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  12210 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtct 12112  T
Q  304 aagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  12111 aagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22362 - 22042
Alignment:
Q  4 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  22362 tcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 22263  T
Q  104 atgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 203  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || |||||    
T  22262 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatt 22163  T
Q  204 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  22162 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtct 22064  T
Q  304 aagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  22063 aagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16397 - 16721
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16397 gcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagactta 16496  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | || ||    
T  16497 atgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat 16596  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16597 acttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 16696  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  16697 tctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5171 - 4849
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| | |  ||||||    
T  5171 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag--ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagactta 5074  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| |  ||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    || ||||||    
T  5073 atgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat 4974  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  4973 acttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcgg 4874  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  4873 tctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 32756 - 33077
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  32756 gcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaactta 32855  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaa-gatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
     ||| |  |||| |||| | |||||||||| ||| | |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  32856 ttgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatgatgc--tgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaa 32952  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32953 tatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcg 33051  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  33052 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46249 - 45928
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  46249 gcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaactta 46150  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaa-gatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
     ||| |  |||| |||| | |||||||||| ||| | |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  46149 ttgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatgatgc--tgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaa 46053  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46052 tatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcg 45954  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  45953 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16316 - 16113
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 219  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||| | || ||| || ||||| ||||| ||    
T  16316 ctgtgaagctgttttaagatg--ttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggct 16219  T
Q  220 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16218 tgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 16119  T
Q  320 tgatgt 325  Q
    ||||||    
T  16118 tgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16410 - 16334
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaac 78  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410 cctcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaac 16334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  264 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21234 - 20910
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||  ||||||    
T  21234 gcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgacttgttgagtttt-gcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagactta 21136  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || | | ||||||    
T  21135 atgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaat 21036  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||    
T  21035 atataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcg 20936  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||||| | |||||||| ||||||    
T  20935 gtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2275 - 1952
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  2275 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacatgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactta 2177  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||| | |||||| || |  ||| ||||||| || |||  |||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||  ||  ||||||    
T  2176 atgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaat 2077  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  2076 atttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcgg 1977  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||| || |||||||||||||||    
T  1976 tctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 760 - 1021
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  760 gcctcgtgagtgacctagaaacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagactta 859  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  860 atggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaat 959  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 266  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  960 atttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 325
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28154 - 27911
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | || ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  28154 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 28055  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || ||    
T  28054 atgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtat 27955  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc 244  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27954 atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 324
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||| | || ||| || |||||||||||| ||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  221 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 320  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  321 gatg 324  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 10224 - 10544
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  10224 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagactta 10322  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || || | |||| |||| | |||||||||||| ||||||  || | || |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  10323 ataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtat 10421  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  10422 acttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcg 10518  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  10519 gtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 124908 - 124675
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  124908 gcctcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagactta 124810  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  124809 atgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat 124710  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattatt 235  Q
    |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  124709 atttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgttatgt-gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  256 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  304 aag 306  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  304 aag 306  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15263 - 15584
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaa-ctttgggatagtattgggactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| |||  |||||    
T  15263 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttggg-taggattaagactt 15360  T
Q  100 aatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
    ||| || | |||| |||| | |||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||| ||  |    
T  15361 aataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatattttta 15459  T
Q  200 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  15460 tacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtca 15558  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  15559 gtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7359 - 7295
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  7359 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13818 - 13497
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||| |||  ||||||    
T  13818 gcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagactta 13720  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| ||    
T  13719 acaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtat 13621  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |  |||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13620 acataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 13522  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  13521 tctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5035 - 4712
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||  | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  5035 gcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagactta 4936  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | |||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||    
T  4935 acaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtat 4837  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |  |||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4836 acataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 4737  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  4736 tctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 1
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||  | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||  ||||||    
T  259 gcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagactta 160  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | |||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||    
T  159 acaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtat 61  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 260  Q
    |  |||||| ||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  60 acataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32387 - 32067
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  32387 gcctcgcgagtgacccagaaacagagttactt-ttttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactta 32289  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  32288 acaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtat 32190  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  32189 acctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 32092  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  32091 tctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4835 - 4545
Alignment:
Q  13 acccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgtta 112  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||| || ||||    
T  4835 acccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgtta 4736  T
Q  113 tttatgacctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgt 211  Q
     |||| |  ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4735 attataatttgtgaggctgttttaagatg--ttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgt 4638  T
Q  212 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||| ||  | |||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4637 tgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6933 - 6669
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||  || |||    
T  6933 gcctcgcgagtgacccataaacagagtgacatgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagattta 6835  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    ||||| | ||||||||| | |||| ||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||  ||||||    
T  6834 atgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaat 6735  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 266  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6734 atttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 195 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28544 - 28414
Alignment:
Q  195 ttgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 294  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28544 ttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 28445  T
Q  295 agtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28444 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1997
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  2013 gttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  272 ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16602 - 16282
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  16602 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgtt-ggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagactta 16504  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || |||| ||||  ||| | |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| ||    
T  16503 ataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtat 16405  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  ||| |||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  16404 acataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcg 16308  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  16307 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 850 - 1170
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | || ||| |||  | ||||    
T  850 gcctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtctta 948  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | |||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||    
T  949 agaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtat 1047  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  1048 acataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcg 1144  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  1145 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  158 atgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 20255 - 20524
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctg-t 132  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    ||    || | |||| | |||| ||||||||||| |    
T  20255 ttaggattttgcggtctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgggatagttatgaatattgtatataatgttaatgatgatctgtgaagctgat 20354  T
Q  133 ttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
    ||| ||||  ||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20355 ttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20452  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20453 attatgtcatgttg-ttttgtatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 297
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10487 - 10323
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  10487 gcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagactta 10388  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgata 165  Q
    || |||| |||| | || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10387 ataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1609 - 1289
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | || ||| |||  ||||||    
T  1609 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgtt-ggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagactta 1511  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| ||    
T  1510 agaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtat 1412  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1411 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 1315  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  1314 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7586 - 7266
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | || ||| |||  ||||||    
T  7586 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgtt-ggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagactta 7488  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  |||| ||||  ||| | || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| ||    
T  7487 agaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtat 7389  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7388 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 7292  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  7291 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 322
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1237 - 1052
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||    
T  1237 gcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagacttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagactta 1139  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttga 187  Q
    |||| || | || |||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  1138 atgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  99 taatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattg 197  Q
    ||||||||| |||| |||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  198 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 262  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 348 - 289
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  348 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44600 - 44454
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttg 274  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  44600 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg-ttgtgttgctgttg 44502  T
Q  275 ttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44501 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 38421 - 38596
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||||| |    
T  38421 atgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgtt 38520  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| ||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  38521 gttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  198 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgag 296  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  297 tcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  254 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Original strand, 40169 - 40291
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  40169 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagt 40267  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |  ||||||||||||| |||||||    
T  40268 cagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Original strand, 23608 - 23695
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatta 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  23608 atgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13537 - 13392
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13537 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 13439  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13438 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12763
Alignment:
Q  148 gttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-g 246  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | |    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattg 12838  T
Q  247 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||   ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  12837 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51902 - 51582
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  | || ||| |||  ||||||    
T  51902 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagactta 51804  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |   ||| ||||  ||| | |||||||||||  ||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||| |||| | |||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  51803 agagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtat 51705  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| | ||| ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51704 acataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 51608  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||| ||||||||||    
T  51607 gtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 62321 - 62200
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||   |||| | |||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  62321 atatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagt 62226  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    || | ||||| || || |||||||||    
T  62225 cggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132662
Alignment:
Q  239 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16846 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
      || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 310
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22776
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  298 cgatctaagttga 310  Q
    || ||||||||||    
T  22764 cggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatg 318  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 322
Target Start/End: Original strand, 85536 - 85742
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg- 213  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| ||||     
T  85536 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttga 85634  T
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |    
T  85635 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatta 85733  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    |||||||||    
T  85734 agatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 160809 - 160688
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  160809 atatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagt 160712  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  160711 cggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 422589 - 422625
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  422589 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 422625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatga 319  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4359 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Original strand, 6281 - 6425
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  6281 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 6379  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  6380 tatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47309 - 46995
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||   |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||  ||||||    
T  47309 gcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgacttgttagaaatg-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactta 47211  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    |  ||||       ||| | |||||||||||| ||||||  |||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||    
T  47210 acaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtat 47118  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||    
T  47117 acataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcg 47021  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
     |||||| || |||||||||||||||    
T  47020 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3802 - 3640
Alignment:
Q  3 ctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaat 102  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||    
T  3802 ctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-gtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaat 3704  T
Q  103 gatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatat 166  Q
    || || | || |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3703 gaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7866 - 7704
Alignment:
Q  3 ctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaat 102  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||    
T  7866 ctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-gtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaat 7768  T
Q  103 gatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatat 166  Q
    || || | || |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7767 gaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Original strand, 27660 - 27855
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||||||    
T  27660 atgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgt 27759  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27760 tgatttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| | ||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Original strand, 51683 - 51985
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaa 101  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||| |    
T  51683 cctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttga 51781  T
Q  102 tgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgatt-atgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaa 199  Q
      ||||  ||| |||  |  |||||||||||| | ||||   || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  51782 atatgatattaattacaatttgtgaagctgttatgagata--ttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaa 51878  T
Q  200 tatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    || || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  51879 taattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagt 51976  T
Q  298 cgatctaag 306  Q
    || ||||||    
T  51977 cggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32654 - 32538
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32654 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 32557  T
Q  305 agttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  32556 agttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 323  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 128971 - 129072
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  128971 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtct 129069  T
Q  304 aag 306  Q
    |||    
T  129070 aag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 73824 - 73883
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 73883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 78442 - 78348
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  78442 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 78348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 325
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  203 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  303 taagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 11312 - 11445
Alignment:
Q  2 cctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||  |||||||    
T  11312 cctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaa 11410  T
Q  102 tgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaa 136  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  11411 tgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaa 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 4929 - 5246
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||  || |||    
T  4929 gcctcgcgagtgacacagaaacagagtgacttatt-ggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagattta 5027  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 200  Q
    || || | |||| |||| |  |||||| |||  ||| ||  |||| ||||||||| |||||| |||| |||| | | |||||||||||| ||  ||| ||    
T  5028 ataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtat 5126  T
Q  201 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5127 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 5223  T
Q  300 atctaagttgatgaagatgatga 322  Q
     |||||| || ||||||||||||    
T  5224 gtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgtt--atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 240  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||  || | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  241 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  160 gtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
     |||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30074 - 29946
Alignment:
Q  179 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 278  Q
    |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  30074 attatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttat 29976  T
Q  279 ttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29975 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 258  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  259 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | || ||||||||      |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Original strand, 17790 - 17929
Alignment:
Q  6 gcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgat 105  Q
    |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||||||     
T  17790 gcgagtcacccagaaatagagtgacttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgag 17888  T
Q  106 gacgttatttatgacctgtgaagctgtttaagatgcgttga 146  Q
    || |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  17889 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13421 - 13147
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||| ||| | ||    ||||  | | | |||| |||||||||||||    
T  13421 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgtt 13322  T
Q  134 -taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaata-tttaagatgttgttgacttgcaattgatat 231  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  13321 ataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatat 13222  T
Q  232 tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    | |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13221 tgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Original strand, 16011 - 16206
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||   |||| ||| |||||||||    
T  16011 atgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgt 16110  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttga 310  Q
    ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16111 tgatttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20726 - 20595
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggactta 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||  ||||||    
T  20726 gcctcgcgagcgacctagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagactta 20628  T
Q  101 atgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||||| ||||  ||| | |||||||||||||    
T  20627 atgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  159 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 257  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  161189 tg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 242
Target Start/End: Original strand, 164547 - 164674
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg- 213  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||||||||     
T  164547 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttga 164645  T
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  164646 ttgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11464
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  11546 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Original strand, 17938 - 18148
Alignment:
Q  116 atgacctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  17938 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgt 18037  T
Q  215 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    | ||||||  | ||||||||||| ||||| || || || ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  18038 ttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 18136  T
Q  314 agatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||    
T  18137 agatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2291
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatta 2282  T
Q  314 agatgatga 322  Q
    | |||||||    
T  2283 aaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 325
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38377
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  38295 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42686 - 42627
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  42686 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 42627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 4746 - 4921
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||| |||    
T  4746 atgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagct 4845  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  4846 gttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 319
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1440
Alignment:
Q  214 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1336 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 1434  T
Q  314 agatga 319  Q
    ||||||    
T  1435 agatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 8995 - 9080
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  8995 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Original strand, 16291 - 16442
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 245  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||||| | |||||| |    
T  16291 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaat-taattgatattatgaagtcatgat 16389  T
Q  246 gtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16390 gttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38820
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |  |||  ||| |||||||| ||||  | ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 322  Q
    | |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  38741 gttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  156 tgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat--ttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 252  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  253 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    ||  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 295
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53640
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatga 295  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  150 tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 248  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 276  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || |||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 225698 - 225465
Alignment:
Q  34 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggatagtattgggacttaatgatgacgttatttatgacctgtgaagctgtt 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||    |||   ||||  ||| | |||| ||||||||||| |    
T  225698 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaagattatatatgatattaataatgaactgtgaagctgat 225599  T
Q  134 -taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatt 232  Q
     || ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  225598 atatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatatt 225500  T
Q  233 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 268  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  225499 attatatcacgctg-ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  298 cgatctaagttgatga 313  Q
    || |||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 299
Target Start/End: Original strand, 60631 - 60811
Alignment:
Q  121 ctgtgaagctgtt-taagatgcgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 219  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| |    
T  60631 ctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt 60730  T
Q  220 tgcaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  60731 tgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 60811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  309 gatgaagatgatga 322  Q
    ||| ||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1339
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||  |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  1424 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Original strand, 6121 - 6244
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  6121 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6220 tctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  298 cgatctaagttgatga 313  Q
    || |||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 304
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  243 --gctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
      ||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  8098 gagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15898
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||| ||| | | | |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  298 cgatctaag 306  Q
    || ||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 310
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10647
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  298 cgatctaagttga 310  Q
    || ||||||||||    
T  10635 cggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| | ||||||| ||| ||||  | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  243 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1190
Alignment:
Q  210 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagtt 308  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1173  T
Q  309 gatgaagatgatgatgt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  1174 gttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  298 cgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2024 - 1881
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttgtatactgcctatgttgctgttg 274  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||    
T  2024 tgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgctattg 1928  T
Q  275 ttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  1927 ttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193070
Alignment:
Q  149 ttgattatgatgtgatatagtgttatg-tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 247  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |  | ||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| || ||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  248 ttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 15268 - 15304
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15268 tatgatgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 15304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 19790 - 19826
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19790 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 325
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  254 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12766
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatgatgt 325  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15796
Alignment:
Q  261 ctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15736 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26999 - 26828
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 245  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| |     
T  26999 tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat--catgatt 26904  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  26903 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 321
Target Start/End: Original strand, 21749 - 21920
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 245  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  21749 tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 21844  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21845 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 321
Target Start/End: Original strand, 29641 - 29812
Alignment:
Q  147 tgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 245  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  29641 tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 29736  T
Q  246 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  29737 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 321
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  254 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  202 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||     
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  301 tctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 321
Target Start/End: Original strand, 45794 - 45909
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45794 agatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45892  T
Q  305 agttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||||||    
T  45893 agttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 920
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  1041 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 943  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  942 tattgaactaagttgcatgagtc 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1853
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||  ||||    
T  1974 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgt 1876  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1875 tatttaactaagttgcatgagtc 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9656 - 9536
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||||||||  |||   |||  ||||||| | ||||    
T  9656 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatga-gttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgt 9559  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9558 tatttaactaagttgcatgagtc 9536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1257
Alignment:
Q  146 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattat 234  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1169 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattatttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattat 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 6284 - 6386
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  6284 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtc 6382  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  6383 taag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  304 aagttga 310  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Original strand, 46670 - 46820
Alignment:
Q  148 gttgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 246  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| | || |||||     
T  46670 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaagttatgcta 46768  T
Q  247 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    || ||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46769 ttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtc 46820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44225 - 44104
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  44225 tgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 44127  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44126 tatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 163
Alignment:
Q  5 cgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgt 66  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||    
T  224 cgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgt 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  249 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatga 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8134 - 8090
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8134 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 304 - 159
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||     |||||||||||| | || ||| ||||  |||   |||  |||| |||| ||||    
T  304 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 205  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  204 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  305 agttga 310  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18321 - 18236
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  18321 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  255 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatcta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25226 - 25121
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  25226 agatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 25129  T
Q  303 taagttga 310  Q
    ||||||||    
T  25128 taagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32102
Alignment:
Q  227 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  258 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4603 - 4430
Alignment:
Q  148 gttgattatgatgtgatatagtg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 246  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||  ||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||||||    
T  4603 gttgattataatgtgatttattgattaattgcattacttgaaatattatcgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctg 4505  T
Q  247 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    || ||||   |||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  4504 ttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 4430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  264 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 298
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  260 cctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 393
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| |||||   | |||||||||||| | || |||||| | ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  537 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaag-aattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgt 439  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  438 tatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38342
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcg 299  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcg 38342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  236 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Original strand, 7870 - 7934
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||||||    
T  7870 ctgcctaggctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatatgagatgatcaagatgatg 7934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 10015 - 10162
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || || || ||  |||   |||  |||| |||| ||||    
T  10015 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattataaagttatactattgatgtgatctgattatgctgctattgt 10113  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 324  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||| |||| ||||||||||||    
T  10114 tatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 10162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14728 - 14664
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  14728 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23743 - 23679
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23743 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39167 - 39103
Alignment:
Q  257 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  39167 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 267781 - 267679
Alignment:
Q  206 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatc 302  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  267781 agatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 267683  T
Q  303 taag 306  Q
    ||||    
T  267682 taag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  207 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgatct 303  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||    
T  669 gatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 572  T
Q  304 aag 306  Q
    |||    
T  571 aag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1553 - 1494
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 321  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  1553 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 97188 - 97024
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  97188 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 97090  T
Q  243 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |  ||| |||| | ||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  97089 gaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 106466 - 106302
Alignment:
Q  143 ttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 242  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  106466 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 106368  T
Q  243 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 306  Q
    |  ||| |||| | ||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  106367 gaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 2057 - 2178
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||||||| | | |||||||  | |||||||||||||  || | |||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  2057 tgcattacttgaaatttcattgaatgatcaagatgttgttgaaatgga-ttgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 2155  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2156 tatttaactaagttgcatgagtc 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 6387 - 6508
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 275  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||||| || ||||   || |||||| |||| ||||    
T  6387 tgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgt 6485  T
Q  276 tatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  6486 tatttaactatgttgcatgagtc 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2281
Alignment:
Q  199 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 268  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  2213 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1947
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtt 74  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||| |  ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  1874 gcctcgcgagtgacccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagtt 1947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13153 - 13092
Alignment:
Q  176 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 237  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13153 tgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8619 - 8583
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8619 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 8583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7530 - 7494
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7530 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2227 - 2191
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2227 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 2191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 35569 - 35605
Alignment:
Q  262 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35569 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1083 times since January 2019
Visitors: 2243