View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0157_low_2 (Length: 587)

Name: NF0157_low_2
Description: NF0157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0157_low_2
NF0157_low_2
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (14-503)||(10055-10544)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (14-503)||(681-1170)
[»] chr2 (147 HSPs)
chr2 (14-503)||(20309108-20309597)
chr2 (14-503)||(37745-38235)
chr2 (15-503)||(23285865-23286352)
chr2 (14-503)||(23654028-23654507)
chr2 (14-500)||(298433-298933)
chr2 (15-503)||(22737799-22738300)
chr2 (15-503)||(22730852-22731355)
chr2 (17-503)||(23076442-23076940)
chr2 (14-503)||(23660023-23660525)
chr2 (15-503)||(22337115-22337617)
chr2 (14-353)||(27753728-27754078)
chr2 (38-486)||(32451571-32452033)
chr2 (202-503)||(23060513-23060815)
chr2 (14-121)||(28291920-28292027)
chr2 (386-503)||(23103399-23103516)
chr2 (47-192)||(23071614-23071768)
chr2 (27-127)||(22133848-22133948)
chr2 (28-132)||(25176227-25176331)
chr2 (151-484)||(23708383-23708721)
chr2 (386-487)||(7735-7838)
chr2 (407-503)||(19671830-19671928)
chr2 (354-500)||(22105412-22105560)
chr2 (407-503)||(23071972-23072070)
chr2 (299-499)||(40622123-40622327)
chr2 (430-487)||(23207293-23207350)
chr2 (60-128)||(28406368-28406436)
chr2 (387-499)||(7679589-7679702)
chr2 (13-127)||(24503473-24503587)
chr2 (33-99)||(24658055-24658121)
chr2 (14-99)||(22740579-22740664)
chr2 (14-99)||(22758334-22758419)
chr2 (427-503)||(8946657-8946732)
chr2 (432-487)||(20520243-20520298)
chr2 (14-81)||(23100849-23100916)
chr2 (354-500)||(26505379-26505526)
chr2 (354-500)||(26507857-26508004)
chr2 (431-498)||(28405981-28406048)
chr2 (37-192)||(22460843-22460999)
chr2 (14-100)||(22811553-22811639)
chr2 (430-487)||(22413186-22413243)
chr2 (354-497)||(21155075-21155219)
chr2 (439-503)||(23040247-23040310)
chr2 (431-499)||(25175854-25175922)
chr2 (33-129)||(25963355-25963451)
chr2 (340-502)||(32214921-32215085)
chr2 (15-126)||(12829434-12829545)
chr2 (354-500)||(18808943-18809090)
chr2 (431-502)||(22134256-22134326)
chr2 (432-487)||(23004764-23004819)
chr2 (354-500)||(23130862-23131009)
chr2 (354-500)||(23133329-23133476)
chr2 (354-500)||(23135590-23135737)
chr2 (354-500)||(23709547-23709694)
chr2 (354-500)||(23712028-23712175)
chr2 (432-487)||(25108903-25108958)
chr2 (354-500)||(34402537-34402684)
chr2 (14-113)||(37318652-37318751)
chr2 (354-500)||(39682313-39682460)
chr2 (16-126)||(21138903-21139013)
chr2 (37-131)||(27263610-27263704)
chr2 (37-192)||(19928155-19928311)
chr2 (33-78)||(45677793-45677838)
chr2 (405-500)||(571397-571493)
chr2 (405-500)||(6725995-6726091)
chr2 (432-488)||(23287378-23287433)
chr2 (33-100)||(21917954-21918021)
chr2 (432-487)||(23791289-23791344)
chr2 (354-484)||(24367790-24367921)
chr2 (35-78)||(24654989-24655032)
chr2 (433-488)||(26392397-26392451)
chr2 (33-100)||(37525078-37525145)
chr2 (354-500)||(45029869-45030016)
chr2 (13-192)||(15477901-15478081)
chr2 (38-100)||(22798769-22798831)
chr2 (405-498)||(43137301-43137395)
chr2 (431-484)||(18786952-18787005)
chr2 (13-126)||(21146918-21147031)
chr2 (13-114)||(24640590-24640691)
chr2 (33-78)||(24674012-24674057)
chr2 (13-114)||(30970608-30970709)
chr2 (28-128)||(18786440-18786540)
chr2 (34-74)||(24175227-24175267)
chr2 (34-74)||(24870307-24870347)
chr2 (354-500)||(24898210-24898358)
chr2 (354-500)||(24900693-24900841)
chr2 (354-500)||(24903170-24903318)
chr2 (354-500)||(24905647-24905795)
chr2 (354-500)||(24908122-24908270)
chr2 (15-127)||(27197248-27197360)
chr2 (27-115)||(29233904-29233992)
chr2 (27-115)||(29347203-29347291)
chr2 (35-75)||(40621848-40621888)
chr2 (148-191)||(22133977-22134020)
chr2 (141-192)||(22740717-22740768)
chr2 (432-487)||(24697657-24697712)
chr2 (37-131)||(26125562-26125656)
chr2 (354-500)||(32039513-32039660)
chr2 (450-500)||(28577099-28577149)
chr2 (450-500)||(38967374-38967424)
chr2 (59-105)||(39827602-39827648)
chr2 (33-74)||(21318284-21318325)
chr2 (33-74)||(21327215-21327256)
chr2 (37-74)||(23187491-23187528)
chr2 (54-127)||(23207744-23207817)
chr2 (37-74)||(23598754-23598791)
chr2 (13-74)||(24628107-24628168)
chr2 (37-74)||(40428892-40428929)
chr2 (37-74)||(41667365-41667402)
chr2 (13-86)||(44621358-44621431)
chr2 (13-101)||(12901141-12901229)
chr2 (29-101)||(19672318-19672390)
chr2 (29-105)||(23708252-23708328)
chr2 (405-500)||(24529595-24529691)
chr2 (441-497)||(24643054-24643109)
chr2 (42-192)||(24716188-24716339)
chr2 (157-192)||(12901286-12901321)
chr2 (54-129)||(22412717-22412792)
chr2 (33-100)||(23019344-23019411)
chr2 (38-81)||(23038468-23038511)
chr2 (68-115)||(23171413-23171460)
chr2 (68-115)||(23582670-23582717)
chr2 (157-192)||(24628252-24628287)
chr2 (157-192)||(24649654-24649689)
chr2 (157-192)||(27379206-27379241)
chr2 (157-192)||(27383252-27383287)
chr2 (157-192)||(27602094-27602129)
chr2 (157-192)||(41530783-41530818)
chr2 (28-98)||(7308-7378)
chr2 (434-488)||(9241941-9241994)
chr2 (44-126)||(10101305-10101387)
chr2 (59-101)||(23005221-23005263)
chr2 (384-430)||(23019706-23019752)
chr2 (151-189)||(28406297-28406335)
chr2 (59-101)||(34137412-34137454)
chr2 (37-74)||(61231-61268)
chr2 (44-101)||(18546536-18546593)
chr2 (13-74)||(24649773-24649834)
chr2 (37-66)||(24735827-24735856)
chr2 (150-191)||(25176158-25176199)
chr2 (13-74)||(41530638-41530699)
chr2 (44-113)||(41604391-41604460)
chr2 (44-113)||(41610288-41610357)
chr2 (13-86)||(41684378-41684451)
chr2 (48-81)||(44369952-44369985)
chr2 (38-66)||(18855115-18855143)
chr2 (13-101)||(27602186-27602274)
chr2 (156-192)||(31756232-31756268)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (17-503)||(32067-32553)
[»] chr7 (187 HSPs)
chr7 (14-501)||(40443393-40443880)
chr7 (14-503)||(27847462-27847951)
chr7 (14-503)||(16385876-16386369)
chr7 (14-503)||(9509189-9509692)
chr7 (14-503)||(12698831-12699335)
chr7 (14-503)||(26211995-26212488)
chr7 (15-503)||(38227481-38227982)
chr7 (158-503)||(10589039-10589386)
chr7 (14-500)||(3563982-3564482)
chr7 (45-484)||(15143686-15144139)
chr7 (14-192)||(28504919-28505106)
chr7 (14-131)||(15754505-15754622)
chr7 (291-500)||(18456319-18456530)
chr7 (14-188)||(39267264-39267447)
chr7 (14-192)||(2831924-2832110)
chr7 (14-131)||(9751168-9751285)
chr7 (14-131)||(18302564-18302681)
chr7 (38-500)||(17061602-17062077)
chr7 (14-128)||(34201172-34201286)
chr7 (29-196)||(44116816-44116992)
chr7 (29-193)||(12756350-12756523)
chr7 (14-106)||(11995676-11995768)
chr7 (27-131)||(44014560-44014664)
chr7 (27-131)||(810760-810864)
chr7 (407-503)||(16495402-16495500)
chr7 (407-503)||(28505321-28505419)
chr7 (407-503)||(34200786-34200884)
chr7 (354-503)||(13647325-13647476)
chr7 (408-503)||(11996051-11996148)
chr7 (27-132)||(68131-68236)
chr7 (334-500)||(16213684-16213852)
chr7 (28-132)||(47832193-47832297)
chr7 (27-106)||(18006052-18006131)
chr7 (299-499)||(17137978-17138177)
chr7 (27-132)||(9389326-9389431)
chr7 (14-99)||(24054884-24054969)
chr7 (431-503)||(67745-67817)
chr7 (28-132)||(16324391-16324495)
chr7 (14-81)||(19649103-19649170)
chr7 (13-127)||(44407988-44408102)
chr7 (386-484)||(2280121-2280221)
chr7 (299-403)||(12187115-12187218)
chr7 (384-503)||(16219717-16219835)
chr7 (386-500)||(48273392-48273508)
chr7 (13-127)||(14953560-14953674)
chr7 (38-132)||(16219358-16219452)
chr7 (14-132)||(21064780-21064898)
chr7 (354-500)||(24704688-24704832)
chr7 (13-127)||(26420340-26420454)
chr7 (13-126)||(4318174-4318287)
chr7 (14-99)||(10508701-10508786)
chr7 (431-499)||(811180-811248)
chr7 (431-499)||(18005650-18005718)
chr7 (431-499)||(44014182-44014250)
chr7 (431-503)||(47831807-47831879)
chr7 (29-100)||(2760542-2760613)
chr7 (29-100)||(3272202-3272273)
chr7 (407-503)||(10063841-10063939)
chr7 (407-503)||(15754910-15755008)
chr7 (33-100)||(17137701-17137768)
chr7 (354-500)||(24702238-24702385)
chr7 (385-450)||(2530139-2530205)
chr7 (13-127)||(14959526-14959640)
chr7 (354-503)||(18430709-18430859)
chr7 (50-132)||(22073301-22073383)
chr7 (14-99)||(11880668-11880753)
chr7 (59-132)||(12255454-12255527)
chr7 (427-484)||(12901342-12901399)
chr7 (14-78)||(9703703-9703767)
chr7 (432-484)||(14044765-14044817)
chr7 (432-484)||(14354795-14354847)
chr7 (405-500)||(44116509-44116605)
chr7 (354-500)||(456321-456468)
chr7 (354-500)||(11972496-11972643)
chr7 (354-500)||(14949137-14949284)
chr7 (354-500)||(15376728-15376875)
chr7 (386-484)||(16056347-16056446)
chr7 (354-500)||(16232520-16232667)
chr7 (354-500)||(18640272-18640419)
chr7 (407-503)||(19486767-19486865)
chr7 (432-487)||(20220238-20220293)
chr7 (354-500)||(20385138-20385285)
chr7 (354-500)||(21189610-21189757)
chr7 (354-484)||(24275187-24275318)
chr7 (354-500)||(32125491-32125638)
chr7 (354-500)||(41522917-41523064)
chr7 (354-500)||(41525379-41525526)
chr7 (430-484)||(1868043-1868097)
chr7 (354-499)||(11393302-11393448)
chr7 (33-99)||(12187429-12187495)
chr7 (37-192)||(13149451-13149607)
chr7 (13-127)||(14148932-14149046)
chr7 (59-128)||(2279781-2279850)
chr7 (14-127)||(11262691-11262804)
chr7 (430-487)||(15008547-15008604)
chr7 (28-81)||(18154469-18154522)
chr7 (430-487)||(48991196-48991253)
chr7 (405-500)||(16410059-16410155)
chr7 (435-503)||(22072913-22072981)
chr7 (50-101)||(2529631-2529682)
chr7 (33-100)||(12321380-12321447)
chr7 (432-475)||(14036282-14036325)
chr7 (432-475)||(14346312-14346355)
chr7 (40-99)||(15211844-15211903)
chr7 (354-500)||(27216860-27217007)
chr7 (37-192)||(6801509-6801665)
chr7 (44-126)||(20702651-20702733)
chr7 (37-192)||(26292692-26292848)
chr7 (44-126)||(32768038-32768120)
chr7 (13-114)||(6016800-6016901)
chr7 (37-74)||(8917842-8917879)
chr7 (37-74)||(13462177-13462214)
chr7 (33-78)||(14430315-14430360)
chr7 (37-74)||(15581108-15581145)
chr7 (29-74)||(42205530-42205575)
chr7 (405-500)||(13869346-13869442)
chr7 (38-74)||(15604926-15604962)
chr7 (151-219)||(16056616-16056684)
chr7 (441-500)||(3386333-3386391)
chr7 (13-127)||(12692858-12692973)
chr7 (37-131)||(16275850-16275944)
chr7 (153-192)||(18302494-18302533)
chr7 (151-193)||(810894-810936)
chr7 (37-131)||(9593704-9593798)
chr7 (37-131)||(9644667-9644761)
chr7 (13-127)||(11547896-11548010)
chr7 (13-127)||(11554492-11554606)
chr7 (431-481)||(12255842-12255892)
chr7 (50-132)||(16056713-16056795)
chr7 (37-192)||(16438687-16438843)
chr7 (422-484)||(18154882-18154943)
chr7 (450-500)||(20110556-20110606)
chr7 (37-74)||(11043-11080)
chr7 (37-74)||(18711-18748)
chr7 (13-126)||(33471-33584)
chr7 (13-126)||(70394-70507)
chr7 (13-126)||(74502-74615)
chr7 (13-114)||(7536561-7536662)
chr7 (37-74)||(11313064-11313101)
chr7 (37-74)||(11987628-11987665)
chr7 (37-74)||(12318543-12318580)
chr7 (37-74)||(13635122-13635159)
chr7 (408-500)||(13831373-13831466)
chr7 (60-129)||(14045212-14045281)
chr7 (60-129)||(14355242-14355311)
chr7 (50-115)||(14655082-14655147)
chr7 (37-74)||(15728740-15728777)
chr7 (37-74)||(16583650-16583687)
chr7 (37-74)||(16724284-16724321)
chr7 (37-74)||(17701298-17701335)
chr7 (151-200)||(22073223-22073272)
chr7 (37-74)||(35152021-35152058)
chr7 (34-74)||(9445808-9445848)
chr7 (153-192)||(9389462-9389501)
chr7 (153-192)||(9751316-9751355)
chr7 (68-115)||(11238655-11238702)
chr7 (153-192)||(11995796-11995835)
chr7 (157-192)||(12718966-12719001)
chr7 (157-192)||(12723877-12723912)
chr7 (70-129)||(12901793-12901852)
chr7 (250-476)||(15211484-15211703)
chr7 (157-192)||(16906974-16907009)
chr7 (50-125)||(17017045-17017120)
chr7 (141-192)||(17137820-17137871)
chr7 (432-487)||(18203828-18203882)
chr7 (157-192)||(18279701-18279736)
chr7 (157-192)||(18283664-18283699)
chr7 (153-192)||(34201099-34201138)
chr7 (154-192)||(68061-68099)
chr7 (59-125)||(9177252-9177318)
chr7 (59-101)||(11768526-11768568)
chr7 (151-193)||(12255556-12255598)
chr7 (54-100)||(15008102-15008148)
chr7 (69-127)||(25038895-25038953)
chr7 (14-132)||(35366609-35366727)
chr7 (60-129)||(1867650-1867719)
chr7 (28-65)||(14194729-14194766)
chr7 (13-74)||(16114658-16114719)
chr7 (13-74)||(16117811-16117872)
chr7 (13-74)||(16906829-16906890)
chr7 (13-74)||(18279820-18279881)
chr7 (13-74)||(18283783-18283844)
chr7 (69-126)||(18531608-18531665)
chr7 (37-74)||(18557387-18557424)
chr7 (151-192)||(44014489-44014530)
chr7 (13-86)||(48785744-48785817)
chr7 (13-113)||(9410321-9410421)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (14-503)||(15094-15584)
scaffold0114 (14-88)||(32894-32968)
scaffold0114 (335-499)||(7295-7459)
scaffold0114 (33-99)||(7705-7771)
[»] chr8 (153 HSPs)
chr8 (14-503)||(16199276-16199765)
chr8 (14-503)||(31971257-31971747)
chr8 (14-503)||(45130649-45131117)
chr8 (14-503)||(21918628-21919121)
chr8 (14-503)||(20536208-20536711)
chr8 (14-503)||(18878855-18879352)
chr8 (14-503)||(18818028-18818530)
chr8 (14-503)||(21923546-21924049)
chr8 (14-503)||(22626736-22627238)
chr8 (14-503)||(23406379-23406884)
chr8 (15-502)||(28648663-28649164)
chr8 (33-367)||(25362788-25363123)
chr8 (15-506)||(6759255-6759759)
chr8 (15-502)||(23648554-23649055)
chr8 (14-503)||(16091959-16092463)
chr8 (29-503)||(7372778-7373237)
chr8 (14-503)||(22875065-22875568)
chr8 (290-503)||(21389358-21389571)
chr8 (290-503)||(21395888-21396101)
chr8 (290-503)||(21790381-21790594)
chr8 (303-503)||(21778697-21778897)
chr8 (14-192)||(5865895-5866082)
chr8 (14-128)||(17141302-17141416)
chr8 (14-131)||(21255605-21255722)
chr8 (14-127)||(21491382-21491495)
chr8 (38-197)||(41598494-41598663)
chr8 (14-131)||(21249767-21249884)
chr8 (14-132)||(19801045-19801163)
chr8 (407-503)||(5866297-5866395)
chr8 (407-503)||(17140916-17141014)
chr8 (27-131)||(21674091-21674195)
chr8 (408-503)||(21490995-21491092)
chr8 (14-99)||(21389071-21389156)
chr8 (27-131)||(26355329-26355433)
chr8 (28-132)||(38854883-38854987)
chr8 (387-503)||(6520368-6520486)
chr8 (431-503)||(38855300-38855372)
chr8 (28-132)||(39834217-39834321)
chr8 (431-503)||(23760893-23760962)
chr8 (407-496)||(13508108-13508199)
chr8 (386-487)||(20498578-20498681)
chr8 (28-128)||(20499049-20499149)
chr8 (407-503)||(17612133-17612231)
chr8 (432-487)||(24353036-24353091)
chr8 (432-487)||(37116363-37116418)
chr8 (28-106)||(6520779-6520857)
chr8 (13-127)||(20527812-20527926)
chr8 (430-487)||(19154935-19154992)
chr8 (386-484)||(21285616-21285716)
chr8 (407-503)||(21249384-21249483)
chr8 (407-503)||(21255222-21255321)
chr8 (354-500)||(14409459-14409606)
chr8 (432-487)||(17267044-17267099)
chr8 (33-100)||(22010317-22010384)
chr8 (340-484)||(16413316-16413462)
chr8 (33-99)||(19899510-19899576)
chr8 (38-132)||(23760482-23760576)
chr8 (33-78)||(377714-377759)
chr8 (431-484)||(983455-983508)
chr8 (14-99)||(17353556-17353641)
chr8 (33-78)||(20465677-20465722)
chr8 (407-496)||(13597640-13597731)
chr8 (29-129)||(16409889-16409989)
chr8 (405-500)||(20046261-20046357)
chr8 (13-113)||(23845412-23845512)
chr8 (14-78)||(24756157-24756221)
chr8 (431-499)||(26355747-26355815)
chr8 (354-500)||(1484402-1484549)
chr8 (354-500)||(5853307-5853454)
chr8 (33-100)||(15602655-15602722)
chr8 (33-100)||(15611107-15611174)
chr8 (29-100)||(16860971-16861042)
chr8 (432-487)||(17439557-17439612)
chr8 (354-500)||(20403227-20403374)
chr8 (38-125)||(21414869-21414956)
chr8 (354-500)||(22001753-22001900)
chr8 (33-100)||(30642929-30642996)
chr8 (29-127)||(16411903-16412001)
chr8 (14-99)||(19976860-19976947)
chr8 (33-129)||(21168359-21168455)
chr8 (43-99)||(21395630-21395686)
chr8 (43-99)||(21790123-21790179)
chr8 (354-500)||(4483281-4483427)
chr8 (33-100)||(21161753-21161820)
chr8 (354-500)||(41598188-41598335)
chr8 (50-100)||(13507663-13507713)
chr8 (50-100)||(13597195-13597245)
chr8 (33-99)||(16185143-16185209)
chr8 (37-99)||(19983508-19983570)
chr8 (37-131)||(23834532-23834626)
chr8 (37-192)||(24433890-24434046)
chr8 (44-126)||(29123449-29123531)
chr8 (43-100)||(17926355-17926412)
chr8 (37-74)||(18619894-18619931)
chr8 (13-126)||(18865695-18865808)
chr8 (37-74)||(22028973-22029010)
chr8 (13-114)||(26934805-26934906)
chr8 (405-500)||(15203297-15203393)
chr8 (38-78)||(20856068-20856108)
chr8 (441-500)||(4542477-4542535)
chr8 (441-500)||(19896265-19896323)
chr8 (50-128)||(982980-983058)
chr8 (37-192)||(15538745-15538901)
chr8 (37-192)||(22113381-22113537)
chr8 (37-192)||(22134884-22135040)
chr8 (33-78)||(23776471-23776517)
chr8 (450-500)||(26225359-26225409)
chr8 (13-114)||(3216637-3216738)
chr8 (37-74)||(15532304-15532341)
chr8 (155-192)||(17141229-17141266)
chr8 (54-127)||(17266574-17266647)
chr8 (13-86)||(17615348-17615421)
chr8 (13-126)||(18855300-18855413)
chr8 (38-99)||(19259245-19259305)
chr8 (405-487)||(19801448-19801530)
chr8 (155-192)||(21249697-21249734)
chr8 (435-484)||(21673723-21673772)
chr8 (37-70)||(22057768-22057801)
chr8 (13-86)||(22059006-22059079)
chr8 (37-74)||(22166034-22166071)
chr8 (37-74)||(23252415-23252452)
chr8 (386-484)||(26219733-26219831)
chr8 (37-74)||(30308407-30308444)
chr8 (37-74)||(32599094-32599131)
chr8 (37-74)||(32605626-32605663)
chr8 (59-128)||(37116813-37116882)
chr8 (37-74)||(39094594-39094631)
chr8 (151-192)||(39834147-39834188)
chr8 (405-484)||(15070574-15070654)
chr8 (450-506)||(19937118-19937174)
chr8 (432-488)||(22525573-22525628)
chr8 (405-484)||(45290761-45290841)
chr8 (44-115)||(19111601-19111672)
chr8 (44-115)||(19117892-19117963)
chr8 (54-129)||(24353488-24353563)
chr8 (157-192)||(43252110-43252145)
chr8 (67-101)||(17085770-17085804)
chr8 (434-488)||(20502154-20502207)
chr8 (28-86)||(21286652-21286710)
chr8 (37-74)||(17055042-17055079)
chr8 (37-74)||(17828236-17828273)
chr8 (155-192)||(21255535-21255572)
chr8 (13-74)||(21972213-21972274)
chr8 (37-74)||(22045274-22045311)
chr8 (37-66)||(23844567-23844596)
chr8 (13-86)||(28854381-28854454)
chr8 (151-191)||(21674021-21674061)
chr8 (152-192)||(21972353-21972393)
chr8 (152-192)||(21976438-21976478)
chr8 (435-487)||(28397566-28397617)
chr8 (152-192)||(37116664-37116704)
chr8 (151-191)||(38855015-38855055)
chr8 (59-127)||(40492438-40492506)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (14-503)||(13497-13987)
[»] chr4 (170 HSPs)
chr4 (14-503)||(14052932-14053422)
chr4 (14-503)||(12902757-12903248)
chr4 (17-503)||(7088877-7089366)
chr4 (14-503)||(44052829-44053332)
chr4 (14-377)||(3096772-3097135)
chr4 (14-501)||(22636437-22636937)
chr4 (33-367)||(17047721-17048055)
chr4 (38-500)||(16377164-16377639)
chr4 (15-498)||(14038653-14039151)
chr4 (266-503)||(17046487-17046724)
chr4 (151-496)||(23374125-23374473)
chr4 (134-503)||(7893703-7894073)
chr4 (180-503)||(16239764-16240090)
chr4 (14-236)||(7798967-7799200)
chr4 (14-309)||(15091093-15091400)
chr4 (15-500)||(44928542-44929042)
chr4 (14-131)||(15552199-15552316)
chr4 (14-131)||(16597031-16597148)
chr4 (294-503)||(16270145-16270356)
chr4 (14-192)||(24029057-24029244)
chr4 (14-131)||(16239610-16239728)
chr4 (14-192)||(13812427-13812614)
chr4 (14-131)||(20156908-20157025)
chr4 (14-131)||(22633831-22633948)
chr4 (322-503)||(7798774-7798958)
chr4 (38-197)||(44102520-44102688)
chr4 (38-131)||(6190819-6190912)
chr4 (186-486)||(6190479-6190782)
chr4 (334-503)||(6899891-6900062)
chr4 (27-130)||(12774385-12774488)
chr4 (38-193)||(21814945-21815109)
chr4 (38-193)||(21815274-21815438)
chr4 (38-193)||(21818367-21818531)
chr4 (27-131)||(8846761-8846865)
chr4 (384-503)||(52873367-52873488)
chr4 (407-503)||(15551817-15551915)
chr4 (334-487)||(13800-13956)
chr4 (28-132)||(39705920-39706024)
chr4 (422-503)||(3096293-3096373)
chr4 (354-501)||(22353835-22353984)
chr4 (28-132)||(15099735-15099839)
chr4 (13-127)||(14679325-14679439)
chr4 (331-417)||(15121749-15121834)
chr4 (331-450)||(43256106-43256227)
chr4 (431-499)||(12774011-12774079)
chr4 (15-127)||(14685534-14685646)
chr4 (431-503)||(39706337-39706409)
chr4 (28-132)||(43198220-43198324)
chr4 (386-500)||(14280316-14280431)
chr4 (59-484)||(52242856-52243298)
chr4 (13-192)||(9556827-9557007)
chr4 (28-106)||(13844950-13845028)
chr4 (13-127)||(23838796-23838910)
chr4 (28-129)||(13405-13506)
chr4 (13-126)||(7900800-7900913)
chr4 (431-484)||(12288259-12288312)
chr4 (430-487)||(46640504-46640561)
chr4 (50-129)||(15868289-15868368)
chr4 (33-100)||(16356591-16356658)
chr4 (68-115)||(17046718-17046765)
chr4 (15-66)||(17053482-17053533)
chr4 (354-500)||(18215289-18215436)
chr4 (40-192)||(19757257-19757410)
chr4 (40-192)||(19782396-19782549)
chr4 (432-487)||(53082202-53082257)
chr4 (386-500)||(54798756-54798872)
chr4 (340-500)||(23803265-23803427)
chr4 (13-127)||(35614301-35614415)
chr4 (39-132)||(15190702-15190795)
chr4 (13-126)||(15321723-15321836)
chr4 (14-99)||(44676047-44676132)
chr4 (13-126)||(51493447-51493560)
chr4 (431-499)||(8846360-8846428)
chr4 (14-78)||(13569948-13570012)
chr4 (13-113)||(16956279-16956379)
chr4 (340-506)||(19242693-19242861)
chr4 (340-502)||(19618172-19618336)
chr4 (354-500)||(12322-12469)
chr4 (33-100)||(15094187-15094254)
chr4 (354-500)||(15118367-15118514)
chr4 (33-100)||(15121441-15121508)
chr4 (354-500)||(44615288-44615435)
chr4 (354-500)||(52312510-52312657)
chr4 (340-500)||(3515007-3515169)
chr4 (37-192)||(16243053-16243209)
chr4 (13-131)||(27534384-27534502)
chr4 (438-484)||(43198611-43198657)
chr4 (340-500)||(51463868-51464030)
chr4 (386-484)||(8574871-8574969)
chr4 (59-128)||(15464592-15464661)
chr4 (33-78)||(16348330-16348375)
chr4 (14-99)||(23843894-23843979)
chr4 (334-500)||(1837503-1837671)
chr4 (14-78)||(12570457-12570521)
chr4 (37-189)||(26243318-26243471)
chr4 (405-500)||(44773153-44773249)
chr4 (27-126)||(385997-386096)
chr4 (354-500)||(18239434-18239581)
chr4 (44-127)||(40471837-40471920)
chr4 (354-500)||(50222354-50222501)
chr4 (37-192)||(2015075-2015231)
chr4 (151-193)||(12774313-12774355)
chr4 (37-192)||(18222031-18222187)
chr4 (50-100)||(32851868-32851918)
chr4 (44-126)||(40478511-40478593)
chr4 (37-74)||(3413212-3413249)
chr4 (13-114)||(9271733-9271834)
chr4 (37-74)||(18602398-18602435)
chr4 (37-74)||(18608992-18609029)
chr4 (13-114)||(53433753-53433854)
chr4 (37-192)||(1951414-1951570)
chr4 (34-74)||(11250211-11250251)
chr4 (340-500)||(12610950-12611105)
chr4 (27-115)||(14268101-14268189)
chr4 (405-484)||(15355391-15355471)
chr4 (34-74)||(16351498-16351538)
chr4 (153-192)||(3332201-3332240)
chr4 (441-500)||(7641286-7641344)
chr4 (405-503)||(15367690-15367789)
chr4 (405-503)||(15370018-15370117)
chr4 (405-503)||(15371202-15371301)
chr4 (405-503)||(15373483-15373582)
chr4 (405-503)||(15402703-15402802)
chr4 (33-100)||(16487716-16487783)
chr4 (13-127)||(35170991-35171105)
chr4 (37-192)||(17152140-17152296)
chr4 (154-192)||(22633980-22634018)
chr4 (44-126)||(26284568-26284650)
chr4 (450-500)||(44102214-44102264)
chr4 (37-192)||(45938444-45938600)
chr4 (13-126)||(6873005-6873118)
chr4 (37-74)||(14708287-14708324)
chr4 (151-192)||(15099665-15099706)
chr4 (155-192)||(15552129-15552166)
chr4 (450-503)||(16223532-16223585)
chr4 (37-74)||(18237308-18237345)
chr4 (37-74)||(23139686-23139723)
chr4 (13-86)||(28383255-28383328)
chr4 (37-74)||(28569097-28569134)
chr4 (37-74)||(36133615-36133652)
chr4 (37-74)||(43255813-43255850)
chr4 (151-260)||(15464694-15464805)
chr4 (432-488)||(17333292-17333347)
chr4 (34-74)||(25555932-25555972)
chr4 (157-192)||(4561107-4561142)
chr4 (157-192)||(5756711-5756746)
chr4 (54-129)||(12287791-12287866)
chr4 (35-74)||(15352957-15352996)
chr4 (153-192)||(20157056-20157095)
chr4 (157-192)||(33742675-33742710)
chr4 (69-127)||(12522447-12522505)
chr4 (44-126)||(14757082-14757164)
chr4 (340-484)||(14970707-14970853)
chr4 (33-99)||(15124792-15124858)
chr4 (44-126)||(17810636-17810718)
chr4 (37-131)||(18228528-18228622)
chr4 (13-99)||(30234807-30234893)
chr4 (59-101)||(32306582-32306624)
chr4 (69-127)||(41385430-41385488)
chr4 (13-86)||(287521-287594)
chr4 (13-74)||(4560962-4561023)
chr4 (13-74)||(5756566-5756627)
chr4 (151-192)||(8846689-8846730)
chr4 (407-465)||(16596686-16596746)
chr4 (13-74)||(33742794-33742855)
chr4 (37-74)||(42997103-42997140)
chr4 (13-86)||(47126441-47126514)
chr4 (54-131)||(53081755-53081832)
chr4 (38-74)||(9530849-9530885)
chr4 (151-191)||(39706052-39706092)
[»] chr5 (178 HSPs)
chr5 (26-503)||(21292611-21293090)
chr5 (14-503)||(8286471-8286964)
chr5 (14-503)||(22075018-22075511)
chr5 (15-503)||(23390115-23390617)
chr5 (14-503)||(24493569-24494071)
chr5 (14-503)||(25421532-25422035)
chr5 (15-503)||(13095495-13095996)
chr5 (14-500)||(24529223-24529724)
chr5 (14-368)||(22107002-22107357)
chr5 (15-503)||(13025311-13025812)
chr5 (14-503)||(9077952-9078455)
chr5 (14-483)||(25431414-25431897)
chr5 (14-503)||(1096467-1096970)
chr5 (14-367)||(21985765-21986130)
chr5 (14-131)||(19660455-19660572)
chr5 (14-192)||(22119811-22119998)
chr5 (38-199)||(11580887-11581058)
chr5 (15-131)||(21871190-21871306)
chr5 (15-131)||(21875470-21875586)
chr5 (339-503)||(21808343-21808510)
chr5 (353-503)||(21729033-21729185)
chr5 (38-197)||(36154470-36154639)
chr5 (386-496)||(37723910-37724020)
chr5 (14-192)||(24766955-24767142)
chr5 (27-131)||(21565930-21566034)
chr5 (29-130)||(22959166-22959267)
chr5 (405-503)||(21997555-21997655)
chr5 (407-503)||(36314577-36314675)
chr5 (431-503)||(19660884-19660956)
chr5 (27-131)||(19669286-19669390)
chr5 (387-503)||(21329500-21329618)
chr5 (59-487)||(22144065-22144508)
chr5 (28-132)||(21329127-21329231)
chr5 (431-503)||(21502205-21502277)
chr5 (387-487)||(20026942-20027046)
chr5 (299-499)||(22032323-22032520)
chr5 (299-499)||(18769919-18770118)
chr5 (38-132)||(21498659-21498753)
chr5 (405-484)||(26012056-26012137)
chr5 (331-450)||(18356367-18356488)
chr5 (431-499)||(22959581-22959649)
chr5 (331-403)||(23572180-23572252)
chr5 (15-99)||(37724319-37724403)
chr5 (13-127)||(21294892-21295006)
chr5 (388-499)||(21565546-21565659)
chr5 (13-126)||(15441583-15441696)
chr5 (28-132)||(5888807-5888911)
chr5 (291-500)||(22412187-22412388)
chr5 (354-500)||(29329934-29330081)
chr5 (13-127)||(14359448-14359562)
chr5 (331-450)||(20910745-20910866)
chr5 (37-192)||(21340420-21340576)
chr5 (33-99)||(22032731-22032797)
chr5 (13-127)||(24554896-24555010)
chr5 (37-192)||(26665784-26665940)
chr5 (37-192)||(26937381-26937537)
chr5 (29-78)||(17918796-17918845)
chr5 (430-487)||(22178269-22178326)
chr5 (14-99)||(23201784-23201869)
chr5 (13-126)||(25406789-25406902)
chr5 (405-500)||(11581265-11581361)
chr5 (28-132)||(21741175-21741279)
chr5 (13-113)||(25808115-25808215)
chr5 (354-500)||(264783-264930)
chr5 (354-500)||(10732955-10733102)
chr5 (354-500)||(20909012-20909159)
chr5 (33-100)||(21366304-21366371)
chr5 (15-78)||(31342539-31342602)
chr5 (354-500)||(39363384-39363531)
chr5 (37-192)||(16674449-16674605)
chr5 (37-192)||(18356624-18356780)
chr5 (33-99)||(18769642-18769708)
chr5 (14-192)||(20910430-20910609)
chr5 (37-192)||(23535242-23535398)
chr5 (37-192)||(24532701-24532857)
chr5 (291-484)||(18418599-18418793)
chr5 (13-126)||(22133362-22133475)
chr5 (13-126)||(22140054-22140167)
chr5 (14-78)||(14079584-14079648)
chr5 (431-503)||(19668898-19668970)
chr5 (405-484)||(20902075-20902155)
chr5 (13-125)||(22588459-22588571)
chr5 (405-500)||(39245136-39245232)
chr5 (33-100)||(20805961-20806028)
chr5 (33-100)||(23512521-23512588)
chr5 (407-503)||(40725853-40725951)
chr5 (354-500)||(42245380-42245527)
chr5 (34-100)||(12028215-12028281)
chr5 (44-126)||(17284430-17284512)
chr5 (33-99)||(21887239-21887305)
chr5 (433-487)||(26740697-26740750)
chr5 (37-131)||(33409565-33409659)
chr5 (354-500)||(36154798-36154942)
chr5 (28-125)||(20026495-20026592)
chr5 (35-100)||(26680980-26681045)
chr5 (433-482)||(26732884-26732932)
chr5 (35-100)||(26952587-26952652)
chr5 (405-500)||(2154680-2154776)
chr5 (34-74)||(22760081-22760121)
chr5 (34-74)||(24222304-24222344)
chr5 (14-74)||(26742376-26742436)
chr5 (62-126)||(41294112-41294176)
chr5 (441-500)||(20918052-20918110)
chr5 (50-101)||(22177797-22177848)
chr5 (14-81)||(23500964-23501031)
chr5 (354-500)||(29345980-29346127)
chr5 (44-126)||(15236440-15236522)
chr5 (434-488)||(15796434-15796487)
chr5 (37-192)||(17718092-17718248)
chr5 (13-192)||(19472348-19472528)
chr5 (37-192)||(21884842-21884998)
chr5 (434-488)||(23469818-23469871)
chr5 (69-127)||(25535351-25535409)
chr5 (50-132)||(26011688-26011770)
chr5 (44-126)||(29471019-29471101)
chr5 (44-126)||(29477614-29477696)
chr5 (450-500)||(38619434-38619484)
chr5 (29-74)||(1858621-1858666)
chr5 (37-74)||(4036636-4036673)
chr5 (151-192)||(5888940-5888981)
chr5 (13-86)||(16255551-16255624)
chr5 (13-86)||(16259184-16259257)
chr5 (405-497)||(18319100-18319193)
chr5 (37-74)||(18784463-18784500)
chr5 (155-192)||(19660606-19660643)
chr5 (37-74)||(21482894-21482931)
chr5 (151-200)||(21501919-21501968)
chr5 (151-188)||(21565863-21565900)
chr5 (13-126)||(22325555-22325668)
chr5 (13-86)||(22589348-22589421)
chr5 (13-86)||(22592903-22592976)
chr5 (13-86)||(22596458-22596531)
chr5 (151-192)||(22959298-22959339)
chr5 (450-499)||(23064512-23064561)
chr5 (69-126)||(23336973-23337030)
chr5 (37-74)||(25229059-25229096)
chr5 (37-74)||(25293215-25293252)
chr5 (37-74)||(26172880-26172917)
chr5 (50-115)||(27517126-27517191)
chr5 (50-115)||(27523763-27523828)
chr5 (450-487)||(27988997-27989034)
chr5 (37-74)||(42805836-42805873)
chr5 (452-500)||(10775790-10775838)
chr5 (153-193)||(20026706-20026746)
chr5 (405-500)||(31061068-31061164)
chr5 (68-115)||(19992258-19992305)
chr5 (157-192)||(20296145-20296180)
chr5 (68-115)||(22334501-22334548)
chr5 (141-192)||(23201680-23201731)
chr5 (13-104)||(23693870-23693961)
chr5 (38-81)||(26704499-26704542)
chr5 (38-81)||(26974232-26974275)
chr5 (153-192)||(31342414-31342453)
chr5 (354-500)||(32027393-32027540)
chr5 (44-115)||(34294212-34294283)
chr5 (68-127)||(37286464-37286523)
chr5 (68-127)||(37293167-37293226)
chr5 (33-63)||(23572510-23572540)
chr5 (154-192)||(25744036-25744074)
chr5 (422-484)||(26704090-26704151)
chr5 (59-101)||(26732421-26732463)
chr5 (59-101)||(26740234-26740276)
chr5 (422-484)||(26973823-26973884)
chr5 (37-74)||(18774620-18774657)
chr5 (143-192)||(20232847-20232896)
chr5 (37-66)||(20232954-20232983)
chr5 (13-74)||(20296264-20296325)
chr5 (434-487)||(21328268-21328320)
chr5 (151-188)||(21741308-21741345)
chr5 (13-114)||(22343873-22343974)
chr5 (59-100)||(25574056-25574097)
chr5 (59-100)||(25575249-25575290)
chr5 (59-100)||(25576442-25576483)
chr5 (152-192)||(123074-123114)
chr5 (14-86)||(4398138-4398210)
chr5 (136-192)||(21871321-21871377)
chr5 (136-192)||(21875601-21875657)
chr5 (13-113)||(24020637-24020737)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (14-503)||(16282-16771)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (14-503)||(46995-47478)
scaffold0064 (33-99)||(64301-64367)
[»] chr3 (242 HSPs)
chr3 (14-503)||(20698065-20698556)
chr3 (15-503)||(17487856-17488359)
chr3 (66-503)||(13442274-13442725)
chr3 (14-503)||(12399209-12399698)
chr3 (15-503)||(17499338-17499841)
chr3 (14-503)||(26686887-26687390)
chr3 (14-503)||(18438534-18439037)
chr3 (14-503)||(14972854-14973357)
chr3 (14-484)||(14576451-14576934)
chr3 (14-500)||(40213339-40213838)
chr3 (17-484)||(14572608-14573088)
chr3 (14-503)||(25476003-25476506)
chr3 (14-503)||(23082979-23083482)
chr3 (14-503)||(11424381-11424880)
chr3 (14-484)||(30029859-30030331)
chr3 (129-503)||(43840932-43841309)
chr3 (15-182)||(16809724-16809887)
chr3 (14-200)||(17247904-17248100)
chr3 (14-131)||(14179708-14179825)
chr3 (14-131)||(12340138-12340255)
chr3 (18-193)||(53070321-53070505)
chr3 (178-367)||(16796685-16796875)
chr3 (14-131)||(13209946-13210062)
chr3 (14-131)||(14665991-14666108)
chr3 (14-131)||(14669146-14669263)
chr3 (14-131)||(14735504-14735621)
chr3 (291-500)||(24153115-24153326)
chr3 (38-484)||(42386429-42386890)
chr3 (38-128)||(4588457-4588547)
chr3 (14-123)||(43842572-43842681)
chr3 (16-192)||(12851984-12852169)
chr3 (27-130)||(49389275-49389378)
chr3 (27-131)||(12933941-12934045)
chr3 (27-127)||(32308058-32308158)
chr3 (27-128)||(9513299-9513400)
chr3 (27-128)||(9521274-9521375)
chr3 (18-112)||(17247142-17247236)
chr3 (29-129)||(16104168-16104268)
chr3 (27-131)||(49667715-49667818)
chr3 (407-503)||(13210350-13210448)
chr3 (27-128)||(1644314-1644415)
chr3 (27-128)||(16097719-16097820)
chr3 (29-106)||(12171750-12171827)
chr3 (14-99)||(15877447-15877532)
chr3 (28-132)||(15471309-15471413)
chr3 (431-499)||(49668125-49668193)
chr3 (407-503)||(24340746-24340844)
chr3 (405-503)||(43550544-43550644)
chr3 (28-126)||(2050833-2050931)
chr3 (290-367)||(14179570-14179648)
chr3 (386-503)||(15470927-15471043)
chr3 (28-132)||(1465041-1465145)
chr3 (431-499)||(9512924-9512992)
chr3 (431-499)||(9520899-9520967)
chr3 (431-499)||(12174308-12174376)
chr3 (50-125)||(324627-324702)
chr3 (432-487)||(22110402-22110457)
chr3 (432-487)||(43925974-43926029)
chr3 (13-127)||(839609-839723)
chr3 (335-499)||(856140-856304)
chr3 (13-127)||(24188140-24188254)
chr3 (430-499)||(37251216-37251283)
chr3 (37-192)||(38814681-38814837)
chr3 (13-127)||(55149341-55149455)
chr3 (386-500)||(27165250-27165366)
chr3 (431-484)||(32307696-32307749)
chr3 (38-126)||(14234881-14234969)
chr3 (431-487)||(52523778-52523834)
chr3 (354-500)||(9707622-9707769)
chr3 (387-503)||(14234487-14234605)
chr3 (354-500)||(29172598-29172745)
chr3 (37-192)||(17242269-17242425)
chr3 (340-500)||(17672626-17672788)
chr3 (438-500)||(28194693-28194755)
chr3 (340-484)||(50242838-50242984)
chr3 (354-487)||(53070668-53070802)
chr3 (405-500)||(53301572-53301669)
chr3 (434-487)||(606378-606431)
chr3 (29-78)||(3402600-3402649)
chr3 (33-78)||(11298167-11298212)
chr3 (386-500)||(36166598-36166712)
chr3 (13-113)||(4291149-4291249)
chr3 (430-486)||(12377938-12377994)
chr3 (435-499)||(16097332-16097396)
chr3 (431-499)||(16103784-16103852)
chr3 (33-129)||(18383555-18383651)
chr3 (13-192)||(20723298-20723478)
chr3 (407-484)||(23274706-23274785)
chr3 (15-78)||(321634-321697)
chr3 (354-500)||(7781362-7781509)
chr3 (33-100)||(12173199-12173266)
chr3 (33-100)||(12496668-12496735)
chr3 (340-501)||(13544024-13544187)
chr3 (354-500)||(17463178-17463325)
chr3 (33-100)||(23077116-23077183)
chr3 (354-500)||(28848626-28848773)
chr3 (354-500)||(34159326-34159473)
chr3 (407-503)||(37642288-37642386)
chr3 (354-500)||(45606922-45607069)
chr3 (354-500)||(55476491-55476638)
chr3 (33-99)||(856550-856616)
chr3 (37-192)||(3833971-3834127)
chr3 (340-484)||(12567576-12567722)
chr3 (33-99)||(15060706-15060772)
chr3 (50-128)||(22109929-22110007)
chr3 (13-114)||(16333548-16333649)
chr3 (29-78)||(17674209-17674258)
chr3 (37-78)||(26190651-26190692)
chr3 (388-500)||(55500942-55501055)
chr3 (38-78)||(3389600-3389640)
chr3 (405-500)||(6469200-6469296)
chr3 (405-500)||(8499518-8499614)
chr3 (405-500)||(15977515-15977611)
chr3 (34-78)||(17524813-17524857)
chr3 (59-131)||(52523390-52523462)
chr3 (33-76)||(323026-323069)
chr3 (354-500)||(8899094-8899241)
chr3 (50-101)||(14501615-14501666)
chr3 (33-100)||(14878143-14878210)
chr3 (354-500)||(16454296-16454443)
chr3 (50-125)||(23275133-23275208)
chr3 (354-484)||(38961906-38962037)
chr3 (37-192)||(1598133-1598289)
chr3 (151-193)||(1644447-1644489)
chr3 (37-192)||(11300164-11300320)
chr3 (33-99)||(15051930-15051996)
chr3 (37-192)||(15849738-15849894)
chr3 (17-99)||(23408847-23408928)
chr3 (44-126)||(23704428-23704510)
chr3 (44-126)||(23722884-23722966)
chr3 (44-126)||(23741340-23741422)
chr3 (151-193)||(32307983-32308025)
chr3 (44-126)||(41201457-41201539)
chr3 (151-193)||(49667848-49667890)
chr3 (50-131)||(605945-606026)
chr3 (13-126)||(5149596-5149709)
chr3 (13-114)||(12891782-12891883)
chr3 (13-126)||(14499692-14499805)
chr3 (13-114)||(17252685-17252786)
chr3 (386-484)||(21618465-21618563)
chr3 (13-113)||(4710675-4710775)
chr3 (34-74)||(11594789-11594829)
chr3 (405-500)||(12119791-12119887)
chr3 (354-500)||(13151805-13151953)
chr3 (354-500)||(13154270-13154418)
chr3 (432-488)||(13919344-13919399)
chr3 (405-500)||(15412429-15412525)
chr3 (13-101)||(15617766-15617854)
chr3 (37-192)||(15941557-15941713)
chr3 (34-74)||(16690635-16690675)
chr3 (34-74)||(16697208-16697248)
chr3 (354-500)||(10247738-10247885)
chr3 (153-192)||(12340068-12340107)
chr3 (44-115)||(13251095-13251166)
chr3 (44-115)||(13257741-13257812)
chr3 (15-114)||(13321348-13321447)
chr3 (408-498)||(16282880-16282971)
chr3 (33-76)||(16369845-16369888)
chr3 (354-500)||(17446670-17446816)
chr3 (441-500)||(17737236-17737294)
chr3 (29-100)||(19725546-19725617)
chr3 (141-192)||(19725669-19725720)
chr3 (50-101)||(23412827-23412878)
chr3 (50-101)||(45797659-45797710)
chr3 (37-192)||(326817-326973)
chr3 (13-127)||(7986069-7986183)
chr3 (450-500)||(10556985-10557035)
chr3 (44-126)||(11070435-11070517)
chr3 (44-126)||(11165189-11165271)
chr3 (36-74)||(11557037-11557075)
chr3 (151-193)||(12934075-12934117)
chr3 (37-192)||(15482959-15483115)
chr3 (56-126)||(15691949-15692019)
chr3 (44-126)||(15726591-15726673)
chr3 (37-131)||(16862833-16862927)
chr3 (44-126)||(30066313-30066395)
chr3 (54-100)||(43927597-43927643)
chr3 (450-500)||(45577950-45578000)
chr3 (44-126)||(55023212-55023294)
chr3 (37-74)||(7792999-7793036)
chr3 (29-78)||(11852006-11852055)
chr3 (37-74)||(16797707-16797744)
chr3 (37-74)||(20461153-20461190)
chr3 (37-74)||(31097207-31097244)
chr3 (34-74)||(1982460-1982500)
chr3 (27-115)||(5221780-5221868)
chr3 (450-498)||(41123892-41123940)
chr3 (405-500)||(44494809-44494905)
chr3 (54-101)||(316612-316659)
chr3 (157-192)||(7109999-7110034)
chr3 (157-192)||(7113934-7113969)
chr3 (27-114)||(10326229-10326316)
chr3 (54-101)||(12378412-12378459)
chr3 (153-192)||(14665921-14665960)
chr3 (153-192)||(14669076-14669115)
chr3 (153-192)||(14735434-14735473)
chr3 (44-115)||(16623714-16623785)
chr3 (407-503)||(22147548-22147646)
chr3 (157-192)||(22321965-22322000)
chr3 (157-192)||(22337020-22337055)
chr3 (29-80)||(23052711-23052762)
chr3 (157-192)||(27409417-27409452)
chr3 (151-193)||(324549-324591)
chr3 (150-192)||(16097645-16097687)
chr3 (13-115)||(22642967-22643069)
chr3 (13-115)||(22670515-22670617)
chr3 (68-114)||(41092030-41092076)
chr3 (151-189)||(49389408-49389446)
chr3 (151-192)||(1465174-1465215)
chr3 (13-86)||(2034599-2034672)
chr3 (13-86)||(2038106-2038179)
chr3 (13-86)||(2041847-2041920)
chr3 (13-74)||(7110118-7110179)
chr3 (13-74)||(7114053-7114114)
chr3 (151-188)||(9513228-9513265)
chr3 (151-188)||(9521203-9521240)
chr3 (17-102)||(10236027-10236112)
chr3 (155-192)||(13210096-13210133)
chr3 (13-86)||(14038608-14038681)
chr3 (13-86)||(14042076-14042149)
chr3 (434-487)||(15246034-15246086)
chr3 (44-113)||(15337810-15337879)
chr3 (44-113)||(15397562-15397631)
chr3 (44-113)||(15404153-15404222)
chr3 (422-499)||(15878092-15878168)
chr3 (13-114)||(15991732-15991833)
chr3 (68-113)||(17710275-17710320)
chr3 (13-74)||(22322084-22322145)
chr3 (13-74)||(22337139-22337200)
chr3 (422-499)||(23408428-23408504)
chr3 (13-74)||(27409272-27409333)
chr3 (69-126)||(28350846-28350903)
chr3 (13-74)||(28950145-28950206)
chr3 (152-193)||(37250932-37250973)
chr3 (13-86)||(39231155-39231228)
chr3 (37-74)||(42326360-42326397)
chr3 (50-115)||(53380017-53380082)
chr3 (50-115)||(53386669-53386734)
chr3 (27-115)||(10153377-10153465)
chr3 (151-191)||(12171869-12171909)
chr3 (13-113)||(19809406-19809506)
chr3 (152-192)||(22110116-22110156)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (14-500)||(4760-5246)
[»] chr6 (173 HSPs)
chr6 (15-503)||(16920263-16920751)
chr6 (14-503)||(22831503-22831994)
chr6 (17-503)||(20637915-20638404)
chr6 (26-503)||(20360601-20361081)
chr6 (14-491)||(11185517-11185994)
chr6 (14-503)||(22779845-22780348)
chr6 (14-503)||(19303159-19303661)
chr6 (42-503)||(29060540-29061015)
chr6 (14-503)||(17287414-17287917)
chr6 (14-502)||(18409445-18409947)
chr6 (38-280)||(18821472-18821714)
chr6 (14-503)||(20593773-20594276)
chr6 (38-503)||(25628997-25629476)
chr6 (331-503)||(35245586-35245758)
chr6 (14-131)||(1561689-1561806)
chr6 (14-193)||(28496091-28496280)
chr6 (14-193)||(29808501-29808691)
chr6 (14-192)||(21939699-21939886)
chr6 (353-503)||(16496244-16496396)
chr6 (15-192)||(15894049-15894237)
chr6 (38-193)||(18457029-18457193)
chr6 (14-131)||(4667831-4667948)
chr6 (14-131)||(4674678-4674795)
chr6 (14-131)||(22334500-22334617)
chr6 (14-131)||(31155016-31155133)
chr6 (14-131)||(4185441-4185558)
chr6 (14-131)||(4189342-4189459)
chr6 (20-192)||(25611347-25611530)
chr6 (27-131)||(19652581-19652685)
chr6 (14-476)||(25603003-25603478)
chr6 (339-503)||(20076700-20076863)
chr6 (14-86)||(22439230-22439302)
chr6 (28-132)||(23019792-23019896)
chr6 (11-127)||(31164473-31164589)
chr6 (358-484)||(20109157-20109285)
chr6 (14-99)||(22432667-22432752)
chr6 (38-131)||(27332926-27333019)
chr6 (38-131)||(27393666-27393759)
chr6 (431-503)||(27333267-27333339)
chr6 (431-503)||(27394007-27394079)
chr6 (407-503)||(28496494-28496592)
chr6 (407-503)||(29808905-29809003)
chr6 (14-99)||(19863395-19863480)
chr6 (386-503)||(23019408-23019525)
chr6 (14-99)||(25641802-25641887)
chr6 (13-127)||(22331803-22331917)
chr6 (331-450)||(27415887-27416008)
chr6 (50-192)||(22080391-22080543)
chr6 (405-500)||(25656629-25656725)
chr6 (407-503)||(1561303-1561401)
chr6 (358-500)||(1595549-1595692)
chr6 (354-500)||(2291195-2291342)
chr6 (33-100)||(21834528-21834595)
chr6 (386-484)||(25644339-25644440)
chr6 (438-484)||(19668390-19668436)
chr6 (340-500)||(25754809-25754971)
chr6 (431-484)||(9098563-9098616)
chr6 (432-485)||(23076748-23076801)
chr6 (432-485)||(35008166-35008219)
chr6 (13-113)||(3708111-3708211)
chr6 (13-113)||(14099004-14099104)
chr6 (431-499)||(19652199-19652267)
chr6 (37-192)||(19663065-19663221)
chr6 (405-500)||(22782227-22782323)
chr6 (28-132)||(25956253-25956357)
chr6 (340-502)||(30676710-30676874)
chr6 (407-503)||(8227534-8227632)
chr6 (37-192)||(12496605-12496761)
chr6 (354-500)||(12742317-12742464)
chr6 (354-500)||(18334607-18334754)
chr6 (354-500)||(19005046-19005193)
chr6 (354-500)||(19858934-19859081)
chr6 (354-500)||(24422547-24422694)
chr6 (354-500)||(33861794-33861941)
chr6 (354-500)||(33864278-33864425)
chr6 (430-488)||(33443062-33443119)
chr6 (13-127)||(34295696-34295810)
chr6 (29-130)||(15041184-15041285)
chr6 (13-114)||(34833031-34833132)
chr6 (28-128)||(25644711-25644811)
chr6 (14-74)||(27415572-27415632)
chr6 (340-502)||(34963371-34963535)
chr6 (354-500)||(1540926-1541073)
chr6 (354-500)||(8055029-8055176)
chr6 (33-100)||(16523041-16523108)
chr6 (28-127)||(20109605-20109704)
chr6 (37-100)||(21739664-21739727)
chr6 (354-500)||(26924655-26924802)
chr6 (38-100)||(18180903-18180965)
chr6 (354-487)||(18456732-18456866)
chr6 (354-487)||(18461892-18462026)
chr6 (457-503)||(22080800-22080846)
chr6 (37-192)||(22429683-22429839)
chr6 (441-503)||(25714417-25714478)
chr6 (13-126)||(1538573-1538686)
chr6 (13-126)||(1544672-1544785)
chr6 (390-480)||(4185827-4185919)
chr6 (422-499)||(22432249-22432325)
chr6 (422-499)||(22438799-22438875)
chr6 (13-122)||(25594981-25595090)
chr6 (13-126)||(34369602-34369715)
chr6 (405-484)||(25688518-25688598)
chr6 (13-132)||(15685718-15685837)
chr6 (141-192)||(22334648-22334699)
chr6 (39-78)||(22405709-22405748)
chr6 (141-192)||(25641940-25641991)
chr6 (37-192)||(1645002-1645158)
chr6 (37-131)||(2684994-2685088)
chr6 (13-126)||(16372223-16372326)
chr6 (37-192)||(17804494-17804650)
chr6 (441-487)||(18821904-18821949)
chr6 (13-127)||(19808890-19809004)
chr6 (34-72)||(20907631-20907669)
chr6 (13-114)||(23276907-23277008)
chr6 (37-74)||(1587384-1587421)
chr6 (151-192)||(4185588-4185629)
chr6 (151-192)||(4667978-4668019)
chr6 (37-74)||(5616467-5616504)
chr6 (13-86)||(12596388-12596461)
chr6 (37-74)||(12707104-12707141)
chr6 (405-497)||(16448593-16448686)
chr6 (37-74)||(16741623-16741660)
chr6 (37-74)||(20803205-20803242)
chr6 (37-74)||(21702703-21702740)
chr6 (37-74)||(25766821-25766858)
chr6 (29-70)||(29096138-29096179)
chr6 (13-113)||(14472647-14472747)
chr6 (34-74)||(19790429-19790469)
chr6 (13-101)||(19870980-19871068)
chr6 (405-500)||(20556958-20557054)
chr6 (34-74)||(23657070-23657110)
chr6 (151-191)||(27333049-27333089)
chr6 (151-191)||(27393789-27393829)
chr6 (30-74)||(27567255-27567299)
chr6 (441-500)||(3852121-3852179)
chr6 (157-192)||(8244158-8244193)
chr6 (157-192)||(11567160-11567195)
chr6 (42-81)||(16964957-16964996)
chr6 (437-488)||(18199473-18199523)
chr6 (151-190)||(19652512-19652551)
chr6 (157-192)||(19870888-19870923)
chr6 (15-114)||(22759227-22759326)
chr6 (157-192)||(22863243-22863278)
chr6 (157-192)||(23395366-23395401)
chr6 (37-131)||(9481946-9482040)
chr6 (36-114)||(17036987-17037065)
chr6 (434-488)||(18453197-18453250)
chr6 (37-192)||(22592457-22592613)
chr6 (69-115)||(30694738-30694784)
chr6 (390-480)||(4186390-4186482)
chr6 (13-74)||(11567279-11567340)
chr6 (13-74)||(12618473-12618534)
chr6 (13-86)||(16102774-16102847)
chr6 (147-192)||(16924642-16924687)
chr6 (147-192)||(16929357-16929402)
chr6 (33-74)||(18907549-18907590)
chr6 (422-499)||(19873120-19873196)
chr6 (48-81)||(22059396-22059429)
chr6 (13-74)||(22863362-22863423)
chr6 (13-74)||(23395485-23395546)
chr6 (13-74)||(23990337-23990398)
chr6 (44-113)||(24314739-24314808)
chr6 (37-74)||(25135325-25135362)
chr6 (50-115)||(27327722-27327787)
chr6 (50-115)||(27388462-27388527)
chr6 (151-192)||(31155163-31155204)
chr6 (28-100)||(9098081-9098153)
chr6 (51-115)||(14059283-14059347)
chr6 (50-101)||(18696979-18697031)
chr6 (29-101)||(18916911-18916983)
chr6 (152-192)||(19668688-19668728)
chr6 (152-192)||(23657189-23657229)
chr6 (54-106)||(33443532-33443584)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (14-503)||(678-1169)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (14-503)||(167608-168099)
scaffold0011 (14-503)||(51913-52415)
scaffold0011 (434-487)||(38204-38256)
[»] chr1 (140 HSPs)
chr1 (14-503)||(38801020-38801508)
chr1 (14-503)||(27250358-27250850)
chr1 (14-503)||(21026680-21027172)
chr1 (14-502)||(50209832-50210333)
chr1 (14-428)||(22354190-22354616)
chr1 (14-394)||(22355803-22356185)
chr1 (14-394)||(22357489-22357871)
chr1 (14-500)||(34509783-34510283)
chr1 (14-503)||(22532269-22532772)
chr1 (14-313)||(20846848-20847147)
chr1 (14-502)||(20135188-20135690)
chr1 (15-500)||(433012-433509)
chr1 (14-192)||(20918917-20919104)
chr1 (14-192)||(20091092-20091281)
chr1 (14-128)||(21162117-21162231)
chr1 (27-129)||(21754423-21754525)
chr1 (15-103)||(21301157-21301245)
chr1 (27-131)||(52927612-52927716)
chr1 (27-215)||(33681301-33681499)
chr1 (28-132)||(22921499-22921603)
chr1 (38-130)||(20248664-20248756)
chr1 (292-502)||(22468604-22468816)
chr1 (407-503)||(14295574-14295672)
chr1 (29-131)||(22238015-22238117)
chr1 (386-487)||(21896258-21896361)
chr1 (409-503)||(45574912-45575008)
chr1 (427-503)||(20847200-20847275)
chr1 (386-487)||(21861572-21861675)
chr1 (28-132)||(43697745-43697849)
chr1 (29-100)||(18181755-18181826)
chr1 (331-450)||(33797573-33797694)
chr1 (290-367)||(48603652-48603730)
chr1 (14-99)||(22468315-22468400)
chr1 (405-487)||(35261099-35261183)
chr1 (431-499)||(22921918-22921986)
chr1 (432-487)||(50614167-50614222)
chr1 (432-487)||(50621995-50622050)
chr1 (13-127)||(23763574-23763688)
chr1 (431-503)||(33681010-33681079)
chr1 (434-487)||(16368338-16368391)
chr1 (407-484)||(20918623-20918702)
chr1 (28-128)||(28194080-28194180)
chr1 (405-484)||(21754064-21754145)
chr1 (386-503)||(22237630-22237746)
chr1 (340-500)||(23593735-23593897)
chr1 (431-484)||(16758668-16758721)
chr1 (28-129)||(35981319-35981419)
chr1 (430-487)||(41050084-41050141)
chr1 (14-99)||(42864830-42864915)
chr1 (354-500)||(13988866-13989013)
chr1 (340-501)||(21840766-21840929)
chr1 (354-500)||(21923306-21923453)
chr1 (33-100)||(22831016-22831083)
chr1 (354-500)||(29776688-29776835)
chr1 (354-500)||(31612313-31612460)
chr1 (17-127)||(20524848-20524958)
chr1 (13-127)||(21438157-21438271)
chr1 (33-99)||(21787680-21787746)
chr1 (38-100)||(22432426-22432488)
chr1 (433-487)||(50686627-50686681)
chr1 (431-503)||(52928019-52928088)
chr1 (13-126)||(19063884-19063997)
chr1 (13-126)||(19111774-19111887)
chr1 (28-101)||(21342564-21342637)
chr1 (28-101)||(21347429-21347502)
chr1 (28-81)||(21714983-21715036)
chr1 (13-126)||(21829078-21829191)
chr1 (13-126)||(21844591-21844704)
chr1 (28-129)||(21895864-21895965)
chr1 (14-78)||(8761252-8761316)
chr1 (28-128)||(16759115-16759215)
chr1 (431-499)||(20248283-20248351)
chr1 (434-502)||(20454606-20454673)
chr1 (405-484)||(22123133-22123214)
chr1 (29-76)||(3472560-3472607)
chr1 (405-503)||(13212928-13213027)
chr1 (408-506)||(15860078-15860177)
chr1 (430-485)||(16093933-16093988)
chr1 (354-500)||(21475102-21475249)
chr1 (432-487)||(26064954-26065009)
chr1 (35-74)||(45489394-45489433)
chr1 (33-99)||(6152270-6152336)
chr1 (37-192)||(12647166-12647322)
chr1 (37-192)||(18882664-18882820)
chr1 (405-506)||(21342090-21342192)
chr1 (151-193)||(21754350-21754392)
chr1 (13-126)||(19105117-19105230)
chr1 (28-129)||(21861126-21861227)
chr1 (37-74)||(23818952-23818989)
chr1 (13-114)||(50887381-50887482)
chr1 (340-502)||(16361915-16362079)
chr1 (33-77)||(21023075-21023119)
chr1 (405-500)||(21346961-21347057)
chr1 (37-131)||(19212226-19212320)
chr1 (37-131)||(21615796-21615890)
chr1 (37-100)||(24782753-24782816)
chr1 (50-129)||(26065382-26065461)
chr1 (441-500)||(29298137-29298195)
chr1 (54-129)||(41049626-41049701)
chr1 (44-126)||(1011087-1011169)
chr1 (403-500)||(16275428-16275526)
chr1 (34-100)||(18393613-18393679)
chr1 (37-192)||(20138380-20138536)
chr1 (450-500)||(21707167-21707217)
chr1 (450-500)||(21711709-21711759)
chr1 (54-128)||(35260713-35260787)
chr1 (34-100)||(45310016-45310082)
chr1 (37-192)||(46975764-46975920)
chr1 (151-192)||(20637165-20637206)
chr1 (151-192)||(21162080-21162121)
chr1 (37-74)||(21305730-21305767)
chr1 (422-499)||(21714546-21714622)
chr1 (13-86)||(22899869-22899942)
chr1 (37-74)||(33797949-33797986)
chr1 (59-131)||(16367873-16367945)
chr1 (42-74)||(17678245-17678277)
chr1 (29-132)||(20637235-20637339)
chr1 (432-488)||(21533923-21533978)
chr1 (157-192)||(16375231-16375266)
chr1 (157-192)||(21407653-21407688)
chr1 (157-192)||(52639839-52639874)
chr1 (59-105)||(16381652-16381698)
chr1 (36-74)||(33049739-33049777)
chr1 (59-101)||(52940464-52940506)
chr1 (37-74)||(3704739-3704776)
chr1 (13-74)||(16375086-16375147)
chr1 (37-74)||(20228462-20228499)
chr1 (151-192)||(20248592-20248633)
chr1 (13-86)||(20631747-20631820)
chr1 (13-74)||(21407772-21407833)
chr1 (150-191)||(22921631-22921672)
chr1 (152-193)||(26065254-26065295)
chr1 (151-192)||(28194213-28194254)
chr1 (151-192)||(35981451-35981492)
chr1 (13-86)||(36182006-36182079)
chr1 (37-74)||(36818961-36818998)
chr1 (13-74)||(52639958-52640019)
chr1 (150-191)||(52927745-52927786)
chr1 (59-131)||(16093479-16093551)
chr1 (152-192)||(45310135-45310175)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (14-503)||(4712-5204)
scaffold0358 (14-428)||(13-428)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (14-503)||(1952-2444)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (18-503)||(51582-52067)
scaffold0032 (44-115)||(108984-109055)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (14-503)||(1289-1778)
scaffold0106 (14-503)||(7266-7755)
scaffold0106 (14-81)||(16083-16150)
scaffold0106 (434-500)||(15291-15356)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (14-503)||(13211-13703)
scaffold0193 (37-192)||(9717-9873)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (14-443)||(6669-7102)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (15-503)||(4849-5339)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (14-503)||(3470-3973)
scaffold0292 (38-503)||(343-821)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (15-503)||(1851-2353)
scaffold0016 (37-192)||(207160-207324)
scaffold0016 (50-100)||(119205-119255)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (14-503)||(5739-6245)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (15-503)||(20910-21392)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (15-484)||(23921-24405)
scaffold0042 (37-192)||(64150-64306)
scaffold0042 (14-78)||(34529-34593)
scaffold0042 (37-192)||(76034-76190)
scaffold0042 (33-78)||(41191-41236)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (14-503)||(38761-39262)
scaffold0145 (294-503)||(32942-33153)
scaffold0145 (405-505)||(9744-9845)
[»] scaffold0021 (9 HSPs)
scaffold0021 (14-415)||(124675-125085)
scaffold0021 (386-502)||(174767-174883)
scaffold0021 (39-131)||(62947-63039)
scaffold0021 (14-79)||(175202-175267)
scaffold0021 (433-503)||(121766-121835)
scaffold0021 (427-487)||(136414-136474)
scaffold0021 (427-487)||(145122-145182)
scaffold0021 (152-193)||(136132-136173)
scaffold0021 (152-193)||(144840-144881)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (14-502)||(16833-17337)
scaffold0056 (14-130)||(78980-79096)
scaffold0056 (14-78)||(13696-13760)
scaffold0056 (441-487)||(79388-79433)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (15-453)||(13141-13594)
scaffold0175 (14-191)||(34437-34623)
scaffold0175 (407-503)||(34123-34221)
scaffold0175 (450-503)||(273-326)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (14-503)||(8479-8978)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (33-367)||(1052-1387)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (15-496)||(25684-26179)
scaffold0122 (14-351)||(33112-33461)
scaffold0122 (386-500)||(44709-44825)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (17-503)||(8154-8650)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (33-347)||(3640-3954)
scaffold0165 (33-347)||(7704-8018)
scaffold0165 (28-129)||(27274-27375)
scaffold0165 (405-484)||(27770-27851)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (14-503)||(39913-40414)
scaffold0080 (430-487)||(19933-19990)
scaffold0080 (36-99)||(18297-18360)
scaffold0080 (141-192)||(18413-18464)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (14-500)||(339569-340065)
scaffold0003 (331-450)||(71353-71474)
scaffold0003 (354-500)||(158465-158612)
scaffold0003 (14-74)||(71729-71789)
scaffold0003 (37-74)||(140126-140163)
[»] scaffold0026 (7 HSPs)
scaffold0026 (14-503)||(39858-40359)
scaffold0026 (189-503)||(25896-26213)
scaffold0026 (14-131)||(39549-39666)
scaffold0026 (72-128)||(59179-59235)
scaffold0026 (80-131)||(26611-26662)
scaffold0026 (155-192)||(59271-59308)
scaffold0026 (143-177)||(26555-26589)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (42-312)||(11170-11440)
scaffold0235 (388-503)||(11447-11564)
scaffold0235 (50-101)||(14055-14106)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (29-500)||(22886-23370)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (14-313)||(20596-20906)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (24-503)||(16227-16721)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (15-503)||(4508-5010)
scaffold0228 (15-503)||(12090-12592)
scaffold0228 (15-503)||(22042-22544)
scaffold0228 (37-192)||(18285-18441)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (38-486)||(51526-51987)
scaffold0034 (405-484)||(32555-32636)
scaffold0034 (50-132)||(32921-33003)
scaffold0034 (151-217)||(32826-32892)
scaffold0034 (37-74)||(16316-16353)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (147-501)||(39479-39836)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (147-501)||(74976-75333)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (14-443)||(580-1021)
scaffold0395 (14-132)||(8110-8228)
scaffold0395 (436-503)||(4888-4954)
[»] scaffold0120 (6 HSPs)
scaffold0120 (14-503)||(32577-33077)
scaffold0120 (14-503)||(45928-46428)
scaffold0120 (15-260)||(16333-16588)
scaffold0120 (295-503)||(16113-16323)
scaffold0120 (441-503)||(17389-17450)
scaffold0120 (37-74)||(19670-19707)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (14-326)||(17626-17928)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (221-503)||(2987-3271)
scaffold0540 (14-210)||(631-837)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (14-247)||(163-407)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (14-171)||(13226-13383)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (145-423)||(27912-28192)
scaffold0130 (14-129)||(28924-29039)
scaffold0130 (50-100)||(1357-1407)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (14-346)||(10323-10661)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (14-482)||(4545-5026)
scaffold0070 (37-192)||(10200-10356)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (15-192)||(2064-2250)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (14-193)||(20426-20615)
scaffold0100 (431-503)||(23932-24001)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (14-131)||(2703-2820)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-131)||(18576-18693)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (15-127)||(28899-29011)
scaffold0218 (427-484)||(8119-8176)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (15-131)||(7913-8029)
scaffold0075 (334-487)||(53498-53654)
scaffold0075 (28-129)||(53103-53204)
scaffold0075 (155-192)||(8062-8099)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (14-200)||(1696-1891)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (14-197)||(15233-15426)
scaffold0413 (386-487)||(12584-12687)
scaffold0413 (28-128)||(13033-13133)
[»] scaffold0261 (5 HSPs)
scaffold0261 (14-128)||(16047-16161)
scaffold0261 (407-500)||(15664-15759)
scaffold0261 (9-99)||(1755-1845)
scaffold0261 (155-192)||(15974-16011)
scaffold0261 (50-101)||(17920-17971)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (14-189)||(12427-12611)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (38-197)||(17090-17259)
scaffold0142 (405-500)||(16784-16880)
scaffold0142 (96-131)||(7471-7506)
scaffold0142 (153-192)||(7537-7576)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (15-192)||(10226-10412)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (14-192)||(344-530)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (14-189)||(20044-20228)
scaffold0031 (14-81)||(65412-65479)
scaffold0031 (354-487)||(20394-20527)
scaffold0031 (37-192)||(53862-54018)
scaffold0031 (339-428)||(128827-128917)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (14-192)||(79950-80137)
scaffold0037 (386-503)||(22672-22788)
scaffold0037 (340-500)||(82072-82234)
scaffold0037 (35-129)||(21209-21303)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (302-502)||(3103-3306)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (14-192)||(24268-24456)
scaffold0124 (407-503)||(38279-38377)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (14-131)||(9462-9579)
scaffold0475 (151-192)||(9391-9432)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (367-503)||(28414-28552)
scaffold0046 (407-503)||(11292-11390)
scaffold0046 (407-503)||(1997-2095)
scaffold0046 (14-80)||(14914-14980)
scaffold0046 (447-503)||(4552-4608)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (27-131)||(32469-32573)
scaffold0150 (439-499)||(32102-32162)
scaffold0150 (151-193)||(32397-32439)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (14-121)||(10540-10647)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (14-192)||(9452-9639)
[»] scaffold0556 (4 HSPs)
scaffold0556 (27-131)||(7197-7301)
scaffold0556 (431-487)||(6828-6884)
scaffold0556 (28-132)||(8401-8505)
scaffold0556 (151-192)||(7126-7167)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (14-94)||(10890-10970)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (27-127)||(28440-28540)
scaffold0211 (151-193)||(28574-28616)
scaffold0211 (431-499)||(28818-28887)
[»] scaffold0028 (12 HSPs)
scaffold0028 (27-131)||(133039-133143)
scaffold0028 (439-499)||(132662-132722)
scaffold0028 (354-500)||(136680-136827)
scaffold0028 (354-500)||(139149-139296)
scaffold0028 (354-500)||(144087-144234)
scaffold0028 (431-484)||(62217-62270)
scaffold0028 (354-500)||(134211-134358)
scaffold0028 (354-500)||(141618-141765)
scaffold0028 (151-193)||(132967-133009)
scaffold0028 (157-192)||(58492-58527)
scaffold0028 (68-126)||(41901-41959)
scaffold0028 (68-126)||(57408-57466)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (38-193)||(12243-12407)
scaffold0503 (441-487)||(11979-12024)
[»] scaffold0555 (5 HSPs)
scaffold0555 (14-131)||(965-1082)
scaffold0555 (28-106)||(10200-10278)
scaffold0555 (386-503)||(10543-10659)
scaffold0555 (141-188)||(897-944)
scaffold0555 (151-193)||(10305-10347)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (29-130)||(161072-161173)
scaffold0001 (405-499)||(160688-160784)
scaffold0001 (340-484)||(501100-501246)
scaffold0001 (405-500)||(85646-85742)
scaffold0001 (29-74)||(422175-422221)
scaffold0001 (59-101)||(446965-447007)
scaffold0001 (59-101)||(497896-497938)
[»] scaffold0102 (4 HSPs)
scaffold0102 (27-131)||(19652-19756)
scaffold0102 (431-499)||(19268-19336)
scaffold0102 (151-200)||(19573-19622)
scaffold0102 (27-99)||(48092-48164)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (29-132)||(3317-3420)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (299-487)||(26840-27027)
scaffold0215 (33-81)||(27256-27304)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (17-125)||(6449-6557)
scaffold0247 (152-216)||(6561-6625)
scaffold0247 (407-503)||(18050-18148)
scaffold0247 (405-484)||(2195-2275)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (407-503)||(1092-1190)
scaffold0184 (34-100)||(3874-3940)
scaffold0184 (152-192)||(3993-4033)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (27-130)||(101781-101884)
scaffold0023 (431-503)||(119875-119947)
scaffold0023 (386-499)||(100378-100493)
scaffold0023 (354-500)||(44454-44602)
scaffold0023 (432-499)||(40224-40291)
scaffold0023 (354-500)||(94411-94558)
scaffold0023 (340-484)||(17440-17586)
scaffold0023 (431-499)||(101503-101571)
scaffold0023 (38-89)||(39651-39702)
scaffold0023 (149-193)||(101709-101753)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (27-129)||(45420-45522)
scaffold0125 (431-499)||(45841-45909)
scaffold0125 (151-192)||(45555-45596)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (29-130)||(2277-2378)
scaffold0207 (431-499)||(2694-2762)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (29-125)||(1934-2030)
scaffold1137 (151-193)||(2066-2108)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (28-132)||(13325-13429)
scaffold0138 (13-127)||(29836-29950)
scaffold0138 (13-127)||(41832-41946)
scaffold0138 (387-503)||(12942-13057)
scaffold0138 (151-192)||(13255-13296)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (27-200)||(437-620)
scaffold1984 (431-499)||(133-201)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (27-132)||(5978-6083)
scaffold0278 (431-484)||(5662-5715)
[»] scaffold1124 (2 HSPs)
scaffold1124 (335-499)||(1881-2045)
scaffold1124 (33-99)||(2291-2357)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (38-128)||(2445-2535)
scaffold0628 (386-499)||(2808-2923)
scaffold0628 (151-193)||(2567-2609)
[»] scaffold0210 (6 HSPs)
scaffold0210 (299-499)||(21721-21920)
scaffold0210 (299-499)||(29613-29812)
scaffold0210 (33-81)||(21444-21492)
scaffold0210 (33-81)||(29336-29384)
scaffold0210 (141-192)||(21563-21614)
scaffold0210 (141-192)||(29455-29506)
[»] scaffold0621 (4 HSPs)
scaffold0621 (27-132)||(6922-7026)
scaffold0621 (431-503)||(6535-6607)
scaffold0621 (358-484)||(8485-8613)
scaffold0621 (28-101)||(8961-9034)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (14-79)||(20418-20483)
scaffold0139 (430-480)||(38339-38389)
scaffold0139 (54-129)||(38761-38836)
[»] scaffold0010 (9 HSPs)
scaffold0010 (27-132)||(130292-130397)
scaffold0010 (427-487)||(60761-60821)
scaffold0010 (13-127)||(242420-242534)
scaffold0010 (386-484)||(129924-130024)
scaffold0010 (37-192)||(23513-23669)
scaffold0010 (151-192)||(130222-130263)
scaffold0010 (54-125)||(60296-60367)
scaffold0010 (435-488)||(662-714)
scaffold0010 (152-193)||(60479-60520)
[»] scaffold0004 (7 HSPs)
scaffold0004 (14-99)||(70211-70296)
scaffold0004 (68-127)||(58102-58161)
scaffold0004 (37-192)||(10237-10393)
scaffold0004 (50-125)||(332784-332859)
scaffold0004 (422-499)||(69794-69870)
scaffold0004 (299-368)||(69930-70000)
scaffold0004 (13-113)||(78592-78692)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (386-487)||(1048-1151)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (48-132)||(43436-43520)
scaffold0116 (48-132)||(47356-47440)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (28-132)||(15462-15566)
scaffold0020 (431-503)||(15826-15898)
scaffold0020 (38-81)||(179085-179128)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (15-74)||(17343-17402)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (39-123)||(671-755)
scaffold0530 (431-503)||(1083-1155)
[»] scaffold0357 (6 HSPs)
scaffold0357 (386-487)||(13144-13247)
scaffold0357 (405-484)||(16121-16202)
scaffold0357 (432-487)||(2677-2732)
scaffold0357 (54-125)||(3162-3233)
scaffold0357 (54-129)||(13595-13670)
scaffold0357 (154-269)||(15866-15983)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (431-503)||(6611-6683)
scaffold0333 (28-132)||(6998-7102)
scaffold0333 (431-503)||(13991-14063)
scaffold0333 (28-132)||(14378-14482)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (33-192)||(587-747)
scaffold0327 (290-428)||(3434-3574)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (431-503)||(6172-6244)
scaffold0243 (39-126)||(5765-5852)
[»] scaffold0029 (9 HSPs)
scaffold0029 (331-403)||(12859-12931)
scaffold0029 (33-99)||(13173-13239)
scaffold0029 (340-483)||(11305-11450)
scaffold0029 (13-126)||(125742-125855)
scaffold0029 (13-101)||(61241-61329)
scaffold0029 (157-192)||(61386-61421)
scaffold0029 (28-101)||(65172-65245)
scaffold0029 (159-192)||(65304-65337)
scaffold0029 (69-126)||(105563-105620)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (407-503)||(11464-11562)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (432-499)||(14747-14814)
scaffold0008 (29-100)||(30379-30450)
scaffold0008 (37-74)||(2292-2329)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (340-484)||(4710-4856)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (430-484)||(25125-25179)
scaffold0123 (59-131)||(25568-25640)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (331-450)||(15362-15483)
scaffold0107 (15-74)||(15049-15108)
scaffold0107 (434-488)||(36195-36248)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (50-132)||(10913-10995)
scaffold0078 (386-484)||(10546-10646)
scaffold0078 (151-193)||(10842-10884)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (14-99)||(867-952)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (434-487)||(566-619)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (13-126)||(3505-3618)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (430-487)||(6332-6389)
scaffold0420 (437-487)||(13793-13843)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (13-126)||(14169-14282)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (13-126)||(8506-8619)
scaffold0216 (14-78)||(16740-16804)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (386-500)||(38704-38820)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (340-497)||(4300-4459)
scaffold0761 (38-81)||(5952-5995)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (33-100)||(46365-46432)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (432-487)||(129021-129075)
scaffold0022 (434-487)||(78338-78391)
scaffold0022 (54-129)||(80726-80801)
scaffold0022 (386-500)||(116430-116544)
scaffold0022 (152-192)||(128735-128775)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (50-132)||(7711-7793)
scaffold0507 (384-487)||(8059-8166)
scaffold0507 (151-193)||(7822-7864)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (38-100)||(1307-1369)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (33-99)||(3254-3320)
scaffold0158 (29-99)||(6920-6990)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (431-484)||(1101-1154)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (59-132)||(12380-12453)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (14-99)||(10440-10525)
scaffold0297 (14-99)||(15298-15383)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (430-487)||(2691-2748)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (29-78)||(44486-44535)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (14-78)||(15837-15901)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (14-126)||(10541-10653)
[»] scaffold0017 (7 HSPs)
scaffold0017 (19-99)||(190905-190985)
scaffold0017 (19-99)||(192608-192688)
scaffold0017 (37-192)||(56394-56550)
scaffold0017 (34-74)||(14963-15003)
scaffold0017 (34-74)||(19485-19525)
scaffold0017 (406-476)||(192997-193070)
scaffold0017 (141-193)||(192741-192793)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (15-74)||(1075-1134)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (29-100)||(1718-1789)
[»] scaffold0476 (4 HSPs)
scaffold0476 (37-100)||(5996-6059)
scaffold0476 (37-100)||(7191-7254)
scaffold0476 (387-503)||(12766-12884)
scaffold0476 (28-127)||(13233-13331)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (340-501)||(10772-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (354-500)||(13392-13539)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (33-100)||(1904-1971)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (354-500)||(20747-20894)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (29-100)||(35155-35226)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (354-500)||(37821-37968)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (15-126)||(9704-9815)
scaffold0013 (435-487)||(30347-30398)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (432-487)||(97021-97076)
scaffold0006 (432-487)||(106299-106354)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (340-500)||(106-268)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (43-125)||(2245-2327)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (13-127)||(5427-5541)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (37-192)||(18651-18807)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (13-126)||(478-591)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (29-74)||(6543-6588)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (33-78)||(6054-6099)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (33-78)||(6716-6761)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (14-127)||(19762-19875)
scaffold0256 (14-132)||(24605-24723)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (28-81)||(26834-26887)
scaffold0198 (422-499)||(23843-23919)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (28-81)||(36024-36077)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (28-81)||(36891-36944)
scaffold0131 (450-499)||(36454-36503)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (14-99)||(8576-8661)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (34-99)||(18655-18720)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (67-132)||(227877-227942)
scaffold0012 (37-192)||(24621-24777)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (430-487)||(267676-267733)
scaffold0005 (45-126)||(307460-307541)
scaffold0005 (50-129)||(268116-268195)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (38-78)||(18945-18985)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (40-100)||(2240-2300)
scaffold0104 (40-100)||(9922-9982)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (33-100)||(4841-4908)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (33-76)||(595-638)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (354-500)||(13947-14094)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (13-127)||(17361-17475)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (13-127)||(12785-12899)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (33-99)||(15987-16053)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (50-132)||(24174-24256)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (430-484)||(103679-103733)
scaffold0040 (54-129)||(103241-103316)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (37-74)||(769-806)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (33-74)||(830-871)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (29-74)||(2080-2125)
scaffold0439 (29-74)||(9940-9985)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (29-74)||(6915-6960)
[»] scaffold0109 (7 HSPs)
scaffold0109 (13-126)||(27006-27119)
scaffold0109 (37-131)||(10955-11049)
scaffold0109 (50-101)||(35524-35575)
scaffold0109 (37-74)||(38472-38509)
scaffold0109 (29-74)||(45534-45579)
scaffold0109 (37-74)||(7468-7505)
scaffold0109 (13-114)||(43667-43768)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (13-126)||(37071-37184)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (405-484)||(29948-30028)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (405-500)||(40400-40496)
scaffold0044 (37-192)||(19485-19641)
scaffold0044 (45-126)||(8423-8504)
scaffold0044 (37-74)||(62676-62713)
scaffold0044 (157-193)||(62556-62592)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (405-500)||(161156-161252)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (37-131)||(2258-2352)
scaffold0546 (37-74)||(5802-5839)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (37-100)||(9345-9408)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (340-501)||(9241-9404)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (33-100)||(4571-4638)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (15-114)||(3148-3247)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (50-101)||(29177-29228)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (37-192)||(226-382)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (37-131)||(18013-18107)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (37-131)||(12112-12206)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (29-99)||(32849-32919)
scaffold0111 (434-487)||(7447-7499)
scaffold0111 (434-487)||(14566-14618)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (37-192)||(66068-66224)
scaffold0036 (37-74)||(71209-71246)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (432-482)||(206575-206624)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (33-78)||(1138-1183)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (29-74)||(2217-2262)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (430-487)||(1846-1903)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (29-74)||(747-792)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (354-500)||(12064-12205)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (37-74)||(15759-15796)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (37-78)||(15107-15148)
scaffold0081 (37-100)||(24100-24163)
scaffold0081 (37-100)||(39524-39587)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (34-74)||(1853-1893)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (405-500)||(4214-4310)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (340-502)||(12249-12413)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (14-78)||(18072-18136)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (38-74)||(36721-36757)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (50-129)||(7118-7197)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (157-192)||(4875-4910)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (37-192)||(3183-3339)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (59-101)||(55271-55313)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (37-74)||(6432-6469)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (37-66)||(11453-11482)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (39-80)||(9081-9122)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (435-488)||(3272-3324)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (432-488)||(17517-17572)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (70-126)||(3073-3129)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (384-499)||(4804-4921)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (34-74)||(191966-192006)


Alignment Details
Target: scaffold0456 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 10055 - 10544
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 10154  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10155 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 10254  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10255 tgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 10354  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10355 ataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatatta 10454  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10455 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 681 - 1170
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  681 cagagagcattcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 780  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  781 atgagattgaacctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgact 880  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  881 tgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgt 980  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  981 ataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataa 1080  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1081 ttatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 147)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20309597 - 20309108
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309597 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctggatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20309498  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309497 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgact 20309398  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  20309397 tgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctga 20309298  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20309297 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 20309198  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309197 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 37745 - 38235
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37745 cagaaagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtagg 37844  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37845 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgact 37944  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37945 tgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgt 38044  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38045 ataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatatta 38144  T
Q  414 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38145 ttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23286352 - 23285865
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286352 agagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23286253  T
Q  115 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 214  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23286252 tgagattgaacatggaatgaaaattgtgagattatgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgactt 23286153  T
Q  215 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||     
T  23286152 gttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtt 23286053  T
Q  315 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23286052 taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 23285953  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285952 ttatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 23654028 - 23654507
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654028 cagagagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 23654127  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||    
T  23654128 atgagattgaacctggaattaaactgttgggattctgacttgaactcgccacggcgagca-------------cgcgagtgacccagaaacagagtgact 23654214  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23654215 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 23654314  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23654315 ttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 23654414  T
Q  413 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654415 attatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 500
Target Start/End: Original strand, 298433 - 298933
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  298433 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatatagg 298532  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298533 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 298632  T
Q  204 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||| |    
T  298633 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatat 298732  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| |||||||     
T  298733 gtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgc 298832  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  298833 aattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 298932  T
Q  500 a 500  Q
    |    
T  298933 a 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Original strand, 22737799 - 22738300
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737799 agagatcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagga 22737898  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||| |||           | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22737899 tgagattgaacctagaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 22737998  T
Q  204 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  22737999 cagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 22738098  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  22738099 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 22738198  T
Q  403 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  22738199 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  22738297 atgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Original strand, 22730852 - 22731355
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22730852 agagagcatgcaatatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 22730951  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22730952 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaa 22731051  T
Q  204 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaaccct-tgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| || | ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22731052 cagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 22731151  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  22731152 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattg 22731251  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22731252 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 22731350  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  22731351 gatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23076940 - 23076442
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23076940 agagcatgcaagatttcgtgattttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatg 23076841  T
Q  117 agattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 206  Q
    |||||| ||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076840 agattggacctggaaagatttagaatgaaactt-tggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacag 23076742  T
Q  207 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtg 306  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  || || || || | |||||||||||||||||    
T  23076741 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtg 23076642  T
Q  307 aagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaat 405  Q
    ||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| ||| ||| ||| |||    
T  23076641 aagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaat 23076542  T
Q  406 tgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23076541 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23660525 - 23660023
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23660525 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 23660426  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660425 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaat-ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaa 23660327  T
Q  203 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||| | || | ||||||||||||    
T  23660326 acagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataat 23660227  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  23660226 ttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgattt 23660127  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23660126 gcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23660028  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  23660027 gatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22337617 - 22337115
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337617 agagagcatgcaagatttcgtgattctgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 22337518  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    |||||||||||||||||          | |||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337517 tgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 22337418  T
Q  205 agagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    |||| | |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  22337417 agagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataattt 22337318  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||  |||     
T  22337317 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgc 22337218  T
Q  403 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    | |||||||||||||||||   |||| || ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22337217 atttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  22337118 atgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27754078 - 27753728
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27754078 cagatagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 27753979  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27753978 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaa 27753879  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  27753878 acagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataata 27753779  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 353  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27753778 tgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 38 - 486
Target Start/End: Original strand, 32451571 - 32452033
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||          
T  32451571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatggaaagattg 32451670  T
Q  132 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 226  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32451671 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 32451770  T
Q  227 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 326  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| ||||||||||| || |  |||||     
T  32451771 gacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgt-tatgggatgtta 32451869  T
Q  327 ttgatga-ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg- 423  Q
     || ||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||     
T  32451870 atgttgatttatgatgtgatattatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattgttatgtcatgc 32451968  T
Q  424 --ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 486  Q
      || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451969 tatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  202 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||  | |||||| |||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  23060716 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 23060618  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23060617 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 28291920 - 28292027
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28291920 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtaga 28292019  T
Q  114 atgagatt 121  Q
    ||||||||    
T  28292020 atgagatt 28292027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Original strand, 23071614 - 23071768
Alignment:
Q  47 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||| |||    
T  23071614 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaa 23071713  T
Q  137 cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23071714 atttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 22133848 - 22133948
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22133848 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 22133947  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  22133948 t 22133948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25176331 - 25176227
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  25176331 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacct 25176232  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  25176231 ggaat 25176227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 484
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708721
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 248  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||||||     
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  249 gagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 346  Q
    || ||||||||| | |||| | | | |||| ||  | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgata 23708580  T
Q  347 taatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgt 443  Q
    ||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  23708581 taattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgt 23708680  T
Q  444 tgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708681 tgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 487
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  484 gatg 487  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19671928 - 19671830
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671928 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 393  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  394 atgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 491  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |    
T  40622222 atgaattg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatta 40622319  T
Q  492 agatgatg 499  Q
    ||||||||    
T  40622320 agatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28406436 - 28406368
Alignment:
Q  60 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  28406436 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 28406368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7679702 gatgttgatgactt-acattgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 7679604  T
Q  485 atgttgaagatgatg 499  Q
     || | |||||||||    
T  7679603 ttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24503587 - 24503473
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24503587 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24503488  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  24503487 gacaagattgaacct 24503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24658121 - 24658055
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  24658121 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 24658055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 22740579 - 22740664
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22740579 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22740664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 22758334 - 22758419
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22758334 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22758419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 23100849 - 23100916
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  23100849 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaa 23100916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 22460843 - 22460999
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  22460843 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 22460941  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22460942 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22460999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Original strand, 22811553 - 22811639
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22811553 cagagagcatgttaaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 22811639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 497
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 503
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  439 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Original strand, 25963355 - 25963451
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| ||||||||||||||||    
T  25963355 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctgg 25963451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 502
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12829545 - 12829434
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  12829545 agagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 12829446  T
Q  115 tgagattgaacc 126  Q
    | ||||||||||    
T  12829445 tcagattgaacc 12829434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 502
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37318751 - 37318652
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37318751 cagagagcatgtaggattttgtatttttgaccttttagttggaccttgagcgcttatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 37318652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 126
Target Start/End: Original strand, 21138903 - 21139013
Alignment:
Q  16 gagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  21138903 gagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgac 21139002  T
Q  116 gagattgaacc 126  Q
     ||||||||||    
T  21139003 aagattgaacc 21139013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27263704 - 27263610
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  27263704 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 27263610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 19928155 - 19928311
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  19928155 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 19928253  T
Q  137 ctt-gt-gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||| || |||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19928254 cttagtcgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19928311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 45677793 - 45677838
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45677793 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 45677838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 571493 - 571397
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571493 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6726091 - 6725995
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726091 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 432 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 21917954 - 21918021
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21917954 tgtaattttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21918021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367790
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 24654989 - 24655032
Alignment:
Q  35 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24654989 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 24655032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37525145 - 37525078
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  37525145 tgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 37525078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030016
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029968 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15478081 - 15477901
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| | ||||||||    
T  15478081 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagttatgattagggatgaatgtag 15477982  T
Q  113 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |   ||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15477981 ggcaagattgaacctagaa-caatcttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15477901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Original strand, 22798769 - 22798831
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22798769 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22798831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 43137395 - 43137301
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137395 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 21146918 - 21147031
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  21146918 gcagagagcttgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtag 21147017  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  21147018 gacaagattgaacc 21147031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 24640590 - 24640691
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  24640590 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgccagaacaaacctagtaatgattagggatgaatgtag 24640689  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  24640690 ga 24640691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24674057 - 24674012
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24674057 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgcct 24674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 30970608 - 30970709
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  30970608 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 30970707  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  30970708 ga 30970709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 18786440 - 18786540
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  18786440 gattttgtagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacacgtatattattgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 18786539  T
Q  128 g 128  Q
    |    
T  18786540 g 18786540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24175267 - 24175227
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24175267 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24175227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24870347 - 24870307
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24870347 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24870307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  451 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  451 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  451 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  451 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  451 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27197360 - 27197248
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||| | ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27197360 agagagcatgtaggattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 27197261  T
Q  115 tgagattgaacct 127  Q
      |||||||||||    
T  27197260 caagattgaacct 27197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 29233992 - 29233904
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29233992 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29233904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 29347291 - 29347203
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29347291 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29347203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 40621848 - 40621888
Alignment:
Q  35 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40621848 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 40621888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Original strand, 22133977 - 22134020
Alignment:
Q  148 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133977 ctgaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 22740717 - 22740768
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22740717 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26125656 - 26125562
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  26125656 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-agaatgagattgaacctggaa 26125562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Original strand, 39827602 - 39827648
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39827602 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaag 39827648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 21318284 - 21318325
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21318284 tgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 21318325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 21327215 - 21327256
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21327215 tgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 21327256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23187528 - 23187491
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23187528 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23187491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23207817 - 23207744
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  23207817 gaactttagatgattatgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 23207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23598791 - 23598754
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23598791 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 24628107 - 24628168
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24628107 gcagagagcatgttagattttgtgtttcggccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24628168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 40428929 - 40428892
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428929 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 40428892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 41667402 - 41667365
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41667402 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41667365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 44621431 - 44621358
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  44621431 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagttgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 44621358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 12901141 - 12901229
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12901141 gcagagaacatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 12901229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19672390 - 19672318
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||  ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  19672390 attttgtagctttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtttgaatatgtataataatgattagg 19672318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 23708252 - 23708328
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 105  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  23708252 atttcgtagttttgacccttgagttgatctttagatgtttttgagtgtctgaacatatgtattaatgattaggaaag 23708328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 497
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 192
Target Start/End: Original strand, 24716188 - 24716339
Alignment:
Q  42 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta-aactt 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||| | | || | ||  | ||||||||||||||||| |  | |     
T  24716188 gacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgact-taaaacgagattgaacctggaataaccaatg 24716286  T
Q  140 gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     ||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24716287 ttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24716339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 12901286 - 12901321
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901286 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12901321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Original strand, 22412717 - 22412792
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  22412717 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 22412792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 23019344 - 23019411
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23019344 tgtatgtttgacttttgagttgaaccttcgatgtgtttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 23019411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23038511 - 23038468
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23038511 ttttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaa 23038468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23171460 - 23171413
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23171460 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23171413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23582717 - 23582670
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23582717 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23582670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 24628252 - 24628287
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24628287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24649689 - 24649654
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24649689 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24649654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 27379206 - 27379241
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27379206 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27379241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 27383252 - 27383287
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27383252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27383287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27602129 - 27602094
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27602129 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27602094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 41530783 - 41530818
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41530783 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 41530818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 7308 - 7378
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatt 98  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||| | ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7308 gattttgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgatt 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241941
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgtt-gtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 9241941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 10101305 - 10101387
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10101305 ctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 10101387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23005263 - 23005221
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23005263 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 23005221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 430
Target Start/End: Original strand, 23019706 - 23019752
Alignment:
Q  384 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 430  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23019706 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgt 23019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28406335 - 28406297
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28406335 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 34137454 - 34137412
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34137454 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 34137412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 61268 - 61231
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  61268 tttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagt 61231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 101
Target Start/End: Original strand, 18546536 - 18546593
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  18546536 cttttgggtcgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattagg 18546593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24649834 - 24649773
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24649834 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24649773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 24735856 - 24735827
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735856 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 24735827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25176199 - 25176158
Alignment:
Q  150 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  25176199 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 25176158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 41530638 - 41530699
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41530638 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41530699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Original strand, 41604391 - 41604460
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41604391 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 41604460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Original strand, 41610288 - 41610357
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41610288 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 41610357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 41684378 - 41684451
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  41684378 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 41684451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 81
Target Start/End: Original strand, 44369952 - 44369985
Alignment:
Q  48 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44369952 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 44369985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 66
Target Start/End: Original strand, 18855115 - 18855143
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855115 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 18855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27602274 - 27602186
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   | | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  27602274 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 27602186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  156 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 32553 - 32067
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32553 agagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatg 32454  T
Q  117 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32453 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttactttt 32354  T
Q  217 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 316  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32353 ttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtata 32254  T
Q  317 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatta 416  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32253 agatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattatta 32154  T
Q  417 tgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32153 tgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 187)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40443880 - 40443393
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40443880 cagaaagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 40443781  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443780 atgagattgaacctggaattaa-cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 40443682  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40443681 tattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 40443582  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443581 ataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatatta 40443482  T
Q  414 ttatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443481 ttatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 27847462 - 27847951
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27847462 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttagg 27847561  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27847562 atgagattgaacctggaattaaacttatgggattttgacctgaactcgccacggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgact 27847661  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||     
T  27847662 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctga 27847761  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27847762 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 27847861  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847862 ttatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 16385876 - 16386369
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385876 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 16385975  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385976 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 16386075  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386076 tgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgt 16386175  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||     
T  16386176 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatata 16386275  T
Q  413 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386276 tttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9509692 - 9509189
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509692 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 9509593  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509592 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 9509493  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  9509492 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatc 9509393  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  9509392 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 9509293  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9509292 caattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 9509194  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  9509193 gatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12699335 - 12698831
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699335 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 12699236  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||| |||||||||||||           | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12699235 atgaaattgaacctggaaagattgttgaatgaaactcgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaa 12699136  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  12699135 acaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatc 12699036  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  12699035 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 12698936  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12698935 caattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 12698837  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    ||||||    
T  12698836 tgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26212488 - 26211995
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  26212488 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtagg 26212389  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgac 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26212388 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgat 26212289  T
Q  213 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  26212288 ttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctg 26212190  T
Q  313 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 411  Q
    | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26212189 tttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 26212090  T
Q  412 tattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 503  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212089 tattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38227982 - 38227481
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38227982 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 38227883  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    |||||||||||||||||          | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38227882 tgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaac 38227783  T
Q  205 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  38227782 agagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 38227683  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||     
T  38227682 gtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgc 38227583  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  38227582 atttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatga 38227484  T
Q  501 tgt 503  Q
    |||    
T  38227483 tgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 158 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10589386 - 10589039
Alignment:
Q  158 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  10589386 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgg 10589287  T
Q  258 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589286 acctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatg 10589187  T
Q  358 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 454  Q
    |||| ||||||||||||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10589186 cattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgtt 10589088  T
Q  455 aattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589087 atttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 500
Target Start/End: Original strand, 3563982 - 3564482
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3563982 cagagagcttgcaagatttcgttattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3564081  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3564082 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 3564181  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |    
T  3564182 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacc 3564281  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    | ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||     
T  3564282 tatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactta 3564381  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3564382 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3564480  T
Q  499 ga 500  Q
    ||    
T  3564481 ga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 484
Target Start/End: Original strand, 15143686 - 15144139
Alignment:
Q  45 ttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----tta----- 134  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||     |||         
T  15143686 ttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctggaaagattttagaatg 15143785  T
Q  135 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgaccttt 233  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15143786 aacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgaccttt 15143885  T
Q  234 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatg 332  Q
    ||||| | |||||   |||||||||||   |||||| | ||||||||||| || | ||| | |||||||||| |||||| | |||||| | |||    ||    
T  15143886 gttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattg 15143985  T
Q  333 attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgtt 428  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||| | |||||||| ||  ||| | |||||||||| || ||    |||| ||    
T  15143986 attatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttatt 15144085  T
Q  429 gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    | ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144086 gcatactg-agatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 28504919 - 28505106
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28504919 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 28505018  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28505019 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 15754505 - 15754622
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15754505 cagagagcatgcaagatttcgaatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtaga 15754604  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15754605 atgagattgaacctggaa 15754622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 291 - 500
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  291 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  390 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  488 ttgaagatgatga 500  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 39267264 - 39267447
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39267264 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 39267363  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 188  Q
    ||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39267364 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 2831924 - 2832110
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2831924 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 2832023  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||    |||     |||||  | || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2832024 atgagattgaacctagaaagacttagaatgaactttggagaatctga-ctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 9751168 - 9751285
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9751168 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 9751267  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  9751268 atgaggttgaacctggaa 9751285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18302681 - 18302564
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18302681 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtagg 18302582  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18302581 atgagattgaacctggaa 18302564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 500
Target Start/End: Original strand, 17061602 - 17062077
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  17061602 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattt 17061701  T
Q  129 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agatttt 224  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||   ||||||    
T  17061702 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggatttt 17061799  T
Q  225 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatat 322  Q
    |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||   ||||  ||||| || ||||||||||||| | || |||      
T  17061800 gcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccatggggtagttatgaata-ttacatataatattaataatgatctgtgaagctgatttatgatga 17061898  T
Q  323 gttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca 421  Q
     ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17061899 tttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  422 tg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||   | |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17061998 tgctattttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34201286 - 34201172
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||     
T  34201286 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttaga 34201187  T
Q  114 atgagattgaacctg 128  Q
    |||||||||||||||    
T  34201186 atgagattgaacctg 34201172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44116992 - 44116816
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc-- 126  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  44116992 atttcgtaattttgactcttgagttgatccttatatgcctttgagtccctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccg 44116893  T
Q  127 --------tggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 196  Q
            | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116892 gaaagatttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 44116816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 12756350 - 12756523
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12756350 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12756449  T
Q  129 ga---------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||         | | ||||| | |||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12756450 gattatttaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12756523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 11995676 - 11995768
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995676 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44014664 - 44014560
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44014664 agatttcgtaattttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 44014565  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  44014564 tggaa 44014560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 810760 - 810864
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  810760 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacc 810859  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  810860 tggaa 810864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 354 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 503
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  408 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 68236 - 68131
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  68236 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacc 68137  T
Q  127 tggaat 132  Q
    ||||||    
T  68136 tggaat 68131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 334 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  334 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 429  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 47832297 - 47832193
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||    
T  47832297 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatct 47832198  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  47832197 ggaat 47832193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18006131 - 18006052
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 106  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18006131 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaaga 18006052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138177
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  399 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  17138077 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Original strand, 9389326 - 9389431
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  9389326 agattttgtacttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacc 9389425  T
Q  127 tggaat 132  Q
    ||||||    
T  9389426 tggaat 9389431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24054969 - 24054884
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  24054969 cagagtgcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 24054884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16324495 - 16324391
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  16324495 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacct 16324396  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  16324395 ggaat 16324391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 19649103 - 19649170
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19649103 cagagagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19649170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 44407988 - 44408102
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44407988 gcagagagcatgtaagattttgaaatttcgactttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 44408087  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  44408088 gacaagattgaacct 44408102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  484 g 484  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 299 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187115
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  399 ttgaa 403  Q
    |||||    
T  12187119 ttgaa 12187115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  384 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 481  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  482 aagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  483 agatgttgaagatgatga 500  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14953674 - 14953560
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14953674 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14953575  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  14953574 gacaagattgaacct 14953560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 132
Target Start/End: Original strand, 16219358 - 16219452
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  16219358 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaat 16219452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 21064780 - 21064898
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||     
T  21064780 cagagagcttgcaagattttgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggaaatattttaga 21064879  T
Q  114 atgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21064880 atgagattgaacttggaat 21064898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 453  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  454 taattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26420454 - 26420340
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26420454 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 26420355  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  26420354 gacaagattgaacct 26420340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 4318174 - 4318287
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4318174 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtag 4318273  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  4318274 gacaagattgaacc 4318287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 10508701 - 10508786
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  10508701 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 10508786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2760613 - 2760542
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2760613 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 2760542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3272273 - 3272202
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  3272273 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 3272202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 15754910 - 15755008
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754910 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 17137701 - 17137768
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17137701 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 17137768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 450
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  385 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14959640 - 14959526
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14959640 gcagagagcatgtaagatttttcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14959541  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  14959540 gacaagattgaacct 14959526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22073383 - 22073301
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  22073383 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctagaat 22073301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11880753 - 11880668
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  11880753 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 11880668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Original strand, 12255454 - 12255527
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  12255454 ttagatgattttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaat 12255527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9703767 - 9703703
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9703767 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 9703703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44116605 - 44116509
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116605 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 19486767 - 19486865
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486767 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 499
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12187495 - 12187429
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  12187495 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 12187429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13149607 - 13149451
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  13149607 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 13149509  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13149508 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13149451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14149046 - 14148932
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14149046 gcagagagcatgtaagatttttcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14148947  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  14148946 gacaagattgaacct 14148932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 2279781 - 2279850
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  2279781 ttagatgattttgagtgcctgaacatgcataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 2279850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11262804 - 11262691
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11262804 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 11262705  T
Q  114 atgagattgaacct 127  Q
    |  |||||||||||    
T  11262704 acaagattgaacct 11262691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Original strand, 18154469 - 18154522
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18154469 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 18154522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410059
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 435 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 2529631 - 2529682
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2529631 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 2529682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 12321380 - 12321447
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12321380 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12321447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15211903 - 15211844
Alignment:
Q  40 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  15211903 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttataaatgatta 15211844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6801665 - 6801509
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| |  |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  6801665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctacttttgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 6801567  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6801566 cttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6801509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 20702651 - 20702733
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20702651 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 20702733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26292848 - 26292692
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  26292848 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 26292750  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  26292749 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgag 26292692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32768120 - 32768038
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32768120 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 32768038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 6016800 - 6016901
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6016800 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 6016899  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  6016900 ga 6016901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 8917879 - 8917842
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917879 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 8917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13462214 - 13462177
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462214 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13462177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14430360 - 14430315
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14430360 tgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcct 14430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15581145 - 15581108
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15581145 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15581108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 42205575 - 42205530
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42205575 attttataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 42205530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869346
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 15604926 - 15604962
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15604926 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15604962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16056684 - 16056616
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag 219  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  16056684 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttag 16056616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12692973 - 12692858
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagt-tgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||  || |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||     
T  12692973 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagagtggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtc 12692874  T
Q  112 ggatgagattgaacct 127  Q
    |||  |||||||||||    
T  12692873 ggacaagattgaacct 12692858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16275944 - 16275850
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  16275944 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-gggatgatattgaacctggaa 16275850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18302533 - 18302494
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18302533 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 810894 - 810936
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  810894 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9593798 - 9593704
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  9593798 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 9593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9644761 - 9644667
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  9644761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 9644667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 11547896 - 11548010
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||  ||||   ||    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11547896 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttgggccttgagtgtcactgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 11547995  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  11547996 gaaaagattgaacct 11548010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 11554492 - 11554606
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||  ||||   ||    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11554492 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttgggccttgagtgtcactgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 11554591  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  11554592 gaaaagattgaacct 11554606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 481  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16056795 - 16056713
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||| | |||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  16056795 agttgagctttaggtgattttgtgtacctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaat 16056713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 16438687 - 16438843
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  | |||| || |||||||| ||   | ||| |||||||| |||||| ||  ||     
T  16438687 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtatctactattgattagggaatgttttagaatgagattaaacctgaaac-aac 16438785  T
Q  137 cttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16438786 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16438843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 484
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154943
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11080
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11043 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 18711 - 18748
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18711 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 33584 - 33471
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || | |||||||  ||||||||    
T  33584 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtag 33485  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  33484 gatcagattgaacc 33471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 70394 - 70507
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||    
T  70394 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtag 70493  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  70494 gatcagattgaacc 70507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 74502 - 74615
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||    
T  74502 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtag 74601  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  74602 gatcagattgaacc 74615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7536662 - 7536561
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  7536662 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 7536563  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  7536562 ga 7536561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11313101 - 11313064
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11313101 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11313064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11987665 - 11987628
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11987665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11987628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12318580 - 12318543
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12318580 tttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagt 12318543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 13635122 - 13635159
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13635122 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 13635159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 408 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  408 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14045281 - 14045212
Alignment:
Q  60 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14045281 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14045212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14355311 - 14355242
Alignment:
Q  60 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14355311 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14355242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Original strand, 14655082 - 14655147
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14655082 agttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14655147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15728777 - 15728740
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15728777 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15728740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16583687 - 16583650
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16583687 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16583650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 16724284 - 16724321
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16724284 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16724321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 17701298 - 17701335
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17701298 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17701335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22073272 - 22073223
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22073272 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35152058 - 35152021
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35152058 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 35152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 9445808 - 9445848
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9445808 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgctttcgagt 9445848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 9389462 - 9389501
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9389462 ctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9389501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 9751316 - 9751355
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9751316 ctgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 11238655 - 11238702
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  11238655 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 11238702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 11995796 - 11995835
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995796 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 11995835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12719001 - 12718966
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12719001 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12718966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12723912 - 12723877
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12723912 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12901852 - 12901793
Alignment:
Q  70 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12901852 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12901793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15211703 - 15211484
Alignment:
Q  250 agagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa 349  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||| |  || || ||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||    
T  15211703 agagttgaacctttgggtagctttaagacttaataatgacgtttaagatgatatgtgaagctgtttaagat----------tgattatgatgtgatataa 15211614  T
Q  350 tgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgtt 444  Q
    || | ||| |||  |||||||  |  ||| |||  | |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| |    
T  15211613 tgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgct 15211515  T
Q  445 gctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 476  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15211514 gctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 16906974 - 16907009
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16906974 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16907009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Original strand, 17017045 - 17017120
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  17017045 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 17017120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 17137820 - 17137871
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17137820 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17137871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203828
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatg 18203828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18279736 - 18279701
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18279736 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18279701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18283699 - 18283664
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18283699 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18283664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34201138 - 34201099
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34201138 ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 68099 - 68061
Alignment:
Q  154 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  68099 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 68061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Original strand, 9177252 - 9177318
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  9177252 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggtaagtttttagattgagattgaac 9177318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Original strand, 11768526 - 11768568
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11768526 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 11768568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 12255556 - 12255598
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12255556 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12255598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Original strand, 15008102 - 15008148
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15008102 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattag 15008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 127
Target Start/End: Original strand, 25038895 - 25038953
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25038895 ttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25038953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35366727 - 35366609
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| |  | |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||   | |||     
T  35366727 cagagagcttgcaagatttcgtgtttttaagctgtgagtttaaccttggatgtttttgagggcctgaacatgtactacaatgattaggcaaagttttaga 35366628  T
Q  114 atgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  35366627 atgagattgaacttggaat 35366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Original strand, 1867650 - 1867719
Alignment:
Q  60 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  1867650 tagatgttttttagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 1867719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14194766 - 14194729
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 65  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14194766 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatg 14194729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16114719 - 16114658
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16114719 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16114658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16117872 - 16117811
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16117872 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16117811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 16906829 - 16906890
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16906829 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16906890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18279881 - 18279820
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18279881 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18279820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18283844 - 18283783
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18283844 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18283783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18531665 - 18531608
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  18531665 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 18531608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18557424 - 18557387
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18557424 tttttgacttttgagttgaaccttagaggcctttgagt 18557387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44014530 - 44014489
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  44014530 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 48785817 - 48785744
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  48785817 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 48785744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9410421 - 9410321
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9410421 gcagagagcatgttggatttcgtattttcgactttttagttggaccttgagcgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaagaatgaatgtag 9410322  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  9410321 g 9410321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 15094 - 15584
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15094 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 15193  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15194 atgagattgaacctggaataaaacttgtaggattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 15293  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 15393  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15394 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 15493  T
Q  414 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15494 ttatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 32894 - 32968
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtct 88  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32894 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaacatgtct 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 335 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7295
Alignment:
Q  335 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattg-at-attattatgtcatgttgttgtat 432  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||   ||||||||||     
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttgtataattatcatg-attgttgttgtaa 7361  T
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7360 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7771 - 7705
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  7771 tgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 7705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 153)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 16199276 - 16199765
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16199276 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaagaatgtagg 16199375  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16199376 atgagattgaacctagaattaaact-gtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgact 16199474  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16199475 tattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 16199574  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16199575 ataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatatta 16199674  T
Q  414 ttatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199675 ttatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31971747 - 31971257
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971747 cagagagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagg 31971648  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31971647 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgacctgaactcgccccggcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatagagtgact 31971548  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  31971547 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgt 31971448  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31971447 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatatta 31971348  T
Q  414 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971347 ttatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 45130649 - 45131117
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130649 cagagaccatgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 45130748  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130749 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaac----------------------tcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 45130826  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45130827 tattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgt 45130926  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaaattgatatt 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45130927 ataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatatt 45131026  T
Q  413 attatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131027 attatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 21918628 - 21919121
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21918628 cagacagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagg 21918727  T
Q  114 atgagattgaacctggaatt-aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac 212  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21918728 aagagattgaacctggaaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgac 21918827  T
Q  213 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||    
T  21918828 ttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctg 21918927  T
Q  313 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaa-tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 411  Q
    | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21918928 tttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 21919027  T
Q  412 tattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919028 tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20536711 - 20536208
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536711 cagagagcatgcaagattttgtgattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtagg 20536612  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536611 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 20536512  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  20536511 acagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 20536412  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20536411 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 20536312  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20536311 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 20536213  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  20536212 gatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 18878855 - 18879352
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878855 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 18878954  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878955 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 18879054  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||| || | ||||| |||||||    
T  18879055 acagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatc 18879154  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18879155 tgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 18879252  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18879253 gcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18879349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 18818028 - 18818530
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18818028 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagg 18818127  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818128 atgagattgaacctggaaagattgtaaaatgaaacttttggt-ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 18818226  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||   | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  18818227 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 18818326  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||     
T  18818327 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactta 18818426  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18818427 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18818525  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  18818526 gatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 21923546 - 21924049
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923546 cagagagcatgtgagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagg 21923645  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923646 atgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 21923745  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21923746 acagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 21923845  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| | | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  21923846 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 21923945  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21923946 caattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 21924044  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  21924045 gatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22627238 - 22626736
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627238 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22627139  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||| |||  |          ||| | ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22627138 atgagattgaacctcgaaagattgtagaatgaacctttggaaatctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaa 22627039  T
Q  204 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22627038 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatc 22626939  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  22626938 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttg 22626839  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22626838 tatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  22626739 atgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23406884 - 23406379
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406884 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 23406785  T
Q  114 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||| |||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406784 atgagattggacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 23406685  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||  | || ||  |||  |||||||| |  | ||||||||||||     
T  23406684 acagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataata 23406585  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg--ttgatgaat 399  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||   || ||| |    
T  23406584 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgact 23406485  T
Q  400 tgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23406484 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23406386  T
Q  497 atgatgt 503  Q
    |||||||    
T  23406385 atgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 502
Target Start/End: Original strand, 28648663 - 28649164
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28648663 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagga 28648762  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    ||||||||||| |||||          | |||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28648763 tgagattgaacatggaaagatttagaatgaaaccttttgaattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaac 28648862  T
Q  205 agagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| |    
T  28648863 agagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatat 28648962  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||||||| ||| |||     
T  28648963 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgc 28649062  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28649063 atttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28649161  T
Q  500 atg 502  Q
    |||    
T  28649162 atg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 25362788 - 25363123
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25362788 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 25362887  T
Q  133 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  25362888 gaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctt 25362987  T
Q  233 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 332  Q
    | |||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  25362988 tcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttg 25363087  T
Q  333 attatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 367  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25363088 attatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6759759 - 6759255
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6759759 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 6759660  T
Q  115 tgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||           ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759659 tgagattgaacttggaaatattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 6759560  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  6759559 cagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 6759460  T
Q  303 tgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||   ||||||  | ||||||   ||| ||    
T  6759459 tgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgt---tgactt 6759363  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6759362 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 6759264  T
Q  498 tgatgtcca 506  Q
    |||||||||    
T  6759263 tgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 23649055 - 23648554
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23649055 agagagcatgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23648956  T
Q  115 tgagattgaacctg----------gaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||| |||||          |||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23648955 tgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaa 23648857  T
Q  204 cagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  23648856 cagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatc 23648757  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||||||| || ||||    
T  23648756 tgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattg 23648657  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     || |||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |    
T  23648656 caaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 23648558  T
Q  499 gatg 502  Q
    ||||    
T  23648557 gatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 16091959 - 16092463
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16091959 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16092058  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----ttaaa------cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||| |||||| ||    |||||      ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092059 atgagattaaacctgaaaagatttaaaaaaaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaa 16092158  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| || |||  | ||||||||  ||||||||||| | |||||  ||| ||||||||  || | ||||||||||||     
T  16092159 cagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataata 16092258  T
Q  303 tgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    || |||| || | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  16092259 tgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 16092358  T
Q  401 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16092359 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 16092457  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    ||||||    
T  16092458 tgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7373237 - 7372778
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7373237 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctg 7373138  T
Q  129 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 217  Q
               |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7373137 gaaagattgtagaatgaaacttgtgaaattctgacctgaactcgccacggc---------------------gagtgacccagaaacagagtgtcttgtt 7373059  T
Q  218 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 317  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||| | | | ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7373058 aggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaa 7372959  T
Q  318 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 417  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  7372958 gatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattat 7372866  T
Q  418 gtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7372865 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22875568 - 22875065
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  22875568 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttaatccttagatgcttttgagcgtctaaacatgtttaataatgattaggaaagattgtaga 22875469  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    | ||| ||||||||||||           | |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875468 acgaggttgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 22875370  T
Q  203 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||  ||||  | | ||||||||||||    
T  22875369 acagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataat 22875270  T
Q  302 ctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 399  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |    
T  22875269 ctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 22875170  T
Q  400 tgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22875169 tgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatga 22875071  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    ||||||    
T  22875070 tgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 290 - 503
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  290 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 389  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  390 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 489  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21389557  T
Q  490 gaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||    
T  21389558 gaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 290 - 503
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  290 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  390 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 489  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  490 gaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 290 - 503
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  290 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  390 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 489  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  490 gaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 303 - 503
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  503 t 503  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 5865895 - 5866082
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5865895 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 5865994  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5865995 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17141416 - 17141302
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17141416 cagagagcatgcaagattttgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 17141317  T
Q  114 atgagattgaacctg 128  Q
    |||||||||||||||    
T  17141316 atgagattgaacctg 17141302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21255722 - 21255605
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255722 cagagagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 21255623  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21255622 atgagattgaacctggaa 21255605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21491495 - 21491382
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21491495 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 21491396  T
Q  114 atgagattgaacct 127  Q
    ||||||||||||||    
T  21491395 atgagattgaacct 21491382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41598663 - 41598494
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||             
T  41598663 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 41598564  T
Q  129 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 197  Q
      |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598563 tagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 41598494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21249884 - 21249767
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249884 cagagagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 21249785  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21249784 atgagactgaacctggaa 21249767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 19801045 - 19801163
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  19801045 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagaga 19801144  T
Q  114 atgagattgaacctggaat 132  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19801145 ataagattgaacctggaat 19801163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21674195 - 21674091
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21674195 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21674096  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  21674095 tggaa 21674091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 408 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  408 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 21389071 - 21389156
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21389071 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21389156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 26355329 - 26355433
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||    
T  26355329 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacc 26355428  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  26355429 tggaa 26355433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 38854883 - 38854987
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||||    
T  38854883 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacct 38854982  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  38854983 ggaat 38854987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39834321 - 39834217
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  39834321 gattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacttgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacct 39834222  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  39834221 ggaat 39834217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 407 - 496
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  484 gatg 487  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20499149 - 20499049
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  20499149 gattttgtagttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaacct 20499050  T
Q  128 g 128  Q
    |    
T  20499049 g 20499049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 17612133 - 17612231
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612133 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6520857 - 6520779
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 106  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6520857 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaaga 6520779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20527926 - 20527812
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20527926 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 20527827  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  20527826 gacaagattgaacct 20527812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  484 g 484  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21249483 - 21249384
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249483 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21255321 - 21255222
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255321 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 22010317 - 22010384
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  22010317 tgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 22010384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 484
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413462
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19899576 - 19899510
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19899576 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19899510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 132
Target Start/End: Original strand, 23760482 - 23760576
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||||||||    
T  23760482 ttttgacttttgagttgatccctgaatgtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaat 23760576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 377759 - 377714
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377759 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 377714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 17353556 - 17353641
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  17353556 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 17353641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 20465677 - 20465722
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465677 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20465722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 496
Target Start/End: Original strand, 13597640 - 13597731
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597640 gatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Original strand, 16409889 - 16409989
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| |||||||||||||||    
T  16409889 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 16409988  T
Q  129 g 129  Q
    |    
T  16409989 g 16409989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 20046261 - 20046357
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046261 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 23845412 - 23845512
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23845412 gcagagagcatgttagattttttattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23845511  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  23845512 g 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24756221 - 24756157
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24756221 cagagagcatgtaggattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 24756157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 15602655 - 15602722
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15602655 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 15611107 - 15611174
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15611107 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15611174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 16860971 - 16861042
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16860971 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 16861042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 125
Target Start/End: Original strand, 21414869 - 21414956
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21414869 tttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 21414956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 30642929 - 30642996
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  30642929 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 30642996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 127
Target Start/End: Original strand, 16411903 - 16412001
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    | |||||||||| |||||||||||    
T  16411903 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattaaatgataatgtaggatcagattgaacct 16412001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19976947 - 19976860
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttg--acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19976947 cagagagcatgtagaattttgtattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19976860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Original strand, 21168359 - 21168455
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||   | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  21168359 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaatgagattgaacctgg 21168455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21395686
Alignment:
Q  43 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21395686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790179
Alignment:
Q  43 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21790179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483328 -gtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 21161753 - 21161820
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21161753 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 21161820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598188
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598236 -gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Original strand, 13507663 - 13507713
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13507663 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13507713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Original strand, 13597195 - 13597245
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13597195 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13597245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16185209 - 16185143
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  16185209 tgtatttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16185143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19983570 - 19983508
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19983570 ttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23834626 - 23834532
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  23834626 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa 23834532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 24433890 - 24434046
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| |  ||||||||||| |||  ||     
T  24433890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacctagaa-caac 24433988  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24433989 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29123531 - 29123449
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29123531 ctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29123449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 100
Target Start/End: Original strand, 17926355 - 17926412
Alignment:
Q  43 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17926355 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 17926412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18619931 - 18619894
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18619894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18865808 - 18865695
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  18865808 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 18865709  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  18865708 gatcagattgaacc 18865695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22029010 - 22028973
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22029010 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22028973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 26934805 - 26934906
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  26934805 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 26934904  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  26934905 ga 26934906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 15203297 - 15203393
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203297 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Original strand, 20856068 - 20856108
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856068 ttttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20856108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 982980 - 983058
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||    
T  982980 agttgaactttagatgattttgagtgtctgaacatgtatattagtgattaggaaagtttttagattgagattgaacctg 983058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15538901 - 15538745
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| || |||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  15538901 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 15538803  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15538802 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 22113381 - 22113537
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  ||     
T  22113381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caac 22113479  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22113480 cttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22113537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 22134884 - 22135040
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  ||     
T  22134884 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caac 22134982  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22134983 cttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22135040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 23776471 - 23776517
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaacc-ttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23776471 tgtatttttgacttttgagttgaacctttagatgtttttgagtgcct 23776517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3216738 - 3216637
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  3216738 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 3216639  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  3216638 ga 3216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15532341 - 15532304
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15532341 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17141229
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 17266574 - 17266647
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  17266574 gaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 17266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17615421 - 17615348
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  17615421 gcagagagcgtgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 17615348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18855413 - 18855300
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||    
T  18855413 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtag 18855314  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  18855313 gatcagattgaacc 18855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Original strand, 19259245 - 19259305
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  19259245 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc-tttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 19259305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 487
Target Start/End: Original strand, 19801448 - 19801530
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801448 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21249734 - 21249697
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21249734 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22057801 - 22057768
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22057801 tttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 22059006 - 22059079
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  22059006 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttatgagggcctgaacatgt 22059079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 22166034 - 22166071
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22166034 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22166071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 23252415 - 23252452
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23252415 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23252452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 30308407 - 30308444
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308407 tttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 30308444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 32599131 - 32599094
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32599131 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32599094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 32605663 - 32605626
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32605663 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32605626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37116882 - 37116813
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  37116882 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 37116813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 39094594 - 39094631
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094594 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 39094631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39834188 - 39834147
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39834188 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070574
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 506
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 506  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290841
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19111672 - 19111601
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| ||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19111672 ctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19111601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19117963 - 19117892
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| ||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19117963 ctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19117892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24353563 - 24353488
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  24353563 gaactttagataattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 24353488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43252145 - 43252110
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43252145 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 43252110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 101
Target Start/End: Original strand, 17085770 - 17085804
Alignment:
Q  67 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17085770 ttttgagtgcctgaacatgtataataatgattagg 17085804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 488
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 21286710 - 21286652
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21286710 gatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgt 21286652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 17055042 - 17055079
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17055042 tttttgacttttgagttgaactttagatgcctttgagt 17055079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 17828236 - 17828273
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17828236 tttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17828273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21255572 - 21255535
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255572 gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 21972213 - 21972274
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21972213 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21972274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22045311 - 22045274
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22045311 tttttgacctttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22045274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 66
Target Start/End: Original strand, 23844567 - 23844596
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23844567 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 23844596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28854454 - 28854381
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| | || || |||| ||||||||||||    
T  28854454 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttgggtgtttatgagggcctgaacatgt 28854381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21674061 - 21674021
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21674061 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 21674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 21972353 - 21972393
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21972353 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21972393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 21976438 - 21976478
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21976438 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21976478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397566
Alignment:
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgtt-gtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 28397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 38855015 - 38855055
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  38855015 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 38855055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Original strand, 40492438 - 40492506
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  40492438 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 40492506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13987 - 13497
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13987 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagc 13888  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13887 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgagctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgact 13788  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13787 tgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 13688  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13687 ataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatatta 13588  T
Q  414 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13587 tcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 170)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 14052932 - 14053422
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14052932 cagagagcatgcaagattc-gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 14053030  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14053031 atgagattgaacttggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgact 14053130  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14053131 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgt 14053230  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag-atgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053231 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatatt 14053330  T
Q  413 attatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053331 attatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12903248 - 12902757
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12903248 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 12903150  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12903149 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcct 12903050  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12903049 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 12902950  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12902949 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatatt 12902850  T
Q  413 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902849 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7089366 - 7088877
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089366 agagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 7089267  T
Q  117 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 216  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7089266 agattgaacctggaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgt 7089167  T
Q  217 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 316  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7089166 tagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgttta 7089067  T
Q  317 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 415  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7089066 agatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattatt 7088967  T
Q  416 atgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088966 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44053332 - 44052829
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44053332 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattgggaaagaatgtagg 44053233  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44053232 atgagattgaacctgtaaagattataggatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaa 44053133  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  44053132 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatc 44053033  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    ||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  44053032 tgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 44052934  T
Q  401 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  44052933 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatga 44052835  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    ||||||    
T  44052834 tgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3097135 - 3096772
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097135 cagagagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3097036  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097035 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 3096936  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3096935 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgt 3096836  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttg 377  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3096835 ttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22636937 - 22636437
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636937 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22636838  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22636837 atgagattgaacctggaaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacttgacctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaa 22636738  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
T  22636737 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatc 22636638  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22636637 tgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 22636539  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22636538 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 22636440  T
Q  499 gat 501  Q
    |||    
T  22636439 gat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 17047721 - 17048055
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17047721 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaac-tggaat 17047819  T
Q  133 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  17047820 gaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctt 17047919  T
Q  233 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 332  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  17047920 tgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttg 17048019  T
Q  333 attatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 367  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17048020 attatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 38 - 500
Target Start/End: Original strand, 16377164 - 16377639
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |       
T  16377164 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctggaatgatcg 16377263  T
Q  135 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 226  Q
           ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  16377264 tagaatgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgc 16377363  T
Q  227 gacctttgttgctcaagttgt-cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 325  Q
     ||||||||||| | |||| |  |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||    
T  16377364 tacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgtt 16377463  T
Q  326 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 424  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||     
T  16377464 gatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 16377563  T
Q  425 tg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16377564 tgtttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14039151 - 14038653
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14039151 agagagcttgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaa 14039052  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||| |||           | |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039051 tgagattgaacctagaaagattttagaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 14038952  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||    
T  14038951 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatc 14038852  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  14038851 tgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 14038752  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  14038751 catttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  266 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattactt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  366 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 465  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 17046525  T
Q  466 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046524 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 151 - 496
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374473
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttga 23374224  T
Q  251 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 350  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23374225 ggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataat 23374324  T
Q  351 g-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgc 446  Q
    |  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23374325 gttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgc 23374424  T
Q  447 tgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374425 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7894073 - 7893703
Alignment:
Q  134 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  7894073 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctt 7893974  T
Q  233 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 332  Q
    ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||    
T  7893973 tgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagat---gtgttgctg 7893877  T
Q  333 attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgtt 428  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||    
T  7893876 attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 7893777  T
Q  429 gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893776 gtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 180 - 503
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240090
Alignment:
Q  180 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  279 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttg 377  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||| ||| |||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  378 tatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 475  Q
     |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  476 cggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7799200 - 7798967
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  7799200 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggacataatgtagg 7799101  T
Q  114 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799100 atgagattgaacctggaaagtttgtagaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 7799001  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 236  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7799000 acaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtt 7798967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15091400 - 15091093
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15091400 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtttctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaga 15091301  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15091300 atgagattgaacctggaaggattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 15091201  T
Q  203 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||    
T  15091200 acagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataat 15091101  T
Q  302 ctgtgaag 309  Q
    ||||||||    
T  15091100 ctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 500
Target Start/End: Original strand, 44928542 - 44929042
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44928542 agagagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaa 44928641  T
Q  115 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||           |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44928642 tgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagtta 44928740  T
Q  204 cagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattata 299  Q
    |||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| |  |||||  ||| || | | ||| ||||  ||||| ||     
T  44928741 cagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatg 44928837  T
Q  300 atctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 397  Q
    ||||||||||||| | || |||   ||  || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  |||    
T  44928838 atctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattga 44928937  T
Q  398 attgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 494  Q
     ||| | |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  44928938 cttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44929036  T
Q  495 tgatga 500  Q
    ||||||    
T  44929037 tgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15552316 - 15552199
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552316 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 15552217  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15552216 atgagattggacctggaa 15552199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16597148 - 16597031
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16597148 cagagagcatgcaagattctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16597049  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16597048 atgagattgaacctggaa 16597031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 503
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  294 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  393 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 490  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  491 aagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24029244 - 24029057
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24029244 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtagg 24029145  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24029144 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 16239610 - 16239728
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag-aatgtag 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16239610 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtag 16239709  T
Q  113 gatgagattgaacctggaa 131  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16239710 aatgagattgaacctggaa 16239728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 13812427 - 13812614
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13812427 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtagg 13812526  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13812527 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-taaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 20156908 - 20157025
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20156908 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 20157007  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20157008 atgagattgaacctggaa 20157025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 22633831 - 22633948
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22633831 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22633930  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22633931 atgagattgaacctggaa 22633948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  322 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 420  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  421 atgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44102688 - 44102520
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||             
T  44102688 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgattatg-aagaatgtaggatgagattgaacctggatagattt 44102590  T
Q  129 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 197  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102589 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 44102520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6190912 - 6190819
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190912 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa 6190819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190479
Alignment:
Q  186 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataa 285  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |  |    
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaata 6190683  T
Q  286 taaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgat-tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacat 384  Q
    | |  ||||||| |||  |||||||||| || || |||||  || |||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||  || |||  |    
T  6190682 tgatattaattacaattcgtgaagctgt-tatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataatt 6190584  T
Q  385 aagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 480  Q
     ||||| ||| |   || | ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6190583 gagatgattgttcgctt-acattgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtc 6190485  T
Q  481 taagat 486  Q
    ||||||    
T  6190484 taagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 334 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  334 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--g 429  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12774488 - 12774385
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  12774488 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacc 12774389  T
Q  127 tgga 130  Q
    ||||    
T  12774388 tgga 12774385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 21814945 - 21815109
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||   |||||    
T  21814945 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatta 21815044  T
Q  135 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
          ||||| | |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815045 agaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 21815274 - 21815438
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||   |||||    
T  21815274 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctggattaatta 21815373  T
Q  135 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
          ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815374 agaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 21818367 - 21818531
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||   |||||    
T  21818367 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatta 21818466  T
Q  135 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
          ||||| | |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21818467 agaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21818531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8846865 - 8846761
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8846865 agatttcgtaattttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 8846766  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  8846765 tggaa 8846761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  384 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 480  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  481 taagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15551915 - 15551817
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551915 gatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 334 - 487
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13956
Alignment:
Q  334 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 430  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 39705920 - 39706024
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  39705920 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacct 39706019  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  39706020 ggaat 39706024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 422 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096293
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 354 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353835
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353884 -gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15099839 - 15099735
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  15099839 gattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacct 15099740  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  15099739 ggaat 15099735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14679439 - 14679325
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14679439 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14679340  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  14679339 gacaagattgaacct 14679325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 417
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121834
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 417  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 450
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 428  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  429 -gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14685646 - 14685534
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14685646 agagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 14685547  T
Q  115 tgagattgaacct 127  Q
    | |||||||||||    
T  14685546 taagattgaacct 14685534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 43198220 - 43198324
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |    
T  43198220 gatttcgtagttttgacccttaagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttagattgagattgaacat 43198319  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  43198320 ggaat 43198324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  483 agatgttgaagatgatga 500  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 484
Target Start/End: Original strand, 52242856 - 52243298
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taaacttg------tgggattc 148  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    |||   ||      ||||| |     
T  52242856 ttagatgatttcgagtgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagtt 52242955  T
Q  149 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 246  Q
      ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  52242956 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcg 52243054  T
Q  247 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 344  Q
    |  ||||||||||  | |||||| | | |||| |  |||| |   ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||    
T  52243055 taaagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagata-ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtga 52243153  T
Q  345 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcct 439  Q
    ||||||  | ||||||||||||| |  |||| || ||   | |||||||| ||||||  | |||||||| |||| |||||   ||  ||| |||||||||    
T  52243154 tataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcct 52243253  T
Q  440 atgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243254 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9557007 - 9556827
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9557007 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 9556908  T
Q  113 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |   ||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556907 ggcaagattgaacctagaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13845028 - 13844950
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 106  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13845028 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaaga 13844950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23838910 - 23838796
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23838910 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23838811  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  23838810 gacaagattgaacct 23838796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 13405 - 13506
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  13405 gattttgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 13504  T
Q  128 gg 129  Q
    ||    
T  13505 gg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 7900800 - 7900913
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  7900800 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgggtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 7900899  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  7900900 gatcagattgaacc 7900913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Original strand, 15868289 - 15868368
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  15868289 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 15868368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 16356591 - 16356658
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16356591 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 16356658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17046765 - 17046718
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046765 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 17046718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17053533 - 17053482
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17053533 agagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 17053482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Original strand, 19757257 - 19757410
Alignment:
Q  40 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19757257 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacctt 19757355  T
Q  140 --gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
       |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19757356 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19757410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19782549 - 19782396
Alignment:
Q  40 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19782549 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacctt 19782451  T
Q  140 --gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
       |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19782450 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19782396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  483 agatgttgaagatgatga 500  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35614415 - 35614301
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||    
T  35614415 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtag 35614316  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  ||||| |||||    
T  35614315 gactagattaaacct 35614301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15190795 - 15190702
Alignment:
Q  39 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||  ||||||| ||||||||||    
T  15190795 tttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaat 15190702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 15321723 - 15321836
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  15321723 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 15321822  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  15321823 gatcagattgaacc 15321836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44676132 - 44676047
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  44676132 cagagagcatgtagaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 44676047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 51493447 - 51493560
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  51493447 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 51493546  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  51493547 gatcagattgaacc 51493560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13570012 - 13569948
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13570012 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 16956279 - 16956379
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16956279 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 16956378  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  16956379 g 16956379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 506  Q
    |  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 502
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15094254 - 15094187
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15094254 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15094187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 15121441 - 15121508
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15121441 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15121508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    || | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 16243053 - 16243209
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || |||||| |||||||  ||  || ||| |||||||||||||| |||  ||     
T  16243053 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctaatattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctagaa-caac 16243151  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16243152 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16243209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27534502 - 27534384
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||||||||  ||  ||    
T  27534502 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtacctactaatgattaggaaacgattgag 27534403  T
Q  113 gatgagattgaacctggaa 131  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27534402 aatgagattgaacctggaa 27534384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  438 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 15464592 - 15464661
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  15464592 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 15464661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 16348330 - 16348375
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348330 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16348375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23843979 - 23843894
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  | |||||||||    
T  23843979 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttcattaatgatta 23843894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 500
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  334 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 429  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12570521 - 12570457
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12570521 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 12570457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Original strand, 26243318 - 26243471
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||  ||    
T  26243318 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa-caa 26243415  T
Q  136 actt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 189  Q
     |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26243416 ccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 26243471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 44773153 - 44773249
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773153 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Original strand, 385997 - 386096
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  385997 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 386096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 40471920 - 40471837
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40471920 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacct 40471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2015231 - 2015075
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  2015231 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 2015133  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  2015132 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagacgctctcgcctcgcgag 2015075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12774355 - 12774313
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774355 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 18222031 - 18222187
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  18222031 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 18222129  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  18222130 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 18222187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32851918 - 32851868
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32851918 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 32851868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40478593 - 40478511
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40478593 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 40478511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3413249 - 3413212
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413249 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 3413212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 9271733 - 9271834
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  9271733 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 9271832  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  9271833 ga 9271834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 18602398 - 18602435
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18602398 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18602435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 18608992 - 18609029
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18608992 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18609029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 53433854 - 53433753
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  53433854 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 53433755  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  53433754 ga 53433753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 1951414 - 1951570
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  |      
T  1951414 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaacgacc 1951513  T
Q  137 cttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     | | ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  1951514 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgcgag 1951570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 11250211 - 11250251
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250211 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11250251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcc 438  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |    ||      
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt----tgt- 12611011  T
Q  439 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611010 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Original strand, 14268101 - 14268189
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14268101 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14268189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355471
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 16351498 - 16351538
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16351498 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 16351538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3332240 - 3332201
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3332240 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15367789 - 15367690
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15367789 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15370117 - 15370018
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15370117 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15370020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15371301 - 15371202
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15371301 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15371204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15373582 - 15373483
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15373582 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15373485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15402802 - 15402703
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15402802 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15402705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 16487716 - 16487783
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16487716 tgtatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgggtgcctaaagatgtttattaaagattag 16487783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35171105 - 35170991
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaacct-tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||   ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  35171105 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggacctctag-tgtcattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgta 35171007  T
Q  112 ggatgagattgaacct 127  Q
    |||  |||||||||||    
T  35171006 ggacaagattgaacct 35170991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 17152140 - 17152296
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  |  || ||| || |||||||| ||   | ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  17152140 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgactacctttaggtgcctattattgattagggaatgttttagaacgagattgaacctggaa-caac 17152238  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  17152239 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgag 17152296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 192
Target Start/End: Original strand, 22633980 - 22634018
Alignment:
Q  154 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22633980 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 26284568 - 26284650
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26284568 ctttttagttggaccttggatgtcttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 26284650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45938600 - 45938444
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |  |||||| |  |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  ||     
T  45938600 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgtctactgttgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaa-caac 45938502  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45938501 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45938444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 6873005 - 6873118
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| ||||||||    
T  6873005 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtag 6873104  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  6873105 gatcagattgaacc 6873118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 14708287 - 14708324
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14708287 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 14708324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15099706 - 15099665
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15099706 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15552166 - 15552129
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552166 gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18237345 - 18237308
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18237345 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18237308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23139723 - 23139686
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23139723 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23139686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28383328 - 28383255
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  28383328 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttatgagggcctgaacatgt 28383255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 28569097 - 28569134
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28569097 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28569134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 36133615 - 36133652
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36133615 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36133652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 43255813 - 43255850
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43255813 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 43255850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 260
Target Start/End: Original strand, 15464694 - 15464805
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 248  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||   |||||||| | |||||| || ||||||||     
T  15464694 acctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttaggattttgcaatctttgtcgcacaagttgtt 15464793  T
Q  249 gagagttgaacc 260  Q
      ||||||||||    
T  15464794 atgagttgaacc 15464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25555972 - 25555932
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25555972 gtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 25555932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 4561107 - 4561142
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4561107 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4561142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 5756711 - 5756746
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5756711 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 5756746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Original strand, 12287791 - 12287866
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12287791 gaaccttagatgtttctaagtgtctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 74
Target Start/End: Original strand, 15352957 - 15352996
Alignment:
Q  35 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15352957 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15352996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 20157056 - 20157095
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157056 ctgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33742710 - 33742675
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33742710 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 33742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12522505 - 12522447
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  12522505 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacct 12522447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 14757082 - 14757164
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || | |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14757082 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 14757164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 484
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970853
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    || | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970807 gc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 15124792 - 15124858
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  15124792 tgtacttttgacctttgagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15124858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17810718 - 17810636
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17810718 ctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 17810636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 18228528 - 18228622
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  18228528 tttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 18228622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Original strand, 30234807 - 30234893
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30234807 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgatta 30234893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Original strand, 32306582 - 32306624
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32306582 ttagatggttttgagtgcctaaacatgtataataatgattagg 32306624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 127
Target Start/End: Original strand, 41385430 - 41385488
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  41385430 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacct 41385488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 287594 - 287521
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  287594 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 287521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 4560962 - 4561023
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4560962 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4561023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 5756566 - 5756627
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5756566 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 5756627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8846730 - 8846689
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8846730 accttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596686
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 465  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 33742855 - 33742794
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33742855 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 42997103 - 42997140
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42997103 tttttgacttttgagttgaaacttagatgcctttgagt 42997140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 47126441 - 47126514
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  47126441 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 47126514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 131
Target Start/End: Original strand, 53081755 - 53081832
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  53081755 gaactttagatgattctgagtgcctaaacatgtataataatgattaagcaagtttttagattgagattgaacctggaa 53081832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9530885 - 9530849
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9530885 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagt 9530849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 39706052 - 39706092
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39706052 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 39706092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 178)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 503
Target Start/End: Original strand, 21292611 - 21293090
Alignment:
Q  26 aagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292611 aagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 21292710  T
Q  126 ctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttg 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21292711 ctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttg 21292810  T
Q  226 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 325  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21292811 cgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtt 21292910  T
Q  326 gttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  21292911 gttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcata 21293010  T
Q  424 ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293011 ctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 8286471 - 8286964
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8286471 cagagagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtagg 8286570  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286571 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctaaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 8286670  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| | |||||||||||    
T  8286671 tgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgt 8286770  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286771 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 8286870  T
Q  413 attatgtcatg----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286871 attatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22075511 - 22075018
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075511 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 22075412  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgac 212  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075411 atgaaaatgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgac 22075312  T
Q  213 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  22075311 ttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctg 22075213  T
Q  313 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 411  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22075212 tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 22075113  T
Q  412 tattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075112 tattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Original strand, 23390115 - 23390617
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390115 agagagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23390214  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  23390215 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaa 23390314  T
Q  204 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  23390315 cagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 23390414  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  23390415 gtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 23390514  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23390515 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  23390614 atgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24494071 - 24493569
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24494071 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 24493972  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||    
T  24493971 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaa 24493872  T
Q  204 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24493871 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatc 24493772  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  24493771 tgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 24493672  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24493671 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  24493572 atgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25422035 - 25421532
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  25422035 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttagg 25421936  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||| ||||||||          | ||||||  || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25421935 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttcggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 25421836  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  25421835 ccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatc 25421736  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  25421735 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttg 25421636  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25421635 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 25421537  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  25421536 gatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13095996 - 13095495
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095996 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 13095897  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    |||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13095896 tgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaac 13095797  T
Q  205 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  13095796 agagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 13095697  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  13095696 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 13095598  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13095597 catttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  13095498 atgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24529724 - 24529223
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529724 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 24529625  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529624 atgagattgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 24529525  T
Q  203 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| || | ||||| ||||||    
T  24529524 acagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataat 24529425  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| ||    
T  24529424 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgactt 24529325  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24529324 gcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 24529226  T
Q  498 tga 500  Q
    |||    
T  24529225 tga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 368
Target Start/End: Original strand, 22107002 - 22107357
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107002 cagagagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22107101  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22107102 acgagattgaacctgaaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgcct 22107201  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22107202 tgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 22107301  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-gattatgcattacttgaa 368  Q
     |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22107302 ttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13025812 - 13025311
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025812 agagagcatgcaagatttcgtgattttgaattttgagttgatccttagatacttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 13025713  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    |||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13025712 tgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaac 13025613  T
Q  205 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  13025612 agagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 13025513  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  13025512 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 13025414  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13025413 catttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  13025314 atgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9078455 - 9077952
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9078455 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaga 9078356  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078355 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 9078256  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  9078255 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 9078156  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  9078155 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 9078056  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  9078055 cacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgat 9077957  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  9077956 gatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 25431897 - 25431414
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  25431897 cagagagcgtgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagaatttagg 25431798  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25431797 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaa 25431698  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  25431697 tcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatc 25431598  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| | |  |||||||||| ||| |||    
T  25431597 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttg 25431498  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431497 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1096970 - 1096467
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096970 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 1096871  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||| ||||||  |          ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096870 atgagattgaatctggaaagattgcagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 1096771  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  | ||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |    
T  1096770 cagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacc 1096671  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    | ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  1096670 tatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttg 1096571  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  1096570 catttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgtt 1096472  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  1096471 gatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 21985765 - 21986130
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21985765 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 21985864  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21985865 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaa 21985964  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||| || || | ||||| ||||||     
T  21985965 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatt 21986064  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttga 367  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  21986065 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 19660455 - 19660572
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19660455 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtgga 19660554  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||| |||||||||    
T  19660555 atgagattaaacctggaa 19660572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 22119811 - 22119998
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22119811 cagagagcatgcaaaattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22119910  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22119911 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 199
Target Start/End: Original strand, 11580887 - 11581058
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  11580887 ttttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattt 11580986  T
Q  129 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 199  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580987 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 11581058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 21871190 - 21871306
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21871190 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtagga 21871289  T
Q  115 tgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||    
T  21871290 tgagattgaacctggaa 21871306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 21875470 - 21875586
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21875470 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtagga 21875569  T
Q  115 tgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||    
T  21875570 tgagattgaacctggaa 21875586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 339 - 503
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  339 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatac 434  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 353 - 503
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729185
Alignment:
Q  353 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 449  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 21729132  T
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729133 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 36154470 - 36154639
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 128  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||             
T  36154470 ttttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctggatagattt 36154569  T
Q  129 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 197  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36154570 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacc 36154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 386 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 485  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  486 tgttgaagatg 496  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 24766955 - 24767142
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||| ||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24766955 cagatagcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtagg 24767054  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||| ||||||          | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24767055 atgagattgaatctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21566034 - 21565930
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21566034 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21565935  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  21565934 tggaa 21565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Original strand, 22959166 - 22959267
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  22959166 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 22959265  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  22959266 ga 22959267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997655
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 21997653  T
Q  502 gt 503  Q
    ||    
T  21997654 gt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19669390 - 19669286
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  19669390 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacg 19669291  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  19669290 tggaa 19669286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22144508 - 22144065
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taa------acttgtgggattc 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    |||      | || ||||| |     
T  22144508 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagtt 22144409  T
Q  149 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 246  Q
      ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | |||||    
T  22144408 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttg 22144310  T
Q  247 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 344  Q
    | |||||||||||| | | || | | | |||| ||  | || |  ||||| || | |||||||| ||| |||||||   ||| || || |||  ||||||    
T  22144309 ttgagagttgaaccttggagtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtga 22144211  T
Q  345 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctat 441  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||| || ||   | |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| |||||    
T  22144210 tataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctat 22144111  T
Q  442 gttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144110 gttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 21329127 - 21329231
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  21329127 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 21329226  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  21329227 ggaat 21329231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 487
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  483 agatg 487  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032323
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  399 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  22032421 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770118
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  399 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  18770018 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 132
Target Start/End: Original strand, 21498659 - 21498753
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21498659 ttttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattgaacctggaat 21498753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 26012056 - 26012137
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012056 ttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 331 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tt 428  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  429 gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 331 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572180
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 403  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37724403 - 37724319
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  37724403 agagagcatgtaagattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 37724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 21294892 - 21295006
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21294892 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 21294991  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  21294992 gacaagattgaacct 21295006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 388 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  388 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 485  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  486 tgttgaagatgatg 499  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 15441583 - 15441696
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15441583 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 15441682  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  15441683 gacaagattgaacc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 5888807 - 5888911
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  5888807 gattttgtagttttgacctttaagtcgaagcttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacat 5888906  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  5888907 ggaat 5888911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 291 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  291 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  391 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  489 tgaagatgatga 500  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 14359448 - 14359562
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14359448 gcagaaagcatgtaagattttgcattttcgacttttgagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14359547  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||   ||||||||||    
T  14359548 gacatgattgaacct 14359562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 450
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 427  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  428 tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 21340420 - 21340576
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  21340420 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 21340518  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21340519 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22032797 - 22032731
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  22032797 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 22032731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24555010 - 24554896
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24555010 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24554911  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  24554910 gacaagattgaacct 24554896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 26665784 - 26665940
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  26665784 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 26665882  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26665883 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26665940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 26937381 - 26937537
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  26937381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 26937479  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26937480 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26937537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 17918796 - 17918845
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918796 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17918845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23201869 - 23201784
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23201869 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23201784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25406902 - 25406789
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  25406902 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 25406803  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  25406802 gatcagattgaacc 25406789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 11581265 - 11581361
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581265 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 21741175 - 21741279
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  21741175 gattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgaataggaaagattatagattgagattgaacct 21741274  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  21741275 ggaat 21741279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 25808115 - 25808215
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || || |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25808115 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 25808214  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  25808215 g 25808215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 21366304 - 21366371
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21366304 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21366371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 31342602 - 31342539
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31342602 agagagcatgtcaaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 31342539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16674605 - 16674449
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  16674605 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 16674507  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16674506 cttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16674449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18356780 - 18356624
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| ||||||||| ||||||||  ||     
T  18356780 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaagtgcctactattgattagggaatgatttagaatgagattgcacctggaa-caac 18356682  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18356681 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18356624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 18769642 - 18769708
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18769642 tgtatttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18769708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 20910430 - 20910609
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |  |||||| ||| |||||| | | |||| |||    
T  20910430 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaat-tag 20910528  T
Q  113 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20910529 aacaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20910609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 23535242 - 23535398
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  23535242 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 23535340  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23535341 cttagttgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23535398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 24532701 - 24532857
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  24532701 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 24532799  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24532800 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24532857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418599
Alignment:
Q  291 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 388  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  389 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22133475 - 22133362
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22133475 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22133376  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  22133375 gatcagattgaacc 22133362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22140167 - 22140054
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22140167 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22140068  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  22140067 gatcagattgaacc 22140054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14079648 - 14079584
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14079648 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcct 14079584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22588571 - 22588459
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  22588571 gcagagagcatgttagattttatgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 22588472  T
Q  113 gatgagattgaac 125  Q
    ||| |||||||||    
T  22588471 gatcagattgaac 22588459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245136
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20806028 - 20805961
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20806028 tgtaattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 20805961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23512588 - 23512521
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23512588 tgtattttcgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 23512521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 40725951 - 40725853
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725951 gatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 12028215 - 12028281
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  12028215 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattag 12028281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17284512 - 17284430
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17284512 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 17284430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21887305 - 21887239
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  21887305 tgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 21887239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 433 - 487
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33409659 - 33409565
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  33409659 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa 33409565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 36154798 - 36154942
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||    |    
T  36154798 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----t 36154892  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154893 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 20026495 - 20026592
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    ||||||||| |||||||  || ||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  20026495 gattttgtagttttgacccttaagtcgatctttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 20026592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26681045 - 26680980
Alignment:
Q  35 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26681045 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26680980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 482
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26952652 - 26952587
Alignment:
Q  35 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26952652 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26952587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22760121 - 22760081
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22760121 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22760081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24222344 - 24222304
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24222344 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24222304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 26742376 - 26742436
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26742376 cagagagcatgtaaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 126
Target Start/End: Original strand, 41294112 - 41294176
Alignment:
Q  62 gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41294112 gatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41294176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 22177797 - 22177848
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22177797 agttgaaccctagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 22177848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 23500964 - 23501031
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23500964 cagagagcatgtagaattctgtattcctaacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 23501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 15236440 - 15236522
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15236440 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 15236522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 17718092 - 17718248
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||| | |||  ||     
T  17718092 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacatagaa-caac 17718190  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17718191 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 17718248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 19472348 - 19472528
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || |||    
T  19472348 gcagagagcatgttagattttgtgtttcggccttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttag 19472447  T
Q  113 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     |||||||||||||| |||  || |||   ||| |  ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19472448 aatgagattgaacctagaa-caaccttagttggaaagctggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19472528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 21884842 - 21884998
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  ||     
T  21884842 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caac 21884940  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21884941 cttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21884998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25535409 - 25535351
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25535409 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25535351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Original strand, 26011688 - 26011770
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  26011688 agttgaactttagatgattatgagtgtctaaacatgtgtaataatgattaagaaagattctaaattgagattgaacctggaat 26011770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 29471019 - 29471101
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29471019 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29471101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 29477614 - 29477696
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29477614 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29477696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 1858621 - 1858666
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858621 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 1858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4036673 - 4036636
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4036673 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 5888940 - 5888981
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5888940 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 16255551 - 16255624
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  16255551 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 16255624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 16259184 - 16259257
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  16259184 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 16259257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 497
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319193
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18784500 - 18784463
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18784500 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18784463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19660643
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21482931 - 21482894
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21482931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21482894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 200  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21565900 - 21565863
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565900 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 22325555 - 22325668
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  22325555 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgacattttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 22325654  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  22325655 gaaaagattgaacc 22325668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 22589348 - 22589421
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  22589348 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 22589421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 22592903 - 22592976
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  22592903 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 22592976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 22596458 - 22596531
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  22596458 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 22596531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 22959298 - 22959339
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959298 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 23336973 - 23337030
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23336973 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 23337030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 25229059 - 25229096
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25229059 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 25293215 - 25293252
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25293215 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26172917 - 26172880
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26172917 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26172880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27517191 - 27517126
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27517191 agttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27517126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27523828 - 27523763
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27523828 agttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 487
Target Start/End: Original strand, 27988997 - 27989034
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988997 ttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 42805873 - 42805836
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42805873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 42805836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 500
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  452 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 193
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31061164 - 31061068
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19992305 - 19992258
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19992305 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19992258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20296180 - 20296145
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20296180 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20296145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 22334501 - 22334548
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  22334501 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 22334548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23201731 - 23201680
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201731 tgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23201680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23693961 - 23693870
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| | || || |||| ||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23693961 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttgggtgtttatgagggcctgaacatgtaccttaatgattaggaaa 23693870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26704542 - 26704499
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  26704542 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26704499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26974275 - 26974232
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  26974275 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26974232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31342453 - 31342414
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31342453 ctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 31342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Original strand, 34294212 - 34294283
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  34294212 cttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggat 34294283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Original strand, 37286464 - 37286523
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37286464 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37286523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Original strand, 37293167 - 37293226
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37293167 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37293226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23572540 - 23572510
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572540 tgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 23572510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744036
Alignment:
Q  154 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26704151 - 26704090
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704151 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Original strand, 26732421 - 26732463
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26732421 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26732463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Original strand, 26740234 - 26740276
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26740234 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26740276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26973884 - 26973823
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973884 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18774657 - 18774620
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18774657 tttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagt 18774620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20232896 - 20232847
Alignment:
Q  143 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20232896 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20232847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20232983 - 20232954
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232983 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 20232954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20296325 - 20296264
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20296325 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20296264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328320
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgct-gtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 21328320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 188
Target Start/End: Original strand, 21741308 - 21741345
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 188  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21741308 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21741345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22343974 - 22343873
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | |||| |||    
T  22343974 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatatag 22343875  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  22343874 ga 22343873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 25574056 - 25574097
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25574056 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25574097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 25575249 - 25575290
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25575249 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25575290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 25576442 - 25576483
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25576442 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25576483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 123074 - 123114
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  123074 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 123114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4398210 - 4398138
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  4398210 cagagagcttgcacgattttgcatttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 4398138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 21871321 - 21871377
Alignment:
Q  136 acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21871321 acttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21871377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 21875601 - 21875657
Alignment:
Q  136 acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21875601 acttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21875657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24020737 - 24020637
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  24020737 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtag 24020638  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  24020637 g 24020637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16771 - 16282
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16771 cagagagcatgcaagatttcgtacttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 16672  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16671 acgagattgaacctgaaattaaacttatgggattttgaccagaactcggcacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 16572  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16571 tgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctga 16472  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  16471 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataa 16372  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 47478 - 46995
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47478 cagagagcatgcaagatttcgtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattaggaatgaatgtagg 47379  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47378 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgagctcgccacggagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgact 47279  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||||||||||||||||||    
T  47278 tgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgt 47185  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47184 ataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 47085  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47084 ttatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 64301 - 64367
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  64301 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 64367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 242)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 20698065 - 20698556
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698065 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20698164  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698165 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 20698264  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20698265 tgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 20698364  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
      ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20698365 tcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatatta 20698464  T
Q  414 ttatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698465 ttacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17488359 - 17487856
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488359 agagagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 17488260  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17488259 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 17488160  T
Q  204 -cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17488159 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatc 17488060  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17488059 tgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 17487960  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17487959 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17487861  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  17487860 gatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 66 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13442725 - 13442274
Alignment:
Q  66 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacct 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||    
T  13442725 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacct 13442626  T
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagt 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13442625 gaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagt 13442526  T
Q  255 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 353  Q
    |||||| | || |   ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  13442525 tgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 13442426  T
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |    
T  13442425 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-t 13442327  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442326 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12399698 - 12399209
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12399698 cagagagcatgctagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatatagg 12399599  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  12399598 atgggtttgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgacccagaaac--agtgact 12399501  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| | |  || | || |||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  12399500 tgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctat 12399402  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12399401 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatatt 12399302  T
Q  413 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399301 attatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17499841 - 17499338
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||| |||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499841 agagagaatgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 17499742  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  17499741 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgttggattctgacctgaattcgccacggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaa 17499642  T
Q  204 -cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  17499641 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatt 17499542  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17499541 tgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 17499442  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17499441 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17499343  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  17499342 gatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26687390 - 26686887
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687390 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 26687291  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687290 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 26687191  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||    
T  26687190 acagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatc 26687091  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  ||||||| || ||| |||    
T  26687090 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttg 26686991  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  26686990 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgat 26686892  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  26686891 gatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18439037 - 18438534
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18439037 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaa 18438938  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438937 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 18438838  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||| |||||||    
T  18438837 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatc 18438738  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||   |||||| | ||||||||| ||| |||    
T  18438737 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttg 18438638  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18438637 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18438539  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  18438538 gatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14973357 - 14972854
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14973357 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 14973258  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||| |||| | ||     |||     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14973257 atgagattaaaccagaaaagattttagaaagaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaa 14973158  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  14973157 cagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 14973058  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   |||||| || |||||||| ||| |||    
T  14973057 tatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttg 14972958  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14972957 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 14972859  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  14972858 gatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 484
Target Start/End: Original strand, 14576451 - 14576934
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  14576451 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtaga 14576550  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14576551 atgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 14576650  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  14576651 caaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatc 14576750  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  14576751 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 14576850  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576851 caattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 500
Target Start/End: Original strand, 40213339 - 40213838
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213339 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 40213438  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213439 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 40213538  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  40213539 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 40213638  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  40213639 tgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 40213738  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||    
T  40213739 catttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgat 40213836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14573088 - 14572608
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14573088 agagcatgcaagattttgtgtttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatg 14572989  T
Q  117 agattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 206  Q
    |||||||||||||||          | |||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14572988 agattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 14572889  T
Q  207 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgt 305  Q
    |||  |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||    
T  14572888 agtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgt 14572789  T
Q  306 gaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaa 404  Q
    |||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |   ||    
T  14572788 gaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaa 14572689  T
Q  405 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 25476003 - 25476506
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25476003 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaga 25476102  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||           | |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476103 atgagatcgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaat-ctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 25476201  T
Q  203 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |  | |||||||| |||    
T  25476202 acagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaat 25476301  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 399  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |    
T  25476302 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgact 25476400  T
Q  400 tgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    || | |||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25476401 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25476499  T
Q  497 atgatgt 503  Q
    |||||||    
T  25476500 atgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 23082979 - 23083482
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23082979 cagagagcatgtcagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctggatatgtctaatagtgattaggacaaaatgtagg 23083078  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23083079 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaa 23083178  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||    
T  23083179 acatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatc 23083278  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| | | ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  23083279 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttg 23083378  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23083379 caattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23083477  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  23083478 gatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 11424381 - 11424880
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11424381 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaga 11424480  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11424481 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaa 11424580  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||  | | ||||||| |||||    
T  11424581 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatc 11424680  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   || |||  | ||||||||||   |||    
T  11424681 tgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttg 11424777  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
      ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  11424778 ctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 30030331 - 30029859
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30030331 cagagagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgattacgaaagaatgtggg 30030232  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtga-cccagaaacagagtga 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||     
T  30030231 atgagattgaacctggaatgaaacagtttggaattctgacct-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccag-aacagaatgc 30030134  T
Q  212 cttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || | ||| | |||||| |||||||||    
T  30030133 cttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagct 30030034  T
Q  312 gtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgata 410  Q
    || |||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  30030033 gtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgata 30029935  T
Q  411 ttattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    || ||||||||   ||||||||||  ||| ||||| ||||  |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30029934 ttcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgct-attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaag 30029859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 129 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 43841309 - 43840932
Alignment:
Q  129 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 228  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43841309 gaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcga 43841210  T
Q  229 cctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgtt 328  Q
    |||||||| | | |||||| |||||||  ||  | |||||| |||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43841209 cctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 43841110  T
Q  329 gatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgt 424  Q
    | |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||    
T  43841109 gttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 43841010  T
Q  425 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    | |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  43841009 ttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16809887 - 16809724
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16809887 agagagcatgctagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaacat----aataatgattaggaaagaatgtagga 16809792  T
Q  115 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctc 182  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16809791 tgagattgatcctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Original strand, 17247904 - 17248100
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17247904 cagagaggttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 17248003  T
Q  114 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 200  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248004 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 17248100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14179825 - 14179708
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14179825 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 14179726  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14179725 atgagattgaacttggaa 14179708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12340255 - 12340138
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12340255 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 12340156  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12340155 atgagattgaacctggaa 12340138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 53070321 - 53070505
Alignment:
Q  18 gagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 117  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53070321 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatga 53070420  T
Q  118 gattgaacctgg---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||||||||||   |||||      ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  53070421 gattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 53070505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  178 ctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaaga 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaaga 16796776  T
Q  278 cttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 367  Q
    |||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16796775 cttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 13209946 - 13210062
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  13209946 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaat-atgattaggaaagaaagtaga 13210044  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13210045 atgagattgaacctggaa 13210062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14666108 - 14665991
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14666108 cagagagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtagg 14666009  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14666008 atgagattgaacctggaa 14665991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14669263 - 14669146
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14669263 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtagg 14669164  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14669163 atgagattgaacctggaa 14669146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14735621 - 14735504
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14735621 cagagagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtagg 14735522  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14735521 atgagattgaacctggaa 14735504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 500
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  291 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  390 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  488 ttgaagatgatga 500  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 42386890 - 42386429
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 128  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| | |||  || |||||||||||             
T  42386890 ttttgacctttaagttgaaccttagttgtttatgagtgcatgaacatgcataataatgattaggcaagactttagactgtgattgaacctgaaatagtta 42386791  T
Q  129 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttg 225  Q
     |||| |||||| ||||| |   |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||    
T  42386790 agaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttg 42386692  T
Q  226 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgt 324  Q
    ||| |||||| || | |||||| | |||||||||| | |||||| |||  |||||  | || | |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |    
T  42386691 cgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttt 42386592  T
Q  325 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 423  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||  | |||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  42386591 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatg 42386492  T
Q  424 ttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
     ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386491 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588547
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 4588547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43842681 - 43842572
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842681 cagagagcatgcaagatttcatgattttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 43842582  T
Q  114 atgagattga 123  Q
    ||||||||||    
T  43842581 atgagattga 43842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Original strand, 12851984 - 12852169
Alignment:
Q  16 gagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12851984 gagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtttaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12852083  T
Q  116 gagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||| ||||||          | |||||| ||  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12852084 gagattgaatctggaaagacttagaatgaaacttttgataatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 49389275 - 49389378
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  49389275 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 49389374  T
Q  127 tgga 130  Q
    ||||    
T  49389375 tgga 49389378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 12933941 - 12934045
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  12933941 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 12934040  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  12934041 tggaa 12934045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 32308158 - 32308058
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32308158 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32308059  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  32308058 t 32308058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9513400 - 9513299
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  9513400 agatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 9513301  T
Q  127 tg 128  Q
    ||    
T  9513300 tg 9513299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9521375 - 9521274
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  9521375 agatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 9521276  T
Q  127 tg 128  Q
    ||    
T  9521275 tg 9521274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Original strand, 17247142 - 17247236
Alignment:
Q  18 gagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17247142 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 17247236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16104268 - 16104168
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  16104268 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctg 16104169  T
Q  129 g 129  Q
    |    
T  16104168 g 16104168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 49667715 - 49667818
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  49667715 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 49667813  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  49667814 tggaa 49667818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Original strand, 1644314 - 1644415
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  1644314 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 1644413  T
Q  127 tg 128  Q
    ||    
T  1644414 tg 1644415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16097820 - 16097719
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16097820 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacc 16097721  T
Q  127 tg 128  Q
    ||    
T  16097720 tg 16097719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Original strand, 12171750 - 12171827
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 106  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171750 atttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 12171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 15877447 - 15877532
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  15877447 cagagagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15471413 - 15471309
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  15471413 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 15471314  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  15471313 ggaat 15471309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 43550544 - 43550644
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 43550642  T
Q  502 gt 503  Q
    ||    
T  43550643 gt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 126
Target Start/End: Original strand, 2050833 - 2050931
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  2050833 gattttgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc 2050931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  290 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  484 gatgttgaagatgatgatgt 503  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 1465041 - 1465145
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  1465041 gattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaacct 1465140  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  1465141 ggaat 1465145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 324702 - 324627
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  324702 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 324627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 839723 - 839609
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  839723 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgacttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 839624  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  839623 gacaagattgaacct 839609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  335 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 432  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24188254 - 24188140
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24188254 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24188155  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  24188154 gacaagattgaacct 24188140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 430 - 499
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38814837 - 38814681
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  38814837 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa-caac 38814739  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38814738 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 38814681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 55149455 - 55149341
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55149455 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 55149356  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  55149355 gacaagattgaacct 55149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165250
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27165267  T
Q  484 gatgttgaagatgatga 500  Q
    | || | ||||||||||    
T  27165266 gttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14234969 - 14234881
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  14234969 ttttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacc 14234881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17242425 - 17242269
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  17242425 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 17242327  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17242326 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17242269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 438 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  438 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242838
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 487
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070802
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 53301572 - 53301669
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301572 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 3402600 - 3402649
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402600 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 11298167 - 11298212
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298167 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11298212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  484 gatgttgaagatgatga 500  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4291249 - 4291149
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4291249 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 4291150  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  4291149 g 4291149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 430 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 435 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Original strand, 18383555 - 18383651
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| ||||||||||||||||    
T  18383555 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctgg 18383651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20723478 - 20723298
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20723478 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 20723379  T
Q  113 gatgagattgaacctggaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||  ||||||||||| |||  | | | | |||||  ||| | || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20723378 gacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 20723298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274706
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274785 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Original strand, 321634 - 321697
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  321634 agagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 321697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12173266 - 12173199
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12173266 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12173199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12496735 - 12496668
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12496735 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 12496668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 23077116 - 23077183
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23077116 tgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 23077183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 37642288 - 37642386
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642288 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 856616 - 856550
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  856616 tgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 856550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3834127 - 3833971
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||||| |||  ||     
T  3834127 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctagaac-aac 3834029  T
Q  137 cttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||  |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3834028 cttggttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3833971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567576
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15060772 - 15060706
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15060772 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15060706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 22109929 - 22110007
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  22109929 agttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctg 22110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16333649 - 16333548
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16333649 gcagagagcatgttagattttgtaacttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 16333550  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  16333549 ga 16333548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 17674209 - 17674258
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674209 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 26190651 - 26190692
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190651 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 26190692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  388 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  485 atgttgaagatgatga 500  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389640
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3389640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469296
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8499614 - 8499518
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499614 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15977611 - 15977515
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977611 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 17524813 - 17524857
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17524813 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 17524857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Original strand, 52523390 - 52523462
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  52523390 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattctagtttgatattgaacctggaa 52523462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 323069 - 323026
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 76  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323069 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 323026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14501666 - 14501615
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14501666 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14501615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 14878143 - 14878210
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  14878143 tgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 14878210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23275208 - 23275133
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  23275208 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 23275133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 484
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962037
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 1598133 - 1598289
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  ||     
T  1598133 tttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagtacctttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaa-caac 1598231  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1598232 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 1598289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 1644447 - 1644489
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644447 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 11300164 - 11300320
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  11300164 tttttgacttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 11300262  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11300263 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11300320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15051996 - 15051930
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15051996 tgtaattttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15051930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 15849738 - 15849894
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  15849738 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 15849836  T
Q  137 cttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||  ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15849837 cttggttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23408928 - 23408847
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23408928 agagcatgcaagaattcgtaattttgacttttgagttgaaccttagat-attatgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23408847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 23704428 - 23704510
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23704428 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23704510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 23722884 - 23722966
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23722884 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23722966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 23741340 - 23741422
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23741340 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23741422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32308025 - 32307983
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32308025 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 41201457 - 41201539
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41201457 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41201539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 49667848 - 49667890
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49667848 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 131
Target Start/End: Original strand, 605945 - 606026
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||    
T  605945 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaa 606026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 5149596 - 5149709
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||| | |    
T  5149596 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgg 5149695  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  5149696 gatcagattgaacc 5149709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12891883 - 12891782
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  12891883 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 12891784  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  12891783 ga 12891782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14499805 - 14499692
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||    
T  14499805 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtag 14499706  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  14499705 gatcagattgaacc 14499692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 17252685 - 17252786
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  17252685 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 17252784  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  17252785 ga 17252786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4710775 - 4710675
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  4710775 gcagagagcatgttggattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtag 4710676  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  4710675 g 4710675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 11594789 - 11594829
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594789 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11594829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119887
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  451 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  451 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412429
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15617854 - 15617766
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15617854 gcagagagcatgttggattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 15617766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 15941557 - 15941713
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  |      
T  15941557 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaacaacc 15941656  T
Q  137 cttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     | | ||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15941657 gtagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15941713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16690675 - 16690635
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16690675 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16690635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16697248 - 16697208
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16697248 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16697208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12340107 - 12340068
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12340107 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13251166 - 13251095
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13251166 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13251095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13257812 - 13257741
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13257812 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13257741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13321447 - 13321348
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  13321447 agagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagga 13321348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 498
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  408 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16369888 - 16369845
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 76  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369888 tgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 16369845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 19725546 - 19725617
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  19725546 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgccttaagatgttgaataaagattag 19725617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 19725669 - 19725720
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19725669 tgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19725720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 23412827 - 23412878
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23412827 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataaaaatgattagg 23412878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 45797710 - 45797659
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45797710 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 45797659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 326817 - 326973
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  326817 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 326915  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  326916 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 326973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7986183 - 7986069
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||| || ||||||||  | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||     
T  7986183 gcagagagcgtgtaagattttacaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacttagtaatgattaggaaggaatgtaa 7986084  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  7986083 gacaagattgaacct 7986069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11070517 - 11070435
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11070517 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11070435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 11165189 - 11165271
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11165189 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11165271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 74
Target Start/End: Original strand, 11557037 - 11557075
Alignment:
Q  36 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11557037 attttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11557075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 12934075 - 12934117
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12934075 acctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15483115 - 15482959
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  15483115 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 15483017  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   | ||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15483016 cttagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15482959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 126
Target Start/End: Original strand, 15691949 - 15692019
Alignment:
Q  56 accttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15691949 accttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 15692019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 15726591 - 15726673
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15726591 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacc 15726673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 16862833 - 16862927
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  16862833 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaatgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa 16862927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 30066395 - 30066313
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30066395 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 30066313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43927643 - 43927597
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43927643 gaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattag 43927597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 55023294 - 55023212
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  55023294 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 55023212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 7792999 - 7793036
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7792999 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7793036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11852055 - 11852006
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11852055 atttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11852006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 16797707 - 16797744
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16797707 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16797744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 20461153 - 20461190
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20461153 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 31097207 - 31097244
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31097207 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 31097244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 1982460 - 1982500
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1982460 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 1982500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5221868 - 5221780
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  5221868 agattttgtgttttcgactttttagttagaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 5221780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 316659 - 316612
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  316659 gaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 316612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7110034 - 7109999
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7110034 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7109999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7113969 - 7113934
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7113969 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7113934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10326316 - 10326229
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  10326316 agattttgcattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagga 10326229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12378459 - 12378412
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12378459 gaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattagg 12378412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14665960 - 14665921
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14665960 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14669115 - 14669076
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14669115 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14735473 - 14735434
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14735473 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Original strand, 16623714 - 16623785
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  16623714 ctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 16623785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 22147548 - 22147646
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||| ||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  22147548 gatattattatatcatgatgttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22322000 - 22321965
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22322000 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22321965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22337055 - 22337020
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22337055 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22337020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Original strand, 23052711 - 23052762
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 80  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23052711 attttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 23052762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 27409417 - 27409452
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27409417 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 324591 - 324549
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  324591 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 324549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16097687 - 16097645
Alignment:
Q  150 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16097687 gacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 22642967 - 22643069
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  22642967 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 22643066  T
Q  113 gat 115  Q
    |||    
T  22643067 gat 22643069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 22670515 - 22670617
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  22670515 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 22670614  T
Q  113 gat 115  Q
    |||    
T  22670615 gat 22670617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Original strand, 41092030 - 41092076
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  41092030 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtagga 41092076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 49389408 - 49389446
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  49389408 acctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 1465174 - 1465215
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1465174 acctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1465215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 2034599 - 2034672
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  2034599 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 2034672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 2038106 - 2038179
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  2038106 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 2038179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 2041847 - 2041920
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  2041847 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 2041920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7110179 - 7110118
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7110179 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7110118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7114114 - 7114053
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7114114 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7114053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9513265 - 9513228
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 188  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9513265 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9521240 - 9521203
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 188  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9521240 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Original strand, 10236027 - 10236112
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagga 102  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  10236027 agagcatgatagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattagga 10236112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210133
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14038681 - 14038608
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  14038681 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 14038608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14042149 - 14042076
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  14042149 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 14042076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246034
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgtt-gtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 15246034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15337879 - 15337810
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15337879 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15337810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Original strand, 15397562 - 15397631
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15397562 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15397631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Original strand, 15404153 - 15404222
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15404153 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15404222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 15991732 - 15991833
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  15991732 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcgtttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 15991831  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  15991832 ga 15991833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 113
Target Start/End: Original strand, 17710275 - 17710320
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17710275 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 17710320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22322145 - 22322084
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22322145 gcagagagcatgttagattttgtgttttgaccttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 22322084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22337200 - 22337139
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22337200 gcagagagcatgttagattttgtgttttgaccttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 22337139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23408504 - 23408428
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  23408504 tgttgttgtaatctgtctatgttgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 27409272 - 27409333
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27409272 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 27409333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 28350846 - 28350903
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28350846 ttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 28350903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28950206 - 28950145
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28950206 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28950145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37250973
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 37250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39231228 - 39231155
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  39231228 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 39231155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 42326397 - 42326360
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42326397 ttttggacttttgagttgaaccttagaagcttttgagt 42326360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Original strand, 53380017 - 53380082
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53380017 agttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53380082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Original strand, 53386669 - 53386734
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53386669 agttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53386734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Original strand, 10153377 - 10153465
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||||||  |||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  10153377 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 10153465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171909
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 12171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19809506 - 19809406
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  19809506 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtag 19809407  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  19809406 g 19809406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110156
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22110156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 500
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5246
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 4859  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4860 atgagattgaacctggaattgaacttatgggattctgacctgaactcgccaaagagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgact 4959  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    | || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4960 tattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactga 5059  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5060 ataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 5159  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5160 ttatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Original strand, 16920263 - 16920751
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16920263 agagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattagaaaagaatgtagga 16920362  T
Q  115 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 214  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16920363 taagattgtacctggaattaaacttatggaattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgactt 16920462  T
Q  215 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16920463 gttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaa 16920562  T
Q  315 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattat 414  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |    
T  16920563 taagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatact 16920662  T
Q  415 tatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920663 tatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22831994 - 22831503
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  22831994 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtttgaacatgtctaatattgattagtgaagaatatagg 22831895  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22831894 acgagattgaacctggaattaaactgatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgact 22831795  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  22831794 tgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctga 22831695  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaaattgatat 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22831694 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatat 22831595  T
Q  412 tattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831594 gattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 503
Target Start/End: Original strand, 20637915 - 20638404
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637915 agagcatccaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 20638014  T
Q  117 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20638015 agattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgt 20638114  T
Q  217 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 316  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20638115 tagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 20638214  T
Q  317 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 415  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20638215 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattatt 20638314  T
Q  416 atgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638315 atgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 26 - 503
Target Start/End: Original strand, 20360601 - 20361081
Alignment:
Q  26 aagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360601 aagatttcgtgtttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 20360700  T
Q  126 ctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttg 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20360701 ctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttg 20360800  T
Q  226 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 325  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20360801 cgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgtt 20360900  T
Q  326 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  20360901 gttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 20361000  T
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361001 tgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 11185994 - 11185517
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||    
T  11185994 cagagagcatgtaagatttcgtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtcgaatattgattagtgaagagtgtagg 11185895  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11185894 acgagattgaacctggaattaaacttatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgact 11185795  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||| ||     
T  11185794 tgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatga 11185695  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  11185694 ataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataa 11185595  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185594 ttatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 22779845 - 22780348
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22779845 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22779944  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22779945 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaa 22780044  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||| || | |||||| ||||||    
T  22780045 acagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatc 22780144  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  22780145 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 22780244  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22780245 caattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 22780343  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  22780344 gatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 19303159 - 19303661
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19303159 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 19303258  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19303259 atgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaa 19303358  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| | | ||| ||||| || | |||||||||||||    
T  19303359 cagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatc 19303458  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  19303459 tgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgactt 19303557  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
    | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19303558 gcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgat 19303656  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  19303657 gatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29061015 - 29060540
Alignment:
Q  42 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta------- 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |           
T  29061015 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtaga 29060916  T
Q  135 ---aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacc 230  Q
       ||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29060915 atgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacc 29060816  T
Q  231 tttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga 330  Q
    |||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||     
T  29060815 tttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt 29060716  T
Q  331 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--- 426  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||       
T  29060715 tgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 29060616  T
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29060615 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 17287414 - 17287917
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287414 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 17287513  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||| ||||| ||||||||           | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  17287514 atgtgattgtacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaa 17287613  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |    
T  17287614 acagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacc 17287713  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  17287714 tgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 17287813  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  17287814 caattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17287912  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  17287913 gatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 502
Target Start/End: Original strand, 18409445 - 18409947
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18409445 cagagagcatgcaggatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtaga 18409544  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18409545 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaa 18409644  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||     
T  18409645 cagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataata 18409744  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||||||| ||| |||    
T  18409745 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttg 18409844  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18409845 catttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18409943  T
Q  499 gatg 502  Q
    ||||    
T  18409944 gatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 38 - 280
Target Start/End: Original strand, 18821472 - 18821714
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18821472 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 18821571  T
Q  138 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821572 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 18821671  T
Q  238 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactt 280  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18821672 cacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20594276 - 20593773
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20594276 cagagagcttgcaagatttcgtgatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtctaaatatgattagggaagaatgtagg 20594177  T
Q  114 atgagattgaacctggaat----------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||           ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20594176 atgagattgaacctggaaagattgtagaataaacttttggaaatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 20594077  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  20594076 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatc 20593977  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| |||    
T  20593976 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttg 20593877  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20593876 catttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgat 20593778  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  20593777 gatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 38 - 503
Target Start/End: Original strand, 25628997 - 25629476
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | || || |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||       
T  25628997 ttttgactttttagttgaaccttagatgttgttaagcgcctaaacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattgaacctggaaatattt 25629096  T
Q  135 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 226  Q
           ||||| || |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25629097 tagaataaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 25629196  T
Q  227 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 326  Q
    ||| |||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25629197 gacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 25629296  T
Q  327 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 425  Q
     || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| |    
T  25629297 atgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgct 25629396  T
Q  426 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||   ||||||||| | |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25629397 gttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 331 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1561806 - 1561689
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1561806 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtaga 1561707  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1561706 atgagattgaacctggaa 1561689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 28496091 - 28496280
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28496091 cagagagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaga 28496190  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496191 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 29808501 - 29808691
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29808501 cagagagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaga 29808600  T
Q  114 atgagattgaacctg------------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||||            |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808601 atgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21939886 - 21939699
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21939886 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtagg 21939787  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| ||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21939786 atgagattgagcctggaaagacttagaataaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 353 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496244
Alignment:
Q  353 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 449  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 16496297  T
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496296 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 15894049 - 15894237
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  15894049 agagagcatgcaagatttcgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaaga 15894148  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||| ||||||||    |||         ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15894149 tgagattggacctggaaagacttagaatgaaagaact--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18457193 - 18457029
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 134  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  18457193 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatta 18457094  T
Q  135 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
          ||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18457093 agaatgaactttttggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 18457029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 4667831 - 4667948
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4667831 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4667930  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4667931 gtgagattggacctggaa 4667948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 4674678 - 4674795
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4674678 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4674777  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4674778 gtgagattggacctggaa 4674795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 22334500 - 22334617
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  22334500 cagagagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 22334599  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22334600 atgagattggacctggaa 22334617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 31155016 - 31155133
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  31155016 cagagagcatgcaagattctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtaga 31155115  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31155116 atgagattgaacctggaa 31155133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 4185441 - 4185558
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  4185441 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtaga 4185540  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
     |||||||||||||||||    
T  4185541 gtgagattgaacctggaa 4185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4189459 - 4189342
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4189459 cagagagcatgcaagattctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4189360  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4189359 gtgagattggacctggaa 4189342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 25611347 - 25611530
Alignment:
Q  20 gcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaga 119  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  25611347 gcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcagcatgaga 25611446  T
Q  120 ttgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||| ||||||||    |||         ||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25611447 ttggacctggaaagacttagaatgaaacaact--taggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgag 25611530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19652685 - 19652581
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19652685 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacc 19652586  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  19652585 tggaa 19652581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 476
Target Start/End: Original strand, 25603003 - 25603478
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |    
T  25603003 cagagagcatgcaagatttcgtgattttaacttttgagttgaacctgaaacgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcatg 25603102  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 200  Q
    ||||||||| ||||||||    |||         ||||  | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |      
T  25603103 atgagattggacctggaaagacttagaatgaaacaact--taggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtcta 25603200  T
Q  201 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataa 300  Q
     |||||||||  |||| ||   |||||| || ||| ||   |||||   ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  | ||| | || ||    
T  25603201 gaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaa 25603300  T
Q  301 tctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 399  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||   ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||  |  ||| |||  | |||||| | |||||    
T  25603301 tctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaat 25603399  T
Q  400 tgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 476  Q
    |  || ||||||| |||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  25603400 tataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctg-ttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 339 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  339 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatact 435  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22439302 - 22439230
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22439302 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22439230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23019896 - 23019792
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  23019896 gatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagattttagattgagattgaacct 23019797  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  23019796 ggaat 23019792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Original strand, 31164473 - 31164589
Alignment:
Q  11 gagcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31164473 gagcagagagcatgcaagattttgcaattttgacatttgagttgatacttggatgtccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgt 31164572  T
Q  111 aggatgagattgaacct 127  Q
    |||||||||||| ||||    
T  31164573 aggatgagattggacct 31164589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109157
Alignment:
Q  358 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 455  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  456 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22432752 - 22432667
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||    
T  22432752 cagagagcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtatattaaagatta 22432667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 27332926 - 27333019
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  27332926 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaa 27333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 27393666 - 27393759
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  27393666 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaa 27393759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19863480 - 19863395
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  19863480 cagagagcatgtaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 19863395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  484 gatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 25641802 - 25641887
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  25641802 cagagagcatgtaagattttgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 25641887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22331917 - 22331803
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22331917 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 22331818  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  22331817 gacaagattgaacct 22331803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 450
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 427  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  428 tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 192
Target Start/End: Original strand, 22080391 - 22080543
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tta------aactt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  | |||||||||||||||    |||      |||||    
T  22080391 agttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaactt 22080490  T
Q  140 gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     ||||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080491 atgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656629
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1561401 - 1561303
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561401 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  358 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 454  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  455 aattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 21834528 - 21834595
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21834528 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattag 21834595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  483 ag 484  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  438 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 3708111 - 3708211
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    || | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3708111 gcagagagcatgtaggattttgtatttttgactttttagttggaccttgagcgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 3708210  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  3708211 g 3708211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14099104 - 14099004
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14099104 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14099005  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  14099004 g 14099004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19663221 - 19663065
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  |      
T  19663221 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaacaacc 19663122  T
Q  137 cttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     ||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19663121 tttgttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctatcgcctcgcgag 19663065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22782323 - 22782227
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782323 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 25956253 - 25956357
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  25956253 gatttcgtaattttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacct 25956352  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  25956353 ggaat 25956357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 502
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 8227534 - 8227632
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227534 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12496761 - 12496605
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||  ||    
T  12496761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacctttaggtgcctattattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa-caa 12496664  T
Q  136 actt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12496663 ccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12496605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 34295696 - 34295810
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| || |||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  34295696 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgaatttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtag 34295795  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  34295796 gacaagattgaacct 34295810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Original strand, 15041184 - 15041285
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||   | ||  ||| |||||||||||||||    
T  15041184 attttgtaattttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataaaggttagatgataacttagaatgagattgaacctg 15041283  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  15041284 ga 15041285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34833132 - 34833031
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34833132 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 34833033  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  34833032 ga 34833031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25644811 - 25644711
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  25644811 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttcatgtataacgttgattaggaaagattttagattgagattgaacct 25644712  T
Q  128 g 128  Q
    |    
T  25644711 g 25644711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 27415572 - 27415632
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27415572 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27415632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 16523041 - 16523108
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||| ||||||    
T  16523041 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattag 16523108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20109704 - 20109605
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  20109704 gattttgtagttttgatccttaagttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 20109605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Original strand, 21739664 - 21739727
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21739664 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattag 21739727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18180965 - 18180903
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18180965 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 18180903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456732
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 457 - 503
Target Start/End: Original strand, 22080800 - 22080846
Alignment:
Q  457 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080800 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 22429683 - 22429839
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  22429683 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 22429781  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22429782 cttagctgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22429839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 441 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 1538573 - 1538686
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  1538573 gcagagagcatgttagattttctgttttcaactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 1538672  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  1538673 gatcagattgaacc 1538686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 1544672 - 1544785
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  1544672 gcagagagcatgttagattttctgttttcaactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 1544771  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  1544772 gatcagattgaacc 1544785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 480
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  390 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 480  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432249
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438799
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 25594981 - 25595090
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||   |||  |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | | ||||||    
T  25594981 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtag 25595080  T
Q  113 gatgagattg 122  Q
    || |||||||    
T  25595081 gacgagattg 25595090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 34369602 - 34369715
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34369602 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgtcattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 34369701  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  34369702 gacaagattgaacc 34369715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 15685718 - 15685837
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| | || || |||| ||||||||||||    ||||||||||| | || | |||    
T  15685718 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttgggtgtttgtgagggcctgaacatgtaccttaatgattaggcatgattttag 15685817  T
Q  113 gatgagattgaacctggaat 132  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  15685818 aatgagattgaacttggaat 15685837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 22334648 - 22334699
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22334648 tgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgag 22334699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 22405709 - 22405748
Alignment:
Q  39 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22405709 tttgacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgcct 22405748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 25641940 - 25641991
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25641940 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1645158 - 1645002
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  1645158 tttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 1645060  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1645059 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgag 1645002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 2684994 - 2685088
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  2684994 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 2685088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16372326 - 16372223
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||          |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16372326 gcagagagcatgtaagattttgtaatttcgactttttagttggacctt----------gagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtag 16372237  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  16372236 gacaagattgaacc 16372223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17804650 - 17804494
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  17804650 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 17804552  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17804551 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17804494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 487
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19809004 - 19808890
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  ||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19809004 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctggacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 19808905  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  || ||||||||    
T  19808904 gacaagtttgaacct 19808890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 72
Target Start/End: Original strand, 20907631 - 20907669
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttga 72  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20907631 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttga 20907669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 23276907 - 23277008
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaacctt-agatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 111  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| || | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||    
T  23276907 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagct-cctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgta 23277005  T
Q  112 gga 114  Q
    |||    
T  23277006 gga 23277008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 1587384 - 1587421
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1587384 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1587421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 4185588 - 4185629
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4185588 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 4667978 - 4668019
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4667978 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 5616467 - 5616504
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5616467 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 5616504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12596461 - 12596388
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  12596461 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttatgagggcctgaacatgt 12596388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12707141 - 12707104
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12707141 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12707104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 497
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448686
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16741660 - 16741623
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16741660 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16741623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 20803205 - 20803242
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20803205 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21702740 - 21702703
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21702740 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21702703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 25766821 - 25766858
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25766821 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25766858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Original strand, 29096138 - 29096179
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 70  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29096138 attttgtaattttgacttctgagttgaaccttagatgctttt 29096179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14472747 - 14472647
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14472747 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14472648  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  14472647 g 14472647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 19790429 - 19790469
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19790429 gtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 19790469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19871068 - 19870980
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  19871068 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 19870980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 20556958 - 20557054
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556958 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 23657070 - 23657110
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657070 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagt 23657110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 27333049 - 27333089
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27333049 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 27393789 - 27393829
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27393789 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 27567255 - 27567299
Alignment:
Q  30 ttttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27567255 ttttgtattttggacgtttgagttgaaccttatatgcttttgagt 27567299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8244193 - 8244158
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8244193 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8244158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11567195 - 11567160
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11567195 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 81
Target Start/End: Original strand, 16964957 - 16964996
Alignment:
Q  42 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16964957 gacttttgagttgaaccttagatggctttgagtgcctgaa 16964996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  437 cctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19652551 - 19652512
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 190  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19652551 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19870923 - 19870888
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19870923 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19870888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22759326 - 22759227
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||   ||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||| | ||||||||||    
T  22759326 agagagcatgttagattttgtattttcgactttttagtttgaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtattgattagggatgaatgtagga 22759227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22863278 - 22863243
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22863278 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22863243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23395401 - 23395366
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23395401 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23395366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 9481946 - 9482040
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  9481946 tttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa 9482040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 114
Target Start/End: Original strand, 17036987 - 17037065
Alignment:
Q  36 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  17036987 atttttgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 17037065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453197
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcataagtcggtctaagatgt 18453197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 22592457 - 22592613
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| |||||||||||  |  || ||| | ||||||| ||||||||  ||     
T  22592457 tttttgacatttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattaggggatgatttagaacgagattgtacctggaa-caac 22592555  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||  |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22592556 cttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22592613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 30694784 - 30694738
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  30694784 ttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 30694738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  390 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 480  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11567340 - 11567279
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11567340 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11567279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 12618473 - 12618534
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12618473 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12618534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16102847 - 16102774
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  16102847 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 16102774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 192
Target Start/End: Original strand, 16924642 - 16924687
Alignment:
Q  147 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16924642 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16924687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 192
Target Start/End: Original strand, 16929357 - 16929402
Alignment:
Q  147 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16929357 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18907590 - 18907549
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18907590 tgtattttttacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 18907549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 19873196 - 19873120
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873196 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 81
Target Start/End: Original strand, 22059396 - 22059429
Alignment:
Q  48 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22059396 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22059429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22863423 - 22863362
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22863423 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22863362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23395546 - 23395485
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23395546 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23395485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23990398 - 23990337
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23990398 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23990337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Original strand, 24314739 - 24314808
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24314739 ctttttagttggaccttgaatgctttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 24314808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 25135325 - 25135362
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25135325 tttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagt 25135362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Original strand, 27327722 - 27327787
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27327722 agttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27327787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Original strand, 27388462 - 27388527
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27388462 agttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27388527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 31155163 - 31155204
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155163 acctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 31155204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 100
Target Start/End: Original strand, 9098081 - 9098153
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  9098081 gattttgtagttttgacccttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacagatataataatgattag 9098153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 14059283 - 14059347
Alignment:
Q  51 gttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||||||||  || | |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14059283 gttgaaccttgtatacctttgagtgcccgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14059347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18697031 - 18696979
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgctttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18697031 agttgaactttagatgatttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 18696979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 18916911 - 18916983
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  18916911 attttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 18916983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668688
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 19668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 23657189 - 23657229
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657189 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23657229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33443584 - 33443532
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 106  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  33443584 gaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaaga 33443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 678 - 1169
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  678 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 777  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  778 atgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 877  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  878 tgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgt 977  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
     |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  978 ttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 1077  T
Q  414 ttatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1078 ttatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 167608 - 168099
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  167608 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 167707  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167708 atgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 167807  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  167808 tgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgt 167907  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
     |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  167908 ttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168007  T
Q  414 ttatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168008 ttatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 52415 - 51913
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52415 cagagagcatgcaagattttttgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 52316  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52315 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 52216  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  52215 actgagtgtcttgttaggttttgcgacc-ttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 52117  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  52116 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 52017  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  52016 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 51918  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  51917 gatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38256
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatg 38256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 140)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 38801020 - 38801508
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801020 cagagagcatgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 38801119  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38801120 atgtgattgaacctggaattgaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 38801219  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||     
T  38801220 tgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctga 38801319  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  38801320 ataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataa 38801419  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801420 ttatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 27250358 - 27250850
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250358 cagagagcatgcaagatttcgtaatattgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 27250457  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  27250458 atgggattgaacctggaatgaaacctgtgggattctgacctgaactcgccacgtcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtccct 27250557  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27250558 tgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 27250657  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27250658 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 27250757  T
Q  413 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27250758 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21027172 - 21026680
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21027172 cagagagcatgcaagaatttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 21027073  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21027072 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctaaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgact 21026973  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21026972 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 21026873  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  21026872 ttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatata 21026773  T
Q  413 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     ||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026772 tttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 502
Target Start/End: Original strand, 50209832 - 50210333
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50209832 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatc-ttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 50209930  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50209931 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 50210030  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  50210031 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 50210130  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||    
T  50210131 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg 50210230  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50210231 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 50210329  T
Q  499 gatg 502  Q
    ||||    
T  50210330 gatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 428
Target Start/End: Original strand, 22354190 - 22354616
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  22354190 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtagg 22354289  T
Q  114 atgagattgaacctgga-----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||||||           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22354290 atgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaa 22354389  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22354390 acagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 22354489  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22354490 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 22354589  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgtt 428  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22354590 caattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 394
Target Start/End: Original strand, 22355803 - 22356185
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355803 cagagaacatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22355902  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac- 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22355903 atgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 22356001  T
Q  213 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  22356002 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22356101  T
Q  313 tataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 394  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22356102 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 394
Target Start/End: Original strand, 22357489 - 22357871
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357489 cagagaacatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22357588  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac- 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22357589 atgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 22357687  T
Q  213 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  22357688 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22357787  T
Q  313 tataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 394  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22357788 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34510283 - 34509783
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34510283 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 34510184  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34510183 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaa 34510084  T
Q  204 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  34510083 cagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 34509984  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| |||    
T  34509983 tttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttg 34509884  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34509883 catttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 34509785  T
Q  499 ga 500  Q
    ||    
T  34509784 ga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22532772 - 22532269
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532772 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22532673  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22532672 atgagattgaacctggaaggattgtagaatgaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaa 22532573  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||| |||| | |    
T  22532572 cagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaac 22532473  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   || |||  |||||||||| |||||||    
T  22532472 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattg 22532373  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     ||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  22532372 caatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 22532274  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  22532273 gatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Original strand, 20846848 - 20847147
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20846848 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 20846947  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20846948 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 20847047  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||  ||||||| |||||||||    
T  20847048 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgt 20847147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20135690 - 20135188
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135690 cagagagcatgcaatattttgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20135591  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  20135590 atgagattggacctggaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaa 20135492  T
Q  203 acagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| | |||||| | |||||| |||| ||   ||||||||||||    
T  20135491 acagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataat 20135392  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20135391 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaatt 20135292  T
Q  401 gaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | |  |||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||  |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||     
T  20135291 gcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgt 20135193  T
Q  498 tgatg 502  Q
    |||||    
T  20135192 tgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 433509 - 433012
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  433509 agagagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaa 433410  T
Q  115 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||           |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  433409 tgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttg 433311  T
Q  204 cagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataa 300  Q
    || | || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||  |||||  ||||| || |    
T  433310 caaaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaata-ttataaataatattaatgatga 433213  T
Q  301 tctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    ||||| |||||| | || |||   ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| |||     
T  433212 tctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgac 433113  T
Q  399 ttgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 495  Q
    ||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  433112 ttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 433017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20919104 - 20918917
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20919104 cagagagcatgcaagattttataattttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 20919005  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||          ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20919004 atgagattgaacctgaaaagacttagaatttaaatttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 20091092 - 20091281
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  20091092 cagagagcatgcaagatttcttatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 20091191  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgt-gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||| |||||          |||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  20091192 atgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacaacttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21162231 - 21162117
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  21162231 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtaga 21162132  T
Q  114 atgagattgaacctg 128  Q
    |||||||||||||||    
T  21162131 atgagattgaacctg 21162117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21754525 - 21754423
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  21754525 agatttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacc 21754426  T
Q  127 tgg 129  Q
    |||    
T  21754425 tgg 21754423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 103
Target Start/End: Original strand, 21301157 - 21301245
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21301157 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 21301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 52927612 - 52927716
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  52927612 agatttcgtaattttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacc 52927711  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  52927712 tggaa 52927716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33681499 - 33681301
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33681499 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 33681400  T
Q  127 tggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg 215  Q
    |||||     |||     || || || || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
T  33681399 tggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 22921499 - 22921603
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||     
T  22921499 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacca 22921598  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  22921599 ggaat 22921603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20248756 - 20248664
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 130  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20248756 ttttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctgga 20248664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 502
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  292 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  391 ttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  488 ttgaagatgatgatg 502  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22238117 - 22238015
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  22238117 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctg 22238018  T
Q  129 gaa 131  Q
    |||    
T  22238017 gaa 22238015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 386 - 487
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  484 gatg 487  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 409 - 503
Target Start/End: Original strand, 45574912 - 45575008
Alignment:
Q  409 tattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 487
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  484 gatg 487  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43697849 - 43697745
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  43697849 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacct 43697750  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  43697749 ggaat 43697745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 18181755 - 18181826
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  18181755 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattag 18181826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 427  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  428 tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  290 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 22468315 - 22468400
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  22468315 cagagagcatgtaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 22468400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 487
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261183
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23763688 - 23763574
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23763688 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23763589  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  23763588 gacaagattgaacct 23763574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918623
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 28194080 - 28194180
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28194080 gattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacct 28194179  T
Q  128 g 128  Q
    |    
T  28194180 g 28194180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21754145 - 21754064
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754145 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  484 gatgttgaagatgatgatgt 503  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 35981319 - 35981419
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  35981319 gattttgtagttttgacctttaagtcgaacctt-gatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacct 35981417  T
Q  128 gg 129  Q
    ||    
T  35981418 gg 35981419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 42864830 - 42864915
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||||||||    
T  42864830 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgatta 42864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 22831016 - 22831083
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22831016 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22831083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 20524848 - 20524958
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    |||||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  20524848 agagcatgtaagatttttcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaca 20524947  T
Q  117 agattgaacct 127  Q
    |||||||||||    
T  20524948 agattgaacct 20524958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21438271 - 21438157
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||  |  || ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21438271 gcagagagcatgtaagattttacaaattagactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 21438172  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  21438171 gacaagattgaacct 21438157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 21787680 - 21787746
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  21787680 tgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagatta 21787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Original strand, 22432426 - 22432488
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22432426 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22432488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19063997 - 19063884
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19063997 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcaactctttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 19063898  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  19063897 gacaagattgaacc 19063884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19111887 - 19111774
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19111887 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcaactctttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 19111788  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  19111787 gacaagattgaacc 19111774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21342637 - 21342564
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21342637 gattttgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21342564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21347502 - 21347429
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21347502 gattttgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21347429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21715036 - 21714983
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21715036 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21714983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21829191 - 21829078
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21829191 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21829092  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  21829091 gatcagattgaacc 21829078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21844704 - 21844591
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21844704 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21844605  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  21844604 gatcagattgaacc 21844591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 21895864 - 21895965
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||| | ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||    
T  21895864 gattttgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacct 21895963  T
Q  128 gg 129  Q
    ||    
T  21895964 gg 21895965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 8761252 - 8761316
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||||   ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761252 cagagagcatgttggatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 8761316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16759215 - 16759115
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  16759215 gattttgtagttttgacccttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacacgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 16759116  T
Q  128 g 128  Q
    |    
T  16759115 g 16759115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 434 - 502
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 22123133 - 22123214
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123133 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 76
Target Start/End: Original strand, 3472560 - 3472607
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 76  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472560 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 3472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 13212928 - 13213027
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |  || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  13212928 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 506
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  408 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtc 504  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtc 15860175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 485
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 485  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 74
Target Start/End: Original strand, 45489394 - 45489433
Alignment:
Q  35 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45489394 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45489433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6152336 - 6152270
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  6152336 tgtatttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 6152270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12647322 - 12647166
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | |||||||||| |||||  ||     
T  12647322 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacttggaa-caac 12647224  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12647223 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12647166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18882820 - 18882664
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  18882820 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 18882722  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18882721 cttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 18882664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21342192 - 21342090
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  21342192 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 21342095  T
Q  502 gtcca 506  Q
    |||||    
T  21342094 gtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21754392 - 21754350
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754392 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19105230 - 19105117
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||| ||||| |||||   ||  ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19105230 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcaactttttagttggaccttgagtgactttgagtgcctaaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 19105131  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  19105130 gacaagattgaacc 19105117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 21861126 - 21861227
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||| | ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  21861126 gattttgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 21861225  T
Q  128 gg 129  Q
    ||    
T  21861226 gg 21861227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 23818952 - 23818989
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23818952 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 23818989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 50887381 - 50887482
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  50887381 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 50887480  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  50887481 ga 50887482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    |  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21023119 - 21023075
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21023119 tgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcc 21023075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21347057 - 21346961
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347057 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19212320 - 19212226
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  19212320 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa 19212226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21615890 - 21615796
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21615890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-agaatgagattgaacctggaa 21615796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Original strand, 24782753 - 24782816
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| || ||||||||||    
T  24782753 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattag 24782816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26065461 - 26065382
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  26065461 agttgaactttagatgatcctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 26065382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Original strand, 41049626 - 41049701
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  41049626 gaaccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtataataatggttaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 41049701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1011169 - 1011087
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1011169 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 1011087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 500
Target Start/End: Original strand, 16275428 - 16275526
Alignment:
Q  403 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16275428 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 18393613 - 18393679
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  18393613 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 18393679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20138536 - 20138380
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||   |  || ||| |||||||||||||  |||  ||     
T  20138536 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacccagaa-caac 20138438  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20138437 cttagttgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Original strand, 35260713 - 35260787
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  35260713 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 35260787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 45310016 - 45310082
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  45310016 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 45310082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46975920 - 46975764
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  46975920 ttttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacttttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 46975822  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46975821 cttagttgggattctttcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 46975764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21162121 - 21162080
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21162121 acctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21305767 - 21305730
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21305767 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21305730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714546
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 22899869 - 22899942
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  22899869 gcagagagcttgcaagattttgtgtttttgagctgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgt 22899942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 33797986 - 33797949
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33797986 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33797949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Original strand, 16367873 - 16367945
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  16367873 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctggaa 16367945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Original strand, 17678245 - 17678277
Alignment:
Q  42 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17678245 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17678277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20637339 - 20637235
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  20637339 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgttttttgagtgcctagacttgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 20637240  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  20637239 ggaat 20637235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 488
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533978
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgtt-gtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 16375231 - 16375266
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16375231 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16375266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21407688 - 21407653
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21407688 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52639874 - 52639839
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639874 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 52639839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16381698 - 16381652
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 105  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  16381698 ttagatggttttgagtgcctggacatgtataagaatgattaggaaag 16381652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 74
Target Start/End: Original strand, 33049739 - 33049777
Alignment:
Q  36 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33049739 attttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 33049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Original strand, 52940464 - 52940506
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52940464 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataataattagg 52940506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 3704739 - 3704776
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3704739 ttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 3704776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 16375086 - 16375147
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16375086 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16375147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 20228462 - 20228499
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20228462 tttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagt 20228499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20248633 - 20248592
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20248633 acctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20631820 - 20631747
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  20631820 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 20631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21407833 - 21407772
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21407833 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21407772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 191
Target Start/End: Original strand, 22921631 - 22921672
Alignment:
Q  150 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22921631 gacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22921672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065254
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 28194213 - 28194254
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  28194213 acctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 28194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 35981451 - 35981492
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  35981451 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 35981492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36182079 - 36182006
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  36182079 gcagagagcttgcaagattctgtgtttttgagctgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 36182006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 36818961 - 36818998
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36818961 tttttgacttttgagttgaaccttaaatgcctttgagt 36818998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 52640019 - 52639958
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52640019 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 52639958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 191
Target Start/End: Original strand, 52927745 - 52927786
Alignment:
Q  150 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  52927745 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 52927786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Original strand, 16093479 - 16093551
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16093479 ttagatggttttgagtgcctggatatgtataataatgatttggcaagtttttagattgagattgaacctggaa 16093551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 45310135 - 45310175
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45310135 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45310175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4712
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5204 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 5105  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  5104 atgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgact 5005  T
Q  214 tgttaga-ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  5004 tgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttg 4905  T
Q  313 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  4904 tataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgta 4805  T
Q  413 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
     ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4804 tttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 13
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  428 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 329  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  328 atgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgact 229  T
Q  214 tgttaga-ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  228 tgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttg 129  T
Q  313 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  128 tataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgta 29  T
Q  413 attatgtcatgttgtt 428  Q
     |||||||||| ||||    
T  28 tttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2444 - 1952
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2444 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataataattaggaaggaatgtagg 2345  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2344 atgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 2245  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  2244 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgt 2145  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  2144 atatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatc 2045  T
Q  413 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2044 attatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 52067 - 51582
Alignment:
Q  18 gagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 117  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52067 gagcttgcaagatttcgtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacga 51968  T
Q  118 gattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51967 gattgaacctggaatgaaacttacgggattctaacctgagctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 51868  T
Q  218 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 317  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51867 agattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataa 51768  T
Q  318 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 417  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  51767 gatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattat 51668  T
Q  418 gtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51667 gtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Original strand, 108984 - 109055
Alignment:
Q  44 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 115  Q
    ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  108984 cttttaagttgaaccttgtatacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 109055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1778 - 1289
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||    
T  1778 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtagg 1679  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1678 acgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 1579  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||     
T  1578 tgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctga 1479  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1478 ataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 1379  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1378 ttatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7755 - 7266
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||    
T  7755 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtagg 7656  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7655 acgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 7556  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||     
T  7555 tgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctga 7456  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  7455 ataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 7356  T
Q  414 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7355 ttatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16150 - 16083
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16150 cagagagcatccaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcctgaa 16083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 500
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13703 - 13211
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13703 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 13604  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  13603 atgagactgaacctggaatgaaacttgtggcattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgcct 13504  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  13503 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgt 13404  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13403 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 13304  T
Q  413 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13303 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9717
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | |   || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  9873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatggatttatttagaacgagattgaacctggaa-caac 9775  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9774 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 9717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 14 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7102 - 6669
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7102 cagagagcacgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataattattaggaaggaatgtagg 7003  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7002 atgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgaca 6903  T
Q  214 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6902 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgt 6803  T
Q  314 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 412  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||     
T  6802 atatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatc 6703  T
Q  413 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgt 443  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6702 attatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5339 - 4849
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5339 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 5240  T
Q  115 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5239 tgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgactt 5140  T
Q  215 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||| ||| | ||||||||||| |   |||||  ||||||||||||||||||     
T  5139 gttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtt 5041  T
Q  315 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  5040 taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatatta 4941  T
Q  414 ttatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4940 ttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 3973 - 3470
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3973 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3874  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3873 atgagattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaa 3774  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  3773 acagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 3674  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  3673 tatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 3574  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3573 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3475  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  3474 gatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 343
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||          
T  821 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagaatt 722  T
Q  132 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 225  Q
         | |||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  721 tagaatgaaacttttggaat-ctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttg 623  T
Q  226 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 325  Q
    | |||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||    
T  622 caacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgtt 523  T
Q  326 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg- 423  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||     
T  522 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgc 423  T
Q  424 -ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
      | ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  422 tattttgtatactgcctatgttattg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2353 - 1851
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2353 agagagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 2254  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  2253 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaa 2154  T
Q  204 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  2153 cagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 2054  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  2053 gtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 1954  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1953 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  1854 atgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 207160 - 207324
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg-------- 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||            
T  207160 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagact 207259  T
Q  129 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
      |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  207260 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Original strand, 119205 - 119255
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  119205 agttgaacattagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 119255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 5739 - 6245
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5739 cagagagcatgcaagatttcgtgttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagg 5838  T
Q  114 atgagattgaacctgg-----------aattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||           ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5839 atgagattgaacctgggaagattattgaatgaaatttgcgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaa 5938  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||      
T  5939 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaa 6038  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
     |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T
Q  497 atgatgt 503  Q
    |||||||    
T  6239 atgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21392 - 20910
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21392 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagga 21293  T
Q  115 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 214  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21292 tgagattgtacctggaatgaaacttgt----------cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgactt 21203  T
Q  215 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 314  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||     
T  21202 gttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtt 21103  T
Q  315 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 413  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21102 taagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatatta 21003  T
Q  414 ttatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21002 ttatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 484
Target Start/End: Original strand, 23921 - 24405
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23921 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagga 24020  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    |||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24021 tgagattgaacctggaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaac 24120  T
Q  205 agagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctg 304  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||| | |  | |||||||||||||||    
T  24121 aaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctg 24220  T
Q  305 tgaagctgtataagatatgttgttgatg-attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  24221 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 24320  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24321 aattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 64306 - 64150
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  ||  || || |||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||  ||     
T  64306 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcgtactattgattagggaaggatttagaacgagattgaaactggaa-caac 64208  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  64207 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 64150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 34529 - 34593
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34529 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 34593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 76190 - 76034
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  76190 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaactttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa-caac 76092  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   | ||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  76091 cttagttaggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 76034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 41191 - 41236
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41191 tgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcct 41236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39262 - 38761
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39262 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 39163  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39162 atgagattgaacctggaaagattttgaatgaaacttgtgg-attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 39064  T
Q  204 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39063 catagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 38964  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| | | |||    
T  38963 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttg 38864  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  38863 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  38764 atgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  294 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  393 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 490  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  491 aagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  502 gtcc 505  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 9)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 125085 - 124675
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125085 cagagagcatgcaagatttggtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 124986  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||   ||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124985 atgag---gaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 124889  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  124888 aaagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatc 124789  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||    
T  124788 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattg 124689  T
Q  402 aaattgatattatt 415  Q
     |||||||||||||    
T  124688 caattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 386 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 485  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  486 tgttgaagatgatgatg 502  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 63039 - 62947
Alignment:
Q  39 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  63039 tttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 62947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 175267 - 175202
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  175267 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 427 - 487
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 427 - 487
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136173
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 136173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Original strand, 144840 - 144881
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 502
Target Start/End: Original strand, 16833 - 17337
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16833 cagagagcatgcaagatttcttgtttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16932  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 17032  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  17033 cagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatc 17132  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||    
T  17133 tgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg 17232  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatg-----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
     | |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17233 catttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17331  T
Q  497 atgatg 502  Q
    ||||||    
T  17332 atgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 78980 - 79096
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  78980 cagagagcatgcaagattttgtaattctgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtaga 79079  T
Q  114 atgagattgaacctgga 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  79080 atgagattgaacctgga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 13696 - 13760
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13696 cagagagcatgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcct 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 487
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13594 - 13141
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13594 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagga 13495  T
Q  115 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||| |||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13494 tgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 13395  T
Q  204 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | ||||||||||||||    
T  13394 ctgagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatct 13295  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||     
T  13294 gtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgc 13195  T
Q  403 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 453  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13194 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34623 - 34437
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34623 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 34524  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 191  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34523 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34123
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34221 gatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 8978 - 8479
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8978 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtagg 8879  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||| |||  |           |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8878 atgagattgaacctagaaagattgtaaaatggaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaa 8779  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||    
T  8778 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatc 8679  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||    ||||| | | |||||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||| |||    
T  8678 tgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttg 8583  T
Q  402 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8582 caattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgct-attgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1387 - 1052
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1387 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 1288  T
Q  133 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 232  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  1287 gaaacttgtgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctt 1188  T
Q  233 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 332  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||    
T  1187 tgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttg 1088  T
Q  333 attatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 367  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1087 attatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 496
Target Start/End: Original strand, 25684 - 26179
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25684 agagagcttgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 25783  T
Q  115 tgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    |||||||||||||| ||  |          || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25784 tgagattgaacctgaaaagattgtagaatgaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 25883  T
Q  205 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25884 agagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatct 25983  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
     ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | ||| |||| ||||||      
T  25984 atgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattac 26083  T
Q  403 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    | |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26084 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 33112 - 33461
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112 cagagagcttgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctggacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 33211  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33212 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaa 33311  T
Q  203 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| || |||    ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||     
T  33312 acagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataac 33411  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg 351  Q
    || ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33412 ctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  483 agatgttgaagatgatga 500  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 503
Target Start/End: Original strand, 8154 - 8650
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 8252  T
Q  117 agattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 205  Q
    |||||||||||||||           | |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8253 agattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 8352  T
Q  206 gagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttggg-taggattaagacttaataataaggttaattataatctg 304  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||  | ||| ||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||||    
T  8353 gagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctg 8452  T
Q  305 tgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 403  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |    
T  8453 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgca 8552  T
Q  404 attgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8553 attgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgc----tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 8648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3954 - 3640
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3954 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 3855  T
Q  133 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  3854 gaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctt 3755  T
Q  233 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 332  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  3754 tgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttg 3655  T
Q  333 attatgatgtgatat 347  Q
    |||||||||||||||    
T  3654 attatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8018 - 7704
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8018 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 7919  T
Q  133 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  7918 gaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctt 7819  T
Q  233 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 332  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  7818 tgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttg 7719  T
Q  333 attatgatgtgatat 347  Q
    |||||||||||||||    
T  7718 attatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 27274 - 27375
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||||| || |||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  27274 gattttttagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacct 27373  T
Q  128 gg 129  Q
    ||    
T  27374 gg 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27851
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 40414 - 39913
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  40414 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtagg 40315  T
Q  114 atgagattgaacctg---gaat------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
    |||||||||||||||   || |      | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40314 atgagattgaacctgacagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 40215  T
Q  205 agagtgacttgttagat-tttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
    |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  40214 agagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatct 40115  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||||||  |||  ||     
T  40114 gtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgc 40015  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  40014 atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 39916  T
Q  501 tgt 503  Q
    |||    
T  39915 tgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Original strand, 18297 - 18360
Alignment:
Q  36 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18297 attttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 18413 - 18464
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18413 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 500
Target Start/End: Original strand, 339569 - 340065
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  339569 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaatttgtctaataatgattaggaatgaatgtagg 339668  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339669 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 339768  T
Q  204 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 303  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  339769 tagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatct 339868  T
Q  304 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 402  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||     
T  339869 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg- 339967  T
Q  403 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  339968 atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 427  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  428 tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 71789 - 71729
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  71789 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 71729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 140163 - 140126
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  140163 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 140126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 7)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 40359 - 39858
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40359 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggagg 40260  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40259 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggt-ttctaacctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaa 40161  T
Q  203 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||    
T  40160 accgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaa-ccttgggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataat 40062  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
     ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||| | | ||    
T  40061 ttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttactt 39962  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 498  Q
    | | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  39961 gcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 39863  T
Q  499 gatgt 503  Q
    |||||    
T  39862 gatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  189 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataata 287  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |      
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  288 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
     || ||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 39549 - 39666
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39549 cagagagcatgccagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtaga 39648  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39649 atgagattgaacctggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 128
Target Start/End: Original strand, 59179 - 59235
Alignment:
Q  72 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  59179 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctg 59235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26662 - 26611
Alignment:
Q  80 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26662 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattaaacctggaa 26611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59308
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26589 - 26555
Alignment:
Q  143 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26589 ggattctgacctgaagtcgccacggcgagcagagg 26555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11440
Alignment:
Q  42 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgt 11269  T
Q  142 gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctca 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11270 gggatactgacctgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacg 11369  T
Q  242 agttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 312  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11370 agttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctg 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  388 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14106 - 14055
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14106 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23370 - 22886
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23370 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggatctg 23271  T
Q  129 gaat-----taaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta 218  Q
    |||      || | |||     ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23270 gaaagattgtagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgtta 23171  T
Q  219 gatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 317  Q
    | |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23170 ggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaa 23071  T
Q  318 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatta 416  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  23070 gatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattatta 22971  T
Q  417 tgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22970 tgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20906 - 20596
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20906 cagagagcatgtaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20807  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20806 atgagattgaacctggaaagattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaa 20707  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  20706 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatc 20607  T
Q  303 tgtgaagctgt 313  Q
    |||||||||||    
T  20606 tgtgaagctgt 20596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 503
Target Start/End: Original strand, 16227 - 16721
Alignment:
Q  24 gcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 123  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16227 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattga 16326  T
Q  124 acctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac 212  Q
    ||||||||           | |||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16327 acctggaaagattttcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgcc 16426  T
Q  213 ttgtt-agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagct 311  Q
    |||||  |||||||||| || ||| || ||||||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  16427 ttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagct 16526  T
Q  312 gtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgata 410  Q
    || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||| | ||||| || ||| ||  | ||||||    
T  16527 gtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgata 16626  T
Q  411 ttattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16627 ttattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5010 - 4508
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5010 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 4911  T
Q  115 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4910 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 4812  T
Q  203 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  4811 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 4712  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  4711 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 4612  T
Q  401 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  4611 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 4514  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    | ||||    
T  4513 ttatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12592 - 12090
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12592 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 12493  T
Q  115 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12492 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 12394  T
Q  203 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  12393 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 12294  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  12293 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 12194  T
Q  401 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  12193 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 12096  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    | ||||    
T  12095 ttatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22544 - 22042
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22544 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 22445  T
Q  115 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22444 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 22346  T
Q  203 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  22345 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 22246  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  22245 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 22146  T
Q  401 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  22145 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 22048  T
Q  498 tgatgt 503  Q
    | ||||    
T  22047 ttatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 18285 - 18441
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  ||||||||||| |||  ||     
T  18285 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctagaa-caac 18383  T
Q  137 ct--tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||  | ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18384 cttatttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 38 - 486
Target Start/End: Original strand, 51526 - 51987
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  51526 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 51625  T
Q  132 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 226  Q
         | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51626 tcgaatgaaacttgtgggattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 51725  T
Q  227 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagata-tgt 324  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |      
T  51726 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgttatgagatattaa 51825  T
Q  325 tgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 423  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||    
T  51826 tgttgat--ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattattatgtcttg 51922  T
Q  424 ---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 486  Q
       || ||| || ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51923 ctatttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32555
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 33003 - 32921
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||    
T  33003 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacttggaat 32921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32892 - 32826
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 217  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  32892 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgtt 32826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 16316 - 16353
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16316 tttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagt 16353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 147 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 39836 - 39479
Alignment:
Q  147 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  39836 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 39737  T
Q  246 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 345  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  39736 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 39637  T
Q  346 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 442  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39636 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 39537  T
Q  443 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39536 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 147 - 501
Target Start/End: Original strand, 74976 - 75333
Alignment:
Q  147 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  74976 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 75075  T
Q  246 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 345  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  75076 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 75175  T
Q  346 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 442  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  75176 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 75275  T
Q  443 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75276 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 443
Target Start/End: Original strand, 580 - 1021
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  580 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaga 679  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    | |||||||||||||          |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  680 acgagattgaacctggtttagtagagaatgaaacttgttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaa 779  T
Q  203 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 301  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||  | | | || |||| ||    
T  780 acagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgat 879  T
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  ||  ||| |||  | |||| ||| ||| ||    
T  880 atgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgactt 979  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgt 443  Q
    |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  980 g-cattgatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 8110 - 8228
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||| || |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||     
T  8110 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagttgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggcaaggttttaga 8209  T
Q  114 atgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  8210 atgagattgaacttggaat 8228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 503
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 6)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Original strand, 32577 - 33077
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  32577 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggaga 32676  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     || || || || |   |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32677 atgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaa 32776  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||    
T  32777 cagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatc 32876  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||| | | |   ||| || || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| |||||||    
T  32877 tgtgaagctattttatg-atgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattg 32974  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32975 caattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  33074 atgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 46428 - 45928
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  46428 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggaga 46329  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     || || || || |   |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  46328 atgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaa 46229  T
Q  204 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||    
T  46228 cagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatc 46129  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||||||| | | |   ||| || || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| |||||||    
T  46128 tgtgaagctattttatg-atgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattg 46031  T
Q  402 aaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46030 caattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T
Q  500 atgt 503  Q
    ||||    
T  45931 atgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16588 - 16333
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588 agagagcatgcaagatttcaagattttgacttttgagttgatccttagg-gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 16490  T
Q  115 tgagattgaacctggaa-----ttaaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 204  Q
     ||||||||||||||||      || | |||     ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16489 cgagattgaacctggaaagattgtagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaac 16390  T
Q  205 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacc 260  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16389 agagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacc 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  295 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 393  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  394 atgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 490  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  491 aagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 441 - 503
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 19670 - 19707
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19670 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Original strand, 17626 - 17928
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17626 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 17725  T
Q  114 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 202  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||| ||||||||    
T  17726 atgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggc---------------------gagtcacccagaa 17804  T
Q  203 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  17805 atagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 17904  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttg 326  Q
    ||||||||||| |||||| |||||    
T  17905 tgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 221 - 503
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  221 ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 320  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  321 atgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 419  Q
      |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 3186  T
Q  420 catgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3187 catgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 631 - 837
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| || ||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  631 cagagagcttgtaagattttgtgattttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 730  T
Q  114 atgagattgaacctgga----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||| ||| |          | | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  731 atgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 830  T
Q  204 cagagtg 210  Q
    |||||||    
T  831 cagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 407 - 163
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  407 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 308  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  307 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccagaaa 208  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgt 247  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||    
T  207 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgt 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 13226 - 13383
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13226 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 13325  T
Q  114 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 171  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13326 atgagattgagcctgaaatgaaacttgtgggatcctgacctgaacttgccccggcgag 13383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28192 - 27912
Alignment:
Q  145 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaag 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||| || ||||    
T  28192 attctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaag 28093  T
Q  244 ttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtg 343  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  28092 ttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtg 27993  T
Q  344 atataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 423  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27992 atataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29039 - 28924
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29039 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 28940  T
Q  114 atgagattgaacctgg 129  Q
    ||||||||||||||||    
T  28939 atgagattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Original strand, 1357 - 1407
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1357 agttgaacttcagatgattttgagtgcctgaacatgtatattaatgattag 1407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10661 - 10323
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||        
T  10661 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgcctagtagtgattaggaaagaatg---- 10566  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----tta-------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaga 201  Q
       |||||||||||||||     |||       || || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||    
T  10565 ---agattgaacctggaaagattttagaatgaaaaattttcaaattctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctaga 10469  T
Q  202 aacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataa 300  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  10468 aacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataa 10369  T
Q  301 tctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 346  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10368 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5026 - 4545
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||     
T  5026 cagagagcttgcaagatttcgtgactttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaatgactagggaagattgtaga 4927  T
Q  114 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 203  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     ||||| ||    || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  4926 atgagattgaacctgaaaagattttagaatgaacttttgtcgatcagacctgtcctcgccatggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaa 4827  T
Q  204 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 302  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| | |  | ||||||||||||     
T  4826 cagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatt 4727  T
Q  303 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 401  Q
    ||||| ||||| | | | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||||||| ||||||     
T  4726 tgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaatta 4628  T
Q  402 aaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
     | |||||||||| || ||    || ||||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4627 tatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10200
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  10356 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 10258  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10257 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 2064 - 2250
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2064 agagagcatgcaagattttgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 2163  T
Q  115 tgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2164 tgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20615 - 20426
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20615 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 20516  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    || ||||||||||||          |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20515 ataagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 2703 - 2820
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2703 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 2802  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2803 atgagattgaacctggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 18576 - 18693
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18576 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 18675  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18676 atgagattgaacctggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Original strand, 28899 - 29011
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28899 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 28998  T
Q  115 tgagattgaacct 127  Q
    |||||||||||||    
T  28999 tgagattgaacct 29011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8029
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7913 agagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagga 8012  T
Q  115 tgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||    
T  8013 tgagattgaacctggaa 8029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 334 - 487
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53654
Alignment:
Q  334 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 430  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 53103 - 53204
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  53103 gattttgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 53202  T
Q  128 gg 129  Q
    ||    
T  53203 gg 53204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8099
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8062 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1891
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1696 cagagagcttgcaagattctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 1794  T
Q  114 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 200  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 1891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 15233 - 15426
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15233 cagagagcatgcaagatatcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtaga 15332  T
Q  114 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 197  Q
    ||||||||||| |||           |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15333 atgagattgaatctggatagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 15426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  484 gatg 487  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13133 - 13033
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||  |||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  13133 gattttgtggttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaccatgtatattaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 13034  T
Q  128 g 128  Q
    |    
T  13033 g 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 5)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16161 - 16047
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16161 cagagagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16062  T
Q  114 atgagattgaacctg 128  Q
    |||||||||||||||    
T  16061 atgagattgaacctg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1845 - 1755
Alignment:
Q  9 aggagcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  1845 aggaccagagagcatgtaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagatta 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15974
Alignment:
Q  155 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16011 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 17920 - 17971
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  17920 agttgaaccttagataattttgagtgcatgaatatgtataataatgattagg 17971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 12427 - 12611
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12427 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 12526  T
Q  114 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 189  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12527 atgagattgaacctggaaagacatagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17259 - 17090
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  17259 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattt 17160  T
Q  129 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 197  Q
      |||| |||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17159 tagaataaaactt-tgagaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 17090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16880 - 16784
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16880 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 131
Target Start/End: Original strand, 7471 - 7506
Alignment:
Q  96 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 7537 - 7576
Alignment:
Q  153 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7537 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10412 - 10226
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10412 agagagcatgtaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtagga 10313  T
Q  115 tgagattgaacctggaa----tt------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||||    ||      ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10312 tgagattgaacctggaaagacttagaaggaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 530 - 344
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  530 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgaattgaaccttagatgcctt-gagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 432  T
Q  114 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||||||| ||          |||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  431 atgagattgaacctggaaatacttagaatggaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 20044 - 20228
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  20044 cagagagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtaga 20143  T
Q  114 atgagattgaacctgg---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 189  Q
    ||||||||||||||||   |||||      ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20144 atgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 65412 - 65479
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  65412 cagagagcatgtaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 65479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 487
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20527
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 451  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  452 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54018 - 53862
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  54018 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 53920  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53919 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128827
Alignment:
Q  339 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 428  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 79950 - 80137
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79950 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaacattaaatgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 80049  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  80050 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  484 gatgttgaagatgatgatgt 503  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 21209 - 21303
Alignment:
Q  35 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||| || ||| |||||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21209 tattttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggattaaatgataatgtaggatgagattgaacctgg 21303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 302 - 502
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  302 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  401 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  498 tgatg 502  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24456
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgt-atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24268 cagagagcatgcaagatttcgtgatttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttag 24367  T
Q  113 gatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||| |||          | ||||||  |  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24368 gatgagattgaacctagaaagacttagaatgaaactttggataatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 38279 - 38377
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38279 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9579 - 9462
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9579 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 9480  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
     |||||||| ||||||||    
T  9479 gtgagattggacctggaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9432 - 9391
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9432 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  367 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaacta 463  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  464 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14980 - 14914
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14980 cagagagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgctttggagtgcctga 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  447 tgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32573 - 32469
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32573 agattttgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32474  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  32473 tggaa 32469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  439 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32439 - 32397
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32439 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10540
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 10548  T
Q  114 atgagatt 121  Q
    ||||||||    
T  10547 atgagatt 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 9452 - 9639
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    |||| ||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9452 cagatagcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtagg 9551  T
Q  114 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||| ||||||          | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9552 atgagattgaatctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7301 - 7197
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7301 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 7202  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  7201 tggaa 7197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8505 - 8401
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  8505 gatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 8406  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  8405 ggaat 8401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7167 - 7126
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7167 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 10890 - 10970
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10890 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 10970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 28440 - 28540
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  28440 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 28539  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  28540 t 28540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28616
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtt-tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 12)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 133143 - 133039
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  133143 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 133044  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  133043 tggaa 133039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  439 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 133009 - 132967
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  133009 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 58492 - 58527
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58492 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 58527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41959 - 41901
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41959 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacc 41901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 57466 - 57408
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  57466 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacc 57408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12407 - 12243
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 134  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  12407 ttttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatta 12308  T
Q  135 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
          ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12307 agaatgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagt 12243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  441 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1082 - 965
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  1082 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgctagaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 983  T
Q  114 atgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  982 atgagataggacctggaa 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 10200 - 10278
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 106  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10200 gatttcgtaattttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaaga 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  484 gatgttgaagatgatgatgt 503  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 944 - 897
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  944 tgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10347
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10305 acctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 161173 - 161072
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  161173 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 161074  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  161073 ga 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 160784 - 160688
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501100
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85742
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 422175 - 422221
Alignment:
Q  29 attttgtatttttga-cttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  422175 attttgtaattttgaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 422221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 447007 - 446965
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  447007 ttagatgattttgggtgcctgaacatgtataataatgattagg 446965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 497938 - 497896
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  497938 ttagatgattttgtgtgcctgaacatgtataataatgattagg 497896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19756 - 19652
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  19756 agattttgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacc 19657  T
Q  127 tggaa 131  Q
    |||||    
T  19656 tggaa 19652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19573
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19622 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Original strand, 48092 - 48164
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||| |||||    
T  48092 agattttgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagatta 48164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3317
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  3420 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 3321  T
Q  129 gaat 132  Q
    ||||    
T  3320 gaat 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 299 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26840
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  399 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26928 ttg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27304 - 27256
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27304 tgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 27256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 6449 - 6557
Alignment:
Q  17 agagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 116  Q
    |||| |||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6449 agagaatgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatg 6548  T
Q  117 agattgaac 125  Q
    |||||||||    
T  6549 agattgaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6625
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 2195 - 2275
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2195 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 3874 - 3940
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  3874 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 3993 - 4033
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3993 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 101884 - 101781
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  101884 agatttcgtaatttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 101785  T
Q  127 tgga 130  Q
    ||||    
T  101784 tgga 101781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  484 gatgttgaagatgatg 499  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgt 449  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 499
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 484
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17586
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    || | ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 89
Target Start/End: Original strand, 39651 - 39702
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtcta 89  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  39651 ttttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcctgaacaggtcta 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 101753 - 101709
Alignment:
Q  149 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  101753 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Original strand, 45420 - 45522
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  45420 agattttgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacc 45519  T
Q  127 tgg 129  Q
    |||    
T  45520 tgg 45522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 45555 - 45596
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45555 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Original strand, 2277 - 2378
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  2277 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 2376  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  2377 ga 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Original strand, 1934 - 2030
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  1934 atttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaac 2030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 2066 - 2108
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2066 acctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13429 - 13325
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  13429 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 13330  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  13329 ggaat 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 29836 - 29950
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29836 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 29935  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  29936 gacaagattgaacct 29950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 41832 - 41946
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41832 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 41931  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  41932 gacaagattgaacct 41946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13255
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  13296 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 437
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||     
T  620 agatttcgtaattttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaact 521  T
Q  127 tggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 200  Q
    |||||     |||     || || || || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520 tggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6083 - 5978
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||     
T  6083 agatttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaact 5984  T
Q  127 tggaat 132  Q
    ||||||    
T  5983 tggaat 5978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  335 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 432  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 1947  T
Q  433 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1946 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2357 - 2291
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  2357 tgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2535
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 128  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  2445 ttttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacctg 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 499
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  484 gatgttgaagatgatg 499  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 2567 - 2609
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2567 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  399 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  21820 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 398  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  399 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 496  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  29712 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 21444 - 21492
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21444 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 29336 - 29384
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29336 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 29384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 21563 - 21614
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21563 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 29455 - 29506
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29455 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 29506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7026 - 6922
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  7026 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatg-ttttgagtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacc 6928  T
Q  127 tggaat 132  Q
    ||||||    
T  6927 tggaat 6922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8485
Alignment:
Q  358 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 455  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  456 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9034 - 8961
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9034 gattttgtagttttgacccttaagttgatctttagaagattttgagtgcctgaacatgtataataatgactagg 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20483 - 20418
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20483 cagagagcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38836 - 38761
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  38836 gaaccttagatgattctgagtgcgtgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 9)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 130397 - 130292
Alignment:
Q  27 agattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||    
T  130397 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacc 130298  T
Q  127 tggaat 132  Q
    ||||||    
T  130297 tggaat 130292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 427 - 487
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  427 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 242534 - 242420
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  242534 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 242435  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    |   |||||||||||    
T  242434 ggcaagattgaacct 242420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  484 g 484  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23669 - 23513
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  23669 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactactgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 23571  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   || || |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23570 cttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 130263 - 130222
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  130263 acctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Original strand, 60296 - 60367
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  60296 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 60367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 662
Alignment:
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60520
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 60520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 7)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 70296 - 70211
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  70296 cagagagcatgcaagattttatagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 70211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Original strand, 58102 - 58161
Alignment:
Q  68 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  58102 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 58161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 10237 - 10393
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  10237 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 10335  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10336 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 332859 - 332784
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||    
T  332859 agttgagctttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggaaagtttttagattgagattgaac 332784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 69870 - 69794
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69870 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  299 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 368  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 78692 - 78592
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  78692 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtag 78593  T
Q  113 g 113  Q
    |    
T  78592 g 78592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  484 gatg 487  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 132
Target Start/End: Original strand, 43436 - 43520
Alignment:
Q  48 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  43436 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 43520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 132
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47440
Alignment:
Q  48 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  47356 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 47440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 15462 - 15566
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  15462 gatttcgtaattttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacct 15561  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  15562 ggaat 15566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 179128 - 179085
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  179128 ttttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaa 179085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 17343 - 17402
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17343 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 671 - 755
Alignment:
Q  39 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 123  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  671 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtagattgagattga 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 6)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  484 gatg 487  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16202
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16121 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3233 - 3162
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  3233 gaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13670 - 13595
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13670 gaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 269
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15983
Alignment:
Q  154 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgag 251  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || ||||||||   |    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  252 agttgaacccttgggtag 269  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15966 agttgaacctttgggtag 15983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7102 - 6998
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  7102 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 7003  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  7002 ggaat 6998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14482 - 14378
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  14482 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 14383  T
Q  128 ggaat 132  Q
    |||||    
T  14382 ggaat 14378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 747 - 587
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||   |  |  ||| |  ||||||||||||||||    
T  747 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctggaat 648  T
Q  133 taaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
     |   ||| ||| |||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  647 aaccattgttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 428
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  290 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 387  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  388 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 428  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Original strand, 5765 - 5852
Alignment:
Q  39 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  5765 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaacc 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 9)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 331 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12859
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 403  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13239 - 13173
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  13239 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 13173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 125742 - 125855
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  125742 gcagagagcatgttagattttgtgtttcaacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 125841  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  125842 gatcagattgaacc 125855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 61241 - 61329
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  61241 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 61329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 61386 - 61421
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61386 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 61421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 65172 - 65245
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  65172 gattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 65245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 192
Target Start/End: Original strand, 65304 - 65337
Alignment:
Q  159 tcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65304 tcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 65337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 105563 - 105620
Alignment:
Q  69 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  105563 ttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 105620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 407 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11562 - 11464
Alignment:
Q  407 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11562 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 499
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 30379 - 30450
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||    
T  30379 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattag 30450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2329 - 2292
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2329 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4710
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25568
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||| |||||    
T  25640 ttagatgattttgagtgcctgaaaatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttggaa 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 450
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  331 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 427  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  428 tgtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 15049 - 15108
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15049 agagagcatgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36195
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10913
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||    
T  10995 agttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaat 10913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  484 g 484  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10842
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10884 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 867 - 952
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  867 cagagagcatgtagaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3618
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3505 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 3604  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  3605 gatcagattgaacc 3618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 437 - 487
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  437 cctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 14169 - 14282
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14169 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14268  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||  ||||||||||    
T  14269 gacaagattgaacc 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 8506 - 8619
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  8506 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 8605  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  8606 gataagattgaacc 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16804
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16740 cagagagcatgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgcct 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  484 gatgttgaagatgatga 500  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||  ||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 497  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Original strand, 5952 - 5995
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5952 ttttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 46365 - 46432
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  46365 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 46432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 80801 - 80726
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  80801 gaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 80726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  386 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 483  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  484 gatgttgaagatgatga 500  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 192
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  152 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Original strand, 7711 - 7793
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||    
T  7711 agttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaat 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 384 - 487
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  384 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 479  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  480 ctaagatg 487  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 7822 - 7864
Alignment:
Q  151 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7822 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1369 - 1307
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  1369 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattag 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3320 - 3254
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  3320 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6990 - 6920
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  6990 attttgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  431 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12453 - 12380
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  12453 ttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaat 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 10440 - 10525
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||    
T  10440 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagatta 10525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15383
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||| |||||    
T  15298 cagagagcatgtagaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagatta 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 44535 - 44486
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44535 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 44486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15901 - 15837
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15901 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10653 - 10541
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| || || |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10653 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagatggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 10554  T
Q  114 atgagattgaacc 126  Q
    |  ||||||||||    
T  10553 acaagattgaacc 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 7)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 190905 - 190985
Alignment:
Q  19 agcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  190905 agcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 190985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 192608 - 192688
Alignment:
Q  19 agcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  192608 agcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 192688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 56550 - 56394
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||   |  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  56550 tttttgacttttaagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 56452  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  56451 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 56394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 14963 - 15003
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14963 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 19485 - 19525
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 19525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 476
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193070
Alignment:
Q  406 tgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 476  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 192741 - 192793
Alignment:
Q  141 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  192741 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 192793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1134
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1075 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 1718 - 1789
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1718 attttgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattag 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6059 - 5996
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  6059 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7254 - 7191
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  7254 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  387 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  485 atgttgaagatgatgatgt 503  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13331 - 13233
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  13331 gattttgtaattttgacctta-agttgaactttagttgtttatgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1971 - 1904
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1971 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 1904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 35155 - 35226
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||    
T  35155 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattag 35226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9815 - 9704
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||  |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9815 agagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttttaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 9716  T
Q  115 tgagattgaacc 126  Q
      ||||||||||    
T  9715 caagattgaacc 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30347
Alignment:
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 30347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
       | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2327 - 2245
Alignment:
Q  43 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 125  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2327 actttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 5427 - 5541
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| || |||| ||||| |||||   ||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  5427 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgattttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 5526  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||| |||||||||||    
T  5527 gataagattgaacct 5541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18807 - 18651
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  18807 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 18709  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18708 cttagttgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 478
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  591 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtag 492  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||| ||||    
T  491 gattagattaaacc 478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6588 - 6543
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6588 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 6543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 6054 - 6099
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6054 tgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 6099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 6716 - 6761
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6716 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 19762 - 19875
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19762 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtagg 19861  T
Q  114 atgagattgaacct 127  Q
    |  |||||||||||    
T  19862 acaagattgaacct 19875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 24605 - 24723
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   | |  ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24605 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtaccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtagg 24704  T
Q  114 atgagattgaacctggaat 132  Q
    |  ||||||||||| ||||    
T  24705 acaagattgaacctagaat 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26887 - 26834
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26887 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23919 - 23843
Alignment:
Q  422 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Original strand, 36024 - 36077
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36024 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 36944 - 36891
Alignment:
Q  28 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 81  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36944 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  450 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 499  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 8576 - 8661
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  8576 cagagagcatgtaaaattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 8661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18720 - 18655
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18720 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 227942 - 227877
Alignment:
Q  67 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  227942 ttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaat 227877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 24621 - 24777
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  24621 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaactatttagaacgagattgaacctggaa-caac 24719  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24720 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgag 24777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 307541 - 307460
Alignment:
Q  45 ttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  307541 tttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 307460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 268195 - 268116
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  268195 agttgaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 268116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Original strand, 18945 - 18985
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18945 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2300 - 2240
Alignment:
Q  40 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2300 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 9982 - 9922
Alignment:
Q  40 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  9982 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4908 - 4841
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  4908 tgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 638 - 595
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  638 tgtatttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgc 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17475
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17361 gcagagagcatgtaggattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 17460  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||  |||||||||||    
T  17461 gacaagattgaacct 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12899 - 12785
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||    
T  12899 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtag 12800  T
Q  113 gatgagattgaacct 127  Q
    ||| |||||||||||    
T  12799 gatcagattgaacct 12785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 15987 - 16053
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15987 tgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Original strand, 24174 - 24256
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  24174 agttgaagcttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaat 24256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Original strand, 103241 - 103316
Alignment:
Q  54 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  103241 gaaccttagaggattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 103316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 806 - 769
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  806 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 871 - 830
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  871 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 2080 - 2125
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2080 attttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 9940 - 9985
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9940 attttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 6915 - 6960
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6915 attttgtaattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 7)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27119 - 27006
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  27119 gcagagagcatgttagattttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 27020  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    ||| ||||||||||    
T  27019 gatcagattgaacc 27006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 10955 - 11049
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  10955 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-ggaatgagattgaacctggaa 11049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 35524 - 35575
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35524 agttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 35575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 38472 - 38509
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38472 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 45579 - 45534
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45579 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7505 - 7468
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7505 tttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagt 7468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43768 - 43667
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    ||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43768 gcagagagcatgttggtttttgtcatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 43669  T
Q  113 ga 114  Q
    ||    
T  43668 ga 43667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37184 - 37071
Alignment:
Q  13 gcagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 112  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  37184 gcagagagcatgtaagattttgcgatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 37085  T
Q  113 gatgagattgaacc 126  Q
    |   ||||||||||    
T  37084 ggcaagattgaacc 37071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40496 - 40400
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40496 ttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19641 - 19485
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  19641 tttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 19543  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19542 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8504 - 8423
Alignment:
Q  45 ttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8504 tttttagttggaccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 8423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 62713 - 62676
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  62713 tttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagt 62676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 62592 - 62556
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 193  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  62592 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 62556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161252
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2258
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  2352 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-ggaatgagattgaacctggaa 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 5802 - 5839
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5802 tttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagt 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Original strand, 9345 - 9408
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||||||||||    
T  9345 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgtctactaatgattag 9408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 501  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 4571 - 4638
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| || ||| ||||||    
T  4571 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatatttttgaatgcctaaagatgtttattaaagattag 4638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3247 - 3148
Alignment:
Q  15 agagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 114  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3247 agagagcatgttagattttgtgtttccgactttttagttggaccttgagtgcccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 3148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29228 - 29177
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  29228 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattagg 29177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 226
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||   | ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  382 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgttttagaacaagattgaacctggaa-caac 284  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  283 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 18013 - 18107
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  18013 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 18107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12206 - 12112
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  12206 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32919 - 32849
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 99  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  32919 attttgtacttttgatcgttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 32849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7447
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14566
Alignment:
Q  434 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 14566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 66068 - 66224
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||||||  ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  66068 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 66166  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  66167 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 66224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 71209 - 71246
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  71209 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 71246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 482
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 1138 - 1183
Alignment:
Q  33 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1138 tgtagttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2262 - 2217
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Original strand, 1846 - 1903
Alignment:
Q  430 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 487  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846 tatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 792 - 747
Alignment:
Q  29 attttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  792 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12064
Alignment:
Q  354 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  451 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12106 t-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15759
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15796 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15148 - 15107
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15148 ttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24163 - 24100
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  24163 ttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 24100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 39587 - 39524
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  39587 ttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 39524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1893 - 1853
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1893 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4214
Alignment:
Q  405 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4310 ttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 502
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  340 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  436 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 502  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 18072 - 18136
Alignment:
Q  14 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 78  Q
    ||||||||||| |  ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18072 cagagagcatgtagaattctataattttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36757 - 36721
Alignment:
Q  38 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36757 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7118
Alignment:
Q  50 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 129  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  7197 agttgaattttagatgattttgagtgactgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 192
Target Start/End: Original strand, 4875 - 4910
Alignment:
Q  157 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4875 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3339
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||| |||||  ||     
T  3183 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacttggaa-gaac 3281  T
Q  137 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 192  Q
    |||   ||| | |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3282 cttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Original strand, 55271 - 55313
Alignment:
Q  59 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55271 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 55313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6469 - 6432
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6469 tttttgacttttgagttgaaccttagacgcctttgagt 6432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 66
Target Start/End: Original strand, 11453 - 11482
Alignment:
Q  37 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11453 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 9081 - 9122
Alignment:
Q  39 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 80  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9081 tttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3272
Alignment:
Q  435 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 3272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17572 - 17517
Alignment:
Q  432 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 488  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17572 tactgcctaagttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 17517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3129 - 3073
Alignment:
Q  70 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 126  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  3129 tgagtgcctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  384 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 480  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||   ||||||||| ||||  || ||| ||||||||| ||||||||||  |     
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgct-attattatttaactaagttgcatgagtcaata 4902  T
Q  481 taagatgttgaagatgatg 499  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  4903 taagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 191966 - 192006
Alignment:
Q  34 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  191966 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgttttcgagt 192006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 929 times since January 2019
Visitors: 2241